SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_054255660.1 NCBI__GCF_001298675.1:WP_054255660.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 5 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9FMF7 Dicarboxylate transporter 2.1, chloroplastic; AtpDCT1; Glutamate/malate translocator from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
41% identity, 100% coverage: 1:485/485 of query aligns to 92:563/563 of Q9FMF7

query
sites
Q9FMF7
M
 
Q
G
 
G
F
 
A
K
 
K
P
 
L
L
 
I
P
 
P
T
 
L
A
 
I
I
 
L
A
 
S
V
 
I
A
 
S
L
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
I
I
 
L
G
 
R
F
 
F
V
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
A
 
G
W
 
W
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
S
L
 
I
F
 
F
V
 
L
G
 
S
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
G
I
 
L
I
 
V
G
 
L
K
 
S
A
 
P
L
 
L
P
 
P
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
W
S
 
A
I
 
F
I
 
I
A
 
G
I
 
L
A
 
T
L
 
A
V
 
S
A
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
K
V
 
T
T
 
L
N
 
S
D
 
F
K
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
F
S
 
S
S
 
A
F
 
F
S
 
T
N
 
S
S
 
E
L
 
V
I
 
I
W
 
W
L
 
L
I
 
I
G
 
V
V
 
I
S
 
S
I
 
F
M
 
F
I
 
F
S
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
F
I
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
D
R
 
R
I
 
I
G
 
A
Y
 
T
L
 
Y
F
 
F
I
 
V
A
 
K
V
 
W
W
 
L
G
|
G
K
 
K
K
 
S
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
S
Y
 
Y
S
 
G
L
 
L
A
 
T
L
 
L
S
 
S
E
 
E
L
 
A
I
 
L
L
 
I
A
 
A
P
 
P
V
 
A
T
 
M
P
 
P
S
 
S
N
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
F
H
 
L
P
 
P
I
 
I
M
 
I
R
 
K
A
 
S
I
 
L
A
 
S
G
 
L
S
 
S
Y
 
A
G
 
G
S
 
S
D
 
K
P
 
P
E
 
N
K
 
D
G
 
S
T
 
S
Q
 
S
G
 
R
R
 
K
M
 
L
G
 
G
R
 
S
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
L
 
Q
T
 
S
N
 
Q
Y
 
F
H
 
Q
A
 
C
N
 
A
P
 
G
I
 
N
T
 
S
S
 
S
A
 
A
M
 
L
F
 
F
I
 
L
T
 
T
A
 
A
T
 
A
A
 
A
P
 
Q
N
 
N
P
 
L
L
 
L
V
 
C
V
 
L
K
 
K
L
 
L
I
 
-
A
 
A
D
 
E
V
 
E
T
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
N
S
 
P
W
 
W
G
 
V
T
 
S
W
 
W
A
 
F
L
 
K
A
 
A
M
 
A
L
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
I
V
 
I
A
 
S
L
 
L
A
 
L
V
 
C
M
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
L
Y
 
Y
M
 
K
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
P
 
P
E
 
E
I
 
T
K
 
K
S
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
E
A
 
A
M
 
P
Q
 
G
F
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
L
K
 
K
E
 
Q
L
 
M
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
T
R
 
K
G
 
N
E
 
E
I
 
W
T
 
I
M
 
M
F
 
V
G
 
G
V
 
T
F
 
M
A
 
L
V
 
L
L
 
A
L
 
V
V
 
T
L
 
L
W
 
W
A
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
I
F
 
C
G
 
G
P
 
E
S
 
T
A
 
L
A
 
G
V
 
I
D
 
P
P
 
S
T
 
V
T
 
V
T
 
A
A
 
A
F
 
M
I
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
I
C
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
N
W
 
W
E
 
D
D
 
D
V
 
C
I
 
L
K
 
S
E
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
A
W
 
W
D
 
D
T
 
T
I
 
L
V
 
A
W
 
W
F
 
F
G
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
M
 
G
M
 
M
A
 
A
T
 
G
F
 
Q
L
 
L
N
 
T
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
V
T
 
T
W
 
W
F
 
M
A
 
S
K
 
D
S
 
C
I
 
V
E
 
A
T
 
K
G
 
V
I
 
L
G
 
Q
H
 
S
M
 
L
G
 
S
L
 
L
S
 
S
W
 
W
V
 
P
T
 
A
A
 
A
S
 
F
A
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
Q
L
 
A
T
 
A
Y
 
Y
L
 
F
Y
 
F
A
 
I
H
 
H
Y
 
Y
M
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
S
T
 
Q
T
 
T
A
 
G
H
 
H
I
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
S
A
 
A
F
 
F
Y
 
L
G
 
A
A
 
M
G
 
H
L
 
I
A
 
A
L
 
A
G
 
G
A
 
V
P
 
P
P
 
G
L
 
I
P
 
L
F
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
Y
A
 
N
S
 
T
N
 
N
I
 
L
M
 
F
M
 
G
T
 
A
L
 
L
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
A
 
S
T
 
S
G
 
G
T
 
Q
S
 
A
P
 
A
V
 
V
I
 
Y
F
 
Y
G
 
G
S
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
T
 
D
L
 
L
G
 
P
E
 
D
W
 
V
W
 
F
K
 
K
T
 
I
G
 
G
F
 
F
I
 
V
M
 
M
S
 
A
L
 
T
A
 
I
L
 
N
L
 
A
A
 
I
I
 
I
W
 
W
L
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
T
V
 
F
W
 
W
W
 
W
K
 
K
V
 
F
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
W
 
Y

7t9gA Structure of vcindy-na+ (see paper)
21% identity, 82% coverage: 81:480/485 of query aligns to 71:445/445 of 7t9gA

query
sites
7t9gA
A
 
A
L
 
L
S
 
N
S
 
N
F
 
F
S
 
A
N
 
N
S
 
S
L
 
I
I
 
I
W
 
F
L
 
L
I
 
F
G
 
L
V
 
G
S
 
G
I
 
F
M
 
A
I
 
L
S
 
A
R
 
A
G
 
A
I
 
M
I
 
H
K
 
H
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
D
A
 
K
R
 
V
I
 
I
G
 
A
Y
 
D
L
 
K
F
 
V
I
 
L
A
 
A
V
 
M
-
 
A
W
 
Q
G
 
G
K
 
K
K
 
M
T
 
S
I
 
V
G
 
A
I
 
V
A
 
F
Y
 
M
S
 
L
L
 
F
A
 
G
L
 
V
S
 
T
E
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
-
A
 
-
P
x
S
V
 
M
T
 
W
P
 
I
S
|
S
N
|
N
T
 
T
A
 
A
R
 
T
G
 
A
G
 
A
G
 
M
I
 
M
I
 
L
H
 
-
P
 
P
I
 
L
M
 
V
R
 
L
A
 
G
I
 
V
A
 
L
G
 
S
S
 
K
Y
 
V
G
 
D
S
 
A
D
 
D
P
 
K
E
 
Q
K
 
R
G
 
S
T
 
T
Q
 
Y
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
R
 
V
Y
 
F
L
 
V
A
 
L
L
 
L
T
 
G
N
 
V
Y
 
A
H
 
Y
A
 
S
N
 
A
P
 
S
I
 
I
T
 
G
S
 
G
A
 
I
M
 
A
F
 
T
I
 
L
T
 
V
A
x
G
T
 
S
A
 
P
P
 
P
N
 
N
P
 
A
L
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
I
T
 
A
G
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
V
S
 
G
L
 
L
S
 
S
W
 
F
G
 
T
T
 
D
W
 
W
A
 
-
L
 
M
A
 
K
M
 
F
L
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
-
L
 
-
V
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
M
V
 
M
M
 
L
P
 
P
L
 
M
I
 
A
I
 
I
Y
 
A
M
 
I
L
 
L
H
 
Y
P
 
F
P
 
-
E
 
L
I
 
L
K
 
K
S
 
P
T
 
T
P
 
L
N
 
N
A
 
G
M
 
M
Q
 
-
F
 
F
A
 
E
R
 
L
E
 
D
K
 
R
L
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
A
P
 
P
I
 
V
S
 
N
-
 
W
-
 
D
R
 
K
G
 
G
E
 
K
I
 
V
T
 
V
M
 
T
F
 
L
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
G
V
 
L
L
 
T
L
 
V
V
 
F
L
 
L
W
 
W
-
 
I
-
 
F
A
 
S
G
 
S
V
 
P
P
 
I
T
 
N
F
 
A
L
 
A
F
 
L
G
 
G
P
 
G
S
 
F
A
 
K
A
 
S
V
 
F
D
 
D
P
 
-
T
 
T
T
 
L
T
 
V
A
 
A
F
 
L
I
 
G
G
 
A
L
 
I
S
 
L
L
 
M
C
 
L
L
 
S
V
 
F
T
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
V
T
 
H
W
 
W
E
 
K
D
 
E
V
 
-
I
 
I
K
 
Q
E
 
K
K
 
T
S
 
A
A
 
D
W
 
W
D
 
G
T
 
V
I
 
L
V
 
L
W
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
G
L
 
G
V
 
L
M
 
C
M
 
L
A
 
S
T
 
N
F
 
V
L
 
L
N
 
K
K
 
Q
L
 
T
G
 
G
L
 
T
I
 
S
T
 
V
W
 
F
F
 
L
A
 
A
K
 
N
S
 
A
I
 
L
E
 
S
T
 
D
G
 
M
I
 
V
G
 
S
H
 
H
M
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
W
 
V
V
 
V
T
 
I
A
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
V
M
 
V
L
 
A
T
 
T
Y
 
F
L
 
V
Y
 
V
A
 
F
H
 
L
Y
x
T
M
 
E
F
 
F
A
|
A
S
|
S
T
x
N
T
 
T
A
 
A
H
 
S
I
 
A
T
 
A
A
 
L
M
 
L
F
 
I
A
 
P
A
 
V
F
 
F
Y
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
A
L
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
M
P
 
S
P
 
P
L
 
V
P
 
L
F
 
L
A
 
S
L
 
V
M
 
L
M
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
S
 
A
N
 
S
I
 
C
M
 
A
M
 
F
T
 
M
L
 
L
T
 
P
H
 
-
Y
 
V
A
|
A
T
 
T
G
 
P
T
 
P
S
 
N
P
 
A
V
 
I
I
 
V
F
 
F
G
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
H
T
 
I
T
 
K
L
 
Q
G
 
S
E
 
E
W
 
M
W
 
M
K
 
R
T
 
V
G
 
G
F
 
L
I
 
Y
M
 
L
S
 
N
L
 
I
A
 
A
L
 
C
L
 
I
A
 
G
I
 
L
W
 
L
L
 
T
V
 
A
V
 
I
G
 
A
G
 
M
V
 
L
W
 
F
W
 
W
K
 
Q

6wtxA Structure of vcindy in complex with terephthalate (see paper)
21% identity, 82% coverage: 81:480/485 of query aligns to 71:445/445 of 6wtxA

query
sites
6wtxA
A
 
A
L
 
L
S
 
N
S
 
N
F
 
F
S
 
A
N
 
N
S
 
S
L
 
I
I
 
I
W
 
F
L
 
L
I
 
F
G
 
L
V
 
G
S
 
G
I
 
F
M
 
A
I
 
L
S
 
A
R
 
A
G
 
A
I
 
M
I
 
H
K
 
H
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
D
A
 
K
R
 
V
I
 
I
G
 
A
Y
 
D
L
 
K
F
 
V
I
 
L
A
 
A
V
 
M
-
 
A
W
 
Q
G
 
G
K
 
K
K
 
M
T
 
S
I
 
V
G
 
A
I
 
V
A
 
F
Y
 
M
S
 
L
L
 
F
A
 
G
L
 
V
S
 
T
E
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
-
A
 
-
P
x
S
V
 
M
T
 
W
P
 
I
S
|
S
N
|
N
T
 
T
A
 
A
R
 
T
G
 
A
G
 
A
G
 
M
I
 
M
I
 
L
H
 
-
P
 
P
I
 
L
M
 
V
R
 
L
A
 
G
I
 
V
A
 
L
G
 
S
S
 
K
Y
 
V
G
 
D
S
 
A
D
 
D
P
 
K
E
 
Q
K
 
R
G
 
S
T
 
T
Q
 
Y
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
R
 
V
Y
 
F
L
 
V
A
 
L
L
 
L
T
 
G
N
 
V
Y
 
A
H
 
Y
A
 
S
N
 
A
P
 
S
I
 
I
T
 
G
S
x
G
A
 
I
M
 
A
F
 
T
I
 
L
T
 
V
A
x
G
T
x
S
A
 
P
P
 
P
N
 
N
P
 
A
L
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
I
T
 
A
G
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
V
S
 
G
L
 
L
S
 
S
W
 
F
G
 
T
T
 
D
W
 
W
A
 
-
L
 
M
A
 
K
M
 
F
L
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
-
L
 
-
V
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
M
V
 
M
M
 
L
P
 
P
L
 
M
I
 
A
I
 
I
Y
 
A
M
 
I
L
 
L
H
 
Y
P
 
F
P
 
-
E
 
L
I
 
L
K
 
K
S
 
P
T
 
T
P
 
L
N
 
N
A
 
G
M
 
M
Q
 
-
F
 
F
A
 
E
R
 
L
E
 
D
K
 
R
L
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
A
P
 
P
I
 
V
S
 
N
-
 
W
-
 
D
R
 
K
G
 
G
E
 
K
I
 
V
T
 
V
M
 
T
F
 
L
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
G
V
 
L
L
 
T
L
 
V
V
 
F
L
 
L
W
 
W
-
 
I
-
 
F
A
 
S
G
 
S
V
 
P
P
 
I
T
 
N
F
 
A
L
 
A
F
 
L
G
 
G
P
 
G
S
 
F
A
 
K
A
 
S
V
 
F
D
 
D
P
 
-
T
 
T
T
 
L
T
 
V
A
 
A
F
 
L
I
 
G
G
 
A
L
 
I
S
 
L
L
 
M
C
 
L
L
 
S
V
 
F
T
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
V
T
 
H
W
 
W
E
 
K
D
 
E
V
 
-
I
 
I
K
 
Q
E
 
K
K
 
T
S
 
A
A
 
D
W
 
W
D
 
G
T
 
V
I
 
L
V
 
L
W
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
G
L
 
G
V
 
L
M
 
C
M
 
L
A
 
S
T
 
N
F
 
V
L
 
L
N
 
K
K
 
Q
L
 
T
G
 
G
L
 
T
I
 
S
T
 
V
W
 
F
F
 
L
A
 
A
K
 
N
S
 
A
I
 
L
E
 
S
T
 
D
G
 
M
I
 
V
G
 
S
H
 
H
M
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
W
 
V
V
 
V
T
 
I
A
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
V
M
 
V
L
 
A
T
 
T
Y
 
F
L
 
V
Y
 
V
A
 
F
H
 
L
Y
x
T
M
 
E
F
 
F
A
|
A
S
|
S
T
x
N
T
|
T
A
 
A
H
 
S
I
 
A
T
 
A
A
 
L
M
 
L
F
 
I
A
 
P
A
 
V
F
 
F
Y
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
A
L
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
M
P
 
S
P
 
P
L
 
V
P
 
L
F
 
L
A
 
S
L
 
V
M
 
L
M
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
S
 
A
N
 
S
I
 
C
M
 
A
M
 
F
T
 
M
L
 
L
T
 
P
H
 
-
Y
 
V
A
|
A
T
|
T
G
 
P
T
 
P
S
 
N
P
 
A
V
 
I
I
 
V
F
 
F
G
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
H
T
 
I
T
 
K
L
 
Q
G
 
S
E
 
E
W
 
M
W
 
M
K
 
R
T
 
V
G
 
G
F
 
L
I
 
Y
M
 
L
S
 
N
L
 
I
A
 
A
L
 
C
L
 
I
A
 
G
I
 
L
W
 
L
L
 
T
V
 
A
V
 
I
G
 
A
G
 
M
V
 
L
W
 
F
W
 
W
K
 
Q

6okzB Structure of vcindy bound to fumarate
21% identity, 82% coverage: 81:480/485 of query aligns to 70:444/444 of 6okzB

query
sites
6okzB
A
 
A
L
 
L
S
 
N
S
 
N
F
 
F
S
 
A
N
 
N
S
 
S
L
 
I
I
 
I
W
 
F
L
 
L
I
 
F
G
 
L
V
 
G
S
 
G
I
 
F
M
 
A
I
 
L
S
 
A
R
 
A
G
 
A
I
 
M
I
 
H
K
 
H
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
D
A
 
K
R
 
V
I
 
I
G
 
A
Y
 
D
L
 
K
F
 
V
I
 
L
A
 
A
V
 
M
-
 
A
W
 
Q
G
 
G
K
 
K
K
 
M
T
 
S
I
 
V
G
 
A
I
 
V
A
 
F
Y
 
M
S
 
L
L
 
F
A
 
G
L
 
V
S
 
T
E
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
-
A
 
-
P
 
S
V
 
M
T
 
W
P
 
I
S
 
S
N
|
N
T
 
T
A
 
A
R
 
T
G
 
A
G
 
A
G
 
M
I
 
M
I
 
L
H
 
-
P
 
P
I
 
L
M
 
V
R
 
L
A
 
G
I
 
V
A
 
L
G
 
S
S
 
K
Y
 
V
G
 
D
S
 
A
D
 
D
P
 
K
E
 
Q
K
 
R
G
 
S
T
 
T
Q
 
Y
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
R
 
V
Y
 
F
L
 
V
A
 
L
L
 
L
T
 
G
N
 
V
Y
 
A
H
 
Y
A
 
S
N
 
A
P
 
S
I
 
I
T
 
G
S
 
G
A
 
I
M
 
A
F
 
T
I
 
L
T
 
V
A
 
G
T
x
S
A
x
P
P
 
P
N
 
N
P
 
A
L
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
I
T
 
A
G
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
V
S
 
G
L
 
L
S
 
S
W
 
F
G
 
T
T
 
D
W
 
W
A
 
-
L
 
M
A
 
K
M
 
F
L
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
-
L
 
-
V
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
M
V
 
M
M
 
L
P
 
P
L
 
M
I
 
A
I
 
I
Y
 
A
M
 
I
L
 
L
H
 
Y
P
 
F
P
 
-
E
 
L
I
 
L
K
 
K
S
 
P
T
 
T
P
 
L
N
 
N
A
 
G
M
 
M
Q
 
-
F
 
F
A
 
E
R
 
L
E
 
D
K
 
R
L
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
A
P
 
P
I
 
V
S
 
N
-
 
W
-
 
D
R
 
K
G
 
G
E
 
K
I
 
V
T
 
V
M
 
T
F
 
L
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
G
V
 
L
L
 
T
L
 
V
V
 
F
L
 
L
W
 
W
-
 
I
-
 
F
A
 
S
G
 
S
V
 
P
P
 
I
T
 
N
F
 
A
L
 
A
F
 
L
G
 
G
P
 
G
S
 
F
A
 
K
A
 
S
V
 
F
D
 
D
P
 
-
T
 
T
T
 
L
T
 
V
A
 
A
F
 
L
I
 
G
G
 
A
L
 
I
S
 
L
L
 
M
C
 
L
L
 
S
V
 
F
T
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
V
T
 
H
W
 
W
E
 
K
D
 
E
V
 
-
I
 
I
K
 
Q
E
 
K
K
 
T
S
 
A
A
 
D
W
 
W
D
 
G
T
 
V
I
 
L
V
 
L
W
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
G
L
 
G
V
 
L
M
 
C
M
 
L
A
 
S
T
 
N
F
 
V
L
 
L
N
 
K
K
 
Q
L
 
T
G
 
G
L
 
T
I
 
S
T
 
V
W
 
F
F
 
L
A
 
A
K
 
N
S
 
A
I
 
L
E
 
S
T
 
D
G
 
M
I
 
V
G
 
S
H
 
H
M
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
W
 
V
V
 
V
T
 
I
A
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
V
M
 
V
L
 
A
T
 
T
Y
 
F
L
 
V
Y
 
V
A
 
F
H
 
L
Y
 
T
M
 
E
F
 
F
A
 
A
S
|
S
T
x
N
T
|
T
A
 
A
H
 
S
I
 
A
T
 
A
A
 
L
M
 
L
F
 
I
A
 
P
A
 
V
F
 
F
Y
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
A
L
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
M
P
 
S
P
 
P
L
 
V
P
 
L
F
 
L
A
 
S
L
 
V
M
 
L
M
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
S
 
A
N
 
S
I
 
C
M
 
A
M
 
F
T
 
M
L
 
L
T
 
P
H
 
-
Y
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
P
T
 
P
S
 
N
P
 
A
V
 
I
I
 
V
F
 
F
G
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
H
T
 
I
T
 
K
L
 
Q
G
 
S
E
 
E
W
 
M
W
 
M
K
 
R
T
 
V
G
 
G
F
 
L
I
 
Y
M
 
L
S
 
N
L
 
I
A
 
A
L
 
C
L
 
I
A
 
G
I
 
L
W
 
L
L
 
T
V
 
A
V
 
I
G
 
A
G
 
M
V
 
L
W
 
F
W
 
W
K
 
Q

7jsjA Structure of the nact-pf2 complex (see paper)
24% identity, 66% coverage: 144:465/485 of query aligns to 128:440/468 of 7jsjA

query
sites
7jsjA
S
|
S
N
|
N
T
|
T
A
 
A
R
 
T
G
 
T
G
 
A
G
 
M
I
 
M
I
 
V
H
 
-
P
 
P
I
 
I
M
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
L
G
 
Q
S
 
Q
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
-
Q
 
R
G
 
K
R
 
R
M
 
L
G
 
C
R
 
K
Y
 
A
L
 
M
A
 
T
L
 
L
T
 
C
N
 
I
Y
 
C
H
 
Y
A
 
A
N
 
A
P
 
S
I
 
I
T
 
G
S
 
G
A
 
T
M
 
A
F
 
T
I
 
L
T
 
T
A
x
G
T
|
T
A
 
G
P
 
P
N
 
N
P
 
V
L
 
V
V
 
L
V
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
M
-
 
N
K
 
E
L
 
L
I
 
F
A
 
P
D
 
D
V
 
S
T
 
K
G
 
D
A
 
L
Q
 
V
I
 
N
S
 
F
L
 
A
S
 
S
W
 
W
G
 
F
T
 
A
W
 
F
A
 
A
L
 
F
A
 
P
M
 
N
L
 
M
L
 
L
P
 
V
G
 
M
L
 
L
V
 
L
A
 
F
L
 
A
A
 
W
V
 
L
M
 
W
P
 
L
L
 
Q
I
 
F
I
 
V
Y
 
Y
M
 
M
L
 
R
H
 
S
P
 
K
P
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
K
S
 
N
T
 
E
P
 
K
N
 
A
A
 
A
M
 
L
Q
 
K
F
 
V
A
 
L
R
 
Q
E
 
E
K
 
E
L
 
Y
K
 
R
E
 
K
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
L
S
 
S
R
 
F
G
 
A
E
 
E
I
 
I
T
 
N
M
 
V
F
 
L
G
 
I
V
 
C
F
 
F
A
 
F
V
 
L
L
 
L
L
 
V
V
 
I
L
 
L
W
 
W
A
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
F
L
 
S
F
 
R
G
 
D
P
 
P
S
 
E
A
 
T
A
 
K
V
 
Y
-
 
V
-
 
S
D
 
D
P
 
A
T
 
T
T
 
V
T
 
A
A
 
I
F
 
F
I
 
V
G
 
A
L
 
T
S
 
L
L
 
L
C
 
F
L
 
I
V
 
V
T
 
P
G
 
S
-
 
Q
-
 
K
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
P
-
 
P
V
 
L
L
 
L
T
 
D
W
 
W
E
 
K
D
 
-
V
 
V
I
 
T
K
 
Q
E
 
E
K
 
K
S
 
V
A
 
P
W
 
W
D
x
G
T
x
I
I
 
V
V
 
L
W
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
G
V
 
F
M
 
A
M
 
L
A
 
A
T
 
K
F
 
G
L
 
S
N
 
E
K
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
S
T
 
V
W
 
W
F
 
M
A
 
G
K
 
K
S
 
Q
I
 
M
E
 
E
T
 
P
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
H
W
 
A
V
 
V
T
 
P
A
 
P
S
 
A
A
 
A
L
 
I
-
 
T
L
 
L
M
 
I
L
 
L
T
 
S
Y
 
L
L
 
L
Y
 
V
A
 
A
H
 
V
Y
 
F
M
x
T
F
 
E
A
 
C
S
x
T
T
x
S
T
x
N
A
 
V
H
 
A
I
 
T
T
 
T
A
 
T
M
 
L
F
 
F
A
 
L
A
 
P
F
 
I
Y
 
F
G
 
A
A
 
S
-
 
M
G
 
S
L
 
R
A
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
L
P
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
Y
F
 
I
A
 
M
L
 
L
M
 
P
M
 
C
A
 
T
A
 
L
A
 
S
S
 
A
N
 
S
I
 
F
M
 
A
M
 
F
T
 
M
L
 
L
T
 
P
H
 
-
Y
 
V
A
|
A
T
|
T
G
 
P
T
 
P
S
 
N
P
 
A
V
 
I
I
 
V
F
 
F
G
 
T
S
 
Y
G
 
G
Y
 
H
T
 
L
T
 
K
L
 
V
G
 
A
E
 
D
W
 
M
W
 
V
K
 
K
T
 
T
G
 
G
F
 
V
I
 
I
M
 
M
S
 
N
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_054255660.1 NCBI__GCF_001298675.1:WP_054255660.1
MGFKPLPTAIAVALGLIIGFVIPVPAGVTPDAWHLLGLFVGTIAAIIGKALPIGALSIIA
IALVAVTGVTNDKAAGAINDALSSFSNSLIWLIGVSIMISRGIIKTGLGARIGYLFIAVW
GKKTIGIAYSLALSELILAPVTPSNTARGGGIIHPIMRAIAGSYGSDPEKGTQGRMGRYL
ALTNYHANPITSAMFITATAPNPLVVKLIADVTGAQISLSWGTWALAMLLPGLVALAVMP
LIIYMLHPPEIKSTPNAMQFAREKLKELGPISRGEITMFGVFAVLLVLWAGVPTFLFGPS
AAVDPTTTAFIGLSLCLVTGVLTWEDVIKEKSAWDTIVWFGALVMMATFLNKLGLITWFA
KSIETGIGHMGLSWVTASALLMLTYLYAHYMFASTTAHITAMFAAFYGAGLALGAPPLPF
ALMMAAASNIMMTLTHYATGTSPVIFGSGYTTLGEWWKTGFIMSLALLAIWLVVGGVWWK
VLGYW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory