SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_046560901.1 NCBI__GCF_000981765.1:WP_046560901.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3uboA The crystal structure of adenosine kinase from sinorhizobium meliloti
35% identity, 96% coverage: 4:327/337 of query aligns to 2:325/338 of 3uboA

query
sites
3uboA
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
I
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
A
E
 
R
V
 
C
N
 
D
E
 
D
T
 
S
E
 
F
L
 
L
E
 
E
R
 
E
L
 
N
G
 
G
V
 
I
E
 
I
K
 
K
G
 
G
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
N
E
 
A
E
 
D
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
V
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
D
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
E
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
H
N
 
F
T
 
Q
L
 
T
S
 
K
Q
 
P
L
 
L
E
 
D
G
 
G
N
 
H
E
 
P
G
 
-
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
D
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
Q
S
 
S
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
D
A
 
A
A
 
I
I
 
R
K
 
E
A
 
A
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
A
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
T
A
 
A
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
H
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
S
E
 
E
-
 
F
I
 
L
E
 
E
Q
 
L
I
 
M
L
 
R
D
 
S
G
 
G
G
 
T
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
|
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
A
Y
 
L
T
 
Y
G
 
E
T
 
T
D
 
E
N
 
D
V
 
F
E
 
D
K
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
E
I
 
L
L
 
L
S
 
A
Q
 
R
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
L
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
|
T
L
 
L
G
x
S
K
x
E
E
 
E
G
|
G
A
 
S
L
 
V
S
 
V
F
 
V
D
 
R
G
 
G
-
 
A
E
 
E
K
 
R
V
 
V
Q
 
R
T
 
V
I
 
G
E
 
A
P
 
S
F
 
V
K
x
L
V
 
E
K
 
Q
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
Y
A
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
E
S
 
C
G
 
S
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
x
N
F
 
L
A
 
A
S
x
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
x
I
T
 
G
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R
-
 
P
L
 
L
K
 
V
S
 
S
E
 
L
A
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
A
L
 
R
Q
 
Q

4k8pA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 2-ethylbenzyl alcohol
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 5:317/332 of 4k8pA

query
sites
4k8pA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
x
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
x
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
x
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
 
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R

4lbxA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with cytidine
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 4:316/331 of 4lbxA

query
sites
4lbxA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
|
T
L
 
M
G
x
S
K
 
E
E
 
N
G
|
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
x
C
F
 
L
A
 
A
S
x
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
x
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R

4k8kA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 1-(4-methoxyphenyl)-1-cyclopropane and 2- aminoperimidine
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 4:316/331 of 4k8kA

query
sites
4k8kA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
x
A
E
 
E
R
 
R
H
x
A
D
x
E
Y
 
L
L
 
L
L
x
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
x
A
D
|
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
x
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
x
P
T
 
T
G
 
A
K
x
R
C
 
S
L
x
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
x
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
 
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R

4lc4A Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with guanosine
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4lc4A

query
sites
4lc4A
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
|
T
L
 
M
G
x
S
K
x
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
x
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
x
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R

4kbeA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with benzoguanamine
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4kbeA

query
sites
4kbeA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
x
I
I
x
S
E
x
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
x
P
N
x
A
I
x
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
 
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R

4kanA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 2-(2,5-dimethyl-1,3-thiazol-4-yl)acetic acid
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4kanA

query
sites
4kanA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
x
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
x
A
D
x
E
Y
 
L
L
 
L
L
x
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
x
R
C
 
S
L
x
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
|
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
|
T
L
 
M
G
x
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R

4kalA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with quinoline-3-carboxylic acid
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4kalA

query
sites
4kalA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
x
S
N
x
F
M
 
C
V
 
V
R
x
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
x
S
Y
 
L
T
 
Y
G
x
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
 
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
 
P
R
 
R

4kahA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 4-bromo-1h-pyrazole
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4kahA

query
sites
4kahA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
x
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
x
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
x
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
 
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R

4kadA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with n1-(2.3-dihydro-1h-inden-5-yl)acetam
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4kadA

query
sites
4kadA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
x
S
K
x
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
x
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
x
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
 
P
R
 
R

4k9iA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with norharmane
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4k9iA

query
sites
4k9iA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
x
S
N
x
F
M
 
C
V
 
V
R
x
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
x
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
 
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
 
P
R
 
R

4k9cA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with n-(hydroxymethyl)benzamide and 4-methyl-3,4- dihydro-2h-1,4-benzoxazine-7-carboxylic acid
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4k9cA

query
sites
4k9cA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
x
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
x
Q
A
x
L
G
 
G
V
x
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
x
P
T
 
T
G
 
A
K
x
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
x
S
N
x
F
M
 
C
V
 
V
R
x
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
x
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
 
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R

4k93A Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with n-(hydroxymethyl)benzamide
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4k93A

query
sites
4k93A
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
|
L
V
x
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
x
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
x
Q
A
 
L
G
 
G
V
x
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
x
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
|
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
x
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
x
S
N
x
F
M
 
C
V
 
V
R
x
D
F
 
R
F
 
Y
K
x
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
|
L
E
x
S
Y
 
L
T
 
Y
G
x
Q
T
 
T
D
|
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
x
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
 
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R

4k8tA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with ethyl 3,4-diaminobenzoate
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4k8tA

query
sites
4k8tA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
x
F
G
 
P
T
x
P
T
 
T
G
 
A
K
x
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
x
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
 
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
|
P
R
 
R

4k8cA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with adp
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4k8cA

query
sites
4k8cA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
 
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
N
 
F
M
 
C
V
 
V
R
 
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
|
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
S
Y
 
L
T
 
Y
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
|
T
L
 
M
G
x
S
K
x
E
E
 
N
G
|
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
x
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
x
C
F
 
L
A
 
A
S
x
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
x
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
 
P
R
 
R

4jkuA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with quinaldic acid, nysgrc target 14306
33% identity, 93% coverage: 4:317/337 of query aligns to 3:315/330 of 4jkuA

query
sites
4jkuA
K
 
R
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
L
x
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
E
 
I
I
 
S
E
 
R
V
 
C
N
 
N
E
 
D
T
 
Q
E
 
F
L
 
L
E
 
I
R
 
D
L
 
N
G
 
Q
V
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
V
 
A
M
|
M
T
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
A
D
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
Y
G
 
S
H
 
R
L
 
M
K
 
G
G
 
P
N
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
A
 
A
A
 
G
N
|
N
S
 
T
V
 
A
I
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
A
H
 
Y
S
 
F
C
 
G
K
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
D
F
 
I
Y
 
F
S
 
T
D
 
H
D
 
D
L
 
I
D
 
R
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
H
T
 
Y
L
 
Q
S
 
T
Q
 
K
L
 
P
E
 
K
G
 
G
N
 
A
E
 
F
G
 
P
T
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
R
C
 
S
L
 
M
V
 
I
M
 
F
I
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
A
 
G
D
 
E
R
|
R
T
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
C
S
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
G
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
E
Y
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
V
G
 
A
D
 
D
S
 
A
Q
 
K
Y
 
V
L
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
V
 
W
S
 
D
S
 
P
P
 
P
D
 
R
A
 
A
H
 
K
F
 
E
A
 
A
A
 
I
I
 
L
K
 
D
A
 
C
R
 
A
D
 
R
F
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
G
 
G
V
 
R
K
 
E
V
 
M
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
x
S
N
x
F
M
 
C
V
 
V
R
x
D
F
 
R
F
 
Y
K
 
R
P
 
G
E
 
E
I
 
F
E
 
L
Q
 
D
I
 
L
L
 
M
D
 
R
G
 
S
G
 
G
-
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
F
 
F
C
 
A
N
 
N
D
 
R
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
x
S
Y
 
L
T
 
Y
G
x
Q
T
 
T
D
 
D
N
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
R
L
 
I
S
 
A
Q
 
A
Q
 
D
A
 
C
K
 
K
Q
 
I
V
 
A
V
 
A
I
 
V
T
 
T
L
 
M
G
 
S
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
I
F
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
R
Q
 
Y
T
 
Y
I
 
V
E
 
N
P
 
A
F
 
I
K
 
R
V
 
I
K
 
R
-
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
N
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
G
F
 
F
M
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
N
 
Q
G
 
G
L
 
R
S
 
S
W
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
C
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
C
F
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
G
H
 
I
L
 
V
V
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
G
 
G
P
 
P
R
 
R

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
32% identity, 79% coverage: 49:315/337 of query aligns to 20:286/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
G
 
G
H
 
H
L
 
L
K
 
R
G
 
G
-
 
K
N
 
R
I
 
L
H
 
L
Q
 
E
R
 
V
A
 
Y
S
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
A
 
E
A
 
V
N
 
N
S
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
V
K
 
K
A
 
V
F
 
G
H
 
F
S
 
V
C
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
G
K
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
L
G
 
G
V
 
A
F
 
M
Y
 
V
S
 
E
D
 
E
D
 
R
L
 
L
D
 
R
D
 
A
A
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
D
N
 
-
T
 
-
L
 
L
S
 
T
Q
 
H
L
 
F
E
 
R
G
 
R
N
 
A
E
 
P
G
 
G
T
 
F
T
 
T
G
 
G
K
 
L
C
 
Y
L
 
L
V
 
R
M
 
E
I
 
Y
T
 
L
P
 
P
D
 
L
A
 
G
D
 
Q
R
 
G
T
 
R
M
 
V
N
 
F
T
 
Y
F
 
Y
L
 
R
G
 
K
I
 
G
S
 
S
-
 
A
-
 
G
S
 
S
E
 
A
L
 
L
K
 
A
E
 
P
Q
 
G
D
 
A
I
 
F
N
 
D
Y
 
P
E
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
E
D
 
G
S
 
V
Q
 
R
Y
 
F
L
 
L
Y
 
H
I
 
L
E
 
S
G
 
G
Y
 
I
L
 
T
V
 
P
S
 
A
-
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
E
A
 
A
H
 
R
F
 
A
A
 
F
A
 
S
I
 
L
K
 
W
A
 
A
R
 
M
D
 
E
F
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
R
K
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
V
A
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
 
R
T
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
W
D
 
S
P
 
P
N
 
E
M
 
E
V
 
A
R
 
R
F
 
G
F
 
F
K
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
L
E
 
E
Q
 
R
I
 
A
L
 
L
D
 
P
G
 
G
G
 
-
V
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
L
N
 
S
D
 
E
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
E
E
 
L
Y
 
L
T
 
F
G
 
G
T
 
-
D
 
-
N
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
R
I
 
A
L
 
L
S
 
S
Q
 
-
Q
 
-
A
 
A
K
 
P
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
x
K
L
 
R
G
|
G
K
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
W
S
 
A
F
 
F
-
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
R
K
 
R
V
 
V
Q
 
E
T
 
G
I
 
-
E
 
S
P
x
A
F
|
F
K
 
A
V
|
V
K
 
E
A
 
A
L
 
V
D
 
D
T
 
P
N
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
Y
M
 
L
F
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
V
N
 
W
G
 
G
L
 
L
S
 
P
W
 
V
A
 
E
D
 
E
S
 
R
G
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
A
S
x
N
F
 
L
A
 
L
S
 
G
A
|
A
H
 
S
L
 
V
V
 
A
T
 
A
Q
 
S
F
 
R
G
 
G

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
32% identity, 79% coverage: 49:315/337 of query aligns to 20:286/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
G
 
G
H
 
H
L
 
L
K
 
R
G
 
G
-
 
K
N
 
R
I
 
L
H
 
L
Q
 
E
R
 
V
A
 
Y
S
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
A
A
 
E
A
 
V
N
|
N
S
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
V
K
 
K
A
 
V
F
 
G
H
 
F
S
 
V
C
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
G
K
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
L
G
 
G
V
 
A
F
 
M
Y
 
V
S
 
E
D
 
E
D
 
R
L
 
L
D
 
R
D
 
A
A
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
D
N
 
-
T
 
-
L
 
L
S
 
T
Q
 
H
L
 
F
E
 
R
G
 
R
N
 
A
E
 
P
G
 
G
T
 
F
T
 
T
G
 
G
K
 
L
C
x
Y
L
 
L
V
 
R
M
 
E
I
 
Y
T
 
L
P
 
P
D
 
L
A
 
G
D
 
Q
R
 
G
T
 
R
M
 
V
N
 
F
T
 
Y
F
 
Y
L
x
R
G
 
K
I
 
G
S
 
S
-
 
A
-
 
G
S
 
S
E
 
A
L
 
L
K
 
A
E
 
P
Q
 
G
D
 
A
I
 
F
N
 
D
Y
 
P
E
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
E
D
 
G
S
 
V
Q
 
R
Y
 
F
L
 
L
Y
 
H
I
 
L
E
 
S
G
 
G
Y
 
I
L
 
T
V
 
P
S
 
A
-
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
E
A
 
A
H
 
R
F
 
A
A
 
F
A
 
S
I
 
L
K
 
W
A
 
A
R
 
M
D
 
E
F
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
R
K
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
V
A
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
x
R
T
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
W
D
 
S
P
 
P
N
 
E
M
 
E
V
 
A
R
 
R
F
 
G
F
 
F
K
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
L
E
 
E
Q
 
R
I
 
A
L
 
L
D
 
P
G
 
G
G
 
-
V
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
L
N
 
S
D
 
E
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
E
E
 
L
Y
 
L
T
 
F
G
 
G
T
 
-
D
 
-
N
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
R
I
 
A
L
 
L
S
 
S
Q
 
-
Q
 
-
A
 
A
K
 
P
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
x
K
L
 
R
G
|
G
K
x
A
E
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
W
S
 
A
F
 
F
-
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
R
K
 
R
V
 
V
Q
 
E
T
 
G
I
 
-
E
 
S
P
 
A
F
 
F
K
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
L
 
V
D
 
D
T
 
P
N
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
Y
M
 
L
F
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
V
N
 
W
G
 
G
L
 
L
S
 
P
W
 
V
A
 
E
D
 
E
S
 
R
G
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
A
S
x
N
F
 
L
A
 
L
S
 
G
A
|
A
H
 
S
L
 
V
V
 
A
T
 
A
Q
 
S
F
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
32% identity, 79% coverage: 49:315/337 of query aligns to 20:286/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
G
 
G
H
 
H
L
 
L
K
 
R
G
 
G
-
 
K
N
 
R
I
 
L
H
 
L
Q
 
E
R
 
V
A
 
Y
S
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
A
A
x
E
A
x
V
N
|
N
S
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
V
K
 
K
A
 
V
F
 
G
H
 
F
S
 
V
C
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
G
K
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
L
G
 
G
V
 
A
F
 
M
Y
 
V
S
 
E
D
 
E
D
 
R
L
 
L
D
 
R
D
 
A
A
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
D
N
 
-
T
 
-
L
 
L
S
 
T
Q
 
H
L
 
F
E
 
R
G
 
R
N
 
A
E
 
P
G
 
G
T
 
F
T
 
T
G
 
G
K
 
L
C
 
Y
L
 
L
V
 
R
M
 
E
I
 
Y
T
 
L
P
 
P
D
 
L
A
 
G
D
 
Q
R
 
G
T
 
R
M
 
V
N
 
F
T
x
Y
F
x
Y
L
x
R
G
 
K
I
 
G
S
 
S
-
 
A
-
 
G
S
 
S
E
 
A
L
 
L
K
 
A
E
 
P
Q
 
G
D
 
A
I
 
F
N
 
D
Y
 
P
E
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
E
D
 
G
S
 
V
Q
 
R
Y
 
F
L
 
L
Y
 
H
I
 
L
E
 
S
G
 
G
Y
 
I
L
 
T
V
 
P
S
 
A
-
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
E
A
 
A
H
 
R
F
 
A
A
 
F
A
 
S
I
 
L
K
 
W
A
 
A
R
 
M
D
 
E
F
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
R
K
 
R
G
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
V
A
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
x
R
T
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
W
D
 
S
P
 
P
N
 
E
M
 
E
V
 
A
R
 
R
F
 
G
F
 
F
K
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
L
E
 
E
Q
 
R
I
 
A
L
 
L
D
 
P
G
 
G
G
 
-
V
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
L
N
x
S
D
 
E
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
E
E
 
L
Y
 
L
T
 
F
G
 
G
T
 
-
D
 
-
N
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
R
I
 
A
L
 
L
S
 
S
Q
 
-
Q
 
-
A
 
A
K
 
P
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
x
K
L
x
R
G
|
G
K
x
A
E
x
K
G
|
G
A
|
A
L
 
W
S
 
A
F
 
F
-
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
R
K
 
R
V
 
V
Q
 
E
T
 
G
I
 
-
E
 
S
P
 
A
F
 
F
K
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
L
 
V
D
 
D
T
 
P
N
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
M
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
G
F
 
Y
M
 
L
F
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
V
N
 
W
G
 
G
L
 
L
S
 
P
W
 
V
A
 
E
D
 
E
S
 
R
G
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
A
S
x
N
F
 
L
A
 
L
S
 
G
A
 
A
H
 
S
L
 
V
V
 
A
T
 
A
Q
 
S
F
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
28% identity, 78% coverage: 53:315/337 of query aligns to 28:283/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
G
 
G
N
 
E
I
 
D
H
 
Y
Q
 
Q
R
 
T
A
 
H
S
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
K
A
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
Q
V
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
V
F
 
R
H
 
M
S
 
L
C
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
G
K
 
E
D
 
D
E
 
P
A
 
F
G
 
G
V
 
Q
F
 
A
Y
 
L
S
 
K
D
 
S
D
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
Q
A
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
-
N
 
D
T
 
V
L
 
A
S
 
W
Q
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
-
N
 
T
E
 
P
G
 
G
T
 
P
T
 
S
G
 
G
K
 
T
C
 
G
L
 
F
V
 
I
M
 
L
I
 
V
T
 
D
P
 
P
D
 
E
A
 
G
D
 
Q
R
 
N
T
 
Q
M
 
I
N
 
A
T
 
V
F
 
A
L
 
P
G
 
G
I
 
A
S
 
N
S
 
A
E
 
R
L
 
L
K
 
V
E
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
L
N
 
P
Y
 
A
E
 
T
A
 
A
L
 
F
G
 
Q
D
 
G
S
 
V
Q
 
G
Y
 
V
L
 
V
Y
 
L
I
 
L
E
 
Q
G
 
L
Y
 
E
L
 
I
V
 
P
S
 
L
S
 
E
P
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
F
 
-
A
 
T
A
 
V
I
 
V
K
 
R
A
 
A
R
 
A
D
 
A
F
 
L
A
 
G
R
 
R
E
 
K
K
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
I
A
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
L
S
 
L
D
 
N
P
 
A
N
 
A
M
 
P
V
 
A
R
 
H
F
 
A
F
 
L
K
 
P
P
 
S
E
 
E
I
 
I
E
 
L
Q
 
Q
I
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
L
C
 
V
N
|
N
D
 
E
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
A
E
 
Q
Y
 
L
T
 
T
-
 
E
-
 
A
-
 
S
G
 
P
T
 
P
D
 
R
N
 
T
V
 
P
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
A
I
 
L
L
 
A
S
 
R
Q
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
A
Q
 
P
A
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
|
T
L
 
L
G
|
G
K
x
A
E
 
Q
G
|
G
A
 
A
L
 
V
S
 
-
F
 
W
D
 
S
G
 
G
E
 
T
K
 
E
V
 
E
Q
 
S
T
 
H
I
 
F
E
 
P
P
 
A
F
 
F
K
 
P
V
 
V
K
 
R
A
 
A
L
 
V
D
|
D
T
 
T
N
x
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
M
 
A
F
|
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
L
M
 
A
F
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
N
 
E
G
 
G
L
 
Q
S
 
N
W
 
M
A
 
R
D
 
A
S
 
A
G
 
L
K
 
R
L
 
F
A
 
A
S
x
N
F
 
A
A
 
A
S
x
G
A
|
A
H
 
L
L
x
A
V
x
T
T
 
T
Q
 
R
F
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_046560901.1 NCBI__GCF_000981765.1:WP_046560901.1
MTKKYDLYALGNALVDVEIEVNETELERLGVEKGVMTLVDEERHDYLLGHLKGNIHQRAS
GGSAANSVIALAQLGGKAFHSCKVAKDEAGVFYSDDLDDAGVTNTLSQLEGNEGTTGKCL
VMITPDADRTMNTFLGISSELKEQDINYEALGDSQYLYIEGYLVSSPDAHFAAIKARDFA
REKGVKVATTLSDPNMVRFFKPEIEQILDGGVDLLFCNDDEALEYTGTDNVEKALTILSQ
QAKQVVITLGKEGALSFDGEKVQTIEPFKVKALDTNGAGDMFAGAFMFGLTNGLSWADSG
KLASFASAHLVTQFGPRLKSEAVAELQQFVKKEFSIQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory