SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_043744649.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_043744649.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8c0zE Cryoem structure of a tungsten-containing aldehyde oxidoreductase from aromatoleum aromaticum (see paper)
52% identity, 99% coverage: 1:416/421 of query aligns to 1:413/424 of 8c0zE

query
sites
8c0zE
M
 
M
H
 
K
H
 
H
L
 
V
I
 
I
V
 
L
G
|
G
A
 
N
G
 
G
P
|
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
T
I
 
L
R
 
R
E
 
R
L
 
A
E
 
A
P
 
P
G
 
T
A
 
D
T
 
D
I
 
I
T
 
L
L
 
L
V
 
F
G
 
G
D
 
S
E
 
E
P
 
D
E
 
A
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
R
|
R
M
|
M
A
 
A
I
 
I
P
|
P
Y
 
Y
M
 
L
L
 
L
V
 
E
G
 
G
K
 
N
V
 
I
G
 
D
E
 
E
D
 
S
G
 
G
T
 
T
Y
 
W
L
 
L
R
 
R
K
 
K
G
 
S
P
 
P
N
 
G
H
 
H
Y
 
F
E
 
D
R
 
R
L
 
L
G
 
R
I
 
I
T
 
H
L
 
E
M
 
M
P
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
A
M
 
V
S
 
S
G
 
-
L
 
L
D
 
D
P
 
S
A
 
E
A
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
I
V
 
L
L
 
F
D
 
D
G
 
D
G
 
G
E
 
H
T
 
F
L
 
E
A
 
S
Y
 
W
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
A
L
x
T
G
 
G
A
 
S
R
 
H
P
 
P
L
 
V
R
 
R
P
 
P
D
 
P
I
 
I
E
 
P
G
 
G
L
 
I
D
 
D
L
 
L
P
 
P
G
 
E
I
 
V
H
 
Q
T
 
T
C
 
C
W
|
W
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
K
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
A
H
 
R
V
 
V
V
 
L
L
 
Q
M
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
|
F
V
 
I
G
 
G
T
 
C
I
 
I
V
 
I
L
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
R
 
R
Q
 
G
V
 
V
S
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
M
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
R
M
 
M
V
 
V
P
 
P
R
 
R
M
 
M
M
 
M
D
 
T
E
 
P
T
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
L
 
I
K
 
R
R
 
K
W
 
W
C
 
V
E
 
E
A
 
D
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
N
T
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
S
R
 
R
I
 
I
T
 
-
Q
 
D
A
 
C
Q
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
N
D
 
D
T
 
A
R
 
-
D
 
-
S
 
P
L
 
L
V
 
D
V
 
V
E
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
T
G
 
G
T
 
E
S
 
V
L
 
V
P
 
V
A
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
A
S
 
P
N
 
N
T
 
I
E
 
A
A
 
F
V
 
L
A
 
E
A
 
A
S
 
T
G
 
P
I
 
V
A
 
H
L
 
V
G
 
A
N
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
H
 
R
M
 
L
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
L
 
V
P
 
P
D
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
A
R
 
P
D
 
D
F
 
L
M
 
F
S
 
T
G
 
G
E
 
A
A
 
H
H
 
L
V
 
V
H
 
A
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
I
 
P
T
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
D
H
 
Q
G
 
A
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
N
 
N
M
 
M
T
 
A
G
 
G
N
 
H
D
 
E
Q
 
A
A
 
R
Y
 
L
H
 
K
G
 
G
S
 
V
L
 
L
N
 
A
M
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
T
 
S
C
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
Q
W
 
W
Q
 
W
G
 
G
N
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
A
C
 
G
A
 
V
R
 
E
L
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
R
 
S
L
 
L
E
 
Q
F
 
F
D
 
-
G
 
-
T
 
K
S
 
D
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
A
 
S
V
 
I
G
 
G
T
 
L
T
 
T
D
 
E
H
 
H
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
H
S
 
G
K
 
R
R
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
W
V
 
-
K
 
K
E
 
E
Q
 
R
M
 
L
M
 
L
A
 
H
D
 
S
P
 
P
T
 
L
R
 
Q
F
 
F
M
 
V
N
 
D
G
 
A
F
 
Y
V
 
I

6pfzA Structure of a NAD-dependent persulfide reductase from a. Fulgidus (see paper)
28% identity, 86% coverage: 19:378/421 of query aligns to 19:399/541 of 6pfzA

query
sites
6pfzA
I
 
I
R
 
R
E
x
R
L
 
K
E
 
D
P
 
G
G
 
D
A
 
A
T
 
S
I
 
I
T
 
T
L
 
V
V
 
V
G
x
E
D
x
A
E
 
G
P
 
K
E
 
Y
P
x
V
P
x
S
Y
 
L
S
x
G
R
|
R
M
x
C
A
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
M
 
Y
L
 
V
V
 
G
G
 
G
K
 
L
V
 
V
G
 
H
E
 
E
-
 
V
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
R
D
 
D
G
 
E
T
 
A
Y
 
Y
L
 
F
R
 
K
K
 
K
G
 
L
P
x
K
N
 
N
H
 
-
Y
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
I
T
 
D
L
 
V
M
 
L
P
 
T
G
 
E
R
 
T
R
 
V
M
x
A
S
 
T
G
 
E
L
 
I
D
 
D
P
 
R
A
 
S
A
 
R
R
 
K
-
 
T
-
 
V
R
 
K
I
 
I
V
 
V
L
 
R
D
 
N
G
 
G
G
 
S
E
 
E
-
 
D
T
 
E
L
 
L
A
 
N
Y
 
Y
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
L
 
V
L
 
I
A
|
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
R
P
 
P
L
 
A
R
 
K
P
 
P
D
 
P
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
I
D
 
E
L
 
A
P
 
E
G
 
G
I
 
V
H
 
V
T
 
T
C
x
L
W
 
T
T
 
S
L
 
A
A
 
E
D
 
E
A
 
A
R
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
I
A
 
E
Q
 
M
A
 
W
I
 
E
P
 
E
G
 
G
S
 
A
H
 
E
-
 
K
V
 
A
V
 
V
L
 
V
M
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
G
T
 
L
I
 
E
V
 
S
L
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
N
R
 
L
Q
 
D
V
 
M
S
 
E
L
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
I
E
 
E
M
 
M
G
 
M
D
 
D
R
 
R
M
 
V
V
 
A
P
 
P
R
 
A
M
 
M
M
 
L
D
 
D
E
 
R
T
 
E
A
 
M
G
 
A
G
 
V
M
 
L
L
 
V
K
 
E
R
 
N
W
 
H
C
 
L
E
 
R
A
 
E
K
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
N
V
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
S
T
 
T
G
 
R
I
 
V
R
 
E
R
 
K
I
 
I
T
 
V
Q
 
S
A
 
Q
Q
 
D
A
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
D
S
 
K
L
 
V
V
 
R
V
 
A
E
 
V
L
 
I
S
 
A
D
 
N
G
 
G
T
 
K
S
 
E
L
 
Y
P
 
P
A
 
A
H
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
A
A
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
K
S
 
P
N
 
N
T
 
S
E
 
E
A
 
L
V
 
A
A
 
E
A
 
K
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
K
L
 
I
G
 
G
N
 
E
-
 
T
-
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
W
V
 
V
D
 
D
D
 
E
H
 
Y
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
D
P
 
E
D
 
S
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
G
G
|
G
D
|
D
V
 
C
A
 
V
Q
 
E
G
 
T
R
 
T
D
 
C
F
 
L
M
 
V
S
 
T
G
 
G
E
 
K
A
 
K
H
 
I
V
 
I
H
 
A
A
x
P
I
x
F
Q
x
G
I
x
D
T
 
V
A
 
A
A
 
N
A
 
K
H
 
Q
G
 
G
R
|
R
I
 
V
A
 
I
A
 
G
Y
 
E
N
 
N
M
 
I
T
 
T
G
 
G
N
 
G
D
 
R
Q
 
A
A
 
V
Y
 
F
H
 
P
G
 
G
S
 
V
L
 
I
N
 
R
M
x
T
N
 
A
V
 
I
L
 
F
D
 
K
T
 
V
L
 
F
G
 
D
L
 
F
I
 
T
T
 
A
C
 
A
S
 
S
F
 
A
G
 
G
S
 
V
W
 
N
Q
 
E
-
 
Q
-
 
M
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
F
-
 
T
-
 
V
-
 
I
G
 
A
N
 
P
G
 
S
G
 
P
D
 
D
C
 
R
A
 
A
R
 
H
L
 
Y
V
 
Y
D
 
P
E
 
Q
A
 
A
G
 
N
F
 
Y
R
 
I
Y
 
R
L
 
L
R
 
K
L
 
L
E
 
I
F
 
V
D
 
E
G
 
K
T
 
G
S
 
S
D
 
W
V
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
G
V
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3nt6A Structure of the shewanella loihica pv-4 nadh-dependent persulfide reductase c43s/c531s double mutant (see paper)
27% identity, 81% coverage: 39:378/421 of query aligns to 40:415/565 of 3nt6A

query
sites
3nt6A
Y
 
F
S
 
A
R
x
N
M
x
S
A
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
M
 
H
L
 
I
V
 
S
G
 
G
K
 
E
V
 
I
G
 
A
E
 
Q
D
 
R
G
 
S
T
 
A
Y
 
L
L
 
V
R
 
L
K
 
Q
G
 
T
P
 
P
N
 
E
H
 
S
Y
 
F
E
 
K
-
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
N
I
 
V
T
 
E
L
 
V
M
 
R
P
 
V
G
 
K
R
 
H
R
x
E
M
x
V
S
 
V
G
 
A
L
 
I
D
 
D
P
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
V
R
 
R
I
 
R
V
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
S
E
 
E
T
 
Y
L
 
Q
-
 
E
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
R
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
x
S
L
x
P
G
|
G
A
 
A
R
 
A
P
 
P
L
 
I
R
 
V
P
 
P
D
 
P
I
 
I
E
 
P
G
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
N
P
 
P
G
 
L
I
 
T
H
 
H
T
 
S
C
x
L
W
x
R
T
 
N
L
 
I
A
 
P
D
 
D
A
 
M
R
 
D
K
 
R
I
 
I
-
 
L
-
 
Q
A
 
T
A
 
I
Q
 
Q
A
 
M
I
 
N
P
 
N
G
 
V
S
 
E
H
 
H
V
 
A
V
 
T
L
 
V
M
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
|
F
V
 
I
G
 
G
T
 
L
I
 
E
V
 
M
L
 
M
E
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
H
L
 
H
R
 
L
Q
 
G
V
 
I
S
 
K
L
 
T
T
 
T
V
 
L
V
 
L
E
 
E
M
 
L
G
 
A
D
 
D
R
 
Q
-
 
V
M
 
M
V
 
T
P
 
P
R
 
-
M
 
-
M
 
V
D
 
D
E
 
R
T
 
E
A
 
M
G
 
A
G
 
G
M
 
F
L
 
A
K
 
H
R
 
Q
W
 
A
C
 
I
E
 
R
A
 
D
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
D
V
 
L
L
 
R
T
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
A
I
 
L
R
 
S
R
 
E
I
 
V
T
 
S
-
 
Y
-
 
Q
-
 
V
Q
 
Q
A
 
T
Q
 
H
A
 
V
A
 
A
A
 
S
D
 
D
T
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
H
-
 
Q
-
 
H
-
 
I
R
 
K
D
 
G
S
 
H
L
 
L
V
 
S
V
 
L
E
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
N
G
 
G
T
 
E
S
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
T
H
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
I
V
 
M
S
 
A
A
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
R
S
 
P
N
 
E
T
 
T
E
 
Q
A
 
L
V
 
A
A
 
R
A
 
D
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
G
N
 
E
-
 
L
-
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
K
V
 
V
D
 
N
D
 
A
H
 
M
M
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
L
 
D
P
 
P
D
 
A
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
V
G
|
G
D
|
D
V
 
A
A
 
V
Q
 
E
G
 
E
R
 
Q
D
 
D
F
 
F
M
 
V
S
 
T
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
H
 
C
V
 
L
H
 
V
A
x
P
I
x
L
Q
x
A
I
 
G
T
 
P
A
 
A
A
x
N
A
 
R
H
 
Q
G
 
G
R
|
R
I
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
 
D
N
 
N
M
 
M
T
 
F
G
 
G
N
 
R
D
 
E
Q
 
E
A
 
R
Y
 
Y
H
 
Q
G
 
G
S
 
-
L
 
-
N
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
T
L
 
Q
G
 
G
L
 
T
I
 
A
T
 
I
C
 
C
S
 
K
-
 
V
F
 
F
G
 
D
S
 
L
W
 
A
Q
 
V
G
 
G
N
 
A
G
 
T
G
 
G
D
 
K
C
 
N
A
 
E
R
 
K
L
 
Q
V
 
L
D
 
K
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
F
 
I
R
 
A
Y
 
F
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
-
 
V
-
 
H
-
 
T
-
 
A
-
 
S
-
 
H
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
-
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
S
L
 
F
R
 
K
L
 
L
E
 
L
F
 
F
D
 
D
G
 
P
T
 
V
S
 
K
D
 
G
V
 
T
V
 
I
I
 
F
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8a56B Coenzyme a-persulfide reductase (coapr) from enterococcus faecalis (see paper)
26% identity, 95% coverage: 4:404/421 of query aligns to 4:410/539 of 8a56B

query
sites
8a56B
L
 
V
I
 
I
V
x
I
G
|
G
A
 
G
G
x
V
P
 
A
A
x
G
G
 
G
V
 
M
T
 
S
A
 
A
A
 
A
E
x
T
I
x
R
I
 
L
R
 
R
E
x
R
L
 
L
E
 
M
P
 
E
G
 
D
A
 
A
T
 
E
I
 
I
T
 
V
L
 
V
V
 
M
G
x
E
D
x
K
E
 
G
P
 
P
E
 
F
P
 
V
P
 
S
Y
 
F
S
 
A
R
 
N
M
x
C
A
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
M
 
Y
L
 
V
V
 
S
G
 
G
K
 
E
V
 
I
G
 
A
E
 
E
D
 
R
G
 
E
T
 
Q
Y
 
L
L
 
L
R
 
V
K
 
Q
G
 
T
P
 
P
N
 
E
H
 
A
Y
 
L
E
 
K
-
 
A
R
 
R
L
x
F
G
 
N
I
 
L
T
 
D
L
 
V
M
 
R
P
 
P
G
 
H
R
 
H
R
 
E
M
x
V
S
 
V
G
 
A
L
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
I
A
 
E
R
 
K
R
 
V
I
 
I
V
 
T
L
 
V
D
 
K
G
 
H
G
 
E
E
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
L
T
 
T
L
 
E
A
 
H
Y
 
Y
D
 
D
R
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
x
S
L
x
P
G
|
G
A
 
A
R
 
K
P
 
P
L
 
F
R
 
V
P
 
P
D
 
P
I
 
I
E
 
T
G
 
G
L
 
L
-
 
A
D
 
E
L
 
A
P
 
K
G
 
N
I
 
V
H
 
F
T
 
S
C
 
L
W
 
R
T
 
N
L
 
V
A
 
P
D
 
D
A
 
L
R
 
D
K
 
Q
I
 
I
A
 
M
A
 
T
Q
 
A
A
 
L
I
 
T
P
 
P
G
 
E
S
 
T
H
 
K
-
 
R
V
 
A
V
 
V
L
 
V
M
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
 
E
V
 
M
L
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
L
A
 
Q
L
 
K
R
 
R
Q
 
G
V
 
L
S
 
E
L
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
V
E
 
E
M
 
K
G
 
A
D
 
P
R
 
H
M
 
V
V
 
L
P
 
P
R
 
P
M
 
L
M
 
-
D
 
D
E
 
E
T
 
E
A
 
M
G
 
A
G
 
A
M
 
F
L
 
V
K
 
K
R
 
A
W
 
E
C
 
L
E
 
S
A
 
K
K
 
N
G
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
G
 
S
I
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
F
T
 
E
R
 
E
D
 
E
S
 
G
L
 
Q
V
 
V
V
 
I
E
 
R
L
 
L
S
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
S
 
T
L
 
L
P
 
A
A
 
S
H
 
D
L
 
L
V
 
T
V
 
I
V
 
L
S
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
S
 
P
N
 
E
T
 
N
E
 
T
A
 
L
V
 
A
A
 
V
A
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
R
N
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
H
 
H
M
 
Y
R
 
Q
T
 
T
S
 
N
L
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
V
G
|
G
D
|
D
V
 
A
A
 
I
Q
 
V
G
 
V
R
 
K
D
 
Q
F
 
Q
M
 
I
S
 
T
G
 
Q
E
 
E
A
 
D
H
 
A
V
 
L
H
 
I
A
x
S
I
x
L
Q
x
A
I
 
S
T
 
P
A
 
A
A
 
N
A
 
R
H
 
Q
G
 
G
R
|
R
I
 
Q
A
 
V
A
 
A
Y
 
D
N
 
V
M
 
I
T
 
A
G
 
G
N
 
L
D
 
E
Q
 
R
A
 
K
Y
 
N
H
 
Q
G
 
G
S
 
S
L
 
I
N
 
G
M
 
T
N
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
R
T
 
V
L
 
F
G
 
D
L
 
L
I
 
T
T
 
A
C
 
A
S
 
S
F
 
T
G
 
G
S
 
L
W
 
S
Q
 
E
G
 
-
N
 
R
G
 
A
G
 
A
D
 
K
C
 
A
A
 
A
R
 
G
L
 
L
V
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
H
-
x
I
-
 
S
-
 
G
-
 
K
D
 
D
E
 
H
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
R
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
L
Y
 
Q
L
 
L
R
 
K
L
 
L
E
 
V
F
 
F
D
 
H
G
 
P
T
 
T
S
 
T
D
 
G
V
 
E
V
 
I
I
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
G
V
 
I
G
 
G
T
 
A
T
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
K
G
 
G
L
 
V
I
 
D
Q
 
K
S
 
R
K
 
I
R
 
D
R
 
I
L
 
L
G
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
I
K
 
K
E
 
G
Q
 
Q
M
 
L

Sites not aligning to the query:

2yvjA Crystal structure of the ferredoxin-ferredoxin reductase (bpha3-bpha4)complex (see paper)
33% identity, 68% coverage: 4:290/421 of query aligns to 7:279/402 of 2yvjA

query
sites
2yvjA
L
 
V
I
 
V
V
 
L
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
x
L
A
 
A
G
 
S
V
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
E
 
A
I
 
E
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
L
 
A
E
 
G
P
 
Y
G
 
Q
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
T
L
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
E
|
E
P
 
A
E
 
E
P
 
R
P
 
P
Y
 
Y
S
 
D
R
|
R
-
x
P
-
 
P
M
 
L
A
 
S
I
 
K
P
 
D
Y
 
F
M
 
M
L
 
A
V
 
H
G
 
G
K
 
D
V
 
A
G
 
E
E
 
K
D
 
I
G
 
R
T
 
L
Y
 
D
L
 
C
R
 
K
K
 
R
G
 
A
P
 
P
N
 
E
H
 
V
Y
 
E
E
 
W
R
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
M
x
A
S
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
R
 
H
R
 
T
I
 
V
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
D
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
A
P
 
P
L
 
R
R
 
A
-
 
L
P
 
P
D
 
T
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
D
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
-
I
 
V
H
 
H
T
 
T
C
 
L
W
x
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
K
 
R
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
G
A
 
L
I
 
R
P
 
P
G
 
Q
S
 
S
H
 
R
V
 
L
V
 
L
L
 
I
M
x
V
G
|
G
A
x
G
G
|
G
F
 
V
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
 
E
V
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
R
L
 
T
R
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
H
L
 
V
T
 
S
V
 
L
V
|
V
E
|
E
M
x
T
G
 
Q
D
 
P
R
 
R
M
 
L
V
 
M
P
 
S
R
|
R
M
 
A
M
 
A
D
 
P
E
 
A
T
 
T
A
 
L
G
 
A
G
 
D
M
 
F
L
 
V
K
 
A
R
 
R
W
 
Y
C
 
H
E
 
A
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
D
I
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
E
T
 
R
Q
 
S
A
 
V
Q
 
T
A
 
G
A
 
S
A
 
V
D
 
D
T
 
G
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
V
V
 
V
E
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
x
G
A
x
I
G
|
G
V
|
V
R
 
L
S
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
R
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
C
G
 
D
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
V
D
 
D
D
 
A
H
 
Y
M
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
G
 
Q
R
 
R
D
 
N
F
 
P
M
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2gr2A Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 (oxidized form)
33% identity, 68% coverage: 4:290/421 of query aligns to 6:278/401 of 2gr2A

query
sites
2gr2A
L
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
x
L
A
|
A
G
 
S
V
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
E
 
A
I
 
E
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
L
 
A
E
 
G
P
 
Y
G
 
Q
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
T
L
 
V
V
 
V
G
 
G
D
|
D
E
|
E
P
 
A
E
 
E
P
 
R
P
 
P
Y
 
Y
S
 
D
R
|
R
-
x
P
-
 
P
M
 
L
A
 
S
I
x
K
P
 
D
Y
 
F
M
 
M
L
 
A
V
 
H
G
 
G
K
 
D
V
 
A
G
 
E
E
 
K
D
 
I
G
 
R
T
 
L
Y
 
D
L
 
C
R
 
K
K
 
R
G
 
A
P
 
P
N
 
E
H
 
V
Y
 
E
E
 
W
R
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
M
x
A
S
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
R
 
H
R
 
T
I
 
V
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
D
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
A
P
 
P
L
x
R
R
 
A
-
 
L
P
 
P
D
 
T
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
D
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
-
I
 
V
H
 
H
T
 
T
C
 
L
W
x
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
K
 
R
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
G
A
 
L
I
 
R
P
 
P
G
 
Q
S
 
S
H
 
R
V
 
L
V
 
L
L
 
I
M
x
V
G
|
G
A
 
G
G
|
G
F
x
V
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
 
E
V
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
R
L
 
T
R
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
H
L
 
V
T
 
S
V
 
L
V
 
V
E
|
E
M
x
T
G
 
Q
D
 
P
R
 
R
M
 
L
V
 
M
P
 
S
R
|
R
M
 
A
M
 
A
D
 
P
E
 
A
T
 
T
A
 
L
G
 
A
G
 
D
M
 
F
L
 
V
K
 
A
R
 
R
W
 
Y
C
 
H
E
 
A
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
D
I
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
E
T
 
R
Q
 
S
A
 
V
Q
 
T
A
 
G
A
 
S
A
 
V
D
 
D
T
 
G
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
V
V
 
V
E
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
x
G
A
x
I
G
|
G
V
 
V
R
 
L
S
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
R
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
C
G
 
D
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
V
D
 
D
D
 
A
H
 
Y
M
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
G
 
Q
R
 
R
D
 
N
F
 
P
M
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2gr0A Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 (oxidized form, NAD+ complex) (see paper)
33% identity, 68% coverage: 4:290/421 of query aligns to 6:278/401 of 2gr0A

query
sites
2gr0A
L
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
x
L
A
|
A
G
 
S
V
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
E
 
A
I
 
E
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
L
 
A
E
 
G
P
 
Y
G
 
Q
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
T
L
 
V
V
 
V
G
 
G
D
|
D
E
|
E
P
 
A
E
 
E
P
 
R
P
 
P
Y
 
Y
S
 
D
R
|
R
-
x
P
-
 
P
M
 
L
A
 
S
I
x
K
P
 
D
Y
 
F
M
 
M
L
 
A
V
 
H
G
 
G
K
 
D
V
 
A
G
 
E
E
 
K
D
 
I
G
 
R
T
 
L
Y
 
D
L
 
C
R
 
K
K
 
R
G
 
A
P
 
P
N
 
E
H
 
V
Y
 
E
E
 
W
R
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
|
T
L
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
M
x
A
S
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
R
 
H
R
 
T
I
 
V
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
D
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
A
P
 
P
L
 
R
R
 
A
-
 
L
P
 
P
D
 
T
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
D
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
-
I
 
V
H
 
H
T
 
T
C
 
L
W
x
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
K
 
R
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
G
A
 
L
I
 
R
P
 
P
G
 
Q
S
 
S
H
 
R
V
 
L
V
 
L
L
 
I
M
x
V
G
|
G
A
 
G
G
|
G
F
 
V
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
 
E
V
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
R
L
 
T
R
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
H
L
 
V
T
 
S
V
 
L
V
 
V
E
|
E
M
x
T
G
 
Q
D
 
P
R
 
R
M
 
L
V
 
M
P
 
S
R
|
R
M
 
A
M
 
A
D
 
P
E
 
A
T
 
T
A
 
L
G
 
A
G
 
D
M
 
F
L
 
V
K
 
A
R
 
R
W
 
Y
C
 
H
E
 
A
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
D
I
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
E
T
 
R
Q
 
S
A
 
V
Q
 
T
A
 
G
A
 
S
A
 
V
D
 
D
T
 
G
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
V
V
 
V
E
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
x
G
A
x
I
G
|
G
V
 
V
R
 
L
S
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
R
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
C
G
 
D
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
V
D
 
D
D
 
A
H
 
Y
M
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
G
 
Q
R
 
R
D
 
N
F
 
P
M
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8pxkA Structure of nadh-dependent ferredoxin reductase, bpha4, solved at wavelength 5.76 a (see paper)
33% identity, 68% coverage: 4:290/421 of query aligns to 8:280/403 of 8pxkA

query
sites
8pxkA
L
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
 
L
A
|
A
G
 
S
V
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
E
 
A
I
 
E
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
L
 
A
E
 
G
P
 
Y
G
 
Q
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
T
L
 
V
V
 
V
G
 
G
D
|
D
E
|
E
P
 
A
E
 
E
P
 
R
P
 
P
Y
 
Y
S
 
D
R
|
R
-
x
P
-
 
P
M
 
L
A
 
S
I
x
K
P
 
D
Y
 
F
M
 
M
L
 
A
V
 
H
G
 
G
K
 
D
V
 
A
G
 
E
E
 
K
D
 
I
G
 
R
T
 
L
Y
 
D
L
 
C
R
 
K
K
 
R
G
 
A
P
 
P
N
 
E
H
 
V
Y
 
E
E
 
W
R
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
M
x
A
S
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
R
 
H
R
 
T
I
 
V
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
D
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
A
P
 
P
L
 
R
R
 
A
-
 
L
P
 
P
D
 
T
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
D
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
-
I
 
V
H
 
H
T
 
T
C
 
L
W
x
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
K
 
R
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
G
A
 
L
I
 
R
P
 
P
G
 
Q
S
 
S
H
 
R
V
 
L
V
 
L
L
 
I
M
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
 
V
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
 
E
V
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
R
L
 
T
R
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
H
L
 
V
T
 
S
V
 
L
V
 
V
E
 
E
M
 
T
G
 
Q
D
 
P
R
 
R
M
 
L
V
 
M
P
 
S
R
 
R
M
 
A
M
 
A
D
 
P
E
 
A
T
 
T
A
 
L
G
 
A
G
 
D
M
 
F
L
 
V
K
 
A
R
 
R
W
 
Y
C
 
H
E
 
A
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
D
I
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
E
T
 
R
Q
 
S
A
 
V
Q
 
T
A
 
G
A
 
S
A
 
V
D
 
D
T
 
G
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
V
V
 
V
E
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
G
A
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
L
S
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
R
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
C
G
 
D
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
V
D
 
D
D
 
A
H
 
Y
M
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
G
 
Q
R
 
R
D
 
N
F
 
P
M
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1f3pA Ferredoxin reductase (bpha4)-nadh complex (see paper)
33% identity, 68% coverage: 4:290/421 of query aligns to 7:279/401 of 1f3pA

query
sites
1f3pA
L
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
x
L
A
|
A
G
 
S
V
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
E
 
A
I
 
E
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
L
 
A
E
 
G
P
 
Y
G
 
Q
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
T
L
 
V
V
|
V
G
 
G
D
|
D
E
|
E
P
 
A
E
 
E
P
 
R
P
 
P
Y
 
Y
S
 
D
R
|
R
-
x
P
-
 
P
M
 
L
A
 
S
I
 
K
P
 
D
Y
 
F
M
 
M
L
 
A
V
 
H
G
 
G
K
 
D
V
 
A
G
 
E
E
 
K
D
 
I
G
 
R
T
 
L
Y
 
D
L
 
C
R
 
K
K
 
R
G
 
A
P
 
P
N
 
E
H
 
V
Y
 
E
E
 
W
R
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
M
x
A
S
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
R
 
H
R
 
T
I
 
V
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
D
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
A
P
 
P
L
 
R
R
 
A
-
 
L
P
 
P
D
 
T
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
D
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
-
I
 
V
H
 
H
T
 
T
C
 
L
W
x
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
K
 
R
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
G
A
 
L
I
 
R
P
 
P
G
 
Q
S
 
S
H
 
R
V
 
L
V
 
L
L
 
I
M
x
V
G
|
G
A
 
G
G
|
G
F
x
V
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
x
E
V
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
R
L
 
T
R
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
H
L
 
V
T
 
S
V
 
L
V
 
V
E
|
E
M
x
T
G
 
Q
D
 
P
R
 
R
M
 
L
V
 
M
P
 
S
R
|
R
M
 
A
M
 
A
D
 
P
E
 
A
T
 
T
A
 
L
G
 
A
G
 
D
M
 
F
L
 
V
K
 
A
R
 
R
W
 
Y
C
 
H
E
 
A
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
D
I
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
E
T
 
R
Q
 
S
A
 
V
Q
 
T
A
 
G
A
 
S
A
 
V
D
 
D
T
 
G
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
V
V
 
V
E
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
x
G
A
x
I
G
|
G
V
|
V
R
 
L
S
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
R
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
C
G
 
D
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
V
D
 
D
D
 
A
H
 
Y
M
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
G
 
Q
R
 
R
D
 
N
F
 
P
M
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4h4uA Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 t176r mutant (reduced form)
33% identity, 68% coverage: 4:290/421 of query aligns to 7:279/401 of 4h4uA

query
sites
4h4uA
L
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
x
L
A
|
A
G
 
S
V
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
E
 
A
I
 
E
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
L
 
A
E
 
G
P
 
Y
G
 
Q
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
T
L
 
V
V
 
V
G
 
G
D
|
D
E
 
E
P
 
A
E
 
E
P
 
R
P
 
P
Y
 
Y
S
 
D
R
|
R
-
x
P
-
 
P
M
 
L
A
 
S
I
 
K
P
 
D
Y
 
F
M
 
M
L
 
A
V
 
H
G
 
G
K
 
D
V
 
A
G
 
E
E
 
K
D
 
I
G
 
R
T
 
L
Y
 
D
L
 
C
R
 
K
K
 
R
G
 
A
P
 
P
N
 
E
H
 
V
Y
 
E
E
 
W
R
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
M
x
A
S
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
R
 
H
R
 
T
I
 
V
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
D
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
A
P
 
P
L
 
R
R
 
A
-
 
L
P
 
P
D
 
T
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
D
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
-
I
 
V
H
 
H
T
 
T
C
x
L
W
x
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
K
 
R
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
G
A
 
L
I
 
R
P
 
P
G
 
Q
S
 
S
H
 
R
V
 
L
V
 
L
L
 
I
M
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
x
V
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
x
E
V
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
R
L
 
T
R
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
H
L
 
V
T
 
S
V
 
L
V
 
V
E
|
E
M
x
R
G
x
Q
D
 
P
R
 
R
M
 
L
V
 
M
P
 
S
R
 
R
M
 
A
M
 
A
D
 
P
E
 
A
T
 
T
A
 
L
G
 
A
G
 
D
M
 
F
L
 
V
K
 
A
R
 
R
W
 
Y
C
 
H
E
 
A
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
D
I
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
E
T
 
R
Q
 
S
A
 
V
Q
 
T
A
 
G
A
 
S
A
 
V
D
 
D
T
 
G
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
V
V
 
V
E
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
x
G
A
x
I
G
|
G
V
 
V
R
 
L
S
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
R
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
C
G
 
D
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
V
D
 
D
D
 
A
H
 
Y
M
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
G
 
Q
R
 
R
D
 
N
F
 
P
M
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4h4wA Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 e175c/t176r/q177g mutant (reduced form)
33% identity, 68% coverage: 4:290/421 of query aligns to 6:278/399 of 4h4wA

query
sites
4h4wA
L
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
x
L
A
|
A
G
 
S
V
 
V
T
 
S
A
 
F
A
 
V
E
 
A
I
 
E
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
L
 
A
E
 
G
P
 
Y
G
 
Q
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
T
L
 
V
V
 
V
G
 
G
D
|
D
E
 
E
P
 
A
E
 
E
P
 
R
P
 
P
Y
 
Y
S
 
D
R
|
R
-
x
P
-
 
P
M
 
L
A
 
S
I
 
K
P
 
D
Y
 
F
M
 
M
L
 
A
V
 
H
G
 
G
K
 
D
V
 
A
G
 
E
E
 
K
D
 
I
G
 
R
T
 
L
Y
 
D
L
 
C
R
 
K
K
 
R
G
 
A
P
 
P
N
 
E
H
 
V
Y
 
E
E
 
W
R
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
M
x
A
S
 
Q
G
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
R
 
H
R
 
T
I
 
V
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
D
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
A
P
 
P
L
 
R
R
 
A
-
 
L
P
 
P
D
 
T
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
D
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
-
I
 
V
H
 
H
T
 
T
C
 
L
W
x
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
K
 
R
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
G
A
 
L
I
 
R
P
 
P
G
 
Q
S
 
S
H
 
R
V
 
L
V
 
L
L
 
I
M
 
V
G
 
G
A
x
G
G
 
G
F
 
V
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
x
E
V
 
L
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
R
L
 
T
R
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
H
L
 
V
T
 
S
V
 
L
V
 
V
E
 
C
M
x
R
G
 
G
D
 
P
R
 
R
M
 
L
V
 
M
P
x
S
R
|
R
M
 
A
M
 
A
D
 
P
E
 
A
T
 
T
A
 
L
G
 
A
G
 
D
M
 
F
L
 
V
K
 
A
R
 
R
W
 
Y
C
 
H
E
 
A
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
D
I
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
E
T
 
R
Q
 
S
A
 
V
Q
 
T
A
 
G
A
 
S
A
 
V
D
 
D
T
 
G
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
V
V
 
V
E
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
x
G
A
x
I
G
|
G
V
 
V
R
 
L
S
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
R
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
C
G
 
D
N
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
F
V
 
V
D
 
D
D
 
A
H
 
Y
M
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
L
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
G
 
Q
R
 
R
D
 
N
F
 
P
M
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3fg2P Crystal structure of ferredoxin reductase for the cyp199a2 system from rhodopseudomonas palustris (see paper)
31% identity, 76% coverage: 4:321/421 of query aligns to 5:316/404 of 3fg2P

query
sites
3fg2P
L
 
L
I
 
I
V
 
A
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
x
H
A
|
A
G
 
G
V
 
F
T
 
Q
A
 
V
A
 
A
E
 
V
I
 
S
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
L
 
A
E
 
K
P
 
Y
G
 
P
A
 
G
T
 
R
I
 
I
T
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
N
D
|
D
E
|
E
P
 
K
E
 
H
P
 
L
P
 
P
Y
 
Y
S
 
Q
R
|
R
M
x
P
A
 
P
I
 
L
P
x
S
Y
x
K
M
 
A
L
 
Y
V
 
L
G
 
K
K
 
S
V
 
G
G
 
G
E
 
D
D
 
P
G
 
N
T
 
S
Y
 
L
L
 
M
R
 
F
K
 
R
G
 
P
P
 
E
N
 
K
H
 
F
Y
 
F
E
 
Q
R
 
D
L
 
Q
G
 
A
I
 
I
T
 
E
L
 
L
M
 
I
P
 
-
G
 
S
R
 
D
R
|
R
M
|
M
S
 
V
G
 
S
L
 
I
D
 
D
P
 
R
A
 
E
A
 
G
R
 
R
R
 
K
I
 
L
V
 
L
L
 
L
D
 
A
G
 
S
G
 
G
E
 
T
T
 
A
L
 
I
A
 
E
Y
 
Y
D
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
P
 
N
L
 
R
R
 
M
P
 
L
D
 
D
I
 
V
E
 
P
G
 
N
L
 
A
D
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
D
I
 
V
H
 
L
T
 
Y
C
 
L
W
x
R
T
 
T
L
 
L
A
 
-
D
 
D
A
 
E
R
 
S
K
 
E
I
 
V
A
 
L
A
 
R
Q
 
Q
A
 
R
I
 
M
P
 
P
-
 
D
G
 
K
S
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
V
M
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
 
E
V
 
F
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
R
L
 
A
R
 
K
Q
 
G
V
 
L
S
 
E
L
 
V
T
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
M
 
L
G
 
A
D
 
P
R
 
R
M
 
V
V
 
M
P
 
A
R
 
R
M
 
V
M
 
V
D
 
T
E
 
P
T
 
E
A
 
I
G
 
S
G
 
S
M
 
Y
L
 
F
K
 
H
R
 
D
W
 
R
C
 
H
E
 
S
A
 
G
K
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
M
L
 
H
T
 
Y
G
 
G
T
 
V
G
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
R
I
 
A
T
 
T
Q
 
E
A
 
I
Q
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
G
D
 
D
T
 
R
R
 
V
D
 
T
S
 
G
L
 
V
V
 
V
V
 
-
E
 
-
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
N
S
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
C
H
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
I
S
 
P
N
 
N
T
 
V
E
 
E
A
 
I
V
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
P
L
 
T
G
 
A
N
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
Q
H
 
Q
M
 
L
R
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
D
P
 
P
D
 
H
V
 
I
F
 
S
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
C
A
 
A
Q
 
L
G
 
F
R
 
E
D
 
S
F
 
V
M
 
R
S
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
T
-
 
M
H
 
R
V
 
V
H
 
E
A
x
S
I
x
V
Q
 
Q
I
 
-
T
 
N
A
 
A
A
 
T
A
 
D
H
 
Q
G
 
A
R
 
R
I
 
C
A
 
V
A
 
A
Y
 
A
N
 
R
M
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
D
D
 
A
Q
 
K
A
 
P
Y
 
Y
H
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6rvhA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase soaked with menadione (see paper)
29% identity, 71% coverage: 39:339/421 of query aligns to 41:340/443 of 6rvhA

query
sites
6rvhA
Y
|
Y
S
 
G
R
x
A
M
x
C
A
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
M
 
V
L
 
L
V
 
S
G
 
G
K
x
E
V
 
I
G
 
P
E
 
R
D
 
L
G
x
E
T
 
R
Y
 
L
L
 
V
R
 
A
K
x
R
G
 
T
P
 
P
N
 
E
H
 
E
Y
 
F
E
 
R
R
 
K
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
L
L
 
V
M
 
H
P
 
T
G
 
R
R
 
H
R
 
E
M
x
V
S
 
V
G
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
Y
A
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
T
I
 
L
V
 
T
L
 
V
D
 
H
G
 
D
-
 
H
-
 
A
-
 
E
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
F
A
 
Q
-
 
D
-
 
R
Y
 
F
D
 
D
R
 
H
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
R
P
 
P
L
 
S
R
 
L
P
 
P
D
 
P
I
 
I
E
 
P
G
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
Q
P
 
E
G
 
G
I
 
V
H
 
Y
T
 
T
C
 
L
W
x
R
T
 
T
L
 
M
A
 
E
D
 
D
A
 
G
R
 
E
K
 
R
I
 
L
A
 
L
A
 
K
Q
 
A
A
 
L
I
 
P
P
 
Q
G
 
A
S
 
R
H
 
R
V
 
A
V
 
A
L
 
I
M
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
x
Y
V
 
I
G
 
G
T
 
L
I
x
E
V
 
A
L
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
R
L
 
K
R
 
R
Q
 
G
V
 
L
S
 
Q
L
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
E
 
E
M
 
A
G
 
K
D
 
D
R
 
R
M
 
P
V
 
L
P
 
P
R
 
H
M
 
-
M
 
W
D
 
D
E
 
P
T
 
E
A
 
V
G
 
G
G
 
A
M
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
E
W
 
E
C
 
L
E
 
E
A
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
V
L
 
W
T
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
K
I
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
R
 
R
R
 
G
I
 
M
T
 
G
Q
 
R
A
 
V
Q
 
E
A
 
A
A
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
V
E
 
E
L
 
T
S
 
S
D
 
E
G
 
G
T
 
V
S
 
-
L
 
V
P
 
P
A
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
V
 
L
S
 
A
A
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
R
S
 
P
N
 
N
T
 
T
E
 
E
A
 
L
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
S
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
T
N
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
A
V
 
T
D
 
D
D
 
E
H
 
R
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
N
L
 
L
P
 
E
D
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
S
R
 
F
D
 
H
F
 
R
M
 
V
S
 
L
G
 
K
E
 
R
A
 
P
H
 
Y
V
 
W
H
 
L
A
x
P
I
x
L
Q
x
G
I
 
D
T
 
V
A
 
A
A
x
N
A
 
K
H
 
H
G
 
G
R
|
R
I
 
T
A
 
A
A
 
G
Y
 
S
N
 
V
M
 
I
T
 
A
G
 
G
N
 
R
D
 
E
Q
 
A
A
 
R
Y
 
F
H
 
L
G
 
G
S
 
V
L
 
V
N
 
G
M
 
T
N
 
A
V
 
I
L
 
F
D
 
K
T
 
A
L
 
F
G
 
D
L
 
L
I
 
A
T
 
V
C
 
A
S
 
T
F
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6rvbA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase soaked with nadh (see paper)
29% identity, 71% coverage: 39:339/421 of query aligns to 41:340/443 of 6rvbA

query
sites
6rvbA
Y
|
Y
S
 
G
R
x
A
M
x
C
A
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
M
 
V
L
 
L
V
 
S
G
 
G
K
x
E
V
 
I
G
 
P
E
 
R
D
 
L
G
x
E
T
 
R
Y
 
L
L
 
V
R
 
A
K
x
R
G
 
T
P
 
P
N
 
E
H
 
E
Y
 
F
E
 
R
R
 
K
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
L
L
 
V
M
 
H
P
 
T
G
 
R
R
 
H
R
x
E
M
x
V
S
 
V
G
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
Y
A
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
T
I
 
L
V
 
T
L
 
V
D
 
H
G
 
D
-
 
H
-
 
A
-
 
E
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
F
A
 
Q
-
 
D
-
 
R
Y
 
F
D
 
D
R
 
H
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
R
P
 
P
L
 
S
R
 
L
P
 
P
D
 
P
I
 
I
E
 
P
G
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
Q
P
 
E
G
 
G
I
 
V
H
 
Y
T
 
T
C
x
L
W
x
R
T
 
T
L
 
M
A
 
E
D
 
D
A
 
G
R
 
E
K
 
R
I
 
L
A
 
L
A
 
K
Q
 
A
A
 
L
I
 
P
P
 
Q
G
 
A
S
 
R
H
 
R
V
 
A
V
 
A
L
 
I
M
 
L
G
|
G
A
 
A
G
|
G
F
x
Y
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
x
E
V
 
A
L
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
R
L
 
K
R
 
R
Q
 
G
V
 
L
S
 
Q
L
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
E
|
E
M
x
A
G
 
K
D
 
D
R
 
R
M
 
P
V
 
L
P
 
P
R
 
H
M
 
-
M
 
W
D
 
D
E
 
P
T
 
E
A
 
V
G
 
G
G
 
A
M
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
E
W
 
E
C
 
L
E
 
E
A
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
V
L
 
W
T
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
K
I
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
R
 
R
R
 
G
I
 
M
T
 
G
Q
 
R
A
 
V
Q
 
E
A
 
A
A
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
V
E
 
E
L
 
T
S
 
S
D
 
E
G
 
G
T
 
V
S
 
-
L
 
V
P
 
P
A
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
V
 
L
S
x
A
A
x
T
G
|
G
V
 
I
R
 
R
S
 
P
N
 
N
T
 
T
E
 
E
A
 
L
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
S
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
T
N
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
A
V
 
T
D
 
D
D
 
E
H
 
R
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
N
L
 
L
P
 
E
D
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
S
R
 
F
D
 
H
F
 
R
M
 
V
S
 
L
G
 
K
E
 
R
A
 
P
H
 
Y
V
 
W
H
 
L
A
x
P
I
x
L
Q
x
G
I
 
D
T
 
V
A
 
A
A
x
N
A
 
K
H
 
H
G
 
G
R
|
R
I
 
T
A
 
A
A
 
G
Y
 
S
N
 
V
M
 
I
T
 
A
G
 
G
N
 
R
D
 
E
Q
 
A
A
 
R
Y
 
F
H
 
L
G
 
G
S
 
V
L
 
V
N
 
G
M
 
T
N
 
A
V
x
I
L
x
F
D
 
K
T
 
A
L
 
F
G
 
D
L
 
L
I
 
A
T
 
V
C
 
A
S
 
T
F
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6ruzA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase (see paper)
29% identity, 71% coverage: 39:339/421 of query aligns to 41:340/443 of 6ruzA

query
sites
6ruzA
Y
|
Y
S
 
G
R
x
A
M
x
C
A
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
M
 
V
L
 
L
V
 
S
G
 
G
K
x
E
V
 
I
G
 
P
E
 
R
D
 
L
G
x
E
T
 
R
Y
 
L
L
 
V
R
 
A
K
x
R
G
 
T
P
 
P
N
 
E
H
 
E
Y
 
F
E
 
R
R
 
K
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
L
L
 
V
M
 
H
P
 
T
G
 
R
R
 
H
R
x
E
M
x
V
S
 
V
G
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
Y
A
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
T
I
 
L
V
 
T
L
 
V
D
 
H
G
 
D
-
 
H
-
 
A
-
 
E
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
F
A
 
Q
-
 
D
-
 
R
Y
 
F
D
 
D
R
 
H
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
|
A
R
 
R
P
 
P
L
 
S
R
 
L
P
 
P
D
 
P
I
 
I
E
 
P
G
 
G
L
 
T
D
 
E
L
 
Q
P
 
E
G
 
G
I
 
V
H
 
Y
T
 
T
C
x
L
W
x
R
T
 
T
L
 
M
A
 
E
D
 
D
A
 
G
R
 
E
K
 
R
I
 
L
A
 
L
A
 
K
Q
 
A
A
 
L
I
 
P
P
 
Q
G
 
A
S
 
R
H
 
R
V
 
A
V
 
A
L
 
I
M
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
x
Y
V
 
I
G
 
G
T
 
L
I
x
E
V
 
A
L
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
R
L
 
K
R
 
R
Q
 
G
V
 
L
S
 
Q
L
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
E
 
E
M
 
A
G
 
K
D
 
D
R
 
R
M
 
P
V
 
L
P
 
P
R
 
H
M
 
-
M
 
W
D
 
D
E
 
P
T
 
E
A
 
V
G
 
G
G
 
A
M
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
E
W
 
E
C
 
L
E
 
E
A
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
V
L
 
W
T
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
K
I
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
R
 
R
R
 
G
I
 
M
T
 
G
Q
 
R
A
 
V
Q
 
E
A
 
A
A
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
V
E
 
E
L
 
T
S
 
S
D
 
E
G
 
G
T
 
V
S
 
-
L
 
V
P
 
P
A
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
V
 
L
S
 
A
A
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
R
S
 
P
N
 
N
T
 
T
E
 
E
A
 
L
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
S
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
T
N
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
A
V
 
T
D
 
D
D
 
E
H
 
R
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
N
L
 
L
P
 
E
D
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
S
R
 
F
D
 
H
F
 
R
M
 
V
S
 
L
G
 
K
E
 
R
A
 
P
H
 
Y
V
 
W
H
 
L
A
x
P
I
x
L
Q
x
G
I
 
D
T
 
V
A
 
A
A
x
N
A
 
K
H
 
H
G
 
G
R
|
R
I
 
T
A
 
A
A
 
G
Y
 
S
N
 
V
M
 
I
T
 
A
G
 
G
N
 
R
D
 
E
Q
 
A
A
 
R
Y
 
F
H
 
L
G
 
G
S
 
V
L
 
V
N
 
G
M
 
T
N
 
A
V
 
I
L
 
F
D
 
K
T
 
A
L
 
F
G
 
D
L
 
L
I
 
A
T
 
V
C
 
A
S
 
T
F
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6tukB Crystal structure of fdr9 (see paper)
32% identity, 66% coverage: 4:282/421 of query aligns to 5:262/393 of 6tukB

query
sites
6tukB
L
 
V
I
 
I
V
|
V
G
|
G
A
x
G
G
|
G
P
 
L
A
|
A
G
 
A
V
 
S
T
 
R
A
 
T
A
 
C
E
 
E
I
 
Q
I
 
L
R
 
R
E
 
S
L
 
R
E
 
G
P
 
Y
G
 
E
A
 
G
T
 
E
I
 
L
T
 
V
L
 
M
V
 
L
G
 
C
D
x
A
E
|
E
P
 
P
E
 
H
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
S
 
D
R
|
R
M
x
P
A
 
P
I
 
L
P
 
S
Y
x
K
M
 
A
L
 
A
V
 
L
G
 
L
K
 
E
V
 
E
G
 
E
E
 
H
D
 
D
G
 
S
T
 
T
Y
 
F
L
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
P
N
 
T
H
 
D
Y
 
Y
E
 
A
R
 
Q
L
 
L
G
 
S
I
 
V
T
 
D
L
 
V
M
 
R
P
 
L
G
 
G
R
 
V
R
x
A
M
x
A
S
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
V
P
 
P
A
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
T
I
 
V
V
 
Q
L
 
T
D
 
T
G
 
D
G
 
G
E
 
E
T
 
-
L
 
L
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
I
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
A
R
 
S
P
 
P
L
 
I
R
 
R
P
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
P
-
 
G
-
 
R
-
 
Q
H
 
F
T
 
T
C
x
V
W
x
R
T
 
T
L
 
V
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
A
K
 
Q
I
 
L
A
 
R
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
I
 
K
P
 
P
G
 
G
S
 
Q
H
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
L
M
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
S
F
 
W
V
 
I
G
 
S
T
 
A
I
 
E
V
 
V
L
 
A
E
 
T
A
 
A
L
 
A
A
 
L
L
 
R
R
 
R
Q
 
G
V
 
C
S
 
S
L
 
V
T
 
T
V
 
C
V
 
I
E
 
E
M
 
A
G
 
G
D
 
P
R
 
A
M
 
P
V
 
L
P
 
S
R
 
A
M
 
A
M
 
L
D
 
G
E
 
A
T
 
D
A
 
V
G
 
G
G
 
Q
M
 
R
L
 
F
K
 
L
R
 
P
W
 
W
C
 
W
E
 
S
A
 
E
K
 
V
G
 
D
V
 
L
R
 
R
V
 
L
L
 
-
T
 
-
G
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
V
R
 
A
R
 
E
I
 
V
T
 
T
Q
 
E
A
 
T
Q
 
G
A
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
V
E
 
Q
L
 
L
S
 
A
D
 
N
G
 
G
T
 
E
S
 
Q
L
 
V
P
 
D
A
 
A
H
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
T
S
 
G
A
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
R
S
 
P
N
 
A
T
 
V
E
 
D
A
 
W
V
 
L
A
 
S
A
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
D
N
 
T
G
 
G
I
 
V
L
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
H
 
H
M
 
L
R
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
G
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P16640 Putidaredoxin reductase CamA; Pdr; Putidaredoxin--NAD(+) reductase; EC 1.18.1.5 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 2 papers)
31% identity, 67% coverage: 4:283/421 of query aligns to 8:287/422 of P16640

query
sites
P16640
L
 
V
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
T
G
 
G
P
 
L
A
|
A
G
 
G
V
 
V
T
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
F
I
 
G
I
 
L
R
 
R
E
 
A
L
 
S
E
 
G
P
 
W
G
 
E
A
 
G
T
 
N
I
 
I
T
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
|
D
E
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
I
P
 
P
E
 
H
-
 
H
-
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
L
S
 
S
R
x
K
M
 
A
A
 
-
I
 
-
P
 
-
Y
 
-
M
 
Y
L
 
L
V
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
A
G
 
T
E
 
A
D
 
E
G
 
S
T
 
L
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
K
 
T
G
 
-
P
 
P
N
 
D
H
 
A
Y
 
Y
E
 
A
R
 
A
L
 
Q
G
 
N
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
G
G
 
G
R
 
T
R
 
Q
M
x
V
S
 
T
G
 
A
L
 
I
D
 
N
P
 
R
A
 
D
A
 
R
R
 
Q
R
 
Q
I
 
V
V
 
I
L
 
L
D
 
S
G
 
D
G
 
G
E
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
D
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
-
R
 
R
P
 
P
D
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
N
G
 
N
I
 
F
H
 
R
T
 
Y
C
 
L
W
x
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
E
K
 
C
I
 
I
A
 
R
A
 
R
Q
 
Q
A
 
L
I
 
I
P
 
A
G
 
D
S
 
N
H
 
R
V
 
L
V
 
V
L
 
V
M
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
I
G
 
G
T
 
L
I
 
E
V
 
V
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
I
L
 
K
R
 
A
Q
 
N
V
 
M
S
 
H
L
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
E
 
D
M
 
T
G
 
A
D
 
A
R
 
R
M
 
V
V
 
L
P
 
E
R
 
R
M
 
V
M
 
T
D
 
A
E
 
P
T
 
P
A
 
V
G
 
S
G
 
A
M
 
F
L
 
Y
K
 
E
R
 
H
W
 
L
C
 
H
E
 
R
A
 
E
K
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
D
V
 
I
L
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
Q
I
 
V
T
 
C
Q
 
G
A
 
F
Q
 
E
A
 
M
A
 
S
A
 
T
D
 
D
T
 
Q
R
 
Q
D
 
K
S
 
V
L
 
T
V
 
A
V
 
V
E
 
L
L
 
C
S
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
A
S
 
G
A
 
I
G
 
G
V
 
L
R
 
I
S
 
P
N
 
N
T
 
C
E
 
E
A
 
L
V
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
L
 
V
G
 
D
N
 
N
G
 
G
I
 
I
L
 
V
V
 
I
D
 
N
D
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
L
 
D
P
 
P
D
 
L
V
 
I
F
 
M
A
 
A
A
 
V
G
 
G
D
|
D
V
 
C
A
 
A
Q
 
R

Sites not aligning to the query:

1q1wA Crystal structure of putidaredoxin reductase from pseudomonas putida (see paper)
31% identity, 67% coverage: 4:283/421 of query aligns to 7:286/422 of 1q1wA

query
sites
1q1wA
L
 
V
I
 
I
V
 
V
G
|
G
A
 
T
G
|
G
P
x
L
A
|
A
G
 
G
V
 
V
T
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
F
I
 
G
I
 
L
R
 
R
E
 
A
L
 
S
E
 
G
P
 
W
G
 
E
A
 
G
T
 
N
I
 
I
T
 
R
L
 
L
V
 
V
G
|
G
D
|
D
E
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
I
P
 
P
E
 
H
-
 
H
-
x
L
P
|
P
P
 
P
Y
 
L
S
 
S
R
x
K
M
 
A
A
 
-
I
 
-
P
 
-
Y
 
-
M
 
Y
L
 
L
V
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
A
G
 
T
E
 
A
D
 
E
G
 
S
T
 
L
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
K
 
T
G
 
-
P
 
P
N
 
D
H
 
A
Y
 
Y
E
 
A
R
 
A
L
 
Q
G
 
N
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
G
G
 
G
R
 
T
R
 
Q
M
x
V
S
 
T
G
 
A
L
 
I
D
 
N
P
 
R
A
 
D
A
 
R
R
 
Q
R
 
Q
I
 
V
V
 
I
L
 
L
D
 
S
G
 
D
G
 
G
E
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
D
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
|
A
L
x
T
G
|
G
A
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
-
R
 
R
P
 
P
D
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
N
G
 
N
I
 
F
H
 
R
T
 
Y
C
 
L
W
x
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
E
K
 
C
I
 
I
A
 
R
A
 
R
Q
 
Q
A
 
L
I
 
I
P
 
A
G
 
D
S
 
N
H
 
R
V
 
L
V
 
V
L
 
V
M
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
 
E
V
 
V
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
I
L
 
K
R
 
A
Q
 
N
V
 
M
S
 
H
L
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
E
 
D
M
 
T
G
 
A
D
 
A
R
 
R
M
 
V
V
 
L
P
 
E
R
 
R
M
 
V
M
 
T
D
 
A
E
 
P
T
 
P
A
 
V
G
 
S
G
 
A
M
 
F
L
 
Y
K
 
E
R
 
H
W
 
L
C
 
H
E
 
R
A
 
E
K
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
D
V
 
I
L
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
Q
I
 
V
T
 
C
Q
 
G
A
 
F
Q
 
E
A
 
M
A
 
S
A
 
T
D
 
D
T
 
Q
R
 
Q
D
 
K
S
 
V
L
 
T
V
 
A
V
 
V
E
 
L
L
 
C
S
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
A
S
 
G
A
 
I
G
 
G
V
 
L
R
 
I
S
 
P
N
 
N
T
 
C
E
 
E
A
 
L
V
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
L
 
V
G
 
D
N
 
N
G
 
G
I
 
I
L
 
V
V
 
I
D
 
N
D
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
L
 
D
P
 
P
D
 
L
V
 
I
F
 
M
A
 
A
A
 
V
G
 
G
D
|
D
V
 
C
A
 
A
Q
 
R

Sites not aligning to the query:

3cgeA Pyridine nucleotide complexes with bacillus anthracis coenzyme a- disulfide reductase: a structural analysis of dual NAD(p)h specificity (see paper)
25% identity, 90% coverage: 1:378/421 of query aligns to 1:394/444 of 3cgeA

query
sites
3cgeA
M
 
M
H
 
N
H
 
Y
L
 
V
I
 
I
V
x
I
G
 
G
A
 
G
G
x
D
P
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
M
T
 
S
A
 
A
A
 
A
-
x
M
E
 
Q
I
 
I
I
 
V
R
|
R
E
 
N
L
 
D
E
 
E
P
 
N
G
 
A
A
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
T
L
|
L
V
x
E
G
x
K
D
 
G
E
 
E
P
 
I
E
 
-
P
x
Y
P
x
S
Y
 
Y
S
 
A
R
x
Q
M
x
C
A
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
M
 
V
L
 
I
V
 
S
G
 
G
K
 
A
V
 
I
G
 
A
E
 
S
D
 
T
G
 
E
T
 
K
Y
 
L
L
 
I
R
 
A
K
x
R
G
 
N
P
 
V
N
 
K
H
 
T
Y
 
F
-
 
R
E
 
D
R
 
K
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
D
L
 
A
M
 
K
P
 
V
G
 
R
R
 
H
R
 
E
M
x
V
S
 
T
G
 
K
L
 
V
D
 
D
P
 
T
A
 
E
A
 
K
R
 
K
R
 
I
I
 
V
V
 
Y
L
 
A
D
 
E
G
 
H
G
 
T
E
 
K
T
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
E
L
 
F
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
A
L
x
T
G
|
G
A
 
V
R
 
R
P
 
P
L
 
V
R
 
M
P
 
P
D
 
E
I
 
W
E
 
E
G
 
G
L
 
R
D
 
D
L
 
L
P
 
Q
G
 
G
I
 
V
H
 
H
T
 
L
C
 
L
W
 
K
T
 
T
L
 
I
A
 
P
D
 
D
A
 
A
R
 
E
K
 
R
I
 
I
-
 
L
-
 
K
A
 
T
A
 
L
Q
 
E
A
 
T
I
 
N
P
 
K
G
 
V
S
 
E
H
 
D
V
 
V
V
 
T
L
 
I
M
x
I
G
|
G
A
 
G
G
 
G
F
x
A
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
x
E
V
 
M
S
 
A
L
 
E
T
 
T
V
 
F
V
 
V
E
 
E
M
 
L
G
 
G
D
 
K
-
 
K
-
 
V
R
 
R
M
 
M
V
 
I
P
x
E
R
|
R
-
x
N
-
 
D
-
 
H
-
 
I
-
 
G
-
x
T
M
 
I
M
 
Y
D
 
D
E
 
G
T
 
D
A
 
M
G
 
A
G
 
E
M
 
Y
L
 
I
K
 
Y
R
 
K
W
 
E
C
 
A
E
 
D
A
 
K
K
 
H
G
 
H
V
 
I
R
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
N
T
 
E
G
 
N
I
 
V
R
 
K
R
 
A
I
 
F
T
 
K
Q
 
G
A
 
N
Q
 
E
A
 
R
A
 
V
A
 
E
D
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
T
S
 
D
D
 
K
G
 
G
T
 
T
S
 
-
L
 
Y
P
 
K
A
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
V
 
V
S
 
S
A
x
V
G
|
G
V
 
V
R
 
K
S
 
P
N
 
N
T
 
T
E
 
D
A
 
F
V
 
L
A
 
E
A
 
G
S
 
T
G
 
N
I
 
I
A
 
R
L
 
T
G
 
N
N
 
H
-
 
K
-
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
E
V
 
V
D
 
N
D
 
A
H
 
Y
M
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
N
L
 
V
P
 
Q
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
C
A
 
A
Q
 
T
G
 
H
R
 
Y
D
 
H
F
 
V
M
 
I
S
 
K
G
 
-
E
 
E
A
 
I
H
 
H
V
 
D
H
 
H
-
 
I
A
x
P
I
|
I
Q
x
G
I
 
T
T
 
T
A
|
A
A
x
N
A
 
K
H
 
Q
G
 
G
R
|
R
I
 
L
A
 
A
A
 
G
Y
 
L
N
 
N
M
 
M
T
 
L
G
 
D
N
 
K
D
 
R
Q
 
R
A
 
A
Y
 
F
H
 
K
G
 
G
S
 
T
L
 
L
N
 
G
M
 
T
N
 
G
V
 
I
L
 
I
D
 
K
T
 
F
L
 
M
G
 
N
L
 
L
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
G
I
 
L
T
 
H
C
 
I
S
 
P
F
 
Y
G
 
K
S
 
T
W
 
V
Q
 
K
G
 
V
N
 
D
G
 
S
G
 
T
D
 
N
C
 
M
A
 
A
R
 
G
L
 
Y
V
 
Y
D
 
P
E
 
N
A
 
A
G
 
K
F
 
P
R
 
L
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
L
 
L
E
 
L
F
 
Y
D
 
R
G
 
S
T
 
D
S
 
T
D
 
K
V
 
Q
V
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
G
Q
 
Q
A
 
V
V
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3cgdA Pyridine nucleotide complexes with bacillus anthracis coenzyme a- disulfide reductase: a structural analysis of dual NAD(p)h specificity (see paper)
25% identity, 90% coverage: 1:378/421 of query aligns to 1:394/444 of 3cgdA

query
sites
3cgdA
M
 
M
H
 
N
H
 
Y
L
 
V
I
 
I
V
x
I
G
|
G
A
 
G
G
x
D
P
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
M
T
 
S
A
 
A
A
 
A
-
x
M
E
x
Q
I
 
I
I
 
V
R
|
R
E
 
N
L
 
D
E
 
E
P
 
N
G
 
A
A
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
T
L
|
L
V
x
E
G
x
K
D
 
G
E
 
E
P
 
I
E
 
-
P
x
Y
P
x
S
Y
|
Y
S
 
A
R
x
Q
M
x
C
A
 
G
I
 
L
P
 
P
Y
 
Y
M
 
V
L
 
I
V
 
S
G
 
G
K
 
A
V
 
I
G
 
A
E
 
S
D
 
T
G
 
E
T
 
K
Y
 
L
L
 
I
R
 
A
K
x
R
G
 
N
P
 
V
N
 
K
H
 
T
Y
 
F
-
 
R
E
 
D
R
 
K
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
D
L
 
A
M
 
K
P
 
V
G
 
R
R
 
H
R
 
E
M
x
V
S
 
T
G
 
K
L
 
V
D
 
D
P
 
T
A
 
E
A
 
K
R
 
K
R
 
I
I
 
V
V
 
Y
L
 
A
D
 
E
G
 
H
G
 
T
E
 
K
T
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
E
L
 
F
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
I
A
|
A
L
x
T
G
 
G
A
 
V
R
 
R
P
 
P
L
 
V
R
 
M
P
 
P
D
 
E
I
 
W
E
 
E
G
 
G
L
 
R
D
 
D
L
 
L
P
 
Q
G
 
G
I
 
V
H
 
H
T
 
L
C
 
L
W
 
K
T
 
T
L
 
I
A
 
P
D
 
D
A
 
A
R
 
E
K
 
R
I
 
I
-
 
L
-
 
K
A
 
T
A
 
L
Q
 
E
A
 
T
I
 
N
P
 
K
G
 
V
S
 
E
H
 
D
V
 
V
V
 
T
L
 
I
M
x
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
F
x
A
V
x
I
G
 
G
T
 
L
I
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
x
E
V
 
M
S
 
A
L
 
E
T
 
T
V
 
F
V
 
V
E
 
E
M
 
L
G
 
G
D
 
K
-
 
K
-
 
V
R
 
R
M
 
M
V
 
I
P
x
E
R
|
R
-
 
N
-
 
D
-
 
H
-
 
I
-
 
G
-
 
T
M
 
I
M
 
Y
D
 
D
E
 
G
T
 
D
A
 
M
G
 
A
G
 
E
M
 
Y
L
 
I
K
 
Y
R
 
K
W
 
E
C
 
A
E
 
D
A
 
K
K
 
H
G
 
H
V
 
I
R
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
N
T
 
E
G
 
N
I
 
V
R
 
K
R
 
A
I
 
F
T
 
K
Q
 
G
A
 
N
Q
 
E
A
 
R
A
 
V
A
 
E
D
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
T
S
 
D
D
 
K
G
 
G
T
 
T
S
 
-
L
 
Y
P
 
K
A
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
V
 
V
S
 
S
A
x
V
G
|
G
V
 
V
R
 
K
S
 
P
N
 
N
T
 
T
E
 
D
A
 
F
V
 
L
A
 
E
A
 
G
S
 
T
G
 
N
I
 
I
A
 
R
L
 
T
G
 
N
N
 
H
-
 
K
-
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
E
V
 
V
D
 
N
D
 
A
H
 
Y
M
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
N
L
 
V
P
 
Q
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
C
A
 
A
Q
 
T
G
 
H
R
 
Y
D
 
H
F
 
V
M
 
I
S
 
K
G
 
-
E
 
E
A
 
I
H
 
H
V
 
D
H
 
H
-
 
I
A
x
P
I
|
I
Q
x
G
I
 
T
T
 
T
A
|
A
A
x
N
A
 
K
H
 
Q
G
 
G
R
|
R
I
 
L
A
 
A
A
 
G
Y
 
L
N
 
N
M
 
M
T
 
L
G
 
D
N
 
K
D
 
R
Q
 
R
A
 
A
Y
 
F
H
 
K
G
 
G
S
 
T
L
 
L
N
 
G
M
 
T
N
 
G
V
 
I
L
 
I
D
 
K
T
 
F
L
 
M
G
 
N
L
 
L
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
G
I
 
L
T
 
H
C
 
I
S
 
P
F
 
Y
G
 
K
S
 
T
W
 
V
Q
 
K
G
 
V
N
 
D
G
 
S
G
 
T
D
 
N
C
 
M
A
 
A
R
 
G
L
 
Y
V
 
Y
D
 
P
E
 
N
A
 
A
G
 
K
F
 
P
R
 
L
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
L
 
L
E
 
L
F
 
Y
D
 
R
G
 
S
T
 
D
S
 
T
D
 
K
V
 
Q
V
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
G
Q
 
Q
A
 
V
V
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_043744649.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_043744649.1
MHHLIVGAGPAGVTAAEIIRELEPGATITLVGDEPEPPYSRMAIPYMLVGKVGEDGTYLR
KGPNHYERLGITLMPGRRMSGLDPAARRIVLDGGETLAYDRLLLALGARPLRPDIEGLDL
PGIHTCWTLADARKIAAQAIPGSHVVLMGAGFVGTIVLEALALRQVSLTVVEMGDRMVPR
MMDETAGGMLKRWCEAKGVRVLTGTGIRRITQAQAAADTRDSLVVELSDGTSLPAHLVVV
SAGVRSNTEAVAASGIALGNGILVDDHMRTSLPDVFAAGDVAQGRDFMSGEAHVHAIQIT
AAAHGRIAAYNMTGNDQAYHGSLNMNVLDTLGLITCSFGSWQGNGGDCARLVDEAGFRYL
RLEFDGTSDVVIGAQAVGTTDHVGALRGLIQSKRRLGTAVKEQMMADPTRFMNGFVQILH
R

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory