SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_041753050.1 NCBI__GCF_000013905.1:WP_041753050.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P76558 NADP-dependent malic enzyme; NADP-ME; EC 1.1.1.40 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
58% identity, 97% coverage: 17:766/773 of query aligns to 3:755/759 of P76558

query
sites
P76558
E
 
D
Q
 
Q
F
 
L
E
 
K
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
D
Y
 
F
H
 
H
E
 
E
F
 
F
P
 
P
R
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
S
 
Q
V
 
V
T
 
S
P
 
P
I
 
T
K
 
K
Q
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
T
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
A
P
 
P
C
 
C
L
 
L
E
 
E
I
 
I
Q
 
E
R
 
K
D
 
D
P
 
P
S
 
L
L
x
K
A
 
A
A
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
R
S
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
D
Q
 
E
N
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
D
K
 
K
F
 
F
I
 
I
E
 
E
A
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
K
 
Y
I
 
I
E
 
E
R
 
Q
E
 
K
L
 
L
R
 
R
K
 
E
R
 
R
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
S
A
 
T
A
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
G
L
 
L
I
 
R
I
 
V
T
 
V
N
 
E
K
 
K
K
 
N
I
 
I
E
 
S
D
 
D
I
 
V
K
 
R
I
 
M
I
 
V
C
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
A
C
 
C
L
 
M
D
 
N
I
 
L
I
 
L
C
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
L
N
 
Q
K
 
K
N
 
H
N
 
N
I
 
I
Y
 
V
V
 
V
S
 
C
D
 
D
S
 
S
R
 
K
G
 
G
I
 
V
I
 
I
S
 
Y
T
 
Q
T
 
G
R
 
R
E
 
E
-
 
P
N
 
N
L
 
M
D
 
A
E
 
E
T
 
T
K
 
K
Q
 
A
R
 
A
Y
 
Y
A
 
A
R
 
V
-
 
V
E
 
D
T
 
D
T
 
G
A
 
K
T
 
R
T
 
T
I
 
L
E
 
D
E
 
D
L
 
V
M
 
I
D
 
E
D
 
G
V
 
A
D
 
D
M
 
I
F
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
C
S
 
S
M
 
G
P
 
P
G
 
K
T
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
D
 
E
M
 
M
V
 
V
R
 
K
R
 
K
M
 
M
A
 
A
K
 
R
D
 
A
P
 
P
I
 
M
I
 
I
F
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
T
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
L
P
 
P
E
 
P
I
 
L
A
 
A
H
 
K
A
 
E
V
 
V
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
A
I
 
I
M
 
I
A
 
C
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
C
F
 
F
P
 
P
Y
 
F
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
A
V
 
I
N
 
N
E
 
E
E
 
E
M
 
M
K
 
K
I
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
M
 
L
A
 
A
H
 
H
V
 
A
E
 
E
A
 
Q
T
 
S
P
 
E
M
 
V
S
 
V
N
 
A
V
 
S
K
 
A
N
 
Y
V
 
G
E
 
D
S
 
Q
T
 
D
P
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
G
R
 
P
D
 
E
Y
 
Y
L
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
K
P
 
P
L
 
F
E
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
L
I
 
I
I
 
V
E
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
L
 
R
P
 
P
I
 
I
A
 
A
D
 
D
M
 
F
K
 
D
A
 
V
Y
 
Y
R
 
I
Q
 
D
R
 
K
L
 
L
S
 
T
E
 
E
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
N
 
K
S
 
T
A
 
N
F
 
L
V
 
F
M
 
M
K
 
K
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
S
R
 
Q
A
 
A
K
 
R
A
 
K
D
 
A
P
 
P
K
 
K
R
 
R
I
 
V
V
 
V
Y
 
L
C
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
E
D
 
E
S
 
A
N
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
H
A
 
A
V
 
T
Q
 
Q
V
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
T
E
 
L
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
N
V
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
M
N
 
R
I
 
I
A
 
Q
K
 
K
L
 
L
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
L
 
I
K
 
K
D
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
D
I
 
F
T
 
E
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
N
D
 
E
D
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
Y
 
F
N
 
K
D
 
E
Y
 
Y
W
 
W
K
 
T
G
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
Q
K
 
I
N
 
M
K
 
K
R
 
R
T
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
T
I
 
Q
E
 
E
L
 
Q
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
D
 
A
V
 
L
R
 
I
R
 
S
K
 
N
T
 
P
S
 
T
L
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
M
V
 
V
E
 
Q
N
 
R
G
 
G
D
 
E
A
 
A
D
 
D
G
 
A
M
 
M
I
 
I
C
 
C
G
 
G
T
 
T
F
 
V
G
 
G
H
 
D
Y
 
Y
Q
 
H
L
 
E
H
 
H
L
 
F
K
 
S
Y
 
V
V
 
V
G
 
K
G
 
N
V
 
V
I
 
F
N
 
G
K
 
Y
K
 
R
E
 
D
G
 
G
I
 
V
N
 
H
D
 
T
F
 
A
Y
 
G
A
 
A
M
 
M
N
 
N
A
 
A
V
 
L
L
 
L
M
 
L
Q
 
P
D
 
S
R
 
G
N
 
N
I
 
T
F
 
F
I
 
I
A
 
A
D
 
D
T
 
T
Y
 
Y
I
 
V
H
 
N
E
 
D
D
 
E
P
 
P
T
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
M
 
I
T
 
T
V
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
L
 
V
C
 
R
R
 
R
F
 
F
S
 
G
I
 
I
T
 
E
P
 
P
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
L
S
 
S
H
 
H
S
 
S
N
 
N
F
 
F
G
 
G
T
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
C
A
 
P
S
 
S
A
 
S
V
 
S
K
 
K
M
 
M
R
 
R
K
 
Q
V
 
A
H
 
L
Q
 
E
L
 
L
L
 
V
T
 
R
E
 
E
M
 
R
N
 
A
V
 
P
D
 
E
F
 
L
E
 
M
F
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
E
M
 
M
Q
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
V
E
 
E
H
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
N
N
 
D
D
 
R
L
 
M
P
 
P
S
 
D
S
 
S
N
 
S
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
N
 
N
L
 
I
L
 
L
I
 
V
L
 
M
P
 
P
T
 
N
L
 
M
D
 
E
A
 
A
S
 
A
N
 
R
I
 
I
A
 
S
F
 
Y
N
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
V
A
 
S
T
 
S
G
 
S
S
 
E
A
 
G
-
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
V
L
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
V
S
 
A
K
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
H
I
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
I
A
 
A
T
 
S
A
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
M
T
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q

6zngF Maeb full-length acetyl-coa bound state (see paper)
46% identity, 97% coverage: 19:766/773 of query aligns to 4:744/753 of 6zngF

query
sites
6zngF
F
 
F
E
 
D
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
H
 
H
E
 
Q
F
 
Q
P
 
G
R
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
S
 
E
V
 
V
T
 
I
P
 
S
I
 
S
K
 
K
Q
 
P
L
 
C
A
 
A
N
 
T
Q
 
E
R
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
A
P
 
P
C
 
C
L
 
K
E
 
A
I
 
I
Q
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
P
S
 
A
L
 
K
A
 
V
A
 
Y
K
 
D
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
K
S
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
A
N
 
T
D
 
D
P
 
V
D
 
D
K
 
V
F
 
F
I
 
C
E
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
K
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
K
K
 
K
R
 
E
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
A
M
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
C
I
 
S
I
 
I
T
 
T
N
 
N
K
 
R
K
 
K
I
 
M
E
 
E
D
 
T
I
 
V
K
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
I
 
N
S
 
S
C
 
C
L
 
A
D
 
K
I
 
I
I
 
F
C
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
N
 
R
K
 
R
N
 
E
N
 
N
I
 
I
Y
 
I
V
 
M
S
 
C
D
 
D
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
I
 
V
I
 
I
S
 
Y
T
 
K
T
 
G
R
 
R
E
 
T
-
 
A
N
 
G
L
 
M
D
 
N
E
 
K
T
 
Y
K
 
K
Q
 
E
R
 
Y
Y
 
F
A
 
A
R
 
S
E
 
E
T
 
T
T
 
E
A
 
A
T
 
R
T
 
T
I
 
L
E
 
T
E
 
E
L
 
A
M
 
L
D
 
R
D
 
G
V
 
A
D
 
D
M
 
V
F
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
V
P
 
A
G
 
G
T
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
P
D
 
E
M
 
M
V
 
L
R
 
K
R
 
D
M
 
M
A
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
I
F
 
F
A
 
A
L
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
T
P
 
P
E
 
D
I
 
K
A
 
A
H
 
R
A
 
A
V
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
A
I
 
I
M
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
R
A
 
S
T
 
T
T
 
Q
V
 
I
N
 
N
E
 
E
E
 
E
M
 
M
K
 
K
I
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
L
A
 
A
H
 
R
V
 
E
E
 
G
A
 
G
T
 
K
P
 
S
M
 
F
S
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
K
P
 
P
L
 
F
E
 
D
P
 
T
N
 
R
L
 
V
I
 
L
I
 
L
E
 
W
I
 
V
A
 
A
S
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
L
 
R
P
 
A
I
 
I
A
 
E
D
 
D
M
 
W
K
 
D
A
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
E
R
 
S
L
 
L
S
 
E
E
 
A
F
 
L
V
 
Q
Y
 
G
N
 
P
S
 
S
A
 
K
F
 
V
V
 
F
M
 
I
K
 
R
P
 
S
I
 
A
F
 
I
A
 
N
R
 
R
A
 
V
K
 
H
A
 
Q
D
 
N
P
 
S
K
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
P
R
 
R
I
 
I
V
 
V
Y
 
F
C
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
T
D
 
S
S
 
T
N
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
K
A
 
A
V
 
L
Q
 
A
V
 
T
V
 
L
V
 
V
D
 
E
E
 
E
Q
 
K
L
 
I
A
 
C
Y
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
G
R
 
Y
P
 
P
S
 
E
V
 
R
I
 
V
E
 
K
N
 
E
N
 
K
I
 
I
A
 
K
K
 
A
L
 
L
A
 
D
L
 
I
R
 
P
L
 
L
K
 
L
D
 
N
G
 
-
V
 
-
N
 
D
I
 
V
T
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
H
V
 
P
D
 
S
D
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
K
Y
 
Y
N
 
F
D
 
S
Y
 
F
W
 
V
K
 
E
G
 
K
Y
 
L
Y
 
Y
E
 
S
K
 
L
N
x
R
K
 
Q
R
 
R
T
x
K
G
 
G
V
 
I
S
 
N
I
 
L
E
 
G
L
 
E
A
 
A
R
 
E
R
 
R
D
 
-
V
 
L
R
 
M
R
 
A
K
 
D
T
 
P
S
 
N
L
 
Y
I
 
F
G
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
M
V
 
V
E
 
N
N
 
Q
G
 
G
D
 
E
A
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
M
I
 
V
C
 
S
G
 
G
T
 
S
F
 
S
G
 
I
H
 
N
Y
|
Y
Q
x
A
L
 
D
H
 
A
L
 
V
K
x
R
Y
 
P
V
 
I
G
x
L
G
 
Q
V
 
T
I
 
I
N
 
G
-
 
V
K
 
Y
K
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
I
N
x
P
D
 
A
F
 
-
Y
 
-
A
 
G
M
 
L
N
 
N
A
 
F
V
 
V
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
D
 
D
R
 
K
N
 
F
I
 
L
F
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
Y
x
T
I
x
V
H
x
N
E
x
L
D
 
N
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
C
A
 
A
E
 
Q
M
 
I
T
 
A
V
 
L
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
K
Q
 
I
L
 
V
C
 
E
R
 
Y
F
 
F
S
 
G
I
 
I
T
 
E
P
 
P
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
L
S
 
S
H
x
Y
S
 
S
N
 
N
F
 
F
G
 
S
T
 
G
S
 
A
D
 
E
R
 
-
A
 
G
S
 
T
A
 
P
V
 
R
K
 
K
M
 
M
R
 
K
K
 
K
V
 
A
H
 
A
Q
 
E
L
 
I
L
 
A
T
 
R
E
 
S
M
 
L
N
 
R
V
 
P
D
 
D
F
 
L
E
 
M
F
 
I
D
 
E
G
 
G
E
 
D
M
 
M
Q
|
Q
G
 
A
D
 
D
A
 
T
A
 
A
L
 
V
D
 
N
E
 
P
H
 
E
I
 
I
R
 
M
A
 
E
N
 
R
D
 
L
L
 
F
P
 
P
S
 
F
S
 
S
N
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
G
A
 
A
N
 
N
L
 
V
L
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
T
 
N
L
|
L
D
 
E
A
 
S
S
 
S
N
|
N
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
N
 
K
L
 
L
L
 
I
K
 
Q
T
 
Q
A
 
I
T
 
G
G
 
K
S
 
A
A
 
E
S
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
F
L
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
V
S
 
R
K
 
R
P
 
S
V
 
A
H
 
N
I
 
V
L
 
L
T
x
Q
P
 
R
S
 
T
A
 
T
T
 
T
A
 
V
R
 
D
R
 
G
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
S
T
 
V
A
 
V
L
 
F
A
 
T
V
 
A
T
 
L
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q

6zn4A Maeb malic enzyme domain apoprotein (see paper)
59% identity, 52% coverage: 19:419/773 of query aligns to 3:404/406 of 6zn4A

query
sites
6zn4A
F
 
F
E
 
D
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
H
 
H
E
 
Q
F
 
Q
P
 
G
R
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
S
 
E
V
 
V
T
 
I
P
 
S
I
 
S
K
 
K
Q
 
P
L
 
C
A
 
A
N
 
T
Q
 
E
R
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
A
P
 
P
C
 
C
L
 
K
E
 
A
I
 
I
Q
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
P
S
 
A
L
 
K
A
 
V
A
 
Y
K
 
D
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
K
S
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
A
N
 
T
D
 
D
P
 
V
D
 
D
K
 
V
F
 
F
I
 
C
E
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
K
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
K
K
 
K
R
 
E
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
A
M
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
C
I
 
S
I
 
I
T
 
T
N
 
N
K
 
R
K
 
K
I
 
M
E
 
E
D
 
T
I
 
V
K
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
I
 
N
S
 
S
C
 
C
L
 
A
D
 
K
I
 
I
I
 
F
C
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
N
 
R
K
 
R
N
 
E
N
 
N
I
 
I
Y
 
I
V
 
M
S
 
C
D
 
D
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
I
 
V
I
 
I
S
 
Y
T
 
K
T
 
G
R
 
R
E
 
T
-
 
A
N
 
G
L
 
M
D
 
N
E
 
K
T
 
Y
K
 
K
Q
 
E
R
 
Y
Y
 
F
A
 
A
R
 
S
E
 
E
T
 
T
T
 
E
A
 
A
T
 
R
T
 
T
I
 
L
E
 
T
E
 
E
L
 
A
M
 
L
D
 
R
D
 
G
V
 
A
D
 
D
M
 
V
F
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
V
P
 
A
G
 
G
T
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
P
D
 
E
M
 
M
V
 
L
R
 
K
R
 
D
M
 
M
A
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
I
F
 
F
A
 
A
L
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
T
P
 
P
E
 
D
I
 
K
A
 
A
H
 
R
A
 
A
V
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
A
I
 
I
M
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
R
A
 
S
T
 
T
T
 
Q
V
 
I
N
 
N
E
 
E
E
 
E
M
 
M
K
 
K
I
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
L
A
 
A
H
 
R
V
 
E
E
 
D
A
 
V
T
 
P
P
 
D
M
 
K
S
 
V
N
 
S
V
 
A
K
 
T
N
 
Y
V
 
G
E
 
G
S
 
K
T
 
S
P
 
F
S
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
K
P
 
P
L
 
F
E
 
D
P
 
T
N
 
R
L
 
V
I
 
L
I
 
L
E
 
W
I
 
V
A
 
A
S
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T

6zn7A Maeb malic enzyme domain apoprotein (see paper)
59% identity, 52% coverage: 19:419/773 of query aligns to 3:404/405 of 6zn7A

query
sites
6zn7A
F
 
F
E
 
D
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
H
 
H
E
 
Q
F
 
Q
P
 
G
R
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
S
 
E
V
 
V
T
 
I
P
 
S
I
 
S
K
 
K
Q
 
P
L
 
C
A
 
A
N
 
T
Q
 
E
R
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
A
P
 
P
C
 
C
L
 
K
E
 
A
I
 
I
Q
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
P
S
 
A
L
 
K
A
 
V
A
 
Y
K
 
D
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
K
S
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
A
N
 
T
D
 
D
P
 
V
D
 
D
K
 
V
F
 
F
I
 
C
E
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
K
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
K
K
 
K
R
 
E
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
|
T
S
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
A
M
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
C
I
 
S
I
 
I
T
 
T
N
 
N
K
 
R
K
 
K
I
 
M
E
 
E
D
 
T
I
 
V
K
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
V
S
x
N
G
 
G
A
|
A
G
|
G
A
|
A
A
x
S
A
 
A
I
 
N
S
 
S
C
 
C
L
 
A
D
 
K
I
 
I
I
 
F
C
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
N
 
R
K
 
R
N
 
E
N
 
N
I
 
I
Y
 
I
V
 
M
S
 
C
D
|
D
S
|
S
R
 
Q
G
 
G
I
 
V
I
 
I
S
 
Y
T
 
K
T
 
G
R
 
R
E
 
T
-
 
A
N
 
G
L
 
M
D
 
N
E
 
K
T
 
Y
K
|
K
Q
 
E
R
 
Y
Y
 
F
A
 
A
R
 
S
E
 
E
T
 
T
T
 
E
A
 
A
T
 
R
T
 
T
I
 
L
E
 
T
E
 
E
L
 
A
M
 
L
D
 
R
D
 
G
V
 
A
D
 
D
M
 
V
F
 
F
L
 
V
G
 
G
L
|
L
S
|
S
M
x
V
P
 
A
G
 
G
T
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
P
D
 
E
M
 
M
V
 
L
R
 
K
R
 
D
M
 
M
A
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
I
F
 
F
A
 
A
L
x
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
T
P
 
P
E
 
D
I
 
K
A
 
A
H
 
R
A
 
A
V
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
A
I
 
I
M
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
|
V
N
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
R
A
 
S
T
 
T
T
 
Q
V
 
I
N
 
N
E
 
E
E
 
E
M
 
M
K
 
K
I
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
L
A
 
A
H
 
R
V
 
E
E
 
D
A
 
V
T
 
P
P
 
D
M
 
K
S
 
V
N
 
S
V
 
A
K
 
T
N
 
Y
V
 
G
E
 
G
S
 
K
T
 
S
P
 
F
S
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
K
P
 
P
L
 
F
E
 
D
P
 
T
N
 
R
L
 
V
I
 
L
I
 
L
E
 
W
I
 
V
A
 
A
S
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T

5ceeA Malic enzyme from candidatus phytoplasma aywb in complex with NAD and mg2+ (see paper)
46% identity, 48% coverage: 45:417/773 of query aligns to 26:385/387 of 5ceeA

query
sites
5ceeA
N
 
N
Q
 
L
R
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
V
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
E
P
 
P
C
 
C
L
 
L
E
 
K
I
 
I
Q
 
K
R
 
E
D
 
N
P
 
P
S
 
S
L
 
D
A
 
V
A
 
Y
K
 
R
Y
 
Y
T
 
T
A
 
M
R
 
K
S
 
G
N
 
N
L
 
M
V
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
K
A
 
A
S
 
S
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
V
 
I
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
E
F
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
S
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
C
I
 
I
A
 
D
Q
 
S
N
 
T
D
 
D
P
 
S
D
 
Q
K
 
E
F
 
I
I
 
V
E
 
N
A
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
K
L
 
I
E
 
S
P
 
T
T
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
S
P
 
P
E
 
Q
C
 
C
F
 
I
K
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
K
K
 
A
R
 
K
M
 
L
N
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
|
T
S
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
M
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
K
I
 
V
T
 
V
N
 
K
K
 
K
K
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
I
S
x
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
A
 
S
A
|
A
A
 
G
I
 
M
S
 
A
C
 
I
L
 
A
D
 
K
I
 
M
I
 
L
C
 
L
A
 
L
L
 
L
G
 
K
V
 
V
N
 
-
K
 
-
N
 
N
N
 
N
I
 
V
Y
 
V
V
 
L
S
 
V
D
|
D
S
x
K
R
 
T
G
 
G
I
 
T
I
 
L
S
 
Y
T
 
K
T
 
G
R
 
V
E
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
N
E
 
E
T
 
P
K
 
Q
Q
 
K
R
 
K
Y
 
L
A
 
V
R
 
E
E
 
V
T
 
T
T
 
N
-
 
K
-
 
Y
-
 
Q
-
 
E
A
 
K
T
 
G
T
 
T
I
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
V
M
 
L
D
 
K
D
 
G
V
 
K
D
 
D
M
 
I
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
x
V
S
|
S
M
 
A
P
 
P
G
 
G
T
x
I
L
 
V
T
 
T
E
 
A
D
 
E
M
 
M
V
 
V
R
 
A
R
 
T
M
 
M
A
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
F
A
 
A
L
|
L
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
M
P
 
P
E
 
D
I
 
E
A
 
A
H
 
K
A
 
K
V
 
G
R
 
G
P
 
A
D
 
R
V
 
I
I
 
V
M
 
-
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
|
V
N
 
N
N
|
N
A
 
C
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
V
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
A
G
 
K
A
 
A
T
 
T
T
 
Q
V
 
I
N
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
M
K
 
K
I
 
K
A
 
A
C
 
A
V
 
T
R
 
Y
A
 
A
I
 
L
A
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
S
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
K
N
 
N
V
 
I
E
 
I
S
 
K
T
 
E
P
 
Q
S
 
D
F
 
L
G
 
N
R
 
E
D
 
N
Y
 
N
L
 
I
I
 
L
P
 
P
G
 
T
P
 
S
L
 
F
E
 
N
P
 
K
N
 
E
L
 
V
I
 
V
I
 
K
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
S
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
C
K
 
K
A
 
V
A
 
A
M
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
V

2dvmA NAD complex structure of ph1275 protein from pyrococcus horikoshii
43% identity, 55% coverage: 21:446/773 of query aligns to 3:424/438 of 2dvmA

query
sites
2dvmA
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
L
 
L
H
 
E
Y
 
F
H
 
H
E
 
K
-
 
N
-
 
N
F
 
F
P
 
P
R
 
G
P
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
I
S
 
E
V
 
V
T
 
I
P
 
P
I
 
K
K
 
V
Q
 
S
L
 
L
A
 
E
N
 
S
Q
 
R
R
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
E
P
 
P
C
 
C
L
 
K
E
 
E
I
 
I
Q
 
A
R
 
R
D
 
D
P
 
P
S
 
G
L
 
K
A
 
V
A
 
Y
K
 
E
Y
 
Y
T
 
T
A
 
S
R
 
K
S
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
S
A
x
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
G
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
V
 
L
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
R
F
 
F
A
 
G
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
A
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
M
I
 
I
A
 
K
Q
 
E
N
 
Q
D
 
E
P
 
P
D
 
N
K
 
K
F
 
F
I
 
I
E
 
D
A
 
I
V
 
V
A
 
K
S
 
A
L
 
I
E
 
A
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
A
A
 
S
P
 
P
E
 
K
C
 
C
F
 
F
K
 
Y
I
 
I
E
 
L
R
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
R
K
 
E
R
 
E
M
 
L
N
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
G
T
|
T
S
 
A
I
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
G
M
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
K
I
 
V
T
 
V
N
 
G
K
 
K
K
 
K
I
 
I
E
 
S
D
 
E
I
 
I
K
 
T
I
 
L
I
 
A
C
 
L
S
 
F
G
 
G
A
 
A
G
|
G
A
|
A
A
|
A
A
 
G
I
 
F
S
 
A
C
 
T
L
 
L
D
 
R
I
 
I
I
 
L
C
 
T
A
 
E
L
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
K
K
 
P
N
 
E
N
 
N
I
 
V
Y
 
R
V
 
V
S
x
V
D
x
E
-
x
L
-
 
V
-
 
N
S
 
G
R
 
K
G
x
P
I
 
R
I
 
I
S
 
L
T
 
T
T
 
S
R
 
D
E
 
L
N
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
K
T
 
L
-
 
F
-
 
P
-
 
Y
K
 
R
Q
 
G
R
 
W
Y
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
K
T
 
T
T
 
N
A
 
G
T
 
E
T
 
N
I
 
I
E
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
Q
E
 
E
L
 
A
M
 
L
D
 
K
D
 
D
V
 
A
D
 
D
M
 
V
F
 
L
L
 
I
G
 
S
L
x
F
S
x
T
M
 
R
-
 
P
-
 
G
P
 
P
G
 
G
T
 
V
L
 
I
T
 
K
E
 
P
D
 
Q
M
 
W
V
 
I
R
 
E
R
 
K
M
 
M
A
 
N
K
 
E
D
 
D
P
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
F
A
 
P
L
|
L
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
E
A
 
A
H
 
K
A
 
K
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
R
V
 
I
I
 
V
M
 
-
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
L
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
G
 
R
A
 
A
T
 
R
T
 
T
V
 
I
N
 
T
E
 
D
E
 
S
M
 
M
K
 
-
I
 
-
A
 
I
C
 
I
V
 
A
R
 
A
A
 
A
I
 
K
A
 
A
A
 
I
M
 
A
A
 
S
H
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
E
T
 
P
P
 
S
M
 
E
S
 
E
N
 
N
V
 
I
K
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
I
 
I
P
 
P
G
 
S
P
 
P
L
 
L
E
 
N
P
 
P
N
 
I
L
 
V
I
 
Y
I
 
A
E
 
R
I
 
E
A
 
A
S
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
E
A
 
A
M
 
M
D
 
K
S
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
R
L
 
T
P
 
K
I
 
V
A
 
K
D
 
G
-
 
E
-
 
W
M
 
V
K
 
E
A
 
E
Y
 
H
R
 
T
Q
 
I
R
 
R
L
 
L
S
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
Y
Y
 
E
N
 
N
S
 
-
A
 
-
F
 
-
V
 
V
M
 
I
K
 
A
P
 
P
I
 
I

2a9fA Crystal structure of a putative malic enzyme ((s)-malate:nad+ oxidoreductase (decarboxylating))
45% identity, 47% coverage: 16:377/773 of query aligns to 2:361/383 of 2a9fA

query
sites
2a9fA
K
 
K
E
 
N
Q
 
Q
F
 
L
E
 
G
Q
 
Q
A
 
L
A
 
A
L
 
L
H
 
E
Y
 
Q
H
 
A
E
 
K
F
 
-
P
 
T
R
 
F
P
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
L
S
 
E
V
 
V
T
 
Q
P
 
P
I
 
K
K
 
V
Q
 
D
L
 
I
A
 
K
N
 
T
Q
 
K
R
 
H
D
 
D
L
 
L
A
 
S
L
 
I
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
S
P
 
V
C
 
S
L
 
S
E
 
A
I
 
I
Q
 
A
R
 
K
D
 
D
P
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
Y
K
 
D
Y
 
L
T
 
T
A
 
T
R
 
K
S
 
K
N
 
N
L
 
T
V
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
E
A
 
A
S
 
A
K
 
M
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
A
F
 
I
D
 
P
I
 
I
E
 
V
I
 
L
A
 
D
Q
 
T
N
 
K
D
 
D
P
 
T
D
 
E
K
 
E
F
 
I
I
 
I
E
 
S
A
 
I
V
 
V
A
 
K
S
 
A
L
 
L
E
 
A
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
S
A
 
A
P
 
P
E
 
R
C
 
C
F
 
F
K
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
Q
E
 
R
L
 
L
R
 
I
K
 
K
R
 
E
M
 
C
N
 
H
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
F
N
 
N
A
 
S
L
 
L
I
 
K
I
 
L
T
 
L
N
 
K
K
 
K
K
 
S
I
 
L
E
 
D
D
 
E
I
 
V
K
 
S
I
 
I
I
 
V
C
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
S
A
 
A
A
 
G
I
 
L
S
 
S
C
 
I
L
 
T
D
 
R
I
 
K
I
 
L
C
 
L
A
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
A
N
 
T
K
 
K
N
 
-
N
 
-
I
 
V
Y
 
T
V
 
V
S
 
V
D
 
D
S
 
K
R
 
F
G
 
G
I
 
I
I
 
I
S
 
N
T
 
E
T
 
Q
R
 
E
-
 
A
-
 
A
E
 
Q
N
 
L
L
 
A
D
 
P
E
 
D
T
 
I
K
 
A
Q
 
K
R
 
V
Y
 
T
A
 
N
R
 
R
E
 
E
T
 
F
T
 
K
A
 
S
T
 
G
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
D
L
 
A
M
 
L
D
 
E
D
 
G
V
 
A
D
 
D
M
 
I
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
V
S
 
S
M
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
V
L
 
L
T
 
K
E
 
A
D
 
E
M
 
W
V
 
I
R
 
S
R
 
K
M
 
M
A
 
A
K
 
A
D
 
R
P
 
P
I
 
V
I
 
I
F
 
F
A
 
A
L
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
I
P
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
Y
P
 
P
E
 
D
I
 
E
A
 
A
H
 
L
A
 
E
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
-
V
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
A
G
 
R
A
 
A
T
 
K
T
 
T
V
 
I
N
 
T
E
 
V
E
 
E
M
 
M
K
 
Q
I
 
I
A
 
A
C
 
A
V
 
A
R
 
K
A
 
G
I
 
I
A
 
A
A
 
S
M
 
L
A
 
V
H
 
P
V
 
D
E
 
D
A
 
A
T
 
L
P
 
S
M
 
T
S
 
T
N
 
N
V
 
I

2haeD Crystal structure of a putative malic enzyme (malate oxidoreductase)
45% identity, 44% coverage: 23:364/773 of query aligns to 2:342/373 of 2haeD

query
sites
2haeD
A
 
A
L
 
L
H
 
E
Y
 
L
H
 
H
E
 
R
F
 
F
P
 
L
R
 
K
P
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
-
 
R
S
 
T
V
 
A
T
 
L
P
 
P
I
 
V
K
 
E
Q
 
K
L
 
V
A
 
-
N
 
D
Q
 
R
R
 
E
D
 
T
L
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
L
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
D
P
 
V
C
 
A
L
 
R
E
 
A
I
 
C
Q
 
A
R
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
E
L
 
K
A
 
T
A
 
Y
K
 
V
Y
 
Y
T
 
T
A
 
S
R
 
R
S
 
W
N
 
N
L
 
T
V
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
S
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
S
 
A
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
V
 
F
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
D
I
 
I
D
 
D
V
 
A
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
C
I
 
L
A
 
S
Q
 
E
N
 
S
D
 
E
P
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
I
I
 
I
E
 
S
A
 
I
V
 
V
A
 
K
S
 
S
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
C
 
C
F
 
F
K
 
R
I
 
I
E
 
L
R
 
Q
E
 
R
L
 
L
R
 
S
K
 
E
R
 
E
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
G
T
 
T
S
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
K
I
 
L
T
 
T
N
 
E
K
 
K
K
 
K
I
 
I
E
 
E
D
 
E
I
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
V
C
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
G
I
 
Y
S
 
N
C
 
I
L
 
V
D
 
K
I
 
F
I
 
L
C
 
L
A
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
-
K
 
-
N
 
K
N
 
N
I
 
V
Y
 
V
V
 
A
S
 
V
D
 
D
S
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
S
 
N
T
 
E
T
 
N
R
 
D
E
 
P
N
 
E
L
 
T
D
 
C
E
 
L
T
 
N
K
 
E
Q
 
Y
R
 
E
Y
 
I
A
 
A
R
 
R
-
 
I
-
 
T
-
 
N
-
 
P
E
 
E
T
 
R
T
 
L
A
 
S
T
 
G
T
 
D
I
 
L
E
 
E
E
 
T
L
 
A
M
 
L
D
 
E
D
 
G
V
 
A
D
 
D
M
 
F
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
V
S
 
S
M
 
R
P
 
G
G
 
N
T
 
I
L
 
L
T
 
K
E
 
P
D
 
E
M
 
W
V
 
I
R
 
K
R
 
K
M
 
M
A
 
S
K
 
R
D
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
F
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
L
A
 
A
H
 
R
A
 
E
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
-
V
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
L
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
M
R
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
E
V
 
-
G
 
K
A
 
R
T
 
S
T
 
K
V
 
I
N
 
T
E
 
K
E
 
N
M
 
M
K
 
L
I
 
L
A
 
S
C
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

2haeB Crystal structure of a putative malic enzyme (malate oxidoreductase)
45% identity, 44% coverage: 23:364/773 of query aligns to 2:342/373 of 2haeB

query
sites
2haeB
A
 
A
L
 
L
H
 
E
Y
 
L
H
 
H
E
 
R
F
 
F
P
 
L
R
 
K
P
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
-
 
R
S
 
T
V
 
A
T
 
L
P
 
P
I
 
V
K
 
E
Q
 
K
L
 
V
A
 
-
N
 
D
Q
 
R
R
 
E
D
 
T
L
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
L
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
D
P
 
V
C
 
A
L
 
R
E
 
A
I
 
C
Q
 
A
R
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
E
L
 
K
A
 
T
A
 
Y
K
 
V
Y
 
Y
T
 
T
A
 
S
R
 
R
S
 
W
N
 
N
L
 
T
V
 
V
G
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
S
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
S
 
A
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
V
 
F
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
D
I
 
I
D
 
D
V
 
A
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
C
I
 
L
A
 
S
Q
 
E
N
 
S
D
 
E
P
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
I
I
 
I
E
 
S
A
 
I
V
 
V
A
 
K
S
 
S
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
C
 
C
F
 
F
K
 
R
I
 
I
E
 
L
R
 
Q
E
 
R
L
 
L
R
 
S
K
 
E
R
 
E
M
 
M
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
G
T
|
T
S
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
K
I
 
L
T
 
T
N
 
E
K
 
K
K
 
K
I
 
I
E
 
E
D
 
E
I
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
V
C
 
V
S
x
N
G
 
G
A
 
I
G
|
G
A
|
A
A
|
A
A
 
G
I
 
Y
S
 
N
C
 
I
L
 
V
D
 
K
I
 
F
I
 
L
C
 
L
A
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
-
K
 
-
N
 
K
N
 
N
I
 
V
Y
 
V
V
 
A
S
 
V
D
|
D
S
x
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
S
 
N
T
 
E
T
 
N
R
 
D
E
 
P
N
 
E
L
 
T
D
 
C
E
 
L
T
 
N
K
 
E
Q
 
Y
R
 
E
Y
 
I
A
 
A
R
 
R
-
 
I
-
 
T
-
 
N
-
 
P
E
 
E
T
 
R
T
 
L
A
 
S
T
 
G
T
 
D
I
 
L
E
 
E
E
 
T
L
 
A
M
 
L
D
 
E
D
 
G
V
 
A
D
 
D
M
 
F
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
x
V
S
|
S
M
x
R
P
 
G
G
 
N
T
 
I
L
 
L
T
 
K
E
 
P
D
 
E
M
 
W
V
 
I
R
 
K
R
 
K
M
 
M
A
 
S
K
 
R
D
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
F
 
F
A
 
A
L
|
L
A
|
A
N
|
N
P
 
P
T
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
L
A
 
A
H
 
R
A
 
E
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
-
V
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
L
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
M
R
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
E
V
 
-
G
 
K
A
 
R
T
 
S
T
 
K
V
 
I
N
 
T
E
 
K
E
 
N
M
 
M
K
 
L
I
 
L
A
 
S
C
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

6ioxA Crystal structure of porphyromonas gingivalis phosphotransacetylase in complex with acetyl-coa (see paper)
29% identity, 42% coverage: 442:765/773 of query aligns to 7:334/339 of 6ioxA

query
sites
6ioxA
V
 
L
M
 
I
K
 
Q
P
 
D
I
 
V
F
 
I
A
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
Q
A
 
E
D
 
N
P
 
K
K
 
Q
R
 
R
I
 
I
V
 
V
Y
 
L
C
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
L
D
 
E
S
 
P
N
 
R
V
 
T
L
 
L
L
 
E
A
 
A
V
 
A
Q
 
D
V
 
R
V
 
L
V
 
M
D
 
A
E
 
D
Q
 
K
L
 
V
A
 
V
Y
 
N
P
 
I
I
 
I
L
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
N
P
 
V
S
 
D
V
 
S
I
 
V
E
 
K
N
 
A
N
 
K
I
 
V
A
 
A
K
 
E
L
 
L
A
 
G
L
 
L
R
 
K
L
 
N
K
 
L
D
 
D
G
 
-
V
 
-
N
 
E
I
 
A
T
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
D
V
 
P
D
 
N
D
 
N
D
 
H
P
 
P
R
 
K
Y
 
K
N
 
Q
D
 
Q
Y
 
Y
W
 
T
K
 
D
G
 
L
Y
 
L
Y
 
L
E
 
Q
K
 
I
N
 
R
K
 
Q
R
 
K
T
 
K
G
 
G
V
 
L
S
 
T
I
 
P
E
 
E
L
 
K
A
 
A
R
 
A
R
 
E
D
 
L
V
 
V
R
 
E
R
 
N
K
 
P
T
 
L
S
 
Y
L
 
L
I
 
-
G
 
G
A
 
C
L
 
L
L
 
I
V
 
V
E
 
K
N
 
S
G
 
G
D
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
L
I
 
I
C
 
A
G
 
G
T
 
A
F
 
Q
G
 
N
H
 
T
Y
 
T
Q
 
G
L
 
D
H
 
V
L
 
L
K
 
R
Y
 
P
V
 
A
G
x
L
G
 
Q
V
 
V
I
 
I
N
 
K
K
 
T
K
 
A
E
 
P
G
 
G
I
 
M
N
 
T
D
x
S
-
x
V
-
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
L
F
 
L
Y
 
F
A
 
T
M
 
K
N
 
A
A
 
K
V
 
E
L
 
Y
M
 
G
Q
 
K
D
 
D
R
 
G
N
 
L
I
 
L
F
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
D
T
 
C
Y
x
A
I
x
V
H
 
I
E
 
P
D
 
N
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
M
 
I
T
 
A
V
 
V
L
 
A
A
 
T
A
 
A
E
 
R
Q
 
T
L
 
A
C
 
K
R
 
A
F
 
I
S
 
A
-
 
D
I
 
I
T
 
E
P
 
P
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
L
S
 
S
H
 
F
S
 
S
N
 
T
F
 
K
G
 
G
T
 
S
S
 
A
D
 
K
R
 
H
A
 
E
S
 
M
A
 
T
V
 
D
K
 
K
M
 
V
R
 
V
K
 
E
V
 
A
H
 
T
Q
 
R
L
 
M
L
 
A
T
 
Q
E
 
E
M
 
M
N
 
A
V
 
P
D
 
D
F
 
L
E
 
L
F
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
G
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
V
E
 
E
H
 
R
I
 
V
R
 
A
A
 
A
N
 
L
D
 
K
L
 
A
P
 
P
S
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
V
K
 
A
G
 
G
S
 
K
A
 
A
N
 
N
L
 
V
L
 
L
I
 
V
L
 
F
P
 
P
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
V
S
 
G
N
 
N
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
N
 
K
L
 
L
L
 
V
K
 
E
T
 
R
A
 
L
T
 
G
G
 
H
S
 
A
A
 
E
S
 
A
I
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
A
 
M
S
 
A
K
 
A
P
 
P
V
 
V