SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_043769224.1 NCBI__GCF_000733765.1:WP_043769224.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9SS48 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial; Protein SUGAR-DEPENDENT 6; EC 1.1.5.3 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
31% identity, 94% coverage: 21:501/514 of query aligns to 74:577/629 of Q9SS48

query
sites
Q9SS48
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
A
Y
 
T
G
 
G
A
x
S
W
 
G
A
 
V
A
 
A
Y
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
V
S
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
E
A
 
R
E
 
E
D
 
D
W
 
F
G
 
S
A
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
S
 
S
A
 
R
S
 
S
S
 
T
K
 
K
L
 
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
V
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
F
N
 
N
F
 
L
E
 
D
L
 
Y
G
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
F
H
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
K
V
 
Q
L
 
L
A
 
I
R
 
E
L
 
N
A
 
A
P
 
P
H
 
H
M
 
L
V
 
C
R
 
H
P
 
A
I
 
L
N
 
P
F
 
C
V
 
M
L
 
T
P
 
P
V
 
C
W
 
F
Q
 
D
G
 
W
A
 
F
R
 
E
V
 
V
G
 
-
M
 
-
A
 
I
R
 
Y
L
 
F
R
 
W
A
 
M
G
 
G
L
 
L
M
 
K
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
T
 
L
L
 
V
A
 
A
W
 
-
G
 
G
R
 
P
Q
 
R
P
 
L
V
 
L
Q
 
H
R
 
L
H
 
S
K
 
R
R
 
Y
F
 
Y
N
 
S
R
 
A
E
 
K
R
 
E
L
 
S
L
 
I
R
 
E
R
 
L
Y
 
F
P
 
P
F
 
T
L
 
L
A
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
K
D
 
D
A
 
K
G
 
N
L
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
T
F
 
V
R
 
V
Y
 
Y
G
 
Y
D
 
D
C
 
G
Q
 
Q
E
 
M
D
 
N
D
 
D
A
 
S
R
 
R
L
 
L
V
 
N
T
 
V
L
 
G
V
 
L
V
 
A
A
 
C
A
 
T
A
 
A
Q
 
A
A
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
C
 
V
A
 
L
N
 
N
H
 
H
V
 
A
R
 
E
A
 
V
E
 
V
A
 
S
L
 
L
Q
 
I
R
 
T
D
 
D
N
 
D
-
 
A
T
 
T
G
 
K
T
 
R
V
 
I
T
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
N
T
 
N
L
 
L
G
 
T
D
 
G
A
 
Q
R
 
E
W
 
F
T
 
N
L
 
S
H
 
Y
A
 
A
G
 
K
H
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
N
T
 
A
V
 
A
G
 
G
P
 
P
W
 
F
V
 
C
E
 
D
E
 
S
L
 
I
T
 
R
G
 
K
A
 
M
-
 
I
-
 
D
-
 
E
-
 
D
Q
 
T
S
 
K
P
 
P
A
 
M
V
 
I
Q
 
C
F
 
P
V
 
S
K
 
S
G
 
G
T
 
V
H
 
H
L
 
I
V
 
V
M
 
L
S
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
P
D
 
D
C
 
Y
H
 
Y
S
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
M
A
 
G
F
 
L
L
 
I
L
 
V
N
 
P
A
 
K
P
 
T
Q
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
V
F
 
V
F
 
F
V
 
M
I
 
L
P
 
P
Y
 
W
Y
 
L
N
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
S
S
 
N
V
 
T
N
 
S
A
 
I
P
 
T
A
 
S
D
 
L
A
 
P
R
 
E
P
 
P
S
 
H
D
 
E
E
 
D
E
 
E
C
 
I
R
 
Q
Y
 
F
L
 
I
L
 
L
A
 
D
A
 
A
A
 
I
H
 
S
A
 
D
W
 
Y
M
 
L
P
 
-
G
 
N
L
 
I
P
 
K
W
 
V
R
 
R
E
 
R
E
 
T
D
 
D
I
 
V
I
 
L
Q
 
S
R
 
A
F
 
W
A
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
M
Q
 
D
-
 
P
G
 
T
A
 
A
G
 
K
S
 
S
L
 
T
S
 
E
K
 
S
V
 
I
S
 
S
R
 
R
E
 
D
F
 
H
E
 
V
I
 
V
T
 
F
Q
 
E
P
 
E
A
 
N
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
V
V
 
T
P
 
I
V
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
K
Y
 
W
T
 
T
T
 
T
A
 
Y
R
 
R
L
 
S
D
 
M
A
 
A
A
 
E
E
 
D
I
 
A
I
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
A
-
 
I
-
 
K
C
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
L
G
 
K
V
 
P
K
 
T
A
 
N
K
 
E
S
 
C
V
 
V
T
 
T
D
 
Q
R
 
K
A
 
L
P
 
Q
L
 
L
P
 
L
G
 
G
A
 
S
-
 
Y
-
 
G
-
 
W
-
 
E
P
 
P
P
 
S
A
 
S
D
 
F
N
 
T
S
 
T
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
W
 
Q
L
 
Y
E
 
V
D
 
R
A
 
M
Q
 
K
R
 
K
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
-
 
G
R
 
K
L
 
V
C
 
V
A
 
P
L
 
G
G
 
A
L
 
M
D
 
D
E
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
K
Q
 
H
A
 
L
A
 
S
L
 
H
R
 
A
H
 
Y
G
 
G
T
 
S
R
 
M
V
 
A
D
 
D
T
 
R
L
 
V
C
 
-
A
 
A
R
 
T
L
 
I
E
 
A
A
 
Q
D
 
E
K
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
G
T
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
A
P
 
H
D
 
G
C
 
H
P
 
P
F
 
F
A
 
L
R
x
E
V
 
A
E
 
E
A
 
V
A
 
A
V
 
Y
A
 
C
I
 
A
S
 
R
D
 
H
E
 
E
M
 
Y
A
 
C
M
 
E
T
 
S
A
 
A
E
 
V
D
 
D
V
 
F
L
 
I
R
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
C
P
 
R
L
 
I
D
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
T
 
T
D
 
D

2rgoA Structure of alpha-glycerophosphate oxidase from streptococcus sp.: A template for the mitochondrial alpha-glycerophosphate dehydrogenase (see paper)
30% identity, 78% coverage: 43:443/514 of query aligns to 41:459/557 of 2rgoA

query
sites
2rgoA
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
A
 
G
L
 
L
I
 
I
D
x
E
A
x
M
E
x
Q
D
 
D
W
 
F
G
 
A
A
 
E
G
 
G
T
|
T
S
|
S
S
 
S
A
 
R
S
 
S
S
 
T
K
 
K
L
 
L
I
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
N
 
T
F
 
F
E
 
D
L
 
V
G
 
E
L
 
V
V
 
V
R
 
A
H
 
D
A
 
T
L
 
V
T
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
R
 
G
L
 
I
A
 
A
P
 
P
H
 
H
M
 
I
V
 
P
R
 
K
P
 
P
I
 
D
N
 
P
F
 
M
V
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
W
 
Y
Q
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
G
G
 
A
A
 
T
R
 
T
V
 
F
G
 
N
M
 
M
A
 
F
R
 
S
L
 
V
R
 
K
A
 
V
G
 
A
L
 
M
M
 
D
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
T
 
K
L
 
L
A
 
A
W
 
N
G
 
V
R
 
T
Q
 
G
P
 
T
V
 
K
Q
 
Y
R
 
E
H
 
N
K
 
Y
R
 
T
F
 
L
N
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
E
L
 
V
L
 
L
R
 
E
R
 
R
Y
 
E
P
 
P
F
 
F
L
 
L
A
 
K
D
 
K
A
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
A
F
 
G
R
 
V
Y
 
Y
G
 
L
D
 
D
C
 
F
Q
 
R
E
 
N
D
 
N
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
I
L
 
D
V
 
N
V
 
I
A
 
K
A
 
K
A
 
A
Q
 
A
A
 
E
A
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
C
 
L
A
 
V
N
 
S
H
 
K
V
 
M
R
 
K
A
|
A
E
 
V
A
 
G
L
 
F
Q
 
L
R
 
Y
D
 
E
N
 
G
T
 
-
G
 
D
T
 
Q
V
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
V
T
 
K
L
 
A
R
 
R
D
 
D
T
 
L
L
 
L
G
 
T
D
 
D
A
 
E
R
 
V
W
 
I
T
 
E
L
 
I
H
 
K
A
 
A
G
 
K
H
 
L
T
 
V
V
 
I
G
 
N
T
 
T
V
x
S
G
|
G
P
 
P
W
|
W
V
 
V
E
 
D
E
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
N
-
 
L
-
 
N
L
 
F
T
 
T
G
 
R
A
 
P
Q
 
V
S
 
S
P
 
P
A
 
K
V
 
M
Q
 
R
F
 
P
V
 
T
K
 
K
G
|
G
T
 
I
H
 
H
L
 
L
V
 
V
M
 
V
S
 
D
G
 
A
-
 
K
-
 
K
I
 
L
P
 
P
D
 
V
C
 
P
H
 
Q
S
 
P
A
 
T
F
 
Y
L
 
F
L
 
D
N
 
T
A
 
G
P
 
K
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
M
F
 
V
F
 
F
V
 
A
I
 
I
P
 
P
Y
 
R
Y
 
E
N
 
N
R
 
K
T
 
T
L
 
Y
V
 
F
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
T
S
 
D
V
 
Y
N
 
Q
A
 
G
P
 
D
-
 
F
A
 
T
D
 
D
A
 
P
R
 
K
P
 
V
S
 
T
D
 
Q
E
 
E
E
 
D
C
 
V
R
 
D
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
V
A
 
I
H
 
N
A
 
H
W
 
R
M
 
Y
P
 
P
G
 
E
L
 
A
P
 
N
W
 
I
R
 
T
E
 
L
E
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
E
Q
 
A
R
 
S
F
 
W
A
 
A
G
|
G
I
x
L
R
 
R
T
 
P
L
 
L
A
 
L
A
 
I
Q
 
G
G
 
N
A
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
D
S
x
Y
K
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
R
E
 
G
F
 
S
E
 
S
I
 
L
T
 
E
Q
 
R
P
 
E
A
 
P
P
 
D
G
 
G
L
 
L
T
 
L
V
 
T
P
 
L
V
 
S
G
 
G
G
 
G
K
|
K
Y
x
I
T
|
T
T
 
D
A
 
Y
R
 
R
L
 
-
D
 
K
A
 
M
A
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
L
I
 
I
I
 
R
D
 
Q
S
 
L
V
 
L
C
 
K
G
 
E
H
 
E
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
K
 
E
A
 
T
K
 
K
S
 
E
V
 
I
-
 
D
T
 
S
D
 
K
R
 
K
A
 
Y
P
 
Q
L
 
I
P
 
S
G
 
G
A
 
G
P
 
N
P
 
F
A
 
D
D
 
P
N
 
T
S
 
K
L
 
L
G
 
E
D
 
E
W
 
T
L
 
V
E
 
T
D
 
E
A
 
L
Q
 
A
R
 
K
R
 
E
L
 
G
C
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
D
A
 
A
M
 
T
Q
 
Y
A
 
I
A
 
A
L
 
D
R
 
F
H
 
Y
G
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

2rgoB Structure of alpha-glycerophosphate oxidase from streptococcus sp.: A template for the mitochondrial alpha-glycerophosphate dehydrogenase (see paper)
32% identity, 65% coverage: 43:376/514 of query aligns to 39:379/530 of 2rgoB

query
sites
2rgoB
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
A
 
G
L
 
L
I
 
I
D
x
E
A
x
M
E
x
Q
D
 
D
W
 
F
G
 
A
A
 
E
G
 
G
T
|
T
S
|
S
S
 
S
A
 
R
S
|
S
S
x
T
K
 
K
L
 
L
I
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
N
 
T
F
 
F
E
 
D
L
 
V
G
 
E
L
 
V
V
 
V
R
 
A
H
 
D
A
 
T
L
 
V
T
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
R
 
G
L
 
I
A
 
A
P
 
P
H
 
H
M
 
I
V
 
P
R
 
K
P
 
P
I
 
D
N
 
P
F
 
M
V
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
W
 
Y
Q
 
E
G
 
D
-
 
E
A
 
T
R
 
T
V
 
F
G
 
N
M
 
M
A
 
F
R
 
S
L
 
V
R
 
K
A
 
V
G
 
A
L
 
M
M
 
D
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
T
 
K
L
 
L
A
 
A
W
 
N
G
 
V
R
 
T
Q
 
G
P
 
T
V
 
K
Q
 
Y
R
 
E
H
 
N
K
 
Y
R
 
T
F
 
L
N
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
E
L
 
V
L
 
L
R
 
E
R
 
R
Y
 
E
P
 
P
F
 
F
L
 
L
A
 
K
D
 
K
A
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
A
F
 
G
R
 
V
Y
 
Y
G
 
L
D
 
D
C
 
F
Q
 
R
E
 
N
D
 
N
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
I
L
 
D
V
 
N
V
 
I
A
 
K
A
 
K
A
 
A
Q
 
A
A
 
E
A
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
C
 
L
A
 
V
N
 
S
H
 
K
V
 
M
R
 
K
A
|
A
E
 
V
A
 
G
L
 
F
Q
 
L
R
 
Y
D
 
G
N
 
D
T
 
-
G
 
-
T
 
Q
V
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
V
T
 
K
L
 
A
R
 
R
D
 
D
T
 
L
L
 
L
G
 
T
D
 
D
A
 
E
R
 
V
W
 
I
T
 
E
L
 
I
H
 
K
A
 
A
G
 
K
H
 
L
T
 
V
V
 
I
G
 
N
T
 
T
V
x
S
G
|
G
P
 
P
W
|
W
V
 
V
E
 
D
E
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
N
L
 
L
T
 
N
G
 
F
A
 
P
Q
 
V
S
 
S
P
 
P
A
 
K
V
 
M
Q
 
R
F
 
P
V
 
T
K
 
K
G
 
G
T
 
I
H
 
H
L
 
L
V
 
V
M
 
V
S
 
D
G
 
A
-
 
K
-
 
K
I
 
L
P
 
P
D
 
V
C
 
P
H
 
Q
S
 
P
A
 
T
F
 
Y
L
 
F
L
 
D
N
 
T
A
 
G
P
 
K
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
M
F
 
V
F
 
F
V
 
A
I
 
I
P
 
P
Y
 
R
Y
 
E
N
 
N
R
 
K
T
 
T
L
 
Y
V
 
F
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
T
S
 
D
V
 
Y
N
 
Q
A
 
G
P
 
D
-
 
F
A
 
T
D
 
D
A
 
P
R
 
K
P
 
V
S
 
T
D
 
Q
E
 
E
E
 
D
C
 
V
R
 
D
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
V
A
 
I
H
 
N
A
 
H
W
 
R
M
 
Y
P
 
P
G
 
E
L
 
A
P
 
N
W
 
I
R
 
T
E
 
L
E
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
E
Q
 
A
R
 
S
F
 
W
A
 
A
G
 
G
I
x
L
R
|
R
T
 
P
L
 
L
A
 
L
A
 
I
Q
 
G
G
 
N
A
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
D
S
x
Y
K
 
N
-
 
G
-
 
G
V
 
I
S
 
S
R
 
R
E
 
G
F
 
S
E
 
S
I
 
L
T
 
E
Q
 
R
P
 
E
A
 
P
P
 
D
G
 
G
L
 
L
T
 
L
V
 
T
P
 
L
V
 
S
G
 
G
G
 
G
K
|
K
Y
x
I
T
|
T
T
 
D
A
 
Y
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2qcuB Crystal structure of glycerol-3-phosphate dehydrogenase from escherichia coli (see paper)
30% identity, 87% coverage: 44:492/514 of query aligns to 27:470/501 of 2qcuB

query
sites
2qcuB
L
 
L
R
 
S
T
 
V
A
 
L
L
 
M
I
 
L
D
x
E
A
|
A
E
 
Q
D
 
D
W
 
L
G
 
A
A
x
C
G
 
A
T
|
T
S
|
S
S
 
S
A
 
A
S
|
S
S
|
S
K
 
K
L
|
L
I
 
I
H
|
H
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
|
R
Y
|
Y
L
 
L
E
 
E
N
 
H
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
G
 
R
L
 
L
V
 
V
R
 
S
H
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
M
A
 
A
P
 
P
H
 
H
M
 
I
V
 
A
R
 
F
P
 
P
I
 
M
N
 
R
F
 
F
V
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
H
W
 
R
Q
 
P
G
 
H
A
 
L
R
 
R
V
 
P
G
 
A
M
 
W
A
 
M
R
 
-
L
 
I
R
 
R
A
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
F
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
T
 
H
L
 
L
A
 
-
W
 
-
G
 
G
R
 
K
Q
 
R
-
 
T
-
 
S
-
 
L
P
 
P
V
 
G
Q
 
S
R
 
T
H
 
G
K
 
L
R
 
R
F
 
F
N
 
G
R
 
A
E
 
N
R
 
S
L
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
P
G
 
E
L
 
I
R
 
K
G
 
R
G
 
G
F
 
F
R
 
E
Y
 
Y
G
 
S
D
 
D
C
 
C
Q
 
W
E
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
L
L
 
A
V
 
N
V
 
A
A
 
Q
A
 
M
A
 
V
Q
 
V
A
 
R
A
 
K
G
 
G
A
 
G
V
 
E
C
 
V
A
 
L
N
 
T
H
 
R
V
 
T
R
 
R
A
|
A
E
 
T
A
 
S
L
 
A
Q
 
R
R
 
R
D
 
E
N
 
N
T
 
G
G
 
L
T
 
W
V
 
I
T
 
V
G
 
E
A
 
A
T
 
E
L
 
D
R
 
I
D
 
D
T
 
T
L
 
G
G
 
K
D
 
K
A
 
Y
R
 
S
W
 
W
T
 
-
L
 
-
H
 
Q
A
 
A
G
 
R
H
 
G
T
 
L
V
 
V
G
 
N
T
 
A
V
x
T
G
 
G
P
 
P
W
|
W
V
 
V
E
 
K
E
 
Q
L
 
F
-
 
F
-
 
D
T
 
D
G
 
G
A
 
M
Q
 
H
S
 
L
P
 
P
A
 
S
-
 
P
-
 
Y
-
 
G
V
 
I
Q
 
R
F
 
L
V
 
I
K
 
K
G
|
G
T
 
S
H
 
H
L
 
I
V
 
V
M
 
V
S
 
P
G
 
R
I
 
V
P
 
H
D
 
T
C
 
Q
H
 
K
S
 
Q
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
L
 
L
N
 
Q
A
 
N
P
 
-
Q
 
E
D
 
D
G
 
K
R
 
R
V
 
I
F
 
V
F
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
W
Y
 
M
N
 
D
R
 
E
-
 
F
T
 
S
L
 
I
V
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
V
S
 
E
V
 
Y
N
 
K
A
 
G
-
 
D
P
 
P
A
 
K
D
 
A
A
 
V
R
 
K
P
 
I
S
 
E
D
 
E
E
 
S
E
 
E
C
 
I
R
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
V
A
 
Y
H
 
N
A
 
T
W
 
H
M
 
F
P
 
K
G
 
K
L
 
Q
P
 
L
W
 
S
R
 
R
E
 
-
E
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
V
Q
 
W
R
 
T
F
 
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
V
R
|
R
T
 
P
L
 
L
A
 
C
A
 
D
Q
 
D
G
 
E
A
 
S
G
 
D
S
 
S
L
 
P
S
 
Q
K
 
A
V
 
I
S
 
T
R
|
R
E
 
D
F
 
Y
E
 
T
I
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
D
-
 
E
T
 
N
Q
 
G
P
 
K
A
 
A
P
 
P
G
 
L
L
 
L
T
 
S
V
 
V
P
 
-
V
 
F
G
 
G
G
|
G
K
|
K
Y
x
L
T
|
T
T
 
T
A
 
Y
R
 
R
L
 
K
D
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
H
I
 
A
I
 
L
D
 
E
S
 
K
V
 
L
C
 
T
G
 
P
H
 
Y
L
 
Y
G
 
Q
V
 
G
K
 
I
A
 
G
K
 
P
S
 
A
V
 
W
T
 
T
D
 
K
R
 
E
A
 
S
P
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
G
P
 
-
P
 
A
A
 
I
D
 
E
N
 
G
S
 
D
L
 
R
G
 
D
D
 
D
W
 
Y
L
 
A
E
 
A
D
 
R
A
 
L
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
Y
C
 
P
A
 
F
L
 
-
G
 
-
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
S
A
 
L
A
 
A
M
 
R
Q
 
H
A
 
Y
A
 
A
L
 
R
R
 
T
H
 
Y
G
 
G
T
 
S
R
 
N
V
 
S
D
 
E
T
 
L
L
 
L
C
 
L
A
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
G
D
 
N
K
 
A
G
 
G
L
 
T
A
 
V
T
 
S
R
 
D
I
 
L
R
 
G
P
 
E
D
 
D
C
 
F
-
 
G
-
 
H
P
 
E
F
 
F
A
 
Y
R
 
E
V
 
A
E
 
E
A
 
L
A
 
K
V
 
Y
A
 
L
I
 
V
S
 
D
D
 
H
E
 
E
M
 
W
A
 
V
M
 
R
T
 
R
A
 
A
E
 
D
D
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
W
R
 
R
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2r46A Crystal structure of escherichia coli glycerol-3-phosphate dehydrogenase in complex with 2-phosphopyruvic acid. (see paper)
30% identity, 87% coverage: 44:492/514 of query aligns to 27:470/495 of 2r46A

query
sites
2r46A
L
 
L
R
 
S
T
 
V
A
 
L
L
 
M
I
x
L
D
x
E
A
|
A
E
 
Q
D
 
D
W
 
L
G
 
A
A
 
C
G
 
A
T
|
T
S
|
S
S
 
S
A
|
A
S
|
S
S
|
S
K
 
K
L
|
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
|
R
Y
|
Y
L
 
L
E
 
E
N
 
H
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
G
 
R
L
 
L
V
 
V
R
 
S
H
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
M
A
 
A
P
 
P
H
 
H
M
 
I
V
 
A
R
 
F
P
 
P
I
 
M
N
 
R
F
 
F
V
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
H
W
 
R
Q
 
P
G
 
H
A
 
L
R
 
R
V
 
P
G
 
A
M
 
W
A
 
M
R
 
-
L
 
I
R
 
R
A
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
F
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
T
 
H
L
 
L
A
 
-
W
 
-
G
 
G
R
 
K
Q
 
R
-
 
T
-
 
S
-
 
L
P
 
P
V
 
G
Q
 
S
R
 
T
H
 
G
K
 
L
R
 
R
F
 
F
N
 
G
R
 
A
E
 
N
R
 
S
L
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
P
G
 
E
L
 
I
R
 
K
G
 
R
G
 
G
F
 
F
R
 
E
Y
 
Y
G
 
S
D
 
D
C
 
C
Q
 
W
E
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
L
L
 
A
V
 
N
V
 
A
A
x
Q
A
 
M
A
 
V
Q
 
V
A
 
R
A
 
K
G
 
G
A
 
G
V
 
E
C
 
V
A
 
L
N
 
T
H
 
R
V
 
T
R
 
R
A
|
A
E
 
T
A
 
S
L
 
A
Q
 
R
R
 
R
D
 
E
N
 
N
T
 
G
G
 
L
T
 
W
V
 
I
T
 
V
G
 
E
A
 
A
T
 
E
L
 
D
R
 
I
D
 
D
T
 
T
L
 
G
G
 
K
D
 
K
A
 
Y
R
 
S
W
 
W
T
 
-
L
 
-
H
 
Q
A
 
A
G
 
R
H
 
G
T
 
L
V
 
V
G
 
N
T
 
A
V
x
T
G
 
G
P
 
P
W
 
W
V
 
V
E
 
K
E
 
Q
L
 
F
-
 
F
-
 
D
T
 
D
G
 
G
A
 
M
Q
 
H
S
 
L
P
 
P
A
 
S
-
 
P
-
 
Y
-
 
G
V
 
I
Q
 
R
F
 
L
V
 
I
K
 
K
G
|
G
T
 
S
H
 
H
L
 
I
V
 
V
M
 
V
S
 
P
G
 
R
I
 
V
P
 
H
D
 
T
C
 
Q
H
 
K
S
 
Q
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
L
 
L
N
 
Q
A
 
N
P
 
-
Q
 
E
D
 
D
G
 
K
R
|
R
V
 
I
F
 
V
F
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
W
Y
 
M
N
 
D
R
 
E
-
 
F
T
 
S
L
 
I
V
 
I
G
 
G
T
|
T
T
 
T
E
x
D
V
 
V
S
 
E
V
 
Y
N
 
K
A
 
G
-
 
D
P
 
P
A
 
K
D
 
A
A
 
V
R
 
K
P
 
I
S
 
E
D
 
E
E
 
S
E
 
E
C
 
I
R
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
V
A
 
Y
H
 
N
A
 
T
W
 
H
M
 
F
P
 
K
G
 
K
L
 
Q
P
 
L
W
 
S
R
 
R
E
 
-
E
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
V
Q
 
W
R
 
T
F
 
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
V
R
|
R
T
 
P
L
 
L
A
 
C
A
 
D
Q
 
D
G
 
E
A
 
S
G
 
D
S
 
S
L
 
P
S
 
Q
K
 
A
V
 
I
S
 
T
R
|
R
E
 
D
F
 
Y
E
 
T
I
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
D
-
 
E
T
 
N
Q
 
G
P
 
K
A
 
A
P
 
P
G
 
L
L
 
L
T
 
S
V
 
V
P
 
-
V
 
F
G
 
G
G
|
G
K
|
K
Y
x
L
T
|
T
T
 
T
A
 
Y
R
 
R
L
 
K
D
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
H
I
 
A
I
 
L
D
 
E
S
 
K
V
 
L
C
 
T
G
 
P
H
 
Y
L
 
Y
G
 
Q
V
 
G
K
 
I
A
 
G
K
 
P
S
 
A
V
 
W
T
 
T
D
 
K
R
 
E
A
 
S
P
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
G
P
 
-
P
 
A
A
 
I
D
 
E
N
 
G
S
 
D
L
 
R
G
 
D
D
 
D
W
 
Y
L
 
A
E
 
A
D
 
R
A
 
L
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
Y
C
 
P
A
 
F
L
 
-
G
 
-
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
S
A
 
L
A
 
A
M
 
R
Q
 
H
A
 
Y
A
 
A
L
 
R
R
 
T
H
 
Y
G
 
G
T
 
S
R
 
N
V
 
S
D
 
E
T
 
L
L
 
L
C
 
L
A
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
G
D
 
N
K
 
A
G
 
G
L
 
T
A
 
V
T
 
S
R
 
D
I
 
L
R
 
G
P
 
E
D
 
D
C
 
F
-
 
G
-
 
H
P
 
E
F
 
F
A
 
Y
R
 
E
V
 
A
E
 
E
A
 
L
A
 
K
V
 
Y
A
 
L
I
x
V
S
x
D
D
x
H
E
 
E
M
x
W
A
 
V
M
 
R
T
 
R
A
 
A
E
 
D
D
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
W
R
 
R
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2r45A Crystal structure of escherichia coli glycerol-3-phosphate dehydrogenase in complex with 2-phospho-d-glyceric acid (see paper)
30% identity, 87% coverage: 44:492/514 of query aligns to 27:470/495 of 2r45A

query
sites
2r45A
L
 
L
R
 
S
T
 
V
A
 
L
L
 
M
I
 
L
D
x
E
A
|
A
E
 
Q
D
 
D
W
 
L
G
 
A
A
x
C
G
x
A
T
|
T
S
|
S
S
 
S
A
|
A
S
|
S
S
|
S
K
 
K
L
|
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
|
R
Y
|
Y
L
 
L
E
 
E
N
 
H
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
G
 
R
L
 
L
V
 
V
R
 
S
H
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
E
R
 
R
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
M
A
 
A
P
 
P
H
 
H
M
 
I
V
 
A
R
 
F
P
 
P
I
 
M
N
 
R
F
 
F
V
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
H
W
 
R
Q
 
P
G
 
H
A
 
L
R
 
R
V
 
P
G
 
A
M
 
W
A
 
M
R
 
-
L
 
I
R
 
R
A
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
F
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
T
 
H
L
 
L
A
 
-
W
 
-
G
 
G
R
 
K
Q
 
R
-
 
T
-
 
S
-
 
L
P
 
P
V
 
G
Q
 
S
R
 
T
H
 
G
K
 
L
R
 
R
F
 
F
N
 
G
R
 
A
E
 
N
R
 
S
L
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
P
G
 
E
L
 
I
R
 
K
G
 
R
G
 
G
F
 
F
R
 
E
Y
 
Y
G
 
S
D
 
D
C
 
C
Q
 
W
E
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
L
L
 
A
V
 
N
V
 
A
A
x
Q
A
 
M
A
 
V
Q
x
V
A
 
R
A
 
K
G
 
G
A
 
G
V
 
E
C
 
V
A
 
L
N
 
T
H
 
R
V
 
T
R
 
R
A
|
A
E
 
T
A
 
S
L
 
A
Q
 
R
R
 
R
D
 
E
N
 
N
T
 
G
G
 
L
T
 
W
V
 
I
T
 
V
G
 
E
A
 
A
T
 
E
L
 
D
R
 
I
D
 
D
T
 
T
L
 
G
G
 
K
D
 
K
A
 
Y
R
 
S
W
 
W
T
 
-
L
 
-
H
 
Q
A
 
A
G
 
R
H
 
G
T
 
L
V
 
V
G
 
N
T
 
A
V
x
T
G
|
G
P
 
P
W
|
W
V
 
V
E
 
K
E
x
Q
L
 
F
-
 
F
-
 
D
T
 
D
G
 
G
A
 
M
Q
 
H
S
 
L
P
 
P
A
 
S
-
 
P
-
 
Y
-
 
G
V
 
I
Q
 
R
F
 
L
V
 
I
K
 
K
G
|
G
T
 
S
H
 
H
L
 
I
V
 
V
M
 
V
S
 
P
G
 
R
I
 
V
P
 
H
D
 
T
C
 
Q
H
 
K
S
 
Q
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
L
 
L
N
 
Q
A
 
N
P
 
-
Q
 
E
D
 
D
G
 
K
R
|
R
V
x
I
F
 
V
F
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
W
Y
 
M
N
 
D
R
 
E
-
 
F
T
 
S
L
 
I
V
 
I
G
 
G
T
|
T
T
 
T
E
 
D
V
 
V
S
 
E
V
 
Y
N
 
K
A
x
G
-
 
D
P
|
P
A
 
K
D
 
A
A
 
V
R
 
K
P
 
I
S
 
E
D
 
E
E
 
S
E
 
E
C
 
I
R
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
V
A
 
Y
H
 
N
A
 
T
W
 
H
M
 
F
P
 
K
G
 
K
L
 
Q
P
 
L
W
 
S
R
 
R
E
 
-
E
 
D
D
 
D
I
 
I
I
x
V
Q
 
W
R
 
T
F
 
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
V
R
|
R
T
 
P
L
 
L
A
 
C
A
 
D
Q
 
D
G
 
E
A
 
S
G
 
D
S
 
S
L
 
P
S
 
Q
K
 
A
V
 
I
S
 
T
R
|
R
E
 
D
F
 
Y
E
 
T
I
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
D
-
 
E
T
 
N
Q
 
G
P
 
K
A
 
A
P
 
P
G
 
L
L
 
L
T
 
S
V
 
V
P
 
-
V
 
F
G
 
G
G
|
G
K
|
K
Y
x
L
T
|
T
T
 
T
A
 
Y
R
 
R
L
 
K
D
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
H
I
 
A
I
 
L
D
 
E
S
 
K
V
 
L
C
 
T
G
 
P
H
 
Y
L
 
Y
G
 
Q
V
 
G
K
 
I
A
 
G
K
 
P
S
 
A
V
 
W
T
 
T
D
 
K
R
 
E
A
 
S
P
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
G
P
 
-
P
 
A
A
 
I
D
 
E
N
 
G
S
 
D
L
 
R
G
 
D
D
 
D
W
x
Y
L
 
A
E
 
A
D
x
R
A
 
L
Q
 
R
R
 
R
R
|
R
L
 
Y
C
 
P
A
 
F
L
 
-
G
 
-
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
S
A
 
L
A
 
A
M
 
R
Q
 
H
A
 
Y
A
 
A
L
 
R
R
 
T
H
 
Y
G
 
G
T
 
S
R
 
N
V
 
S
D
 
E
T
 
L
L
 
L
C
 
L
A
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
G
D
 
N
K
 
A
G
 
G
L
 
T
A
 
V
T
 
S
R
 
D
I
 
L
R
 
G
P
 
E
D
 
D
C
 
F
-
 
G
-
 
H
P
 
E
F
 
F
A
 
Y
R
 
E
V
 
A
E
 
E
A
 
L
A
 
K
V
 
Y
A
 
L
I
x
V
S
x
D
D
x
H
E
 
E
M
x
W
A
 
V
M
 
R
T
x
R
A
 
A
E
x
D
D
 
D
V
 
A
L
 
L
R
x
W
R
 
R
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3da1A X-ray structure of the glycerol-3-phosphate dehydrogenase from bacillus halodurans complexed with fad. Northeast structural genomics consortium target bhr167.
30% identity, 85% coverage: 9:446/514 of query aligns to 6:396/496 of 3da1A

query
sites
3da1A
K
 
K
R
 
R
D
 
D
-
 
K
L
 
C
A
 
I
G
 
G
L
 
E
Q
 
M
D
 
S
A
 
E
R
 
K
R
 
Q
F
 
L
D
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
V
V
x
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
I
|
I
Y
x
T
G
 
G
A
 
A
W
 
G
A
 
I
A
 
A
Y
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
S
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
Q
T
 
T
A
 
G
L
 
L
I
 
V
D
x
E
A
x
M
E
 
N
D
 
D
W
 
F
G
 
A
A
 
S
G
|
G
T
 
T
S
|
S
S
 
S
A
 
R
S
|
S
S
x
T
K
 
K
L
|
L
I
 
V
H
|
H
G
 
G
G
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
V
G
 
G
L
 
-
V
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
K
E
 
E
R
 
R
R
 
A
V
 
I
L
 
V
A
 
Y
R
 
E
L
 
N
A
 
A
P
 
P
H
 
H
M
 
V
V
 
T
R
 
T
P
 
P
I
 
-
N
 
-
F
 
-
V
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
Y
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
E
W
 
W
G
 
M
R
 
L
Q
 
L
P
 
P
V
 
I
Q
 
F
R
 
K
H
 
R
K
 
Y
R
 
M
F
 
L
N
 
N
R
 
E
E
 
K
R
 
Q
L
 
T
L
 
L
R
 
E
R
 
K
Y
 
E
P
 
P
F
 
L
L
 
L
A
 
R
D
 
K
A
 
E
G
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
F
 
G
R
 
I
Y
 
Y
G
 
V
D
 
E
C
 
Y
Q
 
R
E
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
T
T
 
L
L
 
E
V
 
I
V
 
M
A
 
K
A
 
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
V
C
 
A
A
 
L
N
 
N
H
 
Y
V
 
M
R
 
K
A
x
V
E
 
E
A
 
S
L
 
F
Q
 
I
R
 
Y
D
 
D
N
 
Q
T
 
-
G
 
G
T
 
K
V
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
V
T
 
V
L
 
A
R
 
K
D
 
D
T
 
R
L
 
L
G
 
T
D
 
D
A
 
T
R
 
T
W
 
H
T
 
T
L
 
I
H
 
Y
A
 
A
G
 
K
H
 
K
T
 
V
V
 
V
G
 
N
T
 
A
V
 
A
G
|
G
P
 
P
W
|
W
V
 
V
E
 
D
E
 
T
L
|
L
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
D
T
 
R
G
 
S
A
 
K
Q
 
H
S
 
G
P
 
K
A
 
Y
V
 
L
Q
 
K
F
 
L
V
 
S
K
 
K
G
|
G
T
 
V
H
 
H
L
 
L
V
 
V
M
 
V
-
 
D
-
 
Q
S
 
S
G
 
R
I
 
F
P
 
P
D
 
-
C
 
L
H
 
R
S
 
Q
A
 
A
F
 
V
L
 
Y
L
 
F
N
 
D
A
 
T
P
 
E
Q
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
M
F
 
I
F
 
F
V
 
A
I
 
I
P
 
P
Y
 
R
Y
 
E
N
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
Y
V
 
I
G
 
G
T
|
T
T
 
T
E
 
D
V
 
T
S
 
F
V
 
Y
N
 
D
A
 
K
P
 
D
-
 
I
A
 
A
D
 
S
A
 
P
R
 
R
P
 
M
S
 
T
D
 
V
E
 
E
E
 
D
C
 
R
R
 
D
Y
 
Y
L
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
N
A
 
Y
W
 
M
M
 
F
P
 
P
G
 
S
L
 
L
P
 
R
W
 
L
R
 
T
E
 
A
E
 
D
D
 
D
I
 
V
I
 
E
Q
 
S
R
 
S
F
 
W
A
 
A
G
|
G
I
 
L
R
|
R
T
 
P
L
 
L
A
 
I
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
K
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
H
E
 
E
F
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
F
Q
 
F
P
 
S
A
 
D
P
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
I
V
 
S
P
 
I
V
 
A
G
 
G
G
|
G
K
|
K
Y
x
L
T
 
T
T
 
G
A
 
Y
R
 
R
L
 
K
D
 
M
A
 
A
A
 
E
E
 
R
I
 
T
I
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
V
C
 
A
G
 
Q
H
 
G
L
 
L
G
 
N
V
 
V
K
 
N
A
 
E
K
 
P
S
 
C
V
 
T
T
 
T
D
 
A
R
 
A
A
 
I
P
 
R
L
 
L
P
 
S
G
 
G
A
 
G
-
 
L
P
 
A
P
 
E
A
 
G
D
 
A
N
 
Q
S
 
G
L
 
F
G
 
P
D
 
R
W
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
S
R
 
R
R
 
K
L
 
G
C
 
A
A
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
F
D
 
D
E
 
A
A
 
D
A
 
E
A
 
V
M
 
R
Q
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
K
R
 
L
H
 
Y
G
 
G
T
 
S
R
 
N
V
 
V
D
 
D

Q9HUH4 Probable FAD-dependent oxidoreductase PA4991; EC 1.-.-.- from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
41% identity, 10% coverage: 22:72/514 of query aligns to 8:58/391 of Q9HUH4

query
sites
Q9HUH4
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
Y
x
A
G
 
G
A
 
L
W
 
W
A
 
L
A
 
N
Y
 
A
D
 
R
A
 
L
A
 
R
S
 
R
R
 
A
G
 
G
L
 
Y
R
 
A
T
 
T
A
 
V
L
 
L
I
 
V
D
x
E
A
 
S
E
 
A
D
 
S
W
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
T
x
Q
S
|
S
S
 
V
A
 
K
S
 
S
S
x
Q
K
x
G
L
x
I
I
 
I
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
A
R
 
K
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_043769224.1 NCBI__GCF_000733765.1:WP_043769224.1
MSNAAFPLKRDLAGLQDARRFDVLVVGGGIYGAWAAYDAASRGLRTALIDAEDWGAGTSS
ASSKLIHGGLRYLENFELGLVRHALTERRVLARLAPHMVRPINFVLPVWQGARVGMARLR
AGLMLYDTLAWGRQPVQRHKRFNRERLLRRYPFLADAGLRGGFRYGDCQEDDARLVTLVV
AAAQAAGAVCANHVRAEALQRDNTGTVTGATLRDTLGDARWTLHAGHTVGTVGPWVEELT
GAQSPAVQFVKGTHLVMSGIPDCHSAFLLNAPQDGRVFFVIPYYNRTLVGTTEVSVNAPA
DARPSDEECRYLLAAAHAWMPGLPWREEDIIQRFAGIRTLAAQGAGSLSKVSREFEITQP
APGLTVPVGGKYTTARLDAAEIIDSVCGHLGVKAKSVTDRAPLPGAPPADNSLGDWLEDA
QRRLCALGLDEAAAMQAALRHGTRVDTLCARLEADKGLATRIRPDCPFARVEAAVAISDE
MAMTAEDVLRRRLPLDLLDTDREAARTSIADLLP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory