SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_054560113.1 NCBI__GCF_001306415.1:WP_054560113.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
44% identity, 95% coverage: 4:219/227 of query aligns to 2:217/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
T
 
S
I
 
I
L
 
I
K
 
E
L
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
K
-
 
K
F
x
Y
Q
 
D
K
 
N
E
x
G
N
 
T
L
 
T
I
x
A
L
 
L
N
 
R
H
 
G
V
 
V
T
 
S
L
 
V
E
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
A
Y
 
Y
V
 
I
I
 
V
G
 
G
K
 
P
T
x
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
M
 
I
K
 
R
T
 
S
L
 
L
Y
 
Y
G
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
K
I
 
I
N
 
D
S
 
K
G
 
G
E
 
S
G
 
L
S
 
S
I
 
V
V
 
A
D
 
G
F
 
F
N
 
N
L
 
L
K
 
V
T
 
K
L
 
I
K
 
K
E
 
K
K
 
K
D
 
D
I
 
V
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
Y
K
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
K
R
 
K
N
 
T
I
 
V
N
 
Y
N
 
E
N
 
N
L
 
I
K
 
A
F
 
Y
V
 
A
L
 
M
K
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
-
K
 
E
D
 
N
S
 
R
V
 
R
K
 
N
M
 
I
D
 
K
A
 
R
K
 
R
I
 
V
E
 
M
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
D
K
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
K
T
 
H
K
 
K
G
 
V
F
 
R
K
 
S
F
 
F
P
 
P
H
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
V
N
 
N
D
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
T
 
N
S
 
S
V
 
W
E
 
E
I
 
I
M
 
M
K
 
N
V
 
L
L
 
L
Q
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
E
 
L
N
 
Q
G
 
G
R
 
T
T
 
T
I
 
I
I
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
N
Y
 
S
A
 
Q
L
 
I
I
 
V
L
 
N
K
 
T
Y
 
L
P
 
R
H
 
H
K
 
R
T
 
V
L
 
I
K
 
A
C
 
I
D
 
E
N
 
N
S
 
G
K
 
R
V
 
V

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
44% identity, 95% coverage: 4:219/227 of query aligns to 2:217/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
T
 
S
I
 
I
L
 
I
K
 
E
L
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
K
-
 
K
F
x
Y
Q
 
D
K
 
N
E
 
G
N
x
T
L
 
T
I
x
A
L
 
L
N
 
R
H
 
G
V
 
V
T
 
S
L
 
V
E
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
A
Y
 
Y
V
 
I
I
 
V
G
 
G
K
 
P
T
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
M
 
I
K
 
R
T
 
S
L
 
L
Y
 
Y
G
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
K
I
 
I
N
 
D
S
 
K
G
 
G
E
 
S
G
 
L
S
 
S
I
 
V
V
 
A
D
 
G
F
 
F
N
 
N
L
 
L
K
 
V
T
 
K
L
 
I
K
 
K
E
 
K
K
 
K
D
 
D
I
 
V
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
Y
K
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
K
R
 
K
N
 
T
I
 
V
N
 
Y
N
 
E
N
 
N
L
 
I
K
 
A
F
 
Y
V
 
A
L
 
M
K
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
-
K
 
E
D
 
N
S
 
R
V
 
R
K
 
N
M
 
I
D
 
K
A
 
R
K
 
R
I
 
V
E
 
M
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
D
K
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
K
T
 
H
K
 
K
G
 
V
F
 
R
K
 
S
F
 
F
P
 
P
H
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
V
N
 
N
D
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
T
 
N
S
 
S
V
 
W
E
 
E
I
 
I
M
 
M
K
 
N
V
 
L
L
 
L
Q
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
E
 
L
N
 
Q
G
 
G
R
 
T
T
 
T
I
 
I
I
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
N
Y
 
S
A
 
Q
L
 
I
I
 
V
L
 
N
K
 
T
Y
 
L
P
 
R
H
 
H
K
 
R
T
 
V
L
 
I
K
 
A
C
 
I
D
 
E
N
 
N
S
 
G
K
 
R
V
 
V

A0A0H2ZM82 Cell division ATP-binding protein FtsE from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
44% identity, 95% coverage: 4:219/227 of query aligns to 2:217/230 of A0A0H2ZM82

query
sites
A0A0H2ZM82
T
 
S
I
 
I
L
 
I
K
 
E
L
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
K
-
 
K
F
 
Y
Q
 
D
K
 
N
E
 
G
N
 
T
L
 
T
I
 
A
L
 
L
N
 
R
H
 
G
V
 
V
T
 
S
L
 
V
E
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
A
Y
 
Y
V
 
I
I
 
V
G
 
G
K
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
F
 
F
M
 
I
K
 
R
T
 
S
L
 
L
Y
 
Y
G
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
K
I
 
I
N
 
D
S
 
K
G
 
G
E
 
S
G
 
L
S
 
S
I
 
V
V
 
A
D
 
G
F
 
F
N
 
N
L
 
L
K
 
V
T
 
K
L
 
I
K
 
K
E
 
K
K
 
K
D
 
D
I
 
V
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
Y
K
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
K
R
 
K
N
 
T
I
 
V
N
 
Y
N
 
E
N
 
N
L
 
I
K
 
A
F
 
Y
V
 
A
L
 
M
K
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
-
K
 
E
D
 
N
S
 
R
V
 
R
K
 
N
M
 
I
D
 
K
A
 
R
K
 
R
I
 
V
E
 
M
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
D
K
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
K
T
 
H
K
 
K
G
 
V
F
 
R
K
 
S
F
 
F
P
 
P
H
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
V
N
 
N
D
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
T
 
N
S
 
S
V
 
W
E
 
E
I
 
I
M
 
M
K
 
N
V
 
L
L
 
L
Q
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
E
 
L
N
 
Q
G
 
G
R
 
T
T
 
T
I
 
I
I
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
N
Y
 
S
A
 
Q
L
 
I
I
 
V
L
 
N
K
 
T
Y
 
L
P
 
R
H
 
H
K
 
R
T
 
V
L
 
I
K
 
A
C
 
I
D
 
E
N
 
N
S
 
G
K
 
R
V
 
V

8iddA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis atp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
46% identity, 81% coverage: 21:204/227 of query aligns to 20:202/225 of 8iddA

query
sites
8iddA
L
 
L
N
 
D
H
 
D
V
 
I
T
 
N
L
 
V
E
 
K
V
 
I
K
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
K
 
P
T
x
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
F
 
F
M
 
M
K
 
R
T
 
L
L
 
L
Y
 
L
G
 
A
D
 
A
L
 
E
P
 
T
I
 
P
N
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
G
 
V
S
 
R
I
 
V
V
 
S
D
 
K
F
 
F
N
 
H
L
 
V
K
 
N
T
 
K
L
 
L
K
 
R
E
 
G
K
 
R
D
 
H
I
 
V
P
 
P
Y
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
K
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
D
 
Q
R
 
K
N
 
T
I
 
V
N
 
Y
N
 
D
N
 
N
L
 
V
K
 
A
F
 
F
V
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
-
K
 
K
D
 
R
S
 
T
V
 
D
K
 
A
M
 
I
D
 
N
A
 
R
K
 
V
I
 
V
E
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
E
K
 
T
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
S
T
 
G
K
 
K
G
 
A
F
 
N
K
 
R
F
 
L
P
 
P
H
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
L
 
V
N
 
N
D
 
R
P
 
P
E
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
S
 
S
V
 
R
E
 
D
I
 
I
M
 
M
K
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
E
 
R
N
 
T
G
 
G
R
 
T
T
 
T
I
 
V
I
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
D
Y
 
H
A
 
H
L
 
I
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8igqA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis adp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
46% identity, 81% coverage: 21:204/227 of query aligns to 20:202/227 of 8igqA

query
sites
8igqA
L
 
L
N
 
D
H
 
D
V
 
I
T
 
N
L
 
V
E
 
K
V
 
I
K
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
K
 
P
T
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
F
 
F
M
 
M
K
 
R
T
 
L
L
 
L
Y
 
L
G
 
A
D
 
A
L
 
E
P
 
T
I
 
P
N
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
G
 
V
S
 
R
I
 
V
V
 
S
D
 
K
F
 
F
N
 
H
L
 
V
K
 
N
T
 
K
L
 
L
K
 
R
E
 
G
K
 
R
D
 
H
I
 
V
P
 
P
Y
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
K
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
D
 
Q
R
 
K
N
 
T
I
 
V
N
 
Y
N
 
D
N
 
N
L
 
V
K
 
A
F
 
F
V
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
-
K
 
K
D
 
R
S
 
T
V
 
D
K
 
A
M
 
I
D
 
N
A
 
R
K
 
V
I
 
V
E
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
E
K
 
T
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
S
T
 
G
K
 
K
G
 
A
F
 
N
K
 
R
F
 
L
P
 
P
H
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
L
 
V
N
 
N
D
 
R
P
 
P
E
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
S
 
S
V
 
R
E
 
D
I
 
I
M
 
M
K
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
E
 
R
N
 
T
G
 
G
R
 
T
T
 
T
I
 
V
I
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
D
Y
 
H
A
 
H
L
 
I
I
 
V

Sites not aligning to the query:

A5U7B7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25177 / H37Ra) (see 2 papers)
46% identity, 81% coverage: 21:204/227 of query aligns to 19:201/229 of A5U7B7

query
sites
A5U7B7
L
 
L
N
 
D
H
 
D
V
 
I
T
 
N
L
 
V
E
 
K
V
 
I
K
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
Y
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
K
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
F
 
F
M
 
M
K
 
R
T
 
L
L
 
L
Y
 
L
G
 
A
D
 
A
L
 
E
P
 
T
I
 
P
N
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
G
 
V
S
 
R
I
 
V
V
 
S
D
 
K
F
 
F
N
 
H
L
 
V
K
 
N
T
 
K
L
 
L
K
 
R
E
 
G
K
 
R
D
 
H
I
 
V
P
 
P
Y
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
L
 
I
G
 
G
I
x
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
K
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
D
 
Q
R
 
K
N
 
T
I
 
V
N
 
Y
N
 
D
N
 
N
L
 
V
K
 
A
F
 
F
V
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
-
K
 
K
D
 
R
S
 
T
V
 
D
K
 
A
M
 
I
D
 
N
A
 
R
K
 
V
I
 
V
E
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
E
K
 
T
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
S
T
 
G
K
 
K
G
 
A
F
 
N
K
 
R
F
 
L
P
 
P
H
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
L
 
V
N
 
N
D
 
R
P
 
P
E
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
S
 
S
V
 
R
E
 
D
I
 
I
M
 
M
K
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
E
 
R
N
 
T
G
 
G
R
 
T
T
 
T
I
 
V
I
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
D
Y
 
H
A
 
H
L
 
I
I
 
V

8i6rB Cryo-em structure of pseudomonas aeruginosa ftse(e163q)x/envc complex with atp in peptidisc (see paper)
38% identity, 88% coverage: 21:220/227 of query aligns to 18:216/222 of 8i6rB

query
sites
8i6rB
L
 
L
N
 
H
H
 
E
V
 
V
T
 
S
L
 
F
E
 
R
V
 
V
K
 
H
K
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
I
V
 
L
Y
 
F
V
 
V
I
 
T
G
 
G
K
 
H
T
x
S
G
 
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
M
 
L
K
 
R
T
 
L
L
 
I
Y
 
L
G
 
A
D
 
M
L
 
E
P
 
R
I
 
P
N
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
K
G
 
L
S
 
L
I
 
L
V
 
G
D
 
G
F
 
Q
N
 
D
L
 
L
K
 
G
T
 
R
L
 
I
K
 
T
E
 
T
K
 
A
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
F
 
H
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
T
D
 
D
R
 
R
N
 
T
I
 
V
N
 
A
N
 
D
N
 
N
L
 
I
K
 
A
F
 
L
V
 
P
L
 
L
K
 
Q
A
 
I
T
 
L
G
 
G
W
 
M
K
 
P
D
 
K
S
 
P
V
 
-
K
 
E
M
 
I
D
 
A
A
 
K
K
 
R
I
 
V
E
 
A
E
 
S
V
 
A
L
 
L
S
 
E
K
 
R
V
 
V
G
 
N
M
 
L
K
 
K
T
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
E
K
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
S
E
x
D
L
 
L
S
|
S
G
x
T
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
V
N
 
H
D
 
Q
P
 
P
E
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
T
 
L
S
 
A
V
 
S
E
 
E
I
 
I
M
 
M
K
 
G
V
 
V
L
 
F
Q
 
E
D
 
D
I
 
I
N
 
N
E
 
R
N
 
L
G
 
G
R
 
T
T
 
T
I
 
V
I
 
L
M
 
I
A
 
A
T
 
S
H
 
H
D
 
D
Y
 
L
A
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
A
K
 
R
Y
 
M
P
 
R
H
 
H
K
 
R
T
 
M
L
 
L
K
 
T
C
 
L
D
 
Q
N
 
R
S
 
G
K
 
R
V
 
I
F
 
I

Sites not aligning to the query:

8tzjA Cryo-em structure of vibrio cholerae ftse/ftsx complex (see paper)
35% identity, 96% coverage: 5:222/227 of query aligns to 2:220/220 of 8tzjA

query
sites
8tzjA
I
 
V
L
 
I
K
 
R
L
 
F
Q
 
Q
D
 
Q
V
 
V
A
 
S
-
 
K
I
 
A
F
x
Y
Q
 
R
K
 
G
E
 
G
N
x
R
L
 
Q
I
x
A
L
 
L
N
 
Q
H
 
K
V
 
V
T
 
D
L
 
F
E
 
H
V
 
L
K
 
R
K
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
G
G
 
G
K
 
H
T
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
F
 
L
M
 
L
K
 
K
T
 
L
L
 
I
Y
 
C
G
 
A
D
 
I
L
 
E
P
 
R
I
 
P
N
 
T
S
 
D
G
 
G
E
 
K
G
 
I
S
 
S
I
 
F
V
 
N
D
 
G
F
 
H
N
 
D
L
 
I
K
 
T
T
 
R
L
 
I
K
 
P
E
 
N
K
 
K
D
 
D
I
 
I
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
N
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
K
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
M
D
 
D
R
 
R
N
 
S
I
 
I
N
 
Y
N
 
D
N
 
N
L
 
V
K
 
A
F
 
L
V
 
P
L
 
M
K
 
R
A
 
I
T
 
E
G
 
S
W
 
I
K
 
S
D
 
E
S
 
N
V
 
-
K
 
E
M
 
I
D
 
K
A
 
R
K
 
R
I
 
V
E
 
S
E
 
A
V
 
A
L
 
L
S
 
D
K
 
K
V
 
T
G
 
G
M
 
L
K
 
L
T
 
D
K
 
K
G
 
A
F
 
R
K
 
C
F
 
L
P
 
P
H
 
S
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
N
D
 
R
P
 
P
E
 
T
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
L
S
 
S
V
 
S
E
 
R
I
 
V
M
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
F
Q
 
E
D
 
E
I
 
F
N
 
N
E
 
R
N
 
A
G
 
G
R
 
V
T
 
T
I
 
I
I
 
L
M
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
D
Y
 
I
A
 
H
L
 
L
I
 
V
L
 
N
K
 
S
Y
 
R
P
 
P
-
 
Q
H
 
Y
K
 
R
T
 
H
L
 
L
K
 
E
C
 
L
D
 
N
N
 
Q
S
 
G
K
 
F
V
 
L
F
 
S
E
 
E
V
 
V

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
38% identity, 88% coverage: 21:219/227 of query aligns to 18:215/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
L
 
L
N
 
Q
H
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
F
E
 
H
V
 
M
K
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
T
G
 
G
K
 
H
T
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
M
 
L
K
 
K
T
 
L
L
 
I
Y
 
C
G
 
G
D
 
I
L
 
E
P
 
R
I
 
P
N
 
S
S
 
A
G
 
G
E
 
K
G
 
I
S
 
W
I
 
F
V
 
S
D
 
G
F
 
H
N
 
D
L
 
I
K
 
T
T
 
R
L
 
L
K
 
K
E
 
N
K
 
R
D
 
E
I
 
V
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
D
 
D
F
 
H
K
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
M
D
 
D
R
 
R
N
 
T
I
 
V
N
 
Y
N
 
D
N
 
N
L
 
V
K
 
A
F
 
I
V
 
P
L
 
L
K
 
I
A
 
I
T
 
A
G
 
G
W
 
A
K
 
S
-
 
G
D
 
D
S
 
D
V
 
I
K
 
R
M
 
R
D
 
-
A
 
-
K
 
R
I
 
V
E
 
S
E
 
A
V
 
A
L
 
L
S
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
L
T
 
D
K
|
K
G
 
A
F
 
K
K
 
N
F
 
F
P
 
P
H
 
I
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
N
D
 
K
P
 
P
E
 
A
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
Q
 
A
T
 
L
S
 
S
V
 
E
E
 
G
I
 
I
M
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
F
Q
 
E
D
 
E
I
 
F
N
 
N
E
 
R
N
 
V
G
 
G
R
 
V
T
 
T
I
 
V
I
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
|
H
D
 
D
Y
 
I
A
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
S
K
 
R
Y
 
R
P
 
S
H
 
Y
K
 
R
T
 
M
L
 
L
K
 
T
C
 
L
D
 
S
N
 
D
S
 
G
K
 
H
V
 
L

Sites not aligning to the query:

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
38% identity, 88% coverage: 21:219/227 of query aligns to 18:215/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
L
 
L
N
 
Q
H
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
F
E
 
H
V
 
M
K
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
T
G
 
G
K
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
F
 
L
M
 
L
K
 
K
T
 
L
L
 
I
Y
x
C
G
 
G
D
 
I
L
 
E
P
 
R
I
 
P
N
 
S
S
 
A
G
 
G
E
 
K
G
 
I
S
 
W
I
 
F
V
 
S
D
 
G
F
 
H
N
 
D
L
 
I
K
 
T
T
 
R
L
 
L
K
 
K
E
 
N
K
 
R
D
 
E
I
 
V
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
K
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
M
D
 
D
R
 
R
N
 
T
I
 
V
N
 
Y
N
 
D
N
 
N
L
 
V
K
 
A
F
 
I
V
 
P
L
 
L
K
 
I
A
 
I
T
 
A
G
 
G
W
 
A
K
 
S
-
 
G
D
 
D
S
 
D
V
 
I
K
 
R
M
 
R
D
 
-
A
 
-
K
 
R
I
 
V
E
 
S
E
 
A
V
 
A
L
 
L
S
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
L
T
 
D
K
 
K
G
 
A
F
 
K
K
 
N
F
 
F
P
 
P
H
 
I
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
N
D
 
K
P
 
P
E
 
A
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
Q
 
A
T
 
L
S
 
S
V
 
E
E
 
G
I
 
I
M
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
F
Q
 
E
D
 
E
I
 
F
N
 
N
E
 
R
N
 
V
G
 
G
R
 
V
T
 
T
I
 
V
I
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
D
Y
 
I
A
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
S
K
 
R
Y
 
R
P
 
S
H
 
Y
K
 
R
T
 
M
L
 
L
K
 
T
C
 
L
D
 
S
N
 
D
S
 
G
K
 
H
V
 
L

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
37% identity, 88% coverage: 21:219/227 of query aligns to 18:215/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
L
 
L
N
 
Q
H
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
F
E
 
H
V
 
M
K
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
Y
 
F
V
 
L
I
 
T
G
 
G
K
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
M
 
L
K
 
K
T
 
L
L
 
I
Y
 
C
G
 
G
D
 
I
L
 
E
P
 
R
I
 
P
N
 
S
S
 
A
G
 
G
E
 
K
G
 
I
S
 
W
I
 
F
V
 
S
D
 
G
F
 
H
N
 
D
L
 
I
K
 
T
T
 
R
L
 
L
K
 
K
E
 
N
K
 
R
D
 
E
I
 
V
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
K
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
M
D
 
D
R
 
R
N
 
T
I
 
V
N
 
Y
N
 
D
N
 
N
L
 
V
K
 
A
F
 
I
V
 
P
L
 
L
K
 
I
A
 
I
T
 
A
G
 
G
W
 
A
K
 
S
-
 
G
D
 
D
S
 
D
V
 
I
K
 
R
M
 
R
D
 
-
A
 
-
K
 
R
I
 
V
E
 
S
E
 
A
V
 
A
L
 
L
S
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
L
T
 
D
K
 
K
G
 
A
F
 
K
K
 
N
F
 
F
P
 
P
H
 
I
E
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
V
N
 
N
D
 
K
P
 
P
E
 
A
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
Q
 
A
T
 
L
S
 
S
V
 
E
E
 
G
I
 
I
M
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
F
Q
 
E
D
 
E
I
 
F
N
 
N
E
 
R
N
 
V
G
 
G
R
 
V
T
 
T
I
 
V
I
 
L
M
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
D
Y
 
I
A
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
S
K
 
R
Y
 
R
P
 
S
H
 
Y
K
 
R
T
 
M
L
 
L
K
 
T
C
 
L
D
 
S
N
 
D
S
 
G
K
 
H
V
 
L

Sites not aligning to the query:

5xu1B Structure of a non-canonical abc transporter from streptococcus pneumoniae r6 (see paper)
45% identity, 80% coverage: 20:200/227 of query aligns to 22:202/226 of 5xu1B

query
sites
5xu1B
I
 
V
L
 
L
N
 
K
H
 
N
V
 
I
T
 
N
L
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
Y
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
K
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
F
 
L
M
 
M
K
 
N
T
 
T
L
 
I
-
 
G
Y
 
M
G
 
L
D
 
D
L
 
T
P
 
P
I
 
-
N
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
G
 
Y
S
 
Y
I
 
L
V
 
E
D
 
G
F
 
Q
N
 
E
L
 
V
K
 
A
T
 
G
L
 
L
K
 
G
E
 
E
K
 
K
D
 
Q
I
 
L
P
 
A
Y
 
K
L
 
V
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
Q
F
 
F
K
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
S
D
 
K
R
 
L
N
 
N
I
 
A
N
 
L
N
 
Q
N
 
N
L
 
V
K
 
E
F
 
L
V
 
P
L
 
L
K
 
I
A
 
Y
T
 
A
G
 
G
W
 
V
K
 
S
D
 
S
S
 
S
V
 
-
K
 
K
M
 
R
D
 
R
A
 
K
K
 
L
I
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
S
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
E
M
 
L
K
 
T
T
 
E
K
 
R
G
 
S
F
 
H
K
 
H
F
 
L
P
 
P
H
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
N
 
N
D
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
T
Q
 
K
T
 
T
S
 
G
V
 
N
E
 
Q
I
 
I
M
 
M
K
 
Q
V
 
L
L
 
L
Q
 
V
D
 
D
I
 
L
N
 
N
E
 
K
N
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
I
I
 
I
M
 
M
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
40% identity, 97% coverage: 5:225/227 of query aligns to 3:222/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
I
 
I
L
 
L
K
 
R
L
 
A
Q
 
E
D
 
N
V
 
I
A
 
K
I
 
K
F
 
V
Q
 
I
K
 
R
E
 
G
N
 
Y
L
 
E
I
 
I
L
 
L
N
 
K
H
 
G
V
 
I
T
 
S
L
 
L
E
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
Y
 
S
V
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
A
T
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
F
 
L
M
 
L
K
 
Y
T
 
I
L
 
L
-
 
G
Y
 
L
G
 
L
D
 
D
L
 
A
P
 
P
I
 
T
N
 
E
S
 
G
G
 
K
-
 
V
-
 
F
-
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
K
I
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
Y
N
 
T
L
 
-
K
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
N
E
 
E
K
 
K
D
 
E
I
 
L
P
 
S
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
R
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
F
F
 
H
K
 
Y
L
 
L
L
 
I
P
 
P
D
 
E
R
 
L
N
 
T
I
 
A
N
 
L
N
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
I
F
 
V
V
 
P
L
 
M
K
 
L
A
 
K
T
 
M
G
 
G
W
 
-
K
 
K
D
 
P
S
 
K
V
 
K
K
 
E
M
 
A
D
 
K
A
 
E
K
 
R
I
 
G
E
 
E
E
 
Y
V
 
L
L
 
L
S
 
S
K
 
E
V
 
L
G
 
G
M
 
L
K
 
G
T
 
D
K
 
K
G
 
L
F
 
S
K
 
R
F
 
K
P
 
P
H
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
N
D
 
E
P
 
P
E
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
F
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
S
Q
 
A
T
 
N
S
 
T
V
 
K
E
 
R
I
 
V
M
 
M
K
 
D
V
 
I
L
 
F
Q
 
L
D
 
K
I
 
I
N
 
N
E
 
E
N
 
G
G
 
G
R
 
T
T
 
S
I
 
I
I
 
V
M
 
M
A
 
V
T
|
T
H
 
H
D
 
E
Y
 
R
A
 
E
L
 
L
I
 
A
L
 
-
K
 
E
Y
 
L
P
 
T
H
 
H
K
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
E
C
 
M
D
 
K
N
 
D
S
 
G
K
 
K
V
 
V
F
 
V
E
 
G
V
 
E
I
 
I
Q
 
T
K
 
R

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
36% identity, 89% coverage: 20:221/227 of query aligns to 18:218/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
I
x
V
L
 
L
N
 
K
H
 
G
V
 
I
T
 
N
L
 
V
E
 
H
V
 
I
K
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
V
Y
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
P
T
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
M
 
L
K
 
R
T
 
C
L
 
L
Y
 
N
G
 
L
D
 
L
L
 
E
P
 
D
I
 
F
N
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
G
 
I
S
 
I
I
 
I
V
 
D
D
 
G
F
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
T
 
A
L
 
-
K
 
K
E
 
D
K
 
T
D
 
N
I
 
L
P
 
N
Y
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
K
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
R
F
 
F
K
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
D
 
H
R
 
M
N
 
T
I
 
V
N
 
L
N
 
N
N
 
N
L
 
I
K
 
T
F
 
L
V
 
A
-
 
P
L
 
M
K
 
K
A
 
V
T
 
R
G
 
K
W
 
W
K
 
P
D
 
R
S
 
E
V
 
-
K
 
K
M
 
A
D
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
A
E
 
M
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
K
T
 
D
K
 
K
G
 
A
F
 
H
K
 
A
F
 
Y
P
 
P
H
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
M
D
 
E
P
 
P
E
 
K
L
 
I
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
S
 
V
V
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
L
K
 
S
V
 
V
L
 
M
Q
 
K
D
 
Q
I
 
L
N
 
A
E
 
N
N
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
I
 
M
I
 
V
M
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
Y
 
M
A
 
G
L
 
F
I
 
A
L
 
R
K
 
E
Y
 
V
P
 
G
H
 
D
K
 
R
T
 
V
L
 
L
K
 
F
C
 
M
D
 
D
N
 
G
S
 
G
K
 
Y
V
 
I
F
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
36% identity, 89% coverage: 20:221/227 of query aligns to 18:218/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
I
x
V
L
 
L
N
 
K
H
 
G
V
 
I
T
 
N
L
 
V
E
 
H
V
 
I
K
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
V
Y
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
P
T
x
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
M
 
L
K
 
R
T
 
C
L
 
L
Y
 
N
G
 
L
D
 
L
L
 
E
P
 
D
I
 
F
N
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
G
 
I
S
 
I
I
 
I
V
 
D
D
 
G
F
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
T
 
A
L
 
-
K
 
K
E
 
D
K
 
T
D
 
N
I
 
L
P
 
N
Y
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
K
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
R
F
 
F
K
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
D
 
H
R
 
M
N
 
T
I
 
V
N
 
L
N
 
N
N
 
N
L
 
I
K
 
T
F
 
L
V
 
A
-
 
P
L
 
M
K
 
K
A
 
V
T
 
R
G
 
K
W
 
W
K
 
P
D
 
R
S
 
E
V
 
-
K
 
K
M
 
A
D
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
A
E
 
M
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
K
T
 
D
K
 
K
G
 
A
F
 
H
K
 
A
F
 
Y
P
 
P
H
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
M
D
 
E
P
 
P
E
 
K
L
 
I
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
S
 
V
V
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
L
K
 
S
V
 
V
L
 
M
Q
 
K
D
 
Q
I
 
L
N
 
A
E
 
N
N
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
I
 
M
I
 
V
M
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
Y
 
M
A
 
G
L
 
F
I
 
A
L
 
R
K
 
E
Y
 
V
P
 
G
H
 
D
K
 
R
T
 
V
L
 
L
K
 
F
C
 
M
D
 
D
N
 
G
S
 
G
K
 
Y
V
 
I
F
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
36% identity, 89% coverage: 20:221/227 of query aligns to 18:218/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
I
x
V
L
 
L
N
 
K
H
 
G
V
 
I
T
 
N
L
 
V
E
 
H
V
 
I
K
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
V
Y
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
P
T
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
M
 
L
K
 
R
T
 
C
L
 
L
Y
 
N
G
 
L
D
 
L
L
 
E
P
 
D
I
 
F
N
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
G
 
I
S
 
I
I
 
I
V
 
D
D
 
G
F
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
T
 
A
L
 
-
K
 
K
E
 
D
K
 
T
D
 
N
I
 
L
P
 
N
Y
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
K
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
R
F
 
F
K
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
D
 
H
R
 
M
N
 
T
I
 
V
N
 
L
N
 
N
N
 
N
L
 
I
K
 
T
F
 
L
V
 
A
-
 
P
L
 
M
K
 
K
A
 
V
T
 
R
G
 
K
W
 
W
K
 
P
D
 
R
S
 
E
V
 
-
K
 
K
M
 
A
D
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
A
E
 
M
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
K
T
 
D
K
 
K
G
 
A
F
 
H
K
 
A
F
 
Y
P
 
P
H
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
M
D
 
E
P
 
P
E
 
K
L
 
I
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
S
 
V
V
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
L
K
 
S
V
 
V
L
 
M
Q
 
K
D
 
Q
I
 
L
N
 
A
E
 
N
N
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
I
 
M
I
 
V
M
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
Y
 
M
A
 
G
L
 
F
I
 
A
L
 
R
K
 
E
Y
 
V
P
 
G
H
 
D
K
 
R
T
 
V
L
 
L
K
 
F
C
 
M
D
 
D
N
 
G
S
 
G
K
 
Y
V
 
I
F
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
36% identity, 89% coverage: 20:221/227 of query aligns to 18:218/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
I
x
V
L
 
L
N
 
K
H
 
G
V
 
I
T
 
N
L
 
V
E
 
H
V
 
I
K
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
V
Y
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
P
T
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
M
 
L
K
 
R
T
 
C
L
 
L
Y
 
N
G
 
L
D
 
L
L
 
E
P
 
D
I
 
F
N
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
G
 
I
S
 
I
I
 
I
V
 
D
D
 
G
F
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
T
 
A
L
 
-
K
 
K
E
 
D
K
 
T
D
 
N
I
 
L
P
 
N
Y
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
K
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
R
F
 
F
K
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
D
 
H
R
 
M
N
 
T
I
 
V
N
 
L
N
 
N
N
 
N
L
 
I
K
 
T
F
 
L
V
 
A
-
 
P
L
 
M
K
 
K
A
 
V
T
 
R
G
 
K
W
 
W
K
 
P
D
 
R
S
 
E
V
 
-
K
 
K
M
 
A
D
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
A
E
 
M
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
K
T
 
D
K
 
K
G
 
A
F
 
H
K
 
A
F
 
Y
P
 
P
H
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
M
D
 
E
P
 
P
E
 
K
L
 
I
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
S
 
V
V
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
L
K
 
S
V
 
V
L
 
M
Q
 
K
D
 
Q
I
 
L
N
 
A
E
 
N
N
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
I
 
M
I
 
V
M
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
Y
 
M
A
 
G
L
 
F
I
 
A
L
 
R
K
 
E
Y
 
V
P
 
G
H
 
D
K
 
R
T
 
V
L
 
L
K
 
F
C
 
M
D
 
D
N
 
G
S
 
G
K
 
Y
V
 
I
F
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
33% identity, 89% coverage: 20:221/227 of query aligns to 17:216/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
x
V
L
 
L
N
 
K
H
 
G
V
 
I
T
 
H
L
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
A
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
K
V
 
L
Y
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
P
T
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
M
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
I
Y
 
-
G
 
-
D
 
N
L
 
R
P
 
L
I
 
E
N
 
D
S
 
F
G
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
V
 
V
D
 
V
F
 
D
N
 
G
L
 
L
K
 
S
T
 
V
L
 
K
K
 
D
E
 
D
K
 
R
D
 
A
I
 
L
P
 
R
Y
 
E
L
 
I
R
 
R
R
 
R
K
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
Q
F
 
F
K
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
D
 
H
R
 
M
N
 
T
I
 
V
N
 
L
N
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
T
F
 
L
V
 
A
-
 
P
L
 
M
K
 
R
A
 
V
T
 
R
G
 
R
W
 
W
K
 
P
D
 
R
S
 
E
V
 
-
K
 
K
M
 
A
D
 
E
A
 
K
K
 
K
I
 
A
E
 
L
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
E
K
 
R
V
 
V
G
 
G
M
 
I
K
 
L
T
 
D
K
 
Q
G
 
A
F
 
R
K
 
K
F
 
Y
P
 
P
H
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
M
D
 
E
P
 
P
E
 
K
L
 
I
I
 
M
L
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
S
 
V
V
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
L
K
 
D
V
 
V
L
 
M
Q
 
R
D
 
D
I
 
L
N
 
A
E
 
Q
N
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
T
I
 
M
I
 
V
M
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
Y
 
M
A
 
G
L
 
F
I
 
A
L
 
R
K
 
E
Y
 
V
P
 
A
H
 
D
K
 
R
T
 
V
L
 
V
K
 
F
C
 
M
D
 
D
N
 
G
S
 
G
K
 
Q
V
 
I
F
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
40% identity, 81% coverage: 21:204/227 of query aligns to 21:204/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
L
N
 
N
H
 
N
V
 
V
T
 
S
L
 
L
E
 
H
V
 
V
K
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
F
 
I
V
 
Y
Y
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
A
T
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
M
 
I
K
 
R
T
 
C
L
 
V
Y
 
-
G
 
-
D
 
N
L
 
L
P
 
L
I
 
E
N
 
R
S
 
P
G
 
T
E
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
-
 
L
V
 
V
D
 
D
F
 
G
N
 
Q
-
 
E
L
 
L
K
 
T
T
 
T
L
 
L
K
 
S
E
 
E
K
 
S
D
 
E
I
 
L
P
 
T
Y
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
F
 
F
K
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
D
 
S
R
 
R
N
 
T
I
 
V
N
 
F
N
 
G
N
 
N
L
 
V
K
 
A
F
 
L
V
 
P
L
 
L
K
 
E
A
 
L
T
 
D
G
 
N
W
 
T
-
 
P
K
 
K
D
 
D
S
 
E
V
 
V
K
 
K
M
 
R
D
 
-
A
 
-
K
 
R
I
 
V
E
 
T
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
S
K
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
G
T
 
D
K
 
K
G
 
H
F
 
D
K
 
S
F
 
Y
P
 
P
H
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
S
D
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
T
 
T
S
 
T
V
 
R
E
 
S
I
 
I
M
 
L
K
 
E
V
 
L
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
N
E
 
R
N
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
L
T
 
T
I
 
I
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
L
 
V
I
 
V

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
40% identity, 81% coverage: 21:204/227 of query aligns to 22:205/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
L
N
 
N
H
 
N
V
 
V
T
 
S
L
 
L
E
 
H
V
 
V
K
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
F
 
I
V
 
Y
Y
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
A
T
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
M
 
I
K
 
R
T
 
C
L
 
V
Y
 
-
G
 
-
D
 
N
L
 
L
P
 
L
I
 
E
N
 
R
S
 
P
G
 
T
E
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
-
 
L
V
 
V
D
 
D
F
 
G
N
 
Q
-
 
E
L
 
L
K
 
T
T
 
T
L
 
L
K
 
S
E
 
E
K
 
S
D
 
E
I
 
L
P
 
T
Y
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
F
 
F
K
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
D
 
S
R
 
R
N
 
T
I
 
V
N
 
F
N
 
G
N
 
N
L
 
V
K
 
A
F
 
L
V
 
P
L
 
L
K
 
E
A
 
L
T
 
D
G
 
N
W
 
T
-
 
P
K
 
K
D
 
D
S
 
E
V
 
V
K
 
K
M
 
R
D
 
-
A
 
-
K
 
R
I
 
V
E
 
T
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
S
K
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
L
K
 
G
T
 
D
K
 
K
G
 
H
F
 
D
K
 
S
F
 
Y
P
 
P
H
 
S
E
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
x
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
S
D
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
T
 
T
S
 
T
V
 
R
E
 
S
I
 
I
M
 
L
K
 
E
V
 
L
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
N
E
 
R
N
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
L
T
 
T
I
 
I
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
T
H
|
H
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
L
 
V
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_054560113.1 NCBI__GCF_001306415.1:WP_054560113.1
MPETILKLQDVAIFQKENLILNHVTLEVKKGEFVYVIGKTGSGKSSFMKTLYGDLPINSG
EGSIVDFNLKTLKEKDIPYLRRKLGIVFQDFKLLPDRNINNNLKFVLKATGWKDSVKMDA
KIEEVLSKVGMKTKGFKFPHELSGGEQQRIAIARALLNDPELILADEPTGNLDPQTSVEI
MKVLQDINENGRTIIMATHDYALILKYPHKTLKCDNSKVFEVIQKAI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory