SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_043920531.1 NCBI__GCF_000877395.1:WP_043920531.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

O69315 Beta-galactosidase; Beta-gal; Lactase; EC 3.2.1.23 from Thermus thermophilus (see paper)
52% identity, 97% coverage: 5:625/642 of query aligns to 2:618/645 of O69315

query
sites
O69315
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
C
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
H
 
H
W
 
W
P
 
P
E
 
K
D
 
E
R
 
R
W
 
W
A
 
K
T
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
R
M
 
R
M
 
M
A
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
S
W
 
H
V
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
E
F
 
F
A
 
A
W
 
W
S
 
A
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
R
L
 
L
R
 
E
F
 
W
D
 
G
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
P
H
 
K
W
 
W
M
 
L
L
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
P
 
P
D
 
E
M
 
I
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
R
R
 
R
K
 
R
F
 
F
G
 
G
S
 
G
R
|
R
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
S
 
S
H
 
S
V
 
P
P
 
V
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
R
M
 
I
A
 
V
R
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
P
 
G
D
 
G
V
 
L
D
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
G
W
 
F
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
|
N
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
H
 
H
D
 
D
T
 
T
I
 
V
L
 
R
S
 
C
W
 
Y
S
 
C
D
 
P
A
 
R
A
 
C
R
 
Q
D
 
E
A
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
G
W
 
W
L
 
L
R
 
E
E
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
K
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
G
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
E
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
T
V
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
S
M
 
Q
D
 
R
Y
 
Y
A
 
R
D
 
S
F
 
F
D
 
A
Q
 
E
I
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
N
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
A
E
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
S
H
 
H
L
 
L
M
 
L
A
 
D
F
 
Y
R
 
Y
R
 
R
F
 
F
S
 
A
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
R
R
 
A
W
 
F
N
 
N
A
 
R
A
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
A
 
I
I
 
L
R
 
R
V
 
A
H
 
H
S
 
A
D
 
P
A
 
G
P
 
K
-
 
F
I
 
V
S
 
T
H
 
H
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
F
I
 
F
T
 
T
E
 
D
F
 
L
D
 
D
H
 
A
Y
 
F
D
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
Q
Q
 
D
M
 
L
E
 
D
I
 
F
A
 
A
T
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
T
-
 
D
L
 
L
D
 
M
R
 
P
V
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
E
D
 
E
A
 
K
Q
 
L
A
 
R
Y
 
Y
L
 
A
R
 
R
Q
 
T
G
 
G
D
 
H
P
 
P
D
 
D
F
 
V
Q
 
A
A
 
A
F
 
F
H
 
H
H
 
H
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
A
 
G
V
 
V
A
 
G
A
 
R
Q
 
G
A
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
R
W
 
F
W
 
W
V
 
V
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
N
W
|
W
A
 
A
P
 
P
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
S
P
 
P
L
 
A
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
T
 
T
W
 
W
E
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
V
C
 
S
Y
 
Y
F
 
F
R
 
R
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
S
 
Q
H
 
M
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
R
 
R
P
 
P
D
 
D
A
 
S
E
 
A
P
 
P
A
 
D
P
 
Q
G
 
G
L
 
F
A
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
L
P
 
A
D
 
L
V
 
P
A
 
P
S
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
E
S
 
A
Q
 
A
W
 
W
A
 
I
W
 
Y
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
K
 
A
G
 
E
F
 
W
D
 
S
H
 
Y
F
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
V
F
 
Y
H
 
L
L
 
F
Y
 
Y
R
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
P
D
 
G
A
 
A
P
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
F
T
 
A
L
 
V
I
 
V
P
 
P
S
 
S
L
 
L
M
 
P
T
 
I
L
 
V
G
 
R
S
 
E
A
 
E
L
 
A
R
 
L
G
 
E
A
 
A
I
 
F
E
 
R
E
 
E
A
 
A
P
 
E
G
 
G
I
 
P
V
 
V
L
 
L
T
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
T
 
S
D
 
G
L
 
S
R
 
K
G
 
T
P
 
E
D
 
T
L
 
F
A
 
Q
M
 
I
-
 
P
-
 
K
H
 
E
V
 
L
P
 
P
L
 
P
G
 
G
P
 
P
H
 
L
L
 
Q
P
 
A
G
 
L
L
 
L
D
 
P
V
 
L
T
 
K
A
 
V
T
 
V
L
 
R
V
 
V
E
 
E
T
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
H
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
A
 
A
P
 
E
R
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
G
R
 
R
G
 
-
G
 
F
A
 
P
L
 
L
T
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
R
E
 
E
H
 
W
L
 
V
E
 
E
T
 
A
D
 
P
A
 
L
A
 
K
I
 
P
V
 
L
E
 
L
H
 
T
T
 
F
T
 
Q
D
 
D
G
 
G
L
 
K
P
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
Y
R
 
R
S
 
E
G
 
G
N
 
R
R
 
Y
A
 
L
H
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
A
W
 
W
P
 
P
D
 
S
M
 
P
E
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
G
R
 
R
I
 
L
L
 
L
R
 
S
D
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
K
P
 
V
I
 
L
D
 
S
M
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
G
V
 
L
R
 
R
R
 
L
R
 
R
G
 
R
T
 
R
A
 
G
T
 
T
E
 
W
T
 
V
F
 
F
L
 
A
F
 
F
N
 
N
Y
 
Y
A
 
G
A
 
P
E
 
E
D
 
A
R
 
V
E
 
E

1kwkA Crystal structure of thermus thermophilus a4 beta-galactosidase in complex with galactose (see paper)
52% identity, 97% coverage: 5:625/642 of query aligns to 2:618/644 of 1kwkA

query
sites
1kwkA
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
C
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
H
 
H
W
 
W
P
 
P
E
 
K
D
 
E
R
 
R
W
 
W
A
 
K
T
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
R
M
 
R
M
 
M
A
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
S
W
 
H
V
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
E
F
|
F
A
 
A
W
 
W
S
 
A
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
R
L
 
L
R
 
E
F
 
W
D
 
G
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
P
H
 
K
W
 
W
M
 
L
L
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
P
 
P
D
 
E
M
 
I
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
R
R
 
R
K
 
R
F
 
F
G
 
G
S
 
G
R
|
R
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
C
|
C
F
 
F
S
 
S
H
 
S
V
 
P
P
 
V
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
R
M
 
I
A
 
V
R
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
P
 
G
D
 
G
V
 
L
D
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
G
W
 
F
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
|
N
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
H
 
H
D
 
D
T
 
T
I
 
V
L
 
R
S
 
C
W
 
Y
S
x
C
D
 
P
A
 
R
A
 
C
R
 
Q
D
 
E
A
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
G
W
 
W
L
 
L
R
 
E
E
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
K
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
G
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
E
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
T
V
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
S
M
 
Q
D
 
R
Y
 
Y
A
 
R
D
 
S
F
 
F
D
 
A
Q
 
E
I
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
N
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
A
E
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
S
H
 
H
L
 
L
M
 
L
A
 
D
F
 
Y
R
 
Y
R
 
R
F
 
F
S
 
A
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
R
R
 
A
W
 
F
N
 
N
A
 
R
A
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
A
 
I
I
 
L
R
 
R
V
 
A
H
 
H
S
 
A
D
 
P
A
 
G
P
 
K
-
 
F
I
 
V
S
 
T
H
 
H
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
F
I
 
F
T
 
T
E
 
D
F
 
L
D
 
D
H
 
A
Y
 
F
D
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
Q
Q
 
D
M
 
L
E
 
D
I
 
F
A
 
A
T
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
S
Y
|
Y
P
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
T
-
 
D
L
 
L
D
 
M
R
 
P
V
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
E
D
 
E
A
 
K
Q
 
L
A
 
R
Y
 
Y
L
 
A
R
 
R
Q
 
T
G
 
G
D
 
H
P
 
P
D
 
D
F
 
V
Q
 
A
A
 
A
F
 
F
H
 
H
H
 
H
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
A
 
G
V
 
V
A
 
G
A
 
R
Q
 
G
A
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
R
W
 
F
W
 
W
V
 
V
M
 
M
E
|
E
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
N
W
|
W
A
 
A
P
 
P
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
S
P
 
P
L
 
A
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
T
 
T
W
 
W
E
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
V
C
 
S
Y
 
Y
F
|
F
R
 
R
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
E
|
E
S
 
Q
H
 
M
H
|
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
R
 
R
P
 
P
D
 
D
A
 
S
E
 
A
P
 
P
A
 
D
P
 
Q
G
 
G
L
 
F
A
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
L
P
 
A
D
 
L
V
 
P
A
 
P
S
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
E
S
 
A
Q
 
A
W
 
W
A
 
I
W
 
Y
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
K
 
A
G
 
E
F
 
W
D
 
S
H
 
Y
F
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
V
F
 
Y
H
 
L
L
 
F
Y
 
Y
R
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
P
D
 
G
A
 
A
P
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
F
T
 
A
L
 
V
I
 
V
P
 
P
S
 
S
L
 
L
M
 
P
T
 
I
L
 
V
G
 
R
S
 
E
A
 
E
L
 
A
R
 
L
G
 
E
A
 
A
I
 
F
E
 
R
E
 
E
A
 
A
P
 
E
G
 
G
I
 
P
V
 
V
L
 
L
T
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
T
 
S
D
 
G
L
 
S
R
 
K
G
 
T
P
 
E
D
 
T
L
 
F
A
 
Q
M
 
I
-
 
P
-
 
K
H
 
E
V
 
L
P
 
P
L
 
P
G
 
G
P
 
P
H
 
L
L
 
Q
P
 
A
G
 
L
L
 
L
D
 
P
V
 
L
T
 
K
A
 
V
T
 
V
L
 
R
V
 
V
E
 
E
T
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
H
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
A
 
A
P
 
E
R
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
G
R
 
R
G
 
-
G
 
F
A
 
P
L
 
L
T
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
R
E
 
E
H
 
W
L
 
V
E
 
E
T
 
A
D
 
P
A
 
L
A
 
K
I
 
P
V
 
L
E
 
L
H
 
T
T
 
F
T
 
Q
D
 
D
G
 
G
L
 
K
P
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
Y
R
 
R
S
 
E
G
 
G
N
 
R
R
 
Y
A
 
L
H
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
A
W
 
W
P
 
P
D
 
S
M
 
P
E
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
G
R
 
R
I
 
L
L
 
L
R
 
S
D
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
K
P
 
V
I
 
L
D
 
S
M
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
G
V
 
L
R
 
R
R
 
L
R
 
R
G
 
R
T
 
R
A
 
G
T
 
T
E
 
W
T
 
V
F
 
F
L
 
A
F
 
F
N
 
N
Y
 
Y
A
 
G
A
 
P
E
 
E
D
 
A
R
 
V
E
 
E

1kwgA Crystal structure of thermus thermophilus a4 beta-galactosidase (see paper)
52% identity, 97% coverage: 5:625/642 of query aligns to 2:618/644 of 1kwgA

query
sites
1kwgA
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
C
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
H
 
H
W
 
W
P
 
P
E
 
K
D
 
E
R
 
R
W
 
W
A
 
K
T
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
R
M
 
R
M
 
M
A
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
S
W
 
H
V
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
E
F
 
F
A
 
A
W
 
W
S
 
A
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
R
L
 
L
R
 
E
F
 
W
D
 
G
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
P
H
 
K
W
 
W
M
 
L
L
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
P
 
P
D
 
E
M
 
I
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
R
R
 
R
K
 
R
F
 
F
G
 
G
S
 
G
R
 
R
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
C
|
C
F
 
F
S
 
S
H
 
S
V
 
P
P
 
V
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
R
M
 
I
A
 
V
R
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
P
 
G
D
 
G
V
 
L
D
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
G
W
 
F
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
N
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
H
 
H
D
 
D
T
 
T
I
 
V
L
 
R
S
x
C
W
 
Y
S
x
C
D
 
P
A
 
R
A
x
C
R
 
Q
D
 
E
A
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
G
W
 
W
L
 
L
R
 
E
E
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
K
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
G
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
E
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
T
V
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
S
M
 
Q
D
 
R
Y
 
Y
A
 
R
D
 
S
F
 
F
D
 
A
Q
 
E
I
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
N
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
A
E
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
S
H
 
H
L
 
L
M
 
L
A
 
D
F
 
Y
R
 
Y
R
 
R
F
 
F
S
 
A
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
R
R
 
A
W
 
F
N
 
N
A
 
R
A
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
A
 
I
I
 
L
R
 
R
V
 
A
H
 
H
S
 
A
D
 
P
A
 
G
P
 
K
-
 
F
I
 
V
S
 
T
H
 
H
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
F
I
 
F
T
 
T
E
 
D
F
 
L
D
 
D
H
 
A
Y
 
F
D
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
Q
Q
 
D
M
 
L
E
 
D
I
 
F
A
 
A
T
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
T
-
 
D
L
 
L
D
 
M
R
 
P
V
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
E
D
 
E
A
 
K
Q
 
L
A
 
R
Y
 
Y
L
 
A
R
 
R
Q
 
T
G
 
G
D
 
H
P
 
P
D
 
D
F
 
V
Q
 
A
A
 
A
F
 
F
H
 
H
H
 
H
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
A
 
G
V
 
V
A
 
G
A
 
R
Q
 
G
A
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
R
W
 
F
W
 
W
V
 
V
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
P
 
P
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
S
P
 
P
L
 
A
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
T
 
T
W
 
W
E
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
V
C
 
S
Y
 
Y
F
 
F
R
 
R
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
S
 
Q
H
 
M
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
R
 
R
P
 
P
D
 
D
A
 
S
E
 
A
P
 
P
A
 
D
P
 
Q
G
 
G
L
 
F
A
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
L
P
 
A
D
 
L
V
 
P
A
 
P
S
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
E
S
 
A
Q
 
A
W
 
W
A
 
I
W
 
Y
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
K
 
A
G
 
E
F
 
W
D
 
S
H
 
Y
F
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
V
F
 
Y
H
 
L
L
 
F
Y
 
Y
R
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
P
D
 
G
A
 
A
P
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
F
T
 
A
L
 
V
I
 
V
P
 
P
S
 
S
L
 
L
M
 
P
T
 
I
L
 
V
G
 
R
S
 
E
A
 
E
L
 
A
R
 
L
G
 
E
A
 
A
I
 
F
E
 
R
E
 
E
A
 
A
P
 
E
G
 
G
I
 
P
V
 
V
L
 
L
T
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
T
 
S
D
 
G
L
 
S
R
 
K
G
 
T
P
 
E
D
 
T
L
 
F
A
 
Q
M
 
I
-
 
P
-
 
K
H
 
E
V
 
L
P
 
P
L
 
P
G
 
G
P
 
P
H
 
L
L
 
Q
P
 
A
G
 
L
L
 
L
D
 
P
V
 
L
T
 
K
A
 
V
T
 
V
L
 
R
V
 
V
E
 
E
T
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
H
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
A
 
A
P
 
E
R
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
G
R
 
R
G
 
-
G
 
F
A
 
P
L
 
L
T
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
R
E
 
E
H
 
W
L
 
V
E
 
E
T
 
A
D
 
P
A
 
L
A
 
K
I
 
P
V
 
L
E
 
L
H
 
T
T
 
F
T
 
Q
D
 
D
G
 
G
L
 
K
P
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
Y
R
 
R
S
 
E
G
 
G
N
 
R
R
 
Y
A
 
L
H
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
A
W
 
W
P
 
P
D
 
S
M
 
P
E
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
G
R
 
R
I
 
L
L
 
L
R
 
S
D
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
K
P
 
V
I
 
L
D
 
S
M
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
G
V
 
L
R
 
R
R
 
L
R
 
R
G
 
R
T
 
R
A
 
G
T
 
T
E
 
W
T
 
V
F
 
F
L
 
A
F
 
F
N
 
N
Y
 
Y
A
 
G
A
 
P
E
 
E
D
 
A
R
 
V
E
 
E

6lvwA Polyextremophilic beta-galactosidase from the antarctic haloarchaeon halorubrum lacusprofundi (see paper)
41% identity, 96% coverage: 5:622/642 of query aligns to 3:628/668 of 6lvwA

query
sites
6lvwA
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
C
Y
 
Y
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
H
 
H
W
 
W
P
 
P
E
 
S
D
 
E
R
 
E
W
 
W
A
 
E
T
 
R
D
 
D
A
 
V
T
 
A
M
 
A
M
 
M
A
 
A
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
E
W
 
Y
V
 
V
R
 
R
I
 
M
G
 
A
E
 
E
F
 
F
A
 
S
W
 
W
S
 
G
R
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
R
G
 
G
E
 
T
L
 
F
R
 
D
F
 
F
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
E
T
 
L
L
 
I
R
 
G
G
 
D
A
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
Q
I
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
C
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
P
H
 
K
W
 
W
M
 
L
L
 
V
D
 
D
R
 
E
H
 
R
P
 
P
D
 
S
M
 
I
L
 
R
A
 
Q
V
 
E
D
 
D
A
 
P
E
 
D
G
 
G
R
 
T
P
 
V
R
 
R
K
 
E
F
 
H
G
 
G
S
 
S
R
 
R
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
C
|
C
F
 
F
S
 
N
H
 
S
V
 
D
P
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
R
M
 
I
A
 
V
R
 
E
L
 
R
L
 
V
A
 
T
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
S
P
 
P
D
 
H
V
 
V
D
 
A
A
 
G
W
 
W
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
N
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
H
 
H
D
 
E
T
 
T
I
 
V
L
 
R
S
x
C
W
 
Y
S
x
C
D
 
D
A
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
T
W
 
W
L
 
L
R
 
A
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
K
 
D
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
G
 
D
A
 
R
L
 
L
N
 
N
A
 
E
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
N
V
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
S
M
 
Q
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
D
 
S
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
P
P
 
P
N
 
G
L
 
P
T
 
T
V
 
P
T
 
A
E
 
E
P
 
H
N
 
H
P
 
P
A
 
S
H
 
R
L
 
L
M
 
L
A
 
A
F
 
Y
R
 
A
R
 
R
F
 
F
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Q
 
S
V
 
V
A
 
V
R
 
E
W
 
Y
N
 
N
A
 
R
A
 
L
Q
 
H
V
 
A
E
 
D
A
 
L
I
 
I
R
 
R
-
 
E
V
 
A
H
 
D
S
 
P
D
 
D
A
 
W
P
 
F
I
 
V
S
 
T
H
 
H
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
F
T
 
P
E
 
T
F
 
L
D
 
N
H
 
A
Y
 
Y
D
 
D
L
 
V
G
 
S
R
 
E
Q
 
D
M
 
L
E
 
D
I
 
R
A
 
V
T
 
A
W
 
W
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
V
L
 
Q
D
 
D
R
 
R
V
 
Y
P
 
-
D
 
D
G
 
G
D
 
E
A
 
A
Q
 
S
A
 
P
-
 
D
Y
 
Q
L
 
L
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
D
 
D
F
 
Q
Q
 
V
A
 
G
F
 
M
H
 
D
H
 
H
D
 
D
L
 
I
Y
 
Y
R
 
R
A
 
S
V
 
A
A
 
L
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
R
P
 
P
P
 
-
R
 
-
W
 
F
W
 
W
V
 
V
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
P
 
D
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
P
P
 
P
H
 
H
N
 
C
P
 
P
A
 
Q
P
 
P
L
 
G
P
 
E
G
 
G
M
 
A
V
 
M
R
 
R
L
 
L
W
 
W
T
 
A
W
 
H
E
 
H
A
 
A
F
 
A
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
L
Y
 
Y
F
 
F
R
 
R
W
 
W
R
 
R
Q
 
R
A
 
C
P
 
L
F
 
E
A
 
G
Q
 
Q
E
 
E
S
 
Q
H
 
Y
H
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
R
R
 
K
P
 
A
D
 
D
A
 
G
E
 
S
P
 
P
A
 
D
P
 
R
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
A
R
 
A
A
 
H
V
 
T
A
 
S
A
 
E
E
 
E
L
 
F
A
 
A
D
 
T
A
 
L
P
 
D
D
 
G
V
 
A
A
 
S
S
 
H
A
 
V
Q
 
D
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
Q
 
L
W
 
W
A
 
A
W
 
L
E
 
N
V
 
A
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
H
G
 
A
K
 
P
G
 
D
F
 
F
D
 
D
H
 
Y
F
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
F
 
E
H
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
S
 
G
L
 
R
G
 
G
L
 
V
G
 
Q
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
P
D
 
S
A
 
A
P
 
-
S
 
D
L
 
L
D
 
S
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
A
T
 
V
L
 
V
I
 
A
P
 
P
S
 
A
L
 
L
M
 
H
T
 
L
L
 
V
G
 
T
S
 
E
A
 
D
L
 
L
R
 
A
G
 
D
A
 
R
I
 
L
E
 
T
E
 
D
-
 
Y
-
 
I
-
 
A
A
 
G
P
 
G
G
 
G
I
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
T
 
T
D
 
G
L
 
V
R
 
K
G
 
D
P
 
A
D
 
E
L
 
N
A
 
K
M
 
L
H
 
R
V
 
-
P
 
P
L
 
M
G
 
S
P
 
Q
H
 
P
L
 
G
P
 
P
G
 
L
L
 
T
D
 
D
V
 
L
T
 
V
A
 
G
T
 
A
L
 
T
V
 
V
-
 
D
-
 
Q
-
 
H
E
 
E
T
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
R
H
 
R
A
 
L
P
 
E
R
 
T
A
 
T
L
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
V
G
 
P
A
 
P
L
 
V
T
 
S
L
 
F
-
 
R
-
 
T
W
 
W
L
 
A
E
 
E
H
 
W
L
 
L
E
 
D
T
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
A
-
 
E
-
 
P
-
 
Q
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
I
 
D
V
 
V
E
 
D
H
 
G
T
 
P
T
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
V
 
V
R
 
T
S
 
N
-
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
D
G
 
G
N
 
Q
R
 
V
A
 
T
H
 
Y
L
 
C
A
 
G
G
 
V
W
 
W
P
 
P
D
 
E
M
 
S
E
 
D
A
 
L
A
 
A
R
 
D
R
 
A
I
 
L
L
 
A
R
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
L
T
 
D
E
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
R
P
 
Y
I
 
A
D
 
E
-
 
R
M
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
I
R
 
G
G
 
Y
T
 
R
A
 
G
T
 
G
E
 
R
T
 
T
F
 
W
L
 
V
F
 
T
N
 
N
Y
 
F
A
 
T
A
 
S
E
 
D

5e9aB Crystal structure analysis of the cold-adamped beta-galactosidase from rahnella sp. R3 (see paper)
29% identity, 97% coverage: 6:627/642 of query aligns to 16:652/684 of 5e9aB

query
sites
5e9aB
G
 
G
V
 
A
C
 
D
Y
 
Y
Y
 
N
P
 
P
E
 
E
H
 
Q
W
 
W
P
 
L
E
 
D
-
 
H
-
 
P
D
 
D
R
 
V
W
 
L
A
 
V
T
 
R
D
 
D
A
 
V
T
 
E
M
 
M
M
 
M
A
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
R
L
 
C
T
 
N
W
 
V
V
 
M
R
 
S
I
 
V
G
 
G
E
 
I
F
 
F
A
 
S
W
 
W
S
 
S
R
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
E
G
 
G
E
 
R
L
 
Y
R
 
T
F
 
F
D
 
D
W
 
W
L
 
M
A
 
D
R
 
Q
A
 
V
I
 
L
D
 
N
T
 
R
L
 
L
R
 
H
G
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
I
K
 
S
I
 
V
V
 
F
L
 
L
G
 
A
T
 
T
P
 
P
S
 
S
A
 
G
T
 
A
P
 
R
P
 
P
H
 
A
W
 
W
M
 
M
L
 
S
D
 
Q
R
 
K
H
 
Y
P
 
P
D
 
Q
M
 
V
L
 
L
A
 
R
V
 
V
D
 
G
A
 
R
E
 
D
G
 
R
R
 
V
P
 
P
R
 
A
K
 
L
F
 
H
G
 
G
S
 
G
R
 
R
R
 
H
H
 
N
Y
 
H
C
 
C
F
 
M
S
 
S
H
 
S
V
 
P
P
 
V
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
K
A
 
V
A
 
Q
R
 
L
M
 
M
A
 
N
R
 
G
L
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
R
F
 
Y
-
 
A
-
 
H
-
 
H
P
 
P
D
 
A
V
 
V
D
 
I
A
 
G
W
 
W
Q
 
H
T
 
I
D
 
S
N
 
N
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
-
 
G
-
 
E
C
|
C
H
 
H
D
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
W
 
-
S
x
C
D
 
D
A
 
T
A
x
C
R
 
Q
D
 
G
A
 
Q
F
 
F
R
 
R
D
 
D
W
 
W
L
 
L
R
 
K
E
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
V
K
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
L
G
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
K
H
 
A
W
 
W
G
 
W
N
 
S
V
 
T
F
 
F
W
 
W
S
 
S
M
 
H
D
 
T
Y
 
Y
A
 
T
D
 
D
F
 
W
D
 
S
Q
 
Q
I
 
L
D
 
E
L
 
S
P
 
P
N
 
S
L
 
P
T
 
Q
V
 
G
T
 
E
E
 
N
P
 
G
N
 
V
P
 
H
A
 
G
H
 
L
L
 
N
M
 
L
A
 
D
F
 
W
R
 
R
R
 
R
F
 
F
S
 
N
S
 
T
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
T
R
 
R
W
 
F
N
 
C
A
 
S
A
 
E
Q
 
E
V
 
I
E
 
R
A
 
P
I
 
L
R
 
K
V
 
A
H
 
E
S
 
N
D
 
P
A
 
A
-
 
L
P
 
P
I
 
A
S
 
T
H
 
T
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
G
 
E
R
 
Y
I
 
F
T
 
N
E
 
D
F
 
Y
D
 
D
H
 
Y
Y
 
W
D
 
K
L
 
L
G
 
A
R
 
G
Q
 
V
M
 
L
E
 
D
I
 
F
A
 
I
T
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
M
G
 
W
F
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
H
L
 
T
R
 
R
Q
 
Q
G
 
D
D
 
D
P
 
I
D
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
A
F
 
Y
Q
 
T
A
 
A
F
 
M
H
 
Y
H
 
H
D
 
D
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
A
 
T
V
 
L
A
 
K
A
 
Q
Q
 
G
A
 
K
P
 
P
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
F
W
 
V
V
 
L
M
 
M
E
 
E
Q
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
S
P
 
F
V
 
T
N
 
N
W
 
W
A
 
Q
P
 
P
H
 
T
N
 
S
P
 
K
A
 
L
P
 
K
L
 
K
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
H
R
 
I
L
 
L
W
 
S
T
 
S
W
 
L
E
 
Q
A
 
A
F
 
V
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
S
V
 
V
C
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
W
 
W
R
 
R
Q
 
K
A
 
S
P
 
R
F
 
G
A
 
S
Q
 
C
E
 
E
S
 
K
H
 
F
H
 
H
A
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
V
-
 
D
-
 
H
-
 
V
-
 
G
R
 
H
P
 
I
D
 
D
A
 
T
E
 
R
P
 
V
A
 
G
P
 
R
G
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
L
R
 
G
A
 
S
V
 
I
A
 
L
A
 
S
E
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
P
A
 
V
P
 
A
D
 
G
V
 
-
A
 
S
S
 
R
A
 
V
Q
 
E
A
 
A
P
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
I
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
A
 
E
S
 
S
Q
 
R
W
 
W
A
 
A
W
 
M
E
 
D
-
 
D
-
 
A
V
 
M
Q
 
G
P
 
P
Q
 
R
G
 
N
K
 
A
G
 
G
F
 
L
D
 
H
H
 
Y
F
 
E
A
 
N
L
 
T
A
 
V
F
 
A
H
 
D
L
 
H
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
W
S
 
A
L
 
Q
G
 
G
L
 
I
G
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
A
D
 
D
A
 
C
P
 
-
S
 
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
L
 
L
T
 
V
L
 
I
I
 
A
P
 
P
S
 
M
L
 
L
M
 
Y
T
 
M
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
G
L
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
R
L
 
I
R
 
S
G
 
A
A
 
F
I
 
V
E
 
Q
E
 
A
A
 
G
P
 
G
G
 
R
I
 
F
V
 
V
L
 
A
T
 
T
G
 
Y
P
 
W
R
 
S
T
 
G
D
 
I
L
 
V
R
 
N
G
 
E
P
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
C
M
 
F
H
 
L
V
 
N
P
 
G
L
 
F
-
 
P
G
 
G
P
 
P
H
 
L
L
 
R
P
 
P
G
 
V
L
 
L
D
 
G
V
 
I
T
 
W
A
 
A
T
 
E
L
 
E
V
 
I
E
 
D
T
 
S
L
 
L
P
 
T
-
 
D
-
 
E
P
 
Q
H
 
H
A
 
N
P
 
S
R
 
V
A
 
A
L
 
G
R
 
V
R
 
E
G
 
G
G
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
G
L
 
L
W
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
Y
-
 
R
-
 
A
-
 
S
-
 
Q
-
 
L
-
 
C
-
 
E
L
 
V
E
 
I
H
 
H
L
 
L
E
 
E
T
 
G
D
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
V
 
A
E
 
T
H
 
Y
T
 
G
T
 
D
D
 
D
-
 
F
-
 
Y
-
 
A
G
 
G
L
 
N
P
 
P
A
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
N
L
 
L
V
 
Y
R
 
G
S
 
K
G
 
G
N
 
Q
R
 
A
A
 
Y
H
 
Y
L
 
V
A
 
A
G
 
S
W
 
R
P
 
N
D
 
D
M
 
Q
E
 
Q
A
 
F
A
 
H
R
 
A
R
 
D
I
 
F
L
 
F
R
 
T
D
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
K
E
 
E
A
 
M
G
 
K
L
 
L
-
 
P
-
 
R
-
 
A
D
 
I
P
 
N
I
 
T
D
 
P
M
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
G
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
R
R
 
R
R
 
T
R
 
D
G
 
G
T
 
E
A
 
S
T
 
E
E
 
F
T
 
I
F
 
F
L
 
L
F
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
A
 
N
A
 
A
E
 
D
D
 
N
R
 
Q
E
 
T
F
 
V
A
 
A

3ttyA Crystal structure of beta-galactosidase from bacillus circulans sp. Alkalophilus in complex with galactose (see paper)
28% identity, 96% coverage: 9:626/642 of query aligns to 15:642/675 of 3ttyA

query
sites
3ttyA
Y
 
Y
Y
 
N
P
 
P
E
 
E
H
 
Q
W
 
W
P
 
D
E
 
K
D
 
A
R
 
T
W
 
M
A
 
E
T
 
E
D
 
D
A
 
M
T
 
R
M
 
M
M
 
F
A
 
N
E
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
D
W
 
V
V
 
A
R
 
T
I
 
V
G
 
N
E
 
V
F
 
F
A
 
S
W
 
W
S
 
A
R
 
K
L
 
I
E
 
Q
P
 
R
A
 
D
P
 
E
G
 
V
E
 
S
L
 
Y
R
 
D
F
 
F
D
 
T
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
D
A
 
I
I
 
I
D
 
E
T
 
R
L
 
L
R
 
T
G
 
K
A
 
E
G
 
N
L
 
I
K
 
Y
I
 
L
V
 
C
L
 
L
G
 
A
T
 
T
P
 
S
S
 
T
A
 
G
T
 
A
P
 
H
P
 
P
H
 
A
W
 
W
M
 
M
L
 
A
D
 
K
R
 
K
H
 
Y
P
 
P
D
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
Y
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
K
R
 
R
K
 
K
F
 
F
G
 
G
S
 
G
R
|
R
R
 
H
H
 
N
Y
 
S
C
|
C
F
 
P
S
 
N
H
 
S
V
 
P
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
D
 
K
E
 
Y
A
 
A
A
 
K
R
 
I
M
 
L
A
 
A
R
 
G
L
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
-
 
K
-
 
D
-
 
H
P
 
P
D
 
Q
V
 
I
D
 
V
A
 
M
W
 
W
Q
 
H
T
 
V
D
 
S
N
 
N
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
G
H
 
Y
D
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
S
x
C
W
 
Y
S
 
C
D
 
D
A
 
N
A
x
C
R
 
E
D
 
K
A
 
Q
F
 
F
R
 
R
D
 
V
W
 
W
L
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
K
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
T
I
 
L
G
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
K
H
 
A
W
 
W
G
 
N
N
 
T
V
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
S
M
 
H
D
 
T
Y
 
F
A
 
Y
D
 
D
F
 
W
D
 
D
Q
 
E
I
 
I
D
 
V
L
 
A
P
 
P
N
 
N
L
 
A
T
 
L
V
 
S
T
 
E
E
 
E
-
 
W
-
 
S
P
 
G
N
 
N
P
 
R
A
 
T
H
 
N
L
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
I
-
 
S
M
 
L
A
 
D
F
 
Y
R
 
R
R
 
R
F
 
F
S
 
Q
S
 
S
D
 
D
Q
 
S
V
 
L
A
 
L
R
 
E
-
 
C
W
 
F
N
 
K
A
 
M
A
 
E
Q
 
R
V
 
D
E
 
E
A
 
L
I
 
K
R
 
R
V
 
W
H
 
T
S
 
P
D
 
D
A
 
I
P
 
P
I
 
V
S
 
T
H
 
T
N
 
N
Y
 
L
M
 
M
G
 
G
R
 
F
I
 
Y
T
 
P
E
 
E
F
 
L
D
 
D
H
 
Y
Y
 
F
D
 
K
L
 
W
G
 
A
R
 
K
Q
 
E
M
 
M
E
 
D
I
 
V
A
 
V
T
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
N
Y
|
Y
P
 
P
L
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
S
Q
 
M
G
 
D
D
 
T
P
 
P
-
 
F
D
 
S
F
 
F
Q
 
T
A
 
A
F
 
M
H
 
A
H
 
H
D
 
N
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
A
 
G
V
 
L
A
 
K
A
 
S
Q
 
G
A
 
Q
P
 
P
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
F
W
 
M
V
 
L
M
 
M
E
|
E
Q
 
Q
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
P
 
V
V
x
Q
N
 
N
W
|
W
A
 
Q
P
 
P
H
 
Y
N
 
N
P
 
S
A
 
A
P
 
K
L
 
R
P
 
P
G
 
G
M
 
V
V
 
M
R
 
R
L
 
L
W
 
W
T
 
S
W
 
Y
E
 
Q
A
 
A
F
 
V
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
T
V
 
V
C
 
M
Y
 
F
F
|
F
R
 
Q
W
 
L
R
 
R
Q
 
R
A
 
S
P
 
V
F
 
G
A
 
A
Q
 
C
E
|
E
S
 
K
H
 
Y
H
|
H
A
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
I
R
 
E
P
 
H
D
 
V
A
 
G
-
 
H
E
 
E
P
 
H
A
 
T
P
 
R
G
 
V
L
 
F
A
 
R
E
 
E
A
 
C
R
 
A
A
 
E
V
 
L
A
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
D
 
Q
A
 
L
P
 
G
D
 
D
V
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
D
A
 
A
S
 
R
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
P
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
M
F
 
Y
D
 
D
Y
 
W
A
 
E
S
 
N
Q
 
R
W
 
W
A
 
A
W
 
L
E
 
E
V
 
L
Q
 
S
P
 
S
Q
 
G
-
 
P
G
 
S
K
 
I
G
 
A
F
 
L
D
 
N
H
 
Y
F
 
V
A
 
N
L
 
E
A
 
V
F
 
H
H
 
K
L
 
Y
Y
 
Y
R
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
Y
S
 
K
L
 
Q
G
 
N
L
 
I
G
 
Q
V
 
T
D
 
D
I
 
M
L
 
I
P
 
S
P
 
V
D
 
E
A
 
-
P
 
E
S
 
D
L
 
L
D
 
S
G
 
K
Y
 
Y
A
 
K
L
 
V
T
 
V
L
 
I
I
 
A
P
 
P
S
 
V
L
 
M
M
 
Y
T
 
M
L
 
V
G
 
K
S
 
P
A
 
G
L
 
F
R
 
A
G
 
E
A
 
R
I
 
V
E
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
V
-
 
A
E
 
Q
A
 
G
P
 
G
G
 
T
I
 
F
V
 
V
L
 
T
T
 
T
G
 
F
P
 
F
R
 
S
T
 
G
D
 
I
L
 
V
R
 
N
G
 
E
P
 
N
D
 
D
L
 
L
A
 
-
M
 
-
H
 
-
V
 
V
P
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
G
H
 
Y
L
 
-
P
 
P
G
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
V
L
 
M
D
 
G
V
 
I
T
 
W
A
 
A
T
 
E
L
 
E
V
 
I
E
 
D
T
 
A
-
 
L
L
 
L
P
 
P
P
 
G
H
 
H
A
 
Q
P
 
N
R
 
E
A
 
I
L
 
V
R
 
L
R
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
W
G
 
G
G
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
Y
-
 
S
-
 
C
A
 
G
L
 
I
T
 
L
L
 
C
W
 
D
L
 
V
E
 
I
H
 
H
L
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
A
A
 
E
A
 
V
I
 
L
V
 
A
E
 
E
H
 
Y
T
 
G
T
 
A
D
 
D
-
 
Y
-
 
Y
-
 
K
G
 
G
L
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
L
V
 
T
R
 
R
-
 
N
-
 
K
-
 
F
-
 
G
S
 
N
G
 
G
N
 
Q
R
 
S
A
 
Y
H
 
Y
L
 
V
A
 
A
G
 
S
W
 
S
P
 
P
D
 
D
M
 
A
E
 
D
A
 
F
A
 
L
R
 
Q
R
 
G
I
 
L
L
 
I
R
 
A
D
 
N
L
 
L
A
 
C
T
 
E
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
K
P
 
P
-
 
L
I
 
L
D
 
N
M
 
T
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
E
R
 
R
R
 
V
R
 
K
G
 
N
T
 
G
A
 
T
T
 
S
E
 
Y
T
 
L
F
 
F
L
 
V
F
 
M
N
 
N
Y
 
H
A
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
E
R
 
M
E
 
T
F
 
F

3ttsA Crystal structure of beta-galactosidase from bacillus circulans sp. Alkalophilus (see paper)
28% identity, 96% coverage: 9:626/642 of query aligns to 15:642/675 of 3ttsA

query
sites
3ttsA
Y
 
Y
Y
 
N
P
 
P
E
 
E
H
 
Q
W
 
W
P
 
D
E
 
K
D
 
A
R
 
T
W
 
M
A
 
E
T
 
E
D
 
D
A
 
M
T
 
R
M
 
M
M
 
F
A
 
N
E
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
D
W
 
V
V
 
A
R
 
T
I
 
V
G
 
N
E
 
V
F
 
F
A
 
S
W
 
W
S
 
A
R
 
K
L
 
I
E
 
Q
P
 
R
A
 
D
P
 
E
G
 
V
E
 
S
L
 
Y
R
 
D
F
 
F
D
 
T
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
D
A
 
I
I
 
I
D
 
E
T
 
R
L
 
L
R
 
T
G
 
K
A
 
E
G
 
N
L
 
I
K
 
Y
I
 
L
V
 
C
L
 
L
G
 
A
T
 
T
P
 
S
S
 
T
A
 
G
T
 
A
P
 
H
P
 
P
H
 
A
W
 
W
M
 
M
L
 
A
D
 
K
R
 
K
H
 
Y
P
 
P
D
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
Y
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
K
R
 
R
K
 
K
F
 
F
G
 
G
S
 
G
R
 
R
R
 
H
H
 
N
Y
 
S
C
|
C
F
 
P
S
 
N
H
 
S
V
 
P
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
D
 
K
E
 
Y
A
 
A
A
 
K
R
 
I
M
 
L
A
 
A
R
 
G
L
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
-
 
K
-
 
D
-
 
H
P
 
P
D
 
Q
V
 
I
D
 
V
A
 
M
W
 
W
Q
 
H
T
 
V
D
 
S
N
 
N
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
G
H
 
Y
D
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
S
x
C
W
 
Y
S
x
C
D
 
D
A
 
N
A
x
C
R
 
E
D
 
K
A
 
Q
F
 
F
R
 
R
D
 
V
W
 
W
L
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
K
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
T
I
 
L
G
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
K
H
 
A
W
 
W
G
 
N
N
 
T
V
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
S
M
 
H
D
 
T
Y
 
F
A
 
Y
D
 
D
F
 
W
D
 
D
Q
 
E
I
 
I
D
 
V
L
 
A
P
 
P
N
 
N
L
 
A
T
 
L
V
 
S
T
 
E
E
 
E
-
 
W
-
 
S
P
 
G
N
 
N
P
 
R
A
 
T
H
 
N
L
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
I
-
 
S
M
 
L
A
 
D
F
 
Y
R
 
R
R
 
R
F
 
F
S
 
Q
S
 
S
D
 
D
Q
 
S
V
 
L
A
 
L
R
 
E
-
 
C
W
 
F
N
 
K
A
 
M
A
 
E
Q
 
R
V
 
D
E
 
E
A
 
L
I
 
K
R
 
R
V
 
W
H
 
T
S
 
P
D
 
D
A
 
I
P
 
P
I
 
V
S
 
T
H
 
T
N
 
N
Y
 
L
M
 
M
G
 
G
R
 
F
I
 
Y
T
 
P
E
 
E
F
 
L
D
 
D
H
 
Y
Y
 
F
D
 
K
L
 
W
G
 
A
R
 
K
Q
 
E
M
 
M
E
 
D
I
 
V
A
 
V
T
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
N
Y
 
Y
P
 
P
L
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
S
Q
 
M
G
 
D
D
 
T
P
 
P
-
 
F
D
 
S
F
 
F
Q
 
T
A
 
A
F
 
M
H
 
A
H
 
H
D
 
N
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
A
 
G
V
 
L
A
 
K
A
 
S
Q
 
G
A
 
Q
P
 
P
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
F
W
 
M
V
 
L
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
P
 
V
V
 
Q
N
 
N
W
 
W
A
 
Q
P
 
P
H
 
Y
N
 
N
P
 
S
A
 
A
P
 
K
L
 
R
P
 
P
G
 
G
M
 
V
V
 
M
R
 
R
L
 
L
W
 
W
T
 
S
W
 
Y
E
 
Q
A
 
A
F
 
V
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
T
V
 
V
C
 
M
Y
 
F
F
 
F
R
 
Q
W
 
L
R
 
R
Q
 
R
A
 
S
P
 
V
F
 
G
A
 
A
Q
 
C
E
 
E
S
 
K
H
 
Y
H
 
H
A
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
I
R
 
E
P
 
H
D
 
V
A
 
G
-
 
H
E
 
E
P
 
H
A
 
T
P
 
R
G
 
V
L
 
F
A
 
R
E
 
E
A
 
C
R
 
A
A
 
E
V
 
L
A
 
G
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
D
 
Q
A
 
L
P
 
G
D
 
D
V
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
D
A
 
A
S
 
R
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
P
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
M
F
 
Y
D
 
D
Y
 
W
A
 
E
S
 
N
Q
 
R
W
 
W
A
 
A
W
 
L
E
 
E
V
 
L
Q
 
S
P
 
S
Q
 
G
-
 
P
G
 
S
K
 
I
G
 
A
F
 
L
D
 
N
H
 
Y
F
 
V
A
 
N
L
 
E
A
 
V
F
 
H
H
 
K
L
 
Y
Y
 
Y
R
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
Y
S
 
K
L
 
Q
G
 
N
L
 
I
G
 
Q
V
 
T
D
 
D
I
 
M
L
 
I
P
 
S
P
 
V
D
 
E
A
 
-
P
 
E
S
 
D
L
 
L
D
 
S
G
 
K
Y
 
Y
A
 
K
L
 
V
T
 
V
L
 
I
I
 
A
P
 
P
S
 
V
L
 
M
M
 
Y
T
 
M
L
 
V
G
 
K
S
 
P
A
 
G
L
 
F
R
 
A
G
 
E
A
 
R
I
 
V
E
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
V
-
 
A
E
 
Q
A
 
G
P
 
G
G
 
T
I
 
F
V
 
V
L
 
T
T
 
T
G
 
F
P
 
F
R
 
S
T
 
G
D
 
I
L
 
V
R
 
N
G
 
E
P
 
N
D
 
D
L
 
L
A
 
-
M
 
-
H
 
-
V
 
V
P
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
G
H
 
Y
L
 
-
P
 
P
G
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
V
L
 
M
D
 
G
V
 
I
T
 
W
A
 
A
T
 
E
L
 
E
V
 
I
E
 
D
T
 
A
-
 
L
L
 
L
P
 
P
P
 
G
H
 
H
A
 
Q
P
 
N
R
 
E
A
 
I
L
 
V
R
 
L
R
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
W
G
 
G
G
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
Y
-
 
S
-
 
C
A
 
G
L
 
I
T
 
L
L
 
C
W
 
D
L
 
V
E
 
I
H
 
H
L
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
A
A
 
E
A
 
V
I
 
L
V
 
A
E
 
E
H
 
Y
T
 
G
T
 
A
D
 
D
-
 
Y
-
 
Y
-
 
K
G
 
G
L
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
L
V
 
T
R
 
R
-
 
N
-
 
K
-
 
F
-
 
G
S
 
N
G
 
G
N
 
Q
R
 
S
A
 
Y
H
 
Y
L
 
V
A
 
A
G
 
S
W
 
S
P
 
P
D
 
D
M
 
A
E
 
D
A
 
F
A
 
L
R
 
Q
R
 
G
I
 
L
L
 
I
R
 
A
D
 
N
L
 
L
A
 
C
T
 
E
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
K
P
 
P
-
 
L
I
 
L
D
 
N
M
 
T
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
E
R
 
R
R
 
V
R
 
K
G
 
N
T
 
G
A
 
T
T
 
S
E
 
Y
T
 
L
F
 
F
L
 
V
F
 
M
N
 
N
Y
 
H
A
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
E
R
 
M
E
 
T
F
 
F

4ucfA Crystal structure of bifidobacterium bifidum beta-galactosidase in complex with alpha-galactose (see paper)
30% identity, 86% coverage: 9:557/642 of query aligns to 23:551/682 of 4ucfA

query
sites
4ucfA
Y
 
Y
Y
 
N
P
 
P
E
 
D
H
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
E
D
 
E
R
 
V
W
 
W
A
 
D
T
 
D
D
 
D
A
 
I
T
 
R
M
 
L
M
 
M
A
 
K
E
 
K
A
 
A
G
|
G
L
 
V
T
x
N
W
 
L
V
 
V
R
 
S
I
 
V
G
 
G
E
 
I
F
 
F
A
 
S
W
 
W
S
 
A
R
 
K
L
 
I
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
E
G
 
G
E
 
K
L
 
Y
R
 
D
F
 
F
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
R
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
K
L
 
L
R
 
G
G
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
K
 
A
I
 
V
V
 
D
L
 
L
G
 
A
T
 
S
P
 
A
S
 
T
A
 
A
T
 
S
P
 
P
P
 
P
H
 
M
W
 
W
M
 
L
L
 
T
D
 
Q
R
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
E
M
 
V
L
 
L
A
 
W
V
 
K
D
 
D
A
 
E
E
 
R
G
 
G
R
 
D
P
 
T
R
 
V
K
 
W
F
 
P
G
 
G
S
 
A
R
|
R
R
 
E
H
 
H
Y
 
W
C
 
R
F
 
P
S
 
T
H
 
S
V
 
P
P
 
V
Y
 
F
R
 
R
D
 
E
E
 
Y
A
 
A
A
 
L
R
 
N
M
 
L
A
 
C
R
 
R
L
 
R
L
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
H
F
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
N
P
 
P
D
 
Y
V
 
V
D
 
V
A
 
A
W
 
W
Q
 
H
T
 
V
D
 
S
N
|
N
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
H
 
H
D
 
N
T
 
R
I
 
-
L
 
F
S
 
D
W
 
Y
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
R
 
M
D
 
R
A
 
A
F
 
F
R
 
Q
D
 
K
W
 
W
L
 
C
R
 
K
E
 
K
R
 
R
Y
 
Y
S
 
K
K
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
G
 
D
A
 
A
L
 
V
N
 
N
A
 
E
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
T
V
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
A
M
 
Q
D
 
H
Y
 
M
A
 
N
D
 
D
F
 
F
D
 
S
Q
 
E
I
 
I
D
 
I
L
 
P
P
 
P
N
 
R
L
 
Y
T
 
I
V
 
G
T
 
D
E
 
G
P
 
N
-
 
F
-
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
G
H
 
K
L
 
L
M
 
L
A
 
D
F
 
Y
R
 
K
R
 
R
F
 
F
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Q
 
A
V
 
L
A
 
K
R
 
E
W
 
L
N
 
Y
A
 
I
A
 
A
Q
 
E
V
 
R
E
 
D
A
 
V
I
 
L
R
 
E
-
 
S
V
 
I
H
 
T
S
 
P
D
 
G
A
 
L
P
 
P
I
 
L
S
 
T
H
 
T
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
M
T
 
L
E
 
D
F
 
Y
D
 
D
H
 
-
Y
 
-
D
 
D
L
 
W
G
 
G
R
 
A
Q
 
E
M
 
V
E
 
D
I
 
F
A
 
V
T
 
S
W
 
N
D
|
D
S
 
H
Y
|
Y
P
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
F
P
 
T
D
 
P
G
 
G
D
 
E
A
 
A
Q
 
H
A
 
F
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
D
F
 
E
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
H
 
A
H
 
A
D
 
S
L
 
L
Y
 
M
R
 
D
A
 
G
V
 
I
A
 
S
A
 
R
Q
 
K
A
 
E
P
 
P
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
W
W
 
F
V
 
Q
M
 
M
E
|
E
Q
 
H
Q
 
S
P
 
T
G
 
S
P
 
A
V
 
V
N
 
N
W
|
W
A
 
R
P
 
P
H
 
I
N
 
N
P
 
Y
A
 
R
P
 
A
L
 
E
P
 
P
G
 
G
M
 
S
V
 
V
R
 
V
L
 
R
W
 
D
T
 
S
W
 
L
E
 
A
A
 
Q
F
 
V
A
 
A
H
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
Y
 
Y
F
|
F
R
 
Q
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
K
F
 
A
A
 
G
Q
 
A
E
|
E
S
 
K
H
 
W
H
|
H
A
 
S
G
 
S
L
 
M
L
 
V
R
 
P
P
 
H
D
 
A
A
 
G
E
 
E
P
 
D
A
 
S
P
 
Q
G
 
I
L
 
F
A
 
R
E
 
D
A
 
V
R
 
C
A
 
E
V
 
L
A
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
G
D
 
R
A
 
L
P
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
G
V
 
T
A
 
K
S
 
T
A
 
V
Q
 
K
A
 
S
P
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
E
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
W
 
T
E
 
E
V
 
Y
Q
 
T
P
 
A
Q
 
N
-
 
P
G
 
T
K
 
Q
G
 
Q
F
 
V
D
 
D
H
 
H
F
 
W
A
 
T
L
 
E
A
 
P
F
 
L
H
 
D
L
 
W
Y
 
F
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
S
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
I
G
 
T
V
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
V
D
 
R
A
 
S
P
 
-
S
 
D
L
 
W
D
 
D
G
 
S
Y
 
Y
A
 
E
L
 
I
T
 
A
L
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
C
L
 
V
M
 
Y
T
 
L
L
 
L
G
 
S
S
 
E
A
 
E
L
 
T
R
 
S
G
 
R
A
 
R
I
 
V
E
 
R
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
A
A
 
N
P
 
G
G
 
G
I
 
K
V
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
T
P
 
Y
R
 
Y
T
 
T
D
 
G
L
 
L
R
 
-
G
 
-
P
 
S
D
 
D
L
 
E
A
 
N
M
 
D
H
 
H
V
 
I
P
 
W
L
 
L
G
 
G
P
 
G
H
 
Y
L
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
S
-
 
I
-
 
R
D
 
D
V
 
V
T
 
V
A
 
G
T
 
V
L
 
R
V
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
F
P
 
A
P
 
P
H
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
M
G
 
G
G
 
N
A
 
D
L
 
M
T
 
P
L
 
G
W
 
A
L
 
L
E
 
D
H
 
H
L
 
L
E
 
D
T
 
L
D
 
D
A
 
N
A
 
G
I
 
T
V
 
V
E
 
A
H
 
H

Sites not aligning to the query:

4uzsA Crystal structure of bifidobacterium bifidum beta-galactosidase (see paper)
30% identity, 86% coverage: 9:557/642 of query aligns to 24:552/687 of 4uzsA

query
sites
4uzsA
Y
 
Y
Y
 
N
P
 
P
E
 
D
H
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
E
D
 
E
R
 
V
W
 
W
A
 
D
T
 
D
D
 
D
A
 
I
T
 
R
M
 
L
M
 
M
A
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
N
W
 
L
V
 
V
R
 
S
I
 
V
G
 
G
E
 
I
F
 
F
A
 
S
W
 
W
S
 
A
R
 
K
L
 
I
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
E
G
 
G
E
 
K
L
 
Y
R
 
D
F
 
F
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
x
D
R
 
R
A
 
A
I
 
I
D
|
D
T
 
K
L
 
L
R
 
G
G
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
K
 
A
I
 
V
V
 
D
L
 
L
G
 
A
T
 
S
P
 
A
S
 
T
A
 
A
T
 
S
P
 
P
P
 
P
H
 
M
W
 
W
M
 
L
L
 
T
D
 
Q
R
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
E
M
 
V
L
 
L
A
 
W
V
 
K
D
 
D
A
 
E
E
 
R
G
 
G
R
 
D
P
 
T
R
 
V
K
 
W
F
 
P
G
 
G
S
 
A
R
 
R
R
 
E
H
 
H
Y
 
W
C
 
R
F
 
P
S
 
T
H
 
S
V
 
P
P
 
V
Y
 
F
R
 
R
D
 
E
E
 
Y
A
 
A
A
 
L
R
 
N
M
 
L
A
 
C
R
 
R
L
 
R
L
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
H
F
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
x
N
P
 
P
D
x
Y
V
 
V
D
 
V
A
 
A
W
 
W
Q
 
H
T
 
V
D
 
S
N
 
N
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
H
 
H
D
 
N
T
 
R
I
 
-
L
 
F
S
 
D
W
 
Y
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
R
 
M
D
 
R
A
 
A
F
 
F
R
 
Q
D
 
K
W
 
W
L
 
C
R
 
K
E
 
K
R
 
R
Y
 
Y
S
 
K
K
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
G
 
D
A
 
A
L
 
V
N
 
N
A
 
E
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
T
V
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
A
M
 
Q
D
 
H
Y
 
M
A
 
N
D
 
D
F
 
F
D
 
S
Q
 
E
I
 
I
D
 
I
L
 
P
P
 
P
N
 
R
L
 
Y
T
 
I
V
 
G
T
 
D
E
 
G
P
 
N
-
 
F
-
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
G
H
 
K
L
 
L
M
 
L
A
 
D
F
 
Y
R
 
K
R
 
R
F
 
F
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Q
 
A
V
 
L
A
 
K
R
 
E
W
 
L
N
 
Y
A
 
I
A
 
A
Q
 
E
V
 
R
E
 
D
A
 
V
I
 
L
R
 
E
-
 
S
V
 
I
H
 
T
S
 
P
D
 
G
A
 
L
P
 
P
I
 
L
S
 
T
H
 
T
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
M
T
 
L
E
 
D
F
 
Y
D
 
D
H
 
-
Y
 
-
D
 
D
L
 
W
G
 
G
R
 
A
Q
 
E
M
 
V
E
 
D
I
 
F
A
 
V
T
 
S
W
 
N
D
 
D
S
 
H
Y
 
Y
P
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
F
P
 
T
D
 
P
G
 
G
D
 
E
A
 
A
Q
 
H
A
 
F
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
D
F
 
E
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
H
 
A
H
 
A
D
 
S
L
 
L
Y
 
M
R
 
D
A
 
G
V
 
I
A
 
S
A
 
R
Q
 
K
A
 
E
P
 
P
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
W
W
 
F
V
 
Q
M
 
M
E
 
E
Q
 
H
Q
 
S
P
 
T
G
 
S
P
 
A
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
R
P
 
P
H
 
I
N
 
N
P
 
Y
A
 
R
P
 
A
L
 
E
P
 
P
G
 
G
M
 
S
V
 
V
R
 
V
L
 
R
W
 
D
T
 
S
W
 
L
E
 
A
A
 
Q
F
 
V
A
 
A
H
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
K
F
 
A
A
 
G
Q
 
A
E
 
E
S
 
K
H
 
W
H
 
H
A
 
S
G
 
S
L
 
M
L
 
V
R
 
P
P
 
H
D
 
A
A
 
G
E
 
E
P
 
D
A
 
S
P
 
Q
G
 
I
L
 
F
A
 
R
E
 
D
A
 
V
R
 
C
A
 
E
V
 
L
A
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
G
D
 
R
A
 
L
P
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
G
V
 
T
A
 
K
S
 
T
A
 
V
Q
 
K
A
 
S
P
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
E
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
W
 
T
E
 
E
V
 
Y
Q
 
T
P
 
A
Q
 
N
-
 
P
G
 
T
K
 
Q
G
 
Q
F
 
V
D
 
D
H
 
H
F
 
W
A
 
T
L
 
E
A
 
P
F
 
L
H
 
D
L
 
W
Y
 
F
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
S
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
I
G
 
T
V
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
V
D
 
R
A
 
S
P
 
-
S
 
D
L
 
W
D
 
D
G
 
S
Y
 
Y
A
 
E
L
 
I
T
 
A
L
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
C
L
 
V
M
 
Y
T
 
L
L
 
L
G
 
S
S
 
E
A
 
E
L
 
T
R
 
S
G
 
R
A
 
R
I
 
V
E
 
R
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
A
A
 
N
P
 
G
G
 
G
I
 
K
V
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
T
P
 
Y
R
 
Y
T
 
T
D
 
G
L
 
L
R
 
-
G
 
-
P
 
S
D
 
D
L
 
E
A
 
N
M
 
D
H
 
H
V
 
I
P
 
W
L
 
L
G
 
G
P
 
G
H
 
Y
L
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
S
-
 
I
-
 
R
D
 
D
V
 
V
T
 
V
A
x
G
T
x
V
L
x
R
V
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
F
P
 
A
P
 
P
H
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
M
G
 
G
G
 
N
A
 
D
L
 
M
T
 
P
L
 
G
W
 
A
L
 
L
E
 
D
H
 
H
L
 
L
E
 
D
T
 
L
D
 
D
A
 
N
A
 
G
I
 
T
V
 
V
E
 
A
H
 
H

Sites not aligning to the query:

8ibtA Crystal structure of gh42 beta-galactosidase bibga42a from bifidobacterium longum subspecies infantis e318s mutant in complex with lacto-n-tetraose (see paper)
30% identity, 88% coverage: 9:575/642 of query aligns to 25:568/694 of 8ibtA

query
sites
8ibtA
Y
 
Y
Y
 
N
P
 
P
E
 
D
H
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
E
D
 
E
R
 
V
W
 
W
A
 
D
T
 
E
D
 
D
A
 
V
T
 
A
M
 
L
M
 
M
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
N
W
 
L
V
 
V
R
 
S
I
 
V
G
 
A
E
 
I
F
 
F
A
 
S
W
 
W
S
 
A
R
 
K
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
E
G
 
G
E
 
V
L
 
Y
R
 
D
F
 
F
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
R
A
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
K
L
 
L
R
 
G
G
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
K
 
A
I
 
V
V
 
D
L
 
L
G
 
A
T
 
S
P
 
G
S
 
T
A
 
A
T
 
S
P
 
P
P
 
P
H
 
M
W
 
W
M
 
M
L
 
T
D
 
Q
R
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
E
M
 
I
L
 
L
A
 
W
V
 
V
D
 
D
A
 
Y
E
 
R
G
 
G
R
 
D
P
 
V
R
 
C
K
 
Q
F
 
P
G
 
G
S
 
A
R
|
R
R
 
Q
H
 
H
Y
 
W
C
 
R
F
 
A
S
 
T
H
 
S
V
 
P
P
 
V
Y
 
F
R
 
L
D
 
D
E
 
Y
A
 
A
A
 
L
R
 
N
M
 
L
A
 
C
R
 
R
L
 
K
L
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
H
F
 
Y
P
 
K
D
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
Y
V
 
V
D
 
V
A
 
S
W
 
W
Q
 
H
T
 
V
D
 
S
N
 
N
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
H
 
H
D
 
N
T
 
R
I
 
-
L
 
F
S
 
D
W
 
Y
S
 
S
D
 
E
A
 
D
A
 
A
R
 
E
D
 
R
A
 
A
F
 
F
R
 
Q
D
 
K
W
 
W
L
 
C
R
 
E
E
 
K
R
 
K
Y
 
Y
S
 
G
K
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
G
 
D
A
 
A
L
 
V
N
 
N
A
 
D
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
T
V
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
A
M
 
Q
D
 
R
Y
 
M
A
 
N
D
 
N
F
 
F
D
 
S
Q
 
E
I
 
I
D
 
I
L
 
P
P
 
P
N
 
R
L
 
F
T
 
I
V
 
G
T
 
D
E
 
G
P
 
N
-
 
F
-
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
G
H
 
K
L
 
L
M
 
L
A
 
D
F
 
W
R
 
K
R
 
R
F
 
F
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Q
 
A
V
 
L
A
 
L
R
 
D
W
 
F
N
 
Y
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
V
 
R
E
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
L
V
 
E
H
 
I
S
 
A
D
 
P
A
 
K
P
 
P
I
 
Q
S
 
T
H
 
T
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
-
 
V
-
 
S
G
 
A
R
 
G
I
 
C
T
 
T
E
 
V
F
 
L
D
 
D
H
 
Y
Y
 
D
D
 
K
L
 
W
G
 
G
R
 
H
Q
 
D
M
 
V
E
 
D
I
 
F
A
 
V
T
 
S
W
 
N
D
 
D
S
 
H
Y
|
Y
P
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
F
P
 
S
D
 
P
G
 
G
D
 
E
A
 
A
Q
 
H
A
 
F
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
D
F
 
E
Q
 
M
A
 
A
F
 
Y
H
 
A
H
 
A
D
 
C
L
 
L
Y
 
T
R
 
D
A
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
R
Q
 
K
A
 
N
P
 
P
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
W
W
 
F
V
 
L
M
 
M
E
 
S
Q
 
H
Q
 
S
P
 
T
G
 
S
P
 
A
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
R
P
 
P
H
 
T
N
 
N
P
 
Y
A
 
R
P
 
L
L
 
E
P
 
P
G
 
G
M
 
E
V
 
L
R
 
V
L
 
R
W
 
D
T
 
S
W
 
L
E
 
A
A
 
H
F
 
L
A
 
A
H
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
Y
 
Y
F
|
F
R
 
Q
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
K
F
 
A
A
 
G
Q
 
A
E
|
E
S
 
K
H
 
W
H
 
H
A
 
S
G
 
A
L
 
M
L
 
V
-
 
P
-
 
H
-
 
A
R
 
G
P
 
P
D
 
D
A
 
S
E
 
Q
P
 
I
A
 
F
P
 
R
G
 
D
L
 
V
A
 
C
E
 
E
A
 
L
R
 
G
A
 
A
V
 
D
A
 
L
A
 
N
E
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
E
P
 
G
D
 
L
V
 
L
A
 
S
S
 
T
-
 
K
-
 
L
A
 
V
Q
 
K
A
 
S
P
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
E
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
W
 
T
E
 
E
-
 
H
V
 
T
Q
 
A
P
 
T
Q
 
P
G
 
T
K
 
Q
G
 
E
F
 
V
D
 
R
H
 
H
F
 
W
A
 
T
L
 
E
A
 
P
F
 
L
H
 
D
L
 
W
Y
 
F
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
S
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
V
D
 
R
A
 
G
P
 
P
S
 
-
L
 
W
D
 
D
G
 
E
Y
 
Y
A
 
E
L
 
A
T
 
V
L
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
S
L
 
L
M
 
A
T
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
E
A
 
Q
L
 
T
R
 
T
G
 
R
A
 
R
I
 
V
E
 
R
E
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
A
 
N
P
 
G
G
 
G
I
 
K
V
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
T
P
 
Y
R
 
Y
T
 
T
D
 
G
L
 
L
R
 
-
G
 
-
P
 
V
D
 
D
L
 
D
A
 
R
M
 
D
H
 
H
V
 
V
P
 
W
L
 
L
G
 
G
P
 
G
H
 
Y
L
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
S
-
 
I
-
 
R
D
 
D
V
 
V
T
 
V
A
 
G
T
 
V
L
 
R
V
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
F
P
 
A
P
 
P
H
 
M
A
 
G
P
 
T
R
 
D
A
 
A
L
 
P
R
 
G
R
 
T
G
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
M
E
 
D
H
 
H
L
 
L
E
 
D
T
 
L
D
 
D
A
 
N
A
 
G
I
 
T
V
 
V
E
 
A
H
 
H
T
 
-
T
 
-
D
 
D
G
 
F
L
 
A
P
 
D
A
 
V
L
 
I
V
 
T
R
 
S
S
 
V
G
 
A
N
 
D
R
 
T
A
 
A
H
 
H
L
 
V
A
 
V

8ibsA Crystal structure of gh42 beta-galactosidase bibga42a from bifidobacterium longum subspecies infantis e160a/e318a mutant in complex with galactose (see paper)
30% identity, 88% coverage: 9:575/642 of query aligns to 25:568/691 of 8ibsA

query
sites
8ibsA
Y
 
Y
Y
 
N
P
 
P
E
 
D
H
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
E
D
 
E
R
 
V
W
 
W
A
 
D
T
 
E
D
 
D
A
 
V
T
 
A
M
 
L
M
 
M
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
N
W
 
L
V
 
V
R
 
S
I
 
V
G
 
A
E
 
I
F
 
F
A
 
S
W
 
W
S
 
A
R
 
K
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
E
G
 
G
E
 
V
L
 
Y
R
 
D
F
 
F
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
R
A
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
K
L
 
L
R
 
G
G
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
K
 
A
I
 
V
V
 
D
L
 
L
G
 
A
T
 
S
P
 
G
S
 
T
A
 
A
T
 
S
P
 
P
P
 
P
H
 
M
W
 
W
M
 
M
L
 
T
D
 
Q
R
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
E
M
 
I
L
 
L
A
 
W
V
 
V
D
 
D
A
 
Y
E
 
R
G
 
G
R
 
D
P
 
V
R
 
C
K
 
Q
F
 
P
G
 
G
S
 
A
R
|
R
R
 
Q
H
 
H
Y
 
W
C
 
R
F
 
A
S
 
T
H
 
S
V
 
P
P
 
V
Y
 
F
R
 
L
D
 
D
E
 
Y
A
 
A
A
 
L
R
 
N
M
 
L
A
 
C
R
 
R
L
 
K
L
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
H
F
 
Y
P
 
K
D
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
Y
V
 
V
D
 
V
A
 
S
W
 
W
Q
 
H
T
 
V
D
 
S
N
|
N
E
 
A
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
H
 
H
D
 
N
T
 
R
I
 
-
L
 
F
S
 
D
W
 
Y
S
 
S
D
 
E
A
 
D
A
 
A
R
 
E
D
 
R
A
 
A
F
 
F
R
 
Q
D
 
K
W
 
W
L
 
C
R
 
E
E
 
K
R
 
K
Y
 
Y
S
 
G
K
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
G
 
D
A
 
A
L
 
V
N
 
N
A
 
D
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
T
V
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
A
M
 
Q
D
 
R
Y
 
M
A
 
N
D
 
N
F
 
F
D
 
S
Q
 
E
I
 
I
D
 
I
L
 
P
P
 
P
N
 
R
L
 
F
T
 
I
V
 
G
T
 
D
E
 
G
P
 
N
-
 
F
-
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
G
H
 
K
L
 
L
M
 
L
A
 
D
F
 
W
R
 
K
R
 
R
F
 
F
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Q
 
A
V
 
L
A
 
L
R
 
D
W
 
F
N
 
Y
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
V
 
R
E
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
L
V
 
E
H
 
I
S
 
A
D
 
P
A
 
K
P
 
P
I
 
Q
S
 
T
H
 
T
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
-
 
V
-
 
S
G
 
A
R
 
G
I
 
C
T
 
T
E
 
V
F
 
L
D
 
D
H
 
Y
Y
 
D
D
 
K
L
 
W
G
 
G
R
 
H
Q
 
D
M
 
V
E
 
D
I
 
F
A
 
V
T
 
S
W
 
N
D
|
D
S
 
H
Y
|
Y
P
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
F
P
 
S
D
 
P
G
 
G
D
 
E
A
 
A
Q
 
H
A
 
F
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
D
F
 
E
Q
 
M
A
 
A
F
 
Y
H
 
A
H
 
A
D
 
C
L
 
L
Y
 
T
R
 
D
A
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
R
Q
 
K
A
 
N
P
 
P
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
W
W
 
F
V
 
L
M
 
M
E
 
A
Q
 
H
Q
 
S
P
 
T
G
 
S
P
 
A
V
 
V
N
 
N
W
|
W
A
 
R
P
 
P
H
 
T
N
 
N
P
 
Y
A
 
R
P
 
L
L
 
E
P
 
P
G
 
G
M
 
E
V
 
L
R
 
V
L
 
R
W
 
D
T
 
S
W
 
L
E
 
A
A
 
H
F
 
L
A
 
A
H
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
Y
 
Y
F
|
F
R
 
Q
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
K
F
 
A
A
 
G
Q
 
A
E
|
E
S
 
K
H
 
W
H
|
H
A
 
S
G
 
A
L
 
M
L
 
V
-
 
P
-
 
H
-
 
A
R
 
G
P
 
P
D
 
D
A
 
S
E
 
Q
P
 
I
A
 
F
P
 
R
G
 
D
L
 
V
A
 
C
E
 
E
A
 
L
R
 
G
A
 
A
V
 
D
A
 
L
A
 
N
E
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
E
P
 
G
D
 
L
V
 
L
A
 
S
S
 
T
-
 
K
-
 
L
A
 
V
Q
 
K
A
 
S
P
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
E
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
W
 
T
E
 
E
-
 
H
V
 
T
Q
 
A
P
 
T
Q
 
P
G
 
T
K
 
Q
G
 
E
F
 
V
D
 
R
H
 
H
F
 
W
A
 
T
L
 
E
A
 
P
F
 
L
H
 
D
L
 
W
Y
 
F
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
S
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
V
D
 
R
A
 
G
P
 
P
S
 
-
L
 
W
D
 
D
G
 
E
Y
 
Y
A
 
E
L
 
A
T
 
V
L
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
S
L
 
L
M
 
A
T
 
I
L
 
L
G
 
S
S
 
E
A
 
Q
L
 
T
R
 
T
G
 
R
A
 
R
I
 
V
E
 
R
E
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
A
 
N
P
 
G
G
 
G
I
 
K
V
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
T
P
 
Y
R
 
Y
T
 
T
D
 
G
L
 
L
R
 
-
G
 
-
P
 
V
D
 
D
L
 
D
A
 
R
M
 
D
H
 
H
V
 
V
P
 
W
L
 
L
G
 
G
P
 
G
H
 
Y
L
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
S
-
 
I
-
 
R
D
 
D
V
 
V
T
 
V
A
 
G
T
 
V
L
 
R
V
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
F
P
 
A
P
 
P
H
 
M
A
 
G
P
 
T
R
 
D
A
 
A
L
 
P
R
 
G
R
 
T
G
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
M
E
 
D
H
 
H
L
 
L
E
 
D
T
 
L
D
 
D
A
 
N
A
 
G
I
 
T
V
 
V
E
 
A
H
 
H
T
 
-
T
 
-
D
 
D
G
 
F
L
 
A
P
 
D
A
 
V
L
 
I
V
 
T
R
 
S
S
 
V
G
 
A
N
 
D
R
 
T
A
 
A
H
 
H
L
 
V
A
 
V

4uniA Beta-(1,6)-galactosidase from bifidobacterium animalis subsp. Lactis bl-04 in complex with galactose (see paper)
28% identity, 80% coverage: 5:517/642 of query aligns to 19:539/689 of 4uniA

query
sites
4uniA
L
 
F
G
 
G
V
 
A
C
 
D
Y
 
Y
Y
 
N
P
 
P
E
 
D
H
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
E
D
 
D
R
 
V
W
 
Q
A
 
D
T
 
E
D
 
D
A
 
I
T
 
R
M
 
L
M
 
M
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
N
W
 
I
V
 
V
R
 
S
I
 
L
G
 
A
E
 
I
F
|
F
A
 
S
W
 
W
S
 
A
R
 
N
L
 
I
E
 
E
P
 
T
A
 
S
P
 
D
G
 
G
E
 
N
L
 
F
R
 
E
F
 
F
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
R
A
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
K
L
 
L
R
 
Y
G
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
K
 
A
I
 
V
V
 
D
L
 
L
G
 
A
T
 
S
P
 
A
S
 
T
A
 
A
T
 
S
P
 
P
P
 
P
H
 
M
W
 
W
M
 
L
L
 
T
D
 
S
R
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
E
M
 
V
L
 
L
A
 
R
V
 
R
D
 
D
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
R
 
H
P
 
V
R
 
I
K
 
W
F
 
P
G
 
G
S
 
A
R
|
R
R
 
Q
H
 
H
Y
 
W
C
 
R
F
 
P
S
 
T
H
 
S
V
 
P
P
 
T
Y
 
F
R
 
R
D
 
T
E
 
Y
A
 
A
A
 
L
R
 
R
M
 
L
A
 
C
R
 
R
L
 
E
L
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
H
F
 
Y
P
 
K
D
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
A
V
 
I
D
 
V
A
 
S
W
 
W
Q
 
H
T
 
V
D
 
G
N
|
N
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
H
 
H
D
 
N
T
 
-
I
 
Y
L
 
F
S
 
D
W
 
Y
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
R
 
V
D
 
Q
A
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
E
W
 
W
L
 
C
R
 
R
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
K
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
G
 
D
A
 
K
L
 
V
N
 
N
A
 
A
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
T
V
 
N
F
 
F
W
 
W
S
 
S
M
 
Q
D
 
R
Y
 
L
A
 
N
D
 
S
F
 
F
D
 
E
Q
 
E
I
 
I
D
 
L
L
 
P
P
 
P
N
 
R
L
 
Y
T
 
V
V
 
G
T
 
G
E
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
F
P
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
G
H
 
R
L
 
L
M
 
L
A
 
D
F
 
F
R
 
K
R
 
H
F
 
F
S
 
C
S
 
S
D
 
D
Q
 
A
V
 
L
A
 
K
R
 
E
W
 
F
N
 
F
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
V
 
R
E
 
D
A
 
V
I
 
L
-
 
S
R
 
E
V
 
V
H
 
T
S
 
P
D
 
N
A
 
I
P
 
P
I
 
L
S
 
T
H
 
T
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
G
 
V
R
 
S
I
 
A
T
 
S
E
 
Q
-
 
N
-
 
T
F
 
L
D
 
D
H
 
Y
Y
 
D
D
 
D
L
 
W
G
 
A
R
 
H
Q
 
E
M
 
V
E
 
D
I
 
F
A
 
V
T
 
S
W
 
N
D
 
D
S
 
H
Y
|
Y
-
 
F
-
 
T
P
 
P
L
 
G
G
 
S
F
 
W
L
 
H
L
 
I
D
 
D
R
 
E
V
 
L
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
A
F
 
Y
H
 
S
H
 
A
D
 
S
L
 
L
Y
 
V
R
 
D
A
 
G
V
 
I
A
 
S
A
 
R
Q
 
K
A
 
K
P
 
P
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
W
W
 
F
V
 
L
M
 
M
E
|
E
Q
 
Q
Q
 
S
P
 
T
G
 
S
P
 
A
V
 
V
N
 
N
W
|
W
A
 
R
P
 
E
H
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
R
P
 
K
L
 
E
P
 
P
G
 
G
M
 
E
V
 
L
R
 
I
L
 
R
W
 
D
T
 
S
W
 
M
E
 
L
A
 
H
F
 
L
A
 
A
H
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
Y
 
Y
F
|
F
R
 
Q
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
R
F
 
S
A
 
G
Q
 
A
E
|
E
S
 
K
H
 
F
H
|
H
A
 
S
G
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
P
P
 
L
D
 
A
A
 
G
E
 
E
P
 
H
A
 
S
P
 
Q
G
 
I
L
 
Y
A
 
R
E
 
D
A
 
V
R
 
C
A
 
A
V
 
L
A
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
D
D
 
T
A
 
L
P
 
S
D
 
D
V
 
A
A
 
G
S
 
I
-
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
L
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
P
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
F
 
Q
D
 
D
Y
 
I
A
 
Q
S
 
S
Q
 
E
W
 
W
A
 
A
W
 
T
E
 
E
-
 
H
V
 
T
Q
 
A
P
 
T
Q
 
P
G
 
T
K
 
Q
G
 
H
F
 
I
D
 
R
H
 
E
F
 
W
A
 
T
L
 
E
A
 
P
F
 
L
H
 
D
L
 
W
Y
 
F
R
 
A
A
 
A
L
 
F
R
 
A
S
 
N
L
 
R
G
 
G
L
 
V
G
 
T
V
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
T
P
 
P
P
 
I
D
 
H
A
 
A
P
 
-
S
 
Q
L
 
W
D
 
D
G
 
T
Y
 
Y
A
 
D
L
 
A
T
 
V
L
 
V
I
 
I
P
 
P
S
 
C
L
 
V
M
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
E
T
 
E
L
 
M
G
 
A
S
 
E
A
 
R
L
 
L
R
 
R
G
 
T
A
 
F
I
 
V
E
 
R
E
 
N
A
 
G
P
 
G
G
 
K
I
 
A
V
 
F
L
 
V
T
 
T
-
 
Y
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
W
-
 
P
G
 
G
P
 
L
R
 
I
T
 
G
D
 
D
L
 
V
R
 
V
G
 
G
P
 
V
D
 
R
L
 
I
A
 
E
M
 
E
H
 
H
V
 
C
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
T
H
 
L
L
 
F
P
 
P
G
 
G
L
 
M

O31529 Beta-galactosidase YesZ; Beta-gal; Probable rhamnogalacturonan beta-galactosidase; EC 3.2.1.23 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
28% identity, 87% coverage: 6:564/642 of query aligns to 7:547/663 of O31529

query
sites
O31529
G
 
G
V
 
A
C
 
C
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
H
 
L
W
 
W
P
 
D
E
 
E
D
 
E
R
 
T
W
 
I
A
 
Q
T
 
Q
D
 
D
A
 
I
T
 
D
M
 
I
M
 
M
A
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
V
T
 
N
W
 
V
V
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
E
F
 
F
A
 
A
W
 
W
S
 
S
R
 
V
L
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
E
G
 
G
E
 
K
L
 
I
R
 
D
F
 
V
D
 
G
W
 
F
L
 
F
A
 
K
R
 
E
A
 
I
I
 
I
D
 
A
T
 
R
L
 
L
R
 
Y
G
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
I
K
 
E
I
 
T
V
 
I
L
 
M
G
 
C
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
P
T
 
T
P
 
P
P
 
P
H
 
I
W
 
W
M
 
F
L
 
S
D
 
H
R
 
G
H
 
R
P
 
P
D
 
E
M
 
R
L
 
M
A
 
H
V
 
A
D
 
N
A
 
E
E
 
K
G
 
R
R
 
E
P
 
I
R
 
M
K
 
G
F
 
H
G
 
G
S
 
S
R
 
R
R
 
Q
H
 
H
Y
 
A
C
 
C
F
 
T
S
 
N
H
 
N
V
 
P
P
 
Y
Y
 
F
R
 
R
D
 
K
E
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
I
M
 
I
A
 
T
R
 
T
L
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
G
R
 
R
F
 
L
P
 
P
D
 
G
V
 
L
D
 
I
A
 
G
W
 
W
Q
 
Q
T
 
L
D
 
D
N
 
N
E
|
E
Y
 
F
G
 
K
C
 
C
H
 
H
D
 
V
T
 
A
I
 
E
L
 
C
S
 
M
W
 
C
S
 
E
D
 
T
A
 
C
A
 
L
R
 
R
D
 
-
A
 
L
F
 
W
R
 
H
D
 
D
W
 
W
L
 
L
R
 
K
E
 
N
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
K
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
V
I
 
I
G
 
E
A
 
R
L
 
L
N
 
N
A
 
E
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
T
V
 
D
F
 
V
W
 
W
S
 
S
M
 
E
D
 
T
Y
 
Y
A
 
Q
D
 
T
F
 
F
D
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
P
L
 
Q
P
 
P
N
 
G
L
 
P
T
 
A
V
 
P
T
 
F
E
 
L
P
 
H
N
 
H
P
 
A
A
 
S
H
 
L
L
 
R
M
 
T
A
 
M
F
 
Y
R
 
Q
R
 
L
F
 
F
S
 
S
S
 
M
D
 
E
Q
 
M
V
 
I
A
 
A
R
 
S
W
 
F
N
 
A
A
 
D
A
 
E
Q
 
Q
V
 
A
E
 
K
A
 
I
I
 
I
R
 
R
V
 
C
H
 
Y
S
 
S
D
 
D
A
 
A
P
 
P
I
 
I
S
 
T
H
 
H
N
 
N
Y
 
-
M
 
-
G
 
G
R
 
S
I
 
V
T
 
M
-
 
F
E
 
S
F
 
V
D
 
D
H
 
N
Y
 
E
D
 
R
L
 
M
G
 
F
R
 
Q
Q
 
N
M
 
L
E
 
D
I
 
F
A
 
A
T
 
S
W
 
Y
D
 
D
S
 
T
Y
 
Y
P
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
A
P
 
S
D
 
Q
G
 
E
D
 
N
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
-
F
 
L
H
 
N
H
 
C
D
 
D
L
 
L
Y
 
W
R
 
R
A
 
N
V
 
L
A
 
K
A
 
Q
Q
 
G
A
 
R
P
 
P
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
F
W
 
W
V
 
I
M
 
L
E
 
E
Q
 
T
Q
 
S
P
 
P
G
 
S
P
 
Y
V
 
A
N
 
A
W
 
S
A
 
L
P
 
E
H
 
S
N
 
S
P
 
A
A
 
Y
P
 
P
-
 
H
L
 
A
P
 
D
G
 
G
M
 
Y
V
 
L
R
 
Q
L
 
A
W
 
E
T
 
A
W
 
V
E
 
S
A
 
S
F
 
Y
A
 
A
H
 
L
G
 
G
A
 
S
E
 
Q
A
 
G
V
 
F
C
 
C
Y
 
Y
F
 
W
R
 
L
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
Q
P
 
R
F
 
S
A
 
G
Q
 
S
E
 
E
S
 
I
H
 
S
H
 
H
A
 
G
G
 
S
L
 
V
L
 
L
R
 
S
P
 
A
D
 
W
A
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
T
P
 
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
Q
E
 
N
A
 
V
R
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
E
-
 
R
A
 
A
E
 
R
L
 
K
A
 
E
D
 
I
A
 
E
P
 
P
D
 
I
V
 
I
A
 
L
S
 
S
-
 
T
-
 
E
-
 
P
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
P
 
E
V
 
A
A
 
A
L
 
M
V
 
T
F
 
Y
D
 
S
Y
 
D
A
 
R
S
 
A
Q
 
K
W
 
A
A
 
F
W
 
I
E
 
K
V
 
T
Q
 
E
P
 
P
Q
 
H
G
 
-
K
 
R
G
 
G
F
 
L
D
 
R
H
 
H
F
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
V
F
 
T
H
 
H
L
 
F
Y
 
Y
R
 
E
A
 
R
L
 
I
R
 
L
S
 
N
L
 
T
G
 
G
L
 
I
G
 
H
V
 
R
D
 
D
I
 
L
L
 
I
P
 
P
P
 
E
D
 
G
A
 
A
P
 
P
S
 
-
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
A
 
R
L
 
L
T
 
L
L
 
F
I
 
T
P
 
P
S
 
F
L
 
V
M
 
P
T
 
Y
L
 
L
G
 
S
S
 
S
A
 
E
L
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
K
R
 
A
G
 
S
A
 
A
I
 
F
E
 
A
E
 
E
A
 
A
P
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
W
L
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
R
 
L
T
 
T
D
 
G
L
 
G
R
 
R
G
 
T
P
 
C
D
 
E
L
 
H
A
 
T
M
 
I
H
 
H
V
 
T
P
 
D
L
 
C
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
L
P
 
E
H
 
K
L
 
T
P
 
S
G
 
G
L
 
I
D
 
K
V
 
T
T
 
L
A
 
F
T
 
T
L
 
F
V
 
P
E
 
M
T
 
N
L
 
E
P
 
N
P
 
V
H
 
N
A
 
T
P
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
F
R
 
G
R
 
I
G
 
T
G
 
A
A
 
P
L
 
L
T
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
S
E
 
A
H
 
V
L
 
F
E
 
D
T
 
T
D
 
E
A
 
S
A
 
G
I
 
N
V
 
T
E
 
L
H
 
G
T
 
T
T
 
V
D
 
E
G
 
A
L
 
G
P
 
P
A
 
G

4uozA Beta-(1,6)-galactosidase from bifidobacterium animalis subsp. Lactis bl-04 nucleophile mutant e324a in complex with galactose (see paper)
28% identity, 80% coverage: 5:517/642 of query aligns to 18:538/688 of 4uozA

query
sites
4uozA
L
 
F
G
 
G
V
 
A
C
 
D
Y
 
Y
Y
 
N
P
 
P
E
 
D
H
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
E
D
 
D
R
 
V
W
 
Q
A
 
D
T
 
E
D
 
D
A
 
I
T
 
R
M
 
L
M
 
M
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
N
W
 
I
V
 
V
R
 
S
I
 
L
G
 
A
E
 
I
F
 
F
A
 
S
W
 
W
S
 
A
R
 
N
L
 
I
E
 
E
P
 
T
A
 
S
P
 
D
G
 
G
E
 
N
L
 
F
R
 
E
F
 
F
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
R
A
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
K
L
 
L
R
 
Y
G
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
K
 
A
I
 
V
V
 
D
L
 
L
G
 
A
T
 
S
P
 
A
S
 
T
A
 
A
T
 
S
P
 
P
P
 
P
H
 
M
W
 
W
M
 
L
L
 
T
D
 
S
R
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
E
M
 
V
L
 
L
A
 
R
V
 
R
D
 
D
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
R
 
H
P
 
V
R
 
I
K
 
W
F
 
P
G
 
G
S
 
A
R
|
R
R
 
Q
H
 
H
Y
 
W
C
 
R
F
 
P
S
 
T
H
 
S
V
 
P
P
 
T
Y
 
F
R
 
R
D
 
T
E
 
Y
A
 
A
A
 
L
R
 
R
M
 
L
A
 
C
R
 
R
L
 
E
L
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
H
F
 
Y
P
 
K
D
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
A
V
 
I
D
 
V
A
 
S
W
 
W
Q
 
H
T
 
V
D
 
G
N
|
N
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
H
 
H
D
 
N
T
 
-
I
 
Y
L
 
F
S
 
D
W
 
Y
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
R
 
V
D
 
Q
A
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
E
W
 
W
L
 
C
R
 
R
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
K
 
T
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
I
G
 
D
A
 
K
L
 
V
N
 
N
A
 
A
H
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
T
V
 
N
F
 
F
W
 
W
S
 
S
M
 
Q
D
 
R
Y
 
L
A
 
N
D
 
S
F
 
F
D
 
E
Q
 
E
I
 
I
D
 
L
L
 
P
P
 
P
N
 
R
L
 
Y
T
 
V
V
 
G
T
 
G
E
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
F
P
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
G
H
 
R
L
 
L
M
 
L
A
 
D
F
 
F
R
 
K
R
 
H
F
 
F
S
 
C
S
 
S
D
 
D
Q
 
A
V
 
L
A
 
K
R
 
E
W
 
F
N
 
F
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
V
 
R
E
 
D
A
 
V
I
 
L
-
 
S
R
 
E
V
 
V
H
 
T
S
 
P
D
 
N
A
 
I
P
 
P
I
 
L
S
 
T
H
 
T
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
G
 
V
R
 
S
I
 
A
T
 
S
E
 
Q
-
 
N
-
 
T
F
 
L
D
 
D
H
 
Y
Y
 
D
D
 
D
L
 
W
G
 
A
R
 
H
Q
 
E
M
 
V
E
 
D
I
 
F
A
 
V
T
 
S
W
 
N
D
|
D
S
 
H
Y
|
Y
-
 
F
-
 
T
P
 
P
L
 
G
G
 
S
F
 
W
L
 
H
L
 
I
D
 
D
R
 
E
V
 
L
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
A
F
 
Y
H
 
S
H
 
A
D
 
S
L
 
L
Y
 
V
R
 
D
A
 
G
V
 
I
A
 
S
A
 
R
Q
 
K
A
 
K
P
 
P
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
W
W
 
F
V
 
L
M
 
M
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
S
P
 
T
G
 
S
P
 
A
V
 
V
N
 
N
W
|
W
A
 
R
P
 
E
H
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
R
P
 
K
L
 
E
P
 
P
G
 
G
M
 
E
V
 
L
R
 
I
L
 
R
W
 
D
T
 
S
W
 
M
E
 
L
A
 
H
F
 
L
A
 
A
H
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
Y
 
Y
F
|
F
R
 
Q
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
A
 
S
P
 
R
F
 
S
A
 
G
Q
 
A
E
|
E
S
 
K
H
 
F
H
|
H
A
 
S
G
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
P
P
 
L
D
 
A
A
 
G
E
 
E
P
 
H
A
 
S
P
 
Q
G
 
I
L
 
Y
A
 
R
E
 
D
A
 
V
R
 
C
A
 
A
V
 
L
A
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
D
D
 
T
A
 
L
P
 
S
D
 
D
V
 
A
A
 
G
S
 
I
-
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
L
A
 
S
Q
 
K
A
 
A
P
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
F
 
Q
D
 
D
Y
 
I
A
 
Q
S
 
S
Q
 
E
W
 
W
A
 
A
W
 
T
E
 
E
-
 
H
V
 
T
Q
 
A
P
 
T
Q
 
P
G
 
T
K
 
Q
G
 
H
F
 
I
D
 
R
H
 
E
F
 
W
A
 
T
L
 
E
A
 
P
F
 
L
H
 
D
L
 
W
Y
 
F
R
 
A
A
 
A
L
 
F
R
 
A
S
 
N
L
 
R
G
 
G
L
 
V
G
 
T
V
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
T
P
 
P
P
 
I
D
 
H
A
 
A
P
 
-
S
 
Q
L
 
W
D
 
D
G
 
T
Y
 
Y
A
 
D
L
 
A
T
 
V
L
 
V
I
 
I
P
 
P
S
 
C
L
 
V
M
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
E
T
 
E
L
 
M
G
 
A
S
 
E
A
 
R
L
 
L
R
 
R
G
 
T
A
 
F
I
 
V
E
 
R
E
 
N
A
 
G
P
 
G
G
 
K
I
 
A
V
 
F
L
 
V
T
 
T
-
 
Y
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
W
-
 
P
G
 
G
P
 
L
R
 
I
T
 
G
D
 
D
L
 
V
R
 
V
G
 
G
P
 
V
D
 
R
L
 
I
A
 
E
M
 
E
H
 
H
V
 
C
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
T
H
 
L
L
 
F
P
 
P
G
 
G
L
 
M

5dfaA 3d structure of the e323a catalytic mutant of gan42b, a gh42 beta- galactosidase from g. Stearothermophilus (see paper)
29% identity, 64% coverage: 9:422/642 of query aligns to 20:423/685 of 5dfaA

query
sites
5dfaA
Y
 
Y
Y
 
N
P
 
P
E
 
D
H
 
Q
W
 
W
P
 
L
E
 
D
-
 
R
-
 
P
D
 
D
R
 
I
W
 
L
A
 
Q
T
 
A
D
 
D
A
 
L
T
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
K
E
 
L
A
 
S
G
 
H
L
 
T
T
 
N
W
 
T
V
 
F
R
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
V
F
 
F
A
 
A
W
 
W
S
 
S
R
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
E
G
 
G
E
 
V
L
 
Y
R
 
R
F
 
F
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
D
R
 
K
A
 
V
I
 
F
D
 
D
T
 
D
L
 
I
R
 
Y
G
 
R
A
 
I
G
 
G
L
 
G
K
 
R
I
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
A
T
 
T
P
 
P
S
 
S
A
 
G
T
 
A
P
 
R
P
 
P
H
 
A
W
 
W
M
 
L
L
 
S
D
 
Q
R
 
K
H
 
Y
P
 
P
D
 
E
M
 
V
L
 
L
A
 
R
V
 
V
D
 
N
A
 
A
E
 
A
G
 
R
R
 
V
P
 
R
R
 
Q
K
 
L
F
 
H
G
 
G
S
 
G
R
 
R
R
 
H
H
 
N
Y
 
H
C
|
C
F
 
F
S
 
T
H
 
S
V
 
S
P
 
V
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
K
A
 
T
A
 
Q
R
 
H
M
 
I
A
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
-
 
G
-
 
D
-
 
H
P
 
P
D
 
A
V
 
L
D
 
L
A
 
M
W
 
W
Q
 
H
T
 
V
D
 
S
N
 
N
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
-
 
G
-
 
E
C
|
C
H
 
H
D
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
W
 
-
S
x
C
D
 
N
A
 
L
A
x
C
R
 
Q
D
 
E
A
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
E
W
 
W
L
 
L
R
 
K
E
 
K
R
 
K
Y
 
Y
S
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
N
D
 
H
P
 
D
I
 
L
G
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
H
 
A
W
 
W
G
 
W
N
 
T
V
 
S
F
 
F
W
 
W
S
 
S
M
 
H
D
 
T
Y
 
Y
A
 
T
D
 
D
F
 
W
D
 
S
Q
 
Q
I
 
I
D
 
E
L
 
S
P
 
P
N
 
S
L
 
P
T
 
I
V
 
G
T
 
E
E
 
H
P
 
T
N
 
I
P
 
H
A
 
G
H
 
L
L
 
N
M
 
L
A
 
D
F
 
W
R
 
K
R
 
R
F
 
F
S
 
V
S
 
T
D
 
D
Q
 
Q
V
 
T
A
 
I
R
 
S
W
 
F
N
 
F
A
 
E
A
 
N
Q
 
E
V
 
I
E
 
V
A
 
P
I
 
L
R
 
R
-
 
E
V
 
L
H
 
T
S
 
P
D
 
H
A
 
I
P
 
P
I
 
I
S
 
T
H
 
T
N
 
N
Y
 
F
M
 
M
G
 
A
R
 
D
I
 
T
T
 
H
E
 
D
-
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
Q
-
 
G
F
 
L
D
 
D
H
 
Y
Y
 
S
D
 
K
L
 
F
G
 
A
R
 
K
Q
 
H
M
 
L
E
 
D
I
 
V
A
 
I
T
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
A
Y
 
Y
P
 
P
L
 
A
G
 
W
F
 
H
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
N
D
 
D
G
 
W
D
 
E
A
 
S
Q
 
T
A
 
A
Y
 
D
L
 
L
R
 
A
Q
 
M
G
 
K
D
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
Q
 
V
A
 
G
F
 
F
H
 
I
H
 
N
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
A
 
S
V
 
L
A
 
K
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
P
P
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
F
W
 
L
V
 
L
M
 
M
E
 
A
Q
 
C
Q
 
T
P
 
P
G
 
S
P
 
L
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
H
P
 
K
H
 
V
N
 
N
P
 
K
A
 
A
P
 
K
L
 
R
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
H
R
 
F
L
 
L
W
 
S
T
 
S
W
 
M
E
 
Q
A
 
M
F
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
S
E
 
D
A
 
S
V
 
I
C
 
L
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
W
 
W
R
 
R
Q
 
K
A
 
S
P
 
R
F
 
G
A
 
S
Q
 
F
E
 
E
S
 
K
H
 
F
H
 
H
A
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
V
R
 
D
P
 
H
D
 
D
A
 
N
E
 
R
P
 
T
-
 
D
A
 
S
P
 
R
G
 
V
L
 
F
A
 
Q
E
 
E
A
 
V
R
 
A
A
 
E
V
 
V
A
 
G
A
 
K
E
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
K
A
 
M
P
 
S
D
 
G
V
 
I
A
 
V
S
 
G
A
 
T
Q
 
N
A
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
L
F
 
Y
D
 
D
Y
 
W
A
 
E
S
 
N
Q
 
N
W
 
W
A
 
A

Query Sequence

>WP_043920531.1 NCBI__GCF_000877395.1:WP_043920531.1
MKRTLGVCYYPEHWPEDRWATDATMMAEAGLTWVRIGEFAWSRLEPAPGELRFDWLARAI
DTLRGAGLKIVLGTPSATPPHWMLDRHPDMLAVDAEGRPRKFGSRRHYCFSHVPYRDEAA
RMARLLAERFPDVDAWQTDNEYGCHDTILSWSDAARDAFRDWLRERYSKAGANDPIGALN
AHWGNVFWSMDYADFDQIDLPNLTVTEPNPAHLMAFRRFSSDQVARWNAAQVEAIRVHSD
APISHNYMGRITEFDHYDLGRQMEIATWDSYPLGFLLDRVPDGDAQAYLRQGDPDFQAFH
HDLYRAVAAQAPGDAPPRWWVMEQQPGPVNWAPHNPAPLPGMVRLWTWEAFAHGAEAVCY
FRWRQAPFAQESHHAGLLRPDAEPAPGLAEARAVAAELADAPDVASAQAPVALVFDYASQ
WAWEVQPQGKGFDHFALAFHLYRALRSLGLGVDILPPDAPSLDGYALTLIPSLMTLGSAL
RGAIEEAPGIVLTGPRTDLRGPDLAMHVPLGPHLPGLDVTATLVETLPPHAPRALRRGGA
LTLWLEHLETDAAIVEHTTDGLPALVRSGNRAHLAGWPDMEAARRILRDLATEAGLDPID
MPEGVRRRGTATETFLFNYAAEDREFAGHRLPPAGVLRLPDA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory