SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_044620841.1 NCBI__GCF_000940995.1:WP_044620841.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3v77A Crystal structure of a putative fumarylacetoacetate isomerase/hydrolase from oleispira antarctica (see paper)
35% identity, 91% coverage: 15:200/205 of query aligns to 17:219/224 of 3v77A

query
sites
3v77A
K
 
K
V
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
A
Y
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
N
N
 
N
E
 
P
V
 
I
P
 
P
D
 
S
E
 
S
M
 
P
V
 
I
L
 
L
F
 
F
T
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
A
S
 
S
A
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
P
I
 
F
S
 
G
E
 
P
V
 
V
L
 
F
L
 
S
S
 
I
S
 
P
H
 
K
R
 
D
G
 
Q
D
 
G
E
 
S
L
 
V
H
 
H
Y
 
H
E
 
E
A
 
L
E
|
E
L
 
I
S
 
A
F
 
I
L
 
L
Y
 
I
R
 
G
N
 
K
G
 
A
R
 
L
F
 
S
D
 
R
A
 
A
-
 
S
-
 
T
-
 
E
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
A
-
 
G
V
 
I
A
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
L
D
|
D
L
 
L
T
 
T
K
 
L
R
 
R
R
 
D
V
 
V
Q
 
Q
S
 
D
K
 
Q
L
 
L
K
 
K
E
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
H
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
R
S
 
A
K
 
K
A
 
S
F
 
F
D
 
D
G
 
G
S
 
A
A
 
C
L
 
P
F
 
L
S
 
T
E
 
E
F
 
F
V
 
V
P
 
A
L
 
V
P
 
N
P
 
L
S
 
A
E
 
S
R
 
E
G
 
D
E
 
E
-
 
W
-
 
Q
-
 
A
L
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
F
 
E
I
 
K
N
 
N
D
 
G
K
 
Q
L
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
G
S
 
S
T
 
S
S
 
A
L
 
E
M
 
M
I
 
L
Y
 
F
S
 
P
P
 
I
D
 
L
V
 
P
V
 
L
L
 
I
Q
 
A
E
x
H
V
 
M
Q
 
S
T
 
E
F
x
H
M
 
F
S
 
S
L
 
L
N
 
Q
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
I
M
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
P
V
 
L
Q
 
E
A
 
V
G
 
G
S
 
D
Q
 
S
F
 
L
E
 
S
A
 
A
Q
 
K
V
 
L
T
 
S
A
 
L
G
 
E
E
 
D
E
 
N
V
 
V
I
 
L
V
 
L
S
 
T
T
 
C

P76004 Oxaloacetate tautomerase YcgM; EC 5.3.2.2 from Escherichia coli (strain K12)
38% identity, 84% coverage: 14:186/205 of query aligns to 17:205/219 of P76004

query
sites
P76004
N
 
S
K
 
K
V
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
S
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
K
H
 
H
I
 
I
Y
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
G
N
 
S
E
 
A
V
 
V
P
 
P
D
 
E
E
 
E
M
 
P
V
 
V
L
 
L
F
 
F
T
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
E
S
 
T
A
 
A
I
 
L
S
 
C
E
 
D
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
P
V
 
L
L
 
A
L
 
I
S
 
P
S
 
S
H
 
D
R
 
F
G
 
G
D
 
-
E
 
S
L
 
V
H
 
H
Y
 
H
E
|
E
A
 
V
E
|
E
L
 
L
S
 
A
F
 
V
L
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
E
-
 
E
Y
 
H
R
 
V
N
 
R
G
 
K
R
 
A
F
 
I
D
 
A
A
 
G
V
 
Y
A
 
G
V
 
V
G
 
A
L
 
L
D
|
D
L
 
L
T
 
T
K
 
L
R
 
R
R
 
D
V
 
V
Q
 
Q
S
 
G
K
 
K
L
 
M
K
 
K
E
 
K
K
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
K
S
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
D
 
D
G
 
N
S
 
S
A
 
C
L
 
P
F
 
L
S
 
S
E
 
G
F
 
F
V
 
I
P
 
P
L
 
A
P
 
A
-
 
E
-
 
F
P
 
T
S
 
G
E
 
D
R
 
P
G
 
Q
E
 
N
L
 
T
G
 
T
L
 
L
R
 
S
L
 
L
F
 
S
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
Q
T
 
R
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
G
S
 
T
T
 
T
S
 
A
L
 
D
M
 
M
I
 
I
Y
 
H
S
 
K
P
 
I
D
 
V
V
 
P
V
 
L
L
 
I
Q
 
A
E
 
Y
V
 
M
Q
 
S
T
 
K
F
 
F
M
 
F
S
 
T
L
 
L
N
 
K
D
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
V
M
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
P
V
 
L
Q
 
Q
A
 
S
G
 
G
S
 
D
Q
 
E
F
 
L

Q6P587 Oxaloacetate tautomerase FAHD1, mitochondrial; Acylpyruvase FAHD1; Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 1; FAH domain-containing protein 1; Oxaloacetate decarboxylase; OAA decarboxylase; ODx; YisK-like protein; EC 5.3.2.2; EC 3.7.1.5; EC 4.1.1.112 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
39% identity, 85% coverage: 16:190/205 of query aligns to 17:206/221 of Q6P587

query
sites
Q6P587
V
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
R
|
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
R
E
|
E
L
 
M
G
 
R
N
 
S
E
 
A
V
 
V
P
 
L
D
 
S
E
 
E
M
 
P
V
 
V
L
 
L
F
 
F
T
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
S
S
 
T
A
 
A
I
 
Y
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
G
S
 
S
E
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
M
S
 
P
S
 
A
H
 
Y
R
 
T
G
 
R
D
 
N
E
 
-
L
 
L
H
 
H
Y
 
H
E
|
E
A
 
L
E
|
E
L
 
L
S
 
G
F
 
V
L
 
V
Y
 
M
R
 
-
N
 
G
G
 
K
R
 
R
F
 
C
D
 
R
A
 
A
V
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
M
-
 
D
-
 
Y
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
C
L
 
L
D
|
D
L
x
M
T
|
T
K
x
A
R
|
R
R
 
D
V
 
V
Q
 
Q
S
 
D
K
 
E
L
 
C
K
 
K
E
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
E
 
T
R
 
L
S
 
A
K
|
K
A
 
S
F
 
F
D
 
T
G
 
A
S
 
S
A
 
C
L
 
P
F
 
V
S
 
S
E
 
A
F
 
F
V
 
V
P
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
K
L
 
I
P
 
P
P
 
D
S
 
P
E
 
H
R
 
K
G
 
-
E
 
-
L
 
L
G
 
K
L
 
L
R
 
W
L
 
L
F
 
K
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
E
G
 
G
S
 
E
T
 
T
S
 
S
L
 
S
M
 
M
I
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
I
D
 
P
V
 
Y
V
 
I
L
 
I
Q
 
S
E
 
Y
V
 
V
Q
 
S
T
 
K
F
 
I
M
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
I
M
 
L
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
P
V
 
V
Q
 
K
A
 
E
G
 
N
S
 
D
Q
 
E
F
 
I
E
 
E
A
 
A
Q
 
G
V
 
I

6fogA X-ray structure of homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate at 1.94a resolution. (see paper)
39% identity, 85% coverage: 16:190/205 of query aligns to 15:204/218 of 6fogA

query
sites
6fogA
V
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
|
G
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
 
H
I
 
V
Y
 
R
E
 
E
L
 
M
G
 
R
N
 
S
E
 
A
V
 
V
P
 
L
D
 
S
E
 
E
M
 
P
V
 
V
L
 
L
F
 
F
T
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
S
S
 
T
A
 
A
I
 
Y
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
G
S
 
S
E
 
P
V
 
I
L
 
L
L
 
M
S
 
P
S
 
A
H
 
Y
R
 
T
G
 
R
D
 
N
E
 
-
L
 
L
H
 
H
Y
 
H
E
|
E
A
 
L
E
|
E
L
 
L
S
 
G
F
 
V
L
 
V
Y
 
M
R
 
-
N
 
G
G
 
K
R
 
R
F
 
C
D
 
R
A
 
A
V
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
M
-
 
D
-
 
Y
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
C
L
 
L
D
|
D
L
 
M
T
 
T
K
 
A
R
 
R
R
 
D
V
 
V
Q
 
Q
S
 
D
K
 
E
L
 
C
K
 
K
E
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
E
 
T
R
 
L
S
 
A
K
 
K
A
 
S
F
 
F
D
 
T
G
 
A
S
 
S
A
 
C
L
 
P
F
 
V
S
 
S
E
 
A
F
 
F
V
 
V
P
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
K
L
 
I
P
 
P
P
 
D
S
 
P
E
 
H
R
 
K
G
 
-
E
 
-
L
 
L
G
 
K
L
 
L
R
 
W
L
 
L
F
 
K
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
E
G
 
G
S
 
E
T
 
T
S
 
S
L
 
S
M
 
M
I
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
I
D
 
P
V
 
Y
V
 
I
L
 
I
Q
 
S
E
 
Y
V
 
V
Q
 
S
T
 
K
F
 
I
M
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
I
M
 
L
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
P
V
 
V
Q
 
K
A
 
E
G
 
N
S
 
D
Q
 
E
F
 
I
E
 
E
A
 
A
Q
 
G
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Q8R0F8 Oxaloacetate tautomerase FAHD1, mitochondrial; Acylpyruvase FAHD1; Acylpyruvate hydrolase; ApH; Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 1; Oxaloacetate decarboxylase; OAA decarboxylase; ODx; EC 5.3.2.2; EC 3.7.1.5; EC 4.1.1.112 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
38% identity, 85% coverage: 16:190/205 of query aligns to 17:206/221 of Q8R0F8

query
sites
Q8R0F8
V
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
R
|
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
 
H
I
 
V
Y
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
R
N
 
S
E
 
T
V
 
V
P
 
L
D
 
S
E
 
E
M
 
P
V
 
V
L
 
L
F
 
F
T
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
S
S
 
T
A
 
A
I
 
Y
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
G
S
 
S
E
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
M
S
 
P
S
 
A
H
 
Y
R
 
C
G
 
R
D
 
N
E
 
-
L
 
L
H
 
H
Y
 
H
E
|
E
A
 
V
E
|
E
L
 
L
S
 
G
F
 
V
L
 
L
Y
 
L
R
 
-
N
 
G
G
 
K
R
 
R
F
 
G
D
 
E
A
 
A
V
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
M
-
 
D
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
C
L
 
L
D
|
D
L
 
M
T
 
T
K
 
A
R
 
R
R
 
D
V
 
V
Q
 
Q
S
 
E
K
 
E
L
 
C
K
 
K
E
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
E
 
T
R
 
L
S
 
A
K
|
K
A
 
S
F
 
F
D
 
T
G
 
S
S
 
S
A
 
C
L
 
P
F
 
V
S
 
S
E
 
A
F
 
F
V
 
V
P
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
K
L
 
I
P
 
P
P
 
-
S
 
-
E
 
D
R
 
P
G
 
H
E
 
A
L
 
L
G
 
R
L
 
L
R
 
W
L
 
L
F
 
K
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
E
G
 
G
S
 
K
T
 
T
S
 
S
L
 
S
M
 
M
I
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
I
D
 
P
V
 
Y
V
 
I
L
 
I
Q
 
S
E
 
Y
V
 
V
Q
 
S
T
 
K
F
 
I
M
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
I
M
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
P
V
 
I
Q
 
K
A
 
E
G
 
N
S
 
D
Q
 
E
F
 
I
E
 
E
A
 
A
Q
 
G
V
 
I

6sbiA X-ray structure of murine fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate (see paper)
38% identity, 85% coverage: 16:190/205 of query aligns to 14:203/216 of 6sbiA

query
sites
6sbiA
V
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
|
G
R
|
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
R
N
 
S
E
 
T
V
 
V
P
 
L
D
 
S
E
 
E
M
 
P
V
 
V
L
 
L
F
 
F
T
 
L
K
 
K
P
 
P
N
x
S
S
 
T
A
 
A
I
 
Y
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
G
S
 
S
E
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
M
S
 
P
S
 
A
H
 
Y
R
 
C
G
 
R
D
 
N
E
 
-
L
 
L
H
 
H
Y
 
H
E
|
E
A
 
V
E
|
E
L
 
L
S
 
G
F
 
V
L
 
L
Y
 
L
R
 
-
N
 
G
G
 
K
R
 
R
F
 
G
D
 
E
A
 
A
V
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
M
-
 
D
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
C
L
 
L
D
|
D
L
 
M
T
 
T
K
 
A
R
 
R
R
 
D
V
 
V
Q
 
Q
S
 
E
K
 
E
L
 
C
K
 
K
E
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
E
 
T
R
 
L
S
 
A
K
|
K
A
 
S
F
 
F
D
 
T
G
 
S
S
 
S
A
 
C
L
 
P
F
 
V
S
 
S
E
 
A
F
 
F
V
 
V
P
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
K
L
 
I
P
 
P
P
 
-
S
 
-
E
 
D
R
 
P
G
 
H
E
 
A
L
 
L
G
 
R
L
 
L
R
 
W
L
 
L
F
 
K
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
E
G
 
G
S
 
K
T
 
T
S
 
S
L
 
S
M
 
M
I
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
I
D
 
P
V
 
Y
V
 
I
L
 
I
Q
 
S
E
 
Y
V
 
V
Q
 
S
T
 
K
F
 
I
M
 
I
S
x
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
I
M
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
V
|
V
G
 
G
K
 
P
V
 
I
Q
 
K
A
 
E
G
 
N
S
 
D
Q
 
E
F
 
I
E
 
E
A
 
A
Q
 
G
V
 
I

1nkqA Crystal structure of yeast ynq8, a fumarylacetoacetate hydrolase family protein
32% identity, 92% coverage: 15:202/205 of query aligns to 10:234/247 of 1nkqA

query
sites
1nkqA
K
 
K
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
Y
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
N
N
 
N
E
 
Q
V
 
P
P
 
-
D
 
-
E
 
-
M
 
-
V
 
F
L
 
F
F
 
F
T
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
T
S
 
S
A
 
S
I
 
I
S
 
V
E
 
T
V
 
P
L
 
L
L
 
S
S
 
S
S
 
S
H
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
T
-
 
F
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
I
-
 
F
-
 
I
-
 
P
R
 
R
G
 
G
D
 
V
E
 
K
L
 
V
H
 
H
Y
 
H
E
|
E
A
 
I
E
|
E
L
 
L
S
 
A
F
 
L
L
 
I
Y
 
V
R
 
S
N
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
Y
G
 
D
R
 
S
F
 
I
D
 
S
A
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
L
G
 
A
L
 
L
D
|
D
L
 
L
T
 
T
K
 
A
R
 
R
R
 
N
V
 
V
Q
 
Q
S
 
D
K
 
E
L
 
A
K
 
K
E
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
E
 
T
R
 
I
S
 
S
K
 
K
A
 
G
F
 
F
D
 
D
G
 
T
-
 
F
-
 
M
-
 
P
-
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
I
F
 
V
S
 
S
-
 
R
-
 
E
E
 
K
F
 
F
V
 
S
P
 
S
L
 
Y
P
 
K
P
 
S
S
 
N
E
 
L
R
 
Q
G
 
D
E
 
I
L
 
F
G
 
R
L
 
V
R
 
K
L
 
C
F
 
S
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
D
G
 
G
S
 
G
T
 
T
S
 
N
L
 
L
M
 
M
I
 
L
Y
 
H
S
 
P
P
 
L
D
 
H
V
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
Q
E
 
H
V
 
I
Q
 
S
T
 
T
F
 
M
M
 
I
S
 
S
L
 
L
N
 
E
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
I
M
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
E
V
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
G
S
 
D
Q
 
R
F
 
V
E
 
H
A
 
C
Q
 
E
V
 
L
T
 
L
A
 
Q
G
 
N
E
 
N
E
 
D
V
 
N
I
 
I
V
 
V
S
 
D
T
 
M
Q
 
N
W
 
F

6j5yA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from pseudomonas aeruginosa in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
34% identity, 84% coverage: 14:186/205 of query aligns to 24:216/233 of 6j5yA

query
sites
6j5yA
N
 
R
K
 
R
V
 
V
V
 
Y
C
 
C
V
 
V
G
|
G
R
|
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
A
H
|
H
I
 
A
Y
 
R
E
 
E
L
 
M
G
 
G
N
 
F
E
 
D
V
 
P
P
 
E
D
 
R
E
 
E
M
 
P
-
 
P
V
 
F
L
 
F
F
|
F
T
 
C
K
 
K
P
 
P
N
 
A
S
 
D
A
 
A
I
 
V
S
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
T
-
 
L
E
 
E
V
 
L
L
 
A
L
 
Y
S
 
P
S
 
S
H
 
Q
R
 
T
G
 
G
D
 
N
E
 
-
L
 
Y
H
 
H
Y
 
Y
E
|
E
A
 
I
E
|
E
L
 
L
S
 
V
F
 
A
L
 
A
Y
 
I
R
 
G
N
 
K
G
 
G
R
 
G
F
 
C
D
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
H
-
 
V
-
 
W
A
 
G
V
 
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
|
D
L
 
M
T
 
T
K
 
R
R
 
R
R
 
D
V
 
L
Q
 
Q
S
 
M
K
 
R
L
 
M
K
 
R
E
 
E
K
 
M
G
 
G
L
 
R
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
I
S
 
G
K
|
K
A
 
A
F
 
F
D
 
D
G
 
R
S
 
S
A
 
A
L
 
P
F
 
I
S
 
G
E
 
P
F
 
L
V
 
Y
P
 
P
L
 
A
P
 
-
P
 
-
S
 
S
E
 
Q
R
 
V
G
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
R
E
 
H
L
 
A
G
 
A
L
 
I
R
 
S
L
 
L
F
 
Q
I
 
V
N
 
D
D
 
G
K
 
E
L
 
D
T
 
R
Q
 
Q
S
 
R
G
 
S
S
 
D
T
 
I
S
 
D
L
 
Q
M
 
L
I
 
I
Y
 
W
S
 
S
P
 
V
D
 
A
V
 
E
V
 
T
L
 
V
Q
 
S
E
 
Y
V
 
L
Q
 
S
T
 
R
F
 
F
M
 
F
S
 
E
L
 
L
N
 
R
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
V
M
 
F
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
A
V
 
V
Q
 
E
A
 
R
G
 
G
S
 
E
Q
 
R
F
 
M

6j5xB Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
30% identity, 89% coverage: 4:186/205 of query aligns to 53:255/280 of 6j5xB

query
sites
6j5xB
V
 
V
I
 
T
V
 
F
E
 
E
N
 
N
K
 
K
A
 
E
V
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
P
T
 
A
P
 
P
N
 
K
K
 
K
V
 
I
V
 
V
C
 
C
V
|
V
G
|
G
R
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
N
H
|
H
I
 
I
Y
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
G
N
 
R
E
 
D
V
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
T
M
 
P
V
 
T
L
 
L
F
|
F
T
 
V
K
 
K
-
 
F
P
 
P
N
 
D
S
 
A
A
 
L
I
 
I
-
 
G
-
 
P
-
 
F
S
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
V
S
 
P
S
 
E
H
 
W
R
 
A
G
 
N
D
 
K
E
 
A
L
 
L
H
 
D
Y
 
W
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
M
S
 
A
F
 
V
L
 
I
Y
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
R
R
 
R
N
 
V
G
 
K
R
 
Q
F
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
A
-
 
E
-
 
Y
-
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
M
L
 
N
D
|
D
L
 
Y
T
 
T
K
 
T
R
 
R
R
 
D
V
 
F
Q
 
Q
S
 
Y
K
 
A
L
 
A
K
 
P
E
 
A
K
 
K
G
 
T
L
 
P
P
 
Q
W
|
W
E
 
H
R
 
Q
S
 
G
K
|
K
A
 
S
F
 
L
D
 
E
G
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
G
F
 
F
S
 
G
E
 
P
F
 
W
V
 
M
P
 
T
L
 
T
P
 
P
P
 
D
S
 
S
E
 
F
R
 
E
G
 
F
E
 
G
L
 
G
G
 
E
L
 
L
R
 
A
L
 
T
F
 
Y
I
 
L
N
 
E
D
 
G
K
 
E
L
 
K
T
 
V
Q
 
Q
S
 
S
G
 
T
S
 
P
T
 
T
S
 
N
L
 
D
M
 
L
I
 
V
Y
 
F
S
 
S
P
 
P
D
 
E
V
 
K
V
 
L
L
 
I
Q
 
E
E
 
Y
V
 
I
Q
 
T
T
 
H
F
 
I
M
 
Y
S
 
P
L
 
L
N
 
D
D
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
I
M
 
V
T
 
T
G
|
G
T
|
T
P
 
P
S
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
H
V
 
A
Q
 
R
A
 
N
G
 
P
S
 
Q
Q
 
R
F
 
Y

6j5xA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
30% identity, 89% coverage: 4:186/205 of query aligns to 53:255/280 of 6j5xA

query
sites
6j5xA
V
 
V
I
 
T
V
 
F
E
 
E
N
 
N
K
 
K
A
 
E
V
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
P
T
 
A
P
 
P
N
 
K
K
 
K
V
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
N
H
 
H
I
 
I
Y
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
G
N
 
R
E
 
D
V
 
L
P
 
P
D
 
D
E
 
T
M
 
P
V
 
T
L
 
L
F
 
F
T
 
V
K
 
K
-
 
F
P
 
P
N
 
D
S
 
A
A
 
L
I
 
I
-
 
G
-
 
P
-
 
F
S
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
V
S
 
P
S
 
E
H
 
W
R
 
A
G
 
N
D
 
K
E
 
A
L
 
L
H
 
D
Y
 
W
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
M
S
 
A
F
 
V
L
 
I
Y
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
R
R
 
R
N
 
V
G
 
K
R
 
Q
F
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
A
-
 
E
-
 
Y
-
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
M
L
 
N
D
|
D
L
 
Y
T
 
T
K
 
T
R
 
R
R
 
D
V
 
F
Q
 
Q
S
 
Y
K
 
A
L
 
A
K
 
P
E
 
A
K
 
K
G
 
T
L
 
P
P
 
Q
W
 
W
E
 
H
R
 
Q
S
 
G
K
 
K
A
 
S
F
 
L
D
 
E
G
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
G
F
 
F
S
 
G
E
 
P
F
 
W
V
 
M
P
 
T
L
 
T
P
 
P
P
 
D
S
 
S
E
 
F
R
 
E
G
 
F
E
 
G
L
 
G
G
 
E
L
 
L
R
 
A
L
 
T
F
 
Y
I
 
L
N
 
E
D
 
G
K
 
E
L
 
K
T
 
V
Q
 
Q
S
 
S
G
 
T
S
 
P
T
 
T
S
 
N
L
 
D
M
 
L
I
 
V
Y
 
F
S
 
S
P
 
P
D
 
E
V
 
K
V
 
L
L
 
I
Q
 
E
E
 
Y
V
 
I
Q
 
T
T
 
H
F
 
I
M
 
Y
S
 
P
L
 
L
N
 
D
D
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
I
M
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
H
V
 
A
Q
 
R
A
 
N
G
 
P
S
 
Q
Q
 
R
F
 
Y

6iymA Fumarylacetoacetate hydrolase (eafah) from psychrophilic exiguobacterium antarcticum (see paper)
31% identity, 81% coverage: 13:178/205 of query aligns to 68:245/277 of 6iymA

query
sites
6iymA
P
 
P
N
 
R
K
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
K
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
 
H
I
 
I
Y
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
D
N
 
T
E
 
A
V
 
G
P
 
A
D
 
G
E
 
K
M
 
F
V
 
V
L
 
L
F
 
F
T
 
T
K
 
K
P
 
A
N
 
P
S
 
S
A
 
S
I
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
F
S
 
D
E
 
P
V
 
I
L
 
E
L
 
R
S
 
H
S
 
A
H
 
D
R
 
L
G
 
T
D
 
Q
E
 
Q
L
 
L
H
 
D
Y
 
Y
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
L
S
 
A
F
 
I
L
 
I
Y
 
I
R
 
G
N
 
T
G
 
T
R
 
G
F
 
R
D
 
D
A
 
L
V
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
H
A
 
V
V
 
F
G
 
G
L
 
Y
D
 
S
L
 
I
T
 
I
K
 
N
R
x
D
R
 
V
V
 
T
Q
 
A
S
 
R
K
 
D
L
 
L
K
 
Q
E
 
K
K
 
E
G
 
H
L
 
V
P
 
Q
W
 
F
E
 
F
R
 
R
S
 
G
K
 
K
A
 
S
F
 
L
D
 
D
G
 
G
S
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
S
 
C
E
 
P
F
 
F
V
 
G
P
 
P
L
 
V
P
 
I
P
 
V
S
 
T
E
 
E
R
 
D
G
 
A
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
A
E
 
D
L
 
V
G
 
L
L
 
V
R
 
E
L
 
T
F
 
R
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
S
 
S
T
 
T
S
 
K
L
 
L
M
 
M
I
 
L
Y
 
R
S
 
D
P
 
V
D
 
V
V
 
T
V
 
I
L
 
L
Q
 
T
E
 
E
V
 
V
Q
 
S
T
 
R
F
 
G
M
 
M
S
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
I
M
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G

3qdfA Crystal structure of 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase from mycobacterium marinum (see paper)
31% identity, 83% coverage: 14:183/205 of query aligns to 62:230/252 of 3qdfA

query
sites
3qdfA
N
 
S
K
 
K
V
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
K
N
 
N
Y
 
Y
V
 
T
A
 
-
H
 
-
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
P
D
 
A
E
 
D
M
 
P
V
 
V
L
 
I
F
 
F
T
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
N
S
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
N
-
 
V
E
 
P
V
 
I
L
 
R
L
 
L
S
 
P
S
 
A
H
 
N
R
 
-
G
 
A
D
 
S
E
 
P
L
 
V
H
 
H
Y
 
F
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
L
S
 
A
F
 
I
L
 
V
Y
 
I
R
 
G
N
 
R
G
 
P
R
 
C
F
 
K
D
 
D
A
 
V
V
 
S
A
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
N
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
V
 
I
G
 
G
L
 
N
D
|
D
L
 
V
T
 
S
K
 
A
R
 
R
R
 
D
V
 
Q
Q
 
Q
S
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
K
E
 
S
K
 
D
G
 
G
L
 
Q
P
 
-
W
 
W
E
 
T
R
 
R
S
 
A
K
 
K
A
 
G
F
 
H
D
 
D
G
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
E
 
T
F
 
F
V
 
C
P
 
P
L
 
V
P
 
G
P
 
P
-
 
W
-
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
D
S
 
V
E
 
D
R
 
P
G
 
A
E
 
D
L
 
L
G
x
E
L
 
L
R
 
R
L
 
T
F
 
E
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
A
L
 
V
T
 
K
Q
 
Q
S
x
H
G
 
A
S
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
L
M
 
M
I
 
I
Y
 
H
S
 
D
P
 
V
D
 
G
V
 
A
V
 
I
L
 
V
Q
 
E
E
 
W
V
 
I
Q
 
S
T
 
A
F
 
V
M
 
M
S
 
T
L
 
L
N
 
L
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
I
M
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
P
V
 
I
Q
 
E
A
 
D
G
 
G

O06724 Oxaloacetate tautomerase YisK; Oxaloacetate decarboxylase YisK; EC 5.3.2.2; EC 4.1.1.112 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
31% identity, 81% coverage: 13:179/205 of query aligns to 90:272/301 of O06724

query
sites
O06724
P
 
P
N
 
S
K
 
K
-
 
N
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
I
G
 
G
R
x
K
N
 
N
Y
 
Y
V
 
R
A
 
D
H
 
H
I
 
A
Y
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
G
N
 
S
E
 
E
-
 
A
-
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
E
E
 
H
M
 
P
V
 
M
L
 
V
F
 
F
T
 
T
K
 
K
P
 
S
N
 
P
S
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
E
 
G
V
 
H
-
 
G
-
 
D
L
 
I
L
 
V
S
 
K
S
 
S
H
 
H
R
 
E
-
 
E
-
 
V
G
 
T
D
 
S
E
 
Q
L
 
L
H
 
D
Y
 
Y
E
|
E
A
x
G
E
|
E
L
 
L
S
 
A
F
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
R
L
 
I
Y
 
S
R
 
K
N
 
E
G
 
D
R
 
A
F
 
Y
D
 
D
A
 
H
V
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
A
 
T
V
 
I
G
 
V
L
 
N
D
|
D
L
 
I
T
 
T
K
 
A
R
 
R
R
 
D
V
 
L
Q
 
Q
S
 
K
K
 
R
L
 
H
K
 
K
E
 
Q
K
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
F
F
 
F
D
 
I
G
 
G
S
x
K
A
 
S
L
 
L
F
 
D
S
 
T
E
 
T
F
 
-
V
 
C
P
 
P
L
 
M
P
 
G
P
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
H
-
 
K
-
 
S
-
 
S
-
 
I
S
 
Q
E
 
E
R
 
P
G
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
V
R
 
E
L
 
T
F
 
R
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
S
 
S
T
 
A
S
 
S
L
 
D
M
 
M
I
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
I
D
 
P
V
 
E
V
 
L
L
 
I
Q
 
E
E
 
T
V
 
L
Q
 
S
T
 
K
F
 
G
M
 
M
S
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
I
M
 
A
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
K

Sites not aligning to the query:

8skyB Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with oxalate (see paper)
31% identity, 81% coverage: 13:179/205 of query aligns to 90:272/303 of 8skyB

query
sites
8skyB
P
 
P
N
 
S
K
 
K
-
 
N
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
x
I
G
|
G
R
 
K
N
 
N
Y
 
Y
V
 
R
A
 
D
H
|
H
I
 
A
Y
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
G
N
 
S
E
 
E
-
 
A
-
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
E
E
 
H
M
 
P
V
 
M
L
 
V
F
 
F
T
 
T
K
 
K
P
 
S
N
 
P
S
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
E
 
G
V
 
H
-
 
G
-
 
D
L
 
I
L
 
V
S
 
K
S
 
S
H
 
H
R
 
E
-
 
E
-
 
V
G
 
T
D
 
S
E
 
Q
L
 
L
H
 
D
Y
 
Y
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
L
S
 
A
F
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
R
L
 
I
Y
 
S
R
 
K
N
 
E
G
 
D
R
 
A
F
 
Y
D
 
D
A
 
H
V
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
A
 
T
V
 
I
G
 
V
L
 
N
D
|
D
L
 
I
T
 
T
K
 
A
R
 
R
R
 
D
V
 
L
Q
 
Q
S
 
K
K
 
R
L
 
H
K
 
K
E
 
Q
K
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
F
F
 
F
D
 
I
G
 
G
S
x
K
A
 
S
L
 
L
F
 
D
S
 
T
E
 
T
F
 
-
V
 
C
P
 
P
L
 
M
P
 
G
P
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
H
-
 
K
-
 
S
-
 
S
-
 
I
S
 
Q
E
 
E
R
 
P
G
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
V
R
 
E
L
 
T
F
 
R
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
S
 
S
T
 
A
S
 
S
L
 
D
M
 
M
I
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
I
D
 
P
V
 
E
V
 
L
L
 
I
Q
 
E
E
 
T
V
 
L
Q
 
S
T
 
K
F
 
G
M
 
M
S
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
I
M
 
A
T
 
T
G
|
G
T
|
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
K

8sutA Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with reaction product 4-hydroxy-2-oxoglutaric acid (see paper)
31% identity, 81% coverage: 13:179/205 of query aligns to 91:273/303 of 8sutA

query
sites
8sutA
P
 
P
N
 
S
K
 
K
-
 
N
V
 
I
V
 
I
C
 
C
V
x
I
G
|
G
R
x
K
N
 
N
Y
 
Y
V
 
R
A
 
D
H
|
H
I
 
A
Y
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
G
N
 
S
E
 
E
-
 
A
-
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
E
E
 
H
M
 
P
V
 
M
L
 
V
F
|
F
T
 
T
K
 
K
P
 
S
N
 
P
S
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
E
 
G
V
 
H
-
 
G
-
 
D
L
 
I
L
 
V
S
 
K
S
 
S
H
 
H
R
 
E
-
 
E
-
 
V
G
 
T
D
 
S
E
 
Q
L
 
L
H
 
D
Y
 
Y
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
L
S
 
A
F
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
R
L
 
I
Y
 
S
R
 
K
N
 
E
G
 
D
R
 
A
F
 
Y
D
 
D
A
 
H
V
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
A
 
T
V
 
I
G
 
V
L
 
N
D
|
D
L
 
I
T
 
T
K
 
A
R
|
R
R
 
D
V
 
L
Q
|
Q
S
 
K
K
 
R
L
 
H
K
 
K
E
 
Q
K
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
F
F
 
F
D
 
I
G
 
G
S
x
K
A
 
S
L
 
L
F
 
D
S
 
T
E
 
T
F
 
-
V
 
C
P
 
P
L
 
M
P
 
G
P
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
H
-
 
K
-
 
S
-
 
S
-
 
I
S
 
Q
E
 
E
R
 
P
G
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
V
R
 
E
L
 
T
F
 
R
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
S
 
S
T
 
A
S
 
S
L
 
D
M
 
M
I
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
I
D
 
P
V
 
E
V
 
L
L
 
I
Q
 
E
E
 
T
V
 
L
Q
 
S
T
 
K
F
 
G
M
 
M
S
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
I
M
 
A
T
 
T
G
|
G
T
|
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
K

6jvwB Crystal structure of maleylpyruvate hydrolase from sphingobium sp. Syk-6 in complex with manganese (ii) ion and pyruvate (see paper)
29% identity, 90% coverage: 4:187/205 of query aligns to 67:247/264 of 6jvwB

query
sites
6jvwB
V
 
V
I
 
S
V
 
L
E
 
E
N
 
T
K
 
P
A
 
V
V
 
P
T
 
W
P
 
P
N
 
N
K
 
K
V
 
I
V
 
I
C
 
A
V
 
Y
G
 
P
R
x
V
N
 
N
Y
 
Y
V
 
H
A
 
A
H
 
H
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
G
N
 
N
E
 
Q
V
 
G
P
 
-
D
 
-
E
 
-
M
 
-
V
 
-
L
 
F
F
|
F
T
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
G
S
 
S
A
 
A
I
 
L
S
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
T
-
 
D
E
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
P
S
 
A
H
 
V
R
 
P
G
 
G
D
 
R
E
 
E
L
 
V
H
 
H
Y
 
H
E
|
E
A
 
S
E
|
E
L
 
L
S
 
A
F
 
I
L
 
I
Y
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
C
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
A
R
 
R
N
 
E
G
 
D
R
 
W
F
 
K
D
 
D
A
 
V
V
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
V
 
C
G
 
L
L
 
L
D
|
D
L
 
M
T
 
V
K
 
V
R
 
R
-
 
G
R
 
R
V
 
V
Q
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
F
S
 
R
K
|
K
A
 
A
F
 
Y
D
 
D
G
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
E
 
T
F
 
F
V
 
C
P
 
P
L
 
V
P
 
G
P
 
P
-
 
W
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
V
S
 
N
E
 
D
R
 
P
G
 
A
E
 
T
L
 
L
G
 
D
L
 
M
R
 
K
L
 
L
F
 
W
I
 
V
N
 
N
D
 
D
K
 
D
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
K
G
 
A
S
 
N
T
 
T
S
 
R
L
 
D
M
 
L
I
 
V
Y
 
L
S
 
D
P
 
I
D
 
P
V
 
G
V
 
M
L
 
I
Q
 
A
E
 
T
V
 
A
Q
 
S
T
 
A
F
 
V
M
 
M
S
 
T
L
 
L
N
 
Q
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
I
M
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
P
V
 
V
Q
 
V
A
 
D
G
 
G
S
 
D
Q
 
R
F
 
I
E
 
R

Q1NEI7 2,4-didehydro-3-deoxy-L-rhamnonate hydrolase; L-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase; L-DKDR hydrolase; SpLRA6; EC 3.7.1.26 from Sphingomonas sp. (strain SKA58) (see paper)
29% identity, 80% coverage: 15:179/205 of query aligns to 67:244/285 of Q1NEI7

query
sites
Q1NEI7
K
 
K
V
 
I
V
 
V
C
 
A
V
 
I
G
 
G
R
x
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
E
A
 
D
H
|
H
I
 
A
Y
 
I
E
|
E
L
x
S
G
 
N
N
 
L
E
 
P
V
 
I
P
 
P
D
 
T
E
 
E
M
 
P
V
x
M
L
 
M
F
 
F
T
 
M
K
 
K
P
 
A
N
 
L
S
 
S
A
 
S
I
 
L
S
 
N
-
 
G
-
 
P
-
 
N
-
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
K
S
 
N
S
 
S
H
 
T
R
 
H
G
 
G
D
 
D
E
 
-
L
 
-
H
 
-
Y
 
W
E
|
E
A
 
V
E
|
E
L
 
L
S
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
C
-
 
R
F
 
F
L
 
V
Y
 
S
R
 
E
N
 
D
G
 
E
R
 
A
F
 
L
D
 
S
A
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
G
G
 
Y
L
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
N
D
|
D
L
 
V
T
 
S
K
 
E
R
|
R
R
 
F
V
 
N
Q
|
Q
S
 
-
K
 
-
L
 
-
K
|
K
E
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
T
P
 
Q
W
 
W
E
 
S
R
 
K
S
 
G
K
|
K
A
 
G
F
 
H
D
 
D
G
 
T
S
 
F
A
 
C
L
 
P
F
 
V
S
 
G
E
 
P
F
 
W
V
 
L
P
 
-
L
 
V
P
 
T
P
 
P
S
 
D
E
 
E
R
 
V
G
 
G
E
 
D
-
 
P
-
 
Q
-
 
D
L
 
L
G
 
D
L
 
M
R
 
H
L
 
L
F
 
N
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
T
L
 
R
T
 
M
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
N
T
 
T
S
 
K
L
 
T
M
 
M
I
 
I
Y
 
F
S
 
N
P
 
V
D
 
A
V
 
Q
V
 
L
L
 
I
Q
 
S
E
 
Y
V
 
V
Q
 
S
T
 
E
F
 
Y
M
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
Y
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
M
M
 
I
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
E

8gstC Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Pyruvate bound-form) (see paper)
29% identity, 80% coverage: 15:179/205 of query aligns to 72:249/290 of 8gstC

query
sites
8gstC
K
 
K
V
 
I
V
 
V
C
 
A
V
x
I
G
|
G
R
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
E
A
 
D
H
|
H
I
 
A
Y
 
I
E
 
E
L
 
S
G
 
N
N
 
L
E
 
P
V
 
I
P
 
P
D
 
T
E
 
E
M
 
P
V
 
M
L
 
M
F
 
F
T
 
M
K
 
K
P
 
A
N
 
L
S
 
S
A
 
S
I
 
L
S
 
N
-
 
G
-
 
P
-
 
N
-
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
K
S
 
N
S
 
S
H
 
T
R
 
H
G
 
G
D
 
D
E
 
-
L
 
-
H
 
-
Y
 
W
E
|
E
A
 
V
E
|
E
L
 
L
S
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
C
-
 
R
F
 
F
L
 
V
Y
 
S
R
 
E
N
 
D
G
 
E
R
 
A
F
 
L
D
 
S
A
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
G
G
 
Y
L
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
N
D
|
D
L
 
V
T
 
S
K
 
E
R
 
R
R
 
F
V
 
N
Q
 
Q
S
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
K
E
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
T
P
 
Q
W
 
W
E
 
S
R
 
K
S
 
G
K
|
K
A
 
G
F
 
H
D
 
D
G
 
T
S
 
F
A
 
C
L
 
P
F
 
V
S
 
G
E
 
P
F
 
W
V
 
L
P
 
-
L
 
V
P
 
T
P
 
P
S
 
D
E
 
E
R
 
V
G
 
G
E
 
D
-
 
P
-
 
Q
-
 
D
L
 
L
G
 
D
L
 
V
R
 
H
L
 
L
F
 
D
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
R
T
 
M
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
N
T
 
T
S
 
K
L
 
T
M
 
M
I
 
I
Y
 
F
S
 
N
P
 
V
D
 
A
V
 
Q
V
 
L
L
 
I
Q
 
S
E
 
Y
V
 
V
Q
 
S
T
 
E
F
 
Y
M
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
Y
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
M
M
 
I
T
 
T
G
|
G
T
 
T
P
 
P
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
E

8gsrA Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Apo-form) (see paper)
29% identity, 80% coverage: 15:179/205 of query aligns to 72:249/290 of 8gsrA

query
sites
8gsrA
K
 
K
V
 
I
V
 
V
C
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
E
A
 
D
H
 
H
I
 
A
Y
 
I
E
 
E
L
 
S
G
 
N
N
 
L
E
 
P
V
 
I
P
 
P
D
 
T
E
 
E
M
 
P
V
 
M
L
 
M
F
 
F
T
 
M
K
 
K
P
 
A
N
 
L
S
 
S
A
 
S
I
 
L
S
 
N
-
 
G
-
 
P
-
 
N
-
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
K
S
 
N
S
 
S
H
 
T
R
 
H
G
 
G
D
 
D
E
 
-
L
 
-
H
 
-
Y
 
W
E
|
E
A
 
V
E
|
E
L
 
L
S
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
C
-
 
R
F
 
F
L
 
V
Y
 
S
R
 
E
N
 
D
G
 
E
R
 
A
F
 
L
D
 
S
A
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
G
G
 
Y
L
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
N
D
|
D
L
 
V
T
 
S
K
 
E
R
 
R
R
 
F
V
 
N
Q
 
Q
S
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
K
E
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
T
P
 
Q
W
 
W
E
 
S
R
 
K
S
 
G
K
 
K
A
 
G
F
 
H
D
 
D
G
 
T
S
 
F
A
 
C
L
 
P
F
 
V
S
 
G
E
 
P
F
 
W
V
 
L
P
 
-
L
 
V
P
 
T
P
 
P
S
 
D
E
 
E
R
 
V
G
 
G
E
 
D
-
 
P
-
 
Q
-
 
D
L
 
L
G
 
D
L
 
V
R
 
H
L
 
L
F
 
D
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
R
T
 
M
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
N
T
 
T
S
 
K
L
 
T
M
 
M
I
 
I
Y
 
F
S
 
N
P
 
V
D
 
A
V
 
Q
V
 
L
L
 
I
Q
 
S
E
 
Y
V
 
V
Q
 
S
T
 
E
F
 
Y
M
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
Y
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
M
M
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
E

1gttA Crystal structure of hpce (see paper)
30% identity, 79% coverage: 16:177/205 of query aligns to 225:391/421 of 1gttA

query
sites
1gttA
V
 
L
V
 
F
C
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
 
H
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
P
D
 
E
E
 
E
M
 
P
V
 
L
L
 
V
F
 
F
T
 
L
K
 
K
-
 
A
P
 
P
N
 
N
S
 
T
A
 
L
I
 
T
-
 
G
-
 
D
S
 
N
E
 
Q
V
 
T
L
 
S
L
 
V
S
 
R
S
 
P
H
 
N
R
 
N
G
 
I
D
 
E
E
 
Y
L
 
M
H
 
H
Y
 
Y
E
|
E
A
 
A
E
|
E
L
 
L
S
 
V
F
 
V
L
 
V
Y
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
R
 
R
N
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
A
G
 
D
R
 
A
F
 
M
D
 
D
A
 
Y
V
 
V
A
 
A
V
 
G
G
 
Y
L
 
T
D
 
V
L
 
C
T
 
N
K
x
D
R
 
Y
R
 
A
V
 
I
Q
 
R
S
 
D
K
 
Y
L
 
L
K
 
E
E
 
N
K
 
Y
G
 
Y
L
 
R
P
 
P
W
 
N
E
 
L
R
 
R
S
 
V
K
 
K
A
 
S
F
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
L
S
 
T
A
 
P
L
 
M
F
 
L
S
 
S
E
 
T
F
 
I
V
 
V
P
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
A
L
 
I
P
 
P
P
 
-
S
 
-
E
 
D
R
 
P
G
 
H
E
 
N
L
 
L
G
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
T
F
 
F
I
 
V
N
 
N
D
 
G
K
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
G
S
 
T
T
 
T
S
 
A
L
 
D
M
 
L
I
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
V
D
 
P
V
 
F
V
 
L
L
 
I
Q
 
A
E
 
Y
V
 
L
Q
 
S
T
 
E
F
 
F
M
 
M
S
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
M
V
 
I
M
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
V
 
L

Query Sequence

>WP_044620841.1 NCBI__GCF_000940995.1:WP_044620841.1
MNTVIVENKAVTPNKVVCVGRNYVAHIYELGNEVPDEMVLFTKPNSAISEVLLSSHRGDE
LHYEAELSFLYRNGRFDAVAVGLDLTKRRVQSKLKEKGLPWERSKAFDGSALFSEFVPLP
PSERGELGLRLFINDKLTQSGSTSLMIYSPDVVLQEVQTFMSLNDGDIVMTGTPSGVGKV
QAGSQFEAQVTAGEEVIVSTQWLAK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory