SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_041278382.1 NCBI__GCF_000025945.1:WP_041278382.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

3wlxA Crystal structure of low-specificity l-threonine aldolase from escherichia coli
58% identity, 98% coverage: 4:333/337 of query aligns to 2:330/331 of 3wlxA

query
sites
3wlxA
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
|
S
D
 
D
T
 
T
V
 
V
T
 
T
K
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
R
K
 
A
M
 
M
Q
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
M
R
 
A
A
 
A
E
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
P
S
 
T
I
 
V
N
 
N
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
L
F
 
S
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
F
 
F
T
 
L
P
 
P
S
 
T
G
|
G
T
|
T
A
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
L
S
 
S
H
 
H
C
 
C
G
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
D
 
A
A
 
A
H
|
H
T
 
N
Y
 
Y
R
 
L
Y
 
F
E
 
E
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
E
 
D
F
 
A
A
 
A
K
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
L
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
D
R
 
K
I
 
V
E
 
A
E
 
M
E
 
K
I
 
I
K
 
K
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
I
H
 
H
Y
 
F
A
 
A
R
 
R
T
 
T
R
 
K
L
 
L
L
 
L
C
 
S
L
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
W
Y
 
E
F
 
F
S
 
T
L
 
R
Q
 
E
K
 
R
G
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
D
|
D
G
 
G
A
|
A
R
|
R
A
 
I
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
Y
D
 
G
I
 
C
D
 
E
I
 
L
K
 
K
K
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
Q
L
 
Y
F
 
C
D
 
D
S
 
S
A
 
F
S
 
T
I
 
I
C
 
C
L
 
L
S
 
S
K
|
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
V
G
 
G
S
 
N
V
 
R
P
 
D
L
 
Y
I
 
I
N
 
K
Q
 
R
A
 
A
R
 
I
R
 
R
W
 
W
R
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
K
N
 
N
H
 
N
V
 
V
E
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
D
 
D
H
 
H
D
 
D
N
 
N
A
 
A
K
 
A
R
 
W
L
 
M
Q
 
A
E
 
E
G
 
Q
L
 
L
K
 
R
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
C
 
-
Q
 
E
I
 
A
S
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
V
Q
 
M
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
L
F
 
F
V
 
V
Q
 
R
F
 
V
Q
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
N
S
 
A
R
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
F
 
Y
L
 
M
K
 
K
T
 
A
K
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
N
E
 
A
D
 
S
K
 
P
T
 
I
T
 
V
R
|
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
S
G
 
R
E
 
E
D
 
Q
I
 
L
D
 
A
Y
 
E
V
 
V
I
 
A
K
 
A
Q
 
H
I
 
W
G
 
R
L
 
A
F
 
F

4rjyA Crystal structure of e. Coli l-threonine aldolase in complex with a non-covalently uncleaved bound l-serine substrate (see paper)
59% identity, 94% coverage: 4:319/337 of query aligns to 2:316/332 of 4rjyA

query
sites
4rjyA
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
S
D
 
D
T
 
T
V
 
V
T
 
T
K
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
R
K
 
A
M
 
M
Q
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
M
R
 
A
A
 
A
E
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
P
S
 
T
I
 
V
N
 
N
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
L
F
 
S
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
F
 
F
T
 
L
P
 
P
S
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
L
S
 
S
H
 
H
C
 
C
G
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
D
 
A
A
 
A
H
|
H
T
 
N
Y
 
Y
R
 
L
Y
 
F
E
 
E
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
E
 
D
F
 
A
A
 
A
K
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
L
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
D
R
 
K
I
 
V
E
 
A
E
 
M
E
 
K
I
 
I
K
 
K
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
I
H
 
H
Y
 
F
A
 
A
R
 
R
T
 
T
R
 
K
L
 
L
L
 
L
C
 
S
L
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
W
Y
 
E
F
 
F
S
 
T
L
 
R
Q
 
K
K
 
R
G
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
I
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
Y
D
 
G
I
 
C
D
 
E
I
 
L
K
 
K
K
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
Q
L
 
Y
F
 
C
D
 
D
S
 
S
A
 
F
S
 
T
I
 
I
C
 
C
L
 
L
S
 
S
K
|
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
V
G
 
G
S
 
N
V
 
R
P
 
D
L
 
Y
I
 
I
N
 
K
Q
 
R
A
 
A
R
 
I
R
 
R
W
 
W
R
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
K
N
 
N
H
 
N
V
 
V
E
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
D
 
D
H
 
H
D
 
D
N
 
N
A
 
T
K
 
A
R
 
W
L
 
M
Q
 
A
E
 
E
G
 
Q
L
 
L
K
 
R
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
C
 
-
Q
 
E
I
 
A
S
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
V
Q
 
M
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
L
F
 
F
V
 
V
Q
 
R
F
 
V
Q
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
N
S
 
A
R
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
F
 
Y
L
 
M
K
 
K
T
 
A
K
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
N
E
 
A
D
 
S
K
 
P
T
 
I
T
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
S

4lnlA Structure of escherichia coli threonine aldolase in complex with allo- thr (see paper)
59% identity, 94% coverage: 4:319/337 of query aligns to 2:316/332 of 4lnlA

query
sites
4lnlA
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
|
S
D
 
D
T
|
T
V
 
V
T
|
T
K
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
R
K
 
A
M
 
M
Q
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
M
R
 
A
A
 
A
E
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
P
S
 
T
I
 
V
N
 
N
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
L
F
 
S
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
F
 
F
T
 
L
P
 
P
S
 
T
G
|
G
T
|
T
A
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
L
S
 
S
H
 
H
C
 
C
G
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
D
 
A
A
 
A
H
|
H
T
 
N
Y
 
Y
R
 
L
Y
 
F
E
 
E
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
x
V
L
 
L
G
 
G
S
|
S
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
E
 
D
F
 
A
A
 
A
K
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
L
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
D
R
 
K
I
 
V
E
 
A
E
 
M
E
 
K
I
 
I
K
 
K
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
I
H
 
H
Y
 
F
A
 
A
R
 
R
T
 
T
R
 
K
L
 
L
L
 
L
C
 
S
L
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
W
Y
 
E
F
 
F
S
 
T
L
 
R
Q
 
K
K
 
R
G
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
D
|
D
G
 
G
A
|
A
R
|
R
A
 
I
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
Y
D
 
G
I
 
C
D
 
E
I
 
L
K
 
K
K
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
Q
L
 
Y
F
 
C
D
 
D
S
 
S
A
 
F
S
 
T
I
 
I
C
 
C
L
 
L
S
|
S
K
|
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
x
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
V
G
 
G
S
 
N
V
 
R
P
 
D
L
 
Y
I
 
I
N
 
K
Q
 
R
A
 
A
R
 
I
R
 
R
W
 
W
R
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
K
N
 
N
H
 
N
V
 
V
E
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
D
 
D
H
 
H
D
 
D
N
 
N
A
 
T
K
 
A
R
 
W
L
 
M
Q
 
A
E
 
E
G
 
Q
L
 
L
K
 
R
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
C
 
-
Q
 
E
I
 
A
S
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
V
Q
 
M
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
L
F
 
F
V
 
V
Q
 
R
F
 
V
Q
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
N
S
 
A
R
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
F
 
Y
L
 
M
K
 
K
T
 
A
K
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
N
E
 
A
D
 
S
K
 
P
T
 
I
T
 
V
R
|
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
S

4lnjA Structure of escherichia coli threonine aldolase in unliganded form (see paper)
59% identity, 94% coverage: 4:319/337 of query aligns to 2:316/332 of 4lnjA

query
sites
4lnjA
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
S
D
 
D
T
|
T
V
 
V
T
|
T
K
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
R
K
 
A
M
 
M
Q
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
M
R
 
A
A
 
A
E
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
P
S
 
T
I
 
V
N
 
N
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
L
F
 
S
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
F
 
F
T
 
L
P
 
P
S
 
T
G
|
G
T
|
T
A
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
L
S
 
S
H
 
H
C
 
C
G
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
D
 
A
A
 
A
H
|
H
T
 
N
Y
 
Y
R
 
L
Y
 
F
E
 
E
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
E
 
D
F
 
A
A
 
A
K
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
L
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
D
R
 
K
I
 
V
E
 
A
E
 
M
E
 
K
I
 
I
K
 
K
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
I
H
 
H
Y
 
F
A
 
A
R
 
R
T
 
T
R
 
K
L
 
L
L
 
L
C
 
S
L
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
W
Y
 
E
F
 
F
S
 
T
L
 
R
Q
 
K
K
 
R
G
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
D
|
D
G
 
G
A
|
A
R
 
R
A
 
I
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
Y
D
 
G
I
 
C
D
 
E
I
 
L
K
 
K
K
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
Q
L
 
Y
F
 
C
D
 
D
S
 
S
A
 
F
S
 
T
I
 
I
C
 
C
L
 
L
S
|
S
K
|
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
x
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
V
G
 
G
S
 
N
V
 
R
P
 
D
L
 
Y
I
 
I
N
 
K
Q
 
R
A
 
A
R
 
I
R
 
R
W
 
W
R
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
K
N
 
N
H
 
N
V
 
V
E
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
D
 
D
H
 
H
D
 
D
N
 
N
A
 
T
K
 
A
R
 
W
L
 
M
Q
 
A
E
 
E
G
 
Q
L
 
L
K
 
R
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
C
 
-
Q
 
E
I
 
A
S
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
V
Q
 
M
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
L
F
 
F
V
 
V
Q
 
R
F
 
V
Q
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
N
S
 
A
R
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
F
 
Y
L
 
M
K
 
K
T
 
A
K
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
N
E
 
A
D
 
S
K
 
P
T
 
I
T
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
S

4lnmA Structure of escherichia coli threonine aldolase in complex with serine (see paper)
59% identity, 94% coverage: 4:319/337 of query aligns to 2:316/331 of 4lnmA

query
sites
4lnmA
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
S
D
 
D
T
|
T
V
 
V
T
|
T
K
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
R
K
 
A
M
 
M
Q
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
M
R
 
A
A
 
A
E
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
P
S
 
T
I
 
V
N
 
N
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
L
F
 
S
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
F
 
F
T
 
L
P
 
P
S
x
T
G
|
G
T
|
T
A
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
L
S
 
S
H
 
H
C
 
C
G
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
D
 
A
A
 
A
H
|
H
T
 
N
Y
 
Y
R
 
L
Y
 
F
E
 
E
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
x
V
L
 
L
G
 
G
S
|
S
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
E
 
D
F
 
A
A
 
A
K
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
L
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
D
R
 
K
I
 
V
E
 
A
E
 
M
E
 
K
I
 
I
K
 
K
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
I
H
 
H
Y
 
F
A
 
A
R
 
R
T
 
T
R
 
K
L
 
L
L
 
L
C
 
S
L
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
W
Y
 
E
F
 
F
S
 
T
L
 
R
Q
 
K
K
 
R
G
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
D
|
D
G
 
G
A
|
A
R
 
R
A
 
I
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
Y
D
 
G
I
 
C
D
 
E
I
 
L
K
 
K
K
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
Q
L
 
Y
F
 
C
D
 
D
S
 
S
A
 
F
S
 
T
I
 
I
C
 
C
L
 
L
S
|
S
K
|
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
x
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
V
G
 
G
S
 
N
V
 
R
P
 
D
L
 
Y
I
 
I
N
 
K
Q
 
R
A
 
A
R
 
I
R
 
R
W
 
W
R
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
K
N
 
N
H
 
N
V
 
V
E
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
L
 
E
D
 
D
H
 
H
D
 
D
N
 
N
A
 
T
K
 
A
R
 
W
L
 
M
Q
 
A
E
 
E
G
 
Q
L
 
L
K
 
R
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
C
 
-
Q
 
E
I
 
A
S
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
V
Q
 
M
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
L
F
 
F
V
 
V
Q
 
R
F
 
V
Q
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
N
S
 
A
R
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
F
 
Y
L
 
M
K
 
K
T
 
A
K
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
N
E
 
A
D
 
S
K
 
P
T
 
I
T
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
S

O07051 L-allo-threonine aldolase; L-allo-TA; L-allo-threonine acetaldehyde-lyase; EC 4.1.2.49 from Aeromonas jandaei (see paper)
55% identity, 100% coverage: 1:336/337 of query aligns to 1:338/338 of O07051

query
sites
O07051
M
 
M
K
 
R
T
 
Y
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
S
D
 
D
T
 
T
V
 
V
T
 
T
K
 
Q
P
 
P
T
 
T
P
 
D
K
 
A
M
 
M
Q
 
R
E
 
Q
A
 
C
M
 
M
F
 
L
R
 
H
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
G
I
 
V
N
 
N
M
 
A
L
 
L
E
 
E
D
 
A
Y
 
Y
A
 
G
A
 
A
E
 
D
R
 
L
F
 
L
G
 
G
F
x
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
V
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
M
A
 
S
N
 
N
L
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
V
M
 
M
S
 
S
H
 
H
C
 
C
G
 
Q
R
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
G
Y
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
S
D
 
A
A
 
A
H
 
H
T
 
I
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
G
 
A
G
 
Q
G
 
G
A
 
S
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
A
P
 
L
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
E
 
P
F
 
M
A
 
Q
K
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
L
D
 
A
R
 
D
I
 
V
E
 
R
E
 
A
E
 
A
I
 
I
K
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
V
H
 
H
Y
 
F
A
 
T
R
 
P
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
V
C
 
C
L
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
M
 
L
E
 
P
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
R
 
E
A
 
M
R
 
R
Y
 
E
F
 
L
S
 
V
L
 
D
Q
 
E
K
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
H
 
H
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
L
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
S
D
 
G
I
 
H
D
 
T
I
 
V
K
 
R
K
 
E
I
 
L
T
 
V
G
 
A
L
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
V
S
 
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
S
 
S
K
|
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
H
P
 
A
L
 
F
I
 
I
N
 
A
Q
 
R
A
 
A
R
 
R
R
 
R
W
 
L
R
 
R
K
|
K
V
 
M
T
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
N
 
Q
H
 
H
V
 
V
E
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
A
L
 
D
D
 
D
H
 
H
D
 
R
N
 
R
A
 
A
K
 
R
R
 
Q
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
A
Y
 
L
P
 
P
T
 
G
F
 
I
C
 
R
Q
 
L
I
 
D
S
 
L
E
 
A
D
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
V
F
 
F
V
 
L
Q
 
Q
F
 
L
Q
 
T
-
 
S
-
 
G
E
 
E
S
 
S
R
 
A
R
 
P
L
 
L
A
 
L
E
 
A
F
 
F
L
 
M
K
 
K
T
 
A
K
 
R
N
 
G
I
 
I
L
 
L
I
 
F
S
 
S
E
 
G
D
 
Y
K
 
G
T
 
E
T
 
L
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
Q
I
 
I
S
 
H
G
 
D
E
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
E
Y
 
E
V
 
V
I
 
I
K
 
D
Q
 
A
I
 
F
G
 
T
L
 
E
F
 
Y
A
 
L
G
 
G
A
 
A

3wgcB Aeromonas jandaei l-allo-threonine aldolase h128y/s292r double mutant (see paper)
55% identity, 97% coverage: 2:327/337 of query aligns to 1:326/333 of 3wgcB

query
sites
3wgcB
K
 
R
T
 
Y
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
|
S
D
 
D
T
 
T
V
 
V
T
 
T
K
 
Q
P
 
P
T
 
T
P
 
D
K
 
A
M
 
M
Q
 
R
E
 
Q
A
 
C
M
 
M
F
 
L
R
 
H
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
G
I
 
V
N
 
N
M
 
A
L
 
L
E
 
E
D
 
A
Y
 
Y
A
 
G
A
 
A
E
 
D
R
 
L
F
 
L
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
V
P
 
P
S
 
S
G
|
G
T
|
T
A
 
M
A
 
S
N
 
N
L
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
V
M
 
M
S
 
S
H
 
H
C
 
C
G
 
Q
R
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
G
Y
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
S
D
 
A
A
 
A
H
|
H
T
 
I
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
G
 
A
G
 
Q
G
 
G
A
 
S
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
A
P
 
L
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
E
 
P
F
 
M
A
 
Q
K
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
L
D
 
A
R
 
D
I
 
V
E
 
R
E
 
A
E
 
A
I
 
I
K
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
V
H
 
Y
Y
 
F
A
 
T
R
 
P
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
V
C
 
C
L
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
M
 
L
E
 
P
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
R
 
E
A
 
M
R
 
R
Y
 
E
F
 
L
S
 
V
L
 
D
Q
 
E
K
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
H
 
H
L
 
L
D
|
D
G
 
G
A
|
A
R
|
R
A
 
L
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
S
D
 
G
I
 
H
D
 
T
I
 
V
K
 
R
K
 
E
I
 
L
T
 
V
G
 
A
L
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
V
S
 
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
S
 
S
K
|
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
H
P
 
A
L
 
F
I
 
I
N
 
A
Q
 
R
A
 
A
R
 
R
R
 
R
W
 
L
R
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
N
 
Q
H
 
H
V
 
V
E
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
A
L
 
D
D
 
D
H
 
H
D
 
R
N
 
R
A
 
A
K
 
R
R
 
Q
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
A
Y
 
L
P
 
P
T
 
G
F
 
I
C
 
R
Q
 
L
I
 
D
S
 
L
E
 
A
D
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
V
F
 
F
V
 
L
Q
 
Q
F
 
L
Q
 
T
E
 
S
S
 
G
R
 
E
R
 
R
-
 
A
-
 
P
L
 
L
A
 
L
E
 
A
F
 
F
L
 
M
K
 
K
T
 
A
K
 
R
N
 
G
I
 
I
L
 
L
I
 
F
S
 
S
E
 
G
D
 
E
K
 
-
T
 
-
T
 
L
R
|
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
Q
I
 
I
S
 
H
G
 
D
E
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
E
Y
 
E
V
 
V
I
 
I

3wgbD Crystal structure of aeromonas jandaei l-allo-threonine aldolase (see paper)
55% identity, 96% coverage: 4:326/337 of query aligns to 2:317/324 of 3wgbD

query
sites
3wgbD
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
|
S
D
 
D
T
 
T
V
 
V
T
 
T
K
 
Q
P
 
P
T
 
T
P
 
D
K
 
A
M
 
M
Q
 
R
E
 
Q
A
 
C
M
 
M
F
 
L
R
 
H
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
G
I
 
V
N
 
N
M
 
A
L
 
L
E
 
E
D
 
A
Y
 
Y
A
 
G
A
 
A
E
 
D
R
 
L
F
 
L
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
V
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
M
A
 
S
N
 
N
L
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
V
M
 
M
S
 
S
H
 
H
C
 
C
G
 
Q
R
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
G
Y
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
S
D
 
A
A
 
A
H
|
H
T
 
I
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
G
 
A
G
 
Q
G
 
G
A
 
S
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
A
P
 
L
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
E
 
P
F
 
M
A
 
-
K
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
L
D
 
A
R
 
D
I
 
V
E
 
R
E
 
A
E
 
A
I
 
I
K
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
V
H
 
H
Y
 
F
A
 
T
R
 
P
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
V
C
 
C
L
 
L
E
|
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
M
 
L
E
 
P
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
R
 
E
A
 
M
R
 
R
Y
 
E
F
 
L
S
 
V
L
 
D
Q
 
E
K
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
H
 
H
L
 
L
D
|
D
G
 
G
A
|
A
R
|
R
A
 
L
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
S
D
 
G
I
 
H
D
 
T
I
 
V
K
 
R
K
 
E
I
 
L
T
 
V
G
 
A
L
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
V
S
 
S
I
 
I
C
|
C
L
|
L
S
 
S
K
|
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
L
C
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
H
P
 
A
L
 
F
I
 
I
N
 
A
Q
 
R
A
 
A
R
 
R
R
 
R
W
 
L
R
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
N
 
Q
H
 
H
V
 
V
E
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
A
L
 
D
D
 
D
H
 
H
D
 
R
N
 
R
A
 
A
K
 
R
R
 
Q
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
L
Y
 
P
P
 
G
T
 
I
F
 
R
C
 
L
Q
 
D
I
 
L
S
 
A
E
 
Q
D
 
-
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
V
F
 
F
V
 
L
Q
 
Q
F
 
L
Q
 
T
E
 
S
S
 
A
R
 
P
R
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
-
F
 
F
L
 
M
K
 
K
T
 
A
K
 
R
N
 
G
I
 
I
L
 
L
I
 
F
S
 
S
E
 
E
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
L
R
|
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
L
D
 
Q
I
 
I
S
 
H
G
 
D
E
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
E
Y
 
V
V
 
I

1jg8D Crystal structure of threonine aldolase (low-specificity)
47% identity, 95% coverage: 4:324/337 of query aligns to 3:330/344 of 1jg8D

query
sites
1jg8D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
S
D
 
D
T
|
T
V
 
V
T
|
T
K
 
K
P
 
P
T
 
T
P
 
E
K
 
E
M
 
M
Q
 
R
E
 
K
A
 
A
M
 
M
F
 
A
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
T
I
 
I
N
 
N
M
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
R
Y
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
T
F
 
F
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
V
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
M
A
 
G
N
 
N
L
 
Q
I
 
V
A
 
S
L
 
I
M
 
M
S
 
A
H
 
H
C
 
T
G
 
Q
R
 
R
G
 
G
D
 
D
E
 
E
Y
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
E
Q
 
A
D
 
D
A
 
S
H
 
H
T
 
I
Y
 
F
R
 
W
Y
 
Y
E
 
E
G
 
V
G
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
S
S
 
G
I
 
V
Q
 
M
P
 
P
Q
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
P
F
 
-
A
 
G
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
M
D
 
D
L
 
P
D
 
D
R
 
D
I
 
V
E
 
R
E
 
K
E
 
A
I
 
I
K
 
R
P
 
P
D
 
R
D
 
N
F
 
I
H
 
H
Y
 
F
A
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
S
L
 
L
L
 
I
C
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
-
 
N
-
 
R
-
 
S
G
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
M
 
L
E
 
E
Y
 
N
L
 
I
E
 
K
R
 
E
A
 
I
R
 
C
Y
 
T
F
 
I
S
 
A
L
 
K
Q
 
E
K
 
H
G
 
G
L
 
I
A
 
N
L
 
V
H
 
H
L
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
I
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
S
D
 
G
I
 
V
D
 
P
I
 
V
K
 
K
K
 
E
I
 
Y
T
 
A
G
 
G
L
 
Y
F
 
A
D
 
D
S
 
S
A
 
V
S
 
M
I
 
F
C
 
C
L
 
L
S
|
S
K
 
K
G
 
G
L
 
L
G
 
C
A
|
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
V
L
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
D
V
 
R
P
 
D
L
 
F
I
 
I
N
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
R
R
 
K
W
 
A
R
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
S
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
Y
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
T
N
 
K
H
 
M
V
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
K
L
 
E
D
 
D
H
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
A
K
 
R
R
 
F
L
 
L
Q
 
A
E
 
L
G
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
E
Y
 
I
P
 
-
T
 
G
F
 
Y
C
 
S
Q
 
V
I
 
N
S
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
Q
 
K
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
V
F
 
I
V
 
L
Q
 
R
F
 
T
Q
 
D
E
 
N
S
 
L
R
 
K
R
 
V
L
 
N
A
 
A
-
 
H
-
 
G
-
 
F
-
 
I
E
 
E
F
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
N
K
 
S
N
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
A
S
 
N
-
 
A
-
 
V
E
 
S
D
 
D
K
 
T
T
 
E
T
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
K
D
 
D
I
 
V
S
 
S
G
 
R
E
x
N
D
 
D
I
 
I
D
x
E

1lw5B X-ray structure of l-threonine aldolase (low-specificity) in complex with glycine (see paper)
47% identity, 95% coverage: 4:324/337 of query aligns to 2:329/343 of 1lw5B

query
sites
1lw5B
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
|
S
D
 
D
T
|
T
V
 
V
T
|
T
K
 
K
P
 
P
T
 
T
P
 
E
K
 
E
M
 
M
Q
 
R
E
 
K
A
 
A
M
 
M
F
 
A
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
T
I
 
I
N
 
N
M
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
R
Y
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
T
F
 
F
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
V
P
 
P
S
 
S
G
|
G
T
|
T
A
 
M
A
 
G
N
 
N
L
 
Q
I
 
V
A
 
S
L
 
I
M
 
M
S
 
A
H
 
H
C
 
T
G
 
Q
R
 
R
G
 
G
D
 
D
E
 
E
Y
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
E
Q
 
A
D
 
D
A
 
S
H
|
H
T
 
I
Y
 
F
R
 
W
Y
 
Y
E
 
E
G
 
V
G
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
S
S
 
G
I
 
V
Q
 
M
P
 
P
Q
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
P
F
 
-
A
 
G
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
M
D
 
D
L
 
P
D
 
D
R
 
D
I
 
V
E
 
R
E
 
K
E
 
A
I
 
I
K
 
R
P
 
P
D
 
R
D
 
N
F
 
I
H
 
H
Y
 
F
A
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
S
L
 
L
L
 
I
C
 
A
L
 
I
E
|
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
-
 
N
-
 
R
-
 
S
G
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
M
 
L
E
 
E
Y
 
N
L
 
I
E
 
K
R
 
E
A
 
I
R
 
C
Y
 
T
F
 
I
S
 
A
L
 
K
Q
 
E
K
 
H
G
 
G
L
 
I
A
 
N
L
 
V
H
 
H
L
 
I
D
|
D
G
 
G
A
|
A
R
|
R
A
 
I
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
S
D
 
G
I
 
V
D
 
P
I
 
V
K
 
K
K
 
E
I
 
Y
T
 
A
G
 
G
L
 
Y
F
 
A
D
 
D
S
 
S
A
 
V
S
 
M
I
 
F
C
 
C
L
 
L
S
|
S
K
|
K
G
 
G
L
 
L
G
 
C
A
|
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
V
L
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
D
V
 
R
P
 
D
L
 
F
I
 
I
N
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
R
R
 
K
W
 
A
R
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
S
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
Y
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
T
N
 
K
H
 
M
V
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
K
L
 
E
D
 
D
H
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
A
K
 
R
R
 
F
L
 
L
Q
 
A
E
 
L
G
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
E
Y
 
I
P
 
-
T
 
G
F
 
Y
C
 
S
Q
 
V
I
 
N
S
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
Q
 
K
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
V
F
 
I
V
 
L
Q
 
R
F
 
T
Q
 
D
E
 
N
S
 
L
R
 
K
R
 
V
L
 
N
A
 
A
-
 
H
-
 
G
-
 
F
-
 
I
E
 
E
F
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
N
K
 
S
N
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
A
S
 
N
-
 
A
-
 
V
E
 
S
D
 
D
K
 
T
T
 
E
T
 
I
R
|
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
K
D
 
D
I
 
V
S
 
S
G
 
R
E
x
N
D
 
D
I
 
I
D
x
E

1lw4B X-ray structure of l-threonine aldolase (low-specificity) in complex with l-allo-threonine (see paper)
47% identity, 95% coverage: 4:324/337 of query aligns to 2:329/343 of 1lw4B

query
sites
1lw4B
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
|
S
D
 
D
T
|
T
V
 
V
T
|
T
K
 
K
P
 
P
T
 
T
P
 
E
K
 
E
M
 
M
Q
 
R
E
 
K
A
 
A
M
 
M
F
 
A
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
T
I
 
I
N
 
N
M
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
R
Y
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
T
F
 
F
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
V
P
 
P
S
 
S
G
|
G
T
|
T
A
 
M
A
 
G
N
 
N
L
 
Q
I
 
V
A
 
S
L
 
I
M
 
M
S
 
A
H
 
H
C
 
T
G
 
Q
R
 
R
G
 
G
D
 
D
E
 
E
Y
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
E
Q
 
A
D
 
D
A
 
S
H
|
H
T
 
I
Y
 
F
R
 
W
Y
 
Y
E
 
E
G
 
V
G
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
S
S
 
G
I
 
V
Q
 
M
P
 
P
Q
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
P
F
 
-
A
 
G
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
M
D
 
D
L
 
P
D
 
D
R
 
D
I
 
V
E
 
R
E
 
K
E
 
A
I
 
I
K
 
R
P
 
P
D
 
R
D
 
N
F
 
I
H
 
H
Y
 
F
A
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
S
L
 
L
L
 
I
C
 
A
L
 
I
E
|
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
-
 
N
-
 
R
-
 
S
G
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
M
 
L
E
 
E
Y
 
N
L
 
I
E
 
K
R
 
E
A
 
I
R
 
C
Y
 
T
F
 
I
S
 
A
L
 
K
Q
 
E
K
 
H
G
 
G
L
 
I
A
 
N
L
 
V
H
 
H
L
 
I
D
|
D
G
 
G
A
|
A
R
|
R
A
 
I
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
S
D
 
G
I
 
V
D
 
P
I
 
V
K
 
K
K
 
E
I
 
Y
T
 
A
G
 
G
L
 
Y
F
 
A
D
 
D
S
 
S
A
 
V
S
 
M
I
 
F
C
 
C
L
 
L
S
|
S
K
|
K
G
 
G
L
 
L
G
 
C
A
|
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
V
L
 
V
C
 
V
G
 
G
S
 
D
V
 
R
P
 
D
L
 
F
I
 
I
N
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
R
R
 
K
W
 
A
R
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
S
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
Y
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
T
N
 
K
H
 
M
V
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
L
S
 
K
L
 
E
D
 
D
H
 
H
D
 
E
N
 
N
A
 
A
K
 
R
R
 
F
L
 
L
Q
 
A
E
 
L
G
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
E
Y
 
I
P
 
-
T
 
G
F
 
Y
C
 
S
Q
 
V
I
 
N
S
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
Q
 
K
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
V
F
 
I
V
 
L
Q
 
R
F
 
T
Q
 
D
E
 
N
S
 
L
R
 
K
R
 
V
L
 
N
A
 
A
-
 
H
-
 
G
-
 
F
-
 
I
E
 
E
F
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
N
K
 
S
N
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
A
S
 
N
-
 
A
-
 
V
E
 
S
D
 
D
K
 
T
T
 
E
T
 
I
R
|
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
L
 
K
D
 
D
I
 
V
S
 
S
G
 
R
E
x
N
D
 
D
I
 
I
D
x
E

Q8RXU4 Low-specificity L-threonine aldolase 1; Threonine aldolase 1; EC 4.1.2.48 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
43% identity, 97% coverage: 1:327/337 of query aligns to 3:342/358 of Q8RXU4

query
sites
Q8RXU4
M
 
M
K
 
R
T
 
S
I
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
S
D
 
D
T
 
T
V
 
V
T
 
T
K
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
D
K
 
A
M
 
M
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
M
F
 
C
R
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
D
D
 
D
D
 
D
V
 
V
Y
 
L
G
 
G
D
 
Y
D
 
D
P
 
P
S
 
T
I
 
A
N
 
R
M
 
R
L
 
L
E
 
E
D
 
E
Y
 
E
A
 
M
A
 
A
E
 
K
R
 
M
F
 
M
G
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
V
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
M
A
 
G
N
 
N
L
 
L
I
 
I
A
 
S
L
 
V
M
 
M
S
 
V
H
 
H
C
 
C
G
 
D
-
 
V
R
 
R
G
 
G
D
 
S
E
 
E
Y
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
Q
 
D
D
 
N
A
 
C
H
 
H
T
 
I
Y
 
H
R
 
V
Y
 
Y
E
 
E
G
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
I
A
 
S
I
 
T
L
 
I
G
 
G
S
 
G
I
 
V
Q
 
H
P
 
P
Q
 
K
P
 
T
I
 
V
E
 
K
F
 
N
A
 
E
K
 
E
D
 
D
G
|
G
S
 
T
L
 
M
D
 
D
L
 
L
D
 
E
R
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
A
E
 
A
I
 
I
K
 
R
-
 
D
-
 
P
P
 
K
D
 
G
D
 
S
F
 
T
H
 
F
Y
 
Y
A
 
P
R
 
S
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
C
 
C
L
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
T
Q
 
H
-
 
A
-
 
N
-
 
S
G
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
C
L
 
L
P
 
S
M
 
V
E
 
E
Y
 
Y
L
 
T
E
 
E
R
 
K
A
 
V
R
 
G
Y
 
E
F
 
I
S
 
A
L
 
K
Q
 
R
K
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
K
L
 
L
H
 
H
L
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
L
F
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
G
I
 
V
D
 
P
I
 
V
K
 
H
K
 
K
I
 
L
T
 
V
G
 
K
L
 
A
F
 
A
D
 
D
S
 
S
A
 
V
S
 
Q
I
 
V
C
 
C
L
 
L
S
 
S
K
 
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
V
L
 
I
C
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
Q
P
 
S
L
 
F
I
 
I
N
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
T
W
 
V
R
 
R
K
 
K
V
 
T
T
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
I
G
 
G
S
 
V
L
 
L
A
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
L
Y
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
N
 
E
H
 
N
V
 
L
E
 
P
R
 
K
L
 
L
S
 
Q
L
 
H
D
 
D
H
 
H
D
 
K
N
 
K
A
 
A
K
 
K
R
 
L
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
N
K
 
Q
Y
 
M
P
 
K
T
 
G
F
 
I
C
 
R
Q
 
V
I
 
N
S
 
V
E
 
A
D
 
A
V
 
V
Q
 
E
T
 
T
N
 
N
M
 
M
V
 
I
F
 
F
V
 
M
Q
 
D
F
 
M
Q
 
E
E
 
D
S
 
G
R
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
T
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
R
E
 
K
F
 
N
L
 
L
K
 
E
T
 
E
K
 
N
N
 
G
I
 
I
L
 
L
I
 
L
S
 
I
E
 
R
D
 
G
K
 
N
T
 
S
T
 
S
-
 
R
-
 
I
R
 
R
L
 
I
V
 
V
T
 
I
H
 
H
L
 
H
D
 
Q
I
 
I
S
 
T
G
 
T
E
 
S
D
 
D
I
 
V
D
 
H
Y
 
Y
V
 
T
I
 
L

5vyeB Crystal structure of l-threonine aldolase from pseudomonas putida
28% identity, 55% coverage: 2:187/337 of query aligns to 2:191/344 of 5vyeB

query
sites
5vyeB
K
 
K
T
 
S
I
 
Q
D
 
Q
L
 
F
R
 
A
S
 
S
D
 
D
T
 
N
V
 
Y
T
 
S
K
 
G
P
 
I
T
 
C
P
 
P
K
 
E
M
 
A
Q
 
W
E
 
A
A
 
A
M
 
M
F
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
N
V
 
H
G
 
G
D
 
H
D
 
D
-
 
R
V
 
A
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
Q
S
 
W
I
 
T
N
 
E
M
 
R
L
 
A
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
A
 
F
A
 
R
E
 
N
R
 
L
F
 
F
G
 
E
F
 
T
E
 
D
A
 
C
-
 
E
A
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
A
P
 
F
S
x
N
G
|
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
S
I
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
A
S
 
S
H
 
L
C
 
C
G
 
Q
R
 
S
G
 
Y
D
 
H
E
 
S
Y
 
V
L
 
I
V
 
C
G
 
S
Q
 
E
D
 
T
A
 
A
H
|
H
T
 
V
Y
 
E
R
 
T
Y
 
D
E
 
E
G
 
C
G
 
G
G
 
A
A
 
P
A
 
E
I
 
F
L
 
F
G
 
S
S
 
N
I
 
G
Q
 
S
P
 
K
Q
 
L
P
 
L
I
 
T
E
 
A
F
 
A
A
 
S
K
 
V
D
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
L
D
 
T
L
 
P
D
 
Q
R
 
S
I
 
I
E
 
R
E
 
E
-
 
V
E
 
A
I
 
L
K
 
K
P
 
R
D
 
Q
D
 
D
F
 
I
H
 
H
Y
 
Y
A
 
P
R
 
K
T
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
V
C
 
T
L
 
I
-
 
T
E
 
Q
N
 
A
T
 
T
Q
 
E
G
 
V
G
 
G
K
 
T
V
 
V
L
 
Y
P
 
R
M
 
P
E
 
D
Y
 
E
L
 
L
E
 
K
R
 
A
A
 
I
R
 
S
Y
 
A
F
 
T
S
 
C
L
 
K
Q
 
E
K
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
N
L
 
L
H
 
H
L
 
M
D
|
D
G
 
G
A
|
A
R
 
R
A
 
F
F
 
T
N
 
N
A
 
A
A
 
C
V
 
A
A
 
F
L
 
L
D
 
G
I
 
C
D
 
S
I
 
P
K
 
A
K
 
E
I
 
L
T
 
T

Sites not aligning to the query:

O50584 Low specificity L-threonine aldolase; Low specificity L-TA; EC 4.1.2.48 from Pseudomonas sp. (strain NCIMB 10558) (see paper)
28% identity, 53% coverage: 8:187/337 of query aligns to 10:193/346 of O50584

query
sites
O50584
S
 
S
D
 
D
T
 
N
V
 
Y
T
 
S
K
 
G
P
 
I
T
 
C
P
 
P
K
 
E
M
 
A
Q
 
W
E
 
A
A
 
A
M
 
M
F
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
N
V
 
H
G
 
G
D
 
H
D
 
E
-
 
R
V
 
A
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
Q
S
 
W
I
 
T
N
 
A
M
 
R
L
 
A
E
 
A
D
 
D
Y
 
H
A
 
F
A
 
R
E
 
K
R
 
L
F
 
F
G
 
E
F
 
T
E
 
D
A
 
C
A
 
E
L
 
V
F
 
F
T
 
F
P
 
A
-
 
F
S
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
S
I
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
S
S
 
S
H
 
L
C
 
C
G
 
Q
R
 
S
G
 
Y
D
 
H
E
 
S
Y
 
V
L
 
I
V
 
C
G
 
S
Q
 
E
D
 
T
A
 
A
H
 
H
T
 
V
Y
 
E
R
 
T
Y
 
D
E
 
E
G
 
C
G
 
G
G
 
A
A
 
P
A
 
E
I
 
F
L
 
F
G
 
S
S
 
N
I
 
G
Q
 
S
P
 
K
Q
 
L
P
 
L
I
 
T
E
 
A
F
 
R
A
 
S
K
 
E
D
 
G
G
 
G
S
 
K
L
 
L
D
 
T
L
 
P
D
 
A
R
 
S
I
 
I
E
 
R
E
 
E
-
 
V
E
 
A
I
 
L
K
 
K
P
 
R
D
 
Q
D
 
D
F
 
I
H
 
H
Y
 
Y
A
 
P
R
 
K
T
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
V
C
 
T
L
 
I
-
 
T
E
 
Q
N
 
A
T
 
T
Q
 
E
G
 
V
G
 
G
K
 
S
V
 
V
L
 
Y
P
 
R
M
 
P
E
 
D
Y
 
E
L
 
L
E
 
K
R
 
A
A
 
I
R
 
S
Y
 
A
F
 
T
S
 
C
L
 
K
Q
 
E
K
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
N
L
 
L
H
 
H
L
 
M
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
F
F
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
C
V
 
A
A
 
F
L
 
L
D
 
G
I
 
C
D
 
T
I
 
P
K
 
A
K
 
E
I
 
L
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_041278382.1 NCBI__GCF_000025945.1:WP_041278382.1
MKTIDLRSDTVTKPTPKMQEAMFRAEVGDDVYGDDPSINMLEDYAAERFGFEAALFTPSG
TAANLIALMSHCGRGDEYLVGQDAHTYRYEGGGAAILGSIQPQPIEFAKDGSLDLDRIEE
EIKPDDFHYARTRLLCLENTQGGKVLPMEYLERARYFSLQKGLALHLDGARAFNAAVALD
IDIKKITGLFDSASICLSKGLGAPVGSLLCGSVPLINQARRWRKVTGGAMRQAGSLAAAG
LYALENHVERLSLDHDNAKRLQEGLKKYPTFCQISEDVQTNMVFVQFQESRRLAEFLKTK
NILISEDKTTRLVTHLDISGEDIDYVIKQIGLFAGAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory