SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_049795410.1 NCBI__GCF_000015165.1:WP_049795410.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
41% identity, 90% coverage: 16:297/315 of query aligns to 2:285/292 of Q07607

query
sites
Q07607
L
 
F
A
 
E
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
T
D
 
A
I
 
L
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
-
 
A
-
 
D
D
 
D
R
 
R
S
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
I
D
 
D
I
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
H
R
 
D
L
 
L
C
 
V
E
 
E
R
 
W
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
F
A
 
G
I
 
L
L
 
V
V
 
P
C
 
C
E
 
G
T
 
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
 
P
T
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
K
A
 
S
E
 
E
R
 
H
E
 
E
A
 
Q
V
 
V
I
 
V
R
 
E
T
 
I
A
 
T
V
 
I
T
 
K
V
 
T
A
 
A
C
 
N
N
 
G
R
 
R
I
 
V
H
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
N
 
N
S
 
S
T
 
T
L
 
A
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
N
 
F
T
 
V
R
 
R
Q
 
H
A
 
A
A
 
Q
A
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
V
M
 
L
S
 
I
V
 
V
V
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
D
D
 
A
A
 
A
T
 
S
A
 
T
L
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
V
H
 
Y
D
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
A
R
 
I
G
 
E
L
 
I
P
 
H
D
 
V
E
 
E
T
 
T
L
 
L
I
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
F
Q
 
E
W
 
D
A
 
C
Q
 
P
F
 
N
I
 
V
-
 
K
G
 
G
L
 
V
R
x
K
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
N
I
 
L
A
 
L
R
 
R
V
 
P
V
 
S
H
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
M
R
 
A
V
 
C
P
 
G
L
 
E
G
 
D
F
 
F
R
 
N
L
 
L
L
 
L
-
 
T
G
 
G
D
 
E
D
 
D
L
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
G
Y
 
Y
A
 
M
A
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
G
D
 
H
G
 
G
C
 
C
F
 
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
C
 
C
N
 
A
A
 
D
L
 
F
L
 
Q
E
 
Q
S
 
A
C
 
C
R
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
D
W
 
F
R
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
L
R
 
K
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
M
Q
 
P
L
 
L
S
 
H
E
 
R
A
 
A
T
 
L
S
 
F
R
 
L
E
 
E
L
 
T
-
 
N
P
 
P
A
 
A
A
 
G
L
 
A
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
L
 
R
Q
 
L
G
 
G
L
 
R
A
 
M
M
 
R
P
 
G
H
 
D
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
V
E
 
T
L
 
I
D
 
S
Q
 
P
P
 
S
A
 
F
Q
 
Q
A
 
E
M
 
E
V
 
I
A
 
D
Q
 
D
A
 
A
M
 
M

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
38% identity, 86% coverage: 16:285/315 of query aligns to 2:273/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
L
 
I
A
 
Q
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
 
A
I
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
R
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
W
A
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
C
 
V
E
 
E
R
 
W
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
L
 
V
V
 
A
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
E
 
T
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
R
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
T
 
R
V
 
V
A
 
A
C
 
N
N
 
K
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
L
 
R
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
N
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
M
 
L
S
 
L
V
 
V
V
x
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
x
N
C
x
V
P
|
P
A
 
G
R
|
R
T
|
T
G
 
G
R
 
V
G
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
I
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
W
 
I
A
 
P
Q
 
N
F
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
L
V
 
I
V
 
D
H
 
A
L
 
L
R
 
N
A
 
G
R
 
K
V
 
M
P
 
A
L
 
V
G
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
Y
L
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
W
A
 
E
Y
 
L
A
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
D
G
 
G
C
 
N
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
L
 
A
C
 
M
N
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
E
 
A
S
 
V
C
 
A
R
 
I
R
 
A
G
 
K
R
 
D
W
 
E
R
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
H
 
N
Q
 
N
Q
 
K
L
 
I
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
S
 
H
E
 
N
A
 
I
T
 
L
S
 
F
R
 
C
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
D
P
 
T
H
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
E
 
P
L
 
L

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
38% identity, 86% coverage: 16:285/315 of query aligns to 2:273/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
L
 
I
A
 
Q
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
x
A
I
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
R
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
W
A
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
C
 
V
E
 
E
R
 
W
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
L
 
V
V
 
A
C
 
V
E
x
G
T
|
T
A
x
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
E
 
T
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
R
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
T
 
R
V
 
V
A
 
A
C
 
N
N
 
K
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
L
 
R
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
N
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
M
x
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
G
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
I
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
W
 
I
A
 
P
Q
 
N
F
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
L
V
 
I
V
 
D
H
 
A
L
 
L
R
 
N
A
 
G
R
 
K
V
 
M
P
 
A
L
 
V
G
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
Y
L
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
W
A
 
E
Y
 
L
A
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
D
G
 
G
C
 
N
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
L
 
A
C
 
M
N
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
E
 
A
S
 
V
C
 
A
R
 
I
R
 
A
G
 
K
R
 
D
W
 
E
R
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
H
 
N
Q
 
N
Q
 
K
L
 
I
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
S
 
H
E
 
N
A
 
I
T
 
L
S
 
F
R
 
C
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
D
P
 
T
H
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
E
 
P
L
 
L

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
38% identity, 86% coverage: 16:285/315 of query aligns to 2:273/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
L
 
I
A
 
Q
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
x
A
I
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
R
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
W
A
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
C
 
V
E
 
E
R
 
W
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
L
 
V
V
 
A
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
x
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
E
 
T
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
R
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
T
 
R
V
 
V
A
 
A
C
 
N
N
 
K
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
L
 
R
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
N
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
M
 
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
G
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
I
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
W
 
I
A
 
P
Q
 
N
F
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
L
V
 
I
V
 
D
H
 
A
L
 
L
R
 
N
A
 
G
R
 
K
V
 
M
P
 
A
L
 
V
G
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
Y
L
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
W
A
 
E
Y
 
L
A
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
D
G
 
G
C
 
N
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
L
 
A
C
 
M
N
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
E
 
A
S
 
V
C
 
A
R
 
I
R
 
A
G
 
K
R
 
D
W
 
E
R
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
H
 
N
Q
 
N
Q
 
K
L
 
I
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
S
 
H
E
 
N
A
 
I
T
 
L
S
 
F
R
 
C
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
D
P
 
T
H
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
E
 
P
L
 
L

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
38% identity, 86% coverage: 16:285/315 of query aligns to 2:273/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
L
 
I
A
 
Q
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
 
A
I
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
R
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
W
A
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
C
 
V
E
 
E
R
 
W
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
L
 
V
V
 
A
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
 
T
L
|
L
T
 
S
A
 
M
A
 
E
E
 
E
R
x
H
E
 
T
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
R
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
T
 
R
V
 
V
A
 
A
C
 
N
N
 
K
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
L
 
R
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
N
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
M
 
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
G
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
I
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
W
 
I
A
 
P
Q
 
N
F
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
L
V
 
I
V
 
D
H
 
A
L
 
L
R
 
N
A
 
G
R
 
K
V
 
M
P
 
A
L
 
V
G
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
Y
L
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
W
A
 
E
Y
 
L
A
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
D
G
 
G
C
 
N
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
L
 
A
C
 
M
N
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
E
 
A
S
 
V
C
 
A
R
 
I
R
 
A
G
 
K
R
 
D
W
 
E
R
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
H
 
N
Q
 
N
Q
 
K
L
 
I
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
S
 
H
E
 
N
A
 
I
T
 
L
S
 
F
R
 
C
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
D
P
 
T
H
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
E
 
P
L
 
L

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
38% identity, 86% coverage: 16:285/315 of query aligns to 2:273/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
L
 
I
A
 
Q
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
 
A
I
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
R
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
W
A
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
C
 
V
E
 
E
R
 
W
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
L
 
V
V
 
A
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
E
 
T
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
R
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
T
 
R
V
 
V
A
 
A
C
 
N
N
 
K
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
L
 
R
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
N
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
M
 
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
G
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
I
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
W
 
I
A
 
P
Q
 
N
F
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
L
V
 
I
V
 
D
H
 
A
L
 
L
R
 
N
A
 
G
R
 
K
V
 
M
P
 
A
L
 
V
G
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
Y
L
 
S
G
|
G
D
 
D
D
 
D
L
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
W
A
 
E
Y
 
L
A
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
D
G
 
G
C
 
N
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
L
 
A
C
 
M
N
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
E
 
A
S
 
V
C
 
A
R
 
I
R
 
A
G
 
K
R
 
D
W
 
E
R
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
H
 
N
Q
 
N
Q
 
K
L
 
I
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
S
 
H
E
 
N
A
 
I
T
 
L
S
x
F
R
 
C
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
D
P
 
T
H
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
E
 
P
L
 
L

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
38% identity, 86% coverage: 16:285/315 of query aligns to 2:273/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
L
 
I
A
 
Q
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
 
A
I
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
R
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
W
A
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
C
 
V
E
 
E
R
 
W
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
I
 
I
L
 
V
V
 
A
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
E
 
T
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
R
 
K
T
 
E
A
 
I
V
 
I
T
 
R
V
 
V
A
 
A
C
 
N
N
 
K
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
L
 
R
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
N
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
M
 
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
V
G
 
D
L
 
L
P
 
S
D
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
I
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
W
 
I
A
 
P
Q
 
N
F
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
P
R
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
L
V
 
I
V
 
D
H
 
A
L
 
L
R
 
N
A
 
G
R
 
K
V
 
M
P
 
A
L
 
V
G
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
Y
L
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
W
A
 
E
Y
 
L
A
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
D
G
 
G
C
 
N
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
L
 
A
C
 
M
N
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
E
 
A
S
 
V
C
 
A
R
 
I
R
 
A
G
 
K
R
 
D
W
 
E
R
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
L
H
 
N
Q
 
N
Q
 
K
L
 
I
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
S
 
H
E
 
N
A
 
I
T
 
L
S
x
F
R
 
C
E
 
E
L
 
S
-
x
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
D
P
 
T
H
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
E
 
P
L
 
L

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
38% identity, 87% coverage: 15:289/315 of query aligns to 1:278/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
W
 
M
L
 
F
A
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
P
D
 
A
I
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
T
R
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
D
I
 
E
A
 
Q
A
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
A
L
 
H
C
 
V
E
 
E
R
 
W
Q
 
Q
I
 
I
E
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
N
A
 
G
I
 
L
L
 
V
V
 
P
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
x
P
T
 
T
L
|
L
T
 
S
A
 
H
A
 
D
E
 
E
R
x
H
E
 
K
A
 
R
V
 
V
I
 
V
R
 
E
T
 
L
A
 
C
V
 
I
T
 
E
V
 
V
A
 
A
C
 
A
N
 
K
R
 
R
I
 
V
H
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
N
T
 
T
L
 
D
Q
x
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
N
 
L
T
 
A
R
 
L
Q
 
H
A
 
A
A
 
Q
A
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
M
 
L
S
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
K
G
 
G
I
 
L
Y
 
F
A
 
A
H
 
H
F
 
F
R
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
K
L
 
L
P
 
P
I
 
I
I
 
V
L
 
I
H
x
Y
D
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
P
R
|
R
T
 
S
G
 
V
R
 
V
G
 
D
L
 
M
P
 
S
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
M
I
 
G
R
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
-
 
A
W
 
H
A
 
K
Q
 
N
F
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
V
R
x
K
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
K
I
 
L
A
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
S
H
 
E
L
 
Q
R
 
R
A
 
I
R
 
S
V
 
C
P
 
G
L
 
K
G
 
D
F
 
F
-
 
I
R
 
Q
L
 
L
L
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
L
 
S
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
G
Y
 
F
A
 
N
A
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
G
D
 
V
G
 
G
C
 
C
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
S
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
Q
 
R
L
 
L
C
 
C
N
 
S
A
 
E
L
 
F
L
 
Q
E
 
A
S
 
A
C
 
M
R
 
L
R
 
A
G
 
G
R
 
D
W
 
Y
R
 
A
T
 
K
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
Y
H
 
Q
Q
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
M
Q
 
P
L
 
L
S
 
H
E
 
R
A
 
A
T
 
I
S
 
F
R
 
M
E
 
E
L
 
-
P
 
P
A
 
G
-
 
V
-
 
C
A
 
G
L
 
T
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
K
Q
 
T
G
 
R
L
 
G
A
 
C
M
 
N
P
 
R
H
 
K
V
 
V
R
 
R
L
 
S
P
 
P
L
 
L
T
 
M
E
 
S
L
 
T
D
 
L
Q
 
E
P
 
P
A
 
A

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
38% identity, 87% coverage: 15:289/315 of query aligns to 1:278/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
W
 
M
L
 
F
A
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
P
D
 
A
I
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
T
R
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
E
A
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
A
L
 
H
C
 
V
E
 
E
R
 
W
Q
 
Q
I
 
I
E
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
N
A
 
G
I
 
L
L
 
V
V
 
P
C
 
V
E
 
G
T
 
T
A
x
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
x
P
T
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
H
A
 
D
E
 
E
R
x
H
E
 
K
A
 
R
V
 
V
I
 
V
R
 
E
T
 
L
A
 
C
V
 
I
T
 
E
V
 
V
A
 
A
C
 
A
N
 
K
R
 
R
I
 
V
H
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
N
T
 
T
L
 
D
Q
x
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
N
 
L
T
 
A
R
 
L
Q
 
H
A
 
A
A
 
Q
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
M
 
L
S
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
K
G
 
G
I
 
L
Y
 
F
A
 
A
H
 
H
F
 
F
R
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
K
L
 
L
P
 
P
I
 
I
I
 
V
L
 
I
H
 
Y
D
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
P
R
 
R
T
 
S
G
 
V
R
 
V
G
 
D
L
 
M
P
 
S
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
M
I
 
G
R
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
-
 
A
W
 
H
A
 
K
Q
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
V
R
x
K
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
K
I
 
L
A
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
S
H
 
E
L
 
Q
R
 
R
A
 
I
R
 
S
V
 
C
P
 
G
L
 
K
G
 
D
F
 
F
-
 
V
R
 
Q
L
 
L
L
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
L
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
G
Y
 
F
A
 
N
A
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
G
D
 
V
G
 
G
C
 
C
F
 
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
Q
 
R
L
 
L
C
 
C
N
 
S
A
 
E
L
 
F
L
 
Q
E
 
A
S
 
A
C
 
M
R
 
L
R
 
A
G
 
G
R
 
D
W
 
Y
R
 
A
T
 
K
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
Y
H
 
Q
Q
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
M
Q
 
P
L
 
L
S
 
H
E
 
R
A
 
A
T
 
I
S
 
F
R
 
M
E
 
E
L
 
-
P
 
P
A
 
G
-
 
V
-
 
C
A
 
G
L
 
T
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
K
Q
 
T
G
 
R
L
 
G
A
 
G
M
 
N
P
 
R
H
 
R
V
 
V
R
 
R
L
 
S
P
 
P
L
 
L
T
 
M
E
 
S
L
 
T
D
 
L
Q
 
E
P
 
P
A
 
A

4pfmA Shewanella benthica dhdps with lysine and pyruvate
36% identity, 90% coverage: 15:297/315 of query aligns to 2:287/295 of 4pfmA

query
sites
4pfmA
W
 
M
L
 
I
A
 
N
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
 
A
I
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
L
D
 
N
R
 
S
S
 
D
G
 
G
A
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
Y
A
 
T
A
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
C
 
V
E
 
E
R
 
Y
Q
 
H
I
 
I
E
 
T
A
 
E
G
 
G
A
 
T
S
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
A
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
T
 
P
A
 
I
A
 
S
E
 
E
R
x
H
E
 
I
A
 
A
V
 
V
I
 
V
R
 
G
T
 
Q
A
 
T
V
 
V
T
 
K
V
 
F
A
 
A
C
 
S
N
 
G
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
G
G
 
G
A
 
N
G
 
G
S
 
A
N
|
N
S
 
A
T
 
T
L
 
A
Q
x
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
N
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
A
A
 
Q
A
 
N
A
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
A
A
 
A
I
 
M
M
 
L
S
 
G
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
S
A
 
P
E
 
K
G
 
G
I
 
L
Y
 
I
A
 
A
H
 
H
F
 
Y
R
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
A
D
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
D
L
 
I
P
 
P
I
 
Q
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
A
R
 
V
G
 
D
L
 
M
P
 
L
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
I
I
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
W
 
V
A
 
P
Q
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
V
R
x
K
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
K
H
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
D
R
 
L
V
 
C
P
 
G
L
 
N
G
 
D
F
 
F
R
 
L
L
 
L
L
 
Y
-
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
R
A
 
E
Y
 
F
A
 
L
A
 
T
A
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
C
 
V
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
N
N
 
N
I
 
I
A
 
V
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
C
 
F
N
 
K
A
 
L
L
 
M
L
 
C
E
 
D
S
 
A
C
 
A
R
 
L
R
 
A
G
 
G
R
 
D
W
 
T
R
 
Q
T
 
A
A
 
A
R
 
M
R
 
A
L
 
A
H
 
E
Q
 
D
Q
 
Q
L
 
I
L
 
K
Q
 
G
L
 
L
S
 
F
E
 
S
A
 
A
T
 
L
S
 
F
R
 
C
E
 
E
L
 
A
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
A
S
 
H
L
 
K
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
-
 
I
A
 
S
M
 
Q
P
 
G
H
 
D
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
E
 
E
L
 
L
D
 
S
Q
 
T
P
 
E
A
 
F
Q
 
H
A
 
G
M
 
L
V
 
L
A
 
L
Q
 
D
A
 
A
M
 
M

3s8hA Structure of dihydrodipicolinate synthase complexed with 3- hydroxypropanoic acid(hpa)at 2.70 a resolution
40% identity, 90% coverage: 16:297/315 of query aligns to 2:285/292 of 3s8hA

query
sites
3s8hA
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
M
A
 
V
D
x
A
I
x
L
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
D
R
 
A
S
 
Q
G
 
G
A
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
W
A
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
K
L
 
L
C
 
V
E
 
D
R
 
F
Q
 
H
I
 
L
E
 
Q
A
 
D
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
A
I
 
I
L
x
V
V
 
A
C
 
V
E
x
G
T
|
T
A
x
T
G
|
G
E
 
E
A
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
D
A
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
H
E
 
I
A
 
Q
V
 
V
I
 
V
R
 
R
T
 
R
A
 
V
V
 
V
T
 
D
V
 
Q
A
 
V
C
 
K
N
 
G
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
L
 
R
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
N
 
L
T
 
T
R
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
S
A
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
C
M
 
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
M
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
R
 
R
A
 
H
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
I
P
 
P
I
 
Q
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
S
R
 
C
G
 
D
L
 
M
P
 
L
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
I
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
W
 
V
A
 
P
Q
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
E
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
Q
R
 
R
V
 
A
V
 
K
H
 
E
L
 
V
R
 
I
A
 
E
R
 
R
V
 
V
P
 
G
L
 
K
G
 
D
F
 
F
R
 
L
L
 
V
L
 
Y
-
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
E
Y
 
L
A
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
K
G
 
G
C
 
N
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
Q
 
R
L
 
A
C
 
M
N
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
C
E
 
A
S
 
A
C
 
A
R
 
M
R
 
R
G
 
G
R
 
D
W
 
A
R
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
A
L
 
I
H
 
N
Q
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
M
Q
 
P
L
 
L
S
 
H
E
 
K
A
 
A
T
 
L
S
 
F
R
 
I
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
P
P
 
E
H
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
E
 
W
L
 
L
D
 
S
Q
 
P
P
 
H
A
 
C
Q
 
H
A
 
D
M
 
P
V
 
L
A
 
R
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M

3puoA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from pseudomonas aeruginosa(psdhdps)complexed with l-lysine at 2.65a resolution (see paper)
40% identity, 90% coverage: 16:297/315 of query aligns to 2:285/292 of 3puoA

query
sites
3puoA
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
M
A
 
V
D
 
A
I
 
L
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
D
R
 
A
S
 
Q
G
 
G
A
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
W
A
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
K
L
 
L
C
 
V
E
 
D
R
 
F
Q
 
H
I
 
L
E
 
Q
A
 
D
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
A
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
T
x
D
A
x
V
A
 
E
E
 
E
R
 
H
E
 
I
A
 
Q
V
 
V
I
 
V
R
 
R
T
 
R
A
 
V
V
 
V
T
 
D
V
 
Q
A
 
V
C
 
K
N
 
G
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
L
 
R
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
N
 
L
T
 
T
R
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
S
A
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
C
M
 
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
M
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
R
 
R
A
 
H
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
I
P
 
P
I
 
Q
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
S
R
 
C
G
 
D
L
 
M
P
 
L
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
I
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
W
 
V
A
 
P
Q
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
E
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
Q
R
 
R
V
 
A
V
 
K
H
 
E
L
 
V
R
 
I
A
 
E
R
 
R
V
 
V
P
 
G
L
 
K
G
 
D
F
 
F
R
 
L
L
 
V
L
 
Y
-
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
E
Y
 
L
A
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
K
G
 
G
C
 
N
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
Q
 
R
L
 
A
C
 
M
N
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
C
E
 
A
S
 
A
C
 
A
R
 
M
R
 
R
G
 
G
R
 
D
W
 
A
R
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
A
L
 
I
H
 
N
Q
 
D
Q
 
R
L
 
L
L
 
M
Q
 
P
L
 
L
S
 
H
E
 
K
A
 
A
T
 
L
S
 
F
R
 
I
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
P
P
 
E
H
 
G
V
x
I
R
 
R
L
|
L
P
 
P
L
|
L
T
|
T
E
 
W
L
 
L
D
 
S
Q
 
P
P
 
H
A
 
C
Q
 
H
A
 
D
M
 
P
V
 
L
A
 
R
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M

3i7sA Dihydrodipicolinate synthase mutant - k161a - with the substrate pyruvate bound in the active site. (see paper)
36% identity, 90% coverage: 15:297/315 of query aligns to 1:286/292 of 3i7sA

query
sites
3i7sA
W
 
M
L
 
F
A
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
x
A
I
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
D
R
 
E
S
 
K
G
 
G
A
 
N
L
 
V
D
 
C
I
 
R
A
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
L
C
 
I
E
 
D
R
 
Y
Q
 
H
I
 
V
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
S
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
x
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
N
A
 
H
A
 
D
E
 
E
R
 
H
E
 
A
A
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
M
T
 
M
A
 
T
V
 
L
T
 
D
V
 
L
A
 
A
C
 
D
N
 
G
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
A
T
 
T
L
 
A
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
S
N
 
L
T
 
T
R
 
Q
Q
 
R
A
 
F
A
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
A
 
G
I
 
C
M
 
L
S
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
P
 
P
T
 
S
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
H
T
 
T
A
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
Q
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
G
 
D
L
 
L
P
 
L
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
I
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
W
 
V
A
 
K
Q
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
|
R
D
 
E
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
N
I
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
V
V
 
N
H
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
R
 
L
V
 
V
P
 
S
L
 
D
G
 
D
F
 
F
R
 
V
L
 
L
L
 
L
-
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
A
T
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Y
 
F
A
 
M
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
H
G
 
G
C
 
V
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
A
Q
 
R
L
 
D
C
 
M
N
 
A
A
 
Q
L
 
M
L
 
C
E
 
K
S
 
L
C
 
A
R
 
A
R
 
E
G
 
G
R
 
H
W
 
F
R
 
A
T
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
V
L
 
I
H
 
N
Q
 
Q
Q
 
R
L
 
L
L
 
M
Q
 
P
L
 
L
S
 
H
E
 
N
A
 
K
T
 
L
S
 
F
R
 
V
E
 
E
-
 
P
L
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
C
S
 
K
L
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
M
 
T
P
 
D
H
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
T
E
 
P
L
 
I
D
 
T
Q
 
D
P
 
S
A
 
G
Q
 
R
A
 
E
M
 
T
V
 
V
A
 
R
Q
 
A
A
 
A
M
 
L

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
36% identity, 90% coverage: 15:297/315 of query aligns to 1:286/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
W
 
M
L
 
F
A
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
 
A
I
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
D
R
 
E
S
 
K
G
 
G
A
 
N
L
 
V
D
 
C
I
 
R
A
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
L
C
 
I
E
 
D
R
 
Y
Q
 
H
I
 
V
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
S
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
T
 
N
A
x
H
A
 
D
E
 
E
R
x
H
E
 
A
A
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
M
T
 
M
A
 
T
V
 
L
T
 
D
V
 
L
A
 
A
C
 
D
N
 
G
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
|
N
S
 
A
T
 
T
L
 
A
Q
x
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
S
N
 
L
T
 
T
R
 
Q
Q
 
R
A
 
F
A
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
A
 
G
I
 
C
M
 
L
S
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
P
 
P
T
 
S
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
H
T
 
T
A
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
Q
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
G
 
D
L
 
L
P
 
L
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
I
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
W
 
V
A
 
K
Q
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
E
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
N
I
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
V
V
 
N
H
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
R
 
L
V
 
V
P
 
S
L
 
D
G
 
D
F
 
F
R
 
V
L
 
L
L
 
L
-
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
A
T
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Y
 
F
A
 
M
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
H
G
 
G
C
 
V
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
A
Q
 
R
L
 
D
C
 
M
N
 
A
A
 
Q
L
 
M
L
 
C
E
 
K
S
 
L
C
 
A
R
 
A
R
 
E
G
 
G
R
 
H
W
 
F
R
 
A
T
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
V
L
 
I
H
 
N
Q
 
Q
Q
 
R
L
 
L
L
 
M
Q
 
P
L
 
L
S
 
H
E
 
N
A
 
K
T
 
L
S
 
F
R
 
V
E
 
E
-
 
P
L
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
C
S
 
K
L
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
M
 
T
P
 
D
H
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
T
E
 
P
L
 
I
D
 
T
Q
 
D
P
 
S
A
 
G
Q
 
R
A
 
E
M
 
T
V
 
V
A
 
R
Q
 
A
A
 
A
M
 
L

P0A6L2 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
36% identity, 90% coverage: 15:297/315 of query aligns to 1:286/292 of P0A6L2

query
sites
P0A6L2
W
 
M
L
 
F
A
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
 
A
I
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
D
R
 
E
S
 
K
G
 
G
A
 
N
L
 
V
D
 
C
I
 
R
A
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
L
C
 
I
E
 
D
R
 
Y
Q
 
H
I
 
V
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
S
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
x
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
N
A
 
H
A
 
D
E
 
E
R
 
H
E
 
A
A
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
M
T
 
M
A
 
T
V
 
L
T
 
D
V
 
L
A
 
A
C
 
D
N
 
G
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
A
T
 
T
L
 
A
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
S
N
 
L
T
 
T
R
 
Q
Q
 
R
A
 
F
A
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
A
 
G
I
 
C
M
 
L
S
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
P
 
P
T
 
S
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
H
T
 
T
A
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
Q
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
G
 
D
L
 
L
P
 
L
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
I
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
W
 
V
A
 
K
Q
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
E
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
N
I
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
V
V
 
N
H
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
R
 
L
V
 
V
P
 
S
L
 
D
G
 
D
F
 
F
R
 
V
L
 
L
L
 
L
-
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
A
T
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Y
 
F
A
 
M
A
 
Q
A
x
L
G
 
G
G
 
G
D
 
H
G
 
G
C
 
V
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
A
Q
 
R
L
 
D
C
 
M
N
 
A
A
 
Q
L
 
M
L
 
C
E
 
K
S
 
L
C
 
A
R
 
A
R
 
E
G
 
G
R
 
H
W
 
F
R
 
A
T
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
V
L
 
I
H
 
N
Q
 
Q
Q
 
R
L
 
L
L
 
M
Q
 
P
L
 
L
S
 
H
E
 
N
A
 
K
T
 
L
S
 
F
R
 
V
E
 
E
-
 
P
L
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
C
S
 
K
L
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
M
 
T
P
 
D
H
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
T
E
 
P
L
 
I
D
 
T
Q
 
D
P
 
S
A
 
G
Q
 
R
A
 
E
M
 
T
V
 
V
A
 
R
Q
 
A
A
 
A
M
 
L

5t25A Kinetic, spectral and structural characterization of the slow binding inhibitor acetopyruvate with dihydrodipicolinate synthase from escherichia coli.
36% identity, 90% coverage: 15:297/315 of query aligns to 2:287/293 of 5t25A

query
sites
5t25A
W
 
M
L
 
F
A
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
V
D
 
A
I
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
D
R
 
E
S
 
K
G
 
G
A
 
N
L
 
V
D
 
C
I
 
R
A
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
L
C
 
I
E
 
D
R
 
Y
Q
 
H
I
 
V
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
S
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
T
 
N
A
x
H
A
 
D
E
 
E
R
 
H
E
 
A
A
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
M
T
 
M
A
 
T
V
 
L
T
 
D
V
 
L
A
 
A
C
 
D
N
 
G
R
 
R
I
 
I
H
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
A
N
|
N
S
 
A
T
 
T
L
 
A
Q
x
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
S
N
 
L
T
 
T
R
 
Q
Q
 
R
A
 
F
A
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
A
 
G
I
 
C
M
 
L
S
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
P
 
P
T
 
S
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
E
A
 
H
T
 
T
A
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
Q
I
 
I
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
G
 
D
L
 
L
P
 
L
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
I
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
W
 
V
A
 
K
Q
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
x
K
D
 
E
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
N
I
 
L
A
 
T
R
 
R
V
 
V
V
 
N
H
 
Q
L
 
I
R
 
K
A
 
E
R
 
L
V
 
V
P
 
S
L
 
D
G
 
D
F
 
F
R
 
V
L
 
L
L
 
L
-
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
A
T
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Y
 
F
A
 
M
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
H
G
 
G
C
 
V
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
A
Q
 
R
L
 
D
C
 
M
N
 
A
A
 
Q
L
 
M
L
 
C
E
 
K
S
 
L
C
 
A
R
 
A
R
 
E
G
 
G
R
 
H
W
 
F
R
 
A
T
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
V
L
 
I
H
 
N
Q
 
Q
Q
 
R
L
 
L
L
 
M
Q
 
P
L
 
L
S
 
H
E
 
N
A
 
K
T
 
L
S
 
F
R
 
V
E
 
E
-
 
P
L
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
C
S
 
K
L
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
-
 
V
A
 
A
M
 
T
P
 
D
H
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
T
E
 
P
L
 
I
D
 
T
Q
 
D
P
 
S
A
 
G
Q
 
R
A
 
E
M
 
T
V
 
V
A
 
R
Q
 
A
A
 
A
M
 
L

7kg2A Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, h59k mutant with pyruvate bound in the active site and l-histidine bound at the allosteric site
33% identity, 91% coverage: 13:299/315 of query aligns to 1:290/296 of 7kg2A

query
sites
7kg2A
R
 
K
G
 
N
W
 
I
L
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
M
A
 
T
D
 
A
I
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
-
R
 
K
S
 
N
G
 
G
A
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
E
A
 
Q
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
I
E
 
K
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
V
 
P
C
 
V
E
 
G
T
 
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
T
 
T
A
 
H
A
 
E
E
 
E
R
x
K
E
 
R
A
 
T
V
 
C
I
 
I
R
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
V
-
 
E
T
 
T
V
 
C
A
 
K
C
 
G
N
 
T
R
 
K
I
 
V
H
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
A
T
 
T
L
 
H
Q
x
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
N
 
L
T
 
A
R
 
K
Q
 
F
A
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
I
M
 
L
S
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
E
H
 
H
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
Q
A
 
S
T
 
V
A
 
D
L
 
I
P
 
P
I
 
V
I
 
L
L
 
L
H
 
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
G
 
E
L
 
I
P
 
S
D
 
T
E
 
D
T
 
T
L
 
I
I
 
I
R
 
K
L
 
L
A
 
F
Q
 
R
W
 
D
A
 
C
Q
 
E
F
 
N
I
 
I
-
 
Y
G
 
G
L
 
V
R
 
K
D
 
E
S
 
A
T
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
A
 
D
R
 
K
V
 
C
V
 
V
H
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
R
 
H
V
 
E
P
 
P
L
 
R
G
 
M
F
 
M
R
 
L
L
 
I
L
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
L
 
A
T
 
I
A
 
N
L
 
Y
A
 
P
Y
 
I
A
 
L
A
 
S
A
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
K
G
 
G
C
 
V
F
 
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
S
N
 
N
I
 
L
A
 
L
P
 
P
Q
 
D
L
 
M
C
 
I
N
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
T
E
 
H
S
 
F
C
 
A
R
 
L
R
 
D
G
 
E
R
 
N
W
 
Y
R
 
K
T
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
K
L
 
I
H
 
N
Q
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
Y
Q
 
N
L
 
I
S
 
N
E
 
K
A
 
I
T
 
L
S
 
F
R
 
C
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
I
K
 
K
Y
 
T
A
 
A
L
 
M
S
 
Y
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
E
P
 
S
-
 
L
H
 
E
V
 
F
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
C
E
 
S
L
 
P
D
 
S
Q
 
K
P
 
E
A
 
N
Q
 
F
A
 
A
M
 
K
V
 
I
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
M
 
M
A
 
K
E
 
K

4m19A Dihydrodipicolinate synthase from c. Jejuni with pyruvate bound to the active site and lysine bound to allosteric site (see paper)
33% identity, 91% coverage: 13:299/315 of query aligns to 1:290/296 of 4m19A

query
sites
4m19A
R
 
K
G
 
N
W
 
I
L
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
M
A
 
T
D
 
A
I
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
-
R
 
K
S
 
N
G
 
G
A
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
E
A
 
Q
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
I
E
 
K
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
V
 
P
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
T
 
T
A
x
H
A
 
E
E
 
E
R
x
H
E
 
R
A
 
T
V
 
C
I
 
I
R
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
V
-
 
E
T
 
T
V
 
C
A
 
K
C
 
G
N
 
T
R
 
K
I
 
V
H
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
A
T
 
T
L
 
H
Q
x
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
N
 
L
T
 
A
R
 
K
Q
 
F
A
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
I
M
 
L
S
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
E
H
 
H
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
Q
A
 
S
T
 
V
A
 
D
L
 
I
P
 
P
I
 
V
I
 
L
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
G
 
E
L
 
I
P
 
S
D
 
T
E
 
D
T
 
T
L
 
I
I
 
I
R
 
K
L
 
L
A
 
F
Q
 
R
W
 
D
A
 
C
Q
 
E
F
 
N
I
 
I
-
 
Y
G
 
G
L
 
V
R
x
K
D
 
E
S
 
A
T
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
A
 
D
R
 
K
V
 
C
V
 
V
H
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
R
 
H
V
 
E
P
 
P
L
 
R
G
 
M
F
 
M
R
 
L
L
 
I
L
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
L
 
A
T
 
I
A
 
N
L
 
Y
A
 
P
Y
 
I
A
 
L
A
 
S
A
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
K
G
 
G
C
 
V
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
S
N
 
N
I
 
L
A
 
L
P
 
P
Q
 
D
L
 
M
C
 
I
N
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
T
E
 
H
S
 
F
C
 
A
R
 
L
R
 
D
G
 
E
R
 
N
W
 
Y
R
 
K
T
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
K
L
 
I
H
 
N
Q
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
Y
Q
 
N
L
 
I
S
 
N
E
 
K
A
 
I
T
 
L
S
 
F
R
 
C
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
I
K
 
K
Y
 
T
A
 
A
L
 
M
S
 
Y
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
E
P
 
S
-
 
L
H
 
E
V
 
F
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
C
E
 
S
L
 
P
D
 
S
Q
 
K
P
 
E
A
 
N
Q
 
F
A
 
A
M
 
K
V
 
I
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
M
 
M
A
 
K
E
 
K

6u01B Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84d mutant with pyruvate bound in the active site (see paper)
33% identity, 91% coverage: 13:299/315 of query aligns to 1:290/296 of 6u01B

query
sites
6u01B
R
 
K
G
 
N
W
 
I
L
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
M
A
 
T
D
 
A
I
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
-
R
 
K
S
 
N
G
 
G
A
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
E
A
 
Q
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
I
E
 
K
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
V
 
P
C
 
V
E
 
G
T
|
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
H
A
 
E
E
 
E
R
 
H
E
 
R
A
 
T
V
 
C
I
 
I
R
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
V
-
 
E
T
 
T
V
 
C
A
 
K
C
 
G
N
 
T
R
 
K
I
 
V
H
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
N
 
D
S
 
A
T
 
T
L
 
H
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
N
 
L
T
 
A
R
 
K
Q
 
F
A
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
I
M
 
L
S
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
E
H
 
H
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
Q
A
 
S
T
 
V
A
 
D
L
 
I
P
 
P
I
 
V
I
 
L
L
 
L
H
x
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
G
 
E
L
 
I
P
 
S
D
 
T
E
 
D
T
 
T
L
 
I
I
 
I
R
 
K
L
 
L
A
 
F
Q
 
R
W
 
D
A
 
C
Q
 
E
F
 
N
I
 
I
-
 
Y
G
 
G
L
 
V
R
x
K
D
 
E
S
 
A
T
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
A
 
D
R
 
K
V
 
C
V
 
V
H
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
R
 
H
V
 
E
P
 
P
L
 
R
G
 
M
F
 
M
R
 
L
L
 
I
L
x
S
G
 
G
D
x
E
D
|
D
L
 
A
T
 
I
A
x
N
L
 
Y
A
 
P
Y
 
I
A
 
L
A
 
S
A
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
K
G
 
G
C
 
V
F
x
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
S
N
 
N
I
 
L
A
 
L
P
 
P
Q
 
D
L
 
M
C
 
I
N
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
T
E
 
H
S
 
F
C
 
A
R
 
L
R
 
D
G
 
E
R
 
N
W
 
Y
R
 
K
T
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
K
L
 
I
H
 
N
Q
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
Y
Q
 
N
L
 
I
S
 
N
E
 
K
A
 
I
T
 
L
S
 
F
R
 
C
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
I
K
 
K
Y
 
T
A
 
A
L
 
M
S
 
Y
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
E
P
 
S
-
 
L
H
 
E
V
 
F
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
C
E
 
S
L
 
P
D
 
S
Q
 
K
P
 
E
A
 
N
Q
 
F
A
 
A
M
 
K
V
 
I
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
M
 
M
A
 
K
E
 
K

7kkdB Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84a mutant with pyruvate bound in the active site and r,r-bislysine bound at the allosteric site
33% identity, 91% coverage: 13:299/315 of query aligns to 11:300/306 of 7kkdB

query
sites
7kkdB
R
 
K
G
 
N
W
 
I
L
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
M
A
 
T
D
 
A
I
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
-
R
 
K
S
 
N
G
 
G
A
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
E
A
 
Q
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
I
E
 
K
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
V
 
P
C
 
V
E
 
G
T
 
T
A
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
 
A
T
 
T
L
|
L
T
 
T
A
 
H
A
 
E
E
 
E
R
x
H
E
 
R
A
 
T
V
 
C
I
 
I
R
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
V
-
 
E
T
 
T
V
 
C
A
 
K
C
 
G
N
 
T
R
 
K
I
 
V
H
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
N
 
A
S
 
A
T
 
T
L
 
H
Q
x
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
N
 
L
T
 
A
R
 
K
Q
 
F
A
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
I
M
 
L
S
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
N
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
A
 
E
H
 
H
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
A
D
 
Q
A
 
S
T
 
V
A
 
D
L
 
I
P
 
P
I
 
V
I
 
L
L
 
L
H
 
Y
D
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
C
G
 
E
L
 
I
P
 
S
D
 
T
E
 
D
T
 
T
L
 
I
I
 
I
R
 
K
L
 
L
A
 
F
Q
 
R
W
 
D
A
 
C
Q
 
E
F
 
N
I
 
I
-
 
Y
G
 
G
L
 
V
R
 
K
D
 
E
S
 
A
T
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
A
 
D
R
 
K
V
 
C
V
 
V
H
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
R
 
H
V
 
E
P
 
P
L
 
R
G
 
M
F
 
M
R
 
L
L
 
I
L
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
L
 
A
T
 
I
A
 
N
L
 
Y
A
 
P
Y
 
I
A
 
L
A
 
S
A
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
K
G
 
G
C
 
V
F
 
I
S
 
S
L
 
V
A
 
T
A
 
S
N
 
N
I
 
L
A
 
L
P
 
P
Q
 
D
L
 
M
C
 
I
N
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
T
E
 
H
S
 
F
C
 
A
R
 
L
R
 
D
G
 
E
R
 
N
W
 
Y
R
 
K
T
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
K
L
 
I
H
 
N
Q
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
Y
Q
 
N
L
 
I
S
 
N
E
 
K
A
 
I
T
 
L
S
 
F
R
 
C
E
 
E
L
 
S
-
 
N
P
 
P
A
 
I
A
 
P
L
 
I
K
 
K
Y
 
T
A
 
A
L
 
M
S
 
Y
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
M
 
E
P
 
S
-
 
L
H
 
E
V
 
F
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
C
E
 
S
L
 
P
D
 
S
Q
 
K
P
 
E
A
 
N
Q
 
F
A
 
A
M
 
K
V
 
I
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
M
 
M
A
 
K
E
 
K

Query Sequence

>WP_049795410.1 NCBI__GCF_000015165.1:WP_049795410.1
MTAAAPMQREAARGWLAGAIADIPTPFDRSGALDIAALARLCERQIEAGASAILVCETAG
EASTLTAAEREAVIRTAVTVACNRIHVIAGAGSNSTLQAVQNTRQAAAAGADAIMSVVPY
YNRPTAEGIYAHFRAVGDATALPIILHDCPARTGRGLPDETLIRLAQWAQFIGLRDSTGD
IARVVHLRARVPLGFRLLGDDLTALAYAAAGGDGCFSLAANIAPQLCNALLESCRRGRWR
TARRLHQQLLQLSEATSRELPAALKYALSLQGLAMPHVRLPLTELDQPAQAMVAQAMAEL
NAWLATAPGIPACQS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory