SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_047006779.1 NCBI__GCF_001010925.1:WP_047006779.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4b5bA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 1:290/293 of 4b5bA

query
sites
4b5bA
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
C
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

4b4gA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 1:290/293 of 4b4gA

query
sites
4b4gA
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
x
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
C
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
Q
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

4b42A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 1:290/293 of 4b42A

query
sites
4b42A
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
x
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
C
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

4b3uA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 7:296/299 of 4b3uA

query
sites
4b3uA
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
C
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

4asyA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 1:290/293 of 4asyA

query
sites
4asyA
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
C
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

4b2xB Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 10:299/302 of 4b2xB

query
sites
4b2xB
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
C
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
Q
|
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

1h5tA Thymidylyltransferase complexed with thymidylyldiphosphate-glucose (see paper)
68% identity, 97% coverage: 3:287/293 of query aligns to 3:287/290 of 1h5tA

query
sites
1h5tA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
N
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
D
S
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
G
x
D
L
 
L
P
 
P
E
 
K
V
 
L
L
 
M
H
 
E
S
 
A
A
 
A
H
 
V
A
 
N
R
 
K
D
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
K
N
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
N
T
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
Q
R
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
I
N
 
N
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
Q
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
A
I
 
M
M
 
M
G
 
G
R
|
R
G
|
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
Q
S
 
S
L
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
N
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
C
x
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
W
 
F
R
 
R
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
D
 
V
A
 
E
G
 
Q
L
 
V
E
 
R
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
V
P
 
P
L
 
L
Q
 
I
K
 
K
S
 
N
G
 
N
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
Y
A
 
K
L
 
M

1h5rA Thymidylyltransferase complexed with thimidine and glucose-1-phospate (see paper)
68% identity, 97% coverage: 3:287/293 of query aligns to 3:287/290 of 1h5rA

query
sites
1h5rA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
N
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
D
S
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
K
V
 
L
L
 
M
H
 
E
S
 
A
A
 
A
H
 
V
A
 
N
R
 
K
D
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
K
N
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
N
T
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
Q
R
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
I
N
 
N
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
Q
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
A
I
 
M
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
Q
S
 
S
L
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
N
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
C
x
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
F
R
 
R
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
D
 
V
A
 
E
G
 
Q
L
 
V
E
 
R
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
V
P
 
P
L
 
L
Q
 
I
K
 
K
S
 
N
G
 
N
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
Y
A
 
K
L
 
M

5fuhA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 6:295/298 of 5fuhA

query
sites
5fuhA
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
x
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
C
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

4b4bA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 6:295/298 of 4b4bA

query
sites
4b4bA
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
C
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
Q
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

5fu8A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 5:294/297 of 5fu8A

query
sites
5fu8A
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
x
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
C
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
Q
|
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

4b4mA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 4:293/296 of 4b4mA

query
sites
4b4mA
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
C
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
Q
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

4b2wA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
70% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 5:294/297 of 4b2wA

query
sites
4b2wA
M
 
M
T
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
C
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
Q
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
K
 
K
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E

1h5sB Thymidylyltransferase complexed with tmp (see paper)
69% identity, 96% coverage: 3:284/293 of query aligns to 4:285/291 of 1h5sB

query
sites
1h5sB
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
N
 
S
P
|
P
D
|
D
G
|
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
D
S
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
G
x
D
L
 
L
P
 
P
E
 
K
V
 
L
L
 
M
H
 
E
S
 
A
A
 
A
H
 
V
A
 
N
R
 
K
D
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
K
N
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
A
S
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
N
T
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
Q
R
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
I
N
 
N
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
M
 
L
D
 
E
H
 
Q
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
A
I
 
L
M
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
Q
S
 
S
L
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
N
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
C
x
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
F
R
|
R
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
D
 
V
A
 
E
G
 
Q
L
 
V
E
 
R
A
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
V
P
 
P
L
 
L
Q
 
I
K
 
K
S
 
N
G
 
N
Y
 
Y
G
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

P26393 Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase; dTDP-glucose pyrophosphorylase; Ep; dTDP-glucose synthase; EC 2.7.7.24 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
67% identity, 98% coverage: 2:288/293 of query aligns to 3:289/292 of P26393

query
sites
P26393
T
 
T
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
D
 
D
A
 
D
S
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
K
V
 
L
L
 
M
H
 
E
S
 
A
A
 
A
H
 
V
A
 
N
R
 
K
D
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
R
 
H
V
 
V
K
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
N
 
K
G
 
G
R
 
T
A
 
A
S
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
E
 
L
K
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
N
T
 
S
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
|
T
D
 
D
L
 
I
N
 
N
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
M
 
M
D
 
E
H
 
Q
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
A
I
 
M
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
A
 
Q
S
 
S
L
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
N
Y
 
F
V
 
I
R
 
A
I
 
T
T
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
C
 
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
W
 
F
R
 
R
Q
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
D
 
A
A
 
Q
G
 
Q
L
 
V
E
 
I
A
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
S
K
 
K
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
G
 
G
D
 
K
Y
 
Y
L
 
L
M
 
L
A
 
K
L
 
M
L
 
V

4asjA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
70% identity, 98% coverage: 3:290/293 of query aligns to 2:289/292 of 4asjA

query
sites
4asjA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
R
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
N
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
H
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
x
F
P
 
H
E
 
E
V
 
L
L
 
L
H
 
G
S
 
S
A
 
A
H
 
S
A
 
Q
R
 
R
D<