SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_051184346.1 NCBI__GCF_000422285.1:WP_051184346.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2o7qA Crystal structure of the a. Thaliana dhq-dehydroshikimate-sdh- shikimate-NADP(h)
34% identity, 95% coverage: 1:212/224 of query aligns to 6:220/501 of 2o7qA

query
sites
2o7qA
M
 
L
I
 
I
G
 
C
V
 
A
P
 
P
I
 
V
T
 
M
A
 
A
R
 
D
G
 
S
T
 
I
D
 
D
E
 
K
A
 
M
V
 
V
A
 
I
K
 
E
M
 
T
Q
 
S
Q
 
K
A
 
A
S
 
H
N
 
E
-
 
L
E
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
E
|
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
W
M
 
L
E
 
K
Q
 
D
I
 
F
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
E
D
 
D
M
 
L
E
 
K
R
 
T
L
 
I
L
 
I
A
 
K
A
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
T
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
S
 
P
R
 
K
R
 
W
Q
x
E
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
G
 
Y
T
 
E
L
 
G
D
 
D
N
 
E
R
 
N
A
 
E
R
 
R
S
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Y
 
L
S
 
Q
L
 
V
P
 
A
L
 
S
E
 
E
V
 
F
R
 
I
E
 
K
E
 
S
L
 
I
F
 
-
D
 
D
R
 
G
C
 
K
R
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
K
-
 
F
R
 
K
I
 
V
I
 
I
L
 
V
S
 
S
H
 
S
H
|
H
H
 
N
P
 
Y
N
 
Q
G
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
S
P
 
V
A
 
E
E
 
D
L
 
L
S
 
D
R
 
G
R
 
L
L
 
V
R
 
A
N
 
R
M
 
I
A
 
Q
D
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
V
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
T
R
 
T
A
 
A
N
 
V
R
 
D
P
 
I
E
 
A
D
 
D
N
 
V
L
 
A
T
 
R
V
 
M
L
 
F
G
 
H
L
 
I
I
 
T
P
 
S
R
 
K
A
 
A
R
 
Q
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
V
D
 
P
I
 
T
I
 
I
A
 
G
F
 
L
C
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
E
V
 
R
G
 
G
R
 
L
L
 
M
S
 
S
R
|
R
I
 
I
A
 
L
C
 
C
V
 
S
P
 
K
M
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
|
F
A
 
G
A
 
T
F
 
L
E
 
D
K
 
S
G
 
S
E
 
K
E
 
V
S
|
S
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
K
E
 
D

Sites not aligning to the query:

6bmqA Crystal structure of arabidopsis dehydroquinate dehydratase-shikimate dehydrogenase (t381g mutant) in complex with tartrate and shikimate (see paper)
34% identity, 95% coverage: 1:212/224 of query aligns to 6:220/498 of 6bmqA

query
sites
6bmqA
M
 
L
I
 
I
G
 
C
V
 
A
P
 
P
I
 
V
T
 
M
A
 
A
R
 
D
G
 
S
T
 
I
D
 
D
E
 
K
A
 
M
V
 
V
A
 
I
K
 
E
M
 
T
Q
 
S
Q
 
K
A
 
A
S
 
H
N
 
E
-
 
L
E
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
W
M
 
L
E
 
K
Q
 
D
I
 
F
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
E
D
 
D
M
 
L
E
 
K
R
 
T
L
 
I
L
 
I
A
 
K
A
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
T
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
S
 
P
R
 
K
R
 
W
Q
x
E
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
G
 
Y
T
 
E
L
 
G
D
 
D
N
 
E
R
 
N
A
 
E
R
 
R
S
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Y
 
L
S
 
Q
L
 
V
P
 
A
L
 
S
E
 
E
V
 
F
R
 
I
E
 
K
E
 
S
L
 
I
F
 
-
D
 
D
R
 
G
C
 
K
R
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
K
-
 
F
R
 
K
I
 
V
I
 
I
L
 
V
S
 
S
H
 
S
H
|
H
H
 
N
P
 
Y
N
 
Q
G
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
S
P
 
V
A
 
E
E
 
D
L
 
L
S
 
D
R
 
G
R
 
L
L
 
V
R
 
A
N
 
R
M
 
I
A
 
Q
D
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
V
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
T
R
 
T
A
 
A
N
 
V
R
 
D
P
 
I
E
 
A
D
 
D
N
 
V
L
 
A
T
 
R
V
 
M
L
 
F
G
 
H
L
 
I
I
 
T
P
 
S
R
 
K
A
 
A
R
 
Q
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
V
D
 
P
I
 
T
I
 
I
A
 
G
F
 
L
C
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
E
V
 
R
G
 
G
R
 
L
L
 
M
S
 
S
R
 
R
I
 
I
A
 
L
C
 
C
V
 
S
P
 
K
M
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
 
F
A
 
G
A
 
T
F
 
L
E
 
D
K
 
S
G
 
S
E
 
K
E
 
V
S
 
S
A
 
A
D
 
P
G
 
G
Q
 
Q
M
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
K
E
 
D

Sites not aligning to the query:

2gptA Crystal structure of arabidopsis dehydroquinate dehydratase-shikimate dehydrogenase in complex with tartrate and shikimate (see paper)
34% identity, 95% coverage: 1:212/224 of query aligns to 6:220/498 of 2gptA

query
sites
2gptA
M
 
L
I
 
I
G
 
C
V
 
A
P
 
P
I
 
V
T
 
M
A
 
A
R
 
D
G
 
S
T
 
I
D
 
D
E
 
K
A
 
M
V
 
V
A
 
I
K
 
E
M
 
T
Q
 
S
Q
 
K
A
 
A
S
 
H
N
 
E
-
 
L
E
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
W
M
 
L
E
 
K
Q
 
D
I
 
F
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
E
D
 
D
M
 
L
E
 
K
R
 
T
L
 
I
L
 
I
A
 
K
A
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
T
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
S
 
P
R
 
K
R
 
W
Q
x
E
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
G
 
Y
T
 
E
L
 
G
D
 
D
N
 
E
R
 
N
A
 
E
R
 
R
S
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Y
 
L
S
 
Q
L
 
V
P
 
A
L
 
S
E
 
E
V
 
F
R
 
I
E
 
K
E
 
S
L
 
I
F
 
-
D
 
D
R
 
G
C
 
K
R
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
K
-
 
F
R
 
K
I
 
V
I
 
I
L
 
V
S
 
S
H
 
S
H
|
H
H
 
N
P
 
Y
N
 
Q
G
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
S
P
 
V
A
 
E
E
 
D
L
 
L
S
 
D
R
 
G
R
 
L
L
 
V
R
 
A
N
 
R
M
 
I
A
 
Q
D
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
V
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
T
R
 
T
A
 
A
N
 
V
R
 
D
P
 
I
E
 
A
D
 
D
N
 
V
L
 
A
T
 
R
V
 
M
L
 
F
G
 
H
L
 
I
I
 
T
P
 
S
R
 
K
A
 
A
R
 
Q
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
V
D
 
P
I
 
T
I
 
I
A
 
G
F
 
L
C
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
E
V
 
R
G
 
G
R
 
L
L
 
M
S
 
S
R
 
R
I
 
I
A
 
L
C
 
C
V
 
S
P
 
K
M
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
 
F
A
 
G
A
 
T
F
 
L
E
 
D
K
 
S
G
 
S
E
 
K
E
 
V
S
 
S
A
 
A
D
 
P
G
 
G
Q
 
Q
M
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
K
E
 
D

Sites not aligning to the query:

2o7sA Crystal structure of the a. Thaliana dhq-dehydroshikimate-sdh- shikimate-NADP(h)
34% identity, 95% coverage: 1:212/224 of query aligns to 6:220/500 of 2o7sA

query
sites
2o7sA
M
 
L
I
 
I
G
 
C
V
 
A
P
 
P
I
 
V
T
 
M
A
 
A
R
 
D
G
 
S
T
 
I
D
 
D
E
 
K
A
 
M
V
 
V
A
 
I
K
 
E
M
 
T
Q
 
S
Q
 
K
A
 
A
S
 
H
N
 
E
-
 
L
E
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
E
|
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
W
M
 
L
E
 
K
Q
 
D
I
 
F
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
E
D
 
D
M
 
L
E
 
K
R
 
T
L
 
I
L
 
I
A
 
K
A
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
T
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
S
 
P
R
 
K
R
 
W
Q
x
E
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
G
 
Y
T
 
E
L
 
G
D
 
D
N
 
E
R
 
N
A
 
E
R
 
R
S
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Y
 
L
S
 
Q
L
 
V
P
 
A
L
 
S
E
 
E
V
 
F
R
 
I
E
 
K
E
 
S
L
 
I
F
 
-
D
 
D
R
 
G
C
 
K
R
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
K
-
 
F
R
 
K
I
 
V
I
 
I
L
 
V
S
 
S
H
 
S
H
|
H
H
 
N
P
 
Y
N
 
Q
G
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
S
P
 
V
A
 
E
E
 
D
L
 
L
S
 
D
R
 
G
R
 
L
L
 
V
R
 
A
N
 
R
M
 
I
A
 
Q
D
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
V
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
T
R
 
T
A
 
A
N
 
V
R
 
D
P
 
I
E
 
A
D
 
D
N
 
V
L
 
A
T
 
R
V
 
M
L
 
F
G
 
H
L
 
I
I
 
T
P
 
S
R
 
K
A
 
A
R
 
Q
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
V
D
 
P
I
 
T
I
 
I
A
 
G
F
 
L
C
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
E
V
 
R
G
 
G
R
 
L
L
 
M
S
 
S
R
|
R
I
 
I
A
 
L
C
 
C
V
 
S
P
 
K
M
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
|
F
A
 
G
A
 
T
F
 
L
E
 
D
K
 
S
G
 
S
E
 
K
E
 
V
S
|
S
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
K
E
 
D

Sites not aligning to the query:

Q9SQT8 Bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic; DHQ-SDH protein; DHQase-SORase; Protein EMBRYO DEFECTIVE 3004; EC 4.2.1.10; EC 1.1.1.25 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
34% identity, 95% coverage: 1:212/224 of query aligns to 95:309/603 of Q9SQT8

query
sites
Q9SQT8
M
 
L
I
 
I
G
 
C
V
 
A
P
 
P
I
 
V
T
 
M
A
 
A
R
 
D
G
 
S
T
 
I
D
 
D
E
 
K
A
 
M
V
 
V
A
 
I
K
 
E
M
 
T
Q
 
S
Q
 
K
A
 
A
S
 
H
N
 
E
-
 
L
E
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
E
|
E
I
 
I
R
|
R
L
 
L
D
 
D
G
 
W
M
 
L
E
 
K
Q
 
D
I
 
F
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
E
D
 
D
M
 
L
E
 
K
R
 
T
L
 
I
L
 
I
A
 
K
A
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
T
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
Y
R
|
R
S
 
P
R
 
K
R
 
W
Q
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
G
 
Y
T
 
E
L
 
G
D
 
D
N
 
E
R
 
N
A
 
E
R
 
R
S
 
R
E
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Y
 
L
S
 
Q
L
 
V
P
 
A
L
 
S
E
 
E
V
 
F
R
 
I
E
 
K
E
 
S
L
 
I
F
 
-
D
 
D
R
 
G
C
 
K
R
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
K
-
 
F
R
 
K
I
 
V
I
 
I
L
 
V
S
 
S
H
 
S
H
 
H
H
 
N
P
 
Y
N
 
Q
G
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
S
P
 
V
A
 
E
E
 
D
L
 
L
S
 
D
R
 
G
R
 
L
L
 
V
R
 
A
N
 
R
M
 
I
A
 
Q
D
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
V
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
T
R
 
T
A
 
A
N
 
V
R
 
D
P
 
I
E
 
A
D
 
D
N
 
V
L
 
A
T
 
R
V
 
M
L
 
F
G
 
H
L
 
I
I
 
T
P
 
S
R
 
K
A
 
A
R
 
Q
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
V
D
 
P
I
 
T
I
 
I
A
 
G
F
 
L
C
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
E
V
 
R
G
 
G
R
 
L
L
 
M
S
 
S
R
|
R
I
 
I
A
 
L
C
 
C
V
 
S
P
 
K
M
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
 
F
A
 
G
A
 
T
F
 
L
E
 
D
K
 
S
G
 
S
E
 
K
E
 
V
S
|
S
A
 
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
P
T
 
T
V
 
I
A
 
K
E
 
D

Sites not aligning to the query:

1sfjA 2.4a crystal structure of staphylococcus aureus type i 3- dehydroquinase, with 3-dehydroquinate bound (see paper)
25% identity, 90% coverage: 15:215/224 of query aligns to 15:222/227 of 1sfjA

query
sites
1sfjA
V
 
I
A
 
Q
K
 
K
M
 
I
Q
 
N
Q
 
H
A
 
R
S
 
I
N
 
D
E
 
A
A
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
L
E
|
E
I
 
L
R
|
R
L
 
I
D
 
D
G
 
Q
M
 
F
E
 
E
Q
 
N
I
 
V
D
 
T
M
 
V
E
 
D
R
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
E
L
 
M
L
 
I
A
 
T
A
 
K
A
 
L
P
 
S
L
 
F
P
 
K
V
 
L
I
 
L
A
 
V
T
 
T
Y
 
Y
R
|
R
S
 
T
R
 
K
R
 
L
Q
|
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
T
 
Q
L
 
F
D
 
T
N
 
N
R
 
D
A
 
S
R
 
Y
S
 
L
E
 
N
V
 
L
L
 
I
I
 
S
T
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
N
A
 
I
-
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
Y
 
M
I
 
I
D
 
D
V
 
I
E
 
E
Y
 
W
S
 
Q
-
 
A
-
 
D
L
 
I
P
 
D
L
 
I
E
 
E
V
 
K
R
 
H
E
 
Q
E
 
R
L
 
I
F
 
I
D
 
T
R
 
H
C
 
L
R
 
Q
P
 
Q
-
 
Y
-
 
N
G
 
K
R
 
E
I
 
V
I
 
I
L
 
I
S
 
S
H
 
H
H
|
H
H
 
N
P
 
F
N
 
E
G
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
P
P
 
L
A
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
R
 
F
R
 
I
L
 
F
R
 
F
N
 
K
M
 
M
A
 
Q
D
 
K
S
 
F
G
 
N
A
 
P
D
 
E
I
 
Y
I
 
V
K
|
K
I
 
L
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
H
R
 
N
P
 
K
E
 
N
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
N
V
 
L
L
 
L
G
 
Q
L
 
A
I
 
M
P
 
S
R
 
T
A
 
F
R
 
S
D
 
D
-
 
T
L
 
M
G
 
D
V
 
C
D
 
K
I
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
I
C
 
S
M
 
M
G
 
S
P
 
K
V
 
L
G
 
G
R
 
L
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
T
A
 
A
C
 
Q
V
 
G
P
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
A
L
 
L
T
 
T
F
x
Y
A
 
G
A
 
C
F
 
I
E
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
E
E
 
P
S
 
Q
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
I
T
 
D
V
 
V
A
 
T
E
 
D
T
 
L
K
 
K
A
 
A

P05194 3-dehydroquinate dehydratase; 3-dehydroquinase; Type I DHQase; Type I dehydroquinase; DHQ1; EC 4.2.1.10 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
30% identity, 83% coverage: 26:210/224 of query aligns to 43:239/252 of P05194

query
sites
P05194
D
 
D
L
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
W
R
 
R
L
 
V
D
 
D
G
 
H
M
 
Y
E
 
A
Q
 
D
I
 
L
-
 
S
D
 
N
M
 
V
E
 
E
R
 
S
L
 
V
L
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
K
L
 
I
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
M
-
 
P
-
 
E
-
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
F
R
 
R
S
 
S
R
 
A
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
Q
T
 
A
L
 
I
D
 
S
N
 
T
R
 
E
A
 
A
R
 
Y
S
 
I
E
 
A
V
 
L
L
 
N
I
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
D
A
 
S
G
 
G
-
 
L
A
 
V
S
 
D
Y
 
M
I
 
I
D
 
D
V
 
L
E
 
E
-
 
L
Y
 
F
S
 
T
L
 
G
P
 
D
L
 
D
E
 
Q
V
 
V
R
 
K
E
 
E
E
 
T
L
 
V
-
 
A
F
 
Y
D
 
A
R
 
H
C
 
A
R
 
H
P
 
D
G
 
V
R
 
K
I
 
V
I
 
V
L
 
M
S
 
S
H
 
N
H
|
H
H
 
D
P
 
F
N
x
H
G
 
K
T
 
T
P
 
P
E
 
E
P
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
I
R
 
A
R
 
R
L
 
L
R
 
R
N
 
K
M
 
M
A
 
Q
D
 
S
S
 
F
G
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
P
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
L
R
 
M
A
 
P
N
 
Q
R
 
S
P
 
T
E
 
S
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
L
G
 
A
L
 
A
I
 
T
P
 
L
R
 
E
A
 
M
R
 
Q
D
 
E
L
 
Q
G
 
Y
V
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
M
C
 
S
M
|
M
G
 
A
P
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
V
L
 
I
S
 
S
R
 
R
I
 
L
A
 
A
C
 
G
V
 
E
P
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
S
F
 
A
L
 
A
T
 
T
F
 
F
A
 
G
A
 
A
F
 
V
E
 
K
K
 
K
G
 
A
E
 
-
E
 
-
S
 
S
A
 
A
D
 
P
G
 
G
Q
 
Q
M
 
I
T
 
S
V
 
V

Q6GII7 3-dehydroquinate dehydratase; 3-dehydroquinase; Type I DHQase; Type I dehydroquinase; DHQ1; EC 4.2.1.10 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
24% identity, 90% coverage: 15:215/224 of query aligns to 21:233/238 of Q6GII7

query
sites
Q6GII7
V
 
I
A
 
Q
K
 
K
M
 
I
Q
 
N
Q
 
H
A
 
R
S
 
I
N
 
D
E
 
A
A
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
L
R
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
Q
M
 
F
E
 
E
Q
 
N
I
 
V
D
 
T
M
 
V
E
 
D
R
 
Q
L
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
M
-
 
I
-
 
T
-
 
K
-
 
L
-
 
K
L
 
V
A
 
M
A
 
Q
A
 
D
P
 
S
L
 
F
P
 
K
V
 
L
I
 
L
A
 
V
T
 
T
Y
 
Y
R
|
R
S
 
T
R
 
K
R
 
L
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
T
 
Q
L
 
F
D
 
T
N
 
N
R
 
D
A
 
S
R
 
Y
S
 
L
E
 
N
V
 
L
L
 
I
I
 
S
T
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
N
A
 
I
-
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
Y
 
M
I
 
I
D
 
D
V
 
I
E
 
E
Y
 
W
S
 
Q
-
 
A
-
 
D
L
 
I
P
 
D
L
 
I
E
 
E
V
 
K
R
 
H
E
 
Q
E
 
R
L
 
I
F
 
I
D
 
T
R
 
H
C
 
L
R
 
Q
P
 
Q
-
 
Y
-
 
N
G
 
K
R
 
E
I
 
V
I
 
I
L
 
I
S
 
S
H
 
H
H
|
H
H
 
N
P
 
F
N
 
E
G
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
P
P
 
L
A
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
R
 
F
R
 
I
L
 
F
R
 
F
N
 
K
M
 
M
A
 
Q
D
 
K
S
 
F
G
 
N
A
 
P
D
 
E
I
 
Y
I
 
V
K
|
K
I
 
L
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
H
R
 
N
P
 
K
E
 
N
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
N
V
 
L
L
 
L
G
 
Q
L
 
A
I
 
M
P
 
S
R
 
T
A
 
F
R
 
S
D
 
D
-
 
T
L
 
M
G
 
D
V
 
C
D
 
K
I
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
I
C
 
S
M
 
M
G
 
S
P
 
K
V
 
L
G
 
G
R
 
L
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
T
A
 
A
C
 
Q
V
 
G
P
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
A
L
 
L
T
 
T
F
 
Y
A
 
G
A
 
C
F
 
I
E
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
E
E
 
P
S
 
Q
A
 
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
I
T
 
D
V
 
V
A
 
T
E
 
D
T
 
L
K
 
K
A
 
A

6sfhA Crystal structure of dhq1 from staphylococcus aureus covalently modified by ligand 7 (see paper)
24% identity, 90% coverage: 15:215/224 of query aligns to 20:232/237 of 6sfhA

query
sites
6sfhA
V
 
I
A
 
Q
K
 
K
M
 
I
Q
 
N
Q
 
H
A
 
R
S
 
I
N
 
D
E
 
A
A
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
L
E
|
E
I
 
L
R
|
R
L
 
I
D
 
D
G
 
Q
M
 
I
E
 
E
Q
 
N
I
 
V
D
 
T
M
 
V
E
 
N
R
 
Q
L
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
M
-
 
I
-
 
T
-
 
K
-
 
L
-
 
K
L
 
V
A
 
M
A
 
Q
A
 
D
P
 
S
L
 
F
P
 
K
V
 
L
I
 
L
A
 
V
T
 
T
Y
 
Y
R
|
R
S
 
T
R
 
K
R
 
L
Q
|
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
T
 
Q
L
 
F
D
 
T
N
 
N
R
 
D
A
 
L
R
 
Y
S
 
L
E
 
N
V
 
L
L
 
I
I
 
S
T
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
N
A
 
I
-
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
Y
 
M
I
 
I
D
 
D
V
 
I
E
 
E
Y
 
W
S
 
Q
-
 
A
-
 
D
L
 
I
P
 
D
L
 
I
E
 
E
V
 
K
R
 
H
E
 
Q
E
 
R
L
 
I
F
 
I
D
 
T
R
 
H
C
 
L
R
 
Q
P
 
Q
-
 
Y
-
 
N
G
 
K
R
 
E
I
 
V
I
 
V
L
 
I
S
 
S
H
 
H
H
|
H
H
 
N
P
 
F
N
 
E
G
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
P
P
 
L
A
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
R
 
F
R
 
I
L
 
F
R
 
F
N
 
K
M
 
M
A
 
Q
D
 
K
S
 
F
G
 
N
A
 
P
D
 
E
I
 
Y
I
 
V
K
|
K
I
 
L
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
H
R
 
N
P
 
K
E
 
N
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
N
V
 
L
L
 
L
G
 
Q
L
 
A
I
 
M
P
 
S
R
 
T
A
 
F
R
 
S
D
 
D
-
 
T
L
 
M
G
 
D
V
 
C
D
 
K
I
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
I
C
 
S
M
 
M
G
 
S
P
 
K
V
 
L
G
 
G
R
 
L
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
T
A
 
A
C
 
Q
V
 
G
P
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
A
L
 
L
T
 
T
F
x
Y
A
 
G
A
 
C
F
 
I
E
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
E
E
 
P
S
 
Q
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
I
T
 
D
V
 
V
A
 
T
E
 
D
T
 
L
K
 
K
A
 
A

8b2aBBB 3-dehydroquinate dehydratase (see paper)
24% identity, 90% coverage: 15:215/224 of query aligns to 21:233/238 of 8b2aBBB

query
sites
8b2aBBB
V
 
I
A
 
Q
K
 
K
M
 
I
Q
 
N
Q
 
H
A
 
R
S
 
I
N
 
D
E
 
A
A
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
L
E
|
E
I
 
L
R
|
R
L
 
I
D
 
D
G
 
Q
M
 
I
E
 
E
Q
 
N
I
 
V
D
 
T
M
 
V
E
 
N
R
 
Q
L
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
M
-
 
I
-
 
T
-
 
K
-
 
L
-
 
K
L
 
V
A
 
M
A
 
Q
A
 
D
P
 
S
L
 
F
P
 
K
V
 
L
I
 
L
A
 
V
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
S
 
T
R
 
K
R
 
L
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
T
 
Q
L
 
F
D
 
T
N
 
N
R
 
D
A
 
L
R
 
Y
S
 
L
E
 
N
V
 
L
L
 
I
I
 
S
T
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
N
A
 
I
-
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
Y
 
M
I
 
I
D
 
D
V
 
I
E
 
E
Y
 
W
S
 
Q
-
 
A
-
 
D
L
 
I
P
 
D
L
 
I
E
 
E
V
 
K
R
 
H
E
 
Q
E
 
R
L
 
I
F
 
I
D
 
T
R
 
H
C
 
L
R
 
Q
P
 
Q
-
 
Y
-
 
N
G
 
K
R
 
E
I
 
V
I
 
V
L
 
I
S
 
S
H
 
H
H
 
H
H
 
N
P
 
F
N
 
E
G
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
P
P
 
L
A
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
R
 
F
R
 
I
L
 
F
R
 
F
N
 
K
M
 
M
A
 
Q
D
 
K
S
 
F
G
 
N
A
 
P
D
 
E
I
 
Y
I
 
V
K
|
K
I
 
L
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
H
R
 
N
P
 
K
E
 
N
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
N
V
 
L
L
 
L
G
 
Q
L
 
A
I
 
M
P
 
S
R
 
T
A
 
F
R
 
S
D
 
D
-
 
T
L
 
M
G
 
D
V
 
C
D
 
K
I
 
V
I
 
V
A
 
G
F
x
I
C
 
S
M
 
M
G
 
S
P
 
K
V
 
L
G
 
G
R
 
L
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
T
A
 
A
C
 
Q
V
 
G
P
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
A
L
 
L
T
 
T
F
x
Y
A
 
G
A
 
C
F
 
I
E
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
E
E
 
P
S
 
Q
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
I
T
 
D
V
 
V
A
 
T
E
 
D
T
 
L
K
 
K
A
 
A

P58687 3-dehydroquinate dehydratase; 3-dehydroquinase; DHQD; Type I DHQase; Type I dehydroquinase; DHQ1; EC 4.2.1.10 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 4 papers)
30% identity, 85% coverage: 26:216/224 of query aligns to 43:245/252 of P58687

query
sites
P58687
D
 
D
L
 
I
L
 
L
E
|
E
I
x
W
R
|
R
L
 
V
D
 
D
G
 
H
M
 
F
E
 
A
Q
 
N
I
 
V
D
 
T
M
 
T
-
 
A
E
 
E
R
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
T
P
 
D
L
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
F
R
|
R
S
 
S
R
 
A
R
 
K
Q
x
E
G
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
Q
T
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
T
R
 
G
A
 
Q
R
 
Y
S
 
I
E
 
D
V
 
L
L
 
N
I
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
D
A
 
S
G
 
G
-
 
L
A
 
V
S
 
D
Y
 
M
I
 
I
D
 
D
V
 
L
E
 
E
-
 
L
Y
 
F
S
 
T
L
 
G
P
 
D
L
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
K
E
 
A
E
 
T
L
 
V
-
 
G
F
 
Y
D
 
A
R
 
H
C
 
Q
R
 
H
P
 
N
G
 
V
R
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
M
S
 
S
H
 
N
H
|
H
H
 
D
P
 
F
N
 
H
G
 
K
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
V
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
R
N
 
K
M
 
M
A
 
Q
D
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
P
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
Q
R
 
T
P
 
K
E
 
A
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
L
G
 
T
L
 
A
I
 
T
P
 
V
R
 
E
A
 
M
R
 
Q
D
 
E
L
 
R
G
 
Y
V
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
M
C
 
S
M
 
M
G
 
S
P
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
V
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
L
A
 
A
C
 
G
V
 
E
P
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
S
F
 
A
L
 
A
T
 
T
F
 
F
A
 
G
A
 
A
F
 
V
E
 
K
K
 
K
G
 
A
E
 
-
E
 
-
S
|
S
A
 
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
D
T
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
V

Sites not aligning to the query:

4gujA 1.50 angstrom crystal structure of the salmonella enterica 3- dehydroquinate dehydratase (arod) in complex with shikimate (see paper)
30% identity, 85% coverage: 26:216/224 of query aligns to 42:244/251 of 4gujA

query
sites
4gujA
D
 
D
L
 
I
L
 
L
E
|
E
I
 
W
R
|
R
L
 
V
D
 
D
G
 
H
M
 
F
E
 
A
Q
 
N
I
 
V
D
 
T
M
 
T
-
 
A
E
 
E
R
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
T
P
 
D
L
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
F
R
|
R
S
 
S
R
 
A
R
 
K
Q
x
E
G
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
Q
T
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
T
R
 
G
A
 
Q
R
 
Y
S
 
I
E
 
D
V
 
L
L
 
N
I
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
D
A
 
S
G
 
G
-
 
L
A
 
V
S
 
D
Y
 
M
I
 
I
D
 
D
V
 
L
E
 
E
-
 
L
Y
 
F
S
 
T
L
 
G
P
 
D
L
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
K
E
 
A
E
 
T
L
 
V
-
 
G
F
 
Y
D
 
A
R
 
H
C
 
Q
R
 
H
P
 
N
G
 
V
R
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
M
S
 
S
H
 
N
H
|
H
H
 
D
P
 
F
N
 
H
G
 
K
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
V
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
R
N
 
K
M
 
M
A
 
Q
D
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
P
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
Q
R
 
T
P
 
K
E
 
A
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
L
G
 
T
L
 
A
I
 
T
P
 
V
R
 
E
A
 
M
R
 
Q
D
 
E
L
 
R
G
 
Y
V
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
M
C
 
S
M
 
M
G
 
S
P
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
V
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
L
A
 
A
C
 
G
V
 
E
P
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
S
F
 
A
L
 
A
T
 
T
F
|
F
A
 
G
A
 
A
F
 
V
E
 
K
K
 
K
G
 
A
E
 
-
E
 
-
S
|
S
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
D
T
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
V

4guiA 1.78 angstrom crystal structure of the salmonella enterica 3- dehydroquinate dehydratase (arod) in complex with quinate (see paper)
30% identity, 85% coverage: 26:216/224 of query aligns to 42:244/251 of 4guiA

query
sites
4guiA
D
 
D
L
 
I
L
 
L
E
|
E
I
 
W
R
|
R
L
 
V
D
 
D
G
 
H
M
 
F
E
 
A
Q
 
N
I
 
V
D
 
T
M
 
T
-
 
A
E
 
E
R
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
T
P
 
D
L
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
F
R
|
R
S
 
S
R
 
A
R
 
K
Q
x
E
G
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
Q
T
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
T
R
 
G
A
 
Q
R
 
Y
S
 
I
E
 
D
V
 
L
L
 
N
I
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
D
A
 
S
G
 
G
-
 
L
A
 
V
S
 
D
Y
 
M
I
 
I
D
 
D
V
 
L
E
 
E
-
 
L
Y
 
F
S
 
T
L
 
G
P
 
D
L
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
K
E
 
A
E
 
T
L
 
V
-
 
G
F
 
Y
D
 
A
R
 
H
C
 
Q
R
 
H
P
 
N
G
 
V
R
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
M
S
 
S
H
 
N
H
|
H
H
 
D
P
 
F
N
 
H
G
 
K
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
V
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
R
N
 
K
M
 
M
A
 
Q
D
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
P
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
Q
R
 
T
P
 
K
E
 
A
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
L
G
 
T
L
 
A
I
 
T
P
 
V
R
 
E
A
 
M
R
 
Q
D
 
E
L
 
R
G
 
Y
V
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
M
C
 
S
M
|
M
G
 
S
P
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
V
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
L
A
 
A
C
 
G
V
 
E
P
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
S
F
 
A
L
 
A
T
 
T
F
|
F
A
 
G
A
 
A
F
 
V
E
 
K
K
 
K
G
 
A
E
 
-
E
 
-
S
 
S
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
D
T
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
V

3m7wA Crystal structure of type i 3-dehydroquinate dehydratase (arod) from salmonella typhimurium lt2 in covalent complex with dehydroquinate (see paper)
30% identity, 85% coverage: 26:216/224 of query aligns to 42:244/251 of 3m7wA

query
sites
3m7wA
D
 
D
L
 
I
L
 
L
E
|
E
I
 
W
R
|
R
L
 
V
D
 
D
G
 
H
M
 
F
E
 
A
Q
 
N
I
 
V
D
 
T
M
 
T
-
 
A
E
 
E
R
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
T
P
 
D
L
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
F
R
 
R
S
 
S
R
 
A
R
 
K
Q
x
E
G
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
Q
T
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
T
R
 
G
A
 
Q
R
 
Y
S
 
I
E
 
D
V
 
L
L
 
N
I
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
D
A
 
S
G
 
G
-
 
L
A
 
V
S
 
D
Y
 
M
I
 
I
D
 
D
V
 
L
E
 
E
-
 
L
Y
 
F
S
 
T
L
 
G
P
 
D
L
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
K
E
 
A
E
 
T
L
 
V
-
 
G
F
 
Y
D
 
A
R
 
H
C
 
Q
R
 
H
P
 
N
G
 
V
R
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
M
S
 
S
H
 
N
H
|
H
H
 
D
P
 
F
N
 
H
G
 
K
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
V
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
R
N
 
K
M
 
M
A
 
Q
D
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
P
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
Q
R
 
T
P
 
K
E
 
A
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
L
G
 
T
L
 
A
I
 
T
P
 
V
R
 
E
A
 
M
R
 
Q
D
 
E
L
 
R
G
 
Y
V
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
T
F
x
M
C
 
S
M
|
M
G
 
S
P
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
V
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
L
A
 
A
C
 
G
V
 
E
P
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
S
F
 
A
L
 
A
T
 
T
F
|
F
A
 
G
A
 
A
F
 
V
E
 
K
K
 
K
G
 
A
E
 
-
E
 
-
S
 
S
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
D
T
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
V

4guhB 1.95 angstrom crystal structure of the salmonella enterica 3- dehydroquinate dehydratase (arod) e86a mutant in complex with dehydroshikimate (crystal form #2) (see paper)
30% identity, 85% coverage: 26:216/224 of query aligns to 56:258/265 of 4guhB

query
sites
4guhB
D
 
D
L
 
I
L
 
L
E
|
E
I
 
W
R
|
R
L
 
V
D
 
D
G
 
H
M
 
F
E
 
A
Q
 
N
I
 
V
D
 
T
M
 
T
-
 
A
E
 
E
R
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
T
P
 
D
L
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
F
R
|
R
S
 
S
R
 
A
R
 
K
Q
x
A
G
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
Q
T
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
T
R
 
G
A
 
Q
R
 
Y
S
 
I
E
 
D
V
 
L
L
 
N
I
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
D
A
 
S
G
 
G
-
 
L
A
 
V
S
 
D
Y
 
M
I
 
I
D
 
D
V
 
L
E
 
E
-
 
L
Y
 
F
S
 
T
L
 
G
P
 
D
L
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
K
E
 
A
E
 
T
L
 
V
-
 
G
F
 
Y
D
 
A
R
 
H
C
 
Q
R
 
H
P
 
N
G
 
V
R
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
M
S
 
S
H
 
N
H
|
H
H
 
D
P
 
F
N
 
H
G
 
K
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
V
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
R
N
 
K
M
 
M
A
 
Q
D
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
P
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
Q
R
 
T
P
 
K
E
 
A
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
L
G
 
T
L
 
A
I
 
T
P
 
V
R
 
E
A
 
M
R
 
Q
D
 
E
L
 
R
G
 
Y
V
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
T
F
x
M
C
 
S
M
 
M
G
 
S
P
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
V
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
L
A
 
A
C
 
G
V
 
E
P
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
S
F
 
A
L
 
A
T
 
T
F
|
F
A
 
G
A
 
A
F
 
V
E
 
K
K
 
K
G
 
A
E
 
-
E
 
-
S
 
S
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
D
T
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
V

Q186A6 3-dehydroquinate dehydratase; 3-dehydroquinase; Type I DHQase; Type I dehydroquinase; DHQ1; EC 4.2.1.10 from Clostridioides difficile (strain 630) (Peptoclostridium difficile) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 2:220/224 of query aligns to 19:250/255 of Q186A6

query
sites
Q186A6
I
 
I
G
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
T
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
T
 
K
D
 
K
E
 
D
A
 
I
V
 
I
A
 
K
K
 
E
M
 
A
Q
 
K
Q
 
E
A
 
L
S
 
K
N
 
D
E
 
A
A
 
C
-
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
I
E
|
E
I
x
W
R
|
R
L
 
V
D
 
D
G
 
F
M
 
F
E
 
E
Q
 
N
I
 
V
D
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
L
M
 
Y
E
 
E
R
 
L
L
 
R
L
 
S
A
 
Y
A
 
I
A
 
H
P
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
F
R
|
R
S
 
S
R
 
V
R
 
V
Q
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
K
T
 
L
L
 
I
D
 
S
N
 
R
R
 
D
A
 
Y
R
 
Y
S
 
T
E
 
T
V
 
L
L
 
N
I
 
K
T
 
E
A
 
I
A
 
S
E
 
N
A
 
T
G
 
G
-
 
L
A
 
V
S
 
D
Y
 
L
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Y
 
L
S
 
F
L
 
M
P
 
G
L
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
I
E
 
D
E
 
E
L
 
V
-
 
V
-
 
N
F
 
F
D
 
A
R
 
H
C
 
K
R
 
K
P
 
E
G
 
V
R
 
K
I
 
V
I
 
I
L
 
I
S
 
S
H
 
N
H
|
H
H
 
D
P
 
F
N
 
N
G
 
K
T
 
T
P
 
P
E
 
K
P
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
V
R
 
S
R
 
R
L
 
L
R
 
C
N
 
R
M
 
M
A
 
Q
D
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
P
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
Q
R
 
N
P
 
E
E
 
K
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
V
V
 
L
L
 
L
G
 
E
L
 
A
I
 
T
P
 
N
R
 
E
A
 
M
R
 
F
D
 
K
L
 
I
G
 
Y
V
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
M
C
 
S
M
 
M
G
 
S
P
 
G
V
 
M
G
 
G
R
 
V
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
L
A
 
C
C
 
G
V
 
E
P
 
I
M
 
F
G
 
G
G
 
S
F
 
A
L
 
L
T
 
T
F
 
F
A
 
G
A
 
A
F
 
A
E
 
K
K
 
S
G
 
V
E
 
-
E
 
-
S
|
S
A
 
A
D
 
P
G
 
G
Q
|
Q
M
 
I
T
 
S
V
 
F
A
 
K
E
 
E
T
 
L
K
 
N
A
 
S
L
 
V
Q
 
L
E
 
N
T
 
L
L
 
L

4h3dB 1.95 angstrom crystal structure of of type i 3-dehydroquinate dehydratase (arod) from clostridium difficile with covalent modified comenic acid.
26% identity, 98% coverage: 2:220/224 of query aligns to 19:250/254 of 4h3dB

query
sites
4h3dB
I
 
I
G
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
T
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
T
 
K
D
 
K
E
 
D
A
 
I
V
 
I
A
 
K
K
 
E
M
 
A
Q
 
K
Q
 
E
A
 
L
S
 
K
N
 
D
E
 
A
A
 
C
-
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
W
R
 
R
L
 
V
D
 
D
G
 
F
M
 
F
E
 
E
Q
 
N
I
 
V
D
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
L
M
 
Y
E
 
E
R
 
L
L
 
R
L
 
S
A
 
Y
A
 
I
A
 
H
P
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
F
R
 
R
S
 
S
R
 
V
R
 
V
Q
x
E
G
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
K
T
 
L
L
 
I
D
 
S
N
 
R
R
 
D
A
 
Y
R
 
Y
S
 
T
E
 
T
V
 
L
L
 
N
I
 
K
T
 
E
A
 
I
A
 
S
E
 
N
A
 
T
G
 
G
-
 
L
A
 
V
S
 
D
Y
 
L
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Y
 
L
S
 
F
L
 
M
P
 
G
L
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
I
E
 
D
E
 
E
L
 
V
-
 
V
-
 
N
F
 
F
D
 
A
R
 
H
C
 
K
R
 
K
P
 
E
G
 
V
R
 
K
I
 
V
I
 
I
L
 
I
S
 
S
H
 
N
H
|
H
H
 
D
P
 
F
N
 
N
G
 
K
T
 
T
P
 
P
E
 
K
P
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
V
R
 
S
R
 
R
L
 
L
R
 
C
N
 
R
M
 
M
A
 
Q
D
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
P
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
Q
R
 
N
P
 
E
E
 
K
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
V
V
 
L
L
 
L
G
 
E
L
 
A
I
 
T
P
 
N
R
 
E
A
 
M
R
 
F
D
 
K
L
 
I
G
 
Y
V
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
T
F
x
M
C
 
S
M
 
M
G
 
S
P
 
G
V
 
M
G
 
G
R
 
V
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
L
A
 
C
C
 
G
V
 
E
P
 
I
M
 
F
G
 
G
G
 
S
F
 
A
L
 
L
T
 
T
F
|
F
A
 
G
A
 
A
F
 
A
E
 
K
K
 
S
G
 
V
E
 
-
E
 
-
S
 
S
A
 
A
D
 
P
G
 
G
Q
 
Q
M
 
I
T
 
S
V
 
F
A
 
K
E
 
E
T
 
L
K
 
N
A
 
S
L
 
V
Q
 
L
E
 
N
T
 
L
L
 
L

3js3A Crystal structure of type i 3-dehydroquinate dehydratase (arod) from clostridium difficile with covalent reaction intermediate (see paper)
26% identity, 98% coverage: 2:220/224 of query aligns to 19:250/253 of 3js3A

query
sites
3js3A
I
 
I
G
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
T
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
T
 
K
D
 
K
E
 
D
A
 
I
V
 
I
A
 
K
K
 
E
M
 
A
Q
 
K
Q
 
E
A
 
L
S
 
K
N
 
D
E
 
A
A
 
C
-
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
I
E
|
E
I
 
W
R
|
R
L
 
V
D
 
D
G
 
F
M
 
F
E
 
E
Q
 
N
I
 
V
D
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
L
M
 
Y
E
 
E
R
 
L
L
 
R
L
 
S
A
 
Y
A
 
I
A
 
H
P
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
L
I
 
L
A
 
F
T
 
T
Y
 
F
R
 
R
S
 
S
R
 
V
R
 
V
Q
x
E
G
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
K
T
 
L
L
 
I
D
 
S
N
 
R
R
 
D
A
 
Y
R
 
Y
S
 
T
E
 
T
V
 
L
L
 
N
I
 
K
T
 
E
A
 
I
A
 
S
E
 
N
A
 
T
G
 
G
-
 
L
A
 
V
S
 
D
Y
 
L
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Y
 
L
S
 
F
L
 
M
P
 
G
L
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
I
E
 
D
E
 
E
L
 
V
-
 
V
-
 
N
F
 
F
D
 
A
R
 
H
C
 
K
R
 
K
P
 
E
G
 
V
R
 
K
I
 
V
I
 
I
L
 
I
S
 
S
H
 
N
H
|
H
H
 
D
P
 
F
N
 
N
G
 
K
T
 
T
P
 
P
E
 
K
P
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
V
R
 
S
R
 
R
L
 
L
R
 
C
N
 
R
M
 
M
A
 
Q
D
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
P
K
|
K
I
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
M
A
 
P
N
 
Q
R
 
N
P
 
E
E
 
K
D
 
D
N
 
V
L
 
L
T
 
V
V
 
L
L
 
L
G
 
E
L
 
A
I
 
T
P
 
N
R
 
E
A
 
M
R
 
F
D
 
K
L
 
I
G
 
Y
V
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
T
F
x
M
C
 
S
M
 
M
G
 
S
P
 
G
V
 
M
G
 
G
R
 
V
L
 
I
S
 
S
R
|
R
I
 
L
A
 
C
C
 
G
V
 
E
P
 
I
M
 
F
G
 
G
G
 
S
F
 
A
L
 
L
T
 
T
F
|
F
A
 
G
A
 
A
F
 
A
E
 
K
K
 
S
G
 
V
E
 
-
E
 
-
S
|
S
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
 
Q
M
 
I
T
 
S
V
 
F
A
 
K
E
 
E
T
 
L
K
 
N
A
 
S
L
 
V
Q
 
L
E
 
N
T
 
L
L
 
L

7tbvA Crystal structure of the shikimate kinase + 3-dehydroquinate dehydratase + 3-dehydroshikimate dehydrogenase domains of aro1 from candida albicans (see paper)
26% identity, 81% coverage: 3:183/224 of query aligns to 177:365/682 of 7tbvA

query
sites
7tbvA
G
 
A
V
 
V
P
 
V
I
 
L
T
 
T
A
 
S
R
 
P
G
 
D
T
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
V
V
 
V
A
 
R
K
 
D
M
 
L
Q
 
E
Q
 
S
A
 
I
S
 
T
N
 
I
E
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
A
L
 
V
E
 
E
I
 
L
R
 
R
L
 
V
D
 
D
G
 
L
M
 
F
E
 
K
Q
 
D
I
 
T
D
 
S
M
 
A
E
 
E
R
 
F
L
 
V
L
 
A
A
 
A
A
 
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
H
A
 
A
P
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
Y
T
 
T
Y
 
V
R
 
R
S
 
T
R
 
M
R
 
S
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
K
G
 
F
T
 
P
L
 
D
D
 
E
N
 
N
R
 
V
A
 
D
R
 
E
-
 
L
S
 
K
E
 
S
V
 
L
L
 
L
I
 
L
T
 
L
A
 
G
A
 
I
E
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
A
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
V
 
L
E
 
Q
Y
 
L
S
 
T
L
 
A
P
 
P
L
 
N
E
 
E
V
 
L
R
 
I
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
S
D
 
S
R
 
K
C
 
K
R
 
G
P
 
F
G
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
L
 
G
S
 
T
H
 
Y
H
 
Q
H
 
D
P
 
I
N
 
N
G
|
G
T
 
E
P
x
L
E
 
K
-
 
W
-
 
N
P
 
N
A
 
V
E
 
E
L
 
W
S
 
K
R
 
N
R
 
K
L
 
Y
R
 
N
N
 
Q
M
 
G
A
 
V
D
 
S
S
 
M
G
 
N
A
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
V
K
 
R
I
 
L
V
 
V
T
 
G
R
x
K
A
 
A
N
 
N
R
 
S
P
 
I
E
 
Q
D
 
D
N
 
N
L
 
L
T
 
D
V
 
L
L
 
E
G
 
N
L
 
F
I
 
-
P
 
-
R
 
K
A
 
K
R
 
Q
D
 
N
L
 
T
G
 
L
V
 
K
D
 
P
I
 
L
I
 
I
A
 
A
F
 
F
C
 
N
M
 
L
G
 
G
P
 
S
V
 
Q
G
 
G
R
 
K
L
 
L
S
 
S
R
 
Q
I
 
V

6hqvA Pentafunctional arom complex from chaetomium thermophilum (see paper)
28% identity, 85% coverage: 25:214/224 of query aligns to 1056:1253/1555 of 6hqvA

query
sites
6hqvA
A
 
S
D
 
D
L
 
A
L
 
V
E
|
E
I
 
L
R
|
R
L
 
V
D
 
D
G
 
L
M
 
L
E
 
E
Q
 
S
I
 
Y
D
 
E
M
 
P
E
 
E
R
 
F
-
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
-
 
L
L
 
L
L
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
Q
L
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
V
A
 
Y
T
 
T
Y
 
V
R
 
R
S
 
T
R
 
Q
R
 
S
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
-
 
K
L
 
F
G
 
P
T
 
D
L
 
E
D
 
D
N
 
Y
R
 
D
A
 
L
R
 
A
S
 
L
E
 
R
V
 
L
L
 
Y
I
 
Q
T
 
T
A
 
G
A
 
L
E
 
R
A
 
S
G
 
G
A
 
V
S
 
E
Y
 
Y
I
 
L
D
 
D
V
 
L
E
 
E
Y
 
M
S
 
T
L
 
M
P
 
P
L
 
D
E
 
H
V
 
I
R
 
L
E
 
Q
E
 
A
L
 
V
F
 
T
D
 
D
R
 
A
C
 
K
R
 
G
P
 
F
G
 
T
R
 
S
I
 
I
I
 
I
L
 
A
S
 
S
H
 
H
H
 
H
H
 
D
P
 
P
N
 
Q
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
P
 
-
A
 
C
E
 
K
L
 
L
S
 
S
R
 
W
R
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
W
-
 
I
-
 
P
L
 
F
R
 
Y
N
 
N
M
 
K
A
 
A
D
 
L
S
 
Q
G
 
Y
A
 
G
D
 
D
I
 
V
I
 
I
K
|
K
I
 
L
V
 
V
T
 
G
R
 
V
A
 
A
N
 
R
R
 
E
P
 
M
E
 
A
D
 
D
N
 
N
L
 
F
T
 
A
V
 
L
L
 
T
G
 
N
L
 
F
I
 
-
P
 
-
R
 
K
A
 
A
R
 
K
D
 
M
L
 
L
G
 
A
V
 
A
D
 
H
-
 
D
-
 
N
-
 
K
-
 
P
I
 
M
I
 
I
A
 
A
F
 
L
C
 
N
M
 
M
G
 
G
P
 
T
V
 
A
G
 
G
R
 
K
L
 
L
S
 
S
R
|
R
I
 
V
A
 
-
C
 
-
V
 
-
P
 
-
M
 
L
G
 
N
G
 
G
F
 
F
L
 
L
T
 
T
F
x
P
A
 
V
A
 
S
F
 
H
E
 
P
K
 
A
-
 
L
G
 
P
E
 
S
E
 
K
S
x
A
A
|
A
D
 
P
G
 
G
Q
 
Q
M
 
L
T
 
S
V
 
A
A
 
T
E
 
E
T
 
I
K
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_051184346.1 NCBI__GCF_000422285.1:WP_051184346.1
MIGVPITARGTDEAVAKMQQASNEADLLEIRLDGMEQIDMERLLAAAPLPVIATYRSRRQ
GGLGTLDNRARSEVLITAAEAGASYIDVEYSLPLEVREELFDRCRPGRIILSHHHPNGTP
EPAELSRRLRNMADSGADIIKIVTRANRPEDNLTVLGLIPRARDLGVDIIAFCMGPVGRL
SRIACVPMGGFLTFAAFEKGEESADGQMTVAETKALQETLALCE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory