SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_058857680.1 NCBI__GCF_001482365.1:WP_058857680.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

Q8NLB7 Gentisate transporter from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / JCM 1318 / BCRC 11384 / CCUG 27702 / LMG 3730 / NBRC 12168 / NCIMB 10025 / NRRL B-2784 / 534) (see paper)
26% identity, 66% coverage: 29:324/447 of query aligns to 36:318/444 of Q8NLB7

query
sites
Q8NLB7
V
 
I
R
 
S
R
 
G
R
 
R
V
 
R
V
 
L
T
 
A
A
 
A
S
 
V
F
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
W
F
 
F
V
 
F
-
 
V
-
 
I
-
 
F
E
x
D
W
 
G
F
 
Y
D
|
D
Y
 
L
A
 
I
I
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
T
L
 
V
A
 
Q
A
 
S
T
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
-
V
 
-
F
 
-
F
 
-
P
 
K
E
 
E
S
 
W
D
 
N
P
 
L
Q
 
S
T
 
S
A
 
A
L
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
T
F
 
I
A
 
G
L
 
-
F
 
-
A
 
S
I
 
T
S
 
A
F
 
F
F
 
F
V
 
G
R
 
M
P
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
A
F
 
V
V
 
F
W
 
I
G
 
G
H
 
R
L
 
L
G
 
S
D
 
D
K
x
R
L
 
V
G
 
G
R
 
R
R
 
K
T
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
I
L
 
G
S
 
S
I
 
V
L
 
L
I
 
I
M
 
L
S
 
S
V
 
V
S
 
F
T
 
T
F
 
M
C
 
L
I
 
C
A
 
A
L
 
F
I
 
A
P
 
P
G
 
N
Y
 
P
A
 
W
T
 
V
I
 
F
G
 
G
I
 
A
F
 
F
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
R
I
 
F
V
 
I
Q
 
A
G
 
G
F
 
L
S
 
G
A
 
L
A
 
G
G
 
G
E
 
L
Y
 
V
A
 
P
G
 
S
A
 
V
S
 
N
A
 
A
F
 
M
L
 
T
V
 
S
E
 
D
Y
 
L
A
 
V
P
 
P
A
 
R
N
 
K
R
 
T
R
 
M
G
 
S
L
 
A
Y
 
W
A
 
A
A
 
T
V
 
V
V
 
M
P
 
M
A
 
S
S
 
G
T
 
V
A
 
P
T
 
I
G
 
G
L
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
G
S
 
S
L
 
-
F
 
-
V
 
I
A
 
A
G
 
A
L
 
V
T
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
V
D
 
V
D
 
P
Q
 
S
L
 
S
N
 
E
S
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
F
P
 
M
F
 
F
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
L
P
 
I
M
 
P
G
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
L
Y
 
P
I
 
I
R
 
A
T
 
M
K
 
K
L
 
V
E
 
-
D
 
-
T
 
I
P
 
P
A
 
S
F
 
D
Q
 
K
E
 
A
L
 
I
A
 
K
E
 
A
E
 
D
D
 
H
E
 
D
V
 
I
I
 
R
Q
 
E
-
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
E
-
 
P
A
 
A
P
 
G
V
 
F
R
 
K
D
 
D
M
 
L
F
 
L
-
 
V
-
 
D
R
 
R
N
 
Y
H
 
R
W
 
W
G
 
I
A
 
S
L
 
I
L
 
W
R
 
F
A
 
A
V
 
L
G
 
-
A
 
A
V
 
T
L
 
F
L
 
V
N
 
T
A
 
L
V
 
L
G
 
A
F
 
W
Y
 
Y
V
 
G
L
 
L
L
 
G
S
 
T
Y
 
W
M
 
L
P
 
P
T
 
R
Y
 
-
L
 
L
S
 
M
E
 
E
E
 
T
I
 
A
G
 
G
L
 
Y
G
 
E
K
 
F
T
 
G
E
 
H
S
 
A
F
 
L
L
 
M
A
 
F
T
 
T
-
 
L
S
 
A
L
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
G
S
 
A
Y
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
S
I
 
V
F
 
-
L
 
V
T
 
T
G
 
A
L
x
W
A
 
A
S
 
G
D
|
D
R
|
R
F
 
F
G
 
G
R
 
P
K
x
I
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P36035 Carboxylic acid transporter protein homolog from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
23% identity, 70% coverage: 84:395/447 of query aligns to 186:501/616 of P36035

query
sites
P36035
F
 
F
V
 
V
R
 
R
P
 
S
L
 
A
G
 
G
G
 
A
F
 
V
V
 
I
W
 
F
G
 
G
H
 
L
L
 
W
G
 
T
D
 
D
K
 
K
L
 
S
G
 
S
R
 
R
R
 
K
T
 
W
A
 
P
L
 
Y
S
 
I
L
 
T
S
 
C
I
 
L
L
 
F
I
 
L
M
 
F
S
 
V
V
 
I
S
 
A
T
 
Q
F
 
L
C
 
C
I
 
T
A
 
P
L
 
W
I
 
C
P
 
D
G
 
T
Y
 
Y
A
 
E
T
 
K
I
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
L
 
L
V
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
W
V
 
I
Q
 
T
G
 
G
F
 
I
S
 
A
A
 
M
A
 
G
G
 
G
E
 
I
Y
 
Y
A
 
G
G
 
C
A
 
A
S
 
S
A
 
A
F
 
T
L
 
A
V
 
I
E
 
E
Y
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
V
N
 
K
R
 
A
R
 
R
G
 
S
L
 
F
Y
 
L
A
 
S
A
 
G
V
 
L
V
 
F
P
 
F
A
 
S
S
 
A
T
 
Y
A
 
A
T
 
M
G
 
G
L
 
F
L
 
I
F
 
F
G
 
A
S
 
I
L
 
I
F
 
F
V
 
Y
A
 
R
G
 
A
L
 
F
T
 
G
A
 
Y
L
 
F
L
 
R
S
 
D
D
 
D
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
N
 
-
S
 
-
W
 
-
G
 
G
W
 
W
R
 
K
I
 
I
P
 
L
F
 
F
L
 
W
L
 
F
A
 
S
A
 
I
P
 
F
M
 
L
G
 
P
L
 
I
I
 
L
G
 
L
R
 
I
Y
 
F
I
 
W
R
 
R
T
 
L
K
 
L
L
 
W
E
 
P
D
 
E
T
 
T
P
 
K
A
 
Y
F
 
F
Q
 
T
E
 
K
L
 
V
A
 
L
E
 
K
E
 
A
D
 
R
E
 
K
V
 
L
I
 
I
Q
 
L
A
 
S
P
 
D
V
 
A
-
 
V
-
x
K
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
L
-
 
P
R
 
K
D
 
A
M
 
N
F
 
F
R
 
K
N
 
Q
H
 
K
W
 
M
G
 
V
A
 
S
L
 
M
L
 
K
R
 
R
A
 
T
V
 
V
G
 
Q
A
 
K
V
 
Y
L
 
W
L
 
L
N
 
L
A
 
F
V
 
A
G
 
Y
F
 
L
Y
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
N
-
 
Y
-
 
L
-
 
T
-
 
H
-
 
A
-
 
S
-
 
Q
S
 
D
Y
 
L
M
 
L
P
 
P
T
 
T
Y
 
M
L
 
L
S
 
R
E
 
A
E
 
Q
I
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
S
K
 
K
T
 
D
E
 
A
S
 
V
F
 
T
L
 
V
A
 
I
T
 
V
S
 
V
L
 
V
A
 
T
L
 
N
L
 
I
S
 
G
Y
 
A
V
 
I
-
 
C
-
 
G
G
 
G
F
 
M
I
 
I
F
 
F
L
 
-
T
 
-
G
 
G
L
 
Q
A
 
F
S
 
M
D
 
E
R
 
V
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
R
R
 
L
M
 
G
L
 
L
M
 
L
A
 
I
A
 
A
S
 
C
V
 
T
S
 
M
F
 
G
V
 
G
V
 
C
L
 
F
T
 
T
V
 
Y
P
 
P
A
 
A
F
 
F
M
 
M
V
 
L
L
 
R
E
 
S
S
 
E
G
 
K
T
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
G
V
 
F
L
 
M
L
 
L
G
 
Y
A
 
F
M
 
C
L
 
V
T
 
F
L
 
G
N
 
V
D
 
W
G
 
G
T
 
I
L
 
L
P
 
P
S
 
I
F
 
H
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
A
P
 
P
T
 
A
R
 
D
I
 
A
R
 
R
Y
 
A
T
 
L
G
 
V
F
 
A
A
 
G
V
 
L
S
 
S
F
 
Y
N
 
Q
L
 
L
A
 
G
N
 
N

Sites not aligning to the query:

Q5EXK5 3-hydroxybenzoate transporter MhbT from Klebsiella oxytoca (see paper)
24% identity, 82% coverage: 24:390/447 of query aligns to 14:384/452 of Q5EXK5

query
sites
Q5EXK5
A
 
A
P
 
P
D
 
V
P
 
G
S
 
A
V
 
R
R
 
Q
R
 
W
R
 
R
V
 
V
V
 
I
T
 
I
A
 
C
S
 
C
F
 
F
I
 
L
G
 
V
N
 
V
F
 
M
V
 
L
E
 
D
W
 
G
F
 
F
D
 
D
Y
 
T
A
 
A
I
 
A
Y
 
I
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
A
 
A
A
 
P
T
 
D
I
 
I
A
 
-
V
 
-
V
 
-
F
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
R
S
 
S
D
 
H
P
 
W
Q
 
Q
T
 
L
A
 
T
L
 
A
L
 
G
A
 
D
T
 
L
F
 
A
A
 
P
L
 
L
F
 
F
A
 
G
I
 
A
S
 
G
F
 
L
F
 
L
V
 
G
R
 
L
P
 
T
L
 
A
G
 
G
G
 
A
F
 
L
V
 
L
W
 
C
G
 
G
H
 
P
L
 
L
G
 
S
D
|
D
K
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
R
 
K
T
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
I
 
-
M
 
-
S
 
R
V
 
V
S
 
I
T
 
E
F
 
F
C
 
C
I
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
F
P
 
G
G
 
L
Y
 
F
A
 
S
T
 
L
I
 
L
G
 
S
I
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
P
V
 
D
L
 
L
L
 
Q
L
 
M
V
 
L
V
 
V
-
 
F
-
 
L
R
 
R
I
 
F
V
 
L
Q
 
T
G
 
G
F
 
L
S
 
G
A
 
L
A
 
G
G
 
G
E
 
A
Y
 
M
A
 
P
G
 
N
A
 
T
S
 
I
A
 
T
F
 
M
L
 
T
V
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
L
P
 
P
A
 
A
N
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
L
A
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
M
P
 
F
A
 
C
S
 
G
T
 
F
A
 
T
T
 
L
G
 
G
L
 
S
L
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
G
L
 
V
F
 
V
V
 
S
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
T
 
V
A
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
G
D
 
W
D
 
H
Q
 
G
L
 
I
N
 
L
S
 
V
W
 
L
G
 
G
W
 
G
R
 
V
I
 
L
P
 
P
F
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
R
-
 
W
-
 
Q
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
P
 
P
M
 
Q
G
 
A
L
 
T
I
 
I
G
 
A
R
 
R
Y
 
T
I
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
T
R
 
G
T
 
E
K
 
R
L
 
Y
E
 
N
D
 
D
T
 
T
P
 
H
A
 
F
F
 
W
Q
 
-
E
 
-
L
 
L
A
 
D
E
 
E
E
 
P
D
 
A
E
 
A
V
 
G
I
 
A
Q
 
K
A
 
G
P
 
S
V
 
I
R
 
S
D
 
Q
M
 
L
F
 
F
R
 
A
N
 
G
H
 
R
W
 
Q
G
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
T
R
 
L
A
 
M
V
 
L
G
 
W
A
 
V
V
 
V
-
 
F
L
 
F
L
 
M
N
 
S
A
 
L
V
 
L
G
 
I
F
 
I
Y
 
Y
V
 
L
L
 
L
L
 
S
S
 
S
Y
 
W
M
 
M
P
 
P
T
 
T
Y
 
L
L
 
L
S
 
N
E
 
H
E
 
R
I
 
G
G
 
I
L
 
D
G
 
L
K
 
Q
T
 
H
E
 
A
S
 
S
F
 
W
L
 
V
A
 
T
T
 
A
S
 
A
L
 
F
A
 
Q
L
 
I
L
 
G
S
 
G
Y
 
T
V
 
F
G
 
G
F
 
A
I
 
L
F
 
L
L
 
L
T
 
-
G
 
G
L
x
V
A
 
L
S
 
M
D
|
D
R
 
R
F
 
F
G
 
N
R
 
P
K
 
Y
R
 
R
M
 
V
L
 
L
M
 
-
A
 
A
A
 
L
S
 
S
V
 
Y
S
 
G
F
 
L
V
 
G
V
 
A
L
 
V
T
 
C
V
 
I
P
 
V
A
 
M
F
 
I
M
 
G
V
 
L
L
 
S
E
 
E
S
 
N
G
 
G
T
 
L
F
 
W
L
 
L
A
 
M
V
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
Q
 
-
V
 
F
L
 
G
L
 
T
G
 
G
A
 
I
M
 
G
L
 
I
T
 
S
L
 
G
N
 
S
D
 
Q
G
 
V
T
 
G
L
 
L
P
 
N
S
 
A
F
 
L
L
 
T
A
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
T
 
T
R
 
Q
I
 
S
R
 
R
Y
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
V
A
 
S
V
 
W
S
 
S

8fvzA Pipt y150a
22% identity, 93% coverage: 32:447/447 of query aligns to 4:429/433 of 8fvzA

query
sites
8fvzA
R
 
K
V
 
L
V
 
V
T
 
L
A
 
L
S
 
A
F
 
G
I
 
V
G
 
G
N
 
F
F
 
F
V
 
L
E
 
D
W
 
A
F
 
Y
D
 
D
Y
 
L
A
 
F
I
 
I
Y
 
I
G
 
N
Y
 
Q
L
 
V
A
 
A
A
 
P
T
 
M
I
 
L
A
 
A
V
 
Q
V
 
V
F
 
Y
F
 
F
P
 
P
E
 
K
S
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
A
D
 
Q
P
 
R
Q
 
Q
T
 
D
A
 
L
L
 
M
L
 
K
A
 
A
T
 
A
F
 
A
A
 
N
L
 
I
F
 
G
A
 
C
I
 
V
S
 
-
F
 
-
F
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
V
G
 
G
G
 
Q
F
 
V
V
 
M
W
 
F
G
 
G
H
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
K
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
R
R
 
K
T
 
F
A
 
V
L
 
Y
S
 
G
L
 
K
S
 
E
I
 
L
L
 
I
I
 
L
M
 
I
S
 
I
V
 
V
S
 
A
T
 
T
F
 
I
C
 
F
I
 
Q
A
 
M
L
 
S
I
 
A
P
 
P
G
 
S
Y
 
H
A
 
W
T
 
D
I
 
-
G
 
G
I
 
N
F
 
R
A
 
V
P
 
L
V
 
T
L
 
W
L
 
I
L
 
T
V
 
I
V
 
C
R
 
R
I
 
V
V
 
F
Q
 
L
G
 
G
F
 
I
S
 
G
A
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
D
Y
 
A
A
 
P
G
 
M
A
 
S
S
 
A
A
 
T
F
 
V
L
 
V
V
 
S
E
 
D
Y
 
R
A
 
A
P
 
N
A
 
I
N
 
H
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
A
 
L
A
 
C
V
 
F
V
 
I
P
x
F
A
 
A
S
 
N
T
 
Q
A
 
G
T
 
W
G
 
G
L
 
S
L
 
F
F
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
L
F
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
T
V
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
F
T
 
K
A
 
H
L
 
R
L
 
L
S
 
K
D
 
S
D
 
G
Q
 
H
L
 
T
N
 
H
S
 
D
-
 
V
-
 
D
W
 
K
G
 
A
W
 
W
R
 
R
I
 
I
P
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
-
Y
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
L
E
 
S
D
 
L
T
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
F
Q
 
G
E
 
T
L
 
L
A
 
Y
E
 
Q
E
 
R
D
 
L
E
 
T
V
 
G
I
 
V
Q
 
I
A
 
A
P
 
S
V
 
K
R
 
K
D
 
A
M
 
H
F
 
W
R
 
Q
-
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
A
-
 
Y
-
 
F
-
 
S
-
 
T
-
 
W
N
 
N
H
 
H
W
 
F
G
 
R
A
 
N
L
 
L
L
 
L
R
 
G
A
 
S
V
 
M
G
 
L
A
 
G
V
x
W
L
 
F
L
 
L
N
 
V
A
x
D
V
 
I
G
 
A
F
 
F
Y
|
Y
V
 
G
L
 
I
L
 
N
S
 
L
Y
 
N
M
 
Q
P
 
S
T
 
V
Y
 
V
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
E
 
I
I
 
G
G
 
F
L
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
G
S
 
D
F
 
V
-
 
Y
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
F
-
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
S
 
G
L
 
N
A
 
I
L
 
I
L
 
V
S
 
T
Y
 
A
V
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
Y
F
 
Y
L
 
F
T
 
T
G
 
L
L
 
F
A
 
L
S
 
I
D
 
D
R
 
I
F
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
R
 
K
M
 
L
L
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
Q
F
 
F
M
 
M
-
 
G
V
 
F
L
 
I
E
 
M
S
 
S
G
 
G
T
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
G
Q
 
E
V
 
I
-
 
D
-
 
H
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
C
M
 
F
L
 
T
T
 
F
L
 
M
N
 
Q
-
 
F
-
 
F
-
 
F
-
 
N
-
 
F
D
 
G
G
 
A
T
x
N
L
 
T
P
 
T
S
 
T
F
 
F
L
 
I
-
 
V
-
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
T
 
T
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Y
 
A
T
 
S
G
 
A
F
 
H
A
 
G
V
 
I
S
 
S
F
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
A
V
 
A
F
 
A
G
 
G
G
 
K
T
 
C
A
 
G
P
 
A
F
 
I
M
 
L
A
 
S
T
 
S
L
 
L
L
 
V
I
 
F
S
 
N
A
 
Q
F
 
L
A
 
K
T
 
A
N
 
K
L
 
I
A
 
G
P
 
T
A
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
L
W
 
W
Y
 
I
L
 
F
M
 
F
A
 
S
A
 
T
A
 
C
A
 
I
V
 
L
S
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
S
V
 
T
A
 
F
L
 
L
S
 
I
R
 
D
E
 
E
T
 
T
G
 
M
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
D
-
 
E
K
 
K
P
 
D
L
 
L
E
 
E
H
 
E

8bvtA Cryo-em structure of rat slc22a6 bound to probenecid (see paper)
35% identity, 18% coverage: 88:168/447 of query aligns to 138:210/508 of 8bvtA

query
sites
8bvtA
L
 
L
G
 
G
G
 
A
F
 
M
V
 
V
W
 
F
G
 
G
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
K
A
 
V
L
 
L
S
 
I
L
 
L
S
 
N
I
 
Y
L
 
L
I
 
Q
M
 
T
S
 
A
V
 
V
S
 
S
T
 
G
F
 
T
C
 
C
I
 
A
A
 
A
L
 
Y
I
 
A
P
 
P
G
 
N
Y
 
Y
A
 
T
T
 
V
I
 
Y
G
 
C
I
 
V
F
 
F
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
R
I
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
F
 
M
S
 
S
A
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
I
Y
 
A
A
 
I
G
 
N
A
 
C
S
x
M
A
 
T
F
 
L
L
 
N
V
 
V
E
 
E
Y
 
W
A
 
M
P
 
P
A
 
I
N
 
H
R
 
T
R
 
R

Sites not aligning to the query:

8bw7A Cryo-em structure of rat slc22a6 bound to alpha-ketoglutaric acid (see paper)
35% identity, 18% coverage: 88:168/447 of query aligns to 129:201/497 of 8bw7A

query
sites
8bw7A
L
 
L
G
 
G
G
 
A
F
 
M
V
 
V
W
 
F
G
 
G
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
K
A
 
V
L
 
L
S
 
I
L
 
L
S
 
N
I
 
Y
L
 
L
I
 
Q
M
 
T
S
 
A
V
 
V
S
 
S
T
 
G
F
 
T
C
 
C
I
 
A
A
 
A
L
 
Y
I
 
A
P
 
P
G
 
N
Y
 
Y
A
 
T
T
 
V
I
 
Y
G
 
C
I
 
V
F
 
F
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
R
I
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
F
 
M
S
 
S
A
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
I
Y
 
A
A
 
I
G
 
N
A
 
C
S
 
M
A
 
T
F
 
L
L
 
N
V
 
V
E
 
E
Y
 
W
A
 
M
P
 
P
A
 
I
N
 
H
R
 
T
R
 
R

Sites not aligning to the query:

8bvsA Cryo-em structure of rat slc22a6 bound to tenofovir (see paper)
35% identity, 18% coverage: 88:168/447 of query aligns to 129:201/502 of 8bvsA

query
sites
8bvsA
L
 
L
G
 
G
G
 
A
F
 
M
V
 
V
W
 
F
G
 
G
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
K
A
 
V
L
 
L
S
 
I
L
 
L
S
 
N
I
 
Y
L
 
L
I
 
Q
M
 
T
S
 
A
V
 
V
S
 
S
T
 
G
F
 
T
C
 
C
I
 
A
A
 
A
L
 
Y
I
 
A
P
 
P
G
 
N
Y
 
Y
A
 
T
T
 
V
I
 
Y
G
 
C
I
 
V
F
 
F
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
R
I
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
F
 
M
S
 
S
A
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
I
Y
 
A
A
 
I
G
 
N
A
 
C
S
 
M
A
 
T
F
 
L
L
 
N
V
 
V
E
 
E
Y
 
W
A
 
M
P
 
P
A
 
I
N
 
H
R
 
T
R
 
R

Sites not aligning to the query:

A0A0H2VG78 Glucose transporter GlcP; Glucose/H(+) symporter from Staphylococcus epidermidis (strain ATCC 12228 / FDA PCI 1200) (see paper)
22% identity, 79% coverage: 94:447/447 of query aligns to 63:432/446 of A0A0H2VG78

query
sites
A0A0H2VG78
G
 
G
H
 
P
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
R
A
 
L
L
 
V
S
 
M
L
 
L
S
 
I
I
 
A
L
 
I
I
 
V
M
 
F
S
 
I
V
 
I
S
 
G
T
 
A
F
 
L
C
 
I
I
 
L
A
 
A
L
 
A
I
 
S
P
 
T
G
 
N
Y
 
L
A
 
A
T
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
L
L
 
L
L
 
I
V
 
I
V
 
G
R
|
R
I
 
L
V
 
I
Q
x
I
G
 
G
F
 
L
S
 
A
A
 
V
A
 
G
G
 
G
E
 
S
Y
 
M
A
 
S
G
 
T
A
 
V
S
 
P
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
V
 
S
E
|
E
Y
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
T
N
 
E
R
 
Y
R
 
R
G
 
G
L
 
S
Y
 
L
A
 
G
A
 
S
V
 
L
V
 
N
P
x
Q
A
 
L
S
 
M
T
 
I
A
 
T
T
 
I
G
 
G
L
 
I
L
 
L
F
 
A
G
 
A
S
 
Y
L
 
L
F
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
V
T
 
N
A
 
Y
L
 
A
L
 
F
S
 
A
D
 
D
D
 
I
Q
 
E
L
 
-
N
 
-
S
 
-
W
 
-
G
 
G
W
 
W
R
 
R
-
 
W
-
 
M
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
I
-
 
L
-
 
L
-
 
V
-
 
G
I
 
I
P
 
Y
F
 
F
L
 
M
L
 
P
A
 
E
A
 
S
P
 
P
M
 
R
G
 
W
L
 
L
I
 
L
G
 
E
-
 
N
-
 
R
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
R
R
 
Q
Y
 
V
I
 
M
R
 
K
T
 
I
K
 
T
L
 
Y
E
 
D
D
 
D
T
 
S
P
 
E
A
 
I
F
 
D
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
E
E
 
M
D
 
K
E
 
E
V
 
I
-
 
N
-
 
A
I
 
I
Q
 
S
A
 
E
P
 
S
V
 
T
R
 
W
D
 
T
M
 
V
F
 
I
R
 
K
N
 
S
H
 
P
W
 
W
G
 
L
A
 
G
L
 
R
L
 
I
R
 
L
A
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
C
V
 
I
L
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
F
-
x
Q
-
x
Q
-
 
F
-
 
I
-
 
G
L
 
I
N
|
N
A
 
A
V
 
V
G
 
I
F
 
F
Y
 
Y
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
M
 
-
P
 
S
T
 
S
Y
 
S
L
 
I
S
 
F
E
 
A
E
 
K
I
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
K
 
E
T
 
A
E
 
A
S
 
S
F
 
I
L
 
L
A
 
G
T
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
G
S
 
T
L
 
I
A
 
N
L
 
V
L
 
L
S
 
V
Y
 
T
V
 
I
G
 
V
F
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
V
T
 
V
G
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
D
R
 
K
F
 
I
G
 
D
R
 
R
K
 
K
R
 
K
M
 
L
L
 
L
M
 
V
A
 
G
A
 
G
S
 
N
V
 
I
S
 
G
F
 
M
V
 
I
V
 
A
-
 
S
L
 
L
T
 
L
V
 
I
P
 
M
A
 
A
F
 
I
M
 
L
V
 
I
L
 
W
E
 
T
S
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
A
L
 
S
A
 
S
V
 
A
L
 
W
A
 
I
V
 
I
Q
 
I
V
 
V
L
 
C
L
 
L
G
 
S
A
 
L
M
 
F
L
 
I
T
 
V
-
 
F
-
 
F
-
 
G
L
 
I
N
 
S
D
 
W
G
 
G
-
 
P
T
 
V
L
 
L
P
x
W
S
 
V
F
 
M
L
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
T
 
M
R
 
R
I
 
A
R
 
R
Y
 
G
T
 
A
G
 
A
F
 
T
A
 
G
V
 
I
S
 
S
F
 
A
N
 
L
L
 
V
A
 
L
N
 
N
A
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
M
 
I
A
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
L
F
 
F
-
 
F
-
 
P
-
 
I
-
 
L
A
 
S
T
 
D
N
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
T
A
 
E
W
 
W
Y
 
V
L
 
F
M
 
L
A
 
I
A
 
F
A
 
A
A
 
F
V
 
I
S
 
G
F
 
V
V
 
L
A
 
A
-
 
M
-
 
I
-
 
F
-
 
V
V
 
I
A
 
K
L
 
F
S
 
L
R
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
R
G
 
G
K
 
R
P
 
S
L
 
L
E
 
E
H
 
E

Sites not aligning to the query:

8uo9A Structure of synaptic vesicle protein 2a in complex with a nanobody (see paper)
30% identity, 18% coverage: 88:169/447 of query aligns to 65:138/555 of 8uo9A

query
sites
8uo9A
L
 
V
G
 
G
G
 
A
F
 
F
V
 
L
W
 
W
G
 
G
H
 
G
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
A
 
C
L
 
L
S
 
L
L
 
I
S
 
S
I
 
L
L
 
S
I
 
V
M
 
N
S
 
S
V
 
V
S
 
F
T
 
A
F
 
F
C
 
F
I
 
S
A
 
S
L
 
F
I
 
V
P
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
T
 
T
I
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
L
 
L
V
 
F
V
 
C
R
 
R
I
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
F
 
V
S
 
G
A
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
S
Y
 
I
A
 
P
G
 
I
A
 
V
S
 
F
A
 
S
F
 
Y
L
 
F
V
 
S
E
 
E
Y
 
F
A
 
L
P
 
A
A
 
Q
N
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P25297 Inorganic phosphate transporter PHO84 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 6 papers)
26% identity, 33% coverage: 88:235/447 of query aligns to 117:277/587 of P25297

query
sites
P25297
L
 
I
G
 
G
G
 
Q
F
 
F
V
 
G
W
 
F
G
 
G
H
 
T
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
I
L
 
V
G
 
G
R
 
R
R
 
K
T
 
R
A
 
I
L
 
Y
S
 
G
L
 
M
S
 
E
I
 
L
L
 
I
I
 
I
M
 
M
S
 
I
V
 
V
S
x
C
T
 
T
F
 
I
C
 
L
I
 
Q
A
 
T
L
 
T
I
 
V
P
 
A
G
 
H
Y
 
S
A
 
P
T
 
A
I
 
I
G
 
N
I
x
F
F
 
V
A
 
A
P
 
-
V
 
-
L
 
V
L
 
L
L
 
T
V
 
F
V
 
Y
R
|
R
I
 
I
V
 
V
Q
 
M
G
|
G
F
 
I
S
x
G
A
 
I
A
x
G
G
 
G
E
x
D
Y
|
Y
A
 
P
G
 
L
A
 
S
S
 
S
A
 
I
F
 
I
L
 
T
V
 
S
E
 
E
Y
 
F
A
 
A
P
 
T
A
 
T
N
 
K
R
 
W
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
I
A
 
M
A
 
G
V
 
A
V
 
V
P
 
F
A
 
A
S
 
N
T
 
Q
A
 
A
T
 
W
G
 
G
L
 
Q
L
 
I
F
 
S
G
 
G
S
 
G
L
 
I
F
 
I
V
 
A
A
 
L
G
 
I
L
 
L
T
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
Y
S
 
K
D
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
x
C
-
 
D
-
 
A
-
 
R
-
x
C
-
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
x
C
D
 
D
Q
 
Q
L
 
M
N
 
-
S
 
-
W
 
-
G
 
-
W
 
W
R
 
R
I
 
I
P
 
L
F
 
I
L
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
T
P
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
A
G
x
C
R
 
L
Y
 
Y
I
 
F
R
 
R
T
 
L
K
 
T
L
 
I
E
 
P
D
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
R
F
 
Y
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

8k77A Synaptic vesicle glycoprotein 2A (see paper)
30% identity, 18% coverage: 88:169/447 of query aligns to 81:154/592 of 8k77A

query
sites
8k77A
L
 
V
G
 
G
G
 
A
F
 
F
V
 
L
W
 
W
G
 
G
H
 
G
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
A
 
C
L
 
L
S
 
L
L
 
I
S
 
S
I
 
L
L
 
S
I
 
V
M
 
N
S
 
S
V
 
V
S
 
F
T
 
A
F
 
F
C
 
F
I
 
S
A
 
S
L
 
F
I
 
V
P
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
T
 
T
I
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
L
 
L
V
 
F
V
 
C
R
 
R
I
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
F
 
V
S
 
G
A
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
S
Y
 
I
A
 
P
G
 
I
A
 
V
S
 
F
A
 
S
F
 
Y
L
 
F
V
 
S
E
 
E
Y
 
F
A
 
L
P
 
A
A
 
Q
N
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8jlhA Cryo-em structure of sv2a dimer in complex with bont/a2 hc and levetiracetam (see paper)
30% identity, 18% coverage: 88:169/447 of query aligns to 81:154/592 of 8jlhA

query
sites
8jlhA
L
 
V
G
 
G
G
 
A
F
 
F
V
 
L
W
 
W
G
 
G
H
 
G
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
A
 
C
L
 
L
S
 
L
L
 
I
S
 
S
I
 
L
L
 
S
I
 
V
M
 
N
S
 
S
V
 
V
S
 
F
T
 
A
F
 
F
C
 
F
I
 
S
A
 
S
L
 
F
I
 
V
P
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
T
 
T
I
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
L
 
L
V
 
F
V
 
C
R
 
R
I
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
F
 
V
S
 
G
A
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
S
Y
 
I
A
 
P
G
 
I
A
 
V
S
 
F
A
 
S
F
 
Y
L
 
F
V
 
S
E
 
E
Y
 
F
A
 
L
P
 
A
A
 
Q
N
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8jlcA Synaptic vesicle glycoprotein 2A (see paper)
30% identity, 18% coverage: 88:169/447 of query aligns to 81:154/592 of 8jlcA

query
sites
8jlcA
L
 
V
G
 
G
G
 
A
F
 
F
V
 
L
W
 
W
G
 
G
H
 
G
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
A
 
C
L
 
L
S
 
L
L
 
I
S
 
S
I
 
L
L
 
S
I
 
V
M
 
N
S
 
S
V
 
V
S
 
F
T
 
A
F
 
F
C
 
F
I
 
S
A
 
S
L
 
F
I
 
V
P
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
T
 
T
I
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
L
 
L
V
 
F
V
 
C
R
 
R
I
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
F
 
V
S
 
G
A
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
S
Y
x
I
A
 
P
G
 
I
A
 
V
S
 
F
A
 
S
F
 
Y
L
 
F
V
 
S
E
 
E
Y
 
F
A
 
L
P
 
A
A
 
Q
N
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q02563 Synaptic vesicle glycoprotein 2A; Synaptic vesicle protein 2; Synaptic vesicle protein 2A from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
30% identity, 19% coverage: 88:171/447 of query aligns to 217:292/742 of Q02563

query
sites
Q02563
L
 
V
G
 
G
G
 
A
F
 
F
V
 
L
W
 
W
G
 
G
H
 
G
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
A
 
C
L
 
L
S
 
L
L
 
I
S
 
S
I
 
L
L
 
S
I
 
V
M
 
N
S
 
S
V
 
V
S
 
F
T
 
A
F
 
F
C
 
F
I
 
S
A
 
S
L
 
F
I
 
V
P
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
T
 
T
I
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
F
L
 
L
V
 
F
V
 
C
R
 
R
I
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
F
 
V
S
 
G
A
 
I
A
 
G
G
 
G
E
 
S
Y
 
I
A
 
P
G
 
I
A
 
V
S
 
F
A
 
S
F
 
Y
L
 
F
V
 
S
E
 
E
Y
 
F
A
 
L
P
 
A
A
 
Q
N
 
E
R
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
E
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

Q8VC69 Solute carrier family 22 member 6; Kidney-specific transport protein; Novel kidney transcript; mNKT; Organic anion transporter 1; mOAT1; Renal organic anion transporter 1; mROAT1 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
33% identity, 18% coverage: 88:168/447 of query aligns to 141:213/545 of Q8VC69

query
sites
Q8VC69
L
 
L
G
 
G
G
 
A
F
 
M
V
 
M
W
 
F
G
 
G
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
K
A
 
V
L
 
L
S
 
I
L
 
L
S
 
N
I
 
Y
L
 
L
I
 
Q
M
 
T
S
 
A
V
 
V
S
 
S
T
 
G
F
 
T
C
 
C
I
 
A
A
 
A
L
 
Y
I
 
A
P
 
P
G
 
N
Y
 
Y
A
 
T
T
 
V
I
 
Y
G
x
C
I
 
I
F
 
F
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
R
I
 
L
V
 
L
Q
 
S
G
 
G
F
 
M
S
 
S
A
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
I
Y
 
A
A
 
I
G
 
N
A
 
C
S
 
M
A
 
T
F
 
L
L
 
N
V
 
M
E
 
E
Y
 
W
A
 
M
P
 
P
A
 
I
N
 
H
R
 
T
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_058857680.1 NCBI__GCF_001482365.1:WP_058857680.1
MSHSSDAAAAAAQAVPASPPAPGAPDPSVRRRVVTASFIGNFVEWFDYAIYGYLAATIAV
VFFPESDPQTALLATFALFAISFFVRPLGGFVWGHLGDKLGRRTALSLSILIMSVSTFCI
ALIPGYATIGIFAPVLLLVVRIVQGFSAAGEYAGASAFLVEYAPANRRGLYAAVVPASTA
TGLLFGSLFVAGLTALLSDDQLNSWGWRIPFLLAAPMGLIGRYIRTKLEDTPAFQELAEE
DEVIQAPVRDMFRNHWGALLRAVGAVLLNAVGFYVLLSYMPTYLSEEIGLGKTESFLATS
LALLSYVGFIFLTGLASDRFGRKRMLMAASVSFVVLTVPAFMVLESGTFLAVLAVQVLLG
AMLTLNDGTLPSFLAELFPTRIRYTGFAVSFNLANAVFGGTAPFMATLLISAFATNLAPA
WYLMAAAAVSFVAVALSRETGGKPLEH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory