SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_051542722.1 NCBI__GCF_000621325.1:WP_051542722.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
38% identity, 96% coverage: 1:310/323 of query aligns to 7:312/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
M
 
M
F
 
I
V
 
L
V
 
C
C
 
C
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
D
V
 
M
F
 
L
V
 
P
P
 
R
E
 
E
G
 
T
V
 
T
S
 
G
Q
 
G
S
 
E
A
 
T
F
 
A
A
 
F
V
 
Q
P
 
P
F
 
F
A
 
A
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
A
L
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
V
 
T
A
 
G
L
 
F
L
 
F
T
 
S
G
 
G
V
 
I
S
 
S
T
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
F
G
 
G
D
 
D
R
 
V
L
 
L
M
 
R
A
 
D
V
 
T
L
 
L
Q
 
A
A
 
R
E
 
S
Q
 
N
V
 
V
S
 
D
T
 
Y
D
 
S
F
 
F
I
 
A
A
 
A
R
 
I
K
 
S
A
 
N
A
 
R
P
 
P
T
 
T
T
 
T
L
 
L
G
 
A
F
 
F
I
 
V
Q
 
R
K
 
L
N
 
-
A
 
V
V
 
D
G
 
G
V
 
Q
P
 
A
N
 
R
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
G
 
D
E
 
E
G
 
N
A
 
T
A
 
A
D
 
G
R
 
R
L
 
M
L
 
L
A
 
S
P
 
R
A
 
N
D
 
D
I
 
M
A
 
P
F
 
Y
D
 
V
D
 
D
A
 
E
E
 
T
I
 
I
T
 
S
G
 
A
I
 
M
H
 
L
M
 
F
G
 
G
S
 
C
Y
 
I
S
 
S
L
 
L
V
 
I
V
 
S
A
 
E
P
 
P
T
 
C
A
 
G
D
 
S
T
 
V
L
 
Y
L
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
L
R
 
A
R
 
R
Q
 
E
A
 
A
G
 
P
K
 
N
C
 
R
L
 
V
L
 
M
S
 
F
L
 
L
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
R
L
 
A
T
 
N
V
 
L
E
 
I
P
 
T
D
 
V
V
 
R
Y
 
K
Q
 
T
W
 
H
R
 
L
E
 
T
R
 
R
I
 
M
T
 
K
Q
 
R
L
 
M
L
 
I
P
 
A
F
 
L
M
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
D
A
 
W
L
 
F
Y
 
G
P
 
E
G
 
K
I
 
G
A
 
S
P
 
H
E
 
D
S
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
P
K
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
V
L
 
I
T
|
T
R
 
K
G
|
G
S
x
A
E
 
H
G
|
G
A
 
A
S
 
V
L
 
A
W
 
Y
S
 
T
Q
 
N
Q
 
H
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
T
 
P
L
 
V
P
 
P
T
 
G
P
 
V
R
 
K
V
 
V
N
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
x
V
Q
 
N
A
 
A
S
 
G
L
 
I
L
 
L
D
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
H
D
 
S
L
 
Q
Q
 
G
A
 
L
N
 
L
T
 
T
A
 
K
D
 
D
W
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
L
T
 
S
A
 
E
S
 
D
T
 
Q
L
 
I
Q
 
H
R
 
S
I
 
A
G
 
V
Q
 
A
K
 
L
A
 
G
V
|
V
C
 
R
A
 
A
A
|
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
C
 
V
S
 
S
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
N
L
 
P
P
 
P
S
 
W
A
 
A
K
 
H
E
 
E
V
 
M

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
32% identity, 93% coverage: 3:302/323 of query aligns to 5:282/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
V
 
L
V
 
V
C
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
D
V
 
I
F
 
V
V
 
-
P
 
-
E
 
D
G
 
G
V
 
P
S
 
D
Q
 
P
S
 
A
A
 
E
F
 
Y
A
 
V
V
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
F
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
P
 
D
V
 
V
A
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
H
V
 
I
S
 
G
T
x
R
D
 
D
F
 
A
L
 
R
G
 
G
D
 
R
R
 
R
L
 
I
M
 
A
A
 
E
V
 
Y
L
 
I
Q
 
E
A
 
S
E
 
S
Q
 
G
V
 
V
S
 
Q
T
 
L
D
 
V
F
x
S
I
x
G
A
 
S
R
 
Q
K
 
T
A
 
A
A
 
D
P
 
R
T
 
T
T
 
P
L
 
T
G
 
A
F
 
T
I
 
A
Q
 
R
K
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
N
 
T
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
Y
 
D
G
 
L
E
 
E
G
 
W
A
 
Q
A
 
I
D
 
P
R
 
D
L
 
T
-
 
P
-
 
P
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
P
D
 
L
I
 
L
A
 
-
F
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
V
H
 
H
M
 
T
G
 
G
S
 
S
Y
 
I
S
 
A
L
 
A
V
 
A
V
 
R
A
 
E
P
 
P
T
 
G
A
 
C
D
 
L
T
 
A
L
 
V
L
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
L
R
 
D
R
 
A
Q
 
Y
A
 
R
G
 
A
K
 
A
C
 
A
L
 
T
L
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
V
R
 
R
-
 
P
-
 
S
L
 
L
T
 
S
V
 
A
E
 
D
P
 
P
D
 
D
V
 
L
Y
 
T
Q
 
-
W
 
-
R
 
R
E
 
R
R
 
R
I
 
I
T
 
Q
Q
 
R
L
 
L
L
 
V
P
 
E
F
 
R
M
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
I
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
H
A
 
W
L
 
I
Y
 
D
P
 
P
G
 
T
I
 
Q
A
 
P
P
 
P
E
 
E
S
 
Q
I
 
T
I
 
A
A
 
R
D
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
V
 
C
G
 
G
V
 
P
K
 
A
L
 
I
A
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
L
G
 
G
S
 
D
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
S
 
V
L
 
A
W
 
F
S
 
C
Q
 
A
Q
 
A
A
 
G
Q
 
P
V
 
A
T
 
S
L
 
V
P
 
P
T
 
A
P
 
-
R
 
-
V
 
Q
N
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
M
A
 
A
S
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
T
L
 
L
L
 
W
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
L
 
L
Q
 
G
A
 
A
N
 
D
T
 
R
A
 
R
D
 
T
W
 
E
V
 
L
A
 
R
A
 
K
L
 
I
T
 
G
A
 
V
S
 
S
T
 
A
L
 
L
Q
 
T
R
 
S
I
 
A
G
 
L
Q
 
E
K
 
V
A
 
A
V
 
A
C
 
L
A
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
L
T
 
T
C
 
V
S
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
A

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
30% identity, 79% coverage: 5:260/323 of query aligns to 5:252/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
C
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
I
D
 
D
V
 
L
F
 
I
-
 
S
V
 
V
P
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
D
S
 
L
Q
 
K
S
 
D
A
 
V
F
 
R
A
 
L
V
 
-
P
 
-
F
 
F
A
 
E
A
 
K
R
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
F
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
L
 
V
R
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
P
 
K
V
 
S
A
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
S
G
 
K
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
F
 
P
L
 
F
G
 
G
D
 
E
R
 
Y
L
 
L
M
 
I
A
 
E
V
 
E
L
 
L
Q
 
S
A
 
K
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
S
 
D
T
 
T
D
 
R
F
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
K
-
 
D
K
 
E
A
 
K
A
 
K
P
 
H
T
 
T
T
 
G
L
 
I
G
 
V
F
 
F
I
 
V
Q
 
Q
K
 
L
N
 
K
A
 
G
V
 
A
G
 
S
V
 
-
P
 
P
N
 
S
Y
 
F
A
 
L
F
 
L
Y
 
Y
G
 
D
E
 
D
G
 
V
A
 
A
A
 
Y
D
 
F
R
 
N
L
 
M
L
 
-
A
 
T
P
 
L
A
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
N
F
 
W
D
 
D
D
 
I
A
 
V
E
 
E
I
 
E
T
 
A
G
 
K
I
 
I
-
 
V
H
 
N
M
 
F
G
 
G
S
 
S
Y
 
V
S
 
I
L
 
L
V
 
A
V
 
R
A
 
N
P
 
P
T
 
S
A
 
R
D
 
E
T
 
T
L
 
V
L
 
M
A
 
K
L
 
V
A
 
I
R
 
K
R
 
K
Q
 
I
A
 
K
G
 
G
K
 
S
C
 
S
L
 
L
L
 
I
S
 
A
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
D
V
 
L
E
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
W
 
W
R
 
R
E
 
G
R
 
Q
I
 
E
T
 
E
Q
 
E
L
 
M
L
 
I
P
 
K
F
 
V
M
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
K
|
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
L
A
 
Y
L
 
L
-
 
E
Y
 
N
P
 
Q
G
 
G
I
 
V
A
 
E
P
 
V
E
 
K
S
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
S
K
 
M
L
 
L
A
 
T
A
 
A
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
S
 
P
E
 
K
G
 
G
A
 
F
S
 
R
L
 
L
W
 
I
S
 
K
Q
 
N
Q
 
E
A
 
T
Q
 
V
V
 
V
T
 
D
L
 
V
P
 
P
T
 
S
P
 
Y
R
 
N
V
|
V
N
 
N
V
x
P
V
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
30% identity, 79% coverage: 5:260/323 of query aligns to 6:253/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
C
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
I
D
 
D
V
 
L
F
 
I
-
 
S
V
 
V
P
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
D
S
 
L
Q
 
K
S
 
D
A
 
V
F
 
R
A
 
L
V
 
-
P
 
-
F
 
F
A
 
E
A
 
K
R
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
F
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
L
 
V
R
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
P
 
K
V
 
S
A
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
S
G
 
K
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
F
 
P
L
 
F
G
 
G
D
 
E
R
 
Y
L
 
L
M
 
I
A
 
E
V
 
E
L
 
L
Q
 
S
A
 
K
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
S
 
D
T
 
T
D
 
R
F
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
K
-
 
D
K
 
E
A
 
K
A
 
K
P
 
H
T
 
T
T
 
G
L
 
I
G
 
V
F
 
F
I
 
V
Q
 
Q
K
 
L
N
 
K
A
 
G
V
 
A
G
 
S
V
 
-
P
 
P
N
 
S
Y
 
F
A
 
L
F
 
L
Y
 
Y
G
 
D
E
 
D
G
 
V
A
 
A
A
 
Y
D
 
F
R
 
N
L
 
M
L
 
-
A
 
T
P
 
L
A
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
N
F
 
W
D
 
D
D
 
I
A
 
V
E
 
E
I
 
E
T
 
A
G
 
K
I
 
I
-
 
V
H
 
N
M
 
F
G
 
G
S
 
S
Y
 
V
S
 
I
L
 
L
V
 
A
V
 
R
A
 
N
P
 
P
T
 
S
A
 
R
D
 
E
T
 
T
L
 
V
L
 
M
A
 
K
L
 
V
A
 
I
R
 
K
R
 
K
Q
 
I
A
 
K
G
 
G
K
 
S
C
 
S
L
 
L
L
 
I
S
 
A
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
D
V
 
L
E
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
W
 
W
R
 
R
E
 
G
R
 
Q
I
 
E
T
 
E
Q
 
E
L
 
M
L
 
I
P
 
K
F
 
V
M
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
L
A
 
Y
L
 
L
-
 
E
Y
 
N
P
 
Q
G
 
G
I
 
V
A
 
E
P
 
V
E
 
K
S
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
S
K
 
M
L
 
L
A
 
T
A
 
A
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
S
 
P
E
 
K
G
 
G
A
 
F
S
 
R
L
 
L
W
 
I
S
 
K
Q
 
N
Q
 
E
A
 
T
Q
 
V
V
 
V
T
 
D
L
 
V
P
 
P
T
 
S
P
 
Y
R
 
N
V
|
V
N
 
N
V
 
P
V
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
27% identity, 80% coverage: 4:263/323 of query aligns to 6:259/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
V
 
L
C
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
F
 
V
D
|
D
V
 
L
F
 
-
V
 
I
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
-
S
 
Q
Q
 
Q
S
 
H
A
 
Y
F
 
L
A
 
K
V
 
C
P
 
P
F
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
P
F
 
A
N
|
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
I
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
Q
 
G
P
 
R
V
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
F
T
 
G
G
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
F
 
P
L
 
F
G
 
G
D
 
R
R
 
F
L
 
M
M
 
Q
A
 
Q
V
 
T
L
 
L
Q
 
T
A
 
D
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
S
 
D
T
 
C
D
 
Q
F
 
H
I
 
L
A
 
H
-
 
F
R
 
D
K
 
P
A
 
V
A
 
H
P
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
T
G
 
V
F
 
V
I
 
V
Q
 
D
K
 
L
N
 
D
A
 
E
V
x
H
G
 
G
V
 
E
P
 
R
N
 
S
Y
x
F
A
 
T
F
|
F
Y
 
M
G
 
V
E
 
K
G
 
P
A
 
S
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
L
 
F
L
 
L
A
 
Q
P
 
L
A
 
S
D
 
D
I
 
I
-
 
P
A
 
S
F
 
F
D
 
Q
D
 
K
A
 
G
E
 
E
I
 
W
T
 
-
G
 
-
I
 
L
H
 
H
M
 
V
G
 
C
S
 
S
Y
 
I
S
 
A
L
 
L
V
 
A
V
 
N
A
 
Q
P
 
P
T
 
S
-
 
R
A
 
S
D
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
M
Q
 
K
A
 
E
G
 
V
K
 
G
C
 
G
L
 
Y
L
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
L
R
|
R
L
 
E
T
 
E
V
 
V
E
 
W
P
 
S
D
 
E
V
 
P
Y
 
Q
Q
 
E
W
 
L
R
 
Q
E
 
A
R
 
T
I
 
V
T
 
M
Q
 
R
L
 
A
L
 
V
P
 
G
F
 
L
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
F
L
 
L
Y
 
T
P
 
G
G
 
T
I
 
Q
A
 
S
P
 
I
E
 
E
S
 
E
I
 
G
I
 
L
A
 
Q
D
 
A
W
 
I
L
 
A
A
 
D
V
 
F
G
 
Q
V
 
I
K
 
P
L
 
L
A
 
V
A
 
V
L
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
S
x
A
E
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
L
L
 
V
W
 
A
S
 
T
Q
 
P
Q
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
Q
T
 
I
L
 
V
P
 
S
T
 
G
P
 
K
R
x
A
V
|
V
N
 
K
V
 
P
V
 
I
D
 
D
T
|
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
Q
 
V
A
 
G
S
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
Y
S
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
27% identity, 80% coverage: 6:263/323 of query aligns to 12:263/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
F
 
V
D
|
D
V
 
L
F
 
-
V
 
I
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
-
S
 
Q
Q
 
Q
S
 
H
A
 
Y
F
 
L
A
 
K
V
 
C
P
 
P
F
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
P
F
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
I
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
Q
 
G
P
 
R
V
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
F
T
 
G
G
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
F
 
P
L
 
F
G
 
G
D
 
R
R
 
F
L
 
M
M
 
Q
A
 
Q
V
 
T
L
 
L
Q
 
T
A
 
D
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
S
 
D
T
 
C
D
 
Q
F
 
H
I
 
L
A
 
H
-
 
F
R
 
D
K
 
P
A
 
V
A
 
H
P
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
T
G
 
V
F
 
V
I
 
V
Q
 
D
K
 
L
N
 
D
A
 
E
V
 
C
G
 
G
V
 
E
P
 
R
N
 
S
Y
x
F
A
 
T
F
|
F
Y
 
M
G
 
V
E
 
K
G
 
P
A
 
S
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
L
 
F
L
 
L
A
 
Q
P
 
L
A
 
S
D
 
D
I
 
I
-
 
P
A
 
S
F
 
F
D
 
Q
D
 
K
A
 
G
E
 
E
I
 
W
T
 
-
G
 
-
I
 
L
H
 
H
M
 
V
G
 
C
S
 
S
Y
 
I
S
 
A
L
 
L
V
 
A
V
 
N
A
 
Q
P
 
P
T
 
S
-
 
R
A
 
S
D
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
M
Q
 
K
A
 
E
G
 
V
K
 
G
C
 
G
L
 
Y
L
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
L
R
|
R
L
 
E
T
 
E
V
 
V
E
 
W
P
 
S
D
 
E
V
 
P
Y
 
Q
Q
 
E
W
 
L
R
 
Q
E
 
A
R
 
T
I
 
V
T
 
M
Q
 
R
L
 
A
L
 
V
P
 
G
F
 
L
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
K
|
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
F
L
 
L
Y
 
T
P
 
G
G
 
T
I
 
Q
A
 
S
P
 
I
E
 
E
S
 
E
I
 
G
I
 
L
A
 
Q
D
 
A
W
 
I
L
 
A
A
 
D
V
 
F
G
 
Q
V
 
I
K
 
P
L
 
L
A
 
V
A
 
V
L
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
S
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
L
L
 
V
W
 
A
S
 
T
Q
 
P
Q
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
Q
T
 
I
L
 
V
P
 
S
T
 
G
P
 
K
R
x
A
V
|
V
N
 
K
V
 
P
V
 
I
D
 
D
T
 
C
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
Q
 
V
A
 
G
S
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
Y
S
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
31% identity, 80% coverage: 3:260/323 of query aligns to 5:260/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
V
 
I
V
 
L
C
 
C
-
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
D
V
 
M
F
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
P
V
 
L
P
 
P
E
 
R
G
 
A
V
 
F
S
 
L
Q
 
Q
S
 
C
A
 
A
F
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
F
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
V
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
V
 
V
A
 
Q
L
 
F
L
 
V
T
 
G
G
 
M
V
 
L
S
 
G
T
 
S
D
 
D
F
 
M
L
 
F
G
 
G
D
 
D
R
 
F
L
 
L
M
 
F
A
 
D
V
 
S
L
 
F
Q
 
A
A
 
E
E
 
A
Q
 
G
V
 
V
S
 
V
T
 
T
D
 
D
F
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
K
 
T
A
 
S
-
 
T
A
 
A
P
 
K
T
 
T
T
 
A
L
 
L
G
 
A
F
 
F
I
 
V
Q
 
A
K
 
L
N
 
D
A
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
E
P
 
R
N
 
S
Y
 
F
A
 
S
F
 
F
Y
 
Y
G
 
R
E
 
P
G
 
P
A
 
A
A
 
A
D
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
F
R
 
R
L
 
V
L
 
E
A
 
H
P
 
F
A
 
Q
D
 
D
I
 
A
A
 
S
F
 
F
D
 
S
D
 
D
A
 
A
E
 
L
I
 
I
T
 
-
G
 
-
I
 
F
H
 
H
M
 
A
G
 
C
S
 
S
Y
 
N
S
 
S
L
 
M
V
 
T
V
 
D
A
 
A
P
 
D
T
 
I
A
 
A
D
 
E
-
 
V
T
 
T
L
 
F
L
 
E
A
 
G
L
 
M
A
 
R
R
 
R
R
 
A
Q
 
Q
A
 
A
G
 
A
K
 
G
C
 
A
L
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
L
N
 
N
I
 
F
R
 
R
L
 
P
T
 
M
V
 
L
E
 
W
P
 
P
D
 
N
V
 
G
Y
 
E
Q
 
N
W
 
P
R
 
A
E
 
S
R
 
R
I
 
L
T
 
W
Q
 
K
L
 
G
L
 
L
P
 
S
F
 
L
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
S
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
D
A
 
Y
L
 
L
Y
 
A
P
 
N
G
 
T
I
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
D
-
 
A
-
 
N
S
 
A
I
 
V
I
 
I
A
 
Q
D
 
Q
W
 
L
L
 
W
A
 
Q
V
 
G
G
 
R
V
 
A
K
 
Q
L
 
L
A
 
L
A
 
L
L
 
V
T
|
T
R
x
D
G
 
A
S
 
A
E
 
G
G
 
P
A
 
V
S
 
H
L
 
W
W
 
Y
S
 
T
Q
 
R
Q
 
T
A
 
A
Q
 
G
V
 
G
T
 
E
L
 
V
P
 
P
T
|
T
P
 
F
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
V
 
V
V
 
Q
D
 
D
T
 
S
V
 
N
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
Q
 
V
A
 
G
S
 
G
L
 
M
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
28% identity, 97% coverage: 4:317/323 of query aligns to 9:310/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
V
 
V
C
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
A
L
 
S
F
 
V
D
|
D
V
 
L
F
 
-
V
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
K
V
 
-
S
 
Q
Q
 
N
S
 
S
A
 
Y
F
 
L
A
 
K
V
 
C
P
 
P
F
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
F
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
I
 
V
G
 
C
L
 
V
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
E
V
 
C
A
 
G
L
 
F
L
 
I
T
 
G
G
 
C
V
 
L
S
 
G
T
 
D
D
 
D
F
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
R
R
 
F
L
 
L
M
 
R
A
 
Q
V
 
V
L
 
F
Q
 
Q
A
 
D
E
 
N
Q
 
G
V
 
V
S
 
D
T
 
V
D
 
T
F
 
F
I
 
L
A
 
R
R
 
L
K
 
D
A
 
A
A
 
D
P
 
L
T
 
T
T
 
S
L
 
A
G
 
V
F
 
L
I
 
I
Q
 
V
K
 
N
-
 
L
N
 
T
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
E
P
 
R
N
 
S
Y
 
F
A
 
T
F
x
Y
Y
 
L
G
 
V
E
 
H
G
 
P
A
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
T
L
 
Y
L
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
A
 
P
-
 
P
F
 
F
D
 
R
D
 
Q
A
 
Y
E
 
E
I
 
W
T
 
-
G
 
-
I
 
F
H
 
Y
M
 
F
G
 
S
S
 
S
Y
 
I
S
 
G
L
 
L
V
 
T
V
 
D
A
 
R
P
 
P
T
 
A
A
 
R
D
 
E
T
 
A
L
 
C
L
 
L
A
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
R
R
 
R
-
 
M
-
 
R
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
G
C
 
Y
L
 
V
L
 
L
S
 
-
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
L
R
|
R
L
 
S
T
 
K
V
 
M
E
 
W
P
 
G
D
 
N
V
 
T
Y
 
D
Q
 
E
W
 
I
R
 
P
E
 
E
R
 
L
I
 
I
T
 
A
Q
 
R
L
 
S
L
x
A
P
x
A
F
 
L
M
x
A
D
 
S
V
 
I
V
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
C
A
 
Q
L
 
L
Y
 
S
P
 
G
G
 
A
I
 
S
A
 
H
P
 
W
E
 
Q
S
 
D
I
 
A
I
 
R
A
 
Y
D
 
Y
W
 
L
L
 
R
A
 
D
V
 
L
G
|
G
V
 
C
K
 
D
L
 
T
A
 
T
A
 
I
L
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
S
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
L
L
 
L
W
 
I
S
 
T
Q
 
A
Q
 
E
A
 
G
Q
 
E
V
 
F
T
 
H
L
 
F
P
 
P
T
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
V
 
V
V
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
V
A
 
G
S
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
F
S
 
T
L
 
L
L
 
-
D
 
-
L
 
S
Q
 
R
A
 
A
N
 
N
T
 
C
A
 
-
D
 
-
W
 
W
V
 
D
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
L
A
 
A
S
 
E
T
 
A
L
 
I
Q
 
S
R
 
N
I
 
-
G
 
-
Q
 
A
K
 
N
A
 
A
V
 
C
C
 
G
A
 
A
A
 
M
A
|
A
I
 
V
T
 
T
C
x
A
S
 
K
R
x
G
Q
 
A
G
 
M
A
 
T
D
 
A
L
 
L
P
 
P
S
 
F
A
 
P
K
 
D
E
 
Q
V
 
L
G
 
N
L
 
T
A
 
F
L
 
L
A
 
S
D
 
S
Y
 
H

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
30% identity, 71% coverage: 32:260/323 of query aligns to 33:258/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
E
F
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
P
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
V
T
 
G
G
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
E
D
 
D
F
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
A
R
 
M
L
 
V
M
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
E
 
E
Q
 
G
V
 
V
S
 
D
T
 
L
D
 
T
F
 
H
I
 
F
A
 
R
R
 
R
K
 
A
A
 
P
A
 
G
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
L
G
 
Y
F
 
L
I
 
R
Q
 
E
K
 
Y
N
 
L
A
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
Q
P
 
G
N
 
R
Y
 
V
A
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
R
E
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
L
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
G
D
 
-
I
 
-
A
 
A
F
 
F
D
 
D
D
 
P
A
 
D
E
 
Y
I
 
L
T
 
E
G
 
G
I
 
V
-
 
R
-
 
F
-
 
L
H
 
H
M
 
L
G
 
S
S
 
G
Y
 
I
S
 
T
L
 
P
V
 
A
V
 
L
A
 
S
P
 
P
T
 
E
A
 
A
D
 
R
-
 
A
-
 
F
T
 
S
L
 
L
L
 
W
A
 
A
L
 
M
A
 
E
R
 
E
R
 
A
Q
 
K
A
 
R
G
 
R
K
 
G
C
 
V
L
 
R
L
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
Y
R
 
R
L
 
Q
T
 
T
V
 
L
-
 
W
E
 
S
P
 
P
D
 
E
V
 
-
Y
 
-
Q
 
E
W
 
A
R
 
R
E
 
G
R
 
F
I
 
L
T
 
E
Q
 
R
L
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
A
 
E
A
 
L
L
 
L
Y
 
F
P
 
-
G
 
G
I
 
R
A
 
V
P
 
E
E
 
E
S
 
A
I
 
L
I
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
R
A
 
A
V
 
L
G
 
S
V
 
A
K
 
P
L
 
E
A
 
V
A
 
V
L
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
S
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
W
L
 
A
W
 
F
S
 
V
Q
 
D
Q
 
G
A
 
R
Q
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
G
P
 
S
T
x
A
P
x
F
R
 
A
V
|
V
N
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
Y
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
30% identity, 71% coverage: 32:260/323 of query aligns to 33:258/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
E
F
 
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
P
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
V
T
 
G
G
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
E
D
 
D
F
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
A
R
 
M
L
 
V
M
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
E
 
E
Q
 
G
V
 
V
S
 
D
T
 
L
D
 
T
F
 
H
I
 
F
A
 
R
R
 
R
K
 
A
A
 
P
A
 
G
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
L
G
x
Y
F
 
L
I
 
R
Q
 
E
K
 
Y
N
 
L
A
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
Q
P
 
G
N
 
R
Y
 
V
A
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
G
x
R
E
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
L
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
G
D
 
-
I
 
-
A
 
A
F
 
F
D
 
D
D
 
P
A
 
D
E
 
Y
I
 
L
T
 
E
G
 
G
I
 
V
-
 
R
-
 
F
-
 
L
H
 
H
M
 
L
G
 
S
S
 
G
Y
 
I
S
 
T
L
 
P
V
 
A
V
 
L
A
 
S
P
 
P
T
 
E
A
 
A
D
 
R
-
 
A
-
 
F
T
 
S
L
 
L
L
 
W
A
 
A
L
 
M
A
 
E
R
 
E
R
 
A
Q
 
K
A
 
R
G
 
R
K
 
G
C
 
V
L
 
R
L
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
Y
R
|
R
L
 
Q
T
 
T
V
 
L
-
 
W
E
 
S
P
 
P
D
 
E
V
 
-
Y
 
-
Q
 
E
W
 
A
R
 
R
E
 
G
R
 
F
I
 
L
T
 
E
Q
 
R
L
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
A
 
E
A
 
L
L
 
L
Y
 
F
P
 
-
G
 
G
I
 
R
A
 
V
P
 
E
E
 
E
S
 
A
I
 
L
I
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
R
A
 
A
V
 
L
G
 
S
V
 
A
K
 
P
L
 
E
A
 
V
A
 
V
L
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
S
x
A
E
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
W
L
 
A
W
 
F
S
 
V
Q
 
D
Q
 
G
A
 
R
Q
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
G
P
 
S
T
 
A
P
 
F
R
 
A
V
 
V
N
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
Y
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
27% identity, 97% coverage: 4:317/323 of query aligns to 5:299/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
V
 
V
C
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
x
S
F
 
V
D
|
D
V
 
L
F
 
-
V
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
K
V
 
-
S
 
Q
Q
 
N
S
 
S
A
 
Y
F
 
L
A
 
K
V
x
C
P
 
P
F
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
F
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
I
 
V
G
 
C
L
 
V
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
E
V
 
C
A
 
G
L
 
F
L
 
I
T
 
G
G
 
C
V
 
L
S
 
G
T
 
D
D
 
D
F
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
R
R
 
F
L
 
L
M
 
R
A
 
Q
V
 
V
L
 
F
Q
 
Q
A
 
D
E
 
N
Q
 
G
V
 
V
S
 
D
T
 
V
D
 
T
F
 
F
I
 
L
A
 
R
R
 
L
K
 
D
A
 
A
A
 
D
P
 
L
T
 
T
T
 
S
L
 
A
G
 
V
F
x
L
I
 
I
Q
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
N
N
 
S
Y
x
F
A
 
T
F
x
Y
Y
 
L
G
 
V
E
 
H
G
 
P
A
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
T
L
 
Y
L
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
A
 
P
-
 
P
F
 
F
D
 
R
D
 
Q
A
 
Y
E
 
E
I
 
W
T
 
-
G
 
-
I
 
F
H
 
Y
M
 
F
G
 
S
S
 
S
Y
 
I
S
 
G
L
 
L
V
 
T
V
 
D
A
 
R
P
 
P
T
 
A
A
 
R
D
 
E
T
 
A
L
 
C
L
 
L
A
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
R
R
 
R
-
 
M
-
 
R
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
G
C
 
Y
L
 
V
L
 
L
S
 
-
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
L
R
|
R
L
 
S
T
 
K
V
x
M
E
 
W
P
 
G
D
 
N
V
 
T
Y
 
D
Q
 
E
W
 
I
R
 
P
E
 
E
R
 
L
I
 
I
T
 
A
Q
 
R
L
 
S
L
 
A
P
 
A
F
 
L
M
 
A
D
 
S
V
 
I
V
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
C
A
 
Q
L
 
L
Y
 
S
P
 
G
G
 
A
I
 
S
A
 
H
P
 
W
E
 
Q
S
 
D
I
 
A
I
 
R
A
 
Y
D
 
Y
W
 
L
L
 
R
A
 
D
V
 
L
G
 
G
V
 
C
K
 
D
L
 
T
A
 
T
A
 
I
L
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
S
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
L
L
 
L
W
 
I
S
 
T
Q
 
A
Q
 
E
A
 
G
Q
 
E
V
 
F
T
 
H
L
 
F
P
 
P
T
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
V
A
 
G
S
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
F
S
 
T
L
 
L
L
 
-
D
 
-
L
 
S
Q
 
R
A
 
A
N
 
N
T
 
C
A
 
-
D
 
-
W
 
W
V
 
D
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
L
A
 
A
S
 
E
T
 
A
L
 
I
Q
 
S
R
 
N
I
 
-
G
 
-
Q
 
A
K
 
N
A
 
A
V
 
C
C
 
G
A
 
A
A
 
M
A
 
A
I
 
V
T
 
T
C
 
A
S
 
K
R
 
G
Q
 
A
G
 
M
A
 
T
D
 
A
L
 
L
P
 
P
S
 
F
A
 
P
K
 
D
E
 
Q
V
 
L
G
 
N
L
 
T
A
 
F
L
 
L
A
 
S
D
 
S
Y
 
H

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
30% identity, 71% coverage: 32:260/323 of query aligns to 33:258/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
x
E
F
x
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
P
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
V
T
 
G
G
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
E
D
 
D
F
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
A
R
 
M
L
 
V
M
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
E
 
E
Q
 
G
V
 
V
S
 
D
T
 
L
D
 
T
F
 
H
I
 
F
A
 
R
R
 
R
K
 
A
A
 
P
A
 
G
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
L
G
 
Y
F
 
L
I
 
R
Q
 
E
K
 
Y
N
 
L
A
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
Q
P
 
G
N
 
R
Y
 
V
A
 
F
F
x
Y
Y
|
Y
G
x
R
E
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
L
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
G
D
 
-
I
 
-
A
 
A
F
 
F
D
 
D
D
 
P
A
 
D
E
 
Y
I
 
L
T
 
E
G
 
G
I
 
V
-
 
R
-
 
F
-
 
L
H
 
H
M
 
L
G
 
S
S
 
G
Y
 
I
S
 
T
L
 
P
V
 
A
V
 
L
A
 
S
P
 
P
T
 
E
A
 
A
D
 
R
-
 
A
-
 
F
T
 
S
L
 
L
L
 
W
A
 
A
L
 
M
A
 
E
R
 
E
R
 
A
Q
 
K
A
 
R
G
 
R
K
 
G
C
 
V
L
 
R
L
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
Y
R
|
R
L
 
Q
T
 
T
V
 
L
-
 
W
E
 
S
P
 
P
D
 
E
V
 
-
Y
 
-
Q
 
E
W
 
A
R
 
R
E
 
G
R
 
F
I
 
L
T
 
E
Q
 
R
L
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
|
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
A
 
E
A
 
L
L
 
L
Y
 
F
P
 
-
G
 
G
I
 
R
A
 
V
P
 
E
E
 
E
S
 
A
I
 
L
I
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
R
A
 
A
V
 
L
G
 
S
V
 
A
K
 
P
L
 
E
A
 
V
A
 
V
L
 
L
T
x
K
R
|
R
G
|
G
S
x
A
E
x
K
G
|
G
A
|
A
S
 
W
L
 
A
W
 
F
S
 
V
Q
 
D
Q
 
G
A
 
R
Q
 
R
V
 
V
T
 
E
L
 
G
P
 
S
T
 
A
P
 
F
R
 
A
V
 
V
N
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
Y
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
28% identity, 91% coverage: 4:296/323 of query aligns to 5:278/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
V
 
V
C
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
S
F
 
V
D
|
D
V
 
L
F
 
-
V
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
K
V
 
-
S
 
Q
Q
 
N
S
 
S
A
 
Y
F
 
L
A
 
K
V
x
C
P
 
P
F
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
F
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
I
 
V
G
 
C
L
 
V
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
E
V
 
C
A
 
G
L
 
F
L
 
I
T
 
G
G
 
C
V
 
L
S
 
G
T
 
D
D
 
D
F
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
R
R
 
F
L
 
L
M
 
R
A
 
Q
V
 
V
L
 
F
Q
 
Q
A
 
D
E
 
N
Q
 
G
V
 
V
S
 
D
T
 
V
D
 
T
F
 
F
I
 
L
A
 
R
R
 
L
K
 
D
A
 
A
A
 
D
P
 
L
T
 
T
T
 
S
L
 
A
G
 
V
F
 
L
I
 
I
Q
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
N
N
 
S
Y
x
F
A
 
T
F
x
Y
Y
 
L
G
 
V
E
 
H
G
 
P
A
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
T
L
 
Y
L
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
A
 
P
-
 
P
F
 
F
D
 
R
D
 
Q
A
 
Y
E
 
E
I
 
W
T
 
-
G
 
-
I
 
F
H
 
Y
M
 
F
G
 
S
S
 
S
Y
 
I
S
 
G
L
 
L
V
 
T
V
 
D
A
 
R
P
 
P
T
 
A
A
 
R
D
 
E
T
 
A
L
 
C
L
 
L
A
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
R
R
 
R
-
 
M
-
 
R
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
G
C
 
Y
L
 
V
L
 
L
S
 
-
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
|
N
I
 
L
R
|
R
L
 
S
T
 
K
V
x
M
E
 
W
P
 
G
D
 
N
V
 
T
Y
 
D
Q
 
E
W
 
I
R
 
P
E
 
E
R
 
L
I
 
I
T
 
A
Q
 
R
L
 
S
L
 
A
P
 
A
F
 
L
M
 
A
D
 
S
V
 
I
V
 
C
K
|
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
x
E
L
 
L
A
 
C
A
 
Q
L
 
L
Y
 
S
P
 
G
G
 
A
I
 
S
A
 
H
P
 
W
E
 
Q
S
 
D
I
 
A
I
 
R
A
 
Y
D
 
Y
W
 
L
L
 
R
A
 
D
V
 
L
G
 
G
V
 
C
K
 
D
L
 
T
A
 
T
A
 
I
L
 
I
T
x
S
R
 
L
G
|
G
S
x
A
E
 
D
G
|
G
A
 
A
S
 
L
L
 
L
W
 
I
S
 
T
Q
 
A
Q
 
E
A
 
G
Q
 
E
V
 
F
T
 
H
L
 
F
P
 
P
T
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
Q
 
V
A
 
G
S
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
F
S
 
T
L
 
L
L
 
-
D
 
-
L
 
S
Q
 
R
A
 
A
N
 
N
T
 
C
A
 
-
D
 
-
W
 
W
V
 
D
A
 
H
A
 
A
L
 
L
T
 
L
A
 
A
S
 
E
T
 
A
L
 
I
Q
 
S
R
 
N
I
 
-
G
 
-
Q
 
A
K
x
N
A
 
A
V
 
C
C
x
G
A
|
A
A
 
M
A
 
A
I
 
V
T
 
T

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
29% identity, 66% coverage: 44:255/323 of query aligns to 47:257/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
V
 
C
A
 
G
L
 
I
L
 
I
T
 
S
G
 
C
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
F
 
G
L
 
F
G
 
G
D
 
D
R
 
I
L
 
N
M
 
I
A
 
H
V
 
R
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
E
 
D
Q
 
G
V
 
V
S
 
D
T
 
I
D
 
R
F
 
G
I
 
I
A
 
S
-
 
V
R
 
L
K
 
P
A
 
L
A
 
E
P
 
A
T
 
T
T
 
G
L
 
S
G
 
A
F
 
F
I
 
V
Q
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
T
V
 
Y
G
 
G
V
 
D
P
 
R
N
 
D
Y
 
F
A
 
I
F
 
F
Y
 
N
G
 
I
E
 
K
G
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
C
R
 
G
L
 
K
L
 
L
A
 
S
P
 
A
A
 
Q
D
 
H
I
 
V
A
 
D
F
 
E
D
 
N
D
 
I
-
 
L
A
 
K
E
 
D
I
 
C
T
 
T
G
 
H
I
 
F
H
 
H
M
 
I
G
 
M
S
 
G
Y
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
F
V
 
S
A
 
F
P
 
H
T
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
V
L
 
K
-
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
T
R
 
I
R
 
V
Q
 
K
A
 
A
G
 
N
K
 
G
C
 
G
L
 
V
L
 
I
S
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
R
L
 
K
T
 
E
V
 
M
E
 
-
P
 
L
D
 
D
V
 
I
Y
 
P
Q
 
E
W
 
M
R
 
R
E
 
D
R
 
A
I
 
L
T
 
H
Q
 
F
L
 
V
L
 
L
P
 
E
F
 
L
M
 
T
D
 
D
V
 
I
V
 
Y
K
 
M
V
 
P
S
|
S
D
 
E
E
 
G
D
 
E
L
 
V
A
 
L
A
 
L
L
 
L
Y
 
S
P
 
P
G
 
H
I
 
S
A
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
R
I
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
G
W
 
F
L
 
L
A
 
E
V
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
E
A
 
V
A
 
I
L
 
V
T
x
K
R
 
R
G
|
G
S
 
N
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
Y
W
 
Y
S
 
S
Q
 
A
Q
 
N
A
 
E
Q
 
Q
V
 
F
T
 
H
L
 
V
P
 
E
T
 
S
P
 
Y
R
 
P
V
 
V
N
 
E
V
x
E
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
C
F
|
F

Sites not aligning to the query:

2varA Crystal structure of sulfolobus solfataricus 2-keto-3-deoxygluconate kinase complexed with 2-keto-3-deoxygluconate (see paper)
25% identity, 85% coverage: 3:278/323 of query aligns to 4:285/311 of 2varA

query
sites
2varA
V
 
I
V
 
A
C
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
|
L
-
 
I
-
 
Q
F
 
F
D
 
N
V
 
S
F
 
F
V
 
N
P
 
P
E
 
G
G
 
P
V
 
L
S
 
R
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
F
A
 
V
V
 
N
P
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
K
R
 
H
A
 
V
G
 
A
G
|
G
S
|
S
P
 
E
F
 
L
N
 
N
V
 
F
A
 
C
I
 
I
G
 
A
L
 
V
R
 
V
R
 
R
L
 
N
G
 
H
Q
 
L
P
 
S
V
 
C
A
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
A
G
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
F
 
E
L
 
F
G
 
G
D
 
K
R
 
N
L
 
I
M
 
I
A
 
E
V
 
Y
L
 
S
Q
 
R
A
 
A
E
 
Q
Q
 
G
V
 
I
S
 
D
T
 
T
D
 
S
F
 
H
I
 
I
A
 
K
-
 
V
R
 
D
K
 
N
A
 
E
A
 
S
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
I
G
x
Y
F
 
F
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
N
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
Y
P
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
M
-
 
K
-
 
S
N
 
E
Y
x
L
A
 
V
F
x
Y
Y
 
Y
G
x
R
E
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
L
 
R
L
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
N
F
 
E
D
 
N
D
 
Y
A
 
V
E
 
R
I
 
N
T
 
S
G
 
R
-
 
L
I
 
V
H
 
H
M
 
S
G
 
T
S
 
G
Y
x
I
S
 
T
L
 
L
V
 
A
V
 
I
A
 
S
P
 
D
T
 
N
A
 
A
D
 
K
T
 
E
L
 
A
L
 
V
A
 
I
L
 
K
A
 
A
R
 
F
R
 
E
Q
 
L
A
 
A
G
 
K
K
 
S
C
 
-
L
 
-
L
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
T
N
 
N
I
 
I
R
|
R
L
 
P
T
 
K
V
 
L
E
 
W
P
 
S
D
 
S
V
 
L
Y
 
E
Q
 
K
W
 
A
R
 
K
E
 
E
R
 
T
I
 
I
T
 
L
Q
 
S
L
 
I
L
 
L
P
 
K
F
 
K
M
 
Y
D
 
D
V
 
I
-
 
E
V
 
V
K
 
L
V
 
I
S
 
T
D
 
D
-
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
T
A
 
K
A
 
I
L
 
L
Y
 
L
P
 
D
G
 
V
I
 
T
A
 
D
P
 
P
E
 
D
S
 
E
I
 
A
I
 
Y
A
 
R
D
 
K
W
 
Y
L
 
K
A
 
E
V
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
V
A
 
L
A
 
L
L
 
Y
T
x
K
R
 
L
G
|
G
S
|
S
E
 
K
G
|
G
A
 
A
S
 
I
L
 
A
W
 
Y
S
 
K
Q
 
D
Q
 
N
A
 
V
Q
 
K
V
 
A
T
 
F
L
 
K
P
 
D
T
 
A
P
 
Y
R
 
K
V
 
V
N
 
P
V
 
V
V
 
E
D
 
D
T
 
P
V
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
x
M
Q
 
A
A
 
G
S
 
T
L
 
F
L
 
V
D
 
S
S
 
L
L
 
Y
L
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
D
 
D
L
 
I
Q
 
E
A
 
Y
N
 
S
T
 
L
A
 
A
D
 
H
W
 
G
V
x
I
A
 
A
A
 
A
L
x
S
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Q97U29 2-dehydro-3-deoxygluconokinase/2-dehydro-3-deoxygalactonokinase; 2-dehydro-3-deoxyglucono/galactono-kinase; 2-keto-3-deoxy-galactonokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; KDGal kinase; EC 2.7.1.178 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
25% identity, 85% coverage: 3:278/323 of query aligns to 5:286/313 of Q97U29

query
sites
Q97U29
V
 
I
V
 
A
C
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
F
 
F
D
 
N
V
 
S
F
 
F
V
 
N
P
 
P
E
 
G
G
 
P
V
 
L
S
 
R
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
F
A
 
V
V
 
N
P
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
K
R
 
H
A
 
V
G
 
A
G
|
G
S
|
S
P
x
E
F
x
L
N
|
N
V
 
F
A
 
C
I
 
I
G
 
A
L
 
V
R
 
V
R
 
R
L
 
N
G
 
H
Q
 
L
P
 
S
V
 
C
A
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
A
G
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
F
 
E
L
 
F
G
 
G
D
 
K
R
 
N
L
 
I
M
 
I
A
 
E
V
 
Y
L
 
S
Q
 
R
A
 
A
E
 
Q
Q
 
G
V
 
I
S
 
D
T
 
T
D
 
S
F
 
H
I
 
I
A
 
K
-
 
V
R
 
D
K
 
N
A
 
E
A
 
S
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
I
G
x
Y
F
 
F
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
N
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
Y
P
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
M
-
 
K
-
 
S
N
 
E
Y
 
L
A
 
V
F
x
Y
Y
|
Y
G
x
R
E
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
L
 
R
L
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
N
F
 
E
D
 
N
D
 
Y
A
 
V
E
 
R
I
 
N
T
 
S
G
 
R
-
 
L
I
 
V
H
 
H
M
 
S
G
 
T
S
 
G
Y
 
I
S
 
T
L
 
L
V
 
A
V
 
I
A
 
S
P
 
D
T
 
N
A
 
A
D
 
K
T
 
E
L
 
A
L
 
V
A
 
I
L
 
K
A
 
A
R
 
F
R
 
E
Q
 
L
A
 
A
G
 
K
K
 
S
C
 
-
L
 
-
L
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
T
N
|
N
I
|
I
R
|
R
L
 
P
T
 
K
V
 
L
E
 
W
P
 
S
D
 
S
V
 
L
Y
 
E
Q
 
K
W
 
A
R
 
K
E
 
E
R
 
T
I
 
I
T
 
L
Q
 
S
L
 
I
L
 
L
P
 
K
F
 
K
M
 
Y
D
 
D
V
 
I
-
 
E
V
 
V
K
 
L
V
 
I
S
 
T
D
 
D
-
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
T
A
 
K
A
 
I
L
 
L
Y
 
L
P
 
D
G
 
V
I
 
T
A
 
D
P
 
P
E
 
D
S
 
E
I
 
A
I
 
Y
A
 
R
D
 
K
W
 
Y
L
 
K
A
 
E
V
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
V
A
 
L
A
 
L
L
 
Y
T
x
K
R
x
L
G
|
G
S
|
S
E
x
K
G
|
G
A
 
A
S
 
I
L
 
A
W
 
Y
S
 
K
Q
 
D
Q
 
N
A
 
V
Q
 
K
V
 
A
T
 
F
L
 
K
P
 
D
T
 
A
P
 
Y
R
 
K
V
 
V
N
 
P
V
 
V
V
 
E
D
 
D
T
 
P
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
M
Q
 
A
A
 
G
S
 
T
L
 
F
L
 
V
D
 
S
S
 
L
L
 
Y
L
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
D
 
D
L
 
I
Q
 
E
A
 
Y
N
 
S
T
 
L
A
 
A
D
 
H
W
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
S
T
 
T

Sites not aligning to the query:

5c3yA Structure of human ribokinase crystallized with amppnp
27% identity, 81% coverage: 16:278/323 of query aligns to 26:287/306 of 5c3yA

query
sites
5c3yA
E
 
E
G
 
T
V
 
I
S
 
H
Q
 
G
S
 
H
A
 
K
F
 
F
A
 
F
V
 
I
P
 
G
F
 
F
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
K
P
 
G
F
 
A
N
 
N
V
 
Q
A
 
C
I
 
V
G
 
Q
L
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
A
P
 
M
V
 
T
A
 
S
L
 
M
L
 
V
T
 
C
G
 
K
V
 
V
S
 
G
T
 
K
D
 
D
F
 
S
L
 
F
G
 
G
D
 
N
R
 
D
L
 
Y
M
 
I
A
 
E
V
 
N
L
 
L
Q
 
K
A
 
Q
E
 
N
Q
 
D
V
 
I
S
 
S
T
 
T
D
 
E
F
 
F
I
 
T
A
 
Y
R
 
Q
-
 
T
K
 
K
A
 
D
A
 
A
P
 
A
T
 
T
T
 
G
L
 
T
G
 
A
F
 
S
I
 
I
Q
 
I
K
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
E
G
 
G
V
 
-
P
 
Q
N
 
N
Y
 
I
A
 
I
F
 
V
Y
 
I
G
 
V
E
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
-
D
 
N
R
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
N
P
 
T
A
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
R
F
 
A
D
 
A
D
 
A
A
 
N
E
 
V
I
 
I
T
 
S
G
 
R
I
 
A
H
 
K
M
 
V
G
 
M
S
 
V
Y
 
C
S
 
Q
L
 
L
V
 
E
V
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
A
T
 
T
A
 
S
D
 
L
T
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
M
A
 
A
R
 
R
R
 
R
Q
 
S
A
 
G
G
 
V
K
 
K
C
 
T
L
 
L
L
 
F
S
 
N
L
 
P
D
 
A
P
 
P
N
 
A
I
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
P
R
 
Q
L
 
F
T
 
Y
V
 
T
E
 
L
P
 
S
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
Q
 
C
W
 
C
R
 
N
E
 
E
R
 
S
I
 
E
T
 
A
Q
 
E
L
 
I
L
 
L
P
 
T
F
 
G
M
 
L
D
 
T
V
 
V
V
 
G
K
 
S
V
 
A
S
 
A
D
 
D
E
 
A
D
 
G
L
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
P
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
L
L
 
L
A
 
K
V
 
R
G
 
G
V
 
C
K
 
Q
L
 
V
A
 
V
A
 
I
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
S
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
C
S
 
V
L
 
V
W
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
T
A
 
E
Q
 
P
-
 
E
-
 
P
V
 
K
T
 
H
L
 
I
P
 
P
T
 
T
P
 
E
R
 
K
V
|
V
N
 
K
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
|
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
S
F
 
F
Q
 
V
A
 
G
S
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
F
S
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
Y
-
 
P
-
 
N
-
 
L
-
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
D
Q
 
M
A
 
L
N
 
N
T
 
R
A
 
S
D
x
N
W
 
F
V
 
I
A
|
A
A
|
A
L
 
V
T
 
S

2fv7A Crystal structure of human ribokinase
27% identity, 81% coverage: 16:278/323 of query aligns to 26:287/308 of 2fv7A

query
sites
2fv7A
E
 
E
G
 
T
V
 
I
S
 
H
Q
 
G
S
 
H
A
 
K
F
 
F
A
 
F
V
 
I
P
 
G
F
 
F
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
K
P
 
G
F
 
A
N
 
N
V
 
Q
A
 
C
I
 
V
G
 
Q
L
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
A
P
 
M
V
 
T
A
 
S
L
 
M
L
 
V
T
 
C
G
 
K
V
 
V
S
 
G
T
 
K
D
 
D
F
 
S
L
 
F
G
 
G
D
 
N
R
 
D
L
 
Y
M
 
I
A
 
E
V
 
N
L
 
L
Q
 
K
A
 
Q
E
 
N
Q
 
D
V
 
I
S
 
S
T
 
T
D
 
E
F
 
F
I
 
T
A
 
Y
R
 
Q
-
 
T
K
 
K
A
 
D
A
 
A
P
 
A
T
 
T
T
 
G
L
 
T
G
 
A
F
 
S
I
 
I
Q
 
I
K
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
E
G
 
G
V
 
-
P
 
Q
N
 
N
Y
 
I
A
 
I
F
 
V
Y
 
I
G
 
V
E
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
-
D
 
N
R
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
N
P
 
T
A
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
R
F
 
A
D
 
A
D
 
A
A
 
N
E
 
V
I
 
I
T
 
S
G
 
R
I
 
A
H
 
K
M
 
V
G
 
M
S
 
V
Y
 
C
S
 
Q
L
 
L
V
 
E
V
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
A
T
 
T
A
 
S
D
 
L
T
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
M
A
 
A
R
 
R
R
 
R
Q
 
S
A
 
G
G
 
V
K
 
K
C
 
T
L
 
L
L
 
F
S
 
N
L
 
P
D
 
A
P
 
P
N
 
A
I
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
P
R
 
Q
L
 
F
T
 
Y
V
 
T
E
 
L
P
 
S
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
Q
 
C
W
 
C
R
x
N
E
 
E
R
 
S
I
 
E
T
 
A
Q
 
E
L
 
I
L
 
L
P
 
T
F
 
G
M
 
L
D
 
T
V
 
V
V
 
G
K
 
S
V
 
A
S
 
A
D
 
D
E
 
A
D
 
G
L
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
P
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
L
L
 
L
A
 
K
V
 
R
G
 
G
V
 
C
K
 
Q
L
 
V
A
 
V
A
 
I
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
S
 
A
E
 
E
G
|
G
A
 
C
S
 
V
L
 
V
W
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
T
A
 
E
Q
 
P
-
 
E
-
 
P
V
 
K
T
 
H
L
 
I
P
 
P
T
|
T
P
 
E
R
 
K
V
|
V
N
 
K
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
S
F
 
F
Q
 
V
A
 
G
S
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
F
S
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
Y
-
 
P
-
 
N
-
 
L
-
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
D
Q
 
M
A
 
L
N
 
N
T
 
R
A
 
S
D
x
N
W
 
F
V
 
I
A
|
A
A
|
A
L
 
V
T
 
S

Sites not aligning to the query:

6wk0B Crystal structure of human ribokinase in complex with amppcp and ribose
27% identity, 81% coverage: 16:278/323 of query aligns to 27:288/311 of 6wk0B

query
sites
6wk0B
E
 
E
G
 
T
V
 
I
S
 
H
Q
 
G
S
 
H
A
 
K
F
 
F
A
 
F
V
 
I
P
 
G
F
 
F
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
|
G
S
x
K
P
 
G
F
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
C
I
 
V
G
 
Q
L
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
A
P
 
M
V
 
T
A
 
S
L
 
M
L
 
V
T
 
C
G
 
K
V
 
V
S
 
G
T
 
K
D
 
D
F
 
S
L
 
F
G
 
G
D
 
N
R
 
D
L
 
Y
M
 
I
A
 
E
V
 
N
L
 
L
Q
 
K
A
 
Q
E
 
N
Q
 
D
V
 
I
S
 
S
T
 
T
D
 
E
F
 
F
I
 
T
A
 
Y
R
 
Q
-
 
T
K
 
K
A
 
D
A
 
A
P
 
A
T
 
T
T
 
G
L
 
T
G
x
A
F
 
S
I
 
I
Q
 
I
K
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
E
G
 
G
V
 
-
P
 
Q
N
 
N
Y
 
I
A
 
I
F
 
V
Y
 
I
G
 
V
E
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
-
D
 
N
R
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
N
P
 
T
A
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
R
F
 
A
D
 
A
D
 
A
A
 
N
E
 
V
I
 
I
T
 
S
G
 
R
I
 
A
H
 
K
M
 
V
G
 
M
S
 
V
Y
 
C
S
 
Q
L
 
L
V
x
E
V
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
A
T
 
T
A
 
S
D
 
L
T
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
M
A
 
A
R
 
R
R
 
R
Q
 
S
A
 
G
G
 
V
K
 
K
C
 
T
L
 
L
L
 
F
S
 
N
L
 
P
D
 
A
P
 
P
N
 
A
I
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
P
R
 
Q
L
 
F
T
 
Y
V
 
T
E
 
L
P
 
S
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
Q
 
C
W
 
C
R
x
N
E
 
E
R
 
S
I
 
E
T
 
A
Q
 
E
L
 
I
L
 
L
P
 
T
F
 
G
M
 
L
D
 
T
V
 
V
V
 
G
K
 
S
V
 
A
S
 
A
D
 
D
E
 
A
D
 
G
L
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
P
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
L
L
 
L
A
 
K
V
 
R
G
 
G
V
 
C
K
 
Q
L
 
V
A
 
V
A
 
I
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
S
x
A
E
 
E
G
|
G
A
 
C
S
 
V
L
 
V
W
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
T
A
 
E
Q
 
P
-
 
E
-
 
P
V
 
K
T
 
H
L
 
I
P
 
P
T
|
T
P
 
E
R
 
K
V
|
V
N
 
K
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
S
F
 
F
Q
 
V
A
 
G
S
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
F
S
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
Y
-
 
P
-
 
N
-
 
L
-
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
D
Q
 
M
A
 
L
N
 
N
T
 
R
A
 
S
D
x
N
W
 
F
V
 
I
A
|
A
A
|
A
L
 
V
T
 
S

Sites not aligning to the query:

5c41A Crystal structure of human ribokinase in complex with amppcp in p21 spacegroup and with 4 protomers
27% identity, 81% coverage: 16:278/323 of query aligns to 27:288/317 of 5c41A

query
sites
5c41A
E
 
E
G
 
T
V
 
I
S
 
H
Q
 
G
S
 
H
A
 
K
F
 
F
A
 
F
V
 
I
P
 
G
F
 
F
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
K
P
 
G
F
 
A
N
 
N
V
 
Q
A
 
C
I
 
V
G
 
Q
L
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
A
P
 
M
V
 
T
A
 
S
L
 
M
L
 
V
T
 
C
G
 
K
V
 
V
S
 
G
T
 
K
D
 
D
F
 
S
L
 
F
G
 
G
D
 
N
R
 
D
L
 
Y
M
 
I
A
 
E
V
 
N
L
 
L
Q
 
K
A
 
Q
E
 
N
Q
 
D
V
 
I
S
 
S
T
 
T
D
 
E
F
 
F
I
 
T
A
 
Y
R
 
Q
-
 
T
K
 
K
A
 
D
A
 
A
P
 
A
T
 
T
T
 
G
L
 
T
G
 
A
F
 
S
I
 
I
Q
 
I
K
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
E
G
 
G
V
 
-
P
 
Q
N
 
N
Y
 
I
A
 
I
F
 
V
Y
 
I
G
 
V
E
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
-
D
 
N
R
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
N
P
 
T
A
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
R
F
 
A
D
 
A
D
 
A
A
 
N
E
 
V
I
 
I
T
 
S
G
 
R
I
 
A
H
 
K
M
 
V
G
 
M
S
 
V
Y
 
C
S
 
Q
L
 
L
V
 
E
V
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
A
T
 
T
A
 
S
D
 
L
T
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
M
A
 
A
R
 
R
R
 
R
Q
 
S
A
 
G
G
 
V
K
 
K
C
 
T
L
 
L
L
 
F
S
 
N
L
 
P
D
 
A
P
 
P
N
 
A
I
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
P
R
 
Q
L
 
F
T
 
Y
V
 
T
E
 
L
P
 
S
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
Q
 
C
W
 
C
R
x
N
E
 
E
R
 
S
I
 
E
T
 
A
Q
 
E
L
 
I
L
 
L
P
 
T
F
 
G
M
 
L
D
 
T
V
 
V
V
 
G
K
 
S
V
 
A
S
 
A
D
 
D
E
 
A
D
 
G
L
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
P
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
L
L
 
L
A
 
K
V
 
R
G
 
G
V
 
C
K
 
Q
L
 
V
A
 
V
A
 
I
L
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
S
x
A
E
 
E
G
|
G
A
 
C
S
 
V
L
 
V
W
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
T
A
 
E
Q
 
P
-
 
E
-
 
P
V
 
K
T
 
H
L
 
I
P
 
P
T
 
T
P
 
E
R
 
K
V
|
V
N
 
K
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
S
F
 
F
Q
 
V
A
 
G
S
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
F
S
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
Y
-
 
P
-
 
N
-
 
L
-
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
D
Q
 
M
A
 
L
N
 
N
T
 
R
A
 
S
D
x
N
W
 
F
V
 
I
A
|
A
A
|
A
L
 
V
T
 
S

Query Sequence

>WP_051542722.1 NCBI__GCF_000621325.1:WP_051542722.1
MFVVCGEALFDVFVPEGVSQSAFAVPFAARAGGSPFNVAIGLRRLGQPVALLTGVSTDFL
GDRLMAVLQAEQVSTDFIARKAAPTTLGFIQKNAVGVPNYAFYGEGAADRLLAPADIAFD
DAEITGIHMGSYSLVVAPTADTLLALARRQAGKCLLSLDPNIRLTVEPDVYQWRERITQL
LPFMDVVKVSDEDLAALYPGIAPESIIADWLAVGVKLAALTRGSEGASLWSQQAQVTLPT
PRVNVVDTVGAGDTFQASLLDSLLDLQANTADWVAALTASTLQRIGQKAVCAAAITCSRQ
GADLPSAKEVGLALADYPEELLV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory