SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_048081634.1 NCBI__GCF_000746075.1:WP_048081634.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
52% identity, 96% coverage: 6:224/229 of query aligns to 1:227/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
I
 
M
I
 
I
E
 
K
I
 
L
K
 
K
G
 
N
L
 
V
K
 
T
K
 
K
S
 
T
Y
|
Y
D
 
K
K
 
M
G
 
G
K
 
E
-
 
E
-
 
I
I
 
I
K
 
Y
A
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
N
I
 
V
D
 
N
L
 
L
E
 
N
I
 
I
R
 
K
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
S
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
N
 
N
M
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
K
A
 
P
G
 
T
E
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
V
E
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
N
I
 
I
D
 
K
L
 
T
T
 
N
K
 
D
T
 
L
K
 
D
D
 
D
-
 
D
-
 
E
L
 
L
S
 
T
K
 
K
F
 
I
R
 
R
S
 
R
Q
 
D
E
 
K
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
L
 
Q
H
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
I
P
 
P
N
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Q
 
E
I
 
L
P
 
P
M
 
L
I
 
I
G
 
F
T
 
K
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
S
 
A
I
 
M
S
 
S
G
 
G
K
 
E
D
 
E
M
 
R
E
 
R
K
 
K
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
C
L
 
L
K
 
K
S
 
M
V
 
A
D
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
E
R
 
R
I
 
F
-
 
A
D
 
N
Q
 
H
R
 
K
P
 
P
T
 
N
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
N
N
 
N
P
 
P
S
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
K
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
E
I
 
K
I
 
I
L
 
M
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
L
H
 
N
K
 
E
K
 
E
E
 
D
N
 
G
V
 
K
T
 
T
L
 
V
V
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
P
 
I
Y
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
R
M
 
F
A
 
G
D
 
E
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
Y
V
 
L
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
V
L
 
E
E
 
R
E
 
E
K
 
E

1l2tA Dimeric structure of mj0796, a bacterial abc transporter cassette (see paper)
52% identity, 96% coverage: 6:224/229 of query aligns to 1:227/230 of 1l2tA

query
sites
1l2tA
I
 
M
I
 
I
E
 
K
I
 
L
K
 
K
G
 
N
L
 
V
K
 
T
K
 
K
S
 
T
Y
|
Y
D
 
K
K
 
M
G
 
G
K
 
E
-
 
E
-
 
I
I
 
I
K
 
Y
A
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
N
I
 
V
D
 
N
L
 
L
E
 
N
I
 
I
R
 
K
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
S
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
N
 
N
M
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
K
A
 
P
G
 
T
E
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
V
E
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
N
I
 
I
D
 
K
L
 
T
T
 
N
K
 
D
T
 
L
K
 
D
D
 
D
-
 
D
-
 
E
L
 
L
S
 
T
K
 
K
F
 
I
R
 
R
S
 
R
Q
 
D
E
 
K
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
L
 
Q
H
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
I
P
 
P
N
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Q
 
E
I
 
L
P
 
P
M
 
L
I
 
I
G
 
F
T
 
K
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
S
 
A
I
 
M
S
 
S
G
 
G
K
 
E
D
 
E
M
 
R
E
 
R
K
 
K
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
C
L
 
L
K
 
K
S
 
M
V
 
A
D
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
E
R
 
R
I
x
F
-
 
A
D
 
N
Q
 
H
R
 
K
P
 
P
T
 
N
K
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
N
N
 
N
P
 
P
S
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
K
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
E
I
 
K
I
 
I
L
 
M
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
L
H
 
N
K
 
E
K
 
E
E
 
D
N
 
G
V
 
K
T
 
T
L
 
V
V
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
D
P
 
I
Y
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
R
M
 
F
A
 
G
D
 
E
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
Y
V
 
L
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
V
L
 
E
E
 
R
E
 
E
K
 
E

5xu1B Structure of a non-canonical abc transporter from streptococcus pneumoniae r6 (see paper)
52% identity, 95% coverage: 4:220/229 of query aligns to 1:220/226 of 5xu1B

query
sites
5xu1B
E
 
K
N
 
Q
I
 
L
I
 
I
E
 
S
I
 
L
K
 
K
G
 
N
L
 
I
K
 
F
K
 
R
S
 
S
Y
 
Y
D
 
R
K
 
N
G
 
G
-
 
D
-
 
Q
K
 
E
I
 
L
K
 
Q
A
 
V
L
 
L
N
 
K
G
 
N
I
 
I
D
 
N
L
 
L
E
 
E
I
 
V
R
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
S
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
M
N
 
N
M
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
M
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
P
G
 
T
E
 
S
G
 
G
S
 
E
V
 
Y
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
 
G
L
 
-
T
 
-
K
 
-
T
 
E
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
S
 
A
K
 
K
F
 
V
R
 
R
S
 
N
Q
 
Q
E
 
Q
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
L
 
Q
H
 
F
N
 
F
L
 
L
I
 
L
P
 
S
N
 
K
L
 
L
T
 
N
V
 
A
L
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
Q
 
E
I
 
L
P
 
P
M
 
L
I
 
I
G
 
Y
T
 
A
S
 
G
I
 
V
S
 
S
G
 
S
K
 
S
D
 
K
M
 
R
E
 
R
K
 
K
R
 
L
A
 
A
L
 
E
K
 
E
L
 
Y
L
 
L
K
 
D
S
 
K
V
 
V
D
 
E
L
 
L
E
 
T
D
 
E
R
 
R
I
 
S
D
 
H
Q
 
H
R
 
L
P
 
P
T
 
S
K
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
P
 
P
S
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
T
K
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
N
I
 
Q
I
 
I
L
 
M
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
V
D
 
D
L
 
L
H
 
N
K
 
-
K
 
K
E
 
E
N
 
G
V
 
K
T
 
T
L
 
I
V
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
Y
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
A
M
 
Y
A
 
A
D
 
K
R
 
R
I
 
Q
I
 
I
T
 
V
V
 
I
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
V
I
 
I

5lj7A Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atp (p21) (see paper)
47% identity, 96% coverage: 5:223/229 of query aligns to 2:223/592 of 5lj7A

query
sites
5lj7A
N
 
N
I
 
I
I
 
I
E
 
E
I
 
I
K
 
K
G
 
Q
L
 
L
K
 
N
K
 
R
S
 
Y
Y
 
F
D
 
G
K
 
E
G
 
G
-
 
E
-
 
N
K
 
R
I
 
V
K
 
H
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
S
L
 
L
E
 
S
I
 
I
R
 
E
K
 
R
G
 
G
E
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
N
 
N
M
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
G
 
T
E
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
S
E
 
K
V
 
I
A
 
D
G
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
T
I
 
I
D
 
E
L
 
L
T
 
T
K
 
N
T
 
D
K
 
Q
D
 
-
L
 
L
S
 
S
K
 
D
F
 
L
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
E
 
K
I
 
F
G
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
L
 
R
H
 
Y
N
 
N
L
 
L
I
 
L
P
 
S
N
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Q
 
A
I
 
L
P
 
P
M
 
A
I
 
I
G
 
Y
T
 
A
S
 
G
I
 
M
S
 
P
G
 
Q
K
 
S
D
 
Q
M
 
R
E
 
L
K
 
E
R
 
R
A
 
A
L
 
K
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
E
S
 
K
V
 
L
D
 
G
L
 
L
E
 
G
D
 
D
R
x
K
I
 
W
D
 
Q
Q
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
N
K
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
M
N
 
N
N
 
G
P
 
G
S
 
E
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
K
 
H
T
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
N
I
 
V
L
 
M
D
 
E
L
 
I
L
 
L
K
 
R
D
 
Q
L
 
L
H
 
H
K
 
-
K
 
E
E
 
E
N
 
G
V
 
H
T
 
T
L
 
I
V
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
P
 
K
Y
 
H
V
 
I
A
 
A
N
 
A
M
 
S
A
 
A
D
 
N
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
E
V
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
S
E
 
D

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
47% identity, 96% coverage: 5:223/229 of query aligns to 2:223/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
N
 
N
I
 
I
I
 
I
E
 
E
I
 
I
K
 
K
G
 
Q
L
 
L
K
 
N
K
 
R
S
 
Y
Y
x
F
D
 
G
K
 
E
G
 
G
-
 
E
-
 
N
K
 
R
I
 
V
K
 
H
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
S
L
 
L
E
 
S
I
 
I
R
 
E
K
 
R
G
 
G
E
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
N
 
N
M
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
G
 
T
E
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
S
E
 
K
V
 
I
A
 
D
G
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
T
I
 
I
D
 
E
L
 
L
T
 
T
K
 
N
T
 
D
K
 
Q
D
 
-
L
 
L
S
 
S
K
 
D
F
 
L
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
E
 
K
I
 
F
G
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
L
 
R
H
 
Y
N
 
N
L
 
L
I
 
L
P
 
S
N
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Q
 
A
I
 
L
P
 
P
M
 
A
I
 
I
G
 
Y
T
 
A
S
 
G
I
 
M
S
 
P
G
 
Q
K
 
S
D
 
Q
M
 
R
E
 
L
K
 
E
R
 
R
A
 
A
L
 
K
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
E
S
 
K
V
 
L
D
 
G
L
 
L
E
 
G
D
 
D
R
x
K
I
 
W
D
 
Q
Q
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
N
K
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
M
N
 
N
N
 
G
P
 
G
S
 
E
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
K
 
H
T
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
N
I
 
V
L
 
M
D
 
E
L
 
I
L
 
L
K
 
R
D
 
Q
L
 
L
H
 
H
K
 
-
K
 
E
E
 
E
N
 
G
V
 
H
T
 
T
L
 
I
V
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
P
 
K
Y
 
H
V
 
I
A
 
A
N
 
A
M
 
S
A
 
A
D
 
N
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
E
V
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
S
E
 
D

P75831 Macrolide export ATP-binding/permease protein MacB; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
44% identity, 94% coverage: 6:221/229 of query aligns to 4:222/648 of P75831

query
sites
P75831
I
 
L
I
 
L
E
 
E
I
 
L
K
 
K
G
 
D
L
 
I
K
 
R
K
 
R
S
 
S
Y
 
Y
D
 
P
K
 
A
G
 
G
-
 
D
-
 
E
K
 
Q
I
 
V
K
 
E
A
 
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
S
L
 
L
E
 
D
I
 
I
R
 
Y
K
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
V
S
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
M
N
 
N
M
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
K
A
 
A
G
 
T
E
 
S
G
 
G
S
 
T
V
 
Y
E
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
L
 
V
T
 
A
K
 
T
-
 
L
-
 
D
T
 
A
K
 
D
D
 
A
L
 
L
S
 
A
K
 
Q
F
 
L
R
 
R
S
 
R
Q
 
E
E
 
H
I
 
F
G
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
L
 
R
H
 
Y
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
S
N
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
E
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
Q
 
E
I
 
V
P
 
P
M
 
A
I
 
V
G
 
Y
T
 
A
S
 
G
I
 
L
S
 
E
G
 
R
K
 
K
D
 
Q
M
 
R
E
 
L
K
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
Q
K
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
Q
S
 
R
V
 
L
D
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
T
D
 
E
Q
 
Y
R
 
Y
P
 
P
T
 
A
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
M
N
 
N
N
 
G
P
 
G
S
 
Q
I
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
K
 
H
T
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
E
I
 
V
L
 
M
D
 
A
L
 
I
L
 
L
K
 
H
D
 
Q
L
 
L
H
 
R
K
 
D
K
 
R
E
 
G
N
 
H
V
 
-
T
 
T
L
 
V
V
 
I
M
 
I
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
P
 
P
Y
 
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
A
M
 
Q
A
 
A
D
 
E
R
 
R
I
 
V
I
 
I
T
 
E
V
 
I
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
I
L
 
V

8g4cB Bceabs atpgs high res tm (see paper)
43% identity, 95% coverage: 6:223/229 of query aligns to 3:224/248 of 8g4cB

query
sites
8g4cB
I
 
I
I
 
L
E
 
E
I
 
A
K
 
N
G
 
K
L
 
I
K
 
R
K
 
K
S
 
S
Y
|
Y
D
 
G
K
 
N
-
 
K
-
 
L
G
 
N
K
 
K
I
 
Q
K
 
E
A
 
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
D
L
 
I
E
 
H
I
 
I
R
 
E
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
S
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
 
G
S
|
S
G
 
G
K
 
K
S
x
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
N
M
 
V
I
 
L
G
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
D
T
 
Q
A
 
V
G
 
S
E
 
H
G
 
G
S
 
T
V
 
I
E
 
H
V
 
I
A
 
N
G
 
G
I
 
N
D
 
D
L
 
M
T
 
T
-
 
A
-
 
M
K
 
K
T
 
E
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
S
 
A
K
 
E
F
 
F
R
 
R
S
 
K
Q
 
Q
E
 
H
I
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
L
 
D
H
 
Y
N
 
N
L
 
L
I
 
L
P
 
D
N
 
T
L
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
K
E
 
E
N
 
N
V
 
I
Q
 
L
I
 
L
P
 
P
M
 
L
I
 
S
G
 
I
T
 
T
S
 
K
I
 
L
S
 
S
G
 
K
K
 
K
D
 
E
M
 
A
E
 
N
K
 
R
R
 
K
A
 
F
L
 
E
K
 
E
L
 
V
L
 
A
K
 
K
S
 
E
V
 
L
D
 
G
L
 
I
E
 
Y
D
 
E
R
 
L
I
 
R
D
 
D
Q
 
K
R
 
Y
P
 
P
T
 
N
K
 
E
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
S
I
 
A
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
F
V
 
I
N
 
H
N
 
D
P
 
P
S
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
K
 
K
T
 
S
G
 
A
D
 
S
I
 
D
I
 
L
L
 
L
D
 
N
L
 
K
L
 
L
K
 
S
D
 
Q
L
 
L
H
 
N
K
 
Q
K
 
K
E
 
R
N
 
N
V
 
A
T
 
T
L
 
I
V
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
P
 
P
Y
 
V
V
 
A
A
 
A
N
 
S
M
 
Y
A
 
C
D
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
I
T
 
F
V
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
I
 
M
L
 
Y
E
 
T
E
 
Q

7tchB Bceab e169q variant atp-bound conformation (see paper)
42% identity, 95% coverage: 6:223/229 of query aligns to 2:223/245 of 7tchB

query
sites
7tchB
I
 
I
I
 
L
E
 
E
I
 
A
K
 
N
G
 
K
L
 
I
K
 
R
K
 
K
S
 
S
Y
|
Y
D
 
G
K
 
N
-
 
K
-
 
L
G
 
N
K
 
K
I
x
Q
K
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
D
L
 
I
E
 
H
I
 
I
R
 
E
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
S
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
N
M
 
V
I
 
L
G
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
D
T
 
Q
A
 
V
G
 
S
E
 
H
G
 
G
S
 
T
V
 
I
E
 
H
V
 
I
A
 
N
G
 
G
I
 
N
D
 
D
L
 
M
T
 
T
-
 
A
-
 
M
K
 
K
T
 
E
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
S
 
A
K
 
E
F
 
F
R
 
R
S
 
K
Q
 
Q
E
 
H
I
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
L
 
D
H
 
Y
N
 
N
L
 
L
I
 
L
P
 
D
N
 
T
L
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
K
E
 
E
N
 
N
V
 
I
Q
 
L
I
 
L
P
 
P
M
 
L
I
 
S
G
 
I
T
 
T
S
 
K
I
 
L
S
 
S
G
 
K
K
 
K
D
 
E
M
 
A
E
 
N
K
 
R
R
 
K
A
 
F
L
 
E
K
 
E
L
 
V
L
 
A
K
 
K
S
 
E
V
 
L
D
 
G
L
 
I
E
 
Y
D
 
E
R
 
L
I
 
R
D
 
D
Q
 
K
R
 
Y
P
 
P
T
 
N
K
x
E
L
 
I
S
 
S
G
|
G
G
|
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
S
I
 
A
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
F
V
 
I
N
 
H
N
 
D
P
 
P
S
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
K
 
K
T
 
S
G
 
A
D
 
S
I
 
D
I
 
L
L
 
L
D
 
N
L
 
K
L
 
L
K
 
S
D
 
Q
L
 
L
H
 
N
K
 
Q
K
 
K
E
 
R
N
 
N
V
 
A
T
 
T
L
 
I
V
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
P
 
P
Y
 
V
V
 
A
A
 
A
N
 
S
M
 
Y
A
 
C
D
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
I
T
 
F
V
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
I
 
M
L
 
Y
E
 
T
E
 
Q

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
42% identity, 97% coverage: 3:223/229 of query aligns to 2:226/233 of P75957

query
sites
P75957
N
 
N
E
 
K
N
 
I
I
 
L
I
 
L
E
 
Q
I
 
C
K
 
D
G
 
N
L
 
L
K
 
C
K
 
K
S
 
R
Y
 
Y
D
 
Q
K
 
E
G
 
G
K
 
S
I
 
V
K
 
Q
A
 
T
-
 
D
-
 
V
L
 
L
N
 
H
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
F
E
 
S
I
 
V
R
 
G
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
M
S
 
A
I
 
I
I
 
V
G
|
G
P
 
S
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
H
M
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
P
G
 
T
E
 
S
G
 
G
S
 
D
V
 
V
E
 
I
V
 
F
A
 
N
G
 
G
I
 
Q
D
 
P
L
 
M
T
 
S
K
 
K
T
 
L
K
 
S
D
 
S
L
 
A
S
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
E
F
 
L
R
 
R
S
 
N
Q
 
Q
E
 
K
I
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
L
 
F
H
 
H
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
P
N
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Q
 
A
I
 
M
P
 
P
M
 
L
I
 
L
G
 
I
T
 
G
S
 
K
I
 
K
S
 
K
G
 
P
K
 
A
D
 
E
M
 
I
E
 
N
K
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
K
S
 
A
V
 
V
D
 
G
L
 
L
E
 
D
D
 
H
R
 
R
I
 
A
D
 
N
Q
 
H
R
 
R
P
 
P
T
 
S
K
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
P
 
P
S
 
R
I
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
S
 
A
K
 
R
T
 
N
G
 
A
D
 
D
I
 
S
I
 
I
L
 
F
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
G
D
 
E
L
 
L
H
 
N
K
 
R
K
 
L
E
 
Q
N
 
G
V
 
T
T
 
A
L
 
F
V
 
L
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
P
 
L
Y
 
Q
V
 
L
A
 
A
N
 
K
M
 
R
A
 
M
D
 
S
R
 
R
I
 
Q
I
 
L
T
 
E
V
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
L
L
 
T
E
 
A
E
 
E

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
42% identity, 95% coverage: 6:223/229 of query aligns to 2:223/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
I
 
L
I
 
L
E
 
Q
I
 
C
K
 
D
G
 
N
L
 
L
K
 
C
K
 
K
S
 
R
Y
|
Y
D
 
Q
K
 
E
G
 
G
K
 
S
I
 
V
K
 
Q
A
 
T
-
 
D
-
 
V
L
 
L
N
 
H
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
F
E
 
S
I
 
V
R
 
G
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
M
S
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
S
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
H
M
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
P
G
 
T
E
 
S
G
 
G
S
 
D
V
 
V
E
 
I
V
 
F
A
 
N
G
 
G
I
 
Q
D
 
P
L
 
M
T
 
S
K
 
K
T
 
L
K
 
S
D
 
S
L
 
A
S
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
E
F
 
L
R
 
R
S
 
N
Q
 
Q
E
 
K
I
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
L
 
F
H
 
H
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
P
N
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Q
 
A
I
 
M
P
 
P
M
 
L
I
 
L
G
 
I
T
 
G
S
 
K
I
 
K
S
 
K
G
 
P
K
 
A
D
 
E
M
 
I
E
 
N
K
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
K
S
 
A
V
 
V
D
 
G
L
 
L
E
 
D
D
 
H
R
 
R
I
 
A
D
 
N
Q
x
H
R
 
R
P
 
P
T
 
S
K
x
E
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
P
 
P
S
 
R
I
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
x
N
L
 
L
D
 
D
S
 
A
K
 
R
T
 
N
G
 
A
D
 
D
I
 
S
I
 
I
L
 
F
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
G
D
 
E
L
 
L
H
 
N
K
 
R
K
 
L
E
 
Q
N
 
G
V
 
T
T
 
A
L
 
F
V
 
L
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
D
P
 
L
Y
 
Q
V
 
L
A
 
A
N
 
K
M
 
R
A
 
M
D
 
S
R
 
R
I
 
Q
I
 
L
T
 
E
V
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
L
L
 
T
E
 
A
E
 
E

7v8iD Lolcd(e171q)e with bound amppnp in nanodiscs (see paper)
41% identity, 97% coverage: 3:223/229 of query aligns to 1:225/229 of 7v8iD

query
sites
7v8iD
N
 
N
E
 
K
N
 
I
I
 
L
I
 
L
E
 
Q
I
 
C
K
 
D
G
 
N
L
 
L
K
 
C
K
 
K
S
 
R
Y
 
Y
D
 
Q
K
 
E
G
 
G
K
 
S
I
 
V
K
 
Q
A
 
T
-
 
D
-
x
V
L
 
L
N
 
H
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
F
E
 
S
I
 
V
R
 
G
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
M
S
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
H
M
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
P
G
 
T
E
 
S
G
 
G
S
 
D
V
 
V
E
 
I
V
 
F
A
 
N
G
 
G
I
 
Q
D
 
P
L
 
M
T
 
S
K
 
K
T
 
L
K
 
S
D
 
S
L
 
A
S
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
E
F
 
L
R
 
R
S
 
N
Q
 
Q
E
 
K
I
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
L
 
F
H
 
H
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
P
N
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Q
 
A
I
 
M
P
 
P
M
 
L
I
 
L
G
 
I
T
 
G
S
 
K
I
 
K
S
 
K
G
 
P
K
 
A
D
 
E
M
 
I
E
 
N
K
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
K
S
 
A
V
 
V
D
 
G
L
 
L
E
 
D
D
 
H
R
|
R
I
 
A
D
 
N
Q
x
H
R
 
R
P
 
P
T
 
S
K
x
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
P
 
P
S
 
R
I
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
S
 
A
K
 
R
T
 
N
G
 
A
D
 
D
I
 
S
I
 
I
L
 
F
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
G
D
 
E
L
 
L
H
 
N
K
 
R
K
 
L
E
 
Q
N
 
G
V
 
T
T
 
A
L
 
F
V
 
L
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
D
P
 
L
Y
 
Q
V
 
L
A
 
A
N
 
K
M
 
R
A
 
M
D
 
S
R
 
R
I
 
Q
I
 
L
T
 
E
V
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
L
L
 
T
E
 
A
E
 
E

7arlD Lolcde in complex with lipoprotein and adp (see paper)
42% identity, 94% coverage: 6:220/229 of query aligns to 2:220/222 of 7arlD

query
sites
7arlD
I
 
L
I
 
L
E
 
Q
I
 
C
K
 
D
G
 
N
L
 
L
K
 
C
K
 
K
S
 
R
Y
 
Y
D
 
Q
K
 
E
G
 
G
K
 
S
I
 
V
K
 
Q
A
 
T
-
 
D
-
 
V
L
 
L
N
 
H
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
F
E
 
S
I
 
V
R
 
G
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
M
S
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
S
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
H
M
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
P
G
 
T
E
 
S
G
 
G
S
 
D
V
 
V
E
 
I
V
 
F
A
 
N
G
 
G
I
 
Q
D
 
P
L
 
M
T
 
S
K
 
K
T
 
L
K
 
S
D
 
S
L
 
A
S
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
E
F
 
L
R
 
R
S
 
N
Q
 
Q
E
 
K
I
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
L
 
F
H
 
H
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
P
N
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Q
 
A
I
 
M
P
 
P
M
 
L
I
 
L
G
 
I
T
 
G
S
 
K
I
 
K
S
 
K
G
 
P
K
 
A
D
 
E
M
 
I
E
 
N
K
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
K
S
 
A
V
 
V
D
 
G
L
 
L
E
 
D
D
 
H
R
 
R
I
 
A
D
 
N
Q
 
H
R
 
R
P
 
P
T
 
S
K
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
P
 
P
S
 
R
I
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
S
 
A
K
 
R
T
 
N
G
 
A
D
 
D
I
 
S
I
 
I
L
 
F
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
G
D
 
E
L
 
L
H
 
N
K
 
R
K
 
L
E
 
Q
N
 
G
V
 
T
T
 
A
L
 
F
V
 
L
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
P
 
L
Y
 
Q
V
 
L
A
 
A
N
 
K
M
 
R
A
 
M
D
 
S
R
 
R
I
 
Q
I
 
L
T
 
E
V
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
L

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
48% identity, 88% coverage: 24:225/229 of query aligns to 19:221/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
S
L
 
L
E
 
S
I
 
V
R
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
S
 
S
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
Y
M
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
A
A
 
P
G
 
T
E
 
E
G
 
G
S
 
K
V
 
V
E
 
F
V
 
L
A
 
E
G
 
G
-
 
K
-
 
E
I
 
V
D
 
D
L
 
Y
T
 
T
K
 
N
T
 
E
K
 
K
D
 
E
L
 
L
S
 
S
K
 
L
F
 
L
R
 
R
S
 
N
Q
 
R
E
 
K
I
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
L
 
F
H
 
H
N
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Q
 
I
I
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
L
G
 
K
T
 
M
S
 
G
I
 
K
S
 
P
G
 
K
K
 
K
D
 
E
M
 
A
E
 
K
K
 
E
R
 
R
A
 
G
L
 
E
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
K
 
S
S
 
E
V
 
L
D
 
G
L
 
L
E
 
G
D
 
D
R
 
K
I
 
L
D
 
S
Q
 
R
R
 
K
P
 
P
T
 
Y
K
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
N
N
 
E
P
 
P
S
 
I
I
 
L
I
 
L
L
 
F
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
G
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
S
 
S
K
 
A
T
 
N
G
 
T
D
 
K
I
 
R
I
 
V
L
 
M
D
 
D
L
 
I
L
 
F
K
 
L
D
 
K
L
 
I
H
 
N
K
 
E
K
 
G
E
 
-
N
 
G
V
 
T
T
 
S
L
 
I
V
 
V
M
 
M
V
 
V
T
|
T
H
 
H
E
 
E
P
 
R
Y
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
E
M
 
L
A
 
T
D
 
H
R
 
R
I
 
T
I
 
L
T
 
E
V
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
V
E
 
G
E
 
E
K
 
I
T
 
T

5ws4A Crystal structure of tripartite-type abc transporter macb from acinetobacter baumannii (see paper)
41% identity, 97% coverage: 4:226/229 of query aligns to 2:227/650 of 5ws4A

query
sites
5ws4A
E
 
Q
N
 
A
I
 
L
I
 
L
E
 
E
I
 
V
K
 
S
G
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
R
S
 
E
Y
 
F
D
 
P
K
 
A
G
 
G
K
 
E
-
 
S
-
 
T
I
 
I
K
 
Q
A
 
I
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
D
L
 
L
E
 
T
I
 
I
R
 
Y
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
V
S
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
M
N
 
N
M
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
R
A
 
P
G
 
T
E
 
S
G
 
G
S
 
S
V
 
Y
E
 
K
V
 
V
A
 
N
G
 
G
I
 
Q
D
 
E
L
 
T
T
 
G
K
 
K
T
 
L
K
 
E
-
 
P
-
 
D
D
 
Q
L
 
L
S
 
A
K
 
Q
F
 
L
R
 
R
S
 
R
Q
 
E
E
 
Y
I
 
F
G
 
G
F
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
L
 
R
H
 
Y
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
G
N
 
D
L
 
L
T
 
S
V
 
A
L
 
E
E
 
G
N
 
N
V
 
V
Q
 
E
I
 
V
P
 
P
M
 
A
I
 
V
G
 
Y
T
 
A
S
 
G
I
 
V
S
 
T
G
 
P
K
 
A
D
 
D
M
 
R
E
 
K
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
T
K
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
T
S
 
E
V
 
L
D
 
G
L
 
L
E
 
G
D
 
T
R
 
K
I
 
T
D
 
Q
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
T
 
S
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
M
N
 
N
N
 
G
P
 
G
S
 
D
I
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
K
 
H
T
 
S
G
 
G
D
 
V
I
 
E
I
 
V
L
 
M
D
 
R
L
 
I
L
 
L
K
 
R
D
 
E
L
 
L
H
 
N
K
 
A
K
 
A
E
 
G
N
 
H
V
 
-
T
 
T
L
 
I
V
 
I
M
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
P
 
M
Y
 
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
K
M
 
N
A
 
A
D
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
E
V
 
I
R
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
S
E
 
D
K
 
R
T
 
P
N
 
N

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
45% identity, 95% coverage: 6:223/229 of query aligns to 2:217/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
I
 
I
E
 
R
I
 
I
K
 
R
G
 
N
L
 
L
K
 
H
K
 
K
S
 
W
Y
x
F
D
 
-
K
 
-
G
 
G
K
 
P
I
 
L
K
 
H
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
H
L
 
L
E
 
E
I
 
V
R
 
A
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
K
V
 
L
S
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
R
M
 
T
I
 
I
G
 
N
A
 
R
L
 
L
D
 
E
T
 
D
A
 
F
G
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
V
E
 
V
V
 
V
A
 
D
G
 
G
I
 
L
D
 
S
L
 
V
T
 
K
K
 
D
T
 
D
K
 
R
D
 
A
L
 
L
S
 
R
K
 
E
F
 
I
R
 
R
S
 
-
Q
 
R
E
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
L
 
Q
H
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
F
P
 
P
N
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
-
 
A
P
 
P
M
 
M
I
 
R
G
 
V
T
 
R
S
 
R
I
 
W
S
 
P
G
 
R
K
 
E
D
 
K
M
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
E
S
 
R
V
 
V
D
 
G
L
 
I
E
 
L
D
 
D
R
 
Q
I
 
A
D
 
R
Q
 
K
R
 
Y
P
 
P
T
 
A
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
M
N
 
E
P
 
P
S
 
K
I
 
I
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
E
T
 
M
G
 
V
D
 
G
I
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
M
K
 
R
D
 
D
L
 
L
H
 
-
K
 
A
K
 
Q
E
 
G
N
 
G
V
 
M
T
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
-
 
M
P
 
G
Y
 
F
V
 
A
A
 
R
N
 
E
M
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
V
T
 
F
V
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
L
 
V
E
 
E
E
 
E

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
45% identity, 90% coverage: 19:225/229 of query aligns to 12:219/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
G
 
G
K
 
S
I
 
L
K
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
T
L
 
L
E
 
K
I
 
V
R
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
V
S
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
M
 
C
I
 
I
G
 
N
A
 
L
L
 
L
D
 
E
T
 
E
A
 
P
G
 
T
E
 
K
G
 
G
S
 
E
V
 
V
E
 
F
V
 
I
A
 
D
G
 
G
I
 
V
D
 
K
L
 
I
T
 
N
K
 
N
T
 
G
K
 
K
-
 
V
D
 
N
L
 
I
S
 
N
K
 
K
F
 
V
R
 
R
S
 
-
Q
 
Q
E
 
K
I
 
V
G
 
G
F
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
L
 
H
H
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
F
P
 
P
N
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
V
 
I
Q
 
T
I
 
L
-
 
A
P
 
P
M
 
V
I
 
K
G
 
V
T
 
K
S
 
K
I
 
M
S
 
N
G
 
K
K
 
K
D
 
E
M
 
A
E
 
E
K
 
E
R
 
L
A
 
A
L
 
V
K
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
A
S
 
K
V
 
V
D
 
G
L
 
L
E
 
L
D
 
D
R
 
K
I
 
K
D
 
D
Q
 
Q
R
 
Y
P
 
P
T
 
I
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
M
N
 
Q
P
 
P
S
 
E
I
 
V
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
E
T
 
M
G
 
V
D
 
K
I
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
N
L
 
V
L
 
M
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
H
 
-
K
 
A
K
 
N
E
 
E
N
 
G
V
 
M
T
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
E
P
 
M
-
 
G
Y
 
F
V
 
A
A
 
R
N
 
E
M
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
I
T
 
F
V
 
M
R
 
D
D
 
D
G
 
G
K
 
V
I
 
I
L
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
43% identity, 96% coverage: 5:223/229 of query aligns to 2:219/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
N
 
Q
I
 
M
I
 
I
E
 
D
I
 
V
K
 
H
G
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
Y
x
F
D
 
-
K
 
-
G
 
G
K
 
S
I
 
L
K
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
R
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
M
 
C
I
 
L
G
 
N
A
 
L
L
 
L
D
 
E
T
 
D
A
 
F
G
 
D
E
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
E
 
I
V
 
I
A
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
L
-
 
K
T
 
A
K
 
K
T
 
D
K
 
T
D
 
N
L
 
L
S
 
N
K
 
K
F
 
V
R
 
R
S
 
-
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
L
 
R
H
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
F
P
 
P
N
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
Q
 
T
I
 
L
-
 
A
P
 
P
M
 
M
I
 
K
G
 
V
T
 
R
S
 
K
I
 
W
S
 
P
G
 
R
K
 
E
D
 
K
M
 
A
E
 
E
K
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
K
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
D
S
 
K
V
 
V
D
 
G
L
 
L
E
 
K
D
 
D
R
 
K
I
 
A
D
 
H
Q
 
A
R
 
Y
P
 
P
T
 
D
K
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
M
N
 
E
P
 
P
S
 
K
I
 
I
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
E
T
 
M
G
 
V
D
 
G
I
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
H
 
-
K
 
A
K
 
N
E
 
E
N
 
G
V
 
M
T
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
-
 
M
P
 
G
Y
 
F
V
 
A
A
 
R
N
 
E
M
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
F
V
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
L
 
I
E
 
E
E
 
E

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
43% identity, 96% coverage: 5:223/229 of query aligns to 2:219/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
N
 
Q
I
 
M
I
 
I
E
 
D
I
 
V
K
 
H
G
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
Y
x
F
D
 
-
K
 
-
G
 
G
K
 
S
I
 
L
K
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
R
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
M
 
C
I
 
L
G
 
N
A
 
L
L
 
L
D
 
E
T
 
D
A
 
F
G
 
D
E
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
E
 
I
V
 
I
A
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
L
-
 
K
T
 
A
K
 
K
T
 
D
K
 
T
D
 
N
L
 
L
S
 
N
K
 
K
F
 
V
R
 
R
S
 
-
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
L
 
R
H
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
F
P
 
P
N
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
Q
 
T
I
 
L
-
 
A
P
 
P
M
 
M
I
 
K
G
 
V
T
 
R
S
 
K
I
 
W
S
 
P
G
 
R
K
 
E
D
 
K
M
 
A
E
 
E
K
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
K
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
D
S
 
K
V
 
V
D
 
G
L
 
L
E
 
K
D
 
D
R
 
K
I
 
A
D
 
H
Q
 
A
R
 
Y
P
 
P
T
 
D
K
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
M
N
 
E
P
 
P
S
 
K
I
 
I
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
E
T
 
M
G
 
V
D
 
G
I
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
H
 
-
K
 
A
K
 
N
E
 
E
N
 
G
V
 
M
T
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
-
 
M
P
 
G
Y
 
F
V
 
A
A
 
R
N
 
E
M
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
F
V
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
L
 
I
E
 
E
E
 
E

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
43% identity, 96% coverage: 5:223/229 of query aligns to 2:219/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
N
 
Q
I
 
M
I
 
I
E
 
D
I
 
V
K
 
H
G
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
Y
x
F
D
 
-
K
 
-
G
 
G
K
 
S
I
 
L
K
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
R
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
M
 
C
I
 
L
G
 
N
A
 
L
L
 
L
D
 
E
T
 
D
A
 
F
G
 
D
E
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
E
 
I
V
 
I
A
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
L
-
 
K
T
 
A
K
 
K
T
 
D
K
 
T
D
 
N
L
 
L
S
 
N
K
 
K
F
 
V
R
 
R
S
 
-
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
L
 
R
H
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
F
P
 
P
N
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
Q
 
T
I
 
L
-
 
A
P
 
P
M
 
M
I
 
K
G
 
V
T
 
R
S
 
K
I
 
W
S
 
P
G
 
R
K
 
E
D
 
K
M
 
A
E
 
E
K
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
K
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
D
S
 
K
V
 
V
D
 
G
L
 
L
E
 
K
D
 
D
R
 
K
I
 
A
D
 
H
Q
 
A
R
 
Y
P
 
P
T
 
D
K
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
M
N
 
E
P
 
P
S
 
K
I
 
I
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
E
T
 
M
G
 
V
D
 
G
I
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
H
 
-
K
 
A
K
 
N
E
 
E
N
 
G
V
 
M
T
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
-
 
M
P
 
G
Y
 
F
V
 
A
A
 
R
N
 
E
M
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
F
V
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
L
 
I
E
 
E
E
 
E

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
43% identity, 96% coverage: 5:223/229 of query aligns to 2:219/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
N
 
Q
I
 
M
I
 
I
E
 
D
I
 
V
K
 
H
G
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
Y
x
F
D
 
-
K
 
-
G
 
G
K
 
S
I
 
L
K
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
R
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
M
 
C
I
 
L
G
 
N
A
 
L
L
 
L
D
 
E
T
 
D
A
 
F
G
 
D
E
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
E
 
I
V
 
I
A
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
L
-
 
K
T
 
A
K
 
K
T
 
D
K
 
T
D
 
N
L
 
L
S
 
N
K
 
K
F
 
V
R
 
R
S
 
-
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
L
 
R
H
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
F
P
 
P
N
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
Q
 
T
I
 
L
-
 
A
P
 
P
M
 
M
I
 
K
G
 
V
T
 
R
S
 
K
I
 
W
S
 
P
G
 
R
K
 
E
D
 
K
M
 
A
E
 
E
K
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
K
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
D
S
 
K
V
 
V
D
 
G
L
 
L
E
 
K
D
 
D
R
 
K
I
 
A
D
 
H
Q
 
A
R
 
Y
P
 
P
T
 
D
K
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
M
N
 
E
P
 
P
S
 
K
I
 
I
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
E
T
 
M
G
 
V
D
 
G
I
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
H
 
-
K
 
A
K
 
N
E
 
E
N
 
G
V
 
M
T
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
-
 
M
P
 
G
Y
 
F
V
 
A
A
 
R
N
 
E
M
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
F
V
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
L
 
I
E
 
E
E
 
E