SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_052666358.1 NCBI__GCF_000969705.1:WP_052666358.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5mh6A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-ketohexanoic acid and NAD+ (1.35 a resolution)
37% identity, 72% coverage: 81:297/303 of query aligns to 83:305/306 of 5mh6A

query
sites
5mh6A
T
 
T
C
 
N
G
 
S
K
x
T
G
 
G
V
 
I
Y
x
H
A
 
G
E
 
T
P
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
H
 
T
V
 
V
L
 
A
A
 
G
L
 
Y
T
 
M
L
 
L
G
 
T
L
 
F
L
 
A
R
 
R
S
 
R
V
 
L
G
 
H
H
 
A
Y
 
Y
S
 
R
R
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
H
S
 
A
W
 
W
T
 
D
G
 
L
P
 
P
R
 
R
G
 
Y
R
 
E
N
 
E
-
 
P
-
 
F
-
x
T
L
 
L
L
x
A
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
V
T
 
C
I
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
L
G
|
G
E
x
T
I
x
L
T
 
G
R
 
R
T
 
G
L
 
V
V
 
V
R
 
D
L
 
R
L
 
A
L
 
A
P
 
A
F
 
L
G
 
G
C
 
M
Y
 
E
L
 
V
T
 
V
V
 
G
V
 
V
R
 
R
R
|
R
H
 
S
A
 
G
D
 
D
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
N
V
 
V
A
 
S
E
 
T
V
 
V
L
 
Y
A
 
T
S
 
P
D
 
D
R
 
R
L
 
L
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
A
T
 
D
T
 
A
D
 
R
V
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
T
A
x
P
L
 
L
T
 
T
P
 
D
E
 
E
T
|
T
E
 
E
H
 
G
I
 
M
V
 
V
D
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
E
I
x
F
A
x
E
A
 
T
L
x
M
P
 
R
D
 
E
H
 
D
A
 
A
V
 
S
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
|
G
R
x
P
H
 
V
I
x
V
D
 
V
T
x
E
D
 
S
A
 
D
L
 
L
T
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
x
D
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
x
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
T
 
D
A
 
F
H
 
E
N
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
S
N
 
A
T
 
A
P
 
T
E
 
S
M
 
K
G
x
Y
R
 
H
V
 
E
L
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
R
 
T
G
 
G
D
 
D
P
 
E
L
 
L
L
 
T
G
 
N
P
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5mhaB D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
37% identity, 72% coverage: 81:297/303 of query aligns to 85:307/308 of 5mhaB

query
sites
5mhaB
T
 
T
C
 
N
G
 
S
K
x
T
G
 
G
V
 
I
Y
x
H
A
 
G
E
 
T
P
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
H
 
T
V
 
V
L
 
A
A
 
G
L
 
Y
T
 
M
L
 
L
G
 
T
L
 
F
L
 
A
R
 
R
S
 
R
V
 
L
G
 
H
H
 
A
Y
 
Y
S
 
R
R
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
H
S
 
A
W
 
W
T
 
D
G
 
L
P
 
P
R
 
R
G
 
Y
R
 
E
N
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
T
L
 
L
L
 
A
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
V
T
 
C
I
 
V
L
 
V
G
 
G
G
x
L
G
|
G
E
x
T
I
x
L
T
 
G
R
 
R
T
 
G
L
 
V
V
 
V
R
 
D
L
 
R
L
 
A
L
 
A
P
 
A
F
 
L
G
 
G
C
 
M
Y
 
E
L
 
V
T
 
V
V
 
G
V
 
V
R
|
R
R
|
R
H
x
S
A
 
G
D
 
D
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
N
V
 
V
A
 
S
E
 
T
V
 
V
L
 
Y
A
 
T
S
x
P
D
 
D
R
 
R
L
 
L
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
A
T
 
D
T
 
A
D
 
R
V
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
A
x
P
L
 
L
T
 
T
P
 
D
E
 
E
T
|
T
E
 
E
H
 
G
I
 
M
V
 
V
D
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
E
I
x
F
A
x
E
A
 
T
L
x
M
P
 
R
D
 
E
H
 
D
A
 
A
V
 
S
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
P
H
 
V
I
 
V
D
 
V
T
 
E
D
 
S
A
 
D
L
 
L
T
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
x
D
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
 
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
T
 
D
A
 
F
H
 
E
N
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
S
N
 
A
T
 
A
P
 
T
E
 
S
M
 
K
G
x
Y
R
 
H
V
 
E
L
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
R
 
T
G
 
G
D
 
D
P
 
E
L
 
L
L
 
T
G
 
N
P
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5mhaA D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
37% identity, 72% coverage: 81:297/303 of query aligns to 85:307/308 of 5mhaA

query
sites
5mhaA
T
 
T
C
 
N
G
 
S
K
x
T
G
 
G
V
 
I
Y
x
H
A
 
G
E
 
T
P
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
H
 
T
V
 
V
L
 
A
A
 
G
L
 
Y
T
 
M
L
 
L
G
 
T
L
 
F
L
 
A
R
 
R
S
 
R
V
 
L
G
 
H
H
 
A
Y
 
Y
S
 
R
R
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
H
S
 
A
W
 
W
T
 
D
G
 
L
P
 
P
R
 
R
G
 
Y
R
 
E
N
 
E
-
 
P
-
 
F
-
x
T
L
 
L
L
x
A
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
V
T
 
C
I
 
V
L
 
V
G
 
G
G
x
L
G
|
G
E
x
T
I
x
L
T
 
G
R
 
R
T
 
G
L
 
V
V
 
V
R
 
D
L
 
R
L
 
A
L
 
A
P
 
A
F
 
L
G
 
G
C
 
M
Y
 
E
L
 
V
T
 
V
V
 
G
V
 
V
R
|
R
R
|
R
H
x
S
A
 
G
D
 
D
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
N
V
 
V
A
 
S
E
 
T
V
 
V
L
 
Y
A
 
T
S
x
P
D
 
D
R
 
R
L
 
L
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
A
T
 
D
T
 
A
D
 
R
V
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
A
x
P
L
 
L
T
 
T
P
 
D
E
 
E
T
|
T
E
 
E
H
 
G
I
 
M
V
 
V
D
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
E
I
 
F
A
 
E
A
 
T
L
 
M
P
 
R
D
 
E
H
 
D
A
 
A
V
 
S
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
P
H
 
V
I
 
V
D
 
V
T
 
E
D
 
S
A
 
D
L
 
L
T
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
D
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
 
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
T
 
D
A
 
F
H
 
E
N
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
S
N
 
A
T
 
A
P
 
T
E
 
S
M
 
K
G
x
Y
R
 
H
V
 
E
L
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
R
 
T
G
 
G
D
 
D
P
 
E
L
 
L
L
 
T
G
 
N
P
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5mh5A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-keto-hexanoic acid and NADP+ (1.4 a resolution)
37% identity, 72% coverage: 81:297/303 of query aligns to 85:307/308 of 5mh5A

query
sites
5mh5A
T
 
T
C
 
N
G
 
S
K
x
T
G
 
G
V
 
I
Y
x
H
A
 
G
E
 
T
P
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
H
 
T
V
 
V
L
 
A
A
 
G
L
 
Y
T
 
M
L
 
L
G
 
T
L
 
F
L
 
A
R
 
R
S
 
R
V
 
L
G
 
H
H
 
A
Y
 
Y
S
 
R
R
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
H
S
 
A
W
 
W
T
 
D
G
 
L
P
 
P
R
 
R
G
 
Y
R
 
E
N
 
E
-
 
P
-
 
F
-
x
T
L
 
L
L
x
A
G
 
G
A
 
E
R
 
R
V
 
V
T
 
C
I
 
V
L
 
V
G
|
G
G
x
L
G
|
G
E
x
T
I
x
L
T
 
G
R
 
R
T
 
G
L
 
V
V
 
V
R
 
D
L
 
R
L
 
A
L
 
A
P
 
A
F
 
L
G
 
G
C
 
M
Y
 
E
L
 
V
T
 
V
V
 
G
V
 
V
R
|
R
R
|
R
H
x
S
A
 
G
D
 
D
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
N
V
 
V
A
 
S
E
 
T
V
 
V
L
 
Y
A
 
T
S
 
P
D
 
D
R
 
R
L
 
L
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
A
T
 
D
T
 
A
D
 
R
V
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
T
A
x
P
L
 
L
T
 
T
P
 
D
E
 
E
T
|
T
E
 
E
H
 
G
I
 
M
V
 
V
D
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
E
I
x
F
A
x
E
A
 
T
L
x
M
P
 
R
D
 
E
H
 
D
A
 
A
V
 
S
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
P
H
 
V
I
 
V
D
 
V
T
 
E
D
 
S
A
 
D
L
 
L
T
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
x
D
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
 
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
T
 
D
A
 
F
H
 
E
N
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
S
N
 
A
T
 
A
P
 
T
E
 
S
M
 
K
G
x
Y
R
 
H
V
 
E
L
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
L
V
 
I
A
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
E
R
 
K
F
 
I
G
 
A
R
 
T
G
 
G
D
 
D
P
 
E
L
 
L
L
 
T
G
 
N
P
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
33% identity, 82% coverage: 50:297/303 of query aligns to 59:310/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
V
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
L
P
 
P
H
 
K
V
 
L
C
 
E
W
 
I
V
 
V
Q
 
S
L
 
S
P
 
F
W
 
S
A
x
V
G
 
G
I
 
L
E
 
D
P
 
K
Y
 
V
R
 
D
D
 
L
V
 
I
L
 
K
D
 
C
D
 
E
D
 
E
R
 
K
-
 
G
-
 
V
R
 
R
W
 
V
T
 
T
C
 
N
G
 
T
K
 
P
G
 
D
V
 
V
Y
x
L
A
 
T
E
 
D
P
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
H
 
L
V
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
I
L
 
L
G
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
R
S
 
R
V
 
I
G
 
C
H
 
E
-
 
C
-
 
D
-
 
K
Y
 
Y
S
 
V
R
 
R
Q
 
R
Q
 
G
S
 
A
W
 
W
T
 
K
G
 
F
P
 
G
R
 
D
G
 
F
R
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
T
N
 
K
L
 
F
L
 
S
G
 
G
A
 
K
R
 
R
V
 
V
T
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
G
x
L
G
|
G
E
x
R
I
|
I
T
 
G
R
 
L
T
 
A
L
 
V
V
 
A
R
 
E
L
 
R
L
 
A
L
 
E
P
 
A
F
 
F
G
 
D
C
 
C
Y
 
P
L
 
I
T
 
S
V
 
Y
V
 
F
R
x
S
R
|
R
H
x
S
A
 
K
D
 
K
P
 
P
I
 
N
D
 
T
G
 
N
V
 
Y
A
 
T
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
Y
S
 
Y
D
 
G
R
 
S
L
 
V
H
 
V
E
 
E
A
 
L
L
 
A
P
 
S
T
 
N
T
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
A
L
x
C
A
x
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
E
T
|
T
E
 
T
H
 
H
I
 
I
V
 
I
D
 
N
A
 
R
A
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
G
D
 
P
H
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
x
G
R
|
R
G
 
G
R
 
P
H
 
H
I
 
V
D
 
D
T
 
E
D
 
P
A
 
E
L
 
L
T
 
V
T
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
R
E
|
E
P
 
P
-
 
E
L
 
V
P
 
P
D
 
E
D
 
K
H
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
F
T
 
G
A
 
L
H
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
|
G
N
 
S
T
 
G
P
 
T
E
 
V
M
 
E
G
 
T
R
 
R
V
 
K
L
 
V
L
 
M
A
 
A
A
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
V
E
 
G
N
 
N
V
 
L
A
 
E
R
 
A
F
 
H
G
 
F
R
 
S
G
 
G
D
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
T
P
 
P
V
 
V

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
33% identity, 82% coverage: 50:297/303 of query aligns to 61:312/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
V
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
L
P
 
P
H
 
K
V
 
L
C
 
E
W
 
I
V
 
V
Q
 
S
L
 
S
P
 
F
W
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
E
 
D
P
 
K
Y
 
V
R
 
D
D
 
L
V
 
I
L
 
K
D
 
C
D
 
E
D
 
E
R
 
K
-
 
G
-
 
V
R
 
R
W
 
V
T
 
T
C
 
N
G
 
T
K
 
P
G
 
D
V
 
V
Y
 
L
A
 
T
E
 
D
P
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
H
 
L
V
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
I
L
 
L
G
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
R
S
 
R
V
 
I
G
 
C
H
 
E
-
 
C
-
 
D
-
 
K
Y
 
Y
S
 
V
R
 
R
Q
 
R
Q
 
G
S
 
A
W
 
W
T
 
K
G
 
F
P
 
G
R
 
D
G
 
F
R
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
T
N
 
K
L
 
F
L
 
S
G
 
G
A
 
K
R
 
R
V
 
V
T
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
G
x
L
G
|
G
E
x
R
I
|
I
T
 
G
R
 
L
T
 
A
L
 
V
V
 
A
R
 
E
L
 
R
L
 
A
L
 
E
P
 
A
F
 
F
G
 
D
C
 
C
Y
 
P
L
 
I
T
 
S
V
 
Y
V
 
F
R
x
S
R
|
R
H
x
S
A
 
K
D
 
K
P
 
P
I
 
N
D
 
T
G
 
N
V
 
Y
A
 
T
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
Y
S
 
Y
D
 
G
R
 
S
L
 
V
H
 
V
E
 
E
A
 
L
L
 
A
P
 
S
T
 
N
T
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
A
L
 
C
A
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
T
H
 
H
I
 
I
V
 
I
D
 
N
A
 
R
A
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
G
D
 
P
H
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
G
R
 
R
G
 
G
R
 
P
H
 
H
I
 
V
D
 
D
T
 
E
D
 
P
A
 
E
L
 
L
T
 
V
T
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
R
E
 
E
P
 
P
-
 
E
L
 
V
P
 
P
D
 
E
D
 
K
H
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
F
T
 
G
A
 
L
H
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
L
P
 
P
H
 
H
V
 
V
G
 
G
N
 
S
T
 
G
P
 
T
E
 
V
M
 
E
G
 
T
R
 
R
V
 
K
L
 
V
L
 
M
A
 
A
A
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
V
E
 
G
N
 
N
V
 
L
A
 
E
R
 
A
F
 
H
G
 
F
R
 
S
G
 
G
D
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
T
P
 
P
V
 
V

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
33% identity, 68% coverage: 86:291/303 of query aligns to 99:315/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
V
 
V
Y
x
L
A
 
T
E
 
N
P
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
H
V
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
L
T
 
L
L
 
L
G
 
A
L
 
T
L
 
A
R
 
R
S
 
H
V
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
R
-
 
S
G
 
G
H
 
E
Y
 
W
S
 
K
R
 
R
Q
 
K
Q
 
G
S
 
I
W
 
A
T
 
W
G
 
H
P
 
P
R
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
G
 
G
R
 
Y
N
 
E
L
 
L
L
 
Y
G
 
G
A
 
K
R
 
T
V
 
I
T
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
G
x
F
G
|
G
E
x
R
I
|
I
T
 
G
R
 
Q
T
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
R
L
 
R
L
 
A
L
 
K
P
 
G
F
 
F
G
 
N
C
 
M
Y
 
R
L
 
I
T
 
L
V
 
Y
V
 
Y
R
x
S
R
|
R
H
 
T
A
 
R
D
 
K
P
 
S
I
 
-
D
 
Q
G
 
A
V
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
G
A
 
A
S
 
E
D
 
Y
R
 
R
-
 
P
L
 
L
H
 
E
E
 
E
A
 
V
L
 
L
P
 
K
T
 
E
T
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
V
 
I
L
 
L
A
|
A
L
x
V
A
x
P
L
 
L
T
 
T
P
 
K
E
 
E
T
|
T
E
 
M
H
 
Y
I
 
M
V
 
I
D
 
N
A
 
E
A
 
E
A
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
L
L
 
M
P
 
K
D
 
P
H
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
K
H
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
D
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
I
T
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
D
 
N
D
 
E
H
 
E
P
 
-
L
 
L
W
 
F
T
 
S
A
 
L
H
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
N
 
S
T
 
A
P
 
T
E
 
F
M
 
E
G
 
A
R
 
R
V
 
E
L
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
E
R
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
R
N
 
N
V
 
L
A
 
I
R
 
A
F
 
F
G
 
K
R
 
R
G
 
G
D
 
E

Sites not aligning to the query:

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
35% identity, 57% coverage: 120:293/303 of query aligns to 148:322/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
G
 
G
R
 
Y
N
 
G
L
 
L
L
 
T
G
 
Q
A
 
S
R
 
T
V
 
V
T
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
L
G
|
G
E
x
R
I
|
I
T
 
G
R
 
Q
T
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
R
L
 
R
L
 
L
L
 
K
P
 
P
F
 
F
G
 
G
C
 
V
-
 
Q
-
 
R
Y
 
F
L
 
L
T
 
Y
V
 
T
V
 
G
R
|
R
-
x
Q
-
x
P
R
|
R
H
 
P
A
 
E
D
 
E
P
 
A
I
 
A
D
 
E
G
 
F
V
 
Q
A
 
A
E
 
E
V
 
F
L
 
V
A
 
S
S
 
T
D
 
P
R
 
E
L
 
L
H
 
A
E
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
A
T
 
Q
T
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
A
L
 
C
A
x
S
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
A
T
 
T
E
 
E
H
 
G
I
 
L
V
 
C
D
 
N
A
 
K
A
 
D
A
 
F
I
 
F
A
 
Q
A
 
K
L
 
M
P
 
K
D
 
E
H
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
R
 
D
H
 
V
I
 
V
D
 
N
T
 
Q
D
 
D
A
 
D
L
 
L
T
 
Y
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
E
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
T
D
 
N
H
 
H
P
 
P
L
 
L
W
 
L
T
 
T
A
 
L
H
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
I
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
x
I
G
|
G
N
x
S
T
 
A
P
 
T
E
 
H
M
 
R
G
 
T
R
 
R
V
 
N
L
 
T
L
 
M
A
 
S
A
 
L
R
 
L
V
 
A
A
 
A
E
 
N
N
 
N
V
 
L
A
 
L
R
 
A
F
 
G
G
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
E
P
 
P
L
 
M

Sites not aligning to the query:

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
35% identity, 57% coverage: 120:293/303 of query aligns to 144:318/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
G
 
G
R
 
Y
N
 
G
L
 
L
L
 
T
G
 
Q
A
 
S
R
 
T
V
 
V
T
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
G
 
L
G
|
G
E
 
R
I
|
I
T
 
G
R
 
Q
T
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
R
L
 
R
L
 
L
L
 
K
P
 
P
F
 
F
G
 
G
C
 
V
-
 
Q
-
 
R
Y
 
F
L
 
L
T
 
Y
V
 
T
V
x
G
R
|
R
-
 
Q
-
 
P
R
|
R
H
 
P
A
 
E
D
 
E
P
 
A
I
 
A
D
 
E
G
 
F
V
 
Q
A
 
A
E
 
E
V
 
F
L
 
V
A
 
S
S
 
T
D
 
P
R
 
E
L
 
L
H
 
A
E
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
A
T
 
Q
T
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
A
L
x
C
A
x
S
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
A
T
|
T
E
 
E
H
 
G
I
 
L
V
 
C
D
 
N
A
 
K
A
 
D
A
 
F
I
 
F
A
 
Q
A
 
K
L
 
M
P
 
K
D
 
E
H
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
R
 
D
H
 
V
I
 
V
D
 
N
T
 
Q
D
 
D
A
 
D
L
 
L
T
 
Y
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
E
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
T
D
 
N
H
 
H
P
 
P
L
 
L
W
 
L
T
 
T
A
 
L
H
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
I
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
N
 
S
T
 
A
P
 
T
E
 
H
M
 
R
G
 
T
R
 
R
V
 
N
L
 
T
L
 
M
A
 
S
A
 
L
R
 
L
V
 
A
A
 
A
E
 
N
N
 
N
V
 
L
A
 
L
R
 
A
F
 
G
G
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
E
P
 
P
L
 
M

Sites not aligning to the query:

8oq2A Binding of NADP to a formate dehydrogenase from starkeya novella.
32% identity, 72% coverage: 77:293/303 of query aligns to 135:362/381 of 8oq2A

query
sites
8oq2A
D
 
D
R
 
R
R
 
G
W
 
I
T
 
T
C
 
V
G
 
A
K
 
E
G
 
V
V
 
T
Y
 
Y
A
 
C
E
x
N
P
 
S
-
 
I
-
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
L
 
V
A
 
M
L
 
M
T
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
N
V
 
Y
-
 
I
-
 
P
G
 
S
H
 
H
-
 
D
Y
 
W
S
 
A
R
 
R
Q
 
K
Q
 
G
S
 
G
W
 
W
T
 
N
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
C
G
 
V
P
 
E
R
 
H
G
 
S
R
 
Y
N
 
D
L
 
L
L
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
T
V
 
V
T
 
G
I
 
S
L
 
V
G
 
G
G
 
A
G
|
G
E
x
R
I
|
I
T
 
G
R
 
L
T
 
A
L
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
L
L
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
V
Y
 
K
L
 
L
T
 
H
V
 
Y
V
 
T
R
x
Q
R
|
R
H
|
H
A
 
R
D
 
L
P
 
P
-
 
E
-
 
A
I
 
V
D
 
E
G
 
K
V
 
E
A
 
L
E
 
G
V
 
L
L
 
V
A
 
W
S
 
H
D
 
D
R
 
T
L
 
R
H
 
E
E
 
D
A
 
M
L
 
Y
P
 
P
T
 
H
T
 
C
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
N
L
x
V
A
x
P
L
 
L
T
x
H
P
 
P
E
 
E
T
|
T
E
 
E
H
 
H
I
 
M
V
 
I
D
 
N
A
 
D
A
 
E
A
 
T
I
 
L
A
 
K
A
 
L
L
 
F
P
 
K
D
 
R
H
 
G
A
 
A
V
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
K
H
 
L
I
 
A
D
 
D
T
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
I
T
 
V
T
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
W
D
 
F
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
K
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
T
 
T
A
 
M
H
 
K
N
 
W
V
 
E
V
 
G
I
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
x
S
N
x
G
T
 
T
P
 
S
E
 
L
M
 
S
G
 
A
R
 
Q
V
 
A
L
 
R
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
G
V
 
T
A
 
R
E
 
E
N
 
I
V
 
L
A
 
E
R
 
C
F
 
F
G
 
F
R
 
E
G
 
G
D
 
R
P
 
P
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
36% identity, 57% coverage: 120:291/303 of query aligns to 144:314/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
G
 
G
R
 
Y
N
 
D
L
 
V
L
 
Y
G
 
G
A
 
K
R
 
T
V
 
I
T
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
G
x
F
G
|
G
E
x
R
I
|
I
T
 
G
R
 
Q
T
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
K
L
 
R
L
 
A
L
 
K
P
 
G
F
 
F
G
 
G
C
 
M
Y
 
R
L
 
I
T
 
L
V
 
Y
V
 
T
R
x
A
R
|
R
H
x
S
A
 
R
D
x
K
P
 
P
I
 
-
D
 
E
G
 
A
V
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
G
A
 
A
S
 
E
D
 
F
R
 
K
-
 
P
L
 
L
H
 
E
E
 
E
A
 
L
L
 
L
P
 
R
T
 
E
T
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
x
V
A
x
P
L
 
L
T
 
T
P
 
K
E
|
E
T
|
T
E
 
Y
H
 
H
I
 
M
V
 
I
D
 
N
A
 
E
A
 
E
A
 
R
I
 
L
A
 
R
A
 
L
L
 
M
P
 
K
D
 
P
H
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
K
H
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
D
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
I
T
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
D
 
D
D
 
E
H
 
E
P
 
-
L
 
L
W
 
F
T
 
A
A
 
L
H
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
N
 
S
T
 
A
P
 
T
E
 
F
M
 
G
G
 
A
R
 
R
V
 
E
L
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
R
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
I
R
 
A
F
 
F
G
 
K
R
 
N
G
 
G
D
 
E

Sites not aligning to the query:

3wr5A Structural basis on the efficient co2 reduction of acidophilic formate dehydrogenase
32% identity, 72% coverage: 77:293/303 of query aligns to 139:366/401 of 3wr5A

query
sites
3wr5A
D
 
D
R
 
R
R
 
G
W
 
I
T
 
T
C
 
V
G
 
A
K
 
E
G
 
V
V
 
T
Y
 
Y
A
 
C
E
x
N
P
 
S
-
 
I
-
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
L
 
V
A
 
M
L
 
M
T
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
N
V
 
Y
-
 
I
-
 
P
G
 
S
H
 
H
-
 
D
Y
 
W
S
 
A
R
 
R
Q
 
K
Q
 
G
S
 
G
W
 
W
T
 
N
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
C
G
 
V
P
 
E
R
 
H
G
 
S
R
 
Y
N
 
D
L
 
L
L
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
T
V
 
V
T
 
G
I
 
S
L
 
V
G
x
A
G
 
A
G
|
G
E
x
R
I
|
I
T
 
G
R
 
L
T
 
A
L
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
L
L
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
V
Y
 
K
L
 
L
T
 
H
V
 
Y
V
 
T
R
x
D
R
|
R
H
 
H
A
 
R
D
 
L
P
 
P
-
 
E
-
 
A
I
 
V
D
 
E
G
 
K
V
 
E
A
 
L
E
 
G
V
 
L
L
 
V
A
 
W
S
 
H
D
 
D
R
 
T
L
 
R
H
 
E
E
 
D
A
 
M
L
 
Y
P
 
P
T
 
H
T
 
C
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
N
L
x
V
A
x
P
L
 
L
T
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
E
H
 
H
I
 
M
V
 
I
D
 
N
A
 
D
A
 
E
A
 
T
I
 
L
A
 
K
A
 
L
L
 
F
P
 
K
D
 
R
H
 
G
A
 
A
V
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
K
H
 
L
I
 
A
D
 
D
T
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
I
T
 
V
T
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
W
D
 
F
P
 
P
E
x
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
K
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
T
 
T
A
 
M
H
 
K
N
 
W
V
 
E
V
 
G
I
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
x
S
N
x
G
T
 
T
P
 
S
E
 
L
M
 
S
G
 
A
R
 
Q
V
 
A
L
 
R
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
G
V
 
T
A
 
R
E
 
E
N
 
I
V
 
L
A
 
E
R
 
C
F
 
F
G
 
F
R
 
E
G
 
G
D
 
R
P
 
P
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2gsdA NAD-dependent formate dehydrogenase from bacterium moraxella sp.C2 in complex with NAD and azide (see paper)
32% identity, 68% coverage: 88:293/303 of query aligns to 147:361/399 of 2gsdA

query
sites
2gsdA
A
 
S
E
 
N
P
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
L
 
V
A
 
M
L
 
M
T
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
N
V
 
Y
-
 
I
-
 
P
G
 
S
H
 
H
-
 
D
Y
 
W
S
 
A
R
 
R
Q
 
N
Q
 
G
S
 
G
W
 
W
T
 
N
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
C
G
 
V
P
 
A
R
 
R
G
 
S
R
 
Y
N
 
D
L
 
V
L
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
H
V
 
V
T
 
G
I
 
T
L
 
V
G
x
A
G
 
A
G
|
G
E
x
R
I
|
I
T
 
G
R
 
L
T
 
R
L
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
M
Y
 
H
L
 
L
T
 
H
V
 
Y
V
 
T
R
x
D
R
|
R
H
 
H
A
 
R
D
 
L
P
 
P
-
 
E
-
 
A
I
 
V
D
 
E
G
 
K
V
 
E
A
 
L
E
 
N
V
 
L
L
 
T
A
 
W
S
 
H
D
 
A
R
 
T
L
 
R
H
 
E
E
 
D
A
 
M
L
 
Y
P
 
G
T
 
A
T
 
C
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
N
L
 
C
A
x
P
L
 
L
T
x
H
P
 
P
E
 
E
T
|
T
E
 
E
H
 
H
I
 
M
V
 
I
D
 
N
A
 
D
A
 
E
A
 
T
I
 
L
A
 
K
A
 
L
L
 
F
P
 
K
D
 
R
H
 
G
A
 
A
V
 
Y
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
K
H
 
L
I
 
C
D
 
D
T
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
I
T
 
V
T
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
W
D
 
F
P
 
P
E
x
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
N
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
T
 
T
A
 
M
H
 
P
N
 
H
V
 
N
V
 
G
I
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
x
S
N
x
G
T
 
T
P
 
S
E
 
L
M
 
S
G
 
A
R
 
Q
V
 
T
L
 
R
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
G
V
 
T
A
 
R
E
 
E
N
 
I
V
 
L
A
 
E
R
 
C
F
 
Y
G
 
F
R
 
E
G
 
G
D
 
R
P
 
P
L
 
I

Sites not aligning to the query:

4zqbB Crystal structure of NADP-dependent dehydrogenase from rhodobactersphaeroides in complex with NADP and sulfate
32% identity, 90% coverage: 31:303/303 of query aligns to 46:316/316 of 4zqbB

query
sites
4zqbB
G
 
A
E
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
A
V
 
I
W
 
V
V
 
A
D
 
N
P
 
P
D
 
D
D
 
P
P
 
A
E
 
D
G
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
L
D
 
A
A
 
E
N
 
L
P
 
P
H
 
N
V
 
L
C
 
V
W
 
W
V
 
I
Q
 
H
L
 
S
P
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
E
P
 
-
Y
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
R
 
R
W
 
L
T
 
V
C
 
A
G
 
E
K
 
L
G
 
G
V
 
H
Y
 
L
A
 
A
E
 
R
P
 
P
V
 
I
-
 
V
-
x
R
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
x
L
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
x
M
A
 
A
E
 
E
H
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
W
T
 
T
L
 
Y
G
 
Y
L
 
L
L
 
F
R
 
R
S
 
D
V
 
M
G
 
P
H
 
A
Y
 
Y
S
 
A
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
S
 
R
-
 
A
-
 
R
-
 
V
W
 
W
T
 
K
G
 
G
P
 
L
R
 
P
G
 
Y
R
 
K
N
 
R
L
 
P
L
 
E
G
 
R
A
 
T
R
 
T
V
 
V
T
 
G
I
 
V
L
 
L
G
|
G
G
x
L
G
|
G
E
|
E
I
x
L
T
 
G
R
 
A
T
 
A
L
 
A
V
 
A
R
 
L
L
 
R
L
 
L
L
 
R
P
 
D
F
 
A
G
 
G
C
 
F
Y
 
D
L
 
V
T
 
H
V
 
G
V
x
W
R
x
S
R
|
R
H
x
S
A
 
P
D
x
K
P
 
E
I
 
I
D
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
T
E
 
C
V
 
H
L
 
A
A
 
G
S
 
E
D
 
E
R
 
T
L
 
L
H
 
E
E
 
R
A
 
M
L
 
L
P
 
G
T
 
Q
T
 
V
D
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
C
A
 
L
L
|
L
A
x
P
L
 
L
T
 
T
P
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
R
H
 
G
I
 
L
V
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
C
L
 
L
P
 
P
D
 
E
H
 
G
A
 
A
V
 
Q
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
F
A
 
A
R
|
R
G
 
G
R
 
P
H
 
I
I
 
L
D
 
D
T
 
S
D
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
I
T
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
G
 
H
A
 
A
G
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
A
H
 
S
P
 
P
L
 
F
W
 
W
T
 
G
A
 
H
H
 
P
N
 
K
V
 
V
V
 
T
I
 
V
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
I
-
x
S
-
x
A
G
 
A
N
 
T
T
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
T
G
 
A
R
 
S
V
 
A
L
 
I
L
 
V
A
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
A
 
A
E
 
D
N
 
Y
V
 
R
A
 
A
R
 
T
F
 
-
G
 
G
R
 
R
G
 
I
D
 
P
P
 
P
L
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
T
L
 
R
G
 
G
Y
|
Y

2nadA High resolution structures of holo and apo formate dehydrogenase (see paper)
31% identity, 72% coverage: 77:293/303 of query aligns to 134:361/391 of 2nadA

query
sites
2nadA
D
 
D
R
 
R
R
 
N
W
 
V
T
 
T
C
 
V
G
 
A
K
 
E
G
 
V
V
 
T
Y
 
Y
A
 
C
E
x
N
P
 
S
-
 
I
-
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
L
 
V
A
 
M
L
 
M
T
 
I
L
 
L
G
 
S
L
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
N
V
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
S
G
 
H
H
 
E
Y
 
W
S
 
A
R
 
R
Q
 
K
Q
 
G
S
 
G
W
 
W
T
 
N
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
C
G
 
V
P
 
S
R
 
H
G
 
A
R
 
Y
N
 
D
L
 
L
L
 
E
G
 
A
A
 
M
R
 
H
V
 
V
T
 
G
I
 
T
L
 
V
G
x
A
G
 
A
G
|
G
E
x
R
I
|
I
T
 
G
R
 
L
T
 
A
L
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
L
L
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
H
V
 
Y
V
 
T
R
x
D
R
 
R
H
 
H
A
 
R
D
 
L
P
 
P
-
 
E
-
 
S
I
 
V
D
 
E
G
 
K
V
 
E
A
 
L
E
 
N
V
 
L
L
 
T
A
 
W
S
 
H
D
 
A
R
 
T
L
 
R
H
 
E
E
 
D
A
 
M
L
 
Y
P
 
P
T
 
V
T
 
C
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
N
L
 
C
A
x
P
L
 
L
T
 
H
P
 
P
E
|
E
T
|
T
E
 
E
H
 
H
I
 
M
V
 
I
D
 
N
A
 
D
A
 
E
A
 
T
I
 
L
A
 
K
A
 
L
L
 
F
P
 
K
D
 
R
H
 
G
A
 
A
V
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
K
H
 
L
I
 
C
D
 
D
T
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
W
D
 
F
P
 
P
E
x
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
K
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
T
 
T
A
 
M
H
 
P
N
 
Y
V
 
N
V
 
G
I
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
x
S
N
x
G
T
 
T
P
 
T
E
 
L
M
 
T
G
 
A
R
 
Q
V
 
A
L
 
R
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
G
V
 
T
A
 
R
E
 
E
N
 
I
V
 
L
A
 
E
R
 
C
F
 
F
G
 
F
R
 
E
G
 
G
D
 
R
P
 
P
L
 
I

Sites not aligning to the query:

P33160 Formate dehydrogenase; FDH; NAD-dependent formate dehydrogenase; EC 1.17.1.9 from Pseudomonas sp. (strain 101) (Achromobacter parvulus T1) (see 3 papers)
31% identity, 72% coverage: 77:293/303 of query aligns to 135:362/401 of P33160

query
sites
P33160
D
 
D
R
 
R
R
 
N
W
 
V
T
 
T
C
 
V
G
 
A
K
 
E
G
 
V
V
 
T
Y
 
Y
A
 
C
E
x
N
P
x
S
-
 
I
-
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
L
 
V
A
 
M
L
 
M
T
 
I
L
 
L
G
 
S
L
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
N
V
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
S
G
 
H
H
 
E
Y
 
W
S
 
A
R
 
R
Q
 
K
Q
 
G
S
 
G
W
 
W
T
 
N
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
C
G
 
V
P
 
S
R
 
H
G
 
A
R
 
Y
N
 
D
L
 
L
L
 
E
G
 
A
A
 
M
R
 
H
V
 
V
T
 
G
I
 
T
L
 
V
G
 
A
G
 
A
G
 
G
E
x
R
I
|
I
T
 
G
R
 
L
T
 
A
L
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
L
L
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
H
V
 
Y
V
 
T
R
x
D
R
 
R
H
 
H
A
 
R
D
 
L
P
 
P
-
 
E
-
 
S
I
 
V
D
 
E
G
 
K
V
 
E
A
 
L
E
 
N
V
 
L
L
 
T
A
 
W
S
 
H
D
 
A
R
 
T
L
 
R
H
 
E
E
 
D
A
 
M
L
 
Y
P
 
P
T
 
V
T
 
C
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
N
L
x
C
A
x
P
L
|
L
T
x
H
P
|
P
E
|
E
T
 
T
E
 
E
H
 
H
I
 
M
V
 
I
D
 
N
A
 
D
A
 
E
A
 
T
I
 
L
A
 
K
A
 
L
L
 
F
P
 
K
D
 
R
H
 
G
A
 
A
V
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
H
 
L
I
 
C
D
 
D
T
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
W
D
 
F
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
K
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
T
 
T
A
 
M
H
 
P
N
 
Y
V
 
N
V
 
G
I
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
x
I
G
x
S
N
x
G
T
 
T
P
 
T
E
 
L
M
 
T
G
 
A
R
 
Q
V
 
A
L
 
R
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
G
V
 
T
A
 
R
E
 
E
N
 
I
V
 
L
A
 
E
R
 
C
F
 
F
G
 
F
R
 
E
G
 
G
D
 
R
P
 
P
L
 
I

Sites not aligning to the query:

5vg6B Crystal structure of d-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase from xanthobacter autotrophicus py2 in complex with NADPH and mes.
31% identity, 86% coverage: 43:303/303 of query aligns to 43:315/315 of 5vg6B

query
sites
5vg6B
D
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
E
L
 
V
R
 
R
S
 
Y
V
 
A
L
 
L
D
 
V
A
 
W
N
 
K
P
 
P
-
 
P
H
 
H
V
 
G
C
 
F
W
 
F
V
 
A
Q
 
R
L
 
F
P
 
P
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
L
W
 
G
A
|
A
G
 
G
I
 
V
E
 
D
P
 
A
Y
 
L
-
 
V
-
 
A
R
 
R
D
 
D
V
 
D
L
 
L
D
 
P
D
 
D
D
 
V
R
 
P
R
 
V
W
 
T
T
x
R
C
 
L
G
 
S
K
 
D
G
 
P
V
 
N
Y
x
M
A
 
S
E
 
Q
P
 
M
V
x
M
A
 
A
E
 
S
H
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
F
L
 
C
T
 
V
L
 
L
G
 
R
L
 
H
L
 
A
R
 
R
S
 
D
V
 
I
G
 
P
H
 
T
Y
 
F
S
 
E
R
 
R
Q
 
A
Q
 
Q
S
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
R
W
 
W
T
 
H
G
 
Y
P
 
V
R
 
H
G
 
P
R
 
R
N
 
T
L
 
A
L
 
A
G
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
G
I
 
V
L
 
L
G
 
G
G
x
L
G
|
G
E
x
D
I
x
L
T
 
G
R
 
A
T
 
A
L
 
A
V
 
A
R
 
L
L
 
E
L
 
L
L
 
A
P
 
R
F
 
H
G
 
G
C
 
F
Y
 
D
L
 
V
T
 
R
V
 
G
V
x
W
R
x
S
R
|
R
H
x
T
A
 
P
D
x
K
P
 
A
I
 
L
D
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
S
E
 
C
V
 
F
L
 
H
A
 
G
S
 
L
D
 
E
R
 
A
L
 
L
H
 
P
E
 
G
A
 
F
L
 
L
P
 
A
T
 
G
T
 
S
D
 
E
V
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
M
L
|
L
A
x
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
E
T
|
T
E
 
R
H
 
G
I
 
L
V
 
M
D
 
N
A
 
A
A
 
E
A
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
H
L
 
L
P
 
P
D
 
R
H
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
F
V
 
I
N
 
N
V
|
V
A
 
A
R
|
R
G
 
G
R
 
P
H
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
E
 
S
G
 
G
R
 
H
L
 
I
G
 
A
G
 
E
A
 
A
G
 
T
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
V
D
 
G
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
T
 
A
A
 
M
H
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
x
A
N
x
S
-
 
I
-
 
A
T
 
I
P
 
P
E
 
R
M
 
T
G
 
A
R
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
P
R
 
Q
V
 
I
A
 
V
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
R
R
 
R
F
 
I
G
 
E
R
 
A
G
 
G
D
 
E
P
 
P
L
 
V
L
 
L
G
 
N
P
 
Q
V
 
V
D
 
D
V
 
P
D
 
R
L
 
R
G
 
G
Y
|
Y

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
40% identity, 39% coverage: 173:291/303 of query aligns to 198:315/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
L
 
L
H
 
E
E
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
R
T
 
E
T
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
|
A
L
x
V
A
x
P
L
 
L
T
 
T
P
 
R
E
 
E
T
|
T
E
 
Y
H
 
H
I
 
L
V
 
I
D
 
N
A
 
E
A
 
E
A
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
L
L
 
M
P
 
K
D
 
K
H
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
K
H
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
V
T
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
D
 
N
D
 
E
H
 
E
P
 
-
L
 
L
W
 
F
T
 
K
A
 
L
H
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
N
 
S
T
 
A
P
 
S
E
 
F
M
 
G
G
 
A
R
 
R
V
 
E
L
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
R
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
I
R
 
A
F
 
F
G
 
K
R
 
R
G
 
G
D
 
E

Sites not aligning to the query:

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
40% identity, 39% coverage: 173:291/303 of query aligns to 198:315/334 of O58320

query
sites
O58320
L
 
L
H
 
E
E
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
R
T
 
E
T
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
R
E
 
E
T
 
T
E
 
Y
H
 
H
I
 
L
V
 
I
D
 
N
A
 
E
A
 
E
A
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
L
L
 
M
P
 
K
D
 
K
H
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
K
H
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
V
T
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
D
 
N
D
 
E
H
 
E
P
 
-
L
 
L
W
 
F
T
 
K
A
 
L
H
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
x
I
G
|
G
N
 
S
T
 
A
P
 
S
E
 
F
M
 
G
G
 
A
R
 
R
V
 
E
L
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
R
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
I
R
 
A
F
 
F
G
 
K
R
 
R
G
 
G
D
 
E

Sites not aligning to the query:

7jqhA Structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with phosphate and NADP+
30% identity, 71% coverage: 89:303/303 of query aligns to 98:313/313 of 7jqhA

query
sites
7jqhA
E
 
E
P
 
Q
V
x
M
A
 
Q
E
 
E
H
 
Y
V
 
A
L
 
V
A
 
S
L
 
Q
T
 
V
L
 
L
G
 
H
L
 
W
L
 
F
R
 
R
S
 
R
V
 
F
G
 
D
H
 
D
Y
 
Y
S
 
R
R
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
S
 
N
-
 
S
-
 
S
-
 
H
W
 
W
T
 
Q
G
 
P
P
 
L
R
 
P
G
 
E
R
 
Y
N
 
H
L
 
R
L
 
E
G
 
D
A
 
F
R
 
T
V
 
I
T
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
-
x
A
-
x
G
-
x
V
-
x
L
G
 
G
G
 
S
E
 
K
I
 
V
T
 
A
R
 
Q
T
 
S
L
 
L
V
 
Q
R
 
T
L
 
W
L
 
R
L
 
F
P
 
P
F
 
L
G
 
R
C
 
C
Y
x
W
L
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
R
x
S
R
|
R
H
x
T
A
 
R
D
x
K
P
 
S
I
 
W
D
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
E
 
S
V
 
F
L
 
A
A
 
G
S
 
R
D
 
E
R
 
E
L
 
L
H
 
S
E
 
A
A
 
F
L
 
L
P
 
S
T
 
Q
T
 
C
D
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
N
A
 
L
L
|
L
A
x
P
L
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
V
H
 
G
I
 
I
V
 
I
D
 
N
A
 
Q
A
 
Q
A
 
L
I
 
L
A
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
G
A
 
A
V
 
Y
V
 
L
V
 
L
N
 
N
V
x
L
A
|
A
R
|
R
G
 
G
R
 
V
H
 
H
I
 
V
D
 
V
T
 
E
D
 
D
A
 
D
L
 
L
T
 
L
T
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
V
G
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
N
P
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
P
D
 
E
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
T
 
Q
A
 
H
H
 
P
N
 
R
V
 
V
V
 
T
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
 
A
N
x
A
T
 
I
P
 
T
E
 
R
M
 
P
G
 
A
R
 
E
V
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
-
A
 
E
R
 
Y
V
 
I
A
 
S
E
 
R
N
 
T
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
E
R
 
K
G
 
G
D
 
E
P
 
K
L
 
V
L
 
C
G
 
G
P
 
Q
V
 
V
D
 
D
V
 
R
D
 
A
L
 
R
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_052666358.1 NCBI__GCF_000969705.1:WP_052666358.1
MRPRCVVLPTGRAPALEEAVGRGGGDLVDVGEADALVWVDPDDPEGLRSVLDANPHVCWV
QLPWAGIEPYRDVLDDDRRWTCGKGVYAEPVAEHVLALTLGLLRSVGHYSRQQSWTGPRG
RNLLGARVTILGGGEITRTLVRLLLPFGCYLTVVRRHADPIDGVAEVLASDRLHEALPTT
DVLVLALALTPETEHIVDAAAIAALPDHAVVVNVARGRHIDTDALTTALQEGRLGGAGLD
VTDPEPLPDDHPLWTAHNVVITPHVGNTPEMGRVLLAARVAENVARFGRGDPLLGPVDVD
LGY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory