SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_057508398.1 NCBI__GCF_001431535.1:WP_057508398.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

Q29551 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial; SCOT; 3-oxoacid CoA-transferase 1; Somatic-type succinyl-CoA:3-oxoacid CoA-transferase; SCOT-s; Succinate-coenzyme A transferase; Succinyl-CoA:3-oxoacid CoA transferase; EC 2.8.3.5 from Sus scrofa (Pig) (see 3 papers)
56% identity, 98% coverage: 5:242/244 of query aligns to 33:287/520 of Q29551

query
sites
Q29551
A
x
S
T
|
T
T
x
S
G
x
T
Q
x
R
R
|
R
R
x
H
D
 
T
K
 
K
R
 
F
Y
 
Y
A
 
T
S
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
G
 
D
V
 
I
V
 
-
A
 
P
D
 
N
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
F
G
 
G
L
 
L
C
|
C
G
 
G
I
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
N
L
 
L
I
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
D
 
K
S
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
K
G
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
I
 
V
S
 
S
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
R
 
K
K
 
R
M
 
M
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
N
K
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
V
E
 
E
F
 
L
N
 
T
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
F
 
Y
T
 
T
A
 
S
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
V
 
L
V
 
V
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
I
-
 
K
-
 
Y
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
P
K
 
R
E
 
E
T
 
V
R
 
R
E
 
E
F
 
F
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
V
 
I
M
 
L
E
 
E
T
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
G
D
 
D
V
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
A
W
 
W
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
V
V
 
T
F
 
F
R
 
R
R
 
K
T
 
S
A
 
A
R
 
R
N
 
N
F
 
F
N
 
N
P
 
L
A
 
P
C
 
M
A
x
C
M
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
E
V
 
T
C
 
T
I
 
V
A
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
D
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
F
D
 
A
P
 
P
D
 
E
H
 
D
V
 
I
H
 
H
L
 
I
P
 
P
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
L
V
 
V
H
 
K
N
 
G
P
 
E
T
 
K
P
 
Y
E
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
R
R
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
R
T
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1o9lA Succinate:coenzyme-a transferase (pig heart)
57% identity, 93% coverage: 13:240/244 of query aligns to 2:246/468 of 1o9lA

query
sites
1o9lA
K
 
K
R
 
F
Y
 
Y
A
 
T
S
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
G
 
D
V
 
I
V
 
-
A
 
P
D
 
N
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
F
G
 
G
L
 
L
C
 
C
G
 
G
I
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
N
L
 
L
I
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
D
 
K
S
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
K
G
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
I
 
V
S
 
S
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
R
 
K
K
 
R
M
 
M
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
N
K
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
F
x
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
x
V
E
|
E
F
x
L
N
 
T
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
F
 
Y
T
 
T
A
 
S
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
V
 
L
V
 
V
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
-
 
G
-
x
S
-
x
P
-
 
I
-
 
K
-
 
Y
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
x
S
-
 
K
-
 
P
K
 
R
E
 
E
T
 
V
R
 
R
E
 
E
F
 
F
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
V
 
I
M
 
L
E
 
E
T
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
G
D
 
D
V
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
A
W
 
W
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
V
V
 
T
F
 
F
R
 
R
R
 
K
T
 
S
A
 
A
R
 
R
N
 
N
F
 
F
N
 
N
P
 
L
A
 
P
C
 
M
A
 
C
M
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
E
V
 
T
C
 
T
I
 
V
A
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
D
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
F
D
 
A
P
 
P
D
 
E
H
 
D
V
 
I
H
 
H
L
 
I
P
 
P
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
L
V
 
V
H
 
K
N
 
G
P
 
E
T
 
K
P
 
Y
E
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
R
R
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
R

3k6mC Dynamic domains of succinyl-coa:3-ketoacid-coenzyme a transferase from pig heart. (see paper)
57% identity, 94% coverage: 13:241/244 of query aligns to 2:247/466 of 3k6mC

query
sites
3k6mC
K
 
K
R
 
F
Y
 
Y
A
 
T
S
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
G
 
D
V
 
I
V
 
-
A
 
P
D
 
N
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
F
|
F
G
 
G
L
 
L
C
 
C
G
 
G
I
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
N
L
 
L
I
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
D
 
K
S
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
K
G
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
I
 
V
S
 
S
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
R
 
K
K
 
R
M
 
M
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
N
K
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
V
E
 
E
F
 
L
N
 
T
P
 
P
Q
|
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
F
 
Y
T
 
T
A
 
S
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
V
 
L
V
 
V
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
I
-
 
K
-
 
Y
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
P
K
 
R
E
 
E
T
 
V
R
 
R
E
 
E
F
 
F
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
V
 
I
M
 
L
E
 
E
T
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
G
D
 
D
V
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
A
W
 
W
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
V
V
 
T
F
 
F
R
 
R
R
 
K
T
 
S
A
 
A
R
 
R
N
 
N
F
 
F
N
 
N
P
 
L
A
 
P
C
 
M
A
 
C
M
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
E
V
 
T
C
 
T
I
 
V
A
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
D
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
F
D
 
A
P
 
P
D
 
E
H
 
D
V
 
I
H
 
H
L
 
I
P
 
P
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
L
V
 
V
H
 
K
N
 
G
P
 
E
T
 
K
P
 
Y
E
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
R
R
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
R
T
 
N

Sites not aligning to the query:

3oxoE Succinyl-coa:3-ketoacid coa transferase from pig heart covalently bound to coa (see paper)
57% identity, 93% coverage: 13:240/244 of query aligns to 2:246/462 of 3oxoE

query
sites
3oxoE
K
 
K
R
 
F
Y
 
Y
A
 
T
S
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
G
 
D
V
 
I
V
 
-
A
 
P
D
 
N
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
F
G
 
G
L
 
L
C
 
C
G
 
G
I
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
N
L
 
L
I
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
D
 
K
S
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
K
G
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
I
 
V
S
 
S
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
R
 
K
K
 
R
M
 
M
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
N
K
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
V
E
 
E
F
 
L
N
 
T
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
F
 
Y
T
 
T
A
 
S
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
V
 
L
V
 
V
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
I
-
 
K
-
 
Y
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
P
K
 
R
E
 
E
T
 
V
R
 
R
E
 
E
F
 
F
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
V
 
I
M
 
L
E
 
E
T
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
G
D
 
D
V
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
A
W
 
W
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
V
V
 
T
F
 
F
R
 
R
R
 
K
T
 
S
A
 
A
R
 
R
N
 
N
F
 
F
N
 
N
P
 
L
A
 
P
C
 
M
A
 
C
M
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
E
V
 
T
C
 
T
I
 
V
A
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
D
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
F
D
 
A
P
 
P
D
 
E
H
 
D
V
 
I
H
 
H
L
 
I
P
 
P
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
L
V
 
V
H
 
K
N
 
G
P
 
E
T
 
K
P
 
Y
E
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
R
R
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

8i3yD Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with succinyl-coa.
51% identity, 90% coverage: 26:244/244 of query aligns to 15:251/471 of 8i3yD

query
sites
8i3yD
V
 
I
A
 
K
D
 
N
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
F
G
 
G
L
 
T
C
 
G
G
 
G
I
 
M
P
 
P
E
 
H
A
 
A
L
 
I
I
 
M
A
 
Q
A
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
K
S
 
M
G
 
G
V
 
V
G
 
R
G
 
D
L
 
L
T
 
I
V
 
I
I
 
Y
S
 
S
N
 
D
N
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
L
 
I
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
L
 
F
A
 
E
T
 
N
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
R
 
N
K
 
K
M
 
M
I
 
I
S
 
V
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
E
 
N
N
 
N
K
 
K
E
 
I
F
 
F
E
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
A
 
E
G
 
G
E
 
D
L
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
E
F
 
F
N
 
C
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
F
F
 
Y
T
 
T
A
 
P
T
 
T
G
 
A
Y
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
L
A
 
Q
E
 
T
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
T
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
P
K
 
R
E
 
E
T
 
T
R
 
R
E
 
F
F
 
F
D
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
L
Y
 
Y
V
 
C
M
 
L
E
 
E
T
 
N
A
 
A
L
 
I
R
 
K
A
 
T
D
 
D
V
 
F
A
 
S
L
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
W
 
W
K
 
K
A
 
G
D
 
D
E
 
R
A
 
C
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
F
R
 
R
R
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
R
N
 
N
F
 
F
N
 
N
P
 
V
A
 
P
C
 
V
A
 
G
M
 
Q
A
 
C
G
 
G
K
x
Q
V
 
T
C
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
N
V
 
L
V
 
V
P
 
E
V
 
N
G
 
G
S
 
D
I
 
I
D
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
E
V
 
V
H
 
H
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
x
D
R
 
R
I
 
V
V
 
V
H
 
V
N
 
P
P
 
E
T
 
R
P
 
Y
E
 
Q
K
 
T
R
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
H
R
 
R
T
 
T
V
 
V
R
 
T
T
 
R
E
 
A
N
 
S
T
 
T

8i40A Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with coa.
51% identity, 93% coverage: 14:239/244 of query aligns to 4:246/467 of 8i40A

query
sites
8i40A
R
 
K
Y
 
V
A
 
M
S
 
S
A
 
L
A
 
S
L
 
S
A
 
A
L
 
V
Q
 
Q
G
 
D
V
 
I
V
 
-
A
 
K
D
 
N
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
F
G
 
G
L
 
T
C
 
G
G
 
G
I
 
M
P
 
P
E
 
H
A
 
A
L
 
I
I
 
M
A
 
Q
A
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
K
S
 
M
G
 
G
V
 
V
G
 
R
G
 
D
L
 
L
T
 
I
V
 
I
I
 
Y
S
 
S
N
 
D
N
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
L
 
I
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
L
 
F
A
 
E
T
 
N
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
R
 
N
K
 
K
M
 
M
I
 
I
S
 
V
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
E
 
N
N
 
N
K
 
K
E
 
I
F
 
F
E
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
A
 
E
G
 
G
E
 
D
L
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
E
F
 
F
N
 
C
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
F
F
 
Y
T
 
T
A
 
P
T
 
T
G
 
A
Y
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
L
A
 
Q
E
 
T
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
T
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
P
K
 
R
E
 
E
T
 
T
R
 
R
E
 
F
F
 
F
D
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
L
Y
 
Y
V
 
C
M
 
L
E
 
E
T
 
N
A
 
A
L
 
I
R
 
K
A
 
T
D
 
D
V
 
F
A
 
S
L
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
W
 
W
K
 
K
A
 
G
D
 
D
E
 
R
A
 
C
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
F
R
 
R
R
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
R
N
 
N
F
 
F
N
 
N
P
 
V
A
 
P
C
 
V
A
 
G
M
 
Q
A
 
C
G
 
G
K
 
Q
V
 
T
C
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
N
V
 
L
V
 
V
P
 
E
V
 
N
G
 
G
S
 
D
I
 
I
D
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
E
V
 
V
H
 
H
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
D
R
 
R
I
 
V
V
 
V
H
 
V
N
 
P
P
 
E
T
 
R
P
 
Y
E
 
Q
K
 
T
R
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
H
R
 
R
T
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8i3yA Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with succinyl-coa.
51% identity, 93% coverage: 14:239/244 of query aligns to 4:246/459 of 8i3yA

query
sites
8i3yA
R
 
K
Y
 
V
A
 
M
S
 
S
A
 
L
A
 
S
L
 
S
A
 
A
L
 
V
Q
 
Q
G
 
D
V
 
I
V
 
-
A
 
K
D
 
N
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
F
|
F
G
 
G
L
 
T
C
 
G
G
 
G
I
 
M
P
 
P
E
 
H
A
 
A
L
 
I
I
 
M
A
 
Q
A
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
K
S
 
M
G
 
G
V
 
V
G
 
R
G
 
D
L
 
L
T
 
I
V
 
I
I
 
Y
S
 
S
N
 
D
N
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
L
 
I
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
L
 
F
A
 
E
T
 
N
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
R
 
N
K
 
K
M
 
M
I
 
I
S
 
V
S
 
S
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G
E
 
N
N
 
N
K
 
K
E
 
I
F
 
F
E
 
A
R
 
R
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
A
 
E
G
 
G
E
 
D
L
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
E
F
 
F
N
 
C
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
F
F
 
Y
T
 
T
A
 
P
T
 
T
G
 
A
Y
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
L
A
 
Q
E
 
T
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
T
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
P
K
 
R
E
 
E
T
 
T
R
 
R
E
 
F
F
 
F
D
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
L
Y
 
Y
V
 
C
M
 
L
E
 
E
T
 
N
A
 
A
L
 
I
R
 
K
A
 
T
D
 
D
V
 
F
A
 
S
L
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
W
 
W
K
 
K
A
 
G
D
 
D
E
 
R
A
 
C
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
F
R
 
R
R
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
R
N
 
N
F
 
F
N
 
N
P
 
V
A
 
P
C
 
V
A
 
G
M
 
Q
A
 
C
G
 
G
K
x
Q
V
 
T
C
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
N
V
 
L
V
 
V
P
 
E
V
 
N
G
 
G
S
 
D
I
 
I
D
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
E
V
 
V
H
 
H
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
x
D
R
 
R
I
 
V
V
 
V
H
 
V
N
 
P
P
 
E
T
 
R
P
 
Y
E
 
Q
K
 
T
R
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
H
R
 
R
T
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

9cq2A Ctfab e46d active site mutant hydrolase (see paper)
47% identity, 82% coverage: 25:225/244 of query aligns to 12:212/213 of 9cq2A

query
sites
9cq2A
V
 
L
V
 
V
A
 
K
D
 
E
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
M
V
 
I
G
 
G
G
 
G
F
|
F
G
x
L
L
 
G
C
 
V
G
 
G
I
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
N
L
 
I
I
 
I
A
 
D
A
 
E
L
 
I
R
 
I
D
 
R
S
 
H
G
 
N
V
 
I
G
 
S
G
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
V
I
 
I
S
 
A
N
 
N
N
 
D
A
 
T
G
 
A
V
 
F
D
 
E
G
 
D
F
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
K
T
 
N
R
 
K
Q
 
L
I
 
C
R
 
K
K
 
K
M
 
V
I
 
I
S
 
V
S
 
S
Y
x
H
V
 
I
G
 
G
E
 
T
N
 
N
K
 
P
E
 
E
F
 
T
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
F
 
M
L
 
I
A
 
E
G
 
G
E
 
T
L
 
L
E
 
E
L
 
V
E
 
E
F
 
L
N
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
I
 
L
P
 
G
A
 
G
F
 
I
F
 
L
T
 
T
A
 
P
T
 
T
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
K
G
 
D
K
 
K
E
 
K
T
 
V
R
 
I
E
 
E
F
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
K
H
 
K
Y
 
Y
V
 
L
M
 
L
E
 
E
T
 
L
A
 
P
L
 
I
R
 
H
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
K
 
K
A
 
A
W
 
K
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
Y
A
 
L
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
Y
R
 
N
R
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
E
N
 
N
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
I
C
 
M
A
 
A
M
 
L
A
 
A
G
 
A
K
|
K
V
 
T
C
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
T
G
 
G
S
 
T
I
 
L
D
 
S
P
 
P
D
 
N
H
 
E
V
 
I
H
 
K
L
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
Y
 
I
V
 
V
H
x
D
R
 
Y
I
 
I
V
 
V

1k6dB Crystal structure of acetate coa-transferase alpha subunit (see paper)
44% identity, 83% coverage: 24:225/244 of query aligns to 13:214/219 of 1k6dB

query
sites
1k6dB
G
 
G
V
 
F
V
 
F
A
 
R
D
 
D
G
 
G
Q
 
M
T
 
T
L
 
I
A
 
M
V
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
F
G
x
M
L
 
G
C
 
I
G
 
G
I
 
T
P
 
P
E
 
S
A
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
L
D
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
R
G
 
D
L
 
L
T
 
T
V
 
L
I
 
I
S
 
A
N
 
N
N
 
D
A
 
T
G
 
A
V
 
F
D
 
V
G
 
D
F
 
T
G
 
G
L
 
I
G
 
G
Q
 
P
L
 
L
L
 
I
A
 
V
T
 
N
R
 
G
Q
 
R
I
 
V
R
 
R
K
 
K
M
 
V
I
 
I
S
 
A
S
 
S
Y
x
H
V
x
I
G
 
G
E
x
T
N
 
N
K
 
P
E
 
E
F
 
T
E
 
G
R
 
R
Q
 
R
F
 
M
L
 
I
A
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
M
E
 
D
L
 
V
E
 
V
F
 
L
N
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
I
E
 
E
R
 
Q
L
 
I
R
 
R
A
 
C
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
G
A
 
G
F
 
F
F
 
L
T
 
T
A
 
P
T
 
T
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
Q
T
 
T
R
 
L
E
 
T
F
 
L
D
 
D
G
 
G
R
 
K
H
 
T
Y
 
W
V
 
L
M
 
L
E
 
E
T
 
R
A
 
P
L
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
K
 
R
A
 
A
W
 
H
K
 
R
A
 
C
D
 
D
E
 
T
A
 
L
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
T
F
 
Y
R
 
Q
R
 
L
T
 
S
A
 
A
R
 
R
N
 
N
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
L
C
 
I
A
 
A
M
 
L
A
 
A
G
 
A
K
 
D
V
 
I
C
 
T
I
 
L
A
 
V
E
 
E
V
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
V
P
 
E
V
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
L
D
 
Q
P
 
P
D
 
D
H
 
H
V
 
I
H
 
V
L
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
A
Y
 
V
V
 
I
H
 
D
R
 
H
I
 
I
V
 
I

2ahvA Crystal structure of acyl-coa transferase from e. Coli o157:h7 (ydif)- thioester complex with coa- 1 (see paper)
25% identity, 49% coverage: 110:228/244 of query aligns to 114:251/512 of 2ahvA

query
sites
2ahvA
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
T
 
V
L
 
L
A
 
T
E
 
Q
R
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
H
I
 
Q
P
 
P
A
 
G
F
 
I
F
 
I
T
 
S
A
 
D
T
 
I
G
 
G
Y
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
F
V
 
V
A
 
D
E
 
P
G
 
R
K
 
Q
E
 
Q
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
I
-
 
K
T
 
L
R
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
N
R
 
K
H
 
E
Y
 
Y
V
 
L
M
 
Y
E
 
Y
T
 
K
A
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
P
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
F
V
 
I
K
 
R
A
 
A
W
 
T
K
 
T
A
 
C
D
 
D
E
 
S
A
 
E
G
 
G
N
 
Y
L
 
A
V
 
T
F
 
F
R
 
E
R
 
D
T
 
E
A
 
V
R
 
M
N
 
Y
F
 
L
N
 
D
P
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
A
 
A
C
 
V
A
 
H
M
 
N
A
 
N
G
 
G
K
 
G
V
 
I
C
 
V
I
 
M
A
 
M
E
 
Q
V
 
V
E
 
Q
E
 
K
V
 
M
V
 
V
P
 
K
V
 
K
G
 
A
S
 
T
I
 
L
D
 
H
P
 
P
D
 
K
H
 
S
V
 
V
H
 
R
L
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
Y
Y
 
L
V
 
V
H
 
D
R
 
I
I
 
V
V
 
V
H
 
V
N
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_057508398.1 NCBI__GCF_001431535.1:WP_057508398.1
MTTPATTGQRRDKRYASAALALQGVVADGQTLAVGGFGLCGIPEALIAALRDSGVGGLTV
ISNNAGVDGFGLGQLLATRQIRKMISSYVGENKEFERQFLAGELELEFNPQGTLAERLRA
GGAGIPAFFTATGYGTVVAEGKETREFDGRHYVMETALRADVALVKAWKADEAGNLVFRR
TARNFNPACAMAGKVCIAEVEEVVPVGSIDPDHVHLPGIYVHRIVHNPTPEKRIEQRTVR
TENT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory