SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_041939755.1 NCBI__GCF_000058485.1:WP_041939755.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1p9lA Structure of m. Tuberculosis dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pdc (see paper)
64% identity, 98% coverage: 5:249/250 of query aligns to 1:244/245 of 1p9lA

query
sites
1p9lA
L
 
M
A
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
|
G
A
 
A
R
 
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
S
 
T
T
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
E
I
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
D
 
P
R
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
T
-
 
D
-
 
G
A
 
N
A
 
T
D
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
H
P
 
P
D
 
D
A
x
V
V
 
V
L
 
M
D
 
G
N
 
N
V
 
L
R
 
E
W
 
F
C
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
N
G
 
G
R
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
F
T
 
Q
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
G
 
S
W
 
W
L
 
L
G
 
V
D
 
A
A
 
K
P
 
P
K
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
G
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
M
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
K
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
D
 
D
S
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
|
H
P
 
P
N
 
H
K
|
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
R
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
A
 
P
P
 
P
G
 
N
G
 
-
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
S
T
 
T
A
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
|
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
Y
 
L
D
 
D
R
 
R
T
 
T
S
 
S
F
|
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

1c3vA Dihydrodipicolinate reductase from mycobacterium tuberculosis complexed with NADPH and pdc (see paper)
64% identity, 98% coverage: 5:249/250 of query aligns to 1:244/245 of 1c3vA

query
sites
1c3vA
L
 
M
A
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
x
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
S
 
T
T
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
E
I
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
D
 
P
R
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
T
-
 
D
-
 
G
A
 
N
A
 
T
D
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
H
P
 
P
D
 
D
A
x
V
V
 
V
L
 
M
D
 
G
N
 
N
V
 
L
R
 
E
W
 
F
C
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
N
G
 
G
R
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
F
T
 
Q
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
G
 
S
W
 
W
L
 
L
G
 
V
D
 
A
A
 
K
P
 
P
K
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
 
F
G
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
M
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
K
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
D
 
D
S
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
 
H
P
 
P
N
 
H
K
|
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
R
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
A
 
P
P
 
P
G
 
N
G
 
-
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
S
T
 
T
A
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
|
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
Y
 
L
D
 
D
R
 
R
T
 
T
S
 
S
F
|
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

P9WP23 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
64% identity, 98% coverage: 5:249/250 of query aligns to 1:244/245 of P9WP23

query
sites
P9WP23
L
 
M
A
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
x
K
G
 
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
E
I
 
L
D
|
D
A
 
A
G
 
G
D
 
D
D
 
P
R
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
T
-
 
D
-
 
G
A
 
N
A
 
T
D
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
T
T
 
H
P
 
P
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
M
D
 
G
N
 
N
V
 
L
R
 
E
W
 
F
C
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
N
G
 
G
R
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
F
T
 
Q
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
G
 
S
W
 
W
L
 
L
G
 
V
D
 
A
A
 
K
P
 
P
K
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
|
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
G
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
M
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
K
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
D
 
D
S
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
L
H
 
H
H
 
H
P
 
P
N
 
H
K
|
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
A
 
P
P
 
P
G
 
N
G
 
-
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
S
T
 
T
A
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
Y
 
L
D
 
D
R
 
R
T
 
T
S
 
S
F
 
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

1yl5A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis dihydrodipicolinate reductase (rv2773c) (crystal form a) (see paper)
64% identity, 97% coverage: 7:249/250 of query aligns to 5:246/247 of 1yl5A

query
sites
1yl5A
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
G
 
G
R
 
K
M
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
|
V
E
x
A
A
 
A
A
|
A
G
 
D
D
 
D
L
|
L
A
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
E
I
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
D
D
 
P
R
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
T
-
 
D
-
 
G
A
 
N
A
 
T
D
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
T
T
 
H
P
 
P
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
M
D
 
G
N
 
N
V
 
L
R
 
E
W
 
F
C
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
N
G
 
G
R
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
F
T
 
Q
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
G
 
S
W
 
W
L
 
L
G
 
V
D
 
A
A
 
K
P
 
P
K
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
M
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
K
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
D
 
D
S
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
 
H
P
 
P
N
 
H
K
|
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
A
 
P
P
 
P
G
 
N
G
 
-
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
S
T
 
T
A
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
Y
 
L
D
 
D
R
 
R
T
 
T
S
 
S
F
 
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

5ugvA Dapb from mycobacterium tuberculosis (see paper)
64% identity, 98% coverage: 5:249/250 of query aligns to 2:245/245 of 5ugvA

query
sites
5ugvA
L
 
M
A
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
|
G
A
 
A
R
 
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
E
I
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
D
 
P
R
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
T
-
 
D
-
 
G
A
 
N
A
 
T
D
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
H
P
 
P
D
 
D
A
x
V
V
 
V
L
 
M
D
 
G
N
 
N
V
 
L
R
 
E
W
 
F
C
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
N
G
 
G
R
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
F
T
 
Q
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
G
 
S
W
 
W
L
 
L
G
 
V
D
 
A
A
 
K
P
 
P
K
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
M
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
K
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
D
 
D
S
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
L
H
 
H
H
 
H
P
 
P
N
 
H
K
 
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
A
 
P
P
 
P
G
 
N
G
 
-
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
S
T
 
T
A
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
Y
 
L
D
 
D
R
 
R
T
 
T
S
 
S
F
 
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

5tjzA Structure of 4-hydroxytetrahydrodipicolinate reductase from mycobacterium tuberculosis with NADPH and 2,6 pyridine dicarboxylic acid (see paper)
64% identity, 98% coverage: 5:249/250 of query aligns to 2:245/245 of 5tjzA

query
sites
5tjzA
L
 
M
A
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
|
G
A
 
A
R
 
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
S
 
A
T
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
E
I
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
D
 
P
R
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
T
-
 
D
-
 
G
A
 
N
A
 
T
D
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
H
P
 
P
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
M
D
 
G
N
 
N
V
 
L
R
 
E
W
 
F
C
 
L
V
 
I
E
 
D
A
 
N
G
 
G
R
 
I
H
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
F
T
 
Q
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
G
 
S
W
 
W
L
 
L
G
 
V
D
 
A
A
 
K
P
 
P
K
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
G
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
M
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
K
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
D
 
D
S
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
|
H
P
 
P
N
 
H
K
|
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
R
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
A
 
P
P
 
P
G
 
N
G
 
-
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
S
T
 
T
A
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
A
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
|
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
Y
 
L
D
 
D
R
 
R
T
 
T
S
 
S
F
|
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

5eesA Crystal structure of dapb in complex with NADP+ from corynebacterium glutamicum (see paper)
59% identity, 98% coverage: 5:249/250 of query aligns to 2:247/247 of 5eesA

query
sites
5eesA
L
 
I
A
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
|
G
A
 
A
R
 
K
G
|
G
R
|
R
M
x
V
G
 
G
S
 
Q
T
 
T
V
 
I
C
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
N
A
 
E
A
 
S
G
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
E
I
 
I
D
x
G
A
x
V
G
 
D
D
 
D
D
 
D
R
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
V
-
 
D
-
 
N
A
 
G
A
 
A
D
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
M
D
 
G
N
 
N
V
 
L
R
 
E
W
 
F
C
 
C
V
 
I
E
 
N
A
 
N
G
 
G
R
 
I
H
 
S
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
D
E
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
E
T
 
Q
V
 
V
R
 
R
G
 
D
W
 
W
L
 
L
G
 
E
D
 
G
A
 
K
P
 
D
K
 
N
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
G
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
T
M
 
M
M
 
V
F
 
F
A
 
S
A
 
K
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
D
 
E
S
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
|
H
P
 
P
N
 
N
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
R
 
I
R
 
H
T
 
T
A
 
A
E
 
Q
L
 
G
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
-
P
 
D
G
 
A
G
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
E
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
M
A
 
S
G
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Q
 
E
E
 
Q
V
 
V
L
 
I
L
 
F
G
 
G
G
 
T
A
 
Q
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
I
R
 
K
H
 
Q
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
T
 
N
S
 
S
F
|
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
R
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
H
L
 
Y
L
 
L
D
 
G
L
 
L

5eerA Crystal structure of dapb from corynebacterium glutamicum (see paper)
59% identity, 98% coverage: 5:249/250 of query aligns to 2:247/247 of 5eerA

query
sites
5eerA
L
 
I
A
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
V
G
 
G
S
 
Q
T
 
T
V
 
I
C
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
N
A
 
E
A
 
S
G
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
E
I
 
I
D
 
G
A
 
V
G
 
D
D
 
D
D
 
D
R
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
V
-
 
D
-
 
N
A
 
G
A
 
A
D
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
T
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
M
D
 
G
N
 
N
V
 
L
R
 
E
W
 
F
C
 
C
V
 
I
E
 
N
A
 
N
G
 
G
R
 
I
H
 
S
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
D
E
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
E
T
 
Q
V
 
V
R
 
R
G
 
D
W
 
W
L
 
L
G
 
E
D
 
G
A
 
K
P
 
D
K
 
N
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
T
M
 
M
M
 
V
F
 
F
A
 
S
A
 
K
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
D
 
E
S
 
S
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
|
H
P
 
P
N
 
N
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
R
 
I
R
 
H
T
 
T
A
 
A
E
 
Q
L
 
G
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
-
P
 
D
G
 
A
G
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
E
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
M
A
 
S
G
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Q
 
E
E
 
Q
V
 
V
L
 
I
L
 
F
G
 
G
G
 
T
A
 
Q
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
I
R
 
K
H
 
Q
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
T
 
N
S
 
S
F
 
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
R
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
H
L
 
Y
L
 
L
D
 
G
L
 
L

5z2fA NADPH/pda bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
41% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 5:265/265 of 5z2fA

query
sites
5z2fA
V
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
G
G
 
G
A
 
P
R
|
R
G
|
G
R
x
K
M
|
M
G
 
G
S
 
Q
T
 
E
V
 
A
C
 
V
A
 
H
A
 
T
V
 
V
E
 
M
A
 
N
A
 
N
G
 
E
D
 
N
L
 
M
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
V
I
 
L
D
|
D
A
x
H
G
x
K
D
 
D
D
 
I
R
 
G
A
 
D
A
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
E
A
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
F
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
K
-
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
L
D
 
D
F
x
L
T
|
T
T
 
T
P
 
P
D
 
H
A
 
Q
V
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
H
V
 
T
R
 
M
W
 
L
C
 
C
V
 
L
E
 
Q
A
 
N
G
 
N
R
 
V
H
 
R
V
 
P
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
D
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
T
 
Q
T
 
Q
V
 
C
R
 
T
G
 
-
W
 
I
L
 
L
G
 
A
D
 
E
A
 
V
P
 
N
K
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
C
L
 
I
V
 
V
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
G
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
M
M
 
M
M
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
S
R
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
A
F
 
Y
F
 
F
D
 
P
S
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
M
H
|
H
H
|
H
P
 
D
N
 
Q
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
R
 
Y
R
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
V
R
 
R
E
 
P
A
 
S
A
 
H
G
 
-
L
 
-
A
 
K
P
 
Q
G
 
G
G
 
H
P
 
P
D
 
N
A
 
E
T
 
K
A
 
E
T
 
T
A
 
-
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
Y
A
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
I
H
 
H
A
 
S
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
|
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
E
G
 
G
E
 
Q
T
 
L
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
N
R
 
R
T
 
Q
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
T
L
 
F
A
 
S
V
 
I
R
 
N
R
 
Q
I
 
V
A
 
M
D
 
E
R
 
I
P
 
K
G
 
E
L
 
L
T
 
V
V
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
I
L
 
L

5z2eA Dipicolinate bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
41% identity, 96% coverage: 7:247/250 of query aligns to 5:265/265 of 5z2eA

query
sites
5z2eA
V
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
G
G
 
G
A
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
M
 
M
G
 
G
S
 
Q
T
 
E
V
 
A
C
 
V
A
 
H
A
 
T
V
 
V
E
 
M
A
 
N
A
 
N
G
 
E
D
 
N
L
 
M
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
H
G
 
K
D
 
D
D
 
I
R
 
G
A
 
D
A
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
E
A
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
F
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
K
-
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
L
D
 
D
F
 
L
T
 
T
T
 
T
P
 
P
D
 
H
A
 
Q
V
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
H
V
 
T
R
 
M
W
 
L
C
 
C
V
 
L
E
 
Q
A
 
N
G
 
N
R
 
V
H
 
R
V
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
D
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
T
 
Q
T
 
Q
V
 
C
R
 
T
G
 
-
W
 
I
L
 
L
G
 
A
D
 
E
A
 
V
P
 
N
K
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
C
L
 
I
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
G
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
M
M
 
M
M
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
S
R
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
A
F
 
Y
F
 
F
D
 
P
S
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
M
H
|
H
H
|
H
P
 
D
N
 
Q
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
R
 
Y
R
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
V
R
 
R
E
 
P
A
 
S
A
 
H
G
 
-
L
 
-
A
 
K
P
 
Q
G
 
G
G
 
H
P
 
P
D
 
N
A
 
E
T
 
K
A
 
E
T
 
T
A
 
-
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
Y
A
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
I
H
 
H
A
 
S
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
E
G
 
G
E
 
Q
T
 
L
L
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
N
R
 
R
T
 
Q
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
T
L
 
F
A
 
S
V
 
I
R
 
N
R
 
Q
I
 
V
A
 
M
D
 
E
R
 
I
P
 
K
G
 
E
L
 
L
T
 
V
V
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
I
L
 
L

5wolA Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase dapb from coxiella burnetii
41% identity, 97% coverage: 5:247/250 of query aligns to 2:230/230 of 5wolA

query
sites
5wolA
L
 
I
A
 
N
V
 
V
G
 
I
V
 
I
L
x
N
G
 
G
A
 
I
R
 
N
G
|
G
R
x
K
M
|
M
G
 
G
S
 
R
T
 
V
V
 
V
C
 
K
A
 
E
A
 
N
V
 
I
E
 
T
A
 
A
A
 
Q
G
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
G
I
 
T
D
x
G
A
x
R
G
 
Q
D
 
D
D
 
D
R
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
T
A
 
I
A
 
Q
-
 
T
-
 
T
-
 
H
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
|
T
P
 
P
D
 
Q
A
x
S
V
 
V
L
 
F
D
 
H
N
 
N
V
 
A
R
 
E
W
 
I
C
 
I
V
 
I
E
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
A
H
 
R
V
 
P
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
L
D
 
T
D
 
L
E
 
E
R
 
Q
L
 
I
T
 
A
T
 
L
V
 
L
R
 
D
G
 
K
W
 
Q
L
 
C
G
 
R
D
 
N
A
 
K
P
 
-
K
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
G
 
S
V
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
M
M
 
M
M
 
K
F
 
Y
A
 
A
A
 
K
R
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
H
F
 
Y
F
 
F
D
 
P
S
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
M
H
|
H
H
 
H
P
 
S
N
 
Q
K
|
K
V
 
I
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
|
T
A
 
A
R
 
I
R
x
K
T
 
T
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
V
 
I
A
 
G
Q
 
E
A
 
M
R
 
R
E
 
S
A
 
S
A
 
R
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
E
R
 
I
V
 
K
A
 
N
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
I
H
 
H
A
 
S
V
 
I
R
 
R
L
 
L
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
F
A
 
S
H
 
H
Q
 
Q
E
 
S
V
 
V
L
 
I
L
 
F
G
 
G
G
 
S
A
 
N
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
G
Y
 
M
D
 
D
R
 
R
T
 
N
S
 
C
F
 
T
M
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
I
L
 
F
L
 
M
A
 
A
V
 
C
R
 
R
R
 
K
I
 
V
A
 
M
D
 
E
R
 
L
P
 
D
G
 
Y
L
 
L
T
 
V
V
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
N
L
 
L
L
 
L

4ywjA Crystal structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase (htpa reductase) from pseudomonas aeruginosa
34% identity, 89% coverage: 7:229/250 of query aligns to 4:247/268 of 4ywjA

query
sites
4ywjA
V
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
A
R
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
S
 
K
T
 
N
V
 
L
C
 
I
A
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
Q
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
D
 
G
L
 
A
A
 
A
-
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
|
D
-
x
R
-
 
P
-
 
D
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
L
A
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
L
R
 
G
A
 
K
A
 
V
L
 
C
A
 
E
A
 
E
A
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
H
P
 
P
D
 
S
A
x
V
V
 
T
L
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
I
R
 
E
W
 
Q
C
 
C
V
 
R
E
 
K
A
 
A
G
 
R
R
 
R
H
 
A
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
S
-
 
A
D
 
D
E
 
E
R
 
K
L
 
L
T
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
W
 
L
L
 
L
G
 
A
D
 
E
A
 
A
P
 
A
K
 
K
-
 
D
V
 
I
G
 
P
V
 
I
L
 
V
V
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
F
|
F
G
 
S
V
 
V
A
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
M
 
C
M
 
L
M
 
K
F
 
L
A
 
L
A
 
D
R
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
V
F
 
L
D
 
G
S
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
 
H
P
 
R
N
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
E
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
-
 
L
-
 
G
R
 
R
E
 
D
A
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
V
G
 
Y
G
 
G
P
 
R
D
 
E
A
 
G
T
 
Q
A
 
T
T
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
A
A
 
R
R
 
E
V
 
T
A
 
I
G
 
G
V
 
F
P
 
A
V
 
T
H
 
-
A
 
-
V
 
V
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
V
V
 
V
A
 
G
H
 
D
Q
 
H
E
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
F
G
 
A
G
 
A
A
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
V
T
 
E
L
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
Y
 
S
D
 
S
R
|
R
T
 
M
S
 
T
F
|
F
M
 
A
P
 
R
G
 
G
V
 
A
L
 
V
L
 
R
A
 
A

5tejB Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
32% identity, 76% coverage: 49:237/250 of query aligns to 70:254/269 of 5tejB

query
sites
5tejB
D
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
A
P
 
P
D
 
A
A
x
S
V
 
T
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
L
R
 
A
W
 
L
C
 
C
V
 
Q
E
 
Q
A
 
Y
G
 
G
R
 
K
H
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
T
 
E
T
 
Q
V
 
I
R
 
D
G
 
L
W
 
V
L
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
P
 
Q
K
 
Q
V
 
V
G
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
x
Y
G
 
S
V
 
V
A
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
M
 
V
M
 
F
M
 
K
F
 
L
A
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
F
 
Y
D
 
C
S
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
|
H
P
 
R
N
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
R
 
I
R
 
G
T
 
M
A
 
G
E
 
E
L
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
R
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
M
A
 
G
P
 
N
G
 
K
G
 
L
P
 
S
D
 
D
A
 
V
T
 
A
A
 
V
T
 
Y
A
 
A
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
T
A
 
K
G
 
D
-
 
E
V
 
I
P
 
G
V
 
F
H
 
A
A
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
L
 
F
G
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
V
T
 
E
L
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
Y
 
T
D
 
D
R
 
R
T
 
M
S
 
T
F
|
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
V
R
 
W
I
 
L
A
 
H
D
 
E
R
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5tejA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
32% identity, 76% coverage: 49:237/250 of query aligns to 70:254/269 of 5tejA

query
sites
5tejA
D
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
A
P
 
P
D
 
A
A
x
S
V
 
T
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
L
R
 
A
W
 
L
C
 
C
V
 
Q
E
 
Q
A
 
Y
G
 
G
R
 
K
H
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
T
 
E
T
 
Q
V
 
I
R
 
D
G
 
L
W
 
V
L
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
P
 
Q
K
 
Q
V
 
V
G
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
A
P
|
P
N
 
N
F
 
Y
G
 
S
V
 
V
A
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
M
 
V
M
 
F
M
 
K
F
 
L
A
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
F
 
Y
D
 
C
S
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
 
H
P
 
R
N
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
I
R
 
G
T
 
M
A
 
G
E
 
E
L
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
R
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
M
A
 
G
P
 
N
G
 
K
G
 
L
P
 
S
D
 
D
A
 
V
T
 
A
A
 
V
T
 
Y
A
 
A
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
T
A
 
K
G
 
D
-
 
E
V
 
I
P
 
G
V
 
F
H
 
A
A
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
L
 
F
G
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
V
T
 
E
L
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
Y
 
T
D
 
D
R
 
R
T
 
M
S
 
T
F
 
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
V
R
 
W
I
 
L
A
 
H
D
 
E
R
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5temA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,6 pyridine dicarboxylic and nadh (see paper)
32% identity, 76% coverage: 49:237/250 of query aligns to 70:254/266 of 5temA

query
sites
5temA
D
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
A
P
 
P
D
 
A
A
x
S
V
 
T
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
L
R
 
A
W
 
L
C
 
C
V
 
Q
E
 
Q
A
 
Y
G
 
G
R
 
K
H
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
T
 
E
T
 
Q
V
 
I
R
 
D
G
 
L
W
 
V
L
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
P
 
Q
K
 
Q
V
 
V
G
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
x
Y
G
 
S
V
 
V
A
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
M
 
V
M
 
F
M
 
K
F
 
L
A
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
F
 
Y
D
 
C
S
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
|
H
P
 
R
N
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
R
 
I
R
 
G
T
 
M
A
 
G
E
 
E
L
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
R
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
M
A
 
G
P
 
N
G
 
K
G
 
L
P
 
S
D
 
D
A
 
V
T
 
A
A
 
V
T
 
Y
A
 
A
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
T
A
 
K
G
 
D
-
 
E
V
 
I
P
 
G
V
 
F
H
 
A
A
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
L
 
F
G
 
A
G
 
D
A
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
V
T
 
E
L
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
Y
 
T
D
 
D
R
 
R
T
 
M
S
 
T
F
|
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
V
R
 
W
I
 
L
A
 
H
D
 
E
R
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q9X1K8 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
29% identity, 94% coverage: 5:239/250 of query aligns to 1:205/216 of Q9X1K8

query
sites
Q9X1K8
L
 
M
A
 
K
V
 
Y
G
 
G
V
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
Y
R
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
S
 
Q
T
 
E
V
 
I
C
 
Q
A
 
K
A
 
V
V
 
F
E
 
S
A
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
H
L
 
-
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
L
A
 
K
I
 
V
D
 
D
A
 
V
G
 
-
D
 
N
D
 
G
R
 
V
A
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
D
A
 
S
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
S
T
 
S
P
 
P
D
 
E
A
 
A
V
 
L
L
 
P
D
 
K
N
 
T
V
 
V
R
 
D
W
 
L
C
 
C
V
 
K
E
 
K
A
 
Y
G
 
R
R
 
A
H
 
G
V
 
L
V
 
V
V
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
A
F
 
L
D
 
K
D
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
L
T
 
Q
T
 
M
V
 
L
R
 
R
G
 
E
W
 
L
L
 
S
G
 
K
D
 
E
A
 
V
P
 
P
K
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
V
L
 
V
V
 
Q
A
|
A
P
x
Y
N
|
N
F
|
F
G
 
S
V
 
I
A
 
G
A
 
I
V
 
N
L
 
V
M
 
L
M
 
K
M
 
R
F
 
F
A
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
L
A
 
V
R
 
K
F
 
V
F
 
L
D
 
E
S
 
D
-
 
W
-
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
T
H
 
H
H
 
H
P
 
R
N
 
F
K
|
K
V
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
E
G
 
S
A
 
A
R
 
L
G
 
G
A
 
K
R
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
I
H
 
H
A
 
S
V
 
L
R
 
R
L
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
P
A
 
G
H
 
D
Q
 
H
E
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
F
G
 
G
G
 
N
A
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
I
T
 
E
L
 
I
R
 
K
H
 
H
D
 
R
S
 
A
Y
 
I
D
 
S
R
 
R
T
 
T
S
 
V
F
 
F
M
 
A
P
 
I
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
E
R
 
F
I
 
L
A
 
V
D
 
G
R
 
K
-
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
M

1vm6B Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase (tm1520) from thermotoga maritima at 2.27 a resolution
29% identity, 94% coverage: 4:239/250 of query aligns to 5:210/218 of 1vm6B

query
sites
1vm6B
Q
 
H
L
 
M
A
 
K
V
 
Y
G
 
G
V
 
I
L
 
V
G
|
G
A
 
Y
R
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
S
 
Q
T
 
E
V
 
I
C
 
Q
A
 
K
A
 
V
V
 
F
E
 
S
A
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
H
L
 
-
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
L
A
 
K
I
 
V
D
|
D
A
x
V
G
 
-
D
 
N
D
 
G
R
 
V
A
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
D
A
 
S
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
x
S
T
x
S
P
 
P
D
x
E
A
|
A
V
 
L
L
 
P
D
 
K
N
 
T
V
 
V
R
 
D
W
 
L
C
 
C
V
 
K
E
 
K
A
 
Y
G
 
R
R
 
A
H
 
G
V
 
L
V
 
V
V
 
L
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
A
F
 
L
D
 
K
D
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
L
T
 
Q
T
 
M
V
 
L
R
 
R
G
 
E
W
 
L
L
 
S
G
 
K
D
 
E
A
 
V
P
 
P
K
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
V
L
 
V
V
 
Q
A
 
A
P
x
Y
N
|
N
F
|
F
G
 
S
V
 
I
A
 
G
A
 
I
V
 
N
L
 
V
M
 
L
M
 
K
M
 
R
F
 
F
A
 
L
A
 
S
R
 
E
A
 
L
A
 
V
R
 
K
F
 
V
F
 
L
D
 
E
S
 
D
-
 
W
-
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
T
H
|
H
H
 
H
P
 
R
N
 
F
K
|
K
V
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
E
G
 
S
A
 
A
R
 
L
G
 
G
A
 
K
R
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
I
H
 
H
A
 
S
V
 
L
R
 
R
L
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
P
A
 
G
H
 
D
Q
 
H
E
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
F
G
 
G
G
 
N
A
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
I
T
 
E
L
 
I
R
 
K
H
 
H
D
 
R
S
 
A
Y
 
I
D
 
S
R
 
R
T
 
T
S
 
V
F
|
F
M
 
A
P
 
I
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
E
R
 
F
I
 
L
A
 
V
D
 
G
R
 
K
-
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
M

1drwA Escherichia coli dhpr/nhdh complex (see paper)
29% identity, 99% coverage: 4:250/250 of query aligns to 4:270/272 of 1drwA

query
sites
1drwA
Q
 
N
L
 
I
A
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
A
G
|
G
A
 
A
R
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
S
 
R
T
 
Q
V
 
L
C
 
I
A
 
Q
A
 
A
V
 
A
E
 
L
A
 
A
A
 
L
G
 
E
D
 
G
L
 
V
A
 
Q
L
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
L
D
x
E
A
x
R
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
L
G
 
G
D
 
S
D
 
D
R
 
A
A
 
G
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
x
R
P
 
P
D
 
E
A
 
G
V
 
T
L
 
L
D
 
N
N
 
H
V
 
L
R
 
A
W
 
F
C
 
C
V
 
R
E
 
Q
A
 
H
G
 
G
R
 
K
H
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
E
E
 
A
R
 
G
L
 
K
T
 
Q
T
 
A
V
 
I
R
 
R
G
 
D
W
 
A
L
 
A
G
 
A
D
 
D
A
 
I
P
 
A
K
 
I
V
 
V
G
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
F
|
F
G
 
S
V
 
V
A
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
M
 
M
M
 
L
M
 
K
F
 
L
A
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
F
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
F
 
Y
D
 
T
S
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
 
H
P
 
R
N
 
H