SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_048082853.1 NCBI__GCF_000745485.1:WP_048082853.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5exeA Crystal structure of oxalate oxidoreductase from moorella thermoacetica bound with carboxy-tpp adduct (see paper)
39% identity, 97% coverage: 4:376/383 of query aligns to 6:390/394 of 5exeA

query
sites
5exeA
I
 
I
T
 
S
A
 
G
N
 
C
R
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
E
 
H
A
 
G
V
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
D
P
 
V
K
 
D
V
 
V
V
 
I
P
 
C
V
 
S
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
x
R
P
 
P
Q
 
Y
T
 
T
T
 
G
I
 
I
S
 
M
E
 
S
Y
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
R
F
 
M
V
 
V
A
 
A
N
 
D
G
 
G
D
 
E
L
 
L
N
 
D
A
 
A
E
 
E
Y
 
F
I
 
V
R
 
H
V
 
G
E
 
E
S
 
G
E
|
E
H
 
H
S
 
A
A
 
Q
I
 
L
S
 
S
A
 
V
A
 
V
V
 
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
R
V
 
V
F
 
F
T
 
T
A
 
G
T
 
S
S
 
S
S
 
G
Q
x
V
G
 
G
L
 
V
A
 
T
L
 
Y
M
 
A
H
 
M
E
 
E
I
 
V
L
 
Y
F
 
S
A
 
P
A
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
R
 
R
N
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
Q
M
 
M
G
 
A
N
 
I
A
 
A
N
 
D
R
|
R
A
 
T
L
 
L
S
 
D
A
 
P
P
 
P
L
 
G
S
 
D
I
x
F
W
 
G
N
 
E
D
 
E
Q
 
H
Q
 
T
D
 
D
S
 
A
I
 
E
S
 
C
Q
 
C
R
 
R
D
 
D
T
 
Q
G
 
G
W
 
W
M
 
I
Q
 
Q
F
 
G
F
 
W
A
 
A
E
 
S
D
 
T
A
 
P
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
N
V
 
T
L
 
L
Q
 
I
A
 
Y
Y
 
Y
K
 
R
I
 
V
S
 
G
E
 
E
N
 
D
E
 
Q
K
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
S
 
Q
M
 
Y
V
 
A
C
 
C
V
 
L
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
F
L
 
V
T
 
S
H
 
H
T
 
I
V
 
L
E
 
G
P
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
D
Q
 
E
E
 
A
E
 
Q
V
 
V
D
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
P
 
-
T
 
N
H
 
H
S
 
H
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
R
D
 
K
P
 
P
M
 
Q
S
 
I
L
 
I
G
 
G
T
 
P
F
 
Q
T
 
I
D
 
E
P
 
P
N
 
A
Y
 
M
Y
 
G
M
 
P
E
 
P
A
 
L
R
 
Q
H
 
Y
D
 
Q
M
 
R
E
 
Y
V
 
Q
A
 
A
M
 
V
E
 
K
G
 
G
A
 
V
K
 
H
D
 
K
V
 
V
I
 
L
R
 
E
N
 
E
V
 
A
N
 
C
K
 
D
E
 
E
F
 
F
A
 
A
E
 
R
K
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
-
 
P
L
 
Y
V
 
L
E
 
D
N
 
E
Y
 
Y
M
 
L
C
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
I
 
F
A
 
G
M
 
Q
G
 
G
S
 
A
L
 
H
C
 
M
G
 
E
T
 
T
I
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
A
D
 
R
N
 
R
M
 
L
R
 
R
K
 
N
E
 
L
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
V
L
 
A
R
 
R
V
 
L
I
 
R
A
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
P
K
 
T
E
 
E
D
 
Q
I
 
I
Y
 
K
N
 
E
A
 
R
I
 
L
K
 
S
N
 
K
A
 
F
D
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
V
N
 
S
I
 
A
S
 
N
L
 
F
G
 
G
I
 
I
-
 
S
-
 
C
-
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
N
 
S
E
 
E
I
 
L
K
 
R
A
 
A
K
 
A
M
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
D
 
K
V
 
V
D
 
K
A
 
T
R
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
V
L
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
E
D
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
H
E
 
D
D
 
E
I
 
F
R
 
Y
N
 
R
I
 
M
I
 
F
K
 
Q
-
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
E
I
 
I
T
 
A
K
 
K
N
 
T
S
 
G
T
 
K
E
 
V
S
 
E
D
 
Q
T
 
T
I
 
S
N
 
Y
W
 
W
I
 
I

5exdD Crystal structure of oxalate oxidoreductase from moorella thermoacetica bound with carboxy-di-oxido-methyl-tpp (coom-tpp) intermediate (see paper)
39% identity, 97% coverage: 4:376/383 of query aligns to 6:390/394 of 5exdD

query
sites
5exdD
I
 
I
T
 
S
A
 
G
N
 
C
R
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
E
 
H
A
 
G
V
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
D
P
 
V
K
 
D
V
 
V
V
 
I
P
 
C
V
 
S
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
x
R
P
 
P
Q
 
Y
T
 
T
T
 
G
I
 
I
S
 
M
E
 
S
Y
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
R
F
 
M
V
 
V
A
 
A
N
 
D
G
 
G
D
 
E
L
 
L
N
 
D
A
 
A
E
 
E
Y
 
F
I
 
V
R
 
H
V
 
G
E
 
E
S
 
G
E
|
E
H
 
H
S
 
A
A
 
Q
I
 
L
S
 
S
A
 
V
A
 
V
V
 
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
R
V
 
V
F
 
F
T
 
T
A
 
G
T
 
S
S
 
S
S
 
G
Q
 
V
G
 
G
L
 
V
A
 
T
L
 
Y
M
 
A
H
 
M
E
 
E
I
 
V
L
 
Y
F
 
S
A
 
P
A
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
R
 
R
N
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
Q
M
 
M
G
 
A
N
 
I
A
 
A
N
 
D
R
|
R
A
 
T
L
 
L
S
 
D
A
 
P
P
 
P
L
 
G
S
x
D
I
 
F
W
 
G
N
 
E
D
 
E
Q
 
H
Q
 
T
D
 
D
S
 
A
I
 
E
S
 
C
Q
 
C
R
 
R
D
 
D
T
 
Q
G
 
G
W
 
W
M
 
I
Q
 
Q
F
 
G
F
 
W
A
 
A
E
 
S
D
 
T
A
 
P
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
N
V
 
T
L
 
L
Q
 
I
A
 
Y
Y
 
Y
K
 
R
I
 
V
S
 
G
E
 
E
N
 
D
E
 
Q
K
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
S
 
Q
M
 
Y
V
 
A
C
 
C
V
 
L
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
F
L
 
V
T
 
S
H
 
H
T
 
I
V
 
L
E
 
G
P
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
D
Q
 
E
E
 
A
E
 
Q
V
 
V
D
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
P
 
-
T
 
N
H
 
H
S
 
H
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
R
D
 
K
P
 
P
M
 
Q
S
 
I
L
 
I
G
 
G
T
 
P
F
 
Q
T
 
I
D
 
E
P
 
P
N
 
A
Y
 
M
Y
 
G
M
 
P
E
 
P
A
 
L
R
 
Q
H
 
Y
D
 
Q
M
 
R
E
 
Y
V
 
Q
A
 
A
M
 
V
E
 
K
G
 
G
A
 
V
K
 
H
D
 
K
V
 
V
I
 
L
R
 
E
N
 
E
V
 
A
N
 
C
K
 
D
E
 
E
F
 
F
A
 
A
E
 
R
K
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
-
 
P
L
 
Y
V
 
L
E
 
D
N
 
E
Y
 
Y
M
 
L
C
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
I
 
F
A
 
G
M
 
Q
G
 
G
S
 
A
L
 
H
C
 
M
G
 
E
T
 
T
I
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
A
D
 
R
N
 
R
M
 
L
R
 
R
K
 
N
E
 
L
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
V
L
 
A
R
 
R
V
 
L
I
 
R
A
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
P
K
 
T
E
 
E
D
 
Q
I
 
I
Y
 
K
N
 
E
A
 
R
I
 
L
K
 
S
N
 
K
A
 
F
D
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
V
N
 
S
I
 
A
S
 
N
L
 
F
G
 
G
I
 
I
-
 
S
-
 
C
-
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
N
 
S
E
 
E
I
 
L
K
 
R
A
 
A
K
 
A
M
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
D
 
K
V
 
V
D
 
K
A
 
T
R
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
V
L
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
E
D
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
H
E
 
D
D
 
E
I
 
F
R
 
Y
N
 
R
I
 
M
I
 
F
K
 
Q
-
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
E
I
 
I
T
 
A
K
 
K
N
 
T
S
 
G
T
 
K
E
 
V
S
 
E
D
 
Q
T
 
T
I
 
S
N
 
Y
W
 
W
I
 
I

5c4iA Structure of an oxalate oxidoreductase (see paper)
39% identity, 97% coverage: 4:376/383 of query aligns to 6:390/394 of 5c4iA

query
sites
5c4iA
I
 
I
T
 
S
A
 
G
N
 
C
R
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
E
 
H
A
 
G
V
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
D
P
 
V
K
 
D
V
 
V
V
 
I
P
 
C
V
 
S
Y
|
Y
P
 
P
I
|
I
T
x
R
P
 
P
Q
 
Y
T
 
T
T
 
G
I
 
I
S
 
M
E
 
S
Y
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
R
F
 
M
V
 
V
A
 
A
N
 
D
G
 
G
D
 
E
L
 
L
N
 
D
A
 
A
E
 
E
Y
 
F
I
 
V
R
 
H
V
 
G
E
 
E
S
 
G
E
|
E
H
 
H
S
 
A
A
 
Q
I
 
L
S
 
S
A
 
V
A
 
V
V
 
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
R
V
 
V
F
 
F
T
 
T
A
 
G
T
 
S
S
 
S
S
 
G
Q
x
V
G
 
G
L
 
V
A
 
T
L
 
Y
M
 
A
H
 
M
E
 
E
I
 
V
L
 
Y
F
 
S
A
 
P
A
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
R
 
R
N
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
Q
M
 
M
G
 
A
N
 
I
A
 
A
N
 
D
R
|
R
A
 
T
L
 
L
S
 
D
A
 
P
P
 
P
L
 
G
S
 
D
I
 
F
W
 
G
N
 
E
D
 
E
Q
 
H
Q
 
T
D
 
D
S
 
A
I
 
E
S
 
C
Q
 
C
R
 
R
D
 
D
T
 
Q
G
 
G
W
 
W
M
 
I
Q
 
Q
F
 
G
F
 
W
A
 
A
E
 
S
D
 
T
A
 
P
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
N
V
 
T
L
 
L
Q
 
I
A
 
Y
Y
 
Y
K
 
R
I
 
V
S
 
G
E
 
E
N
 
D
E
 
Q
K
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
S
 
Q
M
 
Y
V
 
A
C
 
C
V
 
L
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
F
L
 
V
T
 
S
H
 
H
T
 
I
V
 
L
E
 
G
P
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
D
Q
 
E
E
 
A
E
 
Q
V
 
V
D
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
P
 
-
T
 
N
H
 
H
S
 
H
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
R
D
 
K
P
 
P
M
 
Q
S
 
I
L
 
I
G
 
G
T
 
P
F
 
Q
T
 
I
D
 
E
P
 
P
N
 
A
Y
 
M
Y
 
G
M
 
P
E
 
P
A
 
L
R
 
Q
H
 
Y
D
 
Q
M
 
R
E
 
Y
V
 
Q
A
 
A
M
 
V
E
 
K
G
 
G
A
 
V
K
 
H
D
 
K
V
 
V
I
 
L
R
 
E
N
 
E
V
 
A
N
 
C
K
 
D
E
 
E
F
 
F
A
 
A
E
 
R
K
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
-
 
P
L
 
Y
V
 
L
E
 
D
N
 
E
Y
 
Y
M
 
L
C
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
I
 
F
A
 
G
M
 
Q
G
 
G
S
 
A
L
 
H
C
 
M
G
 
E
T
 
T
I
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
A
D
 
R
N
 
R
M
 
L
R
 
R
K
 
N
E
 
L
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
V
L
 
A
R
 
R
V
 
L
I
 
R
A
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
P
K
 
T
E
 
E
D
 
Q
I
 
I
Y
 
K
N
 
E
A
 
R
I
 
L
K
 
S
N
 
K
A
 
F
D
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
V
N
 
S
I
 
A
S
 
N
L
 
F
G
 
G
I
 
I
-
 
S
-
 
C
-
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
N
 
S
E
 
E
I
 
L
K
 
R
A
 
A
K
 
A
M
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
D
 
K
V
 
V
D
 
K
A
 
T
R
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
V
L
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
E
D
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
H
E
 
D
D
 
E
I
 
F
R
 
Y
N
 
R
I
 
M
I
 
F
K
 
Q
-
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
E
I
 
I
T
 
A
K
 
K
N
 
T
S
 
G
T
 
K
E
 
V
S
 
E
D
 
Q
T
 
T
I
 
S
N
 
Y
W
 
W
I
 
I

6ciqA Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from moorella thermoacetica with coenzyme a bound (see paper)
29% identity, 91% coverage: 2:350/383 of query aligns to 3:358/1169 of 6ciqA

query
sites
6ciqA
K
 
Q
V
 
T
I
 
L
T
 
D
A
 
G
N
 
N
R
 
T
A
 
A
I
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
-
V
 
V
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
K
 
M
P
 
S
K
 
E
V
 
V
V
 
A
P
 
T
V
 
I
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
S
T
 
S
T
 
P
I
 
M
S
 
A
E
 
E
Y
 
I
L
 
A
A
 
D
T
 
E
F
 
W
V
 
A
A
 
A
N
 
H
G
 
G
D
 
R
L
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
T
A
 
L
E
 
Q
Y
 
V
I
 
A
R
 
E
V
 
M
E
 
Q
S
 
S
E
|
E
H
 
A
S
 
G
A
 
A
I
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
V
V
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
V
 
T
F
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
M
H
 
I
E
 
P
I
 
N
L
 
M
F
 
Y
A
 
K
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
E
R
 
L
N
 
L
P
 
P
I
 
C
V
 
V
M
 
F
G
 
H
N
 
V
A
 
A
N
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
T
-
 
H
P
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
G
D
 
D
Q
 
H
Q
 
A
D
 
D
S
 
V
I
 
M
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
 
A
Q
 
M
F
 
L
F
 
S
A
 
S
E
 
A
D
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
V
L
 
M
D
 
D
F
 
L
V
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
H
K
 
L
I
 
A
S
 
T
E
 
L
N
 
K
E
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
-
L
 
-
P
 
P
S
 
F
M
 
V
V
 
H
C
 
F
V
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
Y
 
R
L
 
T
T
 
S
H
 
H
T
 
E
V
 
V
E
 
Q
P
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
V
P
 
I
T
 
E
Q
 
Y
E
 
E
E
 
D
V
 
M
D
 
A
E
 
K
F
 
L
L
 
V
P
 
D
P
 
-
Y
 
W
K
 
D
P
 
A
T
 
I
H
 
R
S
 
A
Y
 
F
-
 
R
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
P
K
 
E
D
 
H
P
 
P
M
 
H
S
 
Q
L
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
A
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
D
Y
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
Q
A
 
S
R
 
R
H
 
E
D
 
A
M
 
A
E
 
N
V
 
P
A
 
Y
M
 
Y
E
 
L
G
 
A
A
 
T
K
 
P
D
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
A
N
 
Q
V
 
V
N
 
M
K
 
E
E
 
Q
F
 
V
A
 
A
E
 
G
K
 
L
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
H
Y
 
Y
D
 
H
L
 
L
V
 
F
E
 
D
N
 
Y
Y
 
A
M
 
G
C
 
A
D
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
R
I
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
M
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
S
C
 
C
G
 
E
T
 
V
I
 
I
K
 
E
A
 
E
V
 
T
I
 
V
D
 
N
N
 
Y
M
 
L
R
 
V
K
 
E
E
 
K
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
I
 
R
A
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
S
K
 
A
E
 
E
D
 
H
I
 
F
Y
 
L
N
 
K
A
 
V
I
 
L
-
 
P
K
 
A
N
 
S
A
 
V
D
 
K
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
R
N
 
T
I
 
K
S
 
E
L
 
P
G
 
G
-
 
S
I
 
L
G
 
G
G
 
E
V
 
P
L
 
L
F
 
Y
N
 
E
E
 
D
I
 
V
K
 
Q
A
 
T
K
 
V
M
 
L
D
 
A
V
 
E
D
 
H
A
 
G
R
 
K
G
 
N
F
 
-
I
 
I
L
 
L
G
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6cinB Crystal structure of pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from moorella thermoacetica (see paper)
29% identity, 91% coverage: 2:350/383 of query aligns to 3:358/1169 of 6cinB

query
sites
6cinB
K
 
Q
V
 
T
I
 
L
T
 
D
A
 
G
N
 
N
R
 
T
A
 
A
I
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
-
V
 
V
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
K
 
M
P
 
S
K
 
E
V
 
V
V
 
A
P
 
T
V
 
I
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
S
T
 
S
T
 
P
I
 
M
S
 
A
E
 
E
Y
 
I
L
 
A
A
 
D
T
 
E
F
 
W
V
 
A
A
 
A
N
 
H
G
 
G
D
 
R
L
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
T
A
 
L
E
 
Q
Y
 
V
I
 
A
R
 
E
V
 
M
E
 
Q
S
 
S
E
|
E
H
 
A
S
 
G
A
 
A
I
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
V
V
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
V
 
T
F
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
M
H
 
I
E
 
P
I
 
N
L
 
M
F
 
Y
A
 
K
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
E
R
 
L
N
 
L
P
 
P
I
 
C
V
 
V
M
 
F
G
 
H
N
 
V
A
 
A
N
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
T
-
 
H
P
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
G
D
 
D
Q
 
H
Q
 
A
D
 
D
S
 
V
I
 
M
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
 
A
Q
 
M
F
 
L
F
 
S
A
 
S
E
 
A
D
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
V
L
 
M
D
 
D
F
 
L
V
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
H
K
 
L
I
 
A
S
 
T
E
 
L
N
 
K
E
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
-
L
 
-
P
 
P
S
 
F
M
 
V
V
 
H
C
 
F
V
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
Y
 
R
L
 
T
T
 
S
H
 
H
T
 
E
V
 
V
E
 
Q
P
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
V
P
 
I
T
 
E
Q
 
Y
E
 
E
E
 
D
V
 
M
D
 
A
E
 
K
F
 
L
L
 
V
P
 
D
P
 
-
Y
 
W
K
 
D
P
 
A
T
 
I
H
 
R
S
 
A
Y
 
F
-
 
R
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
P
K
 
E
D
 
H
P
 
P
M
 
H
S
 
Q
L
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
A
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
D
Y
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
Q
A
 
S
R
 
R
H
 
E
D
 
A
M
 
A
E
 
N
V
 
P
A
 
Y
M
 
Y
E
 
L
G
 
A
A
 
T
K
 
P
D
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
A
N
 
Q
V
 
V
N
 
M
K
 
E
E
 
Q
F
 
V
A
 
A
E
 
G
K
 
L
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
H
Y
 
Y
D
 
H
L
 
L
V
 
F
E
 
D
N
 
Y
Y
 
A
M
 
G
C
 
A
D
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
R
I
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
M
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
S
C
 
C
G
 
E
T
 
V
I
 
I
K
 
E
A
 
E
V
 
T
I
 
V
D
 
N
N
 
Y
M
 
L
R
 
V
K
 
E
E
 
K
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
I
 
R
A
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
S
K
 
A
E
 
E
D
 
H
I
 
F
Y
 
L
N
 
K
A
 
V
I
 
L
-
 
P
K
 
A
N
 
S
A
 
V
D
 
K
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
R
N
 
T
I
 
K
S
 
E
L
 
P
G
 
G
-
 
S
I
 
L
G
 
G
G
 
E
V
 
P
L
 
L
F
 
Y
N
 
E
E
 
D
I
 
V
K
 
Q
A
 
T
K
 
V
M
 
L
D
 
A
V
 
E
D
 
H
A
 
G
R
 
K
G
 
N
F
 
-
I
 
I
L
 
L
G
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q2RMD6 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase; PFOR; Pyruvate synthase; EC 1.2.7.1 from Moorella thermoacetica (strain ATCC 39073 / JCM 9320) (see paper)
29% identity, 91% coverage: 2:350/383 of query aligns to 4:359/1171 of Q2RMD6

query
sites
Q2RMD6
K
 
Q
V
 
T
I
 
L
T
 
D
A
 
G
N
 
N
R
 
T
A
 
A
I
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
-
V
 
V
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
K
 
M
P
 
S
K
 
E
V
 
V
V
 
A
P
 
T
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
T
 
T
P
 
P
Q
 
S
T
 
S
T
 
P
I
 
M
S
 
A
E
 
E
Y
 
I
L
 
A
A
 
D
T
 
E
F
 
W
V
 
A
A
 
A
N
 
H
G
 
G
D
 
R
L
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
T
A
 
L
E
 
Q
Y
 
V
I
 
A
R
 
E
V
 
M
E
 
Q
S
 
S
E
 
E
H
 
A
S
 
G
A
 
A
I
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
V
V
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
V
 
T
F
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
M
H
 
I
E
 
P
I
 
N
L
 
M
F
 
Y
A
 
K
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
E
R
 
L
N
 
L
P
 
P
I
 
C
V
 
V
M
 
F
G
 
H
N
 
V
A
 
A
N
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
T
-
 
H
P
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
G
D
 
D
Q
 
H
Q
 
A
D
 
D
S
 
V
I
 
M
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
 
A
Q
 
M
F
 
L
F
 
S
A
 
S
E
 
A
D
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
V
L
 
M
D
 
D
F
 
L
V
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
H
K
 
L
I
 
A
S
 
T
E
 
L
N
 
K
E
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
-
L
 
-
P
 
P
S
 
F
M
 
V
V
 
H
C
 
F
V
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
Y
 
R
L
 
T
T
 
S
H
 
H
T
 
E
V
 
V
E
 
Q
P
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
V
P
 
I
T
 
E
Q
 
Y
E
 
E
E
 
D
V
 
M
D
 
A
E
 
K
F
 
L
L
 
V
P
 
D
P
 
-
Y
 
W
K
 
D
P
 
A
T
 
I
H
 
R
S
 
A
Y
 
F
-
 
R
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
P
K
 
E
D
 
H
P
 
P
M
 
H
S
 
Q
L
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
A
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
D
Y
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
Q
A
 
S
R
 
R
H
 
E
D
 
A
M
 
A
E
 
N
V
 
P
A
 
Y
M
 
Y
E
 
L
G
 
A
A
 
T
K
 
P
D
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
A
N
 
Q
V
 
V
N
 
M
K
 
E
E
 
Q
F
 
V
A
 
A
E
 
G
K
 
L
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
H
Y
 
Y
D
 
H
L
 
L
V
 
F
E
 
D
N
 
Y
Y
 
A
M
 
G
C
 
A
D
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
R
I
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
M
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
S
C
 
C
G
 
E
T
 
V
I
 
I
K
 
E
A
 
E
V
 
T
I
 
V
D
 
N
N
 
Y
M
 
L
R
 
V
K
 
E
E
 
K
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
I
 
R
A
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
S
K
 
A
E
 
E
D
 
H
I
 
F
Y
 
L
N
 
K
A
 
V
I
 
L
-
 
P
K
 
A
N
 
S
A
 
V
D
 
K
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
R
N
 
T
I
 
K
S
 
E
L
 
P
G
 
G
-
 
S
I
 
L
G
 
G
G
 
E
V
 
P
L
 
L
F
 
Y
N
 
E
E
 
D
I
 
V
K
 
Q
A
 
T
K
 
V
M
 
L
D
 
A
V
 
E
D
 
H
A
 
G
R
 
K
G
 
N
F
 
-
I
 
I
L
 
L
G
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6cioA Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from moorella thermoacetica with lactyl-tpp bound (see paper)
29% identity, 91% coverage: 2:350/383 of query aligns to 3:358/1164 of 6cioA

query
sites
6cioA
K
 
Q
V
 
T
I
 
L
T
 
D
A
 
G
N
 
N
R
 
T
A
 
A
I
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
-
V
 
V
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
K
 
M
P
 
S
K
 
E
V
 
V
V
 
A
P
 
T
V
 
I
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
S
T
 
S
T
 
P
I
 
M
S
 
A
E
 
E
Y
 
I
L
 
A
A
 
D
T
 
E
F
 
W
V
 
A
A
 
A
N
 
H
G
 
G
D
 
R
L
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
T
A
 
L
E
 
Q
Y
 
V
I
 
A
R
 
E
V
 
M
E
 
Q
S
 
S
E
|
E
H
 
A
S
 
G
A
 
A
I
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
V
V
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
V
 
T
F
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
M
H
 
I
E
 
P
I
 
N
L
 
M
F
 
Y
A
 
K
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
E
R
 
L
N
 
L
P
 
P
I
 
C
V
 
V
M
 
F
G
 
H
N
 
V
A
 
A
N
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
T
-
 
H
P
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
G
D
 
D
Q
 
H
Q
 
A
D
 
D
S
 
V
I
 
M
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
 
A
Q
 
M
F
 
L
F
 
S
A
 
S
E
 
A
D
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
V
L
 
M
D
 
D
F
 
L
V
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
H
K
 
L
I
 
A
S
 
T
E
 
L
N
 
K
E
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
-
L
 
-
P
 
P
S
 
F
M
 
V
V
 
H
C
 
F
V
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
Y
 
R
L
 
T
T
 
S
H
 
H
T
 
E
V
 
V
E
 
Q
P
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
V
P
 
I
T
 
E
Q
 
Y
E
 
E
E
 
D
V
 
M
D
 
A
E
 
K
F
 
L
L
 
V
P
 
D
P
 
-
Y
 
W
K
 
D
P
 
A
T
 
I
H
 
R
S
 
A
Y
 
F
-
 
R
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
P
K
 
E
D
 
H
P
 
P
M
 
H
S
 
Q
L
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
A
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
D
Y
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
Q
A
 
S
R
 
R
H
 
E
D
 
A
M
 
A
E
 
N
V
 
P
A
 
Y
M
 
Y
E
 
L
G
 
A
A
 
T
K
 
P
D
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
A
N
 
Q
V
 
V
N
 
M
K
 
E
E
 
Q
F
 
V
A
 
A
E
 
G
K
 
L
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
H
Y
 
Y
D
 
H
L
 
L
V
 
F
E
 
D
N
 
Y
Y
 
A
M
 
G
C
 
A
D
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
R
I
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
M
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
S
C
 
C
G
 
E
T
 
V
I
 
I
K
 
E
A
 
E
V
 
T
I
 
V
D
 
N
N
 
Y
M
 
L
R
 
V
K
 
E
E
 
K
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
I
 
R
A
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
S
K
 
A
E
 
E
D
 
H
I
 
F
Y
 
L
N
 
K
A
 
V
I
 
L
-
 
P
K
 
A
N
 
S
A
 
V
D
 
K
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
R
N
 
T
I
 
K
S
 
E
L
 
P
G
 
G
-
 
S
I
 
L
G
 
G
G
 
E
V
 
P
L
 
L
F
 
Y
N
 
E
E
 
D
I
 
V
K
 
Q
A
 
T
K
 
V
M
 
L
D
 
A
V
 
E
D
 
H
A
 
G
R
 
K
G
 
N
F
 
-
I
 
I
L
 
L
G
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6cipA Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from moorella thermoacetica with acetyl-tpp bound (see paper)
29% identity, 91% coverage: 2:350/383 of query aligns to 3:358/1165 of 6cipA

query
sites
6cipA
K
 
Q
V
 
T
I
 
L
T
 
D
A
 
G
N
 
N
R
 
T
A
 
A
I
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
-
V
 
V
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
K
 
M
P
 
S
K
 
E
V
 
V
V
 
A
P
 
T
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
S
T
 
S
T
 
P
I
 
M
S
 
A
E
 
E
Y
 
I
L
 
A
A
 
D
T
 
E
F
 
W
V
 
A
A
 
A
N
 
H
G
 
G
D
 
R
L
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
T
A
 
L
E
 
Q
Y
 
V
I
 
A
R
 
E
V
 
M
E
 
Q
S
 
S
E
|
E
H
 
A
S
 
G
A
 
A
I
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
V
V
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
V
 
T
F
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
M
H
 
I
E
 
P
I
 
N
L
 
M
F
 
Y
A
 
K
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
E
R
 
L
N
 
L
P
 
P
I
 
C
V
 
V
M
 
F
G
 
H
N
 
V
A
 
A
N
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
T
-
 
H
P
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
G
D
 
D
Q
 
H
Q
 
A
D
 
D
S
 
V
I
 
M
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
 
A
Q
 
M
F
 
L
F
 
S
A
 
S
E
 
A
D
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
V
L
 
M
D
 
D
F
 
L
V
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
H
K
 
L
I
 
A
S
 
T
E
 
L
N
 
K
E
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
-
L
 
-
P
 
P
S
 
F
M
 
V
V
 
H
C
 
F
V
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
Y
 
R
L
 
T
T
 
S
H
 
H
T
 
E
V
 
V
E
 
Q
P
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
V
P
 
I
T
 
E
Q
 
Y
E
 
E
E
 
D
V
 
M
D
 
A
E
 
K
F
 
L
L
 
V
P
 
D
P
 
-
Y
 
W
K
 
D
P
 
A
T
 
I
H
 
R
S
 
A
Y
 
F
-
 
R
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
P
K
 
E
D
 
H
P
 
P
M
 
H
S
 
Q
L
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
A
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
D
Y
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
Q
A
 
S
R
 
R
H
 
E
D
 
A
M
 
A
E
 
N
V
 
P
A
 
Y
M
 
Y
E
 
L
G
 
A
A
 
T
K
 
P
D
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
A
N
 
Q
V
 
V
N
 
M
K
 
E
E
 
Q
F
 
V
A
 
A
E
 
G
K
 
L
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
H
Y
 
Y
D
 
H
L
 
L
V
 
F
E
 
D
N
 
Y
Y
 
A
M
 
G
C
 
A
D
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
R
I
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
M
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
S
C
 
C
G
 
E
T
 
V
I
 
I
K
 
E
A
 
E
V
 
T
I
 
V
D
 
N
N
 
Y
M
 
L
R
 
V
K
 
E
E
 
K
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
I
 
R
A
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
S
K
 
A
E
 
E
D
 
H
I
 
F
Y
 
L
N
 
K
A
 
V
I
 
L
-
 
P
K
 
A
N
 
S
A
 
V
D
 
K
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
R
N
 
T
I
 
K
S
 
E
L
 
P
G
 
G
-
 
S
I
 
L
G
 
G
G
 
E
V
 
P
L
 
L
F
 
Y
N
 
E
E
 
D
I
 
V
K
 
Q
A
 
T
K
 
V
M
 
L
D
 
A
V
 
E
D
 
H
A
 
G
R
 
K
G
 
N
F
 
-
I
 
I
L
 
L
G
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

7plmA Cryoem reconstruction of pyruvate ferredoxin oxidoreductase (pfor) in anaerobic conditions (see paper)
30% identity, 85% coverage: 1:326/383 of query aligns to 4:336/1177 of 7plmA

query
sites
7plmA
M
 
M
K
 
M
V
 
T
I
 
T
T
 
D
A
 
G
N
 
N
R
 
T
A
 
A
I
 
T
A
 
A
E
 
H
A
 
-
V
 
V
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
K
 
M
P
 
S
K
 
E
V
 
V
V
 
A
P
 
A
V
 
I
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
 
T
P
 
P
Q
 
S
T
 
S
T
 
T
I
 
M
S
 
G
E
 
E
Y
 
E
L
 
A
A
 
D
T
 
D
F
 
W
V
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
D
 
R
L
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
Q
A
 
T
E
 
L
Y
 
T
I
 
I
R
 
R
-
 
E
V
 
M
E
 
Q
S
 
S
E
|
E
H
 
A
S
 
G
A
 
A
I
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
V
V
 
H
G
 
G
A
 
A
S
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
V
 
T
F
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
M
H
 
I
E
 
P
I
 
N
L
 
M
F
 
Y
A
 
K
A
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
R
 
L
N
 
L
P
 
P
I
 
G
V
 
V
M
 
F
G
 
H
N
 
V
A
 
T
N
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
A
-
 
H
P
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
G
D
 
D
Q
 
H
Q
 
Q
D
 
D
S
 
I
I
 
Y
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
 
A
Q
 
M
F
 
L
F
 
A
A
 
S
E
 
S
D
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
H
D
 
D
F
 
M
V
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
H
K
 
L
I
 
A
S
 
A
E
 
I
N
 
E
E
 
S
K
 
N
V
 
V
L
 
-
L
 
-
P
 
P
S
 
F
M
 
M
V
 
H
C
 
F
V
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
Y
 
R
L
 
T
T
 
S
H
 
H
T
 
E
V
 
I
E
 
Q
P
 
K
V
 
I
D
 
E
I
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
L
P
 
V
T
 
N
Q
 
Q
E
 
K
E
 
A
V
 
L
D
 
A
E
 
E
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
R
H
 
A
S
 
K
Y
 
S
L
 
M
D
 
N
P
 
P
K
 
E
D
 
H
P
 
P
M
 
H
S
 
V
L
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
A
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
D
Y
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
Q
A
 
G
R
 
R
H
 
E
D
 
A
M
 
A
E
 
N
V
 
P
A
 
Y
M
 
Y
E
 
L
G
 
K
A
 
V
K
 
P
D
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
A
N
 
E
V
 
Y
N
 
M
K
 
Q
E
 
K
F
 
V
A
 
A
E
 
S
K
 
L
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
S
Y
 
Y
D
 
K
L
 
L
V
 
F
E
 
D
N
 
Y
Y
 
V
M
 
G
C
 
A
D
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
R
I
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
M
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
S
C
 
C
G
 
E
T
 
T
I
 
I
K
 
E
A
 
E
V
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
H
M
 
L
R
 
A
K
 
A
E
 
K
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
I
 
R
A
 
L
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
V
K
 
S
E
 
E
D
 
A
I
 
F
Y
 
F
N
 
A
A
 
A
I
 
L
-
 
P
K
 
A
N
 
S
A
 
A
D
 
K
R
 
V
V
 
I
A
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
R
N
 
T
I
 
K
S
 
E
L
 
P
G
 
G
I
 
A
G
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2c3uA Crystal structure of pyruvate-ferredoxin oxidoreductase from desulfovibrio africanus, oxygen inhibited form (see paper)
30% identity, 85% coverage: 1:326/383 of query aligns to 4:336/1231 of 2c3uA

query
sites
2c3uA
M
 
M
K
 
M
V
 
T
I
 
T
T
 
D
A
 
G
N
 
N
R
 
T
A
 
A
I
 
T
A
 
A
E
 
H
A
 
-
V
 
V
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
K
 
M
P
 
S
K
 
E
V
 
V
V
 
A
P
 
A
V
 
I
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
S
T
 
S
T
 
T
I
 
M
S
 
G
E
 
E
Y
 
E
L
 
A
A
 
D
T
 
D
F
 
W
V
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
D
 
R
L
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
Q
A
 
T
E
 
L
Y
 
T
I
 
I
R
 
R
-
 
E
V
 
M
E
 
Q
S
 
S
E
|
E
H
 
A
S
 
G
A
 
A
I
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
V
V
 
H
G
 
G
A
 
A
S
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
V
 
T
F
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
M
H
 
I
E
 
P
I
 
N
L
 
M
F
 
Y
A
 
K
A
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
R
 
L
N
 
L
P
 
P
I
 
G
V
 
V
M
 
F
G
 
H
N
 
V
A
 
T
N
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
A
-
 
H
P
 
A
L
 
L
S
 
S
I
|
I
W
 
F
N
 
G
D
 
D
Q
 
H
Q
 
Q
D
 
D
S
 
I
I
 
Y
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
 
A
Q
 
M
F
 
L
F
 
A
A
 
S
E
 
S
D
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
H
D
 
D
F
 
M
V
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
H
K
 
L
I
 
A
S
 
A
E
 
I
N
 
E
E
 
S
K
 
N
V
 
V
L
 
-
L
 
-
P
 
P
S
 
F
M
 
M
V
 
H
C
 
F
V
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
Y
 
R
L
 
T
T
 
S
H
 
H
T
 
E
V
 
I
E
 
Q
P
 
K
V
 
I
D
 
E
I
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
L
P
 
V
T
 
N
Q
 
Q
E
 
K
E
 
A
V
 
L
D
 
A
E
 
E
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
R
H
 
A
S
 
K
Y
 
S
L
 
M
D
 
N
P
 
P
K
 
E
D
 
H
P
 
P
M
 
H
S
 
V
L
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
A
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
D
Y
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
Q
A
 
G
R
 
R
H
 
E
D
 
A
M
 
A
E
 
N
V
 
P
A
 
Y
M
 
Y
E
 
L
G
 
K
A
 
V
K
 
P
D
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
A
N
 
E
V
 
Y
N
 
M
K
 
Q
E
 
K
F
 
V
A
 
A
E
 
S
K
 
L
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
S
Y
 
Y
D
 
K
L
 
L
V
 
F
E
 
D
N
 
Y
Y
 
V
M
 
G
C
 
A
D
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
R
I
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
M
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
S
C
 
C
G
 
E
T
 
T
I
 
I
K
 
E
A
 
E
V
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
H
M
 
L
R
 
A
K
 
A
E
 
K
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
I
 
R
A
 
L
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
V
K
 
S
E
 
E
D
 
A
I
 
F
Y
 
F
N
 
A
A
 
A
I
 
L
-
 
P
K
 
A
N
 
S
A
 
A
D
 
K
R
 
V
V
 
I
A
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
R
N
 
T
I
 
K
S
 
E
L
 
P
G
 
G
I
 
A
G
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2c3pA Crystal structure of the free radical intermediate of pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from desulfovibrio africanus (see paper)
30% identity, 85% coverage: 1:326/383 of query aligns to 4:336/1231 of 2c3pA

query
sites
2c3pA
M
 
M
K
 
M
V
 
T
I
 
T
T
 
D
A
 
G
N
 
N
R
 
T
A
 
A
I
 
T
A
 
A
E
 
H
A
 
-
V
 
V
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
K
 
M
P
 
S
K
 
E
V
 
V
V
 
A
P
 
A
V
 
I
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
S
T
 
S
T
 
T
I
 
M
S
 
G
E
 
E
Y
 
E
L
 
A
A
 
D
T
 
D
F
 
W
V
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
D
 
R
L
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
Q
A
 
T
E
 
L
Y
 
T
I
 
I
R
 
R
-
 
E
V
 
M
E
 
Q
S
 
S
E
|
E
H
 
A
S
 
G
A
 
A
I
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
V
V
 
H
G
 
G
A
 
A
S
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
V
 
T
F
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
M
H
 
I
E
 
P
I
 
N
L
 
M
F
 
Y
A
 
K
A
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
R
 
L
N
 
L
P
 
P
I
 
G
V
 
V
M
 
F
G
 
H
N
 
V
A
 
T
N
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
A
-
 
H
P
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
G
D
 
D
Q
 
H
Q
 
Q
D
 
D
S
 
I
I
 
Y
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
 
A
Q
 
M
F
 
L
F
 
A
A
 
S
E
 
S
D
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
H
D
 
D
F
 
M
V
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
H
K
 
L
I
 
A
S
 
A
E
 
I
N
 
E
E
 
S
K
 
N
V
 
V
L
 
-
L
 
-
P
 
P
S
 
F
M
 
M
V
 
H
C
 
F
V
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
Y
 
R
L
 
T
T
 
S
H
 
H
T
 
E
V
 
I
E
 
Q
P
 
K
V
 
I
D
 
E
I
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
L
P
 
V
T
 
N
Q
 
Q
E
 
K
E
 
A
V
 
L
D
 
A
E
 
E
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
R
H
 
A
S
 
K
Y
 
S
L
 
M
D
 
N
P
 
P
K
 
E
D
 
H
P
 
P
M
 
H
S
 
V
L
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
A
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
D
Y
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
Q
A
 
G
R
 
R
H
 
E
D
 
A
M
 
A
E
 
N
V
 
P
A
 
Y
M
 
Y
E
 
L
G
 
K
A
 
V
K
 
P
D
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
A
N
 
E
V
 
Y
N
 
M
K
 
Q
E
 
K
F
 
V
A
 
A
E
 
S
K
 
L
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
S
Y
 
Y
D
 
K
L
 
L
V
 
F
E
 
D
N
 
Y
Y
 
V
M
 
G
C
 
A
D
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
R
I
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
M
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
S
C
 
C
G
 
E
T
 
T
I
 
I
K
 
E
A
 
E
V
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
H
M
 
L
R
 
A
K
 
A
E
 
K
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
I
 
R
A
 
L
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
V
K
 
S
E
 
E
D
 
A
I
 
F
Y
 
F
N
 
A
A
 
A
I
 
L
-
 
P
K
 
A
N
 
S
A
 
A
D
 
K
R
 
V
V
 
I
A
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
R
N
 
T
I
 
K
S
 
E
L
 
P
G
 
G
I
 
A
G
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2c3oA Crystal structure of the free radical intermediate of pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from desulfovibrio africanus (see paper)
30% identity, 85% coverage: 1:326/383 of query aligns to 4:336/1231 of 2c3oA

query
sites
2c3oA
M
 
M
K
 
M
V
 
T
I
 
T
T
 
D
A
 
G
N
 
N
R
 
T
A
 
A
I
 
T
A
 
A
E
 
H
A
 
-
V
 
V
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
K
 
M
P
 
S
K
 
E
V
 
V
V
 
A
P
 
A
V
 
I
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
S
T
 
S
T
 
T
I
 
M
S
 
G
E
 
E
Y
 
E
L
 
A
A
 
D
T
 
D
F
 
W
V
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
D
 
R
L
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
Q
A
 
T
E
 
L
Y
 
T
I
 
I
R
 
R
-
 
E
V
 
M
E
 
Q
S
 
S
E
|
E
H
 
A
S
 
G
A
 
A
I
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
V
V
 
H
G
 
G
A
 
A
S
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
V
 
T
F
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
M
H
 
I
E
 
P
I
 
N
L
 
M
F
 
Y
A
 
K
A
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
R
 
L
N
 
L
P
 
P
I
 
G
V
 
V
M
 
F
G
 
H
N
 
V
A
 
T
N
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
A
-
 
H
P
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
G
D
 
D
Q
 
H
Q
 
Q
D
 
D
S
 
I
I
 
Y
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
 
A
Q
 
M
F
 
L
F
 
A
A
 
S
E
 
S
D
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
H
D
 
D
F
 
M
V
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
H
K
 
L
I
 
A
S
 
A
E
 
I
N
 
E
E
 
S
K
 
N
V
 
V
L
 
-
L
 
-
P
 
P
S
 
F
M
 
M
V
 
H
C
 
F
V
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
Y
 
R
L
 
T
T
 
S
H
 
H
T
 
E
V
 
I
E
 
Q
P
 
K
V
 
I
D
 
E
I
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
L
P
 
V
T
 
N
Q
 
Q
E
 
K
E
 
A
V
 
L
D
 
A
E
 
E
F
 
F
L
 
-
P
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
R
H
 
A
S
 
K
Y
 
S
L
 
M
D
 
N
P
 
P
K
 
E
D
 
H
P
 
P
M
 
H
S
 
V
L
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
A
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
N
 
D
Y
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
Q
A
 
G
R
 
R
H
 
E
D
 
A
M
 
A
E
 
N
V
 
P
A
 
Y
M
 
Y
E
 
L
G
 
K
A
 
V
K
 
P
D
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
A
N
 
E
V
 
Y
N
 
M
K
 
Q
E
 
K
F
 
V
A
 
A
E
 
S
K
 
L
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
S
Y
 
Y
D
 
K
L
 
L
V
 
F
E
 
D
N
 
Y
Y
 
V
M
 
G
C
 
A
D
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
R
I
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
S
M
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
S
C
 
C
G
 
E
T
 
T
I
 
I
K
 
E
A
 
E
V
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
H
M
 
L
R
 
A
K
 
A
E
 
K
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
I
 
R
A
 
L
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
V
K
 
S
E
 
E
D
 
A
I
 
F
Y
 
F
N
 
A
A
 
A
I
 
L
-
 
P
K
 
A
N
 
S
A
 
A
D
 
K
R
 
V
V
 
I
A
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
R
N
 
T
I
 
K
S
 
E
L
 
P
G
 
G
I
 
A
G
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1kekA Crystal structure of the free radical intermediate of pyruvate:ferredoxin oxidoreductase (see paper)
30% identity, 85% coverage: 1:326/383 of query aligns to 4:336/1231 of 1kekA

query
sites
1kekA
M
 
M
K
 
M
V
 
T
I
 
T
T
 
D
A
 
G
N
 
N
R
 
T
A
 
A
I
 
T
A
 
A
E
 
H
A
 
-
V
 
V
K
 
A
L
 
Y
A
 
A
K
 
M
P
 
S
K
 
E
V
 
V
V
 
A
P
 
A
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
S
T
 
S
T
 
T
I
 
M
S
 
G
E
 
E
Y
 
E
L
 
A
A
 
D
T
 
D
F
 
W
V
 
A
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
D
 
R
L
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
Q
A
 
T
E
 
L
Y
 
T
I
 
I
R
 
R
-
 
E
V
 
M
E
 
Q
S
 
S
E
|
E
H
 
A
S
 
G
A
 
A
I
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
V
V
 
H
G
 
G
A
 
A
S
 
L
G
 
A
T
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
L
V
 
T
F
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
M
H
 
I
E
 
P
I
 
N
L
 
M
F
 
Y
A
 
K
A
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
E
R
 
L
N
 
L
P
 
P
I
 
G
V
 
V
M
 
F
G
 
H
N
 
V
A
 
T
N
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
A
-
 
H
P
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
G
D
 
D
Q
 
H
Q
 
Q
D
 
D
S
 
I
I
 
Y
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
W
 
F
M
 
A
Q
 
M
F
 
L
F
 
A
A
 
S
E
 
S
D
 
S
A
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
H
D
 
D
F
 
M
V
 
A
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
H
K
 
L
I