SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_047213490.1 NCBI__GCF_001931675.1:WP_047213490.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q46856 Alcohol dehydrogenase YqhD; EC 1.1.1.2 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
61% identity, 100% coverage: 1:384/385 of query aligns to 1:386/387 of Q46856

query
sites
Q46856
M
 
M
Q
 
N
N
 
N
F
 
F
D
 
N
Y
 
L
F
 
H
N
 
T
P
 
P
T
 
T
R
 
R
I
 
I
V
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
K
D
 
G
T
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
G
L
 
L
S
 
R
E
 
E
L
 
Q
L
 
I
P
 
P
S
 
H
G
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
A
x
G
S
|
S
A
 
V
E
 
K
K
 
K
N
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
L
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
R
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
K
K
 
G
H
 
M
D
 
D
F
 
V
A
 
L
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
L
 
L
M
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
K
Q
 
L
V
 
V
H
 
R
R
 
E
E
 
Q
Q
 
K
R
 
V
D
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
|
V
I
x
L
D
|
D
G
 
G
T
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
F
 
Y
-
 
P
-
 
E
D
 
N
G
 
I
E
 
D
P
 
P
W
 
W
Q
 
H
I
 
I
M
 
L
E
 
Q
A
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
K
N
 
E
V
 
I
T
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
S
 
C
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
S
N
|
N
N
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
R
 
R
R
 
K
A
 
T
T
 
T
H
 
G
A
 
D
K
|
K
L
 
Q
P
 
A
F
 
F
H
 
H
S
 
S
Q
 
A
H
 
H
T
 
V
F
 
Q
P
 
P
R
 
V
F
 
F
S
 
A
I
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
V
K
x
Y
T
|
T
F
x
Y
T
|
T
L
 
L
P
 
P
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
F
T
 
V
H
|
H
I
 
T
I
 
V
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
Y
 
K
P
 
P
A
 
V
G
 
D
G
 
A
L
 
K
A
 
I
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Q
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
I
 
D
G
 
G
P
 
P
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
E
P
 
P
H
 
E
D
 
N
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
V
M
 
M
W
 
W
V
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
|
H
M
 
M
I
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
M
Y
 
H
N
 
G
I
 
L
D
 
D
H
|
H
A
 
A
R
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
A
M
 
L
L
 
W
Q
 
N
V
 
E
R
 
K
R
 
R
D
 
D
S
 
T
K
 
K
R
 
R
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
V
 
V
W
 
W
G
 
N
I
 
I
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
D
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
A
R
 
A
T
 
T
R
 
R
A
 
N
F
 
F
F
 
F
E
 
E
S
 
Q
L
 
L
D
 
G
V
 
V
K
 
P
T
 
T
R
 
H
L
 
L
Q
 
S
D
 
D
Y
 
Y
A
 
G
I
 
L
N
 
D
A
 
G
A
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
P
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
E
H
 
H
D
 
G
M
 
M
T
 
T
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
N
Q
 
H
D
 
D
V
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
V
S
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
I
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
A

1oj7B Structural genomics, unknown function crystal structure of e. Coli k- 12 yqhd (see paper)
61% identity, 100% coverage: 1:384/385 of query aligns to 4:389/390 of 1oj7B

query
sites
1oj7B
M
 
L
Q
 
N
N
 
N
F
 
F
D
 
N
Y
 
L
F
 
H
N
 
T
P
 
P
T
 
T
R
 
R
I
 
I
V
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
K
D
 
G
T
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
G
L
 
L
S
 
R
E
 
E
L
 
Q
L
 
I
P
 
P
S
 
H
G
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
A
 
G
S
|
S
A
 
V
E
 
K
K
 
K
N
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
L
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
R
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
K
K
 
G
H
 
M
D
 
D
F
 
V
A
 
L
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
P
|
P
N
|
N
P
 
P
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
L
 
L
M
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
K
Q
 
L
V
 
V
H
 
R
R
 
E
E
 
Q
Q
 
K
R
 
V
D
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
I
 
L
D
|
D
G
 
G
T
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
F
 
Y
-
 
P
-
 
E
D
 
N
G
 
I
E
 
D
P
 
P
W
 
W
Q
 
H
I
 
I
M
 
L
E
 
Q
A
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
K
N
 
E
V
 
I
T
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
S
 
C
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
P
 
P
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
S
N
 
N
N
 
A
G
|
G
A
 
A
V
|
V
I
 
I
T
 
S
R
 
R
R
 
K
A
 
T
T
 
T
H
 
G
A
 
D
K
|
K
L
 
Q
P
 
A
F
 
F
H
 
H
S
 
S
Q
 
A
H
 
H
T
 
V
F
 
Q
P
 
P
R
 
V
F
 
F
S
 
A
I
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
V
K
 
Y
T
 
T
F
 
Y
T
|
T
L
|
L
P
|
P
P
 
P
R
 
R
Q
|
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
F
T
 
V
H
|
H
I
 
T
I
 
V
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
Y
 
K
P
 
P
A
 
V
G
 
D
G
 
A
L
 
K
A
 
I
Q
 
H
D
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Q
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
I
 
D
G
 
G
P
 
P
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
E
P
 
P
H
 
E
D
 
N
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
V
M
 
M
W
 
W
V
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
|
H
M
 
M
I
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
M
Y
 
H
N
 
G
I
 
L
D
 
D
H
|
H
A
 
A
R
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
A
M
 
L
L
 
W
Q
 
N
V
 
E
R
 
K
R
 
R
D
 
D
S
 
T
K
 
K
R
 
R
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
V
 
V
W
 
W
G
 
N
I
 
I
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
D
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
A
R
 
A
T
 
T
R
 
R
A
 
N
F
 
F
F
 
F
E
 
E
S
 
Q
L
 
L
D
 
G
V
 
V
K
 
P
T
 
T
R
 
H
L
 
L
Q
 
S
D
 
D
Y
 
Y
A
 
G
I
 
L
N
 
D
A
 
G
A
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
P
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
E
H
 
H
D
 
G
M
 
M
T
 
T
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
N
Q
 
H
D
 
D
V
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
V
S
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
I
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
A

1oj7A Structural genomics, unknown function crystal structure of e. Coli k- 12 yqhd (see paper)
61% identity, 100% coverage: 1:384/385 of query aligns to 4:389/390 of 1oj7A

query
sites
1oj7A
M
 
L
Q
 
N
N
 
N
F
 
F
D
 
N
Y
 
L
F
 
H
N
 
T
P
 
P
T
 
T
R
 
R
I
 
I
V
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
K
D
 
G
T
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
G
L
 
L
S
 
R
E
 
E
L
 
Q
L
 
I
P
 
P
S
 
H
G
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
A
 
G
S
|
S
A
 
V
E
 
K
K
 
K
N
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
L
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
R
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
K
K
 
G
H
 
M
D
 
D
F
 
V
A
 
L
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
P
|
P
N
|
N
P
 
P
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
L
 
L
M
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
K
Q
 
L
V
 
V
H
 
R
R
 
E
E
 
Q
Q
 
K
R
 
V
D
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
I
 
L
D
|
D
G
 
G
T
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
F
 
Y
-
 
P
-
 
E
D
 
N
G
 
I
E
 
D
P
 
P
W
 
W
Q
 
H
I
 
I
M
 
L
E
 
Q
A
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
K
N
 
E
V
 
I
T
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
S
 
C
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
P
 
P
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
S
N
|
N
N
 
A
G
|
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
R
 
R
R
 
K
A
 
T
T
 
T
H
 
G
A
 
D
K
|
K
L
 
Q
P
 
A
F
 
F
H
 
H
S
 
S
Q
 
A
H
 
H
T
 
V
F
 
Q
P
 
P
R
 
V
F
 
F
S
 
A
I
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
V
K
 
Y
T
 
T
F
 
Y
T
|
T
L
|
L
P
 
P
P
 
P
R
 
R
Q
|
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
F
T
 
V
H
|
H
I
 
T
I
 
V
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
Y
 
K
P
 
P
A
 
V
G
 
D
G
 
A
L
 
K
A
 
I
Q
 
H
D
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Q
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
I
 
D
G
 
G
P
 
P
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
E
P
 
P
H
 
E
D
 
N
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
V
M
 
M
W
 
W
V
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
|
H
M
 
M
I
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
M
Y
 
H
N
 
G
I
 
L
D
 
D
H
|
H
A
 
A
R
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
A
M
 
L
L
 
W
Q
 
N
V
 
E
R
 
K
R
 
R
D
 
D
S
 
T
K
 
K
R
 
R
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
V
 
V
W
 
W
G
 
N
I
 
I
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
D
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
A
R
 
A
T
 
T
R
 
R
A
 
N
F
 
F
F
 
F
E
 
E
S
 
Q
L
 
L
D
 
G
V
 
V
K
 
P
T
 
T
R
 
H
L
 
L
Q
 
S
D
 
D
Y
 
Y
A
 
G
I
 
L
N
 
D
A
 
G
A
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
P
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
E
H
 
H
D
 
G
M
 
M
T
 
T
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
N
Q
 
H
D
 
D
V
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
V
S
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
I
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
A

7w9yA Crystal structure of bacillus subtilis yugj in complex with NADP and nickel (see paper)
41% identity, 100% coverage: 1:385/385 of query aligns to 3:389/389 of 7w9yA

query
sites
7w9yA
M
 
M
Q
 
H
N
 
N
F
 
F
D
 
T
Y
 
Y
F
 
W
N
 
N
P
 
P
T
 
T
R
 
K
I
 
L
V
 
I
F
 
F
G
 
G
E
 
R
D
 
G
T
 
E
I
 
V
G
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
P
E
 
E
L
 
E
L
 
L
P
 
K
S
 
S
-
 
Y
G
 
G
A
 
K
R
 
N
V
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
V
Y
 
Y
G
|
G
G
|
G
A
 
G
S
|
S
A
 
I
E
 
K
K
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
L
L
 
Y
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
R
 
I
A
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
N
K
 
K
H
 
A
D
 
G
F
 
V
A
 
T
-
 
V
-
 
H
E
 
E
F
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
E
P
|
P
N
|
N
P
 
P
S
 
R
Y
 
V
E
 
S
T
 
T
L
 
V
M
 
N
R
 
K
A
 
G
V
 
V
G
 
A
Q
 
L
V
 
C
H
 
K
R
 
E
E
 
H
Q
 
H
R
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
C
T
 
T
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
K
F
 
Y
D
 
D
G
 
G
E
 
D
P
 
A
W
 
W
Q
 
D
I
 
I
M
 
V
E
 
T
A
 
K
R
 
K
G
 
H
E
 
Q
N
 
P
V
 
-
T
 
K
R
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
F
G
 
G
S
 
T
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
P
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
S
G
 
G
A
 
S
V
 
V
I
 
I
T
 
T
R
 
N
R
 
W
A
 
E
T
 
T
H
 
K
A
 
E
K
|
K
L
 
Y
P
 
G
F
 
W
H
 
G
S
 
S
Q
 
P
H
 
L
T
 
V
F
 
F
P
 
P
R
 
K
F
 
F
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
V
K
 
N
T
 
T
F
 
F
T
|
T
L
x
V
P
|
P
P
 
K
R
 
N
Q
x
H
V
 
T
A
 
I
N
 
Y
G
 
G
V
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
M
F
 
M
T
 
S
H
 
H
I
 
V
I
 
F
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
F
T
 
H
Y
 
H
P
 
V
A
 
S
G
 
N
G
 
T
L
 
P
A
 
Y
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
F
 
M
A
 
C
E
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
T
 
T
L
 
V
I
 
I
E
 
E
I
 
T
G
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
L
L
 
I
A
 
N
E
 
D
P
 
L
H
 
E
D
 
N
Y
 
Y
E
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
E
N
 
T
L
 
I
M
 
L
W
 
Y
V
 
T
A
 
G
T
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
M
I
 
L
G
 
S
A
 
M
G
 
G
V
 
A
P
 
R
H
 
G
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
 
H
M
 
N
I
 
I
G
 
E
H
 
H
E
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
R
 
V
Y
 
Y
N
 
D
I
 
I
D
 
P
H
|
H
A
 
A
R
 
G
T
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
L
L
 
F
P
 
P
P
 
N
M
 
W
L
 
M
Q
 
R
V
 
H
R
 
T
R
 
L
D
 
S
S
 
E
K
 
N
R
 
P
A
 
A
K
 
R
L
 
M
L
 
K
Q
 
Q
Y
 
L
A
 
A
Q
 
V
R
 
R
V
 
V
W
 
F
G
 
G
I
 
V
T
 
E
Q
 
E
-
 
A
G
 
G
S
 
K
E
 
T
D
 
D
E
 
K
R
 
E
I
 
V
D
 
A
-
 
L
A
 
E
A
 
G
I
 
I
E
 
D
R
 
K
T
 
L
R
 
S
A
 
A
F
 
F
F
 
W
E
 
T
S
 
S
L
 
L
D
 
G
V
 
A
K
 
P
T
 
N
R
 
R
L
 
L
Q
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
D
A
 
E
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
D
 
T
L
 
I
I
 
A
A
 
D
Q
 
K
L
 
A
E
 
M
A
 
A
H
 
N
D
 
G
M
 
-
T
 
-
A
 
T
L
 
F
G
 
G
E
 
Q
R
 
F
Q
 
K
D
 
S
V
 
L
T
 
N
L
 
K
E
 
E
V
 
D
S
 
V
R
 
L
R
 
A
V
 
I
L
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
S
L
 
L

7w9zA Crystal structure of bacillus subtilis yugj in complex with NADP and nitrate (see paper)
42% identity, 92% coverage: 2:354/385 of query aligns to 1:357/381 of 7w9zA

query
sites
7w9zA
Q
 
H
N
 
N
F
 
F
D
 
T
Y
 
Y
F
 
W
N
 
N
P
 
P
T
 
T
R
 
K
I
 
L
V
 
I
F
 
F
G
 
G
E
 
R
D
 
G
T
 
E
I
 
V
G
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
P
E
 
E
L
 
E
L
 
L
P
 
K
S
 
S
-
 
Y
G
 
G
A
 
K
R
 
N
V
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
V
Y
 
Y
G
|
G
G
|
G
A
 
G
S
|
S
A
 
I
E
 
K
K
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
L
L
 
Y
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
R
 
I
A
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
N
K
 
K
H
 
A
D
 
G
F
 
V
A
 
T
-
 
V
-
 
H
E
 
E
F
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
E
P
|
P
N
 
N
P
 
P
S
x
R
Y
x
V
E
x
S
T
 
T
L
 
V
M
 
N
R
 
K
A
 
G
V
 
V
G
 
A
Q
 
L
V
 
C
H
 
K
R
 
E
E
 
H
Q
 
H
R
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
I
 
I
D
|
D
G
 
C
T
 
T
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
K
F
 
Y
D
 
D
G
 
G
E
 
D
P
 
A
W
 
W
Q
 
D
I
 
I
M
 
V
E
 
T
A
 
K
R
 
K
G
 
H
E
 
Q
N
 
P
V
 
-
T
 
K
R
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
F
G
 
G
S
 
T
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
P
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
|
N
N
 
S
G
|
G
A
 
S
V
|
V
I
 
I
T
 
T
R
x
N
R
x
W
A
x
E
T
 
T
H
 
K
A
 
E
K
|
K
L
 
Y
P
 
G
F
 
W
H
 
G
S
 
S
Q
 
P
H
 
L
T
 
V
F
 
F
P
 
P
R
 
K
F
 
F
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
V
K
 
N
T
 
T
F
 
F
T
|
T
L
x
V
P
|
P
P
 
K
R
 
N
Q
x
H
V
 
T
A
 
I
N
 
Y
G
 
G
V
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
M
F
 
M
T
 
S
H
 
H
I
 
V
I
 
F
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
F
T
 
H
Y
 
H
P
 
V
A
 
S
G
 
N
G
 
T
L
 
P
A
 
Y
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
F
 
M
A
 
C
E
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
T
 
T
L
 
V
I
 
I
E
 
E
I
 
T
G
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
L
L
 
I
A
 
N
E
 
D
P
 
L
H
 
E
D
 
N
Y
 
Y
E
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
E
N
 
T
L
 
I
M
 
L
W
 
Y
V
 
T
A
 
G
T
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
M
I
 
L
G
 
S
A
 
M
G
 
G
V
 
A
P
 
R
H
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
T
 
T
H
 
H
M
 
N
I
 
I
G
 
E
H
|
H
E
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
R
 
V
Y
 
Y
N
 
D
I
 
I
D
 
P
H
|
H
A
 
A
R
 
G
T
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
L
L
 
F
P
 
P
P
 
N
M
 
W
L
 
M
Q
 
R
V
 
H
R
 
T
R
 
L
D
 
S
S
 
E
K
 
N
R
 
P
A
 
A
K
 
R
L
 
M
L
 
K
Q
 
Q
Y
 
L
A
 
A
Q
 
V
R
 
R
V
 
V
W
 
F
G
 
G
I
 
V
T
 
E
Q
 
E
-
 
A
G
 
G
S
 
K
E
 
T
D
 
D
E
 
K
R
 
E
I
 
V
D
 
A
-
 
L
A
 
E
A
 
G
I
 
I
E
 
D
R
 
K
T
 
L
R
 
S
A
 
A
F
 
F
F
 
W
E
 
T
S
 
S
L
 
L
D
 
G
V
 
A
K
 
P
T
 
N
R
 
R
L
 
L
Q
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
D
I
 
I
N
 
N
A
 
D
A
 
E
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
D
 
T
L
 
I

1vljB Crystal structure of nadh-dependent butanol dehydrogenase a (tm0820) from thermotoga maritima at 1.78 a resolution
38% identity, 92% coverage: 1:355/385 of query aligns to 6:362/400 of 1vljB

query
sites
1vljB
M
 
M
Q
 
E
N
 
N
F
 
F
D
 
V
Y
 
F
F
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
R
 
K
I
 
I
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
R
D
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
P
R
 
K
L
 
I
S
 
G
E
 
E
L
 
E
L
 
I
P
 
K
S
 
N
G
 
A
A
 
G
-
 
I
-
 
R
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
A
 
G
S
|
S
A
 
I
E
 
K
K
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
V
L
 
Y
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
R
 
V
A
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
K
H
 
H
-
 
G
-
 
I
D
 
E
F
 
W
A
 
V
E
 
E
F
 
V
G
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
K
P
|
P
N
 
N
P
 
P
S
 
V
Y
 
L
E
 
S
T
 
K
L
 
V
M
 
H
R
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
Q
 
V
V
 
A
H
 
K
R
 
K
E
 
E
Q
 
K
R
 
V
D
 
E
F
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
G
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
I
 
V
D
|
D
G
 
S
T
 
A
K
 
K
F
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
D
 
E
G
 
G
E
 
D
P
 
I
W
 
W
Q
 
D
I
 
A
M
 
F
E
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
Y
E
 
Q
N
 
-
V
 
I
T
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
F
S
 
D
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
x
I
P
 
S
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
x
T
E
 
E
M
 
M
N
|
N
N
 
G
G
x
N
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
R
 
N
R
 
E
A
 
K
T
 
T
H
 
K
A
 
E
K
|
K
L
 
Y
P
 
G
F
 
V
H
 
S
S
 
S
Q
 
K
H
 
A
T
 
L
F
 
Y
P
 
P
R
 
K
F
 
V
S
 
S
I
 
I
L
 
I
D
 
D
P
 
P
R
 
S
K
 
V
T
 
Q
F
 
F
T
|
T
L
|
L
P
 
P
P
 
K
R
 
E
Q
|
Q
V
 
T
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
V
 
A
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
I
T
 
S
H
|
H
I
 
I
I
 
L
E
 
E
Q
 
Y
Y
 
Y
L
 
F
T
 
D
Y
 
G
P
 
S
A
 
S
G
 
P
G
 
E
L
 
I
A
 
S
Q
 
N
D
 
E
R
 
-
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
T
L
 
I
Q
 
R
T
 
T
L
 
I
I
 
M
E
 
K
I
 
M
G
 
T
P
 
E
R
 
R
A
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
K
P
 
P
H
 
D
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
L
M
 
A
W
 
W
V
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
T
I
 
M
G
 
A
A
 
V
G
 
G
-
 
R
V
 
R
P
 
G
H
 
G
D
 
E
W
 
W
A
 
A
T
 
C
H
|
H
M
 
R
I
 
I
G
 
E
H
 
H
E
 
S
L
 
L
T
 
S
A
 
A
R
 
L
Y
 
Y
N
 
D
I
 
I
D
 
A
H
|
H
A
 
G
R
 
A
T
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
F
P
 
P
P
 
A
M
 
W
L
 
M
Q
 
K
V
 
Y
R
 
V
R
 
Y
D
 
R
S
 
K
K
 
N
R
 
P
A
 
A
K
 
Q
L
 
F
L
 
E
Q
 
R
Y
 
F
A
 
A
Q
 
K
R
 
K
V
 
I
W
 
F
G
 
G
I
 
F
T
 
-
Q
 
E
G
 
G
S
 
E
E
 
G
D
 
E
E
 
E
R
 
L
I
 
I
D
 
L
A
 
K
A
 
G
I
 
I
E
 
E
R
 
A
T
 
F
R
 
K
A
 
N
F
 
W
F
 
L
E
 
K
S
 
K
L
 
V
D
 
G
V
 
A
K
 
P
T
 
V
R
 
S
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
Y
 
A
A
 
G
I
 
I
N
 
P
A
 
E
A
 
E
A
 
D
L
 
I
D
 
D
D
 
K
L
 
I
I
 
V

8i29A Crystal structure of butanol dehydrogenase a (yqdh) in complex with nadh from fusobacterium nucleatum
32% identity, 89% coverage: 3:346/385 of query aligns to 2:346/384 of 8i29A

query
sites
8i29A
N
 
N
F
 
F
D
 
N
Y
 
Y
F
 
K
N
 
N
P
 
D
T
 
T
R
 
K
I
 
I
V
 
I
F
 
F
G
 
G
E
 
K
D
 
D
T
 
N
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
N
S
 
I
E
 
K
L
 
I
L
 
F
P
 
S
S
 
K
G
 
K
A
 
T
R
 
P
V
 
K
L
 
I
V
 
L
L
 
L
Y
 
H
G
 
Y
G
 
E
A
 
A
S
 
D
A
 
G
E
 
E
-
 
L
-
 
I
-
 
K
K
 
K
N
 
L
G
 
G
T
 
I
L
 
Y
A
 
E
E
 
K
V
 
V
R
 
I
A
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
E
H
 
F
D
 
D
-
 
I
-
 
E
F
 
F
A
 
I
E
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
S
 
R
Y
 
L
E
 
S
T
 
L
L
 
V
M
 
Y
R
 
E
A
 
G
V
 
I
G
 
K
Q
 
I
V
 
C
H
 
K
R
 
E
E
 
E
Q
 
N
R
 
I
D
 
T
F
 
F
L
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
x
A
S
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
S
T
 
A
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
V
F
 
D
D
 
N
G
 
G
E
 
D
P
 
V
W
 
W
Q
 
D
I
 
F
M
 
F
E
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
-
E
 
R
N
 
I
V
 
P
T
 
Q
R
 
D
A
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
I
G
 
G
S
 
V
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
x
I
P
 
P
A
 
G
T
x
A
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
M
N
x
S
N
 
E
G
x
S
A
 
S
V
x
I
I
 
I
T
 
T
R
 
D
R
 
E
A
 
N
T
 
K
H
 
K
A
 
Q
K
 
K
L
 
A
P
 
V
F
 
C
H
 
D
S
 
T
Q
 
E
H
 
V
T
 
N
F
 
F
P
 
P
R
 
K
F
 
F
S
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
N
P
 
P
R
 
E
K
 
V
T
 
C
F
 
Y
T
|
T
L
x
I
P
 
P
P
 
D
R
 
R
Q
x
L
V
 
M
A
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
I
F
 
L
T
 
S
H
 
H
I
 
L
I
 
M
E
|
E
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
F
T
 
T
Y
 
K
P
 
S
A
 
I
G
 
D
G
 
T
L
 
A
A
 
L
Q
 
S
D
 
D
R
 
S
F
 
L
A
 
I
E
 
E
G
 
A
L
 
T
L
 
M
Q
 
K
T
 
I
L
 
V
I
 
I
E
 
K
I
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
L
A
 
L
L
 
M
A
 
K
E
 
D
P
 
R
H
 
K
D
 
N
Y
 
Y
E
 
N
V
 
Y
R
 
C
A
 
S
N
 
Q
L
 
I
M
 
M
W
 
W
V
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
H
N
 
N
G
 
G
L
 
M
I
 
I
G
 
A
A
 
C
G
 
G
V
 
R
P
 
V
H
 
A
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
S
H
|
H
M
 
R
I
 
I
G
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
I
T
 
S
A
 
G
R
 
I
Y
 
Y
N
 
D
I
 
L
D
 
T
H
|
H
A
 
G
R
 
I
T
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
F
P
 
P
P
 
A
M
 
W
L
 
M
Q
 
K
V
 
Y
R
 
T
R
 
K
D
 
N
S
 
I
K
 
R
R
 
P
A
 
Q
K
 
I
L
 
F
L
 
E
Q
 
K
Y
 
F
A
 
F
Q
 
K
R
 
E
V
 
V
W
 
F
G
 
N
I
 
T
T
 
V
Q
 
N
G
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
I
D
 
D
A
 
E
A
 
G
I
 
I
E
 
N
R
 
K
T
 
L
R
 
E
A
 
E
F
 
F
F
 
F
E
 
K
S
 
S
L
 
L
D
 
G
V
 
I
K
 
N
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Q
 
S
D
 
D
Y
 
Y
A
 
G
I
 
I

7fjgA Crystal structure of butanol dehydrogenase a (yqdh) in complex with partial nadh from fusobacterium nucleatum
32% identity, 89% coverage: 3:346/385 of query aligns to 2:346/384 of 7fjgA

query
sites
7fjgA
N
 
N
F
 
F
D
 
N
Y
 
Y
F
 
K
N
 
N
P
 
D
T
 
T
R
 
K
I
 
I
V
 
I
F
 
F
G
 
G
E
 
K
D
 
D
T
 
N
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
N
S
 
I
E
 
K
L
 
I
L
 
F
P
 
S
S
 
K
G
 
K
A
 
T
R
 
P
V
 
K
L
 
I
V
 
L
L
 
L
Y
 
H
G
 
Y
G
 
E
A
 
A
S
 
D
A
 
G
E
 
E
-
 
L
-
 
I
-
 
K
K
 
K
N
 
L
G
 
G
T
 
I
L
 
Y
A
 
E
E
 
K
V
 
V
R
 
I
A
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
E
H
 
F
D
 
D
-
 
I
-
 
E
F
 
F
A
 
I
E
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
S
 
R
Y
 
L
E
 
S
T
 
L
L
 
V
M
 
Y
R
 
E
A
 
G
V
 
I
G
 
K
Q
 
I
V
 
C
H
 
K
R
 
E
E
 
E
Q
 
N
R
 
I
D
 
T
F
 
F
L
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
x
A
S
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
S
T
 
A
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
V
F
 
D
D
 
N
G
 
G
E
 
D
P
 
V
W
 
W
Q
 
D
I
 
F
M
 
F
E
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
-
E
 
R
N
 
I
V
 
P
T
 
Q
R
 
D
A
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
I
G
 
G
S
 
V
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
x
I
P
 
P
A
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
 
S
N
 
E
G
 
S
A
 
S
V
 
I
I
 
I
T
 
T
R
 
D
R
 
E
A
 
N
T
 
K
H
 
K
A
 
Q
K
 
K
L
 
A
P
 
V
F
 
C
H
 
D
S
 
T
Q
 
E
H
 
V
T
 
N
F
 
F
P
 
P
R
 
K
F
 
F
S
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
N
P
 
P
R
 
E
K
 
V
T
 
C
F
 
Y
T
|
T
L
x
I
P
 
P
P
 
D
R
 
R
Q
 
L
V
 
M
A
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
I
F
 
L
T
 
S
H
 
H
I
 
L
I
 
M
E
|
E
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
F
T
 
T
Y
 
K
P
 
S
A
 
I
G
 
D
G
 
T
L
 
A
A
 
L
Q
 
S
D
 
D
R
 
S
F
 
L
A
 
I
E
 
E
G
 
A
L
 
T
L
 
M
Q
 
K
T
 
I
L
 
V
I
 
I
E
 
K
I
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
L
A
 
L
L
 
M
A
 
K
E
 
D
P
 
R
H
 
K
D
 
N
Y
 
Y
E
 
N
V
 
Y
R
 
C
A
 
S
N
 
Q
L
 
I
M
 
M
W
 
W
V
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
H
N
 
N
G
 
G
L
 
M
I
 
I
G
 
A
A
 
C
G
 
G
V
 
R
P
 
V
H
 
A
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
S
H
|
H
M
 
R
I
 
I
G
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
I
T
 
S
A
 
G
R
 
I
Y
 
Y
N
 
D
I
 
L
D
 
T
H
|
H
A
 
G
R
 
I
T
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
F
P
 
P
P
 
A
M
 
W
L
 
M
Q
 
K
V
 
Y
R
 
T
R
 
K
D
 
N
S
 
I
K
 
R
R
 
P
A
 
Q
K
 
I
L
 
F
L
 
E
Q
 
K
Y
 
F
A
 
F
Q
 
K
R
 
E
V
 
V
W
 
F
G
 
N
I
 
T
T
 
V
Q
 
N
G
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
I
D
 
D
A
 
E
A
 
G
I
 
I
E
 
N
R
 
K
T
 
L
R
 
E
A
 
E
F
 
F
F
 
F
E
 
K
S
 
S
L
 
L
D
 
G
V
 
I
K
 
N
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Q
 
S
D
 
D
Y
 
Y
A
 
G
I
 
I

1vhdA Crystal structure of an iron containing alcohol dehydrogenase (see paper)
28% identity, 76% coverage: 4:296/385 of query aligns to 3:288/361 of 1vhdA

query
sites
1vhdA
F
 
W
D
 
E
Y
 
F
F
 
Y
N
 
M
P
 
P
T
 
T
R
 
D
I
 
V
V
 
F
F
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
K
T
 
I
I
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
R
G
 
G
R
 
N
L
 
I
S
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
-
S
 
-
G
 
G
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Y
 
T
G
 
G
G
 
K
A
x
S
S
|
S
A
 
S
E
 
K
K
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
D
E
 
D
V
 
L
R
 
K
A
 
K
A
 
L
L
 
L
A
 
D
K
 
E
H
 
T
D
 
E
F
 
I
A
 
S
E
 
Y
-
 
E
-
 
I
F
 
F
G
 
D
G
 
E
I
 
V
E
 
E
P
x
E
N
|
N
P
 
P
S
 
S
Y
 
F
E
 
D
T
 
N
L
 
V
M
 
M
R
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
E
Q
 
R
V
 
Y
H
 
R
R
 
N
E
 
D
Q
 
S
R
 
F
D
 
D
F
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
I
 
M
D
|
D
G
 
F
T
 
A
K
 
K
F
 
-
V
 
-
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
L
D
 
K
G
 
E
E
 
K
P
 
D
W
 
L
Q
 
S
I
 
V
M
 
E
E
 
D
A
 
L
R
 
Y
G
 
D
-
 
R
E
 
E
N
 
K
V
 
V
T
 
K
R
 
H
A
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
V
S
 
E
V
 
I
L
 
P
T
|
T
L
x
T
P
 
A
A
 
G
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
V
N
x
T
N
 
P
G
x
Y
A
 
S
V
x
I
I
 
L
T
 
T
R
 
D
R
 
P
A
 
E
T
 
G
H
 
N
A
x
K
K
 
R
L
 
-
P
 
-
F
 
-
H
 
G
S
 
C
Q
 
T
H
 
L
T
 
M
F
 
F
P
 
P
R
 
V
F
 
Y
S
 
A
I
 
F
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
R
K
 
Y
T
 
T
F
 
Y
T
x
S
L
x
M
P
 
S
P
 
D
R
 
E
Q
x
L
V
 
T
A
 
L
N
 
S
G
 
T
V
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
S
H
|
H
I
 
A
I
 
V
E
 
E
Q
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
Y
 
R
P
 
K
A
 
S
G
 
T
G
 
P
L
 
-
A
 
P
Q
 
S
D
 
D
R
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
I
G
 
E
L
 
A
L
 
M
Q
 
K
T
 
I
L
 
I
I
 
H
E
 
R
I
 
N
G
 
L
P
 
P
R
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
E
E
 
-
P
 
-
H
 
G
D
 
N
Y
 
R
E
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
K
N
 
K
L
 
-
M
 
M
W
 
F
V
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
-
A
 
C
L
 
L
N
 
A
G
 
G
L
 
M
I
 
V
G
 
I
A
 
A
G
 
Q
V
 
T
P
 
G
H
 
T
D
 
T
W
 
L
A
 
A
T
 
-
H
|
H
M
 
A
I
 
L
G
 
G
H
 
Y
E
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
T
R
 
E
Y
 
K
N
 
G
I
 
I
D
 
K
H
|
H
A
 
G
R
 
K
T
 
A
L
 
T
A
 
G
I
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
F
M
 
V
L
 
M
Q
 
E
V
 
V
R
 
M
R
 
K
D
 
E

1o2dA Crystal structure of alcohol dehydrogenase, iron-containing (tm0920) from thermotoga maritima at 1.30 a resolution (see paper)
28% identity, 76% coverage: 4:296/385 of query aligns to 2:287/359 of 1o2dA

query
sites
1o2dA
F
 
W
D
 
E
Y
 
F
F
 
Y
N
 
M
P
 
P
T
 
T
R
 
D
I
 
V
V
 
F
F
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
K
T
 
I
I
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
R
G
 
G
R
 
N
L
 
I
S
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
-
S
 
-
G
 
G
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Y
 
T
G
 
G
G
 
K
A
x
S
S
|
S
A
 
S
E
 
K
K
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
D
E
 
D
V
 
L
R
 
K
A
 
K
A
 
L
L
 
L
A
 
D
K
 
E
H
 
T
D
 
E
F
 
I
A
 
S
E
 
Y
-
 
E
-
 
I
F
 
F
G
 
D
G
 
E
I
 
V
E
 
E
P
x
E
N
|
N
P
 
P
S
 
S
Y
 
F
E
 
D
T
 
N
L
 
V
M
 
M
R
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
E
Q
 
R
V
 
Y
H
 
R
R
 
N
E
 
D
Q
 
S
R
 
F
D
 
D
F
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
I
 
M
D
|
D
G
 
F
T
 
A
K
 
K
F
 
-
V
 
-
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
L
D
 
K
G
 
E
E
 
K
P
 
D
W
 
L
Q
 
S
I
 
V
M
 
E
E
 
D
A
 
L
R
 
Y
G
 
D
-
 
R
E
 
E
N
 
K
V
 
V
T
 
K
R
 
H
A
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
V
S
 
E
V
 
I
L
 
P
T
|
T
L
x
T
P
 
A
A
 
G
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
V
N
 
T
N
 
P
G
x
Y
A
 
S
V
x
I
I
 
L
T
 
T
R
 
D
R
 
P
A
 
E
T
 
G
H
 
N
A
x
K
K
 
R
L
 
-
P
 
-
F
 
-
H
 
G
S
 
C
Q
 
T
H
 
L
T
 
M
F
 
F
P
 
P
R
 
V
F
 
Y
S
 
A
I
 
F
L
 
L
D
 
D
P
 
P
R
 
R
K
 
Y
T
 
T
F
 
Y
T
x
S
L
x
M
P
 
S
P
 
D
R
 
E
Q
x
L
V
 
T
A
 
L
N
 
S
G
 
T
V
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
L
T
 
S
H
|
H
I
 
A
I
 
V
E
 
E
Q
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
Y
 
R
P
 
K
A
 
S
G
 
T
G
 
P
L
 
-
A
 
P
Q
 
S
D
 
D
R
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
I
G
 
E
L
 
A
L
 
M
Q
 
K
T
 
I
L
 
I
I
 
H
E
 
R
I
 
N
G
 
L
P
 
P
R
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
E
E
 
-
P
 
-
H
 
G
D
 
N
Y
 
R
E
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
K
N
 
K
L
 
-
M
 
M
W
 
F
V
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
-
A
 
C
L
 
L
N
 
A
G
 
G
L
 
M
I
 
V
G
 
I
A
 
A
G
 
Q
V
 
T
P
 
G
H
 
T
D
 
T
W
 
L
A
 
A
T
 
-
H
|
H
M
 
A
I
 
L
G
 
G
H
 
Y
E
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
T
R
 
E
Y
 
K
N
 
G
I
 
I
D
 
K
H
|
H
A
 
G
R
 
K
T
 
A
L
 
T
A
 
G
I
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
F
M
 
V
L
 
M
Q
 
E
V
 
V
R
 
M
R
 
K
D
 
E

3zdrA Structure of the alcohol dehydrogenase (adh) domain of a bifunctional adhe dehydrogenase from geobacillus thermoglucosidasius ncimb 11955 (see paper)
25% identity, 92% coverage: 3:358/385 of query aligns to 1:370/403 of 3zdrA

query
sites
3zdrA
N
 
N
F
 
M
D
 
Q
Y
 
W
F
 
F
N
 
K
-
 
V
P
 
P
T
 
P
R
 
K
I
 
I
V
 
Y
F
 
F
G
 
E
E
 
K
D
 
N
T
 
A
I
 
V
G
 
Q
R
 
Y
L
 
L
S
 
A
E
 
K
L
 
M
L
 
-
P
 
P
S
 
D
G
 
I
A
 
S
R
 
R
V
 
A
L
 
F
V
 
I
L
 
V
Y
 
T
G
 
D
G
 
P
A
 
G
S
 
M
A
 
V
E
 
-
K
 
K
N
 
L
G
 
G
T
 
Y
L
 
V
A
 
D
E
 
K
V
 
V
R
 
L
A
 
Y
A
 
Y
L
 
L
A
 
R
K
 
R
H
 
R
-
 
P
D
 
D
F
 
Y
A
 
V
E
 
H
-
 
S
-
 
E
-
 
I
F
 
F
G
 
S
G
 
E
I
 
V
E
 
E
P
 
P
N
 
D
P
 
P
S
 
S
Y
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
V
M
 
M
R
 
K
A
 
G
V
 
V
G
 
D
Q
 
M
V
 
M
H
 
R
R
 
S
E
 
F
Q
 
E
R
 
P
D
 
D
F
 
V
L
 
I
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
P
I
 
M
D
 
D
G
 
A
T
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
W
-
 
L
-
 
F
F
 
Y
V
 
E
A
 
H
A
 
P
A
 
T
A
 
A
L
 
D
F
 
F
D
 
N
G
 
A
E
 
L
P
 
K
W
 
Q
Q
 
K
I
 
F
M
 
L
E
 
D
A
 
I
R
 
R
G
 
-
E
 
K
N
 
R
V
 
V
T
 
Y
R
 
K
A
 
Y
L
 
P
P
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
F
-
 
V
S
 
A
V
 
I
L
 
P
T
 
T
L
 
T
P
 
S
A
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
V
N
 
T
N
 
S
G
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
R
 
D
R
 
K
A
 
K
T
 
T
H
 
N
A
 
I
K
 
K
L
 
Y
P
 
P
F
 
L
H
 
A
S
 
D
Q
 
Y
H
 
E
T
 
L
F
 
T
P
 
P
R
 
D
F
 
V
S
 
A
I
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
Q
K
 
F
T
 
V
F
 
M
T
 
T
L
 
V
P
 
P
P
 
K
R
 
H
Q
 
V
V
 
T
A
 
A
N
 
D
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
|
D
A
 
V
F
 
L
T
 
T
H
|
H
I
 
A
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
Y
 
N
P
 
M
A
 
A
G
 
N
G
 
D
L
 
Y
A
 
T
Q
 
-
D
 
D
R
 
G
F
 
L
A
 
A
E
 
M
G
 
K
L
 
A
L
 
I
Q
 
Q
T
 
L
L
 
V
I
 
F
E
 
E
I
 
Y
G
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
A
L
 
Y
A
 
Q
E
 
N
P
 
G
H
 
A
D
 
D
Y
 
E
E
 
L
V
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
K
L
 
M
M
 
H
W
 
N
V
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
I
A
 
A
-
 
G
-
 
M
-
 
A
-
 
F
L
 
A
N
 
N
G
 
A
L
 
F
I
 
L
G
 
G
A
 
I
G
 
N
V
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
-
H
|
H
M
 
S
I
 
L
G
 
A
H
 
H
E
 
K
L
 
L
T
 
G
A
 
A
R
 
E
Y
 
F
N
 
H
I
 
I
D
 
P
H
|
H
A
 
G
R
 
R
T
 
A
L
 
N
A
 
T
I
 
I
V
 
L
L
 
M
P
 
P
P
 
H
M
 
V
L
 
I
Q
 
R
V
 
Y
R
 
N
-
 
A
-
 
A
R
 
K
D
 
P
S
 
K
K
 
K
R
 
Y
A
 
F
K
 
K
L
 
A
L
 
D
Q
 
Q
-
 
R
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
E
-
 
I
-
 
A
R
 
R
V
 
M
W
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
P
Q
 
A
G
 
R
S
 
T
E
 
T
D
 
E
E
 
E
R
 
G
I
 
V
D
 
E
A
 
S
A
 
L
I
 
V
E
 
Q
R
 
A
T
 
I
R
 
I
A
 
K
F
 
L
F
 
A
E
 
K
S
 
Q
L
 
L
D
 
D
V
 
M
K
 
P
T
 
L
R
 
S
L
 
I
Q
 
E
D
 
A
Y
 
C
A
 
G
I
 
V
N
 
S
A
 
K
A
 
Q
A
 
E
L
 
F
D
 
E
D
 
S
L
 
K
I
 
V
A
 
E
Q
 
K
L
 
L

6jkpA Crystal structure of sulfoacetaldehyde reductase from bifidobacterium kashiwanohense in complex with NAD+ (see paper)
24% identity, 91% coverage: 4:355/385 of query aligns to 4:345/376 of 6jkpA

query
sites
6jkpA
F
 
W
D
 
D
Y
 
Y
F
 
A
N
 
Q
P
 
P
T
 
V
R
 
T
I
 
I
V
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
K
D
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
A
S
 
M
E
 
E
L
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
G
L
 
L
P
 
H
S
 
D
G
 
G
A
 
I
R
 
M
V
 
V
L
 
T
V
 
P
L
 
K
Y
 
F
G
x
F
G
 
V
A
 
D
S
 
S
A
 
G
E
 
E
K
 
A
N
 
Q
G
 
R
T
 
L
L
 
I
A
 
D
E
 
A
V
 
S
R
 
D
A
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
S
K
 
-
H
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
T
E
 
V
F
 
F
G
 
T
G
 
D
I
 
F
E
 
S
P
 
P
N
 
N
P
 
P
S
 
D
Y
 
V
E
 
T
T
 
E
L
 
V
M
 
D
R
 
A
A
 
C
V
 
A
G
 
E
Q
 
I
V
 
I
H
 
R
R
 
K
E
 
N
Q
 
H
R
 
C
D
 
E
F
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
M
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
 
S
V
 
A
I
 
M
D
|
D
G
 
V
T
 
S
K
 
K
F
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
I
A
 
C
L
 
L
F
 
T
D
 
D
G
 
D
E
 
S
P
 
I
W
 
A
Q
 
D
I
 
Y
M
 
H
E
 
G
A
 
T
R
 
G
G
 
K
E
 
A
N
 
M
V
 
P
T
 
Q
R
 
K
A
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
I
S
 
A
V
 
L
L
 
P
T
|
T
L
x
T
P
 
A
A
 
G
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
V
N
x
T
N
 
C
G
 
V
A
 
S
V
 
V
I
 
L
T
 
T
R
 
N
R
 
R
A
 
K
T
 
L
H
 
G
A
 
K
K
 
K
L
 
A
P
 
P
F
 
I
H
 
V
S
 
S
Q
 
D
H
 
G
T
 
F
F
 
F
P
 
P
R
 
S
F
 
V
S
 
A
I
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
E
K
 
L
T
 
T
F
 
Y
T
x
S
L
x
V
P
|
P
P
 
P
R
 
K
Q
 
I
V
 
T
A
 
A
N
 
S
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
 
D
A
 
V
F
 
L
T
 
S
H
 
Q
I
 
A
I
 
I
E
 
E
Q
 
G
Y
 
F
L
 
W
T
 
S
Y
 
K
P
 
G
A
 
H
G
 
Q
G
 
P
L
 
I
A
 
C
Q
 
-
D
 
D
R
 
S
F
 
C
A
 
A
E
 
A
G
 
H
L
 
A
L
 
A
Q
 
K
T
 
L
L
 
V
I
 
F
E
 
K
I
 
Y
G
 
L
P
 
P
R
 
I
A
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
H
 
H
D
 
N
Y
 
E
E
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
K
L
 
M
M
 
C
W
 
E
V
 
A
A
 
S
T
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
-
N
 
-
G
 
G
L
 
L
I
 
-
G
 
A
A
 
F
G
 
T
V
 
L
P
 
P
H
 
K
D
 
T
W
 
T
A
 
S
T
 
S
H
 
H
M
 
A
I
 
C
G
 
S
H
 
F
E
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
N
R
 
I
Y
 
H
N
 
G
I
 
I
D
 
P
H
 
H
A
 
G
R
 
E
T
 
A
L
 
C
A
 
G
I
 
L
V
 
T
L
 
L
P
 
D
P
 
Y
M
 
F
L
 
A
Q
 
R
V
 
I
R
 
N
R
 
K
D
 
D
S
 
A
K
 
Q
R
 
H
A
 
G
K
 
R
L
 
V
L
 
Q
Q
 
E
Y
 
F
A
 
A
Q
 
R
R
 
G
V
 
I
W
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
G
S
 
F
E
 
K
D
 
D
E
 
-
R
 
-
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
M
I
 
A
E
 
D
R
 
A
T
 
I
R
 
H
A
 
D
F
 
L
F
 
K
E
 
V
S
 
R
L
 
I
D
 
G
V
 
M
K
 
R
T
 
T
R
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
Y
 
L
A
 
N
I
 
L
N
 
T
A
 
E
A
 
E
A
 
Q
L
 
I
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V

6jkoA Crystal structure of sulfoacetaldehyde reductase from bifidobacterium kashiwanohense (see paper)
24% identity, 91% coverage: 4:355/385 of query aligns to 4:345/376 of 6jkoA

query
sites
6jkoA
F
 
W
D
 
D
Y
 
Y
F
 
A
N
 
Q
P
 
P
T
 
V
R
 
T
I
 
I
V
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
K
D
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
A
S
 
M
E
 
E
L
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
G
L
 
L
P
 
H
S
 
D
G
 
G
A
 
I
R
 
M
V
 
V
L