SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_045585170.1 NCBI__GCF_001305595.1:WP_045585170.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

O85673 Anthranilate 1,2-dioxygenase large subunit; EC 1.14.12.1 from Acinetobacter baylyi (strain ATCC 33305 / BD413 / ADP1) (see 2 papers)
32% identity, 86% coverage: 27:395/429 of query aligns to 27:403/471 of O85673

query
sites
O85673
R
 
R
A
 
I
H
 
A
T
 
R
S
 
D
L
 
M
Y
 
F
T
 
T
D
 
E
P
 
P
A
 
E
I
 
L
F
 
F
E
 
E
Q
 
L
E
 
E
M
|
M
D
 
E
R
 
L
I
 
I
F
 
F
A
 
E
N
 
K
C
 
V
W
 
W
V
 
I
W
 
Y
V
 
A
A
 
C
H
 
H
V
 
E
S
 
S
E
 
E
V
 
I
K
 
P
E
 
N
A
 
N
G
 
N
D
 
D
Y
 
F
K
 
V
S
 
T
T
 
V
Y
 
Q
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
V
 
M
V
 
I
V
 
V
V
 
S
R
 
R
D
 
D
R
 
G
K
 
K
Q
 
G
K
 
E
I
 
L
H
 
H
V
 
A
L
 
M
L
 
V
N
 
N
R
 
A
C
 
C
R
 
E
H
 
H
R
 
R
A
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
L
C
 
T
E
 
R
E
 
V
K
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
N
T
 
Q
N
 
S
S
 
V
F
 
F
V
 
T
C
 
C
P
 
P
Y
 
F
H
 
H
G
 
A
W
 
W
S
 
C
Y
 
Y
G
 
K
L
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
R
L
 
L
R
 
V
G
 
K
V
 
V
P
 
K
H
 
A
P
 
P
E
 
G
S
 
E
Y
 
Y
G
 
C
Q
 
E
C
 
D
L
 
F
D
 
D
K
 
K
G
 
S
E
 
S
Y
 
R
P
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
Q
L
 
G
R
 
R
V
 
I
E
 
A
E
 
S
Y
 
Y
A
 
R
G
 
G
M
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
V
T
 
S
F
 
L
-
 
D
R
 
T
E
 
Q
D
 
A
I
 
T
E
 
D
P
 
S
L
 
L
A
 
E
D
 
D
W
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
D
A
 
A
K
 
K
K
 
V
W
 
F
M
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
M
M
 
V
R
 
D
Q
 
Q
G
 
S
G
 
P
G
 
T
Y
 
G
P
 
E
I
 
L
K
 
E
V
 
V
-
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
K
H
 
S
R
 
A
F
 
Y
R
 
T
F
 
F
P
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
L
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
N
 
N
T
 
G
T
 
L
D
|
D
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
F
 
V
P
 
S
V
 
T
V
 
V
H
 
H
K
 
Y
S
 
N
F
 
Y
L
 
V
S
 
S
S
 
T
V
 
V
D
 
Q
E
 
H
Q
 
R
T
 
Q
E
 
Q
-
 
V
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
L
R
 
D
M
 
T
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
V
 
S
N
 
K
-
 
L
G
 
G
P
 
A
G
 
G
F
 
D
V
 
S
E
 
E
-
 
T
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
W
-
 
F
D
 
S
L
 
F
G
 
K
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
V
 
V
M
 
L
V
 
F
M
 
S
I
 
D
P
 
M
E
 
P
L
 
N
V
 
P
D
 
T
L
 
V
E
 
R
D
 
P
N
 
G
L
 
Y
D
 
N
A
 
T
P
 
V
V
 
M
P
 
P
A
 
Y
R
 
L
F
 
V
A
 
E
E
 
K
L
 
F
A
 
G
E
 
E
E
 
K
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
R
D
 
A
E
 
E
A
 
W
K
 
A
V
 
M
R
 
H
R
 
R
I
 
L
V
 
R
R
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
N
 
N
L
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
N
 
S
I
 
L
A
 
F
C
 
F
S
 
M
-
 
D
-
 
Q
-
 
I
M
 
S
A
 
S
F
 
Q
F
 
L
R
 
R
V
 
I
L
 
I
R
 
R
P
 
P
V
 
V
S
 
A
V
 
W
N
 
N
E
 
K
T
 
T
E
 
E
I
 
V
H
 
I
H
 
S
A
 
Q
V
 
C
I
 
I
T
 
G
M
 
V
D
 
K
G
 
G
G
 
E
P
 
S
A
 
S
A
 
E
A
 
A
N
 
R
R
 
R
A
 
N
R
 
R
L
 
I
R
 
R
L
 
Q
H
 
F
E
 
E
H
 
D
F
 
F
Q
 
F
G
 
N
P
 
V
M
 
S
G
 
G
F
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
D
D
 
D
S
 
L
E
 
V
A
 
E
W
 
F
E
 
R
R
 
E
V
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
A
 
F
Q
 
Q
A
 
G
G
 
R
T
 
I
D
 
E
L
 
R
W
 
W
I
 
S
L
 
D
L
 
I
N
 
S
R
 
R
G
 
G

2xrxA Crystal structure of biphenyl dioxygenase in complex with biphenyl from burkholderia xenovorans lb400 (see paper)
29% identity, 93% coverage: 32:428/429 of query aligns to 22:423/432 of 2xrxA

query
sites
2xrxA
L
 
I
Y
 
Y
T
 
A
D
 
D
P
 
Q
A
 
S
I
 
L
F
 
Y
E
 
E
Q
 
L
E
 
E
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
V
F
 
F
A
 
G
N
 
R
C
 
S
W
 
W
V
 
L
W
 
L
V
 
L
A
 
G
H
 
H
V
 
E
S
 
S
E
 
H
V
 
V
K
 
P
E
 
E
A
 
T
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
L
S
 
A
T
 
T
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
R
 
E
Q
 
D
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
M
V
 
V
R
 
R
D
 
Q
R
 
K
K
 
D
Q
 
K
K
 
S
I
 
I
H
 
K
V
 
V
L
 
F
L
 
L
N
 
N
R
 
Q
C
|
C
R
 
R
H
|
H
R
|
R
A
 
G
A
 
M
T
 
R
V
 
I
C
 
C
E
 
R
E
 
S
K
 
D
K
 
A
G
 
G
K
 
N
T
 
A
N
 
K
S
 
A
F
 
F
V
 
T
C
|
C
P
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
W
|
W
S
 
A
Y
 
Y
G
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
L
R
 
V
G
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
F
P
 
E
E
 
K
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
Q
 
E
C
 
A
L
 
F
D
 
D
K
 
K
G
 
A
E
 
E
Y
 
W
P
 
G
L
 
P
K
 
L
S
 
Q
L
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
A
E
 
T
Y
 
Y
A
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
N
F
 
W
R
 
D
E
 
V
D
 
Q
I
 
A
E
 
P
P
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
T
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
D
A
 
A
K
 
R
K
 
P
W
 
Y
M
 
M
D
 
D
L
 
V
F
 
M
M
 
L
R
 
D
Q
 
R
G
 
T
G
 
P
G
 
A
Y
 
G
P
 
T
I
 
V
K
 
A
V
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
M
H
 
Q
R
 
K
F
 
W
R
 
V
F
 
I
P
 
P
G
 
C
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
F
Q
 
A
L
 
A
E
 
E
N
x
Q
-
x
F
T
 
C
T
 
S
D
|
D
G
 
M
Y
 
Y
H
|
H
F
 
A
P
 
G
V
 
T
V
 
T
H
 
-
K
 
-
S
 
T
F
x
H
L
 
L
S
 
S
S
 
G
V
 
I
D
 
L
E
 
A
Q
 
G
T
 
I
E
 
P
R
 
P
M
 
E
L
 
M
D
 
D
F
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
V
 
T
N
 
K
G
 
G
P
 
N
G
 
Q
F
 
F
V
 
R
E
 
A
D
 
A
L
 
W
G
 
G
N
 
-
G
 
G
H
 
H
S
 
G
V
 
S
M
 
G
V
 
W
M
 
Y
I
 
V
P
 
D
E
 
E
L
 
P
V
 
G
D
 
S
L
 
L
E
 
L
D
 
A
N
 
V
L
 
M
D
 
G
A
 
P
P
 
K
V
 
V
P
 
T
A
 
Q
R
 
Y
F
 
W
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
-
R
 
-
K
 
R
E
 
L
G
 
G
H
 
H
D
 
T
E
 
G
A
 
M
K
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
M
V
 
V
R
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
G
F
 
Q
N
x
H
L
 
M
N
 
T
L
 
I
F
 
F
P
 
P
N
 
T
I
 
C
A
 
S
C
 
F
S
x
L
M
 
P
A
 
T
F
|
F
-
 
N
-
 
N
F
 
I
R
 
R
V
 
I
L
 
W
R
 
H
P
 
P
V
 
R
S
 
G
V
 
P
N
 
N
E
 
E
T
 
I
E
 
E
I
 
V
H
 
W
H
 
A
A
 
F
V
 
T
I
 
L
T
 
V
M
 
D
D
 
A
G
 
D
G
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
E
A
 
I
N
 
K
R
 
E
A
 
E
R
 
Y
L
 
R
R
 
R
L
 
H
H
 
N
E
 
I
H
 
R
F
 
N
Q
 
F
G
 
S
P
 
A
M
 
G
G
 
G
F
 
V
G
x
F
T
 
E
P
 
Q
D
 
D
D
|
D
S
 
G
E
 
E
A
 
N
W
 
W
E
 
V
R
 
E
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
G
G
 
Y
T
 
K
D
 
A
L
 
K
W
 
S
I
 
Q
L
 
P
L
 
L
N
 
N
R
 
A
G
 
Q
L
 
M
P
 
G
G
 
L
E
 
G
R
 
R
I
 
S
T
 
Q
E
 
T
D
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
P
G
 
G
R
 
N
A
 
V
G
 
G
D
 
Y
V
 
V
S
 
Y
A
 
A
E
 
E
T
 
E
G
 
A
M
 
A
R
 
R
A
 
G
A
 
M
Y
 
Y
Q
 
H
Q
 
H
W
 
W
K
 
M
K
 
R
L
 
M
M
 
M
T
 
S

2xshA Crystal structure of p4 variant of biphenyl dioxygenase from burkholderia xenovorans lb400 in complex with 2,6 di chlorobiphenyl (see paper)
29% identity, 93% coverage: 32:428/429 of query aligns to 22:424/433 of 2xshA

query
sites
2xshA
L
 
I
Y
 
Y
T
 
A
D
 
D
P
 
Q
A
 
S
I
 
L
F
 
Y
E
 
E
Q
 
L
E
 
E
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
V
F
 
F
A
 
G
N
 
R
C
 
S
W
 
W
V
 
L
W
 
L
V
 
L
A
 
G
H
 
H
V
 
E
S
 
S
E
 
H
V
 
V
K
 
P
E
 
E
A
 
T
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
L
S
 
A
T
 
T
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
R
 
E
Q
 
D
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
M
V
 
V
R
 
R
D
 
Q
R
 
K
K
 
D
Q
 
K
K
 
S
I
 
I
H
 
K
V
 
V
L
 
F
L
 
L
N
 
N
R
 
Q
C
|
C
R
 
R
H
|
H
R
|
R
A
 
G
A
 
M
T
 
R
V
 
I
C
 
C
E
 
R
E
 
S
K
 
D
K
 
A
G
 
G
K
 
N
T
 
A
N
 
K
S
 
A
F
 
F
V
 
T
C
|
C
P
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
W
|
W
S
 
A
Y
 
Y
G
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
L
R
 
V
G
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
F
P
 
E
E
 
K
S
 
E
Y
 
-
G
 
-
Q
 
A
C
 
F
L
 
F
D
 
D
K
 
K
G
 
A
E
 
E
Y
 
W
P
 
G
L
 
P
K
 
L
S
 
Q
L
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
A
E
 
T
Y
 
Y
A
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
N
F
 
W
R
 
D
E
 
V
D
 
Q
I
 
A
E
 
P
P
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
T
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
D
A
 
A
K
 
R
K
 
P
W
 
Y
M
 
M
D
 
D
L
 
V
F
 
M
M
 
L
R
 
D
Q
 
R
G
 
T
G
 
P
G
 
A
Y
 
G
P
 
T
I
 
V
K
 
A
V
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
M
H
 
Q
R
 
K
F
 
W
R
 
V
F
 
I
P
 
P
G
 
C
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
F
Q
 
A
L
 
A
E
 
E
N
x
Q
-
x
F
T
 
C
T
 
S
D
|
D
G
x
M
Y
 
Y
H
|
H
F
 
A
P
 
G
V
 
T
V
 
T
H
 
-
K
 
-
S
 
T
F
x
H
L
 
L
S
 
S
S
 
G
V
 
I
D
 
L
E
 
A
Q
 
G
T
 
I
E
 
P
R
 
P
M
 
E
L
 
M
D
 
D
F
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
V
 
T
N
 
K
G
 
G
P
 
N
G
 
Q
F
 
F
V
 
R
E
 
A
D
 
A
L
 
W
G
 
G
N
 
-
G
 
G
H
 
H
S
 
G
V
 
S
M
 
G
V
 
W
M
 
Y
I
 
V
P
 
D
E
 
E
L
 
P
V
 
G
D
 
S
L
 
L
E
 
L
D
 
A
N
 
V
L
 
M
D
 
G
A
 
P
P
 
K
V
 
V
P
 
T
A
 
Q
R
 
Y
F
 
W
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
-
R
 
-
K
 
R
E
 
L
G
 
G
H
 
H
D
 
T
E
 
G
A
 
M
K
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
M
V
 
V
R
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
G
F
x
Q
N
x
H
L
 
M
N
 
T
L
 
I
F
 
F
P
 
P
N
 
T
I
 
C
A
 
S
C
 
F
-
x
L
-
 
P
S
 
A
M
 
M
A
 
N
F
 
N
F
 
I
R
 
R
V
 
I
L
 
W
R
 
H
P
 
P
V
 
R
S
 
G
V
 
P
N
 
N
E
 
E
T
 
I
E
 
E
I
 
V
H
 
W
H
 
A
A
 
F
V
 
T
I
 
L
T
 
V
M
 
D
D
 
A
G
 
D
G
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
E
A
 
I
N
 
K
R
 
E
A
 
E
R
 
Y
L
 
R
R
 
R
L
 
H
H
 
N
E
 
I
H
 
R
F
 
N
Q
 
F
G
 
S
P
 
A
M
 
G
G
 
G
F
 
V
G
x
F
T
 
E
P
 
Q
D
 
D
D
|
D
S
 
G
E
 
E
A
 
N
W
 
W
E
 
V
R
 
E
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
G
G
 
Y
T
 
K
D
 
A
L
 
K
W
 
S
I
 
Q
L
 
P
L
 
L
N
 
N
R
 
A
G
 
Q
L
 
M
P
 
G
G
 
L
E
 
G
R
 
R
I
 
S
T
 
Q
E
 
T
D
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
P
G
 
G
R
 
N
A
 
V
G
 
G
D
 
Y
V
 
V
S
 
Y
A
 
A
E
 
E
T
 
E
G
 
A
M
 
A
R
 
R
A
 
G
A
 
M
Y
 
Y
Q
 
H
Q
 
H
W
 
W
K
 
M
K
 
R
L
 
M
M
 
M
T
 
S

2yflA Crystal structure of biphenyl dioxygenase variant rr41 with 2-chloro dibenzofuran (see paper)
29% identity, 93% coverage: 32:428/429 of query aligns to 22:424/433 of 2yflA

query
sites
2yflA
L
 
I
Y
 
Y
T
 
A
D
 
D
P
 
Q
A
 
S
I
 
L
F
 
Y
E
 
E
Q
 
L
E
 
E
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
V
F
 
F
A
 
G
N
 
R
C
 
S
W
 
W
V
 
L
W
 
L
V
 
L
A
 
G
H
 
H
V
 
E
S
 
S
E
 
H
V
 
V
K
 
P
E
 
E
A
 
T
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
L
S
 
A
T
 
T
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
R
 
E
Q
 
D
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
M
V
 
V
R
 
R
D
 
Q
R
 
K
K
 
D
Q
 
K
K
 
S
I
 
I
H
 
K
V
 
V
L
 
F
L
 
L
N
 
N
R
 
Q
C
|
C
R
 
R
H
|
H
R
|
R
A
 
G
A
 
M
T
 
R
V
 
I
C
 
C
E
 
R
E
 
S
K
 
D
K
 
A
G
 
G
K
 
N
T
 
A
N
 
K
S
 
A
F
 
F
V
 
T
C
|
C
P
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
W
|
W
S
 
A
Y
 
Y
G
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
L
R
 
V
G
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
F
P
 
E
E
 
K
S
 
E
Y
 
-
G
 
-
Q
 
A
C
 
F
L
 
F
D
 
D
K
 
K
G
 
A
E
 
E
Y
 
W
P
 
G
L
 
P
K
 
L
S
 
Q
L
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
A
E
 
T
Y
 
Y
A
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
N
F
 
W
R
 
D
E
 
V
D
 
Q
I
 
A
E
 
P
P
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
T
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
D
A
 
A
K
 
R
K
 
P
W
 
Y
M
 
M
D
 
D
L
 
V
F
 
M
M
 
L
R
 
D
Q
 
R
G
 
T
G
 
P
G
 
A
Y
 
G
P
 
T
I
 
V
K
 
A
V
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
M
H
 
Q
R
 
K
F
 
W
R
 
V
F
 
I
P
 
P
G
 
C
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
F
Q
 
A
L
 
A
E
 
E
N
x
Q
-
 
F
T
 
C
T
 
S
D
|
D
G
x
M
Y
 
Y
H
|
H
F
 
A
P
 
G
V
 
T
V
 
T
H
 
-
K
 
-
S
 
T
F
x
H
L
 
L
S
 
S
S
 
G
V
 
I
D
 
L
E
 
A
Q
 
G
T
 
I
E
 
P
R
 
P
M
 
E
L
 
M
D
 
D
F
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
V
 
T
N
 
K
G
 
G
P
 
N
G
 
Q
F
 
F
V
 
R
E
 
A
D
 
A
L
 
W
G
 
G
N
 
-
G
 
G
H
 
H
S
 
G
V
 
S
M
 
G
V
 
W
M
 
Y
I
 
V
P
 
D
E
 
E
L
 
P
V
 
G
D
x
S
L
 
L
E
 
L
D
 
A
N
 
V
L
 
M
D
 
G
A
 
P
P
 
K
V
 
V
P
 
T
A
 
Q
R
 
Y
F
 
W
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
-
R
 
-
K
 
R
E
 
L
G
 
G
H
 
H
D
 
T
E
 
G
A
 
M
K
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
M
V
 
V
R
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
G
F
 
Q
N
x
H
L
 
M
N
 
T
L
 
I
F
 
F
P
 
P
N
 
T
I
 
C
A
 
S
C
 
F
-
x
L
-
 
P
S
 
A
M
 
M
A
 
N
F
 
Q
F
 
I
R
 
R
V
 
V
L
 
W
R
 
H
P
 
P
V
 
R
S
 
G
V
 
P
N
 
N
E
 
E
T
 
I
E
 
E
I
 
V
H
 
W
H
 
A
A
 
F
V
 
T
I
 
L
T
 
V
M
 
D
D
 
A
G
 
D
G
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
E
A
 
I
N
 
K
R
 
E
A
 
E
R
 
Y
L
 
R
R
 
R
L
 
H
H
 
N
E
 
I
H
 
R
F
 
N
Q
x
F
G
 
S
P
 
A
M
 
G
G
 
G
F
 
V
G
 
F
T
 
E
P
 
Q
D
 
D
D
|
D
S
 
G
E
 
E
A
 
N
W
 
W
E
 
V
R
 
E
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
G
G
 
Y
T
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
Q
-
 
P
-
 
F
D
 
N
L
 
A
W
 
Q
I
 
M
L
 
G
L
 
L
N
 
G
R
 
R
G
 
S
L
 
Q
P
 
T
G
 
G
E
 
H
R
 
P
I
 
-
T
 
D
E
 
F
D
 
P
G
 
G
R
 
N
A
 
V
G
 
G
D
 
Y
V
 
V
S
 
Y
A
 
A
E
 
E
T
 
E
G
 
A
M
 
A
R
 
R
A
 
G
A
 
M
Y
 
Y
Q
 
H
Q
 
H
W
 
W
K
 
M
K
 
R
L
 
M
M
 
M
T
 
S

2yfjA Crystal structure of biphenyl dioxygenase variant rr41 with dibenzofuran (see paper)
29% identity, 93% coverage: 32:428/429 of query aligns to 22:424/433 of 2yfjA

query
sites
2yfjA
L
 
I
Y
 
Y
T
 
A
D
 
D
P
 
Q
A
 
S
I
 
L
F
 
Y
E
 
E
Q
 
L
E
 
E
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
V
F
 
F
A
 
G
N
 
R
C
 
S
W
 
W
V
 
L
W
 
L
V
 
L
A
 
G
H
 
H
V
 
E
S
 
S
E
 
H
V
 
V
K
 
P
E
 
E
A
 
T
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
L
S
 
A
T
 
T
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
R
 
E
Q
 
D
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
M
V
 
V
R
 
R
D
 
Q
R
 
K
K
 
D
Q
 
K
K
 
S
I
 
I
H
 
K
V
 
V
L
 
F
L
 
L
N
 
N
R
 
Q
C
|
C
R
 
R
H
|
H
R
|
R
A
 
G
A
 
M
T
 
R
V
 
I
C
 
C
E
 
R
E
 
S
K
 
D
K
 
A
G
 
G
K
 
N
T
 
A
N
 
K
S
 
A
F
 
F
V
 
T
C
|
C
P
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
W
|
W
S
 
A
Y
 
Y
G
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
L
R
 
V
G
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
F
P
 
E
E
 
K
S
 
E
Y
 
-
G
 
-
Q
 
A
C
 
F
L
 
F
D
 
D
K
 
K
G
 
A
E
 
E
Y
 
W
P
 
G
L
 
P
K
 
L
S
 
Q
L
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
A
E
 
T
Y
 
Y
A
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
N
F
 
W
R
 
D
E
 
V
D
 
Q
I
 
A
E
 
P
P
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
T
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
D
A
 
A
K
 
R
K
 
P
W
 
Y
M
 
M
D
 
D
L
 
V
F
 
M
M
 
L
R
 
D
Q
 
R
G
 
T
G
 
P
G
 
A
Y
 
G
P
 
T
I
 
V
K
 
A
V
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
M
H
 
Q
R
 
K
F
 
W
R
 
V
F
 
I
P
 
P
G
 
C
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
F
Q
 
A
L
 
A
E
 
E
N
x
Q
-
x
F
T
 
C
T
 
S
D
|
D
G
x
M
Y
 
Y
H
|
H
F
x
A
P
 
G
V
 
T
V
 
T
H
 
-
K
 
-
S
 
T
F
x
H
L
 
L
S
 
S
S
 
G
V
 
I
D
 
L
E
 
A
Q
 
G
T
 
I
E
 
P
R
 
P
M
 
E
L
 
M
D
 
D
F
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
V
 
T
N
 
K
G
 
G
P
 
N
G
 
Q
F
 
F
V
 
R
E
 
A
D
 
A
L
 
W
G
 
G
N
 
-
G
 
G
H
 
H
S
 
G
V
 
S
M
 
G
V
 
W
M
 
Y
I
 
V
P
 
D
E
 
E
L
 
P
V
 
G
D
 
S
L
 
L
E
 
L
D
 
A
N
 
V
L
 
M
D
 
G
A
 
P
P
 
K
V
 
V
P
 
T
A
 
Q
R
 
Y
F
 
W
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
-
R
 
-
K
 
R
E
 
L
G
 
G
H
 
H
D
 
T
E
 
G
A
 
M
K
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
M
V
 
V
R
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
G
F
 
Q
N
x
H
L
 
M
N
 
T
L
 
I
F
 
F
P
 
P
N
 
T
I
 
C
A
 
S
C
 
F
-
x
L
-
 
P
S
 
A
M
 
M
A
 
N
F
 
Q
F
 
I
R
 
R
V
 
V
L
 
W
R
 
H
P
 
P
V
 
R
S
 
G
V
 
P
N
 
N
E
 
E
T
 
I
E
 
E
I
 
V
H
 
W
H
 
A
A
 
F
V
 
T
I
 
L
T
 
V
M
 
D
D
 
A
G
 
D
G
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
E
A
 
I
N
 
K
R
 
E
A
 
E
R
 
Y
L
 
R
R
 
R
L
 
H
H
 
N
E
 
I
H
 
R
F
 
N
Q
 
F
G
 
S
P
 
A
M
 
G
G
 
G
F
 
V
G
x
F
T
 
E
P
 
Q
D
 
D
D
|
D
S
 
G
E
 
E
A
 
N
W
 
W
E
 
V
R
 
E
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
G
G
 
Y
T
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
Q
-
 
P
-
 
F
D
 
N
L
 
A
W
 
Q
I
 
M
L
 
G
L
 
L
N
 
G
R
 
R
G
 
S
L
 
Q
P
 
T
G
 
G
E
 
H
R
 
P
I
 
-
T
 
D
E
 
F
D
 
P
G
 
G
R
 
N
A
 
V
G
 
G
D
 
Y
V
 
V
S
 
Y
A
 
A
E
 
E
T
 
E
G
 
A
M
 
A
R
 
R
A
 
G
A
 
M
Y
 
Y
Q
 
H
Q
 
H
W
 
W
K
 
M
K
 
R
L
 
M
M
 
M
T
 
S

7q05E Crystal structure of tpado in complex with tpa (see paper)
31% identity, 93% coverage: 27:427/429 of query aligns to 13:390/409 of 7q05E

query
sites
7q05E
R
 
R
A
 
V
H
 
P
T
 
F
S
 
G
L
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
P
 
T
A
 
A
I
 
N
F
 
A
E
 
D
Q
 
Q
E
 
E
M
 
Q
D
 
Q
R
 
R
I
 
I
F
 
Y
-
 
R
A
 
G
N
 
E
C
 
V
W
 
W
V
 
N
W
 
Y
V
 
L
A
 
C
H
 
L
V
 
E
S
 
S
E
 
E
V
 
I
K
 
P
E
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
R
S
 
T
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
G
 
G
R
 
E
Q
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
A
K
 
D
Q
 
Q
K
 
E
I
 
I
H
 
Y
V
 
A
L
 
F
L
 
E
N
 
N
R
 
R
C
|
C
R
 
A
H
|
H
R
|
R
A
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
I
C
 
A
E
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
S
G
 
G
K
 
R
T
 
T
N
 
D
S
 
S
F
 
F
V
 
Q
C
|
C
P
 
V
Y
|
Y
H
|
H
G
 
A
W
|
W
S
 
S
Y
 
Y
G
 
N
L
 
R
D
 
Q
G
 
G
S
 
D
L
 
L
R
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
A
H
 
F
P
 
E
E
 
K
S
 
G
Y
 
V
-
 
K
G
 
G
Q
 
Q
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
A
C
 
S
L
 
F
D
 
C
K
 
K
G
 
E
E
 
E
Y
 
H
P
 
G
L
 
P
K
 
R
S
 
K
L
 
L
R
 
R
V
 
V
E
 
A
E
 
V
Y
 
F
A
 
C
G
 
G
M
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
G
T
 
S
F
 
F
R
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
P
P
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
E
K
 
I
-
 
C
K
 
E
W
 
R
M
 
I
D
 
E
L
 
R
F
 
V
M
 
L
R
 
H
Q
 
K
G
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
P
I
 
V
K
 
E
V
 
V
A
 
I
G
 
G
E
 
R
H
 
F
R
 
T
F
 
Q
R
 
K
F
 
L
P
 
P
G
 
N
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
L
Q
 
Y
L
 
F
E
 
E
N
 
N
T
x
V
T
 
K
D
 
D
G
 
S
Y
 
Y
H
 
H
F
x
A
P
 
S
V
 
L
V
 
L
H
 
H
K
 
M
S
 
F
F
 
F
L
 
T
S
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
T
 
T
E
 
F
R
 
E
M
 
L
L
 
N
D
 
R
F
 
L
V
 
S
N
 
Q
G
 
K
P
 
G
G
 
G
F
 
V
V
 
I
E
 
V
D
 
D
L
 
E
G
 
S
N
 
G
G
 
G
H
 
H
S
 
H
V
 
V
M
x
S
V
 
Y
M
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
S
L
 
M
V
 
I
D
 
D
-
 
R
-
 
G
L
 
A
E
 
K
D
 
D
N
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
D
P
 
P
V
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
S
F
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
G
A
 
F
E
 
E
E
 
E
L
 
F
R
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
-
D
 
E
E
 
D
A
 
G
K
 
V
V
 
T
R
x
L
R
 
Q
I
|
I
V
 
L
R
 
S
A
 
V
V
 
F
G
 
-
G
 
-
S
 
P
G
 
G
F
 
F
N
 
V
L
 
L
N
 
Q
L
 
Q
F
 
I
P
 
Q
N
 
N
I
 
-
A
 
-
C
 
-
S
 
S
M
 
I
A
 
A
F
 
-
F
 
V
R
|
R
V
 
Q
L
 
L
R
 
L
P
 
P
V
 
K
S
 
S
V
 
I
N
 
S
E
 
S
T
 
S
E
 
E
I
 
L
H
 
N
H
 
W
A
 
T
V
 
Y
I
 
L
T
 
G
M
 
Y
D
 
A
G
 
D
G
 
D
P
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
N
 
R
R
 
K
A
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
K
L
 
-
H
 
Q
E
 
A
H
 
N
F
 
L
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
I
T
 
S
P
 
M
D
 
E
D
|
D
S
 
G
E
 
A
A
 
V
W
 
G
E
 
G
R
 
F
V
 
V
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
A
 
I
Q
 
A
A
 
G
G
 
A
T
 
A
D
 
N
L
 
L
W
 
D
I
 
A
L
 
V
L
 
I
N
 
E
R
 
M
G
 
G
L
 
G
P
 
D
G
 
H
E
 
E
R
 
G
I
 
S
T
 
S
E
 
E
D
 
-
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
T
E
 
E
T
 
T
G
 
S
M
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
F
Y
 
W
Q
 
K
Q
 
A
W
 
Y
K
 
R
K
 
K
L
 
H
M
 
M

7q06D Crystal structure of tpado in complex with 2-oh-tpa (see paper)
30% identity, 93% coverage: 27:427/429 of query aligns to 13:385/389 of 7q06D

query
sites
7q06D
R
 
R
A
 
V
H
 
P
T
 
F
S
 
G
L
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
P
 
T
A
 
A
I
 
N
F
 
A
E
 
D
Q
 
Q
E
 
E
M
 
Q
D
 
Q
R
 
R
I
 
I
F
 
Y
-
 
R
A
 
G
N
 
E
C
 
V
W
 
W
V
 
N
W
 
Y
V
 
L
A
 
C
H
 
L
V
 
E
S
 
S
E
 
E
V
 
I
K
 
P
E
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
R
S
 
T
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
G
 
G
R
 
E
Q
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
A
K
 
D
Q
 
Q
K
 
E
I
 
I
H
 
Y
V
 
A
L
 
F
L
 
E
N
 
N
R
 
R
C
|
C
R
 
A
H
|
H
R
|
R
A
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
I
C
 
A
E
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
S
G
 
G
K
 
R
T
 
T
N
 
D
S
 
S
F
 
F
V
 
Q
C
|
C
P
 
V
Y
|
Y
H
|
H
G
 
A
W
|
W
S
 
S
Y
 
Y
G
 
N
L
 
R
D
 
Q
G
 
G
S
 
D
L
 
L
R
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
A
H
 
F
P
 
E
E
 
K
S
 
G
Y
 
V
-
 
K
G
 
G
Q
 
Q
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
A
C
 
S
L
 
F
D
 
C
K
 
K
G
 
E
E
 
E
Y
 
H
P
 
G
L
 
P
K
 
R
S
 
K
L
 
L
R
 
R
V
 
V
E
 
A
E
 
V
Y
 
F
A
 
C
G
 
G
M
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
G
T
 
S
F
 
F
R
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
P
P
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
E
K
 
I
-
 
C
K
 
E
W
 
R
M
 
I
D
 
E
L
 
R
F
 
V
M
 
L
R
 
H
Q
 
K
G
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
P
I
 
V
K
 
E
V
 
V
A
 
I
G
 
G
E
 
R
H
 
F
R
 
T
F
 
Q
R
 
K
F
 
L
P
 
P
G
 
N
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
L
Q
 
Y
L
 
F
E
 
E
N
 
N
T
x
V
T
 
K
D
 
D
G
x
S
Y
 
Y
H
|
H
F
x
A
P
 
S
V
 
L
V
 
L
H
|
H
K
 
M
S
 
F
F
|
F
L
 
T
S
 
T
S
 
F
V
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
E
T
 
L
E
x
N
R
 
R
M
 
L
L
 
S
D
 
Q
F
 
-
V
 
-
N
 
K
G
 
G
P
 
G
G
 
V
F
 
I
V
 
V
E
 
D
D
 
E
L
 
S
G
 
G
N
 
G
G
 
H
H
 
H
S
 
V
V
x
S
M
 
Y
V
 
S
M
 
M
I
 
I
P
 
Y
E
 
R
L
 
L
V
 
K
D
 
D
L
 
-
E
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
P
A
 
S
R
 
L
F
 
L
A
 
E
E
 
G
L
 
F
A
 
E
E
 
E
E
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
F
D
 
E
E
 
D
A
 
G
K
 
V
V
 
T
R
 
L
R
 
Q
I
|
I
V
 
L
R
 
S
A
 
V
V
 
F
G
 
-
G
 
-
S
 
P
G
 
G
F
 
F
N
 
V
L
 
L
N
 
Q
L
 
Q
F
 
I
P
 
Q
N
 
N
I
 
-
A
 
-
C
 
-
S
 
S
M
 
I
A
 
A
F
 
-
F
 
V
R
|
R
V
 
Q
L
 
L
R
 
L
P
 
P
V
 
K
S
 
S
V
 
I
N
 
S
E
 
S
T
 
S
E
 
E
I
 
L
H
 
N
H
 
W
A
 
T
V
 
Y
I
 
L
T
 
G
M
 
Y
D
 
A
G
 
D
G
 
D
P
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
N
 
R
R
 
K
A
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
K
L
 
-
H
 
Q
E
 
A
H
 
N
F
 
L
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
I
T
 
S
P
 
M
D
 
E
D
|
D
S
 
G
E
 
A
A
 
V
W
 
G
E
 
G
R
 
F
V
 
V
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
A
 
I
Q
 
A
A
 
G
G
 
A
T
 
A
D
 
N
L
 
L
W
 
D
I
 
A
L
 
V
L
 
I
N
 
E
R
 
M
G
 
G
L
 
G
P
 
D
G
 
H
E
 
E
R
 
G
I
 
S
T
 
S
E
 
E
D
 
-
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
T
E
 
E
T
 
T
G
 
S
M
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
F
Y
 
W
Q
 
K
Q
 
A
W
 
Y
K
 
R
K
 
K
L
 
H
M
 
M

5aeuA Crystal structure of ii9 variant of biphenyl dioxygenase from burkholderia xenovorans lb400 (see paper)
29% identity, 93% coverage: 32:428/429 of query aligns to 22:424/433 of 5aeuA

query
sites
5aeuA
L
 
I
Y
 
Y
T
 
A
D
 
D
P
 
Q
A
 
S
I
 
L
F
 
Y
E
 
E
Q
 
L
E
 
E
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
V
F
 
F
A
 
G
N
 
R
C
 
S
W
 
W
V
 
L
W
 
L
V
 
L
A
 
G
H
 
H
V
 
E
S
 
S
E
 
H
V
 
V
K
 
P
E
 
E
A
 
T
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
L
S
 
A
T
 
T
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
R
 
E
Q
 
D
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
M
V
 
V
R
 
R
D
 
Q
R
 
K
K
 
D
Q
 
K
K
 
S
I
 
I
H
 
K
V
 
V
L
 
F
L
 
L
N
 
N
R
 
Q
C
|
C
R
 
R
H
|
H
R
|
R
A
 
G
A
x
M
T
 
R
V
 
I
C
 
C
E
 
R
E
 
S
K
 
D
K
 
A
G
 
G
K
 
N
T
 
A
N
 
K
S
 
A
F
 
F
V
 
T
C
|
C
P
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
W
|
W
S
 
A
Y
 
Y
G
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
L
R
 
V
G
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
F
P
 
E
E
 
K
S
 
E
Y
 
-
G
 
-
Q
 
A
C
 
F
L
 
F
D
 
D
K
 
K
G
 
A
E
 
E
Y
 
W
P
 
G
L
 
P
K
 
L
S
 
Q
L
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
A
E
 
T
Y
 
Y
A
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
N
F
 
W
R
 
D
E
 
V
D
 
Q
I
 
A
E
 
P
P
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
T
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
D
A
 
A
K
 
R
K
 
P
W
 
Y
M
 
M
D
 
D
L
 
V
F
 
M
M
 
L
R
 
D
Q
 
R
G
 
T
G
 
P
G
 
A
Y
 
G
P
 
T
I
 
V
K
 
A
V
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
M
H
 
Q
R
 
K
F
 
W
R
 
V
F
 
I
P
 
P
G
 
C
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
F
Q
 
A
L
 
A
E
 
E
N
 
Q
-
 
F
T
 
C
T
 
S
D
|
D
G
 
M
Y
 
Y
H
|
H
F
 
A
P
 
G
V
 
T
V
 
T
H
 
-
K
 
-
S
 
T
F
x
H
L
 
L
S
 
S
S
 
G
V
 
I
D
 
L
E
 
A
Q
 
G
T
 
I
E
 
P
R
 
P
M
 
E
L
 
M
D
 
D
F
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
V
 
T
N
 
K
G
 
G
P
 
N
G
 
Q
F
 
F
V
 
R
E
 
A
D
 
A
L
 
W
G
 
G
N
 
-
G
 
G
H
 
H
S
 
G
V
 
S
M
 
G
V
 
W
M
 
Y
I
 
V
P
 
D
E
 
E
L
 
P
V
 
G
D
 
S
L
 
L
E
 
L
D
 
A
N
 
V
L
 
M
D
 
G
A
 
P
P
 
K
V
 
V
P
 
T
A
 
Q
R
 
Y
F
 
W
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
-
R
 
-
K
 
R
E
 
L
G
 
G
H
 
H
D
 
T
E
 
G
A
 
M
K
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
M
V
 
V
R
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
G
F
 
Q
N
 
H
L
 
M
N
 
T
L
 
I
F
 
F
P
 
P
N
 
T
I
 
C
A
 
S
C
 
F
-
 
L
-
 
P
S
 
G
M
 
I
A
 
N
F
 
T
F
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
W
R
 
H
P
 
P
V
 
R
S
 
G
V
 
P
N
 
N
E
 
E
T
 
I
E
 
E
I
 
V
H
 
W
H
 
A
A
 
F
V
 
T
I
 
L
T
 
V
M
 
D
D
 
A
G
 
D
G
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
E
A
 
I
N
 
K
R
 
E
A
 
E
R
 
Y
L
 
R
R
 
R
L
 
H
H
 
N
E
 
I
H
 
R
F
 
N
Q
 
F
G
 
S
P
 
A
M
 
G
G
 
G
F
 
V
G
 
F
T
 
E
P
 
Q
D
 
D
D
|
D
S
 
G
E
 
E
A
 
N
W
 
W
E
 
V
R
 
E
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
G
G
 
Y
T
 
K
D
 
A
L
 
K
W
 
S
I
 
Q
L
 
P
L
 
L
N
 
N
R
 
A
G
 
Q
L
 
M
P
 
G
G
 
L
E
 
G
R
 
R
I
 
S
T
 
Q
E
 
T
D
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
P
G
 
G
R
 
N
A
 
V
G
 
G
D
 
Y
V
 
V
S
 
Y
A
 
A
E
 
E
T
 
E
G
 
A
M
 
A
R
 
R
A
 
G
A
 
M
Y
 
Y
Q
 
H
Q
 
H
W
 
W
K
 
M
K
 
R
L
 
M
M
 
M
T
 
S

7vjuA Crystal structure of terephthalate dioxygenase from comamonas testosteroni kf1 (see paper)
29% identity, 93% coverage: 27:427/429 of query aligns to 12:374/378 of 7vjuA

query
sites
7vjuA
R
 
R
A
 
V
H
 
P
T
 
F
S
 
G
L
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
P
 
T
A
 
A
I
 
N
F
 
A
E
 
D
Q
 
Q
E
 
E
M
 
Q
D
 
Q
R
 
R
I
 
I
F
 
Y
-
 
R
A
 
G
N
 
E
C
 
V
W
 
W
V
 
N
W
 
Y
V
 
L
A
 
C
H
 
L
V
 
E
S
 
S
E
 
E
V
 
I
K
 
P
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
R
S
 
T
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
G
 
G
R
 
E
Q
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
A
K
 
D
Q
 
Q
K
 
E
I
 
I
H
 
Y
V
 
A
L
 
F
L
 
E
N
 
N
R
 
R
C
|
C
R
 
A
H
|
H
R
|
R
A
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
I
C
 
A
E
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
S
G
 
G
K
 
R
T
 
T
N
 
D
S
 
S
F
 
F
V
 
Q
C
|
C
P
 
V
Y
|
Y
H
|
H
G
 
A
W
|
W
S
 
S
Y
 
Y
G
 
N
L
 
R
D
 
Q
G
 
G
S
 
D
L
 
L
R
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
A
H
 
F
P
 
E
E
 
K
S
 
G
Y
 
V
-
 
K
G
 
G
Q
 
Q
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
A
C
 
S
L
 
F
D
 
C
K
 
K
G
 
E
E
 
E
Y
 
H
P
 
G
L
 
P
K
 
R
S
 
K
L
 
L
R
 
R
V
 
V
E
 
A
E
 
V
Y
 
F
A
 
C
G
 
G
M
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
G
T
 
S
F
 
F
R
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
P
P
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
-
 
E
A
 
I
K
 
C
K
 
E
W
 
R
M
 
I
D
 
E
L
 
R
F
 
V
M
 
L
R
 
H
Q
 
K
G
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
P
I
 
V
K
 
E
V
 
V
A
 
I
G
 
G
E
 
R
H
 
F
R
 
T
F
 
Q
R
 
K
F
 
L
P
 
P
G
 
N
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
L
Q
 
Y
L
 
F
E
 
E
N
 
N
T
 
V
T
 
K
D
 
D
G
 
S
Y
 
Y
H
|
H
F
 
A
P
 
S
V
 
L
V
 
L
H
|
H
K
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
M
D
 
F
F
 
F
V
 
T
N
 
T
G
 
F
P
 
G
G
 
G
F
 
V
V
 
I
E
 
V
D
 
D
L
 
E
G
 
S
N
 
G
G
 
G
H
 
H
S
 
H
V
 
V
M
 
S
V
 
Y
M
 
S
I
 
M
-
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
L
V
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
E
D
 
E
L
 
F
E
 
E
D
 
D
N
 
G
L
 
V
D
 
T
A
 
L
P
 
Q
V
 
I
P
 
L
A
 
S
R
 
V
F
 
F
A
 
P
E
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
V
L
 
L
N
 
Q
L
 
Q
F
 
I
P
 
Q
N
 
N
I
 
-
A
 
-
C
 
-
S
 
S
M
 
I
A
 
A
F
 
-
F
 
V
R
 
R
V
 
Q
L
 
L
R
 
L
P
 
P
V
 
K
S
 
S
V
 
I
N
 
S
E
 
S
T
 
S
E
 
E
I
 
L
H
 
N
H
 
W
A
 
T
V
 
Y
I
 
L
T
 
G
M
 
Y
D
 
A
G
 
D
G
 
D
P
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
N
 
R
R
 
K
A
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
K
L
 
-
H
 
Q
E
 
A
H
 
N
F
 
L
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
I
T
 
S
P
 
M
D
 
E
D
|
D
S
 
G
E
 
A
A
 
V
W
 
G
E
 
G
R
 
F
V
 
V
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
A
 
I
Q
 
A
A
 
G
G
 
A
T
 
A
D
 
N
L
 
L
W
 
D
I
 
A
L
 
V
L
 
I
N
 
E
R
 
M
G
 
G
L
 
G
P
 
D
G
 
H
E
 
E
R
 
G
I
 
S
T
 
S
E
 
E
D
 
-
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
T
E
 
E
T
 
T
G
 
S
M
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
F
Y
 
W
Q
 
K
Q
 
A
W
 
Y
K
 
R
K
 
K
L
 
H
M
 
M

7q04D Crystal structure of tpado in a substrate-free state (see paper)
30% identity, 93% coverage: 27:427/429 of query aligns to 12:371/374 of 7q04D

query
sites
7q04D
R
 
R
A
 
V
H
 
P
T
 
F
S
 
G
L
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
P
 
T
A
 
A
I
 
N
F
 
A
E
 
D
Q
 
Q
E
 
E
M
 
Q
D
 
Q
R
 
R
I
 
I
F
 
Y
-
 
R
A
 
G
N
 
E
C
 
V
W
 
W
V
 
N
W
 
Y
V
 
L
A
 
C
H
 
L
V
 
E
S
 
S
E
 
E
V
 
I
K
 
P
E
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
R
S
 
T
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
G
 
G
R
 
E
Q
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
A
K
 
D
Q
 
Q
K
 
E
I
 
I
H
 
Y
V
 
A
L
 
F
L
 
E
N
 
N
R
 
R
C
|
C
R
 
A
H
|
H
R
|
R
A
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
I
C
 
A
E
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
S
G
 
G
K
 
R
T
 
T
N
 
D
S
 
S
F
 
F
V
 
Q
C
|
C
P
 
V
Y
|
Y
H
|
H
G
 
A
W
|
W
S
 
S
Y
 
Y
G
 
N
L
 
R
D
 
Q
G
 
G
S
 
D
L
 
L
R
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
A
H
 
F
P
 
E
E
 
K
S
 
G
Y
 
V
-
 
K
G
 
G
Q
 
Q
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
A
C
 
S
L
 
F
D
 
C
K
 
K
G
 
E
E
 
E
Y
 
H
P
 
G
L
 
P
K
 
R
S
 
K
L
 
L
R
 
R
V
 
V
E
 
A
E
 
V
Y
 
F
A
 
C
G
 
G
M
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
G
T
 
S
F
 
F
R
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
P
P
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
-
 
E
A
 
I
K
 
C
K
 
E
W
 
R
M
 
I
D
 
E
L
 
R
F
 
V
M
 
L
R
 
H
Q
 
K
G
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
P
I
 
V
K
 
E
V
 
V
A
 
I
G
 
G
E
 
R
H
 
F
R
 
T
F
 
Q
R
 
K
F
 
L
P
 
P
G
 
N
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
L
Q
 
Y
L
 
F
E
 
E
N
 
N
T
 
V
T
 
K
D
 
D
G
 
S
Y
 
Y
H
|
H
F
 
A
P
 
S
V
 
L
V
 
L
H
 
Q
K
 
K
S
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
N
 
-
G
 
G
P
 
G
G
 
V
F
 
I
V
 
V
E
 
D
D
 
E
L
 
S
G
 
G
N
 
G
G
 
H
H
 
H
S
 
V
V
 
S
M
 
Y
V
 
S
M
 
M
I
 
I
P
 
Y
E
 
R
L
 
L
V
 
K
D
 
D
L
 
-
E
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
P
A
 
S
R
 
L
F
 
L
A
 
E
E
 
G
L
 
F
A
 
E
E
 
E
E
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
F
D
 
E
E
 
D
A
 
G
K
 
V
V
 
T
R
 
L
R
 
Q
I
 
I
V
 
L
R
 
S
A
 
V
V
 
F
G
 
-
G
 
-
S
 
P
G
 
G
F
 
F
N
 
V
L
 
L
N
 
Q
L
 
Q
F
 
I
P
 
Q
N
 
N
I
 
-
A
 
-
C
 
-
S
 
S
M
 
I
A
 
A
F
 
-
F
 
V
R
 
R
V
 
Q
L
 
L
R
 
L
P
 
P
V
 
K
S
 
S
V
 
I
N
 
S
E
 
S
T
 
S
E
 
E
I
 
L
H
 
N
H
 
W
A
 
T
V
 
Y
I
 
L
T
 
G
M
 
Y
D
 
A
G
 
D
G
 
D
P
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
N
 
R
R
 
K
A
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
K
L
 
-
H
 
Q
E
 
A
H
 
N
F
 
L
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
I
T
 
S
P
 
M
D
 
E
D
|
D
S
 
G
E
 
A
A
 
V
W
 
G
E
 
G
R
 
F
V
 
V
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
A
 
I
Q
 
A
A
 
G
G
 
A
T
 
A
D
 
N
L
 
L
W
 
D
I
 
A
L
 
V
L
 
I
N
 
E
R
 
M
G
 
G
L
 
G
P
 
D
G
 
H
E
 
E
R
 
G
I
 
S
T
 
S
E
 
E
D
 
-
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
T
E
 
E
T
 
T
G
 
S
M
 
V
R
 
R
A
 
G
A
 
F
Y
 
W
Q
 
K
Q
 
A
W
 
Y
K
 
R
K
 
K
L
 
H
M
 
M

Q53122 Biphenyl 2,3-dioxygenase subunit alpha; Biphenyl dioxygenase system, oxygenase component subunit alpha; BDO, oxygenase component subunit alpha; Rieske dioxygenase; Terminal oxygenase component of biphenyl dioxygenase, large subunit; EC 1.14.12.18 from Rhodococcus jostii (strain RHA1) (see paper)
37% identity, 50% coverage: 4:218/429 of query aligns to 3:224/460 of Q53122

query
sites
Q53122
D
 
D
V
 
V
K
 
Q
A
 
C
P
 
E
P
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
R
S
 
K
P
 
P
S
 
K
A
 
W
T
 
A
S
 
D
R
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
-
 
D
-
 
E
R
 
R
A
 
T
D
 
G
R
 
R
A
 
L
H
 
D
T
 
P
S
 
R
L
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
P
 
E
A
 
A
I
 
L
F
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
I
F
 
F
A
 
G
N
 
R
C
 
S
W
 
W
V
 
L
W
 
L
V
 
M
A
 
G
H
 
H
V
 
E
S
 
T
E
 
Q
V
 
I
K
 
P
E
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
M
S
 
T
T
 
N
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
R
 
E
Q
 
D
P
 
P
V
 
V
V
 
M
V
 
V
V
 
V
R
 
R
D
 
Q
R
 
K
K
 
N
Q
 
G
K
 
E
I
 
I
H
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
L
N
 
N
R
 
Q
C
|
C
R
 
R
H
|
H
R
 
R
A
 
G
A
 
M
T
 
R
V
 
I
C
 
C
E
 
R
E
 
A
K
 
D
K
 
G
G
 
G
K
 
N
T
 
A
N
 
K
S
 
S
F
 
F
V
 
T
C
|
C
P
 
S
Y
 
Y
H
|
H
G
 
G
W
 
W
S
 
A
Y
 
Y
G
 
D
L
 
T
D
 
G
G
 
G
S
 
N
L
 
L
R
 
V
G
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
F
P
 
E
E
 
E
S
 
Q
Y
 
A
G
 
F
Q
 
P
C
 
G
L
 
L
D
 
R
K
 
K
G
 
E
E
 
D
Y
 
W
P
 
G
L
 
P
K
 
L
S
 
Q
L
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
T
Y
 
Y
A
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
I
F
 
F
A
 
A
T
 
N
F
 
W
R
 
D
E
 
A
D
 
D
I
 
A
E
 
P
P
 
D
L
 
L
A
 
D
D
 
T
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
E
A
 
A
K
 
K
K
 
F
W
 
Y
M
 
M
D
 
D
L
 
H
F
 
M
M
 
L
R
 
D
Q
 
R
G
 
T
G
 
E
G
 
A
Y
 
G
P
 
T
I
 
E
K
 
A
V
 
I
A
 
P
G
 
G
E
 
I
H
 
Q
R
 
K
F
 
W
R
 
V
F
 
I
P
 
P
G
 
C
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
F
Q
 
A
L
 
A
E
 
E
N
x
Q
-
x
F
T
x
C
T
x
S
D
|
D
G
x
M
Y
|
Y
H
|
H

Sites not aligning to the query:

1uliC Biphenyl dioxygenase (bpha1a2) derived from rhodococcus sp. Strain rha1 (see paper)
29% identity, 96% coverage: 18:429/429 of query aligns to 5:413/425 of 1uliC

query
sites
1uliC
D
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
-
 
D
-
 
E
R
 
R
A
 
T
D
 
G
R
 
R
A
 
L
H
 
D
T
 
P
S
 
R
L
 
I
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
P
 
E
A
 
A
I
 
L
F
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
I
F
 
F
A
 
G
N
 
R
C
 
S
W
 
W
V
 
L
W
 
L
V
 
M
A
 
G
H
 
H
V
 
E
S
 
T
E
 
Q
V
 
I
K
 
P
E
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
M
S
 
T
T
 
N
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
R
 
E
Q
 
D
P
 
P
V
 
V
V
 
M
V
 
V
V
 
V
R
 
R
D
 
Q
R
 
K
K
 
N
Q
 
G
K
 
E
I
 
I
H
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
L
N
 
N
R
 
Q
C
|
C
R
 
R
H
|
H
R
|
R
A
 
G
A
 
M
T
 
R
V
 
I
C
 
C
E
 
R
E
 
A
K
 
D
K
 
G
G
 
G
K
 
N
T
 
A
N
 
K
S
 
S
F
 
F
V
 
T
C
|
C
P
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
W
|
W
S
 
A
Y
 
Y
G
 
D
L
 
T
D
 
G
G
 
G
S
 
N
L
 
L
R
 
V
G
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
F
P
 
E
E
 
E
S
 
Q
Y
 
A
G
 
F
Q
 
P
C
 
G
L
 
L
D
 
R
K
 
K
G
 
E
E
 
D
Y
 
W
P
 
G
L
 
P
K
 
L
S
 
Q
L
 
A
R
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
T
Y
 
Y
A
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
I
F
 
F
A
 
A
T
 
N
F
 
W
R
 
D
E
 
A
D
 
D
I
 
A
E
 
P
P
 
D
L
 
L
A
 
D
D
 
T
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
E
A
 
A
K
 
K
K
 
F
W
 
Y
M
 
M
D
 
D
L
 
H
F
 
M
M
 
L
R
 
D
Q
 
R
G
 
T
G
 
E
G
 
A
Y
 
G
P
 
T