SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_048081113.1 NCBI__GCF_000746075.1:WP_048081113.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7o12B Abc transporter nosdfy, amppnp-bound in gdn (see paper)
35% identity, 96% coverage: 4:243/250 of query aligns to 1:232/298 of 7o12B

query
sites
7o12B
K
 
N
V
 
A
V
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
Q
N
 
G
V
 
V
S
 
S
K
 
Q
K
 
R
F
x
Y
G
 
G
K
 
S
L
 
M
S
 
T
V
|
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
N
V
 
L
N
 
G
E
 
E
K
 
G
D
 
E
L
 
V
M
 
L
A
 
G
I
 
L
I
 
F
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
G
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
S
I
 
M
K
 
K
I
 
L
I
 
I
M
 
L
G
 
G
I
 
L
L
 
L
T
 
S
P
 
P
D
 
S
T
 
E
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
K
 
K
I
 
V
F
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
A
P
 
P
K
 
N
-
 
D
-
 
P
K
 
Q
S
 
V
R
 
R
K
 
R
L
 
Q
M
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
x
E
H
 
N
V
 
V
A
 
T
F
 
F
D
 
Y
P
 
P
D
 
Q
F
 
-
P
 
-
I
 
L
N
 
S
V
 
G
F
 
R
D
 
E
T
 
T
V
 
L
L
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
R
Y
 
H
H
 
F
G
 
A
L
 
R
F
 
L
K
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
A
Y
 
L
T
 
T
K
 
Q
S
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
L
L
 
L
K
 
E
D
 
Q
V
 
V
D
 
G
I
 
L
Y
 
A
K
 
H
L
 
A
R
 
A
D
 
D
R
 
R
Q
 
R
I
 
V
S
 
K
E
 
T
I
 
Y
S
 
S
G
 
K
G
 
G
Q
 
M
M
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
F
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
S
 
A
I
 
L
V
 
L
R
 
G
E
 
E
P
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
V
S
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
I
M
 
A
Q
 
T
N
 
Q
S
 
D
F
 
L
Y
 
Y
K
 
L
L
 
L
L
 
I
S
 
D
R
 
R
L
 
L
N
 
R
D
 
Q
K
 
R
M
 
G
T
 
T
-
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
L
I
 
C
S
 
S
H
 
H
D
 
V
V
 
L
G
 
P
A
 
G
V
 
V
S
 
E
A
 
A
H
 
H
V
 
I
D
 
N
K
 
R
I
 
A
A
 
A
C
 
I
L
 
L
N
 
A
R
 
K
E
 
G
L
 
C
F
 
L
Y
 
Q
H
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
A
E
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
L
K
 
S
G
 
Q
L
 
L
E
 
R
E
 
A
V
 
E
Y
 
A
K
 
G
C
 
L
P
 
P
L
 
V
E
 
R
L
 
I
I
 
R
S
 
A
H
 
S
G
 
G
I
 
I
P
 
S
H
 
E
R
 
R

7o17B Abc transporter nosdfy e154q, atp-bound in lipid nanodisc (see paper)
34% identity, 96% coverage: 4:243/250 of query aligns to 1:232/298 of 7o17B

query
sites
7o17B
K
 
N
V
 
A
V
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
Q
N
 
G
V
 
V
S
 
S
K
 
Q
K
 
R
F
x
Y
G
 
G
K
 
S
L
 
M
S
 
T
V
|
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
N
V
 
L
N
 
G
E
 
E
K
 
G
D
 
E
L
 
V
M
 
L
A
 
G
I
 
L
I
 
F
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
G
x
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
S
I
 
M
K
 
K
I
 
L
I
 
I
M
 
L
G
 
G
I
 
L
L
 
L
T
 
S
P
 
P
D
 
S
T
 
E
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
K
 
K
I
 
V
F
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
A
P
 
P
K
 
N
-
 
D
-
 
P
K
 
Q
S
 
V
R
 
R
K
 
R
L
 
Q
M
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
x
E
H
 
N
V
 
V
A
 
T
F
 
F
D
 
Y
P
 
P
D
 
Q
F
 
-
P
 
-
I
 
L
N
 
S
V
 
G
F
 
R
D
 
E
T
 
T
V
 
L
L
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
R
Y
 
H
H
 
F
G
 
A
L
 
R
F
 
L
K
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
A
Y
 
L
T
 
T
K
 
Q
S
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
L
L
 
L
K
 
E
D
 
Q
V
 
V
D
 
G
I
 
L
Y
 
A
K
 
H
L
 
A
R
 
A
D
 
D
R
|
R
Q
 
R
I
 
V
S
 
K
E
x
T
I
 
Y
S
|
S
G
x
K
G
|
G
Q
x
M
M
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
F
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
S
 
A
I
 
L
V
 
L
R
 
G
E
 
E
P
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
T
A
 
V
S
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
I
M
 
A
Q
 
T
N
 
Q
S
 
D
F
 
L
Y
 
Y
K
 
L
L
 
L
L
 
I
S
 
D
R
 
R
L
 
L
N
 
R
D
 
Q
K
 
R
M
 
G
T
 
T
-
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
L
I
 
C
S
 
S
H
 
H
D
 
V
V
 
L
G
 
P
A
 
G
V
 
V
S
 
E
A
 
A
H
 
H
V
 
I
D
 
N
K
 
R
I
 
A
A
 
A
C
 
I
L
 
L
N
 
A
R
 
K
E
 
G
L
 
C
F
 
L
Y
 
Q
H
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
A
E
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
L
K
 
S
G
 
Q
L
 
L
E
 
R
E
 
A
V
 
E
Y
 
A
K
 
G
C
 
L
P
 
P
L
 
V
E
 
R
L
 
I
I
 
R
S
 
A
H
 
S
G
 
G
I
 
I
P
 
S
H
 
E
R
 
R

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 90% coverage: 4:228/250 of query aligns to 3:238/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
K
 
E
V
 
I
V
 
L
E
 
R
I
 
T
S
 
E
N
 
N
V
 
I
S
 
V
K
 
K
K
 
Y
F
|
F
G
 
G
K
 
E
L
x
F
S
 
K
V
 
A
L
 
L
H
 
D
D
 
G
I
 
V
N
 
S
L
 
I
S
 
S
V
 
V
N
 
N
E
 
K
K
 
G
D
 
D
L
 
V
M
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
G
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
K
 
N
I
 
V
I
 
I
M
 
T
G
 
G
I
 
F
L
 
L
T
 
K
P
 
A
D
 
D
T
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
F
-
 
E
-
 
N
-
 
K
K
 
D
I
 
I
F
 
T
G
 
N
R
 
K
E
 
E
P
 
P
K
 
A
K
 
E
S
 
L
R
 
Y
K
 
H
L
 
-
M
 
Y
G
 
G
Y
 
I
L
 
V
P
 
R
Q
 
T
H
 
F
V
 
Q
A
 
T
F
 
P
D
 
Q
P
 
P
D
 
L
F
 
K
P
 
E
I
 
M
N
 
T
V
 
V
F
 
L
D
 
E
T
 
N
V
 
L
L
 
L
S
 
I
G
 
G
R
 
E
-
 
I
-
 
C
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
P
Y
 
L
H
 
N
G
 
S
L
 
L
F
 
F
-
 
Y
K
 
K
G
 
K
Y
 
W
T
 
I
K
 
P
S
 
K
D
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
M
A
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
F
K
 
K
D
 
I
V
 
L
D
 
E
I
 
F
Y
 
L
K
 
K
L
 
L
R
 
S
-
 
H
-
 
L
-
 
Y
D
 
D
R
 
R
Q
 
K
I
 
A
S
 
G
E
 
E
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
M
Q
 
K
R
 
L
V
 
V
F
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
M
R
 
T
E
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
M
L
 
I
I
 
V
M
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
S
 
G
I
 
V
D
 
A
P
 
P
E
 
G
M
 
L
Q
 
A
N
 
H
S
 
D
F
 
I
Y
 
F
K
 
N
L
 
H
L
 
V
S
 
L
R
 
E
L
 
L
N
 
K
D
 
A
K
 
K
-
 
G
M
 
I
T
 
T
I
 
F
I
 
L
L
 
I
I
 
I
S
 
E
H
 
H
D
 
R
V
 
L
G
 
D
A
 
I
V
 
V
S
 
L
A
 
N
H
 
Y
V
 
I
D
 
D
K
 
H
I
 
L
A
 
Y
C
 
V
L
 
M
N
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
Y
 
F
H
 
N
G
 
G
P
 
Q
V
 
I
E
 
I
G
 
A
S
 
E
A
 
G
K
 
R
G
 
G
L
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
I

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
30% identity, 90% coverage: 4:228/250 of query aligns to 3:238/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
K
 
E
V
 
I
V
 
L
E
 
R
I
 
T
S
 
E
N
 
N
V
 
I
S
 
V
K
 
K
K
 
Y
F
|
F
G
 
G
K
 
E
L
x
F
S
 
K
V
 
A
L
 
L
H
 
D
D
 
G
I
 
V
N
 
S
L
 
I
S
 
S
V
 
V
N
 
C
E
 
K
K
 
G
D
 
D
L
 
V
M
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
G
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
K
 
N
I
 
V
I
 
I
M
 
T
G
 
G
I
 
F
L
 
L
T
 
K
P
 
A
D
 
D
T
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
V
-
 
Y
-
 
F
-
 
E
-
 
N
-
 
K
K
 
D
I
 
I
F
 
T
G
 
N
R
 
K
E
 
E
P
 
P
K
 
A
K
 
E
S
 
L
R
 
Y
K
 
H
L
 
-
M
 
Y
G
 
G
Y
 
I
L
 
V
P
 
R
Q
 
T
H
 
F
V
 
Q
A
 
T
F
 
P
D
 
Q
P
 
P
D
 
L
F
 
K
P
 
E
I
 
M
N
 
T
V
 
V
F
 
L
D
 
E
T
 
N
V
 
L
L
 
L
S
 
I
G
 
G
R
 
E
Y
 
I
H
 
N
G
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
L
L
 
F
F
 
Y
K
 
K
G
 
K
Y
 
W
T
 
I
K
 
P
S
 
K
D
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
M
A
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
F
K
 
K
D
 
I
V
 
L
D
 
E
I
 
F
Y
 
L
K
 
K
L
 
L
R
 
S
-
 
H
-
 
L
-
 
Y
D
 
D
R
 
R
Q
 
K
I
 
A
S
 
G
E
 
E
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
M
Q
 
K
R
 
L
V
 
V
F
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
M
R
 
T
E
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
M
L
 
I
I
 
V
M
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
S
 
G
I
 
V
D
 
A
P
 
P
E
 
G
M
 
L
Q
 
A
N
 
H
S
 
D
F
 
I
Y
 
F
K
 
N
L
 
H
L
 
V
S
 
L
R
 
E
L
 
L
N
 
K
D
 
A
K
 
K
-
 
G
M
 
I
T
 
T
I
 
F
I
 
L
L
 
I
I
 
I
S
 
E
H
 
H
D
 
R
V
 
L
G
 
D
A
 
I
V
 
V
S
 
L
A
 
N
H
 
Y
V
 
I
D
 
D
K
 
H
I
 
L
A
 
Y
C
 
V
L
 
M
N
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
Y
 
F
H
 
N
G
 
G
P
 
Q
V
 
I
E
 
I
G
 
A
S
 
E
A
 
G
K
 
R
G
 
G
L
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
I

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
35% identity, 84% coverage: 16:225/250 of query aligns to 16:227/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
G
 
G
K
 
G
L
x
V
S
 
K
V
x
A
L
 
L
H
 
D
D
 
D
I
 
L
N
 
S
L
 
L
S
 
A
V
 
V
N
 
P
E
 
K
K
 
G
D
 
E
L
 
S
M
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
G
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
K
 
L
I
 
H
I
 
L
M
 
N
G
 
G
I
 
T
L
 
L
T
 
R
P
 
P
D
 
Q
T
 
S
G
 
G
E
 
R
V
 
V
K
 
L
I
 
L
F
 
G
G
 
G
R
 
T
E
 
A
P
 
T
K
 
G
K
 
H
S
 
S
R
 
R
K
 
K
-
 
D
L
 
L
M
 
T
G
 
G
Y
 
W
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
V
-
 
G
L
 
L
P
 
V
Q
 
L
H
x
Q
V
 
D
A
 
A
F
 
D
D
 
D
P
 
Q
D
 
L
F
 
F
P
 
A
I
 
T
N
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
E
T
 
D
V
 
V
L
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
S
Y
 
F
H
 
G
G
 
P
L
 
L
F
 
N
K
 
L
G
 
G
Y
 
L
T
 
S
K
 
E
S
 
A
D
 
E
E
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
R
A
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
A
V
 
L
D
 
S
I
 
I
Y
 
S
K
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
D
R
 
R
Q
 
P
I
 
T
S
x
H
E
x
M
I
x
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
M
 
K
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
S
 
A
I
 
V
V
 
A
R
 
M
E
 
R
P
 
P
K
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
M
 
T
A
 
A
S
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
L
E
 
A
M
 
G
Q
 
T
N
 
E
S
 
Q
F
 
L
Y
 
L
K
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
R
R
 
G
L
 
L
N
 
R
D
 
A
K
 
A
-
 
G
M
 
M
T
 
T
I
 
L
I
 
V
L
 
F
I
 
S
S
 
T
H
|
H
D
 
D
V
 
V
G
 
E
A
 
L
V
 
A
S
 
A
A
 
A
H
 
L
V
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
A
C
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
L
F
 
F
Y
 
R
H
 
T
G
 
G
P
 
R
V
 
V
-
 
L
-
 
A
E
 
E
G
 
G
S
 
A
A
 
A
K
 
E
G
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
30% identity, 88% coverage: 8:228/250 of query aligns to 4:239/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
 
V
S
 
N
N
 
D
V
 
V
S
 
Y
K
 
K
K
 
N
F
|
F
G
 
G
K
 
S
L
 
L
S
 
E
V
|
V
L
 
L
H
 
K
D
 
G
I
 
V
N
 
T
L
 
L
S
 
K
V
 
V
N
 
N
E
 
K
K
 
G
D
 
E
L
 
V
M
 
V
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
G
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
I
 
C
I
 
I
M
 
N
G
 
L
I
 
L
L
 
E
T
 
E
P
 
P
D
 
T
T
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
K
 
F
I
 
I
F
 
D
G
 
G
R
 
V
E
 
K
-
 
I
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
N
P
 
I
K
 
N
K
 
K
S
 
V
R
 
R
K
 
Q
L
 
K
M
 
V
G
 
G
Y
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
H
 
H
V
 
F
A
 
N
F
 
L
D
 
F
P
 
P
D
 
H
F
 
L
P
 
T
I
 
A
N
 
I
V
 
E
F
 
N
D
 
I
T
 
T
V
 
L
L
 
A
S
 
P
G
 
V
R
 
K
Y
 
V
H
 
K
G
 
K
L
 
M
F
 
N
K
 
K
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
K
 
K
S
 
E
D
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
V
K
 
D
A
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
K
V
 
V
D
 
G
I
 
L
Y
 
L
K
 
D
L
 
K
R
 
K
D
 
D
R
 
Q
Q
 
Y
I
 
P
S
 
I
E
 
K
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
F
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
A
R
 
M
E
 
Q
P
 
P
K
 
E
L
 
V
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
S
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
N
 
K
S
 
E
F
 
V
Y
 
L
K
 
N
L
 
V
L
 
M
S
 
K
R
 
Q
L
 
L
-
 
A
N
 
N
D
 
E
K
 
G
M
 
M
T
 
T
I
 
M
I
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
E
V
 
M
G
 
G
A
 
F
V
 
A
S
 
R
A
 
E
H
 
V
V
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
I
C
 
F
L
 
M
N
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
P
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
F
Y
 
Y
H
 
R
G
 
A
P
 
K
V
 
N
E
 
E
G
 
R
S
 
T
A
 
R
K
 
E
G
 
F
L
 
L
E
 
S
E
 
K
V
 
I

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
30% identity, 82% coverage: 4:209/250 of query aligns to 2:212/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
K
 
Q
V
 
M
V
 
I
E
 
D
I
 
V
S
 
H
N
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
K
 
S
F
|
F
G
 
G
K
 
S
L
 
L
S
 
E
V
|
V
L
 
L
H
 
K
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
N
 
R
E
 
E
K
 
G
D
 
E
L
 
V
M
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
G
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
I
 
C
I
 
L
M
 
N
G
 
L
I
 
L
L
 
E
T
 
D
P
 
F
D
 
D
T
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
K
 
I
I
 
I
F
 
D
G
 
G
R
 
I
E
 
N
P
 
L
K
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
L
-
 
N
K
 
K
S
 
V
R
 
R
K
 
E
L
 
E
M
 
V
G
 
G
Y
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
A
 
N
F
 
L
D
 
F
P
 
P
D
 
H
F
 
M
P
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
V
L
 
L
S
 
N
G
 
N
R
 
I
Y
 
T
H
 
L
G
 
A
L
 
P
F
 
M
K
 
K
G
 
V
Y
 
R
T
 
K
K
 
W
S
 
P
D
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
E
E
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
K
 
E
D
 
L
V
 
L
D
 
D
I
 
K
Y
 
V
K
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
R
 
K
Q
 
A
I
 
H
S
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
E
 
S
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
A
R
 
M
E
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
S
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
N
 
G
S
 
E
F
 
V
Y
 
L
K
 
S
L
 
V
L
 
M
S
 
K
R
 
Q
L
 
L
-
 
A
N
 
N
D
 
E
K
 
G
M
 
M
T
 
T
I
 
M
I
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
G
 
G
A
 
F
V
 
A
S
 
R
A
 
E
H
 
V
V
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
L
C
 
F
L
 
M
N
 
D

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
30% identity, 82% coverage: 4:209/250 of query aligns to 2:212/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
K
 
Q
V
 
M
V
 
I
E
 
D
I
 
V
S
 
H
N
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
K
 
S
F
|
F
G
 
G
K
 
S
L
 
L
S
 
E
V
|
V
L
 
L
H
 
K
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
N
 
R
E
 
E
K
 
G
D
 
E
L
 
V
M
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
G
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
I
 
C
I
 
L
M
 
N
G
 
L
I
 
L
L
 
E
T
 
D
P
 
F
D
 
D
T
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
K
 
I
I
 
I
F
 
D
G
 
G
R
 
I
E
 
N
P
 
L
K
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
L
-
 
N
K
 
K
S
 
V
R
 
R
K
 
E
L
 
E
M
 
V
G
 
G
Y
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
A
 
N
F
 
L
D
 
F
P
 
P
D
 
H
F
 
M
P
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
V
L
 
L
S
 
N
G
 
N
R
 
I
Y
 
T
H
 
L
G
 
A
L
 
P
F
 
M
K
 
K
G
 
V
Y
 
R
T
 
K
K
 
W
S
 
P
D
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
E
E
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
K
 
E
D
 
L
V
 
L
D
 
D
I
 
K
Y
 
V
K
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
R
 
K
Q
 
A
I
 
H
S
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
E
 
S
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
A
R
 
M
E
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
S
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
N
 
G
S
 
E
F
 
V
Y
 
L
K
 
S
L
 
V
L
 
M
S
 
K
R
 
Q
L
 
L
-
 
A
N
 
N
D
 
E
K
 
G
M
 
M
T
 
T
I
 
M
I
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
G
 
G
A
 
F
V
 
A
S
 
R
A
 
E
H
 
V
V
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
L
C
 
F
L
 
M
N
 
D

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
30% identity, 82% coverage: 4:209/250 of query aligns to 2:212/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
K
 
Q
V
 
M
V
 
I
E
 
D
I
 
V
S
 
H
N
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
K
 
S
F
|
F
G
 
G
K
 
S
L
 
L
S
 
E
V
|
V
L
 
L
H
 
K
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
N
 
R
E
 
E
K
 
G
D
 
E
L
 
V
M
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
G
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
I
 
C
I
 
L
M
 
N
G
 
L
I
 
L
L
 
E
T
 
D
P
 
F
D
 
D
T
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
K
 
I
I
 
I
F
 
D
G
 
G
R
 
I
E
 
N
P
 
L
K
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
L
-
 
N
K
 
K
S
 
V
R
 
R
K
 
E
L
 
E
M
 
V
G
 
G
Y
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
A
 
N
F
 
L
D
 
F
P
 
P
D
 
H
F
 
M
P
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
V
L
 
L
S
 
N
G
 
N
R
 
I
Y
 
T
H
 
L
G
 
A
L
 
P
F
 
M
K
 
K
G
 
V
Y
 
R
T
 
K
K
 
W
S
 
P
D
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
E
E
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
K
 
E
D
 
L
V
 
L
D
 
D
I
 
K
Y
 
V
K
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
R
 
K
Q
 
A
I
 
H
S
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
E
 
S
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
A
R
 
M
E
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
S
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
N
 
G
S
 
E
F
 
V
Y
 
L
K
 
S
L
 
V
L
 
M
S
 
K
R
 
Q
L
 
L
-
 
A
N
 
N
D
 
E
K
 
G
M
 
M
T
 
T
I
 
M
I
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
G
 
G
A
 
F
V
 
A
S
 
R
A
 
E
H
 
V
V
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
L
C
 
F
L
 
M
N
 
D

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
30% identity, 82% coverage: 4:209/250 of query aligns to 2:212/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
K
 
Q
V
 
M
V
 
I
E
 
D
I
 
V
S
 
H
N
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
K
 
S
F
|
F
G
 
G
K
 
S
L
 
L
S
 
E
V
|
V
L
 
L
H
 
K
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
N
 
R
E
 
E
K
 
G
D
 
E
L
 
V
M
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
G
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
I
 
C
I
 
L
M
 
N
G
 
L
I
 
L
L
 
E
T
 
D
P
 
F
D
 
D
T
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
K
 
I
I
 
I
F
 
D
G
 
G
R
 
I
E
 
N
P
 
L
K
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
L
-
 
N
K
 
K
S
 
V
R
 
R
K
 
E
L
 
E
M
 
V
G
 
G
Y
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
A
 
N
F
 
L
D
 
F
P
 
P
D
 
H
F
 
M
P
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
V
L
 
L
S
 
N
G
 
N
R
 
I
Y
 
T
H
 
L
G
 
A
L
 
P
F
 
M
K
 
K
G
 
V
Y
 
R
T
 
K
K
 
W
S
 
P
D
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
E
E
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
K
 
E
D
 
L
V
 
L
D
 
D
I
 
K
Y
 
V
K
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
R
 
K
Q
 
A
I
 
H
S
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
E
 
S
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
A
R
 
M
E
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
S
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
N
 
G
S
 
E
F
 
V
Y
 
L
K
 
S
L
 
V
L
 
M
S
 
K
R
 
Q
L
 
L
-
 
A
N
 
N
D
 
E
K
 
G
M
 
M
T
 
T
I
 
M
I
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
G
 
G
A
 
F
V
 
A
S
 
R
A
 
E
H
 
V
V
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
L
C
 
F
L
 
M
N
 
D

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
30% identity, 80% coverage: 8:208/250 of query aligns to 6:214/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
I
 
V
S
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
S
K
 
K
K
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
V
S
 
V
V
 
A
L
 
L
H
 
D
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
N
 
E
E
 
N
K
 
G
D
 
E
L
 
R
M
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
G
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
I
 
M
K
 
R
I
 
I
I
 
I
M
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
K
 
Y
I
 
F
F
 
D
G
 
D
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
E
 
V
P
 
P
K
 
P
K
 
E
S
 
D
R
 
R
K
 
K
L
 
I
M
 
-
G
 
G
Y
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
|
Q
H
 
T
V
 
W
A
 
A
F
 
L
D
 
Y
P
 
P
D
 
N
F
 
-
P
 
-
I
 
L
N
 
T
V
 
A
F
 
F
D
 
E
T
 
N
V
 
I
L
 
A
S
 
F
G
 
P
R
 
L
Y
 
T
H
 
N
G
 
-
L
 
-
F
 
M
K
 
K
G
 
M
Y
 
S
T
 
K
K
 
E
S
 
E
D
 
I
E
 
R
E
 
K
A
 
R
A
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
V
L
 
A
K
 
K
D
 
I
V
 
L
D
 
D
I
 
I
Y
 
H
K
 
H
L
 
V
R
 
L
D
 
N
R
 
H
Q
 
F
I
 
P
S
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
S
 
N
I
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
M
 
M
Q
 
R
N
 
D
S
 
S
F
 
A
Y
 
R
K
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
K
R
 
E
L
 
V
N
 
Q
D
 
S
K
 
R
M
 
L
-
 
G
-
 
V
T
 
T
I
 
L
I
 
L
L
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
G
 
A
A
 
D
V
 
I
S
 
F
A
 
A
H
 
I
V
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
G
C
 
V
L
 
L

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
30% identity, 80% coverage: 8:208/250 of query aligns to 6:214/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
I
 
V
S
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
S
K
 
K
K
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
V
S
 
V
V
 
A
L
 
L
H
 
D
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
N
 
E
E
 
N
K
 
G
D
 
E
L
 
R
M
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
G
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
I
 
M
K
 
R
I
 
I
I
 
I
M
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
K
 
Y
I
 
F
F
 
D
G
 
D
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
E
 
V
P
 
P
K
 
P
K
 
E
S
 
D
R
 
R
K
 
K
L
 
I
M
 
-
G
 
G
Y
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
W
A
 
A
F
 
L
D
 
Y
P
 
P
D
 
N
F
 
-
P
 
-
I
 
L
N
 
T
V
 
A
F
 
F
D
 
E
T
 
N
V
 
I
L
 
A
S
 
F
G
 
P
R
 
L
Y
 
T
H
 
N
G
 
-
L
 
-
F
 
M
K
 
K
G
 
M
Y
 
S
T
 
K
K
 
E
S
 
E
D
 
I
E
 
R
E
 
K
A
 
R
A
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
V
L
 
A
K
 
K
D
 
I
V
 
L
D
 
D
I
 
I
Y
 
H
K
 
H
L
 
V
R
 
L
D
 
N
R
 
H
Q
 
F
I
 
P
S
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
S
 
N
I
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
M
 
M
Q
 
R
N
 
D
S
 
S
F
 
A
Y
 
R
K
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
K
R
 
E
L
 
V
N
 
Q
D
 
S
K
 
R
M
 
L
-
 
G
-
 
V
T
 
T
I
 
L
I
 
L
L
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
G
 
A
A
 
D
V
 
I
S
 
F
A
 
A
H
 
I
V
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
G
C
 
V
L
 
L

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
30% identity, 80% coverage: 8:208/250 of query aligns to 6:214/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
I
 
V
S
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
S
K
 
K
K
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
V
S
 
V
V
x
A
L
 
L
H
 
D
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
N
 
E
E
 
N
K
 
G
D
 
E
L
 
R
M
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
G
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
I
 
M
K
 
R
I
 
I
I
 
I
M
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
K
 
Y
I
 
F
F
 
D
G
 
D
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
E
 
V
P
 
P
K
 
P
K
 
E
S
 
D
R
 
R
K
 
K
L
 
I
M
 
-
G
 
G
Y
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
W
A
 
A
F
 
L
D
 
Y
P
 
P
D
 
N
F
 
-
P
 
-
I
 
L
N
 
T
V
 
A
F
 
F
D
 
E
T
 
N
V
 
I
L
 
A
S
 
F
G
 
P
R
 
L
Y
 
T
H
 
N
G
 
-
L
 
-
F
 
M
K
 
K
G
 
M
Y
 
S
T
 
K
K
 
E
S
 
E
D
 
I
E
 
R
E
 
K
A
 
R
A
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
V
L
 
A
K
 
K
D
 
I
V
 
L
D
 
D
I
 
I
Y
 
H
K
 
H
L
 
V
R
 
L
D
 
N
R
 
H
Q
 
F
I
 
P
S
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
S
 
N
I
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
M
 
M
Q
 
R
N
 
D
S
 
S
F
 
A
Y
 
R
K
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
K
R
 
E
L
 
V
N
 
Q
D
 
S
K
 
R
M
 
L
-
 
G
-
 
V
T
 
T
I
 
L
I
 
L
L
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
G
 
A
A
 
D
V
 
I
S
 
F
A
 
A
H
 
I
V
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
G
C
 
V
L
 
L

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
30% identity, 80% coverage: 8:208/250 of query aligns to 6:214/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
I
 
V
S
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
S
K
 
K
K
 
V
F
 
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
V
S
 
V
V
 
A
L
 
L
H
 
D
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
N
 
E
E
 
N
K
 
G
D
 
E
L
 
R
M
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
G
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
F
I
 
M
K
 
R
I
 
I
I
 
I
M
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
K
 
Y
I
 
F
F
 
D
G
 
D
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
E
 
V
P
 
P
K
 
P
K
 
E
S
 
D
R
 
R
K
 
K
L
 
I
M
 
-
G
 
G
Y
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
W
A
 
A
F
 
L
D
 
Y
P
 
P
D
 
N
F
 
-
P
 
-
I
 
L
N
 
T
V
 
A
F
 
F
D
 
E
T
 
N
V
 
I
L
 
A
S
 
F
G
 
P
R
 
L
Y
 
T
H
 
N
G
 
-
L
 
-
F
 
M
K
 
K
G
 
M
Y
 
S
T
 
K
K
 
E
S
 
E
D
 
I
E
 
R
E
 
K
A
 
R
A
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
V
L
 
A
K
 
K
D
 
I
V
 
L
D
 
D
I
 
I
Y
 
H
K
 
H
L
 
V
R
 
L
D
 
N
R
 
H
Q
 
F
I
 
P
S
 
R
E
 
E
I
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
Q
M
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
S
 
N
I
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
M
 
M
Q
 
R
N
 
D
S
 
S
F
 
A
Y
 
R
K
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
K
R
 
E
L
 
V
N
 
Q
D
 
S
K
 
R
M
 
L
-
 
G
-
 
V
T
 
T
I
 
L
I
 
L
L
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
G
 
A
A
 
D
V
 
I
S
 
F
A
 
A
H
 
I
V
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
G
C
 
V
L
 
L

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
29% identity, 82% coverage: 6:210/250 of query aligns to 7:204/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
V
 
V
E
 
K
I
 
L
S
 
E
N
 
N
V
 
L
S
 
T
K
 
K
K
 
R
F
|
F
G
 
G
K
 
N
L
x
F
S
 
T
V
 
A
L
 
V
H
 
N
D
 
K
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
I
N
 
K
E
 
D
K
 
G
D
 
E
L
 
F
M
 
L
A
 
V
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
G
 
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
I
 
L
K
 
R
I
 
M
I
 
I
M
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
E
T
 
E
P
 
P
D
 
T
T
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
I
K
 
Y
I
 
F
F
 
G
G
 
D
R
 
R
E
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
Y
-
 
L
P
 
P
K
 
P
K
 
K
S
 
D
R
 
R
K
 
N
L
 
I
-
 
S
M
 
M
G
 
V
Y
 
F
L
 
Q
P
 
H
Q
 
M
H
 
T
V
 
V
A
 
Y
F
 
E
D
 
N
P
 
I
D
 
A
F
 
F
P
 
P
I
 
L
N
 
-
V
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
K
 
K
G
 
K
Y
 
F
T
 
P
K
 
K
S
 
D
D
 
E
-
 
I
E
 
D
E
 
K
A
 
R
A
 
V
E
 
R
K
 
W
A
 
A
L
 
A
K
 
E
D
 
L
V
 
L
D
 
Q
I
 
I
Y
 
E
K
 
E
L
 
L
R
 
L
D
 
N
R
 
R
Q
 
Y
I
 
P
S
 
A
E
 
Q
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
M
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
I
V
 
V
R
 
V
E
 
E
P
 
P
K
 
D
L
 
V
L
 
L
I
 
L
M
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
S
 
N
I
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
K
M
 
L
Q
 
R
N
 
V
S
 
A
F
 
M
Y
 
R
K
 
A
L
 
E
L
 
I
S
 
K
R
 
K
L
 
L
N
 
Q
D
 
Q
K
 
K
M
 
L
-
 
K
-
 
V
T
 
T
I
 
T
I
 
I
L
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
G
 
V
A
 
E
V
 
A
S
 
M
A
 
T
H
 
M
V
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
I
A
 
A
C
 
V
L
 
M
N
 
N
R
 
R

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
28% identity, 92% coverage: 8:238/250 of query aligns to 14:254/265 of P07821

query
sites
P07821
I
 
L
S
 
R
N
 
N
V
 
I
S
 
S
K
 
F
K
 
R
F
 
V
G
 
P
K
 
G
L
 
R
S
 
T
V
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
P
I
 
L
N
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
F
N
 
P
E
 
A
K
 
G
D
 
K
L
 
V
M
 
T
A
 
G
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
G
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
K
I
 
M
I
 
L
M
 
G
G
 
R
I
 
H
L
 
Q
T
 
P
P
 
P
D
 
S
T
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
K
 
-
I
 
L
F
 
L
G
 
D
R
 
A
E
 
Q
P
 
P
K
 
L
K
 
E
S
 
S
R
 
W
-
 
S
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
A
K
 
R
L
 
K
M
 
V
G
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
H
 
Q
V
 
-
A
 
-
F
 
L
D
 
P
P
 
P
D
 
A
F
 
E
P
 
G
I
 
M
N
 
T
V
 
V
F
 
R
D
 
E
T
 
L
V
 
V
L
 
A
S
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
-
 
P
-
 
W
H
 
H
G
 
G
L
 
A
F
 
L
K
 
G
G
 
R
Y
 
F
T
 
G
K
 
A
S
 
A
D
 
D
E
 
R
E
 
E
A
 
K
A
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
S
D
 
L
V
 
V
D
 
G
I
 
L
Y
 
K
K
 
P
L
 
L
R
 
A
D
 
H
R
 
R
Q
 
L
I
 
V
S
 
D
E
 
S
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
M
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
A
F
 
W
I
 
I
A
 
A
R
 
M
S
 
L
I
 
V
V
 
A
R
 
Q
E
 
D
P
 
S
K
 
R
L
 
C
L
 
L
I
 
L
M
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
S
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
I
E
 
A
M
 
H
Q
 
Q
N
 
V
S
 
D
F
 
V
Y
 
L
K
 
S
L
 
L
L
 
V
S
 
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
D
 
Q
K
 
E
-
 
R
-
 
G
M
 
L
T
 
T
I
 
V
I
 
I
L
 
A
I
 
V
S
 
L
H
 
H
D
 
D
V
 
I
G
 
N
A
 
M
V
 
A
S
 
A
A
 
R
H
 
Y
V
 
C
D
 
D
K
 
Y
I
 
L
A
 
V
C
 
A
L
 
L
-
 
R
N
 
G
R
 
G
E
 
E
L
 
M
F
 
I
Y
 
A
H
 
Q
G
 
G
P
 
T
V
 
P
E
 
A
G
 
E
S
 
I
A
 
M
K
 
R
G
 
G
-
 
E
-
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
M
V
 
I
Y
 
Y
K
 
G
C
 
I
P
 
P
L
 
M
E
 
G
L
 
I
I
 
L
S
 
P
H
 
H

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
27% identity, 82% coverage: 5:209/250 of query aligns to 4:210/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
V
 
I
V
 
I
E
 
V
I
 
V
S
 
E
N
 
N
V
 
L
S
 
V
K
 
K
K
 
K
F
|
F
G
 
G
K
 
D
L
x
F
S
 
E
V
 
A
L
 
V
H
 
K
D
 
G
I
 
V
N
 
S
L
 
F
S
 
S
V
 
V
N
 
K
E
 
K
K
 
G
D
 
E
L
 
I
M
 
F
A
 
A
I
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
G
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
I
 
I
K
 
H
I
 
M
I
 
L
M
 
T
G
 
T
I
 
L
L
 
L
T
 
K
P
 
P
D
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
A
K
 
W
I
 
V
F
 
A
G
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
V
-
 
L
R
 
K
E
 
E
P
 
P
K
 
R
K
 
E
S
 
V
R
 
R
K
 
R
L
 
K
M
 
I
G
 
G
Y
 
I
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
H
 
D
V
 
Q
A
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
R
D
 
E
F
 
L
P
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
A
L
 
Y
S
 
E
G
 
N
R
 
M
Y
 
Y
-
 
I
H
 
H
G
 
G
L
 
K
F
 
I
K
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
T
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
G
A
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
L
L
 
K
K
 
K
D
 
R
V
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
F
-
 
V
D
 
E
I
 
L
Y
 
L
K
 
E
L
 
F
R
 
K
D
 
D
R
 
K
Q
 
P
I
 
V
S
 
K
E
x
T
I
x
F
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
M
 
A
Q
 
R
R
 
R
V
 
L
F
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
L
V
 
I
R
 
H
E
 
E
P
 
P
K
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
F
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
I
S
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
H
M
 
T
Q
 
R
N
 
A
S
 
H
F
 
M
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
L
 
I
S
 
S
R
 
K
L
 
M
N
 
K
D
 
K
K
 
E
-
 
H
-
 
N
M
 
M
T
 
T
I
 
I
I
 
F
L
 
L
I
 
T
S
 
T
H
 
H
D
 
Y
V
 
M
G
 
D
A
 
E
V
 
A
S
 
E
A
 
Q
H
 
L
V
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
A
C
 
I
L
 
I
N
 
D

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 76% coverage: 5:195/250 of query aligns to 5:206/233 of P75957

query
sites
P75957
V
 
L
V
 
L
E
 
Q
I
 
C
S
 
D
N
 
N
V
 
L
S
 
C
K
 
K
K
 
R
F
 
Y
G
 
Q
K
 
E
L
 
G
S
 
S
V
 
V
-
 
Q
-
 
T
-
 
D
-
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
N
I
 
V
N
 
S
L
 
F
S
 
S
V
 
V
N
 
G
E
 
E
K
 
G
D
 
E
L
 
M
M
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
V
G
|
G
P
 
S
N
 
S
G
 
G
G
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
D
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
K
 
-
I
 
I
F
 
F
G
 
N
R
 
G
E
 
Q
P
 
P
K
 
M
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
L
K
 
R
S
 
N
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
-
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
P
 
Y
Q
 
Q
H
 
F
V
 
H
A
 
H
F
 
L
D
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
F
P
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
A
L
 
L
S
 
E
G
 
N
R
 
V
Y
 
A
H
 
M
G
 
P
L
 
L
F
 
L
K
 
I
G
 
G
Y
 
K
T
 
K
K
 
K
S
 
P
D
 
A
E
 
E
-
 
I
-
 
N
E
 
S
A
 
R
A
 
A
E
 
L
K
 
E
A
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
A
V
 
V
D
 
G
I
 
L
Y
 
D
K
 
H
L
 
R
R
 
A
D
 
N
R
 
H
Q
 
R
I
 
P
S
 
S
E
 
E
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
M
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
V
R
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
V
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
G
S
 
N
I
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
M
 
N
Q
 
A
N
 
D
S
 
S
F
 
I
Y
 
F
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
G
R
 
E
L
 
L
N
 
N
-
 
R
-
 
L
D
 
Q
K
 
G
M
 
T
T
 
A
I
 
F
I
 
L
L
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
L

7arlD Lolcde in complex with lipoprotein and adp (see paper)
33% identity, 76% coverage: 5:195/250 of query aligns to 2:203/222 of 7arlD

query
sites
7arlD
V
 
L
V
 
L
E
 
Q
I
 
C
S
 
D
N
 
N
V
 
L
S
 
C
K
 
K
K
 
R
F
 
Y
G
 
Q
K
 
E
L
 
G
S
 
S
V
 
V
-
 
Q
-
 
T
-
 
D
-
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
N
I
 
V
N
 
S
L
 
F
S
 
S
V
 
V
N
 
G
E
 
E
K
 
G
D
 
E
L
 
M
M
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
S
N
 
S
G
|
G
G
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
D
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
K
 
-
I
 
I
F
 
F
G
 
N
R
 
G
E
 
Q
P
 
P
K
 
M
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
L
K
 
R
S
 
N
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
-
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
P
 
Y
Q
 
Q
H
 
F
V
 
H
A
 
H
F
 
L
D
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
F
P
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
A
L
 
L
S
 
E
G
 
N
R
 
V
Y
 
A
H
 
M
G
 
P
L
 
L
F
 
L
K
 
I
G
 
G
Y
 
K
T
 
K
K
 
K
S
 
P
D
 
A
E
 
E
-
 
I
-
 
N
E
 
S
A
 
R
A
 
A
E
 
L
K
 
E
A
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
A
V
 
V
D
 
G
I
 
L
Y
 
D
K
 
H
L
 
R
R
 
A
D
 
N
R
 
H
Q
 
R
I
 
P
S
 
S
E
 
E
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
M
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
V
R
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
V
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
G
S
 
N
I
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
M
 
N
Q
 
A
N
 
D
S
 
S
F
 
I
Y
 
F
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
G
R
 
E
L
 
L
N
 
N
-
 
R
-
 
L
D
 
Q
K
 
G
M
 
T
T
 
A
I
 
F
I
 
L
L
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
L

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
33% identity, 76% coverage: 5:195/250 of query aligns to 2:203/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
V
 
L
V
 
L
E
 
Q
I
 
C
S
 
D
N
 
N
V
 
L
S
 
C
K
 
K
K
 
R
F
x
Y
G
 
Q
K
 
E
L
 
G
S
 
S
V
 
V
-
 
Q
-
 
T
-
 
D
-
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
N
I
 
V
N
 
S
L
 
F
S
 
S
V
 
V
N
 
G
E
 
E
K
 
G
D
 
E
L
 
M
M
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
S
N
 
S
G
|
G
G
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
D
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
K
 
-
I
 
I
F
 
F
G
 
N
R
 
G
E
 
Q
P
 
P
K
 
M
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
L
K
 
R
S
 
N
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
-
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
P
 
Y
Q
|
Q
H
 
F
V
 
H
A
 
H
F
 
L
D
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
F
P
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
T
V
 
A
L
 
L
S
 
E
G
 
N
R
 
V
Y
 
A
H
 
M
G
 
P
L
 
L
F
 
L
K
 
I
G
 
G
Y
 
K
T
 
K
K
 
K
S
 
P
D
 
A
E
 
E
-
 
I
-
 
N
E
 
S
A
 
R
A
 
A
E
 
L
K
 
E
A
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
A
V
 
V
D
 
G
I
 
L
Y
 
D
K
 
H
L
 
R
R
 
A
D
 
N
R
x
H
Q
 
R
I
 
P
S
 
S
E
|
E
I
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
E
M
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
F
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
I
 
L
V
 
V
R
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
V
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
T
A
 
G
S
x
N
I
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
M
 
N
Q
 
A
N
 
D
S
 
S
F
 
I
Y
 
F
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
G
R
 
E
L
 
L
N
 
N
-
 
R
-
 
L
D
 
Q
K
 
G
M
 
T
T
 
A
I
 
F
I
 
L
L
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
D
V
 
L

Query Sequence

>WP_048081113.1 NCBI__GCF_000746075.1:WP_048081113.1
MASKVVEISNVSKKFGKLSVLHDINLSVNEKDLMAIIGPNGGGKSTLIKIIMGILTPDTG
EVKIFGREPKKSRKLMGYLPQHVAFDPDFPINVFDTVLSGRYHGLFKGYTKSDEEAAEKA
LKDVDIYKLRDRQISEISGGQMQRVFIARSIVREPKLLIMDEPMASIDPEMQNSFYKLLS
RLNDKMTIILISHDVGAVSAHVDKIACLNRELFYHGPVEGSAKGLEEVYKCPLELISHGI
PHRVLGKHEK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features