SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_051511580.1 NCBI__GCF_000576635.1:WP_051511580.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ioyA Crystal structure of thermoanaerobacter tengcongensis ribose binding protein (see paper)
38% identity, 81% coverage: 44:317/337 of query aligns to 1:273/274 of 2ioyA

query
sites
2ioyA
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
V
M
 
I
S
 
S
F
 
T
S
 
L
N
 
N
T
x
N
E
 
P
W
x
F
I
x
F
K
 
V
Q
 
T
M
 
L
Q
 
K
A
 
N
G
 
G
V
 
A
V
 
E
E
 
E
T
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
E
Y
 
L
G
 
G
M
 
Y
N
 
K
T
 
I
I
 
I
V
 
V
Y
 
E
D
 
D
A
 
S
N
 
Q
D
 
N
Q
 
D
P
 
S
T
 
S
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
R
 
S
D
 
N
I
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
Q
R
 
Q
N
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
L
I
 
I
S
 
N
T
 
P
Y
 
V
Y
 
D
A
 
S
E
 
D
A
 
A
I
 
V
R
 
V
P
 
T
A
 
A
V
 
I
Q
 
K
E
 
E
I
 
A
N
 
N
R
 
S
A
 
K
G
 
N
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
I
V
 
T
L
 
I
S
x
D
S
x
R
P
 
S
L
 
-
P
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
G
D
 
D
F
 
V
D
 
V
V
 
C
L
 
H
L
 
I
S
 
A
T
 
S
D
 
D
M
 
N
I
 
V
G
 
K
T
 
G
A
 
G
R
 
E
Q
 
M
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
Y
 
F
Y
 
I
V
 
A
K
 
K
K
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
G
E
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
I
P
 
P
G
 
G
S
 
A
L
 
S
I
x
A
N
 
A
Q
 
R
Q
 
D
R
|
R
G
 
G
S
 
K
G
 
G
W
 
F
R
 
D
E
 
E
V
 
A
I
 
I
D
 
A
A
 
K
A
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
H
 
K
V
 
Q
V
 
A
A
 
A
N
 
D
Y
x
F
D
 
D
R
 
R
T
 
S
Q
 
K
A
 
G
I
 
L
R
 
S
G
 
V
M
 
M
E
 
E
D
 
N
A
 
I
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
K
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
I
G
 
-
E
 
E
F
 
A
G
 
A
R
 
N
E
 
R
K
 
Q
D
 
G
M
 
I
F
 
I
F
 
V
T
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
G
 
G
L
 
-
T
 
T
P
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
A
I
 
I
H
 
K
T
 
E
G
 
G
T
 
K
L
 
M
D
 
A
A
 
A
V
 
T
W
 
I
E
 
A
Y
x
Q
L
 
Q
P
 
P
-
 
A
-
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
S
E
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
M
A
 
A
I
 
D
R
 
K
V
 
Y
L
 
L
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
P
 
K
I
 
I
P
 
P
K
 
N
K
 
F
I
 
I
A
 
P
F
 
A
E
 
E
S
 
L
P
 
K
M
 
L
I
 
I
T
 
T
K
 
K
E
 
E
N
 
N
V
 
V

1dbpA Identical mutations at corresponding positions in two homologous proteins with non-identical effects (see paper)
30% identity, 80% coverage: 45:315/337 of query aligns to 3:271/271 of 1dbpA

query
sites
1dbpA
T
 
T
I
 
I
G
 
A
F
 
L
T
 
V
M
 
V
S
 
S
F
 
T
S
 
L
N
 
N
T
x
N
E
 
P
W
x
F
I
 
F
K
 
V
Q
 
S
M
 
L
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
V
 
A
V
 
Q
E
 
K
T
 
E
A
 
A
K
 
D
K
 
K
Y
 
L
G
 
G
M
 
Y
N
 
N
T
 
L
I
 
V
V
 
V
Y
 
L
D
 
D
A
 
S
N
 
Q
D
 
N
Q
 
N
P
 
P
T
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
N
I
 
V
E
 
Q
D
 
D
L
 
L
L
 
T
V
 
V
R
 
R
N
 
G
V
 
T
D
 
K
V
 
I
I
 
L
I
 
L
I
 
I
S
 
N
T
 
P
Y
 
T
Y
 
D
A
 
S
E
 
D
A
 
A
I
 
V
R
 
D
P
 
N
A
 
A
V
 
V
Q
 
K
E
 
M
I
 
A
N
 
N
R
 
Q
A
 
A
G
 
N
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
I
V
 
T
L
 
L
S
x
D
S
x
R
P
 
Q
L
 
A
P
 
T
E
 
K
G
 
G
A
 
E
D
 
V
F
 
V
D
 
S
V
 
H
L
 
I
L
 
A
S
 
S
T
 
D
D
 
N
M
 
V
I
 
L
G
 
G
T
 
-
A
 
G
R
 
K
Q
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
D
Y
 
Y
Y
 
I
V
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
A
N
 
G
G
 
E
E
 
G
G
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
I
Q
 
E
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
I
P
 
A
G
 
G
S
 
T
L
 
S
I
 
A
N
 
A
Q
 
R
Q
 
E
R
|
R
G
 
G
S
 
E
G
 
G
W
 
F
R
 
Q
E
 
Q
V
 
A
I
 
V
D
 
-
A
 
A
A
 
A
P
 
H
G
 
K
I
 
F
K
 
N
V
 
V
V
 
L
S
 
A
H
 
S
V
 
Q
V
 
P
A
 
A
N
 
D
Y
x
F
D
 
D
R
 
R
T
 
I
Q
 
K
A
 
G
I
 
L
R
 
N
G
 
V
M
 
M
E
 
Q
D
 
N
A
 
L
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
N
 
H
P
 
P
K
 
D
I
 
V
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
L
G
 
Q
E
 
T
F
 
A
G
 
G
R
 
K
E
 
S
K
 
-
D
 
D
M
 
V
F
 
M
F
 
V
T
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
G
 
G
L
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
G
L
 
E
E
 
K
A
 
A
I
 
V
H
 
N
T
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
A
V
 
T
W
 
I
E
 
A
Y
 
Q
L
 
L
P
 
P
-
 
D
-
 
Q
F
 
I
G
 
G
V
 
A
E
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
A
I
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
P
 
K
I
 
V
P
 
Q
K
 
A
K
 
K
I
 
Y
A
 
P
F
 
V
E
 
D
S
 
L
P
 
K
M
 
L
I
 
V
T
 
V
K
 
K
E
 
Q

2x7xA Fructose binding periplasmic domain of hybrid two component system bt1754 (see paper)
31% identity, 78% coverage: 53:316/337 of query aligns to 10:275/301 of 2x7xA

query
sites
2x7xA
S
 
S
N
 
D
T
x
D
E
 
S
W
|
W
I
x
R
K
 
H
Q
 
K
M
 
M
Q
 
N
A
 
D
G
 
E
V
 
I
V
 
L
E
 
R
T
 
E
A
 
A
K
 
M
K
 
F
Y
 
Y
-
 
N
G
 
G
M
 
V
N
 
S
T
 
V
I
 
E
V
 
I
Y
 
R
D
 
S
A
 
A
N
 
G
D
 
D
Q
 
D
P
 
N
T
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
A
R
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
H
D
 
Y
L
 
F
L
 
M
V
 
D
R
 
E
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
I
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
A
Y
 
N
Y
 
E
A
 
A
E
 
A
A
 
P
I
 
M
R
 
T
P
 
P
A
 
I
V
 
V
Q
 
E
E
 
E
I
 
A
N
 
Y
R
 
Q
A
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
I
V
 
L
L
 
V
S
x
D
S
x
R
P
 
K
L
 
I
P
 
L
E
 
S
G
 
D
A
 
K
D
 
-
F
 
Y
D
 
T
V
 
A
L
 
Y
L
 
I
S
 
G
T
 
A
D
 
D
M
 
N
I
 
Y
G
 
E
T
 
I
A
 
G
R
 
R
Q
 
S
A
 
V
G
 
G
Q
 
N
Y
 
Y
Y
 
I
V
 
A
K
 
S
K
 
S
L
 
L
N
 
K
G
 
G
E
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
Q
 
E
I
 
L
E
 
T
G
 
G
K
 
L
P
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
T
I
x
P
N
 
A
Q
 
M
Q
 
E
R
|
R
G
 
H
S
 
Q
G
 
G
W
 
F
R
 
M
E
 
A
V
 
A
I
 
I
D
 
S
A
 
K
A
 
F
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
L
V
 
I
S
 
D
H
 
K
V
 
A
V
 
D
A
 
A
N
 
A
Y
x
W
D
 
E
R
 
R
T
 
G
Q
 
P
A
 
A
I
 
E
R
 
I
G
 
E
M
 
M
E
 
D
D
 
S
A
 
M
L
 
L
Q
 
R
A
 
R
N
 
H
P
 
P
K
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
C
 
A
H
 
H
N
|
N
D
 
D
D
x
R
M
 
I
A
 
A
L
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
K
E
 
M
F
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
E
K
 
K
D
 
E
M
 
M
F
 
I
F
 
F
T
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
G
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
G
T
 
K
P
 
G
E
 
N
A
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
L
I
 
V
H
 
L
T
 
D
G
 
S
T
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
T
W
 
F
E
 
I
Y
 
Y
L
 
P
P
 
T
F
 
N
G
 
G
V
 
D
E
 
K
G
 
V
V
 
L
E
 
Q
A
 
L
A
 
A
I
 
M
R
 
D
V
 
I
L
 
L
Q
 
E
K
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
Y
P
 
P
K
 
K
K
 
E
I
 
T
A
 
V
F
 
M
E
 
N
S
 
T
P
 
A
M
 
V
I
 
V
T
 
D
K
 
R
E
 
T
N
 
N

4zjpA Structure of an abc-transporter solute binding protein (sbp_ipr025997) from actinobacillus succinogenes (asuc_0197, target efi-511067) with bound beta-d-ribopyranose
29% identity, 80% coverage: 44:314/337 of query aligns to 3:270/270 of 4zjpA

query
sites
4zjpA
K
 
E
T
 
T
I
 
I
G
 
A
F
 
L
T
 
T
M
 
V
S
 
S
F
 
T
S
 
L
N
 
D
T
x
N
E
 
P
W
x
F
I
x
F
K
 
V
Q
 
S
M
 
L
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
V
 
A
V
 
Q
E
 
K
T
 
K
A
 
A
K
 
T
K
 
E
Y
 
L
G
 
G
M
 
Y
N
 
K
T
 
L
I
 
V
V
 
V
Y
 
L
D
 
D
A
 
S
N
 
Q
D
 
N
Q
 
D
P
 
P
T
 
S
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
R
 
S
D
 
N
I
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
L
L
 
T
V
 
V
R
 
R
N
 
G
V
 
A
D
 
K
V
 
V
I
 
L
I
 
L
I
 
I
S
 
N
T
 
P
Y
 
T
Y
 
D
A
 
S
E
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
S
P
 
N
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
E
 
I
I
 
A
N
 
N
R
 
R
A
 
N
G
 
K
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
I
V
 
T
L
 
L
S
x
D
S
x
R
P
 
G
L
 
A
P
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
-
D
 
E
F
 
V
D
 
V
V
 
S
L
 
H
L
 
I
S
 
A
T
 
S
D
 
D
M
 
N
I
 
V
G
 
A
T
 
G
A
 
G
R
 
K
Q
 
M
A
 
A
G
 
G
Q
 
D
Y
 
F
Y
 
I
V
 
A
K
 
Q
K
 
K
L
 
L
N
 
G
G
 
D
E
 
G
G
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
I
Q
 
Q
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
L
P
 
A
G
 
G
S
 
T
L
 
S
I
 
A
N
 
A
Q
 
R
Q
 
E
R
|
R
G
 
G
S
 
E
G
 
G
W
 
F
R
 
K
E
 
Q
V
 
A
I
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
H
P
 
K
G
 
-
I
 
F
K
 
D
V
 
V
V
 
L
S
 
A
H
 
S
V
 
Q
V
 
P
A
 
A
N
 
D
Y
x
F
D
 
D
R
 
R
T
 
T
Q
 
K
A
 
G
I
 
L
R
 
N
G
 
V
M
 
T
E
 
E
D
 
N
A
 
L
L
 
L
Q
 
A
A
 
S
N
 
K
P
 
G
K
 
S
I
 
V
D
 
Q
A
 
A
V
 
I
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
I
G
 
S
E
 
A
F
 
A
G
 
G
R
 
-
E
 
-
K
 
K
D
 
K
M
 
V
F
 
L
F
 
V
T
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
G
 
G
L
 
-
T
 
T
P
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
V
E
 
K
A
 
A
I
 
V
H
 
K
T
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
A
V
 
T
W
 
V
E
 
A
Y
x
Q
L
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
L
F
 
I
G
 
G
V
 
S
E
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
A
I
 
D
R
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
P
 
K
I
 
V
P
 
D
K
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
P
F
 
V
E
 
A
S
 
L
P
 
K
M
 
V
I
 
V
T
 
T
K
 
E

7e7mC Crystal structure analysis of the streptococcus agalactiae ribose binding protein rbsb
27% identity, 82% coverage: 46:320/337 of query aligns to 11:282/284 of 7e7mC

query
sites
7e7mC
I
 
L
G
 
G
F
 
V
T
 
S
M
 
I
S
 
S
F
 
T
S
 
T
N
 
N
T
x
N
E
 
P
W
x
Y
I
x
F
K
 
V
Q
 
A
M
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
D
E
 
K
T
 
Y
A
 
A
K
 
S
K
 
N
Y
 
K
G
 
K
M
 
I
N
 
S
T
 
I
I
 
K
V
 
V
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
Q
D
 
D
Q
 
D
P
 
A
T
 
A
K
 
R
Q
 
Q
L
 
A
R
 
D
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
D
 
N
L
 
F
L
 
I
V
 
S
R
 
Q
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
I
 
L
I
 
I
S
 
N
T
 
P
Y
 
V
Y
 
D
A
 
S
E
 
K
A
 
A
I
 
I
R
 
V
P
 
T
A
 
A
V
 
I
Q
 
K
E
 
S
I
 
A
N
 
N
R
 
N
A
 
A
G
 
N
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
I
V
 
L
L
 
M
S
x
D
S
x
R
P
 
G
L
 
-
P
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
G
D
 
K
F
 
V
D
 
L
V
 
T
L
 
T
L
 
V
S
 
A
T
 
S
D
 
D
M
 
N
I
 
V
G
 
A
T
 
A
A
 
G
R
 
K
Q
 
M
A
 
A
G
 
A
Q
 
D
Y
 
Y
Y
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
K
L
 
L
N
 
G
G
 
K
E
 
K
G
 
A
N
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
 
E
I
 
L
E
 
S
G
 
G
K
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
A
L
 
S
I
 
A
N
 
T
Q
 
V
Q
 
D
R
|
R
G
 
G
S
 
K
G
 
G
W
 
F
R
 
H
E
 
S
V
 
V
I
 
-
D
 
-
A
 
A
A
 
K
P
 
S
G
 
K
I
 
L
K
 
D
V
 
M
V
 
L
S
 
S
H
 
S
V
 
Q
V
 
S
A
 
A
N
 
N
Y
x
F
D
 
D
R
 
R
T
 
A
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
R
 
N
G
 
T
M
 
T
E
 
Q
D
 
N
A
 
M
L
 
I
Q
 
Q
A
 
G
N
 
H
P
 
K
K
 
D
I
 
V
D
 
Q
A
 
I
V
 
I
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
G
 
K
E
 
S
F
 
A
G
 
G
R
 
L
E
 
Q
K
 
-
D
 
N
M
 
V
F
 
L
F
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
G
 
G
L
 
-
T
 
Q
P
 
P
E
 
D
A
 
A
L
 
H
E
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
K
T
 
K
G
 
G
T
 
D
L
 
I
D
 
S
A
 
A
V
 
T
W
 
I
E
 
A
Y
x
Q
L
 
Q
P
 
P
-
 
A
-
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
E
E
 
I
G
 
A
V
 
I
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
D
V
 
Y
L
 
Y
Q
 
K
K
 
G
K
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
E
K
 
K
K
 
E
I
 
T
A
 
I
F
 
S
E
 
P
S
 
I
P
 
Y
M
 
L
I
 
V
T
 
T
K
 
K
E
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
E
E
 
K
W
 
Y

4yo7A Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from bacillus halodurans c-125 (bh2323, target efi- 511484) with bound myo-inositol
31% identity, 84% coverage: 39:320/337 of query aligns to 1:283/287 of 4yo7A

query
sites
4yo7A
T
 
T
G
 
G
V
 
D
E
 
S
G
 
G
-
 
Q
K
 
K
T
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
V
T
 
S
M
 
I
S
 
S
F
 
N
S
 
L
N
x
D
T
 
-
E
 
E
W
 
F
I
 
L
K
 
T
Q
 
Y
M
 
M
Q
 
Q
A
 
D
G
 
A
V
 
M
V
 
K
E
 
E
T
 
E
A
 
A
K
 
A
K
 
N
Y
 
Y
-
 
P
G
 
D
M
 
F
N
 
E
T
 
F
I
 
I
V
 
F
Y
 
S
D
 
D
A
 
A
N
 
Q
D
 
N
Q
 
D
P
 
S
T
 
T
K
 
Q
Q
 
Q
L
 
M
R
 
A
D
 
Q
I
 
V
E
 
E
D
 
N
L
 
F
L
 
I
V
 
S
R
 
R
N
 
N
V
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
S
 
N
T
 
P
Y
 
V
Y
 
D
A
 
T
E
 
T
A
 
S
I
 
A
R
 
V
P
 
D
A
 
I
V
 
V
Q
 
N
E
 
M
I
 
V
N
 
N
R
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
V
 
I
L
 
A
S
x
N
S
x
R
P
 
T
L
 
F
P
 
D
E
 
G
G
 
V
A
 
D
D
 
Q
F
 
A
D
 
T
V
 
A
L
 
F
L
 
V
S
 
G
T
 
S
D
 
E
M
 
S
I
 
I
G
 
Q
T
 
S
A
 
G
R
 
L
Q
 
L
A
 
Q
G
 
M
Q
 
E
Y
 
E
Y
 
V
V
 
A
K
 
K
K
 
L
L
 
L
N
 
N
G
 
N
E
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
A
Q
 
I
I
 
M
E
 
D
G
 
G
K
 
E
P
 
L
G
 
G
S
 
H
L
 
E
I
 
A
N
 
Q
Q
 
I
Q
 
M
R
|
R
G
 
T
S
 
E
G
 
G
W
 
N
R
 
K
E
 
Q
V
 
I
I
 
I
D
 
E
A
 
E
A
 
H
P
 
D
G
 
G
I
 
L
K
 
E
V
 
V
V
 
V
S
 
L
H
 
Q
V
 
G
V
 
T
A
 
A
N
 
K
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
T
 
S
Q
 
E
A
 
G
I
 
M
R
 
R
G
 
L
M
 
M
E
 
E
D
 
N
A
 
W
L
 
L
Q
 
N
A
 
S
N
 
G
P
 
T
K
 
E
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
Y
 
V
C
 
A
H
 
N
N
|
N
D
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
I
K
 
L
A
 
A
A
 
L
G
 
E
E
 
A
F
 
V
G
 
G
R
 
K
E
x
L
K
 
D
D
 
D
M
x
V
F
 
I
F
 
V
T
 
A
G
 
G
F
 
I
D
|
D
G
 
A
L
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
M
H
 
K
T
 
E
G
 
G
T
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
V
V
 
T
-
 
V
-
 
F
W
x
Q
E
 
D
Y
 
A
L
 
K
P
 
G
F
 
Q
G
 
G
V
 
A
E
 
T
G
 
S
V
 
V
E
 
K
A
 
V
A
 
A
I
 
V
R
 
Q
V
 
A
L
 
A
Q
 
N
K
 
G
K
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
E
K
 
D
K
 
A
-
 
M
I
 
I
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
S
 
-
P
 
-
M
 
L
I
 
V
T
 
T
K
 
P
E
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
E
E
 
E
W
 
Y

5dteB Crystal structure of an abc transporter periplasmic solute binding protein (ipr025997) from actinobacillus succinogenes 130z(asuc_0081, target efi-511065) with bound d-allose
31% identity, 76% coverage: 46:302/337 of query aligns to 5:269/287 of 5dteB

query
sites
5dteB
I
 
I
G
 
A
F
 
L
T
 
L
M
 
M
S
x
K
F
 
T
S
 
L
N
 
S
T
x
N
E
 
E
W
x
Y
I
 
F
K
 
I
Q
 
S
M
 
M
Q
 
R
A
 
Q
G
 
G
V
 
A
V
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
Y
 
K
G
 
D
M
 
I
N
 
D
T
 
L
I
 
I
V
 
V
Y
 
Q
D
 
V
A
 
A
-
 
E
N
 
K
D
 
E
Q
 
D
P
 
S
T
 
T
K
 
E
Q
 
Q
L
 
L
R
 
V
D
 
G
-
 
L
I
 
V
E
 
E
D
 
N
L
 
M
L
 
I
V
 
A
R
 
K
N
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
S
 
T
T
 
P
Y
 
N
Y
 
D
A
 
S
E
 
I
A
 
A
I
 
F
R
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
F
Q
 
Q
E
 
K
I
 
A
N
 
E
R
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
V
 
D
L
 
L
S
x
D
S
 
V
P
 
R
L
 
L
P
 
D
E
 
A
G
 
K
A
 
A
D
 
A
F
 
E
D
 
A
V
 
A
L
 
G
L
 
L
S
 
K
T
 
F
D
 
N
M
 
Y
I
 
V
G
 
G
T
 
V
A
 
D
R
 
N
Q
 
F
A
 
N
G
 
G
Q
 
G
Y
 
Y
Y
 
L
V
 
E
K
 
A
K
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
A
L
 
I
N
 
G
G
 
K
E
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
V
V
 
A
Q
 
I
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
I
P
 
P
G
 
G
S
 
V
L
 
D
I
x
N
N
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
R
|
R
G
 
K
S
 
G
G
 
G
W
 
A
R
 
L
E
 
K
V
 
A
I
 
F
D
 
A
A
 
E
A
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
H
 
S
V
 
Q
V
 
S
A
 
A
N
 
N
Y
x
W
D
 
E
R
 
T
T
 
E
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
R
 
N
G
 
V
M
 
T
E
 
T
D
 
N
A
 
I
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
N
 
N
P
 
P
K
 
N
I
 
I
D
 
N
A
 
G
V
 
I
Y
 
F
C
 
A
H
 
A
N
 
N
D
 
D
D
 
N
M
 
M
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
T
A
 
A
A
 
V
G
 
E
E
 
N
F
 
A
G
 
G
R
 
L
E
 
A
K
 
G
D
 
K
M
 
V
F
 
L
F
 
V
T
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
|
D
G
 
G
L
 
I
T
 
-
P
 
P
E
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
Y
I
 
V
H
 
K
T
 
Q
G
 
G
T
 
K
L
 
M
D
 
Q
A
 
N
V
 
T
W
 
I
E
 
D
Y
x
Q
L
 
L
P
 
P
F
 
K
G
 
K
-
 
Q
-
 
V
V
 
A
E
 
I
G
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
H
A
 
A
I
 
L
R
 
K
V
 
Q
L
 
I
Q
 
N
K
 
K
K
 
Q
P
 
E
I
 
I
P
 
P

5ocpA The periplasmic binding protein component of the arabinose abc transporter from shewanella sp. Ana-3 bound to alpha and beta-l- arabinofuranose
28% identity, 71% coverage: 45:284/337 of query aligns to 2:246/302 of 5ocpA

query
sites
5ocpA
T
 
T
I
 
V
G
 
G
F
 
F
T
 
S
M
 
Q
S
 
V
F
 
G
S
 
S
N
x
E
T
x
S
E
 
G
W
|
W
I
x
R
K
 
T
Q
 
S
M
 
F
Q
 
S
A
 
E
G
 
A
V
 
V
V
 
K
E
 
A
T
 
E
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
Y
 
R
G
 
G
M
 
I
N
 
D
T
 
L
I
 
K
V
 
F
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
Q
D
 
Q
Q
 
K
P
 
Q
T
 
E
K
 
N
Q
 
Q
L
 
I
R
 
K
D
 
A
I
 
V
E
 
R
D
 
S
L
 
F
L
 
I
V
 
A
R
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
I
S
 
A
T
 
P
Y
 
V
Y
 
V
A
 
E
E
 
T
A
 
G
I
 
W
R
 
K
P
 
P
A
 
V
V
 
L
Q
 
K
E
 
E
I
 
A
N
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
K
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
V
S
x
D
S
x
R
P
 
N
L
 
I
P
 
K
E
 
V
G
 
D
A
 
D
D
 
D
-
 
S
-
 
L
F
 
F
D
 
L
V
 
T
L
 
R
L
 
I
S
 
A
T
 
S
D
 
D
M
 
F
I
 
S
G
 
E
T
 
E
A
 
G
R
 
R
Q
 
K
A
 
I
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
W
Y
 
L
V
 
M
K
 
D
K
 
K
L
 
T
N
 
Q
G
 
G
E
 
N
G
 
C
N
 
D
V
 
I
V
 
A
Q
 
E
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
T
P
 
V
G
 
G
S
 
A
L
 
T
I
 
A
N
 
A
Q
 
I
Q
 
D
R
|
R
G
 
A
S
 
A
G
 
G
W
 
F
R
 
N
E
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
A
A
 
N
A
 
Y
P
 
P
G
 
N
I
 
A
K
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
R
H
 
S
V
 
Q
V
 
T
A
 
G
N
 
E
Y
x
F
D
 
T
R
 
R
T
 
A
Q
 
K
A
 
G
I
 
K
R
 
E
G
 
V
M
 
M
E
 
E
D
 
G
A
 
F
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
N
 
Q
-
 
N
-
 
G
P
 
Q
K
 
P
I
 
L
D
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
W
C
 
S
H
 
H
N
|
N
D
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
A
 
A
A
 
I
G
 
K
E
 
E
F
 
A
G
 
G
R
 
L
E
 
K
-
 
P
-
 
G
K
 
K
D
 
D
M
 
I
F
 
L
F
 
I
T
 
V
G
 
S
F
 
V
D
|
D
G
 
G
L
 
V
T
 
-
P
 
P
E
 
D
A
 
Y
L
 
F
E
 
K
A
 
A
I
 
M
H
 
A
T
 
D
G
 
G
T
 
D
L
 
V
D
 
N
A
 
A
V
 
T
W
 
V
E
 
E
Y
 
L
L
 
S
P
 
P
F
 
Y

6hbdA Crystal structure of msmeg_1712 from mycobacterium smegmatis in complex with beta-d-galactofuranose (see paper)
29% identity, 77% coverage: 45:305/337 of query aligns to 4:271/305 of 6hbdA

query
sites
6hbdA
T
 
T
I
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
A
M
 
Q
S
 
V
F
 
G
S
 
A
N
x
E
T
x
S
E
 
G
W
 
W
I
x
R
K
 
T
Q
 
A
M
 
N
Q
 
T
A
 
E
G
 
S
V
 
I
V
 
K
E
 
S
T
 
A
A
 
A
K
 
E
K
 
E
Y
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
N
T
 
L
I
 
K
V
 
F
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
N
D
 
G
Q
 
E
P
 
Q
T
 
E
K
 
K
Q
 
Q
L
 
I
R
 
S
D
 
A
I
 
I
E
 
R
D
 
S
L
 
F
L
 
I
V
 
Q
R
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
I
 
F
S
 
S
T
 
P
Y
 
V
Y
 
V
A
 
R
E
 
T
A
 
G
I
 
W
R
x
D
P
 
A
A
 
V
V
 
L
Q
 
Q
E
 
E
I
 
T
N
 
K
R
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
-
V
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
T
S
x
D
P
x
R
L
 
A
P
 
V
E
 
D
G
 
T
A
 
Q
D
|
D
F
 
T
D
 
D
V
 
V
-
 
Y
-
 
K
-
 
T
L
 
F
L
 
I
S
 
G
T
 
A
D
 
D
M
x
F
I
 
I
G
 
E
T
 
E
A
 
G
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
W
Y
 
V
V
 
A
K
 
D
K
 
Q
L
 
Y
-
 
A
-
 
S
-
 
A
N
 
T
G
 
G
E
 
P
G
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
T
P
 
T
G
 
G
S
 
A
L
x
D
I
 
P
N
 
A
Q
 
I
Q
x
D
R
|
R
G
 
K
S
 
T
G
 
G
W
 
F
R
 
A
E
 
E
V
 
G
I
 
I
D
 
S
A
 
K
A
 
N
P
 
P
G
 
N
I
 
L
K
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
H
 
S
V
 
Q
V
 
T
A
 
G
N
 
D
Y
x
F
D
 
T
R
 
R
T
 
S
Q
 
G
A
 
G
I
 
K
R
 
Q
G
 
V
M
 
M
E
 
E
D
 
A
A
 
F
L
 
L
Q
 
K
A
 
S
N
 
T
P
 
P
K
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
V
V
 
V
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
N
 
N
D
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
M
K
 
E
A
 
A
A
 
I
G
 
E
E
 
A
F
 
A
G
 
G
R
 
K
E
 
K
-
 
P
-
 
G
K
 
T
D
 
D
M
 
I
F
 
K
F
 
I
T
 
V
G
 
A
F
 
V
D
|
D
G
 
A
L
 
-
T
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
G
L
 
M
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
A
T
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
F
D
 
N
A
 
Y
V
 
I
W
 
V
E
|
E
Y
 
C
L
 
N
P
 
P
-
 
L
F
 
L
G
 
G
V
 
P
E
 
E
G
 
L
V
 
M
E
 
D
A
 
L
A
 
A
I
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
A
Q
 
A
K
 
G
K
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
P
K
 
E
K
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

6hyhA Crystal structure of msmeg_1712 from mycobacterium smegmatis in complex with beta-d-fucofuranose (see paper)
29% identity, 77% coverage: 45:305/337 of query aligns to 3:270/304 of 6hyhA

query
sites
6hyhA
T
 
T
I
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
A
M
 
Q
S
 
V
F
 
G
S
 
A
N
x
E
T
x
S
E
 
G
W
 
W
I
x
R
K
 
T
Q
 
A
M
 
N
Q
 
T
A
 
E
G
 
S
V
 
I
V
 
K
E
 
S
T
 
A
A
 
A
K
 
E
K
 
E
Y
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
N
T
 
L
I
 
K
V
 
F
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
N
D
 
G
Q
 
E
P
 
Q
T
 
E
K
 
K
Q
 
Q
L
 
I
R
 
S
D
 
A
I
 
I
E
 
R
D
 
S
L
 
F
L
 
I
V
 
Q
R
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
I
 
F
S
 
S
T
 
P
Y
 
V
Y
 
V
A
 
R
E
 
T
A
 
G
I
 
W
R
x
D
P
 
A
A
 
V
V
 
L
Q
 
Q
E
 
E
I
 
T
N
 
K
R
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
-
V
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
T
S
x
D
P
x
R
L
 
A
P
 
V
E
 
D
G
 
T
A
 
Q
D
|
D
F
 
T
D
 
D
V
 
V
-
 
Y
-
 
K
-
 
T
L
 
F
L
 
I
S
 
G
T
 
A
D
 
D
M
x
F
I
 
I
G
 
E
T
 
E
A
 
G
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
W
Y
 
V
V
 
A
K
 
D
K
 
Q
L
 
Y
-
 
A
-
 
S
-
 
A
N
 
T
G
 
G
E
 
P
G
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
T
P
 
T
G
 
G
S
 
A
L
x
D
I
x
P
N
 
A
Q
 
I
Q
x
D
R
|
R
G
 
K
S
 
T
G
 
G
W
 
F
R
 
A
E
 
E
V
 
G
I
 
I
D
 
S
A
 
K
A
 
N
P
 
P
G
 
N
I
 
L
K
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
H
 
S
V
 
Q
V
 
T
A
 
G
N
 
D
Y
x
F
D
 
T
R
 
R
T
 
S
Q
 
G
A
 
G
I
 
K
R
 
Q
G
 
V
M
 
M
E
 
E
D
 
A
A
 
F
L
 
L
Q
 
K
A
 
S
N
 
T
P
 
P
K
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
V
V
 
V
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
M
K
 
E
A
 
A
A
 
I
G
 
E
E
 
A
F
 
A
G
 
G
R
 
K
E
 
K
-
 
P
-
 
G
K
 
T
D
 
D
M
 
I
F
 
K
F
 
I
T
 
V
G
 
A
F
 
V
D
|
D
G
 
A
L
 
-
T
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
G
L
 
M
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
A
T
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
F
D
 
N
A
 
Y
V
 
I
W
 
V
E
|
E
Y
 
C
L
 
N
P
 
P
-
 
L
F
 
L
G
 
G
V
 
P
E
 
E
G
 
L
V
 
M
E
 
D
A
 
L
A
 
A
I
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
A
Q
 
A
K
 
G
K
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
P
K
 
E
K
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

6hbmA Crystal structure of msmeg_1712 from mycobacterium smegmatis in complex with alpha-l-arabinofuranose (see paper)
29% identity, 77% coverage: 45:305/337 of query aligns to 3:270/304 of 6hbmA

query
sites
6hbmA
T
 
T
I
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
A
M
 
Q
S
 
V
F
 
G
S
 
A
N
x
E
T
x
S
E
 
G
W
 
W
I
 
R
K
 
T
Q
 
A
M
 
N
Q
 
T
A
 
E
G
 
S
V
 
I
V
 
K
E
 
S
T
 
A
A
 
A
K
 
E
K
 
E
Y
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
N
T
 
L
I
 
K
V
 
F
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
N
D
 
G
Q
 
E
P
 
Q
T
 
E
K
 
K
Q
 
Q
L
 
I
R
 
S
D
 
A
I
 
I
E
 
R
D
 
S
L
 
F
L
 
I
V
 
Q
R
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
I
 
F
S
 
S
T
 
P
Y
 
V
Y
 
V
A
 
R
E
 
T
A
 
G
I
 
W
R
x
D
P
 
A
A
 
V
V
 
L
Q
 
Q
E
 
E
I
 
T
N
 
K
R
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
-
V
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
T
S
x
D
P
x
R
L
 
A
P
 
V
E
 
D
G
 
T
A
 
Q
D
|
D
F
 
T
D
 
D
V
 
V
-
 
Y
-
 
K
-
 
T
L
 
F
L
 
I
S
 
G
T
 
A
D
 
D
M
 
F
I
 
I
G
 
E
T
 
E
A
 
G
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
W
Y
 
V
V
 
A
K
 
D
K
 
Q
L
 
Y
-
 
A
-
 
S
-
 
A
N
 
T
G
 
G
E
 
P
G
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
T
P
 
T
G
 
G
S
 
A
L
 
D
I
 
P
N
 
A
Q
 
I
Q
 
D
R
|
R
G
 
K
S
 
T
G
 
G
W
 
F
R
 
A
E
 
E
V
 
G
I
 
I
D
 
S
A
 
K
A
 
N
P
 
P
G
 
N
I
 
L
K
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
H
 
S
V
 
Q
V
 
T
A
 
G
N
 
D
Y
 
F
D
 
T
R
 
R
T
 
S
Q
 
G
A
 
G
I
 
K
R
 
Q
G
 
V
M
 
M
E
 
E
D
 
A
A
 
F
L
 
L
Q
 
K
A
 
S
N
 
T
P
 
P
K
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
V
V
 
V
Y
 
F
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
M
K
 
E
A
 
A
A
 
I
G
 
E
E
 
A
F
 
A
G
 
G
R
 
K
E
 
K
-
 
P
-
 
G
K
 
T
D
 
D
M
 
I
F
 
K
F
 
I
T
 
V
G
 
A
F
 
V
D
|
D
G
 
A
L
 
-
T
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
G
L
 
M
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
H
 
A
T
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
F
D
 
N
A
 
Y
V
 
I
W
 
V
E
|
E
Y
 
C
L
 
N
P
 
P
-
 
L
F
 
L
G
 
G
V
 
P
E
 
E
G
 
L
V
 
M
E
 
D
A
 
L
A
 
A
I
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
A
Q
 
A
K
 
G
K
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
P
K
 
E
K
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

A0QYB5 D-threitol-binding protein from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
29% identity, 81% coverage: 46:317/337 of query aligns to 37:307/349 of A0QYB5

query
sites
A0QYB5
I
 
I
G
 
G
F
 
V
T
 
T
M
 
V
S
 
-
F
x
Y
S
 
D
N
 
M
T
 
S
E
 
S
W
 
F
I
 
I
K
 
T
Q
 
A
M
 
G
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
V
 
M
V
 
D
E
 
A
T
 
Y
A
 
A
K
 
K
K
 
D
Y
 
N
G
 
N
M
 
I
N
 
E
T
 
L
I
 
I
V
 
W
Y
 
N
D
 
S
A
 
A
N
 
N
D
 
L
Q
 
D
P
 
V
T
 
S
K
 
T
Q
 
Q
L
 
A
R
 
S
D
 
Q
I
 
V
E
 
D
D
 
S
L
 
M
L
 
I
V
 
N
R
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
S
 
V
T
 
P
Y
 
V
Y
 
Q
A
 
A
E
 
D
A
 
S
I
 
L
R
 
A
P
 
P
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
E
 
S
I
 
A
N
 
K
R
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
L
V
 
V
V
 
P
L
 
V
S
x
N
S
 
A
P
 
A
L
 
L
P
 
-
E
 
D
G
 
S
A
 
K
D
 
D
F
 
I
D
 
A
V
 
G
L
 
N
L
 
V
S
 
Q
T
 
P
D
 
D
M
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
A
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
A
 
E
G
 
M
Q
 
Q
Y
 
M
Y
 
M
V
 
A
K
 
D
K
 
R
L
 
L
N
 
G
G
 
G
E
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
Q
 
I
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
P
P
 
L
G
 
G
S
 
Q
L
 
S
I
 
G
N
 
E
Q
 
L
Q
 
D
R
|
R
G
 
S
S
 
K
G
 
G
W
 
I
R
 
E
E
 
Q
V
 
V
I
 
L
D
 
A
A
 
K
A
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
V
V
 
L
S
 
A
H
 
K
V
 
D
V
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
 
W
D
 
K
R
 
R
T
 
D
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
N
G
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
N
A
 
W
L
 
I
Q
 
S
A
 
G
-
 
F
N
 
G
P
 
P
K
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
V
 
V
Y
 
V
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
T
K
 
G
D
 
-
M
 
V
F
 
P
F
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
G
 
G
L
 
I
T
 
E
P
 
-
E
 
D
A
 
G
L
 
L
E
 
N
A
 
A
I
 
V
H
 
K
T
 
S
G
 
G
T
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
F
V
 
I
W
 
G
E
 
T
Y
 
S
L
 
L
P
x
Q
F
 
N
G
 
G
V
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
A
E
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
N
R
 
R
V
 
L
L
 
A
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
N
K
 
K
K
 
E
I
 
P
A
 
V
F
 
Y
E
 
I
S
 
M
P
 
P
M
 
A
I
 
I
T
 
T
K
 
K
E
 
D
N
 
N
V
 
V

A0QYB3 Xylitol-binding protein from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
28% identity, 81% coverage: 44:317/337 of query aligns to 35:307/349 of A0QYB3

query
sites
A0QYB3
K
 
K
T
 
R
I
 
I
G
 
G
F
 
V
T
 
T
M
 
V
S
 
-
F
x
Y
S
 
D
N
 
M
T
 
S
E
 
S
W
 
F
I
 
I
K
 
T
Q
 
E
M
 
G
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
V
 
M
V
 
D
E
 
T
T
 
Y
A
 
A
K
 
K
K
 
A
Y
 
N
G
 
N
M
 
I
N
 
E
T
 
L
I
 
V
V
 
W
Y
 
N
D
 
S
A
 
A
N
 
N
D
 
N
Q
 
D
P
 
V
T
 
S
K
 
T
Q
 
Q
L
 
A
R
 
S
D
 
Q
I
 
V
E
 
D
D
 
S
L
 
L
L
 
I
V
 
N
R
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
S
 
V
T
 
P
Y
 
V
Y
 
Q
A
 
A
E
 
D
A
 
S
I
 
L
R
 
G
P
 
P
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
E
 
S
I
 
A
N
 
K
R
 
S
A
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
L
V
 
L
V
 
A
L
 
V
S
x
N
S
 
A
P
 
A
L
 
L
P
 
-
E
 
E
G
 
T
A
 
P
D
 
D
F
 
L
D
 
A
V
 
G
L
 
N
L
 
V
S
 
Q
T
 
P
D
 
D
M
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
A
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
A
 
E
G
 
M
Q
 
Q
Y
 
M
Y
 
M
V
 
A
K
 
D
K
 
R
L
 
L
N
 
G
G
 
G
E
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
Q
 
I
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
P
P
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
S
I
 
G
N
 
E
Q
 
I
Q
 
N
R
|
R
G
 
G
S
 
K
G
 
G
W
 
I
R
 
D
E
 
Q
V
 
V
I
 
L
D
 
A
A
 
K
A
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
V
V
 
L
S
 
A
H
 
K
V
 
D
V
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
 
W
D
 
K
R
 
R
T
 
D
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
N
G
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
N
A
 
W
L
 
I
Q
 
S
A
 
S
-
 
F
N
 
G
P
 
P
K
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
V
 
V
Y
 
V
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
T
K
 
G
D
 
-
M
 
V
F
 
P
F
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
G
 
G
L
 
I
T
 
-
P
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
L
E
 
N
A
 
A
I
 
V
H
 
K
T
 
S
G
 
G
T
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
F
V
 
I
W
 
G
E
 
T
Y
 
S
L
 
L
P
x
Q
F
 
N
G
 
G
V
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
S
E
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
D
R
 
A
V
 
L
L
 
V
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
K
K
 
T
K
 
D
I
 
P
A
 
V
F
 
Y
E
 
V
S
 
M
P
 
P
M
 
A
I
 
I
T
 
T
K
 
K
E
 
D
N
 
N
V
 
V

5hkoA Crystal structure of abc transporter solute binding protein msmeg_3598 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510969, in complex with l-sorbitol
28% identity, 81% coverage: 44:317/337 of query aligns to 2:274/314 of 5hkoA

query
sites
5hkoA
K
 
K
T
 
R
I
 
I
G
 
G
F
 
V
T
 
T
M
x
V
S
 
-
F
x
Y
S
 
D
N
 
M
T
 
S
E
 
S
W
 
F
I
 
I
K
 
T
Q
x
E
M
 
G
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
V
 
M
V
 
D
E
 
T
T
 
Y
A
 
A
K
 
K
K
 
A
Y
 
N
G
 
N
M
 
I
N
 
E
T
 
L
I
 
V
V
 
W
Y
 
N
D
 
S
A
 
A
N
 
N
D
 
N
Q
x
D
P
 
V
T
x
S
K
 
T
Q
 
Q
L
 
A
R
 
S
D
 
Q
I
 
V
E
 
D
D
 
S
L
 
L
L
 
I
V
 
N
R
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
S
 
V
T
 
P
Y
 
V
Y
 
Q
A
 
A
E
 
D
A
 
S
I
 
L
R
 
G
P
 
P
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
E
 
S
I
 
A
N
 
K
R
 
S
A
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
L
V
 
L
V
 
A
L
 
V
S
x
N
S
x
A
P
 
A
L
 
L
P
 
-
E
 
E
G
 
T
A
 
P
D
 
D
F
 
L
D
 
A
V
 
G
L
 
N
L
 
V
S
 
Q
T
 
P
D
 
D
M
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
A
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
A
 
E
G
 
M
Q
 
Q
Y
 
M
Y
 
M
V
 
A
K
 
D
K
 
R
L
 
L
N
 
G
G
 
G
E
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
Q
 
I
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
P
P
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
S
I
 
G
N
 
E
Q
 
I
Q
 
N
R
|
R
G
 
G
S
 
K
G
 
G
W
 
I
R
 
D
E
 
Q
V
 
V
I
 
L
D
 
A
A
 
K
A
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
V
V
 
L
S
 
A
H
 
K
V
 
D
V
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
x
W
D
 
K
R
 
R
T
 
D
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
N
G
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
N
A
 
W
L
 
I
Q
 
S
A
 
S
-
 
F
N
 
G
P
 
P
K
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
V
 
V
Y
 
V
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
T
K
 
G
D
 
-
M
 
V
F
 
P
F
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
G
 
G
L
 
I
T
x
E
P
 
-
E
 
D
A
 
G
L
 
L
E
 
N
A
 
A
I
 
V
H
 
K
T
 
S
G
 
G
T
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
F
V
 
I
W
 
G
E
 
T
Y
 
S
L
 
L
P
x
Q
F
 
N
G
 
G
V
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
S
E
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
D
R
 
A
V
 
L
L
 
V
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
K
K
 
T
K
 
D
I
 
P
A
 
V
F
 
Y
E
 
V
S
 
M
P
 
P
M
 
A
I
 
I
T
 
T
K
 
K
E
 
D
N
 
N
V
 
V

4rsmA Crystal structure of carbohydrate transporter msmeg_3599 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510970, in complex with d-threitol (see paper)
29% identity, 81% coverage: 46:317/337 of query aligns to 5:275/315 of 4rsmA

query
sites
4rsmA
I
 
I
G
 
G
F
 
V
T
 
T
M
 
V
S
 
-
F
x
Y
S
 
D
N
 
M
T
 
S
E
 
S
W
 
F
I
 
I
K
 
T
Q
 
A
M
 
G
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
V
 
M
V
 
D
E
 
A
T
 
Y
A
 
A
K
 
K
K
 
D
Y
 
N
G
 
N
M
 
I
N
 
E
T
 
L
I
 
I
V
 
W
Y
 
N
D
 
S
A
 
A
N
 
N
D
 
L
Q
 
D
P
 
V
T
 
S
K
 
T
Q
 
Q
L
 
A
R
 
S
D
 
Q
I
 
V
E
 
D
D
 
S
L
 
M
L
 
I
V
 
N
R
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
S
 
V
T
 
P
Y
 
V
Y
 
Q
A
 
A
E
 
D
A
 
S
I
 
L
R
 
A
P
 
P
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
E
 
S
I
 
A
N
 
K
R
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
L
V
 
V
V
 
P
L
 
V
S
x
N
S
 
A
P
 
A
L
 
L
P
 
-
E
 
D
G
 
S
A
 
K
D
 
D
F
 
I
D
 
A
V
 
G
L
 
N
L
 
V
S
 
Q
T
 
P
D
 
D
M
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
A
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
A
 
E
G
 
M
Q
 
Q
Y
 
M
Y
 
M
V
 
A
K
 
D
K
 
R
L
 
L
N
 
G
G
 
G
E
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
Q
 
I
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
P
P
 
L
G
 
G
S
 
Q
L
 
S
I
 
G
N
 
E
Q
 
L
Q
 
D
R
|
R
G
 
S
S
 
K
G
 
G
W
 
I
R
 
E
E
 
Q
V
 
V
I
 
L
D
 
A
A
 
K
A
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
V
V
 
L
S
 
A
H
 
K
V
 
D
V
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
x
W
D
 
K
R
 
R
T
 
D
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
N
G
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
N
A
 
W
L
 
I
Q
 
S
A
 
G
-
 
F
N
 
G
P
 
P
K
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
V
 
V
Y
 
V
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
T
K
 
G
D
 
-
M
 
V
F
 
P
F
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
G
 
G
L
 
I
T
 
E
P
 
-
E
 
D
A
 
G
L
 
L
E
 
N
A
 
A
I
 
V
H
 
K
T
 
S
G
 
G
T
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
F
V
 
I
W
 
G
E
 
T
Y
 
S
L
 
L
P
x
Q
F
 
N
G
 
G
V
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
A
E
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
N
R
 
R
V
 
L
L
 
A
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
N
K
 
K
K
 
E
I
 
P
A
 
V
F
 
Y
E
 
I
S
 
M
P
 
P
M
 
A
I
 
I
T
 
T
K
 
K
E
 
D
N
 
N
V
 
V

4rs3A Crystal structure of carbohydrate transporter a0qyb3 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510969, in complex with xylitol (see paper)
28% identity, 81% coverage: 44:317/337 of query aligns to 2:274/315 of 4rs3A

query
sites
4rs3A
K
 
K
T
 
R
I
 
I
G
 
G
F
 
V
T
 
T
M
 
V
S
 
-
F
x
Y
S
 
D
N
 
M
T
 
S
E
 
S
W
 
F
I
 
I
K
 
T
Q
x
E
M
 
G
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
V
 
M
V
 
D
E
 
T
T
 
Y
A
 
A
K
 
K
K
 
A
Y
 
N
G
 
N
M
 
I
N
 
E
T
 
L
I
 
V
V
 
W
Y
 
N
D
 
S
A
 
A
N
 
N
D
 
N
Q
 
D
P
 
V
T
 
S
K
 
T
Q
 
Q
L
 
A
R
 
S
D
 
Q
I
 
V
E
 
D
D
 
S
L
 
L
L
 
I
V
 
N
R
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
S
 
V
T
 
P
Y
 
V
Y
 
Q
A
 
A
E
 
D
A
 
S
I
 
L
R
 
G
P
 
P
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
E
 
S
I
 
A
N
 
K
R
 
S
A
 
K
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
L
V
 
L
V
 
A
L
 
V
S
x
N
S
 
A
P
 
A
L
 
L
P
 
-
E
 
E
G
 
T
A
 
P
D
 
D
F
 
L
D
 
A
V
 
G
L
 
N
L
 
V
S
 
Q
T
 
P
D
 
D
M
 
D
I
 
V
G
 
A
T
 
A
A
 
G
R
 
A
Q
 
Q
A
 
E
G
 
M
Q
 
Q
Y
 
M
Y
 
M
V
 
A
K
 
D
K
 
R
L
 
L
N
 
G
G
 
G
E
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
V
Q
 
I
I
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
P
P
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
S
I
 
G
N
 
E
Q
 
I
Q
 
N
R
|
R
G
 
G
S
 
K
G
 
G
W
 
I
R
 
D
E
 
Q
V
 
V
I
 
L
D
 
A
A
 
K
A
 
Y
P
 
P
G
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
V
V
 
L
S
 
A
H
 
K
V
 
D
V
 
T
A
 
A
N
 
N
Y
x
W
D
 
K
R
 
R
T
 
D
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
N
G
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
N
A
 
W
L
 
I
Q
 
S
A
 
S
-
 
F
N
 
G
P
 
P
K
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
V
 
V
Y
 
V
C
 
A
H
 
Q
N
|
N
D
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
A
 
A
A
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
T
K
 
G
D
 
-
M
 
V
F
 
P
F
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
G
 
G
L
 
I
T
 
-
P
x
E
E
 
D
A
 
G
L
 
L
E
 
N
A
 
A
I
 
V
H
 
K
T
 
S
G
 
G
T
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
F
V
 
I
W
 
G
E
 
T
Y
 
S
L
 
L
P
x
Q
F
 
N
G
 
G
V
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
S
E
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
D
R
 
A
V
 
L
L
 
V
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
K
K
 
T
K
 
D
I
 
P
A
 
V
F
 
Y
E
 
V
S
 
M
P
 
P
M
 
A
I
 
I
T
 
T
K
 
K
E
 
D
N
 
N
V
 
V

P39325 Galactofuranose-binding protein YtfQ from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
28% identity, 71% coverage: 45:283/337 of query aligns to 25:270/318 of P39325

query
sites
P39325
T
 
T
I
 
V
G
 
G
F
 
F
T
 
S
M
 
Q
S
 
V
F
 
G
S
 
S
N
x
E
T
x
S
E
x
G
W
|
W
I
 
-
K
x
R
Q
 
A
M
 
A
Q
 
E
A
 
T
G
 
N
V
 
V
V
 
A
E
 
K
T
 
S
-
 
E
A
 
A
K
 
E
K
 
K
Y
 
R
G
 
G
M
 
I
N
 
T
T
 
L
I
 
K
V
 
I
Y
 
A
D
 
D
A
 
G
N
 
Q
D
 
Q
Q
 
K
P
 
Q
T
 
E
K
 
N
Q
 
Q
L
 
I
R
 
K
D
 
A
I
 
V
E
 
R
D
 
S
L
 
F
L
 
V
V
 
A
R
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
I
 
F
I
 
I
S