SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_058929002.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058929002.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3wyeA Crystal structure of chimeric engineered (2s,3s)-butanediol dehydrogenase complexed with NAD+
43% identity, 96% coverage: 11:261/262 of query aligns to 5:254/255 of 3wyeA

query
sites
3wyeA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
R
 
K
V
 
A
I
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
R
L
 
L
A
 
V
K
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
N
 
A
I
 
V
T
 
A
L
 
I
F
 
A
D
|
D
L
x
Y
N
 
N
F
 
D
A
 
A
A
 
T
A
 
A
N
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
N
L
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
K
G
x
V
N
x
D
V
|
V
V
 
S
D
 
D
R
 
R
A
 
D
D
 
Q
V
 
V
A
 
F
M
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
T
 
Q
S
 
A
V
 
R
D
 
K
S
 
T
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
L
 
F
D
 
D
C
 
V
M
 
I
F
 
V
A
 
N
I
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
I
 
A
K
 
Q
P
 
I
T
 
K
H
 
P
F
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
D
F
 
L
R
 
K
S
 
Q
T
 
I
L
 
Y
D
 
S
V
 
V
N
 
N
G
 
V
L
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
I
 
F
C
 
G
Q
 
I
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
K
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
A
S
 
A
S
|
S
I
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
N
 
I
F
 
L
A
 
S
S
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
S
 
T
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
R
A
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
P
H
 
L
K
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
G
F
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
T
|
T
P
 
G
L
x
M
W
|
W
K
 
E
K
 
Q
L
 
I
D
 
D
L
 
A
D
 
E
L
|
L
M
 
S
D
 
K
M
 
I
G
 
-
D
 
-
T
 
N
S
 
G
R
 
K
P
 
P
-
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
N
F
 
F
E
 
K
S
 
E
F
 
Y
S
 
S
G
 
S
A
 
S
N
 
I
L
 
A
I
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
P
G
 
S
V
 
V
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
L
A
 
V
L
 
S
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
I
 
L
M
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
V
L
 
F

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
41% identity, 96% coverage: 11:261/262 of query aligns to 6:255/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
R
 
K
V
 
A
I
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
R
L
 
L
A
 
V
K
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
N
 
A
I
 
V
T
 
A
L
 
I
F
 
A
D
|
D
L
x
Y
N
 
N
F
 
D
A
 
A
A
 
T
A
 
A
N
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
N
L
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
K
G
x
V
N
x
D
V
|
V
V
 
S
D
 
D
R
|
R
A
x
D
D
 
Q
V
 
V
A
x
F
M
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
T
 
Q
S
 
A
V
 
R
D
 
K
S
 
T
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
L
 
F
D
 
D
C
 
V
M
 
I
F
 
V
A
 
N
I
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
V
I
 
A
K
 
P
P
 
S
T
 
T
H
 
P
F
 
I
L
 
E
E
 
S
T
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
E
N
 
I
F
 
V
R
 
D
S
 
K
T
 
V
L
 
Y
D
 
N
V
x
I
N
 
N
G
 
V
L
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
I
I
 
W
C
 
G
Q
 
I
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
V
K
x
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
K
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
A
S
 
C
S
|
S
I
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
Q
 
V
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
N
 
E
F
 
L
A
 
A
S
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
R
A
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
P
H
 
L
K
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
G
F
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
 
P
L
x
M
W
 
W
K
 
A
K
 
E
L
 
I
D
 
D
L
 
R
D
 
Q
L
x
V
M
 
S
D
 
E
M
 
A
G
 
-
D
 
-
T
 
A
S
 
G
R
 
K
P
 
P
-
 
L
G
 
G
E
 
Y
A
 
G
F
 
T
E
 
A
S
 
E
F
 
F
S
 
A
G
 
K
A
 
R
N
 
I
L
 
T
I
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
L
G
 
S
V
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
A
G
 
A
T
 
C
A
 
V
L
 
S
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
I
 
L
M
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
V
L
 
F

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
40% identity, 96% coverage: 11:261/262 of query aligns to 6:255/256 of Q48436

query
sites
Q48436
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
S
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
|
G
R
x
K
V
x
A
I
|
I
A
|
A
I
x
L
A
x
R
L
|
L
A
x
V
K
|
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
N
x
A
I
x
V
T
x
A
L
x
I
F
x
A
D
|
D
L
 
Y
N
 
N
F
 
D
A
 
A
A
 
T
A
 
A
N
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
N
L
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
R
A
 
A
V
 
M
A
 
A
A
 
V
S
 
K
G
 
V
N
x
D
V
 
V
V
 
S
D
 
D
R
 
R
A
 
D
D
 
Q
V
 
V
A
 
F
M
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
T
 
Q
S
 
A
V
 
R
D
 
K
S
 
T
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
L
 
F
D
 
D
C
 
V
M
 
I
F
 
V
A
 
N
I
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
A
K
 
P
P
 
S
T
 
T
H
 
P
F
 
I
L
 
E
E
 
S
T
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
E
N
 
I
F
 
V
R
 
D
S
 
K
T
 
V
L
 
Y
D
 
N
V
 
I
N
 
N
G
 
V
L
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
I
I
 
W
C
 
G
Q
 
I
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
K
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
A
S
 
C
S
 
S
I
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
Q
 
V
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
N
 
E
F
 
L
A
 
A
S
 
V
Y
 
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
R
A
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
P
H
 
L
K
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
G
F
 
Y
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
M
W
 
W
K
 
A
K
 
E
L
 
I
D
 
D
L
 
R
D
 
Q
L
 
V
M
 
S
D
 
E
M
 
A
G
 
-
D
 
-
T
 
A
S
 
G
R
 
K
P
 
P
-
 
L
G
 
G
E
 
Y
A
 
G
F
 
T
E
 
A
S
 
E
F
 
F
S
 
A
G
 
K
A
 
R
N
 
I
L
 
T
I
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
L
G
 
S
V
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
A
G
 
A
T
 
C
A
 
V
L
 
S
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
I
 
L
M
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
V
L
 
F

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
40% identity, 97% coverage: 4:258/262 of query aligns to 3:253/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
R
 
R
V
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
S
I
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
S
 
R
G
|
G
M
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
A
I
 
F
A
 
A
I
 
E
A
 
A
L
 
Y
A
 
V
K
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
T
I
 
V
T
 
A
L
 
I
F
 
A
D
 
D
L
 
I
N
 
D
F
 
I
A
 
E
A
 
R
A
 
A
N
 
R
A
 
Q
V
 
A
K
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
I
T
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
P
S
 
A
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
A
 
V
S
 
Q
G
 
M
N
 
D
V
 
V
V
 
T
D
 
R
R
 
Q
A
 
D
D
 
S
V
 
I
A
 
D
M
 
A
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
T
 
A
S
 
T
V
 
V
D
 
E
S
 
H
F
 
A
G
 
G
Q
 
G
L
 
L
D
 
D
C
 
I
M
 
L
F
 
V
A
 
N
I
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
L
I
 
F
K
 
D
P
 
L
T
 
A
H
 
P
F
 
I
L
 
V
E
 
E
T
 
I
T
 
T
E
 
R
E
 
E
N
 
S
F
 
Y
R
 
E
S
 
K
T
 
L
L
 
F
D
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
V
L
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
F
C
 
T
Q
 
L
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
R
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
K
 
A
Q
 
Q
G
 
G
K
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
M
S
 
A
S
|
S
I
x
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
Q
 
R
G
 
G
Y
x
E
P
 
A
N
 
L
F
 
V
A
 
A
S
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
T
K
 
K
F
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
I
A
 
S
L
 
L
N
 
T
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
G
H
 
L
A
 
D
L
 
L
A
 
I
K
 
K
H
 
H
K
 
R
I
 
I
T
 
N
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
G
P
 
E
L
x
H
W
|
W
K
 
D
K
 
G
L
 
V
D
 
D
L
 
A
D
 
L
L
x
F
M
 
A
D
 
R
M
 
Y
G
 
E
D
 
N
T
 
R
S
 
P
R
 
R
P
 
-
G
 
G
E
 
E
A
 
K
F
 
K
E
 
R
S
 
L
F
 
V
S
 
G
G
 
E
A
 
A
N
 
V
L
 
P
I
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
M
G
 
G
V
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
L
V
 
T
G
 
G
T
 
M
A
 
A
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
A
D
 
E
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
I
T
 
V
G
 
S
Q
 
Q
T
 
T
I
 
Y
M
 
N
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9ZNN8 L-2,3-butanediol dehydrogenase; L-BDH; (S,S)-butanediol dehydrogenase; Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; EC 1.1.1.76; EC 1.1.1.304 from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium saccharolyticum) (see paper)
37% identity, 95% coverage: 11:260/262 of query aligns to 6:256/258 of Q9ZNN8

query
sites
Q9ZNN8
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
A
S
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
R
 
R
V
 
G
I
 
I
A
 
S
I
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
N
 
D
I
 
I
T
 
A
L
 
V
F
 
A
D
|
D
L
 
L
-
 
P
-
 
Q
-
x
Q
N
 
E
F
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
T
V
 
I
K
 
K
D
 
-
E
 
L
I
 
I
T
 
E
L
 
A
A
 
A
G
 
D
G
 
Q
S
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
F
A
 
V
S
 
G
G
 
L
N
x
D
V
|
V
V
 
T
D
 
D
R
 
K
A
 
A
D
 
N
V
 
F
A
 
D
M
 
S
A
 
A
V
 
I
Q
 
D
T
 
E
S
 
A
V
 
A
D
 
E
S
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
L
 
F
D
 
D
C
 
V
M
 
L
F
 
V
A
 
N
I
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
A
K
 
Q
P
 
I
T
 
K
H
 
P
F
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
D
F
 
L
R
 
K
S
 
Q
T
 
I
L
 
Y
D
 
S
V
 
V
N
 
N
G
 
V
L
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
I
 
F
C
 
G
Q
 
I
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
K
 
E
Q
 
L
G
 
G
K
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
A
S
 
A
S
 
S
I
|
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
Q
 
Q
G
 
G
Y
x
F
P
 
P
N
 
I
F
 
L
A
 
S
S
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
S
 
T
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
R
A
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
P
H
 
K
K
 
G
I
 
H
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
|
V
D
x
G
T
|
T
P
 
G
L
 
M
W
 
W
K
 
E
K
 
Q
L
 
I
D
 
D
L
 
A
D
 
E
L
 
L
M
 
S
D
 
K
M
 
I
G
 
-
D
 
-
T
 
N
S
 
G
R
 
K
P
 
P
-
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
N
F
 
F
E
 
K
S
 
E
F
 
Y
S
 
S
G
 
S
A
 
S
N
 
I
L
 
A
I
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
P
G
 
S
V
 
V
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
L
A
 
V
L
 
S
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
E
D
 
N
S
 
S
D
 
N
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
I
 
M
M
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
L

3a28C Crystal structure of l-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
37% identity, 95% coverage: 11:260/262 of query aligns to 5:255/257 of 3a28C

query
sites
3a28C
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
S
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
R
 
R
V
 
G
I
 
I
A
 
S
I
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
N
 
D
I
 
I
T
 
A
L
 
V
F
 
A
D
|
D
L
|
L
-
 
P
-
 
Q
-
x
Q
N
 
E
F
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
T
V
 
I
K
 
K
D
 
-
E
 
L
I
 
I
T
 
E
L
 
A
A
 
A
G
 
D
G
 
Q
S
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
F
A
 
V
S
 
G
G
x
L
N
x
D
V
|
V
V
 
T
D
 
D
R
 
K
A
 
A
D
 
N
V
 
F
A
 
D
M
 
S
A
 
A
V
 
I
Q
 
D
T
 
E
S
 
A
V
 
A
D
 
E
S
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
L
 
F
D
 
D
C
 
V
M
 
L
F
 
V
A
 
N
I
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
A
K
 
Q
P
 
I
T
 
K
H
 
P
F
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
D
F
 
L
R
 
K
S
 
Q
T
 
I
L
 
Y
D
 
S
V
 
V
N
 
N
G
 
V
L
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
I
 
F
C
 
G
Q
 
I
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
K
 
E
Q
 
L
G
 
G
K
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
A
S
 
A
S
|
S
I
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
N
 
I
F
 
L
A
 
S
S
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
S
 
T
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
R
A
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
P
H
 
K
K
 
G
I
 
H
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
T
|
T
P
 
G
L
x
M
W
|
W
K
 
E
K
 
Q
L
 
I
D
 
D
L
 
A
D
 
E
L
|
L
M
 
S
D
 
K
M
 
I
G
 
-
D
 
-
T
 
N
S
 
G
R
 
K
P
 
P
-
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
N
F
 
F
E
 
K
S
 
E
F
 
Y
S
 
S
G
 
S
A
 
S
N
 
I
L
 
A
I
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
P
G
 
S
V
 
V
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
L
A
 
V
L
 
S
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
E
D
 
N
S
 
S
D
 
N
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
I
 
M
M
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
L

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
35% identity, 97% coverage: 8:261/262 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
R
 
K
S
 
S
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
S
 
R
G
|
G
M
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
S
I
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
I
 
V
T
 
A
L
 
V
F
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
E
A
 
K
A
 
A
N
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
L
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
S
 
D
A
 
S
V
 
F
A
 
A
A
 
I
S
 
Q
G
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
A
D
 
D
R
 
A
A
 
D
D
 
E
V
 
V
A
 
K
M
 
A
A
 
M
V
 
I
Q
 
K
T
 
E
S
 
V
V
 
V
D
 
S
S
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
D
 
D
C
 
V
M
 
L
F
 
V
A
 
N
I
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
K
 
R
P
 
D
T
 
N
H
 
L
F
 
L
L
 
M
E
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
Q
N
 
E
F
 
W
R
 
D
S
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
G
 
L
L
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
I
 
N
C
 
C
Q
 
I
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
A
 
T
K
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
K
 
R
Q
 
Q
G
 
-
K
 
R
G
 
S
G
 
G
K
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
Q
 
V
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
N
 
G
F
x
Q
A
 
A
S
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
T
 
I
A
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
S
H
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
D
 
V
T
 
S
P
 
D
L
 
M
W
 
T
K
 
D
K
 
A
L
 
L
D
 
S
L
 
D
D
 
E
L
 
L
M
 
K
D
 
E
M
 
Q
G
 
M
D
 
L
T
 
T
S
 
Q
R
 
I
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
L
G
 
A
R
 
R
K
 
F
G
 
G
V
 
Q
A
 
D
E
 
T
D
 
D
V
 
I
V
 
A
G
 
N
T
 
T
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
D
 
K
S
 
A
D
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
I
 
I
M
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
Y
L
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
35% identity, 97% coverage: 8:261/262 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
R
 
K
S
 
S
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
M
x
I
G
 
G
R
 
R
V
 
S
I
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
I
 
V
T
 
A
L
 
V
F
 
-
D
 
-
L
 
-
N
|
N
F
x
Y
A
|
A
-
x
G
-
x
S
-
 
K
-
 
E
A
 
K
A
 
A
N
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
L
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
S
 
D
A
 
S
V
 
F
A
 
A
A
 
I
S
 
Q
G
x
A
N
|
N
V
|
V
V
 
A
D
 
D
R
 
A
A
 
D
D
 
E
V
 
V
A
 
K
M
 
A
A
 
M
V
 
I
Q
 
K
T
 
E
S
 
V
V
 
V
D
 
S
S
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
D
 
D
C
 
V
M
 
L
F
 
V
A
 
N
I
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
K
 
R
P
 
D
T
 
N
H
 
L
F
 
L
L
 
M
E
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
Q
N
 
E
F
 
W
R
 
D
S
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
G
 
L
L
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
I
 
N
C
 
C
Q
 
I
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
A
 
T
K
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
K
 
R
Q
 
Q
G
 
-
K
 
R
G
 
S
G
 
G
K
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
Q
 
V
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
N
 
G
F
x
Q
A
 
A
S
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
T
 
I
A
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
S
H
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
V
 
I
D
 
V
T
 
S
P
 
D
L
 
M
W
 
T
K
 
D
K
 
E
L
 
L
D
 
K
L
 
E
D
 
Q
L
 
M
M
 
L
D
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
T
S
 
Q
R
 
I
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
L
G
 
A
R
 
R
K
 
F
G
 
G
V
 
Q
A
 
D
E
 
T
D
 
D
V
 
I
V
 
A
G
 
N
T
 
T
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
D
 
K
S
 
A
D
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
I
 
I
M
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
Y
L
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
34% identity, 98% coverage: 5:261/262 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
V
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
S
 
V
I
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
M
x
I
G
 
G
R
 
R
V
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
T
 
-
L
 
F
F
 
F
D
x
N
L
x
Y
N
|
N
F
x
G
A
x
S
-
 
P
-
 
E
A
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
E
V
 
T
K
 
A
D
 
K
E
 
L
I
 
V
T
 
A
L
 
E
A
 
H
G
 
G
G
 
V
S
 
E
A
 
V
V
 
E
A
 
A
A
 
M
S
 
K
G
 
A
N
|
N
V
|
V
V
 
A
D
 
I
R
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
D
M
 
A
A
 
F
V
 
F
Q
 
K
T
 
Q
S
 
A
V
 
I
D
 
E
S
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
D
 
D
C
 
I
M
 
L
F
 
V
A
 
N
I
x
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
I
 
T
K
 
R
P
 
D
T
 
N
H
 
L
F
 
L
L
 
M
E
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
D
N
 
E
F
 
W
R
 
D
S
 
D
T
 
V
L
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
G
 
L
L
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
I
 
L
C
 
C
Q
 
T
Q
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
R
Q
 
T
M
 
M
I
 
M
K
 
K
Q
 
Q
G
 
-
K
 
R
G
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
M
S
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
Q
 
I
G
 
G
Y
 
N
P
 
A
N
 
G
F
x
Q
A
 
A
S
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
T
 
I
A
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
T
A
 
A
H
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
P
H
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
N
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
D
 
T
T
|
T
P
 
D
L
 
M
W
 
T
K
 
D
K
 
K
L
 
L
D
 
D
L
 
E
D
 
K
L
 
T
M
 
K
D
 
E
M
 
A
G
 
M
D
 
L
T
 
A
S
 
Q
R
 
I
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
L
G
 
G
R
 
A
K
 
Y
G
 
G
V
 
T
A
 
T
E
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
A
G
 
N
T
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
D
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
I
 
L
M
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
V
L
 
M

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
34% identity, 98% coverage: 4:259/262 of query aligns to 2:248/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
R
 
R
V
 
L
E
 
A
G
 
N
R
 
R
S
 
V
I
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
I
 
E
A
 
R
L
 
F
A
 
A
K
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
A
I
 
V
T
 
V
L
 
V
F
 
A
D
|
D
L
 
I
N
 
N
F
 
E
A
 
P
A
 
K
A
 
A
N
 
T
A
 
E
V
 
V
K
 
A
D
 
S
E
 
S
I
 
I
T
 
T
L
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
S
 
A
G
 
V
N
 
D
V
|
V
V
 
S
D
 
D
R
 
V
A
 
E
D
 
S
V
 
V
A
 
N
M
 
R
A
 
M
V
 
V
Q
 
D
T
 
S
S
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
D
 
D
C
 
I
M
 
L
F
 
V
-
 
N
-
x
N
-
 
A
A
|
A
I
 
I
A
 
F
G
x
S
I
 
T
I
 
L
K
 
K
P
 
M
T
 
K
H
 
P
F
 
F
L
 
E
E
 
E
T
 
I
T
 
S
E
 
G
E
 
D
N
 
E
F
 
W
R
 
D
S
 
K
T
 
L
L
 
F
D
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
A
L
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
I
 
L
C
 
C
Q
 
C
Q
 
Q
E
 
-
A
 
A
A
 
V
K
 
S
Q
 
P
M
 
V
I
 
M
K
 
R
Q
 
K
G
 
N
K
 
Q
G
 
Y
G
 
G
K
 
R
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
x
I
S
|
S
S
|
S
I
 
S
A
 
V
G
 
V
R
 
V
Q
 
T
G
 
G
Y
 
R
P
 
P
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
S
 
H
Y
|
Y
C
 
I
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
W
A
 
A
L
 
L
N
 
T
Q
 
H
S
 
A
A
 
L
A
 
A
H
 
T
A
 
E
L
 
M
A
 
G
K
 
T
H
 
D
K
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
T
F
 
V
A
 
S
P
|
P
G
x
H
V
 
G
V
x
I
D
 
I
T
 
T
P
 
E
L
x
I
W
 
P
K
 
R
K
 
E
L
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
T
R
 
I
P
 
S
G
 
E
E
 
E
A
 
G
F
 
W
E
 
R
S
 
R
F
 
N
S
 
L
G
 
E
A
 
E
N
 
Q
L
 
A
I
 
L
G
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
D
A
 
A
E
 
S
D
 
D
V
 
L
V
 
V
G
 
G
T
 
I
A
 
L
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
D
 
E
S
 
S
D
 
K
Y
 
F
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
I
 
V
M
 
A
I
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G
M
 
L

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
32% identity, 98% coverage: 5:260/262 of query aligns to 8:245/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
V
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
S
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
C
G
x
D
S
 
T
G
 
G
M
x
L
G
 
G
R
 
Q
V
 
G
I
 
M
A
 
A
I
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
C
N
 
D
I
 
I
T
 
V
L
 
-
F
 
-
D
 
G
L
 
V
N
 
N
F
x
I
A
 
V
A
 
E
A
 
P
N
 
K
A
 
D
V
 
T
K
 
I
D
 
E
E
 
K
I
 
V
T
 
T
L
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
R
S
 
R
A
 
F
V
 
L
A
 
S
A
 
L
S
 
T
G
 
A
N
x
D
V
x
M
V
 
S
D
 
N
R
 
V
A
 
S
D
 
G
V
 
H
A
 
A
M
 
E
A
 
L
V
 
V
Q
 
E
T
 
K
S
 
A
V
 
V
D
 
A
S
 
E
F
 
F
G
 
G
Q
 
H
L
 
V
D
 
D
C
 
I
M
 
L
F
 
V
A
 
N
I
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
I
 
I
K
 
R
P
 
R
T
 
E
H
 
D
F
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
F
T
 
S
E
 
E
E
 
K
N
 
N
F
 
W
R
 
D
S
 
D
T
 
V
L
 
M
D
 
N
V
x
L
N
 
N
G
 
I
L
 
K
G
 
S
T
 
V
L
 
F
I
 
F
C
 
M
Q
 
S
Q
 
Q
E
 
T
A
 
V
A
 
A
K
 
R
Q
 
Q
M
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
x
I
S
 
A
S
|
S
I
 
M
A
 
L
G
 
S
R
 
F
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
G
P
 
I
N
 
R
F
 
V
A
 
P
S
 
S
Y
|
Y
C
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
S
A
 
A
V
 
V
T
 
M
A
 
G
L
 
V
N
 
T
Q
 
R
S
 
L
A
 
M
A
 
A
H
 
N
A
 
E
L
 
W
A
 
A
K
 
K
H
 
H
K
 
G
I
 
I
T
 
N
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
V
 
Y
V
x
M
D
 
A
T
|
T
P
 
N
L
x
N
W
 
T
K
 
Q
K
 
E
L
 
R
D
 
S
L
 
K
D
 
E
L
 
I
M
 
L
D
 
D
M
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
R
R
 
I
P
 
P
G
 
A
E
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
G
R
 
R
K
 
W
G
 
G
V
 
L
A
 
P
E
 
Q
D
 
D
V
 
L
V
 
M
G
 
G
T
 
P
A
 
S
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
S
D
 
A
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
Y
T
 
T
I
 
I
M
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
V
 
L

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain ATCC 27184 / PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
34% identity, 96% coverage: 11:261/262 of query aligns to 10:246/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
 
S
S
 
R
G
 
G
M
 
I
G
 
G
R
 
K
V
 
A
I
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
T
G
 
G
A
 
M
N
 
K
I
 
V
T
 
V
L
 
V
F
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
-
 
Q
-
 
S
-
 
S
-
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
V
D
 
A
E
 
E
I
 
I
T
 
I
L
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
V
S
 
Q
G
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
A
D
 
N
R
 
A
A
 
D
D
 
E
V
 
V
A
 
D
M
 
Q
A
 
L
V
 
I
Q
 
K
T
 
T
S
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
K
F
 
F
G
 
S
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
C
 
V
M
 
L
F
 
V
A
 
N
I
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
K
 
R
P
 
D
T
 
T
H
 
L
F
 
L
L
 
L
E
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
L
E
 
E
N
 
D
F
 
W
R
 
Q
S
 
A
T
 
V
L
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
I
 
L
C
 
C
Q
 
T
Q
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
K
Q
 
L
M
 
M
I
 
L
K
 
K
Q
 
Q
G
 
-
K
 
K
G
 
S
G
 
G
K
 
R
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
M
Q
 
M
G
 
G
Y
 
N
P
|
P
N
 
G
F
 
Q
A
 
A
S
 
N
Y
 
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
T
 
I
A
 
G
L
 
F
N
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
V
A
 
A
H
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
S
H
 
R
K
 
G
I
 
V
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
x
F
V
 
I
D
 
A
T
 
T
P
 
D
L
 
M
W
 
T
K
 
E
K
 
N
L
 
L
D
x
N
L
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
A
R
 
E
P
 
P
G
 
I
E
 
L
A
 
Q
F
 
F
E
 
I
S
 
P
F
 
L
S
 
A
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
R
K
 
Y
G
 
G
V
 
Q
A
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
I
L
 
R
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
S
 
D
D
 
P
-
 
A
S
 
A
D
 
A
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
I
 
F
M
 
N
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
V
L
 
M

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
31% identity, 99% coverage: 1:259/262 of query aligns to 1:250/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
M
 
M
S
 
Y
G
 
K
R
 
D
V
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
V
I
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
S
S
x
T
G
|
G
M
x
L
G
 
G
R
 
K
V
 
S
I
 
M
A
 
A
I
 
I
A
 
R
L
 
F
A
 
A
K
 
T
E
 
E
G
 
K
A
 
A
N
 
K
I
 
V
T
 
V
L
 
V
-
 
N
F
 
Y
D
x
R
L
 
S
N
 
K
F
 
E
A
 
D
A
 
E
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
K
 
L
D
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
L
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
V
S
 
K
G
 
G
N
x
D
V
|
V
V
 
T
D
 
V
R
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
I
M
 
N
A
 
L
V
 
V
Q
 
Q
T
 
S
S
 
A
V
 
I
D
 
K
S
 
E
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
D
 
D
C
 
V
M
 
M
F
 
I
A
 
N
I
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
I
 
A
K
 
N
P
 
P
T
 
V
H
 
S
F
 
S
L
 
H
E
 
E
T
 
M
T
 
S
E
 
L
E
 
S
N
 
D
F
 
W
R
 
N
S
 
K
T
 
V
L
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
G
 
L
L
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
I
 
L
C
 
G
Q
 
S
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
K
Q
 
Y
M
 
F
I
 
V
K
 
E
Q
 
N
G
 
D
K
 
I
G
 
K
G
 
G
K
 
T
L
 
V
I
 
I
V
 
N
T
x
M
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
H
G
 
E
R
 
K
Q
 
I
G
 
P
Y
 
W
P
 
P
N
 
L
F
 
F
A
 
V
S
 
H
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
G
V
 
M
T
 
K
A
 
L
L
 
M
N
 
T
Q
 
E
S
 
T
A
 
L
A
 
A
H
 
L
A
 
E
L
 
Y
A
 
A
K
 
P
H
 
K
K
 
G
I
 
I
T
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
N
F
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
V
 
A
V
x
I
D
 
N
T
|
T
P
 
P
L
 
I
W
 
N
K
 
A
K
 
E
L
 
K
D
 
F
L
 
A
D
 
D
L
 
P
M
 
E
D
 
Q
M
 
R
G
 
A
D
 
D
T
 
V
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
E
S
 
S
F
 
M
S
 
I
G
 
P
A
 
M
N
 
G
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
E
K
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
V
 
A
G
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
S
D
 
E
S
 
A
D
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
T
 
T
I
 
L
M
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
31% identity, 99% coverage: 1:259/262 of query aligns to 1:250/261 of P40288

query
sites
P40288
M
 
M
S
 
Y
G
 
K
R
 
D
V
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
V
I
 
V
L
x
V
I
|
I
T
|
T
G
|
G
A
x
S
G
x
S
S
x
T
G
|
G
M
x
L
G
|
G
R
x
K
V
x
S
I
x
M
A
|
A
I
|
I
A
x
R
L
x
F
A
|
A
K
x
T
E
|
E
G
x
K
A
|
A
N
x
K
I
x
V
T
x
V
L
 
V
-
 
N
F
 
Y
D
 
R
L
 
S
N
 
K
F
 
E
A
 
D
A
 
E
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
K
 
L
D
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
L
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
V
S
 
K
G
 
G
N
 
D
V
 
V
V
 
T
D
 
V
R
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
I
M
 
N
A
 
L
V
 
V
Q
 
Q
T
 
S
S
 
A
V
 
I
D
 
K
S
 
E
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
D
 
D
C
 
V
M
 
M
F
 
I
A
 
N
I
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
x
E
K
 
N
P
 
P
T
 
V
H
 
S
F
 
S
L
 
H
E
 
E
T
 
M
T
 
S
E
 
L
E
 
S
N
x
D
F
 
W
R
 
N
S
 
K
T
x
V
L
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
G
 
L
L
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
I
 
L
C
 
G
Q
 
S
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
K
Q
 
Y
M
 
F
I
 
V
K
x
E
Q
 
N
G
 
D
K
 
I
G
 
K
G
 
G
K
 
T
L
 
V
I
 
I
V
 
N
T
 
M
S
 
S
S
 
S
I
 
V
A
 
H
G
 
E
R
 
K
Q
 
I
G
 
P
Y
 
W
P
 
P
N
 
L
F
 
F
A
 
V
S
 
H
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
F
 
G
A
 
G
V
 
M
T
 
K
A
 
L
L
 
M
N
 
T
Q
 
E
S
 
T
A
 
L
A
 
A
H
 
L
A
 
E
L
 
Y
A
 
A
K
 
P
H
 
K
K
 
G
I
 
I
T
 
R
S
x
V
N
 
N
A
 
N
F
 
I
A
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
A
V
 
I
D
 
N
T
 
T
P
|
P
L
 
I
W
 
N
K
 
A
K
 
E
L
 
K
D
 
F
L
 
A
D
 
D
L
 
P
M
 
E
D
 
Q
M
 
R
G
 
A
D
 
D
T
 
V
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
E
|
E
S
 
S
F
 
M
S
 
I
G
 
P
A
 
M
N
 
G
L
x
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
E
K
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
V
 
A
G
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
S
D
 
E
S
 
A
D
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
T
 
T
I
 
L
M
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M

Sites not aligning to the query:

8hfkA Crystal structure of cbar mutant (h162f) in complex with NADP+ and halogenated aryl ketone (see paper)
30% identity, 98% coverage: 1:258/262 of query aligns to 2:257/259 of 8hfkA

query
sites
8hfkA
M
 
I
S
 
P
G
 
G
R
 
R
V
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
G
S
x
R
G
 
G
M
x
I
G
 
G
R
 
A
V
 
A
I
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
H
L
 
L
A
 
G
K
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
K
I
 
V
T
 
V
L
 
V
F
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
N
F
 
Y
A
|
A
-
x
N
-
x
S
-
 
P
-
 
T
A
 
H
A
 
A
N
 
Q
A
 
K
V
 
V
K
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
K
L
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
S
S
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
I
S
 
K
G
 
A
N
x
D
V
 
V
V
 
R
D
 
Q
R
 
V
A
 
P
D
 
E
V
 
I
A
 
V
M
 
R
A
 
L
V
 
F
Q
 
D
T
 
E
S
 
A
V
 
V
D
 
A
S
 
H
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
C
 
I
M
 
A
F
 
V
A
 
S
I
x
N
A
x
S
G
 
G
I
 
V
I
 
V
K
 
S
P
 
F
T
 
G
H
 
H
F
 
L
L
 
K
E
 
D
T
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
E
F
 
F
R
 
D
S
 
R
T
 
V
L
 
F
D
 
S
V
x
L
N
 
N
G
 
T
L
 
R
G
 
G
T
 
Q
L
 
F
I
 
F
C
 
V
Q
 
A
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
Y
K
 
K
Q
 
H
M
 
L
I
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
N
K
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
R
L
 
I
I
 
I
V
 
M
T
|
T
S
 
S
S
|
S
I
x
N
A
x
T
G
 
S
R
 
R
Q
 
D
G
 
S
Y
 
V
P
 
P
N
 
K
F
|
F
A
 
S
S
 
L
Y
|
Y
C
 
S
A
 
G
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
I
T
 
D
A
 
S
L
 
F
N
 
V
Q
 
R
S
 
I
A
 
F
A
 
S
H
 
K
A
 
D
L
 
C
A
 
G
K
 
D
H
 
K
K
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
G
V
x
T
D
 
V
T
|
T
P
 
D
L
x
M
W
 
F
K
 
H
K
 
D
L
x
V
D
 
S
L
 
Q
D
 
H
L
 
Y
M
 
I
D
 
P
M
 
N
G
 
G
D
 
E
T
 
T
S
 
Y
R
 
T
P
 
P
G
 
E
E
 
E
A
 
R
F
 
Q
E
 
K
S
 
M
F
 
A
S
 
A
G
 
H
A
 
A
N
 
S
L
 
P
I
 
L
G
 
H
R
 
R
K
 
N
G
 
G
V
 
F
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
A
G
 
R
T
 
V
A
 
V
L
 
G
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
S
 
S
S
 
A
D
 
E
S
 
G
D
 
E
Y
 
W
M
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
K
T
 
V
I
 
L
M
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
31% identity, 98% coverage: 4:261/262 of query aligns to 4:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
V
 
L
E
 
Q
G
 
D
R
 
K
S
 
V
I
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
M
x
I
G
 
G
R
 
L
V
 
E
I
 
A
A
 
A
I
 
R
A
 
V
L
 
F
A
 
M
K
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
I
 
V
T
 
V
L
 
I
F
 
A
D
|
D
L
x
F
N
 
N
F
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
G
N
 
K
A
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
E
I
 
A
T
 
V
L
 
E
A
 
A
G
 
N
G
 
P
S
 
G
A
 
V
V
 
V
A
 
F
A
 
I
S
 
R
G
x
V
N
x
D
V
|
V
V
 
S
D
 
D
R
 
R
A
 
E
D
 
S
V
 
V
A
 
H
M
 
R
A
 
L
V
 
V
Q
 
E
T
 
N
S
 
V
V
 
A
D
 
E
S
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
D
 
D
C
 
I
M
 
L
F
 
I
A
 
N
I
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
I
 
T
K
 
R
P
x
D
T
 
S
H
 
M
F
 
L
L
 
S
E
x
K
T
 
M
T
 
T
E
 
V
E
 
D
N
 
Q
F
 
F
R
 
Q
S
 
Q
T
 
V
L
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
G
 
L
L
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
I
 
H
C
 
C
Q
 
T
Q
 
Q
E
 
A
A
 
V
A
 
L
K
 
P
Q
 
Y
M
 
M
I
 
A
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
|
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
Q
 
Y
G
 
G
Y
x
N
P
x
V
N
 
G
F
x
Q
A
 
T
S
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
T
 
I
A
 
G
L
 
M
N
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
W
A
 
A
H
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
R
H
 
K
K
 
G
I
 
I
T
 
N
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
F
V
x
T
D
 
E
T
|
T
P
 
A
L
x
M
W
 
V
K
 
A
K
 
E
L
 
V
D
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
P
G
 
E
E
 
K
A
 
V
F
 
I
E
 
E
S
x
K
F
 
M
S
 
K
G
 
A
A
 
Q
N
 
V
L
 
P
I
 
M
G
 
G
R
 
R
K
 
L
G
 
G
V
 
K
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
A
G
 
N
T
 
A
A
 
Y
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
H
D
 
E
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
T
 
V
I
 
L
M
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I
V
 
M
L
 
M

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
33% identity, 98% coverage: 4:259/262 of query aligns to 8:252/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
R
 
K
V
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
K
S
 
V
I
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
K
G
|
G
M
x
I
G
 
G
R
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
A
I
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
A
I
 
V
T
 
V
L
 
V
-
 
N
F
 
Y
D
x
A
L
x
S
N
x
S
F
 
K
A
 
A
A
 
G
A
 
A
N
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
V
D
 
S
E
 
A
I
 
I
T
 
T
L
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
G
G
|
G
N
x
D
V
|
V
V
 
S
D
 
K
R
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
A
A
 
Q
M
 
R
A
 
I
V
 
V
Q
 
D
T
 
T
S
 
A
V
 
I
D
 
E
S
 
T
F
 
Y
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
D
C
 
V
M
 
L
F
 
V
A
 
N
I
x
N
A
x
S
G
|
G
I
 
V
I
x
Y
K
 
E
P
 
F
T
 
A
H
 
P
F
 
I
L
 
E
E
 
A
T
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
H
F
 
Y
R
 
R
S
 
R
T
 
Q
L
 
F
D
 
D
V
 
T
N
 
N
G
 
V
L
 
F
G
 
G
T
 
V
L
 
L
I
 
L
C
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
K
Q
 
H
M
 
L
I
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
G
K
 
E
G
 
G
G
 
A
K
 
S
L
 
I
I
 
I
V
 
N
T
x
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
T
R
 
S
Q
 
I
G
 
T
Y
 
P
P
 
P
N
 
A
F
 
S
A
 
A
S
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
G
S
 
T
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
T
Q
 
G
S
 
V
A
 
L
A
 
A
H
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
K
 
P
H
 
R
K
 
K
I
 
I
T
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
V
x
M
V
x
I
D
 
V
T
|
T
P
 
E
L
x
G
W
x
T
K
 
H
K
 
S
L
 
A
-
 
G
-
x
I
-
 
I
-
 
G
-
 
S
D
 
D
L
 
L
D
 
E
L
 
A
M
 
Q
D
 
V
M
 
L
G
 
G
D
 
Q
T
 
T
S
 
P
R
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
L
G
 
G
V
 
E
A
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
I
V
 
A
G
 
S
T
 
V
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
D
 
D
S
 
A
D
 
R
Y
 
W
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
H
I
 
L
M
 
V
I
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
L

8hfjC Crystal structure of cbar mutant (h162f) in complex with NADP+ and a bulky 1,3-cyclodiketone (see paper)
30% identity, 98% coverage: 1:258/262 of query aligns to 2:258/260 of 8hfjC

query
sites
8hfjC
M
 
I
S
 
P
G
 
G
R
 
R
V
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
K
S
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
G
S
x
R
G
 
G
M
x
I
G
 
G
R
 
A
V
 
A
I
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
H
L
 
L
A
 
G
K
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
K
I
 
V
T
 
V
L
 
V
F
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
N
F
x
Y
A
|
A
-
x
N
-
x
S
-
 
P
-
 
T
A
 
H
A
 
A
N
 
Q
A
 
K
V
 
V
K
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
K
L
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
S
S
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
I
S
 
K
G
 
A
N
x
D
V
|
V
V
 
R
D
 
Q
R
 
V
A
 
P
D
 
E
V
 
I
A
 
V
M
 
R
A
 
L
V
 
F
Q
 
D
T
 
E
S
 
A
V
 
V
D
 
A
S
 
H
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
C
 
I
M
 
A
F
 
V
A
 
S
I
x
N
A
x
S
G
 
G
I
 
V
I
 
V
K
 
S
P
 
F
T
 
G
H
 
H
F
 
L
L
 
K
E
 
D
T
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
E
F
 
F
R
 
D
S
 
R
T
 
V
L
 
F
D
 
S
V
x
L
N
 
N
G
 
T
L
 
R
G
 
G
T
 
Q
L
 
F
I
 
F
C
 
V
Q
 
A
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
Y
K
 
K
Q
 
H
M
 
L
I
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
N
K
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
R
L
 
I
I
 
I
V
 
M
T
|
T
S
 
S
S
 
S
I
x
N
A
x
T
G
 
S
R
 
R
Q
 
D
-
 
F
G
 
S
Y
 
V
P
 
P
N
 
K
F
|
F
A
 
S
S
 
L
Y
|
Y
C
 
S
A
 
G
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
I
T
 
D
A
 
S
L
 
F
N
 
V
Q
 
R
S
 
I
A
 
F
A
 
S
H
 
K
A
 
D
L
 
C
A
 
G
K
 
D
H
 
K
K
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
G
V
x
T
D
 
V
T
|
T
P
 
D
L
x
M
W
 
F
K
 
H
K
 
D
L
x
V
D
 
S
L
 
Q
D
 
H
L
 
Y
M
 
I
D
 
P
M
 
N
G
 
G
D
 
E
T
 
T
S
 
Y
R
 
T
P
 
P
G
 
E
E
 
E
A
 
R
F
 
Q
E
 
K
S
 
M
F
 
A
S
 
A
G
 
H
A
 
A
N
 
S
L
 
P
I
 
L
G
 
H
R
 
R
K
 
N
G
 
G
V
 
F
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
A
G
 
R
T
 
V
A
 
V
L
 
G
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
S
 
S
S
 
A
D
 
E
S
 
G
D
 
E
Y
 
W
M
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
K
T
 
V
I
 
L
M
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8w0oA Gdh-105 crystal structure
31% identity, 100% coverage: 1:261/262 of query aligns to 1:252/259 of 8w0oA

query
sites
8w0oA
M
 
M
S
 
Y
G
 
P
R
 
D
V
 
L
E
 
K
G
 
G
R
 
K
S
 
V
I
 
V
L
 
A
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
|
S
G
|
G
M
x
L
G
 
G
R
 
K
V
 
A
I
 
M
A
 
A
I
 
I
A
 
R
L
 
F
A
 
G
K
 
K
E
 
E
G
 
Q
A
 
A
N
 
K
I
 
V
T
 
V
L
 
I
-
 
N
F
 
Y
D
x
Y
L
 
S
N
 
N
F
 
K
A
x
Q
A
 
D
A
 
P
N
 
N
A
 
E
V
 
V
K
 
K
D
 
E
E
 
E
I
 
V
T
 
I
L
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
V
S
 
Q
G
 
G
N
x
D
V
|
V
V
 
T
D
 
K
R
 
E
A
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
K
M
 
N
A
 
I
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
S
 
A
V
 
I
D
 
K
S
 
E
F
 
F
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
I
M
 
M
F
 
I
A
 
N
I
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
I
 
E
K
 
N
P
 
P
T
 
V
H
 
P
F
 
S
L
 
H
E
 
E
T
 
M
T
 
P
E
 
L
E
 
K
N
 
D
F
 
W
R
 
D
S
 
K
T
 
V
L
 
I
D
 
G
V
 
T
N
 
N
G
 
L
L
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
I
 
L
C
 
G
Q
 
S
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
K
Q
 
Y
M
 
F
I
 
V
K
 
E
Q
 
N
G
 
D
K
 
I
G
 
K
G
 
G
K
 
N
L
 
V
I
 
I
V
 
N
T
x
M
S
 
S
S
 
S
I
 
V
A
 
H
G
 
E
R
 
V
Q
 
I
G
 
P
Y
 
W
P
 
P
N
 
L
F
 
F
A
 
V
S
 
H
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
G
V
 
M
T
 
K
A
 
L
L
 
M
N
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
L
A
 
A
H
 
L
A
 
E
L
 
Y
A
 
A
K
 
P
H
 
K
K
 
G
I
 
I
T
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
N
F
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
V
 
A
V
x
I
D
 
N
T
|
T
P
 
T
L
 
I
W
 
N
K
 
A
K
 
E
L
 
K
D
 
F
L
 
A
D
 
D
L
 
P
M
 
K
D
 
Q
M
 
K
G
 
A
D
 
D
T
 
V
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
E
S
 
S
F
 
M
S
 
I
G
 
P
A
 
M
N
 
G
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
E
K
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
V
 
A
G
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
K
D
 
E
S
 
A
D
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
T
 
T
I
 
L
M
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
T
L
 
L

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
31% identity, 99% coverage: 1:259/262 of query aligns to 7:256/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
M
 
M
S
 
Y
G
 
T
R
 
D
V
 
L
E
 
K
G
 
D
R
 
K
S
 
V
I
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
S
S
x
T
G
|
G
M
x
L
G
 
G
R
 
R
V
 
A
I
 
M
A
 
A
I
 
V
A
 
R
L
 
F
A
 
G
K
 
Q
E
 
E
G
 
E
A
 
A
N
 
K
I
 
V
T
 
V
L
 
I
-
 
N
F
 
Y
D
x
Y
L
 
N
N
 
N
F
 
E
A
 
E
A
 
E
A
 
A
N
 
L
A
 
D
V
 
A
K
 
K
D
 
K
E
 
E
I
 
V
T
 
E
L
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
I
A
 
V
S
 
Q
G
 
G
N
x
D
V
|
V
V
 
T
D
 
K
R
 
E
A
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
V
M
 
N
A
 
L
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
S
 
A
V
 
I
D
 
K
S
 
E
F
 
F
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
V
M
 
M
F
 
I
A
 
N
I
x
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
I
x
E
K
 
N
P
 
P
T
 
V
H
 
P
F
 
S
L
 
H
E
 
E
T
 
L
T
 
S
E
 
L
E
 
D
N
 
N
F
 
W
R
 
N
S
 
K
T
 
V
L
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
G
 
L
L
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
I
 
L
C
 
G
Q
 
S
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
K
Q
 
Y
M
 
F
I
 
V
K
 
E
Q
 
N
G
 
D
K
 
I
G
 
K
G
 
G
K
 
N
L
 
V
I
 
I
V
 
N
T
x
M
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
x
H
G
 
E
R
 
M
Q
 
I
G
 
P
Y
x
W
P
 
P
N
 
L
F
 
F
A
 
V
S
 
H
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
A
 
G
V
 
M
T
 
K
A
 
L
L
 
M
N
 
T
Q
 
E
S
 
T
A
 
L
A
 
A
H
 
L
A
 
E
L
 
Y
A
 
A
K
 
P
H
 
K
K
 
G
I
 
I
T
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
N
F
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
V
 
A
V
x
M
D
 
N
T
|
T
P
|
P
L
x
I
W
x
N
K
 
A
K
 
E
L
x
K
D
 
F
L
 
A
D
 
D
L
 
P
M
 
V
D
 
Q
M
 
R
G
 
A
D
 
D
T
 
V
S
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
E
S
 
S
F
 
M
S
 
I
G
 
P
A
 
M
N
 
G
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
K
K
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
S
D
 
Q
S
 
A
D
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
T
 
T
I
 
L
M
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M

Query Sequence

>WP_058929002.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058929002.1
MSGRVEGRSILITGAGSGMGRVIAIALAKEGANITLFDLNFAAANAVKDEITLAGGSAVA
ASGNVVDRADVAMAVQTSVDSFGQLDCMFAIAGIIKPTHFLETTEENFRSTLDVNGLGTL
ICQQEAAKQMIKQGKGGKLIVTSSIAGRQGYPNFASYCASKFAVTALNQSAAHALAKHKI
TSNAFAPGVVDTPLWKKLDLDLMDMGDTSRPGEAFESFSGANLIGRKGVAEDVVGTALYL
ASSDSDYMTGQTIMIDGGMVLV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory