SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_053768287.1 NCBI__GCF_001280255.1:WP_053768287.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

O58478 Alanine/serine racemase; ASR; Ala/Ser racemase; EC 5.1.1.-; EC 5.1.1.1 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:431/432 of query aligns to 21:460/474 of O58478

query
sites
O58478
P
 
P
E
 
K
V
 
I
K
 
V
T
 
V
P
 
K
L
 
P
P
 
P
G
 
G
P
 
P
K
 
R
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
E
R
 
R
G
 
E
E
 
K
K
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
S
P
 
T
S
 
G
Y
 
I
-
 
G
V
 
V
R
 
K
P
 
L
Y
 
F
P
 
P
F
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
K
R
 
R
G
 
G
Q
 
F
G
 
G
V
 
P
F
 
F
L
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
V
F
 
F
L
 
I
D
 
D
F
 
F
M
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
A
T
 
S
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
P
 
P
R
 
K
G
 
L
L
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
A
 
V
E
 
E
R
 
L
F
 
I
A
 
Q
H
 
H
V
 
S
C
 
M
F
 
I
S
 
G
D
 
Y
F
 
T
T
 
H
H
 
S
E
 
E
P
 
R
T
 
A
L
 
I
S
 
R
L
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
V
-
 
E
A
 
I
K
 
S
V
 
P
G
 
I
G
 
E
G
 
N
Y
 
S
R
 
K
V
 
V
F
 
I
F
 
F
G
 
G
N
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
S
E
 
D
G
 
A
I
 
V
E
 
D
A
 
M
A
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
S
R
 
K
H
 
F
H
 
S
T
 
T
G
 
R
R
 
R
P
 
P
Y
 
W
L
 
I
L
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
H
 
H
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
T
S
 
S
L
 
V
T
 
A
A
 
S
S
 
F
K
 
Q
S
 
V
A
 
S
Y
 
Q
R
 
K
K
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
M
P
 
P
G
 
N
V
 
V
V
 
F
H
 
W
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
F
 
F
R
 
R
P
 
N
P
 
I
L
 
W
G
 
G
A
 
I
S
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
-
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
L
G
 
I
E
 
N
A
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
D
H
 
Y
L
 
L
E
 
E
H
 
Y
-
 
Y
L
 
V
F
 
F
A
 
S
T
 
H
V
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
L
F
 
F
L
 
A
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
x
D
G
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
P
A
 
E
G
 
N
F
 
F
L
 
F
P
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
E
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
M
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
K
F
 
W
L
 
F
A
 
A
L
 
S
E
 
E
H
 
W
E
 
F
G
 
N
V
 
V
E
 
K
A
 
P
D
 
D
V
 
M
Y
 
I
V
 
I
L
 
F
A
 
G
K
|
K
G
 
G
L
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
M
P
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
G
V
 
V
L
 
I
F
 
G
R
 
R
E
 
K
E
 
E
L
 
I
G
 
M
S
 
D
W
 
I
R
 
T
P
 
S
G
 
G
A
 
S
H
 
A
G
 
L
T
 
L
T
 
T
F
 
P
G
 
A
G
 
A
Q
 
N
A
 
P
V
 
V
A
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
L
 
I
L
 
I
-
 
E
E
 
E
G
 
E
G
 
N
L
 
L
M
 
L
E
 
K
N
 
N
A
 
A
R
 
L
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
E
F
 
F
L
 
I
L
 
M
A
 
G
G
 
R
L
 
L
R
 
K
E
 
E
M
 
I
Q
 
K
K
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
E
F
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
L
M
 
M
I
 
I
G
 
G
L
 
V
D
 
E
F
 
I
G
 
V
S
 
K
P
 
E
E
 
N
-
 
G
E
 
R
P
 
P
R
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
M
R
 
T
D
 
G
K
 
K
A
 
I
Q
 
C
R
 
W
L
 
R
A
 
A
F
 
F
E
 
E
K
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
L
L
 
P
A
 
S
A
 
Y
G
 
G
P
 
M
-
 
F
-
 
G
S
 
N
A
 
V
L
 
I
R
 
R
L
 
I
A
 
T
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
T
R
 
K
E
 
E
E
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
K
G
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
E
 
R
A
 
A
L
 
I
K
 
K
S
 
D

O50131 Ornithine aminotransferase; Orn-AT; Ornithine delta-aminotransferase; EC 2.6.1.13 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see paper)
44% identity, 100% coverage: 1:430/432 of query aligns to 3:443/454 of O50131

query
sites
O50131
M
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
N
V
 
V
K
 
K
T
 
E
P
 
-
L
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
Q
 
R
E
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
E
R
 
E
G
 
H
E
 
H
K
 
K
V
 
Y
L
 
M
S
 
A
P
 
T
S
 
T
Y
 
T
V
 
N
R
 
D
P
 
P
-
 
N
-
 
E
Y
 
Y
P
 
F
F
 
L
V
 
V
P
 
I
A
 
E
R
 
R
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
L
 
W
E
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
V
F
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
M
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
V
N
 
M
T
 
N
T
 
V
G
 
G
Y
 
L
A
 
R
H
 
N
P
 
P
R
 
K
G
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
A
 
L
E
 
D
R
 
L
F
 
V
A
 
L
H
 
H
V
 
A
C
 
A
F
 
G
S
x
T
D
|
D
F
 
Y
T
 
Y
H
 
N
E
 
P
P
 
Y
T
 
Q
L
 
V
S
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
E
K
 
I
V
 
A
G
 
P
G
 
G
G
 
D
Y
 
I
-
 
E
-
 
R
R
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
L
G
 
S
N
 
N
S
 
S
G
|
G
T
|
T
E
 
E
G
 
A
I
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
A
R
 
K
H
 
W
H
 
S
T
 
T
G
 
N
R
 
R
P
 
K
Y
 
M
L
 
F
L
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
H
G
 
G
R
 
R
S
 
T
L
 
H
G
 
G
A
 
T
L
 
M
S
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
K
 
K
S
 
P
A
 
V
Y
 
Q
R
 
R
K
 
S
G
 
R
F
 
M
A
 
F
P
 
P
L
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
H
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
P
 
N
P
 
P
L
 
W
G
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
A
 
E
S
 
N
P
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
L
G
 
I
E
 
N
A
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
D
H
 
Y
L
 
I
E
 
E
-
 
E
H
 
Y
L
 
L
F
 
F
A
 
E
T
 
H
V
 
Y
L
 
V
P
 
P
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
G
F
 
I
F
 
F
L
 
F
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
P
A
 
K
G
 
N
F
 
F
L
 
F
P
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
D
R
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
D
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
|
Q
T
 
M
G
 
G
A
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
R
F
 
M
L
 
W
A
 
A
L
 
I
E
 
E
H
 
H
E
 
F
G
 
D
V
 
I
E
 
V
A
 
P
D
 
D
V
 
I
Y
 
V
V
 
T
L
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
A
L
 
L
A
 
G
S
 
G
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
L
 
I
S
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
A
E
 
D
L
 
L
G
 
D
S
 
F
W
 
G
R
 
V
P
 
S
G
 
G
A
 
V
H
 
H
G
 
S
T
 
N
T
|
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
I
D
 
E
L
 
E
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
I
E
 
E
N
 
N
A
 
A
R
 
Q
E
 
K
V
 
L
G
 
E
A
 
P
F
 
L
L
 
F
L
 
R
A
 
E
G
 
R
L
 
L
R
 
E
E
 
E
M
 
M
Q
 
K
K
 
E
R
 
K
F
 
Y
P
 
E
F
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
I
 
W
G
 
G
L
 
V
D
 
E
F
 
F
G
 
V
S
 
K
P
 
D
E
 
R
E
 
K
P
 
T
R
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
P
 
T
D
 
K
L
 
E
R
 
R
D
 
G
K
 
E
A
 
I
Q
 
V
R
 
V
L
 
E
A
 
A
F
 
L
E
 
K
K
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
C
G
 
G
P
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
L
A
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
I
S
 
S
R
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
D
I
 
I
L
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
K

7vo1A Structure of aminotransferase-substrate complex (see paper)
44% identity, 100% coverage: 1:430/432 of query aligns to 1:441/452 of 7vo1A

query
sites
7vo1A
M
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
N
V
 
V
K
 
K
T
 
E
P
 
-
L
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
Q
 
R
E
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
E
R
 
E
G
 
H
E
 
H
K
 
K
V
 
Y
L
 
M
S
 
A
P
 
T
S
 
T
Y
 
T
V
 
N
R
 
D
P
 
P
-
 
N
-
 
E
Y
 
Y
P
 
F
F
 
L
V
 
V
P
 
I
A
 
E
R
 
R
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
L
 
W
E
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
V
F
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
M
 
S
A
 
S
G
 
G
I
|
I
A
 
G
V
 
V
N
 
M
T
 
N
T
 
V
G
 
G
Y
 
L
A
 
R
H
 
N
P
 
P
R
 
K
G
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
A
 
L
E
 
D
R
 
L
F
 
V
A
 
L
H
 
H
V
 
A
C
 
A
F
 
G
S
 
T
D
 
D
F
 
Y
T
 
Y
H
 
N
E
 
P
P
 
Y
T
 
Q
L
 
V
S
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
E
K
 
I
V
 
A
G
 
P
G
 
G
G
 
D
Y
 
I
-
 
E
-
 
R
R
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
L
G
 
S
N
 
N
S
|
S
G
|
G
T
|
T
E
 
E
G
 
A
I
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
A
R
 
K
H
 
W
H
 
S
T
 
T
G
 
N
R
 
R
P
 
K
Y
 
M
L
 
F
L
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
I
G
 
G
A
 
A
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
|
R
S
 
T
L
 
H
G
 
G
A
 
T
L
 
M
S
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
K
 
K
S
 
P
A
 
V
Y
 
Q
R
 
R
K
 
S
G
 
R
F
 
M
A
 
F
P
 
P
L
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
H
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
P
 
N
P
 
P
L
 
W
G
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
A
 
E
S
 
N
P
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
L
G
 
I
E
 
N
A
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
D
H
 
Y
L
 
I
E
 
E
-
 
E
H
 
Y
L
 
L
F
 
F
A
 
E
T
 
H
V
 
Y
L
 
V
P
 
P
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
G
F
 
I
F
 
F
L
 
F
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
P
A
 
K
G
 
N
F
 
F
L
 
F
P
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
D
R
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
D
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
M
G
 
G
A
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
R
F
 
M
L
 
W
A
 
A
L
 
I
E
 
E
H
 
H
E
 
F
G
 
D
V
 
I
E
 
V
A
 
P
D
 
D
V
 
I
Y
 
V
V
 
T
L
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
A
L
 
L
A
 
G
S
 
G
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
L
 
I
S
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
A
E
 
D
L
 
L
G
 
D
S
 
F
W
 
G
R
 
V
P
 
S
G
 
G
A
 
V
H
 
H
G
 
S
T
x
N
T
|
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
I
D
 
E
L
 
E
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
I
E
 
E
N
 
N
A
 
A
R
 
Q
E
 
K
V
 
L
G
 
E
A
 
P
F
 
L
L
 
F
L
 
R
A
 
E
G
 
R
L
 
L
R
 
E
E
 
E
M
 
M
Q
 
K
K
 
E
R
 
K
F
 
Y
P
 
E
F
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
I
 
W
G
 
G
L
 
V
D
 
E
F
 
F
G
 
V
S
 
K
P
 
D
E
 
R
E
 
K
P
 
T
R
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
P
 
T
D
 
K
L
 
E
R
 
R
D
 
G
K
 
E
A
 
I
Q
 
V
R
 
V
L
 
E
A
 
A
F
 
L
E
 
K
K
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
C
G
 
G
P
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
I
R
|
R
L
 
L
A
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
I
S
 
S
R
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
D
I
 
I
L
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
K

7vntA Structure of aminotransferase-substrate complex (see paper)
44% identity, 100% coverage: 1:430/432 of query aligns to 1:441/452 of 7vntA

query
sites
7vntA
M
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
N
V
 
V
K
 
K
T
 
E
P
 
-
L
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
Q
 
R
E
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
E
R
 
E
G
 
H
E
 
H
K
 
K
V
 
Y
L
 
M
S
 
A
P
 
T
S
 
T
Y
 
T
V
 
N
R
 
D
P
 
P
-
 
N
-
 
E
Y
 
Y
P
 
F
F
 
L
V
 
V
P
 
I
A
 
E
R
 
R
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
L
 
W
E
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
V
F
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
M
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
V
N
 
M
T
 
N
T
 
V
G
 
G
Y
 
L
A
 
R
H
 
N
P
 
P
R
 
K
G
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
A
 
L
E
 
D
R
 
L
F
 
V
A
 
L
H
 
H
V
 
A
C
 
A
F
 
G
S
 
T
D
 
D
F
 
Y
T
 
Y
H
 
N
E
 
P
P
 
Y
T
 
Q
L
 
V
S
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
E
K
 
I
V
 
A
G
 
P
G
 
G
G
 
D
Y
 
I
-
 
E
-
 
R
R
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
L
G
 
S
N
 
N
S
 
S
G
|
G
T
|
T
E
 
E
G
 
A
I
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
A
R
 
K
H
 
W
H
 
S
T
 
T
G
 
N
R
 
R
P
 
K
Y
 
M
L
 
F
L
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
I
G
 
G
A
 
A
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
|
R
S
 
T
L
 
H
G
 
G
A
 
T
L
 
M
S
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
K
 
K
S
 
P
A
 
V
Y
 
Q
R
 
R
K
 
S
G
 
R
F
 
M
A
 
F
P
 
P
L
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
H
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
P
 
N
P
 
P
L
 
W
G
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
A
 
E
S
 
N
P
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
L
G
 
I
E
 
N
A
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
D
H
 
Y
L
 
I
E
 
E
-
 
E
H
 
Y
L
 
L
F
 
F
A
 
E
T
 
H
V
 
Y
L
 
V
P
 
P
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
G
F
 
I
F
 
F
L
 
F
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
P
A
 
K
G
 
N
F
 
F
L
 
F
P
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
D
R
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
D
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
M
G
 
G
A
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
R
F
 
M
L
 
W
A
 
A
L
 
I
E
 
E
H
 
H
E
 
F
G
 
D
V
 
I
E
 
V
A
 
P
D
 
D
V
 
I
Y
 
V
V
 
T
L
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
A
L
 
L
A
 
G
S
 
G
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
L
 
I
S
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
A
E
 
D
L
 
L
G
 
D
S
 
F
W
 
G
R
 
V
P
 
S
G
 
G
A
 
V
H
 
H
G
 
S
T
 
N
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
I
D
 
E
L
 
E
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
I
E
 
E
N
 
N
A
 
A
R
 
Q
E
 
K
V
 
L
G
 
E
A
 
P
F
 
L
L
 
F
L
 
R
A
 
E
G
 
R
L
 
L
R
 
E
E
 
E
M
 
M
Q
 
K
K
 
E
R
 
K
F
 
Y
P
 
E
F
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
I
 
W
G
 
G
L
 
V
D
 
E
F
 
F
G
 
V
S
 
K
P
 
D
E
 
R
E
 
K
P
 
T
R
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
P
 
T
D
 
K
L
 
E
R
 
R
D
 
G
K
 
E
A
 
I
Q
 
V
R
 
V
L
 
E
A
 
A
F
 
L
E
 
K
K
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
C
G
 
G
P
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
L
A
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
I
S
 
S
R
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
D
I
 
I
L
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
K

7vnoA Structure of aminotransferase (see paper)
44% identity, 100% coverage: 1:430/432 of query aligns to 1:441/452 of 7vnoA

query
sites
7vnoA
M
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
N
V
 
V
K
 
K
T
 
E
P
 
-
L
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
Q
 
R
E
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
E
R
 
E
G
 
H
E
 
H
K
 
K
V
 
Y
L
 
M
S
 
A
P
 
T
S
 
T
Y
 
T
V
 
N
R
 
D
P
 
P
-
 
N
-
 
E
Y
 
Y
P
 
F
F
 
L
V
 
V
P
 
I
A
 
E
R
 
R
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
L
 
W
E
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
V
F
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
M
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
V
N
 
M
T
 
N
T
 
V
G
 
G
Y
 
L
A
 
R
H
 
N
P
 
P
R
 
K
G
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
A
 
L
E
 
D
R
 
L
F
 
V
A
 
L
H
 
H
V
 
A
C
 
A
F
 
G
S
 
T
D
 
D
F
 
Y
T
 
Y
H
 
N
E
 
P
P
 
Y
T
 
Q
L
 
V
S
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
E
K
 
I
V
 
A
G
 
P
G
 
G
G
 
D
Y
 
I
-
 
E
-
 
R
R
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
L
G
 
S
N
 
N
S
 
S
G
|
G
T
|
T
E
 
E
G
 
A
I
x
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
A
R
 
K
H
 
W
H
 
S
T
 
T
G
 
N
R
 
R
P
 
K
Y
 
M
L
 
F
L
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
I
G
 
G
A
 
A
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
 
R
S
 
T
L
 
H
G
 
G
A
 
T
L
 
M
S
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
K
 
K
S
 
P
A
 
V
Y
 
Q
R
 
R
K
 
S
G
 
R
F
 
M
A
 
F
P
 
P
L
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
H
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
P
 
N
P
 
P
L
 
W
G
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
A
 
E
S
 
N
P
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
L
G
 
I
E
 
N
A
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
D
H
 
Y
L
 
I
E
 
E
-
 
E
H
 
Y
L
 
L
F
 
F
A
 
E
T
 
H
V
 
Y
L
 
V
P
 
P
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
G
F
 
I
F
 
F
L
 
F
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
V
P
 
P
P
 
P
A
 
K
G
 
N
F
 
F
L
 
F
P
 
K
K
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
D
R
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
D
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
M
G
 
G
A
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
R
F
 
M
L
 
W
A
 
A
L
 
I
E
 
E
H
 
H
E
 
F
G
 
D
V
 
I
E
 
V
A
 
P
D
 
D
V
 
I
Y
 
V
V
 
T
L
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
A
L
 
L
A
 
G
S
 
G
G
 
G
Y
 
I
P
 
P
L
 
I
S
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
A
E
 
D
L
 
L
G
 
D
S
 
F
W
 
G
R
 
V
P
 
S
G
 
G
A
 
V
H
 
H
G
 
S
T
 
N
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
I
D
 
E
L
 
E
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
I
E
 
E
N
 
N
A
 
A
R
 
Q
E
 
K
V
 
L
G
 
E
A
 
P
F
 
L
L
 
F
L
 
R
A
 
E
G
 
R
L
 
L
R
 
E
E
 
E
M
 
M
Q
 
K
K
 
E
R
 
K
F
 
Y
P
 
E
F
 
I
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
I
 
W
G
 
G
L
 
V
D
 
E
F
 
F
G
 
V
S
 
K
P
 
D
E
 
R
E
 
K
P
 
T
R
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
P
 
T
D
 
K
L
 
E
R
 
R
D
 
G
K
 
E
A
 
I
Q
 
V
R
 
V
L
 
E
A
 
A
F
 
L
E
 
K
K
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
C
G
 
G
P
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
L
A
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
I
S
 
S
R
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
D
I
 
I
L
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
K

2eo5A Crystal structure of 4-aminobutyrate aminotransferase from sulfolobus tokodaii strain7
42% identity, 97% coverage: 14:430/432 of query aligns to 3:410/412 of 2eo5A

query
sites
2eo5A
A
 
S
Q
 
R
E
 
K
L
 
I
L
 
I
A
 
E
R
 
E
G
 
S
E
 
D
K
 
I
V
 
Y
L
 
L
S
 
A
P
 
T
S
 
S
Y
x
T
V
 
R
R
 
D
P
 
P
-
 
E
-
 
L
Y
 
F
P
 
P
F
 
L
V
 
V
P
 
I
A
 
D
R
 
H
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
I
E
 
Y
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
M
 
T
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
V
N
 
N
T
 
N
T
 
L
G
 
G
Y
 
W
-
 
P
A
 
S
H
 
H
P
 
P
R
 
E
G
 
V
L
 
I
A
 
K
A
 
I
V
 
G
K
 
I
A
 
E
Q
 
Q
A
 
M
E
 
Q
R
 
K
F
 
L
A
 
A
H
 
H
V
 
A
C
 
A
F
 
A
S
 
N
D
 
D
F
 
F
T
 
Y
H
 
N
E
 
I
P
 
P
T
 
Q
L
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
T
K
 
Y
V
 
S
G
 
P
G
 
G
G
 
N
Y
 
F
-
 
Q
-
 
K
R
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
F
G
 
S
N
 
N
S
 
S
G
|
G
T
|
T
E
 
E
G
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
S
I
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
V
R
 
K
H
 
N
H
 
-
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
K
Y
 
Y
L
 
I
L
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
L
G
 
G
A
 
G
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
 
R
S
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
S
L
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
K
 
K
S
 
A
A
 
V
Y
 
Q
R
 
R
K
 
S
G
 
I
F
 
V
A
 
G
P
 
P
L
 
F
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
I
H
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
P
 
N
P
 
P
L
 
W
G
 
H
A
 
I
S
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
-
 
N
P
 
P
E
 
S
E
 
E
V
 
L
G
 
V
E
 
N
A
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
E
H
 
F
L
 
I
E
 
E
-
 
D
H
 
Y
L
 
I
F
 
F
A
 
V
T
 
N
V
 
L
L
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
G
F
 
I
F
 
F
L
 
F
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
I
P
 
P
P
 
P
A
 
K
G
 
N
F
 
F
L
 
F
P
 
A
K
 
E
L
 
L
K
 
Q
A
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
K
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
M
G
 
G
A
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
K
F
 
L
L
 
F
A
 
A
L
 
I
E
 
E
H
 
N
E
 
F
G
 
N
V
 
T
E
 
V
A
 
P
D
 
D
V
 
V
Y
 
I
V
 
T
L
 
L
A
 
A
K
|
K
G
 
A
L
 
L
A
 
G
S
 
G
G
 
G
-
 
I
Y
 
M
P
 
P
L
 
I
S
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
K
E
 
D
L
 
L
G
 
D
S
 
F
W
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
T
 
K
T
|
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
C
A
 
A
A
 
I
A
 
G
Q
 
S
A
 
K
T
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
I
L
 
V
E
 
K
G
 
-
G
 
D
L
 
L
M
 
L
E
 
P
N
 
H
A
 
V
R
 
N
E
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
K
F
 
I
L
 
F
L
 
A
A
 
E
G
 
E
L
 
L
R
 
Q
E
 
G
M
 
L
Q
 
A
K
 
D
R
 
-
F
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
A
I
 
W
G
 
G
L
 
L
D
 
E
F
 
Y
G
 
N
S
 
E
P
 
K
E
 
K
E
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
V
R
 
R
D
 
D
K
 
R
A
 
I
Q
 
I
R
 
G
L
 
E
A
 
S
F
 
F
E
 
K
K
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
L
L
 
L
A
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
R
S
 
S
A
 
A
L
 
I
R
|
R
L
 
V
A
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
R
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
E
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
K
E
 
K
A
 
V
L
 
I
K
 
K

4ysnC Structure of aminoacid racemase in complex with plp (see paper)
35% identity, 97% coverage: 13:432/432 of query aligns to 13:441/448 of 4ysnC

query
sites
4ysnC
K
 
K
A
 
A
Q
 
S
E
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
D
R
 
E
G
 
E
E
 
N
K
 
K
V
 
Y
L
 
Y
S
 
A
P
 
R
S
 
S
-
x
A
Y
 
R
V
 
I
R
 
N
P
 
Y
Y
 
Y
P
 
N
F
 
L
V
 
V
P
 
I
A
 
D
R
 
H
G
 
A
Q
 
H
G
 
G
V
 
A
F
 
T
L
 
L
E
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
K
F
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
L
M
 
L
A
 
A
G
 
S
I
 
A
A
 
S
V
 
A
N
 
I
T
 
N
T
 
V
G
 
G
Y
 
H
A
 
T
H
 
H
P
 
E
R
 
K
G
 
V
L
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
K
 
A
A
 
D
Q
 
Q
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
F
 
L
A
 
I
H
 
H
V
 
Y
C
 
T
F
 
P
S
 
A
D
 
Y
F
 
F
T
 
H
H
 
H
E
 
V
P
 
P
T
 
G
L
 
M
S
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
-
A
 
A
K
 
K
V
 
I
G
 
A
G
 
P
G
 
G
Y
 
N
R
 
S
-
 
P
-
 
K
-
 
M
V
 
V
F
 
S
F
 
F
G
 
G
N
 
N
S
|
S
G
|
G
T
x
S
E
 
D
G
 
A
I
 
N
E
 
D
A
 
A
A
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
F
V
 
A
R
 
R
H
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
L
 
V
A
 
S
F
 
Y
T
 
M
G
 
G
A
 
S
F
x
Y
H
|
H
G
 
G
R
 
S
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
L
 
Q
S
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
G
S
 
S
K
 
S
S
 
L
A
 
N
Y
 
M
R
 
T
K
 
R
G
 
K
F
 
I
A
 
G
P
 
P
L
 
M
L
 
L
P
 
P
G
 
S
V
 
V
V
 
V
H
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
D
P
 
S
F
 
Y
R
 
R
P
 
T
P
 
Y
L
 
P
G
 
G
A
 
E
S
 
T
P
 
E
E
 
H
E
 
D
V
 
V
G
 
S
E
 
L
A
 
R
V
 
Y
L
 
F
A
 
N
H
 
E
L
 
F
E
 
K
H
 
K
L
 
P
F
 
F
A
 
E
T
 
S
V
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
A
E
 
D
E
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
C
F
 
V
F
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
I
V
 
I
L
 
K
P
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
E
F
 
Y
L
 
M
P
 
Q
K
 
L
L
 
V
K
 
Y
A
 
K
L
 
F
L
 
C
E
 
H
R
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
F
V
 
A
A
 
I
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
x
N
T
 
Q
G
 
G
A
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
K
F
 
M
L
 
W
A
 
A
L
 
I
E
 
Q
H
 
Q
-
 
F
E
 
K
G
 
D
V
 
I
E
 
E
A
 
P
D
 
D
V
 
L
Y
 
M
V
 
S
L
 
V
A
 
G
K
|
K
G
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
I
F
 
G
R
 
K
E
 
K
E
 
E
-
 
V
L
 
M
G
 
Q
S
 
S
W
 
L
R
 
D
P
 
A
G
 
P
A
 
A
H
 
H
G
 
L
T
x
F
T
|
T
F
 
T
G
 
A
G
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
V
A
 
C
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
S
Q
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
E
-
 
Y
G
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
V
E
 
E
N
 
K
A
 
S
R
 
A
E
 
T
V
 
D
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
L
 
A
L
 
K
A
 
Q
G
 
R
L
 
F
R
 
L
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
F
 
H
P
 
P
F
 
M
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
M
R
 
W
G
 
G
L
 
L
M
 
N
I
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
E
F
 
L
G
 
V
S
 
K
P
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
T
E
 
K
E
 
E
P
 
P
R
 
D
P
 
S
D
 
D
L
 
A
R
 
A
D
 
T
K
 
K
A
 
V
Q
 
I
R
 
Y
L
 
Y
A
 
A
F
 
F
E
 
A
K
 
H
G
 
G
L
 
V
L
 
V
T
 
I
L
 
I
A
 
T
A
 
L
G
 
A
P
 
G
S
 
N
A
 
I
L
 
L
R
|
R
L
 
F
A
 
Q
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
Q
A
 
L
A
 
D
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
T
S
 
A
L
 
V

5wyaA Structure of amino acid racemase, 2.65 a (see paper)
35% identity, 97% coverage: 13:432/432 of query aligns to 4:432/439 of 5wyaA

query
sites
5wyaA
K
 
K
A
 
A
Q
 
S
E
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
D
R
 
E
G
 
E
E
 
N
K
 
K
V
 
Y
L
 
Y
S
 
A
P
 
R
S
 
S
-
x
A
Y
 
R
V
 
I
R
 
N
P
 
Y
Y
 
Y
P
 
N
F
 
L
V
 
V
P
 
I
A
 
D
R
 
H
G
 
A
Q
 
H
G
 
G
V
 
A
F
 
T
L
 
L
E
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
K
F
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
L
M
 
L
A
 
A
G
 
S
I
x
A
A
 
S
V
 
A
N
 
I
T
 
N
T
 
V
G
 
G
Y
 
H
A
 
T
H
 
H
P
 
E
R
 
K
G
 
V
L
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
K
 
A
A
 
D
Q
 
Q
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
F
 
L
A
 
I
H
 
H
V
 
Y
C
 
T
F
 
P
S
 
A
D
x
Y
F
 
F
T
 
H
H
 
H
E
 
V
P
 
P
T
 
G
L
 
M
S
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
-
A
 
A
K
 
K
V
 
I
G
 
A
G
 
P
G
 
G
Y
 
N
R
 
S
-
 
P
-
 
K
-
 
M
V
 
V
F
 
S
F
 
F
G
 
G
N
 
N
S
|
S
G
|
G
T
x
S
E
 
D
G
 
A
I
 
N
E
 
D
A
 
A
A
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
F
V
 
A
R
 
R
H
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
L
 
V
A
 
S
F
 
Y
T
 
M
G
 
G
A
 
S
F
x
Y
H
|
H
G
 
G
R
 
S
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
L
 
Q
S
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
G
S
 
S
K
 
S
S
 
L
A
 
N
Y
 
M
R
 
T
K
 
R
G
 
K
F
 
I
A
 
G
P
 
P
L
 
M
L
 
L
P
 
P
G
 
S
V
 
V
V
 
V
H
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
D
P
 
S
F
 
Y
R
 
R
P
 
T
P
 
Y
L
 
P
G
 
G
A
 
E
S
 
T
P
 
E
E
 
H
E
 
D
V
 
V
G
 
S
E
 
L
A
 
R
V
 
Y
L
 
F
A
 
N
H
 
E
L
 
F
E
 
K
H
 
K
L
 
P
F
 
F
A
 
E
T
 
S
V
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
A
E
 
D
E
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
C
F
 
V
F
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
I
V
 
I
L
 
K
P
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
E
F
 
Y
L
 
M
P
 
Q
K
 
L
L
 
V
K
 
Y
A
 
K
L
 
F
L
 
C
E
 
H
R
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
F
V
 
A
A
 
I
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
x
N
T
 
Q
G
 
G
A
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
K
F
 
M
L
 
W
A
 
A
L
 
I
E
 
Q
H
 
Q
-
 
F
E
 
K
G
 
D
V
 
I
E
 
E
A
 
P
D
 
D
V
 
L
Y
 
M
V
 
S
L
 
V
A
 
G
K
|
K
G
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
I
F
 
G
R
 
K
E
 
K
E
 
E
-
 
V
L
 
M
G
 
Q
S
 
S
W
 
L
R
 
D
P
 
A
G
 
P
A
 
A
H
 
H
G
 
L
T
x
F
T
|
T
F
 
T
G
 
A
G
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
V
A
 
C
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
S
Q
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
E
-
 
Y
G
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
V
E
 
E
N
 
K
A
 
S
R
 
A
E
 
T
V
 
D
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
L
 
A
L
 
K
A
 
Q
G
 
R
L
 
F
R
 
L
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
F
 
H
P
 
P
F
 
M
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
M
R
 
W
G
 
G
L
 
L
M
 
N
I
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
E
F
 
L
G
 
V
S
 
K
P
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
T
E
 
K
E
 
E
P
 
P
R
 
D
P
 
S
D
 
D
L
 
A
R
 
A
D
 
T
K
 
K
A
 
V
Q
 
I
R
 
Y
L
 
Y
A
 
A
F
 
F
E
 
A
K
 
H
G
 
G
L
 
V
L
 
V
T
 
I
L
 
I
A
 
T
A
 
L
G
 
A
P
 
G
S
 
N
A
 
I
L
 
L
R
|
R
L
 
F
A
 
Q
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
Q
A
 
L
A
 
D
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
T
S
 
A
L
 
V

5wyfA Structure of amino acid racemase, 2.12 a (see paper)
35% identity, 97% coverage: 13:432/432 of query aligns to 6:434/446 of 5wyfA

query
sites
5wyfA
K
 
K
A
 
A
Q
 
S
E
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
D
R
 
E
G
 
E
E
 
N
K
 
K
V
 
Y
L
 
Y
S
 
A
P
 
R
S
 
S
-
x
A
Y
 
R
V
 
I
R
 
N
P
 
Y
Y
 
Y
P
 
N
F
 
L
V
 
V
P
 
I
A
 
D
R
 
H
G
 
A
Q
 
H
G
 
G
V
 
A
F
 
T
L
 
L
E
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
K
F
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
L
M
 
L
A
 
A
G
 
S
I
x
A
A
 
S
V
 
A
N
 
I
T
 
N
T
 
V
G
 
G
Y
 
H
A
 
T
H
 
H
P
 
E
R
 
K
G
 
V
L
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
K
 
A
A
 
D
Q
 
Q
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
F
 
L
A
 
I
H
 
H
V
 
Y
C
 
T
F
 
P
S
 
A
D
x
Y
F
 
F
T
 
H
H
 
H
E
 
V
P
 
P
T
 
G
L
 
M
S
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
-
A
 
A
K
 
K
V
 
I
G
 
A
G
 
P
G
 
G
Y
 
N
R
 
S
-
 
P
-
 
K
-
 
M
V
 
V
F
 
S
F
 
F
G
 
G
N
 
N
S
 
S
G
|
G
T
x
S
E
 
D
G
 
A
I
 
N
E
 
D
A
 
A
A
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
F
V
 
A
R
 
R
H
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
L
 
V
A
 
S
F
 
Y
T
 
M
G
 
G
A
 
S
F
x
Y
H
|
H
G
 
G
R
 
S
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
L
 
Q
S
 
T
L
 
L
T
 
S
A
 
G
S
 
S
K
 
S
S
 
L
A
 
N
Y
 
M
R
 
T
K
 
R
G
 
K
F
 
I
A
 
G
P
 
P
L
 
M
L
 
L
P
 
P
G
 
S
V
 
V
V
 
V
H
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
D
P
 
S
F
 
Y
R
 
R
P
 
T
P
 
Y
L
 
P
G
 
G
A
 
E
S
 
T
P
 
E
E
 
H
E
 
D
V
 
V
G
 
S
E
 
L
A
 
R
V
 
Y
L
 
F
A
 
N
H
 
E
L
 
F
E
 
K
H
 
K
L
 
P
F
 
F
A
 
E
T
 
S
V
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
A
E
 
D
E
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
C
F
 
V
F
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
x
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
I
V
 
I
L
 
K
P
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
E
F
 
Y
L
 
M
P
 
Q
K
 
L
L
 
V
K
 
Y
A
 
K
L
 
F
L
 
C
E
 
H
R
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
F
V
 
A
A
 
I
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
x
N
T
 
Q
G
 
G
A
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
K
F
 
M
L
 
W
A
 
A
L
 
I
E
 
Q
H
 
Q
-
 
F
E
 
K
G
 
D
V
 
I
E
 
E
A
 
P
D
 
D
V
 
L
Y
 
M
V
 
S
L
 
V
A
 
G
K
|
K
G
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
M
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
I
F
 
G
R
 
K
E
 
K
E
 
E
-
 
V
L
 
M
G
 
Q
S
 
S
W
 
L
R
 
D
P
 
A
G
 
P
A
 
A
H
 
H
G
 
L
T
x
F
T
|
T
F
 
T
G
 
A
G
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
V
A
 
C
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
S
Q
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
E
-
 
Y
G
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
V
E
 
E
N
 
K
A
 
S
R
 
A
E
 
T
V
 
D
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
L
 
A
L
 
K
A
 
Q
G
 
R
L
 
F
R
 
L
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
F
 
H
P
 
P
F
 
M
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
M
R
 
W
G
 
G
L
 
L
M
 
N
I
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
E
F
 
L
G
 
V
S
 
K
P
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
T
E
 
K
E
 
E
P
 
P
R
 
D
P
 
S
D
 
D
L
 
A
R
 
A
D
 
T
K
 
K
A
 
V
Q
 
I
R
 
Y
L
 
Y
A
 
A
F
 
F
E
 
A
K
 
H
G
 
G
L
 
V
L
 
V
T
 
I
L
 
I
A
 
T
A
 
L
G
 
A
P
 
G
S
 
N
A
 
I
L
 
L
R
|
R
L
 
F
A
 
Q
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
Q
A
 
L
A
 
D
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
E
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
T
S
 
A
L
 
V

1sffA Structure of gamma-aminobutyrate aminotransferase complex with aminooxyacetate (see paper)
36% identity, 96% coverage: 15:429/432 of query aligns to 4:420/425 of 1sffA

query
sites
1sffA
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
M
A
 
Q
R
 
R
G
 
R
E
 
S
K
 
Q
V
 
A
L
 
I
S
 
P
P
 
R
S
 
G
Y
x
V
V
 
G
R
 
Q
P
 
I
Y
 
H
P
 
P
F
 
I
V
 
F
P
 
A
A
 
D
R
 
R
G
 
A
Q
 
E
G
 
N
V
 
C
F
 
R
L
 
V
E
 
W
D
 
D
V
 
V
D
 
E
G
 
G
N
 
R
V
 
E
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
M
 
A
A
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
L
T
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
H
A
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
K
G
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
E
 
K
R
 
K
F
 
L
A
 
S
H
 
H
V
 
T
C
 
C
F
 
F
S
x
Q
D
 
V
F
 
L
T
 
A
H
 
Y
E
 
E
P
 
P
T
 
Y
L
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
C
E
 
E
R
 
I
L
 
M
V
 
N
A
 
Q
K
 
K
V
 
V
G
 
P
G
 
G
G
 
D
Y
 
F
-
 
A
-
 
K
R
 
K
V
 
T
F
 
L
F
 
L
G
 
V
N
 
T
S
 
T
G
|
G
T
x
S
E
 
E
G
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
N
A
 
A
I
 
V
K
 
K
L
 
I
V
 
A
R
 
R
H
 
A
H
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
P
 
S
Y
 
G
L
 
T
L
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
A
F
x
Y
H
|
H
G
 
G
R
|
R
S
 
T
L
 
H
G
 
Y
A
 
T
L
 
L
S
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
G
S
 
K
K
 
V
S
x
N
A
 
P
Y
 
Y
R
 
S
K
 
A
G
 
G
F
 
M
A
 
G
P
 
-
L
 
L
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
H
V
 
V
H
 
Y
-
 
R
V
 
A
P
 
L
F
 
Y
P
 
P
N
 
C
P
 
P
F
 
L
R
 
H
P
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
I
S
 
S
P
 
E
E
 
D
E
 
D
V
 
A
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
I
A
 
A
H
 
S
L
 
I
E
 
H
H
 
R
L
 
I
F
 
F
A
 
K
T
 
N
V
 
D
L
 
A
P
 
A
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
I
F
 
V
L
 
I
E
|
E
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
V
 
Y
L
 
A
P
 
S
P
 
S
A
 
P
G
 
A
F
 
F
L
 
M
P
 
Q
K
 
R
L
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
C
E
 
D
R
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
M
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
T
F
 
L
L
 
F
A
 
A
L
 
M
E
 
E
H
 
Q
E
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
A
A
 
P
D
 
D
V
 
L
Y
 
T
V
 
T
L
 
F
A
 
A
K
|
K
G
 
S
L
 
I
A
 
A
S
 
G
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
T
F
 
G
R
 
R
E
 
A
E
 
E
-
 
V
L
 
M
G
 
D
S
 
A
W
 
V
R
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
G
H
 
L
G
 
G
T
 
G
T
|
T
F
 
Y
G
 
A
G
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
I
A
 
A
A
 
C
A
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
E
T
 
V
L
 
L
D
 
K
L
 
V
L
 
F
E
 
E
G
 
Q
-
 
E
G
 
N
L
 
L
M
 
L
E
 
Q
N
 
K
A
 
A
R
 
N
E
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
Q
F
 
K
L
 
L
L
 
K
A
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
L
E
 
A
M
 
I
Q
 
A
K
 
E
R
 
K
F
 
H
P
 
P
F
 
E
L
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
A
M
 
M
I
 
I
G
 
A
L
 
I
D
 
E
-
 
L
F
 
F
G
 
E
S
 
D
P
 
G
E
 
D
E
 
H
P
 
N
R
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
A
R
 
K
D
 
L
K
 
T
A
 
A
Q
 
E
R
 
I
L
 
V
-
 
A
-
 
R
A
 
A
F
 
R
E
 
D
K
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
C
G
 
G
P
 
P
-
 
Y
-
x
Y
S
 
N
A
 
V
L
 
L
R
|
R
L
 
I
A
 
L
P
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
T
L
 
I
S
 
E
R
 
D
E
 
A
E
 
Q
A
 
I
A
 
R
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
S
E
 
Q
A
 
C
L
 
F

1sf2A Structure of e. Coli gamma-aminobutyrate aminotransferase (see paper)
36% identity, 96% coverage: 15:429/432 of query aligns to 4:420/425 of 1sf2A

query
sites
1sf2A
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
M
A
 
Q
R
 
R
G
 
R
E
 
S
K
 
Q
V
 
A
L
 
I
S
 
P
P
 
R
S
 
G
Y
x
V
V
 
G
R
 
Q
P
 
I
Y
 
H
P
 
P
F
 
I
V
 
F
P
 
A
A
 
D
R
 
R
G
 
A
Q
 
E
G
 
N
V
 
C
F
 
R
L
 
V
E
 
W
D
 
D
V
 
V
D
 
E
G
 
G
N
 
R
V
 
E
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
M
 
A
A
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
L
T
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
H
A
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
K
G
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
E
 
K
R
 
K
F
 
L
A
 
S
H
 
H
V
 
T
C
 
C
F
 
F
S
 
Q
D
 
V
F
 
L
T
 
A
H
 
Y
E
 
E
P
 
P
T
 
Y
L
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
C
E
 
E
R
 
I
L
 
M
V
 
N
A
 
Q
K
 
K
V
 
V
G
 
P
G
 
G
G
 
D
Y
 
F
-
 
A
-
 
K
R
 
K
V
 
T
F
 
L
F
 
L
G
 
V
N
 
T
S
 
T
G
|
G
T
x
S
E
 
E
G
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
N
A
 
A
I
 
V
K
 
K
L
 
I
V
 
A
R
 
R
H
 
A
H
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
P
 
S
Y
 
G
L
 
T
L
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
A
F
x
Y
H
|
H
G
 
G
R
 
R
S
 
T
L
 
H
G
 
Y
A
 
T
L
 
L
S
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
G
S
 
K
K
 
V
S
x
N
A
 
P
Y