SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_048061193.1 NCBI__GCF_000008645.1:WP_048061193.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

A0R220 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
56% identity, 84% coverage: 50:386/401 of query aligns to 19:350/360 of A0R220

query
sites
A0R220
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
F
 
R
M
 
L
P
 
P
V
 
I
-
 
G
D
 
D
P
 
D
S
 
W
R
 
T
I
 
T
V
 
V
S
 
T
L
 
L
D
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
R
 
H
C
 
A
D
 
K
T
 
R
I
 
I
G
 
S
S
 
E
E
 
L
L
 
T
G
 
G
I
 
C
E
 
T
L
 
V
Y
 
H
V
 
L
K
 
K
V
 
V
E
 
E
G
 
G
S
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
A
I
 
V
T
 
T
K
 
E
A
 
S
L
 
L
E
 
A
L
 
R
G
 
G
V
 
Q
D
 
Q
T
 
A
V
 
V
G
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
T
C
 
C
V
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
I
P
 
P
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
F
 
M
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
L
 
I
S
 
Q
V
 
V
R
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
C
L
 
L
E
 
E
A
 
L
V
 
A
T
 
R
E
x
K
L
 
L
-
 
T
A
 
A
L
 
D
M
 
F
G
 
P
E
 
T
L
 
I
Y
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
I
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
T
S
 
A
P
 
P
D
 
D
R
 
V
I
 
H
I
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
I
 
Y
S
 
S
E
 
E
F
 
Y
Y
 
H
R
 
R
A
 
D
G
 
G
F
 
V
I
 
S
D
 
D
E
 
R
R
 
L
P
 
P
M
 
R
M
 
M
T
 
L
G
 
G
I
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
V
E
 
T
A
 
G
F
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
A
P
 
P
V
 
V
R
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
P
V
 
A
S
 
S
Y
 
W
L
 
N
K
 
S
A
 
A
L
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
Q
Y
 
Q
E
 
Q
S
 
S
D
 
D
G
 
G
Y
 
R
A
 
F
E
 
L
S
 
A
V
 
A
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
A
A
 
A
Q
 
Y
K
 
H
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
F
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
L
K
 
K
L
 
S
V
 
V
D
 
E
E
 
D
G
 
G
V
 
W
V
 
V
D
 
K
R
 
R
G
 
G
E
 
S
R
 
T
V
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
N
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
L
K
 
K
A
 
G
S
 
M
T
 
P
E
 
Q
-
 
V
-
 
T
P
 
P
V
 
V
E
 
P
V
 
V
E
 
D
P
 
P

2zsjA Crystal structure of threonine synthase from aquifex aeolicus vf5
53% identity, 87% coverage: 49:395/401 of query aligns to 8:348/350 of 2zsjA

query
sites
2zsjA
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
E
 
K
F
 
Y
M
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
P
 
E
S
 
N
R
 
T
-
 
P
I
 
I
V
 
V
S
 
T
L
 
L
D
 
Y
E
 
E
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
R
 
E
C
 
A
D
 
D
T
 
N
I
 
L
G
 
A
S
 
R
E
 
A
L
 
I
G
 
G
I
 
F
E
 
K
-
 
G
-
 
K
L
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
V
 
Y
E
 
E
G
 
G
S
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
A
I
 
I
T
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
A
G
 
G
V
 
K
D
 
R
T
 
A
V
 
V
G
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
R
C
 
A
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
S
 
K
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
F
 
I
H
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
I
R
 
Q
G
 
G
N
 
T
F
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
I
V
 
V
T
 
R
E
 
K
L
 
I
A
 
G
L
 
E
M
 
N
G
 
F
E
 
P
L
 
V
Y
 
E
L
 
I
L
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
I
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
I
V
 
C
D
 
D
D
 
T
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
E
S
 
A
P
 
P
D
 
D
R
 
Y
I
 
H
I
 
F
L
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
I
 
F
S
 
K
E
 
I
F
 
Y
Y
 
Y
R
 
E
A
 
E
G
 
G
F
 
K
I
 
I
D
 
T
E
 
K
R
 
L
P
 
P
M
 
R
M
 
M
T
 
M
G
 
G
I
 
W
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
|
A
S
 
A
P
 
P
V
 
I
V
 
V
E
 
K
A
 
G
F
 
Y
R
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
P
 
P
V
 
I
R
 
K
D
 
N
P
 
P
E
 
Q
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
 
I
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
P
V
 
Y
S
 
S
Y
 
W
L
 
K
K
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
I
 
A
Y
 
Q
E
 
E
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Y
 
K
A
 
I
E
 
D
S
 
A
V
 
V
T
 
S
D
 
D
E
 
S
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
Y
A
 
A
Q
 
Y
K
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
S
R
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
F
V
 
C
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
F
V
 
F
D
 
K
R
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
V
V
 
V
V
 
T
C
 
C
V
 
T
V
 
L
T
|
T
G
|
G
H
 
N
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
V
S
 
C
T
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
T
V
 
V
E
 
P
P
 
P
D
 
D
I
 
F
N
 
D
Q
 
E
L
 
V
R
 
V
S
 
K
I
 
V
I
 
L

P9WG59 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
55% identity, 82% coverage: 50:376/401 of query aligns to 19:338/360 of P9WG59

query
sites
P9WG59
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
F
 
R
M
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
G
D
 
D
P
 
D
S
 
W
R
 
T
I
 
P
V
 
V
S
 
T
L
 
L
D
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
R
 
A
C
 
A
D
 
T
T
 
N
I
 
L
G
 
S
S
 
K
E
 
Q
L
 
T
G
 
G
I
 
C
E
 
T
L
 
I
Y
 
H
V
 
L
K
 
K
V
 
V
E
 
E
G
 
G
S
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
M
G
 
A
I
 
V
T
 
T
K
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
T
 
A
V
 
V
G
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
T
C
 
C
V
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
I
P
 
P
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
F
 
M
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
L
 
I
S
 
Q
V
 
I
R
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
C
L
 
L
E
 
E
A
 
L
V
 
A
T
 
R
E
x
K
L
 
M
A
 
A
L
 
A
-
 
D
M
 
F
G
 
P
E
 
T
L
 
I
Y
 
S
L
 
L
L
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
V
R
 
R
L
 
I
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
T
S
 
A
P
 
P
D
 
D
R
 
V
I
 
H
I
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
I
 
Y
S
 
T
E
 
E
F
 
Y
Y
 
H
R
 
Q
A
 
L
G
 
G
F
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
K
R
 
L
P
 
P
M
 
R
M
 
M
T
 
L
G
 
G
I
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
V
E
 
L
A
 
G
F
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
P
V
 
V
R
 
S
D
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
P
V
 
A
S
 
S
Y
 
W
L
 
T
K
 
S
A
 
A
L
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
Q
Y
 
Q
E
 
Q
S
 
S
D
 
K
G
 
G
Y
 
R
A
 
F
E
 
L
S
 
A
V
 
A
T
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
A
A
 
A
Q
 
Y
K
 
H
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
V
E
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
F
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
L
K
 
K
L
 
A
V
 
I
D
 
D
E
 
D
G
 
G
V
 
W
V
 
V
D
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
S
R
 
T
V
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
T
V
 
V
T
|
T
G
 
G
H
 
N
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
L
K
 
K

2d1fA Structure of mycobacterium tuberculosis threonine synthase (see paper)
55% identity, 82% coverage: 50:376/401 of query aligns to 10:329/349 of 2d1fA

query
sites
2d1fA
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
F
 
R
M
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
G
D
 
D
P
 
D
S
 
W
R
 
T
I
 
P
V
 
V
S
 
T
L
 
L
D
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
R
 
A
C
 
A
D
 
T
T
 
N
I
 
L
G
 
S
S
 
K
E
 
Q
L
 
T
G
 
G
I
 
C
E
 
T
L
 
I
Y
 
H
V
 
L
K
 
K
V
 
V
E
 
E
G
 
G
S
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
M
G
 
A
I
 
V
T
 
T
K
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
T
 
A
V
 
V
G
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
T
C
 
C
V
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
I
P
 
P
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
F
 
M
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
L
 
I
S
 
Q
V
 
I
R
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
C
L
 
L
E
 
E
A
 
L
V
 
A
T
 
R
E
 
K
L
 
M
A
 
A
L
 
A
-
 
D
M
 
F
G
 
P
E
 
T
L
 
I
Y
 
S
L
 
L
L
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
V
R
 
R
L
 
I
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
T
S
 
A
P
 
P
D
 
D
R
 
V
I
 
H
I
 
A
L
 
L
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
I
 
Y
S
 
T
E
 
E
F
 
Y
Y
 
H
R
 
Q
A
 
L
G
 
G
F
 
L
I
 
I
D
|
D
E
 
K
R
 
L
P
 
P
M
x
R
M
 
M
T
x
L
G
 
G
I
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
V
E
 
L
A
 
G
F
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
P
V
 
V
R
 
S
D
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
P
V
 
A
S
 
S
Y
 
W
L
 
T
K
 
S
A
 
A
L
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
Q
Y
 
Q
E
 
Q
S
 
S
D
 
K
G
 
G
Y
 
R
A
 
F
E
 
L
S
 
A
V
 
A
T
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
A
A
 
A
Q
 
Y
K
 
H
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
V
E
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
F
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
L
K
 
K
L
 
A
V
 
I
D
 
D
E
 
D
G
 
G
V
 
W
V
 
V
D
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
S
R
 
T
V
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
T
V
 
V
T
|
T
G
 
G
H
 
N
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
L
K
 
K

6nmxA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and appa (see paper)
49% identity, 88% coverage: 47:397/401 of query aligns to 7:349/350 of 6nmxA

query
sites
6nmxA
M
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
E
 
E
F
 
F
M
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
T
D
 
D
P
 
Q
S
 
T
R
 
P
I
 
A
V
 
L
S
 
T
L
 
L
D
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
R
 
H
C
 
L
D
 
P
T
 
K
I
 
L
G
 
S
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
L
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
V
 
T
E
 
E
G
 
G
S
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
V
V
 
M
G
 
A
I
 
V
T
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
G
V
 
N
D
 
D
T
 
T
V
 
I
G
 
M
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
|
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
N
L
 
M
G
 
K
C
 
C
V
 
I
V
 
V
L
 
I
L
 
I
P
 
P
S
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
F
 
M
H
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
I
L
 
I
S
 
A
V
 
I
R
 
D
G
 
G
N
 
N
F
|
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
I
V
 
V
T
 
R
E
 
S
L
 
I
A
 
C
L
 
E
M
 
K
G
 
S
E
 
P
L
 
I
Y
 
A
L
 
L
L
 
V
N
|
N
S
|
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
|
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
C
D
 
E
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
E
S
 
A
P
 
P
D
 
D
R
 
V
I
 
L
I
 
A
L
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
S
A
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
I
 
F
S
 
K
E
 
E
F
 
Y
Y
 
H
R
 
E
A
 
K
G
 
N
F
 
G
I
 
T
D
 
S
E
 
-
R
 
L
P
 
P
M
 
K
M
 
M
T
 
R
G
 
G
I
 
F
Q
x
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
x
S
S
 
A
P
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
R
T
 
N
E
 
E
I
 
V
E
 
-
P
 
-
V
 
I
R
 
E
D
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
|
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
P
V
 
A
S
 
S
Y
 
W
L
 
D
K
 
K
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
A
Y
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
N
G
 
G
Y
 
K
A
 
I
E
 
D
S
 
E
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
H
A
 
A
Q
 
Y
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
F
V
 
A
E
|
E
P
 
P
A
 
G
S
 
S
A
 
C
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
K
 
K
L
 
Q
V
 
V
D
 
K
E
 
S
G
 
G
V
 
E
V
 
I
D
 
P
R
 
K
G
 
G
E
 
S
R
 
K
V
 
V
V
 
V
C
 
A
V
 
V
V
 
L
T
|
T
G
 
G
H
 
N
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
N
T
 
T
A
 
A
I
 
V
K
 
D
A
 
I
S
 
S
-
 
E
T
 
I
E
 
K
P
 
P
V
 
V
E
 
T
V
 
L
E
 
P
P
 
T
D
 
N
I
 
E
N
 
D
Q
 
S
L
 
I
R
 
L
S
 
E
I
 
Y
I
 
V
R
 
K
G
 
G

6cgqB Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
50% identity, 85% coverage: 47:386/401 of query aligns to 5:331/345 of 6cgqB

query
sites
6cgqB
M
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
E
 
E
F
 
F
M
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
T
D
 
D
P
 
Q
S
 
T
R
 
P
I
 
A
V
 
L
S
 
T
L
 
L
D
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
R
 
H
C
 
L
D
 
P
T
 
K
I
 
L
G
 
S
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
L
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
V
 
T
E
 
E
G
 
G
S
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
V
V
 
M
G
 
A
I
 
V
T
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
G
V
 
N
D
 
D
T
 
T
V
 
I
G
 
M
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
|
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
N
L
 
M
G
 
K
C
 
C
V
 
I
V
 
V
L
 
I
L
 
I
P
 
P
S
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
F
 
M
H
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
I
L
 
I
S
 
A
V
 
I
R
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
I
V
 
V
T
 
R
E
 
S
L
 
I
A
 
C
L
 
E
M
 
K
G
 
S
E
 
P
L
 
I
Y
 
A
L
 
L
L
 
V
N
|
N
S
|
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
|
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
C
D
 
E
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
E
S
 
A
P
 
P
D
 
D
R
 
V
I
 
L
I
 
A
L
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
 
G
N
|
N
I
 
I
S
 
S
A
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
I
 
F
S
 
K
E
 
E
F
 
Y
Y
 
H
R
 
E
A
 
K
G
 
N
F
 
G
I
 
T
D
 
S
E
 
-
R
 
L
P
 
P
M
 
K
M
 
M
T
 
R
G
 
G
I
 
F
Q
x
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
x
S
S
 
A
P
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
R
T
 
N
E
 
E
I
 
V
E
 
-
P
 
-
V
 
I
R
 
E
D
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
|
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
P
V
 
A
S
 
S
Y
 
W
L
 
D
K
 
K
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
A
Y
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
N
G
 
G
Y
 
K
A
 
I
E
 
D
S
 
E
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
H
A
 
A
Q
 
Y
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
F
V
 
A
E
|
E
P
 
P
A
 
G
S
 
S
A
 
C
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
K
 
K
L
 
Q
V
 
V
D
 
K
E
 
S
G
 
G
V
 
E
V
 
I
D
 
P
R
 
K
G
 
G
E
 
S
R
 
K
V
 
V
V
 
V
C
 
A
V
 
V
V
 
L
T
|
T
G
 
G
H
 
N
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
N
T
 
T
A
 
A
I
 
V
K
 
D
A
 
I
S
 
S
T
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
E
V
 
I
E
 
K
P
 
P

6cgqA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
48% identity, 88% coverage: 47:397/401 of query aligns to 3:339/339 of 6cgqA

query
sites
6cgqA
M
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
E
 
E
F
 
F
M
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
T
D
 
D
P
 
Q
S
 
T
R
 
P
I
 
A
V
 
L
S
 
T
L
 
L
D
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
R
 
H
C
 
L
D
 
P
T
 
K
I
 
L
G
 
S
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
L
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
V
 
T
E
 
E
G
 
G
S
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
V
V
 
M
G
 
A
I
 
V
T
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
G
V
 
N
D
 
D
T
 
T
V
 
I
G
 
M
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
N
L
 
M
G
 
K
C
 
C
V
 
I
V
 
V
L
 
I
L
 
I
P
 
P
S
 
N
G
 
-
K
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
F
 
M
H
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
I
L
 
I
S
 
A
V
 
I
R
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
I
V
 
V
T
 
R
E
 
S
L
 
I
A
 
C
L
 
E
M
 
K
G
 
S
E
 
P
L
 
I
Y
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
C
D
 
E
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
E
S
 
A
P
 
P
D
 
D
R
 
V
I
 
L
I
 
A
L
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
S
A
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
I
 
F
S
 
K
E
 
E
F
 
Y
Y
 
H
R
 
E
A
 
K
G
 
N
F
 
G
I
 
T
D
 
S
E
 
-
R
 
L
P
 
P
M
 
K
M
 
M
T
 
R
G
 
G
I
 
F
Q
x
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
x
S
S
 
A
P
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
R
T
 
N
E
 
E
I
 
V
E
 
-
P
 
-
V
 
I
R
 
E
D
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
P
V
 
A
S
 
S
Y
 
W
L
 
D
K
 
K
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
A
Y
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
N
G
 
G
Y
 
K
A
 
I
E
 
D
S
 
E
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
H
A
 
A
Q
 
Y
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
F
V
 
A
E
|
E
P
 
P
A
 
G
S
 
S
A
 
C
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
K
 
K
L
 
Q
V
 
V
D
 
K
E
 
S
G
 
G
V
 
E
V
 
I
D
 
P
R
 
K
G
 
G
E
 
S
R
 
K
V
 
V
V
 
V
C
 
A
V
 
V
V
 
L
T
|
T
G
|
G
H
 
N
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
N
T
 
T
A
 
A
I
 
V
K
 
D
A
 
I
S
 
S
-
 
E
T
 
I
E
 
K
P
 
P
V
 
V
E
 
T
V
 
L
E
 
P
P
 
T
D
 
N
I
 
E
N
 
D
Q
 
S
L
 
I
R
 
L
S
 
E
I
 
Y
I
 
V
R
 
K
G
 
G

3aexA Catalytic intermediate analogue of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
52% identity, 84% coverage: 49:384/401 of query aligns to 8:337/351 of 3aexA

query
sites
3aexA
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
E
 
N
F
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
S
D
 
E
P
 
K
S
 
T
R
 
P
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
-
 
P
-
 
L
R
 
K
C
 
G
D
 
P
T
 
E
I
 
E
G
 
A
S
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
R
L
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
V
 
Y
E
 
E
G
 
G
S
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
A
I
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
T
 
A
V
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
|
T
S
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
L
C
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
K
 
Y
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
F
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
I
L
 
V
S
 
Q
V
 
V
R
 
E
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
R
A
 
L
V
 
T
T
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
T
L
 
E
M
 
A
G
 
F
E
 
P
L
 
V
Y
 
A
L
 
L
L
 
V
N
|
N
S
|
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
H
R
|
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
L
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
D
S
 
A
P
 
P
D
 
H
R
 
Y
I
 
H
I
 
A
L
 
L
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
H
W
 
W
K
 
M
G
 
G
I
 
Y
S
 
K
E
 
A
F
 
Y
Y
 
H
R
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
K
I
 
A
D
 
K
E
 
R
R
 
L
P
|
P
M
 
R
M
 
M
T
 
L
G
|
G
I
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
V
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
P
 
P
V
 
V
R
 
E
D
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
|
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
P
V
 
A
S
 
S
Y
 
W
L
 
Q
K
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
K
Y
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Y
 
V
A
 
I
E
 
E
S
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
F
A
 
A
Q
 
Y
K
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
F
V
 
C
E
|
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
F
K
 
K
L
 
L
V
 
L
D
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
R
V
 
L
D
 
E
R
 
P
G
 
E
E
 
S
R
 
T
V
 
V
V
 
V
C
 
L
V
 
T
V
 
L
T
|
T
G
 
G
H
 
H
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
E
K
 
R
A
 
V
S
 
A
T
 
E
E
 
L
P
 
P
V
 
P
E
 
P
V
 
V

1v7cA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 in complex with a substrate analogue (see paper)
52% identity, 84% coverage: 49:384/401 of query aligns to 8:337/351 of 1v7cA

query
sites
1v7cA
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
E
 
N
F
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
S
D
 
E
P
 
K
S
 
T
R
 
P
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
-
 
P
-
 
L
R
 
K
C
 
G
D
 
P
T
 
E
I
 
E
G
 
A
S
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
R
L
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
V
 
Y
E
 
E
G
 
G
S
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
A
I
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
T
 
A
V
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
|
T
S
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
L
C
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
K
 
Y
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
F
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
I
L
 
V
S
 
Q
V
 
V
R
 
E
G
 
G
N
 
N
F
|
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
R
A
 
L
V
 
T
T
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
T
L
 
E
M
 
A
G
 
F
E
 
P
L
 
V
Y
 
A
L
 
L
L
 
V
N
|
N
S
|
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
H
R
|
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
L
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
D
S
 
A
P
 
P
D
 
H
R
 
Y
I
 
H
I
 
A
L
 
L
P
 
P
V
|
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
H
W
 
W
K
 
M
G
 
G
I
 
Y
S
 
K
E
 
A
F
 
Y
Y
 
H
R
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
K
I
 
A
D
 
K
E
 
R
R
 
L
P
|
P
M
 
R
M
 
M
T
 
L
G
|
G
I
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
V
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
P
 
P
V
 
V
R
 
E
D
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
|
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
P
V
 
A
S
 
S
Y
 
W
L
 
Q
K
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
K
Y
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Y
 
V
A
 
I
E
 
E
S
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
F
A
 
A
Q
 
Y
K
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
F
V
 
C
E
|
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
F
K
 
K
L
 
L
V
 
L
D
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
R
V
 
L
D
 
E
R
 
P
G
 
E
E
 
S
R
 
T
V
 
V
V
 
V
C
 
L
V
 
T
V
 
L
T
|
T
G
 
G
H
 
H
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
E
K
 
R
A
 
V
S
 
A
T
 
E
E
 
L
P
 
P
V
 
P
E
 
P
V
 
V

1uimA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8, orthorhombic crystal form (see paper)
52% identity, 84% coverage: 49:384/401 of query aligns to 8:337/350 of 1uimA

query
sites
1uimA
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
E
 
N
F
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
S
D
 
E
P
 
K
S
 
T
R
 
P
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
-
 
P
-
 
L
R
 
K
C
 
G
D
 
P
T
 
E
I
 
E
G
 
A
S
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
R
L
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
V
 
Y
E
 
E
G
 
G
S
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
A
I
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
T
 
A
V
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
T
 
T
S
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
L
C
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
K
 
Y
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
F
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
I
L
 
V
S
 
Q
V
 
V
R
 
E
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
R
A
 
L
V
 
T
T
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
T
L
 
E
M
 
A
G
 
F
E
 
P
L
 
V
Y
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
L
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
D
S
 
A
P
 
P
D
 
H
R
 
Y
I
 
H
I
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
|
G
N
|
N
A
|
A
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
H
W
 
W
K
 
M
G
 
G
I
 
Y
S
 
K
E
 
A
F
 
Y
Y
 
H
R
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
K
I
 
A
D
 
K
E
 
R
R
 
L
P
|
P
M
 
R
M
 
M
T
 
L
G
|
G
I
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
V
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
P
 
P
V
 
V
R
 
E
D
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
P
V
 
A
S
 
S
Y
 
W
L
 
Q
K
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
K
Y
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Y
 
V
A
 
I
E
 
E
S
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
F
A
 
A
Q
 
Y
K
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
F
V
 
C
E
|
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
F
K
 
K
L
 
L
V
 
L
D
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
R
V
 
L
D
 
E
R
 
P
G
 
E
E
 
S
R
 
T
V
 
V
V
 
V
C
 
L
V
 
T
V
 
L
T
|
T
G
|
G
H
 
H
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
E
K
 
R
A
 
V
S
 
A
T
 
E
E
 
L
P
 
P
V
 
P
E
 
P
V
 
V

3aeyA Apo form of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
52% identity, 84% coverage: 49:384/401 of query aligns to 7:336/350 of 3aeyA

query
sites
3aeyA
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
E
 
N
F
 
L
M
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
S
D
 
E
P
 
K
S
 
T
R
 
P
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
T
 
T
P
 
P
F
 
L
V
 
I
-
 
P
-
 
L
R
 
K
C
 
G
D
 
P
T
 
E
I
 
E
G
 
A
S
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
R
L
 
L
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
V
 
Y
E
 
E
G
 
G
S
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
A
I
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
T
 
A
V
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
|
G
N
|
N
T
|
T
S
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
L
C
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
K
 
Y
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
F
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
I
L
 
V
S
 
Q
V
 
V
R
 
E
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
R
A
 
L
V
 
T
T
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
T
L
 
E
M
 
A
G
 
F
E
 
P
L
 
V
Y
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
S
|
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
H
R
|
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
L
G
 
A
F
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
D
S
 
A
P
 
P
D
 
H
R
 
Y
I
 
H
I
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
H
W
 
W
K
 
M
G
 
G
I
 
Y
S
 
K
E
 
A
F
 
Y
Y
 
H
R
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
K
I
 
A
D
 
K
E
 
R
R
 
L
P
|
P
M
 
R
M
 
M
T
 
L
G
|
G
I
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
V
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
L
G
 
G
R
|
R
T
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
P
 
P
V
|
V
R
x
E
D
x
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
T
 
T
A
|
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
P
V
 
A
S
 
S
Y
 
W
L
 
Q
K
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
K
Y
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Y
 
V
A
 
I
E
 
E
S
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
F
A
 
A
Q
 
Y
K
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
F
V
 
C
E
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
F
K
 
K
L
 
L
V
 
L
D
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
R
V
 
L
D
 
E
R
 
P
G
 
E
E
 
S
R
 
T
V
 
V
V
 
V
C
 
L
V
 
T
V
 
L
T
|
T
G
 
G
H
 
H
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
P
 
P
D
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
E
K
 
R
A
 
V
S
 
A
T
 
E
E
 
L
P
 
P
V
 
P
E
 
P
V
 
V

2c2bA Crystallographic structure of arabidopsis thaliana threonine synthase complexed with pyridoxal phosphate and s-adenosylmethionine (see paper)
35% identity, 96% coverage: 11:396/401 of query aligns to 21:441/444 of 2c2bA

query
sites
2c2bA
Y
 
Y
D
 
S
L
 
L
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
V
Y
 
Y
T
 
R
C
 
S
R
 
R
E
 
S
C
 
-
G
 
G
S
 
G
V
 
L
L
 
L
E
 
D
V
 
V
E
 
E
C
 
H
D
 
D
V
 
M
E
 
E
V
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
S
 
W
R
 
R
D
 
D
V
 
L
F
 
F
R
 
D
G
 
S
R
 
R
R
 
V
-
 
G
-
 
K
-
x
S
-
x
T
-
x
W
-
x
P
-
 
Y
-
x
G
Q
 
S
N
 
G
M
 
V
W
 
W
R
 
S
Y
 
K
R
 
K
E
 
E
F
 
W
-
 
V
M
 
L
P
 
P
-
 
E
V
 
I
D
 
D
P
 
D
S
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
V
S
|
S
L
 
A
D
x
F
E
 
E
G
 
G
G
 
N
T
 
S
P
x
N
F
x
L
V
 
F
R
x
W
C
 
A
D
 
E
T
 
R
I
 
F
G
 
G
S
 
K
E
 
Q
-
 
F
L
 
L
G
 
G
I
 
M
-
 
N
E
 
D
L
 
L
Y
x
W
V
 
V
K
 
K
V
 
H
E
 
C
G
 
G
S
 
I
N
 
S
P
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
L
I
 
V
T
 
S
K
 
Q
A
 
V
L
 
N
E
 
R
L
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
G
 
P
V
 
V
D
 
V
T
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
x
D
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
A
 
C
A
 
A
R
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
P
C
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
F
L
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
N
K
 
K
V
 
I
A
 
S
L
 
M
G
 
A
K
 
Q
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
A
 
P
M
 
I
F
 
A
H
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
F
V
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
I
R
 
D
G
 
T
N
 
D
F
 
F
D
 
D
E
 
G
A
 
C
L
 
M
E
 
K
A
 
L
V
 
I
T
 
R
E
 
E
L
 
I
A
 
T
L
 
A
M
 
E
G
 
L
E
 
P
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
N
 
N
S
 
S
V
 
L
N
 
N
P
 
S
F
 
L
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
S
 
T
I
 
A
G
 
A
F
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
L
D
 
Q
D
x
Q
L
x
F
G
 
D
W
 
W
E
 
Q
S
 
V
P
 
P
D
 
D
R
 
W
I
 
V
I
 
I
L
 
V
P
 
P
V
x
G
G
|
G
N
|
N
A
x
L
G
|
G
N
|
N
I
 
I
S
 
Y
A
 
A
I
 
F
W
 
Y
K
 
K
G
 
G
I
 
F
S
 
K
E
 
M
F
 
C
Y
 
Q
R
 
E
A
 
L
G
 
G
F
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
R
R
 
I
P
 
P
M
 
R
M
 
M
T
 
V
G
 
C
I
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
N
P
 
P
V
 
L
V
 
Y
E
 
L
A
 
H
F
 
Y
R
 
K
K
 
S
G
 
G
R
 
W
T
 
K
E
 
D
I
 
F
E
 
K
P
 
P
V
 
M
R
 
T
D
 
A
P
 
S
E
 
T
T
 
T
V
 
F
A
 
A
T
 
S
A
|
A
I
 
I
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
A
 
D
P
 
P
V
 
V
S
 
S
Y
 
I
L
 
D
K
 
R
A
 
A
L
 
V
R
 
Y
A
 
A
I
 
L
Y
 
K
E
 
K
S
 
C
D
 
N
G
 
G
Y
 
I
A
 
V
E
 
E
S
 
E
V
 
A
T
 
T
D
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
M
S
 
D
A
 
A
Q
 
M
K
 
A
L
 
-
L
 
Q
A
 
A
R
 
D
R
 
S
E
 
T
G
 
G
I
 
M
G
 
F
V
 
I
E
 
C
P
 
P
A
x
H
S
 
T
A
 
G
A
 
V
S
 
A
I
 
L
A
 
T
G
 
A
L
 
L
I
 
F
K
 
K
L
 
L
V
 
R
D
 
N
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
I
D
 
A
R
 
P
G
 
T
E
 
D
R
 
R
V
 
T
V
 
V
C
 
V
V
 
V
V
 
S
T
|
T
G
 
A
H
 
H
V
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
F
-
 
T
-
 
Q
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
A
-
 
I
P
 
P
D
 
D
T
 
M
A
 
A
I
 
C
K
 
R
A
 
F
S
 
S
T
 
N
E
 
P
P
 
P
V
 
V
E
 
D
V
 
V
E
 
K
P
 
A
D
 
D
I
 
F
N
 
G
Q
 
A
L
 
V
R
 
M
S
 
D
I
 
V
I
 
L
R
 
K

Q9S7B5 Threonine synthase 1, chloroplastic; Protein METHIONINE OVER-ACCUMULATOR 2; EC 4.2.3.1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
35% identity, 96% coverage: 11:396/401 of query aligns to 96:516/526 of Q9S7B5

query
sites
Q9S7B5
Y
 
Y
D
 
S
L
 
L
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
V
Y
 
Y
T
 
R
C
 
S
R
 
R
E
 
S
C
 
-
G
 
G
S
 
G
V
 
L
L
 
L
E
 
D
V
 
V
E
 
E
C
 
H
D
 
D
V
 
M
E
 
E
V
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
S
 
W
R
 
R
D
 
D
V
 
L
F
 
F
R
 
D
G
 
S
R
 
R
R
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
W
-
 
P
-
 
Y
-
 
G
Q
 
S
N
 
G
M
 
V
W
 
W
R
 
S
Y
 
K
R
 
K
E
 
E
F
 
W
-
 
V
M
 
L
P
 
P
-
 
E
V
 
I
D
 
D
P
 
D
S
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
V
S
 
S
L
 
A
D
 
F
E
 
E
G
 
G
G
 
N
T
 
S
P
x
N
F
x
L
V
 
F
R
 
W
C
 
A
D
 
E
T
 
R
I
 
F
G
 
G
S
x
K
E
 
Q
-
 
F
L
 
L
G
 
G
I
 
M
-
x
N
E
 
D
L
 
L
Y
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
H
E
 
C
G
 
G
S
 
I
N
 
S
P
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
D
R
x
L
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
L
I
 
V
T
 
S
-
 
Q
-
 
V
-
 
N
-
 
R
-
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
M
E
 
K
L
 
R
G
 
P
V
 
V
D
 
V