SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_058929091.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058929091.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

6fahB Molecular basis of the flavin-based electron-bifurcating caffeyl-coa reductase reaction (see paper)
33% identity, 98% coverage: 1:253/257 of query aligns to 1:254/262 of 6fahB

query
sites
6fahB
M
 
M
K
 
R
I
 
I
I
 
L
V
 
V
L
x
C
V
x
A
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
T
E
 
N
E
 
E
E
 
-
R
 
V
R
 
K
L
 
I
D
 
D
S
 
P
V
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
M
D
 
I
R
 
R
D
 
E
A
 
G
S
 
V
E
 
P
S
 
S
V
 
I
A
 
L
D
 
N
E
 
P
I
 
D
N
x
D
E
 
A
R
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
V
H
 
I
K
 
K
D
 
D
A
 
E
N
 
N
K
 
P
G
 
G
S
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
M
T
|
T
M
|
M
G
 
G
P
 
P
A
 
P
S
 
Q
A
 
A
T
 
S
Q
 
E
A
 
M
L
 
L
R
 
R
K
 
E
A
 
C
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
E
A
 
A
V
 
Y
H
 
L
V
 
L
E
 
S
D
 
D
D
 
R
R
 
A
L
 
F
E
 
G
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
T
A
 
W
T
 
A
T
|
T
A
 
S
A
 
A
V
 
T
L
|
L
A
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
I
Q
 
K
R
 
K
T
 
V
-
 
K
G
 
K
F
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
A
 
A
G
|
G
N
 
R
E
x
Q
S
 
A
T
 
I
D
 
D
G
|
G
R
 
D
G
x
T
G
x
A
V
 
Q
V
|
V
P
 
G
A
 
S
M
 
Q
M
 
I
A
 
A
E
 
Q
H
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
M
P
 
P
L
 
V
L
 
V
S
 
T
S
 
Y
L
 
V
N
 
E
T
 
D
L
 
I
E
 
K
L
 
I
T
 
E
G
 
D
G
 
K
T
 
K
V
 
A
A
 
I
G
 
V
E
 
H
V
 
R
T
 
Q
V
 
M
E
 
E
S
 
D
G
 
G
S
 
Y
L
 
E
A
 
V
V
 
I
S
 
E
A
 
V
A
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
C
I
 
L
V
 
L
S
 
T
V
 
C
T
 
V
E
 
K
R
 
E
S
 
L
A
 
N
E
 
D
A
 
P
R
 
R
F
 
Y
P
 
M
N
 
S
F
 
V
K
 
G
G
 
G
I
 
I
M
 
M
T
 
D
A
 
A
K
 
Y
R
 
E
K
 
Q
P
 
P
L
 
I
A
 
T
T
 
I
L
 
W
S
 
N
L
 
H
T
 
E
D
 
D
L
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
A
A
 
C
G
 
G
V
 
L
T
 
N
G
 
A
G
 
S
T
 
P
S
x
T
T
 
Q
V
 
V
L
 
F
T
 
R
I
 
S
S
 
F
E
 
S
R
 
P
P
 
P
A
 
A
R
 
K
T
 
G
A
 
G
G
 
G
K
 
E
K
 
M
I
 
I
V
 
T
D
 
-
D
 
-
G
 
G
T
 
T
A
 
T
A
 
V
R
 
N
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
G
F
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
S

4l2iB Electron transferring flavoprotein of acidaminococcus fermentans: towards a mechanism of flavin-based electron bifurcation (see paper)
34% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 1:261/263 of 4l2iB

query
sites
4l2iB
M
 
M
K
 
N
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
x
C
V
|
V
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
T
E
 
A
E
 
E
E
 
-
R
 
M
R
 
K
L
 
I
D
 
D
S
 
P
V
 
V
T
 
T
G
 
N
V
 
N
L
 
L
D
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
G
S
 
V
E
 
T
S
 
N
V
 
I
A
 
M
D
 
N
E
 
P
I
x
Y
N
x
D
E
 
Q
R
x
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
-
N
 
E
K
 
L
G
 
G
S
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
T
V
 
V
L
 
I
T
|
T
M
|
M
G
|
G
P
|
P
A
 
P
S
 
H
A
 
A
T
 
E
Q
 
S
A
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
C
L
 
L
S
 
A
M
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
E
A
 
A
V
 
K
H
 
L
V
 
V
E
x
S
D
|
D
D
 
R
R
 
A
L
 
F
E
 
G
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
x
T
A
 
L
T
 
A
T
|
T
A
 
S
A
 
A
V
 
A
L
x
M
A
 
A
A
 
N
A
 
T
V
 
I
Q
 
K
R
 
H
T
 
F
G
 
G
F
 
V
-
 
P
D
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
L
A
x
C
G
|
G
N
 
R
E
x
Q
S
x
A
T
 
I
D
 
D
G
|
G
R
 
D
G
x
T
G
x
A
V
 
Q
V
|
V
P
 
G
A
 
P
M
 
E
M
 
I
A
 
A
E
 
E
H
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
L
 
V
S
 
T
S
 
A
L
 
A
N
 
L
T
 
K
L
 
V
E
 
Q
L
 
V
T
 
K
G
 
D
G
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
V
G
 
V
E
 
D
V
 
R
T
 
D
V
 
N
E
 
E
S
 
Q
G
 
M
S
 
S
L
 
M
A
 
T
V
 
F
S
 
T
A
 
M
A
 
K
L
 
M
P
 
P
A
 
C
I
 
V
V
 
V
S
 
T
V
 
V
T
 
M
E
 
-
R
 
R
S
 
S
A
 
K
E
 
D
A
 
L
R
 
R
F
 
F
P
 
A
N
 
S
F
 
I
K
 
R
G
 
G
I
 
K
M
 
M
T
 
K
A
 
A
K
 
R
R
 
K
K
 
A
-
 
E
-
 
I
P
 
P
L
 
V
A
 
Y
T
 
T
L
 
A
S
 
A
L
 
A
T
 
L
D
 
E
L
 
I
G
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
I
V
 
G
T
 
K
G
 
A
G
 
G
T
 
S
S
 
P
T
 
T
V
 
Q
L
 
V
T
 
M
I
 
K
S
 
S
E
 
F
R
 
T
P
 
P
A
 
K
R
 
V
T
 
T
A
 
Q
G
 
V
K
 
H
-
 
G
K
 
E
I
 
I
V
 
F
D
 
D
D
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
P
G
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
D
E
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
N
F
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
E
G
 
D
R
 
K
L
 
I
I
 
I

4kpuB Electron transferring flavoprotein of acidaminococcus fermentans: towards a mechanism of flavin-based electron bifurcation (see paper)
34% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 1:261/263 of 4kpuB

query
sites
4kpuB
M
 
M
K
 
N
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
x
C
V
|
V
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
T
E
 
A
E
 
E
E
 
-
R
 
M
R
 
K
L
 
I
D
 
D
S
 
P
V
 
V
T
 
T
G
 
N
V
 
N
L
 
L
D
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
G
S
 
V
E
 
T
S
 
N
V
 
I
A
 
M
D
 
N
E
 
P
I
x
Y
N
x
D
E
 
Q
R
x
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
H
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
-
N
 
E
K
 
L
G
 
G
S
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
T
V
 
V
L
 
I
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
P
A
 
P
S
 
H
A
 
A
T
 
E
Q
 
S
A
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
C
L
 
L
S
 
A
M
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
E
A
 
A
V
 
K
H
 
L
V
 
V
E
 
S
D
 
D
D
 
R
R
 
A
L
 
F
E
 
G
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
T
A
 
L
T
 
A
T
|
T
A
 
S
A
 
A
V
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
N
A
 
T
V
 
I
Q
 
K
R
 
H
T
 
F
G
 
G
F
 
V
-
 
P
D
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
L
A
x
C
G
|
G
N
 
R
E
x
Q
S
x
A
T
 
I
D
 
D
G
|
G
R
 
D
G
x
T
G
x
A
V
 
Q
V
|
V
P
 
G
A
 
P
M
 
E
M
 
I
A
 
A
E
 
E
H
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
L
 
V
S
 
T
S
 
A
L
 
A
N
 
L
T
 
K
L
 
V
E
 
Q
L
 
V
T
 
K
G
 
D
G
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
V
G
 
V
E
 
D
V
 
R
T
 
D
V
 
N
E
 
E
S
 
Q
G
 
M
S
 
S
L
 
M
A
 
T
V
 
F
S
 
T
A
 
M
A
 
K
L
 
M
P
 
P
A
 
C
I
 
V
V
 
V
S
 
T
V
 
V
T
 
M
E
 
-
R
 
R
S
 
S
A
 
K
E
 
D
A
 
L
R
 
R
F
 
F
P
 
A
N
 
S
F
 
I
K
 
R
G
 
G
I
 
K
M
 
M
T
 
K
A
 
A
K
 
R
R
 
K
K
 
A
-
 
E
-
 
I
P
 
P
L
 
V
A
 
Y
T
 
T
L
 
A
S
 
A
L
 
A
T
 
L
D
 
E
L
 
I
G
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
I
V
 
G
T
 
K
G
 
A
G
 
G
T
 
S
S
 
P
T
 
T
V
 
Q
L
 
V
T
 
M
I
 
K
S
 
S
E
 
F
R
 
T
P
 
P
A
 
K
R
 
V
T
 
T
A
 
Q
G
 
V
K
 
H
-
 
G
K
 
E
I
 
I
V
 
F
D
 
D
D
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
P
G
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
D
E
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
N
F
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
E
G
 
D
R
 
K
L
 
I
I
 
I

5ol2B The electron transferring flavoprotein/butyryl-coa dehydrogenase complex from clostridium difficile (see paper)
31% identity, 91% coverage: 1:234/257 of query aligns to 1:236/260 of 5ol2B

query
sites
5ol2B
M
 
M
K
 
N
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
x
C
V
x
I
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
T
E
 
T
E
 
E
E
 
-
R
 
V
R
 
K
L
 
L
D
 
D
S
 
P
V
 
N
T
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
L
D
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
G
S
 
V
E
 
P
S
 
S
V
 
I
A
 
I
D
 
N
E
 
P
I
 
D
N
x
D
E
 
K
R
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
H
 
L
K
 
K
D
 
E
A
 
-
N
 
E
K
 
M
G
 
G
S
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
T
V
 
V
L
 
I
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
P
A
 
P
S
 
Q
A
 
A
T
 
D
Q
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
R
A
 
G
V
 
I
H
 
L
V
 
L
E
 
T
D
 
D
D
 
R
R
 
A
L
 
F
E
 
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
T
A
 
W
T
 
A
T
|
T
A
 
S
A
 
S
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
V
 
L
Q
 
K
R
 
N
T
 
I
G
 
D
F
 
F
D
 
D
L
 
I
V
 
I
V
 
I
A
|
A
G
|
G
N
 
R
E
 
Q
S
x
A
T
 
I
D
 
D
G
|
G
R
 
D
G
x
T
G
x
A
V
 
Q
V
|
V
P
 
G
A
 
P
M
 
Q
M
 
I
A
 
A
E
 
E
H
 
H
L
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
P
L
 
S
L
 
I
S
 
T
S
 
Y
L
 
A
N
 
E
T
 
E
L
 
I
E
 
K
L
 
T
T
 
E
G
 
G
G
 
E
T
 
Y
V
 
V
A
 
L
G
 
V
E
 
K
V
 
R
T
 
Q
V
 
F
E
 
E
S
 
D
G
 
C
S
 
C
L
 
H
A
 
D
V
 
L
S
 
K
A
 
V
A
 
K
L
 
M
P
 
P
A
 
C
I
 
L
V
 
I
S
 
T
V
 
T
T
 
L
E
 
K
R
 
D
S
 
M
A
 
N
E
 
T
A
 
P
R
 
R
F
 
Y
P
 
M
N
 
K
F
 
V
K
 
G
G
 
R
I
 
I
M
 
Y
T
 
D
A
 
A
-
 
F
K
 
E
R
 
N
K
 
D
P
 
V
L
 
V
A
 
E
T
 
T
L
 
W
S
 
T
L
 
V
T
 
K
D
 
D
L
 
I
G
 
E
L
 
V
D
 
D
A
 
P
-
 
S
-
 
N
-
 
L
G
 
G
V
 
L
T
 
K
G
 
G
G
 
S
T
 
P
S
 
T
T
 
S
V
 
V
L
 
F
T
 
K
I
 
S
S
 
F
E
 
T
R
 
K
P
 
S
A
 
V
R
 
K
T
 
P
A
 
A
G
 
G

7koeA Electron bifurcating flavoprotein fix/etfabcx (see paper)
31% identity, 97% coverage: 3:251/257 of query aligns to 4:264/282 of 7koeA

query
sites
7koeA
I
 
V
I
 
V
V
 
V
L
x
C
V
x
I
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
T
E
 
T
E
 
N
E
 
V
R
 
R
R
 
-
L
 
I
D
 
D
S
 
R
V
 
K
T
 
T
G
 
N
V
 
N
L
 
L
D
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
G
S
 
V
E
 
P
S
 
S
V
 
I
A
 
I
D
 
N
E
 
P
I
 
D
N
x
D
E
 
E
R
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
L
 
S
R
 
Q
H
 
L
K
 
K
D
 
E
A
 
K
N
 
F
K
 
-
G
 
G
S
 
A
E
 
T
V
 
V
V
 
Y
V
 
V
L
 
I
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
P
A
 
P
S
 
Q
A
 
A
T
 
K
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
K
 
D
A
 
A
L
 
I
S
 
A
M
 
F
G
 
G
A
 
L
D
 
D
S
 
E
A
 
A
V
 
V
H
 
H
V
 
L
E
 
S
D
 
D
D
 
R
R
 
T
L
 
F
E
 
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
T
A
 
L
T
 
A
T
|
T
A
 
T
A
 
Y
V
 
T
L
|
L
A
 
Y
A
 
W
A
 
G
V
 
I
Q
 
K
R
 
K
T
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
G
G
 
K
F
 
I
D
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
L
A
x
T
G
|
G
N
 
K
E
 
Q
S
x
A
T
 
V
D
 
D
G
|
G
R
 
D
G
x
T
G
|
G
V
 
Q
V
|
V
P
 
G
A
 
P
M
 
G
M
 
L
A
 
A
E
 
T
H
 
R
L
 
F
G
 
G
L
 
Y
P
 
A
L
 
L
L
 
G
S
 
A
S
 
Y
L
 
V
N
 
V
T
 
R
L
 
I
E
 
E
L
 
E
T
 
I
G
 
D
G
 
P
T
 
E
V
 
K
A
 
K
G
 
E
E
 
M
V
 
V
T
 
I
V
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
L
E
 
D
S
 
Q
G
 
G
S
 
F
L
 
E
A
 
K
V
 
I
S
 
R
A
 
L
A
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
V
V
 
L
S
 
T
V
 
I
T
 
T
E
 
D
R
 
E
S
 
L
A
 
N
E
 
K
A
 
P
R
 
R
F
 
Y
P
 
A
N
 
D
F
 
L
K
 
P
G
 
N
I
 
L
M
 
I
T
 
R
A
 
A
K
 
I
R
 
R
K
 
Y
P
 
E
L
 
P
A
 
I
T
 
V
L
 
W
S
 
T
L
 
H
T
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
K
A
 
C
G
 
G
V
 
F
T
 
F
G
 
G
G
 
S
T
 
P
S
 
T
T
 
R
V
 
V
L
 
V
T
 
S
I
 
T
S
 
N
E
 
I
R
 
P
P
 
P
A
 
A
R
 
R
T
 
K
A
 
G
G
 
G
K
 
D
K
 
I
I
 
I
V
 
S
-
 
K
-
 
N
-
 
E
D
 
D
D
 
P
G
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
I
E
 
E
F
 
A
L
 
L

7qh2B Cryo-em structure of ldh-etfab complex from acetobacterium woodii (see paper)
31% identity, 81% coverage: 2:209/257 of query aligns to 3:211/265 of 7qh2B

query
sites
7qh2B
K
 
K
I
 
I
I
 
L
V
 
V
L
x
C
V
 
I
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
G
T
 
T
E
 
S
E
 
N
E
 
-
R
 
V
R
 
E
L
 
V
D
 
D
S
 
P
V
 
E
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
G
S
 
V
E
 
E
S
 
S
V
 
K
A
 
L
D
 
N
E
 
P
I
 
Y
N
x
D
E
 
L
R
 
F
A
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
L
 
F
R
 
R
H
 
L
K
 
K
D
 
E
A
 
Q
N
 
L
K
 
G
G
 
G
S
 
T
E
 
-
V
 
I
V
 
T
V
 
T
L
 
L
T
 
S
M
|
M
G
 
G
P
 
P
A
 
M
S
 
Q
A
 
S
T
 
K
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
R
 
M
K
 
E
A
 
S
L
 
F
S
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
E
A
 
G
V
 
C
H
 
L
V
 
L
E
 
S
D
 
D
D
 
R
R
 
K
L
 
F
E
 
G
G
 
G
A
 
A
D
|
D
I
x
V
A
 
V
T
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
Y
V
 
T
L
|
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
G
V
 
T
Q
 
K
R
 
R
T
 
L
G
 
G
-
 
D
F
 
F
D
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
I
A
 
C
G
|
G
N
 
K
E
x
Q
S
x
T
T
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
D
G
x
T
G
x
A
V
 
Q
V
|
V
P
 
G
A
 
P
M
 
E
M
 
M
A
 
A
E
 
E
H
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
H
L
 
V
S
 
T
S
 
-
L
 
-
N
 
N
T
 
V
L
 
I
E
 
K
L
 
I
T
 
L
G
 
A
G
 
A
T
 
D
V
 
E
A
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
L
E
 
Q
V
 
M
T
 
N
V
 
M
E
 
E
S
 
E
G
 
S
S
 
L
L
 
E
A
 
I
V
 
Q
S
 
R
A
 
V
A
 
P
L
 
Y
P
 
P
A
 
C
I
 
L
V
 
I
S
 
T
V
 
V
T
 
D
E
 
K
R
 
D
S
 
I
A
 
Y
E
 
T
A
 
P
R
 
R
F
 
L
P
 
P
N
 
S
F
 
Y
K
 
K
G
 
R
I
 
K
M
 
L
T
 
D
A
 
I
K
 
S
R
 
K
K
 
N
P
 
P
-
 
E
L
 
I
A
 
K
T
 
I
L
 
L
S
 
T
L
 
L
T
 
K
D
 
D
L
 
M

1efpB Electron transfer flavoprotein (etf) from paracoccus denitrificans (see paper)
29% identity, 92% coverage: 1:237/257 of query aligns to 1:236/246 of 1efpB

query
sites
1efpB
M
 
M
K
 
K
I
 
V
I
 
L
V
 
V
L
x
P
V
|
V
K
 
K
Q
 
R
V
 
L
P
 
I
D
 
D
T
x
Y
E
 
N
E
 
V
E
 
K
R
 
A
R
 
R
L
 
V
D
 
K
S
 
S
V
 
D
T
 
G
G
 
S
V
 
G
L
 
V
D
 
D
R
 
L
D
 
A
A
 
N
S
 
V
E
 
K
S
 
M
V
 
S
A
 
M
D
 
N
E
 
P
I
 
F
N
x
D
E
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
H
 
L
K
 
K
D
 
E
A
 
K
N
 
G
K
 
Q
G
 
A
S
 
E
E
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
S
M
x
I
G
 
G
P
 
V
A
 
K
S
 
Q
A
 
A
T
 
A
Q
 
E
A
 
T
L
 
L
R
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
I
H
 
L
V
 
V
-
 
V
-
 
A
E
 
A
D
 
D
D
 
D
R
 
V
L
 
Q
E
 
Q
G
 
D
A
 
I
D
 
E
I
 
P
A
 
L
T
 
A
T
x
V
A
 
A
A
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
R
R
 
A
T
 
E
G
 
G
F
 
T
D
 
E
L
 
L
V
 
I
V
 
I
A
|
A
G
|
G
N
 
K
E
x
Q
S
x
A
T
 
I
D
 
D
G
x
N
R
 
D
G
x
M
G
x
N
V
 
A
V
x
T
P
 
G
A
 
Q
M
 
M
M
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
W
P
 
A
L
 
Q
L
 
A
S
 
T
S
 
F
L
 
A
N
 
S
T
 
K
L
 
V
E
 
E
L
 
I
T
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
K
V
 
A
A
 
K
G
 
V
E
 
T
V
 
R
T
 
E
V
 
V
E
 
D
S
 
G
G
 
G
S
 
L
L
 
Q
A
 
T
V
 
I
S
 
A
A
 
V
A
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
V
 
A
T
 
D
E
x
L
R
 
R
S
 
L
A
 
N
E
 
E
A
 
P
R
 
R
F
 
Y
P
 
A
N
 
S
F
 
L
K
 
P
G
 
N
I
 
I
M
 
M
T
 
K
A
 
A
K
 
K
R
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
D
T
 
E
L
 
K
S
 
T
L
 
A
T
 
A
D
 
D
L
 
Y
G
 
G
L
 
V
D
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
V
G
 
A
G
 
P
T
 
R
S
 
L
T
 
E
V
 
V
L
 
V
T
 
S
I
 
V
S
 
R
E
 
E
R
 
P
P
 
E
A
 
G
R
 
R
T
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
I
K
 
K
I
 
V

2a1uB Crystal structure of the human etf e165betaa mutant (see paper)
31% identity, 92% coverage: 1:237/257 of query aligns to 1:236/252 of 2a1uB

query
sites
2a1uB
M
 
L
K
 
R
I
 
V
I
 
L
V
 
V
L
x
A
V
|
V
K
|
K
Q
 
R
V
 
V
P
 
I
D
 
D
T
 
Y
E
 
A
E
 
V
E
 
K
R
 
I
R
 
R
L
 
V
D
 
K
S
 
P
-
 
D
V
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
V
D
 
T
R
 
-
D
 
D
A
 
G
S
 
V
E
 
K
S
 
H
V
 
S
A
 
M
D
 
N
E
x
P
I
 
F
N
x
C
E
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
R
H
 
L
K
 
K
D
 
E
A
 
K
N
 
K
K
 
L
G
 
V
S
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
S
M
x
C
G
 
G
P
 
P
A
 
A
S
 
Q
A
 
C
T
 
Q
Q
 
E
A
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
R
A
 
G
V
 
I
H
 
H
V
 
V
E
 
E
D
 
V
D
 
P
R
 
P
L
 
A
E
 
E
G
 
A
A
 
E
D
 
R
I
 
L
A
 
G
-
 
P
-
 
L
T
 
Q
T
x
V
A
 
A
A
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
A
Q
 
E
R
 
K
T
 
E
G
 
K
F
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
A
x
L
G
|
G
N
 
K
E
x
Q
S
x
A
T
 
I
D
 
D
G
x
D
R
 
D
G
x
C
G
x
N
V
x
Q
V
x
T
P
 
G
A
 
Q
M
 
M
M
 
T
A
 
A
E
 
G
H
 
F
L
 
L
G
 
D
L
 
W
P
 
P
L
 
Q
L
 
G
S
 
T
S
 
F
L
 
A
N
 
S
T
 
Q
L
 
V
E
 
T
L
 
L
T
 
E
G
 
G
G
 
D
T
 
K
V
 
L
A
 
K
G
 
V
E
 
E
V
 
R
T
 
A
V
 
I
E
 
D
S
 
G
G
 
G
S
 
L
L
 
E
A
 
T
V
 
L
S
 
R
A
 
L
A
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
V
 
A
T
 
D
E
x
L
R
 
R
S
 
L
A
 
N
E
 
E
A
 
P
R
 
R
F
 
Y
P
 
A
N
 
T
F
 
L
K
 
P
G
 
N
I
 
I
M
 
M
T
 
K
A
 
A
K
 
K
R
 
K
K
 
K
P
 
K
L
 
I
A
 
E
T
 
V
L
 
I
S
 
K
L
 
P
T
 
G
D
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
L
T
 
T
G
 
S
G
 
K
T
 
L
S
 
S
T
 
-
V
 
V
L
 
I
T
 
S
I
 
V
S
 
E
E
 
D
R
 
P
P
 
P
A
 
Q
R
 
R
T
 
T
A
 
A
G
 
G
K
 
V
K
 
K
I
 
V

P38117 Electron transfer flavoprotein subunit beta; Beta-ETF from Homo sapiens (Human) (see 10 papers)
31% identity, 92% coverage: 1:237/257 of query aligns to 4:239/255 of P38117

query
sites
P38117
M
 
L
K
 
R
I
 
V
I
 
L
V
 
V
L
x
A
V
 
V
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
P
 
I
D
 
D
T
 
Y
E
 
A
E
 
V
E
 
K
R
 
I
R
 
R
L
 
V
D
 
K
S
 
P
-
 
D
V
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
V
D
 
T
R
 
-
D
 
D
A
 
G
S
 
V
E
 
K
S
 
H
V
 
S
A
 
M
D
x
N
E
x
P
I
x
F
N
x
C
E
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
R
H
 
L
K
 
K
D
 
E
A
 
K
N
 
K
K
 
L
G
 
V
S
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
S
M
x
C
G
 
G
P
 
P
A
 
A
S
 
Q
A
 
C
T
 
Q
Q
 
E
A
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
R
A
 
G
V
 
I
H
 
H
V
 
V
E
 
E
D
 
V
D
 
P
R
 
P
L
 
A
E
 
E
G
 
A
A
 
E
D
 
R
I
 
L
A
 
G
-
 
P
-
 
L
T
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
A
Q
 
E
R
 
K
T
 
E
G
 
K
F
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
A
 
L
G
|
G
N
x
K
E
x
Q
S
x
A
T
x
I
D
|
D
G
x
D
R
x
D
G
x
C
G
x
N
V
x
Q
V
x
T
P
 
G
A
 
Q
M
 
M
M
 
T
A
 
A
E
 
G
H
 
F
L
 
L
G
 
D
L
 
W
P
 
P
L
 
Q
L
 
G
S
 
T
S
 
F
L
 
A
N
 
S
T
 
Q
L
 
V
E
x
T
L
 
L
T
 
E
G
 
G
G
 
D
T
 
K
V
 
L
A
 
K
G
 
V
E
 
E
V
x
R
T
x
E
V
 
I
E
 
D
S
 
G
G
 
G
S
 
L
L
 
E
A
 
T
V
 
L
S
 
R
A
 
L
A
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
V
x
A
T
x
D
E
x
L
R
|
R
S
x
L
A
x
N
E
|
E
A
x
P
R
|
R
F
x
Y
P
x
A
N
x
T
F
x
L
K
x
P
G
x
N
I
|
I
M
|
M
T
x
K
A
|
A
K
|
K
R
x
K
K
|
K
P
x
K
L
 
I
A
 
E
T
 
V
L
 
I
S
 
K
L
 
P
T
 
G
D
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
L
T
 
T
G
 
S
G
 
K
T
 
L
S
 
S
T
 
-
V
 
V
L
 
I
T
 
S
I
 
V
S
 
E
E
 
D
R
 
P
P
 
P
A
 
Q
R
 
R
T
 
T
A
 
A
G
 
G
K
 
V
K
 
K
I
 
V

Q2TBV3 Electron transfer flavoprotein subunit beta; Beta-ETF from Bos taurus (Bovine) (see paper)
30% identity, 92% coverage: 1:237/257 of query aligns to 4:239/255 of Q2TBV3

query
sites
Q2TBV3
M
 
L
K
 
R
I
 
A
I
 
L
V
 
V
L
 
A
V
 
V
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
P
 
I
D
 
D
T
 
F
E
 
A
E
 
V
E
 
K
R
 
I
R
 
R
L
 
V
D
 
K
-
 
P
S
 
D
V
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
V
D
 
T
R
 
-
D
 
D
A
 
G
S
 
V
E
 
K
S
 
H
V
 
S
A
 
M
D
 
N
E
 
P
I
 
F
N
 
C
E
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
R
H
 
L
K
 
K
D
 
E
A
 
K
N
 
K
K
 
L
G
 
V
S
 
K
E
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
S
M
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
A
S
 
Q
A
 
C
T
 
Q
Q
 
E
A
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
R
A
 
G
V
 
I
H
 
H
V
 
V
E
 
E
D
 
V
D
 
P
R
 
A
L
 
A
E
 
E
G
 
A
A
 
N
D
 
H
I
 
L
A
 
G
-
 
P
-
 
L
T
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
A
Q
 
E
R
 
K
T
 
E
G
 
K
F
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
A
 
L
G
 
G
N
 
K
E
 
Q
S
 
A
T
 
I
D
 
D
G
 
D
R
 
D
G
 
C
G
 
N
V
 
Q
V
 
T
P
 
G
A
 
Q
M
 
M
M
 
T
A
 
A
E
 
G
H
 
F
L
 
L
G
 
D
L
 
W
P
 
P
L
 
Q
L
 
G
S
 
T
S
 
F
L
 
A
N
 
S
T
 
Q
L
 
V
E
 
T
L
 
L
T
 
E
G
 
G
G
 
D
T
 
K
V
 
I
A
 
K
G
 
V
E
 
E
V
 
R
T
 
E
V
 
I
E
 
D
S
 
G
G
 
G
S
 
L
L
 
E
A
 
T
V
 
L
S
 
R
A
 
L
A
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
V
 
A
T
 
D
E
 
L
R
 
R
S
 
L
A
 
N
E
 
E
A
 
P
R
 
R
F
 
Y
P
 
A
N
 
T
F
 
L
K
 
P
G
 
N
I
 
I
M
 
M
T
x
K
A
 
A
K
 
K
R
x
K
K
 
K
P
 
K
L
 
I
A
 
E
T
 
V
L
 
I
S
 
K
L
 
A
T
 
G
D
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
L
T
 
T
G
 
S
G
 
K
T
 
L
S
 
S
T
 
-
V
 
V
L
 
I
T
 
S
I
 
V
S
 
E
E
 
D
R
 
P
P
 
P
A
 
Q
R
 
R
T
 
T
A
 
A
G
 
G
K
 
V
K
 
K
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Q9DCW4 Electron transfer flavoprotein subunit beta; Beta-ETF from Mus musculus (Mouse) (see paper)
29% identity, 92% coverage: 1:237/257 of query aligns to 4:239/255 of Q9DCW4

query
sites
Q9DCW4
M
 
L
K
 
R
I
 
A
I
 
L
V
 
V
L
 
A
V
 
V
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
P
 
I
D
 
D
T
 
F
E
 
A
E
 
V
E
 
K
R
 
I
R
 
R
L
 
V
D
 
K
S
 
P
V
 
D
T
 
K
G
 
S
V
 
G
L
 
V
D
 
V
R
 
T
D
 
D
A
 
G
S
 
V
E
 
K
S
 
H
V
 
S
A
 
M
D
 
N
E
 
P
I
 
F
N
 
C
E
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
R
H
 
L
K
 
K
D
 
E
A
 
K
N
 
K
K
 
L
G
 
V
S
 
K
E
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
S
M
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
S
S
 
Q
A
 
C
T
 
Q
Q
 
E
A
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
R
A
 
G
V
 
I
H
 
H
V
 
V
E
 
E
D
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
I
 
A
A
 
E
T
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
A
Q
 
E
R
 
K
T
 
E
G
 
K
F
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
F
A
 
L
G
 
G
N
 
K
E
 
Q
S
 
A
T
 
I
D
 
D
G
 
D
R
 
D
G
 
C
G
 
N
V
 
Q
V
 
T
P
 
G
A
 
Q
M
 
M
M
 
T
A
 
A
E
 
G
H
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
W
P
 
P
L
 
Q
L
 
G
S
 
T
S
 
F
L
 
A
N
 
S
T
 
Q
L
 
V
E
 
T
L
 
L
T
 
E
G
 
G
G
 
D
T
 
K
V
 
V
A
 
K
G
 
V
E
 
E
V
 
R
T
 
E
V
 
I
E
 
D
S
 
G
G
 
G
S
 
L
L
 
E
A
 
T
V
 
L
S
 
R
A
 
L
A
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
V
 
A
T
 
D
E
 
L
R
 
R
S
 
L
A
 
N
E
 
E
A
 
P
R
 
R
F
 
Y
P
 
A
N
 
T
F
 
L
K
 
P
G
 
N
I
 
I
M
 
M
T
x
K
A
 
A
K
 
K
R
x
K
K
 
K
P
 
K
L
 
I
A
 
E
T
 
V
L
 
V
S
 
K
L
 
A
T
 
G
D
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
L
T
 
T
G
 
S
G
 
K
T
 
V
S
 
S
T
 
-
V
 
V
L
 
I
T
 
S
I
 
V
S
 
E
E
 
E
R
 
P
P
 
P
A
 
Q
R
 
R
T
 
S
A
 
A
G
 
G
K
 
V
K
 
K
I
 
V

Sites not aligning to the query:

P53570 Electron transfer flavoprotein subunit beta; Beta-ETF; Electron transfer flavoprotein small subunit; ETFSS from Methylophilus methylotrophus (Bacterium W3A1) (see paper)
28% identity, 98% coverage: 1:251/257 of query aligns to 1:255/264 of P53570

query
sites
P53570
M
 
M
K
 
K
I
 
I
I
 
L
V
 
V
L
x
A
V
 
V
K
 
K
Q
 
Q
V
 
T
P
 
A
D
 
A
T
 
L
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
F
R
 
E
L
 
I
D
 
R
S
 
E
V
 
D
T
 
G
G
 
M
V
 
D
L
 
V
D
 
D
R
 
E
D
 
D
A
 
F
S
 
M
E
 
M
S
 
Y
V
 
D
A
 
L
D
x
N
E
|
E
I
x
W
N
x
D
E
 
D
R
 
F
A
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
M
R
 
K
H
 
I
K
 
K
D
 
E
A
 
S
-
 
S
N
 
D
K
 
T
G
 
D
S
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
T
 
S
M
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
D
S
 
R
A
 
V
T
 
D
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
C
L
 
L
S
 
A
M
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
H
 
R
V
 
V
E
 
W
D
 
D
D
 
D
R
 
A
L
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
I
 
A
A
 
I
T
 
V
T
 
V
A
 
G
A
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
T
A
 
E
A
 
V
V
 
I
Q
 
K
R
 
K
T
 
E
G
 
A
F
 
P
D
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
F
A
 
A
G
|
G
N
x
V
E
x
Q
S
|
S
T
 
S
D
 
D
G
 
Q
R
 
A
G
x
Y
G
x
A
V
x
S
V
x
T
P
 
G
A
 
I
M
 
S
M
 
V
A
 
A
E
 
S
H
 
Y
L
 
L
G
 
N
L
 
W
P
 
P
L
 
H
L
 
A
S
 
A
S
 
V
L
 
V
N
 
A
T
 
D
L
 
L
E
 
Q
L
 
Y
T
 
K
G
 
P
G
 
G
T
 
D
V
 
N
A
 
K
G
 
A
E
 
V
V
 
I
-
 
R
-
 
R
T
 
E
V
 
L
E
 
E
S
 
G
G
 
G
S
 
M
L
 
L
A
 
Q
-
 
E
V
 
V
S
 
E
A
 
I
A
 
N
L
 
C
P
 
P
A
 
A
I
 
V
V
 
L
S
 
T
V
 
I
T
 
Q
E
 
L
R
 
G
S
 
I
A
 
N
E
 
K
A
 
P
R
 
R
F
 
Y
P
 
A
N
 
S
F
 
L
K
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
K
T
 
Q
A
 
A
K
 
A
R
 
T
K
 
K
P
 
P
L
 
I
A
 
E
T
 
E
L
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
A
D
 
D
L
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
S
A
 
A
G
 
N
V
 
D
T
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
A
S
 
Q
T
 
S
V
 
M
L
 
S
T
 
R
I
 
V
S
 
R
E
 
R
R
 
M
P
 
Y
A
 
I
R
 
P
T
 
E
A
 
K
G
 
G
K
 
R
K
 
A
I
 
T
V
 
M
D
 
I
D
 
E
G
 
G
T
 
T
A
 
I
A
 
S
R
 
E
E
 
Q
L
 
A
A
 
A
E
 
K
F
 
I
L
 
I

1o96A Structure of electron transferring flavoprotein for methylophilus methylotrophus. (see paper)
29% identity, 98% coverage: 1:251/257 of query aligns to 1:254/261 of 1o96A

query
sites
1o96A
M
 
M
K
 
K
I
 
I
I
 
L
V
 
V
L
x
A
V
|
V
K
|
K
Q
 
Q
V
 
T
P
 
A
D
 
A
T
 
L
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
F
R
 
E
L
 
I
D
 
R
S
 
D
V
 
G
T
 
M
G
 
D
V
 
V
L
 
-
D
 
D
R
 
E
D
 
D
A
 
F
S
 
M
E
 
M
S
 
Y
V
 
D
A
 
L
D
 
N
E
 
E
I
 
W
N
x
D
E
 
D
R
 
F
A
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
M
R
 
K
H
 
I
K
 
K
D
 
E
A
 
S
-
 
S
N
 
D
K
 
T
G
 
D
S
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
T
 
S
M
x
V
G
 
G
P
 
P
A
 
D
S
 
R
A
 
V
T
 
D
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
C
L
 
L
S
 
A
M
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
H
 
R
V
 
V
E
 
W
D
 
D
D
 
D
R
 
A
L
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
I
 
A
A
 
I
T
 
V
T
x
V
A
 
G
A
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
T
A
 
E
A
 
V
V
 
I
Q
 
K
R
 
K
T
 
E
G
 
A
F
 
P
D
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
F
A
|
A
G
|
G
N
 
V
E
x
Q
S
|
S
T
 
S
D
 
D
G
 
Q
R
 
A
G
x
Y
G
x
A
V
 
S
V
x
T
P
 
G
A
 
I
M
 
S
M
 
V
A
 
A
E
 
S
H
 
Y
L
 
L
G
 
N
L
 
W
P
 
P
L
 
H
L
 
A
S
 
A
S
 
V
L
 
V
N
 
A
T
 
D
L
 
L
E
 
Q
L
 
Y
T
 
K
G
 
P
G
 
G
T
 
D
V
 
N
A
 
K
G
 
A
E
 
V
V
 
I
-
 
R
-
 
R
T
 
E
V
 
L
E
 
E
S
 
G
G
 
G
S
 
M
L
 
L
A
 
Q
-
 
E
V
 
V
S
 
E
A
 
I
A
 
N
L
 
C
P
 
P
A
 
A
I
 
V
V
 
L
S
 
T
V
 
I
T
x
Q
E
 
L
R
 
G
S
 
I
A
 
N
E
 
K
A
 
P
R
 
R
F
 
Y
P
 
A
N
 
S
F
 
L
K
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
K
T
 
Q
A
 
A
K
 
A
R
 
T
K
 
K
P
 
P
L
 
I
A
 
E
T
 
E
L
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
A
D
 
D
L
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
S
A
 
A
G
 
N
V
 
D
T
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
A
S
 
Q
T
 
S
V
 
M
L
 
S
T
 
R
I
 
V
S
 
R
E
 
R
R
 
M
P
 
Y
A
 
I
R
 
P
T
 
E
A
 
K
G
 
G
K
 
R
K
 
A
I
 
T
V
 
M
D
 
I
D
 
E
G
 
G
T
 
T
A
 
I
A
 
S
R
 
E
E
 
Q
L
 
A
A
 
A
E
 
K
F
 
I
L
 
I

5ow0B Crystal structure of an electron transfer flavoprotein from geobacter metallireducens (see paper)
33% identity, 79% coverage: 1:204/257 of query aligns to 1:202/251 of 5ow0B

query
sites
5ow0B
M
 
M
K
 
Q
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
|
L
V
x
A
K
|
K
Q
 
V
V
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
Y
E
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
N
-
 
R
E
 
A
E
 
H
R
 
P
R
 
R
L
 
Y
D
 
T
S
 
R
V
 
M
T
 
I
G
 
G
V
x
L
L
x
Y
D
|
D
R
 
E
D
 
N
A
 
A
S
 
V
E
 
E
S
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
N
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
R
 
K
H
 
E
K
 
K
D
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
L
G
 
G
S
 
A
E
 
D
V
 
L
V
 
T
V
 
V
L
 
V
T
 
S
M
x
Y
G
 
G
P
 
R
A
 
N
S
 
D
A
 
D
T
 
V
Q
 
Q
A
 
F
L
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
K
A
 
V
V
 
V
H
 
L
V
 
V
E
 
E
D
 
G
D
 
D
R
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
S
A
 
D
D
 
D
I
 
P
A
 
Y
T
 
V
T
x
I
A
 
A
A
 
A
V
 
N
L
 
L
A
 
K
A
 
D
A
 
A
V
 
I
Q
 
D
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
-
 
T
F
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
L
A
|
A
G
|
G
N
 
R
E
x
Q
S
|
S
T
 
S
D
 
D
G
 
M
R
 
D
G
x
R
G
|
G
V
|
V
V
|
V
P
|
P
A
 
G
M
 
V
M
 
L
A
 
A
E
 
G
H
 
M
L
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
F
L
 
V
S
 
P
S
 
Q
L
 
A
N
 
C
T
 
S
L
 
V
E
 
E
-
 
S
L
 
V
T
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
W
V
 
K
A
 
I
G
 
S
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
V
 
-
E
 
E
S
 
T
G
 
G
S
 
K
L
 
R
A
 
L
V
 
L
S
 
K
A
 
L
A
 
S
L
 
G
P
 
K
A
 
G
I
 
V
V
 
L
S
 
S
V
 
I
T
 
T
E
 
S
R
 
V
S
 
P
A
 
E
E
 
N
A
 
V
-
 
P
R
 
R
F
 
I
P
 
P
N
 
A
F
 
V
K
 
K
G
 
A
I
 
I
M
 
F
T
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
A
 
E
T
 
K
L
 
L

Query Sequence

>WP_058929091.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058929091.1
MKIIVLVKQVPDTEEERRLDSVTGVLDRDASESVADEINERALEVALRHKDANKGSEVVV
LTMGPASATQALRKALSMGADSAVHVEDDRLEGADIATTAAVLAAAVQRTGFDLVVAGNE
STDGRGGVVPAMMAEHLGLPLLSSLNTLELTGGTVAGEVTVESGSLAVSAALPAIVSVTE
RSAEARFPNFKGIMTAKRKPLATLSLTDLGLDAGVTGGTSTVLTISERPARTAGKKIVDD
GTAARELAEFLVAGRLI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory