SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_054256928.1 NCBI__GCF_001298675.1:WP_054256928.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
30% identity, 93% coverage: 9:250/260 of query aligns to 5:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
L
 
L
E
 
R
L
 
T
R
 
E
E
 
N
L
 
I
R
 
V
K
 
K
S
 
Y
F
|
F
G
 
G
K
 
E
T
x
F
E
 
K
I
 
A
I
 
L
R
 
D
G
 
G
A
 
V
N
 
S
L
 
I
A
 
S
V
 
V
H
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
V
V
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
R
 
F
F
 
L
A
 
K
P
 
A
T
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
V
L
 
Y
L
 
F
H
 
E
G
 
N
A
 
K
R
 
D
I
 
I
D
 
T
G
 
N
K
 
K
A
 
E
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
L
N
 
Y
R
 
H
M
 
Y
G
 
G
L
 
I
S
 
V
R
 
R
S
 
T
F
 
F
Q
 
Q
I
 
T
S
 
P
N
 
Q
I
 
P
F
 
L
P
 
K
K
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
R
 
L
C
 
I
G
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
C
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
V
 
P
L
 
L
W
 
N
S
 
S
L
 
L
G
 
F
Y
 
Y
R
 
K
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
R
 
K
F
 
W
L
 
I
S
 
P
N
 
K
L
 
E
Q
 
E
D
 
E
A
 
M
N
 
V
E
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
F
Q
 
K
L
 
I
M
 
L
E
 
E
M
 
F
I
 
L
Q
 
K
L
 
L
Q
 
S
K
 
H
K
 
L
R
 
Y
D
 
D
T
 
R
L
 
K
A
 
A
M
 
G
N
 
E
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
M
R
 
K
A
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
M
G
 
T
G
 
N
A
 
P
S
 
K
V
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
A
K
 
P
S
 
G
E
 
L
T
 
A
T
 
H
R
 
D
-
 
I
F
 
F
I
 
N
H
 
H
L
 
V
I
 
L
K
 
E
Q
 
L
V
 
K
T
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
L
T
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
G
 
N
L
 
Y
A
 
I
D
 
D
K
 
H
I
 
L
A
 
Y
V
 
V
V
 
M
V
 
F
Y
 
N
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
I
A
 
A
F
 
E
D
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
N
 
N
V
 
V
R
 
L
A
 
S
N
 
D
P
 
P
R
 
K
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
S
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
30% identity, 93% coverage: 9:249/260 of query aligns to 5:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
L
 
L
E
 
R
L
 
T
R
 
E
E
 
N
L
 
I
R
 
V
K
 
K
S
 
Y
F
|
F
G
 
G
K
 
E
T
x
F
E
 
K
I
 
A
I
 
L
R
 
D
G
 
G
A
 
V
N
 
S
L
 
I
A
 
S
V
 
V
H
 
C
A
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
V
V
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
R
 
F
F
 
L
A
 
K
P
 
A
T
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
V
L
 
Y
L
 
F
H
 
E
G
 
N
A
 
K
R
 
D
I
 
I
D
 
T
G
 
N
K
 
K
A
 
E
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
L
N
 
Y
R
 
H
M
 
Y
G
 
G
L
 
I
S
 
V
R
 
R
S
 
T
F
 
F
Q
 
Q
I
 
T
S
 
P
N
 
Q
I
 
P
F
 
L
P
 
K
K
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
R
 
L
C
 
I
G
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
V
 
P
L
 
L
W
 
N
S
 
S
L
 
L
G
 
F
Y
 
Y
R
 
K
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
R
 
K
F
 
W
L
 
I
S
 
P
N
 
K
L
 
E
Q
 
E
D
 
E
A
 
M
N
 
V
E
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
F
Q
 
K
L
 
I
M
 
L
E
 
E
M
 
F
I
 
L
Q
 
K
L
 
L
Q
 
S
K
 
H
K
 
L
R
 
Y
D
 
D
T
 
R
L
 
K
A
 
A
M
 
G
N
 
E
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
M
R
 
K
A
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
M
G
 
T
G
 
N
A
 
P
S
 
K
V
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
A
K
 
P
S
 
G
E
 
L
T
 
A
T
 
H
R
 
D
-
 
I
F
 
F
I
 
N
H
 
H
L
 
V
I
 
L
K
 
E
Q
 
L
V
 
K
T
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
L
T
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
G
 
N
L
 
Y
A
 
I
D
 
D
K
 
H
I
 
L
A
 
Y
V
 
V
V
 
M
V
 
F
Y
 
N
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
I
A
 
A
F
 
E
D
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
N
 
N
V
 
V
R
 
L
A
 
S
N
 
D
P
 
P
R
 
K
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
32% identity, 90% coverage: 11:245/260 of query aligns to 4:234/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
V
R
 
N
E
 
D
L
 
V
R
 
Y
K
 
K
S
 
N
F
|
F
G
 
G
K
 
S
T
 
L
E
 
E
I
x
V
I
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
V
N
 
T
L
 
L
A
 
K
V
 
V
H
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
V
V
 
V
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
I
S
 
N
G
 
L
R
 
L
F
 
E
A
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
F
L
 
I
H
 
D
G
 
G
A
 
V
R
 
K
I
 
I
-
 
N
D
 
N
G
 
G
K
 
K
A
 
V
P
 
N
F
 
I
E
 
N
I
 
K
N
 
V
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
H
S
 
F
N
 
N
I
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
H
L
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
T
L
 
L
W
 
A
S
 
P
L
 
V
G
 
K
Y
 
V
R
 
K
Y
 
K
A
 
M
F
 
-
W
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
N
L
 
K
Q
 
K
D
 
E
A
 
A
N
 
E
E
 
E
R
 
L
A
 
A
E
 
V
Q
 
D
L
 
L
M
 
L
E
 
A
M
 
K
I
 
V
Q
 
G
L
 
L
Q
 
L
K
 
D
K
 
K
R
 
K
D
 
D
T
 
Q
L
 
Y
A
 
P
M
 
I
N
 
K
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
A
 
R
L
 
L
E
 
A
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
M
G
 
Q
A
 
P
S
 
E
V
 
V
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
S
 
D
K
 
P
S
 
E
E
 
M
T
 
V
T
 
K
R
 
E
F
 
V
I
 
L
H
 
N
L
 
V
I
 
M
K
 
K
Q
 
Q
V
 
L
-
 
A
T
 
N
E
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
T
 
V
V
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
V
 
A
F
 
R
G
 
E
L
 
V
A
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
I
V
 
F
V
 
M
V
 
D
Y
 
D
G
 
G
E
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
E
F
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
E
V
 
I
-
 
F
-
 
Y
R
 
R
A
 
A
-
 
K
N
 
N
P
 
E
R
 
R
V
 
T
Q
 
R
E
 
E

Q8R420 Phospholipid-transporting ATPase ABCA3; ATP-binding cassette sub-family A member 3; Xenobiotic-transporting ATPase ABCA3; EC 7.6.2.1; EC 7.6.2.2 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
34% identity, 79% coverage: 24:228/260 of query aligns to 549:741/1704 of Q8R420

query
sites
Q8R420
I
 
I
R
 
R
G
 
D
A
 
L
N
 
T
L
 
L
A
 
N
V
 
L
H
 
Y
A
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
V
 
T
A
 
V
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
F
 
M
N
 
S
L
 
L
I
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
L
F
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
H
V
 
A
L
 
Y
L
 
I
H
 
H
G
 
G
A
 
Y
R
 
E
I
 
I
D
 
S
G
 
Q
K
 
D
A
 
M
P
 
A
F
 
Q
E
 
I
I
 
R
N
 
K
R
 
S
M
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
C
R
 
P
S
 
Q
F
 
H
Q
 
D
I
 
V
S
 
-
N
 
-
I
 
L
F
 
F
P
 
D
K
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
V
F
 
A
E
 
E
N
 
H
L
 
L
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
Y
R
 
F
Y
 
Y
A
 
A
F
 
Q
W
 
L
R
 
K
F
 
G
L
 
L
S
 
S
N
 
-
L
 
L
Q
 
Q
D
 
K
A
 
C
N
 
P
E
 
E
R
 
E
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
L
 
M
M
 
L
E
 
H
M
 
I
I
 
L
Q
 
S
L
 
L
Q
 
E
K
 
D
K
 
K
R
 
R
D
 
D
T
 
L
L
 
R
A
 
S
M
 
K
N
 
F
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
M
Q
 
K
R
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
A
I
 
L
A
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
S
S
 
K
V
 
V
I
 
L
L
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
M
 
M
S
 
D
K
 
A
S
 
V
E
 
S
T
 
R
T
 
R
R
 
A
F
 
I
I
 
W
H
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
Q
Q
 
Q
V
 
Q
T
 
K
E
 
S
G
 
D
R
 
R
T
 
T
L
 
V
L
 
L
T
 
L
V
 
T
E
 
T
H
 
H
D
 
F
M
 
M
G
 
D
V
 
E
V
 
A
F
 
D
G
 
L
L
 
L
A
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
L
V
 
A
Y
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
L

Sites not aligning to the query:

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 93% coverage: 9:249/260 of query aligns to 3:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
L
 
L
E
 
K
L
 
A
R
 
Q
E
 
H
L
 
L
R
 
A
K
 
K
S
 
S
F
 
Y
G
 
K
K
 
K
T
 
R
E
 
K
I
 
V
I
 
V
R
 
S
G
 
D
A
 
V
N
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
H
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
S
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
I
S
 
V
G
 
G
R
 
L
F
 
V
A
 
A
P
 
R
T
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
I
L
 
T
L
 
I
H
 
D
G
 
D
A
 
N
R
 
D
I
 
I
D
 
S
G
 
I
K
 
L
A
 
P
P
 
M
F
 
H
E
 
S
I
 
R
N
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
 
Q
I
 
E
S
 
A
N
 
S
I
 
I
F
 
F
P
 
R
K
 
K
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
E
E
 
D
N
 
N
L
 
-
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
I
L
 
M
W
 
A
S
 
V
L
 
L
G
 
Q
Y
 
T
R
 
R
Y
 
E
A
 
E
F
 
L
W
 
T
R
 
H
F
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
Q
x
E
D
 
E
A
 
R
N
 
Q
E
x
D
R
 
K
A
 
L
E
 
E
Q
 
D
L
 
L
M
 
L
E
 
E
M
 
E
I
 
F
Q
 
H
L
 
I
Q
 
Q
K
 
H
K
 
I
R
 
R
D
 
K
T
 
S
L
 
A
A
 
G
M
 
M
N
 
A
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
E
Q
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
N
A
 
P
S
 
Q
V
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
K
 
P
S
 
I
E
 
S
T
 
V
T
 
I
R
 
D
F
 
I
I
 
K
H
 
K
L
 
I
I
 
I
K
 
E
Q
 
H
V
 
L
T
 
R
E
 
D
-
 
R
G
 
G
R
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
T
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
C
D
 
E
K
 
K
I
 
A
A
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
S
Y
 
Q
G
 
G
E
 
R
V
 
L
I
 
I
A
 
A
F
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
D
V
 
V
R
 
L
A
 
N
N
 
N
P
 
E
R
 
Q
V
 
V
Q
 
K
E
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
30% identity, 93% coverage: 8:250/260 of query aligns to 2:235/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
A
 
S
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
Q
E
 
N
L
 
V
R
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
K
 
E
T
 
V
E
 
V
I
 
V
I
 
S
R
 
K
G
 
D
A
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
E
A
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
L
L
 
F
L
 
I
H
 
G
G
 
E
A
 
K
R
 
R
I
 
M
D
 
N
G
 
D
K
 
T
A
 
P
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
-
N
 
-
R
 
-
M
 
R
G
 
G
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
|
Q
I
 
S
S
 
Y
N
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
S
L
 
F
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
Y
 
L
A
 
A
F
 
G
W
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
K
Q
 
E
D
 
V
A
 
I
N
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
E
 
N
Q
 
Q
L
 
V
M
 
A
E
 
E
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
K
 
H
K
 
L
R
 
L
D
 
D
T
x
R
L
 
K
A
 
P
M
 
K
N
x
A
L
 
L
T
x
S
Y
 
G
A
x
G
E
x
Q
Q
 
R
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
T
I
 
L
A
 
V
G
 
A
G
 
E
A
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
K
 
A
S
 
A
E
 
L
T
 
R
T
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
R
H
 
I
L
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
R
V
 
L
T
 
H
E
 
K
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
F
 
M
G
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
D
Y
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V
I
 
A
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
N
 
E
V
 
L
R
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
R
 
R
V
 
F
Q
 
V
E
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
S

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
30% identity, 93% coverage: 8:250/260 of query aligns to 2:235/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
A
 
S
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
Q
E
 
N
L
 
V
R
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
K
 
E
T
 
V
E
 
V
I
 
V
I
 
S
R
 
K
G
 
D
A
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
E
A
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
L
L
 
F
L
 
I
H
 
G
G
 
E
A
 
K
R
 
R
I
 
M
D
 
N
G
 
D
K
 
T
A
 
P
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
-
N
 
-
R
 
-
M
 
R
G
 
G
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
|
Q
I
 
S
S
 
Y
N
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
S
L
 
F
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
Y
 
L
A
 
A
F
 
G
W
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
K
Q
 
E
D
 
V
A
 
I
N
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
E
 
N
Q
 
Q
L
 
V
M
 
A
E
 
E
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
K
 
H
K
 
L
R
 
L
D
 
D
T
x
R
L
 
K
A
 
P
M
 
K
N
 
A
L
 
L
T
x
S
Y
 
G
A
x
G
E
x
Q
Q
 
R
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
T
I
 
L
A
 
V
G
 
A
G
 
E
A
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
K
 
A
S
 
A
E
 
L
T
 
R
T
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
R
H
 
I
L
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
R
V
 
L
T
 
H
E
 
K
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
F
 
M
G
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
D
Y
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V
I
 
A
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
N
 
E
V
 
L
R
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
R
 
R
V
 
F
Q
 
V
E
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
S

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
30% identity, 93% coverage: 8:250/260 of query aligns to 2:235/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
A
 
S
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
Q
E
 
N
L
 
V
R
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
K
 
E
T
 
V
E
 
V
I
x
V
I
 
S
R
 
K
G
 
D
A
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
E
A
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
L
L
 
F
L
 
I
H
 
G
G
 
E
A
 
K
R
 
R
I
 
M
D
 
N
G
 
D
K
 
T
A
 
P
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
-
N
 
-
R
 
-
M
 
R
G
 
G
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
|
Q
I
 
S
S
 
Y
N
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
S
L
 
F
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
Y
 
L
A
 
A
F
 
G
W
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
K
Q
 
E
D
 
V
A
 
I
N
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
E
 
N
Q
 
Q
L
 
V
M
 
A
E
 
E
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
K
 
H
K
 
L
R
 
L
D
 
D
T
x
R
L
 
K
A
 
P
M
 
K
N
x
A
L
 
L
T
x
S
Y
x
G
A
x
G
E
x
Q
Q
 
R
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
T
I
 
L
A
 
V
G
 
A
G
 
E
A
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
K
 
A
S
 
A
E
 
L
T
 
R
T
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
R
H
 
I
L
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
R
V
 
L
T
 
H
E
 
K
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
F
 
M
G
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
D
Y
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V
I
 
A
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
N
 
E
V
 
L
R
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
R
 
R
V
 
F
Q
 
V
E
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
S

3puvA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4 (see paper)
30% identity, 93% coverage: 8:250/260 of query aligns to 2:235/371 of 3puvA

query
sites
3puvA
A
 
S
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
Q
E
 
N
L
 
V
R
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
K
 
E
T
 
V
E
 
V
I
x
V
I
 
S
R
 
K
G
 
D
A
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
E
A
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
L
L
 
F
L
 
I
H
 
G
G
 
E
A
 
K
R
 
R
I
 
M
D
 
N
G
 
D
K
 
T
A
 
P
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
-
N
 
-
R
 
-
M
 
R
G
 
G
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
|
Q
I
 
S
S
 
Y
N
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
S
L
 
F
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
Y
 
L
A
 
A
F
 
G
W
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
K
Q
 
E
D
 
V
A
 
I
N
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
E
 
N
Q
 
Q
L
 
V
M
 
A
E
 
E
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
K
 
H
K
 
L
R
 
L
D
 
D
T
x
R
L
 
K
A
 
P
M
 
K
N
x
A
L
 
L
T
x
S
Y
 
G
A
 
G
E
x
Q
Q
 
R
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
T
I
 
L
A
 
V
G
 
A
G
 
E
A
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
K
 
A
S
 
A
E
 
L
T
 
R
T
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
R
H
 
I
L
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
R
V
 
L
T
 
H
E
 
K
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
F
 
M
G
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
D
Y
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V
I
 
A
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
N
 
E
V
 
L
R
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
R
 
R
V
 
F
Q
 
V
E
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
S

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
30% identity, 93% coverage: 8:250/260 of query aligns to 3:236/371 of P68187

query
sites
P68187
A
 
S
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
Q
E
 
N
L
 
V
R
 
T
K
 
K
S
 
A
F
 
W
G
 
G
K
 
E
T
 
V
E
 
V
I
 
V
I
 
S
R
 
K
G
 
D
A
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
E
A
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
L
L
 
F
L
 
I
H
 
G
G
 
E
A
 
K
R
 
R
I
 
M
D
 
N
G
 
D
K
 
T
A
 
P
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
-
N
 
-
R
 
-
M
 
R
G
 
G
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
S
S
 
Y
N
x
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
S
L
 
F
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
Y
 
L
A
 
A
F
 
G
W
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
A
N
x
K
L
 
K
Q
 
E
D
 
V
A
 
I
N
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
x
V
E
 
N
Q
 
Q
L
x
V
M
 
A
E
|
E
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
x
A
K
 
H
K
 
L
R
 
L
D
 
D
T
 
R
L
 
K
A
 
P
M
 
K
N
 
A
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
x
G
E
 
Q
Q
 
R
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
T
I
 
L
A
 
V
G
 
A
G
 
E
A
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
K
 
A
S
 
A
E
 
L
T
 
R
T
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
R
H
 
I
L
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
R
V
 
L
T
 
H
E
 
K
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
F
 
M
G
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
D
Y
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V
I
 
A
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
N
 
E
V
 
L
R
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
R
|
R
V
 
F
Q
 
V
E
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
S

Sites not aligning to the query:

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
30% identity, 93% coverage: 8:250/260 of query aligns to 2:235/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
A
 
S
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
Q
E
 
N
L
 
V
R
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
K
 
E
T
 
V
E
 
V
I
x
V
I
 
S
R
 
K
G
 
D
A
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
E
A
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
L
L
 
F
L
 
I
H
 
G
G
 
E
A
 
K
R
 
R
I
 
M
D
 
N
G
 
D
K
 
T
A
 
P
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
-
N
 
-
R
 
-
M
 
R
G
 
G
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
S
S
 
Y
N
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
S
L
 
F
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
Y
 
L
A
 
A
F
 
G
W
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
K
Q
 
E
D
 
V
A
 
I
N
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
E
 
N
Q
 
Q
L
 
V
M
 
A
E
 
E
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
K
 
H
K
 
L
R
 
L
D
 
D
T
 
R
L
 
K
A
 
P
M
 
K
N
 
A
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
R
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
T
I
 
L
A
 
V
G
 
A
G
 
E
A
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
K
 
A
S
 
A
E
 
L
T
 
R
T
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
R
H
 
I
L
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
R
V
 
L
T
 
H
E
 
K
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
F
 
M
G
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
D
Y
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V
I
 
A
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
N
 
E
V
 
L
R
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
R
 
R
V
 
F
Q
 
V
E
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
S

1q12A Crystal structure of the atp-bound e. Coli malk (see paper)
30% identity, 93% coverage: 9:250/260 of query aligns to 1:233/367 of 1q12A

query
sites
1q12A
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
Q
E
 
N
L
 
V
R
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
K
 
E
T
 
V
E
 
V
I
 
V
I
 
S
R
 
K
G
 
D
A
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
E
A
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
L
L
 
F
L
 
I
H
 
G
G
 
E
A
 
K
R
 
R
I
 
M
D
 
N
G
 
D
K
 
T
A
 
P
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
-
N
 
-
R
 
-
M
 
R
G
 
G
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
S
S
 
Y
N
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
S
L
 
F
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
Y
 
L
A
 
A
F
 
G
W
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
K
Q
 
E
D
 
V
A
 
I
N
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
E
 
N
Q
 
Q
L
 
V
M
 
A
E
 
E
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
K
 
H
K
 
L
R
 
L
D
 
D
T
x
R
L
 
K
A
 
P
M
 
K
N
x
A
L
 
L
T
x
S
Y
 
G
A
x
G
E
x
Q
Q
 
R
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
T
I
 
L
A
 
V
G
 
A
G
 
E
A
 
P
S
 
S
V
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
K
 
A
S
 
A
E
 
L
T
 
R
T
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
R
H
 
I
L
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
R
V
 
L
T
 
H
E
 
K
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
F
 
M
G
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
D
Y
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V
I
 
A
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
N
 
E
V
 
L
R
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
R
 
R
V
 
F
Q
 
V
E
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
S

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
27% identity, 85% coverage: 9:230/260 of query aligns to 5:221/501 of P04983

query
sites
P04983
L
 
L
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
G
L
 
I
R
 
D
K
 
K
S
 
A
F
 
F
G
 
P
K
 
G
T
 
V
E
 
K
I
 
A
I
 
L
R
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
A
L
 
L
A
 
N
V
 
V
H
 
Y
A
 
P
G
 
G
E
 
R
R
 
V
V
 
M
A
 
A
I
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
M
F
 
M
N
 
K
L
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
I
F
 
Y
A
 
T
P
 
R
T
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
T
V
 
L
L
 
L
L
 
W
H
 
L
G
 
G
A
 
K
R
 
E
I
 
T
D
 
T
G
 
F
K
 
T
A
 
G
P
 
P
F
 
K
E
 
S
I
 
S
N
 
Q
R
 
E
M
 
A
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
I
S
 
I
F
 
H
Q
 
Q
I
 
E
S
 
L
N
 
N
I
 
L
F
 
I
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
S
 
T
V
 
I
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
F
C
 
L
G
 
G
V
 
R
L
 
E
W
 
F
S
 
V
L
 
N
G
 
R
Y
 
F
R
 
G
Y
 
K
A
 
I
F
 
D
W
 
W
R
 
K
F
 
T
L
 
M
S
 
Y
N
 
-
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
E
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
L
 
L
M
 
L
E
 
A
M
 
K
I
 
L
Q
 
N
L
 
L
Q
 
R
K
 
F
K
 
K
R
 
S
D
 
D
T
 
K
L
 
L
A
 
V
M
 
G
N
 
D
L
 
L
T
 
S
Y
 
I
A
 
G
E
 
D
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
M
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
 
K
T
 
V
I
 
L
A
 
S
G
 
F
G
 
E
A
 
S
S
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
D
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
D
S
 
T
E
 
E
T
 
T
T
 
E
R
 
S
F
 
L
I
 
F
H
 
R
L
 
V
I
 
I
K
 
R
Q
 
E
V
 
L
-
 
K
T
 
S
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
T
 
G
L
 
I
L
 
V
T
 
Y
V
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
R
M
 
M
G
 
K
V
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
E
L
 
I
A
 
C
D
 
D
K
 
D
I
 
V
A
 
T
V
 
V
V
 
F
V
 
R
Y
 
D
G
 
G
E
 
Q
V
 
F
I
 
I
A
 
A

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
30% identity, 93% coverage: 8:250/260 of query aligns to 3:236/369 of P19566

query
sites
P19566
A
 
S
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
N
L
 
V
R
 
T
K
 
K
S
 
A
F
 
W
G
 
G
K
 
D
T
 
V
E
 
V
I
 
V
I
 
S
R
 
K
G
 
D
A
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
E
A
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
L
L
 
F
L
 
I
H
 
G
G
 
E
A
 
T
R
 
R
I
 
M
D
 
N
G
 
D
K
 
I
A
 
P
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
-
N
 
-
R
 
-
M
 
R
G
 
G
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
S
S
 
Y
N
 
A
I
x
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
S
L
 
F
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
Y
 
L
A
 
A
F
 
G
W
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
A
N
 
K
L
 
K
Q
 
E
D
 
V
A
 
M
N
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
E
 
N
Q
 
Q
L
 
V
M
 
A
E
 
E
M
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
K
 
H
K
 
L
R
 
L
D
 
E
T
 
R
L
 
K
A
 
P
M
 
K
N
 
A
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
R
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
T
I
 
L
A
 
V
G
 
A
G
 
E
A
 
P
S
 
R
V
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
x
D
K
 
A
S
 
A
E
 
L
T
 
R
T
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
R
H
 
I
L
 
E
I
 
I
K
 
S
Q
 
R
V
 
L
T
 
H
E
 
K
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
F
 
M
G
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
V
 
L
V
 
D
Y
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V
I
 
A
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
L
N
 
E
V
 
L
R
 
Y
A
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
R
 
R
V
 
F
Q
 
V
E
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
S
 
S

Sites not aligning to the query:

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
28% identity, 90% coverage: 9:242/260 of query aligns to 3:228/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
L
 
I
E
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
N
L
 
L
R
 
H
K
 
K
S
 
W
F
|
F
G
 
G
K
 
P
T
 
L
E
 
H
I
x
V
I
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
I
N
 
H
L
 
L
A
 
E
V
 
V
H
 
A
A
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
K
V
 
L
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
R
R
 
L
F
 
E
A
 
D
P
 
F
T
 
Q
S
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
L
 
V
H
 
D
G
 
G
A
 
L
R
 
S
I
 
V
-
 
K
D
 
D
G
 
D
K
 
R
A
 
A
P
 
L
F
 
R
E
 
E
I
 
I
N
 
R
R
 
R
M
 
-
G
 
E
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
Q
S
 
F
N
 
N
I
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
R
 
T
C
 
L
G
 
A
V
 
P
L
 
M
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
R
 
R
Y
 
V
A
 
R
F
 
R
W
 
W
R
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
P
L
 
R
Q
 
E
D
 
K
A
 
A
N
 
E
E
 
K
R
 
K
A
 
A
E
 
L
Q
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
E
M
 
R
I
 
V
Q
 
G
L
 
I
Q
 
L
K
 
D
K
 
Q
R
 
A
D
 
R
T
 
K
L
 
Y
A
 
P
M
 
A
N
 
Q
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
M
G
 
E
A
 
P
S
 
K
V
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
S
 
D
K
 
P
S
 
E
E
 
M
T
 
V
T
 
G
R
 
E
F
 
V
I
 
L
H
 
D
L
 
V
I
 
M
K
 
R
Q
 
D
V
 
L
T
 
A
E
 
Q
-
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
T
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
V
 
A
F
 
R
G
 
E
L
 
V
A
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
V
V
 
F
V
 
M
V
 
D
Y
 
G
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
V
A
 
E
F
 
E
D
 
G
T
 
R
P
 
P
E
 
E
N
 
E
V
 
I
R
 
F
A
 
T
N
 
R
P
 
P
R
 
K

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 86% coverage: 19:241/260 of query aligns to 16:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
G
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
V
I
 
A
I
 
L
R
 
D
G
 
N
A
 
V
N
 
N
L
 
I
A
 
N
V
 
I
H
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
F
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
D
A
 
V
P
 
P
T
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
Y
L
 
F
H
 
D
G
 
D
A
 
R
R
 
L
I
 
V
-
 
A
-
 
S
D
 
N
G
 
G
K
 
K
-
 
L
-
 
I
A
 
V
P
 
P
F
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
R
 
K
M
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
-
R
 
-
S
 
V
F
 
F
Q
|
Q
I
 
T
S
 
W
N
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
A
F
 
F
W
 
P
R
 
-
F
 
-
L
 
L
S
 
T
N
 
N
L
 
M
Q
 
K
D
 
M
A
 
S
N
 
K
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
K
R
 
R
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
M
 
A
E
 
K
M
 
I
I
 
L
Q
 
D
L
 
I
Q
 
H
K
 
H
K
 
V
R
 
L
D
 
N
T
 
H
L
 
F
A
 
P
M
 
R
N
 
E
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
V
G
 
K
G
 
D
A
 
P
S
 
S
V
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
K
 
A
S
 
R
E
 
M
T
 
R
T
 
D
R
 
S
F
 
A
I
 
R
H
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
V
 
V
T
 
Q
E
 
S
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
V
Y
 
K
G
 
G
E
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
L
R
 
Y
A
 
D
N
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 86% coverage: 19:241/260 of query aligns to 16:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
G
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
V
I
 
A
I
 
L
R
 
D
G
 
N
A
 
V
N
 
N
L
 
I
A
 
N
V
 
I
H
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
F
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
D
A
 
V
P
 
P
T
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
Y
L
 
F
H
 
D
G
 
D
A
 
R
R
 
L
I
 
V
-
 
A
-
 
S
D
 
N
G
 
G
K
 
K
-
 
L
-
 
I
A
 
V
P
 
P
F
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
R
 
K
M
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
-
R
 
-
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
T
S
 
W
N
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
A
F
 
F
W
 
P
R
 
-
F
 
-
L
 
L
S
 
T
N
 
N
L
 
M
Q
 
K
D
 
M
A
 
S
N
 
K
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
K
R
 
R
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
M
 
A
E
 
K
M
 
I
I
 
L
Q
 
D
L
 
I
Q
 
H
K
 
H
K
 
V
R
 
L
D
 
N
T
 
H
L
 
F
A
 
P
M
 
R
N
 
E
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
V
G
 
K
G
 
D
A
 
P
S
 
S
V
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
K
 
A
S
 
R
E
 
M
T
 
R
T
 
D
R
 
S
F
 
A
I
 
R
H
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
V
 
V
T
 
Q
E
 
S
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
V
Y
 
K
G
 
G
E
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
L
R
 
Y
A
 
D
N
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 86% coverage: 19:241/260 of query aligns to 16:232/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
G
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
V
I
x
A
I
 
L
R
 
D
G
 
N
A
 
V
N
 
N
L
 
I
A
 
N
V
 
I
H
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
F
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
D
A
 
V
P
 
P
T
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
Y
L
 
F
H
 
D
G
 
D
A
 
R
R
 
L
I
 
V
-
 
A
-
 
S
D
 
N
G
 
G
K
 
K
-
 
L
-
 
I
A
 
V
P
 
P
F
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
R
 
K
M
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
-
R
 
-
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
T
S
 
W
N
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
A
F
 
F
W
 
P
R
 
-
F
 
-
L
 
L
S
 
T
N
 
N
L
 
M
Q
 
K
D
 
M
A
 
S
N
 
K
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
K
R
 
R
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
M
 
A
E
 
K
M
 
I
I
 
L
Q
 
D
L
 
I
Q
 
H
K
 
H
K
 
V
R
 
L
D
 
N
T
 
H
L
 
F
A
 
P
M
 
R
N
 
E
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
V
G
 
K
G
 
D
A
 
P
S
 
S
V
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
K
 
A
S
 
R
E
 
M
T
 
R
T
 
D
R
 
S
F
 
A
I
 
R
H
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
V
 
V
T
 
Q
E
 
S
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
G
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
V
Y
 
K
G
 
G
E
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
L
R
 
Y
A
 
D
N
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
28% identity, 86% coverage: 19:241/260 of query aligns to 16:232/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
G
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
V
I
 
A
I
 
L
R
 
D
G
 
N
A
 
V
N
 
N
L
 
I
A
 
N
V
 
I
H
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
F
F
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
F
 
D
A
 
V
P
 
P
T
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
Y
L
 
F
H
 
D
G
 
D
A
 
R
R
 
L
I
 
V
-
 
A
-
 
S
D
 
N
G
 
G
K
 
K
-
 
L
-
 
I
A
 
V
P
 
P
F
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
R
 
K
M
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
-
R
 
-
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
T
S
 
W
N
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
K
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
A
F
 
F
W
 
P
R
 
-
F
 
-
L
 
L
S
 
T
N
 
N
L
 
M
Q
 
K
D
 
M
A
 
S
N
 
K
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
K
R
 
R
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
M
 
A
E
 
K
M
 
I
I
 
L
Q
 
D
L
 
I
Q
 
H
K
 
H
K
 
V
R