SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_055068652.1 NCBI__GCF_001406815.1:WP_055068652.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ml4A The pala-liganded aspartate transcarbamoylase catalytic subunit from pyrococcus abyssi (see paper)
51% identity, 99% coverage: 2:303/306 of query aligns to 5:306/307 of 1ml4A

query
sites
1ml4A
R
 
R
H
 
D
L
 
V
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
R
D
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
K
E
 
E
E
 
D
L
 
I
D
 
E
Q
 
T
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
E
D
 
R
I
 
L
E
 
E
K
 
R
H
 
E
P
 
L
K
 
K
K
 
E
Y
 
K
A
 
G
H
 
Q
A
 
L
-
 
E
-
 
Y
C
 
A
D
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
C
 
L
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
S
A
 
A
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
E
A
 
A
D
 
S
S
 
T
S
 
S
S
 
S
A
 
V
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
S
 
R
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
K
V
 
T
I
 
V
S
 
E
C
 
Q
Y
 
Y
A
 
C
D
 
D
I
 
V
C
 
I
A
 
V
M
 
I
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
A
Q
 
E
K
 
V
S
 
A
R
 
E
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
Y
T
 
T
I
 
I
R
 
K
S
 
K
L
 
E
K
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
D
N
 
G
I
 
L
T
 
K
I
 
I
G
 
G
L
 
L
C
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
T
R
 
F
Y
 
Y
E
 
-
N
 
D
V
 
V
K
 
E
F
 
L
I
 
Y
L
 
L
I
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
E
 
L
L
 
L
K
 
R
I
 
M
P
 
P
D
 
R
Y
 
H
I
 
I
R
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
-
L
 
L
Q
 
R
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
M
E
 
K
F
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
T
E
 
T
R
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
V
M
 
I
S
 
G
Q
 
K
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
M
 
V
T
|
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
F
 
P
N
 
D
E
 
E
E
 
Q
D
 
E
Y
 
Y
I
 
L
R
 
K
L
 
V
K
 
K
D
 
G
F
 
S
Y
 
Y
I
 
Q
L
 
V
T
 
N
K
 
L
E
 
K
K
 
V
M
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
A
K
 
K
D
 
D
D
 
E
M
 
L
I
 
R
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
H
V
 
P
E
 
E
V
 
V
D
 
D
D
 
N
D
 
T
P
 
K
R
 
H
A
 
A
A
 
I
Y
 
Y
F
 
F
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
F
N
 
N
G
|
G
V
 
V
Y
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
V

4eknB Structure of the catalytic chain of methanococcus jannaschii aspartate transcarbamoylase in a hexagonal crystal form (see paper)
51% identity, 98% coverage: 1:301/306 of query aligns to 1:300/304 of 4eknB

query
sites
4eknB
M
 
M
R
 
K
H
 
H
L
 
L
M
 
I
S
 
S
P
 
M
L
 
K
D
 
D
F
 
I
S
 
G
V
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
I
D
 
L
Q
 
E
L
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
E
A
 
A
S
 
R
D
 
K
I
 
M
E
 
E
K
 
E
-
 
L
-
 
L
H
 
N
P
 
T
K
 
K
K
 
R
Y
 
P
A
 
L
H
 
K
A
 
L
C
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
C
 
V
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
A
M
 
M
L
 
K
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
L
 
I
G
 
T
F
 
M
A
 
T
S
 
D
A
 
L
D
 
K
S
 
S
S
 
S
S
 
S
A
 
V
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
S
 
I
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
R
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
I
 
I
C
 
I
A
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
K
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
S
Q
 
E
K
 
Y
S
 
S
R
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
Y
T
 
T
I
 
I
R
 
M
S
 
R
L
 
E
K
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
D
N
 
G
I
 
I
T
 
K
I
 
I
G
 
A
L
 
F
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
Y
A
 
A
L
 
L
I
 
S
R
 
L
Y
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
K
 
E
F
 
M
I
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
E
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
R
I
 
L
P
 
P
D
 
K
Y
 
D
I
 
I
R
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
-
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
N
 
K
H
 
N
V
 
I
E
 
K
F
 
F
E
 
Y
E
 
E
V
 
K
E
 
E
R
 
S
L
 
L
E
 
D
D
 
D
A
 
L
M
 
D
S
 
D
Q
 
D
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
M
 
V
T
|
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
F
 
P
N
 
D
E
 
P
E
 
N
D
 
E
Y
 
Y
I
 
E
R
 
K
L
 
V
K
 
K
D
 
G
F
 
S
Y
 
Y
I
 
K
L
 
I
T
 
K
K
 
R
E
 
E
K
 
Y
M
 
V
E
 
E
L
 
G
A
 
K
K
 
K
D
 
-
D
 
-
M
 
F
I
 
I
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
D
V
 
Y
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
D
D
 
L
P
 
P
R
 
Q
A
 
A
A
 
K
Y
 
Y
F
 
F
T
 
K
Q
 
Q
V
 
S
Q
 
F
N
 
Y
G
|
G
V
 
I
Y
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
I
I
 
L
L
 
K
T
 
K
L
 
L
L
 
I

P0A786 Aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 8:306/311 of P0A786

query
sites
P0A786
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
 
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

Sites not aligning to the query:

2hseA Structure of d236a e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of phosphonoacetamide and l-aspartate at 2.60 a resolution
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 2hseA

query
sites
2hseA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
|
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
|
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
F
 
A
N
 
P
E
 
S
E
 
E
D
 
-
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
x
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
|
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

2a0fA Structure of d236a mutant e. Coli aspartate transcarbamoylase in presence of phosphonoacetamide at 2.90 a resolution (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 2a0fA

query
sites
2a0fA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
F
 
A
N
 
P
E
 
S
E
 
E
D
 
-
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

5g1nE Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to pala (see paper)
47% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 6:305/307 of 5g1nE

query
sites
5g1nE
R
 
Q
H
 
H
L
 
I
M
 
L
S
 
S
P
 
V
L
 
Q
D
 
Q
F
 
F
S
 
T
V
 
K
E
 
D
E
 
Q
L
 
M
D
 
S
Q
 
H
L
 
L
L
 
F
D
 
N
L
 
V
A
 
A
S
 
H
D
 
T
I
 
L
E
 
R
K
 
M
H
 
M
P
 
V
K
 
Q
K
 
K
Y
 
E
A
 
R
H
 
S
-
 
L
-
 
D
A
 
I
C
 
L
D
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
V
L
 
M
A
 
A
T
 
S
C
 
M
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
L
 
S
S
 
S
F
 
F
E
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
A
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
S
F
 
F
A
 
S
S
 
E
A
 
A
D
 
-
S
 
T
S
 
S
S
|
S
A
 
V
S
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
S
I
 
V
R
 
Q
V
 
T
I
 
M
S
 
S
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
I
 
V
C
 
V
A
 
V
M
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
V
L
 
E
V
 
L
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
K
 
H
S
 
C
R
 
R
I
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
V
H
 
G
Q
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
A
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
I
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
R
S
 
E
L
 
E
K
 
L
G
 
G
R
 
T
L
 
V
G
 
N
N
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
I
G
 
T
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
A
N
 
C
A
 
L
L
 
L
I
 
T
R
 
Q
Y
 
Y
E
 
-
N
 
R
V
 
V
K
 
S
F
 
L
I
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
E
 
P
E
 
S
L
 
L
K
 
R
I
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
T
I
 
V
R
 
R
E
 
A
D
 
F
V
 
V
L
 
-
Q
 
A
A
 
S
N
 
R
H
 
G
V
 
T
E
 
K
F
 
Q
E
 
E
E
 
E
V
 
F
E
 
E
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
A
M
 
L
S
 
P
Q
 
D
L
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
I
Q
|
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
F
 
G
N
 
S
E
 
T
E
 
Q
D
 
E
Y
 
Y
I
 
E
R
 
A
L
 
C
K
 
F
D
 
G
F
 
Q
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
T
 
T
K
 
P
E
 
H
K
 
I
M
 
M
E
 
T
L
 
R
A
 
A
K
 
K
D
 
K
D
 
K
M
 
M
I
 
V
V
 
V
L
 
M
H
 
H
P
|
P
L
x
M
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
I
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
D
D
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
T
 
R
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
E
N
 
N
G
|
G
V
 
M
Y
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G

2ipoA E. Coli aspartate transcarbamoylase complexed with n-phosphonacetyl-l- asparagine (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 2ipoA

query
sites
2ipoA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

2h3eA Structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of n-phosphonacetyl-l-isoasparagine at 2.3a resolution (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 2h3eA

query
sites
2h3eA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

2fzkA The structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in complex with novel t state inhibitors at 2.50 resolution (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 2fzkA

query
sites
2fzkA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
|
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

2fzgA The structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in complex with novel t state inhibitors at 2.25 resolution (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 2fzgA

query
sites
2fzgA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

2fzcA The structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in complex with novel t state inhibitors at 2.10 resolution (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 2fzcA

query
sites
2fzcA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

2airA T-state active site of aspartate transcarbamylase:crystal structure of the carbamyl phosphate and l-alanosine ligated enzyme (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 2airA

query
sites
2airA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

1za2A Structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of ctp, carbamoyl phosphate at 2.50 a resolution (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 1za2A

query
sites
1za2A
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

1r0cA Products in the t state of aspartate transcarbamylase: crystal structure of the phosphate and n-carbamyl-l-aspartate ligated enzyme (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 1r0cA

query
sites
1r0cA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

1r0bA Aspartate transcarbamylase (atcase) of escherichia coli: a new crystalline r state bound to pala, or to product analogues phosphate and citrate (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 1r0bA

query
sites
1r0bA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
|
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
|
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
|
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

2at1A Crystal structures of phosphonoacetamide ligated t and phosphonoacetamide and malonate ligated r states of aspartate carbamoyltransferase at 2.8-angstroms resolution and neutral ph (see paper)
45% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 2at1A

query
sites
2at1A
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
Q
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
Q
L
 
T
K
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
E
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

1at1A Crystal structures of phosphonoacetamide ligated t and phosphonoacetamide and malonate ligated r states of aspartate carbamoyltransferase at 2.8-angstroms resolution and neutral p H (see paper)
45% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/310 of 1at1A

query
sites
1at1A
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
Q
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
Q
L
 
T
K
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
E
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
|
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
 
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

P27708 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
47% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 1924:2223/2225 of P27708

query
sites
P27708
R
x
Q
H
|
H
L
x
I
M
x
L
S
|
S
P
x
V
L
x
Q
D
x
Q
F
|
F
S
x
T
V
x
K
E
x
D
E
x
Q
L
x
M
D
x
S
Q
x
H
L
|
L
L
x
F
D
x
N
L
x
V
A
|
A
S
x
H
D
x
T
I
x
L
E
x
R
K
x
M
H
x
M
P
x
V
K
x
Q
K
|
K
Y
x
E
A
x
R
H
x
S
-
x
L
-
x
D
A
x
I
C
x
L
D
x
K
G
|
G
K
|
K
K
x
V
L
x
M
A
|
A
T
x
S
C
x
M
F
|
F
Y
|
Y
E
|
E
P
x
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
x
S
L
x
S
S
|
S
F
|
F
E
x
A
A
|
A
A
|
A
M
|
M
L
x
A
N
x
R
L
|
L
G
|
G
G
|
G
S
x
A
V
|
V
L
|
L
G
x
S
F
|
F
A
x
S
S
x
E
A
|
A
D
 
-
S
x
T
S
|
S
S
|
S
A
x
V
S
x
Q
K
|
K
G
|
G
E
|
E
S
|
S
I
x
L
S
x
A
D
|
D
T
x
S
I
x
V
R
x
Q
V
x
T
I
x
M
S
|
S
C
|
C
Y
|
Y
A
|
A
D
|
D
I
x
V
C
x
V
A
x
V
M
x
L
R
|
R
H
|
H
P
|
P
K
x
Q
E
x
P
G
|
G
A
|
A
A
x
V
L
x
E
V
x
L
A
|
A
S
x
A
Q
x
K
K
x
H
S
x
C
R
|
R
I
x
R
P
|
P
V
|
V
I
|
I
N
|
N
A
|
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
x
V
H
x
G
Q
x
E
H
|
H
P
|
P
T
|
T
Q
|
Q
T
x
A
L
|
L
T
x
L
D
|
D
L
x
I
M
x
F
T
|
T
I
|
I
R
|
R
S
x
E
L
x
E
K
x
L
G
|
G
R
x
T
L
x
V
G
x
N
N
x
G
I
x
M
T
|
T
I
|
I
G
x
T
L
x
M
C
x
V
G
|
G
D
|
D
L
|
L
K
|
K
F
x
H
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
|
V
H
|
H
S
|
S
L
|
L
I
x
A
N
x
C
A
x
L
L
|
L
I
x
T
R
x
Q
Y
|
Y
E
 
-
N
x
R
V
|
V
K
x
S
F
x
L
I
x
R
L
x
Y
I
x
V
S
x
A
P
|
P
E
x
P
E
x
S
L
|
L
K
x
R
I
x
M
P
|
P
D
x
P
Y
x
T
I
x
V
R
|
R
E
x
A
D
x
F
V
|
V
L
 
-
Q
x
A
A
x
S
N
x
R
H
x
G
V
x
T
E
x
K
F
x
Q
E
|
E
E
|
E
V
x
F
E
|
E
R
x
S
L
x
I
E
|
E
D
x
E
A
|
A
M
x
L
S
x
P
Q
x
D
L
x
T
D
|
D
V
|
V
L
|
L
Y
|
Y
M
|
M
T
|
T
R
|
R
V
x
I
Q
|
Q
R
x
K
E
|
E
R
|
R
F
|
F
F
x
G
N
x
S
E
x
T
E
x
Q
D
x
E
Y
|
Y
I
x
E
R
x
A
L
x
C
K
x
F
D
x
G
F
x
Q
Y
x
F
I
|
I
L
|
L
T
|
T
K
x
P
E
x
H
K
x
I
M
|
M
E
x
T
L
x
R
A
|
A
K
|
K
D
x
K
D
x
K
M
|
M
I
x
V
V
|
V
L
x
M
H
|
H
P
|
P
L
x
M
P
|
P
R
|
R
V
|
V
N
|
N
E
|
E
I
|
I
S
|
S
V
|
V
E
|
E
V
|
V
D
|
D
D
x
S
D
|
D
P
|
P
R
|
R
A
|
A
A
|
A
Y
|
Y
F
|
F
T
x
R
Q
|
Q
V
x
A
Q
x
E
N
|
N
G
|
G
V
x
M
Y
|
Y
V
x
I
R
|
R
M
|
M
A
|
A
L
|
L
I
x
L
L
x
A
T
|
T
L
x
V
L
|
L
G
|
G

Sites not aligning to the query:

5vmqC Structure of the r105a mutant catalytic trimer of escherichia coli aspartate transcarbamoylase at 2.0-a resolution (see paper)
45% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 7:305/309 of 5vmqC

query
sites
5vmqC
R
 
K
H
 
H
L
 
I
M
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
N
D
 
D
F
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
N
Q
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
A
L
 
T
A
 
A
S
 
A
D
 
K
I
 
L
E
 
K
K
 
A
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
K
 
P
Y
 
-
A
 
-
H
 
E
A
 
L
C
 
L
D
 
K
G
 
H
K
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
C
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
A
 
S
M
 
M
L
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
-
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
N
S
 
T
S
 
S
S
 
L
A
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
R
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
C
 
T
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
I
 
A
C
 
I
A
 
V
M
 
M
R
x
A
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
K
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
H
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
S
 
E
L
 
T
K
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
L
T
 
H
I
 
V
G
 
A
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
A
R
 
K
Y
 
F
E
 
D
N
 
G
V
 
N
K
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
E
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
A
I
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
R
 
L
E
 
-
D
 
D
V
 
M
L
 
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
K
H
 
G
V
 
I
E
 
A
F
 
W
E
 
S
E
 
L
V
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
E
|
E
D
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
S
D
 
E
Y
 
Y
I
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
A
F
 
Q
Y
 
F
I
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
A
E
 
S
K
x
D
M
 
L
E
 
H
L
 
N
A
 
A
K
 
K
D
 
A
D
 
N
M
 
M
I
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
V
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
A
 
A
A
 
W
Y
 
Y
F
 
F
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
G
N
 
N
G
|
G
V
 
I
Y
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
N

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
47% identity, 98% coverage: 2:302/306 of query aligns to 1924:2223/2225 of P08955

query
sites
P08955
R
 
Q
H
 
H
L
 
I
M
 
L
S
 
S
P
 
V
L
 
K
D
 
Q
F
 
F
S
 
T
V
 
K
E
 
D
E
 
Q
L
 
M
D
 
S
Q
 
H
L
 
L
L
 
F
D
 
N
L
 
V
A
 
A
S
 
H
D
 
T
I
 
L
E
 
R
K
 
M
H
 
M
P
 
V
K
 
Q
K
 
K
Y
 
E
A
 
R
H
 
S
-
 
L
-
 
D
A
 
I
C
 
L
D
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
V
L
 
M
A
 
A
T
 
S
C
 
M
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
L
 
S
S
 
S
F
 
F
E
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
A
N
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
S
F
 
F
A
 
S
S
 
E
A
 
A
D
 
-
S
 
T
S
 
S
S
 
S
A
 
V
S
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
I
 
L
S
 
A
D
 
D
T
 
S
I
 
V
R
 
Q
V
 
T
I
 
M
S
 
S
C
 
C
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
I
 
V
C
 
V
A
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
E
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
V
L
 
E
V
 
L
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
K
 
H
S
 
C
R
 
R
I
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
V
H
 
G
Q
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
T
 
A
L
 
L
T
 
L
D
 
D
L
 
I
M
 
F
T
 
T
I
 
I
R
 
R
S
 
E
L
 
E
K
 
L
G
 
G
R
 
T
L
 
V
G
 
N
N
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
I
G
 
T
L
 
M
C
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
A
N
 
C
A
 
L
L
 
L
I
 
T
R
 
Q
Y
 
Y
E
 
-
N
 
R
V
 
V
K
 
S
F
 
L
I
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
E
 
P
E
 
S
L
 
L
K
 
R
I
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
S
I
 
V
R
 
W
E
 
-
D
 
D
V
 
F
L
 
V
Q
 
A
A
 
S
N
 
R
H
 
G
V
 
T
E
 
K
F
 
Q
E
 
E
E
 
E
V
 
F
E
 
E
R
 
S
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
A
M
 
L
S
 
P
Q
 
D
L
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
R
 
R
V
 
I
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
F
 
G
N
 
S
E
 
T
E
 
Q
D
 
E
Y
 
Y
I
 
E
R
 
A
L
 
C
K
 
F
D
 
G
F
 
Q
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
T
 
T
K
 
P
E
 
H
K
 
I
M
 
M
E
 
T
L
 
R
A
 
A
K
 
K
D
 
K
D
 
K
M
 
M
I
 
V
V
 
V
L
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
M
P
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
I
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
D
D
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
T
 
R
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
M
Y
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
T
 
T
L
 
V
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_055068652.1 NCBI__GCF_001406815.1:WP_055068652.1
MRHLMSPLDFSVEELDQLLDLASDIEKHPKKYAHACDGKKLATCFYEPSTRTRLSFEAAM
LNLGGSVLGFASADSSSASKGESISDTIRVISCYADICAMRHPKEGAALVASQKSRIPVI
NAGDGGHQHPTQTLTDLMTIRSLKGRLGNITIGLCGDLKFGRTVHSLINALIRYENVKFI
LISPEELKIPDYIREDVLQANHVEFEEVERLEDAMSQLDVLYMTRVQRERFFNEEDYIRL
KDFYILTKEKMELAKDDMIVLHPLPRVNEISVEVDDDPRAAYFTQVQNGVYVRMALILTL
LGIEVE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory