SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_043920076.1 NCBI__GCF_000877395.1:WP_043920076.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ebuA Crystal structure of a sugar kinase (target efi-502312) from oceanicola granulosus, with bound amp/adp crystal form i
49% identity, 98% coverage: 5:294/295 of query aligns to 17:306/306 of 4ebuA

query
sites
4ebuA
V
 
I
L
 
L
S
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
C
 
C
M
 
M
V
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
D
C
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
T
F
 
Y
R
 
R
R
 
L
A
 
G
F
 
F
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
M
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
-
L
 
L
S
 
R
R
 
P
D
 
E
I
 
S
P
 
R
V
 
I
H
 
S
Y
 
Y
H
 
F
T
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
L
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
M
 
M
V
 
R
R
 
A
F
 
A
I
 
M
E
 
S
D
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
T
 
G
G
 
G
S
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
V
D
 
I
T
 
P
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
L
I
 
I
H
 
T
L
 
L
S
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
R
S
 
S
F
 
F
T
 
A
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
D
 
G
G
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
D
P
 
A
L
 
D
N
 
A
P
 
L
P
 
A
G
 
A
Q
 
A
R
 
M
P
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
D
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
D
S
 
Q
P
 
C
D
 
G
R
 
R
T
 
A
S
 
T
L
 
L
M
 
L
E
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
L
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
A
 
R
V
 
T
I
 
I
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
L
R
 
R
P
 
P
R
 
R
L
 
L
W
 
W
E
 
A
D
 
G
A
 
T
D
 
G
I
 
E
A
 
M
C
 
T
K
 
E
T
 
T
I
 
I
T
 
M
A
 
Q
M
 
G
A
 
A
D
 
A
E
 
V
S
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
P
 
P
S
|
S
F
 
F
D
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
W
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
D
 
G
P
 
P
S
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
A
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
A
P
 
G
C
 
V
-
 
R
-
 
S
V
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
N
 
N
G
|
G
P
 
P
E
 
H
A
 
A
I
 
V
T
 
H
I
 
F
R
 
L
S
 
Q
D
 
D
G
 
G
E
 
R
I
 
R
S
 
G
T
 
R
R
 
V
P
 
P
A
 
V
H
 
P
V
 
P
T
x
V
Q
 
A
K
 
Q
I
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
|
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
|
F
N
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
S
Y
 
V
I
 
L
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
V
 
L
T
 
E
S
 
T
C
 
A
V
 
I
E
 
A
E
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
|
A
A
 
G
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
Q
Q
 
G
H
 
K
G
 
G
G
 
A
L
 
L
C
 
V
D
 
E
V
 
V

4eumA Crystal structure of a sugar kinase (target efi-502132) from oceanicola granulosus with bound amp, crystal form ii
49% identity, 95% coverage: 5:285/295 of query aligns to 17:293/294 of 4eumA

query
sites
4eumA
V
 
I
L
 
L
S
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
C
 
C
M
 
M
V
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
D
C
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
T
F
 
Y
R
 
R
R
 
L
A
 
G
F
 
F
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
M
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
-
L
 
L
S
 
R
R
 
P
D
 
E
I
 
S
P
 
R
V
 
I
H
 
S
Y
 
Y
H
 
F
T
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
L
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
M
 
M
V
 
R
R
 
A
F
 
A
I
 
M
E
 
S
D
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
T
 
G
G
 
G
S
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
V
D
 
I
T
 
P
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
L
I
 
I
H
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
F
 
F
T
 
A
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
D
 
G
G
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
D
P
 
A
L
 
D
N
 
A
P
 
L
P
 
A
G
 
A
Q
 
A
R
 
M
P
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
D
L
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
D
S
 
Q
P
 
C
D
 
G
R
 
R
T
 
A
S
 
T
L
 
L
M
 
L
E
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
L
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
T
G
 
G
A
 
R
V
 
T
I
 
I
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
L
R
 
R
P
 
P
R
 
R
L
 
L
W
 
W
E
 
A
D
 
G
A
 
T
D
 
G
I
 
E
A
 
M
C
 
T
K
 
E
T
 
T
I
 
I
T
 
M
A
 
Q
M
 
G
A
 
A
D
 
A
E
 
V
S
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
P
 
P
S
 
S
F
 
F
D
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
W
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
D
 
G
P
 
P
S
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
A
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
A
P
 
G
C
 
V
-
 
R
-
 
S
V
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
N
 
N
G
|
G
P
 
P
E
 
H
A
 
A
I
 
V
T
 
H
I
 
F
R
 
L
S
 
Q
D
 
D
G
 
G
E
 
R
I
 
R
S
 
G
T
 
R
R
 
V
P
 
P
A
x
V
H
 
P
V
 
P
T
 
V
Q
 
A
K
 
Q
I
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
|
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
 
F
N
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
S
Y
 
V
I
 
L
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
V
 
L
T
 
E
S
 
T
C
 
A
V
 
I
E
 
A
E
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
|
A
A
 
G
R
 
Q
V
 
V
V
 
V

Q97U29 2-dehydro-3-deoxygluconokinase/2-dehydro-3-deoxygalactonokinase; 2-dehydro-3-deoxyglucono/galactono-kinase; 2-keto-3-deoxy-galactonokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; KDGal kinase; EC 2.7.1.178 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
25% identity, 98% coverage: 1:289/295 of query aligns to 1:293/313 of Q97U29

query
sites
Q97U29
M
 
M
I
 
V
D
 
D
G
 
-
V
 
V
L
 
I
S
 
A
I
 
L
G
 
G
E
 
E
C
 
P
M
 
L
V
 
I
E
 
Q
F
 
F
-
 
N
-
 
S
-
 
F
-
 
N
-
 
P
G
 
G
P
 
P
A
 
L
E
 
R
C
 
F
P
 
V
G
 
N
L
 
Y
F
 
F
R
 
E
R
 
K
A
 
H
F
 
V
A
 
A
G
|
G
D
x
S
T
x
E
F
x
L
N
|
N
T
 
F
A
 
C
W
 
I
-
 
A
Y
 
V
M
 
V
R
 
R
R
 
N
R
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
C
D
 
S
I
 
L
P
 
I
V
 
A
H
 
R
Y
 
-
H
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
G
T
 
N
D
 
D
A
 
E
I
 
F
S
 
G
D
 
K
A
 
N
M
 
I
V
 
I
R
 
E
F
 
Y
I
 
S
E
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
D
T
 
T
G
 
S
S
 
H
I
 
I
A
 
K
R
 
V
D
 
D
T
 
N
G
 
E
R
 
S
T
 
F
I
 
T
G
 
G
L
 
I
Y
|
Y
T
 
F
I
 
I
H
 
Q
L
 
R
S
 
G
-
 
Y
-
 
P
-
 
I
D
 
P
G
 
M
E
 
K
R
 
S
S
 
E
F
 
L
T
 
V
Y
|
Y
W
x
Y
R
|
R
D
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
R
 
S
L
 
R
L
 
L
A
 
S
G
 
P
H
 
E
P
 
D
L
 
I
N
 
N
P
 
E
P
 
N
G
 
Y
Q
 
V
R
 
R
P
 
N
-
 
S
-
 
R
L
 
L
V
 
V
Y
 
H
L
 
S
S
 
T
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
-
S
 
S
S
 
D
P
 
N
D
 
A
R
 
K
T
 
E
S
 
A
L
 
V
M
 
I
E
 
K
G
 
A
L
 
F
A
 
E
E
 
L
L
 
A
R
 
K
A
 
S
Q
 
R
G
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
T
N
|
N
I
|
I
R
|
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
W
 
W
E
 
S
D
 
S
A
 
L
D
 
E
I
 
K
A
 
A
C
 
K
K
 
E
T
 
T
I
 
I
T
 
L
A
 
S
M
 
I
A
 
L
D
 
K
E
 
K
S
 
Y
D
 
D
I
 
I
-
 
E
-
 
V
V
 
L
L
 
I
P
 
T
S
 
D
F
 
P
D
 
D
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
I
A
 
L
F
 
L
G
 
D
D
 
V
A
 
T
D
 
D
P
 
P
S
 
D
A
 
E
T
 
A
L
 
Y
E
 
R
R
 
K
Y
 
Y
A
 
K
-
 
E
-
 
L
A
 
G
A
 
V
P
 
K
C
 
V
V
 
L
I
 
L
V
 
Y
K
|
K
N
x
L
G
|
G
P
x
S
E
x
K
A
x
G
I
 
A
T
 
I
I
 
A
R
 
Y
S
 
K
D
 
D
G
 
N
E
 
V
I
 
K
S
 
A
T
 
F
R
 
K
P
 
D
A
 
A
H
 
Y
V
 
K
T
 
V
Q
 
P
K
 
-
I
 
V
V
 
E
D
 
D
T
 
P
T
 
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
M
N
 
A
A
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
V
A
 
S
A
 
L
Y
 
Y
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
E
 
K
P
 
D
V
 
I
T
 
E
S
 
Y
C
 
S
V
 
L
E
 
A
E
 
H
G
 
G
A
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
S
A
 
T
R
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
T
Q
 
V
H
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2varA Crystal structure of sulfolobus solfataricus 2-keto-3-deoxygluconate kinase complexed with 2-keto-3-deoxygluconate (see paper)
25% identity, 97% coverage: 5:289/295 of query aligns to 3:292/311 of 2varA

query
sites
2varA
V
 
V
L
 
I
S
 
A
I
 
L
G
 
G
E
 
E
C
 
P
M
x
L
V
 
I
E
 
Q
F
 
F
-
 
N
-
 
S
-
 
F
-
 
N
-
 
P
G
 
G
P
 
P
A
 
L
E
 
R
C
 
F
P
 
V
G
 
N
L
 
Y
F
 
F
R
 
E
R
 
K
A
 
H
F
 
V
A
 
A
G
|
G
D
x
S
T
 
E
F
 
L
N
 
N
T
 
F
A
 
C
W
 
I
-
 
A
Y
 
V
M
 
V
R
 
R
R
 
N
R
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
C
D
 
S
I
 
L
P
 
I
V
 
A
H
 
R
Y
 
-
H
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
G
T
 
N
D
 
D
A
 
E
I
 
F
S
 
G
D
 
K
A
 
N
M
 
I
V
 
I
R
 
E
F
 
Y
I
 
S
E
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
D
T
 
T
G
 
S
S
 
H
I
 
I
A
 
K
R
 
V
D
 
D
T
 
N
G
 
E
R
 
S
T
 
F
I
 
T
G
 
G
L
 
I
Y
|
Y
T
 
F
I
 
I
H
 
Q
L
 
R
S
 
G
-
 
Y
-
 
P
-
 
I
D
 
P
G
 
M
E
 
K
R
 
S
S
 
E
F
x
L
T
 
V
Y
|
Y
W
 
Y
R
|
R
D
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
R
 
S
L
 
R
L
 
L
A
 
S
G
 
P
H
 
E
P
 
D
L
 
I
N
 
N
P
 
E
P
 
N
G
 
Y
Q
 
V
R
 
R
P
 
N
-
 
S
-
 
R
L
 
L
V
 
V
Y
 
H
L
 
S
S
 
T
G
 
G
I
|
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
-
S
 
S
S
 
D
P
 
N
D
 
A
R
 
K
T
 
E
S
 
A
L
 
V
M
 
I
E
 
K
G
 
A
L
 
F
A
 
E
E
 
L
L
 
A
R
 
K
A
 
S
Q
 
R
G
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
T
N
 
N
I
 
I
R
|
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
W
 
W
E
 
S
D
 
S
A
 
L
D
 
E
I
 
K
A
 
A
C
 
K
K
 
E
T
 
T
I
 
I
T
 
L
A
 
S
M
 
I
A
 
L
D
 
K
E
 
K
S
 
Y
D
 
D
I
 
I
-
 
E
-
 
V
V
 
L
L
 
I
P
 
T
S
 
D
F
 
P
D
 
D
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
I
A
 
L
F
 
L
G
 
D
D
 
V
A
 
T
D
 
D
P
 
P
S
 
D
A
 
E
T
 
A
L
 
Y
E
 
R
R
 
K
Y
 
Y
A
 
K
-
 
E
-
 
L
A
 
G
A
 
V
P
 
K
C
 
V
V
 
L
I
 
L
V
 
Y
K
|
K
N
 
L
G
|
G
P
x
S
E
 
K
A
x
G
I
 
A
T
 
I
I
 
A
R
 
Y
S
 
K
D
 
D
G
 
N
E
 
V
I
 
K
S
 
A
T
 
F
R
 
K
P
 
D
A
 
A
H
 
Y
V
 
K
T
 
V
Q
 
P
K
 
-
I
 
V
V
 
E
D
 
D
T
 
P
T
|
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
x
M
N
 
A
A
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
V
A
 
S
A
 
L
Y
 
Y
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
E
 
K
P
 
D
V
 
I
T
 
E
S
 
Y
C
 
S
V
 
L
E
 
A
E
 
H
G
 
G
A
x
I
A
 
A
L
 
A
A
x
S
A
 
T
R
 
L
V
 
V
V
x
I
G
 
T
Q
 
V
H
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
28% identity, 70% coverage: 55:261/295 of query aligns to 53:259/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
V
 
L
G
 
G
T
 
D
D
 
D
A
 
D
I
 
A
S
 
G
D
 
R
A
 
F
M
 
L
V
 
R
R
 
Q
F
 
V
I
 
F
E
 
Q
D
 
D
A
 
N
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
V
G
 
T
S
 
F
I
 
L
A
 
R
R
 
L
D
 
D
T
 
A
G
 
D
R
 
L
T
 
T
I
 
S
G
 
A
L
 
V
Y
 
L
T
 
I
I
 
V
H
 
N
L
 
L
S
 
T
-
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
|
Y
W
 
L
R
 
V
D
 
H
G
 
P
S
 
G
A
 
A
A
 
D
R
 
T
L
 
Y
L
 
V
A
 
S
G
 
P
H
 
Q
P
 
D
L
 
L
N
 
P
P
 
P
P
 
F
G
 
R
Q
 
Q
R
 
Y
P
 
E
L
 
W
V
 
F
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
G
 
S
I
 
I
T
 
G
L
 
L
A
 
T
I
 
-
L
 
-
S
 
D
S
 
R
P
 
P
D
 
A
R
 
R
T
 
E
S
 
A
L
 
C
M
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
A
A
 
R
E
 
R
L
 
M
R
 
R
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
A
 
G
V
 
Y
I
 
V
A
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
L
R
|
R
P
 
S
R
 
K
L
 
M
W
 
W
E
 
G
D
 
N
A
 
T
D
 
D
I
 
E
A
 
I
C
 
P
K
 
E
T
 
L
I
 
I
T
 
A
A
 
R
M
 
S
A
|
A
D
x
A
E
 
L
S
x
A
D
 
S
I
 
I
V
 
C
L
 
K
P
 
V
S
 
S
F
 
A
D
 
D
D
 
E
E
 
L
A
 
C
A
 
Q
A
 
L
F
 
S
G
 
G
D
 
A
A
 
S
-
 
H
-
 
W
-
 
Q
D
 
D
P
 
A
S
 
R
A
 
Y
T
 
Y
L
 
L
E
 
R
R
 
D
Y
 
L
A
x
G
A
 
C
A
 
D
P
 
T
C
 
T
V
 
I
I
 
I
V
 
S
K
 
L
N
 
G
G
 
A
P
 
D
E
 
G
A
 
A
I
 
L
T
 
L
I
 
I
R
 
T
S
 
A
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
S
 
H
T
 
F
R
 
P
P
 
A
A
 
P
H
 
R
V
 
V
T
 
-
Q
 
-
K
 
D
I
 
V
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
|
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3in1A Crystal structure of a putative ribokinase in complex with adp from e.Coli
27% identity, 86% coverage: 30:282/295 of query aligns to 40:286/312 of 3in1A

query
sites
3in1A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
 
I
N
 
N
T
 
E
A
 
A
W
 
T
Y
 
I
M
 
I
R
 
S
R
 
R
R
 
L
L
 
G
S
 
H
R
 
R
D
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
T
H
 
A
Y
 
L
H
 
M
T
 
S
A
 
R
V
 
I
G
 
G
T
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
A
S
 
G
D
 
Q
A
 
F
M
 
I
V
 
L
R
 
D
F
 
H
I
 
C
E
 
R
D
 
K
A
 
E
G
 
N
I
 
I
E
 
D
T
 
I
G
 
Q
S
 
S
I
 
L
A
 
K
R
 
Q
D
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
I
-
 
D
T
 
T
G
 
S
R
 
I
T
 
N
I
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
T
 
T
I
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
T
F
 
F
T
 
V
Y
 
T
W
 
N
R
 
R
D
 
N
G
 
G
S
 
S
A
 
L
A
 
W
R
 
K
L
 
L
-
 
N
L
 
I
A
 
D
G
 
D
H
 
V
P
 
D
L
 
F
N
 
A
P
 
R
P
 
F
G
 
S
Q
 
Q
R
 
A
P
 
K
L
 
L
V
 
L
Y
 
S
L
 
L
S
 
A
G
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
S
I
 
I
L
 
F
S
 
N
S
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
L
D
 
D
R
 
G
T
 
K
S
 
A
L
 
L
M
 
T
E
 
E
G
 
I
L
 
F
A
 
T
E
 
Q
L
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
G
 
Q
A
 
M
V
 
I
I
 
I
A
 
C
F
 
A
D
 
D
P
 
M
N
 
-
I
 
I
R
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
W
 
N
E
 
E
D
 
T
A
 
L
D
 
D
I
 
D
A
 
I
C
 
C
K
 
E
T
 
A
I
 
L
T
 
S
A
 
Y
M
 
V
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
D
I
 
Y
V
 
L
L
 
F
P
 
P
S
x
N
F
 
F
D
 
A
D
 
E
E
 
A
A
 
K
A
 
L
A
 
L
F
 
T
G
 
G
D
 
K
A
 
E
D
 
T
P
 
L
S
 
D
A
 
E
T
 
I
L
 
A
E
 
D
R
 
C
Y
 
F
A
 
L
A
 
A
-
 
C
-
 
G
A
 
V
P
 
K
C
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
N
 
T
G
|
G
P
 
K
E
 
D
A
x
G
I
 
C
T
 
F
I
 
I
R
 
K
S
 
R
D
 
G
G
 
D
E
 
M
I
 
T
S
 
M
T
 
K
R
 
V
P
 
P
A
|
A
H
 
V
V
 
A
T
 
G
Q
 
I
K
 
T
I
 
A
V
 
I
D
 
D
T
|
T
T
 
I
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
N
F
 
F
N
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
I
 
L
K
 
E
G
 
G
E
 
K
P
 
N
V
 
L
T
 
R
S
 
E
C
 
C
V
 
A
E
 
R
E
 
F
G
 
A
A
x
N
A
 
A
L
 
T
A
|
A
A
 
A

2dcnA Crystal structure of 2-keto-3-deoxygluconate kinase from sulfolobus tokodaii complexed with 2-keto-6-phosphogluconate (alpha-furanose form)
25% identity, 89% coverage: 5:267/295 of query aligns to 3:268/308 of 2dcnA

query
sites
2dcnA
V
 
L
L
 
I
S
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
E
C
 
I
M
 
L
V
 
I
E
 
E
F
 
F
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
G
 
G
P
 
P
A
 
L
E
 
R
C
 
H
P
 
V
G
 
S
L
 
Y
F
 
F
R
 
E
R
 
K
A
 
H
F
 
V
A
 
A
G
|
G
D
 
S
T
 
E
F
 
A
N
 
N
T
 
-
A
 
-
W
 
-
Y
 
Y
M
 
C
R
 
V
R
 
A
R
 
F
L
 
I
S
 
K
R
 
Q
D
 
G
I
 
N
P
 
E
V
 
C
H
 
G
Y
 
I
H
 
I
T
 
A
A
 
K
V
 
V
G
 
G
T
 
D
D
 
D
A
 
E
I
 
F
S
 
G
D
 
Y
A
 
N
M
 
A
V
 
I
R
 
E
F
 
W
I
 
L
E
 
R
D
 
G
A
 
Q
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
V
G
 
S
S
 
H
I
 
M
A
 
K
R
 
I
D
 
D
T
 
P
G
 
S
R
 
A
T
 
P
I
 
T
G
 
G
L
 
I
Y
x
F
T
 
F
I
 
I
-
 
Q
-
 
R
H
 
H
L
 
Y
S
 
P
D
 
V
G
 
P
E
 
L
R
 
K
S
 
S
F
 
E
T
 
S
-
 
I
Y
|
Y
W
 
Y
R
|
R
D
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
R
 
S
L
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
P
H
 
E
P
 
D
L
 
V
N
 
D
P
 
E
P
 
E
G
 
Y
Q
 
V
R
 
K
P
 
S
-
 
A
-
 
D
L
 
L
V
 
V
Y
 
H
L
 
S
S
 
S
G
 
G
I
|
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
S
S
 
S
S
 
T
P
 
A
D
 
K
R
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
Y
E
 
K
L
 
A
R
 
F
A
 
E
Q
 
I
G
 
A
A
 
S
V
 
N
I
 
R
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
T
N
 
N
I
 
I
R
|
R
P
 
L
R
 
K
L
 
L
W
 
W
E
 
-
D
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
E
A
 
A
C
 
K
K
 
R
T
 
E
I
 
I
T
 
L
A
 
K
M
 
L
A
 
L
D
 
S
E
 
K
S
 
F
D
 
H
I
 
L
-
 
K
-
 
F
V
 
L
L
 
I
P
 
T
S
x
D
F
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
S
A
 
K
A
 
I
A
 
I
F
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
S
D
 
D
P
 
P
S
 
D
A
 
K
T
 
A
L
 
A
E
 
K
R
 
A
Y
 
F
A
 
S
-
 
D
A
 
Y
A
 
A
P
 
E
C
 
I
V
 
I
I
 
V
V
 
M
K
|
K
N
 
L
G
|
G
P
|
P
E
 
K
A
x
G
I
 
A
T
 
I
I
 
V
R
 
Y
S
 
Y
D
 
D
G
 
G
E
 
K
I
 
K
S
 
Y
T
 
Y
R
 
S
P
 
S
A
 
G
H
 
Y
V
 
Q
T
 
V
Q
 
P
K
 
-
I
x
V
V
 
E
D
 
D
T
 
V
T
|
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
L
N
 
G
A
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
L
A
 
S
A
 
L
Y
 
Y
I
 
Y
K
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
28% identity, 97% coverage: 5:289/295 of query aligns to 4:286/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
V
 
V
L
 
V
S
 
T
I
 
A
G
 
G
E
 
E
C
 
P
M
x
L
V
 
V
E
 
A
F
 
L
G
 
V
P
 
P
A
 
Q
E
 
E
C
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
R
R
 
G
A
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
Y
F
 
V
A
 
G
G
|
G
D
x
A
T
 
E
F
 
V
N
|
N
T
 
V
A
 
A
W
 
V
Y
 
A
M
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
G
I
 
V
P
 
K
V
 
V
H
 
G
Y
 
F
H
 
V
T
 
G
A
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
E
D
 
D
A
 
E
I
 
L
S
 
G
D
 
A
A
 
M
M
 
V
V
 
E
R
 
E
F
 
R
I
 
L
E
 
R
D
 
A
A
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
L
G
 
T
S
 
H
I
 
F
A
 
R
R
 
R
D
 
A
T
 
P
G
 
G
R
 
F
T
 
T
I
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
|
Y
T
 
L
I
 
R
-
 
E
H
 
Y
L
 
L
S
 
P
D
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
G
S
 
R
F
 
V
T
 
F
Y
 
Y
W
 
Y
R
|
R
D
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
R
 
S
L
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
P
H
 
G
P
 
A
L
 
F
N
 
D
P
 
P
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
P
 
E
G
 
G
Q
 
V
R
 
R
P
 
-
L
 
F
V
 
L
Y
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
P
A
 
A
I
 
-
L
 
L
S
 
S
S
 
P
P
 
E
D
 
A
R
 
R
T
 
A
S
 
F
L
 
S
M
 
L
E
 
W
G
 
A
L
 
M
A
 
E
E
 
E
L
 
A
R
 
K
A
 
R
Q
 
R
G
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
A
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
Y
R
|
R
P
 
Q
R
 
T
L
 
L
W
 
W
E
 
S
D
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
A
A
 
R
C
 
G
K
 
F
T
 
L
I
 
E
T
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
P
D
 
G
E
 
-
S
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
L
L
 
F
P
 
L
S
 
S
F
 
E
D
 
E
D
 
E
E
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
R
A
 
V
D
 
E
P
 
E
S
 
A
A
 
L
T
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
R
Y
 
A
A
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
P
C
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
L
K
|
K
N
 
R
G
|
G
P
x
A
E
 
K
A
 
G
I
 
A
T
 
W
I
 
A
R
 
F
S
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
R
I
 
R
S
 
V
T
 
E
R
 
G
P
 
S
A
 
A
H
 
F
V
 
A
T
 
V
Q
 
E
K
 
A
I
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
N
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
A
 
G
Y
 
A
I
 
V
K
 
W
G
 
G
E
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
E
S
 
E
C
 
R
V
 
L
E
 
R
E
 
L
G
 
A
A
x
N
A
 
L
L
 
L
A
 
G
A
|
A
R
 
S
V
 
V
V
 
A
G
 
A
Q
 
S
H
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
28% identity, 97% coverage: 5:289/295 of query aligns to 4:286/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
V
 
V
L
 
V
S
 
T
I
 
A
G
 
G
E
 
E
C
 
P
M
 
L
V
 
V
E
 
A
F
 
L
G
 
V
P
 
P
A
 
Q
E
 
E
C
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
R
R
 
G
A
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
Y
F
 
V
A
 
G
G
|
G
D
x
A
T
x
E
F
x
V
N
|
N
T
 
V
A
 
A
W
 
V
Y
 
A
M
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
G
I
 
V
P
 
K
V
 
V
H
 
G
Y
 
F
H
 
V
T
 
G
A
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
E
D
 
D
A
 
E
I
 
L
S
 
G
D
 
A
A
 
M
M
 
V
V
 
E
R
 
E
F
 
R
I
 
L
E
 
R
D
 
A
A
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
L
G
 
T
S
 
H
I
 
F
A
 
R
R
 
R
D
 
A
T
 
P
G
 
G
R
 
F
T
 
T
I
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
L
I
 
R
-
 
E
H
 
Y
L
 
L
S
 
P
D
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
G
S
 
R
F
 
V
T
 
F
Y
|
Y
W
x
Y
R
|
R
D
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
R
 
S
L
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
P
H
 
G
P
 
A
L
 
F
N
 
D
P
 
P
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
P
 
E
G
 
G
Q
 
V
R
 
R
P
 
-
L
 
F
V
 
L
Y
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
P
A
 
A
I
 
-
L
 
L
S
 
S
S
 
P
P
 
E
D
 
A
R
 
R
T
 
A
S
 
F
L
 
S
M
 
L
E
 
W
G
 
A
L
 
M
A
 
E
E
 
E
L
 
A
R
 
K
A
 
R
Q
 
R
G
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
A
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
Y
R
|
R
P
 
Q
R
 
T
L
 
L
W
 
W
E
 
S
D
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
A
A
 
R
C
 
G
K
 
F
T
 
L
I
 
E
T
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
P
D
 
G
E
 
-
S
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
L
L
 
F
P
 
L
S
|
S
F
 
E
D
 
E
D
 
E
E
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
R
A
 
V
D
 
E
P
 
E
S
 
A
A
 
L
T
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
R
Y
 
A
A
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
P
C
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
L
K
|
K
N
x
R
G
|
G
P
x
A
E
x
K
A
x
G
I
x
A
T
 
W
I
 
A
R
 
F
S
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
R
I
 
R
S
 
V
T
 
E
R
 
G
P
 
S
A
 
A
H
 
F
V
 
A
T
 
V
Q
 
E
K
 
A
I
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
N
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
A
 
G
Y
 
A
I
 
V
K
 
W
G
 
G
E
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
E
S
 
E
C
 
R
V
 
L
E
 
R
E
 
L
G
 
A
A
x
N
A
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
V
V
 
A
G
 
A
Q
 
S
H
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
28% identity, 97% coverage: 5:289/295 of query aligns to 4:286/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
V
 
V
L
 
V
S
 
T
I
 
A
G
 
G
E
 
E
C
 
P
M
 
L
V
 
V
E
 
A
F
 
L
G
 
V
P
 
P
A
 
Q
E
 
E
C
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
R
R
 
G
A
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
Y
F
 
V
A
 
G
G
 
G
D
 
A
T
 
E
F
 
V
N
 
N
T
 
V
A
 
A
W
 
V
Y
 
A
M
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
G
I
 
V
P
 
K
V
 
V
H
 
G
Y
 
F
H
 
V
T
 
G
A
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
E
D
 
D
A
 
E
I
 
L
S
 
G
D
 
A
A
 
M
M
 
V
V
 
E
R
 
E
F
 
R
I
 
L
E
 
R
D
 
A
A
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
L
G
 
T
S
 
H
I
 
F
A
 
R
R
 
R
D
 
A
T
 
P
G
 
G
R
 
F
T
 
T
I
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
L
I
 
R
-
 
E
H
 
Y
L
 
L
S
 
P
D
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
G
S
 
R
F
 
V
T
 
F
Y
 
Y
W
 
Y
R
 
R
D
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
R
 
S
L
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
P
H
 
G
P
 
A
L
 
F
N
 
D
P
 
P
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
P
 
E
G
 
G
Q
 
V
R
 
R
P
 
-
L
 
F
V
 
L
Y
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
P
A
 
A
I
 
-
L
 
L
S
 
S
S
 
P
P
 
E
D
 
A
R
 
R
T
 
A
S
 
F
L
 
S
M
 
L
E
 
W
G
 
A
L
 
M
A
 
E
E
 
E
L
 
A
R
 
K
A
 
R
Q
 
R
G
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
A
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
Y
R
 
R
P
 
Q
R
 
T
L
 
L
W
 
W
E
 
S
D
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
A
A
 
R
C
 
G
K
 
F
T
 
L
I
 
E
T
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
P
D
 
G
E
 
-
S
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
L
L
 
F
P
 
L
S
 
S
F
 
E
D
 
E
D
 
E
E
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
R
A
 
V
D
 
E
P
 
E
S
 
A
A
 
L
T
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
R
Y
 
A
A
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
P
C
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
L
K
|
K
N
 
R
G
|
G
P
 
A
E
 
K
A
 
G
I
 
A
T
 
W
I
 
A
R
 
F
S
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
R
I
 
R
S
 
V
T
 
E
R
 
G
P
 
S
A
|
A
H
x
F
V
 
A
T
x
V
Q
 
E
K
 
A
I
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
N
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
A
 
G
Y
 
A
I
 
V
K
 
W
G
 
G
E
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
E
S
 
E
C
 
R
V
 
L
E
 
R
E
 
L
G
 
A
A
x
N
A
 
L
L
 
L
A
 
G
A
|
A
R
 
S
V
 
V
V
 
A
G
 
A
Q
 
S
H
 
R
G
 
G

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
28% identity, 87% coverage: 6:261/295 of query aligns to 5:237/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
L
 
L
S
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
C
 
A
M
 
L
V
 
I
E
 
D
F
 
I
G
 
V
P
 
D
A
 
G
E
 
P
C
 
D
P
 
P
G
 
A
L
 
E
F
 
Y
R
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
V
A
 
G
G
 
G
D
 
S
T
 
P
F
 
L
N
 
N
T
 
V
A
 
A
W
 
V
Y
 
G
M
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
-
L
 
L
S
 
G
R
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
D
V
 
L
H
 
L
Y
 
T
H
 
H
T
 
-
A
 
-
V
 
I
G
 
G
T
x
R
D
 
D
A
 
A
I
 
R
S
 
G
D
 
R
A
 
R
M
 
I
V
 
A
R
 
E
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
D
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
Q
T
 
L
G
 
V
S
|
S
I
x
G
A
 
S
R
 
Q
D
 
T
T
 
A
G
 
D
R
 
R
T
 
T
I
 
P
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
T
D
 
A
G
 
T
E
 
A
R
 
R
S
 
T
F
 
Y
T
 
A
Y
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
E
W
 
W
R
 
Q
D
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
H
 
I
P
 
P
L
 
D
N
 
T
P
 
P
P
 
P
G
 
V
Q
 
A
R
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Y
 
V
L
 
H
S
 
T
G
 
G
I
 
-
T
 
S
L
 
I
A
 
A
I
 
A
L
 
A
S
 
R
S
 
E
P
 
P
D
 
G
R
 
C
T
 
L
S
 
A
L
 
V
M
 
A
E
 
A
G
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
A
L
 
Y
R
 
R
A
 
A
Q
 
-
G
 
A
A
 
A
V
 
T
I
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
V
R
 
R
P
 
P
R
 
S
L
 
L
W
 
S
E
 
A
D
 
D
A
 
P
D
 
D
I
 
L
A
 
T
C
 
R
K
 
R
T
 
R
I
 
I
T
 
Q
A
 
R
M
 
L
A
 
V
D
 
E
E
 
R
S
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
I
L
 
K
P
 
A
S
 
S
F
 
A
D
 
E
D
 
D
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
L
G
 
H
D
 
W
A
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
T
A
 
Q
T
 
P
L
 
P
E
 
E
R
 
Q
Y
 
T
A
 
A
A
 
R
A
 
A
P
 
-
C
 
-
V
 
-
I
 
W
V
 
L
K
 
A
N
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
A
-
 
I
-
 
V
A
 
A
I
 
L
T
 
T
I
 
L
R
 
G
S
 
D
D
 
Q
G
 
G
E
 
A
I
 
V
-
 
A
-
 
F
-
 
C
S
 
A
T
 
A
R
 
G
P
 
P
A
 
A
H
 
S
V
 
V
-
 
P
T
 
A
Q
 
Q
K
 
P
I
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
V
A
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
F
 
F
N
 
M
A
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
L

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
25% identity, 70% coverage: 55:261/295 of query aligns to 50:256/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
V
 
V
G
 
G
T
 
N
D
 
D
A
 
P
I
 
F
S
 
G
D
 
R
A
 
F
M
 
M
V
 
Q
R
 
Q
F
 
T
I
 
L
E
 
T
D
 
D
A
 
E
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
T
 
C
G
 
Q
S
 
H
I
 
L
A
 
H
R
 
F
D
 
D
T
 
P
G
 
V
R
 
H
T
 
R
I
 
T
G
 
S
L
 
T
Y
 
V
T
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
S
 
D
D
 
E
-
x
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
F
|
F
T
 
T
Y
x
F
W
 
M
R
 
V
D
 
K
G
 
P
S
 
S
A
 
A
A
 
D
R
 
Q
L
 
F
L
 
L
A
 
Q
G
 
L
H
 
S
P
 
D
L
 
I
N
 
-
P
 
-
P
 
P
G
 
S
Q
 
F
R
 
Q
P
 
K
L
 
G
V
 
E
Y
 
W
L
 
L
S
 
H
G
 
V
I
 
C
T
 
S
L
 
I
A
 
A
I
 
L
L
 
A
S
 
N
S
 
Q
P
 
P
D
 
S
R
 
R
T
 
S
S
 
S
L
 
T
M
 
F
E
 
A
G
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
R
 
K
A
 
E
Q
 
V
G
 
G
A
 
G
V
 
Y
I
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
L
R
|
R
P
 
E
R
 
E
L
 
V
W
 
W
E
 
S
D
 
E
A
 
P
D
 
Q
I
 
E
A
 
L
C
 
Q
K
 
A
T
 
T
I
 
V
T
 
M
A
 
R
M
 
A
A
 
V
D
 
G
E
 
L
S
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
-
P
 
-
S
 
K
F
 
F
D
 
S
D
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
L
A
 
Q
F
 
F
-
 
L
-
 
T
G
 
G
D
 
T
A
 
Q
D
 
S
P
 
I
S
 
E
A
 
E
T
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
F
A
 
Q
A
 
I
P
 
P
C
 
L
V
 
V
I
 
V
V
 
V
K
x
T
N
 
L
G
|
G
P
x
A
E
 
K
A
 
G
I
 
A
T
 
L
I
 
V
R
 
A
S
 
T
D
 
P
G
 
N
E
 
S
I
 
Q
S
 
Q
T
 
I
R
 
V
P
 
S
A
 
G
H
 
K
V
x
A
T
x
V
Q
 
-
K
 
K
I
 
P
V
 
I
D
 
D
T
|
T
T
 
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
25% identity, 88% coverage: 5:263/295 of query aligns to 8:264/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
V
 
I
L
 
L
S
 
C
I
 
C
G
 
G
E
 
E
C
 
A
M
 
L
V
 
I
E
 
D
F
 
M
G
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
E
C
 
T
P
 
T
G
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
T
L
 
A
F
 
F
R
 
Q
R
 
P
A
 
F
F
 
A
A
 
G
G
 
G
D
 
S
T
 
V
F
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
A
W
 
I
Y
 
A
M
 
L
R
 
G
R
 
R
R
 
L
L
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
T
H
 
G
Y
 
F
H
 
F
T
 
S
A
 
G
V
 
I
G
 
S
T
 
S
D
 
D
A
 
F
I
 
F
S
 
G
D
 
D
A
 
V
M
 
L
V
 
R
R
 
D
F
 
T
I
 
L
E
 
A
D
 
R
A
 
S
G
 
N
I
 
V
E
 
D
T
 
Y
G
 
-
S
 
S
I
 
F
A
 
A
R
 
A
D
 
I
T
 
S
G
 
N
R
 
R
T
 
P
I
 
T
G
 
T
L
 
L
Y
 
A
T
 
F
I
 
V
H
 
R
L
 
L
S
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
R
 
A
S
 
R
F
 
Y
T
 
A
Y
 
F
W
 
Y
R
 
D
D
 
E
G
 
N
S
 
T
A
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
M
L
 
L
A
 
S
G
 
R
H
 
N
P
 
D
L
 
M
N
 
P
P
 
Y
P
 
V
G
 
D
Q
 
E
R
 
T
P
 
I
L
 
S
V
 
A
Y
 
M
L
 
L
S
 
F
G
 
G
I
 
-
T
 
C
L
 
I
A
 
S
I
 
L
L
 
I
S
 
S
S
 
E
P
 
P
D
 
-
R
 
C
T
 
G
S
 
S
L
 
V
M
 
Y
E
 
E
G
 
T
L
 
L
A
 
L
E
 
A
L
 
R
R
 
E
A
 
A
Q
 
P
G
 
N
A
 
R
V
 
V
I
 
M
A
 
F
F
 
L
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
R
P
 
A
R
 
N
L
 
L
W
 
I
E
 
T
D
 
V
A
 
R
D
 
K
I
 
T
A
 
H
C
 
L
K
 
T
T
 
R
I
 
M
T
 
K
A
 
R
M
 
M
A
 
I
D
 
A
E
 
L
S
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
K
P
 
L
S
 
S
F
 
-
D
 
D
D
 
E
E
 
D
A
 
L
A
 
D
A
 
W
F
 
F
G
 
G
D
 
E
A
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
H
-
 
D
D
 
E
P
 
I
S
 
A
A
 
A
T
 
E
L
 
W
E
 
L
R
 
K
Y
 
L
A
 
G
A
 
P
A
 
K
P
 
L
C
 
V
V
 
V
I
 
I
V
x
T
K
 
K
N
x
G
G
x
A
P
 
H
E
x
G
A
 
A
I
 
V
T
 
A
I
 
Y
R
 
T
S
 
N
D
 
H
G
 
A
E
 
T
I
 
V
S
 
P
T
 
V
R
 
P
P
 
G
A
 
V
H
 
K
V
 
V
T
 
-
Q
 
-
K
 
D
I
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
V
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
x
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
24% identity, 97% coverage: 5:291/295 of query aligns to 5:304/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
V
 
I
L
 
L
S
 
C
I
 
F
G
 
G
E
 
E
C
 
A
M
 
L
V
 
I
E
 
D
F
 
M
G
 
L
P
 
A
A
 
Q
E
 
P
C
 
L
P
 
P
G
 
R
L
 
A
F
 
F
R
 
L
R
 
Q
A
 
C
F
 
-
A
 
A
G
 
G
D
 
G
T
 
A
F
 
P
N
 
A
T
 
N
A
 
V
W
 
A
Y
 
V
M
 
A
R
 
V
R
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
G
R
 
G
D
 
-
I
 
-
P
 
A
V
 
V
H
 
Q
Y
 
F
H
 
V
T
 
G
A
 
M
V
 
L
G
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
M
I
 
F
S
 
G
D
 
D
A
 
F
M
 
L
V
 
F
R
 
D
F
 
S
I
 
F
E
 
A
D
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
V
T
 
T
G
 
D
S
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
D
 
T
T
 
S
G
 
T
R
 
A
T
 
K
I
 
T
G
 
A
L
 
L
Y
 
A
T
 
F
I
 
V
H
 
A
L
 
L
S
 
-
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
F
 
F
T
 
S
Y
 
F
W
 
Y
R
 
R
D
 
P
G
 
P
S
 
A
A
 
A
A
 
D
R
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
R
G
 
V
H
 
E
P
 
H
L
 
F
N
 
Q
P
 
D
P
 
A
G
 
S
Q
 
F
R
 
S
P
 
D
L
 
A
V
 
L
Y
 
I
L
 
F
S
 
H
G
 
A
I
 
C
T
 
S
L
 
N
A
 
S
I
 
M
L
 
T
S
 
D
S
 
A
P
 
D
D
 
I
R
 
A
T
 
E
S
 
V
L
 
T
M
 
F
E
 
E
G
 
G
L
 
M
A
 
R
E
 
R
L
 
A
R
 
Q
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
L
N
 
N
I
 
F
R
 
R
P
 
P
R
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
P
D
 
N
A
 
G
D
 
E
I
 
N
A
 
P
C
 
A
K
 
S
T
 
R
I
 
L
T
 
W
A
 
K
M
 
G
A
 
L
D
 
S
E
 
L
S
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
K
P
 
L
S
 
S
F
 
S
D
 
E
-
 
E
-
 
L
D
 
D
E
 
Y
A
 
L
A
 
A
A
 
N
F
 
T
G
 
L
D
 
A
A
 
A
D
 
D
P
 
A
S
 
N
A
 
A
T
 
V
L
 
I
E
 
Q
R
 
Q
Y
 
L
-
 
W
-
 
Q
A
 
G
A
 
R
A
 
A
P
 
Q
C
 
L
V
 
L
I
 
L
V
 
V
K
x
T
N
x
D
-
 
A
-
 
A
G
 
G
P
 
P
E
 
V
A
 
H
I
 
W
T
 
Y
I
 
T
R
 
R
S
 
T
-
 
A
D
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
P
T
|
T
R
 
F
P
 
R
A
 
V
H
 
Q
V
 
V
T
 
Q
Q
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
D
T
 
S
T
 
N
A
|
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
L
A
 
Y
A
 
T
Y
 
F
I
 
A
K
 
Q
G
 
Q
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
C
-
 
H
-
 
D
-
 
P
E
 
E
P
 
S
V
 
I
T
 
V
S
 
S
C
 
T
V
 
L
E
 
R
E
 
F
G
 
A
A
|
A
A
 
A
L
 
V
A
 
G
A
 
A
R
 
L
V
 
A
V
 
V
G
 
T
Q
 
R
H
 
Q
G
 
G
G
 
A
L
 
F

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
25% identity, 70% coverage: 55:261/295 of query aligns to 54:260/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
V
 
V
G
 
G
T
 
N
D
 
D
A
 
P
I
 
F
S
 
G
D
 
R
A
 
F
M
 
M
V
 
Q
R
 
Q
F
 
T
I
 
L
E
 
T
D
 
D
A
 
E
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
T
 
C
G
 
Q
S
 
H
I
 
L
A
 
H
R
 
F
D
 
D
T
 
P
G
 
V
R
 
H
T
 
R
I
 
T
G
 
S
L
 
T
Y
 
V
T
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
S
 
D
D
 
E
-
 
C
G
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
S
F
|
F
T
 
T
Y
x
F
W
 
M
R
 
V
D
 
K
G
 
P
S
 
S
A
 
A
A
 
D
R
 
Q
L
 
F
L
 
L
A
 
Q
G
 
L
H
 
S
P
 
D
L
 
I
N
 
-
P
 
-
P
 
P
G
 
S
Q
 
F
R
 
Q
P
 
K
L
 
G
V
 
E
Y
 
W
L
 
L
S
 
H
G
 
V
I
 
C
T
 
S
L
 
I
A
 
A
I
 
L
L
 
A
S
 
N
S
 
Q
P
 
P
D
 
S
R
 
R
T
 
S
S
 
S
L
 
T
M
 
F
E
 
A
G
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
R
 
K
A
 
E
Q
 
V
G
 
G
A
 
G
V
 
Y
I
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
L
R
|
R
P
 
E
R
 
E
L
 
V
W
 
W
E
 
S
D
 
E
A
 
P
D
 
Q
I
 
E
A
 
L
C
 
Q
K
 
A
T
 
T
I
 
V
T
 
M
A
 
R
M
 
A
A
 
V
D
 
G
E
 
L
S
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
-
P
 
-
S
x
K
F
 
F
D
 
S
D
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
L
A
 
Q
F
 
F
-
 
L
-
 
T
G
 
G
D
 
T
A
 
Q
D
 
S
P
 
I
S
 
E
A
 
E
T
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
F
A
 
Q
A
 
I
P
 
P
C
 
L
V
 
V
I
 
V
V
 
V
K
x
T
N
 
L
G
|
G
P
 
A
E
 
K
A
 
G
I
 
A
T
 
L
I
 
V
R
 
A
S
 
T
D
 
P
G
 
N
E
 
S
I
 
Q
S
 
Q
T
 
I
R
 
V
P
 
S
A
 
G
H
 
K
V
x
A
T
x
V
Q
 
-
K
 
K
I
 
P
V
 
I
D
 
D
T
 
C
T
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
26% identity, 70% coverage: 55:261/295 of query aligns to 49:248/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
V
 
L
G
 
G
T
 
D
D
 
D
A
 
D
I
 
A
S
 
G
D
 
R
A
 
F
M
 
L
V
 
R
R
 
Q
F
 
V
I
 
F
E
 
Q
D
 
D
A
 
N
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
V
G
 
T
S
 
F
I
 
L
A
 
R
R
 
L
D
 
D
T
 
A
G
 
D
R
 
L
T
 
T
I
 
S
G
 
A
L
 
V
Y
x
L
T
 
I
I
 
V
H
 
N
L
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
S
F
|
F
T
 
T
Y
|
Y
W
 
L
R
 
V
D
 
H
G
 
P
S
 
G
A
 
A
A
 
D
R
 
T
L
 
Y
L
 
V
A
 
S
G
 
P
H
 
Q
P
 
D
L
 
L
N
 
P
P
 
P
P
 
F
G
 
R
Q
 
Q
R
 
Y
P
 
E
L
 
W
V
 
F
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
G
 
S
I
 
I
T
 
G
L
 
L
A
 
T
I
 
-
L
 
-
S
 
D
S
 
R
P
 
P
D
 
A
R
 
R
T
 
E
S
 
A
L
 
C
M
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
A
A
 
R
E
 
R
L
 
M
R
 
R
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
A
 
G
V
 
Y
I
 
V
A
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
L
R
|
R
P
 
S
R
 
K
L
x
M
W
 
W
E
 
G
D
 
N
A
 
T
D
 
D
I
 
E
A
 
I
C
 
P
K
 
E
T
 
L
I
 
I
T
 
A
A
 
R
M
 
S
A
 
A
D
 
A
E
 
L
S
 
A
D
 
S
I
 
I
V
 
C
L
 
K
P
 
V
S
 
S
F
 
A
D
 
D
D
 
E
E
 
L
A
 
C
A
 
Q
A
 
L
F
 
S
G
 
G
D
 
A
A
 
S
-
 
H
-
 
W
-
 
Q
D
 
D
P
 
A
S
 
R
A
 
Y
T
 
Y
L
 
L
E
 
R
R
 
D
Y
 
L
A
 
G
A
 
C
A
 
D
P
 
T
C
 
T
V
 
I
I
 
I
V
 
S
K
 
L
N
 
G
G
 
A
P
 
D
E
 
G
A
 
A
I
 
L
T
 
L
I
 
I
R
 
T
S
 
A
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
S
 
H
T
 
F
R
 
P
P
 
A
A
 
P
H
 
R
V
 
V
T
 
-
Q
 
-
K
 
D
I
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
26% identity, 70% coverage: 55:261/295 of query aligns to 49:248/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
V
 
L
G
 
G
T
 
D
D
 
D
A
 
D
I
 
A
S
 
G
D
 
R
A
 
F
M
 
L
V
 
R
R
 
Q
F
 
V
I
 
F
E
 
Q
D
 
D
A
 
N
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
V
G
 
T
S
 
F
I
 
L
A
 
R
R
 
L
D
 
D
T
 
A
G
 
D
R
 
L
T
 
T
I
 
S
G
 
A
L
 
V
Y
 
L
T
 
I
I
 
V
H
 
N
L
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
S
F
|
F
T
 
T
Y
|
Y
W
 
L
R
 
V
D
 
H
G
 
P
S
 
G
A
 
A
A
 
D
R
 
T
L
 
Y
L
 
V
A
 
S
G
 
P
H
 
Q
P
 
D
L
 
L
N
 
P
P
 
P
P
 
F
G
 
R
Q
 
Q
R
 
Y
P
 
E
L
 
W
V
 
F
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
G
 
S
I
 
I
T
 
G
L
 
L
A
 
T
I
 
-
L
 
-
S
 
D
S
 
R
P
 
P
D
 
A
R
 
R
T
 
E
S
 
A
L
 
C
M
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
A
A
 
R
E
 
R
L
 
M
R
 
R
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
A
 
G
V
 
Y
I
 
V
A
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
|
N
I
 
L
R
|
R
P
 
S
R
 
K
L
x
M
W
 
W
E
 
G
D
 
N
A
 
T
D
 
D
I
 
E
A
 
I
C
 
P
K
 
E
T
 
L
I
 
I
T
 
A
A
 
R
M
 
S
A
 
A
D
 
A
E
 
L
S
 
A
D
 
S
I
 
I
V
 
C
L
x
K
P
 
V
S
 
S
F
 
A
D
 
D
D
x
E
E
 
L
A
 
C
A
 
Q
A
 
L
F
 
S
G
 
G
D
 
A
A
 
S
-
 
H
-
 
W
-
 
Q
D
 
D
P
 
A
S
 
R
A
 
Y
T
 
Y
L
 
L
E
 
R
R
 
D
Y
 
L
A
 
G
A
 
C
A
 
D
P
 
T
C
 
T
V
 
I
I
 
I
V
x
S
K
 
L
N
x
G
G
x
A
P
 
D
E
x
G
A
 
A
I
 
L
T
 
L
I
 
I
R
 
T
S
 
A
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
S
 
H
T
 
F
R
 
P
P
 
A
A
 
P
H
 
R
V
 
V
T
 
-
Q
 
-
K
 
D
I
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
22% identity, 97% coverage: 5:289/295 of query aligns to 4:290/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
V
 
V
L
 
F
S
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
C
 
I
M
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
G
G
 
Q
P
 
P
A
 
F
E
 
D
C
 
Q
P
 
P
G
 
G
L
 
I
F
 
W
R
 
N
R
 
G
A
 
P
F
 
Y
A
 
P
G
 
S
D
 
G
T
 
A
F
 
-
N
 
-
T
 
P
A
 
A
W
 
I
Y
 
F
M
 
I
R
 
D
R
 
Q
R
 
V
L
 
T
S
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
C
H
 
G
Y
 
I
H
 
I
T
 
S
A
 
C
V
 
V
G
 
G
T
 
N
D
 
D
A
 
G
I
 
F
S
 
G
D
 
D
A
 
I
M
 
N
V
 
I
R
 
H
F
 
R
I
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
I
A
 
S
R
 
V
D
 
L
T
 
P
G
 
L
R
 
E
T
 
A
I
 
T
G
 
G
L
 
-
Y
 
-
T
 
S
I
 
A
H
 
F
L
 
V
S
 
T
D
 
Y
G
 
G
E
 
D
R
 
R
S
 
D
F
 
F
T
 
I
Y
 
F
W
 
N
R
 
I
D
 
K
G
 
N
S
 
A
A
 
A
A
 
C
R
 
G
L
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
A
H
 
Q
P
 
H
L
 
V
N
 
D
P
 
E
P
 
N
G
 
I
Q
 
L
R
 
K
P
 
D
L
 
C
V
 
T
Y
 
H
L
 
F
S
 
H
G
 
I
I
 
M
T
 
G
L
 
S
A
 
S
I
 
L
L
 
F
S
 
S
S
 
F
P
 
H
D
 
M
R
 
V
T
 
D
S
 
A
L
 
V
M
 
K
E
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
T
E
 
I
L
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
R
P
 
K
R
 
E
L
 
M
W
 
L
E
 
D
D
 
I
A
 
P
D
 
E
I
 
M
A
 
R
C
 
-
K
 
D
T
 
A
I
 
L
T
 
H
A
 
F
M
 
V
A
 
L
D
 
E
E
 
L
S
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
Y
L
 
M
P
 
P
S
|
S
F
 
-
D
 
E
D
 
G
E
 
E
A
 
V
A
 
L
A
 
L
F
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
S
P
 
P
S
 
H
A
 
S
T
 
T
L
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
G
P
 
F
C
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
K
|
K
N
 
R
G
|
G
P
 
N
E
 
Q
A
 
G
I
 
A
T
 
S
I
 
Y
R
 
Y
S
 
S
D
 
A
G
 
N
E
 
E
I
 
Q
S
 
F
T
 
H
R
 
V
P
 
E
A
 
S
H
 
Y
V
 
P
T
 
V
Q
 
E
K
x
E
I
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
C
F
|
F
N
 
G
A
 
G
G
 
A
F
 
W
L
 
I
A
 
A
A
 
C
Y
 
R
I
 
Q
K
 
L
G
 
G
E
 
F
P
 
D
V
 
A
T
 
H
S
 
R
C
 
A
V
 
L
E
 
Q
E
 
Y
G
 
A
A
x
N
A
 
A
L
 
C
A
x
G
A
 
A
R
 
L
V
 
A
V
 
V
G
 
T
Q
 
R
H
 
R
G
 
G

Q57849 Nucleoside kinase; NK; ATP-dependent nucleoside monophosphokinase; Cytidine kinase; Guanosine-inosine kinase; EC 2.7.1.213; EC 2.7.1.73 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see paper)
40% identity, 27% coverage: 209:289/295 of query aligns to 205:282/302 of Q57849

query
sites
Q57849
L
 
L
E
 
E
R
 
R
Y
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
-
P
 
-
C
 
-
V
 
L
I
 
I
V
 
V
K
x
T
N
x
K
G
|
G
P
x
S
E
x
K
A
x
G
I
 
S
T
 
V
I
 
I
R
 
Y
S
 
T
D
 
K
G
 
D
E
 
K
I
 
K
S
 
I
T
 
E
R
 
I
P
 
P
A
 
C
H
 
I
V
 
K
T
 
A
Q
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
I
D
 
D
T
 
P
T
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
S
F
 
Y
N
 
R
A
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
K
 
K
G
 
G
E
 
Y
P
 
D
V
 
L
T
 
E
S
 
K
C
 
C
V
 
G
E
 
L
E
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
S
R
 
F
V
 
V
V
 
V
G
 
E
Q
 
A
H
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2c49A Crystal structure of methanocaldococcus jannaschii nucleoside kinase - an archaeal member of the ribokinase family (see paper)
40% identity, 27% coverage: 209:289/295 of query aligns to 203:280/299 of 2c49A

query
sites
2c49A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
Y
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
-
P
 
-
C
 
-
V
 
L
I
 
I
V
 
V
K
x
T
N
 
K
G
|
G
P
 
S
E
 
K
A
x
G
I
 
S
T
 
V
I
 
I
R
 
Y
S
 
T
D
 
K
G
 
D
E
 
K
I
 
K
S
 
I
T
 
E
R
 
I
P
 
P
A
x
C
H
 
I
V
 
K
T
 
A
Q
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
I
D
 
D
T
 
P
T
|
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
 
Y
N
 
R
A
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
K
 
K
G
 
G
E
 
Y
P
 
D
V
 
L
T
 
E
S
 
K
C
 
C
V
 
G
E
 
L
E
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
T
A
|
A
A
 
S
R
 
F
V
 
V
V
 
V
G
 
E
Q
 
A
H
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_043920076.1 NCBI__GCF_000877395.1:WP_043920076.1
MIDGVLSIGECMVEFGPAECPGLFRRAFAGDTFNTAWYMRRRLSRDIPVHYHTAVGTDAI
SDAMVRFIEDAGIETGSIARDTGRTIGLYTIHLSDGERSFTYWRDGSAARLLAGHPLNPP
GQRPLVYLSGITLAILSSPDRTSLMEGLAELRAQGAVIAFDPNIRPRLWEDADIACKTIT
AMADESDIVLPSFDDEAAAFGDADPSATLERYAAAPCVIVKNGPEAITIRSDGEISTRPA
HVTQKIVDTTAAGDSFNAGFLAAYIKGEPVTSCVEEGAALAARVVGQHGGLCDVA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory