SitesBLAST
Comparing WP_058931123.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058931123.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.
Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures
Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)
5dm3C Crystal structure of glutamine synthetase from chromohalobacter salexigens dsm 3043(csal_0679, target efi-550015) with bound adp
41% identity, 97% coverage: 15:458/460 of query aligns to 1:396/396 of 5dm3C
- active site: E115 (= E152), E117 (= E154), E162 (= E215), E169 (= E222), H218 (= H270), R286 (= R341), E303 (= E357), R305 (= R359)
- binding adenosine-5'-diphosphate: R173 (= R226), C174 (≠ Y227), H220 (= H272), S222 (= S274), R301 (= R355)
5dm3A Crystal structure of glutamine synthetase from chromohalobacter salexigens dsm 3043(csal_0679, target efi-550015) with bound adp
40% identity, 97% coverage: 14:458/460 of query aligns to 2:374/374 of 5dm3A
- active site: E107 (= E152), E109 (= E154), E146 (= E215), E150 (= E222), H199 (= H270), R265 (= R341), E282 (= E357), R284 (= R359)
- binding adenosine-5'-diphosphate: I103 (≠ H148), E141 (= E210), R154 (= R226), C155 (≠ Y227), H201 (= H272), S203 (= S274), R280 (= R355)
7tdpA Structure of paenibacillus polymyxa gs bound to met-sox-p-adp (transition state complex) to 1.98 angstom (see paper)
34% identity, 80% coverage: 90:455/460 of query aligns to 64:434/439 of 7tdpA
- binding adenosine-5'-diphosphate: N123 (≠ H148), G125 (= G150), E127 (= E152), E179 (= E210), D193 (≠ T224), Y196 (= Y227), N242 (≠ H272), S244 (= S274), R316 (= R346), R326 (= R355)
- binding magnesium ion: E127 (= E152), E127 (= E152), E129 (= E154), E184 (= E215), E191 (= E222), E191 (= E222), H240 (= H270), E328 (= E357)
- binding l-methionine-s-sulfoximine phosphate: E127 (= E152), E129 (= E154), E184 (= E215), E191 (= E222), G236 (= G266), H240 (= H270), R293 (= R323), E299 (≠ F329), R311 (= R341), R330 (= R359)
8tfkA Glutamine synthetase (see paper)
29% identity, 97% coverage: 17:460/460 of query aligns to 4:440/440 of 8tfkA
- binding adenosine-5'-diphosphate: E128 (= E152), D194 (≠ T224), F195 (= F225), F197 (≠ Y227), N243 (≠ H272), R312 (= R341), R317 (= R346), G325 (= G353), R327 (= R355)
- binding magnesium ion: E128 (= E152), E128 (= E152), E130 (= E154), E185 (= E215), E192 (= E222), E192 (= E222), H241 (= H270), E329 (= E357)
- binding l-methionine-s-sulfoximine phosphate: E128 (= E152), E130 (= E154), E185 (= E215), E192 (= E222), G237 (= G266), H241 (= H270), R294 (= R323), E300 (≠ F329), R312 (= R341), R331 (= R359)
8oozA Glutamine synthetase (see paper)
31% identity, 80% coverage: 91:458/460 of query aligns to 58:428/430 of 8oozA
- binding adenosine-5'-triphosphate: G117 (= G150), E170 (= E210), F185 (= F225), K186 (≠ R226), Y187 (= Y227), N233 (≠ H272), S235 (= S274), S315 (≠ G353), R317 (= R355)
- binding magnesium ion: E119 (= E152), H231 (= H270), E319 (= E357)
A0R083 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I alpha; GSI alpha; EC 6.3.1.2 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
32% identity, 82% coverage: 77:454/460 of query aligns to 51:441/446 of A0R083
- K363 (≠ N384) modified: Isoglutamyl lysine isopeptide (Lys-Gln) (interchain with Q-Cter in protein Pup)
7tdvC Glutamine synthetase (see paper)
29% identity, 96% coverage: 17:459/460 of query aligns to 6:442/443 of 7tdvC
- binding adenosine-5'-diphosphate: G129 (= G150), E131 (= E152), E183 (= E210), D197 (≠ T224), F198 (= F225), K199 (≠ R226), Y200 (= Y227), N246 (≠ H272), V247 (≠ F273), S248 (= S274), R320 (= R346), S328 (≠ G353), R330 (= R355)
- binding magnesium ion: E131 (= E152), E131 (= E152), E133 (= E154), E188 (= E215), E195 (= E222), E195 (= E222), H244 (= H270), E332 (= E357)
- binding l-methionine-s-sulfoximine phosphate: E131 (= E152), E133 (= E154), E188 (= E215), E195 (= E222), G240 (= G266), H244 (= H270), R297 (= R323), E303 (≠ F329), R315 (= R341)
7tfaB Glutamine synthetase (see paper)
34% identity, 80% coverage: 90:455/460 of query aligns to 64:436/441 of 7tfaB
- binding glutamine: E131 (= E154), Y153 (= Y183), E186 (= E215), G238 (= G266), H242 (= H270), R295 (= R323), E301 (≠ F329)
- binding magnesium ion: E129 (= E152), E131 (= E154), E186 (= E215), E193 (= E222), H242 (= H270), E330 (= E357)
- binding : V187 (≠ C216), N237 (≠ E265), G299 (= G327), Y300 (≠ S328), R313 (= R341), M424 (≠ A443)
Sites not aligning to the query:
8ufjB Glutamine synthetase (see paper)
30% identity, 97% coverage: 17:460/460 of query aligns to 8:444/444 of 8ufjB
8ooxB Glutamine synthetase (see paper)
31% identity, 80% coverage: 91:458/460 of query aligns to 64:436/438 of 8ooxB
7tf6A Glutamine synthetase (see paper)
29% identity, 96% coverage: 17:459/460 of query aligns to 5:437/438 of 7tf6A