SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_053935988.1 NCBI__GCF_001294205.1:WP_053935988.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

P36683 Aconitate hydratase B; ACN; Aconitase; (2R,3S)-2-methylisocitrate dehydratase; (2S,3R)-3-hydroxybutane-1,2,3-tricarboxylate dehydratase; 2-methyl-cis-aconitate hydratase; Iron-responsive protein-like; IRP-like; RNA-binding protein; EC 4.2.1.3; EC 4.2.1.99 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
73% identity, 100% coverage: 1:859/861 of query aligns to 1:859/865 of P36683

query
sites
P36683
M
 
M
L
 
L
E
 
E
S
 
E
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
H
 
H
V
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
A
P
 
P
L
 
K
P
 
P
L
 
L
T
 
D
A
 
A
Q
 
N
Q
 
Q
T
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
N
 
N
P
 
P
P
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
S
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
L
T
 
T
H
 
N
R
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
Y
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
E
D
 
A
S
 
K
C
 
S
A
 
P
L
 
L
I
 
L
S
 
T
R
 
P
A
 
E
H
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
N
 
N
I
 
I
K
 
H
P
 
P
M
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
A
L
 
L
G
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
K
V
 
L
G
 
A
A
 
P
V
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
S
K
 
H
T
 
T
L
 
L
L
 
L
M
 
M
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
F
 
F
H
 
Y
D
 
D
V
 
V
K
 
E
A
 
E
L
 
K
A
 
A
D
 
K
S
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
E
N
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
Q
V
 
V
L
 
M
Q
 
Q
S
 
S
W
 
W
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
W
 
W
F
 
F
T
 
L
S
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
A
V
 
L
P
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
T
V
 
V
F
 
F
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
N
T
 
T
D
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
W
 
W
S
 
S
R
|
R
P
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
N
 
N
T
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
Q
D
 
P
G
 
G
K
 
V
R
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
I
K
 
K
F
 
Q
L
 
I
Q
 
E
D
 
A
L
 
L
A
 
Q
A
 
Q
K
 
K
G
 
G
H
 
F
A
 
P
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
R
|
R
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
N
 
N
S
 
S
V
 
V
L
 
L
W
 
W
W
 
F
T
 
M
G
 
G
E
 
D
D
 
D
I
 
I
P
 
P
Y
 
H
V
 
V
P
 
P
N
 
N
K
 
K
R
 
R
F
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
I
 
I
F
 
F
F
 
F
N
 
N
T
 
T
Q
 
M
E
 
E
D
 
D
S
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
P
 
P
I
 
I
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Q
 
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
E
 
D
L
 
V
L
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
K
 
R
K
 
N
N
 
H
-
 
E
-
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
L
V
 
L
S
 
A
E
 
T
F
 
F
K
 
E
V
 
L
K
 
K
S
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
I
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
N
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
T
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
H
S
 
S
T
 
D
L
 
V
F
 
F
R
 
R
L
 
Q
P
 
A
T
 
K
A
 
D
P
 
V
V
 
A
T
 
E
S
 
S
T
 
D
K
 
R
G
 
G
F
 
F
T
 
S
Q
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
M
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
C
G
 
G
L
 
V
P
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
P
 
P
G
 
G
T
 
A
Y
 
Y
C
 
C
E
 
E
P
 
P
R
 
K
M
 
M
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
S
Q
|
Q
D
|
D
T
|
T
T
 
T
G
 
G
P
 
P
M
 
M
T
 
T
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
A
C
 
C
L
 
L
G
 
G
F
 
F
S
 
S
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
M
 
M
Q
 
Q
S
 
S
F
 
F
C
 
C
H
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
K
 
N
T
 
T
H
 
H
H
 
H
E
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
D
F
 
F
I
 
I
R
 
M
N
 
N
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
H
S
 
S
W
 
W
L
 
L
N
 
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
D
 
D
S
|
S
H
 
H
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
I
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
S
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
V
M
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
D
M
 
M
P
 
P
E
 
E
S
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
F
K
 
K
G
 
G
E
 
K
L
 
M
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
H
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
E
K
 
K
A
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
K
N
 
N
I
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
S
 
T
V
 
I
R
 
K
L
 
L
D
 
N
K
 
K
E
 
E
P
 
P
I
 
I
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
S
 
S
N
 
N
I
 
I
T
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
W
M
 
M
I
 
I
A
 
A
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
A
 
R
K
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
R
 
R
R
 
R
V
 
I
N
 
Q
A
 
G
M
 
M
E
 
E
A
 
K
W
 
W
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
N
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
E
P
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
E
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
I
K
 
K
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
A
 
C
C
 
A
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
A
K
 
R
V
 
P
L
 
L
S
 
S
E
 
A
V
 
V
A
 
Q
G
 
G
T
 
E
H
 
K
I
 
I
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
S
C
|
C
M
 
M
T
 
T
N
 
N
I
 
I
G
 
G
H
 
H
F
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
D
G
 
A
-
 
H
K
 
K
R
 
G
D
 
Q
I
 
L
P
 
P
V
 
T
K
 
R
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
P
 
P
P
 
P
T
 
T
K
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
S
T
 
V
F
 
F
G
 
G
T
 
K
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
T
 
I
E
 
E
M
 
I
P
 
P
G
 
G
C
|
C
S
 
S
L
 
L
C
|
C
M
 
M
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
S
 
S
T
 
T
S
 
S
T
 
T
R
|
R
N
 
N
F
 
F
P
 
P
N
 
N
R
|
R
L
 
L
G
 
G
K
 
T
N
 
G
T
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
S
 
A
R
 
L
L
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
L
P
 
P
T
 
T
V
 
P
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
M
 
Q
A
 
T
D
 
Y
I
 
V
G
 
A
V
 
Q
I
 
V
N
 
D
E
 
K
K
 
T
G
 
A
A
 
V
E
 
D
V
 
T
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
I
 
L
E
 
S
T
 
Q
Y
 
Y
Q
 
T
A
 
E
E
 
K
A
 
A
D
 
D
T
 
G
V
 
V

1l5jA Crystal structure of e. Coli aconitase b. (see paper)
73% identity, 100% coverage: 1:859/861 of query aligns to 1:859/862 of 1l5jA

query
sites
1l5jA
M
 
M
L
 
L
E
 
E
S
 
E
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
H
 
H
V
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
A
P
 
P
L
 
K
P
 
P
L
 
L
T
 
D
A
 
A
Q
 
N
Q
 
Q
T
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
N
 
N
P
 
P
P
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
S
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
L
T
 
T
H
 
N
R
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
Y
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
E
D
 
A
S
 
K
C
 
S
A
 
P
L
 
L
I
 
L
S
 
T
R
 
P
A
 
E
H
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
G
T
 
T
M
 
M
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
N
 
N
I
 
I
K
 
H
P
 
P
M
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
A
L
 
L
G
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
K
V
 
L
G
 
A
A
 
P
V
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
S
K
 
H
T
 
T
L
 
L
L
 
L
M
 
M
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
F
 
F
H
 
Y
D
 
D
V
 
V
K
 
E
A
 
E
L
 
K
A
 
A
D
 
K
S
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
E
N
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
Q
V
 
V
L
 
M
Q
 
Q
S
 
S
W
 
W
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
W
 
W
F
 
F
T
 
L
S
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
A
V
 
L
P
 
A
Q
 
E
S
 
K
V
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
T
V
 
V
F
 
F
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
N
 
N
T
 
T
D
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
W
 
W
S
 
S
R
 
R
P
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
N
 
N
T
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
Q
D
 
P
G
 
G
K
 
V
R
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
I
K
 
K
F
 
Q
L
 
I
Q
 
E
D
 
A
L
 
L
A
 
Q
A
 
Q
K
 
K
G
 
G
H
 
F
A
 
P
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
R
 
R
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
N
 
N
S
 
S
V
 
V
L
 
L
W
 
W
W
 
F
T
 
M
G
 
G
E
 
D
D
 
D
I
 
I
P
 
P
Y
 
H
V
 
V
P
 
P
N
 
N
K
 
K
R
 
R
F
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
P
I
 
I
F
 
F
F
 
F
N
 
N
T
 
T
Q
 
M
E
 
E
D
 
D
S
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
P
 
P
I
 
I
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
S
Q
 
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
E
 
D
L
 
V
L
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
K
 
R
K
 
N
N
 
H
-
 
E
-
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
L
V
 
L
S
 
A
E
 
T
F
 
F
K
 
E
V
 
L
K
 
K
S
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
I
D
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
N
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
T
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
H
S
 
S
T
 
D
L
 
V
F
 
F
R
 
R
L
 
Q
P
 
A
T
 
K
A
 
D
P
 
V
V
 
A
T
 
E
S
 
S
T
 
D
K
 
R
G
 
G
F
 
F
T
 
S
Q
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
M
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
C
G
 
G
L
 
V
P
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
P
 
P
G
 
G
T
 
A
Y
 
Y
C
 
C
E
 
E
P
 
P
R
 
K
M
 
M
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
P
 
P
M
 
M
T
 
T
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
A
C
 
C
L
 
L
G
 
G
F
 
F
S
 
S
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
M
 
M
Q
 
Q
S
 
S
F
 
F
C
 
C
H
|
H
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
K
 
N
T
 
T
H
 
H
H
 
H
E
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
D
F
 
F
I
 
I
R
 
M
N
 
N
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
|
V
I
 
I
H
 
H
S
 
S
W
 
W
L
 
L
N
 
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
D
|
D
S
 
S
H
|
H
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
I
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
S
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
V
M
 
M
P
 
P
L
 
L
D
 
D
M
 
M
P
 
P
E
 
E
S
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
F
K
 
K
G
 
G
E
 
K
L
 
M
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
H
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
E
K
 
K
A
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
K
N
 
N
I
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
S
 
T
V
 
I
R
 
K
L
 
L
D
 
N
K
 
K
E
 
E
P
 
P
I
 
I
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
S
 
S
N
 
N
I
 
I
T
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
W
M
 
M
I
 
I
A
 
A
N
 
E
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
A
 
R
K
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
E
R
 
R
R
 
R
V
 
I
N
 
Q
A
 
G
M
 
M
E
 
E
A
 
K
W
 
W
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
N
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
E
P
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
E
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
I
K
 
K
E
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
A
 
C
C
 
A
P
 
P
N
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
A
K
 
R
V
 
P
L
 
L
S
 
S
E
 
A
V
 
V
A
 
Q
G
 
G
T
 
E
H
 
K
I
 
I
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
|
S
C
|
C
M
 
M
T
 
T
N
 
N
I
 
I
G
 
G
H
 
H
F
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
D
G
 
A
-
 
H
K
 
K
R
 
G
D
 
Q
I
 
L
P
 
P
V
 
T
K
 
R
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
P
 
P
P
 
P
T
 
T
K
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
S
T
 
V
F
 
F
G
 
G
T
 
K
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
T
 
I
E
 
E
M
 
I
P
 
P
G
 
G
C
|
C
S
 
S
L
 
L
C
|
C
M
 
M
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
S
 
S
T
 
T
S
 
S
T
|
T
R
 
R
N
 
N
F
 
F
P
 
P
N
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
T
N
 
G
T
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
S
 
A
R
 
L
L
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
L
P
 
P
T
 
T
V
 
P
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
M
 
Q
A
 
T
D
 
Y
I
 
V
G
 
A
V
 
Q
I
 
V
N
 
D
E
 
K
K
 
T
G
 
A
A
 
V
E
 
D
V
 
T
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
I
 
L
E
 
S
T
 
Q
Y
 
Y
Q
 
T
A
 
E
E
 
K
A
 
A
D
 
D
T
 
G
V
 
V

4kp1A Crystal structure of ipm isomerase large subunit from methanococcus jannaschii (mj0499) (see paper)
29% identity, 51% coverage: 379:820/861 of query aligns to 1:417/423 of 4kp1A

query
sites
4kp1A
G
 
G
F
 
M
T
 
T
Q
 
I
A
 
V
Q
 
E
K
 
K
M
 
I
V
 
L
G
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
K
E
 
E
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
V
R
 
S
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Y
 
I
C
 
V
E
 
M
P
 
A
R
 
N
M
 
I
T
 
D
S
 
V
V
 
A
G
 
M
S
 
V
Q
 
H
D
 
D
T
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
M
 
L
T
 
T
R
 
V
D
 
N
E
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
Y
A
 
G
C
 
I
L
 
E
G
 
K
-
 
V
F
 
W
S
 
N
A
 
P
D
 
E
L
 
K
V
 
I
M
 
V
Q
 
I
S
 
L
F
 
F
C
x
D
H
|
H
T
 
Q
A
 
V
A
 
P
Y
 
A
P
 
D
K
 
S
P
 
I
V
 
K
D
 
A
V
 
A
K
 
E
T
 
N
H
 
H
H
 
I
E
 
L
L
 
M
P
 
R
E
 
K
F
 
F
I
 
V
R
 
K
N
 
E
R
 
Q
G
 
G
-
 
I
-
 
K
-
 
Y
G
 
F
V
 
Y
S
 
D
L
 
I
R
 
R
P
 
-
G
 
-
D
 
E
G
 
G
V
 
V
I
 
C
H
 
H
S
 
Q
W
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
E
N
 
K
R
 
G
M
 
H
L
 
V
L
 
A
P
 
P
D
 
G
T
 
E
V
 
V
G
 
V
T
 
V
G
 
G
G
 
A
D
|
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
-
 
C
-
 
T
-
 
H
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
G
R
 
A
F
 
F
P
 
A
I
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
G
S
 
S
G
 
T
L
 
D
V
 
M
A
 
A
F
 
H
G
 
V
A
 
F
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
K
M
 
L
P
 
W
L
 
F
D
 
K
M
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
T
V
 
I
L
 
Y
V
 
F
R
 
N
F
 
I
K
 
T
G
 
G
E
 
D
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
G
 
Y
I
 
V
T
 
T
L
 
S
R
 
K
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
L
A
 
S
I
 
I
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
I
G
 
G
L
 
E
L
 
V
T
 
G
V
 
V
A
 
D
K
 
G
A
 
A
G
 
T
-
 
Y
K
 
K
T
 
A
N
 
C
I
 
Q
F
 
F
S
 
G
G
 
G
R
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
G
 
T
L
 
V
P
 
K
K
 
K
L
 
M
K
 
S
V
 
I
E
 
A
Q
 
S
A
 
R
F
 
M
E
 
T
L
 
M
T
 
T
D
 
N
A
 
M
S
 
A
A
 
I
E
 
E
R
 
M
S
 
G
A
 
G
A
 
-
G
 
-
C
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
K
E
 
T
P
 
G
I
 
I
I
 
I
E
 
E
Y
 
P
L
 
D
N
 
E
S
 
K
N
 
T
I
 
I
T
 
Q
L
 
Y
L
 
V
K
 
K
S
 
E
M
 
A
I
 
M
A
 
K
N
 
K
G
 
-
Y
 
H
G
 
G
D
 
T
A
 
E
K
 
R
T
 
P
L
 
F
A
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
N
 
E
L
 
V
I
 
I
E
 
K
P
 
G
D
 
D
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Y
 
F
A
 
A
A
 
E
V
 
V
I
 
Y
E
 
E
I
 
I
D
 
E
L
 
-
A
 
A
D
 
D
V
 
K
K
 
I
E
 
E
P
 
P
I
 
V
L
 
F
A
 
A
C
 
C
P
 
P
N
 
H
D
 
N
P
 
V
D
 
D
D
 
N
V
 
V
K
 
K
V
 
Q
L
 
A
S
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
K
H
 
P
I
 
I
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
F
|
F
I
 
I
G
 
G
S
|
S
C
|
C
M
x
T
T
 
N
-
 
G
N
 
R
I
 
L
G
 
E
H
 
D
F
 
L
R
 
R
A
 
M
A
 
A
G
 
I
K
 
K
L
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
K
K
 
H
R
 
G
D
 
G
I
 
I
P
 
A
-
 
D
-
 
D
V
 
V
K
 
R
L
 
V
W
 
V
I
 
V
A
 
T
P
 
P
P
 
A
T
 
S
K
 
R
M
 
E
D
 
E
A
 
Y
Q
 
L
Q
 
K
L
 
A
T
 
L
E
 
K
E
 
E
G
 
G
Y
 
I
Y
 
I
G
 
E
T
 
K
F
 
F
G
 
L
T
 
K
A
 
Y
G
 
G
A
 
C
R
 
V
T
 
V
E
 
T
M
 
N
P
 
P
G
 
S
C
 
C
S
 
S
L
 
A
C
 
C
M
 
M
G
 
G
N
 
S
Q
 
L
A
 
Y
Q
 
G
V
 
V
R
 
L
-
 
G
E
 
P
G
 
G
A
 
E
T
 
V
V
 
C
V
 
V
S
|
S
T
 
T
S
 
S
T
 
N
R
|
R
N
 
N
F
|
F
P
 
R
N
 
G
R
 
R
L
 
Q
G
 
G
K
 
S
-
 
L
N
 
E
T
 
A
N
 
E
V
 
I
F
 
Y
L
 
L
S
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
I
L
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
A
A
 
C
S
 
A
R
 
V
L
 
K
G
 
G
R
 
E
I
 
L

4nqyA The reduced form of mj0499 (see paper)
28% identity, 51% coverage: 380:820/861 of query aligns to 1:404/409 of 4nqyA

query
sites
4nqyA
F
 
M
T
 
T
Q
 
I
A
 
V
Q
 
E
K
 
K
M
 
I
V
 
L
G
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
K
E
 
E
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
V
R
 
S
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Y
 
I
C
 
V
E
 
M
P
 
A
R
 
N
M
 
I
T
 
D
S
 
V
V
 
A
G
 
M
S
 
V
Q
 
H
D
 
D
T
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
M
 
L
T
 
T
R
 
V
D
 
N
E
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
Y
A
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
W
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
I
C
 
V
L
 
I
G
 
L
F
 
F
S
x
D
A
 
N
D
 
H
L
 
I
V
 
L
M
 
M
Q
 
R
S
 
K
F
 
F
C
 
V
H
 
K
T
 
E
A
 
Q
A
 
G
Y
 
I
P
 
K
K
 
Y
P
 
F
V
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
V
T
 
C
H
 
H
H
 
Q
E
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
F
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
-
R
 
K
G
 
G
G
 
H
V
 
V
S
 
A
L
 
-
R
 
-
P
 
P
G
 
G
D
 
E
G
 
V
V
 
V
I
 
V
H
 
-
S
 
-
W
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
G
G
 
A
D
|
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
-
 
C
-
 
T
-
 
H
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
G
R
 
A
F
 
F
P
 
A
I
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
G
S
 
S
G
 
T
L
 
D
V
 
M
A
 
A
F
 
H
G
 
V
A
 
F
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
K
M
 
L
P
 
W
L
 
F
D
 
K
M
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
T
V
 
I
L
 
Y
V
 
F
R
 
N
F
 
I
K
 
T
G
 
G
E
 
D
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
G
 
Y
I
 
V
T
 
T
L
 
S
R
 
K
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
L
A
 
S
I
 
I
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
I
G
 
G
L
 
E
L
 
V
T
 
G
V
 
V
A
 
D
K
 
G
A
 
A
G
 
T
-
 
Y
K
 
K
T
 
A
N
 
C
I
 
Q
F
 
F
S
 
G
G
 
G
R
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
G
 
T
L
 
V
P
 
K
K
 
K
L
 
M
K
 
S
V
 
I
E
 
A
Q
 
S
A
 
R
F
 
M
E
 
T
L
 
M
T
 
T
D
 
N
A
 
M
S
 
A
A
 
I
E
 
E
R
 
M
S
 
G
A
 
G
A
 
-
G
 
-
C
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
K
E
 
T
P
 
G
I
 
I
I
 
I
E
 
E
Y
 
P
L
 
D
N
 
E
S
 
K
N
 
T
I
 
I
T
 
Q
L
 
Y
L
 
V
K
 
K
S
 
E
M
 
A
I
 
M
A
 
K
N
 
K
G
 
-
Y
 
H
G
 
G
D
 
T
A
 
E
K
 
R
T
 
P
L
 
F
A
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
N
 
E
L
 
V
I
 
I
E
 
K
P
 
G
D
 
D
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Y
 
F
A
 
A
A
 
E
V
 
V
I
 
Y
E
 
E
I
 
I
D
 
E
L
 
-
A
 
A
D
 
D
V
 
K
K
 
I
E
 
E
P
 
P
I
 
V
L
 
F
A
 
A
C
 
C
P
 
P
N
 
H
D
 
N
P
 
V
D
 
D
D
 
N
V
 
V
K
 
K
V
 
Q
L
 
A
S
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
K
H
 
P
I
 
I
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
S
C
 
C
M
 
T
T
 
N
-
 
G
N
 
R
I
 
L
G
 
E
H
 
D
F
 
L
R
 
R
A
 
M
A
 
A
G
 
I
K
 
K
L
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
K
K
 
H
R
 
G
D
 
G
I
 
I
P
 
A
-
 
D
-
 
D
V
 
V
K
 
R
L
 
V
W
 
V
I
 
V
A
 
T
P
 
P
P
 
A
T
 
S
K
 
R
M
 
E
D
 
E
A
 
Y
Q
 
L
Q
 
K
L
 
A
T
 
L
E
 
K
E
 
E
G
 
G
Y
 
I
Y
 
I
G
 
E
T
 
K
F
 
F
G
 
L
T
 
K
A
 
Y
G
 
G
A
 
C
R
 
V
T
 
V
E
 
T
M
 
N
P
 
P
G
 
S
C
|
C
S
 
S
L
 
A
C
|
C
M
 
M
G
 
G
N
 
S
Q
 
L
A
 
Y
Q
 
G
V
 
V
R
 
L
-
 
G
E
 
P
G
 
G
A
 
E
T
 
V
V
 
C
V
 
V
S
 
S
T
 
T
S
 
S
T
 
N
R
|
R
N
 
N
F
 
F
P
 
R
N
 
G
R
 
R
L
 
Q
G
 
G
K
 
S
-
 
L
N
 
E
T
 
A
N
 
E
V
 
I
F
 
Y
L
 
L
S
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
I
L
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
A
A
 
C
S
 
A
R
 
V
L
 
K
G
 
G
R
 
E
I
 
L

O14289 3-isopropylmalate dehydratase; Alpha-IPM isomerase; IPMI; Isopropylmalate isomerase; EC 4.2.1.33 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
25% identity, 40% coverage: 489:830/861 of query aligns to 131:482/758 of O14289

query
sites
O14289
L
 
L
P
 
P
D
 
G
T
 
T
V
 
T
G
 
L
T
 
V
G
 
C
G
 
G
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
R
 
S
F
 
T
P
 
H
I
 
G
G
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
A
I
 
L
S
 
A
F
 
F
P
 
G
A
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
S
L
 
E
V
 
V
A
 
E
F
 
H
G
 
V
A
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
Q
V
 
T
M
 
I
P
 
L
L
 
Q
D
 
R
M
 
K
P
 
S
E
 
K
S
 
N
V
 
M
L
 
R
V
 
I
R
 
R
F
 
V
K
 
N
G
 
G
E
 
K
L
 
L
Q
 
P
P
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
A
L
 
S
R
 
K
D
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
L
A
 
H
I
 
I
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
I
L
 
G
T
 
V
V
 
I
A
 
G
K
 
T
A
 
A
G
 
G
K
 
G
T
 
T
N
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
G
R
 
S
I
 
V
L
 
I
E
 
E
I
 
F
-
 
C
-
 
G
E
 
E
G
 
A
L
 
I
P
 
E
K
 
G
L
 
L
K
 
S
V
 
M
E
 
E
Q
 
A
A
 
R
F
 
M
E
 
S
L
 
M
T
 
C
D
 
N
A
 
M
S
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
A
S
 
G
A
 
A
A
 
R
G
 
A
C
 
G
S
 
M
V
 
I
R
 
A
L
 
P
D
 
D
K
 
A
E
 
T
P
 
-
I
 
T
I
 
F
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
N
 
K
S
 
N
N
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
R
T
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
P
R
 
K
V
 
G
N
 
D
A
 
D
M
 
W
E
 
E
A
 
Q
W
 
A
L
 
V
A
 
A
N
 
Y
P
 
W
N
 
K
L
 
T
I
 
L
E
 
R
P
 
S
D
 
D
A
 
E
D
 
N
A
 
A
E
 
K
Y
 
Y
A
 
D
A
 
I
V
 
E
I
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
N
L
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
K
 
L
E
 
-
P
 
P
I
 
T
L
 
V
A
 
T
C
 
W
P
 
G
N
 
T
D
 
S
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
H
-
 
V
-
 
K
-
 
D
-
 
N
-
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
Q
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
E
-
 
Y
-
 
M
-
 
G
-
 
L
K
 
K
V
 
P
L
 
N
S
 
T
E
 
S
V
 
I
A
 
V
G
 
S
T
 
Y
H
 
P
I
 
I
D
 
D
E
 
K
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
S
C
 
C
M
 
T
-
 
N
T
 
S
N
 
R
I
 
I
G
 
E
H
 
D
F
 
L
R
 
R
A
 
L
A
 
A
G
 
A
K
 
A
L
 
V
L
 
V
E
 
K
G
 
G
K
 
R
R
 
K
-
 
V
D
 
A
I
 
A
P
 
N
V
 
V
K
 
K
-
 
D
L
 
A
W
 
M
I
 
I
A
 
V
P
 
P
P
 
G
T
 
S
K
 
G
M
 
L
D
 
V
A
 
K
Q
 
K
Q
 
M
L
 
A
T
 
E
E
 
A
E
 
E
G
 
G
Y
 
L
Y
 
D
G
 
Q
T
 
I
F
 
F
G
 
I
T
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
F
R
 
D
T
 
W
E
 
R
M
 
E
P
 
A
G
 
G
C
 
C
S
 
S
L
 
M
C
 
C
M
 
L
G
 
G
-
 
M
N
 
N
Q
 
P
A
 
D
Q
 
Q
V
 
L
R
 
K
E
 
P
G
 
Y
A
 
E
T
 
R
V
 
C
V
 
A
S
 
S
T
 
T
S
 
S
T
 
N
R
 
R
N
 
N
F
 
F
P
 
E
N
 
G
R
 
R
L
 
Q
G
 
G
K
 
A
N
 
K
T
 
G
N
 
R
V
 
T
F
 
H
L
 
L
S
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
I
 
A
A
 
A
S
 
A
R
 
I
L
 
K
G
 
G
R
 
H
I
 
L
P
 
C
T
 
N
V
 
V
A
 
R
E
 
E
Y
 
F
M
 
F
A
 
G
D
 
D
I
 
V

Sites not aligning to the query:

P19414 Aconitate hydratase, mitochondrial; Aconitase; Citrate hydro-lyase; EC 4.2.1.3 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
25% identity, 51% coverage: 380:817/861 of query aligns to 59:502/778 of P19414

query
sites
P19414
F
 
F
T
 
T
Q
 
Y
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
M
 
I
V
 
L
G
 
Y
R
 
G
A
 
H
V
 
L
G
 
D
L
 
D
P
 
P
E
 
H
G
 
G
Q
 
Q
G
 
D
V
 
I
R
 
Q
P
 
R
G
 
G
-
 
V
T
 
S
Y
 
Y
C
 
L
E
 
K
P
 
L
R
 
R
M
 
P
T
 
D
S
 
R
V
 
V
G
 
A
S
 
C
Q
 
Q
D
 
D
T
 
A
T
 
T
G
 
A
P
 
Q
M
 
M
T
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
A
C
 
I
L
 
L
G
 
Q
F
 
F
S
 
M
A
 
S
D
 
A
L
 
G
V
 
L
M
 
P
Q
 
Q
S
 
-
F
 
-
C
 
-
H
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
V
P
 
A
K
 
K
P
 
P
V
 
V
D
 
T
V
 
V
K
 
H
T
 
C
H
 
D
H
 
H
-
 
L
-
 
I
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
N
-
 
K
E
 
E
L
 
V
P
 
Y
E
 
D
F
 
F
I
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
K
R
 
Y
N
 
N
R
 
M
G
 
G
G
 
-
V
 
-
S
 
F
L
 
W
R
 
K
P
 
P
G
 
G
D
 
S
G
 
G
V
 
I
I
 
I
H
 
H
S
 
Q
W
 
I
-
 
V
L
 
L
N
 
E
R
 
N
M
 
Y
L
 
A
L
 
F
P
 
P
D
 
G
T
 
A
V
 
L
G
 
I
T
 
I
G
 
G
G
 
T
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
R
 
P
F
 
N
P
 
A
I
 
G
G
 
G
I
 
L
S
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
G
S
 
Q
G
 
L
L
 
A
V
 
I
A
 
G
F
 
V
G
 
G
A
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
P
M
 
W
P
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
A
P
 
P
E
 
K
S
 
I
V
 
L
L
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
L
K
 
T
G
 
G
E
 
K
L
 
M
Q
 
N
P
 
G
G
 
W
I
 
T
T
 
S
L
 
P
R
 
K
D
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
L
K
 
K
A
 
L
G
 
A
L
 
G
L
 
I
T
 
T
V
 
T
A
 
V
K
 
K
A
 
G
G
 
G
K
 
-
T
 
-
N
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
L
 
V
E
 
E
I
 
Y
-
 
F
-
 
G
E
 
D
G
 
G
L
 
V
P
 
D
K
 
T
L
 
F
K
 
S
V
 
A
E
 
T
Q
 
G
A
 
M
F
 
G
E
 
T
L
 
I
T
 
C
D
 
N
A
 
M
S
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
I
S
 
G
A
 
A
A
 
T
G
 
T
C
 
S
S
 
V
V
 
F
R
 
P
L
 
F
D
 
N
K
 
K
E
 
S
P
 
-
I
 
M
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
N
 
E
S
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
A
N
 
T
G
 
G
Y
 
R
G
 
G
D
 
K
A
 
I
K
 
A
T
 
D
L
 
F
A
 
A
R
 
K
R
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
L
A
 
Y
N
 
H
P
 
K
N
 
D
L
 
L
I
 
L
E
 
S
P
 
A
D
 
D
A
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
D
A
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
-
D
 
N
V
 
T
K
 
L
E
 
E
P
 
P
I
 
Y
L
 
I
A
 
N
C
 
G
P
 
P
N
 
F
D
 
T
P
 
P
D
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
T
D
 
P
V
 
V
K
 
S
V
 
K
L
 
M
S
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
V
T
 
A
H
 
N
-
 
N
-
 
W
-
 
P
-
 
L
-
 
D
I
 
V
D
 
R
E
 
V
V
 
G
F
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
S
C
 
C
M
 
-
T
 
T
N
 
N
I
 
S
G
 
S
H
 
Y
-
 
E
-
 
D
-
 
M
-
 
S
-
 
R
-
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
V
F
 
K
R
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
A
K
 
H
L
 
G
L
 
L
E
 
K
G
 
S
K
 
K
R
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
T
K
 
I
L
 
F
W
 
T
I
 
V
A
 
T
P
 
P
P
 
G
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
D
 
I
A
 
R
Q
 
A
Q
 
T
L
 
I
T
 
E
E
 
R
E
 
D
G
 
G
Y
 
Q
Y
 
L
G
 
E
T
 
T
F
 
F
G
 
K
T
 
E
A
 
F
G
 
G
A
 
G
R
 
I
T
 
V
E
 
L
M
 
A
P
 
N
G
 
A
C
 
C
S
 
G
L
 
P
C
 
C
M
 
I
G
 
G
-
 
Q
-
 
W
N
 
D
Q
 
R
A
 
R
Q
 
D
V
 
I
R
 
K
E
 
K
G
 
G
-
 
D
-
 
K
A
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
S
S
 
Y
T
 
N
R
 
R
N
 
N
F
 
F
P
 
T
N
 
S
R
 
R
L
 
N
G
 
D
K
 
G
N
 
N
-
 
P
-
 
Q
T
 
T
N
 
H
V
 
A
F
 
F
L
 
V
S
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
F
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
G
R
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P39533 Homocitrate dehydratase, mitochondrial; Aconitase 2; EC 4.2.1.- from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
27% identity, 43% coverage: 452:818/861 of query aligns to 138:505/789 of P39533

query
sites
P39533
P
 
P
V
 
S
D
 
S
V
 
I
K
 
A
T
 
T
H
 
N
H
 
Q
E
 
E
L
 
V
P
 
F
E
 
D
F
 
F
I
 
L
R
 
E
N
 
S
-
 
C
-
 
A
-
 
K
R
 
R
G
 
Y
G
 
G
V
 
I
S
 
Q
L
 
F
R
 
W
-
 
G
P
 
P
G
 
G
D
 
S
G
 
G
V
 
I
I
 
I
H
 
H
S
 
Q
W
 
I
-
 
V
L
 
L
N
 
E
R
 
N
M
 
F
L
 
S
L
 
A
P
 
P
D
 
G
T
 
L
V
 
M
G
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
T
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
R
 
P
F
 
N
P
 
A
I
 
G
G
 
G
I
 
L
S
 
G
F
 
A
P
 
I
A
 
A
-
 
I
-
 
G
G
 
V
S
 
G
G
 
G
L
 
A
V
 
D
A
 
A
F
 
V
G
 
D
A
 
A
A
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
T
-
 
P
M
 
W
P
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
A
P
 
P
E
 
K
S
 
I
V
 
L
L
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
L
K
 
T
G
 
G
E
 
K
L
 
L
Q
 
N
P
 
G
G
 
W
I
 
S
T
 
T
L
 
P
R
 
K
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
T
A
 
K
I
 
L
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
-
K
 
R
A
 
G
G
 
G
K
 
-
T
 
-
N
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
T
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
L
 
V
E
 
E
I
 
Y
-
 
F
-
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
V
P
 
S
K
 
T
L
 
L
K
 
S
V
 
C
E
 
T
Q
 
G
A
 
M
F
 
A
E
 
T
L
 
I
T
 
C
D
 
N
A
 
M
S
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
I
S
 
G
A
 
A
A
 
T
G
 
T
C
 
S
S
 
T
V
 
F
R
 
P
L
 
Y
D
 
-
K
 
Q
E
 
E
P
 
A
I
 
H
I
 
K
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
Q
S
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
A
K
 
T
T
 
N
L
 
R
A
 
A
R
 
E
R
 
V
V
 
A
N
 
E
A
 
A
M
 
A
E
 
D
A
 
V
W
 
A
L
 
L
A
 
N
N
 
K
P
 
F
N
 
N
L
 
F
I
 
L
E
 
R
P
 
A
D
 
D
A
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
S
D
 
A
V
 
I
K
 
-
E
 
E
P
 
P
I
 
H
L
 
V
A
 
N
C
 
G
P
 
P
N
 
F
D
 
T
P
 
P
D
 
D
D
 
L
V
 
S
K
 
T
V
 
P
L
 
I
S
 
S
E
 
Q
V
 
Y
A
 
A
G
 
E
T
 
K
H
 
S
I
 
L
D
 
K
E
 
E
V
 
N
F
 
W
-
 
P
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
S
C
 
C
-
 
T
-
 
N
-
 
S
-
 
S
-
 
Y
-
 
Q
-
 
D
M
 
M
T
 
S
N
 
R
I
 
V
G
 
V
H
 
D
F
 
L
R
 
V
A
 
K
A
 
Q
G
 
A
K
 
S
L
 
K
L
 
A
E
 
G
G
 
L
K
 
K
R
 
P
D
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
-
K
 
-
L
 
F
W
 
F
I
 
V
A
 
T
P
 
P
P
 
G
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
D
 
I
A
 
R
Q
 
A
Q
 
T
L
 
L
T
 
E
E
 
R
E
 
D
G
 
G
Y
 
I
Y
 
I
G
 
D
T
 
I
F
 
F
G
 
Q
T
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
K
T
 
V
E
 
L
M
 
A
P
 
N
G
 
A
C
 
C
S
 
G
L
 
P
C
 
C
M
 
I
G
 
G
-
 
Q
-
 
W
N
 
N
Q
 
R
A
 
E
Q
 
D
V
 
V
-
 
S
-
 
K
-
 
T
-
 
S
R
 
K
E
 
E
G
 
T
A
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
F
S
 
T
T
 
S
S
 
F
T
 
N
R
 
R
N
 
N
F
 
F
P
 
R
N
 
A
R
 
R
L
 
N
-
 
D
-
 
G
G
 
N
K
 
R
N
 
N
T
 
T
N
 
M
V
 
N
F
 
F
L
 
L
S
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
T
I
 
A
A
 
M
S
 
S
R
 
Y
L
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P16276 Aconitate hydratase, mitochondrial; Aconitase; Citrate hydro-lyase; EC 4.2.1.3 from Sus scrofa (Pig) (see 3 papers)
25% identity, 40% coverage: 474:817/861 of query aligns to 167:505/781 of P16276

query
sites
P16276
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
S
G
 
G
V
 
I
I
 
I
H
 
H
S
 
Q
W
 
I
-
 
I
L
 
L
N
 
E
R
 
N
M
 
Y
L
 
A
L
 
Y
P
 
P
D
 
G
T
 
V
V
 
L
G
 
L
T
 
I
G
 
G
G
 
T
D
|
D
S
|
S
H
|
H
T
 
T
R
 
-
F
 
-
P
 
P
I
 
N
G
 
G
I
 
G
S
 
G
F
 
L
P
 
G
A
 
G
G
 
I
S
 
C
G
 
I
L
 
G
V
 
V
A
 
G
F
 
G
G
 
A
A
 
D
A
 
A
T
 
V
G
 
D
V
 
V
M
 
M
-
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
W
P
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
C
P
 
P
E
 
K
S
 
V
V
 
I
L
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
L
K
 
T
G
 
G
E
 
S
L
 
L
Q
 
S
P
 
G
G
 
W
I
 
T
T
 
S
L
 
P
R
 
K
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
L
A
 
K
I
 
V
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
-
K
 
K
A
 
G
G
 
G
K
 
-
T
 
-
N
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
I
L
 
V
E
 
E
I
 
Y
E
 
H
G
 
G
L
 
P
P
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
G
L
 
V
T
 
D
D
 
S
A
 
I
S
 
S
A
 
C
E
 
T
R
 
G
S
 
M
A
 
A
A
 
T
G
 
I
C
 
C
S
 
N
V
 
M
R
 
G
L
 
A
D
 
E
K
 
I
E
 
G
P
 
A
I
 
T
I
 
T
E
 
S
Y
 
V
L
 
F
N
 
P
S
 
Y
N
 
N
I
 
H
T
 
R
L
 
M
L
 
K
K
 
K
S
 
Y
M
 
L
I
 
S
A
 
K
N
 
T
G
 
G
Y
 
R
G
 
A
D
 
D
A
 
I
K
 
A
T
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
D
R
 
E
V
 
F
N
 
K
A
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
N
 
D
L
 
H
I
 
L
E
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
P
D
 
G
A
 
C
E
 
H
Y
 
Y
A
 
D
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
E
 
E
I
 
I
D
 
N
L
 
L
A
 
S
D
 
E
V
 
L
K
 
K
E
 
-
P
 
P
I
 
H
L
 
I
A
 
N
C
 
G
P
 
P
N
 
F
D
 
T
P
 
P
D
 
D
D
 
L
V
 
A
K
 
H
V
 
P
L
 
V
S
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
G
G
 
S
T
 
V
H
 
A
I
 
E
D
 
K
E
 
E
V
 
G
F
 
W
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
G
-
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
S
C
|
C
M
 
T
T
 
N
-
 
S
-
 
S
-
 
Y
-
 
E
N
 
D
I
 
M
G
 
G
H
 
R
F
 
S
R
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
K
 
K
-
 
Q
-
 
A
L
 
L
L
 
A
E
 
H
G
 
G
K
 
L
R
 
K
D
 
-
I
 
C
P
 
K
V
 
S
K
 
Q
L
 
F
W
 
T
I
 
I
A
 
T
P
 
P
P
 
G
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
D
 
I
A
 
R
Q
 
A
Q
 
T
L
 
I
T
 
E
E
 
R
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
A
G
 
Q
T
 
V
F
 
L
G
 
R
T
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
G
R
 
I
T
 
V
E
 
L
M
 
A
P
 
N
G
 
A
C
|
C
S
 
G
L
 
P
C
|
C
M
 
I
G
 
G
-
 
Q
-
 
W
N
 
D
Q
 
R
A
 
K
Q
 
D
V
 
I
R
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
E
-
 
K
-
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
V
S
 
T
T
 
S
S
 
Y
T
 
N
R
|
R
N
 
N
F
 
F
P
 
T
N
 
G
R
|
R
L
 
N
G
 
D
K
 
A
N
 
N
-
 
P
-
 
E
T
 
T
N
 
H
V
 
A
F
 
F
L
 
V
S
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
G
R
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1b0kA S642a:fluorocitrate complex of aconitase (see paper)
25% identity, 40% coverage: 474:817/861 of query aligns to 139:477/753 of 1b0kA

query
sites
1b0kA
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
S
G
 
G
V
 
I
I
 
I
H
 
H
S
 
Q
W
 
I
-
 
I
L
 
L
N
 
E
R
 
N
M
 
Y
L
 
A
L
 
Y
P
 
P
D
 
G
T
 
V
V
 
L
G
 
L
T
 
I
G
 
G
G
 
T
D
|
D
S
|
S
H
|
H
T
 
T
R
 
-
F
 
-
P
 
P
I
 
N
G
 
G
I
 
G
S
 
G
F
 
L
P
 
G
A
 
G
G
 
I
S
 
C
G
 
I
L
 
G
V
 
V
A
 
G
F
 
G
G
 
A
A
 
D
A
 
A
T
 
V
G
 
D
V
 
V
M
 
M
-
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
W
P
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
C
P
 
P
E
 
K
S
 
V
V
 
I
L
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
L
K
 
T
G
 
G
E
 
S
L
 
L
Q
 
S
P
 
G
G
 
W
I
 
T
T
 
S
L
 
P
R
 
K
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
L
A
 
K
I
 
V
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
-
K
 
K
A
 
G
G
 
G
K
 
-
T
 
-
N
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
I
L
 
V
E
 
E
I
 
Y
E
 
H
G
 
G
L
 
P
P
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
G
L
 
V
T
 
D
D
 
S
A
 
I
S
 
S
A
 
C
E
 
T
R
 
G
S
 
M
A
 
A
A
 
T
G
 
I
C
 
C
S
 
N
V
 
M
R
 
G
L
 
A
D
 
E
K
 
I
E
 
G
P
 
A
I
 
T
I
 
T
E
 
S
Y
 
V
L
 
F
N
 
P
S
 
Y
N
 
N
I
 
H
T
 
R
L
 
M
L
 
K
K
 
K
S
 
Y
M
 
L
I
 
S
A
 
K
N
 
T
G
 
G
Y
 
R
G
 
A
D
 
D
A
 
I
K
 
A
T
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
D
R
 
E
V
 
F
N
 
K
A
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
N
 
D
L
 
H
I
 
L
E
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
P
D
 
G
A
 
C
E
 
H
Y
 
Y
A
 
D
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
E
 
E
I
 
I
D
 
N
L
 
L
A
 
S
D
 
E
V
 
L
K
 
K
E
 
-
P
 
P
I
 
H
L
 
I
A
 
N
C
 
G
P
 
P
N
 
F
D
 
T
P
 
P
D
 
D
D
 
L
V
 
A
K
 
H
V
 
P
L
 
V
S
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
G
G
 
S
T
 
V
H
 
A
I
 
E
D
 
K
E
 
E
V
 
G
F
 
W
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
G
-
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
C
|
C
M
 
T
T
 
N
-
 
S
-
 
S
-
 
Y
-
 
E
N
 
D
I
 
M
G
 
G
H
 
R
F
 
S
R
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
K
 
K
-
 
Q
-
 
A
L
 
L
L
 
A
E
 
H
G
 
G
K
 
L
R
 
K
D
 
-
I
 
C
P
 
K
V
 
S
K
 
Q
L
 
F
W
 
T
I
 
I
A
 
T
P
 
P
P
 
G
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
D
 
I
A
 
R
Q
 
A
Q
 
T
L
 
I
T
 
E
E
 
R
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
A
G
 
Q
T
 
V
F
 
L
G
 
R
T
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
G
R
 
I
T
 
V
E
 
L
M
 
A
P
 
N
G
 
A
C
|
C
S
 
G
L
 
P
C
|
C
M
 
I
G
 
G
-
 
Q
-
 
W
N
 
D
Q
 
R
A
 
K
Q
 
D
V
 
I
R
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
E
-
 
K
-
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
V
S
 
T
T
 
S
S
 
Y
T
 
N
R
|
R
N
 
N
F
 
F
P
 
T
N
 
G
R
|
R
L
 
N
G
 
D
K
 
A
N
 
N
-
 
P
-
 
E
T
 
T
N
 
H
V
 
A
F
 
F
L
 
V
S
 
T
S
 
S
A
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
G
R
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5acnA Structure of activated aconitase. Formation of the (4fe-4s) cluster in the crystal (see paper)
25% identity, 40% coverage: 474:817/861 of query aligns to 140:478/754 of 5acnA

query
sites
5acnA
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
S
G
 
G
V
x
I
I
 
I
H
|
H
S
 
Q
W
 
I
-
 
I
L
 
L
N
 
E
R
 
N
M
 
Y
L
 
A
L
 
Y
P
 
P
D
 
G
T
 
V
V
 
L
G
 
L
T
 
I
G
 
G
G
 
T
D
|
D
S
 
S
H
|
H
T
 
T
R
 
-
F
 
-
P
 
P
I
 
N
G
 
G
I
 
G
S
 
G
F
 
L
P
 
G
A
 
G
G
 
I
S
 
C
G
 
I
L
 
G
V
 
V
A
 
G
F
 
G
G
 
A
A
 
D
A
 
A
T
 
V
G
 
D
V
 
V
M
 
M
-
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
W
P
 
E
L
 
L
D
x
K
M
 
C
P
 
P
E
 
K
S
 
V
V
 
I
L
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
L
K
 
T
G
 
G
E
 
S
L
 
L
Q
 
S
P
 
G
G
 
W
I
 
T
T
 
S
L
 
P
R
 
K
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
L
A
 
K
I
 
V
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
-
K
 
K
A
 
G
G
 
G
K
 
-
T
 
-
N
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
T
G
|
G