SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_041101149.1 NCBI__GCF_000828635.1:WP_041101149.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

3dmeA Crystal structure of conserved exported protein from bordetella pertussis. Northeast structural genomics target ber141
63% identity, 99% coverage: 4:367/369 of query aligns to 3:366/366 of 3dmeA

query
sites
3dmeA
I
 
I
D
 
D
C
 
C
A
 
I
V
 
V
I
|
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
|
V
I
x
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
G
G
 
G
R
 
H
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
L
 
A
E
|
E
S
x
A
E
 
A
N
 
E
A
 
G
F
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
x
T
S
|
S
A
 
S
R
|
R
N
|
N
S
|
S
E
 
E
V
|
V
I
 
I
H
|
H
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
P
A
 
A
G
 
D
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
C
V
 
V
A
 
R
G
 
G
R
 
K
R
 
H
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
E
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
P
H
 
H
R
 
Q
R
 
R
C
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
S
D
 
D
D
 
A
Q
 
E
L
 
A
A
 
S
R
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
R
A
 
R
A
 
A
R
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
F
 
H
L
 
I
S
 
D
R
 
G
N
 
A
E
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
H
C
 
C
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
S
P
 
P
S
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
M
 
M
L
 
L
S
 
A
L
 
Y
L
 
Q
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
L
 
L
A
 
V
L
 
F
N
 
H
S
 
T
P
|
P
V
x
L
R
 
I
G
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
R
R
 
P
D
 
E
G
 
G
I
 
-
M
 
G
L
 
F
E
 
E
A
 
L
G
 
D
V
 
F
G
 
G
A
 
G
G
 
A
E
 
E
T
 
P
A
 
M
I
 
T
L
 
L
A
 
S
Q
 
C
S
 
R
V
 
V
-
 
L
V
 
I
N
 
N
C
 
A
A
|
A
G
 
G
L
 
L
G
 
H
A
 
A
Q
 
P
G
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
I
S
 
P
P
 
R
A
 
D
S
 
S
V
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
E
H
 
Y
Y
 
L
A
 
C
K
 
K
G
 
G
N
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
S
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
A
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
H
L
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
P
 
P
D
 
D
V
 
T
E
 
E
W
 
W
I
 
I
E
 
A
N
 
T
I
 
E
D
 
D
Y
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
D
P
 
P
E
 
R
R
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
E
 
A
V
 
V
R
 
R
R
 
S
Y
 
Y
W
 
W
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
A
P
 
P
A
 
G
Y
 
Y
A
 
T
G
 
G
I
|
I
R
|
R
P
 
P
K
 
K
P
 
I
H
 
S
A
 
G
P
 
P
G
 
H
A
 
E
P
 
P
A
 
A
C
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
A
V
 
I
S
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
E
 
S
H
 
H
G
 
G
V
 
V
P
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
|
I
E
|
E
S
|
S
P
|
P
G
|
G
L
|
L
T
|
T
A
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
H
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
A
S
 
R
L
 
L
S
 
A

8w7fB Structure of drosophila melanogaster l-2-hydroxyglutarate dehydrogenase bound with fad and a sulfate ion (see paper)
33% identity, 66% coverage: 28:272/369 of query aligns to 29:274/412 of 8w7fB

query
sites
8w7fB
E
 
K
V
 
V
L
 
A
I
 
V
L
 
L
E
|
E
S
x
K
E
 
E
N
 
C
A
 
K
F
 
L
G
 
A
T
 
K
G
x
H
I
x
Q
S
|
S
A
 
G
R
x
H
N
|
N
S
|
S
E
 
G
V
|
V
I
 
I
H
|
H
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
K
A
 
P
G
 
G
S
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
C
V
 
V
A
 
E
G
 
G
R
 
M
R
 
H
M
 
L
L
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
C
 
L
A
 
D
E
 
E
R
 
K
G
 
K
I
 
I
G
 
P
H
 
Y
R
 
K
R
 
K
C
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
D
D
 
E
D
 
K
Q
 
E
L
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
D
 
K
G
 
D
I
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
R
A
 
G
R
 
I
S
 
A
N
 
N
G
 
N
V
 
V
D
 
P
D
 
D
L
 
L
Q
 
R
F
 
M
L
 
I
S
 
E
R
 
G
N
 
S
E
 
E
A
 
I
R
 
Q
A
 
E
L
 
I
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
L
 
C
E
 
Q
C
 
G
T
 
V
A
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
H
S
 
S
P
 
P
S
 
H
T
 
T
G
 
G
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
W
H
 
G
A
 
L
L
 
V
M
 
T
L
 
E
S
 
H
L
 
Y
L
 
G
G
 
Q
D
 
D
A
 
F
E
 
K
R
 
Q
D
 
C
G
 
G
A
 
G
V
 
D
L
 
I
A
 
Y
L
 
L
N
 
D
S
 
F
P
 
N
V
|
V
-
 
S
R
 
K
G
 
F
G
 
T
R
 
E
V
 
T
D
 
K
R
 
T
D
 
D
G
 
Y
I
 
P
M
 
V
L
 
T
E
 
I
A
 
H
G
 
G
V
 
A
G
 
K
A
 
P
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
A
 
-
I
 
V
L
 
R
A
 
T
Q
 
K
S
 
N
V
 
V
V
 
L
N
 
T
C
 
C
A
x
G
G
|
G
L
 
L
G
x
Q
A
 
S
Q
 
D
G
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
K
L
 
T
R
 
G
G
 
C
L
 
P
S
 
R
P
 
D
A
 
P
S
 
R
V
 
I
P
 
V
P
 
P
L
 
F
H
 
-
Y
 
-
A
 
-
K
 
R
G
 
G
N
 
E
Y
|
Y
Y
 
L
S
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
K
R
 
E
A
 
K
P
 
Q
F
 
H
S
 
M
R
 
V
L
 
K
-
 
G
-
 
N
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
D
A
 
P
-
 
R
-
 
F
A
 
P
G
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
H
L
 
F
T
 
T
L
 
P
D
 
R
L
 
M
G
 
D
G
 
G
Q
 
S
A
 
I
R
 
W
F
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
N

Sites not aligning to the query:

8w78A Structure of drosophila melanogaster l-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with fad and 2-oxoglutarate (see paper)
33% identity, 66% coverage: 28:272/369 of query aligns to 29:272/410 of 8w78A

query
sites
8w78A
E
 
K
V
 
V
L
 
A
I
 
V
L
 
L
E
|
E
S
x
K
E
 
E
N
 
C
A
 
K
F
 
L
G
 
A
T
 
K
G
x
H
I
x
Q
S
|
S
A
 
G
R
 
H
N
|
N
S
|
S
E
 
G
V
|
V
I
 
I
H
|
H
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
K
A
 
P
G
 
G
S
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
C
V
 
V
A
 
E
G
 
G
R
 
M
R
 
H
M
 
L
L
 
A
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
C
 
L
A
 
D
E
 
E
R
 
K
G
 
K
I
 
I
G
 
P
H
 
Y
R
 
K
R
 
K
C
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
D
D
 
E
D
 
K
Q
 
E
L
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
L
D
 
K
G
 
D
I
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
R
A
 
G
R
 
I
S
 
A
N
 
N
G
 
N
V
 
V
D
 
P
D
 
D
L
 
L
Q
 
R
F
 
M
L
 
I
S
 
E
R
 
G
N
 
S
E
 
E
A
 
I
R
 
Q
A
 
E
L
 
I
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
L
 
C
E
 
Q
C
 
G
T
 
V
A
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
H
S
 
S
P
 
P
S
 
H
T
 
T
G
 
G
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
W
H
 
G
A
 
L
L
 
V
M
 
T
L
 
E
S
 
H
L
 
Y
L
 
G
G
 
Q
D
 
D
A
 
F
E
 
K
R
 
Q
D
 
C
G
 
G
A
 
G
V
 
D
L
 
I
A
 
Y
L
 
L
N
 
D
S
 
F
P
 
N
V
|
V
R
 
-
G
 
S
G
 
K
R
 
F
V
 
T
D
 
E
R
 
T
D
 
D
G
 
Y
I
 
P
M
 
V
L
 
T
E
 
I
A
 
H
G
 
G
V
 
A
G
 
K
A
 
P
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
A
 
-
I
 
V
L
 
R
A
 
T
Q
 
K
S
 
N
V
 
V
V
 
L
N
 
T
C
 
C
A
x
G
G
|
G
L
 
L
G
x
Q
A
 
S
Q
 
D
G
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
K
L
 
T
R
 
G
G
 
C
L
 
P
S
 
R
P
 
D
A
 
P
S
 
R
V
 
I
P
 
V
P
 
P
L
 
F
H
 
-
Y
 
-
A
 
-
K
 
R
G
 
G
N
 
E
Y
 
Y
Y
 
L
S
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
K
R
 
E
A
 
K
P
 
Q
F
 
H
S
 
M
R
 
V
L
 
K
-
 
G
-
 
N
I
 
I
Y
|
Y
P
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
D
A
 
P
-
 
R
-
 
F
A
 
P
G
x
F
L
|
L
G
 
G
V
 
V
H
|
H
L
 
F
T
 
T
L
 
P
D
 
R
L
 
M
G
 
D
G
 
G
Q
 
S
A
 
I
R
 
W
F
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
N

Sites not aligning to the query:

4x9mA Oxidized l-alpha-glycerophosphate oxidase from mycoplasma pneumoniae with fad bound (see paper)
26% identity, 99% coverage: 1:367/369 of query aligns to 1:366/384 of 4x9mA

query
sites
4x9mA
M
 
M
D
 
E
K
 
T
I
 
R
D
 
D
C
 
V
A
 
L
V
 
I
I
 
V
G
|
G
A
 
G
G
|
G
V
 
V
I
|
I
G
 
G
L
 
C
A
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
Y
K
 
E
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
A
 
Y
G
 
K
R
 
L
E
 
K
V
 
V
L
 
T
I
 
L
L
 
V
E
|
E
S
x
K
E
 
H
N
 
H
A
 
Y
F
 
L
G
 
A
T
 
Q
G
x
E
I
x
T
S
|
S
A
 
H
R
x
A
N
|
N
S
|
S
E
 
G
V
|
V
I
 
I
H
|
H
A
 
T
G
 
G
I
 
I
Y
 
D
Y
 
P
A
 
N
A
 
P
G
 
H
S
 
K
L
 
L
K
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
Y
C
 
N
V
 
I
A
 
L
G
 
G
R
 
K
R
 
K
M
 
L
-
 
W
L
 
L
Y
 
N
A
 
T
Y
 
Y
C
 
F
A
 
K
E
 
R
R
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
P
H
 
R
R
 
Q
R
 
K
C
 
I
G
 
R
K
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
F
R
 
N
D
 
E
D
 
M
Q
 
E
L
 
R
A
 
E
R
 
Q
L
 
L
D
 
E
G
 
V
I
 
L
A
 
K
A
 
Q
A
 
R
A
 
G
R
 
I
S
 
A
N
 
N
G
 
Q
V
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
E
D
 
D
L
 
I
Q
 
Q
F
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
K
N
 
E
E
 
E
A
 
T
R
 
L
A
 
K
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
L
 
V
-
 
N
-
 
P
E
 
E
C
 
I
T
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
K
S
 
I
P
 
E
S
 
G
T
 
S
G
 
W
I
 
A
I
 
I
D
 
D
S
 
P
H
 
V
A
 
L
L
 
A
M
 
S
L
 
K
S
 
C
L
 
L
L
 
A
G
 
L
D
 
A
A
 
A
E
 
Q
R
 
Q
D
 
N
G
 
K
A
 
V
V
 
Q
L
 
I
A
 
C
L
 
T
N
 
N
S
 
T
P
x
E
V
|
V
R
 
T
G
 
N
G
 
I
R
 
S
V
 
K
D
 
Q
R
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
T
M
 
Y
L
 
L
E
 
V
A
 
W
G
 
T
V
 
N
G
 
N
A
 
E
G
 
T
E
 
T
T
 
P
A
 
S
I
 
F
L
 
K
A
 
V
Q
 
K
S
 
K
V
 
I
V
 
I
N
 
D
C
 
A
A
|
A
G
|
G
L
 
H
G
x
Y
A
 
A
Q
 
D
G
 
Y
I
 
L
A
 
A
R
 
H
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
A
P
 
K
A
 
A
S
 
D
V
 
D
P
 
F
P
 
E
L
 
Q
H
 
T
Y
 
T
A
 
R
K
 
R
G
 
G
N
 
Q
Y
|
Y
Y
 
V
S
 
V
L
 
V
A
 
T
-
 
N
-
 
Q
G
 
G
R
 
E
A
 
L
P
 
H
F
 
L
S
 
N
R
 
S
L
 
M
I
 
V
Y
 
F
P
 
M
V
 
V
P
 
P
E
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
G
L
x
K
G
|
G
V
 
V
H
 
I
L
 
V
T
 
S
L
 
P
D
 
M
L
 
L
G
 
D
G
 
G
Q
 
N
A
 
F
R
 
L
F
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
T
V
 
A
E
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
D
N
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
K
A
 
E
V
 
A
A
 
T
-
 
R
-
 
Y
-
 
I
P
 
T
E
 
K
R
 
D
A
 
A
D
 
P
A
 
C
F
 
M
Y
 
L
A
 
T
E
 
K
V
 
I
R
 
G
R
 
K
Y
 
H
W
 
M
-
 
V
P
 
P
Q
 
S
L
 
L
P
 
N
D
 
I
G
 
N
A
 
N
L
 
A
L
 
L
P
 
I
A
 
S
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
I
x
S
R
|
R
P
 
P
K
 
I
P
 
D
H
 
K
A
 
A
P
 
T
G
 
N
A
 
-
P
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
I
S
 
R
G
 
-
P
 
-
A
 
V
E
 
A
H
 
H
G
 
N
V
 
D
P
 
P
G
 
D
L
 
F
V
 
V
N
 
I
L
 
L
Y
 
G
G
 
G
I
x
M
E
x
K
S
|
S
P
|
P
G
|
G
L
|
L
T
|
T
A
 
A
S
 
A
L
 
P
A
 
A
L
 
I
A
 
V
D
 
R
H
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
R
S
 
L
L
 
L
S
 
N

P75063 Glycerol 3-phosphate oxidase; GlpO; L-alpha-glycerophosphate oxidase; EC 1.1.3.21 from Mycoplasma pneumoniae (strain ATCC 29342 / M129 / Subtype 1) (Mycoplasmoides pneumoniae) (see paper)
26% identity, 99% coverage: 1:367/369 of query aligns to 1:366/384 of P75063

query
sites
P75063
M
 
M
D
 
E
K
 
T
I
 
R
D
 
D
C
 
V
A
 
L
V
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
V
 
V
I
|
I
G
 
G
L
 
C
A
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
Y
K
 
E
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
A
 
Y
G
 
K
R
 
L
E
 
K
V
 
V
L
 
T
I
 
L
L
 
V
E
|
E
S
 
K
E
 
H
N
 
H
A
 
Y
F
 
L
G
 
A
T
 
Q
G
 
E
I
x
T
S
|
S
A
 
H
R
 
A
N
 
N
S
|
S
E
x
G
V
|
V
I
 
I
H
 
H
A
 
T
G
 
G
I
 
I
Y
 
D
Y
 
P
A
 
N
A
 
P
G
 
H
S
 
K
L
 
L
K
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
Y
C
 
N
V
 
I
A
 
L
G
 
G
R
 
K
R
 
K
M
 
L
-
 
W
L
 
L
Y
 
N
A
 
T
Y
 
Y
C
 
F
A
 
K
E
 
R
R
 
L
G
 
G
I
 
F
G
 
P
H
 
R
R
 
Q
R
 
K
C
 
I
G
 
R
K
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
F
R
 
N
D
 
E
D
 
M
Q
 
E
L
 
R
A
 
E
R
 
Q
L
 
L
D
 
E
G
 
V
I
 
L
A
 
K
A
 
Q
A
 
R
A
 
G
R
 
I
S
 
A
N
 
N
G
 
Q
V
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
E
D
 
D
L
 
I
Q
 
Q
F
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
K
N
 
E
E
 
E
A
 
T
R
 
L
A
 
K
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
L
 
V
-
 
N
-
 
P
E
 
E
C
 
I
T
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
K
S
 
I
P
 
E
S
 
G
T
 
S
G
 
W
I
 
A
I
 
I
D
 
D
S
 
P
H
 
V
A
 
L
L
 
A
M
 
S
L
 
K
S
 
C
L
 
L
L
 
A
G
 
L
D
 
A
A
 
A
E
 
Q
R
 
Q
D
 
N
G
 
K
A
 
V
V
 
Q
L
 
I
A
 
C
L
 
T
N
 
N
S
 
T
P
 
E
V
|
V
R
 
T
G
 
N
G
 
I
R
 
S
V
 
K
D
 
Q
R
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
T
M
 
Y
L
 
L
E
 
V
A
 
W
G
 
T
V
 
N
G
 
N
A
 
E
G
 
T
E
 
T
T
 
P
A
 
S
I
 
F
L
 
K
A
 
V
Q
 
K
S
 
K
V
 
I
V
 
I
N
 
D
C
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
H
G
 
Y
A
 
A
Q
 
D
G
 
Y
I
 
L
A
 
A
R
 
H
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
A
P
 
K
A
 
A
S
 
D
V
 
D
P
 
F
P
 
E
L
 
Q
H
 
T
Y
 
T
A
 
R
K
 
R
G
 
G
N
 
Q
Y
 
Y
Y
 
V
S
 
V
L
 
V
A
 
T
-
 
N
-
 
Q
G
 
G
R
 
E
A
 
L
P
 
H
F
 
L
S
 
N
R
 
S
L
 
M
I
 
V
Y
 
F
P
 
M
V
 
V
P
 
P
E
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
G
L
 
K
G
 
G
V
 
V
H
 
I
L
 
V
T
 
S
L
 
P
D
 
M
L
 
L
G
 
D
G
 
G
Q
 
N
A
 
F
R
 
L
F
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
T
V
 
A
E
 
-
W
 
-
I
 
L
E
 
D
N
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
K
A
 
E
V
 
A
A
 
T
-
 
R
-
 
Y
-
 
I
P
 
T
E
 
K
R
 
D
A
 
A
D
 
P
A
 
C
F
 
M
Y
 
L
A
 
T
E
 
K
V
 
I
R
 
G
R
 
K
Y
 
H
W
 
M
-
 
V
P
 
P
Q
 
S
L
 
L
P
 
N
D
 
I
G
 
N
A
 
N
L
 
A
L
 
L
P
 
I
A
 
S
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
S
R
 
R
P
 
P
K
 
I
P
 
D
H
 
K
A
 
A
P
 
T
G
 
N
A
 
-
P
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
I
S
 
R
G
 
-
P
 
-
A
 
V
E
 
A
H
 
H
G
 
N
V
 
D
P
 
P
G
 
D
L
 
F
V
 
V
N
 
I
L
 
L
Y
 
G
G
 
G
I
x
M
E
x
K
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
|
T
A
 
A
S
 
A
L
 
P
A
 
A
L
 
I
A
 
V
D
 
R
H
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
R
S
 
L
L
 
L
S
 
N

Q63342 Dimethylglycine dehydrogenase, mitochondrial; ME2GLYDH; EC 1.5.8.4 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
26% identity, 61% coverage: 2:227/369 of query aligns to 41:263/857 of Q63342

query
sites
Q63342
D
 
D
K
 
R
I
 
A
D
 
E
C
 
T
A
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
V
x
C
I
x
V
G
 
G
L
 
V
A
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
Y
K
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
A
G
 
G
-
 
M
R
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
L
L
 
L
E
|
E
S
x
K
E
 
S
-
 
E
-
 
L
N
 
T
A
 
A
F
x
G
G
x
S
T
|
T
G
x
W
I
x
H
S
x
A
A
|
A
R
x
G
N
x
L
S
 
T
E
 
T
V
 
Y
I
 
F
H
 
H
A
 
P
G
 
G
I
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
I
Y
 
H
Y
 
Y
A
 
D
A
 
S
G
 
I
S
 
K
L
 
L
K
 
Y
A
 
E
R
 
R
L
 
L
C
 
E
V
 
E
A
 
E
G
 
T
R
 
G
R
 
Q
M
 
V
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
C
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
V
G
 
G
H
 
F
R
 
H
R
 
Q
C
 
P
G
 
G
K
 
S
L
 
I
I
 
R
V
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
T
D
 
P
D
 
E
Q
 
R
L
 
V
A
 
D
R
 
E
L
 
F
D
 
K
G
 
-
I
 
-
A
 
Y
A
 
Q
A
 
M
A
 
T
R
 
R
S
 
T
N
 
N
G
 
W
V
 
H
D
 
A
D
 
T
L
 
E
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
I
S
 
I
R
 
E
N
 
P
E
 
E
A
 
K
-
 
I
R
 
H
A
 
E
L
 
L
E
 
F
P
 
P
A
 
L
L
 
L
-
 
N
-
 
M
-
 
D
E
 
K
C
 
I
T
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
N
P
 
P
S
 
G
T
 
D
G
 
G
I
 
H
I
 
I
D
 
D
S
 
P
H
 
Y
A
 
S
L
 
L
M
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
T
D
 
G
A
 
A
E
 
R
R
 
K
D
 
Y
G
 
G
A
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
K
L
 
Y
N
 
P
S
 
A
P
 
P
V
|
V
R
 
T
G
 
S
G
 
L
R
 
K
V
 
P
D
 
R
R
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
T
M
 
W
L
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
D
V
 
V
G
 
E
A
 
T
G
 
P
E
 
Q
T
 
G
A
 
S
I
 
V
L
 
R
A
 
A
Q
 
N
S
 
R
V
 
I
V
 
V
N
 
N
C
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
G
x
W
A
 
A
Q
 
R
G
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
K
A
 
M
L
 
I
R
 
-
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
H
A
 
P
S
 
L
V
 
I
P
 
P
P
 
V
L
 
Q
H
 
H

Sites not aligning to the query:

4pabB Crystal structure of the precursor form of rat dmgdh complexed with tetrahydrofolate (see paper)
26% identity, 61% coverage: 2:227/369 of query aligns to 4:226/824 of 4pabB

query
sites
4pabB
D
 
D
K
 
R
I
 
A
D
 
E
C
 
T
A
 
V
V
 
I
I
|
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
V
x
C
I
x
V
G
 
G
L
 
V
A
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
Y
K
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
A
G
 
G
-
 
M
R
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
L
L
|
L
E
|
E
S
x
K
E
 
S
-
 
E
-
 
L
N
 
T
A
 
A
F
x
G
G
x
S
T
|
T
G
 
W
I
x
H
S
x
A
A
|
A
R
x
G
N
x
L
S
 
T
E
x
T
V
 
Y
I
 
F
H
 
H
A
 
P
G
 
G
I
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
I
Y
 
H
Y
 
Y
A
 
D
A
 
S
G
 
I
S
 
K
L
 
L
K
 
Y
A
 
E
R
 
R
L
 
L
C
 
E
V
 
E
A
 
E
G
 
T
R
 
G
R
 
Q
M
 
V
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
C
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
V
G
 
G
H
 
F
R
 
H
R
 
Q
C
 
P
G
 
G
K
 
S
L
 
I
I
 
R
V
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
T
D
 
P
D
 
E
Q
 
R
L
 
V
A
 
D
R
x
E
L
 
F
D
 
K
G
 
-
I
 
-
A
 
Y
A
 
Q
A
 
M
A
 
T
R
 
R
S
 
T
N
 
N
G
 
W
V
 
H
D
 
A
D
 
T
L
 
E
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
I
S
 
I
R
 
E
N
 
P
E
 
E
A
 
K
-
 
I
R
 
H
A
 
E
L
 
L
E
 
F
P
 
P
A
 
L
L
 
L
-
 
N
-
 
M
-
 
D
E
 
K
C
 
I
T
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
N
P
 
P
S
 
G
T
 
D
G
 
G
I
 
H
I
 
I
D
 
D
S
 
P
H
 
Y
A
 
S
L
 
L
M
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
T
D
 
G
A
 
A
E
 
R
R
 
K
D
 
Y
G
 
G
A
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
K
L
 
Y
N
 
P
S
 
A
P
 
P
V
|
V
R
 
T
G
 
S
G
 
L
R
 
K
V
 
P
D
 
R
R
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
T
M
 
W
L
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
D
V
 
V
G
 
E
A
 
T
G
 
P
E
 
Q
T
 
G
A
 
S
I
 
V
L
 
R
A
 
A
Q
 
N
S
 
R
V
 
I
V
 
V
N
 
N
C
 
A
A
|
A
G
|
G
L
 
F
G
x
W
A
 
A
Q
 
R
G
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
K
A
 
M
L
 
I
R
 
-
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
H
A
 
P
S
 
L
V
 
I
P
 
P
P
 
V
L
 
Q
H
|
H

Sites not aligning to the query:

Q9UI17 Dimethylglycine dehydrogenase, mitochondrial; ME2GLYDH; EC 1.5.8.4 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
26% identity, 61% coverage: 2:227/369 of query aligns to 48:270/866 of Q9UI17

query
sites
Q9UI17
D
 
D
K
 
R
I
 
A
D
 
E
C
 
T
A
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
V
x
C
I
x
V
G
 
G
L
 
V
A
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
Y
K
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
A
G
 
G
-
 
M
R
 
K
E
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
L
L
 
L
E
|
E
S
x
K
E
 
S
-
 
E
-
 
L
N
 
T
A
 
A
F
x
G
G
x
S
T
|
T
G
x
W
I
x
H
S
x
A
A
|
A
R
x
G
N
x
L
S
 
T
E
 
T
V
 
Y
I
 
F
H
 
H
A
 
P
G
 
G
I
 
I
Y
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
-
R
 
K
L
 
I
C
x
H
V
 
Y
A
 
D
G
 
S
R
 
I
R
 
K
M
 
L
L
 
Y
Y
 
E
A
 
K
Y
 
L
C
 
E
A
 
E
E
 
E
R
 
T
G
 
G
-
 
Q
-
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
F
R
 
H
R
 
Q
C
 
P
G
 
G
K
 
S
L
 
I
I
 
R
V
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
T
D
 
P
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
V
R
 
R
L
 
V
D
 
D
G
 
E
I
 
F
A
 
K
A
 
Y
A
 
Q
A
 
M
R
 
T
S
 
R
N
 
T
G
 
G
V
 
W
D
 
H
-
 
A
D
 
T
L
 
E
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
S
 
I
R
 
E
N
 
P
E
 
E
A
 
K
-
 
I
R
 
Q
A
 
E
L
 
M
E
 
F
P
 
P
A
 
L
L
 
L
E
 
N
C
 
M
T
 
N
-
 
K
-
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
N
P
 
P
S
 
G
T
 
D
G
 
G
I
 
H
I
 
I
D
 
D
S
 
P
H
 
Y
A
 
S
L
 
L
M
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
A
D
 
G
A
 
A
E
 
R
R
 
K
D
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
K
L
 
Y
N
 
P
S
 
A
P
 
P
V
|
V
R
 
T
G
 
S
G
 
L
R
 
K
V
 
A
D
 
R
R
 
S
D
 
D
G
 
G
I
 
T
M
 
W
L
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
D
V
 
V
G
 
E
A
 
T
G
 
P
E
 
Q
T
 
G
A
 
S
I
 
M
L
 
R
A
 
A
Q
 
N
S
 
R
V
 
I
V
 
V
N
 
N
C
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
W
A
 
A
Q
 
R
G
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
K
A
 
M
L
 
I
R
 
-
G
 
G
L
 
L
S
 
E
P
 
H
A
 
P
S
 
L
V
 
I
P
 
P
P
 
V
L
 
Q
H
 
H

Sites not aligning to the query:

7cyxA Crystal strcuture of glycine oxidase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
24% identity, 85% coverage: 3:317/369 of query aligns to 1:302/363 of 7cyxA

query
sites
7cyxA
K
 
K
I
 
Y
D
 
D
C
 
V
A
 
A
V
 
I
I
|
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
A
R
 
H
K
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
H
E
 
K
V
 
V
L
 
A
I
 
I
L
x
V
E
|
E
S
x
K
E
 
Q
N
 
S
A
 
-
F
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
I
S
 
A
A
 
S
R
x
E
N
x
A
S
|
S
E
 
K
V
 
A
I
x
A
H
 
A
A
x
G
-
x
L
-
 
L
G
 
G
I
 
V
Y
 
A
Y
 
Y
A
 
N
A
 
P
G
 
L
S
 
F
L
 
E
K
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
E
C
 
S
V
 
R
A
 
A
G
 
I
R
 
F
R
 
P
M
 
Q
L
 
L
Y
 
A
A
 
A
Y
 
V
C
 
L
A
 
R
E
 
E
R
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
V
G
 
D
I
 
I
G
 
G
H
 
Y
R
 
E
R
 
E
C
 
K
G
 
G
K
 
I
L
 
Y
I
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
Q
R
 
N
D
 
E
D
 
D
Q
 
E
L
 
K
A
 
E
R
 
R
L
 
I
D
 
L
G
 
H
I
 
I
A
 
M
A
 
D
A
 
W
A
 
Q
R
 
Q
S
 
K
N
 
T
G
 
G
V
 
-
D
 
E
D
 
D
L
 
S
Q
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
T
R
 
G
N
 
D
E
 
H
A
 
V
R
 
R
A
 
E
L
 
K
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
-
 
S
-
 
E
E
 
S
C
 
I
T
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
V
L
 
Y
S
 
Y
P
 
P
S
 
K
T
 
D
G
 
G
I
 
H
I
 
V
D
 
I
S
 
A
H
 
P
A
 
E
L
 
L
M
 
T
L
 
K
S
 
A
L
 
F
L
 
A
G
 
H
D
 
S
A
 
A
E
 
A
R
 
I
D
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
D
L
 
I
A
 
Y
L
 
E
N
 
Q
S
 
T
P
 
E
V
|
V
R
 
F
G
 
D
G
 
I
R
 
R
V
 
I
D
 
E
R
 
N
D
 
N
G
 
K
I
 
V
M
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
I
L
 
T
A
 
S
Q
 
E
S
 
G
V
 
I
V
 
V
N
 
T
C
 
C
A
 
E
G
 
K
L
 
V
G
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
|
G
I
x
G
A
 
S
R
x
W
A
 
S
L
 
T
R
 
K
G
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
Y
L
 
F
H
 
H
Y
 
R
A
 
D
K
 
W
G
 
G
N
 
T
Y
 
Y
-
 
P
-
 
V
-
 
K
-
 
G
Y
 
E
S
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
V
R
 
R
A
 
S
P
 
R
F
 
K
S
 
Q
R
 
L
L
 
L
I
 
K
Y
 
A
P
 
P
V
 
I
P
 
F
E
 
Q
A
 
E
A
 
R
G
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
F
H
 
Y
L
 
I
T
 
T
L
 
P
D
 
K
L
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
A
 
Y
R
 
V
F
 
I
G
 
G
P
 
A
D
 
T
V
 
M
E
 
K
W
 
-
I
 
P
E
 
H
N
 
T
I
 
F
D
 
N
Y
 
K
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
P
 
P
E
 
E
R
 
S
A
 
I
D
 
T
A
 
S
F
 
I
Y
 
L
A
 
E
E
 
R
V
 
A
R
 
Y
R
 
T
Y
 
I
W
 
L
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
P
 
K
D
 
E
G
 
A
A
 
E
L
 
W
L
 
E
P
 
S
A
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
|
G
I
 
L
R
|
R
P
|
P
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

6j39A Crystal structure of cmis2 with inhibitor (see paper)
28% identity, 63% coverage: 14:244/369 of query aligns to 11:239/368 of 6j39A

query
sites
6j39A
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
A
R
 
W
K
 
Q
L
 
A
A
 
L
A
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
L
E
 
R
V
 
V
L
 
T
I
 
V
L
x
V
E
x
D
S
x
P
E
|
E
N
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
P
A
 
A
R
 
S
N
x
K
S
x
A
E
x
S
V
 
H
I
x
V
H
x
S
A
|
A
G
|
G
I
x
M
Y
 
L
Y
x
P
A
 
A
A
 
A
G
x
N
S
 
E
L
 
M
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
Q
-
 
E
-
 
D
K
 
L
A
 
L
R
 
R
L
 
L
C
 
C
V
 
L
A
 
A
G
 
S
R
 
R
R
 
E
M
 
R
L
 
Y
Y
 
P
A
 
S
Y
 
F
C
 
V
A
 
K
E
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
G
R
 
T
G
 
S
I
 
A
G
 
G
H
 
Y
R
 
R
R
 
R
C
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
L
I
 
D
V
 
A
A
 
A
T
 
F
R
 
D
D
 
D
D
 
E
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
R
A
 
N
A
 
F
A
 
L
R
 
A
S
 
P
N
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
-
D
 
A
L
 
V
Q
 
A
F
 
P
L
 
L
S
 
N
R
 
A
N
 
R
E
 
R
A
 
C
R
 
R
A
 
E
L
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
M
L
 
L
-
 
A
-
 
E
E
 
S
C
 
V
T
 
R
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
G
P
 
P
S
 
D
T
 
D
G
 
G
I
 
A
I
 
V
D
 
N
S
 
P
H
 
R
A
 
E
L
 
L
M
 
T
L
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
A
D
 
A
A
 
I
E
 
D
R
 
V
D
 
R
G
 
G
A
 
G
V
 
T
L
 
L
A
 
I
L
 
R
N
 
R
S
 
R
P
x
A
V
 
T
R
 
E
G
 
F
G
 
L
R
 
A
V
 
D
D
 
E
R
 
R
D
 
T
-
 
P
G
 
G
I
 
V
M
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
C
G
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
A
I
 
V
L
 
H
A
 
G
Q
 
D
S
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
L
C
 
S
A
|
A
G
 
G
L
 
C
G
x
W
A
 
T
Q
 
H
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
L
S
 
P
P
 
A
A
 
G
S
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
E
L
 
I
H
 
A
Y
 
P
A
 
A
K
 
K
G
 
G
N
 
Q
Y
x
I
Y
 
L
S
 
R
L
 
L
A
 
R
G
 
S
R
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6j38A Crystal structure of cmis2 (see paper)
28% identity, 63% coverage: 14:244/369 of query aligns to 11:239/368 of 6j38A

query
sites
6j38A
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
S
V
 
V
A
 
A
R
 
W
K
 
Q
L
 
A
A
 
L
A
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
L
E
 
R
V
 
V
L
 
T
I
 
V
L
x
V
E
x
D
S
x
P
E
 
E
N
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
P
A
 
A
R
 
S
N
x
K
S
x
A
E
x
S
V
 
H
I
 
V
H
x
S
A
|
A
G
|
G
I
x
M
Y
 
L
Y
 
P
A
 
A
A
 
A
G
 
N
S
 
E
L
 
M
-
 
L
-
 
Y
-
 
S
-
 
Q
-
 
E
-
 
D
K
 
L
A
 
L
R
 
R
L
 
L
C
 
C
V
 
L
A
 
A
G
 
S
R
 
R
R
 
E
M
 
R
L
 
Y
Y
 
P
A
 
S
Y
 
F
C
 
V
A
 
K
E
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
G
R
 
T
G
 
S
I
 
A
G
 
G
H
 
Y
R
 
R
R
 
R
C
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
L
I
 
D
V
 
A
A
 
A
T
 
F
R
 
D
D
 
D
D
 
E
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
R
A
 
N
A
 
F
A
 
L
R
 
A
S
 
P
N
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
-
D
 
A
L
 
V
Q
 
A
F
 
P
L
 
L
S
 
N
R
 
A
N
 
R
E
 
R
A
 
C
R
 
R
A
 
E
L
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
M
L
 
L
-
 
A
-
 
E
E
 
S
C
 
V
T
 
R
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
G
P
 
P
S
 
D
T
 
D
G
 
G
I
 
A
I
 
V
D
 
N
S
 
P
H
 
R
A
 
E
L
 
L
M
 
T
L
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
A
D
 
A
A
 
I
E
 
D
R
 
V
D
 
R
G
 
G
A
 
G
V
 
T
L
 
L
A
 
I
L
 
R
N
 
R
S
 
R
P
x
A
V
 
T
R
 
E
G
 
F
G
 
L
R
 
A
V
 
D
D
 
E
R
 
R
D
 
T
-
 
P
G
 
G
I
 
V
M
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
C
G
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
A
I
 
V
L
 
H
A
 
G
Q
 
D
S
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
L
C
 
S
A
|
A
G
 
G
L
 
C
G
x
W
A
 
T
Q
 
H
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
L
S
 
P
P
 
A
A
 
G
S
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
E
L
 
I
H
 
A
Y
 
P
A
 
A
K
 
K
G
|
G
N
 
Q
Y
 
I
Y
 
L
S
 
R
L
 
L
A
 
R
G
 
S
R
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_041101149.1 NCBI__GCF_000828635.1:WP_041101149.1
MDKIDCAVIGAGVIGLAVARKLAAAGREVLILESENAFGTGISARNSEVIHAGIYYAAGS
LKARLCVAGRRMLYAYCAERGIGHRRCGKLIVATRDDQLARLDGIAAAARSNGVDDLQFL
SRNEARALEPALECTAALLSPSTGIIDSHALMLSLLGDAERDGAVLALNSPVRGGRVDRD
GIMLEAGVGAGETAILAQSVVNCAGLGAQGIARALRGLSPASVPPLHYAKGNYYSLAGRA
PFSRLIYPVPEAAGLGVHLTLDLGGQARFGPDVEWIENIDYAVAPERADAFYAEVRRYWP
QLPDGALLPAYAGIRPKPHAPGAPACDFLVSGPAEHGVPGLVNLYGIESPGLTASLALAD
HAVASLSGP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory