SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_058929066.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058929066.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4cxqA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with substrate kapa (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:418/427 of 4cxqA

query
sites
4cxqA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
S
L
 
P
W
 
V
E
 
V
V
 
A
E
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
|
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4w1vA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a thiazole inhibitor (see paper)
54% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:416/425 of 4w1vA

query
sites
4w1vA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
-
A
 
S
S
 
I
G
 
G
D
 
R
L
 
S
P
 
P
L
 
V
W
 
V
E
 
A
V
 
V
E
 
-
A
 
A
A
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
D
D
 
Y
I
 
D
G
 
P
Q
 
A
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4cxrA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with 1-(1,3- benzothiazol-2-yl)methanamine (see paper)
54% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:416/425 of 4cxrA

query
sites
4cxrA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
-
A
 
S
S
 
I
G
 
G
D
 
R
L
 
S
P
 
P
L
 
V
W
 
V
E
 
A
V
 
V
E
 
-
A
 
A
A
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
D
D
 
Y
I
 
D
G
 
P
Q
 
A
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

5te2A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a mechanism-based inhibitor (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/428 of 5te2A

query
sites
5te2A
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4xjoA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/428 of 4xjoA

query
sites
4xjoA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4xewA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a hts lead compound (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/428 of 4xewA

query
sites
4xewA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
|
R
P
 
P
F
|
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4wyfA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a dsf fragment hit (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/428 of 4wyfA

query
sites
4wyfA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4wycA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a thiazole benzamide inhibitor (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/428 of 4wycA

query
sites
4wycA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4mqrA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with e)-5- hydroxy-4-(((z)-isonicotinoyldiazenyl)methylene)-6-methyl-1,4- dihydropyridin-3-yl)methyl phosphate (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/428 of 4mqrA

query
sites
4mqrA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4mqqA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with benzo[d]thiazole-2-carbohydrazide (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/428 of 4mqqA

query
sites
4mqqA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4mqpA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with 2- hydrazinylbenzo[d]thiazole (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/428 of 4mqpA

query
sites
4mqpA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
 
G
P
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4wydA Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase from mycobacterium tuberculosis complexed with a fragment from dsf screening (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/430 of 4wydA

query
sites
4wydA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

5kgtA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead: 1-[4-[4-(3-chlorophenyl)carbonylpiperidin-1- yl]phenyl]ethanone (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/429 of 5kgtA

query
sites
5kgtA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
|
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
|
G
P
 
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

5kgsA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead: 5-[4-(1,3-benzodioxol-5-ylcarbonyl)piperazin-1-yl]-2, 3-dihydroinden-1-one (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/429 of 5kgsA

query
sites
5kgsA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
|
D
P
 
P
V
 
H
D
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4xjpA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/429 of 4xjpA

query
sites
4xjpA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
|
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4xjmA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a hts lead compound
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/429 of 4xjmA

query
sites
4xjmA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
|
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
x
G
G
|
G
M
|
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
x
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
x
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4xjlA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a hts lead compound
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/429 of 4xjlA

query
sites
4xjlA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
|
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4wygA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis complexed with a fragment hit (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/429 of 4wygA

query
sites
4wygA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4wyeA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis complexed with a dsf fragment hit (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/429 of 4wyeA

query
sites
4wyeA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

4w1xA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with 1-(4-(4-(3-chlorobenzoyl) piperazin-1-yl)phenyl)ethanone (see paper)
53% identity, 95% coverage: 3:432/451 of query aligns to 1:419/429 of 4w1xA

query
sites
4w1xA
L
 
L
I
 
T
Q
 
P
R
 
E
N
 
Q
L
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
V
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
A
 
S
P
 
S
A
 
I
S
 
G
G
 
R
D
 
E
L
 
A
P
 
V
L
 
S
W
 
P
E
 
V
V
 
V
E
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
R
 
W
L
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
I
D
 
R
D
 
D
D
 
-
G
 
G
G
 
Q
R
 
P
H
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
S
 
T
V
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
R
 
G
N
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
K
 
T
R
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
R
A
 
V
F
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
G
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
D
L
 
I
V
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
I
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
Q
 
W
T
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
R
 
L
P
 
P
K
 
G
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
L
 
M
S
 
T
L
 
W
R
 
R
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
V
 
H
D
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
A
 
L
F
 
W
P
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
Q
P
 
V
P
 
P
A
 
R
A
 
D
A
 
Y
T
 
D
A
 
P
T
 
A
A
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
Y
R
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
S
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
F
 
R
A
 
F
Y
 
H
P
 
D
A
 
P
E
 
R
C
 
Y
V
 
L
R
 
H
I
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
C
D
 
R
G
 
R
H
 
Y
G
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
T
I
 
L
C
 
C
T
 
T
G
 
A
A
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
T
V
 
I
S
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
S
N
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
G
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
I
A
 
T
R
 
E
I
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
P
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
T
 
V
I
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
D
D
 
R
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
|
Y
T
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
T
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
M

Query Sequence

>WP_058929066.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058929066.1
MSLIQRNLIQRDRASLWHPYAPASGDLPLWEVEAADGVRLRLRDDDGGRHEVLDAMSSWW
SVIHGYRNPVLDAAAKRQIDAFSHVMFGGLTHGPAVELAERLLALVPSTEGRPRLERVFL
ADSGSISVEVALKLAVQFQTAAGRPKRQRFLSLRGGYHGDTFAAMGVCDPVDGMHSAFPG
MLAGNVFAPRPPAAATATAEDIGQWRAEVEELAARHSGGLAAIIAEPVLQGAGGMFAYPA
ECVRILREIADGHGLLLILDEIATGFGRTGELFAAGHAGVVPDIMCVGKALTGGYLTLAA
MICTGAVAETVSRGAAGALLHGPTFMGNPLACAVANASLGIIDGGAWRADVARIGAGLQA
GLAPARELDAVRDVRTIGAVGVIELRDSVDVTAVTAAAISHGVWVRPFRNLVYTMPPYVC
TAADVEQITAGMAAAVAEVHERIPSRSGGAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory