SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_043769901.1 NCBI__GCF_000733765.1:WP_043769901.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
45% identity, 99% coverage: 3:251/252 of query aligns to 3:250/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
L
 
L
T
 
S
N
 
G
K
 
Q
R
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
D
 
A
F
 
T
A
 
A
L
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
V
T
 
V
V
 
V
S
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
D
E
 
S
S
 
A
G
 
G
A
 
G
Q
 
E
A
 
G
V
 
T
A
 
V
A
 
E
E
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
H
 
V
A
 
F
L
 
I
R
 
R
A
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
V
 
R
E
 
D
A
 
A
D
 
E
V
 
V
A
 
K
R
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
E
D
 
G
A
 
C
V
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
C
 
Y
L
 
A
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
T
 
I
I
 
E
K
 
Q
-
 
G
P
 
K
V
 
L
T
 
A
D
 
D
I
 
G
S
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
E
W
 
F
D
 
D
R
 
A
L
 
I
M
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
W
F
 
L
G
 
C
C
 
M
K
 
K
H
 
H
A
 
Q
F
 
I
P
 
P
-
 
L
H
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
T
 
G
H
 
G
G
 
G
N
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
x
T
A
 
A
S
|
S
A
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
G
G
 
A
W
 
A
P
 
P
L
 
K
L
 
M
S
 
S
L
 
I
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
I
Q
 
G
M
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
A
S
 
A
Q
 
I
E
 
E
F
 
Y
R
 
A
E
 
K
A
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
 
P
M
x
A
V
|
V
I
 
I
A
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
G
 
-
S
 
-
R
 
-
F
 
F
K
 
R
D
 
R
T
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
A
E
 
D
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
P
A
 
R
G
 
K
D
 
A
M
 
E
L
 
F
D
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
M
-
 
H
-
 
P
-
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
D
G
 
N
A
 
A
S
 
G
F
 
F
V
 
T
N
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
I
 
V
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
A

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
38% identity, 100% coverage: 1:251/252 of query aligns to 3:254/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
N
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
A
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
Y
D
 
A
F
 
A
A
 
V
L
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
L
T
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
V
 
N
I
 
V
T
 
V
V
 
V
S
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
E
 
E
S
 
A
G
 
Q
A
 
G
Q
 
E
A
 
A
V
 
M
A
 
V
A
 
R
E
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
E
A
 
N
G
 
N
G
 
D
Q
 
R
A
 
L
H
 
H
A
 
F
L
 
V
R
 
Q
A
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
V
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
A
V
 
C
A
 
Q
R
 
H
L
 
A
V
 
V
A
 
E
D
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
H
A
 
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
C
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
E
 
E
T
 
I
I
 
V
K
 
A
P
 
P
V
 
I
T
 
H
D
 
E
I
 
M
S
 
E
E
 
L
A
 
S
E
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
L
 
V
M
 
L
A
 
Q
I
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
M
F
 
F
F
 
L
G
 
M
C
 
S
K
 
K
H
 
H
A
 
A
F
 
L
P
 
K
H
 
H
-
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
A
T
 
G
H
 
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
x
T
A
 
C
S
|
S
A
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
A
W
 
W
P
 
P
L
 
D
L
 
I
S
 
P
L
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
Q
M
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
S
 
A
Q
 
V
E
 
D
F
 
Y
R
 
A
E
 
K
A
 
H
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
C
 
C
P
|
P
M
x
G
V
x
I
I
|
I
A
 
D
T
 
T
D
 
P
M
 
L
G
 
N
S
 
E
R
 
K
-
 
S
F
 
F
K
 
L
D
 
E
T
 
N
Y
 
N
E
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
K
 
K
E
 
K
Y
 
E
G
 
K
V
 
A
P
 
K
A
 
V
G
 
N
D
 
P
M
 
L
L
 
L
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
N
A
 
V
A
 
M
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
M
N
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
A
L
 
I
P
 
T
I
 
A
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
Y
T
 
T
A
 
A

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
39% identity, 100% coverage: 1:251/252 of query aligns to 3:226/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
M
 
M
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
N
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
A
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
Y
D
 
A
F
 
A
A
 
V
L
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
L
T
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
V
 
N
I
 
V
T
 
V
V
 
V
S
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
E
 
E
S
 
-
G
 
-
A
 
A
Q
 
Q
A
 
G
V
 
E
A
 
A
A
 
M
E
 
V
I
 
R
K
 
K
A
 
E
A
 
N
G
 
N
G
 
D
Q
 
R
A
 
L
H
 
H
A
 
F
L
 
V
R
 
Q
A
x
T
D
|
D
V
x
I
T
 
T
V
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
A
V
 
C
A
 
Q
R
 
H
L
 
A
V
 
V
A
 
E
D
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
H
A
 
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
C
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
T
 
I
I
 
V
K
 
A
P
 
P
V
 
I
T
 
H
D
 
E
I
 
M
S
 
E
E
 
L
A
 
S
E
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
L
 
V
M
 
L
A
 
Q
I
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
M
F
 
F
F
 
L
G
 
M
C
 
S
K
 
K
H
 
H
A
 
A
F
 
L
P
 
K
H
 
H
-
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
A
T
 
G
H
 
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
x
T
A
 
C
S
|
S
A
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
A
W
 
W
P
 
P
L
 
D
L
 
I
S
 
P
L
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
Q
M
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
S
 
A
Q
 
V
E
 
D
F
 
Y
R
 
A
E
 
K
A
 
H
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
C
 
C
P
|
P
M
x
G
V
 
I
I
|
I
A
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
F
 
-
K
 
-
D
 
D
T
 
T
Y
 
L
E
 
-
K
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
N
A
 
V
A
 
M
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
M
N
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
A
L
 
I
P
 
T
I
 
A
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
Y
T
 
T
A
 
A

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
39% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 5:251/261 of P40288

query
sites
P40288
L
 
L
T
 
E
N
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
x
V
I
|
I
T
|
T
G
|
G
A
x
S
A
x
S
A
x
T
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
x
K
D
x
S
F
x
M
A
|
A
L
x
I
R
|
R
F
|
F
A
|
A
T
|
T
E
|
E
G
x
K
A
|
A
V
x
K
I
x
V
T
x
V
V
 
V
S
 
N
-
 
Y
D
 
R
I
 
S
D
 
K
E
 
E
S
 
D
G
 
E
A
 
A
Q
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
H
 
I
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
G
D
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
V
E
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
I
R
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
Q
D
 
S
A
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
E
M
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
C
 
V
L
 
M
I
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
L
E
|
E
T
 
N
I
 
P
K
 
V
P
 
S
V
 
S
T
 
H
D
 
E
I
 
M
S
 
S
E
 
L
A
 
S
E
x
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
L
x
V
M
 
I
A
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
G
C
 
S
K
 
R
H
 
E
A
 
A
F
 
I
P
 
K
H
 
Y
L
 
F
A
 
V
E
|
E
T
 
N
-
 
D
-
 
I
H
 
K
G
 
G
N
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
L
 
M
A
 
S
S
 
S
A
 
V
A
 
H
G
 
E
L
 
K
I
 
I
G
 
P
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
F
S
 
V
L
 
H
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
G
V
 
M
I
 
K
Q
 
L
M
 
M
S
 
T
K
 
E
A
 
T
L
 
L
S
 
A
Q
 
L
E
 
E
F
 
Y
R
 
A
E
 
P
A
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
|
V
N
 
N
A
 
N
L
 
I
C
 
G
P
 
P
M
 
G
V
 
A
I
 
I
A
 
N
T
 
T
D
x
P
M
 
I
G
 
N
S
 
A
-
 
E
R
 
K
F
 
F
K
 
A
D
 
D
T
 
P
Y
 
E
E
 
Q
K
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
V
E
|
E
Y
 
S
G
 
M
V
 
I
P
 
P
A
 
-
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
M
G
 
G
R
x
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
G
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
T
L
 
L
P
 
F
I
 
A
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:251/252 of query aligns to 1:243/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
M
 
M
Q
 
R
L
 
F
T
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
A
x
N
G
 
G
L
x
M
G
 
G
R
 
E
D
 
A
F
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
T
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
V
V
 
L
S
 
A
D
|
D
I
 
W
D
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
A
A
 
V
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
L
K
 
P
A
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
H
 
M
A
 
A
L
 
V
R
 
H
A
 
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
V
 
D
E
 
H
A
 
V
D
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
K
L
 
M
V
 
M
A
 
N
D
 
E
A
 
V
V
 
A
A
 
E
A
 
K
M
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
C
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
H
T
 
V
I
 
A
K
 
G
P
 
S
V
 
V
T
 
L
D
 
E
I
 
T
S
 
S
E
 
I
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
L
 
I
M
 
A
A
 
G
I
 
V
N
 
D
V
 
I
K
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
V
F
 
F
G
 
C
C
 
S
K
 
K
H
 
F
A
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
L
E
 
K
T
 
T
H
 
K
G
 
G
N
 
C
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
 
T
A
 
A
S
|
S
A
x
V
A
x
S
G
 
G
L
 
L
I
 
G
G
 
G
W
 
D
P
 
W
L
 
G
L
 
A
S
 
A
L
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
E
 
D
F
 
H
R
 
G
E
 
G
A
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
C
 
C
P
 
P
M
 
S
V
 
L
I
x
V
A
 
K
T
|
T
D
 
N
M
 
M
G
 
T
S
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
P
-
 
Q
R
 
E
F
 
I
K
x
R
D
|
D
T
x
K
Y
 
F
E
 
N
K
 
E
E
 
R
Y
 
I
G
 
A
V
 
L
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
A
A
 
N
L
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 11:257/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
T
 
K
N
 
D
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
S
A
x
T
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
D
 
A
F
 
M
A
 
A
L
 
V
R
 
R
F
 
F
A
 
G
T
 
Q
E
 
E
G
 
E
A
 
A
V
 
K
I
 
V
T
 
V
V
 
I
S
 
N
D
 
Y
I
x
Y
D
 
N
-
 
N
E
 
E
S
 
E
G
 
E
A
 
A
Q
 
L
A
 
D
V
 
A
A
 
K
A
 
K
E
 
E
I
 
V
K
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
H
 
I
A
 
I
L
 
V
R
 
Q
A
 
G
D
|
D
V
|
V
T
 
T
V
 
K
E
 
E
A
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
V
R
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
Q
D
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
E
M
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
V
L
 
M
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
E
|
E
T
 
N
I
 
P
K
 
V
P
 
P
V
 
S
T
 
H
D
 
E
I
 
L
S
 
S
E
 
L
A
 
D
E
 
N
W
 
W
D
 
N
R
 
K
L
 
V
M
 
I
A
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
G
C
 
S
K
 
R
H
 
E
A
 
A
F
 
I
P
 
K
H
 
Y
L
 
F
A
 
V
E
 
E
T
 
N
-
 
D
-
 
I
H
 
K
G
 
G
N
 
N
I
 
V
I
 
I
N
 
N
L
x
M
A
 
S
S
|
S
A
 
V
A
x
H
G
 
E
L
 
M
I
 
I
G
 
P
W
|
W
P
 
P
L
 
L
L
 
F
S
 
V
L
 
H
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
M
I
 
K
Q
 
L
M
 
M
S
 
T
K
 
E
A
 
T
L
 
L
S
 
A
Q
 
L
E
 
E
F
 
Y
R
 
A
E
 
P
A
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
L
 
I
C
 
G
P
|
P
M
x
G
V
 
A
I
x
M
A
 
N
T
|
T
D
x
P
M
x
I
G
x
N
S
 
A
-
 
E
R
x
K
F
 
F
K
 
A
D
 
D
T
 
P
Y
 
V
E
 
Q
K
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
V
E
 
E
Y
 
S
G
 
M
V
 
I
P
 
P
A
 
-
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
M
G
 
G
R
 
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
G
 
Q
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
T
L
 
L
P
 
F
I
 
A
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
M
T
 
T

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
38% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 5:251/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
L
 
L
T
 
E
N
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
S
A
x
T
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
K
D
 
S
F
 
M
A
 
A
L
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
G
 
K
A
 
A
V
 
K
I
 
V
T
 
V
V
 
V
S
 
N
-
 
Y
D
x
R
I
 
S
D
 
K
E
 
E
S
 
D
G
 
E
A
 
A
Q
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
H
 
I
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
G
D
|
D
V
|
V
T
 
T
V
 
V
E
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
I
R
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
Q
D
 
S
A
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
E
M
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
C
 
V
L
 
M
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
E
 
A
T
 
N
I
 
P
K
 
V
P
 
S
V
 
S
T
 
H
D
 
E
I
 
M
S
 
S
E
 
L
A
 
S
E
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
L
 
V
M
 
I
A
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
G
C
 
S
K
 
R
H
 
E
A
 
A
F
 
I
P
 
K
H
 
Y
L
 
F
A
 
V
E
 
E
T
 
N
-
 
D
-
 
I
H
 
K
G
 
G
N
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
L
x
M
A
 
S
S
|
S
A
 
V
A
 
H
G
 
E
L
 
K
I
 
I
G
 
P
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
F
S
 
V
L
 
H
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
M
I
 
K
Q
 
L
M
 
M
S
 
T
K
 
E
A
 
T
L
 
L
S
 
A
Q
 
L
E
 
E
F
 
Y
R
 
A
E
 
P
A
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
L
 
I
C
 
G
P
|
P
M
x
G
V
 
A
I
|
I
A
 
N
T
|
T
D
 
P
M
 
I
G
 
N
S
 
A
-
 
E
R
 
K
F
 
F
K
 
A
D
 
D
T
 
P
Y
 
E
E
 
Q
K
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
V
E
 
E
Y
 
S
G
 
M
V
 
I
P
 
P
A
 
-
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
M
G
 
G
R
 
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
G
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
T
L
 
L
P
 
F
I
 
A
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
M
T
 
T

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:251/252 of query aligns to 2:243/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
Q
 
R
L
 
F
T
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
A
x
N
G
|
G
L
x
M
G
 
G
R
 
E
D
 
A
F
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
T
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
V
V
 
L
S
 
A
D
|
D
I
x
W
D
x
A
E
 
K
S
 
E
G
 
A
A
 
V
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
L
K
 
P
A
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
H
 
M
A
 
A
L
 
V
R
 
H
A
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
V
 
D
E
 
H
A
 
V
D
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
K
L
 
M
V
 
M
A
 
N
D
 
E
A
 
V
V
 
A
A
 
E
A
 
K
M
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
C
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
E
 
H
T
 
V
I
 
A
K
 
G
P
 
S
V
 
V
T
 
L
D
 
E
I
 
T
S
 
S
E
 
I
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
L
 
I
M
 
A
A
 
G
I
x
V
N
 
D
V
 
I
K
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
V
F
 
F
G
 
C
C
 
S
K
 
K
H
 
F
A
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
L
E
 
K
T
 
T
H
 
K
G
 
G
N
 
C
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
x
T
A
 
A
S
|
S
A
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
G
G
 
G
W
 
D
P
 
W
L
 
G
L
 
A
S
 
A
L
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
E
 
D
F
 
H
R
 
G
E
 
G
A
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
C
 
C
P
|
P
M
x
S
V
x
L
I
x
V
A
 
K
T
|
T
D
x
N
M
|
M
G
x
T
S
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
P
-
 
Q
R
 
E
F
 
I
K
 
R
D
 
D
T
 
K
Y
 
F
E
 
N
K
 
E
E
 
R
Y
 
I
G
 
A
V
 
L
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
A
A
 
N
L
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
A

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:251/252 of query aligns to 2:243/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
Q
 
R
L
 
F
T
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
A
x
N
G
|
G
L
x
M
G
 
G
R
 
E
D
 
A
F
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
T
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
V
V
 
L
S
 
A
D
|
D
I
x
W
D
x
A
E
 
K
S
 
E
G
 
A
A
 
V
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
L
K
 
P
A
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
H
 
M
A
 
A
L
 
V
R
 
H
A
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
V
 
D
E
 
H
A
 
V
D
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
K
L
 
M
V
 
M
A
 
N
D
 
E
A
 
V
V
 
A
A
 
E
A
 
K
M
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
C
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
E
 
H
T
 
V
I
 
A
K
 
G
P
 
S
V
 
V
T
 
L
D
 
E
I
 
T
S
 
S
E
 
I
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
L
 
I
M
 
A
A
 
G
I
x
V
N
 
D
V
 
I
K
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
V
F
 
F
G
 
C
C
 
S
K
 
K
H
 
F
A
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
L
E
 
K
T
 
T
H
 
K
G
 
G
N
 
C
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
x
T
A
 
A
S
|
S
A
 
V
A
x
S
G
 
G
L
 
L
I
 
G
G
 
G
W
 
D
P
 
W
L
 
G
L
 
A
S
 
A
L
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
E
 
D
F
 
H
R
 
G
E
 
G
A
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
C
 
C
P
 
P
M
x
S
V
x
L
I
x
V
A
 
K
T
|
T
D
x
N
M
|
M
G
x
T
S
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
P
-
 
Q
R
 
E
F
 
I
K
 
R
D
 
D
T
 
K
Y
 
F
E
 
N
K
 
E
E
 
R
Y
 
I
G
 
A
V
 
L
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
A
A
 
N
L
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
A

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:251/252 of query aligns to 4:245/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
Q
 
R
L
 
F
T
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
A
x
N
G
|
G
L
 
M
G
 
G
R
 
E
D
 
A
F
 
A
A
 
A
L
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
T
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
V
V
 
L
S
 
A
D
|
D
I
x
W
D
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
A
A
 
V
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
L
K
 
P
A
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
H
 
M
A
 
A
L
 
V
R
 
H
A
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
V
 
D
E
 
H
A
 
V
D
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
K
L
 
M
V
 
M
A
 
N
D
 
E
A
 
V
V
 
A
A
 
E
A
 
K
M
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
C
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
 
V
E
 
H
T
 
V
I
 
A
K
 
G
P
 
S
V
 
V
T
 
L
D
 
E
I
 
T
S
 
S
E
 
I
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
L
 
I
M
 
A
A
 
G
I
 
V
N
 
D
V
 
I
K
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
V
F
 
F
G
 
C
C
 
S
K
 
K
H
 
F
A
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
L
E
 
K
T
 
T
H
 
K
G
 
G
N
 
C
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
 
T
A
 
A
S
|
S
A
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
G
G
 
G
W
 
D
P
 
W
L
 
G
L
 
A
S
 
A
L
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
E
 
D
F
 
H
R
 
G
E
 
G
A
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
C
 
C
P
 
P
M
 
S
V
 
L
I
 
V
A
 
K
T
 
T
D
 
N
M
 
M
G
 
T
S
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
P
-
 
Q
R
 
E
F
 
I
K
 
R
D
 
D
T
 
K
Y
 
F
E
 
N
K
 
E
E
 
R
Y
 
I
G
 
A
V
 
L
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
A
A
 
N
L
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
A

8w0oA Gdh-105 crystal structure
38% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 5:251/259 of 8w0oA

query
sites
8w0oA
L
 
L
T
 
K
N
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
A
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
A
x
S
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
K
D
 
A
F
 
M
A
 
A
L
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
G
T
 
K
E
 
E
G
 
Q
A
 
A
V
 
K
I
 
V
T
 
V
V
 
I
S
 
N
D
 
Y
I
x
Y
-
 
S
D
 
N
E
 
K
S
x
Q
G
 
D
A
 
P
Q
 
N
A
 
E
V
 
V
A
 
K
A
 
E
E
 
E
I
 
V
K
 
I
A
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
H
 
V
A
 
V
L
 
V
R
 
Q
A
 
G
D
|
D
V
|
V
T
 
T
V
 
K
E
 
E
A
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
K
R
 
N
L
 
I
V
 
V
A
 
Q
D
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
E
M
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
I
L
 
M
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
E
 
E
T
 
N
I
 
P
K
 
V
P
 
P
V
 
S
T
 
H
D
 
E
I
 
M
S
 
P
E
 
L
A
 
K
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
K
L
 
V
M
 
I
A
 
G
I
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
G
C
 
S
K
 
R
H
 
E
A
 
A
F
 
I
P
 
K
H
 
Y
L
 
F
A
 
V
E
 
E
T
 
N
-
 
D
-
 
I
H
 
K
G
 
G
N
 
N
I
 
V
I
 
I
N
 
N
L
x
M
A
 
S
S
 
S
A
 
V
A
 
H
G
 
E
L
 
V
I
 
I
G
 
P
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
F
S
 
V
L
 
H
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
M
I
 
K
Q
 
L
M
 
M
S
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
L
S
 
A
Q
 
L
E
 
E
F
 
Y
R
 
A
E
 
P
A
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
L
 
I
C
 
G
P
|
P
M
x
G
V
 
A
I
|
I
A
 
N
T
|
T
D
 
T
M
 
I
G
 
N
S
 
A
-
 
E
R
 
K
F
 
F
K
 
A
D
 
D
T
 
P
Y
 
K
E
 
Q
K
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
V
E
 
E
Y
 
S
G
 
M
V
 
I
P
 
P
A
 
-
G
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
M
G
 
G
R
 
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
K
G
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
T
L
 
L
P
 
F
I
 
A
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
M
T
 
T

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
40% identity, 91% coverage: 22:251/252 of query aligns to 27:254/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
A
 
A
L
 
L
R
 
R
F
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
K
I
 
V
T
 
A
V
 
L
S
 
I
D
|
D
I
 
L
D
 
D
E
 
Q
S
 
G
G
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
R
V
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
M
I
 
L
K
 
S
A
 
T
A
 
G
G
 
G
G
 
A
Q
 
V
A
 
A
H
 
K
A
 
G
L
 
F
R
 
G
A
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
V
 
K
E
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
I
A
 
T
R
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
T
D
 
S
A
 
A
V
 
E
A
 
Q
A
 
T
M
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
C
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
A
T
 
G
I
 
F
K
 
G
P
 
S
V
 
V
T
 
H
D
 
D
I
 
A
S
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
A
W
 
W
D
 
D
R
 
R
L
 
I
M
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
T
G
 
G
V
 
T
F
 
F
F
 
L
G
 
A
C
 
S
K
 
K
H
 
A
A
 
A
F
 
L
P
 
A
H
 
G
L
 
M
A
 
L
E
 
E
T
 
R
H
 
H
-
 
K
G
 
G
N
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
 
F
A
 
G
S
|
S
A
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
W
 
I
P
 
P
L
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
A
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
K
 
R
A
 
Q
L
 
M
S
 
A
Q
 
A
E
 
D
F
 
Y
R
 
S
E
 
G
A
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
 
P
-
 
G
M
x
T
V
|
V
I
x
T
A
x
S
T
|
T
D
x
G
M
 
M
G
 
G
S
 
Q
R
 
Q
F
 
L
-
 
L
-
 
G
K
 
S
D
 
D
T
 
T
Y
 
S
E
 
P
K
 
E
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
Q
A
 
A
G
 
R
D
x
R
M
 
L
L
 
A
D
x
K
A
x
Y
R
 
P
Q
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
T
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
A
L
 
F
P
 
A
I
 
V
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
M
T
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
40% identity, 89% coverage: 28:251/252 of query aligns to 28:252/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
K
I
 
V
T
 
A
V
 
L
S
 
I
D
|
D
I
x
L
D
 
D
E
 
Q
S
 
G
G
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
R
V
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
M
I
 
L
K
 
S
A
 
T
A
 
G
G
 
G
G
 
A
Q
 
V
A
 
A
H
 
K
A
 
G
L
 
F
R
 
G
A
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
V
 
K
E
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
I
A
 
T
R
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
T
D
 
S
A
 
A
V
 
E
A
 
Q
A
 
T
M
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
C
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
A
T
 
G
I
 
F
K
 
G
P
 
S
V
 
V
T
 
H
D
 
D
I
 
A
S
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
A
W
 
W
D
 
D
R
 
R
L
 
I
M
 
M
A
 
A
I
x
V
N
|
N
V
 
V
K
 
T
G
 
G
V
 
T
F
 
F
F
 
L
G
 
A
C
 
S
K
 
K
H
 
A
A
 
A
F
 
L
P
 
A
H
 
G
L
 
M
A
 
L
E
 
E
T
 
R
H
 
H
-
 
K
G
 
G
N
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
x
F
A
 
G
S
|
S
A
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
W
 
I
P
 
P
L
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
A
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
K
 
R
A
 
Q
L
 
M
S
 
A
Q
 
A
E
 
D
F
 
Y
R
 
S
E
 
G
A
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
|
P
-
 
G
M
x
T
V
|
V
I
 
T
A
 
S
T
|
T
D
 
G
M
|
M
G
 
G
S
 
Q
R
 
Q
F
 
L
-
 
L
-
 
G
K
 
S
D
 
D
T
 
T
Y
 
S
E
 
P
K
 
E
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
Q
A
 
A
G
 
R
D
x
R
M
 
L
L
 
A
D
 
K
A
x
Y
R
 
P
Q
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
T
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
A
L
 
F
P
 
A
I
 
V
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
M
T
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
39% identity, 89% coverage: 28:251/252 of query aligns to 28:247/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
K
I
 
V
T
 
A
V
 
L
S
 
I
D
|
D
I
x
L
D
 
D
E
 
Q
S
 
G
G
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
R
V
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
M
I
 
L
K
 
S
A
 
T
A
 
G
G
 
G
G
 
A
Q
 
V
A
 
A
H
 
K
A
 
G
L
 
F
R
 
G
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
V
 
K
E
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
I
A
 
T
R
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
T
D
 
S
A
 
A
V
 
E
A
 
Q
A
 
T
M
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
C
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
E
 
A
T
 
G
I
 
F
K
 
G
P
 
S
V
 
V
T
 
H
D
 
D
I
 
A
S
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
A
W
 
W
D
 
D
R
 
R
L
 
I
M
 
M
A
 
A
I
x
V
N
|
N
V
 
V
K
 
T
G
 
G
V
 
T
F
 
F
F
 
L
G
 
A
C
 
S
K
 
K
H
 
A
A
 
A
F
 
L
P
 
A
H
 
G
L
 
M
A
 
L
E
 
E
T
 
R
H
 
H
-
 
K
G
 
G
N
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
x
F
A
 
G
S
|
S
A
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
W
 
I
P
 
P
L
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
A
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
K
 
R
A
 
Q
L
 
M
S
 
A
Q
 
A
E
 
D
F
 
Y
R
 
S
E
 
G
A
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
|
P
-
 
G
M
 
T
V
|
V
I
 
T
A
 
S
T
|
T
D
x
G
M
|
M
G
 
G
S
 
Q
R
 
Q
F
 
L
K
 
L
D
 
P
T
 
E
Y
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
Q
A
 
A
G
 
R
D
 
R
M
 
L
L
 
A
D
 
K
A
 
Y
R
 
P
Q
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
T
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
A
L
 
F
P
 
A
I
 
V
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
M
T
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
37% identity, 98% coverage: 1:248/252 of query aligns to 1:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
M
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
A
N
 
N
K
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
A
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
D
 
I
F
 
Y
A
 
A
L
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
V
V
 
V
S
 
A
D
|
D
I
 
I
D
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
K
A
 
A
Q
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
S
I
 
I
K
 
T
A
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
H
 
I
A
 
A
L
 
A
R
 
A
A
 
V
D
 
D
V
|
V
T
 
S
V
 
D
E
 
V
A
 
E
D
 
S
V
 
V
A
 
N
R
 
R
L
 
M
V
 
V
A
 
D
D
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
M
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
C
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
I
 
I
E
 
F
T
x
S
-
 
T
-
 
L
-
 
K
I
 
M
K
 
K
P
 
P
V
 
F
T
 
E
D
 
E
I
 
I
S
 
S
E
 
G
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
K
L
 
L
M
 
F
A
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
F
 
L
G
 
C
C
 
C
K
 
Q
H
 
A
A
 
V
F
 
S
P
 
P
H
 
V
L
 
M
A
 
R
E
 
K
T
 
N
-
 
Q
H
 
Y
G
 
G
N
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
x
I
A
x
S
S
|
S
A
 
S
A
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
T
G
 
G
W
 
R
P
 
P
L
 
N
L
 
Y
S
 
A
L
 
H
Y
|
Y
C
 
I
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
W
Q
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
H
A
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
T
E
 
E
F
 
M
R
 
G
E
 
T
A
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
C
 
S
P
|
P
M
x
H
V
 
G
I
|
I
A
 
I
T
 
T
D
 
E
M
x
I
G
 
P
S
 
-
R
 
-
F
 
-
K
 
R
D
 
E
T
 
T
Y
 
I
E
 
S
K
 
E
E
 
E
Y
 
G
G
 
W
V
 
-
P
 
-
A
 
R
G
 
R
D
 
N
M
 
L
L
 
E
D
 
E
A
 
Q
R
 
A
Q
 
L
G
 
K
R
 
R
L
 
K
G
 
G
R
 
D
P
 
A
E
 
S
E
 
D
V
 
L
T
 
V
A
 
G
A
 
I
A
 
L
V
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
E
A
 
S
S
 
K
F
 
F
V
 
M
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
L
 
V
P
 
A
I
 
L
D
 
D
N
 
A
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:251/252 of query aligns to 3:247/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
T
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
A
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
D
 
A
F
 
V
A
 
A
L
 
H
R
 
S
F
 
Y
A
 
A
T
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
K
I
 
V
T
 
I
V
 
V
S
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
N
E
 
E
S
 
D
G
 
H
A
 
G
Q
 
N
A
 
K
V
 
A
A
 
V
A
 
E
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
H
 
S
A
 
F
L
 
V
R
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
V
 
N
E
 
P
A
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
E
R
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
D
 
R
A
 
T
V
 
V
A
 
E
A
 
I
M
 
Y
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
C
 
I
L
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
E
 
G
T
 
G
I
 
E
K
 
Q
P
 
A
V
 
L
T
 
A
-
 
G
D
 
D
I
 
Y
S
 
G
E
 
L
A
 
D
E
 
S
W
 
W
D
 
R
R
 
K
L
 
V
M
 
L
A
 
S
I
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
G
 
G
C
 
C
K
 
K
H
 
Y
A
 
E
F
 
L
P
 
E
H
 
Q
L
 
M
A
 
E
E
 
K
T
 
N
H
 
G
G
 
G
N
 
G
-
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
x
M
A
 
A
S
|
S
A
 
I
A
 
H
G
 
G
L
 
I
I
 
V
G
 
A
W
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
S
S
 
S
L
 
A
Y
|
Y
C
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
Q
 
G
M
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
N
L
 
I
S
 
G
Q
 
A
E
 
E
F
 
Y
R
 
G
E
 
Q
A
 
K
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
G
P
|
P
M
x
A
V
x
Y
I
|
I
A
 
E
T
 
T
D
 
P
M
x
L
G
 
L
S
 
E
R
 
S
F
 
L
K
 
T
D
 
K
T
 
E
Y
 
M
E
 
-
K
 
K
E
 
E
Y
 
A
G
 
L
V
 
I
P
 
S
A
 
K
G
 
H
D
 
P
M
 
M
L
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
G
 
K
A
 
S
S
 
S
F
 
F
V
 
M
N
 
T
G
 
G
V
 
G
A
 
Y
L
 
Y
P
 
L
I
 
V
D
 
D
N
 
G
G
 
G
G
 
Y
T
 
T
A
 
A

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
36% identity, 98% coverage: 1:248/252 of query aligns to 3:241/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
M
 
F
Q
 
E
L
 
F
T
 
E
N
 
N
K
 
R
R
 
T
V
 
L
L
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
x
N
A
x
G
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
D
 
A
F
 
I
A
 
A
L
 
E
R
 
L
F
 
F
A
 
H
T
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
N
I
 
L
T
 
V
V
 
L
S
 
T
D
|
D
I
x
L
D
 
D
E
 
R
S
 
E
G
 
G
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
V
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
L
K
 
G
A
 
S
A
 
P
G
 
E
G
 
R
Q
 
I
A
 
A
H
 
-
A
 
T
L
 
I
R
 
K
A
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
S
V
 
S
E
 
A
A
 
D
D
 
D
V
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
T
V
 
V
A
 
A
D
 
L
A
 
A
V
 
M
A
 
E
A
 
R
M
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
C
 
F
L
 
L
I
 
V
N
 
P
N
x
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
Y
T
 
Q
I
 
A
K
 
K
P
 
P
V
 
F
T
 
A
D
 
E
I
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
H
R
 
R
L
 
T
M
 
I
A
 
S
I
|
I
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
G
 
L
C
 
C
K
 
K
H
 
R
A
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
-
H
 
D
G
 
S
N
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
T
L
 
L
A
 
A
S
|
S
A
 
L
A
 
A
G
 
A
L
 
Y
I
 
R
G
 
G
W
 
A
P
 
Y
L
 
V
L
x
N
S
 
A
L
 
H
Y
|
Y
C
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
M
I
 
V
Q
 
S
M
 
M
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
E
 
E
F
 
L
R
 
-
E
 
A
A
 
P
G
 
K
V
 
T
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
V
C
 
S
P
|
P
M
 
G
V
 
I
I
|
I
A
 
E
T
|
T
D
 
P
M
|
M
G
 
T
S
 
S
R
 
E
F
 
L
K
 
L
D
 
K
T
 
T
Y
 
R
E
 
M
K
 
D
E
 
E
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
T
M
 
M
L
 
T
D
 
Q
A
 
T
R
 
P
Q
 
L
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
S
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
S
A
 
V
A
 
I
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
G
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
E
A
 
T
L
 
I
P
 
Q
I
 
V
D
 
N
N
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
36% identity, 98% coverage: 1:248/252 of query aligns to 1:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
|
M
Q
 
G
L
 
I
T
 
Q
N
 
N
K
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
A
x
S
G
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
K
D
 
Q
F
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
V
V
 
I
S
 
N
D
|
D
I
 
I
D
 
D
E
 
A
S
 
E
G
 
K
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
V
 
T
A
 
V
A
 
D
E
 
E
I
 
F
K
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
A
 
V
H
 
L
A
 
G
L
 
A
R
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
V
 
N
E
 
K
A
 
A
D
 
A
V
 
V
A
 
D
R
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
K
D
 
Q
A
 
T
V
 
I
A
 
D
A
 
A
M
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
C
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
E
 
E
T
 
R
I
 
A
K
 
G
P
 
A
V
 
L
T
 
R
D
 
K
I
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
V
L
 
T
M
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
F
 
L
G
 
C
C
 
T
K
 
Q
H
 
A
A
 
V
F
 
H
P
 
G
H
 
H
L
 
M
A
 
V
E
 
E
T
 
N
-
 
K
H
 
H
G
 
G
N
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
L
I
 
-
G
 
G
W
 
G
P
 
A
L
 
G
L
 
Q
S
 
T
L
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
G
M
 
M
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
I
E
 
E
F
 
L
R
 
G
E
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
C
 
A
P
 
P
M
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
H
T
 
T
D
 
P
M
 
M
G
 
-
S
 
-
R
 
-
F
 
W
K
 
D
D
 
E
T
 
L
Y
 
P
E
 
E
K
 
K
E
 
D
Y
 
Q
G
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
Q
M
 
F
L
 
L
D
 
L
A
 
S
R
 
R
Q
 
Q
-
 
P
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
I
T
 
A
A
 
N
A
 
T
A
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
G
 
D
A
 
S
S
 
G
F
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
V
L
 
L
P
 
Y
I
 
V
D
 
C
N
 
G
G
 
G

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:248/252 of query aligns to 2:252/256 of Q48436

query
sites
Q48436
N
 
K
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
A
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
|
G
R
x
K
D
x
A
F
x
I
A
|
A
L
|
L
R
|
R
F
x
L
A
x
V
T
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
V
x
A
I
x
V
T
x
A
V
x
I
S
x
A
D
|
D
I
 
Y
D
 
N
E
 
D
S
 
A
G
 
T
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
N
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
H
 
M
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
V
D
|
D
V
 
V
T
 
S
V
 
D
E
 
R
A
 
D
D
 
Q
V
 
V
A
 
F
R
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
V
 
R
A
 
K
A
 
T
M
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
C
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
A
T
 
P
I
 
S
K
 
T
P
 
P
V
 
I
T
 
E
D
 
S
I
 
I
S
 
T
E
 
P
A
 
E
E
 
I
W
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
V
M
 
Y
A
 
N
I
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
I
F
 
W
G
 
G
C
 
I
K
 
Q
H
 
A
A
 
A
F
 
V
P
 
E
H
 
A
L
 
F
-
 
K
A
 
K
E
 
E
T
 
G
H
 
H
-
 
G
G
 
G
N
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
L
 
A
A
 
C
S
 
S
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
H
I
 
V
G
 
G
W
 
N
P
 
P
L
 
E
L
 
L
S
 
A
L
 
V
Y
 
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
S
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
Q
 
G
M
 
L
S
 
T
K
 
Q
A
 
T
L
 
A
S
 
A
Q
 
R
E
 
D
F
 
L
R
 
A
E
 
P
A
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
Y
C
 
C
P
 
P
M
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
K
T
 
T
D
 
P
M
 
M
G
 
W
S
 
A
R
 
E
F
 
I
K
 
D
D
 
R
T
 
Q
Y
 
V
E
 
S
K
 
E
E
 
A
Y
 
A
G
 
G
V
 
K
P
 
P
-
 
L
-
 
G
A
 
Y
G
 
G
D
 
T
M
 
A
L
 
E
D
 
F
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
-
 
I
-
 
T
-
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
S
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
C
A
 
V
V
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
G
 
D
A
 
S
S
 
D
F
 
Y
V
 
M
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
S
L
 
L
P
 
L
I
 
I
D
 
D
N
 
G
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
36% identity, 98% coverage: 3:248/252 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
T
 
Q
N
 
N
K
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
A
 
S
G
 
G
L
x
M
G
 
G
R
 
K
D
 
Q
F
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
V
V
 
I
S
 
N
D
|
D
I
|
I
D
 
D
E
 
A
S
 
E
G
 
K
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
V
 
T
A
 
V
A
 
D
E
 
E
I
 
F
K
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
A
 
V
H
 
L
A
 
G
L
 
A
R
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
T
 
G
V
 
N
E
 
K
A
 
A
D
 
A
V
 
V
A
 
D
R
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
K
D
 
Q
A
 
T
V
 
I
A
 
D
A
 
A
M
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
C
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
E
 
E
T
 
R
I
 
A
K
 
G
P
 
A
V
 
L
T
 
R
D
 
K
I
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
V
L
 
T
M
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
F
 
L
G
 
C
C
 
T
K
 
Q
H
 
A
A
 
V
F
 
H
P
 
G
H
 
H
L
 
M
A
 
V
E
 
E
T
 
N
-
 
K
H
 
H
G
 
G
N
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
L
x
I
A
 
A
S
|
S
A
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
L
I
 
-
G
 
G
W
 
G
P
 
A
L
 
G
L
 
Q
S
 
T
L
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
G
M
 
M
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
I
E
 
E
F
 
L
R
 
G
E
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
C
 
A
P
 
P
M
 
G
V
 
L
I
|
I
A
 
H
T
 
T
D
 
P
M
 
M
G
 
-
S
 
-
R
 
-
F
 
W
K
 
D
D
 
E
T
 
L
Y
 
P
E
 
E
K
 
K
E
 
D
Y
 
Q
G
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
Q
M
 
F
L
 
L
D
 
L
A
 
S
R
 
R
Q
 
Q
-
 
P
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
I
T
 
A
A
 
N
A
 
T
A
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
G
 
D
A
 
S
S
 
G
F
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
V
L
 
L
P
 
Y
I
 
V
D
 
C
N
 
G
G
 
G

Query Sequence

>WP_043769901.1 NCBI__GCF_000733765.1:WP_043769901.1
MQLTNKRVLITGAAAGLGRDFALRFATEGAVITVSDIDESGAQAVAAEIKAAGGQAHALR
ADVTVEADVARLVADAVAAMGGLDCLINNAGIETIKPVTDISEAEWDRLMAINVKGVFFG
CKHAFPHLAETHGNIINLASAAGLIGWPLLSLYCASKGAVIQMSKALSQEFREAGVRVNA
LCPMVIATDMGSRFKDTYEKEYGVPAGDMLDARQGRLGRPEEVTAAAVFLASDGASFVNG
VALPIDNGGTAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory