SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_043766536.1 NCBI__GCF_000733765.1:WP_043766536.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5i1fA Crystal structure of utp-glucose-1-phosphate uridylyltransferase from burkholderia vietnamiensis in complex with uridine-5'-diphosphate- glucose
61% identity, 94% coverage: 1:284/303 of query aligns to 3:285/290 of 5i1fA

query
sites
5i1fA
M
 
L
R
 
K
I
 
V
R
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
|
P
V
 
V
A
|
A
G
|
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
P
K
|
K
E
|
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
T
E
 
E
L
 
M
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
K
 
K
N
 
R
S
 
A
I
 
I
M
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
K
A
 
S
Y
 
Y
E
 
E
L
 
I
E
 
E
N
 
A
E
 
E
L
 
L
Q
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
L
V
 
V
Q
 
R
E
 
S
I
 
I
L
 
K
P
 
P
P
 
S
G
 
H
I
 
V
T
 
D
C
 
C
I
 
F
F
 
Y
I
 
V
R
 
R
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
A
|
A
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
C
 
C
A
 
A
W
 
E
P
 
K
A
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
N
D
 
P
F
 
F
Y
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
D
|
D
L
 
L
I
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
P
L
 
-
R
 
T
P
 
P
C
 
V
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
M
 
M
H
 
I
R
 
D
V
 
V
Y
 
F
Q
 
D
E
 
H
Y
 
Y
G
 
H
T
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
G
C
 
V
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
P
 
A
H
 
P
D
 
A
E
 
D
I
 
S
G
 
K
S
 
S
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
G
K
 
K
P
 
R
V
 
W
G
 
E
P
 
D
G
 
D
L
 
L
G
 
F
E
 
K
I
 
L
K
 
S
K
 
G
I
 
I
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
E
P
 
P
D
 
A
E
 
Q
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
N
L
 
F
A
 
G
V
|
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
L
T
 
K
P
 
P
R
 
K
I
 
I
F
 
F
K
 
K
I
 
H
L
 
L
Q
 
R
R
 
G
T
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
Q
Q
 
S
M
 
L
M
 
L
Q
 
T
E
 
D
Q
 
E
T
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
 
R
F
 
Y
D
 
D
G
 
G
K
 
T
R
 
R
Y
 
F
D
 
D
C
 
C
G
 
G
S
 
S
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
N
 
T
V
 
V
E
 
E
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
R
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
V
G
 
A
E
 
A
D
 
D
F
 
F
R
 
E
N
 
R
Y
 
Y
L
 
L

5ve7A Crystal structure of utp-glucose-1-phosphate uridylyltransferase from burkholderia ambifaria in complex with utp
60% identity, 94% coverage: 1:284/303 of query aligns to 1:279/282 of 5ve7A

query
sites
5ve7A
M
 
L
R
 
K
I
 
V
R
 
N
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
|
P
V
|
V
A
|
A
G
|
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
P
K
|
K
E
|
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
T
E
 
E
L
 
M
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
K
 
K
N
 
R
S
 
A
I
 
I
M
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
K
A
 
S
Y
 
Y
E
 
E
L
 
V
E
 
E
N
 
A
E
 
E
L
 
L
Q
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
L
V
 
V
Q
 
R
E
 
S
I
 
I
L
 
K
P
 
P
P
 
S
G
 
H
I
 
V
T
 
D
C
 
C
I
 
F
F
 
Y
I
 
V
R
 
R
Q
|
Q
A
 
P
E
 
E
A
|
A
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
C
 
C
A
 
A
W
 
E
P
 
K
A
 
L
V
 
V
G
 
A
D
 
D
E
 
N
D
 
P
F
 
F
Y
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
N
L
 
-
R
 
P
P
 
P
C
 
V
L
 
M
A
 
K
Q
 
Q
M
 
M
H
 
V
R
 
D
V
 
V
Y
 
F
Q
 
D
E
 
H
Y
 
Y
G
 
H
T
 
S
S
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
G
C
 
V
E
 
E
Q
 
E
V
 
I
P
 
P
H
 
P
D
 
S
E
 
E
I
 
T
G
 
K
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
G
K
 
K
P
 
E
V
 
W
G
 
E
P
 
E
G
 
S
L
 
I
G
 
V
E
 
K
I
 
M
K
 
S
K
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
A
P
 
P
D
 
E
E
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
K
P
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
F
K
 
E
I
 
H
L
 
L
Q
 
R
R
 
A
T
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
Q
Q
 
A
M
 
L
M
 
L
Q
 
A
E
 
D
Q
 
E
T
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
 
K
F
 
Y
D
 
Q
G
 
G
K
 
T
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
C
 
C
G
 
G
S
 
S
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
N
 
T
V
 
V
E
 
E
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
R
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
T
D
 
E
F
 
F
R
 
D
N
 
A
Y
 
Y
L
 
L

2ux8G Crystal structure of sphingomonas elodea atcc 31461 glucose-1- phosphate uridylyltransferase in complex with glucose-1-phosphate. (see paper)
52% identity, 93% coverage: 3:283/303 of query aligns to 5:282/288 of 2ux8G

query
sites
2ux8G
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
M
A
 
P
K
 
K
E
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
E
E
 
Q
L
 
M
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
K
N
 
S
S
 
A
I
 
L
M
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
A
E
 
T
L
 
M
Q
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
S
K
 
-
L
 
-
L
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
L
Q
 
D
E
 
G
I
 
T
-
 
R
L
 
L
P
 
K
P
 
P
G
 
G
I
 
-
T
 
N
C
 
I
I
 
A
F
 
Y
I
 
V
R
 
R
Q
 
Q
A
 
Q
E
 
E
A
 
P
L
 
M
G
 
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
W
C
 
C
A
 
A
W
 
R
P
 
D
A
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
E
D
 
P
F
 
F
Y
 
A
V
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
F
I
 
M
D
 
F
G
 
G
Q
 
Q
L
 
P
R
 
G
P
 
-
C
 
C
L
 
L
A
 
K
Q
 
Q
M
 
M
H
 
V
R
 
D
V
 
A
Y
 
Y
Q
 
N
E
 
K
Y
 
V
G
 
G
T
 
G
S
 
N
V
 
L
L
 
I
A
 
C
C
 
A
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
P
 
P
H
 
D
D
 
D
E
 
Q
I
 
T
G
 
H
S
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
I
V
 
I
D
 
T
V
 
P
K
 
G
P
 
T
V
 
Q
G
 
D
P
 
G
G
 
V
L
 
L
G
 
T
E
 
E
I
 
V
K
 
K
K
 
G
I
 
L
V
 
V
E
|
E
K
 
K
P
 
P
K
 
A
P
 
P
D
 
G
E
 
T
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
S
V
|
V
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
Q
P
 
P
R
 
E
I
 
V
F
 
M
K
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
R
 
N
T
 
Q
Q
 
G
A
 
K
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
T
|
T
D
 
D
A
 
A
I
 
M
S
 
Q
Q
 
R
M
 
M
M
 
I
Q
 
G
E
 
D
Q
 
Q
T
 
P
V
 
F
L
 
H
A
 
G
Y
 
V
E
 
T
F
 
F
D
 
Q
G
 
G
K
 
T
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
C
 
C
G
 
G
S
 
D
K
 
K
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
Q
A
 
A
N
 
N
V
 
L
E
 
A
Y
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
S
H
 
R
P
 
P
E
 
D
V
 
L
G
 
E
E
 
P
D
 
A
F
 
V
R
 
R
N
 
A
Y
 
F

8f73E Crystal structure of pseudomonas aeruginosa udp-glucose phosphorylase in complex with udp-glucose (see paper)
50% identity, 87% coverage: 3:266/303 of query aligns to 8:271/281 of 8f73E

query
sites
8f73E
I
 
I
R
 
K
K
 
K
A
 
C
V
 
L
F
 
F
P
|
P
V
 
A
A
|
A
G
|
G
L
 
Y
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
M
A
 
P
K
|
K
E
|
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
N
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
S
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
L
E
 
S
E
 
E
L
 
I
V
 
G
F
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
K
N
 
R
S
 
S
I
 
L
M
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
I
A
 
S
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
H
E
 
Q
L
 
I
Q
 
R
E
 
N
R
 
T
G
 
D
K
 
K
T
 
E
K
 
K
L
 
Y
L
 
L
E
 
V
V
 
G
V
 
I
Q
 
R
E
 
R
I
 
L
L
 
I
P
 
D
P
 
E
G
 
-
I
 
C
T
 
T
C
 
F
I
 
A
F
 
Y
I
 
T
R
 
R
Q
|
Q
A
 
V
E
 
E
A
 
M
L
 
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
I
L
 
L
C
 
T
A
 
G
W
 
R
P
 
P
A
 
L
V
 
I
G
 
G
D
 
D
E
 
E
D
 
P
F
 
F
Y
 
A
V
 
V
I
 
V
L
|
L
A
 
A
D
 
D
D
|
D
L
 
L
-
 
C
I
 
L
D
 
N
G
 
L
Q
 
E
L
 
G
R
 
D
P
 
S
C
 
V
L
 
L
A
 
K
Q
 
Q
M
 
M
H
 
V
R
 
K
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
N
E
 
Q
Y
 
F
G
 
R
T
 
C
S
 
S
V
 
I
L
 
V
A
 
A
C
 
I
E
 
Q
Q
 
E
V
 
V
P
 
P
H
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
T
G
 
N
S
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
I
D
 
A
V
 
G
K
 
E
P
 
M
V
 
I
G
 
R
P
 
D
G
 
D
L
 
I
G
 
F
E
 
R
I
 
V
K
 
N
K
 
T
I
 
M
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
A
V
x
I
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
R
 
D
I
 
I
F
 
F
K
 
D
I
 
L
L
 
I
Q
 
E
R
 
Q
T
 
T
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
L
S
 
M
Q
 
K
M
 
Q
M
 
A
Q
 
Q
E
 
D
Q
 
G
T
 
C
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
 
K
F
 
F
D
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
Y
 
F
D
 
D
C
 
C
G
 
G
S
 
S
K
 
A
L
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
K
 
E
A
 
A
N
 
T

6knlA Uridine and triphosphate-bound ugpase from acinetobacter baumannii
48% identity, 94% coverage: 3:287/303 of query aligns to 2:289/290 of 6knlA

query
sites
6knlA
I
 
I
R
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
L
P
|
P
V
 
V
A
 
A
G
|
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
S
S
 
I
A
 
P
K
|
K
E
 
E
M
 
M
L
 
V
P
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
R
P
 
P
L
 
A
I
 
I
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
V
V
 
V
A
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
E
E
 
Q
L
 
I
V
 
I
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
H
R
 
S
S
 
S
K
 
K
N
 
A
S
 
S
I
 
I
M
 
E
D
 
N
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
K
 
R
A
 
N
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
T
E
 
T
L
 
L
Q
 
E
E
 
Q
R
x
K
G
 
K
K
|
K
T
 
F
K
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
A
V
 
E
V
 
I
Q
 
T
E
 
Q
I
 
I
L
 
V
P
 
P
P
 
E
G
 
H
I
 
V
T
 
S
C
 
V
I
 
I
F
 
S
I
 
V
R
 
R
Q
|
Q
A
 
P
E
 
Q
A
x
P
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
C
 
C
A
 
A
W
 
K
P
 
S
A
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
D
D
 
D
F
 
F
Y
 
A
V
 
V
I
 
L
L
 
L
A
x
P
D
|
D
D
 
V
L
 
L
I
 
V
-
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
L
 
G
R
 
Q
P
 
N
C
 
D
L
 
L
A
 
S
Q
 
R
M
 
M
H
 
I
R
 
S
V
 
R
Y
 
Y
Q
 
N
E
 
S
Y
 
S
G
 
Q
T
 
A
S
 
A
V
 
Q
L
 
I
A
 
M
C
 
V
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
P
 
P
H
 
D
D
 
H
E
 
L
I
 
V
G
 
D
S
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
V
K
 
A
P
 
Q
V
 
-
G
 
S
P
 
P
G
 
N
L
 
E
G
 
G
E
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
A
I
 
M
K
 
Q
K
 
G
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
P
P
 
V
D
 
G
E
 
A
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
L
T
 
P
P
 
A
R
 
K
I
 
I
F
 
M
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
Q
 
E
R
 
N
T
 
T
Q
 
P
A
 
K
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
A
Q
 
M
M
 
L
M
 
Q
Q
 
D
E
 
T
Q
 
D
T
 
T
V
 
V
L
 
E
A
 
A
Y
 
Y
E
 
R
F
 
M
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
R
 
T
Y
 
F
D
 
D
C
 
C
G
 
G
S
 
S
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
N
 
V
V
 
L
E
 
H
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
K
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
K
V
 
L
G
 
G
E
 
M
D
 
E
F
 
F
R
 
K
N
 
Q
Y
 
L
L
 
I
H
 
L
E
 
E
L
 
L

6k8dA Udp-glucose pyrophosphorylase with upg from acinetobacter baumanii
48% identity, 94% coverage: 3:287/303 of query aligns to 2:289/290 of 6k8dA

query
sites
6k8dA
I
 
I
R
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
L
P
|
P
V
 
V
A
|
A
G
|
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
S
S
 
I
A
 
P
K
 
K
E
 
E
M
 
M
L
 
V
P
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
R
P
 
P
L
 
A
I
 
I
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
V
V
 
V
A
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
E
E
 
Q
L
 
I
V
 
I
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
H
R
 
S
S
 
S
K
 
K
N
 
A
S
 
S
I
 
I
M
 
E
D
 
N
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
K
 
R
A
 
N
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
T
E
 
T
L
 
L
Q
 
E
E
 
Q
R
 
K
G
 
K
K
 
K
T
 
F
K
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
A
V
 
E
V
 
I
Q
 
T
E
 
Q
I
 
I
L
 
V
P
 
P
P
 
E
G
 
H
I
 
V
T
 
S
C
 
V
I
 
I
F
 
S
I
 
V
R
 
R
Q
|
Q
A
 
P
E
 
Q
A
x
P
L
 
L
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
C
 
C
A
 
A
W
 
K
P
 
S
A
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
D
D
 
D
F
 
F
Y
 
A
V
 
V
I
 
L
L
|
L
A
 
P
D
|
D
D
 
V
L
 
L
I
 
V
-
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
L
 
G
R
 
Q
P
 
N
C
 
D
L
 
L
A
 
S
Q
 
R
M
 
M
H
 
I
R
 
S
V
 
R
Y
 
Y
Q
 
N
E
 
S
Y
 
S
G
 
Q
T
 
A
S
 
A
V
 
Q
L
 
I
A
 
M
C
 
V
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
P
 
P
H
 
D
D
 
H
E
 
L
I
 
V
G
 
D
S
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
V
K
 
A
P
 
Q
V
 
-
G
 
S
P
 
P
G
 
N
L
 
E
G
 
G
E
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
A
I
 
M
K
 
Q
K
 
G
I
 
I
V
 
V
E
|
E
K
 
K
P
 
P
K
 
P
P
 
V
D
 
G
E
 
A
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
S
V
|
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
L
T
 
P
P
 
A
R
 
K
I
 
I
F
 
M
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
Q
 
E
R
 
N
T
 
T
Q
 
P
A
 
K
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
A
Q
 
M
M
 
L
M
 
Q
Q
 
D
E
 
T
Q
 
D
T
 
T
V
 
V
L
 
E
A
 
A
Y
 
Y
E
 
R
F
 
M
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
R
 
T
Y
 
F
D
 
D
C
 
C
G
 
G
S
 
S
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
N
 
V
V
 
L
E
 
H
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
K
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
K
V
 
L
G
 
G
E
 
M
D
 
E
F
 
F
R
 
K
N
 
Q
Y
 
L
L
 
I
H
 
L
E
 
E
L
 
L

6ikzB Udp-glucose pyrophosphorylase from acinetobacter baumanii
47% identity, 94% coverage: 3:287/303 of query aligns to 2:284/285 of 6ikzB

query
sites
6ikzB
I
 
I
R
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
L
P
|
P
V
|
V
A
|
A
G
|
G
L
|
L
G
|
G
T
|
T
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
S
S
 
I
A
 
P
K
|
K
E
 
E
M
 
M
L
 
V
P
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
R
P
 
P
L
 
A
I
 
I
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
V
V
 
V
A
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
E
E
 
Q
L
 
I
V
 
I
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
H
R
 
S
S
 
S
K
 
K
N
 
A
S
 
S
I
 
I
M
 
E
D
 
N
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
K
 
R
A
 
N
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
T
E
 
T
L
 
L
Q
 
E
E
 
Q
R
 
K
G
 
K
K
 
K
T
 
F
K
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
A
V
 
E
V
 
I
Q
 
T
E
 
Q
I
 
I
L
 
V
P
 
P
P
 
E
G
 
H
I
 
V
T
 
S
C
 
V
I
 
I
F
 
S
I
 
V
R
 
R
Q
|
Q
A
 
P
E
 
Q
A
x
P
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
C
 
C
A
 
A
W
 
K
P
 
S
A
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
D
D
 
D
F
 
F
Y
 
A
V
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
P
D
|
D
D
 
V
L
 
L
I
 
V
-
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
L
 
G
R
 
Q
P
 
N
C
 
D
L
 
L
A
 
S
Q
 
R
M
 
M
H
 
I
R
 
S
V
 
R
Y
 
Y
Q
 
N
E
 
S
Y
 
S
G
 
Q
T
 
A
S
 
A
V
 
Q
L
 
I
A
 
M
C
 
V
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
P
 
P
H
 
D
D
 
H
E
 
L
I
 
V
G
 
D
S
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
V
K
 
A
P
 
Q
V
 
-
G
 
S
P
 
P
G
 
N
L
 
E
G
 
G
E
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
A
I
 
M
K
 
Q
K
 
G
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
P
P
 
V
D
 
G
E
 
A
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
L
T
 
P
P
 
A
R
 
K
I
 
I
F
 
M
K
 
Q
I
 
L
L
 
L
Q
 
E
R
 
N
T
 
T
Q
 
P
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
A
Q
 
M
M
 
L
M
 
Q
Q
 
D
E
 
T
Q
 
D
T
 
T
V
 
V
L
 
E
A
 
A
Y
 
Y
E
 
R
F
 
M
D
 
Q
G
 
G
K
 
Q
R
 
T
Y
 
F
D
 
D
C
 
C
G
 
G
S
 
S
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
N
 
V
V
 
L
E
 
H
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
K
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
K
V
 
L
G
 
G
E
 
M
D
 
E
F
 
F
R
 
K
N
 
Q
Y
 
L
L
 
I
H
 
L
E
 
E
L
 
L

3jukD The crystal structure of udp-glucose pyrophosphorylase complexed with udp-glucose (see paper)
48% identity, 89% coverage: 3:273/303 of query aligns to 2:264/264 of 3jukD

query
sites
3jukD
I
 
I
R
 
K
K
 
K
A
 
C
V
 
L
F
 
F
P
|
P
V
 
A
A
|
A
G
|
G
L
 
Y
G
 
G
T
|
T
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
I
T
 
T
K
 
K
A
 
T
S
 
I
A
 
P
K
 
K
E
|
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
V
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
M
S
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
E
 
E
E
 
V
L
 
M
V
 
A
F
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
N
K
 
K
N
 
R
S
 
S
I
 
L
M
 
E
D
 
D
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
K
 
T
A
 
S
Y
 
Y
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
T
G
 
N
K
 
K
T
 
E
K
 
N
L
 
A
L
 
L
E
 
K
V
 
S
V
 
I
Q
 
R
E
 
N
I
 
I
L
 
I
P
 
E
P
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
K
C
 
C
I
 
C
F
 
F
-
 
S
-
 
Y
I
 
V
R
 
R
Q
|
Q
A
 
K
E
 
Q
A
x
M
L
 
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
I
L
 
L
C
 
T
A
 
G
W
 
E
P
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
D
 
N
E
 
E
D
 
P
F
 
F
Y
 
A
V
 
V
I
 
I
L
|
L
A
 
A
D
 
D
D
|
D
L
 
L
I
 
C
D
 
I
G
 
S
Q
 
H
L
 
D
R
 
H
P
 
P
C
 
S
-
 
V
L
 
L
A
 
K
Q
 
Q
M
 
M
H
 
T
R
 
S
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
E
 
K
Y
 
Y
G
 
Q
T
 
C
S
 
S
V
 
I
L
 
V
A
 
A
C
 
I
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
P
 
A
H
 
L
D
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
S
S
 
K
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
I
D
 
R
V
 
G
K
 
E
P
 
W
V
 
L
G
 
E
P
 
E
G
 
G
L
 
V
G
 
Y
E
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
D
I
 
M
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
N
P
 
Q
D
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
A
V
|
V
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
R
 
D
I
 
I
F
 
F
K
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
S
R
 
E
T
 
T
Q
 
K
A
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
N
G
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
L
S
 
R
Q
 
T
M
 
Q
M
 
A
Q
 
K
E
 
R
Q
 
K
T
 
R
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
F
 
F
D
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
C
 
C
G
 
G
S
 
S
K
 
V
L
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
K
 
E
A
 
A
N
 
S
V
 
N
E
 
A
Y
 
Y
A
 
Y
L
 
K
K
 
K
H
 
R

3jukA The crystal structure of udp-glucose pyrophosphorylase complexed with udp-glucose (see paper)
48% identity, 89% coverage: 3:273/303 of query aligns to 2:264/265 of 3jukA

query
sites
3jukA
I
 
I
R
 
K
K
 
K
A
 
C
V
 
L
F
 
F
P
 
P
V
 
A
A
|
A
G
|
G
L
 
Y
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
I
T
 
T
K
 
K
A
 
T
S
 
I
A
 
P
K
 
K
E
|
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
V
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
M
S
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
E
 
E
E
 
V
L
 
M
V
 
A
F
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
N
K
 
K
N
 
R
S
 
S
I
 
L
M
 
E
D
 
D
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
K
 
T
A
 
S
Y
 
Y
E
 
T
L
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
N
K
 
K
T
 
E
K
 
N
L
 
A
L
 
L
E
 
K
V
 
S
V
 
I
Q
 
R
E
 
N
I
 
I
L
 
I
P
 
E
P
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
K
C
 
C
I
 
C
F
 
F
-
 
S
-
 
Y
I
 
V
R
 
R
Q
|
Q
A
 
K
E
 
Q
A
x
M
L
 
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
I
L
 
L
C
 
T
A
 
G
W
 
E
P
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
D
 
N
E
 
E
D
 
P
F
 
F
Y
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
D
|
D
L
 
L
I
 
C
D
 
I
G
 
S
Q
 
H
L
 
D
R
 
H
P
 
P
C
 
S
-
 
V
L
 
L
A
 
K
Q
 
Q
M
 
M
H
 
T
R
 
S
V
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
E
 
K
Y
 
Y
G
 
Q
T
 
C
S
 
S
V
 
I
L
 
V
A
 
A
C
 
I
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
P
 
A
H
 
L
D
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
S
S
 
K
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
I
D
 
R
V
 
G
K
 
E
P
 
W
V
 
L
G
 
E
P
 
E
G
 
G
L
 
V
G
 
Y
E
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
D
I
 
M
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
N
P
 
Q
D
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
A
V
|
V
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
R
 
D
I
 
I
F
 
F
K
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
S
R
 
E
T
 
T
Q
 
K
A
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
N
G
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
L
S
 
R
Q
 
T
M
 
Q
M
 
A
Q
 
K
E
 
R
Q
 
K
T
 
R
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
F
 
F
D
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
C
 
C
G
 
G
S
 
S
K
 
V
L
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
K
 
E
A
 
A
N
 
S
V
 
N
E
 
A
Y
 
Y
A
 
Y
L
 
K
K
 
K
H
 
R

2ux8A Crystal structure of sphingomonas elodea atcc 31461 glucose-1- phosphate uridylyltransferase in complex with glucose-1-phosphate. (see paper)
45% identity, 93% coverage: 3:283/303 of query aligns to 5:249/255 of 2ux8A

query
sites
2ux8A
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
M
A
 
P
K
 
K
E
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
E
E
 
Q
L
 
M
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
K
N
 
S
S
 
A
I
 
L
M
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
A
E
 
T
L
 
M
Q
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
S
K
 
-
L
 
-
L
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
L
Q
 
D
E
 
G
I
 
T
-
 
R
L
 
L
P
 
K
P
 
P
G
 
G
I
 
-
T
 
N
C
 
I
I
 
A
F
 
Y
I
 
V
R
 
R
Q
 
Q
A
 
Q
E
 
E
A
 
P
L
 
M
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
W
C
 
C
A
 
A
W
 
R
P
 
D
A
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
E
D
 
P
F
 
F
Y
 
A
V
 
V
I
 
L
L
|
L
A
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
F
I
 
M
D
 
F
G
 
G
Q
 
Q
L
 
-
R
 
P
P
 
G
C
 
C
L
 
L
A
 
K
Q
 
Q
M
 
M
H
 
V
R
 
D
V
 
A
Y
 
Y
Q
 
N
E
 
K
Y
 
V
G
 
G
T
 
G
S
 
N
V
 
L
L
 
I
A
 
C
C
 
A
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
E
 
E
I
 
I
G
 
I
S
 
T
Y
 
P
G
 
G
V
 
T
V
 
Q
D
 
D
V
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
V
I
 
L
K
 
T
K
 
E
I
 
V
V
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
K
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
N
 
N
L
 
L
A
 
S
V
|
V
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
|
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
Q
P
 
P
R
 
E
I
 
V
F
 
M
K
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
R
 
N
T
 
Q
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
M
S
 
Q
Q
 
R
M
 
M
M
 
I
Q
 
G
E
 
D
Q
 
Q
T
 
P
V
 
F
L
 
H
A
 
G
Y
 
V
E
 
T
F
 
F
D
 
Q
G
 
G
K
 
T
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
C
 
C
G
 
G
S
 
D
K
 
K
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
Q
A
 
A
N
 
N
V
 
L
E
 
A
Y
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
S
H
 
R
P
 
P
E
 
D
V
 
L
G
 
E
E
 
P
D
 
A
F
 
V
R
 
R
N
 
A
Y
 
F

8b6dA Crystal structure of udp-glucose pyrophosphorylase from thermocrispum agreste dsm 44070 in complex with udp
44% identity, 93% coverage: 6:286/303 of query aligns to 5:286/291 of 8b6dA

query
sites
8b6dA
A
 
A
V
 
I
F
 
V
P
|
P
V
 
A
A
|
A
G
|
G
L
|
L
G
|
G
T
|
T
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
T
T
 
T
K
 
K
A
 
S
S
 
V
A
 
P
K
|
K
E
 
E
M
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
T
P
 
P
L
 
A
I
 
I
Q
 
E
Y
 
L
A
 
V
V
 
A
A
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
R
S
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
V
 
V
F
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
S
R
 
P
S
 
A
K
 
K
N
 
Q
S
 
S
I
 
I
M
 
A
D
 
A
H
 
Y
F
 
F
D
 
R
K
 
P
A
 
A
Y
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
R
E
 
S
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
T
K
 
G
L
 
Q
L
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
I
Q
 
R
E
 
R
I
 
A
L
 
-
P
 
P
P
 
E
G
 
L
I
 
L
T
 
E
C
 
V
I
 
E
F
 
V
I
 
A
R
 
I
Q
|
Q
A
 
E
E
 
Q
A
|
A
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
L
 
A
C
 
C
A
 
A
W
 
E
P
 
P
A
 
N
V
 
L
G
 
G
D
 
P
E
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
V
F
 
V
Y
 
A
V
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
D
 
-
G
 
-
Q
 
L
L
 
P
R
 
H
P
 
G
C
 
I
L
 
L
A
 
E
Q
 
R
M
 
M
H
 
A
R
 
K
V
 
V
Y
 
R
Q
 
A
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
T
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
C
C
 
A
E
 
F
Q
 
D
V
 
I
P
 
P
H
 
K
D
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
S
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
F
D
 
D
V
 
V
K
 
S
P
 
D
V
 
T
G
 
D
P
 
D
G
 
A
-
 
D
L
 
V
G
 
K
E
 
R
I
 
V
K
 
H
K
 
G
I
 
M
V
 
V
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
P
P
 
A
D
 
E
E
 
Q
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
T
L
 
F
A
 
A
V
 
A
V
 
A
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
T
 
D
P
 
R
R
 
A
I
 
I
F
 
F
K
 
D
I
 
A
L
 
L
Q
 
R
R
 
R
T
 
I
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
V
S
 
A
Q
 
L
M
 
L
M
 
I
Q
 
Q
E
 
E
-
 
G
Q
 
H
T
 
P
V
 
V
L
 
H
A
 
V
Y
 
V
E
 
V
F
 
H
D
 
R
G
 
G
K
 
D
R
 
R
Y
 
H
D
 
D
C
 
L
G
 
G
S
 
N
K
 
P
L
 
G
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
R
A
 
A
N
 
A
V
 
V
E
 
D
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
H
 
D
P
 
P
E
 
D
V
 
Y
G
 
G
E
 
P
D
 
E
F
 
L
R
 
R
N
 
A
Y
 
W
L
 
L
H
 
T
E
 
D

8b68A Crystal structure of udp-glucose pyrophosphorylase from thermocrispum agreste dsm 44070 in complex with udp-glucose
42% identity, 93% coverage: 6:286/303 of query aligns to 5:281/286 of 8b68A

query
sites
8b68A
A
 
A
V
 
I
F
 
V
P
|
P
V
 
A
A
|
A
G
|
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
T
T
 
T
K
 
K
A
 
S
S
 
V
A
 
P
K
 
K
E
 
E
M
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
T
P
 
P
L
 
A
I
 
I
Q
 
E
Y
 
L
A
 
V
V
 
A
A
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
R
S
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
V
 
V
F
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
S
R
 
P
S
 
A
K
 
K
N
 
Q
S
 
S
I
 
I
M
 
A
D
 
A
H
 
Y
F
 
F
D
 
R
K
 
P
A
 
A
Y
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
R
E
 
S
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
R
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
T
K
 
G
L
 
Q
L
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
I
Q
 
R
E
 
R
I
 
A
L
 
-
P
 
P
P
 
E
G
 
L
I
 
L
T
 
E
C
 
V
I
 
E
F
 
V
I
 
A
R
 
I
Q
|
Q
A
 
E
E
 
Q
A
|
A
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
L
 
A
C
 
C
A
 
A
W
 
E
P
 
P
A
 
N
V
 
L
G
 
G
D
 
P
E
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
V
F
 
V
Y
 
A
V
 
V
I
 
L
L
|
L
A
x
P
D
 
D
D
|
D
L
 
L
I
 
V
D
 
-
G
 
-
Q
 
L
L
 
P
R
 
H
P
 
G
C
 
I
L
 
L
A
 
E
Q
 
R
M
 
M
H
 
A
R
 
K
V
 
V
Y
 
R
Q
 
A
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
T
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
C
C
 
A
E
 
F
Q
 
D
V
 
I
P
 
P
H
 
K
D
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
S
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
F
D
 
D
V
 
V
K
 
S
P
 
D
V
 
T
G
 
D
P
 
D
G
 
A
-
 
D
L
 
V
G
 
K
E
 
R
I
 
V
K
 
H
K
 
G
I
 
M
V
 
V
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
P
P
 
A
D
 
E
E
 
Q
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
T
L
 
F
A
 
A
V
x
A
V
 
A
G
|
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
T
 
D
P
 
R
R
 
A
I
 
I
F
 
F
K
 
D
I
 
A
L
 
L
Q
 
R
R
 
R
T
 
I
Q
 
E
A
 
P
G
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
V
S
 
A
Q
 
L
M
 
L
M
 
I
Q
 
Q
E
 
E
-
 
G
Q
 
H
T
 
P
V
 
V
L
 
H
A
 
V
Y
 
V
E
 
V
F
 
H
D
 
R
G
 
G
K
 
D
R
 
R
Y
 
H
D
 
D
C
 
L
G
 
G
S
 
N
K
 
P
L
 
G
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
R
A
 
A
N
 
A
V
 
V
E
 
D
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
H
 
D
P
 
P
E
 
D
V
 
Y
G
 
G
E
 
P
D
 
E
F
 
L
R
 
R
N
 
A
Y
 
W
L
 
L
H
 
T
E
 
D

2pa4B Crystal structure of udp-glucose pyrophosphorylase from corynebacteria glutamicum in complex with magnesium and udp-glucose (see paper)
39% identity, 97% coverage: 3:295/303 of query aligns to 3:297/299 of 2pa4B

query
sites
2pa4B
I
 
V
R
 
K
K
 
T
A
 
V
V
 
V
F
 
V
P
|
P
V
x
A
A
|
A
G
|
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
T
S
 
V
A
 
P
K
 
K
E
|
E
M
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
T
P
 
P
L
 
G
I
 
I
Q
 
E
Y
 
L
A
 
I
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
A
S
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
T
E
 
R
L
 
L
V
 
A
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
A
R
 
P
S
 
N
K
 
K
N
 
A
S
 
G
I
 
V
M
 
L
D
 
A
H
 
H
F
 
F
D
 
E
K
 
R
A
 
S
Y
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
E
E
 
T
L
 
L
Q
 
M
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
T
K
 
D
L
 
Q
L
 
V
E
 
E
V
 
I
V
 
I
Q
 
R
E
 
R
I
 
A
L
 
A
P
 
D
P
 
L
G
 
-
I
 
I
T
 
K
C
 
A
I
 
V
F
 
P
I
 
V
R
 
T
Q
|
Q
A
 
D
E
 
K
A
x
P
L
 
L
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
G
C
 
L
A
 
A
W
 
E
P
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
D
D
 
D
E
 
D
D
 
E
-
 
D
-
 
V
F
 
V
Y
 
A
V
 
V
I
 
M
L
|
L
A
x
P
D
 
D
D
|
D
L
 
L
I
 
V
D
 
-
G
 
-
Q
 
L
L
 
P
R
 
T
P
 
G
C
 
V
L
 
M
A
 
E
Q
 
R
M
 
M
H
 
A
R
 
Q
V
 
V
Y
 
R
Q
 
A
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
T
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
C
C
 
A
E
 
V
Q
 
E
V
 
V
P
 
S
H
 
E
D
 
A
E
 
D
I
 
V
G
 
S
S
 
K
Y
|
Y
G
|
G
V
 
I
V
 
F
D
 
E
V
 
I
K
 
E
-
 
A
-
 
D
P
 
T
V
 
K
G
 
D
P
 
S
G
 
D
L
 
V
G
 
K
E
 
K
I
 
V
K
 
K
K
 
G
I
 
M
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
A
P
 
I
D
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
N
 
R
L
 
L
A
 
A
V
x
A
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
T
 
D
P
 
R
R
 
K
I
 
I
F
 
F
K
 
D
I
 
A
L
 
L
Q
 
R
R
 
R
T
 
I
Q
 
T
A
 
P
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
D
Q
 
L
M
 
L
M
 
I
Q
 
D
E
 
E
-
 
G
Q
 
H
T
 
P
V
 
V
L
 
H
A
 
I
Y
 
V
E
 
I
F
 
H
D
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
R
Y
 
H
D
 
D
C
 
L
G
 
G
S
 
N
K
 
P
L
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
K
 
P
A
 
A
N
 
C
V
 
V
E
 
D
Y
 
F
A
 
G
L
 
L
K
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
V
V
 
Y
G
 
G
E
 
A
D
 
Q
F
 
L
R
 
K
N
 
D
Y
 
A
L
 
I
H
 
K
E
 
Q
L
 
I
S
 
L
I
 
A
E
 
E
E
 
H
H
 
E
F
 
A
E
 
A
E
 
E

4ecmA 2.3 angstrom crystal structure of a glucose-1-phosphate thymidylyltransferase from bacillus anthracis in complex with thymidine-5-diphospho-alpha-d-glucose and pyrophosphate (see paper)
26% identity, 86% coverage: 5:266/303 of query aligns to 4:232/245 of 4ecmA

query
sites
4ecmA
K
 
K
A
 
G
V
 
I
F
 
I
P
x
L
V
 
A
A
x
G
G
 
G
L
x
T
G
|
G
T
x
S
R
|
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
I
T
 
T
K
 
K
A
 
V
S
 
T
A
 
N
K
|
K
E
x
H
M
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
G
D
 
R
K
 
Y
P
 
P
L
 
M
I
 
I
Q
 
Y
Y
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
Y
E
 
K
A
 
L
V
 
K
S
 
Q
A
 
C
G
 
D
A
 
I
E
 
T
E
 
D
L
 
I
V
 
M
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
K
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
D
 
E
H
 
H
F
 
M
D
 
G
K
 
D
A
 
V
Y
 
V
E
 
S
L
 
F
E
 
L
N
 
G
E
 
S
L
 
G
Q
 
Q
E
 
E
R
 
F
G
 
G
K
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
T
 
S
C
 
F
I
 
T
F
 
Y
I
 
R
R
 
V
Q
|
Q
A
 
D
E
 
K
A
|
A
L
 
G
G
|
G
L
x
I
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
G
C
 
L
A
 
C
W
 
E
P
 
D
A
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
N
E
 
D
D
 
R
F
 
M
Y
 
V
V
 
V
I
 
I
L
|
L
A
 
G
D
|
D
D
 
N
L
 
I
I
 
F
D
 
S
G
 
D
Q
 
D
L
 
I
R
 
R
P
 
P
C
 
Y
L
 
V
A
 
E
Q
 
E
M
 
F
H
 
T
R
 
N
V
 
-
Y
 
-
Q
 
Q
E
 
K
Y
 
E
G
 
G
T
 
A
S
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
-
C
 
L
E
 
Q
Q
 
S
V
 
V
P
 
-
H
 
-
D
 
D
E
 
D
I
 
P
G
 
E
S
 
R
Y
x
F
G
|
G
V
 
V
V
 
A
D
 
N
V
 
I
K
 
Q
P
 
N
V
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
R
K
 
K
I
 
I
V
 
I
E
 
E
-
 
I
K
 
E
P
x
E
K
|
K
P
 
P
D
 
K
E
 
E
A
 
P
P
 
K
S
 
S
N
 
S
L
 
Y
A
 
A
V
|
V
V
 
T
G
 
G
R
 
I
Y
 
Y
I
 
L
L
 
Y
T
 
D
P
 
S
R
 
K
I
 
V
F
 
F
K
 
S
I
 
Y
L
 
I
Q
 
K
R
 
E
T
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
S
S
 
A
G
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
-
I
 
I
S
 
N
Q
 
N
M
 
W
M
 
Y
Q
 
L
E
 
K
Q
 
R
T
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
T
Y
 
Y
-
 
N
E
 
E
F
 
M
D
 
S
G
 
G
K
 
W
R
 
W
Y
 
T
D
 
D
C
 
A
G
 
G
S
 
T
K
 
H
L
 
V
G
 
S
Y
 
L
L
 
Q
K
 
R
A
 
A
N
 
N

3hl3A 2.76 angstrom crystal structure of a putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase from bacillus anthracis in complex with a sucrose.
26% identity, 86% coverage: 5:266/303 of query aligns to 3:231/246 of 3hl3A

query
sites
3hl3A
K
 
K
A
 
G
V
 
I
F
 
I
P
 
L
V
 
A
A
 
G
G
 
G
L
 
T
G
 
G
T
 
S
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
I
T
 
T
K
 
K
A
 
V
S
 
T
A
 
N
K
 
K
E
 
H
M
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
G
D
 
R
K
 
Y
P
 
P
L
 
M
I
 
I
Q
 
Y
Y
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
Y
E
 
K
A
 
L
V
 
K
S
 
Q
A
 
C
G
 
D
A
 
I
E
 
T
E
 
D
L
 
I
V
 
M
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
K
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
D
 
E
H
 
H
F
 
M
D
 
G
K
 
D
A
 
V
Y
 
V
E
 
S
L
 
F
E
 
L
N
 
G
E
 
S
L
 
G
Q
 
Q
E
 
E
R
 
F
G
 
G
K
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
V
T
 
S
C
 
F
I
 
T
F
 
Y
I
 
R
R
 
V
Q
 
Q
A
 
D
E
 
K
A
 
A
L
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
G
C
 
L
A
 
C
W
 
E
P
 
D
A
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
N
E
 
D
D
 
R
F
 
M
Y
 
V
V
 
V
I
 
I
L
|
L
A
 
G
D
|
D
D
 
N
L
 
I
I
 
F
D
 
S
G
 
D
Q
 
D
L
 
I
R
 
R
P
 
P
C
 
Y
L
 
V
A
 
E
Q
 
E
M
 
F
H
 
T
R
 
N
V
 
-
Y
 
-
Q
 
Q
E
 
K
Y
 
E
G
 
G
T
 
A
S
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
-
C
 
L
E
 
Q
Q
 
S
V
 
V
P
 
-
H
 
-
D
 
D
E
 
D
I
 
P
G
 
E
S
 
R
Y
x
F
G
|
G
V
 
V
V
 
A
D
 
N
V
 
I
K
 
Q
P
 
N
V
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
R
K
 
K
I
 
I
V
 
I
E
 
E
-
 
I
K
 
E
P
x
E
K
|
K
P
 
P
D
 
K
E
 
E
A
 
P
P
 
K
S
 
S
N
 
S
L
 
Y
A
 
A
V
|
V
V
 
T
G
 
G
R
 
I
Y
 
Y
I
 
L
L
 
Y
T
 
D
P
 
S
R
 
K
I
 
V
F
 
F
K
 
S
I
 
Y
L
 
I
Q
 
K
R
 
E
T
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
S
S
 
A
G
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
-
I
 
I
S
 
N
Q
 
N
M
 
W
M
 
Y
Q
 
L
E
 
K
Q
 
R
T
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
T
Y
 
Y
-
 
N
E
 
E
F
 
M
D
 
S
G
 
G
K
 
W
R
 
W
Y
 
T
D
 
D
C
 
A
G
 
G
S
 
T
K
 
H
L
 
V
G
 
S
Y
 
L
L
 
Q
K
 
R
A
 
A
N
 
N

1h5sB Thymidylyltransferase complexed with tmp (see paper)
25% identity, 88% coverage: 1:266/303 of query aligns to 1:237/291 of 1h5sB

query
sites
1h5sB
M
 
M
R
 
K
I
 
M
R
 
R
K
 
K
A
 
G
V
 
I
F
 
I
P
x
L
V
 
A
A
x
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
V
T
 
T
K
 
M
A
 
A
S
 
V
A
 
S
K
 
K
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
M
I
 
I
Q
 
Y
Y
 
Y
A
 
P
V
 
L
A
 
S
E
 
T
A
 
L
V
 
M
S
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
R
E
 
D
L
 
I
V
 
L
F
 
I
I
 
I
T
 
S
G
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
T
E
 
P
R
 
Q
G
 
D
K
 
T
T
 
P
K
 
R
L
 
F
L
 
Q
E
 
Q
V
 
L
V
 
L
Q
 
G
E
 
D
I
 
G
L
 
S
P
 
Q
P
 
W
G
 
G
I
 
L
T
 
N
C
 
L
I
 
Q
F
 
Y
I
 
K
R
 
V
Q
|
Q
A
 
P
E
 
S
A
x
P
L
x
D
G
|
G
L
 
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
L
 
I
C
 
I
A
 
G
W
 
E
P
 
E
A
 
F
V
 
I
G
 
G
D
 
G
E
 
D
D
 
D
F
 
C
Y
 
A
V
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
G
D
|
D
D
 
N
L
 
I
I
 
F
D
x
Y
G
|
G
Q
x
H
L
x
D
R
 
L
P
 
P
C
 
K
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
M
 
A
H
 
A
R
 
-
V
 
V
Y
 
N
Q
 
K
E
 
E
Y
 
S
G
 
G
T
 
A
S
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
C
 
Y
E
 
H
Q
 
V
V
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
N
E
 
D
I
 
P
G
 
E
S
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
E
V
 
F
K
 
D
P
 
K
V
 
N
G
 
G
P
 
T
G
 
A
L
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
I
V
 
S
E
 
L
K
 
E
P
 
E
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
A
 
P
P
 
K
S
 
S
N
 
N
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
V
 
T
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
I
 
F
L
 
Y
T
 
D
P
 
N
R
 
D
I
 
V
F
 
V
K
 
Q
I
 
M
L
 
A
Q
 
K
R
 
N
T
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
S
S
 
A
G
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
-
I
 
I
S
 
N
Q
 
R
M
 
I
M
 
Y
Q
 
L
E
 
E
Q
 
Q
T
 
G
V
 
R
L
 
L
A
 
S
Y
 
V
E
 
A
F
 
L
D
 
M
G
|
G
K
x
R
R
x
G
Y
 
Y
-
 
A
-
 
W
-
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
S
 
T
K
 
H
L
 
Q
G
 
S
Y
 
L
L
 
I
K
 
E
A
 
A
N
 
S

Sites not aligning to the query:

P26393 Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase; dTDP-glucose pyrophosphorylase; Ep; dTDP-glucose synthase; EC 2.7.7.24 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
24% identity, 88% coverage: 1:266/303 of query aligns to 1:237/292 of P26393

query
sites
P26393
M
 
M
R
 
K
I
 
T
R
 
R
K
 
K
A
 
G
V
 
I
F
 
I
P
 
L
V
 
A
A
 
G
G
 
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
V
T
 
T
K
 
M
A
 
A
S
 
V
A
 
S
K
 
K
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
M
I
 
I
Q
 
Y
Y
 
Y
A
 
P
V
 
L
A
 
S
E
 
T
A
 
L
V
 
M
S
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
R
E
 
D
L
 
I
V
 
L
F
 
I
I
 
I
T
 
S
G
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
T
E
 
P
R
 
Q
G
 
D
K
 
T
T
 
P
K
 
R
L
 
F
L
 
Q
E
 
Q
V
 
L
V
 
L
Q
 
G
E
 
D
I
 
G
L
 
S
P
 
Q
P
 
W
G
 
G
I
 
L
T
 
N
C
 
L
I
 
Q
F
 
Y
I
 
K
R
 
V
Q
 
Q
A
 
P
E
 
S
A
 
P
L
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
L
 
I
C
 
I
A
 
G
W
 
E
P
 
E
A
 
F
V
 
I
G
 
G
D
 
H
E
 
D
D
 
D
F
 
C
Y
 
A
V
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
G
D
 
D
D
 
N
L
 
I
I
 
F
D
 
Y
G
 
G
Q
 
H
L
 
D
R
 
L
P
 
P
C
 
K
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
M
 
A
H
 
-
R
 
A
V
 
V
Y
 
N
Q
 
K
E
 
E
Y
 
S
G
 
G
T
 
A
S
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
C
 
Y
E
 
H
Q
 
V
V
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
N
E
 
D
I
 
P
G
 
E
S
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
E
V
 
F
K
 
D
P
 
Q
V
 
K
G
 
G
P
 
T
G
 
A
L
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
V
V
 
S
E
 
L
K
 
E
P
 
E
K
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
Q
A
 
P
P
 
K
S
 
S
N
 
N
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
V
 
T
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
I
 
F
L
 
Y
T
 
D
P
 
N
R
 
S
I
 
V
F
 
V
K
 
E
I
 
M
L
 
A
Q
 
K
R
 
N
T
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
S
S
 
A
G
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
|
T
D
 
D
A
 
-
I
 
I
S
 
N
Q
 
R
M
 
I
M
 
Y
Q
 
M
E
 
E
Q
 
Q
T
 
G
V
 
R
L
 
L
A
 
S
Y
 
V
E
 
A
F
 
M
D
 
M
G
 
G
K
 
R
R
 
G
Y
 
Y
-
 
A
-
x
W
-
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
S
 
T
K
 
H
L
 
Q
G
 
S
Y
 
L
L
 
I
K
 
E
A
 
A
N
 
S

1h5tA Thymidylyltransferase complexed with thymidylyldiphosphate-glucose (see paper)
24% identity, 87% coverage: 2:266/303 of query aligns to 1:236/290 of 1h5tA

query
sites
1h5tA
R
 
K
I
 
M
R
 
R
K
 
K
A
 
G
V
 
I
F
 
I
P
x
L
V
 
A
A
x
G
G
 
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
V
T
 
T
K
 
M
A
 
A
S
 
V
A
 
S
K
 
K
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
M
I
 
I
Q
 
Y
Y
 
Y
A
 
P
V
 
L
A
 
S
E
 
T
A
 
L
V
 
M
S
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
R
E
 
D
L
 
I
V
 
L
F
 
I
I
 
I
T
 
S
G
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
T
E
 
P
R
 
Q
G
 
D
K
 
T
T
 
P
K
 
R
L
 
F
L
 
Q
E
 
Q
V
 
L
V
 
L
Q
 
G
E
 
D
I
 
G
L
 
S
P
 
Q
P
 
W
G
 
G
I
 
L
T
 
N
C
 
L
I
 
Q
F
 
Y
I
 
K
R
 
V
Q
|
Q
A
 
P
E
 
S
A
x
P
L
 
D
G
|
G
L
 
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
L
 
I
C
 
I
A
 
G
W
 
E
P
 
E
A
 
F
V
 
I
G
 
G
D
 
G
E
 
D
D
 
D
F
 
C
Y
 
A
V
 
L
I
 
V
L
|
L
A
 
G
D
|
D
D
 
N
L
 
I
I
 
F
D
x
Y
G
|
G
Q
x
H
L
x
D
R
 
L
P
 
P
C
 
K
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
M
 
A
H
 
A
R
 
-
V
 
V
Y
 
N
Q
 
K
E
 
E
Y
 
S
G
 
G
T
 
A
S
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
C
 
Y
E
 
H
Q
 
V
V
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
N
E
 
D
I
 
P
G
 
E
S
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
D
 
E
V
 
F
K
 
D
P
 
K
V
 
N
G
 
G
P
 
T
G
 
A
L
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
I
V
 
S
E
 
L
K
 
E
P
x
E
K
|
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
A
 
P
P
 
K
S
 
S
N
 
N
L
 
Y
A
 
A
V
|
V
V
 
T
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
I
 
F
L
 
Y
T
 
D
P
 
N
R
 
D
I
 
V
F
 
V
K
 
Q
I
 
M
L
 
A
Q
 
K
R
 
N
T
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
S
S
 
A
G
x
R
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
-
I
 
I
S
 
N
Q
 
R
M
 
I
M
 
Y
Q
 
L
E
 
E
Q
 
Q
T
 
G
V
 
R
L
 
L
A
 
S
Y
 
V
E
 
A
F
 
M
D
 
M
G
 
G
K
x
R
R
x
G
Y
 
Y
-
 
A
-
 
W
-
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
S
 
T
K
 
H
L
 
Q
G
 
S
Y
 
L
L
 
I
K
 
E
A
 
A
N
 
S

Sites not aligning to the query:

1h5rA Thymidylyltransferase complexed with thimidine and glucose-1-phospate (see paper)
24% identity, 87% coverage: 2:266/303 of query aligns to 1:236/290 of 1h5rA

query
sites
1h5rA
R
 
K
I
 
M
R
 
R
K
 
K
A
 
G
V
 
I
F
 
I
P
x
L
V
 
A
A
x
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
V
T
 
T
K
 
M
A
 
A
S
 
V
A
 
S
K
 
K
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
M
I
 
I
Q
 
Y
Y
 
Y
A
 
P
V
 
L
A
 
S
E
 
T
A
 
L
V
 
M
S
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
R
E
 
D
L
 
I
V
 
L
F
 
I
I
 
I
T
 
S
G
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
T
E
 
P
R
 
Q
G
 
D
K
 
T
T
 
P
K
 
R
L
 
F
L
 
Q
E
 
Q
V
 
L
V
 
L
Q
 
G
E
 
D
I
 
G
L
 
S
P
 
Q
P
 
W
G
 
G
I
 
L
T
 
N
C
 
L
I
 
Q
F
 
Y
I
 
K
R
 
V
Q
|
Q
A
 
P
E
 
S
A
x
P
L
 
D
G
|
G
L
|
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
L
 
I
C
 
I
A
 
G
W
 
E
P
 
E
A
 
F
V
 
I
G
 
G
D
 
G
E
 
D
D
 
D
F
 
C
Y
 
A
V
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
G
D
|
D
D
 
N
L
 
I
I
 
F
D
x
Y
G
|
G
Q
 
H
L
 
D
R
 
L
P
 
P
C
 
K
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
M
 
A
H
 
A
R
 
-
V
 
V
Y
 
N
Q
 
K
E
 
E
Y
 
S
G
 
G
T
 
A
S
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
C
 
Y
E
 
H
Q
 
V
V
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
N
E
 
D
I
 
P
G
 
E
S
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
D
 
E
V
 
F
K
 
D
P
 
K
V
 
N
G
 
G
P
 
T
G
 
A
L
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
I
V
 
S
E
 
L
K
 
E
P
x
E
K
|
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
A
 
P
P
 
K
S
 
S
N
 
N
L
 
Y
A
 
A
V
|
V
V
 
T
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
I
 
F
L
 
Y
T
 
D
P
 
N
R
 
D
I
 
V
F
 
V
K
 
Q
I
 
M
L
 
A
Q
 
K
R
 
N
T
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
S
S
 
A
G
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
-
I
 
I
S
 
N
Q
 
R
M
 
I
M
 
Y
Q
 
L
E
 
E
Q
 
Q
T
 
G
V
 
R
L
 
L
A
 
S
Y
 
V
E
 
A
F
 
M
D
 
M
G
 
G
K
 
R
R
 
G
Y
 
Y
-
 
A
-
 
W
-
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
S
 
T
K
 
H
L
 
Q
G
 
S
Y
 
L
L
 
I
K
 
E
A
 
A
N
 
S

Sites not aligning to the query:

1iinA Thymidylyltransferase complexed with udp-glucose (see paper)
23% identity, 88% coverage: 1:266/303 of query aligns to 1:237/289 of 1iinA

query
sites
1iinA
M
 
M
R
 
K
I
 
T
R
 
R
K
 
K
A
 
G
V
 
I
F
 
I
P
x
L
V
 
A
A
x
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
|
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
V
T
 
T
K
 
M
A
 
A
S
 
V
A
 
S
K
 
Q
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
M
I
 
I
Q
 
Y
Y
 
Y
A
 
P
V
 
L
A
 
S
E
 
T
A
 
L
V
 
M
S
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
R
E
 
D
L
 
I
V
 
L
F
 
I
I
 
I
T
 
S
G
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
T
E
 
P
R
 
Q
G
 
D
K
 
T
T
 
P
K
 
R
L
 
F
L
 
Q
E
 
Q
V
 
L
V
 
L
Q
 
G
E
 
D
I
 
G
L
 
S
P
 
Q
P
 
W
G
 
G
I
 
L
T
 
N
C
 
L
I
 
Q
F
 
Y
I
 
K
R
 
V
Q
|
Q
A
 
P
E
 
S
A
x
P
L
x
D
G
|
G
L
|
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
L
 
I
C
 
I
A
 
G
W
 
E
P
 
E
A
 
F
V
 
I
G
 
G
D
 
H
E
 
D
D
 
D
F
 
C
Y
 
A
V
 
L
I
 
V
L
|
L
A
 
G
D
|
D
D
 
N
L
 
I
I
 
F
D
 
Y
G
 
G
Q
 
H
L
 
D
R
 
L
P
 
P
C
 
K
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
M
 
A
H
 
-
R
 
A
V
 
V
Y
 
N
Q
 
K
E
 
E
Y
 
S
G
 
G
T
 
A
S
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
A
C
 
Y
E
 
H
Q
 
V
V
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
N
E
 
D
I
 
P
G
 
E
S
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
D
 
E
V
 
F
K
 
D
P
 
Q
V
 
K
G
 
G
P
 
T
G
 
A
L
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
V
V
 
S
E
 
L
K
 
E
P
x
E
K
|
K
P
 
P
D
 
L
E
 
Q
A
 
P
P
 
K
S
 
S
N
 
N
L
 
Y
A
 
A
V
|
V
V
 
T
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
I
 
F
L
 
Y
T
 
D
P
 
N
R
 
S
I
 
V
F
 
V
K
 
E
I
 
M
L
 
A
Q
 
K
R
 
N
T
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
S
S
 
A
G
x
R
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
-
I
 
I
S
 
N
Q
 
R
M
 
I
M
 
Y
Q
 
M
E
 
E
Q
 
Q
T
 
G
V
 
R
L
 
L
A
 
S
Y
 
V
E
 
A
F
 
M
D
 
M
G
 
G
K
 
R
R
 
G
Y
 
Y
-
 
A
-
x
W
-
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
S
 
T
K
 
H
L
 
Q
G
 
S
Y
 
L
L
 
I
K
 
E
A
 
A
N
 
S

Query Sequence

>WP_043766536.1 NCBI__GCF_000733765.1:WP_043766536.1
MRIRKAVFPVAGLGTRFLPATKASAKEMLPVVDKPLIQYAVAEAVSAGAEELVFITGRSK
NSIMDHFDKAYELENELQERGKTKLLEVVQEILPPGITCIFIRQAEALGLGHAVLCAWPA
VGDEDFYVILADDLIDGQLRPCLAQMHRVYQEYGTSVLACEQVPHDEIGSYGVVDVKPVG
PGLGEIKKIVEKPKPDEAPSNLAVVGRYILTPRIFKILQRTQAGSGGEIQLTDAISQMMQ
EQTVLAYEFDGKRYDCGSKLGYLKANVEYALKHPEVGEDFRNYLHELSIEEHFEEGKKDH
AAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory