SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_051400431.1 NCBI__GCF_000504245.1:WP_051400431.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1p9lA Structure of m. Tuberculosis dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pdc (see paper)
65% identity, 100% coverage: 1:235/235 of query aligns to 12:244/245 of 1p9lA

query
sites
1p9lA
M
x
V
G
 
G
S
 
T
E
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
A
G
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
M
 
L
E
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
D
T
 
G
G
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
V
|
V
V
 
V
M
 
M
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
F
 
F
C
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
N
G
 
G
I
 
I
H
 
H
V
 
A
A
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
V
R
 
E
E
 
S
W
 
W
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
K
P
 
P
D
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
R
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
Y
 
F
E
 
D
T
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
|
H
N
 
P
R
 
H
K
|
K
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
T
 
A
H
 
R
T
 
T
A
 
A
R
 
K
A
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
K
 
K
D
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
G
 
P
A
 
P
A
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
T
 
S
S
 
T
E
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
|
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
H
 
D
R
 
R
S
 
T
S
 
S
F
|
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
R
V
 
I
R
 
A
T
 
E
H
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
P
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1c3vA Dihydrodipicolinate reductase from mycobacterium tuberculosis complexed with NADPH and pdc (see paper)
65% identity, 100% coverage: 1:235/235 of query aligns to 12:244/245 of 1c3vA

query
sites
1c3vA
M
x
V
G
 
G
S
 
T
E
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
A
G
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
M
 
L
E
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
D
T
 
G
G
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
V
|
V
V
 
V
M
 
M
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
F
 
F
C
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
N
G
 
G
I
 
I
H
 
H
V
 
A
A
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
V
R
 
E
E
 
S
W
 
W
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
K
P
 
P
D
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
 
F
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
R
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
Y
 
F
E
 
D
T
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
 
H
N
 
P
R
 
H
K
|
K
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
T
 
A
H
 
R
T
 
T
A
 
A
R
 
K
A
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
K
 
K
D
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
G
 
P
A
 
P
A
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
T
 
S
S
 
T
E
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
|
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
H
 
D
R
 
R
S
 
T
S
 
S
F
|
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
R
V
 
I
R
 
A
T
 
E
H
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
P
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5ugvA Dapb from mycobacterium tuberculosis (see paper)
65% identity, 100% coverage: 1:235/235 of query aligns to 13:245/245 of 5ugvA

query
sites
5ugvA
M
x
V
G
 
G
S
 
A
E
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
A
G
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
M
 
L
E
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
D
T
 
G
G
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
V
|
V
V
 
V
M
 
M
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
F
 
F
C
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
N
G
 
G
I
 
I
H
 
H
V
 
A
A
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
V
R
 
E
E
 
S
W
 
W
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
K
P
 
P
D
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
R
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
Y
 
F
E
 
D
T
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
L
H
 
H
H
 
H
N
 
P
R
 
H
K
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
A
H
 
R
T
 
T
A
 
A
R
 
K
A
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
K
 
K
D
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
G
 
P
A
 
P
A
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
T
 
S
S
 
T
E
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
H
 
D
R
 
R
S
 
T
S
 
S
F
 
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
R
V
 
I
R
 
A
T
 
E
H
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
P
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5tjzA Structure of 4-hydroxytetrahydrodipicolinate reductase from mycobacterium tuberculosis with NADPH and 2,6 pyridine dicarboxylic acid (see paper)
65% identity, 100% coverage: 1:235/235 of query aligns to 13:245/245 of 5tjzA

query
sites
5tjzA
M
x
V
G
 
G
S
 
A
E
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
A
G
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
M
 
L
E
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
|
D
A
|
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
D
T
 
G
G
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
M
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
F
 
F
C
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
N
G
 
G
I
 
I
H
 
H
V
 
A
A
 
V
V
 
V
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
V
R
 
E
E
 
S
W
 
W
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
K
P
 
P
D
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
R
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
Y
 
F
E
 
D
T
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
|
H
N
 
P
R
 
H
K
|
K
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
T
 
A
H
 
R
T
 
T
A
 
A
R
 
K
A
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
K
 
K
D
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
G
 
P
A
 
P
A
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
T
 
S
S
 
T
E
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
|
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
H
 
D
R
 
R
S
 
T
S
 
S
F
|
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
R
V
 
I
R
 
A
T
 
E
H
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
P
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P9WP23 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
65% identity, 100% coverage: 1:235/235 of query aligns to 12:244/245 of P9WP23

query
sites
P9WP23
M
x
V
G
 
G
S
 
A
E
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
A
G
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
M
 
L
E
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
|
D
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
D
T
 
G
G
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
M
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
F
 
F
C
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
N
G
 
G
I
 
I
H
 
H
V
 
A
A
 
V
V
 
V
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
V
R
 
E
E
 
S
W
 
W
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
K
P
 
P
D
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
|
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
R
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
Y
 
F
E
 
D
T
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
L
H
 
H
H
 
H
N
 
P
R
 
H
K
|
K
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
A
H
 
R
T
 
T
A
 
A
R
 
K
A
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
K
 
K
D
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
G
 
P
A
 
P
A
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
T
 
S
S
 
T
E
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
H
 
D
R
 
R
S
 
T
S
 
S
F
 
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
R
V
 
I
R
 
A
T
 
E
H
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
P
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1yl5A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis dihydrodipicolinate reductase (rv2773c) (crystal form a) (see paper)
65% identity, 100% coverage: 1:235/235 of query aligns to 14:246/247 of 1yl5A

query
sites
1yl5A
M
 
V
G
 
G
S
 
A
E
 
T
V
 
M
C
 
V
A
 
R
A
 
A
V
|
V
D
x
A
G
 
A
A
|
A
D
 
D
D
 
D
M
x
L
E
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
D
T
 
G
G
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
 
H
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
M
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
F
 
F
C
 
L
V
 
I
D
 
D
N
 
N
G
 
G
I
 
I
H
 
H
V
 
A
A
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
V
R
 
E
E
 
S
W
 
W
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
K
P
 
P
D
 
N
V
 
T
G
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
S
M
 
M
R
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
Y
 
F
E
 
D
T
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
 
H
N
 
P
R
 
H
K
|
K
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
A
H
 
R
T
 
T
A
 
A
R
 
K
A
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
R
K
 
K
D
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
G
 
P
A
 
P
A
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
T
 
S
S
 
T
E
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
L
H
 
D
R
 
R
S
 
T
S
 
S
F
 
F
M
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
R
V
 
I
R
 
A
T
 
E
H
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
P
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L

5eesA Crystal structure of dapb in complex with NADP+ from corynebacterium glutamicum (see paper)
58% identity, 100% coverage: 1:235/235 of query aligns to 13:247/247 of 5eesA

query
sites
5eesA
M
x
V
G
 
G
S
 
Q
E
 
T
V
 
I
C
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
N
G
 
E
A
 
S
D
 
D
D
 
D
M
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
I
D
x
G
A
x
V
G
 
D
D
 
D
Q
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
T
 
V
E
 
D
T
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
 
T
P
 
P
D
 
N
V
 
A
V
 
V
M
 
M
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
F
 
F
C
 
C
V
 
I
D
 
N
N
 
N
G
 
G
I
 
I
H
 
S
V
 
A
A
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
D
E
 
D
E
 
A
R
 
R
H
 
L
Q
 
E
T
 
Q
L
 
V
R
 
R
E
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
E
A
 
G
K
 
K
P
 
D
D
 
N
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
A
 
A
L
 
I
G
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
T
M
 
M
R
 
V
F
 
F
A
 
S
E
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
Y
 
F
E
 
E
T
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
|
H
N
 
P
R
 
N
K
|
K
A
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
T
 
I
H
 
H
T
 
T
A
 
A
R
 
Q
A
 
G
I
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
M
G
 
D
A
 
A
A
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
T
 
E
S
 
Q
E
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
M
A
 
S
G
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Q
 
E
E
 
Q
V
 
V
L
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
T
Q
 
Q
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
K
H
 
Q
D
 
D
S
 
S
L
 
Y
H
 
D
R
 
R
S
 
N
S
 
S
F
|
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
R
E
 
N
V
 
I
R
 
A
T
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5eerA Crystal structure of dapb from corynebacterium glutamicum (see paper)
58% identity, 100% coverage: 1:235/235 of query aligns to 13:247/247 of 5eerA

query
sites
5eerA
M
 
V
G
 
G
S
 
Q
E
 
T
V
 
I
C
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
N
G
 
E
A
 
S
D
 
D
D
 
D
M
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
I
D
 
G
A
 
V
G
 
D
D
 
D
Q
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
T
 
V
E
 
D
T
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
 
T
P
 
P
D
 
N
V
 
A
V
 
V
M
 
M
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
F
 
F
C
 
C
V
 
I
D
 
N
N
 
N
G
 
G
I
 
I
H
 
S
V
 
A
A
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
F
 
F
T
 
D
E
 
D
E
 
A
R
 
R
H
 
L
Q
 
E
T
 
Q
L
 
V
R
 
R
E
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
E
A
 
G
K
 
K
P
 
D
D
 
N
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
A
 
A
L
 
I
G
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
T
M
 
M
R
 
V
F
 
F
A
 
S
E
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
Y
 
F
E
 
E
T
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
L
H
|
H
H
|
H
N
 
P
R
 
N
K
|
K
A
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
T
 
I
H
 
H
T
 
T
A
 
A
R
 
Q
A
 
G
I
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
M
G
 
D
A
 
A
A
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
T
 
E
S
 
Q
E
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
M
A
 
S
G
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Q
 
E
E
 
Q
V
 
V
L
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
T
Q
 
Q
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
K
H
 
Q
D
 
D
S
 
S
L
 
Y
H
 
D
R
 
R
S
 
N
S
 
S
F
 
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
R
E
 
N
V
 
I
R
 
A
T
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
G
L
 
L

5z2fA NADPH/pda bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
41% identity, 99% coverage: 1:233/235 of query aligns to 14:265/265 of 5z2fA

query
sites
5z2fA
M
|
M
G
 
G
S
 
Q
E
 
E
V
 
A
C
 
V
A
 
H
A
 
T
V
 
V
D
 
M
G
 
N
A
 
N
D
 
E
D
 
N
M
 
M
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
H
G
x
K
D
 
D
Q
 
I
L
 
G
S
 
D
A
 
L
L
 
L
T
 
S
E
 
E
T
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
F
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
I
G
 
K
A
 
P
E
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
L
D
 
D
F
x
L
T
|
T
H
 
T
P
 
P
D
 
H
V
 
Q
V
 
V
M
 
F
D
 
E
N
 
H
L
 
T
R
 
M
F
 
L
C
 
C
V
 
L
D
 
Q
N
 
N
G
 
N
I
 
V
H
 
R
V
 
P
A
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
D
E
 
E
R
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
C
R
 
T
E
 
-
W
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
V
P
 
N
D
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
C
L
 
I
L
 
V
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
M
M
 
M
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
P
T
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
M
H
|
H
H
|
H
N
 
D
R
 
Q
K
|
K
A
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
T
 
Y
H
 
K
T
 
T
A
 
A
R
 
Q
A
 
M
I
 
I
S
 
A
A
 
E
A
 
V
R
 
R
K
 
P
D
 
S
A
 
H
G
 
K
L
 
Q
G
 
G
A
 
H
A
 
P
P
 
N
D
 
E
A
 
K
T
 
E
T
 
T
S
 
-
E
 
-
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
Y
D
 
D
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
I
H
 
H
S
 
S
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
|
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
E
 
Q
T
 
L
L
 
F
T
 
T
I
 
L
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
Y
H
 
N
R
 
R
S
 
Q
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
T
L
 
F
G
 
S
V
 
I
R
 
N
E
 
Q
V
 
V
R
 
M
T
 
E
H
 
I
P
 
K
G
 
E
L
 
L
T
 
V
I
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
N
F
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5z2eA Dipicolinate bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
41% identity, 99% coverage: 1:233/235 of query aligns to 14:265/265 of 5z2eA

query
sites
5z2eA
M
 
M
G
 
G
S
 
Q
E
 
E
V
 
A
C
 
V
A
 
H
A
 
T
V
 
V
D
 
M
G
 
N
A
 
N
D
 
E
D
 
N
M
 
M
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
H
G
 
K
D
 
D
Q
 
I
L
 
G
S
 
D
A
 
L
L
 
L
T
 
S
E
 
E
T
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
F
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
F
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
I
G
 
K
A
 
P
E
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
L
D
 
D
F
 
L
T
 
T
H
 
T
P
 
P
D
 
H
V
 
Q
V
 
V
M
 
F
D
 
E
N
 
H
L
 
T
R
 
M
F
 
L
C
 
C
V
 
L
D
 
Q
N
 
N
G
 
N
I
 
V
H
 
R
V
 
P
A
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
D
E
 
E
R
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
C
R
 
T
E
 
-
W
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
V
P
 
N
D
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
C
L
 
I
L
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
M
M
 
M
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
P
T
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
M
H
|
H
H
|
H
N
 
D
R
 
Q
K
|
K
A
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
T
 
Y
H
 
K
T
 
T
A
 
A
R
 
Q
A
 
M
I
 
I
S
 
A
A
 
E
A
 
V
R
 
R
K
 
P
D
 
S
A
 
H
G
 
K
L
 
Q
G
 
G
A
 
H
A
 
P
P
 
N
D
 
E
A
 
K
T
 
E
T
 
T
S
 
-
E
 
-
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
Y
D
 
D
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
I
H
 
H
S
 
S
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
E
 
Q
T
 
L
L
 
F
T
 
T
I
 
L
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
S
L
 
Y
H
 
N
R
 
R
S
 
Q
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
T
L
 
F
G
 
S
V
 
I
R
 
N
E
 
Q
V
 
V
R
 
M
T
 
E
H
 
I
P
 
K
G
 
E
L
 
L
T
 
V
I
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
N
F
 
I
L
 
L

5wolA Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase dapb from coxiella burnetii
39% identity, 99% coverage: 1:233/235 of query aligns to 13:230/230 of 5wolA

query
sites
5wolA
M
|
M
G
 
G
S
 
R
E
 
V
V
 
V
C
 
K
A
 
E
A
 
N
V
 
I
D
 
T
G
 
A
A
 
Q
D
 
S
D
 
D
M
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
R
 
G
L
 
T
D
x
G
A
x
R
G
 
Q
D
 
D
Q
 
D
L
 
L
S
 
A
A
 
K
L
 
T
T
 
I
E
 
Q
T
 
T
G
 
T
-
 
H
A
 
A
E
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
x
T
P
 
P
D
 
Q
V
x
S
V
 
V
M
 
F
D
 
H
N
 
N
L
 
A
R
 
E
F
 
I
C
 
I
V
 
I
D
 
Q
N
 
S
G
 
G
I
 
A
H
 
R
V
 
P
A
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
F
 
L
T
 
T
E
 
L
E
 
E
R
 
Q
H
 
I
Q
 
A
T
 
L
L
 
L
R
 
D
E
 
K
W
 
Q
L
 
C
A
 
R
A
 
N
K
 
K
P
 
-
D
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
A
L
 
I
L
 
V
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
|
F
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
M
M
 
M
R
 
K
F
 
Y
A
 
A
E
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
H
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
P
T
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
M
H
|
H
H
 
H
N
 
S
R
 
Q
K
|
K
A
 
I
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
|
T
A
 
A
T
 
I
H
x
K
T
 
T
A
 
A
R
 
Q
A
 
M
I
 
I
S
 
G
A
 
E
A
 
M
R
 
R
K
 
S
D
 
S
A
 
R
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
E
R
 
I
V
 
K
D
 
N
D
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
I
H
 
H
S
 
S
V
 
I
R
 
R
L
 
L
A
 
P
G
 
G
L
 
L
V
 
F
A
 
S
H
 
H
Q
 
Q
E
 
S
V
 
V
L
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
S
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
R
 
R
H
 
H
D
 
D
S
 
G
L
 
M
H
 
D
R
 
R
S
 
N
S
 
C
F
 
T
M
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
I
L
 
F
L
 
M
G
 
A
V
 
C
R
 
R
E
 
K
V
 
V
R
 
M
T
 
E
H
 
L
P
 
D
G
 
Y
L
 
L
T
 
V
I
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
N
F
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5temA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,6 pyridine dicarboxylic and nadh (see paper)
32% identity, 76% coverage: 36:213/235 of query aligns to 70:244/266 of 5temA

query
sites
5temA
E
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
 
A
P
 
P
D
 
A
V
x
S
V
 
T
M
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
L
R
 
A
F
 
L
C
 
C
V
 
Q
D
 
Q
N
 
Y
G
 
G
I
 
K
H
 
S
V
 
I
A
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
H
 
R
Q
 
E
T
 
Q
L
 
I
R
 
D
E
 
-
W
 
-
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
Q
P
 
-
D
 
Q
V
 
V
G
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
M
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
x
Y
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
M
 
V
M
 
F
R
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
Y
 
Y
E
 
C
T
 
D
A
 
I
E
 
E
V
 
I
I
 
V
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
|
H
N
 
R
R
 
H
K
|
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
T
 
I
H
 
G
T
 
M
A
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
A
A
 
G
A
 
A
R
 
M
K
 
G
D
 
N
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
L
P
 
S
D
 
D
A
 
V
T
 
A
T
 
V
S
 
Y
E
 
A
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
T
-
 
K
D
 
D
D
 
E
V
 
I
A
 
G
V
 
F
H
 
A
S
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
V
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
L
 
T
H
 
D
R
 
R
S
 
M
S
 
T
F
|
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5tejB Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
32% identity, 76% coverage: 36:213/235 of query aligns to 70:244/269 of 5tejB

query
sites
5tejB
E
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
 
A
P
 
P
D
 
A
V
x
S
V
 
T
M
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
L
R
 
A
F
 
L
C
 
C
V
 
Q
D
 
Q
N
 
Y
G
 
G
I
 
K
H
 
S
V
 
I
A
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
H
 
R
Q
 
E
T
 
Q
L
 
I
R
 
D
E
 
-
W
 
-
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
Q
P
 
-
D
 
Q
V
 
V
G
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
M
A
 
A
P
|
P
N
|
N
F
x
Y
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
M
 
V
M
 
F
R
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
Y
 
Y
E
 
C
T
 
D
A
 
I
E
 
E
V
 
I
I
 
V
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
|
H
N
 
R
R
 
H
K
|
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
T
 
I
H
 
G
T
 
M
A
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
A
A
 
G
A
 
A
R
 
M
K
 
G
D
 
N
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
L
P
 
S
D
 
D
A
 
V
T
 
A
T
 
V
S
 
Y
E
 
A
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
T
-
 
K
D
 
D
D
 
E
V
 
I
A
 
G
V
 
F
H
 
A
S
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
V
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
L
 
T
H
 
D
R
 
R
S
 
M
S
 
T
F
|
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5tejA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
32% identity, 76% coverage: 36:213/235 of query aligns to 70:244/269 of 5tejA

query
sites
5tejA
E
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
 
A
P
 
P
D
 
A
V
x
S
V
 
T
M
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
L
R
 
A
F
 
L
C
 
C
V
 
Q
D
 
Q
N
 
Y
G
 
G
I
 
K
H
 
S
V
 
I
A
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
H
 
R
Q
 
E
T
 
Q
L
 
I
R
 
D
E
 
-
W
 
-
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
Q
P
 
-
D
 
Q
V
 
V
G
 
P
V
 
V
L
 
V
L
 
M
A
 
A
P
|
P
N
 
N
F
 
Y
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
M
 
V
M
 
F
R
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
Y
 
Y
E
 
C
T
 
D
A
 
I
E
 
E
V
 
I
I
 
V
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
 
H
N
 
R
R
 
H
K
|
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
I
H
 
G
T
 
M
A
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
A
A
 
G
A
 
A
R
 
M
K
 
G
D
 
N
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
L
P
 
S
D
 
D
A
 
V
T
 
A
T
 
V
S
 
Y
E
 
A
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
T
-
 
K
D
 
D
D
 
E
V
 
I
A
 
G
V
 
F
H
 
A
S
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
V
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
L
 
T
H
 
D
R
 
R
S
 
M
S
 
T
F
 
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

4ywjA Crystal structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase (htpa reductase) from pseudomonas aeruginosa
32% identity, 76% coverage: 36:213/235 of query aligns to 71:245/268 of 4ywjA

query
sites
4ywjA
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
 
H
P
 
P
D
 
S
V
|
V
V
 
T
M
 
L
D
 
K
N
 
N
L
 
I
R
 
E
F
 
Q
C
 
C
V
 
R
D
 
K
N
 
A
G
 
R
I
 
R
H
 
A
V
 
M
A
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
S
E
 
A
E
 
D
R
 
E
H
 
K
Q
 
L
T
 
L
L
 
L
R
 
A
E
 
E
W
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
A
K
 
A
P
 
K
D
 
D
V
 
I
G
 
P
V
 
I
L
 
V
L
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
F
|
F
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
L
M
 
C
M
 
L
R
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
D
L
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
V
Y
 
L
E
 
G
T
 
D
A
 
E
-
 
V
-
 
D
-
 
I
E
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
 
H
N
 
R
R
 
H
K
|
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
L
H
 
R
T
 
M
A
 
G
R
 
E
A
 
V
I
 
V
S
 
A
A
 
Q
A
 
A
R
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
G
 
G
A
 
R
-
 
D
A
 
L
P
 
Q
D
 
E
A
 
V
T
 
A
T
 
V
S
 
Y
E
 
G
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
Q
R
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
A
-
 
R
D
 
E
D
 
T
V
 
I
A
 
G
V
 
F
H
 
A
S
 
T
V
 
V
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
V
V
 
V
A
 
G
H
 
D
Q
 
H
E
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
A
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
V
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
L
 
S
H
 
S
R
|
R
S
 
M
S
 
T
F
|
F
M
 
A
P
 
R
G
 
G
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

1drvA Escherichia coli dhpr/acnadh complex (see paper)
34% identity, 76% coverage: 36:213/235 of query aligns to 71:245/270 of 1drvA

query
sites
1drvA
E
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
x
R
P
 
P
D
 
E
V
x
G
V
 
T
M
 
L
D
 
N
N
 
H
L
 
L
R
 
A
F
 
F
C
 
C
V
 
R
D
 
Q
N
 
H
G
 
G
I
 
K
H
 
G
V
 
M
A
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
F
 
F
T
 
D
E
 
E
E
 
A
R
 
G
H
 
K
Q
 
Q
T
 
A
L
 
I
R
 
R
E
 
D
W
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
D
K
 
I
P
 
A
D
 
I
V
 
V
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
A
 
A
P
x
A
N
 
N
F
|
F
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
M
 
M
M
 
L
R
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
Y
 
Y
E
 
T
T
 
D
A
 
I
E
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
 
H
N
 
R
R
 
H
K
|
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
L
H
 
A
T
 
M
A
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
A
-
 
H
A
 
A
A
 
L
R
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
L
P
 
K
D
 
D
A
 
C
T
 
A
T
 
V
S
 
Y
E
 
S
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
H
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
V
-
 
P
D
 
G
D
 
T
V
 
I
A
 
G
V
 
F
H
 
A
S
 
T
V
 
V
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
L
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
L
 
S
H
 
S
R
|
R
S
 
M
S
 
T
F
 
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

1druA Escherichia coli dhpr/nadh complex (see paper)
34% identity, 76% coverage: 36:213/235 of query aligns to 71:245/270 of 1druA

query
sites
1druA
E
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
x
R
P
 
P
D
 
E
V
x
G
V
 
T
M
 
L
D
 
N
N
 
H
L
 
L
R
 
A
F
 
F
C
 
C
V
 
R
D
 
Q
N
 
H
G
 
G
I
 
K
H
 
G
V
 
M
A
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
D
E
 
E
E
 
A
R
 
G
H
 
K
Q
 
Q
T
 
A
L
 
I
R
 
R
E
 
D
W
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
D
K
 
I
P
 
A
D
 
I
V
 
V
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
F
|
F
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
M
 
M
M
 
L
R
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
Y
 
Y
E
 
T
T
 
D
A
 
I
E
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
 
H
N
 
R
R
 
H
K
|
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
L
H
 
A
T
 
M
A
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
A
-
 
H
A
 
A
A
 
L
R
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
L
P
 
K
D
 
D
A
 
C
T
 
A
T
 
V
S
 
Y
E
 
S
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
H
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
V
-
 
P
D
 
G
D
 
T
V
 
I
A
 
G
V
 
F
H
 
A
S
 
T
V
 
V
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
L
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
L
 
S
H
 
S
R
 
R
S
 
M
S
 
T
F
|
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

1arzA Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
34% identity, 76% coverage: 36:213/235 of query aligns to 71:245/270 of 1arzA

query
sites
1arzA
E
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
 
R
P
 
P
D
 
E
V
 
G
V
 
T
M
 
L
D
 
N
N
 
H
L
 
L
R
 
A
F
 
F
C
 
C
V
 
R
D
 
Q
N
 
H
G
 
G
I
 
K
H
 
G
V
 
M
A
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
F
 
F
T
 
D
E
 
E
E
 
A
R
 
G
H
 
K
Q
 
Q
T
 
A
L
 
I
R
 
R
E
 
D
W
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
D
K
 
I
P
 
A
D
 
I
V
 
V
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
A
 
A
P
 
A
N
 
N
F
 
F
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
M
 
M
M
 
L
R
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
Y
 
Y
E
 
T
T
 
D
A
 
I
E
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
|
H
N
 
R
R
 
H
K
|
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
L
H
 
A
T
 
M
A
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
A
-
 
H
A
 
A
A
 
L
R
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
L
P
 
K
D
 
D
A
 
C
T
 
A
T
 
V
S
 
Y
E
 
S
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
H
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
V
-
 
P
D
 
G
D
 
T
V
 
I
A
 
G
V
 
F
H
 
A
S
 
T
V
 
V
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
L
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
L
 
S
H
 
S
R
 
R
S
 
M
S
 
T
F
 
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V

1arzB Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
34% identity, 76% coverage: 36:213/235 of query aligns to 70:244/269 of 1arzB

query
sites
1arzB
E
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
x
R
P
 
P
D
 
E
V
x
G
V
 
T
M
 
L
D
 
N
N
x
H
L
 
L
R
 
A
F
 
F
C
 
C
V
 
R
D
 
Q
N
 
H
G
 
G
I
 
K
H
 
G
V
 
M
A
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
D
E
 
E
E
 
A
R
 
G
H
 
K
Q
 
Q
T
 
A
L
 
I
R
 
R
E
 
D
W
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
D
K
 
I
P
 
A
D
 
I
V
 
V
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
F
|
F
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
M
 
M
M
 
L
R
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
Y
 
Y
E
 
T
T
 
D
A
 
I
E
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
|
H
N
 
R
R
 
H
K
|
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
T
 
L
H
 
A
T
 
M
A
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
A
-
 
H
A
 
A
A
 
L
R
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
L
P
 
K
D
 
D
A
 
C
T
 
A
T
 
V
S
 
Y
E
 
S
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
H
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
V
-
 
P
D
 
G
D
 
T
V
 
I
A
 
G
V
 
F
H
 
A
S
 
T
V
 
V
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
L
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
L
 
S
H
 
S
R
 
R
S
 
M
S
 
T
F
|
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

1drwA Escherichia coli dhpr/nhdh complex (see paper)
34% identity, 76% coverage: 36:213/235 of query aligns to 73:247/272 of 1drwA

query
sites
1drwA
E
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
H
x
R
P
 
P
D
 
E
V
 
G
V
 
T
M
 
L
D
 
N
N
 
H
L
 
L
R
 
A
F
 
F
C
 
C
V
 
R
D
 
Q
N
 
H
G
 
G
I
 
K
H
 
G
V
 
M
A
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
F
 
F
T
 
D
E
 
E
E
 
A
R
 
G
H
 
K
Q
 
Q
T
 
A
L
 
I
R
 
R
E
 
D
W
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
D
K
 
I
P
 
A
D
 
I
V
 
V
G
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
F
|
F
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
N
L
 
V
M
 
M
M
 
L
R
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
Y
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
D
Y
 
Y
E
 
T
T
 
D
A
 
I
E
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
E
L
 
A
H
|
H
H
 
H
N
 
R
R
 
H
K
|
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
L
H
 
A
T
 
M
A
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
A
-
 
H
A
 
A
A
 
L
R
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
L
P
 
K
D
 
D
A
 
C
T
 
A
T
 
V
S
 
Y
E
 
S
L
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
H
R
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
V
-
 
P
D
 
G
D
 
T
V
 
I
A
 
G
V
 
F
H
 
A
S
 
T
V
 
V
R
 
R
L
 
A
A
 
G
G
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
G
H
 
E
Q
 
H
E
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
L
T
 
E
I
 
I
R
 
T
H
 
H
D
 
K
S
 
A
L
 
S
H
 
S
R
 
R
S
 
M
S
 
T
F
|
F
M
 
A
P
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_051400431.1 NCBI__GCF_000504245.1:WP_051400431.1
MGSEVCAAVDGADDMELVARLDAGDQLSALTETGAEVVVDFTHPDVVMDNLRFCVDNGIH
VAVGTSGFTEERHQTLREWLAAKPDVGVLLAPNFALGAVLMMRFAELAARYYETAEVIEL
HHNRKADAPSGTATHTARAISAARKDAGLGAAPDATTSELDGARGARVDDVAVHSVRLAG
LVAHQEVLFGGQGETLTIRHDSLHRSSFMPGVLLGVREVRTHPGLTIGLDQFLDL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory