SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_058929092.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058929092.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9L9F8 Short-chain reductase protein NovJ; Novobiocin biosynthesis protein J; EC 1.1.1.- from Streptomyces niveus (Streptomyces spheroides) (see paper)
47% identity, 96% coverage: 9:250/253 of query aligns to 19:260/262 of Q9L9F8

query
sites
Q9L9F8
A
 
A
I
 
M
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
A
D
 
E
G
 
G
F
 
M
A
 
A
V
 
V
A
 
I
V
 
V
L
 
V
D
 
D
L
 
R
D
 
T
K
 
E
S
 
Q
A
 
D
C
 
T
E
 
R
P
 
A
L
 
T
V
 
V
S
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
R
S
 
T
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
R
A
 
G
V
 
I
G
 
G
A
 
C
D
 
D
V
 
V
S
 
A
D
 
V
E
 
A
R
 
Q
S
 
A
V
 
V
A
 
T
Q
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
A
Q
 
T
V
 
A
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
R
P
 
I
L
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
N
R
 
R
D
 
D
N
 
R
L
 
L
L
 
L
F
 
L
K
 
T
M
 
M
T
 
G
T
 
D
A
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
T
 
T
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
H
 
N
L
 
L
R
 
G
G
 
G
S
 
T
F
 
M
L
 
R
M
 
C
S
 
S
R
 
F
A
 
A
A
 
V
Q
 
G
V
 
R
H
 
H
M
 
M
T
 
R
D
 
R
A
 
Q
G
 
G
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
F
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
A
A
 
A
L
 
R
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
I
Q
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
P
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
V
E
 
A
T
 
T
D
 
P
M
 
M
T
 
V
A
 
D
A
 
E
T
 
L
A
 
A
K
 
E
R
 
R
V
 
L
G
 
G
V
 
G
P
 
D
F
 
R
E
 
D
E
 
S
Y
 
V
K
 
M
A
 
S
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
S
I
 
S
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
R
 
R
V
 
I
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
S
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
T
V
 
V
S
 
V
F
 
F
F
 
V
A
 
A
R
 
R
D
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
G
F
 
Y
V
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
V
Y
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
42% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 6:240/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
R
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
Q
L
 
L
S
 
I
R
 
Q
D
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
V
 
V
A
 
V
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
K
 
E
S
 
S
A
 
G
C
 
A
E
 
Q
P
 
K
L
 
L
V
 
T
S
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
D
S
 
S
A
 
F
G
 
G
G
 
E
R
 
Q
A
 
G
L
 
A
A
 
G
V
 
L
G
 
A
A
x
L
D
|
D
V
|
V
S
 
R
D
 
N
E
 
L
R
 
D
S
 
E
V
 
I
A
 
E
Q
 
A
A
 
V
V
 
V
E
 
S
Q
 
H
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
Q
 
N
L
 
Y
G
 
G
A
 
P
P
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
S
T
 
E
A
 
D
D
 
D
W
 
W
D
 
D
T
 
D
V
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
I
H
 
H
L
 
L
R
 
K
G
 
A
S
 
V
F
 
Y
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
R
A
 
V
Q
 
L
V
 
K
H
 
G
M
 
M
T
 
T
D
 
K
A
 
A
G
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
A
 
A
-
 
H
L
 
F
G
 
A
N
 
N
R
 
P
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
T
 
S
K
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
G
R
 
S
Y
 
R
G
 
Q
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
A
T
 
T
D
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
D
A
 
A
T
 
L
A
 
S
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
E
E
 
D
Y
 
I
K
 
R
A
 
K
A
 
K
A
 
M
A
 
S
R
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
V
 
L
Q
 
N
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
S
 
Q
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
S
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
G
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
42% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 6:240/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
R
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
Q
L
 
L
S
 
I
R
 
Q
D
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
V
 
V
A
 
V
V
 
G
L
 
T
D
x
A
L
x
T
D
 
S
K
 
E
S
 
S
A
 
G
C
 
A
E
 
Q
P
 
K
L
 
L
V
 
T
S
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
D
S
 
S
A
 
F
G
 
G
G
 
E
R
 
Q
A
 
G
L
 
A
A
 
G
V
 
L
G
 
A
A
x
L
D
|
D
V
|
V
S
 
R
D
 
N
E
 
L
R
 
D
S
 
E
V
 
I
A
 
E
Q
 
A
A
 
V
V
 
V
E
 
S
Q
 
H
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
Q
 
N
L
 
Y
G
 
G
A
 
P
P
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
S
T
 
E
A
 
D
D
 
D
W
 
W
D
 
D
T
 
D
V
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
I
H
 
H
L
 
L
R
 
K
G
 
A
S
 
V
F
 
Y
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
R
A
 
V
Q
 
L
V
 
K
H
 
G
M
 
M
T
 
T
D
 
K
A
 
A
G
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
|
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
A
 
A
-
 
H
L
 
F
G
 
A
N
 
N
R
 
P
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
T
 
S
K
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
G
R
 
S
Y
 
R
G
 
Q
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
 
T
D
 
E
M
|
M
T
 
T
A
 
D
A
 
A
T
 
L
A
 
S
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
E
E
 
D
Y
 
I
K
 
R
A
 
K
A
 
K
A
 
M
A
 
S
R
 
D
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
V
 
L
Q
 
N
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
S
 
Q
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
S
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
G
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
44% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 9:244/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
R
 
K
T
 
T
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
F
A
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
V
L
 
L
S
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
F
 
A
A
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
R
D
 
D
K
 
A
S
 
H
A
 
G
C
 
-
E
 
E
P
 
A
L
 
A
V
 
A
S
 
A
E
 
S
I
 
L
E
 
R
S
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
F
V
 
I
G
 
S
A
x
C
D
 
N
V
x
I
S
 
A
D
 
E
E
 
K
R
 
T
S
 
Q
V
 
V
A
 
E
Q
 
A
A
 
L
V
 
F
E
 
S
Q
 
Q
V
 
A
A
 
E
E
 
E
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
P
P
 
V
L
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
T
 
N
R
 
R
D
 
D
N
 
A
L
 
M
L
 
L
F
 
H
K
 
K
M
 
L
T
 
T
T
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
T
 
T
V
 
V
M
 
I
N
 
D
V
|
V
H
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
M
R
 
Q
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
V
 
I
H
 
R
M
 
M
T
 
R
D
 
E
A
 
R
G
 
G
W
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
A
S
 
S
A
 
W
L
 
L
G
 
G
N
 
N
R
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
Q
 
V
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
C
I
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
D
T
|
T
D
 
D
M
 
M
T
|
T
A
 
R
A
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
E
E
 
N
E
 
V
Y
 
W
K
 
Q
A
 
I
A
 
M
A
 
V
A
 
S
R
 
K
E
 
-
I
 
I
A
 
P
V
 
A
Q
 
G
R
 
Y
V
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
S
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
G
S
 
E
A
 
C
V
 
V
S
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
R
F
 
Y
V
 
I
S
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
I
Y
 
N
V
 
V
A
 
G
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
44% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 5:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
R
 
K
T
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
Q
L
 
L
S
 
A
R
 
E
D
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
-
 
N
L
 
Y
D
 
A
L
 
G
D
 
S
K
 
K
S
 
E
A
 
K
C
 
A
E
 
E
P
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
K
S
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
D
A
 
S
L
 
F
A
 
A
V
 
I
G
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
S
 
A
D
 
D
E
 
A
R
 
D
S
 
E
V
 
V
A
 
K
Q
 
A
A
 
M
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
S
Q
 
Q
L
 
F
G
 
G
A
 
S
P
 
L
L
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
T
 
E
A
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
T
 
D
V
 
V
M
 
I
N
 
D
V
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
N
M
 
C
S
 
I
R
 
Q
A
 
K
A
 
A
Q
 
T
V
 
P
H
 
Q
M
 
M
T
 
L
D
 
R
A
 
Q
G
 
R
W
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
|
S
-
 
V
I
 
V
S
 
G
A
 
A
L
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
P
G
 
G
Q
|
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
Q
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
D
A
 
A
T
 
L
A
 
S
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
D
E
 
E
Y
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
Q
A
 
M
A
 
L
R
 
T
E
 
Q
I
 
I
A
 
P
V
 
L
Q
 
A
R
 
R
V
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
S
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
K
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
I
Y
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
44% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 13:250/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
R
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
L
S
 
G
R
 
R
D
 
L
G
 
G
F
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
K
 
A
S
 
S
A
 
G
C
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
I
V
 
A
S
 
E
E
 
T
I
 
L
E
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
G
L
 
A
A
 
G
V
 
L
G
 
V
A
x
L
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
S
E
 
D
R
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
A
 
T
V
 
L
E
 
E
Q
 
H
V
 
I
A
 
Q
E
 
Q
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
V
K
 
R
M
 
M
T
 
K
T
 
D
A
 
D
D
 
E
W
 
W
D
 
F
T
 
D
V
 
V
M
 
V
N
 
N
V
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
N
G
 
S
S
 
L
F
 
Y
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
L
V
 
R
H
 
G
M
 
M
T
 
T
D
 
K
A
 
A
G
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
G
S
|
S
-
 
V
I
 
V
S
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
R
 
S
Y
 
R
G
 
A
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
|
F
I
|
I
E
 
D
T
|
T
D
 
D
M
|
M
T
|
T
A
 
R
A
 
E
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
L
P
 
P
F
 
-
E
 
E
E
 
A
Y
 
Q
K
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
I
 
I
A
 
P
V
 
L
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
S
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
K
A
 
V
V
 
V
S
 
G
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
I
 
V
Y
 
P
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
44% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 2:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
R
 
K
T
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
Q
L
 
L
S
 
A
R
 
E
D
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
-
x
N
L
x
Y
D
x
A
L
x
G
D
x
S
K
 
K
S
 
E
A
 
K
C
 
A
E
 
E
P
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
K
S
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
D
A
 
S
L
 
F
A
 
A
V
 
I
G
 
Q
A
|
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
D
 
D
E
 
A
R
 
D
S
 
E
V
 
V
A
 
K
Q
 
A
A
 
M
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
S
Q
 
Q
L
 
F
G
 
G
A
 
S
P
 
L
L
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
T
 
E
A
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
T
 
D
V
 
V
M
 
I
N
 
D
V
x
T
H
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
N
M
 
C
S
 
I
R
 
Q
A
 
K
A
 
A
Q
 
T
V
 
P
H
 
Q
M
 
M
T
 
L
D
 
R
A
 
Q
G
 
R
W
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
|
S
-
 
V
I
 
V
S
 
G
A
 
A
L
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
P
G
 
G
Q
|
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
Q
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
D
E
 
E
Y
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
Q
A
 
M
A
 
L
R
 
T
E
 
Q
I
 
I
A
 
P
V
 
L
Q
 
A
R
 
R
V
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
S
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
K
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
I
Y
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4bo4C Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-methoxyphenyl)-3,4- dihydro-2h-quinoline-1-carboxamide at 2.7a resolution (see paper)
43% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 19:251/255 of 4bo4C

query
sites
4bo4C
R
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
L
S
 
G
R
 
R
D
 
L
G
 
G
F
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
 
T
D
 
S
K
 
A
S
 
S
A
 
G
C
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
I
V
 
A
S
 
E
E
 
T
I
 
L
E
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
G
L
 
A
A
 
G
V
 
L
G
 
V
A
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
D
 
S
E
 
D
R
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
A
 
T
V
 
L
E
 
E
Q
 
H
V
 
I
A
 
Q
E
 
Q
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
V
K
 
R
M
 
M
T
 
K
T
 
D
A
 
D
D
 
E
W
 
W
D
 
F
T
 
D
V
 
V
M
x
V
N
 
N
V
 
T
H
 
N
L
|
L
R
 
N
G
 
S
S
 
L
F
 
Y
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
L
V
 
R
H
 
G
M
 
M
T
 
T
D
 
K
A
 
A
G
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
S
 
V
A
 
G
L
 
-
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
Q
 
E
G
|
G
F
|
F
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
R
 
S
Y
 
R
G
 
A
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
E
E
 
A
Y
 
Q
K
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
I
 
I
A
 
P
V
 
L
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
S
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
K
A
 
V
V
 
V
S
 
G
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
I
 
V
Y
 
P
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
42% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 6:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
R
 
R
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
R
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
V
 
T
A
 
A
R
 
L
R
 
R
L
 
F
S
 
A
R
 
E
D
 
Q
G
 
G
F
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
N
D
|
D
L
 
I
D
 
D
K
 
A
S
 
E
A
 
K
C
 
V
E
 
R
P
 
A
L
 
T
V
 
V
S
 
D
E
 
E
I
 
F
E
 
S
S
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
R
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
G
V
 
A
G
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
G
D
 
N
E
 
K
R
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
D
Q
 
G
A
 
M
V
 
V
E
 
K
Q
 
Q
V
 
T
A
 
I
E
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
R
P
 
I
L
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
M
T
 
E
R
 
R
D
 
A
N
 
G
L
 
A
L
 
L
F
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
S
T
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
T
 
V
V
 
T
M
 
I
N
 
N
V
 
V
H
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
Q
 
H
V
 
G
H
 
H
M
 
M
T
 
V
D
 
E
A
 
N
G
 
K
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
R
S
 
A
A
 
W
L
 
L
G
 
G
N
 
G
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
Q
 
V
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
 
I
E
 
H
T
 
T
D
 
P
M
 
M
T
 
W
A
 
D
A
 
E
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
L
P
 
P
F
 
E
E
 
K
E
 
D
Y
 
Q
K
 
Q
A
 
F
A
 
L
A
 
L
A
 
S
R
 
R
E
 
Q
I
 
-
A
 
P
V
 
T
Q
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
S
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
V
 
L
S
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
F
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
42% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 5:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
R
 
R
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
R
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
V
 
T
A
 
A
R
 
L
R
 
R
L
 
F
S
 
A
R
 
E
D
 
Q
G
 
G
F
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
N
D
|
D
L
x
I
D
 
D
K
 
A
S
 
E
A
 
K
C
 
V
E
 
R
P
 
A
L
 
T
V
 
V
S
 
D
E
 
E
I
 
F
E
 
S
S
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
R
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
G
V
 
A
G
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
S
 
G
D
 
N
E
 
K
R
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
D
Q
 
G
A
 
M
V
 
V
E
 
K
Q
 
Q
V
 
T
A
 
I
E
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
R
P
 
I
L
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
M
T
 
E
R
 
R
D
 
A
N
 
G
L
 
A
L
 
L
F
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
S
T
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
T
 
V
V
 
T
M
 
I
N
 
N
V
 
V
H
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
Q
 
H
V
 
G
H
 
H
M
 
M
T
 
V
D
 
E
A
 
N
G
 
K
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
x
I
S
 
A
S
|
S
I
 
R
S
 
A
A
 
W
L
 
L
G
 
G
N
 
G
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
Q
 
V
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
|
I
E
 
H
T
 
T
D
 
P
M
 
M
T
 
W
A
 
D
A
 
E
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
L
P
 
P
F
 
E
E
 
K
E
 
D
Y
 
Q
K
 
Q
A
 
F
A
 
L
A
 
L
A
 
S
R
 
R
E
 
Q
I
 
-
A
 
P
V
 
T
Q
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
S
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
V
 
L
S
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
F
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
C
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
43% identity, 99% coverage: 1:250/253 of query aligns to 2:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
S
 
S
S
 
R
N
 
L
P
 
Q
I
 
D
R
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
V
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
V
L
 
F
S
 
M
R
 
K
D
 
E
G
 
G
F
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
A
D
|
D
L
x
F
D
 
N
K
 
E
S
 
A
A
 
A
C
 
G
E
 
K
P
 
E
L
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
-
I
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
G
 
P
R
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
F
V
 
I
G
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
E
 
R
R
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
H
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
A
 
K
P
 
I
L
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
|
D
N
 
S
L
 
M
L
 
L
F
 
S
K
|
K
M
 
M
T
 
T
T
 
V
A
 
D
D
 
Q
W
 
F
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
M
 
I
N
 
N
V
 
V
H
x
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
H
M
 
C
S
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
Q
 
L
V
 
P
H
 
Y
M
 
M
T
 
A
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
W
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
T
-
 
G
A
 
T
L
 
Y
G
 
G
N
|
N
R
x
V
G
 
G
Q
|
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
Q
 
I
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
W
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
R
Y
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
I
x
T
E
 
E
T
|
T
D
 
A
M
|
M
T
 
V
A
 
A
A
 
E
T
 
V
A
 
P
K
 
E
R
 
K
V
 
V
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
I
E
 
E
E
x
K
Y
 
M
K
 
K
A
 
A
A
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
Q
I
 
V
A
 
P
V
 
M
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
S
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
V
 
Y
S
 
L
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
S
 
D
F
 
Y
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
41% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 6:240/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
R
 
K
T
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
T
L
 
L
S
 
V
R
 
A
D
 
R
G
 
G
F
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
K
 
E
S
 
S
A
 
G
C
 
A
E
 
Q
P
 
A
L
 
-
V
 
I
S
 
S
E
 
D
I
 
Y
E
 
L
S
 
G
A
 
A
G
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
M
V
x
L
G
 
-
A
 
-
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
D
E
 
P
R
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
E
Q
 
S
A
 
V
V
 
L
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
A
 
R
E
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
E
P
 
V
L
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
T
 
D
A
 
D
D
 
E
W
 
W
D
 
N
T
 
D
V
 
I
M
 
I
N
 
E
V
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
S
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
M
V
 
R
H
 
A
M
 
M
T
 
M
D
 
K
A
 
K
G
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
A
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
A
T
 
L
A
 
T
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
D
E
 
E
Y
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
G
A
 
T
A
 
L
R
 
A
E
 
A
I
 
V
A
 
P
V
 
A
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
S
 
N
D
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain ATCC 27184 / PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
43% identity, 99% coverage: 1:250/253 of query aligns to 1:243/247 of P73574

query
sites
P73574
M
 
M
S
 
T
S
 
A
N
 
L
P
 
T
I
 
A
R
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
L
R
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
A
D
 
T
G
 
G
F
 
M
A
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
V
-
 
N
L
 
Y
D
 
A
L
 
Q
D
 
S
K
 
S
S
 
T
A
 
A
C
 
A
E
 
D
P
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
I
S
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
S
 
A
D
 
N
E
 
A
R
 
D
S
 
E
V
 
V
A
 
D
Q
 
Q
A
 
L
V
 
I
E
 
K
Q
 
T
V
 
T
A
 
L
E
 
D
Q
 
K
L
 
F
G
 
S
A
 
R
P
 
I
L
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
T
L
 
L
L
 
L
F
 
L
K
 
R
M
 
M
T
 
K
T
 
L
A
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
Q
T
 
A
V
 
V
M
 
I
N
 
D
V
 
L
H
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
S
V
 
K
H
 
L
M
 
M
T
 
L
D
 
K
A
 
Q
G
 
K
W
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
V
S
 
A
A
 
G
-
 
M
L
 
M
G
 
G
N
 
N
R
x
P
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
Q
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
|
F
I
 
I
E
 
A
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
E
A
 
N
T
 
L
A
x
N
K
 
A
R
 
E
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
P
F
 
I
E
 
L
E
 
Q
Y
 
F
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
I
 
I
A
 
P
V
 
L
Q
 
A
R
 
R
V
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
S
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
A
 
T
V
 
I
S
 
R
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
T
D
 
D
D
 
P
-
 
A
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
F
Y
 
N
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 9:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
R
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
E
D
 
R
G
 
G
F
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
K
 
E
S
 
S
A
 
G
C
 
A
E
 
Q
P
 
A
L
 
-
V
 
I
S
 
S
E
 
D
I
 
Y
E
 
L
S
 
G
A
 
D
G
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
L
G
 
-
A
 
-
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
N
E
 
P
R
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
E
Q
 
A
A
 
V
V
 
L
E
 
K
Q
 
A
V
 
I
A
 
T
E
 
D
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
G
P
 
V
L
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
T
 
E
A
 
E
D
 
E
W
 
W
D
 
S
T
 
D
V
 
I
M
 
M
N
 
E
V
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
S
 
I
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
L
V
 
R
H
 
G
M
 
M
T
 
M
D
 
K
A
 
K
G
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
A
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
Q
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
|
T
D
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
N
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
D
E
 
E
Y
 
Q
K
 
R
A
 
T
A
 
A
A
 
T
A
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
P
V
 
A
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
S
 
R
D
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4bnzA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-methyl-n-phenylindole- 3-carboxamide at 2.5a resolution (see paper)
42% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 8:237/241 of 4bnzA

query
sites
4bnzA
R
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
L
S
 
G
R
 
R
D
 
L
G
 
G
F
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
 
T
D
 
S
K
 
A
S
 
S
A
 
G
C
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
I
V
 
A
S
 
E
E
 
T
I
 
L
E
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
G
L
 
A
A
 
G
V
 
L
G
 
V
A
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
D
 
S
E
 
D
R
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
A
 
T
V
 
L
E
 
E
Q
 
H
V
 
I
A
 
Q
E
 
Q
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
R
T
 
M
R
 
K
D
 
D
N
 
D
L
 
-
L
 
-
F
 
-
K
 
-
M
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
E
W
 
W
D
x
F
T
 
D
V
 
V
M
x
V
N
 
N
V
 
T
H
 
N
L
|
L
R
 
N
G
 
S
S
 
L
F
 
Y
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
L
V
 
R
H
 
G
M
 
M
T
 
T
D
 
K
A
 
A
G
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
F
|
F
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
R
 
S
Y
 
R
G
 
A
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
L
P
 
P
F
 
-
E
 
E
E
 
A
Y
 
Q
K
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
I
 
I
A
 
P
V
 
L
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
S
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
K
A
 
V
V
 
V
S
 
G
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
I
 
V
Y
 
P
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4k6fB X-ray crystal structure of a putative acetoacetyl-coa reductase from burkholderia cenocepacia bound to the co-factor NADP
38% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 2:241/245 of 4k6fB

query
sites
4k6fB
R
 
R
T
 
I
A
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
M
R
 
G
G
|
G
I
 
L
G
 
G
A
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
I
R
 
R
L
 
L
S
 
N
R
 
D
D
 
A
G
 
G
F
 
H
A
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
V
-
 
T
L
x
Y
D
x
S
L
 
P
D
 
N
K
x
N
S
 
T
A
 
G
C
 
A
E
 
D
P
 
R
L
 
W
V
 
L
S
 
T
E
 
E
I
 
M
E
 
H
S
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
R
R
 
E
A
 
F
L
 
H
A
 
A
V
 
Y
G
 
P
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
A
D
 
D
E
 
H
R
 
D
S
 
S
V
 
C
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
V
 
I
E
 
E
Q
 
K
V
 
I
A
 
V
E
 
R
Q
 
D
L
 
V
G
 
G
A
 
P
P
 
V
L
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
M
L
 
T
L
 
L
F
 
R
K
 
K
M
 
L
T
 
D
T
 
K
A
 
V
D
x
N
W
 
W
D
 
D
T
 
A
V
 
V
M
 
I
N
 
R
V
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
D
G
 
S
S
 
V
F
 
F
L
 
N
M
 
M
S
 
T
R
 
K
A
 
P
A
 
V
Q
 
C
V
 
D
H
 
G
M
 
M
T
 
V
D
 
E
A
 
R
G
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
N
-
 
G
A
 
S
L
 
K
G
 
G
N
 
S
R
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
M
Q
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
Y
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
E
 
A
T
 
T
D
 
K
M
 
M
T
 
V
A
 
T
A
 
A
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
I
P
 
P
F
 
Q
E
 
D
E
 
I
Y
 
L
K
 
D
A
 
T
A
 
K
A
 
I
A
 
L
R
 
P
E
 
Q
I
 
I
A
 
P
V
 
A
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
S
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
L
V
 
V
S
 
A
F
 
Y
F
 
L
A
 
C
R
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
A
S
 
G
F
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
N
I
 
I
Y
 
A
V
 
I
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 9:239/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
R
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
E
D
 
R
G
 
G
F
 
A
A
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
x
T
D
 
S
K
 
E
S
 
S
A
 
G
C
 
A
E
 
Q
P
 
A
L
 
-
V
 
I
S
 
S
E
 
D
I
 
Y
E
 
L
S
 
G
A
 
D
G
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
L
G
 
-
A
 
-
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
N
E
 
P
R
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
E
Q
 
A
A
 
V
V
 
L
E
 
K
Q
 
A
V
 
I
A
 
T
E
 
D
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
G
P
 
V
L
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
F
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
K
T
 
E
A
 
E
D
 
E
W
 
W
D
 
S
T
 
D
V
 
I
M
 
M
N
 
E
V
 
T
H
x
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
S
 
I
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
L
V
 
R
H
 
G
M
 
M
T
 
M
D
 
K
A
 
K
G
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
V
S
x
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
A
 
T
L
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
|
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
Q
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
|
T
D
 
D
M
 
M
T
 
N
A
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
D
E
 
E
Y
 
Q
K
 
R
A
 
T
A
 
A
A
 
T
A
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
P
V
 
A
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
S
 
R
D
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
S
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

7caxD Crystal structure of bacterial reductase
42% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 2:236/238 of 7caxD

query
sites
7caxD
R
 
R
T
 
R
A
 
I
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
Q
L
 
L
S
 
A
R
 
K
D
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
D
V
 
V
A
 
T
V
 
V
L
x
H
D
 
A
L
x
R
D
x
S
K
x
R
S
 
Q
A
 
A
-
 
E
C
 
A
E
 
E
P
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
Q
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
S
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
Q
R
 
N
A
 
S
L
 
H
A
 
Y
V
 
L
G
 
M
A
 
F
D
|
D
V
|
V
S
 
N
D
 
E
E
 
R
R
 
Q
S
 
T
V
 
V
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
I
V
 
L
E
 
E
Q
 
Q
V
 
D
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
H
G
 
G
A
 
G
P
 
F
L
 
Y
V
 
G
L
 
V
V
 
V
N
 
L
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
L
T
 
T
R
 
H
D
 
D
N
 
G
L
 
A
L
 
F
F
 
P
K
 
A
M
 
L
T
 
T
T
 
D
A
 
Q
D
 
D
W
 
W
D
 
D
T
 
E
V
 
V
M
 
I
N
 
S
V
 
T
H
 
S
L
 
L
R
 
D
G
 
G
S
 
F
F
 
Y
L
 
N
M
 
V
S
 
L
R
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
I
A
 
M
A
 
P
Q
 
M
V
 
I
H
 
H
M
 
L
T
 
R
D
 
K
A
 
G
G
 
G
W
 
-
G
 
-
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
T
L
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
S
A
 
G
-
 
I
L
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
A
 
V
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
I
G
 
G
F
 
A
T
 
T
K
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
K
Y
 
R
G
 
K
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
L
I
|
I
E
 
E
T
 
T
D
 
E
M
 
M
T
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
D
E
 
E
Y
 
V
K
 
K
A
 
E
A
 
H
A
 
A
A
 
L
R
 
K
E
 
M
I
 
I
A
 
P
V
 
L
Q
 
Q
R
 
R
V
 
M
G
 
G
Q
 
Q
P
 
V
S
 
D
D
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
V
V
 
V
S
 
K
F
 
F
F
 
L
A
 
C
R
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
R
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
Y
 
S
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4bo5A Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-chlorophenyl)-4- pyrrol-1-yl-1,3,5-triazin-2-amine at 2.6a resolution (see paper)
41% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 11:232/236 of 4bo5A

query
sites
4bo5A
R
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
L
S
 
G
R
 
R
D
 
L
G
 
G
F
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
 
T
D
 
S
K
 
A
S
 
S
A
 
G
C
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
I
V
 
A
S
 
E
E
 
T
I
 
L
E
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
G
L
 
A
A
 
G
V
 
L
G
 
V
A
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
D
 
S
E
 
D
R
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
A
 
T
V
 
L
E
 
E
Q
 
H
V
 
I
A
 
Q
E
 
Q
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
-
L
 
-
F
 
-
K
 
-
M
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
D
D
 
E
W
|
W
D
x
F
T
 
D
V
 
V
M
x
V
N
 
N
V
 
T
H
 
N
L
 
L
R
 
N
G
 
S
S
 
L
F
 
Y
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
L
V
 
R
H
 
G
M
 
M
T
 
T
D
 
K
A
 
A
G
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
G
S
|
S
-
 
V
I
 
V
S
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
|
A
G
|
G
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
R
 
S
Y
 
R
G
 
A
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
D
 
Q
M
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
K
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
I
 
I
A
 
P
V
 
L
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
S
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
K
A
 
V
V
 
V
S
 
G
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
I
 
V
Y
 
P
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4bnyA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 4-(2-phenylthieno(3,2-d) pyrimidin-4-yl)morpholine at 1.8a resolution (see paper)
41% identity, 96% coverage: 7:250/253 of query aligns to 7:235/239 of 4bnyA

query
sites
4bnyA
R
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
L
S
 
G
R
 
R
D
 
L
G
 
G
F
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
G
L
 
T
D
 
A
L
 
T
D
 
S
K
 
A
S
 
S
A
 
G
C
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
I
V
 
A
S
 
E
E
 
T
I
 
L
E
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
G
L
 
A
A
 
G
V
 
L
G
 
V
A
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
D
 
S
E
 
D
R
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
A
 
T
V
 
L
E
 
E
Q
 
H
V
 
I
A
 
Q
E
 
Q
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
F
 
-
K
 
R
M
 
M
T
 
K
T
 
D
A
 
D
D
 
E
W
|
W
D
 
F
T
 
D
V
 
V
M
 
V
N
 
N
V
 
T
H
 
N
L
|
L
R
 
N
G
 
S
S
 
L
F
 
Y
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
L
V
 
R
H
 
G
M
 
M
T
 
T
D
 
K
A
 
A
G
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
G
|
G
F
|
F
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
R
 
S
Y
 
R
G
 
A
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
L
P
 
P
F
 
-
E
 
E
E
 
A
Y
 
Q
K
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
I
 
I
A
 
P
V
 
L
Q
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
S
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
K
A
 
V
V
 
V
S
 
G
F
 
F
F
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
I
 
V
Y
 
P
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>WP_058929092.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058929092.1
MSSNPIRTAIVTGAARGIGAAVARRLSRDGFAVAVLDLDKSACEPLVSEIESAGGRALAV
GADVSDERSVAQAVEQVAEQLGAPLVLVNNAGVTRDNLLFKMTTADWDTVMNVHLRGSFL
MSRAAQVHMTDAGWGRIVNLSSISALGNRGQANYSAAKAGLQGFTKTLAIELGRYGVTVN
AIAPGFIETDMTAATAKRVGVPFEEYKAAAAREIAVQRVGQPSDIASAVSFFARDDASFV
SGQVIYVAGGPKA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory