SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_048505944.1 NCBI__GCF_001045465.1:WP_048505944.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 2 hits to proteins with known functional sites (download)

P52697 6-phosphogluconolactonase; 6-P-gluconolactonase; Pgl; EC 3.1.1.31 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 85% coverage: 41:363/379 of query aligns to 12:315/331 of P52697

query
sites
P52697
T
 
S
E
 
Q
G
 
Q
I
 
I
Y
 
H
V
 
V
Y
 
W
Q
 
N
L
 
L
D
 
N
T
 
H
I
 
E
K
 
G
G
 
A
-
 
L
K
 
T
L
 
L
S
 
T
K
 
Q
V
 
V
T
 
V
S
 
D
L
 
V
K
 
P
G
 
G
I
 
Q
L
 
V
N
 
Q
P
 
P
S
 
-
F
 
-
L
 
M
T
 
V
L
 
V
S
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
K
Q
 
R
Y
 
Y
I
 
L
F
 
Y
A
 
V
C
 
G
T
 
V
E
 
R
S
 
P
K
 
E
T
 
F
P
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
R
V
 
V
S
 
L
S
 
A
F
 
Y
K
 
R
F
 
I
N
 
A
P
 
P
K
 
D
D
 
D
E
 
G
T
 
A
L
 
L
T
 
T
F
 
F
I
 
A
N
 
A
S
 
E
Q
 
S
K
 
A
S
 
L
G
 
P
G
 
G
E
 
-
N
 
S
P
 
P
V
 
T
Y
 
H
V
 
I
S
 
S
V
 
T
H
 
D
Q
 
H
N
 
Q
G
 
G
K
 
Q
W
 
F
L
 
V
V
 
F
N
 
V
A
 
G
N
 
S
Y
 
Y
K
 
N
E
 
A
G
 
G
S
 
N
A
 
V
S
 
S
I
 
V
Y
 
T
P
 
R
I
 
L
D
 
E
D
 
D
D
 
-
G
 
G
T
 
L
I
 
P
Q
 
V
P
 
G
A
 
V
V
 
V
Q
 
D
N
 
V
F
 
V
Q
 
E
F
 
G
S
 
L
E
 
D
G
 
G
S
 
C
V
 
-
N
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
H
 
-
V
 
-
H
 
H
A
 
S
A
 
A
V
 
N
F
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
D
S
 
N
D
 
R
H
 
T
L
 
L
F
 
W
L
 
V
T
 
P
D
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
Q
D
 
D
K
 
R
I
 
I
R
 
C
S
 
L
Y
 
F
T
 
T
F
 
V
D
 
S
S
 
D
D
 
D
K
 
G
T
 
H
E
 
L
P
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
D
A
 
P
K
 
A
Q
 
E
P
 
-
Y
 
-
I
 
V
Q
 
T
S
 
T
V
 
V
L
 
E
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
R
 
R
H
 
H
L
 
M
T
 
V
F
 
F
H
 
H
P
 
P
N
 
N
G
 
E
K
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
C
 
C
I
 
V
E
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
N
G
 
S
T
 
S
V
 
V
N
 
D
A
 
V
Y
 
W
Q
 
E
Y
 
L
E
 
K
N
 
D
-
 
P
-
 
H
A
 
G
T
 
N
L
 
I
K
 
E
S
 
C
I
 
V
Q
 
Q
R
 
T
V
 
L
N
 
D
T
 
M
H
 
M
T
 
P
D
 
E
Q
 
N
Y
 
F
K
 
S
D
 
D
N
 
T
F
 
R
E
 
W
S
 
A
S
 
A
D
 
D
I
 
I
H
 
H
I
 
I
S
 
T
P
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
R
F
 
H
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
A
 
C
N
 
D
R
 
R
G
 
T
G
 
A
E
 
-
N
 
S
N
 
L
I
 
I
A
 
T
I
 
V
F
 
F
S
 
S
I
 
V
L
 
S
E
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
S
-
 
V
L
 
L
K
 
S
N
 
K
V
 
E
G
 
G
Y
 
F
Q
 
Q
S
 
P
T
 
T
L
 
E
G
 
T
K
 
Q
H
 
-
S
 
P
R
 
R
V
 
G
F
 
F
D
 
N
I
 
V
D
 
D
E
 
H
T
 
S
G
 
G
K
|
K
F
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
A
A
 
A
H
 
G
A
 
Q
G
 
K
S
 
S
G
 
H
N
 
H
L
 
I
V
 
S
V
 
V
F
 
Y
K
 
E
R
 
I
D
 
V
P
 
G
Q
 
E
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
H
K
 
E
T
 
K
G
 
G

1jofB Neurospora crassa 3-carboxy-cis,cis-mucoante lactonizing enzyme (see paper)
22% identity, 58% coverage: 132:351/379 of query aligns to 111:338/365 of 1jofB

query
sites
1jofB
V
 
A
N
 
N
A
 
P
N
 
F
Y
 
Y
K
 
K
-
 
F
E
 
A
G
 
G
S
 
Y
A
 
G
S
 
N
I
 
V
Y
 
F
P
 
S
I
 
V
D
 
S
D
 
E
D
 
T
G
 
G
T
 
K
I
 
L
Q
 
E
P
 
K
A
 
N
V
 
V
Q
 
Q
N
 
N
F
 
Y
Q
 
E
F
 
Y
S
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
N
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
Q
 
Q
D
 
E
R
 
N
S
 
T
H
 
G
V
 
I
H
|
H
A
 
G
A
 
M
V
 
V
F
 
F
S
 
D
P
 
P
D
 
T
S
 
E
D
 
T
H
 
Y
L
 
L
F
 
Y
L
 
S
T
 
A
D
 
D
L
 
L
G
 
T
A
 
A
D
 
N
K
 
K
I
 
L
R
 
W
S
 
T
Y
 
H
-
 
R
T
 
K
F
 
L
D
 
A
S
 
S
D
 
G
K
 
E
T
 
V
E
 
E
P
 
L
A
 
V
Q
 
G
A
 
S
A
 
V
K
 
D
Q
 
A
P
 
P
Y
 
-
I
 
-
Q
 
-
S
 
-
V
 
D
L
 
P
G
 
G
S
 
D
G
 
H
P
 
P
R
|
R
H
 
W
L
 
V
T
 
A
F
 
M
H
 
H
P
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
N
Y
 
Y
A
 
L
Y
 
Y
C
 
A
I
 
L
E
 
M
E
|
E
L
 
A
S
 
G
G
 
N
T
 
R
V
 
I
N
 
C
A
 
E
Y
 
Y
Q
 
V
Y
 
I
E
 
D
N
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
H
K
 
M
S
 
P
I
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
V
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
-
 
H
-
 
S
-
 
F
-
 
P
-
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
P
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
R
-
 
D
T
 
P
D
 
E
Q
 
T
Y
 
G
K
 
K
D
 
G
N
 
L
F
 
Y
E
 
R
S
 
A
S
 
D
D
 
V
I
 
C
H
 
A
I
 
L
S
 
T
P
 
F
D
 
S
G
 
G
K
 
K
F
 
Y
L
 
M
Y
 
F
A
 
A
A
 
S
N
 
S
R
|
R
G
 
A
G
 
N
-
 
K
-
 
F
-
x
E
-
 
L
E
 
Q
N
 
G
N
 
Y
I
 
I
A
 
A
I
 
G
F
 
F
S
 
K
I
 
L
L
 
R
E
 
D
D
 
C
G
 
G
T
 
S
L
 
I
K
 
E
N
 
K
V
 
Q
G
 
L
Y
 
F
Q
 
L
S
 
S
-
 
P
-
 
T
-
 
P
T
 
T
L
 
S
G
 
G
K
 
G
H
 
H
S
 
S
R
 
N
-
 
A
V
 
V
F
 
S
D
 
P
I
 
C
D
 
P
E
 
W
T
 
S
G
 
D
K
 
E
F
 
W
L
 
M
I
 
A
V
 
I
A
 
T
H
 
D
A
 
D
G
 
Q
S
x
E
G
 
G
N
 
W
L
 
L
V
 
E
V
 
I
F
 
Y
K
 
R

Query Sequence

>WP_048505944.1 NCBI__GCF_001045465.1:WP_048505944.1
MKITGAFKRILSIITIILASISIYSQNTYVFVGSFNRDKATEGIYVYQLDTIKGKLSKVT
SLKGILNPSFLTLSPNGQYIFACTESKTPNAGSVSSFKFNPKDETLTFINSQKSGGENPV
YVSVHQNGKWLVNANYKEGSASIYPIDDDGTIQPAVQNFQFSEGSVNKDRQDRSHVHAAV
FSPDSDHLFLTDLGADKIRSYTFDSDKTEPAQAAKQPYIQSVLGSGPRHLTFHPNGKYAY
CIEELSGTVNAYQYENATLKSIQRVNTHTDQYKDNFESSDIHISPDGKFLYAANRGGENN
IAIFSILEDGTLKNVGYQSTLGKHSRVFDIDETGKFLIVAHAGSGNLVVFKRDPQTGLLK
KTGNKVKVKSASSVKIRRY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory