SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_051243895.1 NCBI__GCF_000430725.1:WP_051243895.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4fhaA Structure of dihydrodipicolinate synthase from streptococcus pneumoniae,bound to pyruvate and lysine
31% identity, 83% coverage: 16:279/318 of query aligns to 14:275/307 of 4fhaA

query
sites
4fhaA
L
 
F
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
R
 
H
-
 
E
D
 
D
Q
 
G
A
 
S
V
 
I
D
 
N
H
 
F
E
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
P
T
 
A
L
 
L
T
 
I
R
 
E
A
 
H
L
 
L
A
 
L
P
 
A
T
 
H
G
 
H
I
 
T
A
 
D
G
 
G
F
 
I
V
 
L
V
 
L
C
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
A
E
 
E
A
x
S
P
|
P
A
 
T
L
|
L
G
 
T
E
x
H
E
 
D
E
 
E
Q
x
E
L
 
L
T
 
E
C
 
L
L
 
F
D
 
A
T
 
A
V
 
V
A
 
Q
R
 
K
N
 
V
A
 
V
Q
 
N
G
 
G
-
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
G
G
 
T
Y
 
N
H
 
D
L
 
T
G
 
R
D
 
D
T
 
S
R
 
I
A
 
E
W
 
F
V
 
V
E
 
K
R
 
E
L
 
V
S
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
T
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
G
L
 
F
R
 
A
G
 
A
L
 
G
L
 
L
V
 
A
P
 
I
A
 
V
P
 
P
H
x
Y
Y
 
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
Q
W
 
H
F
 
F
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
S
S
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
I
V
 
I
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
Y
 
G
R
 
R
T
 
V
G
 
V
A
 
V
V
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
M
L
 
L
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
D
H
 
H
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
I
A
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
E
C
 
C
G
 
T
G
 
S
D
 
L
A
 
A
G
 
-
K
 
-
T
 
N
Q
 
M
A
 
A
L
 
Y
I
 
L
A
 
I
D
 
E
G
 
H
R
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
E
L
 
F
A
 
L
V
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
D
I
 
G
Q
 
D
I
 
A
F
 
F
G
 
H
N
 
A
V
 
M
A
 
N
Q
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
S
A
 
V
S
 
A
A
 
S
H
 
H
L
 
T
H
 
N
T
 
G
E
 
D
R
 
E
F
 
M
V
 
H
A
 
E
V
 
M
L
 
F
K
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
S
D
 
D
L
 
M
E
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
A
A
 
A
Q
 
I
W
 
Q
Q
 
R
P
 
K
L
 
F
V
 
I
P
 
P
L
 
K
I
 
V
E
 
N
L
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
S
E
 
Y
P
 
P
N
 
S
P
 
P
G
 
A
P
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
A
M
 
I
L
 
L
A
 
N
R
 
Y
Q
 
M
G
 
G
L
 
F
I
 
E
R
 
A
A
 
G
E
 
P
V
 
T
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
31% identity, 89% coverage: 9:290/318 of query aligns to 2:281/292 of Q07607

query
sites
Q07607
F
 
F
S
 
E
G
 
G
L
 
S
W
 
I
V
 
T
P
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
R
 
A
D
 
D
Q
 
D
A
 
R
V
 
I
D
 
D
H
 
E
E
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
H
T
 
D
L
 
L
T
 
V
R
 
E
A
 
W
L
 
Q
A
 
I
P
 
E
T
 
E
G
 
G
I
 
S
A
 
F
G
 
G
F
 
L
V
 
V
V
 
P
C
 
C
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
P
 
P
A
 
T
L
 
L
G
 
S
E
 
K
E
 
S
E
 
E
Q
 
H
L
 
E
T
 
Q
C
 
V
L
 
V
D
 
E
T
 
I
V
 
T
A
 
I
R
 
K
N
 
T
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
-
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
A
S
 
G
G
 
S
Y
 
N
H
 
S
L
 
T
G
 
A
D
 
E
T
 
A
R
 
I
A
 
A
W
 
F
V
 
V
E
 
R
R
 
H
L
 
A
S
 
Q
A
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
A
A
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
V
A
 
S
P
 
P
H
 
Y
Y
 
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
Y
L
 
Q
W
 
H
F
 
F
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
D
D
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
I
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
Y
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
A
A
 
I
V
 
E
L
 
I
A
 
H
R
 
V
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
A
A
 
R
L
 
I
A
 
F
A
 
E
H
 
D
-
 
C
P
 
P
N
 
N
I
 
V
R
 
K
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
C
 
A
G
 
T
G
 
G
D
 
N
A
 
L
G
 
L
K
 
R
-
 
P
-
 
S
T
 
L
Q
 
E
A
 
R
L
 
M
I
 
A
A
 
C
D
 
G
G
 
E
R
 
D
L
 
F
A
 
N
V
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
D
I
 
G
Q
 
T
I
 
A
F
 
L
G
 
G
N
 
Y
V
 
M
A
 
A
Q
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
H
G
 
G
A
 
C
I
 
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
A
H
 
N
L
 
V
H
 
A
T
 
P
E
 
A
R
 
L
F
 
C
V
 
A
A
 
D
V
 
F
L
 
Q
K
 
Q
A
 
A
L
 
C
A
 
L
R
 
N
A
 
G
D
 
D
L
 
F
E
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
L
A
 
K
Q
 
L
W
 
Q
Q
 
D
P
 
R
L
 
L
V
 
M
P
 
P
L
 
L
I
 
H
E
 
R
L
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
L
E
 
E
P
 
T
N
 
N
P
 
P
G
 
A
P
 
G
V
 
A
K
 
K
A
 
Y
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
L
 
R
I
 
M
R
 
R
A
 
G
E
 
D
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
V
G
 
T
I
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
S
L
 
F
Q
 
Q
Q
 
E
R
 
E
L
 
I

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
30% identity, 85% coverage: 9:279/318 of query aligns to 2:273/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
F
 
F
S
 
R
G
 
G
L
 
V
W
 
G
V
 
T
P
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
R
 
K
D
 
N
Q
 
G
A
 
E
V
 
L
D
 
D
H
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
Y
A
 
E
T
 
R
L
 
L
T
 
V
R
 
R
A
 
Y
L
 
Q
A
 
L
P
 
E
T
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
N
G
 
A
F
 
L
V
 
I
V
 
V
C
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
P
 
P
A
 
T
L
 
V
G
 
N
E
 
E
E
 
D
E
 
E
Q
 
R
L
 
E
T
 
K
C
 
L
L
 
V
D
 
S
T
 
R
V
 
T
A
 
L
R
 
E
N
 
I
A
 
V
Q
 
D
G
 
G
-
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
I
M
 
V
G
 
G
L
 
A
S
 
G
G
 
T
Y
 
N
H
 
S
L
 
T
G
 
E
D
 
K
T
 
T
R
 
L
A
 
K
W
 
L
V
 
V
E
 
K
R
 
Q
L
 
A
S
 
E
A
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
V
A
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
 
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
Q
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
Y
L
 
I
A
 
S
D
 
E
A
 
R
S
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
G
L
 
I
I
 
V
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
A
 
L
R
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
A
L
 
A
A
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
D
-
 
L
P
 
K
N
 
N
I
 
V
R
 
V
A
 
G
V
 
I
K
 
K
D
 
E
C
 
A
G
 
N
G
 
P
D
|
D
A
x
I
G
x
D
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
K
 
R
T
 
T
Q
 
V
A
 
S
L
 
L
I
 
T
A
 
K
D
 
Q
G
 
A
R
 
R
-
 
S
-
 
D
L
 
F
A
 
M
V
 
V
L
 
W
A
 
S
G
 
G
E
 
N
D
 
D
I
 
D
Q
 
R
I
 
T
F
 
F
G
 
Y
N
 
L
V
 
L
A
 
C
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
S
A
 
V
S
 
V
A
 
S
H
 
N
L
 
V
H
 
A
T
 
P
E
 
K
R
 
Q
F
 
M
V
 
V
A
 
E
V
 
L
L
 
C
K
 
A
A
 
E
L
 
Y
A
 
F
R
 
S
A
 
G
D
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
S
R
 
R
A
 
E
Q
 
V
W
 
H
Q
 
R
P
 
K
L
 
L
V
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
M
E
 
K
L
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
V
E
 
E
P
 
T
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
A
M
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
L
Q
 
M
G
 
G
L
 
F
I
 
I
R
 
E
A
 
N
E
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
30% identity, 85% coverage: 9:279/318 of query aligns to 3:274/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
F
 
F
S
 
R
G
 
G
L
 
V
W
 
G
V
 
T
P
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
R
 
K
D
 
N
Q
 
G
A
 
E
V
 
L
D
 
D
H
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
Y
A
 
E
T
 
R
L
 
L
T
 
V
R
 
R
A
 
Y
L
 
Q
A
 
L
P
 
E
T
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
N
G
 
A
F
 
L
V
 
I
V
 
V
C
 
L
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
P
 
P
A
 
T
L
 
V
G
 
N
E
 
E
E
 
D
E
 
E
Q
 
R
L
 
E
T
 
K
C
 
L
L
 
V
D
 
S
T
 
R
V
 
T
A
 
L
R
x
E
N
 
I
A
 
V
Q
x
D
G
 
G
-
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
I
M
 
V
G
 
G
L
 
A
S
 
G
G
 
T
Y
 
N
H
 
S
L
 
T
G
 
E
D
 
K
T
 
T
R
 
L
A
 
K
W
 
L
V
 
V
E
 
K
R
 
Q
L
 
A
S
 
E
A
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
V
A
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
Q
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
Y
L
 
I
A
 
S
D
 
E
A
 
R
S
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
G
L
 
I
I
 
V
V
 
V
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
A
 
L
R
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
A
L
 
A
A
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
D
-
 
L
P
 
K
N
 
N
I
 
V
R
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
E
C
 
A
G
 
N
G
 
P
D
 
D
A
 
I
G
 
D
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
K
 
R
T
 
T
Q
 
V
A
 
S
L
 
L
I
 
T
A
 
K
D
 
Q
G
 
A
R
 
R
-
 
S
-
 
D
L
 
F
A
 
M
V
 
V
L
 
W
A
 
S
G
 
G
E
 
N
D
 
D
I
 
D
Q
 
R
I
 
T
F
 
F
G
 
Y
N
 
L
V
 
L
A
 
C
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
D
G
 
G
A
 
V
I
|
I
A
 
S
A
 
V
S
 
V
A
 
S
H
 
N
L
 
V
H
 
A
T
 
P
E
 
K
R
 
Q
F
 
M
V
 
V
A
 
E
V
 
L
L
 
C
K
 
A
A
 
E
L
 
Y
A
 
F
R
 
S
A
 
G
D
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
S
R
 
R
A
 
E
Q
 
V
W
 
H
Q
 
R
P
 
K
L
 
L
V
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
M
E
 
K
L
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
V
E
 
E
P
 
T
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
A
M
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
L
Q
 
M
G
 
G
L
 
F
I
 
I
R
 
E
A
 
N
E
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
32% identity, 91% coverage: 9:296/318 of query aligns to 2:288/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
F
 
I
S
 
Q
G
 
G
L
 
S
W
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
R
 
K
D
 
D
Q
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
W
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
T
 
K
L
 
L
T
 
V
R
 
E
A
 
W
L
 
H
A
 
I
P
 
E
T
 
Q
G
 
G
I
 
T
A
 
N
G
 
S
F
 
I
V
 
V
V
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
P
 
S
A
 
T
L
 
L
G
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
Q
 
H
L
 
T
T
 
Q
C
 
V
L
 
I
D
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
R
 
R
N
 
V
A
 
A
Q
 
N
G
 
K
-
 
R
L
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
G
G
 
A
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
W
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
L
L
 
T
S
 
K
A
 
A
L
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
A
R
 
K
V
 
D
P
 
L
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
P
 
V
A
x
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
Q
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
V
 
L
Y
|
Y
D
x
N
I
x
V
P
|
P
Y
 
G
R
|
R
T
|
T
G
 
G
A
 
V
V
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
L
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
C
 
A
G
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
P
K
 
R
T
 
G
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
D
-
 
A
-
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
Y
A
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
I
 
E
Q
 
T
I
 
A
F
 
W
G
 
E
N
 
L
V
 
M
A
 
L
Q
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
N
I
|
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
A
H
 
N
L
 
I
H
 
A
T
 
P
E
 
K
R
 
A
F
 
M
V
 
S
A
 
E
V
 
V
L
 
C
K
 
A
A
 
V
L
 
A
A
 
I
R
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
E
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
Q
 
L
W
 
N
Q
 
N
P
 
K
L
 
I
V
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
E
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
R
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
T
G
 
P
I
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
Q
 
R
Q
 
E
R
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
K
D
 
D
A
 
A

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
32% identity, 91% coverage: 9:296/318 of query aligns to 2:288/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
F
 
I
S
 
Q
G
 
G
L
 
S
W
 
I
V
 
V
P
x
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
R
 
K
D
 
D
Q
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
W
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
T
 
K
L
 
L
T
 
V
R
 
E
A
 
W
L
 
H
A
 
I
P
 
E
T
 
Q
G
 
G
I
 
T
A
 
N
G
 
S
F
 
I
V
 
V
V
 
A
C
 
V
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
P
 
S
A
 
T
L
 
L
G
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
Q
 
H
L
 
T
T
 
Q
C
 
V
L
 
I
D
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
R
 
R
N
 
V
A
 
A
Q
 
N
G
 
K
-
 
R
L
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
G
G
 
A
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
W
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
L
L
 
T
S
 
K
A
 
A
L
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
A
R
 
K
V
 
D
P
 
L
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
A
L
 
A
L
|
L
V
 
L
P
 
V
A
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
Q
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
V
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
L
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
C
 
A
G
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
P
K
 
R
T
 
G
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
D
-
 
A
-
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
Y
A
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
I
 
E
Q
 
T
I
 
A
F
 
W
G
 
E
N
 
L
V
 
M
A
 
L
Q
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
N
I
|
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
A
H
 
N
L
 
I
H
 
A
T
 
P
E
 
K
R
 
A
F
 
M
V
 
S
A
 
E
V
 
V
L
 
C
K
 
A
A
 
V
L
 
A
A
 
I
R
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
E
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
Q
 
L
W
 
N
Q
 
N
P
 
K
L
 
I
V
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
E
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
R
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
T
G
 
P
I
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
Q
 
R
Q
 
E
R
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
K
D
 
D
A
 
A

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
32% identity, 91% coverage: 9:296/318 of query aligns to 2:288/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
F
 
I
S
 
Q
G
 
G
L
 
S
W
 
I
V
 
V
P
x
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
R
 
K
D
 
D
Q
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
W
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
T
 
K
L
 
L
T
 
V
R
 
E
A
 
W
L
 
H
A
 
I
P
 
E
T
 
Q
G
 
G
I
 
T
A
 
N
G
 
S
F
 
I
V
 
V
V
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
P
 
S
A
 
T
L
 
L
G
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
Q
 
H
L
 
T
T
 
Q
C
 
V
L
 
I
D
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
R
 
R
N
 
V
A
 
A
Q
 
N
G
 
K
-
 
R
L
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
G
G
 
A
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
W
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
L
L
 
T
S
 
K
A
 
A
L
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
A
R
 
K
V
 
D
P
 
L
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
P
 
V
A
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
Q
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
V
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
L
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
C
 
A
G
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
P
K
 
R
T
 
G
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
D
-
 
A
-
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
Y
A
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
I
 
E
Q
 
T
I
 
A
F
 
W
G
 
E
N
 
L
V
 
M
A
 
L
Q
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
N
I
|
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
A
H
 
N
L
 
I
H
 
A
T
 
P
E
 
K
R
 
A
F
 
M
V
 
S
A
 
E
V
 
V
L
 
C
K
 
A
A
 
V
L
 
A
A
 
I
R
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
E
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
Q
 
L
W
 
N
Q
 
N
P
 
K
L
 
I
V
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
E
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
R
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
T
G
 
P
I
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
Q
 
R
Q
 
E
R
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
K
D
 
D
A
 
A

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
32% identity, 91% coverage: 9:296/318 of query aligns to 2:288/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
F
 
I
S
 
Q
G
 
G
L
 
S
W
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
R
 
K
D
 
D
Q
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
W
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
T
 
K
L
 
L
T
 
V
R
 
E
A
 
W
L
 
H
A
 
I
P
 
E
T
 
Q
G
 
G
I
 
T
A
 
N
G
 
S
F
 
I
V
 
V
V
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
P
x
S
A
 
T
L
|
L
G
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
Q
x
H
L
 
T
T
 
Q
C
 
V
L
 
I
D
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
R
 
R
N
 
V
A
 
A
Q
 
N
G
 
K
-
 
R
L
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
G
G
 
A
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
W
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
L
L
 
T
S
 
K
A
 
A
L
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
A
R
 
K
V
 
D
P
 
L
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
P
 
V
A
 
T
P
 
P
H
x
Y
Y
|
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
Q
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
V
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
L
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
C
 
A
G
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
P
K
 
R
T
 
G
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
D
-
 
A
-
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
Y
A
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
I
 
E
Q
 
T
I
 
A
F
 
W
G
 
E
N
 
L
V
 
M
A
 
L
Q
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
N
I
|
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
A
H
 
N
L
 
I
H
 
A
T
 
P
E
 
K
R
 
A
F
 
M
V
 
S
A
 
E
V
 
V
L
 
C
K
 
A
A
 
V
L
 
A
A
 
I
R
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
E
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
Q
 
L
W
 
N
Q
 
N
P
 
K
L
 
I
V
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
E
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
R
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
T
G
 
P
I
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
Q
 
R
Q
 
E
R
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
K
D
 
D
A
 
A

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
32% identity, 91% coverage: 9:296/318 of query aligns to 2:288/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
F
 
I
S
 
Q
G
 
G
L
 
S
W
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
R
 
K
D
 
D
Q
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
W
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
T
 
K
L
 
L
T
 
V
R
 
E
A
 
W
L
 
H
A
 
I
P
 
E
T
 
Q
G
 
G
I
 
T
A
 
N
G
 
S
F
 
I
V
 
V
V
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
P
 
S
A
 
T
L
 
L
G
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
Q
 
H
L
 
T
T
 
Q
C
 
V
L
 
I
D
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
R
 
R
N
 
V
A
 
A
Q
 
N
G
 
K
-
 
R
L
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
G
G
 
A
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
W
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
L
L
 
T
S
 
K
A
 
A
L
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
A
R
 
K
V
 
D
P
 
L
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
P
 
V
A
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
Q
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
V
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
L
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
C
 
A
G
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
P
K
 
R
T
 
G
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
D
-
 
A
-
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
Y
A
 
S
G
|
G
E
 
D
D
 
D
I
 
E
Q
 
T
I
 
A
F
 
W
G
 
E
N
 
L
V
 
M
A
 
L
Q
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
N
I
|
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
A
H
 
N
L
 
I
H
 
A
T
 
P
E
 
K
R
 
A
F
 
M
V
 
S
A
 
E
V
 
V
L
 
C
K
 
A
A
 
V
L
 
A
A
 
I
R
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
E
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
Q
 
L
W
 
N
Q
 
N
P
 
K
L
 
I
V
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
E
 
N
L
 
I
L
 
L
F
|
F
A
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
R
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
T
G
 
P
I
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
Q
 
R
Q
 
E
R
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
K
D
 
D
A
 
A

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
32% identity, 91% coverage: 9:296/318 of query aligns to 2:288/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
F
 
I
S
 
Q
G
 
G
L
 
S
W
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
R
 
K
D
 
D
Q
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
W
E
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
T
 
K
L
 
L
T
 
V
R
 
E
A
 
W
L
 
H
A
 
I
P
 
E
T
 
Q
G
 
G
I
 
T
A
 
N
G
 
S
F
 
I
V
 
V
V
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
P
 
S
A
 
T
L
 
L
G
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
Q
 
H
L
 
T
T
 
Q
C
 
V
L
 
I
D
 
K
T
 
E
V
 
I
A
 
I
R
 
R
N
 
V
A
 
A
Q
 
N
G
 
K
-
 
R
L
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
G
G
 
A
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
N
D
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
W
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
L
L
 
T
S
 
K
A
 
A
L
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
A
R
 
K
V
 
D
P
 
L
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
P
 
V
A
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
Q
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
V
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
A
 
V
V
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
L
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
C
 
A
G
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
P
K
 
R
T
 
G
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
D
-
 
A
-
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
Y
A
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
I
 
E
Q
 
T
I
 
A
F
 
W
G
 
E
N
 
L
V
 
M
A
 
L
Q
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
N
I
|
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
A
H
 
N
L
 
I
H
 
A
T
 
P
E
 
K
R
 
A
F
 
M
V
 
S
A
 
E
V
 
V
L
 
C
K
 
A
A
 
V
L
 
A
A
 
I
R
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
E
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
Q
 
L
W
 
N
Q
 
N
P
 
K
L
 
I
V
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
H
E
 
N
L
 
I
L
 
L
F
|
F
A
 
C
E
 
E
P
 
S
N
|
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
W
M
 
A
L
 
L
A
 
H
R
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
T
G
 
P
I
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
L
 
Y
Q
 
R
Q
 
E
R
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
K
D
 
D
A
 
A

7kg2A Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, h59k mutant with pyruvate bound in the active site and l-histidine bound at the allosteric site
29% identity, 85% coverage: 11:279/318 of query aligns to 6:273/296 of 7kg2A

query
sites
7kg2A
G
 
G
L
 
A
W
 
M
V
 
T
P
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
R
 
K
D
 
N
Q
 
G
A
 
K
V
 
V
D
 
D
H
 
E
E
 
Q
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
T
 
R
L
 
L
T
 
I
R
 
K
A
 
R
L
 
Q
A
 
I
P
 
E
T
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
D
G
 
A
F
 
V
V
 
V
V
 
P
C
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
P
x
A
A
 
T
L
|
L
G
 
T
E
 
H
E
 
E
E
 
E
Q
x
K
L
 
R
T
 
T
C
 
C
L
 
I
D
 
E
T
 
I
V
 
A
A
 
V
R
 
E
N
 
T
A
 
C
Q
 
K
G
 
G
L
 
T
P
 
K
L
 
-
V
 
V
M
 
K
G
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
A
D
 
G
T
 
S
R
x
N
A
 
A
W
 
T
V
 
H
E
|
E
R
 
A
L
 
V
S
 
G
A
 
L
L
 
A
G
 
K
T
 
F
A
 
A
R
 
K
V
 
E
P
 
H
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
V
 
S
P
 
V
A
 
A
P
 
P
H
x
Y
Y
 
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
E
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
S
S
 
V
S
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
L
V
 
L
Y
 
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
C
V
 
E
L
 
I
A
 
S
R
 
T
E
 
D
T
 
T
L
 
I
L
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
F
A
 
R
H
 
D
-
 
C
P
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
Y
A
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
E
C
 
A
G
 
S
G
 
G
D
 
N
A
 
I
G
 
D
K
 
K
T
 
C
Q
 
V
A
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
A
-
 
H
D
 
E
G
 
P
R
 
R
L
 
M
A
 
M
V
 
L
L
 
I
A
 
S
G
 
G
E
 
E
D
 
D
I
 
A
Q
 
I
I
 
N
F
 
Y
G
 
P
N
 
I
V
 
L
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
S
H
 
N
L
 
L
H
 
L
T
 
P
E
 
D
R
 
M
F
 
I
V
 
S
A
 
A
V
 
L
L
 
T
K
 
H
A
 
F
L
 
A
A
 
L
R
 
D
A
 
E
D
 
N
L
 
Y
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
K
Q
 
I
W
 
N
Q
 
D
P
 
E
L
 
L
V
 
Y
P
 
N
L
 
I
I
 
N
E
 
K
L
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
I
K
 
K
A
 
T
M
 
A
L
 
M
A
 
Y
R
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
E
A
 
S
-
 
L
E
 
E
V
 
F
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L

4m19A Dihydrodipicolinate synthase from c. Jejuni with pyruvate bound to the active site and lysine bound to allosteric site (see paper)
29% identity, 85% coverage: 11:279/318 of query aligns to 6:273/296 of 4m19A

query
sites
4m19A
G
 
G
L
 
A
W
 
M
V
 
T
P
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
R
 
K
D
 
N
Q
 
G
A
 
K
V
 
V
D
 
D
H
 
E
E
 
Q
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
T
 
R
L
 
L
T
 
I
R
 
K
A
 
R
L
 
Q
A
 
I
P
 
E
T
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
D
G
 
A
F
 
V
V
 
V
V
 
P
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
P
x
A
A
 
T
L
|
L
G
 
T
E
x
H
E
 
E
E
 
E
Q
x
H
L
 
R
T
 
T
C
 
C
L
 
I
D
 
E
T
 
I
V
 
A
A
 
V
R
 
E
N
 
T
A
 
C
Q
 
K
G
 
G
L
 
T
P
 
K
L
 
-
V
 
V
M
 
K
G
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
A
D
 
G
T
 
S
R
x
N
A
 
A
W
 
T
V
 
H
E
|
E
R
 
A
L
 
V
S
 
G
A
 
L
L
 
A
G
 
K
T
 
F
A
 
A
R
 
K
V
 
E
P
 
H
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
V
 
S
P
 
V
A
 
A
P
 
P
H
x
Y
Y
|
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
E
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
S
S
 
V
S
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
L
V
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
A
 
C
V
 
E
L
 
I
A
 
S
R
 
T
E
 
D
T
 
T
L
 
I
L
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
F
A
 
R
H
 
D
-
 
C
P
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
Y
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
E
C
 
A
G
 
S
G
 
G
D
 
N
A
 
I
G
 
D
K
 
K
T
 
C
Q
 
V
A
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
A
-
 
H
D
 
E
G
 
P
R
 
R
L
 
M
A
 
M
V
 
L
L
 
I
A
 
S
G
 
G
E
 
E
D
 
D
I
 
A
Q
 
I
I
 
N
F
 
Y
G
 
P
N
 
I
V
 
L
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
K
G
 
G
A
 
V
I
|
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
S
H
 
N
L
 
L
H
 
L
T
 
P
E
 
D
R
 
M
F
 
I
V
 
S
A
 
A
V
 
L
L
 
T
K
 
H
A
 
F
L
 
A
A
 
L
R
 
D
A
 
E
D
 
N
L
 
Y
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
K
Q
 
I
W
 
N
Q
 
D
P
 
E
L
 
L
V
 
Y
P
 
N
L
 
I
I
 
N
E
 
K
L
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
I
K
 
K
A
 
T
M
 
A
L
 
M
A
 
Y
R
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
E
A
 
S
-
 
L
E
 
E
V
 
F
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L

6u01B Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84d mutant with pyruvate bound in the active site (see paper)
29% identity, 85% coverage: 11:279/318 of query aligns to 6:273/296 of 6u01B

query
sites
6u01B
G
 
G
L
 
A
W
 
M
V
 
T
P
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
R
 
K
D
 
N
Q
 
G
A
 
K
V
 
V
D
 
D
H
 
E
E
 
Q
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
T
 
R
L
 
L
T
 
I
R
 
K
A
 
R
L
 
Q
A
 
I
P
 
E
T
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
D
G
 
A
F
 
V
V
 
V
V
 
P
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
P
 
A
A
 
T
L
 
L
G
 
T
E
 
H
E
 
E
E
 
E
Q
 
H
L
 
R
T
 
T
C
 
C
L
 
I
D
 
E
T
 
I
V
 
A
A
 
V
R
 
E
N
 
T
A
 
C
Q
 
K
G
 
G
L
 
T
P
 
K
L
 
-
V
 
V
M
 
K
G
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
A
D
 
G
T
 
S
R
 
D
A
 
A
W
 
T
V
 
H
E
 
E
R
 
A
L
 
V
S
 
G
A
 
L
L
 
A
G
 
K
T
 
F
A
 
A
R
 
K
V
 
E
P
 
H
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
V
 
S
P
 
V
A
 
A
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
E
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
S
S
 
V
S
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
L
V
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
A
 
C
V
 
E
L
 
I
A
 
S
R
 
T
E
 
D
T
 
T
L
 
I
L
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
F
A
 
R
H
 
D
-
 
C
P
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
Y
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
E
C
 
A
G
 
S
G
 
G
D
 
N
A
 
I
G
 
D
K
 
K
T
 
C
Q
 
V
A
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
A
-
 
H
D
 
E
G
 
P
R
 
R
L
 
M
A
 
M
V
 
L
L
 
I
A
x
S
G
 
G
E
|
E
D
|
D
I
 
A
Q
 
I
I
x
N
F
 
Y
G
 
P
N
 
I
V
 
L
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
K
G
 
G
A
 
V
I
|
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
S
H
 
N
L
 
L
H
 
L
T
 
P
E
 
D
R
 
M
F
 
I
V
 
S
A
 
A
V
 
L
L
 
T
K
 
H
A
 
F
L
 
A
A
 
L
R
 
D
A
 
E
D
 
N
L
 
Y
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
K
Q
 
I
W
 
N
Q
 
D
P
 
E
L
 
L
V
 
Y
P
 
N
L
 
I
I
 
N
E
 
K
L
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
I
K
 
K
A
 
T
M
 
A
L
 
M
A
 
Y
R
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
E
A
 
S
-
 
L
E
 
E
V
 
F
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L

7kkdB Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84a mutant with pyruvate bound in the active site and r,r-bislysine bound at the allosteric site
29% identity, 85% coverage: 11:279/318 of query aligns to 16:283/306 of 7kkdB

query
sites
7kkdB
G
 
G
L
 
A
W
 
M
V
 
T
P
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
R
 
K
D
 
N
Q
 
G
A
 
K
V
 
V
D
 
D
H
 
E
E
 
Q
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
T
 
R
L
 
L
T
 
I
R
 
K
A
 
R
L
 
Q
A
 
I
P
 
E
T
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
D
G
 
A
F
 
V
V
 
V
V
 
P
C
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
P
 
A
A
 
T
L
|
L
G
 
T
E
 
H
E
 
E
E
 
E
Q
x
H
L
 
R
T
 
T
C
 
C
L
 
I
D
 
E
T
 
I
V
 
A
A
 
V
R
 
E
N
 
T
A
 
C
Q
 
K
G
 
G
L
 
T
P
 
K
L
 
-
V
 
V
M
 
K
G
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
A
D
 
G
T
 
S
R
 
A
A
 
A
W
 
T
V
 
H
E
|
E
R
 
A
L
 
V
S
 
G
A
 
L
L
 
A
G
 
K
T
 
F
A
 
A
R
 
K
V
 
E
P
 
H
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
V
 
S
P
 
V
A
 
A
P
 
P
H
x
Y
Y
 
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
Y
L
 
E
W
 
H
F
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
S
S
 
V
S
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
L
V
 
L
Y
 
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
C
V
 
E
L
 
I
A
 
S
R
 
T
E
 
D
T
 
T
L
 
I
L
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
F
A
 
R
H
 
D
-
 
C
P
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
Y
A
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
E
C
 
A
G
 
S
G
 
G
D
 
N
A
 
I
G
 
D
K
 
K
T
 
C
Q
 
V
A
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
A
-
 
H
D
 
E
G
 
P
R
 
R
L
 
M
A
 
M
V
 
L
L
 
I
A
 
S
G
 
G
E
 
E
D
 
D
I
 
A
Q
 
I
I
 
N
F
 
Y
G
 
P
N
 
I
V
 
L
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
S
A
 
V
S
 
T
A
 
S
H
 
N
L
 
L
H
 
L
T
 
P
E
 
D
R
 
M
F
 
I
V
 
S
A
 
A
V
 
L
L
 
T
K
 
H
A
 
F
L
 
A
A
 
L
R
 
D
A
 
E
D
 
N
L
 
Y
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
K
Q
 
I
W
 
N
Q
 
D
P
 
E
L
 
L
V
 
Y
P
 
N
L
 
I
I
 
N
E
 
K
L
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
P
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
I
K
 
K
A
 
T
M
 
A
L
 
M
A
 
Y
R
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
E
A
 
S
-
 
L
E
 
E
V
 
F
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L

3di1B Crystal structure of the staphylococcus aureus dihydrodipicolinate synthase-pyruvate complex (see paper)
29% identity, 92% coverage: 9:299/318 of query aligns to 5:291/291 of 3di1B

query
sites
3di1B
F
 
F
S
 
E
G
 
G
L
 
V
W
 
G
V
 
V
P
x
A
L
 
L
V
 
T
T
 
T
P
 
P
F
 
F
R
 
T
D
 
N
Q
 
N
A
 
K
V
 
V
D
 
N
H
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
T
 
T
L
 
H
T
 
V
R
 
N
A
 
F
L
 
L
A
 
L
P
 
E
T
 
N
G
 
N
I
 
A
A
 
Q
G
 
A
F
 
I
V
 
I
V
 
V
C
 
N
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
A
E
 
E
A
 
S
P
 
P
A
 
T
L
 
L
G
 
T
E
 
T
E
 
D
E
 
E
Q
 
K
L
 
E
T
 
R
C
 
I
L
 
L
D
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
I
R
 
D
N
 
L
A
 
V
-
 
D
Q
 
K
G
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
G
G
 
T
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
N
D
 
D
T
 
T
R
 
E
A
 
K
W
 
S
V
 
I
E
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
I
R
 
Q
L
 
A
S
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
D
G
 
A
L
 
I
L
 
M
V
 
L
P
 
I
A
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
T
S
 
N
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
K
W
 
H
F
 
F
E
 
E
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
V
S
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
V
V
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
N
A
 
M
V
 
T
L
 
I
A
 
E
R
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
L
 
E
A
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
H
 
H
P
 
P
N
 
Y
I
 
I
R
 
V
A
 
A
V
 
L
K
|
K
D
 
D
C
 
A
G
 
T
G
 
N
D
 
D
A
 
F
-
 
E
-
 
Y
-
 
L
G
 
E
K
 
E
T
 
V
Q
 
K
A
 
K
L
 
R
I
 
I
A
 
D
D
 
T
G
 
N
R
 
S
L
 
F
A
 
A
V
 
L
L
 
Y
A
 
S
G
 
G
E
 
N
D
 
D
I
 
D
Q
 
N
I
 
V
F
 
V
G
 
E
N
 
Y
V
 
Y
A
 
Q
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
V
I
|
I
A
 
S
A
 
V
S
 
I
A
 
A
H
 
N
L
 
V
H
 
I
T
 
P
E
 
K
R
 
E
F
 
F
V
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
Y
K
 
D
A
 
A
L
 
-
A
 
Q
R
 
Q
A
 
S
D
 
G
L
 
L
E
 
D
A
 
-
A
 
I
R
 
Q
A
 
D
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
K
P
 
P
L
 
I
V
 
G
P
 
T
L
 
L
I
 
L
E
 
S
L
 
A
L
 
L
F
 
S
A
 
V
E
 
D
P
 
I
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
I
K
 
K
A
 
A
M
 
L
L
 
T
A
 
S
R
 
Y
Q
 
L
G
 
G
L
 
F
I
 
G
R
 
N
A
 
Y
E
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
V
G
 
S
I
 
L
S
 
E
A
 
D
A
 
T
L
 
D
Q
 
T
Q
 
K
R
 
V
L
 
L
G
 
R
A
 
E
L
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
T
V
 
F
P
 
K
A
 
A

Q5HG25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Staphylococcus aureus (strain COL) (see paper)
29% identity, 92% coverage: 9:299/318 of query aligns to 5:291/295 of Q5HG25

query
sites
Q5HG25
F
 
F
S
 
E
G
 
G
L
 
V
W
 
G
V
 
V
P
 
A
L
 
L
V
 
T
T
 
T
P
 
P
F
 
F
R
 
T
D
 
N
Q
 
N
A
 
K
V
 
V
D
 
N
H
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
T
 
T
L
 
H
T
 
V
R
 
N
A
 
F
L
 
L
A
 
L
P
 
E
T
 
N
G
 
N
I
 
A
A
 
Q
G
 
A
F
 
I
V
 
I
V
 
V
C
 
N
G
 
G
T
 
T
T
|
T
G
 
A
E
 
E
A
 
S
P
 
P
A
 
T
L
 
L
G
 
T
E
 
T
E
 
D
E
 
E
Q
 
K
L
 
E
T
 
R
C
 
I
L
 
L
D
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
I
R
 
D
N
 
L
A
 
V
-
 
D
Q
 
K
G
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
I
M
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
G
G
 
T
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
N
D
 
D
T
 
T
R
 
E
A
 
K
W
 
S
V
 
I
E
 
Q
R
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
A
L
 
S
G
 
I
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
V
 
A
P
 
L
S
 
G
L
 
A
R
 
D
G
 
A
L
 
I
L
 
M
V
 
L
P
 
I
A
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
 
Y
V
 
N
R
 
K
P
 
T
S
 
N
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
K
W
 
H
F
 
F
E
 
E
T
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
V
S
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
V
V
 
L
Y
 
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
S
R
 
R
T
 
T
G
 
N
A
 
M
V
 
T
L
 
I
A
 
E
R
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
L
 
E
A
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
H
 
H
P
 
P
N
 
Y
I
 
I
R
 
V
A
 
A
V
 
L
K
|
K
D
 
D
C
 
A
G
 
T
G
 
N
D
 
D
A
 
F
-
 
E
-
 
Y
-
 
L
G
 
E
K
 
E
T
 
V
Q
 
K
A
 
K
L
 
R
I
 
I
A
 
D
D
 
T
G
 
N
R
 
S
L
 
F
A
 
A
V
 
L
L
 
Y
A
 
S
G
 
G
E
 
N
D
 
D
I
 
D
Q
 
N
I
 
V
F
 
V
G
 
E
N
 
Y
V
 
Y
A
 
Q
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
S
A
 
V
S
 
I
A
 
A
H
 
N
L
 
V
H
 
I
T
 
P
E
 
K
R
 
E
F
 
F
V
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
Y
K
 
D
A
 
A
L
 
-
A
 
Q
R
 
Q
A
 
S
D
 
G
L
 
L
E
 
D
A
 
-
A
 
I
R
 
Q
A
 
D
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
K
P
 
P
L
 
I
V
 
G
P
 
T
L
 
L
I
 
L
E
 
S
L
 
A
L
 
L
F
 
S
A
 
V
E
 
D
P
 
I
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
V
 
I
K
 
K
A
 
A
M
 
L
L
 
T
A
 
S
R
 
Y
Q
 
L
G
 
G
L
 
F
I
 
G
R
 
N
A
 
Y
E
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
M
 
L
T
 
V
G
 
S
I
 
L
S
 
E
A
 
D
A
 
T
L
 
D
Q
 
T
Q
 
K
R
 
V
L
 
L
G
 
R
A
 
E
L
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
T
V
 
F
P
 
K
A
 
A

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
30% identity, 90% coverage: 9:294/318 of query aligns to 5:289/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
F
 
F
S
 
G
G
 
T
L
 
V
W
 
L