SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_049776175.1 NCBI__GCF_000017645.1:WP_049776175.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0A9T0 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
59% identity, 97% coverage: 11:418/422 of query aligns to 4:410/410 of P0A9T0

query
sites
P0A9T0
L
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
E
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
K
V
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
H
D
 
Q
S
 
K
A
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
S
L
 
L
T
 
R
N
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
L
 
I
T
 
E
R
 
F
L
 
H
P
 
K
K
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
D
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
K
 
R
G
 
D
V
 
A
H
 
H
I
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
L
R
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
I
 
L
T
 
T
P
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
C
 
C
F
 
F
S
 
C
V
 
I
G
 
G
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
I
 
K
S
 
R
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
N
T
 
T
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
M
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
G
I
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
A
S
 
N
H
 
A
A
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
R
G
 
G
R
 
V
W
 
W
D
 
N
K
 
K
S
 
L
A
 
A
T
 
A
N
 
G
S
 
S
V
 
F
E
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
N
x
H
I
|
I
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
L
 
L
S
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
S
M
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
Y
V
 
V
I
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
|
D
H
 
I
T
 
E
D
 
N
K
 
K
L
 
L
R
 
P
H
 
L
G
 
G
Q
 
N
A
 
A
E
 
T
P
 
Q
V
 
V
S
 
Q
T
 
H
L
 
L
N
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
Q
 
M
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
V
 
V
P
 
P
E
 
E
T
 
N
A
 
P
A
 
S
T
 
T
H
 
K
G
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
S
T
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
x
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
I
D
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
E
P
 
P
G
 
A
S
 
T
N
 
N
A
 
S
E
 
D
R
 
P
F
 
F
V
 
T
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
C
G
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
G
|
G
S
 
S
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
R
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
K
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
T
 
N
G
 
G
S
 
S
T
 
T
M
 
L
G
 
S
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
F
P
 
P
E
 
E
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
L
R
 
H
P
 
-
T
 
G
G
 
G
T
 
R
R
 
R
F
 
L
I
 
M
Q
 
H
I
 
I
H
 
H
R
 
E
N
 
N
L
 
R
P
 
P
G
 
G
M
 
V
L
 
L
G
 
T
R
 
A
L
 
L
N
 
N
E
 
K
V
 
I
L
 
F
A
 
A
R
 
E
H
 
Q
S
 
G
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
E
 
Q
T
 
T
Y
 
S
A
 
A
D
 
Q
V
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
I
D
 
E
A
 
A
S
 
D
T
 
E
A
 
D
D
 
V
S
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
A
I
 
M
R
 
K
E
 
A
I
 
I
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

1ybaA The active form of phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
59% identity, 96% coverage: 12:418/422 of query aligns to 1:406/406 of 1ybaA

query
sites
1ybaA
S
 
S
L
 
L
S
 
E
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
K
V
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
H
D
 
Q
S
 
K
A
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
S
L
 
L
T
 
R
N
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
L
 
I
T
 
E
R
 
F
L
 
H
P
 
K
K
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
D
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
K
 
R
G
 
D
V
 
A
H
 
H
I
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
L
R
|
R
S
|
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
I
 
L
T
 
T
P
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
C
 
C
F
 
F
S
x
C
V
x
I
G
|
G
T
 
T
N
|
N
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
I
 
K
S
 
R
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
|
F
S
 
S
N
|
N
T
 
T
R
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
M
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
G
I
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
A
S
 
N
H
 
A
A
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
R
G
 
G
R
 
V
W
 
W
D
 
N
K
 
K
S
 
L
A
 
A
T
 
A
N
 
G
S
 
S
V
 
F
E
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
Y
 
Y
G
|
G
N
x
H
I
|
I
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
L
 
L
S
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
S
M
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
Y
V
 
V
I
 
Y
F
 
F
Y
|
Y
D
|
D
H
x
I
T
 
E
D
 
N
K
|
K
L
 
L
R
 
P
H
 
L
G
 
G
Q
 
N
A
 
A
E
 
T
P
 
Q
V
 
V
S
 
Q
T
 
H
L
 
L
N
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
Q
 
M
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
V
|
V
P
|
P
E
 
E
T
 
N
A
 
P
A
 
S
T
 
T
H
 
K
G
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
S
T
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
x
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
I
D
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
|
E
P
 
P
G
 
A
S
 
T
N
 
N
A
 
S
E
 
D
R
 
P
F
 
F
V
 
T
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
C
G
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
R
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
K
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
T
 
N
G
 
G
S
 
S
T
 
T
M
 
L
G
 
S
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
F
P
 
P
E
 
E
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
L
R
 
H
P
 
-
T
 
G
G
 
G
T
 
R
R
 
R
F
 
L
I
 
M
Q
 
H
I
 
I
H
 
H
R
 
E
N
 
N
L
 
R
P
 
P
G
 
G
M
 
V
L
 
L
G
 
T
R
 
A
L
 
L
N
 
N
E
 
K
V
 
I
L
 
F
A
 
A
R
 
E
H
 
Q
S
 
G
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
E
 
Q
T
 
T
Y
 
S
A
 
A
D
 
Q
V
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
I
D
 
E
A
 
A
S
 
D
T
 
E
A
 
D
D
 
V
S
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
A
I
 
M
R
 
K
E
 
A
I
 
I
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y

2p9eA Crystal structure of g336v mutant of e.Coli phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
59% identity, 96% coverage: 12:418/422 of query aligns to 1:406/406 of 2p9eA

query
sites
2p9eA
S
 
S
L
 
L
S
 
E
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
K
V
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
H
D
 
Q
S
 
K
A
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
S
L
 
L
T
 
R
N
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
L
 
I
T
 
E
R
 
F
L
 
H
P
 
K
K
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
D
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
K
 
R
G
 
D
V
 
A
H
 
H
I
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
L
R
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
I
 
L
T
 
T
P
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
C
 
A
F
 
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
I
 
K
S
 
R
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
S
N
|
N
T
 
T
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
M
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
G
I
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
A
S
 
N
H
 
A
A
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
R
G
 
G
R
 
V
W
 
W
D
 
N
K
 
K
S
 
L
A
 
A
T
 
A
N
 
G
S
 
S
V
 
F
E
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
|
G
N
x
H
I
|
I
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
L
 
L
S
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
S
M
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
Y
V
 
V
I
 
Y
F
 
F
Y
|
Y
D
|
D
H
x
I
T
 
E
D
 
N
K
 
K
L
 
L
R
 
P
H
 
L
G
 
G
Q
 
N
A
 
A
E
 
T
P
 
Q
V
 
V
S
 
Q
T
 
H
L
 
L
N
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
Q
 
M
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
V
|
V
P
|
P
E
 
E
T
 
N
A
 
P
A
x
S
T
 
T
H
 
K
G
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
S
T
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
x
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
I
D
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
|
E
P
 
P
G
 
A
S
 
T
N
 
N
A
 
S
E
 
D
R
 
P
F
 
F
V
 
T
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
G
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
R
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
K
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
T
 
N
G
 
G
S
 
S
T
 
T
M
 
L
G
 
S
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
F
P
 
P
E
 
E
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
L
R
 
H
P
 
-
T
 
V
G
 
G
T
 
R
R
 
R
F
 
L
I
 
M
Q
 
H
I
 
I
H
 
H
R
 
E
N
 
N
L
 
R
P
 
P
G
 
G
M
 
V
L
 
L
G
 
T
R
 
A
L
 
L
N
 
N
E
 
K
V
 
I
L
 
F
A
 
A
R
 
E
H
 
Q
S
 
G
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
E
 
Q
T
 
T
Y
 
S
A
 
A
D
 
Q
V
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
I
D
 
E
A
 
A
S
 
D
T
 
E
A
 
D
D
 
V
S
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
A
I
 
M
R
 
K
E
 
A
I
 
I
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y

1psdA The allosteric ligand site in the vmax-type cooperative enzyme phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
59% identity, 96% coverage: 15:418/422 of query aligns to 2:404/404 of 1psdA

query
sites
1psdA
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
K
V
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
H
D
 
Q
S
 
K
A
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
S
L
 
L
T
 
R
N
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
L
 
I
T
 
E
R
 
F
L
 
H
P
 
K
K
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
D
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
K
 
R
G
 
D
V
 
A
H
 
H
I
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
L
R
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
I
 
L
T
 
T
P
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
C
 
C
F
 
F
S
 
C
V
 
I
G
 
G
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
I
 
K
S
 
R
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
S
N
|
N
T
 
T
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
M
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
G
I
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
A
S
 
N
H
 
A
A
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
R
G
 
G
R
 
V
W
 
W
D
 
N
K
 
K
S
 
L
A
 
A
T
 
A
N
 
G
S
 
S
V
 
F
E
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
N
x
H
I
|
I
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
L
 
L
S
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
S
M
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
Y
V
 
V
I
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
|
D
H
x
I
T
 
E
D
 
N
K
|
K
L
 
L
R
 
P
H
 
L
G
 
G
Q
 
N
A
 
A
E
 
T
P
 
Q
V
 
V
S
 
Q
T
 
H
L
 
L
N
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
Q
 
M
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
V
|
V
P
|
P
E
 
E
T
 
N
A
 
P
A
 
S
T
 
T
H
 
K
G
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
S
T
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
x
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
I
D
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
|
E
P
 
P
G
 
A
S
 
T
N
 
N
A
 
S
E
 
D
R
 
P
F
 
F
V
 
T
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
C
G
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
R
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
K
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
T
 
N
G
 
G
S
 
S
T
 
T
M
 
L
G
 
S
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
F
P
 
P
E
 
E
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
L
R
 
H
P
 
-
T
 
G
G
 
G
T
 
R
R
 
R
F
 
L
I
 
M
Q
 
H
I
 
I
H
|
H
R
 
E
N
|
N
L
x
R
P
 
P
G
 
G
M
x
V
L
 
L
G
 
T
R
 
A
L
 
L
N
 
N
E
 
K
V
 
I
L
 
F
A
 
A
R
 
E
H
 
Q
S
 
G
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
E
 
Q
T
 
T
Y
 
S
A
 
A
D
 
Q
V
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
I
D
 
E
A
 
A
S
 
D
T
 
E
A
 
D
D
 
V
S
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
A
I
 
M
R
 
K
E
 
A
I
 
I
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y

1sc6D Crystal structure of w139g d-3-phosphoglycerate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
56% identity, 96% coverage: 15:418/422 of query aligns to 2:384/384 of 1sc6D

query
sites
1sc6D
K
 
K
D
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
K
V
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
H
D
 
Q
S
 
K
A
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
S
L
 
L
T
 
R
N
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
L
 
I
T
 
E
R
 
F
L
 
H
P
 
K
K
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
D
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
K
 
R
G
 
D
V
 
A
H
 
H
I
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
L
R
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
H
I
 
L
T
 
T
P
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
C
 
A
F
 
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
I
 
K
S
 
R
G
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
A
 
A
P
|
P
F
|
F
S
 
S
N
|
N
T
|
T
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
M
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
G
I
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
A
S
 
N
H
 
A
A
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
R
G
 
G
R
 
-
W
 
-
D
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
V
N
 
G
S
 
S
V
 
F
E
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
Y
 
Y
G
|
G
N
x
H
I
|
I
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
L
 
L
S
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
S
M
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
Y
V
 
V
I
 
Y
F
 
F
Y
|
Y
D
|
D
H
x
I
T
 
E
D
 
N
K
 
K
L
 
L
R
 
P
H
 
L
G
 
G
Q
 
N
A
 
A
E
 
T
P
 
Q
V
 
V
S
 
Q
T
 
H
L
 
L
N
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
Q
 
M
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
V
|
V
P
|
P
E
 
E
T
 
N
A
 
P
A
x
S
T
|
T
H
 
K
G
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
S
T
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
 
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
I
D
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
S
G
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
F
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
P
F
 
F
V
 
T
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
G
 
E
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
S
T
 
T
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
R
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
K
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
T
 
N
G
 
G
S
 
S
T
 
T
M
 
L
G
 
S
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
F
P
 
P
E
 
E
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
L
R
 
H
P
 
-
T
 
G
G
 
G
T
 
R
R
 
R
F
 
L
I
 
M
Q
 
H
I
 
I
H
 
H
R
 
E
N
 
N
L
 
R
P
 
P
G
 
G
M
 
V
L
 
L
G
 
T
R
 
A
L
 
L
N
 
N
E
 
K
V
 
I
L
 
F
A
 
A
R
 
E
H
 
Q
S
 
G
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
E
 
Q
T
 
T
Y
 
S
A
 
A
D
 
Q
V
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
I
D
 
E
A
 
A
S
 
D
T
 
E
A
 
D
D
 
V
S
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
A
I
 
M
R
 
K
E
 
A
I
 
I
E
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
48% identity, 98% coverage: 4:418/422 of query aligns to 39:466/466 of P87228

query
sites
P87228
S
 
S
H
 
Y
S
 
S
P
 
Q
T
 
A
P
 
P
H
 
A
L
 
R
S
 
T
L
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
F
S
 
A
K
 
S
D
 
E
K
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
N
V
 
V
N
 
N
D
 
Q
S
 
S
A
 
A
V
 
L
E
 
S
L
 
N
L
 
L
T
 
K
N
 
D
A
 
E
G
 
G
Y
 
Y
T
 
-
N
 
Q
L
 
V
T
 
E
R
 
F
L
 
L
P
 
K
K
 
T
A
 
S
L
 
M
D
x
S
G
 
E
D
 
D
A
 
D
L
 
L
K
 
V
E
 
E
A
 
K
I
 
I
K
 
K
G
 
G
V
 
V
H
 
H
I
 
A
L
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
S
R
 
K
T
 
T
Q
 
R
I
 
L
T
 
T
P
 
R
D
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
V
I
 
I
G
 
G
C
 
C
F
 
F
S
 
C
V
 
I
G
 
G
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
F
S
 
A
R
 
A
I
 
E
S
 
R
G
 
G
V
 
I
P
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
N
A
 
S
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
N
 
N
T
 
S
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
Y
I
 
I
V
 
I
M
 
S
L
 
L
L
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
V
P
 
G
T
 
D
R
 
R
S
 
S
H
 
L
A
 
E
A
 
L
H
 
H
E
 
R
G
 
G
R
 
E
W
 
W
D
 
N
K
 
K
S
 
V
A
 
S
T
 
S
N
 
G
S
 
C
V
 
W
E
 
E
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
N
 
H
I
 
I
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
G
L
 
L
K
 
H
V
 
V
I
 
V
F
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
H
 
I
T
 
L
D
 
P
K
 
I
L
 
M
R
 
P
H
 
L
G
 
G
Q
 
S
A
 
A
E
 
K
P
 
Q
V
 
L
S
 
S
T
 
S
L
 
L
N
 
P
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
H
Q
 
R
S
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
V
 
V
P
 
P
E
 
A
T
x
S
A
 
P
A
 
E
T
 
T
H
 
K
G
 
N
M
 
M
I
 
I
G
 
S
R
 
S
A
 
K
E
 
E
I
 
F
A
 
A
T
 
A
M
 
M
K
 
K
P
 
E
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
I
D
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
S
K
 
K
A
 
S
G
 
G
H
 
K
L
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
P
 
P
V
 
S
E
 
E
P
 
P
G
 
A
S
 
G
N
 
N
A
 
G
-
 
K
E
 
D
R
 
K
F
 
F
V
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
W
-
 
T
S
 
S
P
 
E
L
 
L
Q
 
T
G
 
H
L
 
C
D
 
K
N
 
N
V
 
I
I
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
Y
R
 
N
I
 
I
G
 
G
A
 
I
E
 
E
V
 
V
A
 
S
R
 
E
K
 
A
L
 
L
V
 
T
D
 
R
Y
 
Y
S
 
I
D
 
N
T
 
E
G
 
G
S
 
N
T
 
S
M
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
F
P
 
P
E
 
E
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
T
P
 
E
A
 
A
R
 
D
P
 
R
T
 
N
G
 
A
T
 
A
R
 
R
F
 
V
I
 
L
Q
 
F
I
 
V
H
 
H
R
 
R
N
 
N
L
 
V
P
 
P
G
 
G
M
 
V
L
 
L
G
 
R
R
 
Q
L
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
L
L
 
F
A
 
I
R
 
D
H
 
H
S
 
-
V
 
-
N
 
N
I
 
I
A
 
K
A
 
S
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
S
E
 
D
T
 
S
Y
 
R
A
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
A
Y
 
Y
V
 
L
V
 
V
L
 
A
D
 
D
-
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
C
S
 
T
T
 
P
A
 
G
D
 
S
S
 
L
Q
 
E
S
 
A
V
 
L
L
 
H
A
 
Q
D
 
K
I
 
L
R
 
E
E
 
S
I
 
L
E
 
P
G
 
C
T
 
K
I
 
I
R
 
N
A
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
39% identity, 72% coverage: 18:320/422 of query aligns to 1:299/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
I
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
A
E
 
A
G
 
P
V
 
L
N
 
H
D
 
E
S
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
Q
L
 
V
L
 
L
T
 
K
N
 
D
A
 
A
G
 
G
Y
 
L
T
 
E
N
 
V
L
 
I
T
 
Y
R
 
E
L
 
-
P
 
-
K
 
E
A
 
Y
L
 
P
D
 
D
G
 
E
D
 
D
A
 
R
L
 
L
K
 
V
E
 
E
A
 
L
I
 
V
K
 
K
G
 
D
V
 
V
H
 
E
I
 
A
L
 
I
G
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
K
T
 
P
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
P
 
R
D
 
R
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
D
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
K
A
 
V
I
 
I
G
 
A
C
 
R
F
 
A
S
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
L
N
 
D
Q
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
K
I
 
E
S
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
E
V
 
V
F
 
V
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
A
S
 
A
N
x
S
T
 
S
R
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
L
I
 
M
V
 
F
M
 
S
L
 
V
L
 
A
R
 
R
R
 
K
I
 
I
P
 
A
T
 
F
R
 
A
S
 
D
H
 
R
A
 
K
A
 
M
H
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
V
W
 
W
D
 
A
K
 
K
S
 
K
A
 
E
T
 
A
N
 
M
S
 
G
V
 
I
E
 
E
V
 
L
R
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
Y
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
Y
Q
 
Q
L
 
V
S
 
A
I
 
K
L
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
M
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
N
V
 
I
I
 
L
F
 
L
Y
|
Y
D
|
D
-
x
P
H
 
Y
T
 
P
D
 
N
K
 
E
L
 
E
R
 
R
H
 
A
G
 
K
Q
 
E
A
 
V
E
 
N
-
 
G
P
 
K
V
 
F
S
 
V
T
 
D
L
 
L
N
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
V
|
V
P
|
P
E
 
L
T
 
V
A
 
E
A
 
S
T
|
T
H
 
Y
G
 
H
M
 
L
I
 
I
G
 
N
R
 
E
A
 
E
E
 
R
I
 
L
A
 
K
T
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
G
 
T
A
 
A
Y
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
G
T
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
G
 
G
H
 
W
L
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
P
 
E
V
 
E
E
|
E
P
 
P
G
 
L
S
 
P
N
 
K
A
 
D
E
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
S
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
T
G
 
K
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
E
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
R
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
K
L
 
V
V
 
V

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
33% identity, 75% coverage: 19:333/422 of query aligns to 8:317/533 of O43175

query
sites
O43175
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
S
E
 
D
G
 
S
V
 
L
N
 
D
D
 
P
S
 
C
A
 
C
V
 
R
E
 
K
L
 
I
L
 
L
T
 
Q
N
 
D
A
 
G
G
 
G
Y
 
L
T
 
Q
N
 
V
L
 
V
T
 
E
R
 
K
L
 
-
P
 
-
K
 
Q
A
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
I
E
 
A
A
 
E
I
 
L
K
 
Q
G
 
D
V
 
C
H
 
E
I
 
G
L
 
L
G
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
P
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
Q
A
 
V
I
 
V
G
 
G
C
 
R
F
 
A
S
 
G
V
x
T
G
 
G
T
 
V
N
 
D
Q
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
T
I
 
R
S
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
L
V
 
V
F
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
F
 
N
S
 
G
N
 
N
T
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
G
 
G
E
 
M
I
 
I
V
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
 
Q
R
 
A
S
 
T
H
 
A
A
 
S
A
 
M
H
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
D
 
E
K
x
R
S
 
K
A
 
K
T
 
F
N
 
M
S
 
G
V
 
T
E
 
E
V
 
L
R
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
R
Q
 
E
L
 
V
S
 
A
I
 
T
L
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
M
 
F
G
 
G
L
 
M
K
 
K
V
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
 
Y
D
|
D
H
 
P
T
 
I
D
 
I
K
 
S
L
 
P
R
 
E
H
 
V
G
 
S
Q
 
A
A
 
S
E
 
F
P
 
G
V
 
V
S
 
Q
T
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
N
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
 
P
E
 
L
T
 
L
A
 
P
A
 
S
T
 
T
H
 
T
G
 
G
M
 
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
A
 
N
E
 
T
I
 
F
A
 
A
T
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
T
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
P
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
G
 
P
S
 
R
N
 
D
A
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
S
 
R
P
 
A
L
 
L
Q
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
x
L
G
|
G
G
x
A
S
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
R
 
R
I
 
C
G
 
G
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
K
 
Q
L
 
F
V
 
V
D
 
D
Y
 
M
S
 
V
D
 
K
T
 
G
G
 
K
S
 
S
T
 
L
M
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
V
N
 
N

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
39% identity, 64% coverage: 50:319/422 of query aligns to 32:298/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
D
 
D
G
 
R
D
 
D
A
 
K
L
 
L
K
 
L
E
 
A
A
 
A
I
 
V
K
 
P
G
 
E
V
 
A
H
 
D
I
 
A
L
 
L
G
 
L
I
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
T
I
 
V
T
 
D
P
 
A
D
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
K
A
 
I
I
 
V
G
 
A
C
x
R
F
 
A
S
 
G
V
|
V
G
 
G
T
 
L
N
 
D
Q
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
T
I
 
A
S
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
L
V
 
V
F
 
V
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
T
S
 
S
N
|
N
T
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
V
 
A
I
 
L
G
 
A
E
 
L
I
 
L
V
 
L
M
 
A
L
 
A
L
 
S
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
 
A
R
 
A
S
 
D
H
 
A
A
 
S
A
 
L
H
 
R
E
 
E
G
 
H
R
 
T
W
 
W
D
 
K
K
 
R
S
 
S
A
 
S
T
 
F
N
 
S
S
 
G
V
 
T
E
 
E
V
 
I
R
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
Q
Q
 
L
L
 
V
S
 
A
I
 
Q
L
 
R
A
 
I
E
 
A
A
 
A
M
 
F
G
 
G
L
 
A
K
 
Y
V
 
V
I
 
V
F
 
A
Y
 
Y
D
 
D
-
 
P
H
 
Y
T
 
V
D
 
S
K
 
P
L
 
A
R
 
R
H
 
A
G
 
A
Q
 
Q
-
 
L
A
 
G
E
 
I
P
 
E
V
 
L
S
 
L
T
 
S
L
 
L
N
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
S
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
L
P
 
P
E
 
K
T
 
T
A
 
P
A
 
E
T
 
T
H
 
A
G
 
G
M
 
L
I
 
I
G
 
D
R
 
K
A
 
E
E
 
A
I
 
L
A
 
A
T
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
V
Y
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
 
A
S
 
A
R
|
R
G
 
G
T
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
K
 
T
A
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
P
 
A
V
 
T
E
|
E
P
 
P
G
 
C
S
 
T
N
 
D
A
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
F
G
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
I
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
G
x
A
S
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
|
Q
E
 
D
R
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
E
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
S
L
 
V

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
39% identity, 64% coverage: 50:319/422 of query aligns to 31:297/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
D
 
D
G
 
R
D
 
D
A
 
K
L
 
L
K
 
L
E
 
A
A
 
A
I
 
V
K
 
P
G
 
E
V
 
A
H
 
D
I
 
A
L
 
L
G
 
L
I
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
T
I
 
V
T
 
D
P
 
A
D
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
K
A
 
I
I
 
V
G
 
A
C
 
R
F
 
A
S
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
L
N
 
D
Q
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
T
I
 
A
S
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
L
V
 
V
F
 
V
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
T
S
 
S
N
|
N
T
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
V
 
A
I
 
L
G
 
A
E
 
L
I
 
L
V
 
L
M
 
A
L
 
A
L
 
S
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
 
A
R
 
A
S
 
D
H
 
A
A
 
S
A
 
L
H
 
R
E
 
E
G
 
H
R
 
T
W
 
W
D
 
K
K
 
R
S
 
S
A
 
S
T
 
F
N
 
S
S
 
G
V
 
T
E
 
E
V
 
I
R
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
Q
Q
 
L
L
 
V
S
 
A
I
 
Q
L
 
R
A
 
I
E
 
A
A
 
A
M
 
F
G
 
G
L
 
A
K
 
Y
V
 
V
I
 
V
F
 
A
Y
 
Y
D
 
D
-
 
P
H
 
Y
T
 
V
D
 
S
K
 
P
L
 
A
R
 
R
H
 
A
G
 
A
Q
 
Q
-
 
L
A
 
G
E
 
I
P
 
E
V
 
L
S
 
L
T
 
S
L
 
L
N
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
S
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
L
P
 
P
E
 
K
T
 
T
A
 
P
A
 
E
T
 
T
H
 
A
G
 
G
M
 
L
I
 
I
G
 
D
R
 
K
A
 
E
E
 
A
I
 
L
A
 
A
T
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
V
Y
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
 
A
S
 
A
R
|
R
G
 
G
T
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
K
 
T
A
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
P
 
A
V
 
T
E
|
E
P
 
P
G
 
C
S
 
T
N
 
D
A
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
S
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
F
G
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
I
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
R
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
E
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
S
L
 
V

Sites not aligning to the query:

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
33% identity, 72% coverage: 19:322/422 of query aligns to 3:301/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
S
E
 
D
G
 
S
V
 
L
N
 
D
D
 
P
S
 
C
A
 
C
V
 
R
E
 
K
L
 
I
L
 
L
T
 
Q
N
 
D
A
 
G
G
 
G
Y
 
L
T
 
Q
N
 
V
L
 
V
T
 
E
R
 
K
L
 
-
P
 
-
K
 
Q
A
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
I
E
 
A
A
 
E
I
 
L
K
 
Q
G
 
D
V
 
C
H
 
E
I
 
G
L
 
L
G
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
P
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
Q
A
 
V
I
 
V
G
 
G
C
 
R
F
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
N
 
D
Q
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
T
I
 
R
S
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
L
V
 
V
F
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
F
 
N
S
 
G
N
 
N
T
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
G
 
G
E
 
M
I
 
I
V
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
 
Q
R
 
A
S
 
T
H
 
A
A
 
S
A
 
M
H
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
A
 
K
T
 
F
N
 
M
S
 
G
V
 
T
E
 
E
V
 
L
R
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
Q
 
E
L
 
V
S
 
A
I
 
T
L
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
M
 
F
G
 
G
L
 
M
K
 
K
V
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
H
x
P
T
 
I
D
x
I
K
 
S
L
 
P
R
 
E
H
 
V
G
 
S
Q
 
A
A
 
S
E
 
F
P
 
G
V
 
V
S
 
Q
T
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
N
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
E
 
L
T
 
L
A
 
P
A
 
S
T
 
T
H
 
T
G
 
G
M
x
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
A
 
N
E
 
T
I
 
F
A
 
A
T
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
P
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
G
 
P
S
 
R
N
 
D
A
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
S
 
R
P
 
A
L
 
L
Q
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
R
 
R
I
 
C
G
 
G
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
K
 
Q
L
 
F
V
 
V
D
 
D
Y
 
M

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
33% identity, 72% coverage: 19:322/422 of query aligns to 4:302/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
S
E
 
D
G
 
S
V
 
L
N
 
D
D
 
P
S
 
C
A
 
C
V
 
R
E
 
K
L
 
I
L
 
L
T
 
Q
N
 
D
A
 
G
G
 
G
Y
 
L
T
 
Q
N
 
V
L
 
V
T
 
E
R
 
K
L
 
-
P
 
-
K
 
Q
A
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
I
E
 
A
A
 
E
I
 
L
K
 
Q
G
 
D
V
 
C
H
 
E
I
 
G
L
 
L
G
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
P
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
Q
A
 
V
I
 
V
G
 
G
C
 
R
F
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
N
 
D
Q
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
T
I
 
R
S
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
L
V
 
V
F
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
F
 
N
S
 
G
N
 
N
T
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
G
 
G
E
 
M
I
 
I
V
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
 
Q
R
 
A
S
 
T
H
 
A
A
 
S
A
 
M
H
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
A
 
K
T
 
F
N
 
M
S
 
G
V
 
T
E
 
E
V
 
L
R
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
Q
 
E
L
 
V
S
 
A
I
 
T
L
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
M
 
F
G
 
G
L
 
M
K
 
K
V
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
H
x
P
T
 
I
D
 
I
K
 
S
L
 
P
R
 
E
H
 
V
G
 
S
Q
 
A
A
 
S
E
 
F
P
 
G
V
 
V
S
 
Q
T
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
|
L
N
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
E
 
L
T
 
L
A
 
P
A
 
S
T
 
T
H
 
T
G
 
G
M
x
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
A
 
N
E
 
T
I
 
F
A
 
A
T
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
P
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
G
 
P
S
 
R
N
 
D
A
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
S
 
R
P
 
A
L
 
L
Q
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
R
 
R
I
 
C
G
 
G
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
K
 
Q
L
 
F
V
 
V
D
 
D
Y
 
M

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
33% identity, 72% coverage: 19:322/422 of query aligns to 3:301/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
S
E
 
D
G
 
S
V
 
L
N
 
D
D
 
P
S
 
C
A
 
C
V
 
R
E
 
K
L
 
I
L
 
L
T
 
Q
N
 
D
A
 
G
G
 
G
Y
 
L
T
 
Q
N
 
V
L
 
V
T
 
E
R
 
K
L
 
-
P
 
-
K
 
Q
A
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
I
E
 
A
A
 
E
I
 
L
K
 
Q
G
 
D
V
 
C
H
 
E
I
 
G
L
 
L
G
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
P
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
Q
A
 
V
I
 
V
G
 
G
C
 
R
F
 
A
S
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
N
 
D
Q
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
T
I
 
R
S
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
L
V
 
V
F
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
F
 
N
S
 
G
N
 
N
T
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
G
 
G
E
 
M
I
 
I
V
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
 
Q
R
 
A
S
 
T
H
 
A
A
 
S
A
 
M
H
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
A
 
K
T
 
F
N
 
M
S
 
G
V
 
T
E
 
E
V
 
L
R
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
|
G
Y
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
|
G
S
 
R
Q
 
E
L
 
V
S
 
A
I
 
T
L
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
M
 
F
G
 
G
L
 
M
K
 
K
V
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
 
Y
D
|
D
H
 
P
T
 
I
D
 
I
K
 
S
L
 
P