SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_045585972.1 NCBI__GCF_001305595.1:WP_045585972.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
36% identity, 89% coverage: 11:251/271 of query aligns to 14:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
H
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
I
G
 
S
I
 
V
R
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
D
L
 
V
F
 
T
S
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
M
 
L
V
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
R
 
F
Y
 
L
R
 
K
P
 
A
T
 
D
D
 
E
G
 
G
K
 
R
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
K
 
E
G
 
N
R
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
T
G
 
N
M
 
K
T
 
E
P
 
P
N
 
A
H
 
E
R
 
L
A
 
Y
S
 
H
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
L
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
G
 
K
H
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
M
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
-
H
 
-
L
 
I
L
 
C
K
 
P
N
 
G
N
 
E
F
 
S
L
 
P
T
 
L
G
 
N
P
 
S
L
 
L
Y
 
F
W
 
Y
L
 
K
T
 
K
G
 
W
A
 
I
R
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
-
S
 
E
H
 
M
R
 
V
R
 
E
E
 
K
V
 
A
E
 
F
E
 
K
I
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
L
Q
 
S
H
 
H
V
 
L
R
 
Y
K
 
D
A
 
R
T
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
R
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
M
L
 
T
K
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
L
 
P
E
 
G
E
 
L
K
 
A
E
 
H
D
 
D
M
 
I
A
 
F
R
 
N
Y
 
H
I
 
V
V
 
L
D
 
E
L
 
L
N
 
K
E
 
A
E
 
K
F
 
-
G
 
G
M
 
I
T
 
T
V
 
F
V
 
L
M
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
I
 
Y
S
 
I
H
 
D
R
 
H
V
 
L
M
 
Y
V
 
V
L
 
M
E
 
F
F
 
N
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
K
V
 
V
R
 
V
R
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
E
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
36% identity, 89% coverage: 11:250/271 of query aligns to 14:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
H
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
I
G
 
S
I
 
V
R
 
C
K
 
K
G
 
G
E
 
D
L
 
V
F
 
T
S
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
M
 
L
V
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
R
 
F
Y
 
L
R
 
K
P
 
A
T
 
D
D
 
E
G
 
G
K
 
R
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
K
 
E
G
 
N
R
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
T
G
 
N
M
 
K
T
 
E
P
 
P
N
 
A
H
 
E
R
 
L
A
 
Y
S
 
H
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
L
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
G
 
K
H
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
M
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
I
H
 
N
L
 
P
L
 
G
K
 
E
N
 
S
N
 
P
F
 
L
L
 
-
T
 
-
G
 
N
P
 
S
L
 
L
Y
 
F
W
 
Y
L
 
K
T
 
K
G
 
W
A
 
I
R
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
-
S
 
E
H
 
M
R
 
V
R
 
E
E
 
K
V
 
A
E
 
F
E
 
K
I
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
L
Q
 
S
H
 
H
V
 
L
R
 
Y
K
 
D
A
 
R
T
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
R
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
M
L
 
T
K
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
L
 
P
E
 
G
E
 
L
K
 
A
E
 
H
D
 
D
M
 
I
A
 
F
R
 
N
Y
 
H
I
 
V
V
 
L
D
 
E
L
 
L
N
 
K
E
 
A
E
 
K
F
 
-
G
 
G
M
 
I
T
 
T
V
 
F
V
 
L
M
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
I
 
Y
S
 
I
H
 
D
R
 
H
V
 
L
M
 
Y
V
 
V
L
 
M
E
 
F
F
 
N
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
K
V
 
V
R
 
V
R
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
33% identity, 87% coverage: 17:251/271 of query aligns to 18:236/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
L
 
V
T
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
S
F
 
L
G
 
Q
I
 
V
R
 
E
K
 
S
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
F
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
S
 
T
M
 
S
V
 
F
N
 
Y
C
 
M
I
 
I
S
 
V
G
 
G
R
 
L
Y
 
V
R
 
A
P
 
R
T
 
D
D
 
E
G
 
G
K
 
T
V
 
I
Y
 
T
F
 
I
K
 
D
G
 
D
R
 
N
D
 
D
V
 
I
T
 
S
G
 
I
M
 
L
T
 
P
P
 
M
N
 
H
H
 
S
R
 
R
A
 
S
S
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
L
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
G
 
R
H
 
K
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
E
D
 
D
N
 
N
I
 
I
M
 
M
V
 
A
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
V
L
 
L
K
 
Q
N
 
T
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
K
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
T
H
 
H
R
x
E
R
 
E
E
 
R
V
 
Q
E
x
D
E
 
K
I
 
L
I
 
E
D
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
H
I
 
I
Q
 
Q
H
 
H
V
 
I
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
A
A
 
G
G
 
M
T
 
A
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
R
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
A
K
 
N
P
 
P
D
 
Q
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
S
K
 
V
E
 
I
D
 
D
M
 
I
A
 
K
R
 
K
Y
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
L
 
L
N
 
R
E
 
D
E
 
R
F
 
-
G
 
G
M
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
C
H
 
E
R
 
K
V
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
K
 
R
K
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
N
D
 
N
P
 
E
R
 
Q
V
 
V
R
 
K
R
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 85% coverage: 12:242/271 of query aligns to 16:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
G
 
G
G
 
K
V
 
V
H
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
F
 
I
G
 
N
I
 
I
R
 
E
K
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
R
F
 
F
S
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
F
V
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
Y
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
S
D
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
L
Y
 
Y
F
 
F
K
 
D
G
 
D
R
 
R
D
 
L
V
 
V
T
 
A
G
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
M
 
V
T
 
P
P
 
P
N
 
E
H
 
D
R
 
R
A
 
K
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
T
L
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
G
 
P
H
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
A
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
F
W
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
N
A
 
M
R
 
K
K
 
M
E
 
S
E
 
K
L
 
E
S
 
E
H
 
I
R
 
R
R
 
K
E
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
H
 
H
V
 
V
R
 
L
K
 
N
A
 
H
T
 
F
A
 
P
G
 
R
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
V
L
 
K
K
 
D
P
 
P
D
 
S
L
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
L
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
E
 
D
D
 
S
M
 
A
A
 
R
R
 
A
Y
 
L
I
 
V
V
 
K
D
 
E
L
 
V
N
 
Q
E
 
S
E
 
R
F
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
H
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
V
F
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
Y
A
 
D
D
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 85% coverage: 12:242/271 of query aligns to 16:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
G
 
G
G
 
K
V
 
V
H
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
F
 
I
G
 
N
I
 
I
R
 
E
K
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
R
F
 
F
S
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
F
V
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
Y
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
S
D
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
L
Y
 
Y
F
 
F
K
 
D
G
 
D
R
 
R
D
 
L
V
 
V
T
 
A
G
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
M
 
V
T
 
P
P
 
P
N
 
E
H
 
D
R
 
R
A
 
K
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
L
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
G
 
P
H
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
A
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
F
W
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
N
A
 
M
R
 
K
K
 
M
E
 
S
E
 
K
L
 
E
S
 
E
H
 
I
R
 
R
R
 
K
E
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
H
 
H
V
 
V
R
 
L
K
 
N
A
 
H
T
 
F
A
 
P
G
 
R
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
V
L
 
K
K
 
D
P
 
P
D
 
S
L
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
L
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
E
 
D
D
 
S
M
 
A
A
 
R
R
 
A
Y
 
L
I
 
V
V
 
K
D
 
E
L
 
V
N
 
Q
E
 
S
E
 
R
F
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
H
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
V
F
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
Y
A
 
D
D
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 85% coverage: 12:242/271 of query aligns to 16:232/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
G
 
G
G
 
K
V
 
V
H
 
V
A
|
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
F
 
I
G
 
N
I
 
I
R
 
E
K
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
R
F
 
F
S
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
F
V
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
Y
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
S
D
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
L
Y
 
Y
F
 
F
K
 
D
G
 
D
R
 
R
D
 
L
V
 
V
T
 
A
G
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
M
 
V
T
 
P
P
 
P
N
 
E
H
 
D
R
 
R
A
 
K
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
L
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
G
 
P
H
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
A
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
F
W
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
N
A
 
M
R
 
K
K
 
M
E
 
S
E
 
K
L
 
E
S
 
E
H
 
I
R
 
R
R
 
K
E
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
H
 
H
V
 
V
R
 
L
K
 
N
A
 
H
T
 
F
A
 
P
G
 
R
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
V
L
 
K
K
 
D
P
 
P
D
 
S
L
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
L
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
E
 
D
D
 
S
M
 
A
A
 
R
R
 
A
Y
 
L
I
 
V
V
 
K
D
 
E
L
 
V
N
 
Q
E
 
S
E
 
R
F
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
H
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
V
F
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
Y
A
 
D
D
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
33% identity, 85% coverage: 12:242/271 of query aligns to 16:232/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
G
 
G
G
 
K
V
 
V
H
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
F
 
I
G
 
N
I
 
I
R
 
E
K
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
R
F
 
F
S
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
S
 
T
M
 
F
V
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
Y
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
S
D
 
T
G
 
G
K
 
E
V
 
L
Y
 
Y
F
 
F
K
 
D
G
 
D
R
 
R
D
 
L
V
 
V
T
 
A
G
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
M
 
V
T
 
P
P
 
P
N
 
E
H
 
D
R
 
R
A
 
K
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
L
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
G
 
P
H
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
A
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
F
W
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
N
A
 
M
R
 
K
K
 
M
E
 
S
E
 
K
L
 
E
S
 
E
H
 
I
R
 
R
R
 
K
E
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
H
 
H
V
 
V
R
 
L
K
 
N
A
 
H
T
 
F
A
 
P
G
 
R
T
 
E
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
|
G
L
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
V
L
 
K
K
 
D
P
 
P
D
 
S
L
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
L
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
E
 
D
D
 
S
M
 
A
A
 
R
R
 
A
Y
 
L
I
 
V
V
 
K
D
 
E
L
 
V
N
 
Q
E
 
S
E
 
R
F
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
T
V
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
D
 
A
I
 
I
S
 
A
H
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
V
F
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
L
 
Y
A
 
D
D
 
N
P
 
P

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
28% identity, 92% coverage: 1:250/271 of query aligns to 6:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
M
 
V
F
 
L
E
 
E
A
 
V
R
 
Q
G
 
S
V
 
L
N
 
H
L
 
V
R
 
Y
F
x
Y
G
 
G
G
 
A
V
 
I
H
 
H
A
 
A
L
 
I
T
 
K
D
 
G
V
 
I
S
 
D
F
 
L
G
 
K
I
 
V
R
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
F
 
V
S
 
T
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
T
V
 
L
N
 
S
C
 
A
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
Y
 
V
R
 
R
P
 
A
T
 
Q
D
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
I
Y
 
I
F
 
F
K
 
N
G
 
G
R
 
Q
D
 
D
V
 
I
T
 
T
G
 
N
M
 
K
T
 
P
P
 
A
N
 
H
H
 
V
R
 
I
A
 
N
S
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
A
R
 
L
T
 
V
F
 
P
Q
x
E
N
 
G
L
 
R
A
 
R
L
 
I
F
 
F
G
 
P
H
 
E
M
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
L
M
 
M
V
 
M
G
 
G
R
 
A
H
 
Y
H
 
N
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
R
K
 
K
E
 
D
E
 
K
L
 
E
S
 
G
H
 
I
R
 
K
R
 
R
E
 
D
V
 
L
E
 
E
E
 
W
I
 
I
I
 
F
D
 
S
-
 
L
F
 
F
L
 
P
E
 
R
I
 
L
Q
 
K
H
 
E
V
 
R
R
 
L
K
 
K
A
 
Q
T
 
L
A
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
R
 
Q
K
 
Q
R
 
M
V
 
L
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
M
L
 
S
K
 
R
P
 
P
D
 
K
L
 
L
I
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
S
A
 
L
G
 
G
M
 
L
N
 
A
L
 
P
E
 
I
E
 
L
K
 
V
E
 
S
D
 
E
M
 
V
A
 
F
R
 
E
Y
 
V
I
 
I
V
 
Q
D
 
K
L
 
I
N
 
N
E
 
Q
E
 
E
F
 
-
G
 
G
M
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
L
M
 
L
I
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
G
 
L
V
 
G
V
 
A
M
 
L
D
 
K
I
 
V
S
 
A
H
 
H
R
 
Y
V
 
G
M
 
Y
V
 
V
L
 
L
E
 
E
F
 
T
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
V
A
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
A
E
 
S
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
D
D
 
N
P
 
E
R
 
M
V
 
V
R
 
R
R
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
32% identity, 93% coverage: 2:252/271 of query aligns to 3:237/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
F
 
L
E
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
L
N
 
A
L
 
K
R
 
A
F
 
Y
G
 
K
G
 
G
V
 
R
H
 
R
A
 
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
F
 
L
G
 
T
I
 
V
R
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
F
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
S
 
T
M
 
T
V
 
F
N
 
Y
C
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
R
 
-
Y
 
I
R
 
V
P
 
P
T
 
R
D
 
D
G
 
A
K
 
G
V
 
N
Y
 
I
F
 
I
K
 
I
G
 
D
R
 
D
D
 
D
V
 
D
T
 
I
G
 
S
M
 
L
T
 
L
P
 
P
N
 
L
H
 
H
-
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
L
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
G
x
R
H
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
L
 
V
T
 
L
G
 
Q
A
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
E
 
L
L
 
S
S
 
A
H
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
-
 
R
V
 
A
E
 
N
E
 
E
I
 
L
I
 
M
D
 
E
F
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
Q
 
E
H
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
T
x
M
A
x
G
G
x
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
R
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
A
K
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
S
K
 
V
E
 
I
D
 
D
M
 
I
A
 
K
R
 
R
Y
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
L
 
L
N
 
R
E
 
D
E
 
S
F
 
-
G
 
G
M
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
H
 
E
R
 
R
V
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
K
 
H
K
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
P
 
E
R
 
H
V
 
V
R
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
D
 
D

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
32% identity, 93% coverage: 2:252/271 of query aligns to 3:237/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
F
 
L
E
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
L
N
 
A
L
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
V
x
R
H
 
R
A
 
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
F
 
L
G
 
T
I
 
V
R
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
F
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
T
V
 
F
N
 
Y
C
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
R
 
-
Y
 
I
R
 
V
P
 
P
T
 
R
D
 
D
G
 
A
K
 
G
V
 
N
Y
 
I
F
 
I
K
 
I
G
 
D
R
 
D
D
 
D
V
 
D
T
 
I
G
 
S
M
 
L
T
 
L
P
 
P
N
 
L
H
 
H
-
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
L
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
G
 
R
H
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
L
 
V
T
 
L
G
 
Q
A
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
E
 
L
L
 
S
S
 
A
H
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
-
 
R
V
 
A
E
 
N
E
 
E
I
 
L
I
 
M
D
 
E
F
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
Q
 
E
H
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
T
 
M
A
 
G
G
 
Q
T
x
S
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
E
R
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
A
K
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
S
K
 
V
E
 
I
D
 
D
M
 
I
A
 
K
R
 
R
Y
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
L
 
L
N
 
R
E
 
D
E
 
S
F
 
-
G
 
G
M
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
H
 
E
R
 
R
V
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
K
 
H
K
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
P
 
E
R
 
H
V
 
V
R
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
D
 
D

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
32% identity, 93% coverage: 2:252/271 of query aligns to 4:238/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
F
 
L
E
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
L
N
 
A
L
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
V
x
R
H
 
R
A
x
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
F
 
L
G
 
T
I
 
V
R
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
F
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
T
V
 
F
N
 
Y
C
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
R
 
-
Y
 
I
R
 
V
P
 
P
T
 
R
D
 
D
G
 
A
K
 
G
V
 
N
Y
 
I
F
 
I
K
 
I
G
 
D
R
 
D
D
 
D
V
 
D
T
 
I
G
 
S
M
 
L
T
 
L
P
 
P
N
 
L
H
 
H
-
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
L
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
G
 
R
H
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
L
 
V
T
 
L
G
 
Q
A
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
E
 
L
L
 
S
S
 
A
H
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
-
 
R
V
 
A
E
 
N
E
 
E
I
 
L
I
 
M
D
 
E
F
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
Q
 
E
H
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
T
 
M
A
 
G
G
 
Q
T
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
R
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
A
K
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
S
K
 
V
E
 
I
D
 
D
M
 
I
A
 
K
R
 
R
Y
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
L
 
L
N
 
R
E
 
D
E
 
S
F
 
-
G
 
G
M
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
H
 
E
R
 
R
V
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
K
 
H
K
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
P
 
E
R
 
H
V
 
V
R
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
D
 
D

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
32% identity, 89% coverage: 1:242/271 of query aligns to 4:220/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
M
 
M
F
 
V
E
 
E
A
 
V
R
 
K
G
 
L
V
 
E
N
 
N
L
 
L
-
 
T
-
 
K
R
 
R
F
|
F
G
 
G
G
 
N
V
x
F
H
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
N
D
 
K
V
 
L
S
 
N
F
 
L
G
 
T
I
 
I
R
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
F
F
 
L
S
 
V
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
T
V
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
Y
 
E
R
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
E
G
 
G
K
 
R
V
 
I
Y
 
Y
F
 
F
K
 
G
G
 
D
R
 
R
D
 
D
V
 
V
T
 
T
G
 
Y
M
 
L
T
 
P
P
 
P
N
 
K
H
 
D
R
 
R
A
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
N
I
 
I
G
 
S
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
A
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
F
W
 
P
L
 
L
T
 
K
G
 
K
A
 
F
R
 
P
K
 
K
E
 
D
E
 
E
L
 
I
S
 
D
H
 
K
R
 
R
R
 
-
E
 
-
V
 
V
E
 
R
E
 
W
I
 
A
I
 
A
D
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
Q
I
 
I
Q
 
E
H
 
E
V
 
L
R
 
L
K
 
N
A
 
R
T
 
Y
A
 
P
G
 
A
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
V
L
 
V
K
 
E
P
 
P
D
 
D
L
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
L
 
A
E
 
K
E
 
L
K
 
R
E
 
V
D
 
A
M
 
M
A
 
R
R
 
A
Y
 
E
I
 
I
V
 
K
D
 
K
L
 
L
N
 
Q
E
 
Q
E
 
K
F
 
L
G
 
K
M
 
V
T
 
T
V
 
T
V
 
I
M
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
M
S
 
G
H
 
D
R
 
R
V
 
I
M
 
A
V
 
V
L
 
M
E
 
N
F
 
R
G
 
G
K
 
Q
K
 
L
I
 
L
A
 
Q
E
 
I
G
 
G
R
 
S
P
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
Y
A
 
L
D
 
R
P
 
P

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
31% identity, 97% coverage: 1:263/271 of query aligns to 2:253/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
M
 
L
F
 
I
E
 
E
A
 
V
R
 
K
G
 
N
V
 
L
N
 
S
L
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
H
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
S
F
 
L
G
 
N
I
 
I
R
 
R
K
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
F
 
T
S
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
L
V
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
L
R
 
V
P
 
P
T
 
D
D
 
Q
G
 
G
K
 
E
V
 
V
Y
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
R
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
Q
M
 
M
T
 
S
P
 
R
N
 
Q
H
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
M
G
 
-
R
 
-
T
 
L
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
L
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
T
H
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
A
-
 
F
-
 
P
V
 
I
G
 
R
R
 
A
H
 
H
H
 
T
L
 
K
L
 
L
K
 
S
N
 
E
N
 
N
F
 
L
L
 
I
T
 
A
G
 
E
P
 
L
L
 
V
Y
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
L
K
 
K
E
 
L
E
 
E
L
 
S
S
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
E
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
I
 
L
I
 
M
D
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
P
G
 
T
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
D
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
E
 
G
D
 
V
M
 
L
A
 
T
R
 
R
Y
 
L
I
 
I
V
 
R
D
 
S
L
 
L
N
 
R
E
 
E
E
 
A
F
 
L
G
 
D
M
 
L
T
 
T
V
 
T
V
 
I
M
 
I
I
 
V
E
 
S
H
|
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
H
 
D
R
 
Y
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
L
 
V
E
 
A
F
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
-
 
Q
-
 
A
L
 
Y
A
 
A
D
 
S
P
 
P
R
 
F
V
 
V
R
 
K
R
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
S
D
 
A
D
 
E
D
 
G
E
 
P
E
 
V
A
 
E
P
 
Y
A
 
Q
A
 
F
A
 
S
H
 
H
Q
 
Q

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
32% identity, 92% coverage: 2:250/271 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
F
 
L
E
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
L
N
 
A
L
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
V
 
R
H
 
R
A
 
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
F
 
L
G
 
T
I
 
V
R
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
F
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
T
V
 
F
N
 
Y
C
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
R
 
-
Y
 
I
R
 
V
P
 
P
T
 
R
D
 
D
G
 
A
K
 
G
V
 
N
Y
 
I
F
 
I
K
 
I
G
 
D
R
 
D
D
 
D
V
 
D
T
 
I
G
 
S
M
 
L
T
 
L
P
 
P
N
 
L
H
 
H
-
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
L
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
G
 
R
H
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
L
 
V
T
 
L
G
 
Q
A
 
I
R
 
R
K
 
D
E
 
D
E
 
L
L
 
S
S
 
A
H
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
-
 
R
V
 
A
E
 
N
E
 
E
I
 
L
I
 
M
D
 
E
F
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
Q
 
E
H
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
T
 
M
A
 
G
G
 
Q
T
x
S
L
 
L
S
|
S
Y
x
G
G
|
G
L
 
E
R
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
A
K
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
|
G
M
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
S
K
 
V
E
 
I
D
 
D
M
 
I
A
 
K
R
 
R
Y
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
L
 
L
N
 
R
E
 
D
E
 
S
F
 
-
G
 
G
M
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
H
 
E
R
 
R
V
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
E
 
S
F
 
Q
G
 
G
K
 
H
K
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
P
 
E
R
 
H
V
 
V
R
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
31% identity, 97% coverage: 1:263/271 of query aligns to 4:255/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
M
 
L
F
 
I
E
 
E
A
 
V
R
 
K
G
 
N
V
 
L
N
 
S
L
 
F
R
 
N
F
 
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
H
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
S
F
 
L
G
 
N
I
 
I
R
 
R
K
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
F
 
T
S
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
S
 
T
M
 
L
V
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
L
R
 
V
P
 
P
T
 
D
D
 
Q
G
 
G
K
 
E
V
 
V
Y
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
R
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
Q
M
 
M
T
 
S
P
 
R
N
 
Q
H
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
M
G
 
-
R
 
-
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
L
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
T
H
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
A
-
 
F
-
 
P
V
 
I
G
 
R
R
 
A
H
 
H
H
 
T
L
 
K
L
 
L
K
 
S
N
 
E
N
 
N
F
 
L
L
 
I
T
 
A
G
 
E
P
 
L
L
 
V
Y
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
L
K
 
K
E
 
L
E
 
E
L
 
S
S
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
E
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
I
 
L
I
 
M
D
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
P
G
 
T
T
x
E
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
M
R
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
D
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
E
 
G
D
 
V
M
 
L
A
 
T
R
 
R
Y
 
L
I
 
I
V
 
R
D
 
S
L
 
L
N
 
R
E
 
E
E
 
A
F
 
L
G
 
D
M
 
L
T
 
T
V
 
T
V
 
I
M
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
H
 
D
R
 
Y
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
L
 
V
E
 
A
F
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
-
 
Q
-
 
A
L
 
Y
A
 
A
D
 
S
P
 
P
R
 
F
V
 
V
R
 
K
R
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
S
D
 
A
D
 
E
D
 
G
E
 
P
E
 
V
A
 
E
P
 
Y
A
 
Q
A
 
F
A
 
S
H
 
H
Q
 
Q

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
31% identity, 97% coverage: 1:263/271 of query aligns to 4:255/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
M
 
L
F
 
I
E
 
E
A
 
V
R
 
K
G
 
N
V
 
L
N
 
S
L
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
V
x
R
H
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
S
F
 
L
G
 
N
I
 
I
R
 
R
K
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
F
 
T
S
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
L
V
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
L
R
 
V
P
 
P
T
 
D
D
 
Q
G
 
G
K
 
E
V
 
V
Y
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
R
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
Q
M
 
M
T
 
S
P
 
R
N
 
Q
H
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
M
G
 
-
R
 
-
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
L
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
T
H
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
A
-
 
F
-
 
P
V
 
I
G
 
R
R
 
A
H
 
H
H
 
T
L
 
K
L
 
L
K
 
S
N
 
E
N
 
N
F
 
L
L
 
I
T
 
A
G
 
E
P
 
L
L
 
V
Y
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
L
K
 
K
E
 
L
E
 
E
L
 
S
S
 
V
H
 
G
R
 
L
R
 
R
E
 
G
V
 
T
E
 
E
E
 
Q
I
 
L
I
 
M
D
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
P
G
 
T
T
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
D
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
E
 
G
D
 
V
M
 
L
A
 
T
R
 
R
Y
 
L
I
 
I
V
 
R
D
 
S
L
 
L
N
 
R
E
 
E
E
 
A
F
 
L
G
 
D
M
 
L
T
 
T
V
 
T
V
 
I
M
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
H
 
D
R
 
Y
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
L
 
V
E
 
A
F
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
-
 
Q
-
 
A
L
 
Y
A
 
A
D
 
S
P
 
P
R
 
F
V
 
V
R
 
K
R
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
S
D
 
A
D
 
E
D
 
G
E
 
P
E
 
V
A
 
E
P
 
Y
A
 
Q
A
 
F
A
 
S
H
 
H
Q
 
Q

3d31A Modbc from methanosarcina acetivorans (see paper)
32% identity, 84% coverage: 16:242/271 of query aligns to 15:219/348 of 3d31A

query
sites
3d31A
A
 
S
L
 
L
T
 
D
D
 
N
V
 
L
S
 
S
F
 
L
G
 
K
I
 
V
R
 
E
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
Y
F
 
F
S
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
S
 
L
M
 
F
V
 
L
N
 
E
C
 
L
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
F
Y
 
H
R
 
V
P
 
P
T
 
D
D
 
S
G
 
G
K
 
R
V
 
I
Y
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
R
 
K
D
 
D
V
 
V
T
 
T
G
 
D
M
 
L
T
 
S
P
 
P
N
 
E
H
 
K
R
 
H
A
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
D
I
 
I
G
 
A
R
 
F
T
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
L
 
Y
A
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
P
H
 
H
M
 
M
T
 
N
V
 
V
L
 
K
D
 
K
N
 
N
I
 
L
M
 
E
V
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
M
K
 
R
N
 
M
N
 
K
F
 
K
L
 
I
T
 
K
G
 
D
P
 
P
L
 
K
Y
 
R
W
 
V
L
 
L
T
 
D
G
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
D
E
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
H
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
L
 
L
E
 
K
I
 
I
Q
 
E
H
 
H
V
 
L
R
 
L
K
 
D
A
 
R
T
 
N
A
 
P
G
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
V
L
 
T
K
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
L
 
P
E
 
R
E
 
T
K
 
Q
E
 
E
D
 
N
M
 
A
A
 
R
R
 
E
Y
 
M
I
 
L
V
 
S
D
 
V
L
 
L
N
 
H
E
 
K
E
 
K
F
 
N
G
 
K
M
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
L
M
 
H
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
T
V
 
E
V
 
A
M
 
R
D
 
I
I
 
M
S
 
A
H
 
D
R
 
R
V
 
I
M
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
M
F
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
L
I
 
I
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
E
D
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
31% identity, 85% coverage: 10:238/271 of query aligns to 13:223/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
R
 
K
F
|
F
G
 
G
G
 
D
V
x
F
H
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
K
D
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
G
 
S
I
 
V
R
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
I
F
 
F
S
 
A
I
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
T
V
 
I
N
 
H
C
 
M
I
 
L
S
 
T
G
 
T
R
 
L
Y
 
L
R
 
K
P
 
P
T
 
T
D
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
A
Y
 
W
F
 
V
K
 
A
G
 
G
R
 
H
D
 
D
V
 
V
T
 
L
G
 
K
M
 
E
T
 
P
P
 
R
N
 
E
H
 
V
R
 
R
A
 
R
S
 
K
L
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
D
L
 
Q
A
 
S
L
 
L
F
 
D
G
 
R
H
 
E
M
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
N
 
-
F
 
Y
L
 
I
T
 
H
G
 
G
P
 
K
L
 
I
Y
 
Y
W
 
G
L
 
Y
T
 
G
G
 
G
A
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
E
E
 
K
L
 
L
S
 
K
H
 
K
R
 
R
R
 
-
E
 
-
V
 
I
E
 
L
E
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
V
E
 
E
I
 
L
Q
 
L
H
 
E
V
 
F
R
 
K
K
 
D
A
 
K
T
 
P
A
 
V
G
 
K
T
|
T
L
x
F
S
|
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
S
I
 
L
A
 
I
L
 
H
K
 
E
P
 
P
D
 
E
L
 
V
I
 
L
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
I
G
 
G
M
 
L
N
 
D
L
 
P
E
 
H
E
 
T
K
 
R
E
 
A
D
 
H
M
 
M
A
 
W
R
 
E
Y
 
Y
I
 
I
V
 
S
D
 
K
L
 
M
N
 
K
E
 
K
E
 
E
F
 
H
G
 
N
M
 
M
T
 
T
V
 
I
V
 
F
M
 
L
I
 
T
E
 
T
H
 
H
D
 
Y
M
 
M
G
 
D
V
 
E
V
 
A
M
 
E
D
 
Q
I
 
L
S
 
A
H
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
A
V
 
I
L
 
I
E
 
D
F
 
H
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
L
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
L

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
31% identity, 92% coverage: 2:249/271 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
F
 
L
E
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
L
N
 
A
L
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
V
x
R
H
 
R
A
x
V
L
 
V
T
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
F
 
L
G
 
T
I
 
V
R
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
F
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
M
 
T
V
 
F
N
 
Y
C
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
R
 
-
Y
 
I
R
 
V
P
 
P
T
 
R
D
 
D
G
 
A
K
 
G
V
 
N
Y
 
I
F
 
I
K
 
I
G
 
D
R
 
D
D
 
D
V
 
D
T
 
I
G
 
S
M
 
L
T
 
L
P
 
P
N
x
L
H
|
H
-
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
x
P
Q
|
Q
N
 
E
L
x
A
A
x
S
L
 
I
F
|
F
G
x
R
H
x
R
M
x
L
T
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
-
R
 
-
H