SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_057508879.1 NCBI__GCF_001431535.1:WP_057508879.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3gegA Fingerprint and structural analysis of a scor enzyme with its bound cofactor from clostridium thermocellum (see paper)
40% identity, 92% coverage: 20:265/267 of query aligns to 4:230/241 of 3gegA

query
sites
3gegA
V
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
G
N
x
H
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
G
 
Q
I
 
I
A
 
C
Q
 
L
A
 
D
V
 
F
L
 
L
G
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
D
Q
 
K
V
 
V
M
 
C
I
 
F
G
 
I
D
|
D
L
x
I
D
 
D
V
 
E
A
 
K
A
x
R
G
 
S
K
 
A
A
 
D
C
 
F
L
 
A
A
 
K
E
 
E
W
 
-
D
 
-
R
 
R
P
 
P
A
 
N
D
 
L
A
 
F
A
 
Y
F
 
F
R
 
H
K
 
G
L
 
-
D
|
D
I
x
V
T
 
A
A
 
D
E
 
P
A
 
L
S
 
T
V
 
L
R
 
K
G
 
K
F
 
F
I
 
V
A
 
E
A
 
Y
A
 
A
L
 
M
K
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
-
I
 
-
A
x
C
D
x
R
A
 
G
H
 
S
G
 
K
T
 
G
A
 
I
L
 
L
A
 
S
D
 
S
M
 
L
E
 
L
W
 
Y
A
 
E
Q
 
E
W
 
F
Q
 
D
R
 
Y
R
 
I
L
 
L
S
 
S
-
 
V
S
 
G
L
 
L
H
 
K
G
 
A
A
 
P
F
 
Y
L
 
E
C
 
L
S
 
S
K
 
R
H
 
L
A
 
C
L
 
R
P
 
D
A
 
E
L
 
L
G
 
I
A
 
K
D
 
N
K
 
K
R
 
-
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
|
I
A
|
A
S
|
S
T
 
T
R
 
R
A
 
A
Q
 
F
Q
 
Q
S
 
S
E
 
E
P
 
P
H
 
D
S
 
S
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
V
A
 
A
F
 
L
T
 
T
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
S
 
S
A
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
D
V
 
V
R
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
I
S
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
W
I
|
I
S
 
N
T
x
V
G
 
-
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
T
L
 
F
S
 
T
R
 
Q
A
 
E
D
 
D
H
 
C
A
 
A
Q
 
A
H
 
I
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
S
A
 
N
L
 
M
A
 
V
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
Q
D
 
-
M
 
-
A
 
Q
G
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
D
 
T
H
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
S
R
 
K
K
 
R
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
35% identity, 92% coverage: 15:260/267 of query aligns to 5:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
L
 
L
A
 
T
G
 
D
K
 
K
V
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
G
 
A
I
 
A
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
G
 
Q
G
 
A
Q
 
N
V
 
V
M
 
V
I
 
V
G
 
A
D
|
D
L
x
I
D
 
D
V
 
E
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
K
 
E
A
 
A
C
 
-
L
 
M
A
 
V
E
 
R
W
 
K
D
 
E
R
 
N
P
 
N
A
 
D
D
 
R
A
 
L
A
 
H
F
 
F
R
 
V
K
 
Q
L
x
T
D
 
D
I
|
I
T
 
T
A
 
D
E
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
C
R
 
Q
G
 
H
F
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
S
A
 
A
L
 
V
K
 
H
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
E
D
 
I
A
 
V
H
 
-
G
 
-
T
 
A
A
 
P
L
 
I
A
 
H
D
 
E
M
 
M
E
 
E
W
 
L
A
 
S
Q
 
D
W
 
W
Q
 
N
R
 
K
R
 
V
L
 
L
S
 
Q
-
 
V
S
 
N
L
 
L
H
 
T
G
 
G
A
 
M
F
 
F
L
 
L
C
 
M
S
 
S
K
 
K
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
K
A
 
H
L
 
M
G
 
L
A
 
A
D
 
A
K
 
G
R
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
T
 
V
R
 
G
A
 
G
Q
 
L
Q
 
V
S
 
A
E
 
W
P
 
P
H
 
D
S
 
I
E
 
P
A
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
Q
F
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
D
-
 
Y
A
 
A
G
 
K
P
 
H
A
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
V
S
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
I
I
|
I
S
 
D
T
 
T
G
 
P
A
 
L
W
 
N
Q
 
E
A
 
K
P
 
S
M
 
F
R
 
L
R
 
E
R
 
N
T
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
L
P
 
E
S
 
E
L
 
I
S
 
K
R
 
K
A
 
E
D
 
K
H
 
A
A
 
K
Q
 
V
H
 
N
P
 
P
V
 
L
G
 
L
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
I
G
 
A
A
 
N
L
 
V
A
 
M
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
L
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
D
 
A
H
 
I
I
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
40% identity, 92% coverage: 15:260/267 of query aligns to 3:249/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
G
 
A
I
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
F
L
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
V
Q
 
K
V
 
V
M
 
V
I
 
V
G
 
A
D
|
D
L
|
L
D
 
D
V
 
S
A
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
G
C
 
T
L
 
V
A
 
-
E
 
E
W
 
A
D
 
I
R
 
R
P
 
Q
A
 
A
-
 
G
-
 
G
D
 
E
A
 
A
A
 
V
F
 
F
R
 
I
K
 
R
L
x
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
R
E
 
D
A
 
A
S
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
A
F
 
L
I
 
V
A
 
E
A
 
G
A
 
C
L
 
A
K
 
A
R
 
A
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
Y
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
E
D
 
I
A
 
E
H
 
Q
G
 
G
T
 
K
A
 
-
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
G
E
 
N
W
 
E
A
 
A
Q
 
E
W
 
F
Q
 
D
R
 
A
R
 
I
L
 
M
S
 
A
-
 
V
S
 
N
L
 
V
H
 
K
G
 
G
A
 
V
F
 
W
L
 
L
C
 
C
S
 
M
K
 
K
H
 
H
A
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
L
L
 
M
G
 
L
A
 
A
D
 
Q
K
 
G
R
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
R
 
A
A
 
G
Q
 
L
Q
 
G
S
 
A
E
 
A
P
 
P
H
 
K
S
 
M
E
 
S
A
 
I
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
H
G
 
A
L
 
V
L
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
E
-
 
Y
A
 
A
G
 
K
P
 
K
A
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
C
P
 
P
G
x
A
W
x
V
I
 
I
S
 
D
T
 
T
G
 
-
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
D
M
 
M
R
 
F
R
 
R
R
 
R
T
 
A
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
D
P
 
P
S
 
R
L
 
K
S
 
A
R
 
E
A
 
F
D
 
A
H
 
A
A
 
A
Q
 
M
H
 
H
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
G
Q
 
R
P
 
V
E
 
E
D
 
E
I
 
I
G
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
V
V
 
L
Y
 
Y
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
D
M
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
D
 
A
H
 
L
I
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
A
T
 
T

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
33% identity, 94% coverage: 15:264/267 of query aligns to 8:255/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
|
A
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
G
 
A
I
 
T
A
 
G
Q
 
R
A
 
R
V
 
L
L
 
R
G
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
V
M
 
V
I
 
V
G
 
G
D
|
D
L
x
I
D
 
D
V
 
P
A
 
T
A
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
C
 
A
L
 
A
A
 
D
E
 
E
W
 
L
D
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
E
A
 
G
A
 
L
F
 
F
R
 
V
K
 
P
L
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
A
 
E
E
 
Q
A
 
E
S
 
A
V
 
V
R
 
D
G
 
N
F
 
L
I
 
F
A
 
D
A
 
T
A
 
A
L
 
A
K
 
S
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
S
D
 
P
A
 
P
H
 
E
G
 
D
T
 
D
A
 
L
L
 
I
A
 
E
D
 
N
M
 
T
E
 
D
W
 
L
A
 
P
Q
 
A
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
-
 
V
R
 
Q
L
 
D
S
 
I
S
 
N
L
 
L
H
 
K
G
 
S
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
S
S
 
C
K
 
R
H
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
R
A
 
H
L
 
M
G
 
V
A
 
P
D
 
A
K
 
G
R
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
F
R
 
V
A
 
A
Q
 
V
Q
 
M
S
 
G
E
 
S
P
 
A
H
 
T
S
 
S
E
x
Q
-
 
I
A
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
L
 
L
A
 
A
F
 
M
T
 
S
H
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
G
L
 
V
S
 
Q
-
 
Y
A
 
A
G
 
R
P
 
Q
A
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
L
S
 
C
P
|
P
G
 
G
W
x
P
I
x
V
S
 
N
T
 
T
G
 
P
A
 
L
W
 
L
Q
 
Q
A
 
E
P
 
-
M
 
L
R
 
F
R
 
A
R
 
K
T
 
D
P
 
P
S
 
E
L
 
R
S
 
A
R
 
A
A
 
R
D
 
R
H
 
L
A
 
V
Q
 
H
H
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
F
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
V
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
D
A
 
A
G
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
D
 
T
H
 
F
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I
T
 
S
R
 
S
K
 
A
M
 
Y
I
 
V

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
35% identity, 92% coverage: 15:259/267 of query aligns to 5:255/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
R
V
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
S
N
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
D
G
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
V
M
 
A
I
 
I
G
 
A
D
|
D
L
|
L
D
 
D
V
 
V
A
 
M
A
 
A
G
 
A
K
 
Q
A
 
A
C
 
V
L
 
V
A
 
A
E
 
G
W
 
L
D
 
E
R
 
N
P
 
G
A
 
G
D
 
F
A
 
A
A
 
V
F
 
-
R
 
-
K
 
E
L
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
K
E
 
R
A
 
A
S
 
S
V
 
V
R
 
D
G
 
A
F
 
A
I
 
M
A
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
D
R
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
F
D
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
A
 
S
D
 
T
A
 
M
H
 
R
-
 
P
G
 
A
T
 
V
A
 
D
L
 
I
A
 
T
D
 
D
M
 
E
E
 
E
W
 
W
A
 
-
Q
 
D
W
 
F
Q
 
N
R
 
F
R
 
D
L
 
V
S
 
N
S
 
A
L
 
-
H
 
R
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
N
K
 
Q
H
 
I
A
 
A
L
 
C
P
 
R
-
 
H
A
 
F
L
 
L
G
 
A
A
 
S
D
 
N
K
 
T
R
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
L
R
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
V
S
 
G
E
 
A
P
 
P
H
 
L
S
x
L
E
 
A
A
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
F
G
 
A
L
 
V
L
 
F
A
 
G
F
 
W
T
 
T
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
R
S
 
E
A
 
M
G
 
A
P
 
P
A
 
K
-
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
V
S
 
C
P
 
P
G
|
G
W
 
F
I
x
V
S
 
K
T
|
T
G
 
A
A
x
M
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
W
 
W
Q
x
E
A
 
A
P
 
E
M
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
M
T
 
T
P
 
P
S
 
E
L
 
A
S
 
V
R
 
R
A
 
A
D
 
E
H
 
Y
A
 
V
Q
 
S
-
 
L
H
 
T
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
I
G
 
E
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
V
G
 
A
A
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
A
A
 
A
G
 
R
F
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
D
 
G
H
 
I
I
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
V

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
40% identity, 92% coverage: 15:260/267 of query aligns to 3:237/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
L
 
F
A
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
N
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
F
L
 
A
G
 
R
A
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
L
V
 
V
M
 
A
I
 
L
G
 
C
D
|
D
L
|
L
D
x
R
V
 
-
A
 
P
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
E
W
 
V
D
 
A
R
 
E
P
 
A
A
 
I
D
 
G
A
 
G
A
 
A
F
 
F
R
 
F
K
 
Q
L
x
V
D
|
D
I
x
L
T
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
R
S
 
E
V
 
R
R
 
V
G
 
R
F
 
F
I
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
A
K
 
Y
R
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
A
 
A
D
 
-
A
 
A
H
 
P
G
 
G
T
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
T
D
 
-
M
 
V
E
 
R
W
 
L
A
 
P
Q
 
E
W
 
W
Q
 
R
R
 
R
R
 
V
L
 
L
S
 
E
S
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
V
F
 
N
L
 
L
C
 
T
S
 
A
K
 
P
H
 
M
A
 
H
L
 
L
P
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
A
D
 
R
K
 
E
R
 
M
-
 
R
-
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
V
A
 
A
S
|
S
T
 
V
R
 
Q
A
 
G
Q
 
L
Q
 
F
S
 
A
E
 
E
P
 
Q
H
 
E
S
x
N
E
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
H
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
D
A
 
L
G
 
A
P
 
P
A
 
L
-
 
R
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
A
I
|
I
S
 
A
T
|
T
G
 
E
A
|
A
-
x
V
W
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
I
M
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
D
T
 
W
P
 
E
S
 
D
L
 
L
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
H
P
 
A
V
 
L
G
 
R
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
G
 
A
A
 
E
L
 
A
A
 
V
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
E
M
 
K
A
 
A
G
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
D
 
I
H
 
L
I
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
34% identity, 92% coverage: 15:259/267 of query aligns to 5:242/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
L
 
F
A
 
E
G
 
N
K
 
R
V
 
T
V
 
L
L
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
x
N
N
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
V
 
F
L
 
H
G
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
A
Q
 
N
V
 
L
M
 
V
I
 
L
G
 
T
D
|
D
L
|
L
D
 
D
V
 
R
A
 
E
A
 
G
G
 
L
K
 
D
A
 
A
C
 
F
L
 
A
A
 
A
E
 
S
W
 
L
D
 
G
R
 
S
P
 
P
A
 
E
D
 
R
A
 
I
A
 
A
F
 
T
R
 
I
K
 
K
L
 
A
D
|
D
I
x
A
T
 
S
A
 
S
E
 
A
A
 
D
S
 
D
V
 
A
R
 
E
G
 
K
F
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
M
K
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
P
N
x
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
D
 
Q
A
 
A
H
 
K
G
 
-
T
 
-
A
 
P
L
 
F
A
 
A
D
 
E
M
 
M
E
 
S
W
 
D
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
H
R
 
R
R
 
T
L
 
I
S
 
S
-
x
I
S
 
N
L
 
L
H
 
D
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
Y
C
 
L
S
 
C
K
 
K
H
 
R
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
E
D
 
D
K
 
-
R
 
-
G
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
V
N
 
T
I
 
L
A
 
A
S
|
S
T
 
L
R
 
A
A
 
A
Q
 
Y
Q
 
R
S
 
G
E
 
A
P
 
Y
H
 
V
S
x
N
E
 
A
A
 
H
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
M
L
 
V
A
 
S
F
 
M
T
 
T
H
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
R
S
 
E
A
 
L
G
 
A
P
 
P
A
 
K
V
 
T
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
G
I
 
V
S
 
S
P
|
P
G
 
G
W
 
I
I
|
I
S
 
E
T
|
T
G
 
P
A
x
M
W
 
T
Q
 
S
A
 
E
P
 
L
M
 
L
R
 
K
R
 
T
R
 
R
T
 
M
P
 
D
S
 
E
L
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
T
H
 
M
A
 
T
Q
 
Q
H
 
T
P
 
P
V
 
L
G
 
K
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
S
D
 
E
I
 
I
G
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
I
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
P
M
 
A
A
 
A
G
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
D
 
T
H
 
I
I
 
Q
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
I

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
35% identity, 91% coverage: 15:258/267 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
A
 
Q
G
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
A
N
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
R
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
Q
 
L
A
 
R
V
 
F
L
 
A
G
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
A
Q
 
A
V
 
V
M
 
V
I
 
I
G
 
N
D
|
D
L
 
I
D
 
D
V
 
A
A
 
E
A
 
K
G
 
V
K
 
R
A
 
A
C
 
T
L
 
V
A
 
D
E
 
E
W
 
F
D
 
S
R
 
A
P
 
R
A
 
G
D
 
H
A
 
R
A
 
V
F
 
L
R
 
G
K
 
A
L
 
V
-
 
A
D
|
D
I
|
I
T
 
G
A
 
N
E
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
R
 
D
G
 
G
F
 
M
I
 
V
A
 
K
A
 
Q
A
 
T
L
 
I
K
 
D
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
E
D
 
R
A
 
A
H
 
-
G
 
-
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
R
D
 
K
M
 
L
E
 
S
W
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
R
 
V
R
 
T
L
 
I
S
 
N
-
 
V
S
 
N
L
 
L
H
 
K
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
T
K
 
Q
H
 
A
A
 
V
L
 
H
P
 
G
A
 
H
L
 
M
G
 
V
A
 
E
D
 
N
K
 
K
R
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
-
R
 
R
A
 
A
Q
 
W
Q
 
L
S
 
G
E
 
G
P
 
A
H
 
G
S
 
Q
E
 
T
A
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
V
A
 
G
F
 
M
T
 
T
H
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
I
S
 
E
A
 
L
G
 
G
P
 
R
A
 
A
-
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
L
I
 
I
S
 
H
T
 
T
G
 
P
A
 
M
W
 
W
-
 
D
Q
 
E
A
 
L
P
 
P
M
 
E
R
 
K
R
 
D
R
 
Q
T
 
Q
P
 
F
S
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
-
D
 
-
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
Q
P
 
P
V
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
G
 
A
A
 
N
L
 
T
A
 
L
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
D
D
 
D
M
 
D
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
D
 
V
H
 
L
I
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
35% identity, 91% coverage: 15:258/267 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
A
 
Q
G
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
N
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
Q
 
L
A
 
R
V
 
F
L
 
A
G
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
A
Q
 
A
V
 
V
M
 
V
I
 
I
G
 
N
D
|
D
L
x
I
D
 
D
V
 
A
A
 
E
A
 
K
G
 
V
K
 
R
A
 
A
C
 
T
L
 
V
A
 
D
E
 
E
W
 
F
D
 
S
R
 
A
P
 
R
A
 
G
D
 
H
A
 
R
A
 
V
F
 
L
R
 
G
K
 
A
L
 
V
-
 
A
D
 
D
I
|
I
T
 
G
A
 
N
E
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
R
 
D
G
 
G
F
 
M
I
 
V
A
 
K
A
 
Q
A
 
T
L
 
I
K
 
D
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
A
 
E
D
 
R
A
 
A
H
 
-
G
 
-
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
R
D
 
K
M
 
L
E
 
S
W
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
R
 
V
R
 
T
L
 
I
S
 
N
-
 
V
S
 
N
L
 
L
H
 
K
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
T
K
 
Q
H
 
A
A
 
V
L
 
H
P
 
G
A
 
H
L
 
M
G
 
V
A
 
E
D
 
N
K
 
K
R
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
T
 
-
R
 
R
A
 
A
Q
 
W
Q
 
L
S
 
G
E
 
G
P
 
A
H
 
G
S
 
Q
E
 
T
A
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
V
A
 
G
F
 
M
T
 
T
H
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
I
S
 
E
A
 
L
G
 
G
P
 
R
A
 
A
-
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
L
I
|
I
S
 
H
T
 
T
G
 
P
A
 
M
W
 
W
-
 
D
Q
 
E
A
 
L
P
 
P
M
 
E
R
 
K
R
 
D
R
 
Q
T
 
Q
P
 
F
S
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
-
D
 
-
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
Q
P
 
P
V
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
G
 
A
A
 
N
L
 
T
A
 
L
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
D
D
 
D
M
 
D
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
D
 
V
H
 
L
I
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

5h5xC Crystal structure of nadh bound carbonyl reductase from streptomyces coelicolor
36% identity, 96% coverage: 5:260/267 of query aligns to 2:255/257 of 5h5xC

query
sites
5h5xC
P
 
P
A
 
A
V
 
T
A
 
T
A
 
G
W
 
Y
P
 
-
A
 
A
A
 
A
P
 
E
L
 
F
A
 
A
G
 
G
K
 
R
V
 
T
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
G
 
A
I
 
T
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
V
 
-
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
-
 
A
Q
 
R
V
 
V
M
 
V
I
 
V
G
 
A
D
|
D
L
x
F
D
 
N
V
 
A
A
 
E
A
 
G
G
 
A
K
 
E
A
 
K
C
 
A
L
 
A
A
 
A
E
 
E
W
 
L
D
 
R
R
 
A
P
 
G
-
 
G
A
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
A
R
 
V
K
 
E
L
|
L
D
|
D
I
 
V
T
 
T
A
 
R
E
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
V
R
 
E
G
 
A
F
 
A
I
 
V
A
 
G
A
 
F
A
 
A
L
 
V
K
 
D
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
L
L
 
A
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
G
D
 
G
A
 
P
H
 
S
G
 
A
T
 
P
A
 
T
L
 
-
A
 
G
D
 
E
M
 
Y
E
 
D
W
 
V
A
 
A
Q
 
A
W
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
R
 
V
L
 
V
-
 
R
S
 
T
S
 
N
L
 
L
H
 
D
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
Y
C
 
S
S
 
M
K
 
R
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
I
-
 
E
G
 
A
A
 
A
D
 
G
K
 
K
R
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
V
A
 
A
S
|
S
T
 
I
R
 
L
A
 
G
Q
 
S
Q
 
V
S
 
G
E
 
F
P
 
A
H
 
G
S
 
S
E
 
P
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
L
 
V
L
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
A
S
 
E
A
 
Y
G
 
A
P
 
A
-
 
R
A
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
G
P
|
P
G
|
G
W
 
F
I
|
I
S
 
D
T
|
T
G
 
-
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
P
M
 
L
R
 
L
R
 
K
R
 
T
T
 
M
P
 
E
S
 
E
L
 
A
S
 
A
-
 
Y
R
 
K
A
 
G
D
 
L
H
 
V
A
 
A
Q
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
R
P
 
S
E
 
D
D
 
E
I
 
V
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
I
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
M
 
R
A
 
A
G
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
A
G
 
G
Q
 
S
D
 
Y
H
 
H
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
M
 
Y
T
 
T

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
40% identity, 70% coverage: 73:260/267 of query aligns to 62:251/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
K
E
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
I
R
 
T
G
 
A
F
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
E
K
 
Q
R
 
T
F
 
I
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
-
A
 
G
H
 
F
G
 
G
T
 
S
A
 
-
L
 
V
A
 
H
D
 
D
M
 
A
E
 
D
W
 
A
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
Q
 
D
R
 
R
R
 
I
L
 
M
S
 
A
-
x
V
S
x
N
L
 
V
H
 
T
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
K
 
K
H
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
A
A
 
G
L
 
M
G
 
L
A
 
E
D
 
R
K
 
H
R
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
R
 
A
A
 
G
Q
 
L
Q
 
V
S
 
G
E
 
I
P
 
P
H
 
T
S
 
M
E
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
I
L
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
H
 
R
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
A
S
 
D
-
 
Y
A
 
S
G
 
G
P
 
R
A
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
C
P
|
P
G
 
G
W
x
T
I
x
V
-
 
T
S
 
S
T
|
T
G
 
G
A
x
M
W
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
P
 
L
M
 
L
R
 
G
R
 
S
R
 
D
T
 
T
-
 
S
P
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
Q
R
 
A
A
 
R
D
x
R
H
 
L
A
 
A
Q
 
K
H
x
Y
P
 
P
V
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
F
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
A
A
 
V
V
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
M
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
D
 
A
H
 
F
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
40% identity, 70% coverage: 73:260/267 of query aligns to 64:253/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
K
E
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
I
R
 
T
G
 
A
F
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
E
K
 
Q
R
 
T
F
 
I
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
-
A
 
G
H
 
F
G
 
G
T
 
S
A
 
-
L
 
V
A
 
H
D
 
D
M
 
A
E
 
D
W
 
A
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
Q
 
D
R
 
R
R
 
I
L
 
M
S
 
A
-
 
V
S
 
N
L
 
V
H
 
T
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
K
 
K
H
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
A
A
 
G
L
 
M
G
 
L
A
 
E
D
 
R
K
 
H
R
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
R
 
A
A
 
G
Q
 
L
Q
 
V
S
 
G
E
 
I
P
 
P
H
 
T
S
 
M
E
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
I
L
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
H
 
R
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
A
S
 
D
-
 
Y
A
 
S
G
 
G
P
 
R
A
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
C
P
 
P
G
 
G
W
x
T
I
x
V
-
x
T
S
|
S
T
|
T
G
|
G
A
 
M
W
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
P
 
L
M
 
L
R
 
G
R
 
S
R
 
D
T
 
T
-
 
S
P
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
Q
R
 
A
A
 
R
D
x
R
H
 
L
A
 
A
Q
x
K
H
x
Y
P
 
P
V
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
F
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
A
A
 
V
V
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
M
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
D
 
A
H
 
F
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:260/267 of query aligns to 2:250/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
K
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
N
|
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
G
 
A
I
 
T
A
 
A
Q
 
L
A
 
E
V
 
F
L
 
A
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
Y
Q
 
H
V
 
V
M
 
V
I
 
A
G
 
W
D
|
D
L
|
L
D
 
A
V
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
A
A
 
A
C
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
E
W
 
I
-
 
A
D
 
D
R
 
A
P
 
G
A
 
G
D
 
S
A
 
A
A
 
D
F
 
F
R
 
A
K
 
R
L
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
A
 
A
E
 
A
A
 
E
S
 
S
V
 
V
R
 
E
G
 
A
F
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
E
A
 
I
L
 
I
K
 
A
R
 
E
F
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
 
L
-
 
H
D
 
D
A
 
G
H
 
Q
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
G
 
G
T
 
E
A
 
V
L
 
V
A
 
K
D
 
K
M
 
M
E
 
A
W
 
E
A
 
A
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
D
R
 
A
R
 
V
L
 
I
S
 
S
-
 
V
S
 
N
L
 
L
H
 
K
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
T
K
 
Q
H
 
A
A
 
V
L
 
A
P
 
P
A
 
H
L
 
M
G
 
I
A
 
A
D
 
A
K
 
K
R
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
A
A
 
S
S
|
S
T
 
V
R
 
V
A
 
G
Q
 
L
Q
 
Y
S
 
G
E
 
N
P
 
F
H
 
G
S
 
Q
E
 
T
A
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
I
A
 
G
F
 
M
T
 
T
H
 
K
A
 
V
L
 
W
A
 
A
L
 
R
S
 
E
A
 
L
G
 
G
-
 
R
P
 
Y
A
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
I
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
I
|
I
S
 
A
T
|
T
G
 
E
A
 
M
W
 
V
Q
 
Q
A
 
Q
P
 
M
M
 
P
R
 
E
R
 
R
R
 
V
T
 
L
P
 
E
S
 
A
L
 
M
S
 
V
R
 
-
A
 
-
D
 
-
H
 
-
A
 
A
Q
 
R
H
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
V
 
I
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
A
A
 
R
L
 
A
A
 
Y
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
E
M
 
E
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
I
T
 
S
G
 
G
Q
 
T
D
 
T
H
 
L
I
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
V

1nfqA Rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 91% coverage: 15:258/267 of query aligns to 4:236/244 of 1nfqA

query
sites
1nfqA
L
 
L
A
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
A
G
 
S
I
 
H
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
V
 
M
L
 
V
G
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
V
 
V
M
 
V
I
 
F
G
 
G
D
|
D
L
 
I
D
x
L
V
 
D
A
 
E
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
A
C
 
M
L
 
A
A
 
A
E
 
E
W
 
-
D
 
-
R
 
L
P
 
A
A
 
D
D
 
A
A
 
A
A
 
R
F
 
Y
R
 
V
K
 
H
L
|
L
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
Q
E
 
P
A
 
A
S
 
Q
V
 
W
R
 
K
G
 
A
F
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
T
A
 
A
L
 
V
K
 
T
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
H
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
x
L
D
 
N
A
 
I
H
 
-
G
 
G
T
 
T
A
 
-
L
 
I
A
 
E
D
 
D
M
 
Y
E
 
A
W
 
L
A
 
T
Q
 
E
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
R
 
I
L
 
L
S
 
D
-
 
V
S
 
N
L
 
L
H
 
T
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
G
S
 
I
K
 
R
H
 
A
A
 
V
L
 
V
P
 
K
A
 
P
L
 
M
G
 
K
A
 
E
D
 
A
K
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
x
E
A
 
G
Q
 
L
Q
 
A
S
 
G
E
 
T
P
 
V
H
 
A
S
x
C
E
 
H
A
 
G
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
F
G
 
A
L
 
V
L
 
R
A
 
G
F
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
E
A
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
S
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
H
P
|
P
G
 
G
W
 
L
I
x
V
S
 
K
T
|
T
G
 
-
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
|
P
M
|
M
R
x
T
R
 
D
R
 
W
T
x
V
P
 
P
S
 
E
L
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
H
x
I
A
x
F
Q
 
Q
H
 
T
P
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
V
D
 
E
I
 
V
G
 
S
A
 
N
L
 
L
A
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
E
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
I
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
D
 
E
H
 
F
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1nffA Crystal structure of rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 91% coverage: 15:258/267 of query aligns to 4:236/244 of 1nffA

query
sites
1nffA
L
 
L
A
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
|
G
G
 
G
A
 
A
N
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
A
G
 
S
I
 
H
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
V
 
M
L
 
V
G
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
V
 
V
M
 
V
I
 
F
G
 
G
D
|
D
L
x
I
D
x
L
V
 
D
A
 
E
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
A
C
 
M
L
 
A
A
 
A
E
 
E
W
 
-
D
 
-
R
 
L
P
 
A
A
 
D
D
 
A
A
 
A
A
 
R
F
 
Y
R
 
V
K
 
H
L
|
L
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
Q
E
 
P
A
 
A
S
 
Q
V
 
W
R
 
K
G
 
A
F
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
T
A
 
A
L
 
V
K
 
T
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
H
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
L
D
 
N
A
 
I
H
 
-
G
 
G
T
 
T
A
 
-
L
 
I
A
 
E
D
 
D
M
 
Y
E
 
A
W
 
L
A
 
T
Q
 
E
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
R
 
I
L
 
L
S
 
D
-
 
V
S
 
N
L
 
L
H
 
T
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
G
S
 
I
K
 
R
H
 
A
A
 
V
L
 
V
P
 
K
A
 
P
L
 
M
G
 
K
A
 
E
D
 
A
K
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
 
E
A
 
G
Q
 
L
Q
 
A
S
 
G
E
 
T
P
 
V
H
 
A
S
 
C
E
 
H
A
 
G
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
F
G
 
A
L
 
V
L
 
R
A
 
G
F
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
E
A
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
S
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
H
P
|
P
G
 
G
W
 
L
I
x
V
S
 
K
T
|
T
G
 
-
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
|
P
M
|
M
R
x
T
R
 
D
R
 
W
T
 
V
P
 
P
S
 
E
L
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
H
 
I
A
 
F
Q
 
Q
H
 
T
P
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
V
D
 
E
I
 
V
G
 
S
A
 
N
L
 
L
A
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
E
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
I
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
D
 
E
H
 
F
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
39% identity, 70% coverage: 73:260/267 of query aligns to 62:246/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
K
E
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
I
R
 
T
G
 
A
F
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
E
K
 
Q
R
 
T
F
 
I
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
-
A
 
G
H
 
F
G
 
G
T
 
S
A
 
-
L
 
V
A
 
H
D
 
D
M
 
A
E
 
D
W
 
A
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
Q
 
D
R
 
R
R
 
I
L
 
M
S
 
A
-
x
V
S
x
N
L
 
V
H
 
T
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
K
 
K
H
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
A
A
 
G
L
 
M
G
 
L
A
 
E
D
 
R
K
 
H
R
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
R
 
A
A
 
G
Q
 
L
Q
 
V
S
 
G
E
 
I
P
 
P
H
 
T
S
 
M
E
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
I
L
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
H
 
R
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
A
S
 
D
-
 
Y
A
 
S
G
 
G
P
 
R
A
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
C
P
|
P
G
 
G
W
 
T
I
x
V
-
 
T
S
 
S
T
|
T
G
|
G
A
x
M
W
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
P
 
L
M
 
L
R
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
S
 
E
L
 
V
S
 
Q
R
 
A
A
 
R
D
 
R
H
 
L
A
 
A
Q
 
K
H
 
Y
P
 
P
V
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
F
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
A
A
 
V
V
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
M
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
D
 
A
H
 
F
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
35% identity, 95% coverage: 15:267/267 of query aligns to 5:246/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
L
 
L
A
x
I
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
N
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
A
G
 
S
I
 
H
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
V
 
M
L
 
V
G
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
V
 
V
M
 
V
I
 
F
G
 
G
D
|
D
L
 
I
D
 
L
V
 
D
A
 
E
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
A
C
x
V
L
 
A
A
 
A
E
 
E
W
 
-
D
 
-
R
 
L
P
 
A
A
 
D
D
 
A
A
 
A
A
 
R
F
 
Y
R
 
V
K
 
H
L
 
L
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
Q
E
 
P
A
 
A
S
 
Q
V
 
W
R
x
T
G
 
A
F
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
T
A
 
A
L
 
V
K
 
T
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
H
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
L
D
 
N
A
 
I
H
 
-
G
 
G
T
 
T
A
 
-
L
 
I
A
 
E
D
 
D
M
 
Y
E
 
A
W
 
L
A
 
T
Q
 
E
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
R
 
I
L
 
L
S
 
D
-
 
V
S
 
N
L
 
L
H
 
T
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
G
S
 
I
K
 
R
H
 
A
A
 
V
L
 
V
P
 
K
A
 
P
L
 
M
G
 
K
A
 
E
D
 
A
K
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
R
 
E
A
 
G
Q
 
L
Q
 
A
S
 
G
E
 
T
P
 
V
H
 
A
S
 
C
E
 
H
A
 
G
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
F
G
 
A
L
 
V
L
 
R
A
 
G
F
 
L
T
 
T
H
 
K
A
 
S
L
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
E
A
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
S
-
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
H
P
|
P
G
|
G
W
x
L
I
x
V
S
x
K
T
|
T
G
 
-
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
|
P
M
|
M
R
x
T
R
 
D
R
 
W
T
 
V
P
 
P
S
 
E
L
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
H
 
I
A
 
F
Q
 
Q
H
 
T
P
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
V
D
 
E
I
 
V
G
 
S
A
 
N
L
 
L
A
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
E
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
I
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
D
 
E
H
 
F
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
T
T
 
V
R
 
A
K
 
G
M
 
L
I
 
A
Y
 
H
V
 
N
D
 
D

6gtuA 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase 14 variant t205 in complex with fragment j6
38% identity, 84% coverage: 35:258/267 of query aligns to 24:245/268 of 6gtuA

query
sites
6gtuA
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
L
 
V
G
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
A
Q
 
R
V
 
V
M
 
V
I
 
I
G
 
C
D
|
D
L
x
K
D
 
D
V
 
E
A
 
S
A
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
C
 
-
L
 
-
A
 
L
E
 
E
W
 
Q
D
 
E
R
 
L
P
 
P
A
 
G
D
 
-
A
 
A
A
 
V
F
 
F
R
 
I
K
 
L
L
 
C
D
|
D
I
 
V
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
A
 
D
S
 
D
V
 
V
R
 
K
G
 
T
F
 
L
I
 
V
A
 
S
A
 
E
A
 
T
L
 
I
K
 
R
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
C
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
H
H
 
H
G
 
P
T
 
P
A
 
P
L
 
Q
A
 
R
D
 
P
M
 
E
E
 
E
W
 
T
-
 
S
A
 
A
Q
 
Q
W
 
G
Q
 
F
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
S
 
L
S
 
E
L
|
L
H
 
N
-
 
L
-
 
L
G
 
G
A
 
T
F
 
Y
L
 
T
C
 
L
S
 
T
K
 
K
H
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
G
 
-
A
 
R
D
 
K
K
 
S
R
 
Q
G
 
G
A
 
N
I
 
V
L
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
L
R
 
V
A
 
G
Q
 
A
Q
 
I
S
 
G
E
 
Q
P
 
A
H
 
Q
S
 
A
E
 
V
A
 
P
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
T
A
 
A
F
 
M
T
 
T
H
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
D
A
 
E
G
 
S
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
I
S
 
S
P
 
P
G
|
G
W
x
N
I
|
I
S
 
W
T
|
T
G
 
P
A
x
L
W
 
W
Q
 
E
A
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
M
P
 
P
M
 
D
R
 
P
R
 
R
R
 
A
T
 
T
P
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
I
R
 
R
A
 
E
D
 
G
H
 
M
A
 
L
Q
 
A
H
 
Q
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
M
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
D
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
E
M
 
-
A
 
A
G
 
N
F
 
F
I
 
C
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
D
 
E
H
 
L
I
 
L
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6emmA 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase 14 variant t205 in complex with salicylic acid
38% identity, 84% coverage: 35:258/267 of query aligns to 24:245/268 of 6emmA

query
sites
6emmA
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
L
 
V
G
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
A
Q
 
R
V
 
V
M
 
V
I
 
I
G
 
C
D
|
D
L
x
K
D
 
D
V
 
E
A
 
S
A
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
C
 
-
L
 
-
A
 
L
E
 
E
W
 
Q
D
 
E
R
 
L
P
 
P
A
 
G
D
 
-
A
 
A
A
 
V
F
 
F
R
 
I
K
 
L
L
 
C
D
|
D
I
 
V
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
A
 
D
S
 
D
V
 
V
R
 
K
G
 
T
F
 
L
I
 
V
A
 
S
A
 
E
A
 
T
L
 
I
K
 
R
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
C
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
H
H
 
H
G
 
P
T
 
P
A
 
P
L
 
Q
A
 
R
D
 
P
M
 
E
E
 
E
W
 
T
-
 
S
A
 
A
Q
 
Q
W
 
G
Q
 
F
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
S
 
L
S
 
E
L
|
L
H
 
N
-
 
L
-
 
L
G
 
G
A
 
T
F
 
Y
L
 
T
C
 
L
S
 
T
K
 
K
H
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
G
 
-
A
 
R
D
 
K
K
 
S
R
 
Q
G
 
G
A
 
N
I
 
V
L
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
L
R
 
V
A
 
G
Q
 
A
Q
 
I
S
 
G
E
 
Q
P
 
A
H
 
Q
S
 
A
E
 
V
A
 
P
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
T
A
 
A
F
 
M
T
 
T
H
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
D
A
 
E
G
 
S
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
I
S
 
S
P
|
P
G
|
G
W
 
N
I
|
I
S
 
W
T
|
T
G
 
P
A
x
L
W
 
W
Q
 
E
A
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
M
P
 
P
M
 
D
R
 
P
R
 
R
R
 
A
T
 
T
P
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
I
R
 
R
A
 
E
D
 
G
H
 
M
A
 
L
Q
 
A
H
 
Q
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
M
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
D
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
E
M
 
-
A
 
A
G
 
N
F
 
F
I
 
C
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
D
 
E
H
 
L
I
 
L
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6qckA 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase 14 variant t205 in complex with fb262 (see paper)
38% identity, 84% coverage: 35:258/267 of query aligns to 24:245/258 of 6qckA

query
sites
6qckA
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
L
 
V
G
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
A
Q
 
R
V
 
V
M
 
V
I
 
I
G
 
C
D
|
D
L
x
K
D
 
D
V
 
E
A
 
S
A
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
C
 
-
L
 
-
A
 
L
E
 
E
W
 
Q
D
 
E
R
 
L
P
 
P
A
 
G
D
 
-
A
 
A
A
 
V
F
 
F
R
 
I
K
 
L
L
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
A
 
D
S
 
D
V
 
V
R
 
K
G
 
T
F
 
L
I
 
V
A
 
S
A
 
E
A
 
T
L
 
I
K
 
R
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
C
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
H
H
|
H
G
 
P
T
 
P
A
x
P
L
 
Q
A
 
R
D
 
P
M
 
E
E
 
E
W
 
T
-
 
S
A
 
A
Q
 
Q
W
 
G
Q
 
F
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
S
 
L
S
 
E
L
|
L
H
 
N
-
 
L
-
 
L
G
 
G
A
 
T
F
 
Y
L
 
T
C
 
L
S
 
T
K
 
K
H
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
G
 
-
A
 
R
D
 
K
K
 
S
R
 
Q
G
 
G
A
 
N
I
 
V
L
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
L
R
 
V
A
 
G
Q
 
A
Q
 
I
S
 
G
E
x
Q
P
 
A
H
 
Q
S
 
A
E
 
V
A
 
P
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
T
A
 
A
F
 
M
T
 
T
H
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
D
A
 
E
G
 
S
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
I
S
 
S
P
|
P
G
|
G
W
x
N
I
|
I
S
x
W
T
|
T
G
x
P
A
x
L
W
|
W
Q
x
E
A
 
E
-
x
L
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
M
P
 
P
M
 
D
R
 
P
R
 
R
R
 
A
T
 
T
P
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
I
R
 
R
A
 
E
D
 
G
H
 
M
A
 
L
Q
 
A
H
 
Q
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
M
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
D
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
E
M
 
-
A
 
A
G
 
N
F
 
F
I
 
C
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
D
 
E
H
 
L
I
 
L
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_057508879.1 NCBI__GCF_001431535.1:WP_057508879.1
MSIVPAVAAWPAAPLAGKVVLVTGGANGIGRGIAQAVLGAGGQVMIGDLDVAAGKACLAE
WDRPADAAFRKLDITAEASVRGFIAAALKRFGRIDGLVNNAGIADAHGTALADMEWAQWQ
RRLSSLHGAFLCSKHALPALGADKRGAILNIASTRAQQSEPHSEAYAAAKGGLLAFTHAL
ALSAGPAVRVNSISPGWISTGAWQAPMRRRTPSLSRADHAQHPVGRVGQPEDIGALAVYL
LSDMAGFITGQDHIVDGGMTRKMIYVD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory