SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_055435882.1 NCBI__GCF_001418085.1:WP_055435882.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8k1pB Mycobacterial efflux pump, adp+vanadate bound state
34% identity, 69% coverage: 5:216/308 of query aligns to 4:213/213 of 8k1pB

query
sites
8k1pB
L
 
I
E
 
E
A
 
I
Q
 
R
S
 
G
V
 
L
S
 
T
K
 
K
N
 
H
F
|
F
G
 
G
D
 
S
F
 
V
T
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
G
V
 
L
S
 
D
I
 
L
S
 
T
V
 
V
E
 
R
K
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
F
 
H
G
 
G
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
T
I
 
L
R
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
L
Q
 
G
I
 
L
T
 
V
M
 
K
P
 
A
D
 
D
K
 
G
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
-
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
G
G
 
G
E
 
D
P
 
P
-
 
W
-
 
T
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
D
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
H
 
H
H
 
-
I
 
-
Q
 
-
N
 
-
I
 
I
G
 
A
Y
 
Y
L
 
V
P
 
P
E
 
G
E
 
D
R
 
V
G
 
T
L
 
L
Y
 
W
K
 
P
T
 
S
M
 
L
K
 
T
V
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
A
 
I
L
 
D
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
L
 
M
K
 
R
G
 
G
-
 
G
L
 
I
D
 
D
K
 
N
A
 
A
E
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
R
L
 
R
H
 
A
E
 
E
W
 
L
F
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
G
I
 
L
G
 
D
D
 
P
W
 
-
W
 
-
N
 
T
K
 
K
K
 
K
I
 
A
Q
 
R
E
x
T
L
 
Y
S
|
S
K
 
K
G
 
G
M
 
N
A
 
R
Q
 
Q
K
 
K
I
 
V
Q
 
S
F
 
L
V
 
I
V
 
S
T
 
A
V
 
L
L
 
S
H
 
S
Q
 
H
P
 
A
K
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
S
S
 
S
G
 
G
F
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
L
N
 
M
A
 
E
D
 
N
I
 
V
I
 
F
K
 
Q
N
 
Q
E
 
C
I
 
I
L
 
G
R
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
Q
D
 
R
G
 
G
A
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
F
 
L
S
 
S
T
 
S
H
 
H
R
 
I
M
 
L
E
 
A
S
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
E
H
 
K
I
 
V
A
 
T
L
 
I
I
 
I
H
 
R
K
 
A
S
 
G
N
 
K
K
 
T
I
 
V
L
 
E
D
 
S
G
 
G
N
 
S
L
 
L

8k1oB Mycobacterial efflux pump, amppnp bound state
34% identity, 69% coverage: 5:216/308 of query aligns to 6:215/215 of 8k1oB

query
sites
8k1oB
L
 
I
E
 
E
A
 
I
Q
 
R
S
 
G
V
 
L
S
 
T
K
 
K
N
 
H
F
 
F
G
 
G
D
 
S
F
 
V
T
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
G
V
 
L
S
 
D
I
 
L
S
 
T
V
 
V
E
 
R
K
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
F
 
H
G
 
G
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
T
I
 
L
R
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
L
Q
 
G
I
 
L
T
 
V
M
 
K
P
 
A
D
 
D
K
 
G
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
-
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
G
G
 
G
E
 
D
P
 
P
-
 
W
-
 
T
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
D
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
H
 
H
H
 
-
I
 
-
Q
 
-
N
 
-
I
 
I
G
 
A
Y
 
Y
L
 
V
P
 
P
E
 
G
E
 
D
R
 
V
G
 
T
L
 
L
Y
 
W
K
 
P
T
 
S
M
 
L
K
 
T
V
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
A
 
I
L
 
D
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
L
 
M
K
 
R
G
 
G
-
 
G
L
 
I
D
 
D
K
 
N
A
 
A
E
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
R
L
 
R
H
 
A
E
 
E
W
 
L
F
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
G
I
 
L
G
 
D
D
 
P
W
 
-
W
 
-
N
 
T
K
 
K
K
 
K
I
 
A
Q
 
R
E
x
T
L
 
Y
S
|
S
K
 
K
G
 
G
M
 
N
A
 
R
Q
 
Q
K
 
K
I
 
V
Q
 
S
F
 
L
V
 
I
V
 
S
T
 
A
V
 
L
L
 
S
H
 
S
Q
 
H
P
 
A
K
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
S
S
 
S
G
 
G
F
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
L
N
 
M
A
 
E
D
 
N
I
 
V
I
 
F
K
 
Q
N
 
Q
E
 
C
I
 
I
L
 
G
R
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
Q
D
 
R
G
 
G
A
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
F
 
L
S
 
S
T
 
S
H
 
H
R
 
I
M
 
L
E
 
A
S
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
E
H
 
K
I
 
V
A
 
T
L
 
I
I
 
I
H
 
R
K
 
A
S
 
G
N
 
K
K
 
T
I
 
V
L
 
E
D
 
S
G
 
G
N
 
S
L
 
L

Q8IUA7 ATP-binding cassette sub-family A member 9; EC 7.6.2.- from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
33% identity, 67% coverage: 19:223/308 of query aligns to 1308:1512/1624 of Q8IUA7

query
sites
Q8IUA7
A
 
A
L
 
T
N
 
R
N
 
N
V
 
V
S
 
S
I
 
F
S
 
C
V
 
V
E
 
K
K
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
T
I
 
I
R
 
K
I
 
M
I
 
I
N
 
T
Q
 
G
I
 
D
T
 
T
M
 
K
P
 
P
D
 
T
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Q
 
G
R
 
F
H
 
-
H
 
-
I
 
-
Q
 
-
N
 
-
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
C
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
R
 
N
G
 
A
L
 
L
Y
 
W
K
 
P
T
 
N
M
 
L
K
 
T
V
 
V
G
 
R
E
 
Q
Q
 
H
A
 
L
L
 
E
Y
 
V
L
 
Y
A
 
A
Q
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
R
K
 
K
A
 
G
E
 
D
A
 
A
K
 
M
K
 
I
R
 
A
L
 
I
H
 
T
E
 
R
W
 
L
F
 
V
E
 
D
R
 
A
L
 
L
E
 
K
I
 
L
G
 
Q
D
 
D
W
 
Q
W
 
L
N
 
K
K
 
A
K
 
P
I
 
V
Q
 
K
E
 
T
L
 
L
S
 
S
K
 
E
G
 
G
M
 
I
A
 
K
Q
 
R
K
 
K
I
 
L
Q
 
C
F
 
F
V
 
V
V
 
L
T
 
S
V
 
I
L
 
L
H
 
G
Q
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
V
L
 
V
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
S
S
 
T
G
 
G
F
 
M
D
 
D
P
 
P
I
 
E
N
 
G
A
 
Q
D
 
Q
I
 
Q
I
 
M
K
 
W
N
 
Q
E
 
V
I
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
T
L
 
F
R
 
R
L
 
N
R
 
T
E
 
E
D
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
-
V
 
-
I
 
L
F
 
L
S
 
T
T
 
T
H
 
H
R
 
Y
M
 
M
E
 
A
S
 
E
V
 
A
E
 
E
E
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
D
H
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
M
H
 
V
K
 
S
S
 
G
N
 
R
K
 
L
I
 
R
L
 
C
D
 
I
G
 
G
N
 
S
L
 
I
N
 
Q
A
 
H
I
 
L
K
 
K
R
 
S
Q
 
K
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
31% identity, 72% coverage: 1:221/308 of query aligns to 1:225/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
M
 
M
S
 
E
N
 
D
L
 
I
L
 
I
E
 
V
A
 
V
Q
 
E
S
 
N
V
 
L
S
 
V
K
 
K
N
 
K
F
|
F
G
 
G
D
 
D
F
|
F
T
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
K
N
 
G
V
 
V
S
 
S
I
 
F
S
 
S
V
 
V
E
 
K
K
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
I
R
 
H
I
 
M
I
 
L
N
 
T
Q
 
T
I
 
L
T
 
L
M
 
K
P
 
P
D
 
T
K
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
A
L
 
W
L
 
V
D
 
A
G
 
G
E
 
H
P
 
D
L
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
E
Q
 
P
R
 
R
H
 
E
H
 
V
I
 
R
Q
 
R
N
 
K
I
 
I
G
 
G
Y
 
I
L
 
V
P
 
F
E
 
Q
E
 
D
R
 
Q
G
 
S
L
 
L
Y
 
D
K
 
R
T
 
E
M
 
L
K
 
T
V
 
A
G
 
Y
E
 
E
Q
 
N
A
 
M
L
 
Y
Y
 
I
L
 
H
A
 
G
Q
 
K
L
 
I
K
 
Y
G
 
G
L
 
Y
D
 
G
K
 
G
A
 
E
E
 
K
A
 
L
K
 
K
K
 
K
R
 
R
L
 
I
H
 
L
E
 
E
W
 
L
F
 
L
E
 
E
R
 
F
L
 
V
E
 
E
I
 
L
G
 
L
D
 
E
W
 
F
W
 
K
N
 
D
K
 
K
K
 
P
I
 
V
Q
 
K
E
x
T
L
x
F
S
|
S
K
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
I
 
L
Q
 
E
F
 
I
V
 
A
V
 
R
T
 
S
V
 
L
L
 
I
H
 
H
Q
 
E
P
 
P
K
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
F
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
S
 
I
G
 
G
F
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
H
N
 
T
A
 
R
D
 
A
I
 
H
I
 
M
K
 
W
N
 
E
E
 
Y
I
 
I
L
 
S
R
 
K
L
 
M
-
 
K
R
 
K
E
 
E
D
 
H
G
 
N
A
 
M
T
 
T
V
 
I
I
 
F
F
 
L
S
 
T
T
 
T
H
 
H
R
 
Y
M
 
M
E
 
D
S
 
E
V
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
C
 
A
D
 
D
H
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
H
 
D
K
 
H
S
 
G
N
 
K
K
 
I
I
 
I
L
 
A
D
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
P
N
 
T
A
 
E
I
 
L
K
 
K
R
 
R

Q8N139 ATP-binding cassette sub-family A member 6; EC 7.6.2.- from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
33% identity, 66% coverage: 19:222/308 of query aligns to 1302:1503/1617 of Q8N139

query
sites
Q8N139
A
 
A
L
 
A
N
 
R
N
 
N
V
 
I
S
 
S
I
 
F
S
 
C
V
 
V
E
 
Q
K
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
S
L
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
M
I
 
I
N
 
S
Q
 
G
I
 
I
T
 
T
M
 
K
P
 
P
D
 
T
K
 
A
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
E
L
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
C
P
 
S
L
 
S
Q
 
V
R
 
L
H
 
G
H
 
H
I
 
L
Q
 
-
N
 
-
I
 
-
G
 
G
Y
 
Y
L
 
C
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
R
 
N
G
 
V
L
 
L
Y
 
W
K
 
P
T
 
M
M
 
L
K
 
T
V
 
L
G
 
R
E
 
E
Q
 
H
A
 
L
L
 
E
Y
 
V
L
 
Y
A
 
A
Q
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
R
K
 
K
A
 
A
E
 
D
A
 
A
K
 
R
K
 
L
R
 
A
L
 
I
H
 
A
E
 
R
W
 
L
F
 
V
E
 
S
R
 
A
L
 
F
E
 
K
I
 
L
G
 
H
D
 
E
W
 
Q
W
 
L
N
 
N
K
 
V
K
 
P
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
L
 
L
S
 
T
K
 
A
G
 
G
M
 
I
A
 
T
Q
 
R
K
 
K
I
 
L
Q
 
C
F
 
F
V
 
V
V
 
L
T
 
S
V
 
L
L
 
L
H
 
G
Q
 
N
P
 
S
K
 
P
L
 
V
L
 
L
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
S
S
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
T
N
 
G
A
 
Q
D
 
Q
I
 
Q
I
 
M
K
 
W
N
 
Q
E
 
A
I
 
I
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
L
 
V
R
 
K
L
 
N
R
 
T
E
 
E
D
 
R
G
 
G
A
 
-
T
 
-
V
 
V
I
 
L
F
 
L
S
 
T
T
 
T
H
 
H
R
 
N
M
 
L
E
 
A
S
 
E
V
 
A
E
 
E
E
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
D
H
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
M
H
 
V
K
 
S
S
 
G
N
 
R
K
 
L
I
 
R
L
 
C
D
 
I
G
 
G
N
 
S
L
 
I
N
 
Q
A
 
H
I
 
L
K
 
K
R
 
N
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

E9Q876 Glucosylceramide transporter ABCA12; ATP-binding cassette sub-family A member 12; EC 7.6.2.1 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
29% identity, 67% coverage: 19:223/308 of query aligns to 2272:2480/2595 of E9Q876

query
sites
E9Q876
A
 
A
L
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
I
S
 
S
I
 
L
S
 
G
V
 
I
E
 
P
K
 
A
G
 
G
S
 
E
I
 
C
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
I
I
 
F
R
 
K
I
 
M
I
 
L
N
 
T
Q
 
G
I
 
D
T
 
I
M
 
I
P
 
P
D
 
S
K
 
S
G
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
R
G
 
N
E
 
K
P
 
S
L
 
G
Q
 
S
R
 
L
H
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
D
N
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
S
-
 
L
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
L
 
C
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
R
 
D
G
 
A
L
 
L
Y
 
D
K
 
D
T
 
L
M
 
V
K
 
T
V
 
V
G
 
E
E
 
E
Q
 
H
A
 
L
L
 
Y
Y
 
F
L
 
Y
A
 
A
Q
 
R
L
 
V
K
 
H
G
 
G
L
 
I
D
 
P
K
 
E
A
 
K
E
 
D
A
 
I
K
 
K
K
 
D
R
 
T
L
 
V
H
 
H
E
 
K
W
 
L
F
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
E
 
H
I
 
L
G
 
M
D
 
A
W
 
Y
W
 
K
N
 
D
K
 
R
K
 
S
I
 
T
Q
 
S
E
 
M
L
 
C
S
 
S
K
 
Y
G
 
G
M
 
T
A
 
K
Q
 
R
K
 
K
I
 
L
Q
 
S
F
 
T
V
 
A
V
 
L
T
 
A
V
 
L
L
 
I
H
 
G
Q
 
K
P
 
P
K
 
S
L
 
I
L
 
L
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
S
S
 
S
G
 
G
F
 
M
D
 
D
P
 
P
I
 
K
N
 
S
A
 
K
D
 
R
I
 
H
I
 
L
K
 
W
N
 
R
E
 
I
I
 
I
L
 
S
R
 
E
L
 
E
R
 
V
E
 
Q
D
 
N
G
 
K
A
 
C
T
 
S
V
 
V
I
 
I
F
 
L
S
 
T
T
 
S
H
 
H
R
 
S
M
 
M
E
 
E
S
 
E
V
 
C
E
 
E
E
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
T
H
 
R
I
 
L
A
 
A
L
 
I
I
 
M
H
 
V
K
 
N
S
 
G
N
 
R
K
 
F
I
 
Q
L
 
C
D
 
I
G
 
G
N
 
S
L
 
L
N
 
Q
A
 
H
I
 
I
K
 
K
R
 
S
Q
 
R
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

P55339 ABC-type transporter ATP-binding protein EcsA from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
30% identity, 72% coverage: 3:223/308 of query aligns to 2:225/247 of P55339

query
sites
P55339
N
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
V
Q
 
K
S
 
D
V
 
L
S
 
T
K
 
G
N
 
G
F
 
Y
G
 
T
D
 
R
F
 
N
T
 
P
A
 
V
L
 
L
N
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
S
I
 
F
S
 
T
V
 
L
E
 
E
K
 
P
G
 
N
S
 
Q
I
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
L
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
T
I
 
I
R
 
R
I
 
H
I
 
I
N
 
I
Q
 
G
I
 
L
T
 
M
M
 
D
P
 
P
D
 
H
K
 
K
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
L
 
E
L
 
L
D
 
N
G
 
G
E
 
K
P
 
T
L
 
F
Q
 
A
R
 
E
H
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
G
H
 
Y
I
 
R
Q
 
S
N
 
Q
I
 
F
G
 
T
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
T
R
 
P
G
 
V
L
 
L
Y
 
Y
K
 
E
T
 
E
M
 
L
K
 
T
V
 
L
G
 
M
E
 
E
Q
 
H
A
 
L
L
 
E
Y
 
L
L
 
T
A
 
A
Q
 
M
L
 
A
K
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
S
K
 
K
A
 
E
E
 
T
A
 
M
K
 
E
K
 
K
R
 
R
L
 
L
H
 
P
E
 
P
W
 
L
F
 
L
E
 
K
R
 
E
L
 
F
E
 
R
I
 
M
G
 
E
D
 
K
W
 
R
W
 
L
N
 
K
K
 
W
K
 
F
I
 
P
Q
 
A
E
 
H
L
 
F
S
 
S
K
 
K
G
 
G
M
 
M
A
 
K
Q
 
Q
K
 
K
I
 
V
Q
 
M
F
 
I
V
 
M
V
 
C
T
 
A
V
 
F
L
 
L
H
 
A
Q
 
E
P
 
P
K
 
A
L
 
L
L
 
Y
I
 
I
F
 
I
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
S
 
L
G
|
G
F
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
L
N
 
A
A
 
I
D
 
N
I
 
A
I
 
L
K
 
L
N
 
E
E
 
R
I
 
M
L
 
N
R
 
E
L
 
A
R
 
K
E
 
K
D
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
I
 
L
F
 
M
S
 
S
T
 
T
H
 
H
R
 
I
M
 
L
E
 
A
S
 
T
V
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
Y
C
 
C
D
 
D
H
 
S
I
 
F
A
 
I
L
 
I
I
 
L
H
 
H
K
 
N
S
 
G
N
 
E
K
 
V
I
 
R
L
 
A
D
 
R
G
 
G
N
 
T
L
 
L
N
 
S
A
 
E
I
 
L
K
 
R
R
 
E
Q
 
Q
Y
 
F

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
28% identity, 69% coverage: 4:215/308 of query aligns to 2:219/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
L
 
I
L
 
L
E
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
H
V
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
S
F
 
Y
G
 
K
D
 
K
F
 
R
T
 
K
A
 
V
L
 
V
N
 
S
N
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
S
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
S
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
S
I
 
F
R
 
Y
I
 
M
I
 
I
N
 
V
Q
 
G
I
 
L
T
 
V
M
 
A
P
 
R
D
 
D
K
 
E
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
L
 
T
L
 
I
D
 
D
G
 
D
E
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
I
-
 
L
P
 
P
L
 
M
Q
 
H
R
 
S
H
 
R
H
 
S
I
 
R
Q
 
M
N
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
R
 
A
G
 
S
L
 
I
Y
 
F
K
 
R
T
 
K
M
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
E
E
 
D
Q
 
N
A
 
I
L
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
T
K
 
R
-
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
T
K
 
H
A
x
E
E
 
E
A
 
R
K
 
Q
K
x
D
R
 
K
L
 
L
H
 
E
E
 
D
W
 
L
F
 
L
E
 
E
R
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
G
 
Q
D
 
H
W
 
I
W
 
R
N
 
K
K
 
S
K
 
A
I
 
G
Q
 
M
E
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
G
G
 
G
M
 
E
A
 
R
Q
 
R
K
 
R
I
 
V
Q
 
E
F
 
I
V
 
A
V
 
R
T
 
A
V
 
L
L
 
A
H
 
A
Q
 
N
P
 
P
K
 
Q
L
 
F
L
 
I
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
F
S
 
A
G
 
G
F
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
N
 
S
A
 
V
D
 
I
I
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
K
E
 
I
I
 
I
L
 
E
R
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
D
 
R
G
 
G
A
 
L
T
 
G
V
 
V
I
 
L
F
 
I
S
 
T
T
 
D
H
 
H
R
 
N
M
 
V
E
 
R
S
 
E
V
 
T
E
 
L
E
 
D
L
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
K
I
 
A
A
 
Y
L
 
I
I
 
V
H
 
S
K
 
Q
S
 
G
N
 
R
K
 
L
I
 
I
L
 
A
D
 
E
G
 
G
N
 
T

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
30% identity, 73% coverage: 5:228/308 of query aligns to 3:238/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
S
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
A
F
 
Y
G
 
K
D
 
G
F
 
R
T
 
R
A
 
V
L
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
S
 
T
V
 
V
E
 
N
K
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
I
 
M
I
 
V
N
 
V
Q
 
G
I
 
I
T
 
V
M
 
P
P
 
R
D
 
D
K
 
A
G
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
E
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
H
R
 
A
H
 
R
H
 
A
I
 
R
Q
 
R
N
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
R
 
A
G
 
S
L
 
I
Y
 
F
K
x
R
T
 
R
M
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
Y
E
 
D
Q
 
N
A
 
L
L
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
G
 
D
L
 
D
D
 
L
K
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
K
 
E
-
 
D
R
 
R
L
 
A
H
 
N
E
 
E
W
 
L
F
 
M
E
 
E
R
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
G
 
E
D
 
H
W
 
L
W
 
R
N
 
D
K
 
S
K
x
M
I
x
G
Q
|
Q
E
 
S
L
 
L
S
 
S
K
 
G
G
 
G
M
 
E
A
 
R
Q
 
R
K
 
R
I
 
V
Q
 
E
F
 
I
V
 
A
V
 
R
T
 
A
V
 
L
L
 
A
H
 
A
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
S
 
A
G
 
G
F
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
N
 
S
A
 
V
D
 
I
I
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
R
E
 
I
I
 
I
L
 
E
R
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
D
 
S
G
 
G
A
 
L
T
 
G
V
 
V
I
 
L
F
 
I
S
 
T
T
 
D
H
 
H
R
 
N
M
 
V
E
 
R
S
 
E
V
 
T
E
 
L
E
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
I
 
A
A
 
Y
L
 
I
I
 
V
H
 
S
K
 
Q
S
 
G
N
 
H
K
 
L
I
 
I
L
 
A
D
 
H
G
 
G
N
 
T
L
 
P
N
 
T
A
 
E
I
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
V
K
 
K
R
 
R
Q
 
V
Y
 
Y
K
 
L
S
 
G
N
 
E
T
 
D
F
 
F

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
30% identity, 73% coverage: 5:228/308 of query aligns to 3:238/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
S
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
A
F
x
Y
G
 
K
D
 
G
F
x
R
T
 
R
A
 
V
L
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
S
 
T
V
 
V
E
 
N
K
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
I
 
M
I
 
V
N
 
V
Q
 
G
I
 
I
T
 
V
M
 
P
P
 
R
D
 
D
K
 
A
G
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
E
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
H
R
 
A
H
 
R
H
 
A
I
 
R
Q
 
R
N
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
x
Q
E
 
E
R
 
A
G
 
S
L
 
I
Y
 
F
K
 
R
T
 
R
M
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
Y
E
 
D
Q
 
N
A
 
L
L
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
G
 
D
L
 
D
D
 
L
K
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
K
 
E
-
 
D
R
 
R
L
 
A
H
 
N
E
 
E
W
 
L
F
 
M
E
 
E
R
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
G
 
E
D
 
H
W
 
L
W
 
R
N
 
D
K
 
S
K
 
M
I
 
G
Q
 
Q
E
x
S
L
 
L
S
|
S
K
 
G
G
 
G
M
x
E
A
 
R
Q
 
R
K
 
R
I
 
V
Q
 
E
F
 
I
V
 
A
V
 
R
T
 
A
V
 
L
L
 
A
H
 
A
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
S
 
A
G
 
G
F
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
N
 
S
A
 
V
D
 
I
I
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
R
E
 
I
I
 
I
L
 
E
R
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
D
 
S
G
 
G
A
 
L
T
 
G
V
 
V
I
 
L
F
 
I
S
 
T
T
 
D
H
 
H
R
 
N
M
 
V
E
 
R
S
 
E
V
 
T
E
 
L
E
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
I
 
A
A
 
Y
L
 
I
I
 
V
H
 
S
K
 
Q
S
 
G
N
 
H
K
 
L
I
 
I
L
 
A
D
 
H
G
 
G
N
 
T
L
 
P
N
 
T
A
 
E
I
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
V
K
 
K
R
 
R
Q
 
V
Y
 
Y
K
 
L
S
 
G
N
 
E
T
 
D
F
 
F

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
29% identity, 74% coverage: 2:230/308 of query aligns to 1:241/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
S
 
S
N
 
A
L
 
T
L
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
S
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
A
F
x
Y
G
 
K
D
 
G
F
x
R
T
 
R
A
x
V
L
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
S
 
T
V
 
V
E
 
N
K
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
I
 
M
I
 
V
N
 
V
Q
 
G
I
 
I
T
 
V
M
 
P
P
 
R
D
 
D
K
 
A
G
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
E
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
H
R
 
A
H
 
R
H
 
A
I
 
R
Q
 
R
N
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
R
 
A
G
 
S
L
 
I
Y
 
F
K
 
R
T
 
R
M
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
Y
E
 
D
Q
 
N
A
 
L
L
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
G
 
D
L
 
D
D
 
L
K
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
K
 
E
-
 
D
R
 
R
L
 
A
H
 
N
E
 
E
W
 
L
F
 
M
E
 
E
R
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
G
 
E
D
 
H
W
 
L
W
 
R
N
 
D
K
 
S
K
 
M
I
 
G
Q
 
Q
E
 
S
L
 
L
S
 
S
K
 
G
G
 
G
M
 
E
A
 
R
Q
 
R
K
 
R
I
 
V
Q
 
E
F
 
I
V
 
A
V
 
R
T
 
A
V
 
L
L
 
A
H
 
A
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
F
S
 
A
G
 
G
F
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
N
 
S
A
 
V
D
 
I
I
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
R
E
 
I
I
 
I
L
 
E
R
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
D
 
S
G
 
G
A
 
L
T
 
G
V
 
V
I
 
L
F
 
I
S
 
T
T
 
D
H
|
H
R
 
N
M
 
V
E
 
R
S
 
E
V
 
T
E
 
L
E
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
I
 
A
A
 
Y
L
 
I
I
 
V
H
 
S
K
 
Q
S
 
G
N
 
H
K
 
L
I
 
I
L
 
A
D
 
H
G
 
G
N
 
T
L
 
P
N
 
T
A
 
E
I
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
V
K
 
K
R
 
R
Q
 
V
Y
 
Y
K
 
L
S
 
G
N
 
E
T
 
D
F
 
F
E
 
R
V
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
30% identity, 69% coverage: 5:215/308 of query aligns to 3:219/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
S
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
A
F
x
Y
G
 
K
D
 
G
F
x
R
T
 
R
A
x
V
L
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
S
 
T
V
 
V
E
 
N
K
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
I
 
M
I
 
V
N
 
V
Q
 
G
I
 
I
T
 
V
M
 
P
P
 
R
D
 
D
K
 
A
G
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
E
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
H
R
 
A
H
 
R
H
 
A
I
 
R
Q
 
R
N
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
R
 
A
G
 
S
L
 
I
Y
x
F
K
x
R
T
x
R
M
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
Y
E
 
D
Q
 
N
A
 
L
L
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
G
 
D
L
 
D
D
 
L
K
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
K
 
E
-
 
D
R
 
R
L
 
A
H
 
N
E
 
E
W
 
L
F
 
M
E
 
E
R
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
G
 
E
D
 
H
W
 
L
W
 
R
N
 
D
K
 
S
K
 
M
I
 
G
Q
 
Q
E
 
S
L
 
L
S
 
S
K
 
G
G
 
G
M
 
E
A
 
R
Q
 
R
K
 
R
I
 
V
Q
 
E
F
 
I
V
 
A
V
 
R
T
 
A
V
 
L
L
 
A
H
 
A
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
S
 
A
G
 
G
F
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
N
 
S
A
 
V
D
 
I
I
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
R
E
 
I
I
 
I
L
 
E
R
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
D
 
S
G
 
G
A
 
L
T
 
G
V
 
V
I
 
L
F
 
I
S
 
T
T
 
D
H
 
H
R
 
N
M
 
V
E
 
R
S
 
E
V
 
T
E
 
L
E
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
I
 
A
A
 
Y
L
 
I
I
 
V
H
 
S
K
 
Q
S
 
G
N
 
H
K
 
L
I
 
I
L
 
A
D
 
H
G
 
G
N
 
T

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
30% identity, 69% coverage: 5:215/308 of query aligns to 3:219/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
S
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
A
F
x
Y
G
 
K
D
 
G
F
 
R
T
 
R
A
 
V
L
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
S
 
T
V
 
V
E
 
N
K
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
I
 
M
I
 
V
N
 
V
Q
 
G
I
 
I
T
 
V
M
 
P
P
 
R
D
 
D
K
 
A
G
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
E
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
H
R
 
A
H
 
R
H
 
A
I
 
R
Q
 
R
N
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
x
Q
E
 
E
R
 
A
G
 
S
L
 
I
Y
 
F
K
 
R
T
 
R
M
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
Y
E
 
D
Q
 
N
A
 
L
L
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
G
 
D
L
 
D
D
 
L
K
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
K
 
E
-
 
D
R
 
R
L
 
A
H
 
N
E
 
E
W
 
L
F
 
M
E
 
E
R
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
G
 
E
D
 
H
W
 
L
W
 
R
N
 
D
K
 
S
K
 
M
I
 
G
Q
 
Q
E
x
S
L
 
L
S
|
S
K
x
G
G
|
G
M
 
E
A
 
R
Q
 
R
K
 
R
I
 
V
Q
 
E
F
 
I
V
 
A
V
 
R
T
 
A
V
 
L
L
 
A
H
 
A
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
S
 
A
G
|
G
F
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
N
 
S
A
 
V
D
 
I
I
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
R
E
 
I
I
 
I
L
 
E
R
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
D
 
S
G
 
G
A
 
L
T
 
G
V
 
V
I
 
L
F
 
I
S
 
T
T
 
D
H
|
H
R
 
N
M
 
V
E
 
R
S
 
E
V
 
T
E
 
L
E
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
I
 
A
A
 
Y
L
 
I
I
 
V
H
 
S
K
 
Q
S
 
G
N
 
H
K
 
L
I
 
I
L
 
A
D
 
H
G
 
G
N
 
T

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
30% identity, 69% coverage: 5:215/308 of query aligns to 3:219/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
S
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
A
F
x
Y
G
 
K
D
 
G
F
x
R
T
 
R
A
x
V
L
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
S
 
T
V
 
V
E
 
N
K
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
I
 
M
I
 
V
N
 
V
Q
 
G
I
 
I
T
 
V
M
 
P
P
 
R
D
 
D
K
 
A
G
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
E
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
L
P
 
P
L
|
L
Q
x
H
R
 
A
H
 
R
H
 
A
I
 
R
Q
 
R
N
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
|
P
E
x
Q
E
 
E
R
x
A
G
x
S
L
 
I
Y
x
F
K
x
R
T
x
R
M
x
L
K
 
S
V
 
V
G
 
Y
E
 
D
Q
 
N
A
 
L
L
 
M
Y
 
A
L
x
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
G
 
D
L
 
D
D
 
L
K
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
K
 
E
-
 
D
R
 
R
L
 
A
H
 
N
E
 
E
W
 
L
F
 
M
E
 
E
R
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
G
 
E
D
 
H
W
 
L
W
 
R
N
 
D
K
 
S
K
 
M
I
 
G
Q
|
Q
E
 
S
L
 
L
S
 
S
K
 
G
G
 
G
M
 
E
A
 
R
Q
 
R
K
 
R
I
 
V
Q
 
E
F
 
I
V
 
A
V
x
R
T
 
A
V
 
L
L
 
A
H
 
A
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
S
 
A
G
 
G
F
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
N
 
S
A
 
V
D
 
I
I
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
R
E
 
I
I
 
I
L
 
E
R
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
D
 
S
G
 
G
A
 
L
T
 
G
V
 
V
I
 
L
F
 
I
S
 
T
T
 
D
H
 
H
R
 
N
M
 
V
E
 
R
S
 
E
V
 
T
E
 
L
E
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
I
 
A
A
 
Y
L
 
I
I
 
V
H
 
S
K
 
Q
S
 
G
N
 
H
K
 
L
I
 
I
L
 
A
D
 
H
G
 
G
N
 
T

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
30% identity, 69% coverage: 5:215/308 of query aligns to 3:219/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
S
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
A
F
x
Y
G
 
K
D
 
G
F
x
R
T
 
R
A
x
V
L
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
L
S
 
T
V
 
V
E
 
N
K
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
F
R
 
Y
I
 
M
I
 
V
N
 
V
Q
 
G
I
 
I
T
 
V
M
 
P
P
 
R
D
 
D
K
 
A
G
 
G
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
E
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
H
R
 
A
H
 
R
H
 
A
I
 
R
Q
 
R
N
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
x
Q
E
 
E
R
 
A
G
 
S
L
 
I
Y
 
F
K
 
R
T
 
R
M
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
Y
E
 
D
Q
 
N
A
 
L
L
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
G
 
D
L
 
D
D
 
L
K
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
K
 
E
-
 
D
R
 
R
L
 
A
H
 
N
E
 
E
W
 
L
F
 
M
E
 
E
R
 
E
L
 
F
E
 
H
I
 
I
G
 
E
D
 
H
W
 
L
W
 
R
N
 
D
K
 
S
K
 
M
I
 
G
Q
 
Q
E
 
S
L
 
L
S
 
S
K
 
G
G
 
G
M
 
E
A
 
R
Q
 
R
K
 
R
I
 
V
Q
 
E
F
 
I
V
 
A
V
 
R
T
 
A
V
 
L
L
 
A
H
 
A
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
I
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
S
 
A
G
 
G
F
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
N
 
S
A
 
V
D
 
I
I
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
R
E
 
I
I
 
I
L
 
E
R
 
H
L
 
L
R
 
R
E
 
D
D
 
S
G
 
G
A
 
L
T
 
G
V
 
V
I
 
L
F
 
I
S
 
T
T
 
D
H
 
H
R
 
N
M
 
V
E
 
R
S
 
E
V
 
T
E
 
L
E
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
H
 
R
I
 
A
A
 
Y
L
 
I
I
 
V
H
 
S
K
 
Q
S
 
G
N
 
H
K
 
L
I
 
I
L
 
A
D
 
H
G
 
G
N
 
T

8f5bA Human abca4 structure in complex with amp-pnp
30% identity, 72% coverage: 19:240/308 of query aligns to 737:960/1924 of 8f5bA

query
sites
8f5bA
A
 
A
L
 
V
N
 
D
N
 
R
V
 
L
S
 
N
I
 
I
S
 
T
V
 
F
E
 
Y
K
 
E
G
 
N
S
 
Q
I
 
I
F
 
T
G
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
I
 
L
R
 
S
I
 
I
I
 
L
N
 
T
Q
 
G
I
 
L
T
 
L
M
 
P
P
 
P
D
 
T
K
 
S
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
V
D
 
G
G
 
G
E
 
R
P
 
D
L
 
I
Q
 
E
R
 
T
H
 
S
H
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
V
I
 
R
Q
 
Q
N
 
S
I
 
L
G
 
G
Y
 
M
L
 
C
P
 
P
E
x
Q
E
 
H
R
 
N
G
 
I
L
 
L
Y
 
F
K
 
H
T
 
H
M
 
L
K
 
T
V
 
V
G
 
A
E
 
E
Q
 
H
A
 
M
L
 
L
Y
 
F
L
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
K
D
 
S
K
 
Q
A
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
K
 
L
R
 
E
L
 
M
H
 
E
E
 
A
W
 
M
F
 
L
E
 
E
R
 
D
L
 
T
E
 
G
I
 
L
G
 
H
D
 
H
W
 
K
W
 
R
N
 
N
K
 
E
K
 
E
I
 
A
Q
 
Q
E
x
D
L
 
L
S
 
S
K
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
Q
Q
 
R
K
 
K
I
 
L
Q
 
S
F
 
V
V
 
A
V
 
I
T
 
A
V
 
F
L
 
V
H
 
G
Q
 
D
P
 
A
K
 
K
L
 
V
L
 
V
I
 
I
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
S
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
Y
N
 
S
A
 
R
D
 
R
I
 
S
I
 
I
K
 
W
N
 
D
E
 
L
I
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
Y
R
 
R
E
 
S
D
 
-
G
 
G
A
 
R
T
 
T
V
 
I
I
 
I
F
 
M
S
 
S
T
 
T
H
 
H
R
 
H
M
 
M
E
 
D
S
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
L
L
 
L
C
 
G
D
 
D
H
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
I
I
 
I
H
 
A
K
 
Q
S
 
G
N
 
R
K
 
L
I
 
Y
L
 
C
D
 
S
G
 
G
N
 
T
L
 
P
N
 
L
A
 
F
I
 
L
K
 
K
R
 
N
Q
 
C
Y
 
F
K
 
G
S
 
T
N
 
G
T
 
L
F
 
Y
E
 
L
V
 
T
G
 
L
I
 
V
T
 
R
T
 
D
D
 
G
N
 
D
A
 
V
S
 
N
E
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7e7oA Cryo-em structure of human abca4 in nrpe-bound state (see paper)
30% identity, 72% coverage: 19:240/308 of query aligns to 824:1047/2003 of 7e7oA

query
sites
7e7oA
A
 
A
L
 
V
N
 
D
N
 
R
V
 
L
S
 
N
I
 
I
S
 
T
V
 
F
E
 
Y
K
 
E
G
 
N
S
 
Q
I
 
I
F
 
T
G
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
T
I
 
L
R
 
S
I
 
I
I
 
L
N
 
T
Q
 
G
I
 
L
T
 
L
M
 
P
P
 
P
D
 
T
K
 
S
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
V
D
 
G
G
 
G
E
 
R
P
 
D
L
 
I
Q
 
E
R
 
T
H
 
S
H
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
V
I
 
R
Q
 
Q
N
 
S
I
 
L
G
 
G
Y
 
M
L
 
C
P
 
P
E
 
Q
E
 
H
R
 
N
G
 
I
L
 
L
Y
 
F
K
 
H
T
 
H
M
 
L
K
 
T
V
 
V
G
 
A
E
 
E
Q
 
H
A
 
M
L
 
L
Y
 
F
L
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
K
D
 
S
K
 
Q
A
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
K
 
L
R
 
E
L
 
M
H
 
E
E
 
A
W
 
M
F
 
L
E
 
E
R
 
D
L
 
T
E
 
G
I
 
L
G
 
H
D
 
H
W
 
K
W
 
R
N
 
N
K
 
E
K
 
E
I
 
A
Q
 
Q
E
 
D
L
 
L
S
 
S
K
 
G
G
 
G
M
 
M
A
 
Q
Q
 
R
K
 
K
I
 
L
Q
 
S
F
 
V
V
 
A
V
 
I
T
 
A
V
 
F
L
 
V
H
 
G
Q
 
D
P
 
A
K
 
K
L
 
V
L
 
V
I
 
I
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
S
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
Y
N
 
S
A
 
R
D
 
R
I
 
S
I
 
I
K
 
W
N
 
D
E
 
L
I
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
Y
R
 
R
E
 
-
D
 
S
G
 
G
A
 
R
T
 
T
V
 
I
I
 
I
F
 
M
S
 
S
T
 
T
H
 
H
R
 
H
M
 
M
E
 
D
S
 
E
V
 
A
E
 
D
E
 
L
L
 
L
C
 
G
D
 
D
H
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
I
I
 
I
H
 
A
K
 
Q
S
 
G
N
 
R
K
 
L
I
 
Y
L
 
C
D
 
S
G
 
G
N
 
T
L
 
P
N
 
L
A
 
F
I
 
L
K
 
K
R
 
N
Q
 
C
Y
 
F
K
 
G
S
 
T
N
 
G
T
 
L
F
 
Y
E
 
L
V
 
T
G
 
L
I
 
V
T
 
R
T
 
K
D
 
M
N
 
D
A
 
V
S
 
N
E
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P78363 Retinal-specific phospholipid-transporting ATPase ABCA4; ATP-binding cassette sub-family A member 4; RIM ABC transporter; RIM proteinv; RmP; Retinal-specific ATP-binding cassette transporter; Stargardt disease protein; EC 7.6.2.1 from Homo sapiens (Human) (see 43 papers)
31% identity, 68% coverage: 19:228/308 of query aligns to 945:1156/2273 of P78363

query
sites
P78363
A
|
A
L
x
V
N
x
D
N
x
R
V
x
L
S
x
N
I
|
I
S
x
T
V
x
F
E
x
Y
K
x
E
G
x
N
S
x
Q
I
|
I
F
x
T
G
x
A
L
x
F
L
|
L
G
|
G
P
x
H
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
x
T
I
x
L