SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_053545450.1 NCBI__GCF_001277995.1:WP_053545450.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
33% identity, 83% coverage: 49:300/304 of query aligns to 74:328/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
N
 
N
I
 
L
K
 
K
F
 
V
V
 
I
Q
 
S
A
 
T
S
 
M
M
 
S
A
x
V
G
|
G
I
 
I
D
 
D
A
 
H
L
 
L
V
 
A
K
 
L
R
 
D
G
 
E
V
 
I
V
 
K
N
 
K
G
 
R
Q
 
G
A
 
I
R
 
R
W
 
V
A
 
G
N
 
Y
A
 
T
A
 
P
G
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
D
 
D
T
 
T
V
 
T
A
 
A
E
 
E
S
 
L
T
 
A
I
 
V
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
T
Q
 
-
L
 
-
H
 
-
Y
 
-
H
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
T
C
 
C
R
 
R
S
 
R
K
 
L
T
 
P
W
 
E
D
 
A
V
 
I
R
 
E
S
 
E
T
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
W
V
 
T
E
 
S
Q
 
W
R
 
K
K
 
P
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
C
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
D
 
T
N
 
Q
K
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
L
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
V
 
Q
R
 
A
L
 
I
V
 
A
E
 
R
M
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
F
N
 
G
V
 
V
K
 
Q
T
 
R
-
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
T
N
 
G
N
x
R
S
x
Q
G
x
P
R
|
R
P
 
P
V
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
A
D
 
E
E
 
F
T
 
Q
F
 
A
A
 
E
M
 
F
K
 
V
D
 
S
A
 
T
D
 
P
H
 
E
V
 
L
W
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
F
F
 
I
V
 
V
L
 
V
I
 
A
L
 
C
P
x
S
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
A
T
 
T
Y
 
E
Q
 
G
I
 
L
V
 
C
N
 
N
A
 
K
E
 
D
T
 
F
L
 
F
G
 
Q
K
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
E
S
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
G
 
S
R
|
R
G
 
G
P
 
D
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
Q
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
Y
V
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
N
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
T
R
 
N
H
 
H
P
 
P
L
 
L
W
 
L
D
 
T
M
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
I
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
T
x
I
A
x
G
N
x
S
T
 
A
T
 
T
E
 
H
R
 
R
I
 
T
R
 
R
A
 
N
L
 
T
T
 
M
G
 
S
E
 
L
L
 
L
T
 
A
L
 
A
R
 
N
N
 
N
I
 
L
E
 
L
L
 
A
F
 
G
E
 
L
A
 
R
G
 
G
K
 
E
P
 
P
M
 
M
A
 
P
T
 
S
E
 
E
V
 
L
D
 
K
V
 
L

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
33% identity, 83% coverage: 49:300/304 of query aligns to 70:324/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
N
 
N
I
 
L
K
 
K
F
 
V
V
 
I
Q
 
S
A
 
T
S
 
M
M
x
S
A
x
V
G
|
G
I
 
I
D
 
D
A
 
H
L
 
L
V
 
A
K
 
L
R
 
D
G
 
E
V
 
I
V
 
K
N
 
K
G
 
R
Q
 
G
A
 
I
R
 
R
W
 
V
A
 
G
N
 
Y
A
 
T
A
 
P
G
 
D
L
 
V
Y
x
L
A
 
T
D
 
D
T
 
T
V
x
T
A
 
A
E
 
E
S
 
L
T
 
A
I
 
V
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
T
Q
 
-
L
 
-
H
 
-
Y
 
-
H
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
T
C
 
C
R
 
R
S
 
R
K
 
L
T
 
P
W
 
E
D
 
A
V
 
I
R
 
E
S
 
E
T
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
W
V
 
T
E
 
S
Q
 
W
R
 
K
K
 
P
V
 
L
W
 
W
L
 
L
H
 
C
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
D
 
T
N
 
Q
K
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
A
 
L
G
|
G
G
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
Q
R
 
A
L
 
I
V
 
A
E
 
R
M
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
F
N
 
G
V
 
V
K
 
Q
T
 
R
-
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
T
N
x
G
N
x
R
S
 
Q
G
 
P
R
|
R
P
 
P
V
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
A
D
 
E
E
 
F
T
 
Q
F
 
A
A
 
E
M
 
F
K
 
V
D
 
S
A
 
T
D
 
P
H
 
E
V
 
L
W
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
F
F
 
I
V
 
V
L
 
V
I
 
A
L
x
C
P
x
S
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
A
T
|
T
Y
 
E
Q
 
G
I
 
L
V
 
C
N
 
N
A
 
K
E
 
D
T
 
F
L
 
F
G
 
Q
K
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
E
S
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
G
 
S
R
|
R
G
 
G
P
 
D
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
Q
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
Y
V
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
N
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
T
R
 
N
H
 
H
P
 
P
L
 
L
W
 
L
D
 
T
M
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
I
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
T
 
I
A
x
G
N
 
S
T
 
A
T
 
T
E
 
H
R
 
R
I
 
T
R
 
R
A
 
N
L
 
T
T
 
M
G
 
S
E
 
L
L
 
L
T
 
A
L
 
A
R
 
N
N
 
N
I
 
L
E
 
L
L
 
A
F
 
G
E
 
L
A
 
R
G
 
G
K
 
E
P
 
P
M
 
M
A
 
P
T
 
S
E
 
E
V
 
L
D
 
K
V
 
L

Sites not aligning to the query:

5mhaB D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
33% identity, 73% coverage: 77:298/304 of query aligns to 86:307/308 of 5mhaB

query
sites
5mhaB
N
 
N
A
 
S
A
x
T
G
 
G
L
 
I
Y
x
H
A
 
G
D
 
T
T
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
S
 
T
T
 
V
I
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
M
L
 
L
A
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
R
Q
 
R
L
 
L
H
 
H
Y
 
A
H
 
Y
S
 
R
L
 
D
T
 
A
C
 
Q
R
 
H
S
 
D
K
 
H
T
 
A
W
 
W
D
 
D
V
 
L
R
 
P
S
 
R
T
 
Y
V
 
E
E
 
E
Q
 
P
R
 
F
K
 
T
V
 
L
W
 
A
L
 
-
H
 
-
D
 
-
N
 
G
K
 
E
T
 
R
V
 
V
A
 
C
I
 
V
L
 
V
G
 
G
A
x
L
G
|
G
G
x
T
I
x
L
G
 
G
V
 
R
R
 
G
L
 
V
V
 
V
E
 
D
M
 
R
L
 
A
K
 
A
P
 
A
F
 
L
N
 
G
V
 
M
K
 
E
T
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
V
N
x
R
N
x
R
S
|
S
G
 
G
R
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
D
G
 
N
A
 
V
D
 
S
E
 
T
T
 
V
F
 
Y
A
 
T
M
x
P
K
 
D
D
 
R
A
 
L
D
 
H
H
 
E
V
 
A
W
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
R
I
 
F
F
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
A
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
|
T
Y
 
E
Q
 
G
I
 
M
V
 
V
N
 
A
A
 
A
E
 
P
T
 
E
L
x
F
G
x
E
K
 
T
M
|
M
K
 
R
P
 
E
S
 
D
A
 
A
V
 
S
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
V
I
 
V
N
 
V
T
 
E
D
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
N
 
S
G
 
G
T
x
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
 
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
R
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
D
 
D
M
 
F
D
 
E
N
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
V
A
x
S
N
 
A
T
 
A
T
 
T
E
 
S
R
 
K
I
x
Y
R
 
H
A
 
E
L
 
D
T
 
V
G
 
A
E
 
A
L
 
L
T
 
I
L
 
R
R
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
E
L
 
K
F
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
D
P
 
E
M
 
L
A
 
T
T
 
N
E
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5mhaA D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
33% identity, 73% coverage: 77:298/304 of query aligns to 86:307/308 of 5mhaA

query
sites
5mhaA
N
 
N
A
 
S
A
x
T
G
 
G
L
 
I
Y
x
H
A
 
G
D
 
T
T
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
S
 
T
T
 
V
I
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
M
L
 
L
A
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
R
Q
 
R
L
 
L
H
 
H
Y
 
A
H
 
Y
S
 
R
L
 
D
T
 
A
C
 
Q
R
 
H
S
 
D
K
 
H
T
 
A
W
 
W
D
 
D
V
 
L
R
 
P
S
 
R
T
 
Y
V
 
E
E
 
E
Q
 
P
R
 
F
K
x
T
V
 
L
W
x
A
L
 
-
H
 
-
D
 
-
N
 
G
K
 
E
T
 
R
V
 
V
A
 
C
I
 
V
L
 
V
G
 
G
A
x
L
G
|
G
G
x
T
I
x
L
G
 
G
V
 
R
R
 
G
L
 
V
V
 
V
E
 
D
M
 
R
L
 
A
K
 
A
P
 
A
F
 
L
N
 
G
V
 
M
K
 
E
T
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
V
N
x
R
N
x
R
S
|
S
G
 
G
R
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
D
G
 
N
A
 
V
D
 
S
E
 
T
T
 
V
F
 
Y
A
 
T
M
x
P
K
 
D
D
 
R
A
 
L
D
 
H
H
 
E
V
 
A
W
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
R
I
 
F
F
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
A
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
|
T
Y
 
E
Q
 
G
I
 
M
V
 
V
N
 
A
A
 
A
E
 
P
T
 
E
L
 
F
G
 
E
K
 
T
M
 
M
K
 
R
P
 
E
S
 
D
A
 
A
V
 
S
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
V
I
 
V
N
 
V
T
 
E
D
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
N
 
S
G
 
G
T
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
 
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
R
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
D
 
D
M
 
F
D
 
E
N
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
V
A
x
S
N
 
A
T
 
A
T
 
T
E
 
S
R
 
K
I
x
Y
R
 
H
A
 
E
L
 
D
T
 
V
G
 
A
E
 
A
L
 
L
T
 
I
L
 
R
R
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
E
L
 
K
F
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
D
P
 
E
M
 
L
A
 
T
T
 
N
E
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5mh5A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-keto-hexanoic acid and NADP+ (1.4 a resolution)
33% identity, 73% coverage: 77:298/304 of query aligns to 86:307/308 of 5mh5A

query
sites
5mh5A
N
 
N
A
 
S
A
x
T
G
 
G
L
 
I
Y
x
H
A
 
G
D
 
T
T
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
S
 
T
T
 
V
I
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
M
L
 
L
A
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
R
Q
 
R
L
 
L
H
 
H
Y
 
A
H
 
Y
S
 
R
L
 
D
T
 
A
C
 
Q
R
 
H
S
 
D
K
 
H
T
 
A
W
 
W
D
 
D
V
 
L
R
 
P
S
 
R
T
 
Y
V
 
E
E
 
E
Q
 
P
R
 
F
K
x
T
V
 
L
W
x
A
L
 
-
H
 
-
D
 
-
N
 
G
K
 
E
T
 
R
V
 
V
A
 
C
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
x
L
G
|
G
G
x
T
I
x
L
G
 
G
V
 
R
R
 
G
L
 
V
V
 
V
E
 
D
M
 
R
L
 
A
K
 
A
P
 
A
F
 
L
N
 
G
V
 
M
K
 
E
T
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
V
N
x
R
N
x
R
S
|
S
G
 
G
R
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
D
G
 
N
A
 
V
D
 
S
E
 
T
T
 
V
F
 
Y
A
 
T
M
 
P
K
 
D
D
 
R
A
 
L
D
 
H
H
 
E
V
 
A
W
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
R
I
 
F
F
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
A
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
|
T
Y
 
E
Q
 
G
I
 
M
V
 
V
N
 
A
A
 
A
E
 
P
T
 
E
L
x
F
G
x
E
K
 
T
M
|
M
K
 
R
P
 
E
S
 
D
A
 
A
V
 
S
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
V
I
 
V
N
 
V
T
 
E
D
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
N
 
S
G
 
G
T
x
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
 
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
R
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
D
 
D
M
 
F
D
 
E
N
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
V
A
x
S
N
 
A
T
 
A
T
 
T
E
 
S
R
 
K
I
x
Y
R
 
H
A
 
E
L
 
D
T
 
V
G
 
A
E
 
A
L
 
L
T
 
I
L
 
R
R
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
E
L
 
K
F
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
D
P
 
E
M
 
L
A
 
T
T
 
N
E
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5mh6A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-ketohexanoic acid and NAD+ (1.35 a resolution)
33% identity, 73% coverage: 77:298/304 of query aligns to 84:305/306 of 5mh6A

query
sites
5mh6A
N
 
N
A
 
S
A
x
T
G
 
G
L
 
I
Y
x
H
A
 
G
D
 
T
T
 
T
V
 
V
A
 
G
E
 
E
S
 
T
T
 
V
I
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
M
L
 
L
A
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
R
Q
 
R
L
 
L
H
 
H
Y
 
A
H
 
Y
S
 
R
L
 
D
T
 
A
C
 
Q
R
 
H
S
 
D
K
 
H
T
 
A
W
 
W
D
 
D
V
 
L
R
 
P
S
 
R
T
 
Y
V
 
E
E
 
E
Q
 
P
R
 
F
K
x
T
V
 
L
W
x
A
L
 
-
H
 
-
D
 
-
N
 
G
K
 
E
T
 
R
V
 
V
A
 
C
I
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
L
G
|
G
G
x
T
I
x
L
G
 
G
V
 
R
R
 
G
L
 
V
V
 
V
E
 
D
M
 
R
L
 
A
K
 
A
P
 
A
F
 
L
N
 
G
V
 
M
K
 
E
T
 
V
I
 
V
A
 
G
A
 
V
N
 
R
N
x
R
S
 
S
G
 
G
R
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
D
G
 
N
A
 
V
D
 
S
E
 
T
T
 
V
F
 
Y
A
 
T
M
 
P
K
 
D
D
 
R
A
 
L
D
 
H
H
 
E
V
 
A
W
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
R
I
 
F
F
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
A
L
 
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
|
T
Y
 
E
Q
 
G
I
 
M
V
 
V
N
 
A
A
 
A
E
 
P
T
 
E
L
x
F
G
x
E
K
 
T
M
|
M
K
 
R
P
 
E
S
 
D
A
 
A
V
 
S
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
|
G
P
|
P
L
 
V
I
x
V
N
 
V
T
x
E
D
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
N
 
S
G
 
G
T
x
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
x
S
P
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
R
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
D
 
D
M
 
F
D
 
E
N
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
V
A
x
S
N
 
A
T
 
A
T
 
T
E
 
S
R
 
K
I
x
Y
R
 
H
A
 
E
L
 
D
T
 
V
G
 
A
E
 
A
L
 
L
T
 
I
L
 
R
R
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
E
L
 
K
F
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
D
P
 
E
M
 
L
A
 
T
T
 
N
E
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
37% identity, 62% coverage: 105:292/304 of query aligns to 125:314/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
C
 
V
R
 
R
S
 
S
K
 
G
T
 
E
W
 
W
D
 
K
V
 
R
R
 
R
S
 
G
T
 
I
V
 
A
E
 
W
Q
 
H
R
 
P
K
 
K
V
 
M
W
 
F
L
 
L
-
 
G
H
 
Y
D
 
D
-
 
V
-
 
Y
N
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
I
A
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
A
x
F
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
V
 
Q
R
 
A
L
 
I
V
 
A
E
 
K
M
 
R
L
 
A
K
 
K
P
 
G
F
 
F
N
 
G
V
 
M
K
 
R
T
 
I
I
 
L
A
 
Y
A
 
T
N
x
A
N
x
R
S
|
S
G
 
R
R
x
K
P
 
P
V
 
E
E
 
A
G
 
E
A
 
K
D
 
E
E
 
L
T
 
G
F
 
A
A
 
E
M
 
F
K
 
K
D
 
P
A
 
L
D
 
E
H
 
E
V
 
L
W
 
L
A
 
R
E
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
F
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
K
A
x
E
T
|
T
Y
 
Y
Q
 
H
I
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
T
 
R
L
 
L
G
 
R
K
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
V
I
 
V
N
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
D
 
D
R
 
E
H
 
E
P
 
-
L
 
L
W
 
F
D
 
A
M
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
A
x
G
N
 
S
T
 
A
T
 
T
E
 
F
R
 
G
I
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
G
T
 
M
G
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
A
R
 
K
N
 
N
I
 
L
E
 
I
L
 
A
F
 
F
E
 
K
A
 
N
G
 
G
K
 
E

Sites not aligning to the query:

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
30% identity, 88% coverage: 25:292/304 of query aligns to 40:315/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
V
 
L
E
 
E
D
 
K
I
 
V
K
 
K
D
 
D
A
 
V
D
 
D
F
 
A
L
 
L
F
 
V
F
 
T
N
x
M
G
x
L
S
 
S
A
 
E
P
 
R
E
 
I
F
 
D
P
 
Q
E
 
E
L
 
V
P
 
F
E
 
E
N
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
L
K
 
R
F
 
I
V
 
V
Q
 
A
A
 
N
S
x
Y
M
x
A
A
x
V
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
A
 
N
L
 
I
-
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
V
 
T
K
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
Y
N
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
W
 
V
A
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
D
L
 
V
Y
x
L
A
 
T
D
 
N
T
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
S
 
H
T
 
A
I
 
F
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
T
L
 
A
H
 
R
Y
 
H
-
 
V
-
 
V
-
 
K
H
 
G
S
 
D
L
 
K
T
 
F
C
 
V
R
 
R
S
 
S
K
 
G
T
 
E
W
 
W
D
 
K
V
 
R
R
 
K
S
 
G
T
 
I
V
 
A
E
 
W
Q
 
H
R
 
P
K
 
K
V
 
W
W
 
F
L
 
L
H
 
G
D
 
Y
N
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
I
A
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
A
x
F
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
V
 
Q
R
 
A
L
 
I
V
 
A
E
 
R
M
 
R
L
 
A
K
 
K
P
 
G
F
 
F
N
 
N
V
 
M
K
 
R
T
 
I
I
 
L
A
 
Y
A
 
Y
N
x
S
N
x
R
S
 
T
G
 
R
R
 
K
P
 
S
V
 
Q
E
 
A
G
 
E
A
 
K
D
 
E
E
 
L
T
 
G
F
 
A
A
 
E
M
 
Y
K
 
R
D
 
P
A
 
L
D
 
E
H
 
E
V
 
V
W
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
F
 
V
V
 
I
L
 
L
I
x
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
K
A
 
E
T
|
T
Y
 
M
Q
 
Y
I
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
T
 
R
L
 
L
G
 
K
K
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
I
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
V
I
 
V
N
 
D
T
 
T
D
 
K
D
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
D
 
N
R
 
E
H
 
E
P
 
-
L
 
L
W
 
F
D
 
S
M
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
A
x
G
N
 
S
T
 
A
T
 
T
E
 
F
R
 
E
I
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
A
T
 
M
G
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
A
R
 
R
N
 
N
I
 
L
E
 
I
L
 
A
F
 
F
E
 
K
A
 
R
G
 
G
K
 
E

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
29% identity, 86% coverage: 38:298/304 of query aligns to 56:312/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
G
 
G
S
 
A
A
 
D
P
 
A
E
 
E
F
 
L
P
 
I
E
 
D
L
 
A
P
 
L
E
 
P
N
 
K
I
 
L
K
 
E
F
 
I
V
 
V
Q
 
S
A
 
S
S
 
F
M
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
K
L
 
V
V
 
D
K
 
L
R
 
I
G
 
K
V
 
C
V
 
E
N
 
E
G
 
K
Q
 
G
A
 
V
R
 
R
W
 
V
A
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
D
L
 
V
Y
 
L
A
 
T
D
 
D
T
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
S
 
L
T
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
Q
 
V
L
 
L
H
 
R
Y
 
-
H
 
R
S
 
I
L
 
C
T
 
E
C
 
C
-
 
D
-
 
K
-
 
Y
-
 
V
R
 
R
S
 
R
K
 
G
T
 
A
W
 
W
-
 
K
-
 
F
-
 
G
D
 
D
V
 
F
R
 
K
S
 
L
T
 
T
V
 
T
E
 
K
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
W
 
-
L
 
-
H
 
F
D
 
S
N
 
G
K
 
K
T
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
A
x
L
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
V
 
L
R
 
A
L
 
V
V
 
A
E
 
E
M
 
R
L
 
A
K
 
E
P
 
A
F
 
F
N
 
D
V
 
C
K
 
P
T
 
I
I
 
S
A
 
Y
A
 
F
N
x
S
N
x
R
S
|
S
G
 
K
R
 
K
P
 
P
V
 
-
E
 
-
G
 
N
A
 
T
D
 
N
E
 
Y
T
 
T
F
 
Y
A
 
-
M
 
Y
K
 
G
D
 
S
A
 
V
D
 
V
H
 
E
V
 
L
W
 
A
A
 
S
E
 
N
A
 
S
D
 
D
I
 
I
F
 
L
V
 
V
L
 
V
I
 
A
L
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
T
Y
 
T
Q
 
H
I
 
I
V
 
I
N
 
N
A
 
R
E
 
E
T
 
V
L
 
I
G
 
D
K
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
P
 
P
L
 
H
I
 
V
N
 
D
T
 
E
D
 
P
D
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
N
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
R
E
 
E
P
 
P
-
 
E
L
 
V
P
 
P
D
 
E
R
 
K
H
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
F
D
 
G
M
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
L
P
 
P
H
 
H
T
 
V
A
 
G
N
 
S
T
 
G
T
 
T
E
 
V
R
 
E
I
 
T
R
 
R
A
 
K
L
 
V
T
 
M
G
 
A
E
 
D
L
 
L
T
 
V
L
 
V
R
 
G
N
 
N
I
 
L
E
 
E
L
 
A
F
 
H
E
 
F
A
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
A
 
L
T
 
T
E
 
P
V
 
V

5tsdA Crystal structure of NADPH-dependent 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADPH and oxalate
33% identity, 67% coverage: 101:304/304 of query aligns to 93:316/316 of 5tsdA

query
sites
5tsdA
H
 
R
S
 
S
L
 
L
T
 
T
C
 
T
R
 
R
S
x
M
K
 
S
T
 
E
W
 
W
D
 
V
V
 
V
-
 
M
R
 
Q
S
 
C
T
 
L
V
 
M
E
 
H
Q
 
L
R
 
R
K
 
G
V
 
Q
W
 
Y
L
 
G
H
 
H
D
 
D
N
 
S
K
 
H
-
 
Q
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
W
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
G
I
 
V
L
 
M
G
|
G
A
x
L
G
|
G
G
x
I
I
x
L
G
 
G
V
 
Q
R
 
D
L
 
A
V
 
V
E
 
A
M
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
V
F
 
M
N
 
G
V
 
F
K
 
N
T
 
V
I
 
I
A
 
G
A
x
W
N
x
S
N
x
R
S
x
T
G
 
R
R
x
K
P
 
T
V
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
V
D
 
-
E
 
E
T
 
T
F
 
F
A
 
D
M
 
A
K
 
G
D
 
E
A
 
L
D
 
D
H
 
R
V
 
F
W
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
T
D
 
D
I
 
I
F
 
L
V
 
V
L
 
G
I
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
T
Y
 
T
Q
 
G
I
 
F
V
 
Y
N
 
D
A
 
S
E
 
E
T
 
L
L
 
F
G
 
K
K
 
K
M
 
L
K
 
R
P
 
R
S
 
D
A
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
V
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
S
I
 
Q
N
 
I
T
 
E
D
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
V
 
S
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
N
 
E
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
D
 
T
R
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
D
 
E
M
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
F
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
D
A
 
A
N
 
A
T
 
V
T
 
S
E
 
E
R
 
E
I
 
-
R
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
F
G
 
R
E
 
H
L
 
V
T
 
E
L
 
M
R
 
Q
N
 
-
I
 
I
E
 
A
L
 
R
F
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
K
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
Q
T
 
F
E
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
R
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
29% identity, 86% coverage: 38:298/304 of query aligns to 54:310/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
G
 
G
S
 
A
A
 
D
P
 
A
E
 
E
F
 
L
P
 
I
E
 
D
L
 
A
P
 
L
E
 
P
N
 
K
I
 
L
K
 
E
F
 
I
V
 
V
Q
 
S
A
 
S
S
 
F
M
 
S
A
x
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
K
L
 
V
V
 
D
K
 
L
R
 
I
G
 
K
V
 
C
V
 
E
N
 
E
G
 
K
Q
 
G
A
 
V
R
 
R
W
 
V
A
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
D
L
 
V
Y
x
L
A
 
T
D
 
D
T
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
S
 
L
T
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
Q
 
V
L
 
L
H
 
R
Y
 
-
H
 
R
S
 
I
L
 
C
T
 
E
C
 
C
-
 
D
-
 
K
-
 
Y
-
 
V
R
 
R
S
 
R
K
 
G
T
 
A
W
 
W
-
 
K
-
 
F
-
 
G
D
 
D
V
 
F
R
 
K
S
 
L
T
 
T
V
 
T
E
 
K
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
W
 
-
L
 
-
H
 
F
D
 
S
N
 
G
K
 
K
T
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
A
x
L
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
V
 
L
R
 
A
L
 
V
V
 
A
E
 
E
M
 
R
L
 
A
K
 
E
P
 
A
F
 
F
N
 
D
V
 
C
K
 
P
T
 
I
I
 
S
A
 
Y
A
 
F
N
x
S
N
x
R
S
|
S
G
 
K
R
 
K
P
 
P
V
 
-
E
 
-
G
 
N
A
 
T
D
 
N
E
 
Y
T
 
T
F
 
Y
A
 
-
M
 
Y
K
 
G
D
 
S
A
 
V
D
 
V
H
 
E
V
 
L
W
 
A
A
 
S
E
 
N
A
 
S
D
 
D
I
 
I
F
 
L
V
 
V
L
 
V
I
 
A
L
x
C
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
|
T
Y
 
T
Q
 
H
I
 
I
V
 
I
N
 
N
A
 
R
E
 
E
T
 
V
L
 
I
G
 
D
K
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
G
|
G
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
H
I
 
V
N
 
D
T
 
E
D
 
P
D
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
N
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
|
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
R
E
|
E
P
 
P
-
 
E
L
 
V
P
 
P
D
 
E
R
 
K
H
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
F
D
 
G
M
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
T
 
V
A
x
G
N
 
S
T
 
G
T
 
T
E
 
V
R
 
E
I
 
T
R
 
R
A
 
K
L
 
V
T
 
M
G
 
A
E
 
D
L
 
L
T
 
V
L
 
V
R
 
G
N
 
N
I
 
L
E
 
E
L
 
A
F
 
H
E
 
F
A
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
L
A
 
L
T
 
T
E
 
P
V
 
V

5bqfA Probable 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADP, hepes and l(+)-tartaric acid
33% identity, 67% coverage: 101:304/304 of query aligns to 94:317/317 of 5bqfA

query
sites
5bqfA
H
 
R
S
 
S
L
 
L
T
 
T
C
 
T
R
 
R
S
x
M
K
 
S
T
 
E
W
 
W
D
 
V
V
 
V
-
 
M
R
 
Q
S
 
C
T
 
L
V
 
M
E
 
H
Q
 
L
R
 
R
K
 
G
V
 
Q
W
 
Y
L
 
G
H
 
H
D
 
D
N
 
S
K
 
H
-
 
Q
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
W
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
G
I
 
V
L
 
M
G
|
G
A
x
L
G
|
G
G
x
I
I
x
L
G
 
G
V
 
Q
R
 
D
L
 
A
V
 
V
E
 
A
M
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
V
F
 
M
N
 
G
V
 
F
K
 
N
T
 
V
I
 
I
A
 
G
A
x
W
N
x
S
N
x
R
S
x
T
G
 
R
R
 
K
P
 
T
V
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
V
D
 
-
E
 
E
T
 
T
F
 
F
A
 
D
M
 
A
K
 
G
D
 
E
A
 
L
D
 
D
H
 
R
V
 
F
W
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
T
D
 
D
I
 
I
F
 
L
V
 
V
L
 
G
I
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
T
Y
 
T
Q
 
G
I
 
F
V
 
Y
N
 
D
A
 
S
E
 
E
T
 
L
L
 
F
G
 
K
K
 
K
M
 
L
K
 
R
P
 
R
S
 
D
A
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
V
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
S
I
 
Q
N
 
I
T
 
E
D
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
V
 
S
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
N
 
E
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
D
 
T
R
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
D
 
E
M
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
F
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
D
A
 
A
N
x
A
T
 
V
T
 
S
E
 
E
R
 
E
I
 
-
R
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
F
G
 
R
E
 
H
L
 
V
T
 
E
L
 
M
R
 
Q
N
 
-
I
 
I
E
 
A
L
 
R
F
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
K
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
Q
T
 
F
E
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
R
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

4xcvA Probable 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADPH
33% identity, 67% coverage: 101:304/304 of query aligns to 94:317/317 of 4xcvA

query
sites
4xcvA
H
 
R
S
 
S
L
 
L
T
 
T
C
 
T
R
 
R
S
x
M
K
 
S
T
 
E
W
 
W
D
 
V
V
 
V
-
 
M
R
 
Q
S
 
C
T
 
L
V
 
M
E
 
H
Q
 
L
R
 
R
K
 
G
V
 
Q
W
 
Y
L
 
G
H
 
H
D
 
D
N
 
S
K
 
H
-
 
Q
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
W
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
G
I
 
V
L
 
M
G
|
G
A
x
L
G
|
G
G
x
I
I
x
L
G
 
G
V
 
Q
R
 
D
L
 
A
V
 
V
E
 
A
M
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
V
F
 
M
N
 
G
V
 
F
K
 
N
T
 
V
I
 
I
A
 
G
A
x
W
N
x
S
N
x
R
S
x
T
G
 
R
R
x
K
P
 
T
V
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
V
D
 
-
E
 
E
T
 
T
F
 
F
A
 
D
M
 
A
K
 
G
D
 
E
A
 
L
D
 
D
H
 
R
V
 
F
W
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
T
D
 
D
I
 
I
F
 
L
V
 
V
L
 
G
I
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
T
Y
 
T
Q
 
G
I
 
F
V
 
Y
N
 
D
A
 
S
E
 
E
T
 
L
L
 
F
G
 
K
K
 
K
M
 
L
K
 
R
P
 
R
S
 
D
A
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
V
 
V
V
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
S
I
 
Q
N
 
I
T
 
E
D
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
V
 
S
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
N
 
E
G
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
D
 
T
R
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
D
 
E
M
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
F
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
D
A
 
A
N
x
A
T
 
V
T
 
S
E
 
E
R
 
E
I
 
-
R
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
F
G
 
R
E
 
H
L
 
V
T
 
E
L
 
M
R
 
Q
N
 
-
I
 
I
E
 
A
L
 
R
F
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
K
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
Q
T
 
F
E
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
R
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
46% identity, 32% coverage: 173:270/304 of query aligns to 186:283/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
D
 
D
A
 
L
D
 
E
H
 
T
V
 
L
W
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
V
F
 
V
V
 
T
L
 
I
I
 
H
L
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
V
D
 
E
A
 
S
T
|
T
Y
 
Y
Q
 
H
I
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
T
 
R
L
 
L
G
 
K
K
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
S
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
T
G
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
V
I
 
V
N
 
D
T
 
T
D
 
N
D
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
K
R
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
W
 
T
D
 
K
M
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
A
x
G
N
 
A
T
 
S
T
 
T

Sites not aligning to the query:

8oq2A Binding of NADP to a formate dehydrogenase from starkeya novella.
28% identity, 87% coverage: 41:303/304 of query aligns to 106:371/381 of 8oq2A

query
sites
8oq2A
P
 
P
E
 
E
F
 
R
P
 
I
E
 
A
L
 
K
P
 
A
E
 
K
N
 
N
I
 
L
K
 
K
F
 
L
V
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
A
M
 
G
A
x
I
G
 
G
I
 
S
D
 
D
-
 
H
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
Q
A
 
S
L
 
A
V
 
I
K
 
D
R
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
T
N
 
V
G
 
A
Q
 
E
A
 
V
R
 
T
W
 
Y
A
 
C
N
|
N
A
 
S
A
 
I
G
 
S
L
x
V
Y
 
-
A
 
A
D
 
E
T
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
M
S
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
V
L
 
R
A
 
N
Q
 
Y
L
 
I
H
 
P
Y
 
S
H
 
H
S
 
D
L
 
W
T
 
A
C
 
-
R
 
R
S
 
K
K
 
G
T
 
G
W
 
W
D
 
N
V
 
I
R
 
A
S
 
D
T
 
C
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
R
 
S
K
 
-
V
 
-
W
 
Y
L
 
D
H
 
L
D
 
E
N
 
G
K
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
G
I
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
A
G
|
G
G
x
R
I
|
I
G
 
G
V
 
L
R
 
A
L
 
V
V
 
L
E
 
R
M
 
R
L
 
L
K
 
A
P
 
P
F
 
F
N
 
D
V
 
V
K
 
K
T
 
-
I
 
L
A
 
H
A
 
Y
N
 
T
N
x
Q
S
x
R
G
x
H
R
 
R
P
 
L
V
 
P
E
 
E
G
 
A
A
 
V
D
 
E
E
 
K
T
 
E
F
 
L
A
 
G
M
 
L
-
 
V
-
 
W
-
 
H
K
 
D
D
 
T
A
 
R
D
 
E
H
 
D
V
 
M
W
 
Y
A
 
P
E
 
H
A
 
C
D
 
D
I
 
V
F
 
V
V
 
T
L
 
L
I
 
N
L
x
V
P
|
P
L
 
L
T
x
H
D
 
P
A
 
E
T
|
T
Y
 
E
Q
 
H
I
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
D
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
K
K
 
L
M
 
F
K
 
K
P
 
R
S
 
G
A
 
A
V
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
L
I
 
A
N
 
D
T
 
R
D
 
D
D
 
A
L
 
I
V
 
V
V
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
E
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
W
D
 
F
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
D
 
K
R
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
W
W
 
R
D
 
T
M
 
M
D
 
K
N
 
W
V
 
E
V
 
G
I
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
A
x
S
N
x
G
T
 
T
T
 
S
E
 
L
R
 
S
I
 
A
R
 
Q
A
 
A
L
 
R
T
 
Y
G
 
A
E
 
A
L
 
G
T
 
T
L
 
R
R
 
E
N
 
I
I
 
L
E
 
E
L
 
C
F
 
F
E
 
F
A
 
E
G
 
G
K
 
R
P
 
P
M
 
I
A
 
R
T
 
D
E
 
E
V
 
Y
D
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
Q
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5vg6B Crystal structure of d-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase from xanthobacter autotrophicus py2 in complex with NADPH and mes.
30% identity, 86% coverage: 43:304/304 of query aligns to 60:315/315 of 5vg6B

query
sites
5vg6B
F
 
F
P
 
A
E
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
-
N
 
N
I
 
L
K
 
K
F
 
L
V
 
V
Q
 
I
A
 
N
S
 
L
M
 
G
A
|
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
A
R
 
R
G
 
D
V
 
-
V
 
-
N
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
W
 
-
A
 
-
N
 
D
A
 
L
A
 
P
G
 
D
L
 
V
Y
 
P
A
 
V
D
 
T
T
x
R
V
 
L
A
 
S
E
 
D
S
 
P
T
 
N
I
x
M
G
 
S
L
 
Q
L
 
M
L
x
M
A
 
A
Q
 
S
L
 
F
H
 
V
Y
 
L
H
 
F
S
 
C
L
 
V
T
 
L
C
 
R
R
 
H
S
 
A
K
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
P
T
 
T
W
 
F
D
 
E
V
 
-
R
 
R
S
 
A
T
 
Q
V
 
R
E
 
E
Q
 
G
R
 
R
K
 
W
V
 
H
W
 
Y
L
 
V
H
 
H
D
 
P
N
 
R
K
 
T
T
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
x
L
G
|
G
G
x
D
I
x
L
G
 
G
V
 
A
R
 
A
L
 
A
V
 
A
E
 
L
M
 
E
L
 
L
K
 
A
P
 
R
F
 
H
N
 
G
V
 
F
K
 
D
T
 
V
I
 
R
A
 
G
A
x
W
N
x
S
N
x
R
S
x
T
G
 
P
R
x
K
P
 
A
V
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
V
D
 
S
E
 
C
T
 
F
F
 
H
A
 
G
M
 
L
K
 
E
D
 
A
A
 
L
D
 
P
H
 
G
V
 
F
W
 
L
A
 
A
E
 
G
A
 
S
D
 
E
I
 
I
F
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
M
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
|
T
Y
 
R
Q
 
G
I
 
L
V
 
M
N
 
N
A
 
A
E
 
E
T
 
R
L
 
L
G
 
A
K
 
H
M
 
L
K
 
P
P
 
R
S
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
F
V
 
I
N
 
N
V
|
V
G
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
V
I
 
V
N
 
D
T
 
E
D
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
A
 
T
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
F
D
 
E
P
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
V
R
 
G
H
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
D
 
A
M
 
M
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
L
A
|
A
N
x
S
T
 
I
T
 
A
E
 
-
R
 
-
I
 
I
R
 
P
A
 
R
L
 
T
T
 
A
G
 
A
E
 
P
L
 
Q
T
 
I
L
 
V
R
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
R
L
 
R
F
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
P
M
 
V
A
 
L
T
 
N
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
V
 
P
V
 
R
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

4z0pA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc02828 (smghra) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
29% identity, 92% coverage: 26:304/304 of query aligns to 39:316/316 of 4z0pA

query
sites
4z0pA
E
 
R
D
 
D
I
 
L
K
 
S
D
 
G
A
 
I
D
 
D
F
 
Y
L
 
A
F
 
V
F
 
V
N
x
W
G
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
E
 
D
F
 
L
P
 
F
E
 
S
L
 
R
P
 
A
E
 
P
N
 
D
I
 
L
K
 
K
F
 
V
V
 
V
Q
 
F
A
 
S
S
 
G
M
x
G
A
|
A
G
|
G
I
 
V
D
 
D
-
 
H
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
V
A
x
R
L
 
F
V
 
V
K
 
D
R
 
R
G
 
T
V
x
L
V
 
T
N
 
T
G
 
R
Q
x
M
A
 
S
R
 
E
W
 
W
A
 
V
N
 
M
A
 
M
A
 
Q
G
 
C
L
 
L
Y
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
L
 
H
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
L
x
H
H
x
R
Y
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
A
T
 
L
C
 
A
R
 
K
S
 
K
K
 
H
T
 
E
W
 
W
D
 
R
V
 
D
R
 
L
S
 
S
T
 
Q
V
 
P
E
 
E
Q
 
A
R
 
A
K
 
D
V
 
V
W
 
-
L
 
-
H
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
T
 
T
V
 
V
A
 
G
I
 
I
L
 
M
G
 
G
A
x
M
G
|
G
G
x
V
I
x
L
G
 
G
V
 
Q
R
 
D
L
 
A
V
 
A
E
 
R
M
 
K
L
 
L
K
 
A
P
 
A
F
 
M
N
 
G
V
 
F
K
 
K
T
 
V
I
 
I
A
 
G
A
x
W
N
x
S
N
x
R
S
|
S
G
 
K
R
|
R
P
 
V
V
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
V
D
 
-
E
 
E
T
 
T
F
 
Y
A
 
D
M
 
A
K
 
A
D
 
G
A
 
L
D
 
D
H
 
A
V
 
F
W
 
L
A
 
G
E
 
R
A
 
T
D
 
D
I
 
F
F
 
L
V
 
V
L
 
G
I
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
D
T
 
T
Y
 
R
Q
 
G
I
 
I
V
 
F
N
 
N
A
 
A
E
 
A
T
 
L
L
 
F
G
 
A
K
 
K
M
 
L
K
 
S
P
 
R
S
 
N
A
 
G