SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_041939957.1 NCBI__GCF_000058485.1:WP_041939957.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1uimA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8, orthorhombic crystal form (see paper)
40% identity, 78% coverage: 67:399/425 of query aligns to 3:324/350 of 1uimA

query
sites
1uimA
P
 
P
A
 
P
N
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
V
 
R
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
V
G
 
S
H
 
-
D
 
E
P
 
K
A
 
T
R
 
P
R
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
E
G
 
G
W
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
P
-
 
L
-
 
K
A
 
G
P
 
P
R
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
M
 
I
K
 
R
T
 
-
L
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
D
 
Y
D
 
E
S
 
G
A
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
S
A
 
K
A
 
A
R
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
F
 
A
T
 
Q
T
 
A
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
 
T
A
 
A
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
A
D
 
G
L
 
Y
E
 
V
A
 
A
-
 
L
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
S
 
Q
T
 
S
G
 
L
V
 
V
Y
 
H
G
 
G
G
 
A
T
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
Q
I
 
V
Q
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
R
L
 
L
C
 
T
S
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
T
G
 
E
E
 
A
Y
 
F
E
 
P
W
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
-
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
H
Y
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
H
Q
 
Y
V
 
H
V
 
A
V
 
L
P
 
P
I
 
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
L
 
I
T
 
T
K
 
A
V
 
H
D
 
W
K
 
M
A
 
G
F
 
Y
G
 
K
E
 
A
L
 
Y
G
 
H
K
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
K
V
 
A
E
 
K
P
 
R
T
 
L
P
|
P
Y
 
-
R
 
R
V
 
M
F
 
L
G
|
G
A
 
F
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
V
A
 
-
A
 
-
F
 
L
A
 
G
R
 
R
G
 
P
V
 
V
D
 
E
T
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
R
 
R
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
T
S
x
A
L
 
I
S
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
Q
Y
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
R
V
 
A
A
 
K
R
 
E
R
 
E
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
E
D
 
A
V
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
F
G
 
A
M
 
Y
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
 
C
E
|
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
V
 
A
T
 
A
V
 
M
A
 
A
N
 
G
L
 
V
R
 
F
R
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
R
L
 
L
D
 
E
P
 
P
A
 
E
A
 
S
E
 
T
T
 
V
V
 
V
I
 
L
Y
 
T
N
 
L
T
|
T
G
|
G
D
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
P

3aeyA Apo form of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
40% identity, 78% coverage: 67:399/425 of query aligns to 2:323/350 of 3aeyA

query
sites
3aeyA
P
 
P
A
 
P
N
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
V
 
R
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
V
G
 
S
H
 
-
D
 
E
P
 
K
A
 
T
R
 
P
R
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
E
G
 
G
W
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
P
-
 
L
-
 
K
A
 
G
P
 
P
R
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
M
 
I
K
 
R
T
 
-
L
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
D
 
Y
D
 
E
S
 
G
A
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
S
A
 
K
A
 
A
R
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
F
 
A
T
 
Q
T
 
A
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
|
G
N
|
N
L
x
T
A
 
A
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
A
D
 
G
L
 
Y
E
 
V
A
 
A
-
 
L
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
S
 
Q
T
 
S
G
 
L
V
 
V
Y
 
H
G
 
G
G
 
A
T
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
Q
I
 
V
Q
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
R
L
 
L
C
 
T
S
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
T
G
 
E
E
 
A
Y
 
F
E
 
P
W
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
-
N
x
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
H
Y
x
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
H
Q
 
Y
V
 
H
V
 
A
V
 
L
P
 
P
I
 
V
A
 
G
S
x
N
G
 
A
S
 
G
L
 
N
L
 
I
T
 
T
K
 
A
V
 
H
D
 
W
K
 
M
A
 
G
F
 
Y
G
 
K
E
 
A
L
 
Y
G
 
H
K
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
K
V
 
A
E
 
K
P
 
R
T
 
L
P
|
P
Y
 
-
R
 
R
V
 
M
F
 
L
G
|
G
A
 
F
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
V
A
 
-
A
 
-
F
 
L
A
 
G
R
|
R
G
 
P
V
|
V
D
x
E
T
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
R
|
R
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
T
S
x
A
L
 
I
S
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
Q
Y
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
R
V
 
A
A
 
K
R
 
E
R
 
E
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
E
D
 
A
V
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
F
G
 
A
M
 
Y
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
 
C
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
V
 
A
T
 
A
V
 
M
A
 
A
N
 
G
L
 
V
R
 
F
R
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
R
L
 
L
D
 
E
P
 
P
A
 
E
A
 
S
E
 
T
T
 
V
V
 
V
I
 
L
Y
 
T
N
 
L
T
|
T
G
 
G
D
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
P

3aexA Catalytic intermediate analogue of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
40% identity, 78% coverage: 67:399/425 of query aligns to 3:324/351 of 3aexA

query
sites
3aexA
P
 
P
A
 
P
N
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
V
 
R
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
V
G
 
S
H
 
-
D
 
E
P
 
K
A
 
T
R
 
P
R
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
E
G
 
G
W
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
P
-
 
L
-
 
K
A
 
G
P
 
P
R
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
M
 
I
K
 
R
T
 
-
L
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
D
 
Y
D
 
E
S
 
G
A
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
S
A
 
K
A
 
A
R
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
F
 
A
T
 
Q
T
 
A
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
x
T
A
 
A
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
A
D
 
G
L
 
Y
E
 
V
A
 
A
-
 
L
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
S
 
Q
T
 
S
G
 
L
V
 
V
Y
 
H
G
 
G
G
 
A
T
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
Q
I
 
V
Q
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
R
L
 
L
C
 
T
S
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
T
G
 
E
E
 
A
Y
 
F
E
 
P
W
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
|
N
V
 
-
N
x
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
H
Y
x
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
H
Q
 
Y
V
 
H
V
 
A
V
 
L
P
 
P
I
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
L
 
I
T
 
T
K
 
A
V
 
H
D
 
W
K
 
M
A
 
G
F
 
Y
G
 
K
E
 
A
L
 
Y
G
 
H
K
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
K
V
 
A
E
 
K
P
 
R
T
 
L
P
|
P
Y
 
-
R
 
R
V
 
M
F
 
L
G
|
G
A
 
F
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
V
A
 
-
A
 
-
F
 
L
A
 
G
R
 
R
G
 
P
V
 
V
D
 
E
T
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
R
 
R
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
T
S
x
A
L
x
I
S
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
Q
Y
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
R
V
 
A
A
 
K
R
 
E
R
 
E
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
E
D
 
A
V
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
F
G
 
A
M
 
Y
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
 
C
E
|
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
V
 
A
T
 
A
V
 
M
A
 
A
N
 
G
L
 
V
R
 
F
R
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
R
L
 
L
D
 
E
P
 
P
A
 
E
A
 
S
E
 
T
T
 
V
V
 
V
I
 
L
Y
 
T
N
 
L
T
|
T
G
 
G
D
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
P

1v7cA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 in complex with a substrate analogue (see paper)
40% identity, 78% coverage: 67:399/425 of query aligns to 3:324/351 of 1v7cA

query
sites
1v7cA
P
 
P
A
 
P
N
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
V
 
R
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
V
G
 
S
H
 
-
D
 
E
P
 
K
A
 
T
R
 
P
R
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
E
G
 
G
W
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
P
-
 
L
-
 
K
A
 
G
P
 
P
R
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
M
 
I
K
 
R
T
 
-
L
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
D
 
Y
D
 
E
S
 
G
A
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
S
A
 
K
A
 
A
R
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
F
 
A
T
 
Q
T
 
A
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
x
T
A
 
A
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
A
D
 
G
L
 
Y
E
 
V
A
 
A
-
 
L
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
S
 
Q
T
 
S
G
 
L
V
 
V
Y
 
H
G
 
G
G
 
A
T
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
Q
I
 
V
Q
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
x
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
R
L
 
L
C
 
T
S
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
T
G
 
E
E
 
A
Y
 
F
E
 
P
W
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
|
N
V
 
-
N
x
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
H
Y
x
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
H
Q
 
Y
V
 
H
V
 
A
V
 
L
P
 
P
I
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
L
 
I
T
 
T
K
 
A
V
 
H
D
 
W
K
 
M
A
 
G
F
 
Y
G
 
K
E
 
A
L
 
Y
G
 
H
K
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
K
V
 
A
E
 
K
P
 
R
T
 
L
P
|
P
Y
 
-
R
 
R
V
 
M
F
 
L
G
|
G
A
 
F
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
V
A
 
-
A
 
-
F
 
L
A
 
G
R
 
R
G
 
P
V
 
V
D
 
E
T
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
R
 
R
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
T
S
x
A
L
x
I
S
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
Q
Y
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
R
V
 
A
A
 
K
R
 
E
R
 
E
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
E
D
 
A
V
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
F
G
 
A
M
 
Y
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
 
C
E
|
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
V
 
A
T
 
A
V
 
M
A
 
A
N
 
G
L
 
V
R
 
F
R
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
R
L
 
L
D
 
E
P
 
P
A
 
E
A
 
S
E
 
T
T
 
V
V
 
V
I
 
L
Y
 
T
N
 
L
T
|
T
G
 
G
D
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
P

6nmxA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and appa (see paper)
34% identity, 81% coverage: 70:412/425 of query aligns to 7:333/350 of 6nmxA

query
sites
6nmxA
L
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
K
G
 
E
L
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
V
G
 
-
H
 
T
D
 
D
P
 
Q
A
 
T
R
 
P
R
 
A
V
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
H
A
 
E
G
 
G
W
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
H
A
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
S
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
I
K
 
E
T
 
-
L
 
L
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
D
 
T
D
 
E
S
 
G
A
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
V
V
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
G
F
 
N
T
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
M
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
x
T
A
 
S
Q
 
A
S
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
N
L
 
M
R
 
K
S
 
C
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
P
 
P
H
 
N
-
 
G
D
 
K
L
 
I
E
 
A
A
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
L
V
 
A
S
 
Q
T
 
A
G
 
V
V
 
M
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
T
 
E
L
 
I
V
 
I
A
 
A
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
x
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
K
L
 
I
C
 
V
S
 
R
E
 
S
L
 
I
A
 
C
G
 
E
E
 
K
Y
 
S
E
 
P
W
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
|
N
V
 
-
N
x
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
Y
Y
x
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
E
L
 
A
P
 
P
E
 
D
Q
 
V
V
 
L
V
 
A
V
 
I
P
 
P
I
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
L
 
I
T
 
S
K
 
A
V
 
Y
D
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
K
E
 
E
L
 
Y
G
 
H
K
 
E
L
 
K
G
 
N
L
 
G
V
 
T
E
 
S
P
 
L
T
 
P
P
 
K
Y
 
M
R
 
R
V
 
G
F
 
F
G
x
E
A
 
A
Q
 
E
A
 
G
A
x
S
G
 
-
C
 
-
N
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
V
R
 
R
G
 
N
V
 
-
D
 
E
T
 
V
V
 
I
A
 
E
P
 
-
V
 
-
R
 
N
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
x
A
L
x
I
S
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
D
Y
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
K
V
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
E
T
 
S
G
 
N
G
 
G
A
 
K
I
 
I
T
 
D
D
 
E
V
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
H
G
 
A
M
 
Y
R
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
A
E
|
E
T
 
P
A
 
G
G
 
S
G
 
C
V
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
N
 
G
L
 
V
R
 
L
R
 
K
L
 
Q
L
 
V
R
 
K
E
 
S
G
 
G
L
 
E
L
 
I
D
 
P
P
 
K
A
 
G
A
 
S
E
 
K
T
 
V
V
 
V
I
 
A
Y
 
V
N
 
L
T
|
T
G
 
G
D
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
P
L
 
-
V
 
-
E
 
N
T
 
T
G
 
A
G
 
V
P
 
D
T
 
I
A
 
S
T
 
E
I
 
I
K
 
K
P
 
P

6cgqB Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
34% identity, 81% coverage: 70:412/425 of query aligns to 5:331/345 of 6cgqB

query
sites
6cgqB
L
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
K
G
 
E
L
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
V
G
 
T
H
 
-
D
 
D
P
 
Q
A
 
T
R
 
P
R
 
A
V
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
H
A
 
E
G
 
G
W
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
H
A
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
S
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
I
K
 
E
T
 
-
L
 
L
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
D
 
T
D
 
E
S
 
G
A
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
V
V
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
G
F
 
N
T
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
M
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
x
T
A
 
S
Q
 
A
S
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
N
L
 
M
R
 
K
S
 
C
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
P
 
P
H
 
N
-
 
G
D
 
K
L
 
I
E
 
A
A
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
L
V
 
A
S
 
Q
T
 
A
G
 
V
V
 
M
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
T
 
E
L
 
I
V
 
I
A
 
A
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
K
L
 
I
C
 
V
S
 
R
E
 
S
L
 
I
A
 
C
G
 
E
E
 
K
Y
 
S
E
 
P
W
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
|
N
V
 
-
N
x
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
Y
Y
x
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
E
L
 
A
P
 
P
E
 
D
Q
 
V
V
 
L
V
 
A
V
 
I
P
 
P
I
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
 
G
L
x
N
L
 
I
T
 
S
K
 
A
V
 
Y
D
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
K
E
 
E
L
 
Y
G
 
H
K
 
E
L
 
K
G
 
N
L
 
G
V
 
T
E
 
S
P
 
L
T
 
P
P
 
K
Y
 
M
R
 
R
V
 
G
F
 
F
G
x
E
A
 
A
Q
 
E
A
 
G
A
x
S
G
 
-
C
 
-
N
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
V
R
 
R
G
 
N
V
 
-
D
 
E
T
 
V
V
 
I
A
 
E
P
 
-
V
 
-
R
 
N
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
x
A
L
x
I
S
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
D
Y
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
K
V
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
E
T
 
S
G
 
N
G
 
G
A
 
K
I
 
I
T
 
D
D
 
E
V
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
H
G
 
A
M
 
Y
R
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
A
E
|
E
T
 
P
A
 
G
G
 
S
G
 
C
V
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
N
 
G
L
 
V
R
 
L
R
 
K
L
 
Q
L
 
V
R
 
K
E
 
S
G
 
G
L
 
E
L
 
I
D
 
P
P
 
K
A
 
G
A
 
S
E
 
K
T
 
V
V
 
V
I
 
A
Y
 
V
N
 
L
T
|
T
G
 
G
D
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
P
L
 
-
V
 
-
E
 
N
T
 
T
G
 
A
G
 
V
P
 
D
T
 
I
A
 
S
T
 
E
I
 
I
K
 
K
P
 
P

2zsjA Crystal structure of threonine synthase from aquifex aeolicus vf5
37% identity, 77% coverage: 87:414/425 of query aligns to 22:341/350 of 2zsjA

query
sites
2zsjA
V
 
V
S
 
T
L
 
L
G
 
Y
A
 
E
G
 
G
W
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
E
A
 
A
P
 
D
R
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
A
L
 
I
G
 
G
M
 
F
K
 
K
-
 
G
T
 
K
L
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
D
 
Y
D
 
E
S
 
G
A
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
I
S
 
S
A
 
K
A
 
A
R
 
V
E
 
E
L
 
A
G
 
G
F
 
K
T
 
R
T
 
A
V
 
V
A
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
 
T
A
 
S
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
A
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
V
 
L
P
 
P
H
 
K
D
 
G
L
 
A
E
 
V
A
 
A
-
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
L
V
 
S
S
 
Q
T
 
A
G
 
M
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
T
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
N
 
T
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
N
L
 
I
C
 
V
S
 
R
E
 
K
L
 
I
A
 
G
G
 
E
E
 
N
Y
 
F
E
 
P
W
 
V
A
 
E
F
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
-
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
Y
Y
 
R
A
 
I
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
A
 
C
E
 
D
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
E
L
 
A
P
 
P
E
 
D
Q
 
Y
V
 
H
V
 
F
V
 
I
P
 
P
I
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
L
 
I
T
 
T
K
 
A
V
 
Y
D
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
K
E
 
I
L
 
Y
G
 
Y
K
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
K
V
 
I
E
 
T
P
 
K
T
 
L
P
 
P
Y
 
-
R
 
R
V
 
M
F
 
M
G
 
G
A
 
W
Q
|
Q
A
 
A
A
 
E
G
 
G
C
x
A
N
 
A
P
 
P
V
 
I
A
 
V
A
 
K
A
 
G
F
 
Y
A
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
P
V
 
I
R
 
K
-
 
N
P
 
P
S
 
Q
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
x
A
L
 
I
S
 
K
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
Y
D
 
S
G
 
W
P
 
K
Y
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
K
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
R
 
E
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
K
I
 
I
T
 
D
D
 
A
V
 
V
S
 
S
D
 
D
D
 
S
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
Y
G
 
A
M
 
Y
R
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
S
T
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
C
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
V
 
A
T
 
S
V
 
V
A
 
A
N
 
G
L
 
L
R
 
I
R
 
K
L
 
L
L
 
V
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
F
L
 
F
D
 
K
P
 
G
A
 
G
A
 
E
E
 
V
T
 
V
V
 
T
I
 
C
Y
 
T
N
 
L
T
|
T
G
|
G
D
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
D
L
 
P
D
 
D
P
 
T
L
 
A
V
 
I
E
 
K
T
 
V
G
 
C
G
 
E
P
 
E
T
 
P
A
 
I
T
 
T
I
 
V
K
 
P
P
 
P
S
 
D
L
 
F

6cgqA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
34% identity, 81% coverage: 70:412/425 of query aligns to 3:323/339 of 6cgqA

query
sites
6cgqA
L
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
K
G
 
E
L
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
V
G
 
T
H
 
-
D
 
D
P
 
Q
A
 
T
R
 
P
R
 
A
V
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
H
A
 
E
G
 
G
W
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
H
A
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
S
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
I
K
 
E
T
 
-
L
 
L
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
D
 
T
D
 
E
S
 
G
A
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
V
V
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
G
F
 
N
T
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
M
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
 
T
A
 
S
Q
 
A
S
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
N
L
 
M
R
 
K
S
 
C
V
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
I
P
 
P
H
 
N
D
 
K
L
 
L
E
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
A
S
 
Q
T
 
A
G
 
V
V
 
M
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
T
 
E
L
 
I
V
 
I
A
 
A
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
K
L
 
I
C
 
V
S
 
R
E
 
S
L
 
I
A
 
C
G
 
E
E
 
K
Y
 
S
E
 
P
W
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
-
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
Y
Y
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
E
L
 
A
P
 
P
E
 
D
Q
 
V
V
 
L
V
 
A
V
 
I
P
 
P
I
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
L
 
I
T
 
S
K
 
A
V
 
Y
D
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
K
E
 
E
L
 
Y
G
 
H
K
 
E
L
 
K
G
 
N
L
 
G
V
 
T
E
 
S
P
 
L
T
 
P
P
 
K
Y
 
M
R
 
R
V
 
G
F
 
F
G
x
E
A
 
A
Q
 
E
A
 
G
A
x
S
G
 
-
C
 
-
N
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
V
R
 
R
G
 
N
V
 
-
D
 
E
T
 
V
V
 
I
A
 
E
P
 
-
V
 
-
R
 
N
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
x
A
L
 
I
S
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
D
Y
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
K
V
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
E
T
 
S
G
 
N
G
 
G
A
 
K
I
 
I
T
 
D
D
 
E
V
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
H
G
 
A
M
 
Y
R
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
A
E
|
E
T
 
P
A
 
G
G
 
S
G
 
C
V
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
N
 
G
L
 
V
R
 
L
R
 
K
L
 
Q
L
 
V
R
 
K
E
 
S
G
 
G
L
 
E
L
 
I
D
 
P
P
 
K
A
 
G
A
 
S
E
 
K
T
 
V
V
 
V
I
 
A
Y
 
V
N
 
L
T
|
T
G
|
G
D
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
P
L
 
-
V
 
-
E
 
N
T
 
T
G
 
A
G
 
V
P
 
D
T
 
I
A
 
S
T
 
E
I
 
I
K
 
K
P
 
P

A0R220 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
35% identity, 81% coverage: 67:412/425 of query aligns to 13:347/360 of A0R220

query
sites
A0R220
P
 
P
A
 
G
N
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
A
Y
 
Y
V
 
R
G
 
D
L
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
I
G
 
G
H
 
D
D
 
D
P
 
-
A
 
W
R
 
T
R
 
T
V
 
V
S
 
T
L
 
L
G
 
L
A
 
E
G
 
G
W
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
H
A
 
A
P
 
K
R
 
R
L
 
I
A
 
S
A
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
T
M
 
G
K
 
C
T
 
T
L
 
V
Y
 
H
V
 
L
K
 
K
D
 
V
D
 
E
S
 
G
A
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
V
S
 
T
A
 
E
A
 
S
R
 
L
E
 
A
L
 
R
G
 
G
F
 
Q
T
 
Q
T
 
A
V
 
V
A
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
T
A
 
S
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
T
S
 
C
V
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
Q
-
 
G
D
 
K
L
 
I
E
 
A
A
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
L
V
 
A
S
 
Q
T
 
A
G
 
V
V
 
M
Y
 
H
G
 
G
G
 
A
T
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
Q
I
 
V
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
C
N
 
L
R
 
E
L
 
L
C
 
A
S
 
R
E
x
K
L
 
L
A
 
T
G
 
A
E
 
D
Y
 
F
-
 
P
E
 
T
W
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
-
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
Y
Y
 
R
A
 
I
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
T
L
 
A
P
 
P
E
 
D
Q
 
V
V
 
H
V
 
A
V
 
L
P
 
P
I
 
V
A
 
G
S
 
N
G
 
A
S
 
G
L
 
N
L
 
I
T
 
T
K
 
A
V
 
Y
D
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
Y
G
 
S
E
 
E
L
 
Y
G
 
H
K
 
R
L
 
D
G
 
G
L
 
V
V
 
S
E
 
D
P
 
R
T
 
L
P
 
P
Y
 
-
R
 
R
V
 
M
F
 
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
V
A
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
R
 
K
-
 
D
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
 
A
L
 
I
S
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
N
Y
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
E
V
 
A
A
 
Q
R
 
Q
R
 
Q
T
 
S
G
 
D
G
 
G
A
 
R
I
 
F
T
 
L
D
 
A
V
 
A
S
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
A
G
 
A
M
 
Y
R
 
H
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
V
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
V
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
N
 
G
L
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
S
L
 
V
R
 
E
E
 
D
G
 
G
L
 
W
L
 
V
D
 
K
P
 
R
A
 
G
A
 
S
E
 
T
T
 
V
V
 
V
I
 
C
Y
 
T
N
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
D
L
 
P
D
 
D
P
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
K
T
 
-
G
 
G
G
 
M
P
 
P
T
 
Q
A
 
V
T
 
T
I
 
P
K
 
V
P
 
P

P9WG59 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
34% identity, 78% coverage: 67:398/425 of query aligns to 13:334/360 of P9WG59

query
sites
P9WG59
P
 
P
A
 
G
N
 
V
L
 
I
W
 
A
R
 
A
Y
 
Y
V
 
R
G
 
D
L
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
V
G
 
G
H
 
D
D
 
D
P
 
-
A
 
W
R
 
T
R
 
P
V
 
V
S
 
T
L
 
L
G
 
L
A
 
E
G
 
G
W
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
A
A
 
A
P
 
T
R
 
N
L
 
L
A
 
S
A
 
K
E
 
Q
L
 
T
G
 
G
M
 
C
K
 
-
T
 
T
L
 
I
Y
 
H
V
 
L
K
 
K
D
 
V
D
 
E
S
 
G
A
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
T
A
 
D
A
 
A
R
 
L
E
 
A
L
 
H
G
 
G
F
 
Q
T
 
R
T
 
A
V
 
V
A
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
|
N
L
 
T
A
 
S
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
T
S
 
C
V
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
Q
-
 
G
D
 
K
L
 
I
E
 
A
A
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
L
V
 
A
S
 
Q
T
 
A
G
 
V
V
 
M
Y
 
H
G
 
G
G
 
A
T
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
Q
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
C
N
 
L
R
 
E
L
 
L
C
 
A
S
 
R
E
x
K
L
 
M
A
 
A
G
 
A
E
 
D
Y
 
F
E
 
P
W
 
T
A
 
I
F
 
S
V
 
L
N
 
V
V
 
N
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
V
Y
 
R
A
 
I
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
T
L
 
A
P
 
P
E
 
D
Q
 
V
V
 
H
V
 
A
V
 
L
P
 
P
I
 
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
L
 
I
T
 
T
K
 
A
V
 
Y
D
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
Y
G
 
T
E
 
E
L
 
Y
G
 
H
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
I
E
 
D
P
 
K
T
 
L
P
 
P
Y
 
-
R
 
R
V
 
M
F
 
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
V
A
 
L
A
 
G
F
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
E
P
 
P
V
 
V
-
 
S
R
 
H
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
 
A
L
 
I
S
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
T
Y
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
E
V
 
A
A
 
Q
R
 
Q
R
 
Q
T
 
S
G
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
F
T
 
L
D
 
A
V
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
A
G
 
A
M
 
Y
R
 
H
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
V
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
V
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
V
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
N
 
G
L
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
A
L
 
I
R
 
D
E
 
D
G
 
G
L
 
W
L
 
V
D
 
A
P
 
R
A
 
G
A
 
S
E
 
T
T
 
V
V
 
V
I
 
C
Y
 
T
N
 
V
T
|
T
G
 
G
D
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
D
L
 
P
D
 
D

2d1fA Structure of mycobacterium tuberculosis threonine synthase (see paper)
34% identity, 78% coverage: 67:398/425 of query aligns to 4:325/349 of 2d1fA

query
sites
2d1fA
P
 
P
A
 
G
N
 
V
L
 
I
W
 
A
R
 
A
Y
 
Y
V
 
R
G
 
D
L
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
V
G
 
G
H
 
D
D
 
D
P
 
-
A
 
W
R
 
T
R
 
P
V
 
V
S
 
T
L
 
L
G
 
L
A
 
E
G
 
G
W
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
I
P
 
A
A
 
A
P
 
T
R
 
N
L
 
L
A
 
S
A
 
K
E
 
Q
L
 
T
G
 
G
M
 
C
K
 
-
T
 
T
L
 
I
Y
 
H
V
 
L
K
 
K
D
 
V
D
 
E
S
 
G
A
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
T
A
 
D
A
 
A
R
 
L
E
 
A
L
 
H
G
 
G
F
 
Q
T
 
R
T
 
A
V
 
V
A
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
 
T
A
 
S
Q
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
T
S
 
C
V
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
Q
-
 
G
D
 
K
L
 
I
E
 
A
A
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
L
V
 
A
S
 
Q
T
 
A
G
 
V
V
 
M
Y
 
H
G
 
G
G
 
A
T
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
Q
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
C
N
 
L
R
 
E
L
 
L
C
 
A
S
 
R
E
 
K
L
 
M
A
 
A
G
 
A
E
 
D
Y
 
F
E
 
P
W
 
T
A
 
I
F
 
S
V
 
L
N
 
V
V
 
N
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
V
Y
 
R
A
 
I
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
-
R
 
T
L
 
A
P
 
P
E
 
D
Q
 
V
V
 
H
V
 
A
V
 
L
P
 
P
I
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
L
 
I
T
 
T
K
 
A
V
 
Y
D
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
Y
G
 
T
E
 
E
L
 
Y
G
 
H
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
I
E
x
D
P
 
K
T
 
L
P
 
P
Y
 
-
R
|
R
V
 
M
F
x
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
V
A
 
L
A
 
G
F
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
E
P
 
P
V
 
V
-
 
S
R
 
H
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
x
A
L
 
I
S
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
T
Y
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
E
V
 
A
A
 
Q
R
 
Q
R
 
Q
T
 
S
G
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
F
T
 
L
D
 
A
V
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
A
G
 
A
M
 
Y
R
 
H
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
V
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
V
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
V
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
N
 
G
L
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
A
L
 
I
R
 
D
E
 
D
G
 
G
L
 
W
L
 
V
D
 
A
P
 
R
A
 
G
A
 
S
E
 
T
T
 
V
V
 
V
I
 
C
Y
 
T
N
 
V
T
|
T
G
 
G
D
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
D
L
 
P
D
 
D

Q9S7B5 Threonine synthase 1, chloroplastic; Protein METHIONINE OVER-ACCUMULATOR 2; EC 4.2.3.1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
29% identity, 73% coverage: 87:395/425 of query aligns to 164:477/526 of Q9S7B5

query
sites
Q9S7B5
V
 
V
S
 
S
L
 
A
G
 
F
A
 
E
G
 
G
W
 
N
T
 
S
P
x
N
L
|
L
R
 
F
P
 
W
A
 
A
P
 
E
R
 
R
L
 
F
A
 
G
A
x
K
E
 
Q
-
 
F
L
 
L
G
 
G
M
 
M
K
x
N
T
 
D
L
 
L
Y
 
W
V
 
V
K
 
K
D
 
H
D
 
C
S
 
G
A
 
I
N
 
S
P
 
H
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
D
R
x
L
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
L
L
 
V
S
 
S
A
 
Q
A
 
V
R
 
N
E
 
R
L
 
L
G
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
P
F
 
V
T
 
V
T
 
G
V
 
V
A
 
G
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
D
L
 
T
A
 
S
Q
 
A
S
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A
H
 
Y
A
 
C
A
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
P
S
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
F
V
 
L
P
 
P
-
 
A
H
 
N
D
 
K
L
 
I
E
 
S
A
 
M
G
 
A
K
 
Q
T
 
L
V
 
V
S
 
Q
T
 
P
G
 
I
V
 
A
Y
 
N
G
 
G
G
 
A
T
 
F
L
 
V
V
 
L
A
 
S
I
 
I
Q
 
D
G
 
T
N
 
D
Y
 
F
D
 
D
D
 
G
V
 
C
N
 
M
R
 
K
L
 
L
C
 
I
S
 
R
E
 
E
L
 
I
A
 
T
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
E
 
P
W
 
I
A
 
Y
F
 
L
V
 
A
N
 
N
V
 
-
N
 
S
V
 
L
R
 
N
P
 
S
F
 
L
Y
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
I
E
 
E
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
G
 
D
W
 
W
R
 
Q
L
 
V
P
 
P
E
 
D
Q
 
W
V
 
V
V
 
I
V
 
V
P
 
P
I
 
G
A
 
G
S
 
N
G
 
L
S
 
G
L
 
N
L
 
I
T
 
Y
K
 
A
V
 
F
D
 
Y
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
K
E
 
M
L
 
C
G
 
Q
K
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
D
P
 
R
T
 
I
P
 
P
Y
 
-
R
 
R
V
 
M
F
 
V
G
 
C
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
N
C
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
Y
A
 
L
A
 
H
F
 
Y
A
 
K
R
 
S
G
 
G
V
 
W
D
 
K
T
 
D
V
 
F
A
 
K
P
 
P
V
 
M
R
 
T
P
 
A
S
 
S
-
 
T
T
 
T
I
 
F
A
 
A
K
 
S
S
 
A
L
 
I
S
 
Q
I
 
I
G
 
G
N
 
D
P
 
P
A
 
V
D
 
S
G
 
I
P
 
D
Y
 
R
A
 
A
L
 
V
D
 
Y
V
 
A
A
 
L
R
 
K
R
 
K
T
 
C
G
 
N
G
 
G
A
 
I
I
 
V
T
 
E
D
 
E
V
 
A
S
 
T
D
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
D
G
 
A
M
 
M
R
 
-
L
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
D
T
 
S
E
 
T
G
 
G
I
 
M
F
 
F
G
 
I
E
 
C
T
 
P
A
 
H
G
 
T
G
 
G
V
 
V
T
 
A
V
 
L
A
 
T
N
 
A
L
 
L
R
 
F
R
 
K
L
 
L
L
 
R
R
 
N
E
 
Q
G
 
G
L
 
V
L
 
I
D
 
A
P
 
P
A
 
T
A
 
D
E
 
R
T
 
T
V
 
V
I
 
V
Y
 
V
N
 
S
T
 
T
G
 
A
D
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K

2c2bA Crystallographic structure of arabidopsis thaliana threonine synthase complexed with pyridoxal phosphate and s-adenosylmethionine (see paper)
29% identity, 73% coverage: 87:395/425 of query aligns to 89:402/444 of 2c2bA

query
sites
2c2bA
V
 
V
S
|
S
L
 
A
G
x
F
A
 
E
G
 
G
W
 
N
T
 
S
P
x
N
L
|
L
R
 
F
P
x
W
A
 
A
P
 
E
R
 
R
L
 
F
A
 
G
A
 
K
E
 
Q
-
 
F
L
 
L
G
 
G
M
 
M
K
 
N
T
 
D
L
 
L
Y
x
W
V
 
V
K
 
K
D
 
H
D
 
C
S
 
G
A
 
I
N
 
S
P
 
H
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
L
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
L
L
 
V
S
 
S
A
 
Q
A
 
V
R
 
N
E
 
R
L
 
L
G
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
P
F
 
V
T
 
V
T
 
G
V
 
V
A
 
G
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
x
D
L
 
T
A
 
S
Q
 
A
S
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A
H
 
Y
A
 
C
A
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
P
S
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
F
V
 
L
P
 
P
-
 
A
H
 
N
D
 
K
L
 
I
E
 
S
A
 
M
G
 
A
K
 
Q
T
 
L
V
 
V
S
 
Q
T
 
P
G
 
I
V
 
A
Y
 
N
G
 
G
G
 
A
T
 
F
L
 
V
V
 
L
A
 
S
I
 
I
Q
 
D
G
 
T
N
 
D
Y
 
F
D
 
D
D
 
G
V
 
C
N
 
M
R
 
K
L
 
L
C
 
I
S
 
R
E
 
E
L
 
I
A
 
T
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
E
 
P
W
 
I
A
 
Y
F
 
L
V
 
A
N
 
N
V
 
-
N
 
S
V
 
L
R
 
N
P
 
S
F
 
L
Y
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
I
E
 
E
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
Q
|
Q
L
x
F
G
 
D
W
 
W
R
 
Q
L
 
V
P
 
P
E
 
D
Q
 
W
V
 
V
V
 
I
V
 
V
P
 
P
I
x
G
A
x
G
S
x
N
G
x
L
S
x
G
L
x
N
L
 
I
T
 
Y
K
 
A
V
 
F
D
 
Y
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
K
E
 
M
L
 
C
G
 
Q
K
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
D
P
 
R
T
 
I
P
 
P
Y
 
-
R
 
R
V
 
M
F
 
V
G
 
C
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
N
C
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
Y
A
 
L
A
 
H
F
 
Y
A
 
K
R
 
S
G
 
G
V
 
W
D
 
K
T
 
D
V
 
F
A
 
K
P
 
P
V
 
M
R
 
T
P
 
A
S
 
S
-
 
T
T
 
T
I
 
F
A
 
A
K
 
S
S
x
A
L
 
I
S
 
Q
I
 
I
G
 
G
N
 
D
P
 
P
A
 
V
D
 
S
G
 
I
P
 
D
Y
 
R
A
 
A
L
 
V
D
 
Y
V
 
A
A
 
L
R
 
K
R
 
K
T
 
C
G
 
N
G
 
G
A
 
I
I
 
V
T
 
E
D
 
E
V
 
A
S
 
T
D
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
D
G
 
A
M
 
M
R
 
A
L
 
-
L
 
Q
A
 
A
R
 
D
T
 
S
E
 
T
G
 
G
I
 
M
F
 
F
G
 
I
E
 
C
T
 
P
A
x
H
G
 
T
G
 
G
V
 
V
T
 
A
V
 
L
A
 
T
N
 
A
L
 
L
R
 
F
R
 
K
L
 
L
L
 
R
R
 
N
E
 
Q
G
 
G
L
 
V
L
 
I
D
 
A
P
 
P
A
 
T
A
 
D
E
 
R
T
 
T
V
 
V
I
 
V
Y
 
V
N
 
S
T
|
T
G
 
A
D
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K

Sites not aligning to the query:

2c2gA Crystal structure of threonine synthase from arabidopsis thaliana in complex with its cofactor pyridoxal phosphate (see paper)
29% identity, 73% coverage: 87:395/425 of query aligns to 107:404/448 of 2c2gA

query
sites
2c2gA
V
 
V
S
 
S
L
 
A
G
 
F
A
 
E
G
 
G
W
 
N
T
 
S
P
 
N
L
 
L
R
 
F
P
 
W
A
 
A
P
 
E
R
 
R
L
 
F
A
 
G
A
 
K
E
 
Q
-
 
F
L
 
L
G
 
G
M
 
M
K
 
N
T
 
D
L
 
L
Y
 
W
V
 
V
K
 
K
D
 
H
D
 
C
S
 
G
A
 
I
N
 
S
P
 
H
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
L
V
 
G
V
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
L
L
 
V
S
 
S
A
 
Q
A
 
V
R
 
N
E
 
R
L
 
L
G
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
P
F
 
V
T
 
V
T
 
G
V
 
V
A
 
G
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
 
T
G
 
G
N
 
D
L
x
T
A
 
S
Q
 
A
S
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A
H
 
Y
A
 
C
A
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
P
S
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
F
V
 
L
P
 
P
-
 
A
H
 
N
D
 
K
L
 
I
E
 
S
A
 
M
G
 
A
K
 
Q
T
 
L
V
 
V
S
 
Q
T
 
P
G
 
I
V
 
A
Y
 
N
G
 
G
G
 
A
T
 
F
L
 
V
V
 
L
A
 
S
I
 
I
Q
 
D
G
 
T
N
 
D
Y
 
F
D
 
D
D
 
G
V
 
C
N
 
M
R
 
K
L
 
L
C
 
I
S
 
R
E
 
E
L
 
I
A
 
T
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
E
 
P
W
 
I
A
 
Y
F
 
L
V
 
A
N
 
N
V
 
-
N
x
S
V
 
L
R
 
N
P
 
S
F
 
L
Y
x
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
I
E
 
E
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
G
 
D
W
 
W
R
 
Q
L
 
V
P
 
P
E
 
D
Q
 
W
V
 
V
V
 
I
V
 
V
P
 
P
I
 
G
A
 
G
S
x
N
G
 
L
S
 
G
L
 
N
L
 
I
T
 
Y
K
 
A
V
 
F
D
 
Y
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
K
E
 
M
L
 
C
G
 
Q
K
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
D
P
 
R
T
 
I
P
 
P
Y
 
-
R
 
R
V
 
M
F
 
V
G
 
C
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
N
C
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
Y
A
 
L
A
 
H
F
 
Y
A
 
K
R
 
S
G
 
G
V
 
W
D
 
K
T
 
D
V
 
F
A
 
K
P
 
P
V
 
V
R
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
S
I
 
I
A
 
D
K
 
R
S
 
A
L
 
V
S
 
-
I
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
K
R
 
K
T
 
C
G
 
N
G
 
G
A
 
I
I
 
V
T
 
E
D
 
E
V
 
A
S
 
T
D
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
D
G
 
A
M
 
M
R
 
-
L
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
D
T
 
S
E
 
T
G
 
G
I
 
M
F
 
F
G
 
I
E
 
C
T
 
P
A
 
H
G
 
T
G
 
G
V
 
V
T
 
A
V
 
L
A
 
T
N
 
A
L
 
L
R
 
F
R
 
K
L
 
L
L
 
R
R
 
N
E
 
Q
G
 
G
L
 
V
L
 
I
D
 
A
P
 
P
A
 
T
A
 
D
E
 
R
T
 
T
V
 
V
I
 
V
Y
 
V
N
 
S
T
 
T
G
 
A
D
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K

6zspAAA serine racemase bound to atp and malonate. (see paper)
24% identity, 62% coverage: 105:368/425 of query aligns to 33:281/320 of 6zspAAA

query
sites
6zspAAA
E
 
Q
L
 
L
G
 
T
M
 
G
K
 
R
T
 
N
L
 
L
Y
 
F
V
 
F
K
 
K
D
 
C
D
 
E
S
 
L
A
 
F
N
 
Q
P
x
K
T
|
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
I
R
 
R
V
 
G
V
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
A
L
 
L
S
 
N
A
 
A
A
 
V
R
 
R
E
 
S
L
 
L
G
 
K
F
 
P
T
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
V
C
 
T
A
 
H
S
|
S
T
x
S
G
 
G
N
|
N
L
x
H
A
 
G
Q
|
Q
S
 
A
V
 
L
A
 
T
A
 
Y
H
 
A
A
 
A
A
 
K
G
 
L
A
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
P
S
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
Q
D
 
T
L
 
A
E
 
P
A
 
D
G
 
C
K
 
K
T
 
K
V
 
L
S
 
A
T
 
I
G
 
Q
V
 
A
Y
|
Y
G
 
G
G
 
A
T
 
S
L
 
I
V
 
V
A
 
Y
I
 
C
Q
 
E
G
 
P
N
 
S
Y
 
D
D
 
E
D
 
S
V
x
R
N
 
E
R
 
N
L
 
V
C
 
A
S
 
K
E
 
R
L
 
V
A
 
T
G
 
E
E
 
E
Y
 
T
E
 
E
W
 
G
A
 
I
F
 
M
V
 
V
N
 
H
V
 
P
N
 
N
V
 
Q
R
 
E
P
 
P
F
 
A
Y
 
V
A
 
I
E
 
A
G
 
G
S
 
Q
K
 
G
T
 
T
L
 
I
G
 
A
Y
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
L
E
 
N
Q
 
Q
L
 
V
G
 
P
W
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
V
E
 
D
Q
 
A
V
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
G
S
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
M
L
 
L
T
 
A
K
 
G
V
 
I
D
 
A
K
 
I
A
 
T
F
 
V
G
 
K
E
 
A
L
 
L
G
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
K
P
 
P
T
 
S
P
 
-
Y
 
V
R
 
K
V
 
V
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
Q
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
C
x
A
N
 
D
P
x
D
V
 
C
A
 
Y
A
 
Q
A
 
S
F
 
K
A
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
K
D
 
L
T
 
M
V
 
P
A
 
N
P
 
L
V
 
Y
R
 
P
P
 
P
S
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
D
S
x
G
L
 
V
S
 
-
I
 
-
G
 
-
N
 
K
P
x
S
A
 
S
D
 
I
G
 
G
P
 
L
Y
 
N
A
 
T
L
 
W
D
 
P
V
 
I
A
 
I
R
 
R
R
 
D
T
 
L
G
 
V
G
 
D
A
 
D
I
 
I
T
 
F
D
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
D
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
K
E
 
C
G
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
L
 
V
A
 
W
R
x
E
T
x
R
E
 
M
G
x
K
I
 
L
F
 
L
G
 
I
E
 
E
T
 
P
A
 
T
G
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
G
V
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P04968 L-threonine dehydratase biosynthetic IlvA; Threonine deaminase; EC 4.3.1.19 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 35% coverage: 91:238/425 of query aligns to 29:176/514 of P04968

query
sites
P04968
A
 
A
G
 
Q
W
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
Q
P
 
K
A
 
M
P
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
S
A
 
S
E
 
R
L
 
L
G
 
D
M
 
-
K
 
N
T
 
V
L
 
I
Y
 
L
V
 
V
K
 
K
D
 
R
D
 
E
S
 
D
A
 
R
N
 
Q
P
 
P
T
 
V
H
 
H
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
L
R
 
R
V
 
G
V
 
A
S
 
Y
V
 
A
A
 
M
L
 
M
S
 
A
A
 
G
-
 
L
A
 
T
R
 
E
E
 
E
L
 
Q
G
 
K
F
 
A
T
 
H
T
 
G
V
 
V
A
 
I
C
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
A
G
 
G
N
|
N
L
 
H
A
 
A
Q
 
Q
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
A
G
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
V
R
 
K
S
 
A
V
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
M
P
 
P
H
 
T
D
 
A
L
 
T
E
 
A
A
 
D
G
 
I
K
 
K
T
 
V
V
 
D
S
 
A
T
 
V
G
 
R
V
 
G
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
E
L
 
V
V
 
L
A
 
L
I
 
H
Q
 
G
G
 
A
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
E
V
 
A
N
 
K
R
 
A
L
 
K
C
 
A
S
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
G
 
Q
E
 
Q
Y
 
Q
E
 
G
W
 
F
A
 
T
F
 
W
V
 
V
N
 
P
V
 
P
N
 
F
V
 
D
R
 
H
P
 
P
F
 
M
Y
 
V
A
 
I
E
 
A
G
 
G
S
 
Q
K
 
G
T
 
T
L
 
L
G
 
A
Y
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

1tdjA Threonine deaminase (biosynthetic) from e. Coli (see paper)
28% identity, 35% coverage: 91:238/425 of query aligns to 25:172/494 of 1tdjA

query
sites
1tdjA
A
 
A
G
 
Q
W
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
Q
P
 
K
A
 
M
P
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
S
A
 
S
E
 
R
L
 
L
G
 
D
M
 
-
K
 
N
T
 
V
L
 
I
Y
 
L
V
 
V
K
 
K
D
 
R
D
 
E
S
 
D
A
 
R
N
 
Q
P
 
P
T
 
V
H
 
H
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
L
R
 
R
-
 
G
V
 
A
V
 
Y
S
 
A
V
 
M
A
 
M
L
 
A
S
 
G
A
 
L
A
 
T
R
 
E
E
 
E
L
 
Q
G
 
K
F
 
A
T
 
H
T
 
G
V
 
V
A
 
I
C
 
T
A
 
A
S
 
S
T
x
A
G
 
G
N
|
N
L
 
H
A
 
A
Q
 
Q
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
F
H
 
S
A
 
S
A
 
A
G
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
V
R
 
K
S
 
A
V
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
M
P
 
P
H
 
T
D
 
A
L
 
T
E
 
A
A
 
D
G
 
I
K
 
K
T
 
V
V
 
D
S
 
A
T
 
V
G
 
R
V
 
G
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
E
L
 
V
V
 
L
A
 
L
I
 
H
Q
 
G
G
 
A
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
E
V
 
A
N
 
K
R
 
A
L
 
K
C
 
A
S
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
S
G
 
Q
E
 
Q
Y
 
Q
E
 
G
W
 
F
A
 
T
F
 
W
V
 
V
N
 
P
V
 
P
N
 
F
V
 
D
R
 
H
P
 
P
F
 
M
Y
 
V
A
 
I
E
 
A
G
 
G
S
 
Q
K
 
G
T
 
T
L
 
L
G
 
A
Y
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

A4F2N8 L-threo-3-hydroxyaspartate ammonia-lyase; L-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase; L-THA DH; EC 4.3.1.16 from Pseudomonas sp. (see paper)
27% identity, 71% coverage: 77:376/425 of query aligns to 3:293/319 of A4F2N8

query
sites
A4F2N8
L
 
L
P
 
S
A
 
S
G
 
Y
H
 
H
D
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
K
P
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
V
 
L
S
 
E
L
 
G
G
 
F
A
 
A
G
 
N
W
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
F
P
 
T
A
 
S
P
 
R
R
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
A
E
 
E
L
 
T
G
 
G
M
 
A
K
 
Q
T
 
-
L
 
V
Y
 
F
V
 
I
K
 
K
D
 
C
D
 
E
S
 
N
A
 
L
N
 
Q
P
 
R
T
 
T
H
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
F
R
 
R
V
 
G
V
 
A
S
 
F
V
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
E
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
E
 
K
L
 
A
G
 
G
F
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
V
A
 
V
C
 
A
A
 
F
S
 
S
T
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
H
A
 
A
Q
 
Q
S
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
L
H
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
L
A
 
L
G
 
Q
L
 
M
R
 
P
S
 
A
V
 
T
V
 
I
L
 
V
V
 
M
P
 
P
H
 
T
D
 
D
L
 
A
E
 
P
A
 
A
G
 
A
K
 
K
T
 
V
V
 
A
S
 
A
T
 
T
G
 
R
V
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
T
 
T
L
 
V
V
 
V
A
 
F
I
 
Y
Q
 
D
G
 
R
N
 
I
Y
 
T
D
 
E
D
 
D
V
 
R
N
 
E
R
 
Q
L
 
I
C
 
G
S
 
R
E
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
E
E
 
Q
Y
 
H
E
 
G
W
 
M
A
 
T
F
 
L
V
 
I
N
 
P
V
 
S
N
 
Y
V
 
D
R
 
H
P
 
P
F
 
D
Y
 
V
A
 
L
E
 
A
G
 
G
S
 
Q
K
 
G
T
 
T
L
 
A
G
 
A
Y
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
F
L
 
T
G
 
G
W
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
P
-
 
L
E
 
D
Q
 
A
V
 
L
V
 
F
V
 
V
P
 
G
I
 
L
A
 
G
S
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
M
L
 
L
T
 
S
K
 
G
V
 
T
D
 
A
K
 
L
A
 
A
F
 
T
G
 
R
E
 
A
L
 
L
G
 
S
K
 
P
L
 
D
G
 
C
L
 
L
V
 
-
E
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
-
V
 
L
F
 
Y
G
 
G
A
 
V
Q
 
E
A
 
P
A
 
E
G
 
A
C
 
G
N
 
N
P
 
D
V
 
G
A
 
Q
A
 
R
A
 
S
F
 
F
A
 
Q
R
 
T
G
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
V
-
 
H
V
 
I
D
 
D
T
 
T
V
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
P
S
 
A
T
 
T
I
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
G
A
 
A
K
 
Q
S
 
T
L
 
Q
S
 
H
I
 
L
G
 
G
N
 
N
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
Y
 
H
A
 
T
L
 
F
D
 
P
V
 
I
A
 
I
R
 
R
R
 
E
T
 
N
G
 
V
G
 
N
A
 
D
I
 
I
T
 
L
D
 
T
V
 
V
S
 
S
D
 
D
D
 
A
E
 
E
I
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
S
M
 
M
R
 
R
L
 
F
L
 
F
A
 
M
R
 
Q
T
 
R
E
 
M
G
 
K
I
 
M
F
 
V
G
 
V
E
 
E
T
 
P
A
 
T
G
 
G
G
 
C
V
 
L
T
 
G
V
 
L
A
 
A
N
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
K
R
 
Q
E
 
Q

3x43A Crystal structure of o-ureido-l-serine synthase (see paper)
36% identity, 29% coverage: 92:213/425 of query aligns to 11:136/316 of 3x43A

query
sites
3x43A
G
 
G
W
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
V
P
 
R
A
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
M
A
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
-
G
 
-
M
 
H
K
 
T
T
 
S
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
K
 
K
D
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
F
N
 
N
P
 
P
T
 
G
H
 
G
S
 
S
F
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
L
-
 
A
V
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
V
L
 
L
S
 
D
A
 
A
-
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
P
G
 
G
F
 
D
T
 
T
T
 
I
V
 
V
A
 
E
C
 
C
A
 
T
S
 
S
T
 
-
G
 
G
N
|
N
L
 
V
A
 
G
Q
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
M
H
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
A
A
 
R
G
 
G
L
 
Y
R
 
R
S
 
F
V
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
M
P
 
G
H
 
D
D
 
T
L
 
Y
E
 
S
A
 
V
G
 
E
K
 
R
T
 
R
V
 
K
S
 
L
T
 
I
G
 
R
V
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
L
I
 
F
Q
 
P
G
 
G
N
 
H
Y
 
L
D
 
G
D
 
S
V
 
K
-
 
G
-
 
G
N
 
N
R
 
L
L
 
I
C
 
A
S
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
E
E
 
K
Y
 
Y
E
 
G
W
 
W

Sites not aligning to the query:

D2Z027 O-ureido-L-serine synthase; Cysteine synthase homolog DscD; O-acetylserine sulfhydrylase; EC 2.6.99.3; EC 2.5.1.47 from Streptomyces lavendulae (see paper)
36% identity, 29% coverage: 92:213/425 of query aligns to 12:137/324 of D2Z027

query
sites
D2Z027
G
 
G
W
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
V
P
 
R
A
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
M
A
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
-
G
 
-
M
 
H
K
 
T
T
 
S
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
K
 
K
D
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
F
N
 
N
P
 
P
T
 
G
H
 
G
S
 
S
F
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
L
-
 
A
V
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
V
L
 
L
S
 
D
A
 
A
-
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
P
G
 
G
F
 
D
T
 
T
T
 
I
V
 
V
A
 
E
C
 
C
A
 
T
S
 
S
T
 
-
G
 
G
N
 
N
L
x
V
A
 
G
Q
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
M
H
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
A
A
 
R
G
 
G
L
 
Y
R
 
R
S
 
F
V
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
M
P
 
G
H
 
D
D
 
T
L
x
Y
E
 
S
A
 
V
G
 
E
K
 
R
T
 
R
V
 
K
S
 
L
T
 
I
G
 
R
V
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
L
I
 
F
Q
 
P
G
 
G
N
 
H
Y
 
L
D
 
G
D
x
S
V
 
K
-
 
G
-
 
G
N
 
N
R
 
L
L
 
I
C
 
A
S
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
E
E
 
K
Y
 
Y
E
 
G
W
 
W

Query Sequence

>WP_041939957.1 NCBI__GCF_000058485.1:WP_041939957.1
MTLAPERADTPALDVANPAVGLSCRHCGATYPLSPSHVCVECFAPLEISYDPDLLGRVTR
ESIERGPANLWRYVGLLPAGHDPARRVSLGAGWTPLRPAPRLAAELGMKTLYVKDDSANP
THSFKDRVVSVALSAARELGFTTVACASTGNLAQSVAAHAAGAGLRSVVLVPHDLEAGKT
VSTGVYGGTLVAIQGNYDDVNRLCSELAGEYEWAFVNVNVRPFYAEGSKTLGYEVAEQLG
WRLPEQVVVPIASGSLLTKVDKAFGELGKLGLVEPTPYRVFGAQAAGCNPVAAAFARGVD
TVAPVRPSTIAKSLSIGNPADGPYALDVARRTGGAITDVSDDEILEGMRLLARTEGIFGE
TAGGVTVANLRRLLREGLLDPAAETVIYNTGDGLKTLDPLVETGGPTATIKPSLRAFEAA
GLGDD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory