SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_053936590.1 NCBI__GCF_001294205.1:WP_053936590.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
51% identity, 100% coverage: 2:246/246 of query aligns to 4:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
R
L
 
L
K
 
Q
N
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
H
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
V
F
 
F
V
 
M
T
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
C
 
A
D
|
D
V
x
F
N
 
N
R
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
V
 
A
V
 
G
S
 
K
E
 
E
L
 
A
I
 
V
A
 
E
Q
 
A
G
 
N
G
 
P
Q
 
G
A
 
V
L
 
V
G
 
F
F
 
I
E
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
D
K
 
R
A
 
E
Q
 
S
I
 
V
A
 
H
A
 
R
M
 
L
V
 
V
A
 
E
G
 
N
T
 
V
Q
 
A
Q
 
E
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
V
 
T
A
 
R
D
|
D
A
 
S
Q
 
M
L
 
L
S
 
S
K
|
K
M
 
M
T
 
T
E
 
V
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
N
 
H
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
L
D
 
P
I
 
Y
M
 
M
I
 
A
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
S
 
K
G
 
G
V
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
T
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
|
N
F
x
V
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
V
x
T
A
 
E
T
|
T
P
 
A
I
x
M
L
 
V
K
 
A
D
 
E
M
 
V
P
 
P
D
 
E
K
 
K
V
 
V
I
 
I
Q
 
E
G
x
K
M
 
M
E
 
K
E
 
A
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
A
Y
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S
S
 
D
Y
 
Y
I
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
H
A
 
V
I
 
L
E
 
H
V
 
V
T
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
M
L
 
M

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
51% identity, 98% coverage: 5:246/246 of query aligns to 1:251/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
N
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
H
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
L
K
 
E
F
 
F
V
 
A
T
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
Y
R
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
A
C
 
W
D
|
D
V
x
L
N
 
A
R
 
E
A
 
E
G
 
A
V
 
G
D
 
A
A
 
A
V
 
L
V
 
I
S
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
A
A
 
D
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
S
A
 
A
L
 
D
G
 
F
F
 
A
E
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
A
K
 
A
A
 
E
Q
 
S
I
 
V
A
 
E
A
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
E
T
 
I
Q
 
I
Q
 
A
Q
 
E
F
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
V
 
L
A
 
H
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
L
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
V
S
 
K
K
 
K
M
 
M
T
 
A
E
 
E
D
 
A
Q
 
Q
F
 
F
D
 
D
R
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
N
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
A
D
 
P
I
 
H
M
 
M
I
 
I
E
 
A
Q
 
A
Q
 
K
S
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
F
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
T
K
 
K
T
 
V
W
 
W
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
K
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
P
 
E
I
 
M
L
 
V
K
 
Q
D
 
Q
M
 
M
P
 
P
D
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
L
Q
 
E
G
 
A
M
 
M
E
 
V
E
 
A
R
 
R
V
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
G
R
 
R
M
 
I
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
R
V
 
A
Y
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
T
A
 
T
I
 
L
E
 
S
V
 
V
T
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
L
 
V

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
46% identity, 100% coverage: 2:246/246 of query aligns to 2:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
K
 
K
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
H
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
L
K
 
A
F
 
Y
V
 
A
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
A
C
 
G
D
|
D
V
x
L
N
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
G
E
 
D
L
 
L
I
 
T
A
 
Y
Q
 
S
G
 
H
G
 
P
Q
 
N
A
 
V
L
 
E
G
 
G
F
 
M
E
 
Y
V
x
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
N
 
D
K
 
V
A
 
T
Q
 
G
I
 
V
A
 
E
A
 
K
M
 
F
V
 
Y
A
 
Q
G
 
S
T
 
V
Q
 
I
Q
 
D
Q
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
V
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
A
Q
 
M
L
 
T
S
 
R
K
 
K
M
 
M
T
 
T
E
 
E
D
 
A
Q
 
Q
F
 
W
D
 
D
R
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
N
 
N
C
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
L
V
 
V
V
 
G
D
 
P
I
 
Q
M
 
M
I
 
Q
E
 
T
Q
 
N
Q
 
G
S
 
Y
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
N
F
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
V
 
T
K
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
A
K
 
L
K
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
V
x
I
A
 
M
T
|
T
P
 
D
I
 
I
L
 
L
K
 
K
D
 
T
M
 
V
P
 
P
D
 
Q
K
 
D
V
 
L
I
 
L
Q
 
D
G
 
K
M
 
F
E
 
A
E
 
A
R
 
L
V
 
T
P
 
M
L
 
L
R
 
N
R
 
R
M
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
K
V
 
V
Y
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
N
V
 
V
T
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
R
L
 
L

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
43% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 5:249/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
K
 
R
L
 
L
K
 
R
N
 
S
K
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
H
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
S
R
 
V
K
 
R
F
 
L
V
 
A
T
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
A
V
 
A
C
 
C
D
|
D
V
x
L
N
 
D
R
 
R
A
 
A
G
 
A
V
 
A
D
 
Q
A
 
E
V
 
T
V
 
V
S
 
R
E
 
L
L
 
L
I
 
G
A
 
G
Q
 
P
G
 
G
G
 
S
Q
 
N
A
 
H
L
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
Q
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
E
K
 
A
A
 
R
Q
 
A
I
 
A
A
 
R
A
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
G
 
Q
T
 
V
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
C
F
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
P
-
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
V
 
T
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
Q
 
F
L
 
L
S
 
L
K
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
I
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
Y
 
F
N
 
L
C
 
V
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
A
D
 
Q
I
 
A
M
 
L
I
 
V
E
 
S
Q
 
N
Q
 
G
S
 
C
-
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
K
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
V
 
T
K
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
K
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
P
 
P
I
x
M
L
 
T
K
 
Q
D
 
K
M
 
V
P
 
P
D
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
V
Q
 
D
G
 
K
M
 
I
E
 
T
E
 
E
R
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
M
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
D
V
 
V
Y
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
T
A
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L

4cqmA Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
44% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 3:246/248 of 4cqmA

query
sites
4cqmA
K
 
R
L
 
L
K
 
R
N
 
S
K
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
H
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
S
R
 
V
K
 
R
F
 
L
V
 
A
T
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
A
V
 
A
C
 
C
D
|
D
V
x
L
N
 
D
R
 
R
A
 
A
G
 
A
V
 
A
D
 
Q
A
 
E
V
 
T
V
 
V
S
 
R
E
 
L
L
 
L
I
 
P
A
 
P
Q
 
R
G
 
G
G
 
N
Q
 
H
A
 
A
L
 
-
G
 
A
F
 
F
E
 
Q
V
x
A
D
 
D
V
|
V
T
 
S
N
 
E
K
 
A
A
 
R
Q
 
A
I
 
A
A
 
R
A
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
G
 
Q
T
 
V
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
C
F
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
P
-
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
V
 
T
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
Q
 
F
L
 
L
S
 
L
K
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
I
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
Y
 
F
N
 
L
C
 
V
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
A
D
 
Q
I
 
A
M
 
L
I
 
V
E
 
S
Q
 
N
Q
 
G
S
 
C
-
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
K
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
V
 
T
K
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
K
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
|
T
P
|
P
I
x
M
L
x
T
K
 
Q
D
 
K
M
 
V
P
 
P
D
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
V
Q
 
D
G
 
K
M
 
I
E
 
T
E
 
E
R
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
M
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
D
V
 
V
Y
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
T
A
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
45% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
K
 
K
L
 
M
K
 
-
N
 
T
K
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
H
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
R
 
L
K
 
Q
F
 
L
V
 
A
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
V
 
A
V
 
V
C
 
-
D
 
-
V
 
-
N
 
N
R
 
Y
A
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
K
V
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
S
 
E
E
 
E
L
 
I
I
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
G
 
V
Q
 
D
A
 
S
L
 
F
G
 
A
F
 
I
E
 
Q
V
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
N
 
D
K
 
A
A
 
D
Q
 
E
I
 
V
A
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
G
 
E
T
 
V
Q
 
V
Q
 
S
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
T
A
 
R
D
 
D
A
 
N
Q
 
L
L
 
L
S
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
D
 
Q
Q
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
N
 
N
C
 
C
T
 
I
R
 
Q
A
 
K
V
 
A
V
 
T
D
 
P
I
 
Q
M
 
M
I
 
L
E
 
R
Q
 
Q
Q
 
R
S
 
S
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
A
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
V
 
T
K
 
K
T
 
S
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
V
T
 
S
P
 
D
I
 
M
L
 
T
K
 
D
D
 
A
M
 
L
P
 
S
D
 
D
K
 
E
V
 
L
I
 
K
Q
 
E
G
 
Q
M
 
M
E
 
L
E
 
T
R
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
H
V
 
V
T
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
L
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
45% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 4:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
K
 
K
L
 
L
K
 
A
N
 
S
K
 
K
V
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
H
 
F
A
 
G
T
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
V
F
 
L
V
 
A
T
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
I
C
 
A
D
|
D
V
x
R
N
 
D
R
 
A
A
 
H
G
 
G
V
 
-
D
 
E
A
 
A
V
 
A
V
 
A
S
 
A
E
 
S
L
 
L
I
 
R
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
F
F
 
I
E
 
S
V
x
C
D
 
N
V
x
I
T
 
A
N
 
E
K
 
K
A
 
T
Q
 
Q
I
 
V
A
 
E
A
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
S
G
 
Q
T
 
A
Q
 
E
Q
 
E
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
V
 
N
A
 
R
D
 
D
A
 
A
Q
 
M
L
 
L
S
 
H
K
 
K
M
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
A
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
T
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
Y
 
F
N
 
L
C
 
C
T
 
M
R
 
Q
A
 
Q
V
 
A
V
 
A
D
 
I
I
 
R
M
 
M
I
 
R
E
 
E
Q
 
R
Q
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
A
V
 
S
G
 
W
L
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
K
K
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
x
I
A
 
D
T
|
T
P
 
D
I
 
M
L
x
T
K
 
R
D
 
G
M
 
V
P
 
P
D
 
E
K
 
N
V
 
V
I
 
W
Q
 
Q
G
 
I
M
 
M
E
 
V
E
 
S
R
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
Y
M
 
A
A
 
G
Q
 
E
P
 
A
E
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
N
 
E
V
 
C
Y
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
G
A
 
A
S
 
R
Y
 
Y
I
 
I
S
 
N
G
 
G
A
 
E
A
 
V
I
 
I
E
 
N
V
 
V
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
L
 
L

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
46% identity, 98% coverage: 6:246/246 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
H
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
R
 
L
K
 
Q
F
 
L
V
 
A
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
V
 
A
V
 
V
C
 
-
D
 
-
V
 
-
N
|
N
R
x
Y
A
|
A
G
|
G
-
x
S
-
 
K
-
 
E
-
 
K
V
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
S
 
E
E
 
E
L
 
I
I
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
G
 
V
Q
 
D
A
 
S
L
 
F
G
 
A
F
 
I
E
 
Q
V
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
N
 
D
K
 
A
A
 
D
Q
 
E
I
 
V
A
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
G
 
E
T
 
V
Q
 
V
Q
 
S
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
V
 
T
A
 
R
D
 
D
A
 
N
Q
 
L
L
 
L
S
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
D
 
Q
Q
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
x
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
N
 
N
C
 
C
T
 
I
R
 
Q
A
 
K
V
 
A
V
 
T
D
 
P
I
 
Q
M
 
M
I
 
L
E
 
R
Q
 
Q
Q
 
R
S
 
S
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
A
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
V
 
T
K
 
K
T
 
S
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
I
 
I
L
 
V
K
 
S
D
 
D
M
 
M
P
 
T
D
 
D
K
 
E
V
 
L
I
 
K
Q
 
E
G
 
Q
M
 
M
E
 
L
E
 
T
R
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
H
V
 
V
T
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
L
 
M

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
43% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
|
M
K
 
G
L
 
I
K
 
Q
N
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
H
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
L
K
 
R
F
 
F
V
 
A
T
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
C
 
N
D
|
D
V
 
I
N
 
D
R
 
A
A
 
E
G
 
K
V
 
V
D
 
R
A
 
A
V
 
T
V
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
F
I
 
S
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
A
E
 
V
V
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
N
 
N
K
 
K
A
 
A
Q
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
G
M
 
M
V
 
V
A
 
K
G
 
Q
T
 
T
Q
 
I
Q
 
D
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
V
 
E
A
 
R
D
 
A
A
 
G
Q
 
A
L
 
L
S
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
S
E
 
E
D
 
A
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
Y
 
F
N
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
H
D
 
G
I
 
H
M
 
M
I
 
V
E
 
E
Q
 
N
Q
 
K
S
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
A
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
R
V
 
A
G
 
W
L
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
G
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
T
K
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
K
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
V
 
I
A
 
H
T
 
T
P
 
P
I
 
M
L
 
W
K
 
D
D
 
E
M
 
L
P
 
P
D
 
E
K
 
K
V
 
D
I
 
Q
Q
 
Q
G
 
F
M
 
L
E
 
L
E
 
S
R
 
R
V
 
Q
P
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
M
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
A
 
Q
A
 
V
I
 
L
E
 
Y
V
 
V
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
S
L
 
L

Q92506 (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 8; 17-beta-HSD 8; HSD17B8; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase alpha subunit; KAR alpha subunit; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; Estradiol 17-beta-dehydrogenase 8; Protein Ke6; Ke6; Short chain dehydrogenase/reductase family 30C member 1; Testosterone 17-beta-dehydrogenase 8; EC 1.1.1.n12; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
42% identity, 99% coverage: 2:244/246 of query aligns to 8:259/261 of Q92506

query
sites
Q92506
K
 
R
L
 
L
K
 
R
N
 
S
K
 
A
V
 
L
A
 
A
I
x
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
H
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
S
R
 
V
K
 
R
F
 
L
V
 
A
T
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
A
V
 
A
C
 
C
D
|
D
V
x
L
N
 
D
R
 
R
A
 
A
G
 
A
V
 
A
D
 
Q
A
 
E
V
 
T
V
 
V
S
 
R
E
 
L
L
 
L
I
 
G
A
 
G
Q
 
P
G
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
P
-
 
R
G
 
G
Q
 
N
A
 
H
L
 
A
G
 
A
F
 
F
E
 
Q
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
E
K
 
A
A
 
R
Q
 
A
I
 
A
A
 
R
A
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
G
 
Q
T
 
V
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
C
F
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
P
-
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
T
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
Q
 
F
L
 
L
S
 
L
K
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
Y
 
F
N
 
L
C
 
V
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
A
D
 
Q
I
 
A
M
 
L
I
 
V
E
 
S
Q
 
N
Q
 
G
S
 
C
-
x
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
I
V
|
V
G
 
G
L
 
K
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
A
x
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
V
 
T
K
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
x
R
K
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
x
I
A
|
A
T
|
T
P
 
P
I
 
M
L
 
T
K
 
Q
D
 
K
M
 
V
P
 
P
D
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
V
Q
 
D
G
 
K
M
 
I
E
 
T
E
 
E
R
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
H
M
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
D
V
 
V
Y
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
T
A
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:246/246 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
K
 
Q
N
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
H
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
L
K
 
R
F
 
F
V
 
A
T
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
C
 
N
D
|
D
V
x
I
N
 
D
R
 
A
A
 
E
G
 
K
V
 
V
D
 
R
A
 
A
V
 
T
V
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
F
I
 
S
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
A
E
 
V
V
 
A
D
 
D
V
x
I
T
 
G
N
 
N
K
 
K
A
 
A
Q
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
G
M
 
M
V
 
V
A
 
K
G
 
Q
T
 
T
Q
 
I
Q
 
D
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
V
 
E
A
 
R
D
 
A
A
 
G
Q
 
A
L
 
L
S
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
S
E
 
E
D
 
A
Q
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
Y
 
F
N
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
H
D
 
G
I
 
H
M
 
M
I
 
V
E
 
E
Q
 
N
Q
 
K
S
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
A
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
R
V
 
A
G
 
W
L
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
G
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
T
K
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
K
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
V
x
I
A
 
H
T
 
T
P
 
P
I
 
M
L
 
W
K
 
D
D
 
E
M
 
L
P
 
P
D
 
E
K
 
K
V
 
D
I
 
Q
Q
 
Q
G
 
F
M
 
L
E
 
L
E
 
S
R
 
R
V
 
Q
P
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
M
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
T
Y
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
A
 
Q
A
 
V
I
 
L
E
 
Y
V
 
V
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
S
L
 
L

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain ATCC 27184 / PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:246/246 of query aligns to 4:246/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
K
 
T
N
 
A
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
A
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
L
K
 
A
F
 
L
V
 
A
T
 
A
E
 
T
G
 
G
A
 
M
R
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
N
D
 
Y
V
 
A
N
 
Q
R
 
S
A
 
S
-
 
T
G
 
A
V
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
I
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
L
 
I
G
 
A
F
 
V
E
 
Q
V
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
N
 
N
K
 
A
A
 
D
Q
 
E
I
 
V
A
 
D
A
 
Q
M
 
L
V
 
I
A
 
K
G
 
T
T
 
T
Q
 
L
Q
 
D
Q
 
K
F
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
T
A
 
R
D
 
D
A
 
T
Q
 
L
L
 
L
S
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
W
D
 
Q
R
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
N
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
S
D
 
K
I
 
L
M
 
M
I
 
L
E
 
K
Q
 
Q
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
I
S
 
T
S
 
S
V
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
M
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
x
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
F
V
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
|
F
V
 
I
A
 
A
T
 
T
P
 
D
I
 
M
L
 
T
K
 
E
D
 
N
M
 
L
P
x
N
D
 
A
K
 
E
V
 
P
I
 
I
Q
 
L
G
 
-
M
 
-
E
 
-
E
 
Q
R
 
F
V
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
Y
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
G
V
 
T
Y
 
I
A
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
P
-
 
A
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
I
 
F
E
 
N
V
 
V
T
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
L
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
41% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
K
 
S
L
 
F
K
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
H
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
K
 
T
F
 
L
V
 
V
T
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
C
 
T
D
 
A
V
x
T
N
 
S
R
 
E
A
 
S
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
S
S
 
D
E
 
Y
L
 
L
I
 
G
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
G
 
K
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
F
 
L
E
 
M
V
x
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
N
 
D
K
 
P
A
 
A
Q
 
S
I
 
I
A
 
E
A
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
E
G
 
N
T
 
V
Q
 
R
Q
 
A
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
V
 
T
A
 
R
D
 
D
A
 
N
Q
 
L
L
 
L
S
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
D
D
 
D
Q
 
E
F
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
V
Y
 
F
N
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
M
D
 
R
I
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
Q
 
K
Q
 
R
S
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
T
A
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
M
 
F
V
 
S
K
 
K
T
 
S
W
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
E
T
 
T
P
 
D
I
 
M
L
 
T
K
 
R
D
 
A
M
 
L
P
 
T
D
 
D
K
 
E
V
 
Q
I
 
R
Q
 
A
G
 
G
M
 
T
E
 
L
E
 
A
R
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
A
Y
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
E
A
 
T
I
 
L
E
 
H
V
 
V
T
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
L
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
42% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
K
 
T
L
 
L
K
 
Q
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
H
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
R
 
I
K
 
N
F
 
L
V
 
A
T
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
I
V
 
F
V
 
F
C
x
N
D
x
Y
V
x
N
N
x
G
R
x
S
A
 
P
G
 
E
V
 
A
D
 
A
A
 
E
V
 
E
V
 
T
S
 
A
E
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
H
G
 
G
-
 
V
Q
 
E
A
 
V
L
 
E
G
 
A
F
 
M
E
 
K
V
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
N
 
I
K
 
A
A
 
E
Q
 
D
I
 
V
A
 
D
A
 
A
M
 
F
V
 
F
A
 
K
G
 
Q
T
 
A
Q
 
I
Q
 
E
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
V
 
T
A
 
R
D
 
D
A
 
N
Q
 
L
L
 
L
S
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
D
 
D
Q
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
Y
 
F
N
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
S
D
 
R
I
 
T
M
 
M
I
 
M
E
 
K
Q
 
Q
Q
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
M
S
 
A
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
V
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
P
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
V
x
I
A
 
T
T
|
T
P
 
D
I
 
M
L
 
T
K
 
D
D
 
K
M
 
L
P
 
D
D
 
E
K
 
K
V
 
T
I
 
K
Q
 
E
G
 
A
M
 
M
E
 
L
E
 
A
R
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
A
M
 
Y
A
 
G
Q
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
A
Y
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
S
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
I
 
L
E
 
S
V
 
V
T
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
L
 
M

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
45% identity, 98% coverage: 5:246/246 of query aligns to 1:244/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
N
 
S
K
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
H
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
L
K
 
S
F
 
L
V
 
G
T
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
C
R
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
V
C
x
N
D
x
Y
V
x
A
N
x
R
R
x
S
A
 
A
G
 
K
V
 
A
D
 
A
A
 
E
V
 
E
V
 
V
S
 
S
E
 
K
L
 
Q
I
 
I
-
 
E
A
 
A
Q
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
G
 
T
F
 
F
E
 
G
V
 
G
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
K
K
 
E
A
 
A
Q
 
D
I
 
V
A
 
E
A
 
A
M
 
M
V
 
M
A
 
K
G
 
T
T
 
A
Q
 
I
Q
 
D
Q
 
A
F
 
W
G
 
G
R
 
T
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
V
 
T
A
 
R
D
 
D
A
 
T
Q
 
L
L
 
L
S
 
I
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
K
D
 
S
Q
 
Q
F
 
W
D
 
D
R
 
E
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
N
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
T
D
 
K
I
 
I
M
 
M
I
 
M
E
 
K
Q
 
K
Q
 
R
S
 
K
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
 
I
S
 
A
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
F
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
F
V
 
S
K
 
K
T
 
T
W
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
G
G
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
N
A
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
A
T
x
S
P
 
-
I
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
D
M
|
M
P
 
T
D
 
A
K
 
K
V
 
L
I
 
G
Q
 
E
G
 
D
M
 
M
E
 
E
E
 
K
R
 
K
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
T
V
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
M
 
T
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
N
I
 
V
A
 
A
N
 
G
V
 
L
Y
 
V
A
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
L
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
I
 
F
E
 
T
V
 
I
T
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
A
L
 
I

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
41% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 4:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
K
 
N
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
H
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
K
 
L
F
 
L
V
 
A
T
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
C
 
T
D
 
A
V
x
T
N
 
S
R
 
E
A
 
S
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
-
S
 
S
E
 
D
L
 
Y
I
 
L
A
 
G
Q
 
D
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
A
 
-
L
 
-
G
 
G
F
 
M
E
 
A
V
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
N
 
N
K
 
P
A
 
E
Q
 
S
I
 
I
A
 
E
A
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
G
 
A
T
 
I
Q
 
T
Q
 
D
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
V
 
T
A
 
R
D
 
D
A
 
N
Q
 
L
L
 
L
S
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
D
 
E
Q
 
E
F
 
W
D
 
S
R
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
V
 
I
Y
 
F
N
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
L
D
 
R
I
 
G
M
 
M
I
 
M
E
 
K
Q
 
K
Q
 
R
S
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
A
x
V
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
F
V
 
T
K
 
K
T
 
S
W
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
V
x
I
A
 
E
T
|
T
P
 
D
I
x
M
L
 
T
K
 
K
D
 
A
M
 
L
P
 
N
D
 
D
K
 
E
V
 
Q
I
 
R
Q
 
T
G
 
A
M
 
T
E
 
L
E
 
A
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
A
Y
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
E
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
E
A
 
T
I
 
L
E
 
H
V
 
V
T
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
L
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
41% identity, 100% coverage: 1:246/246 of query aligns to 1:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
M
 
M
K
 
S
L
 
F
K
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
H
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
K
 
T
F
 
L
V
 
V
T
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
C
 
T
D
 
A
V
 
T
N
 
S
R
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
A
D
 
K
A
 
N
V
 
I
V
 
S
S
 
D
E
 
Y
L
 
L
I
 
G
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
G
 
K
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
F
 
L
E
 
M
V
 
L
D
 
N
V
 
V
T
 
T
N
 
D
K
 
P
A
 
A
Q
 
S
I
 
I
A
 
E
A
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
E
G
 
N
T
 
I
Q
 
R
Q
 
A
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
T
A
 
R
D
 
D
A
 
N
Q
 
L
L
 
L
S
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
D
D
 
D
Q
 
E
F
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
V
Y
 
F
N
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
M
D
 
R
I
 
A
M
|
M
I
 
M
E
 
K
Q
 
K
Q
 
R
S
 
C
G
 
G
V