SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_057506707.1 NCBI__GCF_001431535.1:WP_057506707.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
81% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
M
 
M
F
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
K
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
V
A
 
L
H
 
Y
D
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
|
L
S
 
S
R
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
G
M
 
L
I
 
V
A
 
D
H
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
Q
M
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
H
T
 
T
A
 
A
S
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
E
K
 
K
W
 
W
D
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
|
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
H
M
 
M
K
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
A
N
 
N
K
|
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
|
W
V
|
V
R
 
R
T
|
T
A
 
P
L
 
L
V
|
V
E
 
E
Q
 
K
Q
|
Q
I
 
I
T
 
S
A
 
A
L
|
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
E
 
N
G
 
G
T
 
V
D
 
D
Q
 
Q
E
 
E
S
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
M
 
T
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
M
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
L
 
V
P
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
T
A
 
A
R
 
R

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
81% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
M
 
M
F
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
K
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
V
A
 
L
H
 
Y
D
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
G
M
 
L
I
 
V
A
 
D
H
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
Q
M
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
A
 
A
S
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
E
K
 
K
W
 
W
D
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
H
M
 
M
K
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
A
N
 
N
K
 
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
R
 
R
T
 
T
A
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
I
 
I
T
 
S
A
 
A
L
|
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
E
 
N
G
 
G
T
 
V
D
 
D
Q
 
Q
E
 
E
S
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
M
 
T
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
M
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
L
 
V
P
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
T
 
T
A
 
A
R
 
R

1x1tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas fragi complexed with NAD+ (see paper)
75% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:236/236 of 1x1tA

query
sites
1x1tA
M
 
M
F
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
|
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
K
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
V
A
 
L
H
 
Y
D
 
D
G
 
G
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
E
 
G
M
 
L
I
 
V
A
 
D
H
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
Q
M
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
A
 
A
S
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
E
K
 
K
W
 
W
D
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
|
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
H
M
 
M
K
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
A
N
 
N
K
 
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
|
W
V
|
V
R
 
R
T
|
T
A
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
M
 
T
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
M
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
L
 
V
P
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
T
 
T
A
 
A
R
 
R

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
71% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
M
 
M
F
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
A
 
P
Q
 
E
E
 
D
I
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
D
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
A
A
 
Y
H
 
Y
D
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
G
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
T
R
 
R
E
 
D
M
 
F
I
 
I
A
 
A
H
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
E
A
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
H
T
 
T
A
 
A
S
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
A
L
|
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
I
M
 
M
K
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
V
N
 
N
K
|
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
R
 
R
T
|
T
A
 
P
L
|
L
V
|
V
E
 
E
Q
 
K
Q
|
Q
I
 
I
T
 
E
A
 
A
L
x
I
A
 
S
E
 
Q
R
 
Q
E
 
K
G
 
G
T
 
I
D
 
D
Q
 
I
E
 
E
S
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
M
 
A
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
L
 
L
P
 
S
M
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
T
A
 
A
R
 
R

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
71% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
M
 
M
F
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
A
 
P
Q
 
E
E
 
D
I
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
D
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
A
A
 
Y
H
 
Y
D
 
L
G
 
N
A
|
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
G
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
T
R
 
R
E
 
D
M
 
F
I
 
I
A
 
A
H
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
E
A
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
H
T
 
T
A
 
A
S
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
A
L
|
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
I
M
 
M
K
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
V
N
 
N
K
|
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
R
 
R
T
|
T
A
 
P
L
|
L
V
|
V
E
 
E
Q
 
K
Q
|
Q
I
 
I
T
 
E
A
 
A
L
x
I
A
 
S
E
 
Q
R
 
Q
E
 
K
G
 
G
T
 
I
D
 
D
Q
 
I
E
 
E
S
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
M
 
A
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
L
 
L
P
 
S
M
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
T
 
T
A
 
A
R
 
R

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
71% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
M
 
M
F
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
A
 
P
Q
 
E
E
 
D
I
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
D
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
A
A
 
Y
H
 
Y
D
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
G
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
T
R
 
R
E
 
D
M
 
F
I
 
I
A
 
A
H
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
E
A
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
H
T
 
T
A
 
A
S
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
A
L
|
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
I
M
 
M
K
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
V
N
 
N
K
|
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
R
 
R
T
|
T
A
 
P
L
|
L
V
|
V
E
 
E
Q
 
K
Q
|
Q
I
 
I
T
 
E
A
 
A
L
x
I
A
 
S
E
 
Q
R
 
Q
E
 
K
G
 
G
T
 
I
D
 
D
Q
 
I
E
 
E
S
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
M
 
A
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
L
 
L
P
 
S
M
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
T
 
T
A
 
A
R
 
R

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
71% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
M
 
M
F
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
A
 
P
Q
 
E
E
 
D
I
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
D
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
A
A
 
Y
H
 
Y
D
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
G
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
T
R
 
R
E
 
D
M
 
F
I
 
I
A
 
A
H
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
E
A
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
H
T
 
T
A
 
A
S
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
A
L
|
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
I
M
 
M
K
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
V
N
 
N
K
|
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
R
 
R
T
|
T
A
 
P
L
|
L
V
|
V
E
 
E
Q
 
K
Q
|
Q
I
 
I
T
 
E
A
 
A
L
x
I
A
 
S
E
 
Q
R
 
Q
E
 
K
G
 
G
T
 
I
D
 
D
Q
 
I
E
 
E
S
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
M
 
A
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
L
 
L
P
 
S
M
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
T
A
 
A
R
 
R

5yssB Crystal structure of aminocaproic acid cyclase in complex with NAD (+) (see paper)
59% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 2:255/255 of 5yssB

query
sites
5yssB
F
 
L
N
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
I
 
L
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
|
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
A
 
V
Q
 
D
E
 
A
I
 
A
E
 
K
R
 
D
I
 
A
R
 
V
A
 
A
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
D
 
Q
F
 
Y
G
 
G
V
 
K
R
 
T
V
 
P
A
 
G
H
 
Y
D
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
G
 
E
E
 
A
A
 
Q
V
 
I
R
 
A
E
 
D
M
 
M
I
 
M
A
 
R
H
 
Y
A
 
A
V
 
E
A
 
S
A
 
E
M
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
Q
 
Q
H
 
H
T
 
V
A
 
S
S
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
I
A
 
A
L
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
T
T
 
T
A
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
G
M
 
M
K
 
R
Q
 
A
Q
 
R
G
 
N
A
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
|
A
S
 
S
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
K
N
 
E
K
 
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
T
T
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
Q
T
 
T
G
 
E
I
 
I
T
 
T
A
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
W
V
|
V
R
 
L
T
|
T
A
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
T
 
D
A
 
K
L
 
R
A
 
I
E
 
A
R
 
-
E
 
E
G
 
G
T
 
A
D
 
E
Q
 
P
E
 
E
S
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
R
Q
 
E
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
N
M
 
L
V
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
M
 
V
T
 
R
G
 
G
T
 
V
A
 
A
L
 
W
P
 
N
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
V
A
 
A
R
 
Q

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
60% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 2:255/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
F
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
N
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
-
 
P
A
 
A
Q
 
P
E
 
A
I
 
L
E
 
A
R
 
E
I
 
I
R
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
A
D
 
R
F
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
K
V
 
A
A
 
V
H
 
H
D
 
H
G
 
P
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
G
 
V
E
 
A
A
 
Q
V
 
I
R
 
E
E
 
A
M
 
L
I
 
F
A
 
A
H
 
L
A
 
A
V
 
E
A
 
R
A
 
E
M
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
 
Q
H
 
H
T
 
V
A
 
A
S
 
P
I
 
V
E
 
E
E
 
Q
F
 
F
P
 
P
V
 
L
E
 
E
K
 
S
W
 
W
D
 
D
A
 
K
I
 
I
L
 
I
A
 
A
L
|
L
N
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
G
T
 
T
A
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
G
M
 
M
K
 
R
Q
 
A
Q
 
R
G
 
N
A
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
G
S
 
S
V
 
T
N
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
T
 
V
A
 
G
L
 
L
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
T
T
 
S
G
 
N
I
 
V
T
 
T
A
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
R
 
L
T
|
T
A
 
P
L
|
L
V
|
V
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
I
 
I
T
 
D
A
 
D
L
x
R
A
 
A
E
 
A
R
 
-
E
 
N
G
 
G
T
 
G
D
 
D
Q
 
P
E
 
L
S
 
Q
A
 
A
A
 
Q
R
 
H
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
L
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
S
Q
 
Q
M
 
V
T
 
R
G
 
G
T
 
A
A
 
A
L
 
W
P
 
N
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
L
A
 
A
R
 
Q

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
40% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 3:260/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
M
 
L
F
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
K
A
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
S
G
x
D
F
x
M
G
 
-
D
 
N
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
I
 
C
E
 
Q
R
 
E
I
 
T
R
 
A
A
 
N
G
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
D
 
Q
F
 
-
G
 
G
V
 
F
R
 
D
V
 
A
A
 
L
H
 
S
D
 
A
G
 
P
A
 
C
D
|
D
L
x
V
S
 
T
R
 
D
G
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
Y
R
 
K
E
 
Q
M
 
A
I
 
I
A
 
E
H
 
L
A
 
T
V
 
Q
A
 
K
A
 
T
M
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
Q
|
Q
H
 
H
T
 
V
A
 
A
S
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
A
K
 
V
W
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
L
L
 
V
A
 
Q
L
 
V
N
 
M
L
 
L
S
 
T
A
 
G
V
 
A
F
 
F
H
 
I
A
 
G
T
 
I
A
 
K
A
 
H
A
 
V
L
 
L
P
 
P
C
 
I
M
 
M
K
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
G
 
K
A
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
H
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
S
 
F
V
 
A
N
 
G
K
|
K
A
 
A
A
 
G
Y
|
Y
V
 
N
T
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
C
A
 
A
G
 
R
T
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
x
Y
V
|
V
R
 
D
T
|
T
A
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
R
Q
 
G
Q
|
Q
I
 
I
T
 
A
A
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
T
E
 
R
G
 
N
T
 
V
D
 
S
Q
 
L
E
 
D
S
 
S
A
 
A
A
 
L
R
 
E
A
 
D
L
 
V
L
 
I
A
 
L
E
 
A
K
 
M
Q
 
V
P
 
P
S
 
Q
L
 
K
Q
 
R
F
 
L
V
 
L
T
 
S
P
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
D
M
 
Y
V
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
G
Q
 
G
M
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
L
 
V
P
 
V
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
40% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 4:261/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
M
 
L
F
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
K
A
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
S
G
x
D
F
x
M
G
 
-
D
 
N
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
I
 
C
E
 
Q
R
 
E
I
 
T
R
 
A
A
 
N
G
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
D
 
Q
F
 
-
G
 
G
V
 
F
R
 
D
V
 
A
A
 
L
H
 
S
D
 
A
G
 
P
A
 
C
D
|
D
L
x
V
S
 
T
R
 
D
G
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
Y
R
 
K
E
 
Q
M
 
A
I
 
I
A
 
E
H
 
L
A
 
T
V
 
Q
A
 
K
A
 
T
M
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
Q
|
Q
H
 
H
T
 
V
A
 
A
S
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
A
K
 
V
W
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
L
L
 
V
A
 
Q
L
 
V
N
 
M
L
 
L
S
 
T
A
 
G
V
 
A
F
 
F
H
 
I
A
 
G
T
 
I
A
 
K
A
 
H
A
 
V
L
 
L
P
 
P
C
 
I
M
 
M
K
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
G
 
K
A
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
H
x
N
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
S
 
F
V
 
A
N
 
G
K
|
K
A
 
A
A
 
G
Y
|
Y
V
 
N
T
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
C
A
 
A
G
 
R
T
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
V
|
V
R
 
D
T
|
T
A
 
P
L
|
L
V
 
V
E
 
R
Q
 
G
Q
|
Q
I
 
I
T
 
A
A
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
T
E
 
R
G
 
N
T
 
V
D
 
S
Q
 
L
E
 
D
S
 
S
A
 
A
A
 
L
R
 
E
A
 
D
L
 
V
L
 
I
A
 
L
E
 
A
K
 
M
Q
 
V
P
 
P
S
 
Q
L
 
K
Q
 
R
F
 
L
V
 
L
T
 
S
P
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
D
M
 
Y
V
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
G
Q
 
G
M
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
L
 
V
P
 
V
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
40% identity, 98% coverage: 2:256/260 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
F
 
L
N
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
T
 
I
A
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
I
 
I
V
 
F
L
 
F
N
|
N
G
x
Y
F
x
N
G
|
G
D
x
S
A
 
P
Q
 
E
E
 
A
I
 
A
E
 
E
R
 
E
I
 
T
R
 
-
A
 
A
G
 
K
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
D
 
E
F
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
V
A
 
E
H
 
A
D
 
M
G
 
K
A
 
A
D
x
N
L
x
V
S
 
A
R
 
I
G
 
A
E
 
E
A
 
D
V
 
V
R
 
D
E
 
A
M
 
F
I
 
F
A
 
K
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
R
M
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
Q
 
T
H
 
R
T
 
D
A
 
N
S
 
L
I
 
L
E
 
M
E
 
R
F
 
M
P
 
K
V
 
E
E
 
D
K
 
E
W
 
W
D
 
D
A
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
N
L
x
I
N
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
G
V
 
T
F
 
F
H
 
L
A
 
C
T
 
T
A
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
S
P
 
R
C
 
T
M
 
M
K
 
M
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
R
A
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
S
 
N
V
 
A
N
 
G
K
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
E
T
 
L
A
 
A
G
 
P
T
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
A
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
W
 
F
V
x
I
R
 
T
T
|
T
A
 
D
L
 
M
V
 
T
E
 
D
Q
 
K
Q
 
L
I
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
D
E
 
E
S
 
K
A
 
T
A
 
K
R
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
K
 
-
Q
 
I
P
 
P
S
 
L
L
 
G
Q
 
A
F
 
Y
V
 
G
T
 
T
P
 
T
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
M
 
A
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
S
A
 
K
Q
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
T
L
 
L
P
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
35% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 2:247/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
M
 
I
F
 
L
N
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
T
 
H
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
I
L
 
V
N
 
S
G
x
D
F
x
I
G
 
N
D
 
E
-
 
D
-
 
H
-
 
G
A
 
N
Q
 
K
E
 
A
I
 
V
E
 
E
R
 
D
I
 
I
R
 
K
A
 
A
-
 
Q
G
 
G
L
 
G
Q
 
E
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
-
V
 
V
R
 
K
V
 
-
A
 
-
H
 
-
D
 
-
G
 
-
A
|
A
D
|
D
L
x
T
S
 
S
R
 
N
G
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
V
R
 
E
E
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
K
H
 
R
A
 
T
V
 
V
A
 
E
A
 
I
M
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
G
H
 
G
T
 
E
A
 
Q
S
 
A
I
 
L
E
 
A
-
 
G
E
 
D
F
 
Y
P
 
G
V
 
L
E
 
D
K
 
S
W
 
W
D
 
R
A
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
S
L
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
Y
A
 
G
T
 
C
A
 
K
A
 
Y
A
 
E
L
 
L
P
 
E
C
 
Q
M
 
M
K
 
E
Q
 
K
Q
 
N
G
 
G
A
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
V
 
I
H
 
H
G
 
G
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
A
V
 
P
N
 
L
K
 
S
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
T
T
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
N
T
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
T
 
Y
A
 
G
G
 
Q
T
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
R
A
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
W
x
Y
V
x
I
R
 
E
T
 
T
A
 
P
L
|
L
V
 
L
E
 
E
Q
 
S
Q
 
L
I
 
T
T
 
K
A
 
E
L
 
M
A
 
K
E
 
E
R
 
A
E
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
I
E
 
S
K
 
K
Q
 
H
P
 
P
S
 
M
L
 
G
Q
 
R
F
 
L
V
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
G
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
S
A
 
S
Q
 
F
M
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
G
A
 
Y
L
 
Y
P
 
L
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T
A
 
A

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:256/260 of query aligns to 8:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
E
I
 
A
A
 
A
T
 
R
A
 
V
L
 
F
A
 
M
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
A
G
x
D
F
|
F
G
 
N
D
 
E
A
 
A
Q
 
A
E
 
G
I
 
K
E
 
E
R
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
N
L
 
P
Q
 
G
A
 
V
D
 
V
F
 
F
G
 
-
V
 
I
R
 
R
V
|
V
A
 
-
H
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
D
|
D
L
x
V
S
 
S
R
 
D
G
 
R
E
 
E
A
 
S
V
 
V
R
 
H
E
 
R
M
 
L
I
 
V
A
 
E
H
 
N
A
 
V
V
 
A
A
 
E
A
 
R
M
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
Q
 
T
H
 
R
T
x
D
A
 
S
S
 
M
I
 
L
E
 
S
E
x
K
F
 
M
P
 
T
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
W
 
F
D
 
Q
A
 
Q
I
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
V
N
|
N
L
 
L
S
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
C
T
 
T
A
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
C
 
Y
M
 
M
K
 
A
Q
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
V
 
V
H
 
T
G
 
G
L
 
T
V
 
Y
A
 
G
S
x
N
V
|
V
N
 
G
K
x
Q
A
 
T
A
 
N
Y
|
Y
V
 
A
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
K
A
 
T
T
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
T
 
L
A
 
A
G
 
R
T
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
A
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
W
x
F
V
x
T
R
 
E
T
|
T
A
 
A
L
x
M
V
 
V
E
 
A
Q
 
E
Q
 
V
I
 
P
T
 
E
A
 
K
L
 
V
A
 
I
E
 
E
R
x
K
E
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
M
A
 
K
E
 
A
K
 
Q
Q
 
V
P
 
P
S
 
M
L
 
G
Q
 
R
F
 
L
V
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
M
 
A
V
 
Y
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
A
 
E
A
 
S
A
 
D
Q
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
H
A
 
V
L
 
L
P
 
H
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
35% identity, 98% coverage: 5:260/260 of query aligns to 8:255/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
K
 
K
V
 
T
A
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
G
 
A
I
 
A
A
 
V
T
 
Q
A
 
A
L
 
F
A
 
L
R
 
G
Q
 
Q
G
 
Q
A
 
A
D
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
V
N
 
A
G
x
D
F
x
I
G
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
G
I
 
E
E
 
A
R
 
M
I
 
V
R
 
R
A
 
K
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
D
 
E
F
 
N
G
 
N
V
 
D
R
 
R
V
 
L
A
 
H
H
 
F
D
 
V
G
 
Q
A
x
T
D
 
D
L
x
I
S
 
T
R
 
D
G
 
E
E
 
A
A
 
A
V
 
C
R
 
Q
E
 
H
M
 
A
I
 
V
A
 
E
H
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
H
A
 
T
M
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
 
E
H
 
I
T
 
V
A
 
A
S
 
P
I
 
I
E
 
H
E
 
E
F
 
M
P
 
E
V
 
L
E
 
S
K
 
D
W
 
W
D
 
N
A
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
Q
L
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
T
A
 
G
V
 
M
F
 
F
H
 
L
A
 
M
T
 
S
A
 
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
K
C
 
H
M
 
M
K
 
L
Q
 
A
Q
 
A
G
 
G
A
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
V
 
V
H
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
W
V
 
P
N
 
D
K
 
I
A
 
P
A
 
A
Y
|
Y
V
 
N
T
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
T
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
T
 
Y
A
 
A
G
 
K
T
 
H
G
 
Q
I
 
I
T
 
R
A
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
I
V
x
I
R
 
D
T
 
T
A
 
P
L
 
L
V
 
N
E
 
E
Q
 
K
Q
 
S
I
 
F
T
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
E
E
 
N
R
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
T
D
 
L
Q
 
E
E
 
E
S
 
I
A
 
K
A
 
K
R
 
E
A
 
K
L
 
-
L
 
-
A
 
A
E
 
K
K
 
V
Q
 
N
P
 
P
S
 
L
L
 
L
Q
 
R
F
 
L
V
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
N
M
 
V
V
 
M
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
L
A
 
S
A
 
S
Q
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
A
L
 
I
P
 
T
M
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
36% identity, 97% coverage: 6:256/260 of query aligns to 3:241/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
G
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
C
D
 
K
I
 
V
V
 
L
L
 
V
N
|
N
G
x
Y
F
x
A
G
x
R
D
x
S
A
 
A
Q
 
K
E
 
A
I
 
A
E
 
E
R
 
E
I
 
V
R
 
S
A
 
K
G
 
Q
L
 
I
Q
 
E
A
 
A
D
 
-
F
 
Y
G
 
G
V
 
G
R
 
Q
V
 
A
A
 
I
H
 
T
D
 
F
G
 
G
A
 
G
D
|
D
L
x
V
S
 
S
R
 
K
G
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
R
 
E
E
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
H
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
A
M
 
W
G
 
G
R
 
T
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
H
 
R
T
 
D
A
 
T
S
 
L
I
 
L
E
 
I
E
 
R
F
 
M
P
 
K
V
 
K
E
 
S
K
 
Q
W
 
W
D
 
D
A
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
L
A
 
C
T
 
T
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
T
P
 
K
C
 
I
M
 
M
K
 
M
Q
 
K
Q
 
K
G
 
R
A
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
S
 
N
V
 
I
N
 
G
K
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
A
T
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
T
T
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
T
 
G
A
 
A
G
 
S
T
 
R
G
 
N
I
 
I
T
 
N
A
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
F
V
x
I
R
 
A
T
x
S
A
 
D
L
x
M
V
 
T
E
 
-
Q
 
-
Q
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
A
R
 
K
E
 
L
G
 
G
T
 
E
D
 
D
Q
 
M
E
 
E
S
 
K
A
 
K
A
 
I
R
 
L
A
 
G
L
 
T
L
 
I
A
 
-
E
 
-
K
 
-
Q
 
-
P
 
P
S
 
L
L
 
G
Q
 
R
F
 
T
V
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
Q
 
N
L
 
V
G
 
A
E
 
G
M
 
L
V
 
V
V
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
L
S
 
S
D
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
S
Q
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
L
 
F
P
 
T
M
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:259/260 of query aligns to 3:249/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
K
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
R
L
 
F
A
 
L
R
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
D
D
 
R
I
 
V
V
 
A
L
 
A
N
 
L
G
x
D
F
x
L
G
 
S
-
 
A
-
 
E
D
 
T
A
 
L
Q
 
E
E
 
E
I
 
T
E
 
A
R
 
R
I
 
T
R
 
H
A
 
W
G
 
H
L
 
A
Q
 
Y
A
 
A
D
 
D
F
 
K
G
 
V
V
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
R
H
x
A
D
|
D
G
x
V
A
 
A
D
 
D
L
 
-
S
 
-
R
 
E
G
 
G
E
 
D
A
 
-
V
 
V
R
 
N
E
 
A
M
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
A
A
 
T
V
 
M
A
 
E
A
 
Q
M
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
 
T
H
 
G
T
 
N
A
 
S
S
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
V
I
 
L
E
 
H
E
 
T
F
 
T
P
 
P
V
 
V
E
 
E
K
 
Q
W
 
F
D
 
D
A
 
K
I
 
V
L
 
M
A
 
A
L
 
V
N
 
N
L
 
V
S
 
R
A
 
G
V
 
I
F
 
F
H
 
L
A
 
G
T
 
C
A
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
C
 
H
M
 
M
K
 
L
Q
 
L
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
A
G
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
x
F
V
 
P
N
 
G
K
x
R
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
T
T
 
T
A
 
S
K
|
K
H
 
G
G
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
T
 
V
A
 
A
L
 
V
E
 
D
T
 
Y
A
 
A
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
R
A
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
M
V
x
I
R
 
E
T
|
T
A
x
P
L
x
M
V
x
T
E
 
Q
Q
x
W
Q
x
R
I
 
L
T
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
D
Q
 
Q
E
 
P
S
 
E
A
 
L
A
 
R
R
 
D
A
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
-
K
 
R
Q
 
I
P
 
P
S
 
Q
L
 
K
Q
 
E
F
 
I
V
 
G
T
 
T
P
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
G
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
V
V
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
A
 
D
A
 
A
A
 
T
Q
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
V
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
Y
T
 
T
A
 
A

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
38% identity, 98% coverage: 5:259/260 of query aligns to 3:249/250 of Q56840

query
sites
Q56840
K
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
R
L
 
F
A
 
L
R
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
D
D
 
R
I
 
V
V
 
A
L
 
A
N
 
L
G
x
D
F
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
E
D
 
T
A
 
L
Q
 
E
E
 
E
I
 
T
E
 
A
R
 
R
I
 
T
R
 
H
A
 
W
G
 
H
L
 
A
Q
 
Y
A
 
A
D
 
D
F
 
K
G
 
V
V
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
R
H
 
A
D
|
D
G
x
V
A
 
A
D
 
D
L
 
-
S
 
-
R
 
E
G
 
G
E
 
D
A
 
-
V
 
V
R
 
N
E
 
A
M
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
A
A
 
T
V
 
M
A
 
E
A
 
Q
M
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
H
 
G
T
 
N
A
 
S
S
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
V
I
 
L
E
 
H
E
 
T
F
 
T
P
 
P
V
 
V
E
 
E
K
 
Q
W
 
F
D
 
D
A
 
K
I
 
V
L
 
M
A
 
A
L
 
V
N
 
N
L
 
V
S
 
R
A
 
G
V
 
I
F
 
F
H
 
L
A
 
G
T
 
C
A
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
C
 
H
M
 
M
K
 
L
Q
 
L
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
A
G
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
F
V
 
P
N
 
G
K
x
R
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
T
T
 
T
A
 
S
K
|
K
H
 
G
G
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
T
 
V
A
 
A
L
 
V
E
 
D
T
 
Y
A
 
A
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
I
T
x
R
A
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
M
V
x
I
R
x
E
T
|
T
A
x
P
L
x
M
V
 
T
E
 
Q
Q
x
W
Q
x
R
I
 
L
T
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
D
Q
 
Q
E
 
P
S
 
E
A
 
L
A
x
R
R
 
D
A
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
-
K
x
R
Q
 
I
P
 
P
S
 
Q
L
 
K
Q
 
E
F
 
I
V
 
G
T
 
T
P
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
G
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
V
V
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
A
 
D
A
 
A
A
 
T
Q
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
V
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
Y
T
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3s55D Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from mycobacterium abscessus bound to NAD (see paper)
33% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 2:273/275 of 3s55D

query
sites
3s55D
F
 
F
N
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
 
A
S
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
R
G
 
S
I
 
H
A
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
E
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
I
N
 
C
G
x
D
F
x
R
G
 
C
D
 
E
A
 
N
Q
 
S
E
 
D
I
 
V
E
 
V
R
 
G
I
 
Y
R
 
P
A
 
L
G
x
A
L
 
T
Q
 
A
A
 
D
D
|
D
F
 
L
-
 
A
-
x
E
-
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
T
G
 
G
V
 
R
R
 
R
V
 
C
A
 
I
H
 
S
D
 
A
G
 
K
A
x
V
D
|
D
L
x
V
S
 
K
R
 
D
G
 
R
E
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
E
E
 
S
M
 
F
I
 
V
A
 
A
H
 
E
A
 
A
V
 
E
A
 
D
A
 
T
M
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
I
N
 
T
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
Q
 
S
H
 
T
T
 
I
A
 
A
S
 
L
I
 
L
E
 
P
E
 
E
F
 
V
P
 
E
V
 
S
E
 
A
K
 
Q
W
 
W
D
 
D
A
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
G
L
x
T
N
 
N
L
 
L
S
 
T
A
 
G
V
 
T
F
 
F
H
 
N
A
 
T
T
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
A
P
 
P
C
 
G
M
 
M
K
 
I
Q
 
K
Q
 
R
G
 
N
A
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
T
I
x
V
A
 
S
S
|
S
V
 
M
H
 
L
G
 
G
L
 
H
V
 
S
A
 
A
S
 
N
V
 
F
N
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
S
Y
|
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
S
K
|
K
H
 
W
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
C
T
 
A
A
 
A
L
 
H
E
 
D
T
 
L
A
 
V
G
 
G
T
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
N
V
x
I
R
 
E
T
|
T
A
 
P
L
x
M
V
x
T
E
 
H
Q
 
N
Q
 
D
I
 
F
T
 
V
-
 
F
-
x
G
-
 
T
-
 
M
-
 
R
-
 
P
A
 
D
L
 
L
A
 
E
E
 
K
R
 
P
E
 
T
G
 
L
T
 
K
D
 
D
Q
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
V
A
 
F
R
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
H
A
 
L
E
 
Q
K
 
Y
Q
 
A
P
 
P
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
F
 
F
V
 
L
T
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
G
 
T
E
 
R
M
 
A
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
V
S
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
S
Q
 
H
M
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
V
L
 
L
P
 
P
M
 
I
D
 
D
G
 
A
G
 
G
W
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R

1w4zA Structure of actinorhodin polyketide (actiii) reductase (see paper)
37% identity, 98% coverage: 3:256/260 of query aligns to 3:255/259 of 1w4zA

query
sites
1w4zA
N
 
D
G
 
S
K
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
L
D
 
R
I
 
V
V
 
F
L
 
V
N
 
C
G
 
A
F
x
R
G
|
G
D
 
E
A
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
R
 
G
I
 
L
R
 
R
A
 
T
G
 
T
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
D
 
L
F
 
R
G
 
E
V
 
A
R
 
G
V
 
V
A
 
E
H
 
A
D
 
D
G
 
G
-
 
R
-
 
T
A
 
C
D
|
D
L
x
V
S
 
R
R
 
S
G
 
V
E
 
P
A
 
E
V
 
I
R
 
E
E
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
A
H
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
R
M
 
Y
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
R
Q
 
P
H
 
G
T
 
G
A
 
G
S
 
A
I
 
T
E
 
A
E
 
E
F
 
L
P
 
A
V
 
D
E
 
E
K
 
L
W
 
W
D
 
L
A
 
D
I
 
V
L
 
V
A
 
E
L
 
T
N
|
N
L
 
L
S
 
T
A
 
G
V
 
V
F
 
F
H
 
R
A
 
V
T
 
T
A
 
K
A
 
Q
A
 
V
L
 
L
P
 
K
C
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
M
K
 
L
Q
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
T
H
 
G
G
 
G
L
 
K
V
 
Q
A
 
G
S
 
V
V
 
V
N
 
H
K
 
A
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
V
 
S
T
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
G
L
 
L
E
 
E
T
 
L
A
 
A
G
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
F
V
|
V
R
 
E
T
|
T
A
 
P
L
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
S
V
 
V
E
 
R
Q
 
E
Q
 
H
I
x
Y
T
 
S
A
 
D
L
 
I
A
 
W
E
 
E
R
 
V
E
 
-
G
 
-
T
 
S
D
 
T
Q
 
E
E
 
E
S
 
A
A
 
F
A
 
D
R
 
R
A
 
-
L
 
-
L
 
I
A
 
T
E
 
A
K
 
R
Q
 
V
P
 
P
S
 
I
L
 
G
Q
 
R
F
 
Y
V
 
V
T
 
Q
P
 
P
E
 
S
Q
 
E
L
 
V
G
 
A
E
 
E
M
 
M
V
 
V
V
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
I
S
 
G
D
 
P
A
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
M
 
V
T
 
T
G
 
A
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
P
 
N
M
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>WP_057506707.1 NCBI__GCF_001431535.1:WP_057506707.1
MFNGKVAVVTGSTSGIGLGIATALARQGADIVLNGFGDAQEIERIRAGLQADFGVRVAHD
GADLSRGEAVREMIAHAVAAMGRIDILVNNAGIQHTASIEEFPVEKWDAILALNLSAVFH
ATAAALPCMKQQGAGRIINIASVHGLVASVNKAAYVTAKHGVVGFTKATALETAGTGITA
NAICPGWVRTALVEQQITALAEREGTDQESAARALLAEKQPSLQFVTPEQLGEMVVFLAS
DAAAQMTGTALPMDGGWTAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory