SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_050654880.1 NCBI__GCF_002893965.1:WP_050654880.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

Q29551 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial; SCOT; 3-oxoacid CoA-transferase 1; Somatic-type succinyl-CoA:3-oxoacid CoA-transferase; SCOT-s; Succinate-coenzyme A transferase; Succinyl-CoA:3-oxoacid CoA transferase; EC 2.8.3.5 from Sus scrofa (Pig) (see 3 papers)
27% identity, 84% coverage: 14:232/261 of query aligns to 303:509/520 of Q29551

query
sites
Q29551
E
 
E
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
K
V
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
E
G
 
D
K
 
G
R
 
M
R
 
Y
V
 
A
F
 
N
A
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
S
D
 
N
L
 
F
A
 
I
R
 
-
H
 
-
T
 
S
S
 
P
N
 
N
P
 
M
D
 
T
V
 
V
E
 
H
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
|
E
S
 
N
G
 
G
V
 
I
C
 
L
G
 
G
A
 
L
H
 
G
P
 
P
S
 
Y
A
 
P
M
 
L
A
 
Q
E
 
N
G
 
E
I
 
V
A
 
D
D
 
A
S
 
D
V
 
L
V
 
I
V
 
N
S
 
A
G
 
G
A
 
K
E
 
E
S
 
T
V
 
V
-
 
T
-
 
V
L
 
L
S
 
P
M
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
Y
F
 
F
G
 
S
Y
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
A
V
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
N
 
H
V
 
V
D
 
N
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
M
Q
 
Q
I
 
V
D
 
S
R
 
K
T
 
Y
G
 
G
S
 
D
L
 
L
N
 
-
T
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
-
G
 
A
D
 
N
W
 
W
K
 
M
N
 
I
P
 
P
T
 
G
V
 
K
R
 
L
L
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
M
E
 
D
I
 
L
I
 
V
A
 
S
N
 
S
A
 
A
A
 
K
E
 
T
I
 
K
F
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
T
R
 
M
R
 
E
H
 
H
D
 
S
L
 
A
S
 
K
-
 
G
S
 
N
F
 
A
P
 
H
A
 
K
A
 
I
L
 
M
D
 
E
F
 
K
C
 
C
T
 
T
S
 
L
P
 
P
S
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
Q
I
 
C
M
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
V
T
 
N
K
 
R
V
 
I
F
 
I
T
 
T
N
 
E
L
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
T
 
D
H
 
V
Q
 
D
G
 
S
P
 
K
G
 
K
G
 
G
E
 
-
L
 
L
E
 
T
L
 
L
T
 
I
S
 
E
V
 
L
H
 
W
E
 
E
G
 
G
I
 
L
S
 
T
V
 
V
H
 
D
Q
 
D
V
 
I
R
 
K
E
 
K
A
 
S
T
 
T
G
 
G
W
 
C
D
 
D
L
 
F
A
 
A
V
 
V
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3k6mC Dynamic domains of succinyl-coa:3-ketoacid-coenzyme a transferase from pig heart. (see paper)
27% identity, 84% coverage: 14:232/261 of query aligns to 250:456/466 of 3k6mC

query
sites
3k6mC
E
 
E
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
K
V
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
E
G
 
D
K
 
G
R
 
M
R
 
Y
V
 
A
F
 
N
A
 
L
G
 
G
V
x
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
S
D
 
N
L
 
F
A
 
I
R
 
-
H
 
-
T
 
S
S
 
P
N
 
N
P
 
M
D
 
T
V
 
V
E
 
H
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
|
E
S
 
N
G
 
G
V
 
I
C
 
L
G
 
G
A
 
L
H
 
G
P
 
P
S
 
Y
A
 
P
M
 
L
A
 
Q
E
 
N
G
 
E
I
 
V
A
 
D
D
 
A
S
 
D
V
 
L
V
 
I
V
 
N
S
x
A
G
 
G
A
 
K
E
 
E
S
 
T
V
 
V
-
 
T
-
 
V
L
 
L
S
 
P
M
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
Y
F
 
F
G
 
S
Y
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
A
V
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
N
 
H
V
 
V
D
 
N
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
M
Q
 
Q
I
 
V
D
 
S
R
 
K
T
 
Y
G
 
G
S
 
D
L
 
L
N
 
-
T
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
-
G
 
A
D
 
N
W
 
W
K
 
M
N
 
I
P
 
P
T
 
G
V
 
K
R
 
L
L
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
M
E
 
D
I
 
L
I
x
V
A
 
S
N
 
S
A
|
A
A
 
K
E
x
T
I
 
K
F
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
T
R
 
M
R
 
E
H
 
H
D
 
S
L
 
A
S
 
K
-
 
G
S
 
N
F
 
A
P
 
H
A
 
K
A
 
I
L
 
M
D
 
E
F
 
K
C
 
C
T
 
T
S
 
L
P
 
P
S
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
Q
I
x
C
M
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
V
T
x
N
K
 
R
V
 
I
F
 
I
T
 
T
N
 
E
L
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
T
 
D
H
 
V
Q
 
D
G
 
R
P
 
K
G
 
K
G
 
G
E
 
-
L
 
L
E
 
T
L
 
L
T
 
I
S
 
E
V
 
L
H
 
W
E
 
E
G
 
G
I
 
L
S
 
T
V
 
V
H
 
D
Q
 
D
V
 
I
R
 
K
E
 
K
A
 
S
T
 
T
G
 
G
W
 
C
D
 
D
L
 
F
A
 
A
V
 
V
A
 
S

Sites not aligning to the query:

1o9lA Succinate:coenzyme-a transferase (pig heart)
27% identity, 84% coverage: 14:232/261 of query aligns to 251:457/468 of 1o9lA

query
sites
1o9lA
E
 
E
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
K
V
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
E
G
 
D
K
 
G
R
 
M
R
 
Y
V
 
A
F
 
N
A
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
S
D
 
N
L
 
F
A
 
I
R
 
-
H
 
-
T
 
S
S
 
P
N
 
N
P
 
M
D
 
T
V
 
V
E
 
H
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
 
E
S
 
N
G
 
G
V
 
I
C
 
L
G
 
G
A
 
L
H
 
G
P
 
P
S
 
Y
A
 
P
M
 
L
A
 
Q
E
 
N
G
 
E
I
 
V
A
 
D
D
 
A
S
 
D
V
 
L
V
 
I
V
 
N
S
 
A
G
 
G
A
 
K
E
 
E
S
 
T
V
 
V
-
 
T
-
 
V
L
 
L
S
 
P
M
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
Y
F
 
F
G
 
S
Y
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
A
V
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
N
 
H
V
 
V
D
 
N
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
M
Q
 
Q
I
 
V
D
 
S
R
 
K
T
 
Y
G
 
G
S
 
D
L
 
L
N
 
-
T
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
-
G
 
A
D
 
N
W
 
W
K
 
M
N
 
I
P
 
P
T
 
G
V
 
K
R
 
L
L
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
M
E
 
D
I
 
L
I
 
V
A
 
S
N
 
S
A
 
A
A
 
K
E
 
T
I
 
K
F
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
T
R
 
M
R
 
E
H
 
H
D
 
S
L
 
A
S
 
K
-
 
G
S
 
N
F
 
A
P
 
H
A
 
K
A
 
I
L
 
M
D
 
E
F
 
K
C
 
C
T
 
T
S
 
L
P
 
P
S
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
Q
I
 
C
M
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
V
T
 
N
K
 
R
V
 
I
F
 
I
T
 
T
N
 
E
L
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
T
 
D
H
 
V
Q
 
D
G
 
R
P
 
K
G
 
K
G
 
G
E
 
-
L
 
L
E
 
T
L
 
L
T
 
I
S
 
E
V
 
L
H
 
W
E
 
E
G
 
G
I
 
L
S
 
T
V
 
V
H
 
D
Q
 
D
V
 
I
R
 
K
E
 
K
A
 
S
T
 
T
G
 
G
W
 
C
D
 
D
L
 
F
A
 
A
V
 
V
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3oxoE Succinyl-coa:3-ketoacid coa transferase from pig heart covalently bound to coa (see paper)
27% identity, 85% coverage: 12:232/261 of query aligns to 244:452/462 of 3oxoE

query
sites
3oxoE
S
 
S
T
 
V
E
 
R
T
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
K
V
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
E
G
 
D
K
 
G
R
 
M
R
 
Y
V
 
A
F
 
N
A
 
L
G
 
G
V
x
I
G
|
G
L
x
I
P
 
P
T
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
S
D
 
N
L
 
F
A
 
I
R
 
-
H
 
-
T
 
S
S
 
P
N
 
N
P
 
M
D
 
T
V
 
V
E
 
H
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
|
E
S
 
N
G
 
G
V
 
I
C
 
L
G
 
G
A
 
L
H
 
G
P
 
P
S
 
Y
A
 
P
M
 
L
A
 
Q
E
 
N
G
 
E
I
 
V
A
 
D
D
 
A
S
 
D
V
 
L
V
 
I
V
 
N
S
 
A
G
 
G
A
 
K
E
 
E
S
 
T
V
 
V
-
 
T
-
 
V
L
 
L
S
 
P
M
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
Y
F
 
F
G
 
S
Y
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
A
V
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
N
 
H
V
 
V
D
 
N
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
|
G
A
 
A
A
x
M
Q
 
Q
I
 
V
D
 
S
R
 
K
T
 
Y
G
 
G
S
 
D
L
 
L
N
 
-
T
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
-
G
 
A
D
x
N
W
 
W
K
 
M
N
x
I
P
 
P
T
 
G
V
 
K
R
 
L
L
 
V
P
 
K
G
 
G
A
x
M
G
 
G
G
 
G
A
|
A
V
 
M
E
 
D
I
 
L
I
 
V
A
 
S
N
 
S
A
 
A
A
 
K
E
 
T
I
 
K
F
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
T
R
 
M
R
 
E
H
 
H
D
 
S
L
 
A
S
x
K
-
 
G
S
 
N
F
 
A
P
 
H
A
 
K
A
 
I
L
 
M
D
 
E
F
 
K
C
 
C
T
 
T
S
 
L
P
 
P
S
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
Q
I
 
C
M
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
V
T
 
N
K
 
R
V
 
I
F
 
I
T
 
T
N
 
E
L
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
T
 
D
H
 
V
Q
 
D
G
 
R
P
 
K
G
 
K
G
 
G
E
 
-
L
 
L
E
 
T
L
 
L
T
 
I
S
 
E
V
 
L
H
 
W
E
 
E
G
 
G
I
 
L
S
 
T
V
 
V
H
 
D
Q
 
D
V
 
I
R
 
K
E
 
K
A
 
S
T
 
T
G
 
G
W
 
C
D
 
D
L
 
F
A
 
A
V
 
V
A
 
S

5mzzB Crystal structure of the decarboxylase aiba/aibb in complex with 3- methylglutaconate (see paper)
23% identity, 93% coverage: 9:250/261 of query aligns to 1:227/241 of 5mzzB

query
sites
5mzzB
N
 
D
T
 
I
T
 
T
S
 
P
T
 
A
E
 
E
T
 
T
I
 
V
V
 
V
A
 
S
V
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
L
 
I
A
 
D
G
 
D
K
 
G
R
 
G
R
 
V
V
 
V
F
 
A
A
 
T
G
|
G
V
|
V
G
 
A
L
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
A
T
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
I
D
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
H
 
A
T
 
T
S
 
H
N
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
L
E
 
T
L
 
Y
I
 
L
Y
 
A
E
 
C
S
 
V
G
 
G
V
 
S
C
 
L
G
 
D
A
 
P
H
 
E
P
 
I
S
 
P
A
 
T
M
 
L
A
 
L
E
 
P
G
 
S
I
 
S
A
 
E
D
 
D
S
 
L
V
 
G
V
 
Y
V
 
L
S
 
D
G
 
G
A
 
R
E
 
S
S
 
A
V
 
E
L
 
I
S
 
T
M
 
I
A
 
P
A
 
D
L
 
L
F
 
F
G
 
D
Y
 
H
V
 
A
L
 
-
Q
 
R
G
 
R
G
 
G
N
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
T
G
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
V
D
 
D
R
 
A
T
 
E
G
 
G
S
 
R
L
 
T
N
 
N
T
 
M
S
 
T
F
 
A
I
 
S
G
 
G
D
 
S
W
 
L
K
 
D
N
 
K
P
 
P
T
 
R
V
 
T
R
 
K
L
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
V
G
x
A
G
|
G
A
 
A
V
 
A
E
 
T
I
 
L
I
 
R
A
 
Q
N
 
W
A
 
V
A
 
R
E
 
R
I
 
P
F
 
V
V
 
L
V
 
L
M
 
V
R
 
P
R
 
R
H
 
Q
D
 
S
L
 
R
S
 
R
S
 
N
F
 
L
P
 
V
A
 
P
A
 
E
L
 
V
D
 
Q
F
 
V
C
 
A
T
 
T
S
 
T
P
 
R
S
 
D
P
 
P
A
 
R
R
 
R
A
 
P
H
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
V
K
 
T
V
 
L
F
 
I
T
 
S
N
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
E
H
 
L
Q
 
G
G
 
A
P
 
S
G
 
G
G
 
A
E
 
-
L
 
-
E
 
R
L
 
L
T
 
L
S
 
A
V
 
R
H
 
H
E
 
P
G
 
W
I
 
A
S
 
S
V
 
A
H
 
A
Q
 
H
V
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
D
 
A
L
 
F
A
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
E
H
 
A
V
 
L
T
 
S
V
 
V
T
 
T
T
 
S
P
 
L
P
 
P
S
 
D
G
 
A
T
 
R
E
 
T
I
 
V
D
 
A
L
 
A
L
 
I
R
 
R

5mzxB Crystal structure of the decarboxylase aiba/aibb in complex with 4'- diphospho pantetheine (see paper)
23% identity, 93% coverage: 9:250/261 of query aligns to 1:227/241 of 5mzxB

query
sites
5mzxB
N
 
D
T
 
I
T
 
T
S
 
P
T
 
A
E
 
E
T
 
T
I
 
V
V
 
V
A
 
S
V
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
L
 
I
A
 
D
G
 
D
K
 
G
R
 
G
R
 
V
V
 
V
F
 
A
A
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
A
L
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
A
T
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
I
D
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
H
 
A
T
 
T
S
 
H
N
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
L
E
 
T
L
 
Y
I
 
L
Y
 
A
E
 
C
S
 
V
G
 
G
V
 
S
C
 
L
G
 
D
A
 
P
H
 
E
P
 
I
S
 
P
A
 
T
M
 
L
A
 
L
E
 
P
G
 
S
I
 
S
A
 
E
D
 
D
S
 
L
V
 
G
V
 
Y
V
 
L
S
 
D
G
 
G
A
 
R
E
 
S
S
 
A
V
 
E
L
 
I
S
 
T
M
 
I
A
 
P
A
 
D
L
 
L
F
 
F
G
 
D
Y
 
H
V
 
A
L
 
-
Q
 
R
G
 
R
G
 
G
N
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
T
G
 
V
F
 
F
L
x
F
G
|
G
A
|
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
V
D
 
D
R
 
A
T
 
E
G
 
G
S
 
R
L
 
T
N
 
N
T
 
M
S
 
T
F
 
A
I
 
S
G
 
G
D
 
S
W
 
L
K
 
D
N
 
K
P
 
P
T
 
R
V
 
T
R
 
K
L
 
F
P
|
P
G
 
G
A
 
V
G
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
E
 
T
I
 
L
I
 
R
A
 
Q
N
 
W
A
 
V
A
 
R
E
 
R
I
 
P
F
 
V
V
 
L
V
 
L
M
 
V
R
 
P
R
 
R
H
 
Q
D
 
S
L
 
R
S
 
R
S
 
N
F
 
L
P
 
V
A
 
P
A
 
E
L
 
V
D
 
Q
F
 
V
C
 
A
T
 
T
S
 
T
P
 
R
S
 
D
P
 
P
A
 
R
R
 
R
A
 
P
H
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
V
K
 
T
V
 
L
F
 
I
T
 
S
N
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
E
H
 
L
Q
 
G
G
 
A
P
 
S
G
 
G
G
 
A
E
 
-
L
 
-
E
 
R
L
 
L
T
 
L
S
 
A
V
 
R
H
 
H
E
 
P
G
 
W
I
 
A
S
 
S
V
 
A
H
 
A
Q
 
H
V
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
D
 
A
L
 
F
A
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
E
H
 
A
V
 
L
T
 
S
V
 
V
T
 
T
T
 
S
P
 
L
P
 
P
S
 
D
G
 
A
T
 
R
E
 
T
I
 
V
D
 
A
L
 
A
L
 
I
R
 
R

5mzyB Crystal structure of the decarboxylase aiba/aibb in complex with a possible transition state analog (see paper)
23% identity, 93% coverage: 9:250/261 of query aligns to 4:230/244 of 5mzyB

query
sites
5mzyB
N
 
D
T
 
I
T
 
T
S
 
P
T
 
A
E
 
E
T
 
T
I
 
V
V
 
V
A
 
S
V
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
L
 
I
A
 
D
G
 
D
K
 
G
R
 
G
R
 
V
V
 
V
F
 
A
A
 
T
G
|
G
V
|
V
G
 
A
L
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
A
T
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
I
D
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
H
 
A
T
 
T
S
 
H
N
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
L
E
 
T
L
 
Y
I
 
L
Y
 
A
E
 
C
S
 
V
G
 
G
V
 
S
C
 
L
G
 
D
A
 
P
H
 
E
P
 
I
S
 
P
A
 
T
M
 
L
A
 
L
E
 
P
G
 
S
I
 
S
A
 
E
D
 
D
S
 
L
V
 
G
V
 
Y
V
 
L
S
 
D
G
 
G
A
 
R
E
 
S
S
 
A
V
 
E
L
 
I
S
 
T
M
 
I
A
 
P
A
 
D
L
 
L
F
|
F
G
 
D
Y
 
H
V
 
A
L
 
-
Q
 
R
G
 
R
G
 
G
N
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
T
G
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
V
D
 
D
R
 
A
T
 
E
G
 
G
S
 
R
L
 
T
N
 
N
T
 
M
S
 
T
F
 
A
I
 
S
G
 
G
D
 
S
W
 
L
K
 
D
N
 
K
P
 
P
T
 
R
V
 
T
R
 
K
L
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
V
G
x
A
G
|
G
A
 
A
V
 
A
E
 
T
I
 
L
I
 
R
A
 
Q
N
 
W
A
 
V
A
 
R
E
 
R
I
 
P
F
 
V
V
 
L
V
 
L
M
 
V
R
 
P
R
 
R
H
 
Q
D
 
S
L
 
R
S
 
R
S
 
N
F
 
L
P
 
V
A
 
P
A
 
E
L
 
V
D
 
Q
F
 
V
C
 
A
T
 
T
S
 
T
P
 
R
S
 
D
P
 
P
A
 
R
R
 
R
A
 
P
H
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
V
K
 
T
V
 
L
F
 
I
T
 
S
N
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
E
H
 
L
Q
 
G
G
 
A
P
 
S
G
 
G
G
 
A
E
 
-
L
 
-
E
 
R
L
 
L
T
 
L
S
 
A
V
 
R
H
 
H
E
 
P
G
 
W
I
 
A
S
 
S
V
 
A
H
 
A
Q
 
H
V
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
D
 
A
L
 
F
A
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
E
H
 
A
V
 
L
T
 
S
V
 
V
T
 
T
T
 
S
P
 
L
P
 
P
S
 
D
G
 
A
T
 
R
E
 
T
I
 
V
D
 
A
L
 
A
L
 
I
R
 
R

Q0S7Q0 Cholesterol ring-cleaving hydrolase IpdB subunit; (3E)-2-(2-carboxylatoethyl)-3-methyl-6-oxocyclohex-1-ene-1-carboxyl-CoA hydrolase beta subunit; COCHEA-CoA hydrolase beta subunit; EC 4.1.99.- from Rhodococcus jostii (strain RHA1) (see paper)
27% identity, 95% coverage: 13:261/261 of query aligns to 2:249/253 of Q0S7Q0

query
sites
Q0S7Q0
T
 
S
E
 
E
T
 
T
I
 
I
V
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
T
A
 
R
R
 
A
E
 
E
L
 
Y
A
 
C
G
 
A
-
 
I
-
 
A
K
 
C
R
 
A
R
 
D
V
 
I
F
 
F
A
 
S
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
P
-
 
M
-
 
A
-
 
T
L
 
L
P
 
P
T
 
L
L
 
I
A
 
G
V
 
A
D
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
L
T
 
T
S
 
T
N
 
E
P
 
P
D
 
D
V
 
L
E
 
L
L
 
I
I
 
T
Y
 
D
-
 
G
E
|
E
S
 
A
G
 
L
V
 
I
C
 
F
G
 
A
A
 
D
H
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
V
M
 
G
A
 
A
E
 
K
G
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
A
G
 
P
A
 
I
E
 
E
S
 
G
V
 
W
L
 
M
S
 
P
M
 
F
A
 
R
A
 
K
L
 
V
F
 
F
G
 
D
Y
 
V
V
 
V
L
 
A
Q
 
S
G
 
G
G
 
R
N
x
R
V
 
H
D
 
V
V
 
V
G
 
-
F
 
-
L
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
N
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
H
G
 
G
S
 
N
L
 
Q
N
 
N
T
 
L
S
 
S
F
 
A
I
 
F
G
 
G
D
 
P
W
 
L
K
 
Q
N
 
Q
P
 
P
T
 
T
V
 
R
R
 
Q
L
 
M
P
 
F
G
 
G
A
 
V
G
x
R
G
 
G
A
 
A
V
 
P
E
 
G
I
 
N
I
 
T
A
 
I
N
 
N
A
 
H
A
 
P
E
 
T
I
 
S
F
 
Y
V
 
W
V
 
V
M
 
G
R
 
K
R
 
-
H
 
H
D
 
T
L
 
S
S
 
R
S
 
V
F
 
F
P
 
C
A
 
D
A
 
T
L
 
V
D
 
D
F
 
I
C
 
V
T
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
S
 
S
G
 
G
K
 
V
G
 
G
-
 
Y
-
 
D
-
 
Q
I
 
I
M
 
D
P
 
P
A
 
E
G
 
N
A
 
P
G
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
F
-
 
H
-
 
H
V
 
L
T
 
H
K
 
R
V
 
V
F
 
V
T
 
S
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
D
H
 
F
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
D
G
 
H
E
 
T
L
 
F
E
 
R
L
 
A
T
 
L
S
 
S
V
 
L
H
 
H
E
 
P
G
 
G
I
 
V
S
 
T
V
 
A
H
 
D
Q
 
Q
V
 
V
R
 
A
E
 
D
A
 
N
T
 
T
G
 
S
W
 
F
D
 
E
L
 
V
A
 
A
V
 
G
A
 
L
D
 
A
H
 
D
V
 
A
T
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
R
P
 
E
P
 
P
S
 
T
G
 
D
T
 
E
E
 
E
I
 
L
D
 
R
L
 
L
L
 
I
R
 
R
N
 
E
T
 
V
I
 
L
D
 
D
K
 
P
V
 
R
R
 
S
L
 
L
Y
 
R
L
 
D
R
 
R

6cojB Crystal structure of rhodococcus jostii rha1 ipdab e105a cochea-coa complex (see paper)
27% identity, 89% coverage: 30:261/261 of query aligns to 16:244/248 of 6cojB

query
sites
6cojB
V
 
I
F
 
F
A
 
S
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
P
-
x
M
-
 
A
-
 
T
L
 
L
P
 
P
T
 
L
L
 
I
A
 
G
V
 
A
D
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
L
T
 
T
S
 
T
N
 
E
P
 
P
D
 
D
V
 
L
E
 
L
L
 
I
I
 
T
Y
 
D
-
 
G
E
 
E
S
 
A
G
 
L
V
 
I
C
 
F
G
 
A
A
 
D
H
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
V
M
 
G
A
 
A
E
 
K
G
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
A
G
 
P
A
 
I
E
 
E
S
 
G
V
 
W
L
 
M
S
 
P
M
 
F
A
 
R
A
 
K
L
 
V
F
|
F
G
 
D
Y
 
V
V
 
V
L
 
A
Q
 
S
G
 
G
G
 
R
N
x
R
V
 
H
D
 
V
V
 
V
G
 
-
F
 
-
L
x
M
G
|
G
A
|
A
A
x
N
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
H
G
 
G
S
 
N
L
 
Q
N
 
N
T
x
L
S
 
S
F
 
A
I
x
F
G
 
G
D
 
P
W
 
L
K
 
Q
N
 
Q
P
 
P
T
|
T
V
x
R
R
 
Q
L
 
M
P
 
F
G
 
G
A
 
V
G
x
R
G
 
G
A
 
A
V
 
P
E
 
G
I
x
N
I
 
T
A
 
I
N
 
N
A
 
H
A
 
P
E
 
T
I
 
S
F
 
Y
V
 
W
V
 
V
M
 
G
R
 
K
R
 
-
H
 
H
D
 
T
L
 
S
S
x
R
S
 
V
F
 
F
P
 
C
A
 
D
A
 
T
L
 
V
D
 
D
F
 
I
C
 
V
T
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
S
 
S
G
 
G
K
 
V
G
 
G
-
 
Y
-
 
D
-
 
Q
I
 
I
M
 
D
P
 
P
A
 
E
G
 
N
A
 
P
G
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
F
-
 
H
-
 
H
V
 
L
T
 
H
K
 
R
V
 
V
F
 
V
T
 
S
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
F
T
 
D
H
 
F
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
D
G
 
H
E
 
T
L
 
F
E
 
R
L
 
A
T
 
L
S
 
S
V
 
L
H
 
H
E
 
P
G
 
G
I
 
V
S
 
T
V
 
A
H
 
D
Q
 
Q
V
 
V
R
 
A
E
 
D
A
 
N
T
 
T
G
 
S
W
 
F
D
 
E
L
 
V
A
 
A
V
 
G
A
 
L
D
 
A
H
 
D
V
 
A
T
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
R
P
 
E
P
 
P
S
 
T
G
 
D
T
 
E
E
 
E
I
 
L
D
 
R
L
 
L
L
 
I
R
 
R
N
 
E
T
 
V
I
 
L
D
 
D
K
 
P
V
 
R
R
 
S
L
 
L
Y
 
R
L
 
D
R
 
R

8i3yA Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with succinyl-coa.
25% identity, 88% coverage: 11:240/261 of query aligns to 245:458/459 of 8i3yA

query
sites
8i3yA
T
 
T
S
 
V
T
 
T
E
 
R
T
 
R
I
 
I
V
 
A
A
 
R
V
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
A
G
 
N
K
 
G
R
 
M
R
 
Y
V
 
V
F
 
N
A
 
L
G
|
G
V
x
I
G
|
G
L
 
I
P
 
P
T
 
T
L
 
E
A
 
S
V
 
S
D
 
N
L
 
Y
A
 
I
R
 
P
H
 
A
T
 
G
S
 
V
N
 
N
P
 
-
D
 
-
V
 
V
E
 
V
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
|
E
S
 
N
G
 
G
V
 
L
C
 
I
G
 
G
A
 
M
H
 
G
P
 
P
S
 
F
A
 
P
M
 
T
A
 
E
E
 
D
G
 
K
I
 
V
A
 
D
D
 
A
S
 
D
V
 
W
V
 
I
V
 
N
S
x
A
G
 
G
A
x
K
E
 
Q
S
 
T
V
 
I
-
 
S
-
 
H
L
 
L
S
 
A
M
 
G
A
 
S
A
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
D
Y
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
F
-
 
A
V
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
N
 
H
V
 
M
D
 
D
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
I
 
V
D
 
A
R
 
A
T
 
N
G
 
G
S
 
D
L
 
L
N
 
A
T
x
N
S
 
F
F
 
M
I
 
I
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
P
 
P
T
 
G
V
 
K
R
 
L
L
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
P
G
|
G
G
|
G
A
|
A
V
 
M
E
 
D
I
 
L
I
 
V
A
 
S
N
 
C
A
 
G
A
 
T
E
 
R
I
 
V
F
 
V
V
 
V
V
 
T
M
 
T
R
 
T
R
 
H
H
 
C
D
x
N
L
x
K
S
 
N
S
 
G
F
 
D
P
 
P
A
x
K
A
 
I
L
 
V
D
 
E
F
 
R
C
 
C
T
 
R
S
 
L
P
 
P
S
 
V
P
 
T
A
 
G
R
 
K
A
 
-
H
 
H
A
 
C
S
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
V
T
 
C
K
 
R
V
 
I
F
 
I
T
 
T
N
 
E
L
 
Y
G
 
A
V
 
V
L
 
F
T
 
D
H
 
V
Q
 
V
G
 
-
P
 
-
G
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L
E
 
V
L
 
L
T
 
K
S
 
E
V
 
I
H
 
A
E
 
E
G
 
D
I
 
T
S
 
T
V
 
V
H
 
D
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
E
 
K
A
 
L
T
 
T
G
 
G
W
 
V
D
 
G
L
 
F
A
 
D
V
 
-
A
 
A
D
 
D
H
 
N
V
 
V
T
 
-
V
 
I
T
 
T
T
 
M
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8i40A Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with coa.
23% identity, 87% coverage: 14:241/261 of query aligns to 254:467/467 of 8i40A

query
sites
8i40A
E
 
Q
T
 
R
I
 
I
V
 
A
A
 
R
V
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
A
G
 
N
K
 
G
R
 
M
R
 
Y
V
 
V
F
 
N
A
 
L
G
 
G
V
x
I
G
 
G
L
x
I
P
 
P
T
 
T
L
 
E
A
 
S
V
 
S
D
 
N
L
 
Y
A
 
I
R
 
P
H
 
A
T
 
G
S
 
V
N
 
N
P
 
-
D
 
-
V
 
V
E
 
V
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
|
E
S
 
N
G
 
G
V
 
L
C
 
I
G
 
G
A
 
M
H
 
G
P
 
P
S
 
F
A
 
P
M
 
T
A
 
E
E
 
D
G
 
K
I
 
V
A
 
D
D
 
A
S
 
D
V
 
W
V
 
I
V
 
N
S
 
A
G
 
G
A
 
K
E
 
Q
S
 
T
V
 
I
-
 
S
-
 
H
L
 
L
S
 
A
M
 
G
A
 
S
A
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
D
Y
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
F
-
 
A
V
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
N
 
H
V
 
M
D
 
D
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
|
G
A
 
A
A
x
L
Q
 
E
I
 
V
D
 
A
R
 
A
T
 
N
G
 
G
S
 
D
L
 
L
N
 
A
T
x
N
S
 
F
F
 
M
I
 
I
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
P
 
P
T
 
G
V
 
K
R
 
L
L
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
V
 
M
E
 
D
I
 
L
I
 
V
A
 
S
N
 
C
A
 
G
A
 
T
E
 
R
I
 
V
F
 
V
V
 
V
V
 
T
M
 
T
R
 
T
R
 
H
H
 
C
D
 
N
L
 
K
S
 
N
S
 
G
F
 
D
P
 
P
A
x
K
A
 
I
L
 
V
D
 
E
F
 
R
C
 
C
T
 
R
S
 
L
P
 
P
S
 
V
P
 
T
A
 
G
R
 
K
A
 
-
H
 
H
A
 
C
S
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
V
T
 
C
K
 
R
V
 
I
F
 
I
T
 
T
N
 
E
L
 
Y
G
 
A
V
 
V
L
 
F
T
 
D
H
 
V
Q
 
V
G
 
-
P
 
-
G
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L
E
 
V
L
 
L
T
 
K
S
 
E
V
 
I
H
 
A
E
 
E
G
 
D
I
 
T
S
 
T
V
 
V
H
 
D
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
E
 
K
A
 
L
T
 
T
G
 
G
W
 
V
D
 
G
L
 
F
A
 
D
V
 
A
A
 
D
D
 
N
H
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
M
T
 
P
T
 
L
P
 
A
P
 
P

8i3yD Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with succinyl-coa.
23% identity, 87% coverage: 14:241/261 of query aligns to 258:471/471 of 8i3yD

query
sites
8i3yD
E
 
Q
T
 
R
I
 
I
V
 
A
A
 
R
V
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
A
G
 
N
K
 
G
R
 
M
R
 
Y
V
 
V
F
 
N
A
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
T
L
 
E
A
 
S
V
 
S
D
 
N
L
 
Y
A
 
I
R
 
P
H
 
A
T
 
G
S
 
V
N
 
N
P
 
-
D
 
-
V
 
V
E
 
V
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
 
E
S
 
N
G
 
G
V
 
L
C
 
I
G
 
G
A
 
M
H
 
G
P
 
P
S
 
F
A
 
P
M
 
T
A
 
E
E
 
D
G
 
K
I
 
V
A
 
D
D
 
A
S
 
D
V
 
W
V
 
I
V
 
N
S
 
A
G
 
G
A
 
K
E
 
Q
S
 
T
V
 
I
-
 
S
-
 
H
L
 
L
S
 
A
M
 
G
A
 
S
A
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
D
Y
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
F
-
 
A
V
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
N
 
H
V
 
M
D
 
D
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
Q
 
E
I
 
V
D
 
A
R
 
A
T
 
N
G
 
G
S
 
D
L
 
L
N
 
A
T
 
N
S
 
F
F
 
M
I
 
I
G
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
P
 
P
T
 
G
V
 
K
R
 
L
L
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
M
E
 
D
I
 
L
I
 
V
A
 
S
N
 
C
A
 
G
A
 
T
E
 
R
I
 
V
F
 
V
V
 
V
V
 
T
M
 
T
R
 
T
R
 
H
H
 
C
D
 
N
L
 
K
S
 
N
S
 
G
F
 
D
P
 
P
A
 
K
A
 
I
L
 
V
D
 
E
F
 
R
C
 
C
T
 
R
S
 
L
P
 
P
S
 
V
P
 
T
A
 
G
R
 
K
A
 
-
H
 
H
A
 
C
S
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
V
T
 
C
K
 
R
V
 
I
F
 
I
T
 
T
N
 
E
L
 
Y
G
 
A
V
 
V
L
 
F
T
 
D
H
 
V
Q
 
V
G
 
-
P
 
-
G
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L
E
 
V
L
 
L
T
 
K
S
 
E
V
 
I
H
 
A
E
 
E
G
 
D
I
 
T
S
 
T
V
 
V
H
 
D
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
E
 
K
A
 
L
T
 
T
G
 
G
W
 
V
D
 
G
L
 
F
A
 
D
V
 
A
A
 
D
D
 
N
H
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
M
T
 
P
T
 
L
P
 
A
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_050654880.1 NCBI__GCF_002893965.1:WP_050654880.1
MTTTIVSGNTTSTETIVAVAARELAGKRRVFAGVGLPTLAVDLARHTSNPDVELIYESGV
CGAHPSAMAEGIADSVVVSGAESVLSMAALFGYVLQGGNVDVGFLGAAQIDRTGSLNTSF
IGDWKNPTVRLPGAGGAVEIIANAAEIFVVMRRHDLSSFPAALDFCTSPSPARAHASGKG
IMPAGAGVTKVFTNLGVLTHQGPGGELELTSVHEGISVHQVREATGWDLAVADHVTVTTP
PSGTEIDLLRNTIDKVRLYLR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory