SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_058931374.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058931374.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

2uytA Structure of l-rhamnulose kinase in complex with adp and beta-l- rhamnulose. (see paper)
40% identity, 95% coverage: 21:492/497 of query aligns to 7:464/479 of 2uytA

query
sites
2uytA
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
A
 
A
S
|
S
S
 
S
G
 
G
R
|
R
V
 
V
I
 
M
L
 
L
G
 
A
R
 
R
I
 
Y
K
 
E
D
 
R
G
 
E
S
 
C
S
 
R
A
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
L
E
 
T
L
 
L
E
 
R
T
 
E
V
 
I
H
 
H
R
 
R
F
 
F
P
 
N
N
 
N
G
 
G
V
 
L
V
 
H
E
 
S
L
 
Q
P
 
N
G
 
G
G
 
Y
L
 
V
R
 
T
W
 
W
D
 
D
F
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
F
 
E
A
 
S
E
 
A
V
 
I
L
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
N
-
 
K
-
 
V
-
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
A
A
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
I
T
 
D
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
T
W
|
W
A
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
F
G
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
D
A
 
Q
A
 
Q
G
 
G
E
 
Q
L
 
R
M
 
V
A
 
G
Q
 
L
P
 
P
F
 
V
S
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
D
 
S
R
 
R
S
 
T
R
 
N
A
 
G
A
 
L
V
 
M
A
 
A
P
 
Q
V
 
A
H
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
L
 
L
D
 
G
P
 
K
A
 
R
R
 
D
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
T
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
Q
 
P
F
 
F
N
 
N
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
A
 
R
-
 
A
-
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
D
 
Q
L
 
P
D
 
E
G
 
L
L
 
I
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
A
Q
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
M
P
 
P
D
 
D
L
 
Y
I
 
F
A
 
S
F
 
Y
L
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
R
 
M
R
 
N
T
 
W
E
 
E
S
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
T
T
 
T
T
 
T
G
 
Q
L
 
L
F
 
V
D
 
N
A
 
I
V
 
N
A
 
S
G
 
D
E
 
D
W
 
W
A
 
D
T
 
E
E
 
S
F
 
L
L
 
L
T
 
A
A
 
W
L
 
S
G
 
G
L
 
A
P
 
N
K
 
K
K
 
A
L
 
W
F
 
F
P
 
G
P
 
R
L
 
P
I
 
T
E
 
H
P
 
P
G
 
G
E
 
N
T
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
H
L
 
W
L
 
I
P
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
C
P
 
P
T
 
Q
G
 
G
T
 
N
K
 
E
-
 
I
-
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
S
 
S
H
|
H
D
|
D
T
 
T
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
I
A
 
A
V
 
S
P
 
P
A
 
L
Q
 
N
D
 
G
E
 
S
D
 
R
F
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
S
 
S
S
 
S
G
|
G
T
|
T
W
|
W
S
 
S
L
 
L
V
 
M
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
S
N
 
Q
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
L
 
T
T
 
N
E
 
D
A
 
T
S
 
A
R
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
N
F
 
I
T
 
T
N
 
N
E
 
E
R
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
Y
R
 
R
Y
 
V
L
 
L
R
 
K
N
 
N
M
 
I
G
 
M
G
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
L
S
x
Q
E
 
R
C
 
V
Q
 
L
R
 
Q
T
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
G
 
R
F
 
Q
T
 
I
P
 
N
E
 
D
L
|
L
A
 
P
D
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
P
 
P
P
 
A
G
 
C
G
 
R
P
 
F
Q
 
I
I
 
I
N
 
N
P
 
P
D
 
N
D
 
D
S
 
D
A
 
R
F
 
F
I
 
I
A
 
N
P
 
P
D
 
D
N
 
E
M
 
M
P
 
C
H
 
S
R
 
E
I
 
I
R
 
Q
A
 
A
T
 
A
V
 
C
R
 
R
H
 
E
T
 
M
G
 
A
D
 
Q
L
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
D
 
S
P
 
D
V
 
A
A
 
E
I
 
L
T
 
A
R
 
R
C
 
C
I
 
I
M
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
L
G
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
D
A
 
V
I
 
L
A
 
H
D
 
E
A
 
L
E
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
G
R
 
E
T
 
D
V
 
F
D
 
S
V
 
Q
V
 
L
H
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
C
Q
|
Q
N
|
N
R
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
N
Q
 
Q
L
 
L
T
 
C
A
 
A
D
 
D
T
 
A
T
 
C
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
T
V
 
L
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
G
V
 
I
Q
 
Q
A
 
L
R
 
M
A
 
T
A
 
L
G
 
D
H
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
-
G
 
N
L
 
V
T
 
D
E
 
D
L
 
F
R
 
R
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
V
 
S
S
 
T
S
 
T
H
 
A
E
 
N
L
 
L
Q
 
T
T
 
T
F
 
F
T
 
T
P
 
P

2cglA Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose, adp and a modeled atp gamma phosphate. (see paper)
40% identity, 95% coverage: 21:492/497 of query aligns to 7:464/479 of 2cglA

query
sites
2cglA
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
 
S
G
 
G
R
|
R
V
 
V
I
 
M
L
 
L
G
 
A
R
 
R
I
 
Y
K
 
E
D
 
R
G
 
E
S
 
C
S
 
R
A
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
L
E
 
T
L
 
L
E
 
R
T
 
E
V
 
I
H
 
H
R
 
R
F
 
F
P
 
N
N
 
N
G
 
G
V
 
L
V
 
H
E
 
S
L
 
Q
P
 
N
G
 
G
G
 
Y
L
 
V
R
 
T
W
 
W
D
 
D
F
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
F
 
E
A
 
S
E
 
A
V
 
I
L
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
N
-
 
K
-
 
V
-
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
A
A
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
I
T
 
D
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
T
W
|
W
A
x
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
F
G
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
D
A
 
Q
A
 
Q
G
 
G
E
 
Q
L
 
R
M
 
V
A
 
G
Q
 
L
P
 
P
F
 
V
S
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
D
 
S
R
 
R
S
 
T
R
 
N
A
 
G
A
 
L
V
 
M
A
 
A
P
 
Q
V
 
A
H
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
L
 
L
D
 
G
P
 
K
A
 
R
R
 
D
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
T
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
Q
 
P
F
 
F
N
 
N
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
A
 
R
-
 
A
-
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
D
 
Q
L
 
P
D
 
E
G
 
L
L
 
I
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
A
Q
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
M
P
 
P
D
 
D
L
 
Y
I
 
F
A
 
S
F
 
Y
L
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
R
 
M
R
 
N
T
 
W
E
 
E
S
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
T
T
 
T
T
 
T
G
 
Q
L
 
L
F
 
V
D
 
N
A
 
I
V
 
N
A
 
S
G
 
D
E
 
D
W
 
W
A
 
D
T
 
E
E
 
S
F
 
L
L
 
L
T
 
A
A
 
W
L
 
S
G
 
G
L
 
A
P
 
N
K
 
K
K
 
A
L
 
W
F
 
F
P
 
G
P
 
R
L
 
P
I
 
T
E
 
H
P
 
P
G
 
G
E
 
N
T
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
H
L
 
W
L
 
I
P
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
C
P
 
P
T
 
Q
G
 
G
T
 
N
K
 
E
-
 
I
-
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
S
 
S
H
|
H
D
|
D
T
 
T
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
I
A
 
A
V
 
S
P
 
P
A
 
L
Q
 
N
D
 
G
E
 
S
D
 
R
F
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
S
 
S
S
 
S
G
|
G
T
|
T
W
|
W
S
 
S
L
 
L
V
 
M
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
S
N
 
Q
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
L
 
T
T
 
N
E
 
D
A
 
T
S
 
A
R
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
N
F
 
I
T
 
T
N
 
N
E
 
E
R
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
Y
R
 
R
Y
 
V
L
 
L
R
 
K
N
|
N
M
 
I
G
 
M
G
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
L
S
x
Q
E
 
R
C
 
V
Q
 
L
R
 
Q
T
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
G
 
R
F
 
Q
T
 
I
P
 
N
E
 
D
L
|
L
A
 
P
D
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
P
 
P
P
 
A
G
 
C
G
 
R
P
 
F
Q
 
I
I
 
I
N
 
N
P
 
P
D
 
N
D
 
D
S
 
D
A
 
R
F
 
F
I
 
I
A
 
N
P
 
P
D
 
D
N
 
E
M
 
M
P
 
C
H
 
S
R
 
E
I
 
I
R
 
Q
A
 
A
T
 
A
V
 
C
R
 
R
H
 
E
T
 
M
G
 
A
D
 
Q
L
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
D
 
S
P
 
D
V
 
A
A
 
E
I
 
L
T
 
A
R
 
R
C
 
C
I
 
I
M
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
L
G
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
D
A
 
V
I
 
L
A
 
H
D
 
E
A
 
L
E
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
G
R
 
E
T
 
D
V
 
F
D
 
S
V
 
Q
V
 
L
H
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
C
Q
|
Q
N
|
N
R
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
N
Q
 
Q
L
 
L
T
 
C
A
 
A
D
 
D
T
 
A
T
 
C
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
T
V
 
L
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
G
V
 
I
Q
 
Q
A
 
L
R
 
M
A
 
T
A
 
L
G
 
D
H
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
-
G
 
N
L
 
V
T
 
D
E
 
D
L
 
F
R
 
R
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
V
 
S
S
 
T
S
 
T
H
 
A
E
 
N
L
 
L
Q
 
T
T
 
T
F
 
F
T
 
T
P
 
P

2cgjA Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose and adp. (see paper)
40% identity, 95% coverage: 21:492/497 of query aligns to 7:464/479 of 2cgjA

query
sites
2cgjA
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
A
 
A
S
|
S
S
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
M
L
 
L
G
 
A
R
 
R
I
 
Y
K
 
E
D
 
R
G
 
E
S
 
C
S
 
R
A
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
L
E
 
T
L
 
L
E
 
R
T
 
E
V
 
I
H
 
H
R
 
R
F
 
F
P
 
N
N
 
N
G
 
G
V
 
L
V
 
H
E
 
S
L
 
Q
P
 
N
G
 
G
G
 
Y
L
 
V
R
 
T
W
 
W
D
 
D
F
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
F
 
E
A
 
S
E
 
A
V
 
I
L
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
N
-
 
K
-
 
V
-
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
A
A
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
I
T
 
D
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
T
W
 
W
A
x
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
F
G
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
D
A
 
Q
A
 
Q
G
 
G
E
 
Q
L
 
R
M
 
V
A
 
G
Q
 
L
P
 
P
F
 
V
S
 
A
Y
|
Y
R
 
R
D
 
D
D
 
S
R
 
R
S
 
T
R
 
N
A
 
G
A
 
L
V
 
M
A
 
A
P
 
Q
V
 
A
H
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
L
 
L
D
 
G
P
 
K
A
 
R
R
 
D
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
T
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
Q
 
P
F
 
F
N
 
N
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
A
 
R
-
 
A
-
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
D
 
Q
L
 
P
D
 
E
G
 
L
L
 
I
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
A
Q
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
M
P
 
P
D
 
D
L
 
Y
I
 
F
A
 
S
F
 
Y
L
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
R
 
M
R
 
N
T
 
W
E
 
E
S
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
T
T
 
T
T
 
T
G
 
Q
L
 
L
F
 
V
D
 
N
A
 
I
V
 
N
A
 
S
G
 
D
E
 
D
W
 
W
A
 
D
T
 
E
E
 
S
F
 
L
L
 
L
T
 
A
A
 
W
L
 
S
G
 
G
L
 
A
P
 
N
K
 
K
K
 
A
L
 
W
F
 
F
P
 
G
P
 
R
L
 
P
I
 
T
E
 
H
P
 
P
G
 
G
E
 
N
T
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
H
L
 
W
L
 
I
P
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
C
P
 
P
T
 
Q
G
 
G
T
 
N
K
 
E
-
 
I
-
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
S
 
S
H
|
H
D
|
D
T
|
T
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
I
A
 
A
V
 
S
P
 
P
A
 
L
Q
 
N
D
 
G
E
 
S
D
 
R
F
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
S
 
S
S
 
S
G
|
G
T
|
T
W
|
W
S
 
S
L
 
L
V
 
M
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
S
N
 
Q
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
L
 
T
T
 
N
E
 
D
A
 
T
S
 
A
R
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
N
F
 
I
T
 
T
N
 
N
E
 
E
R
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
Y
R
 
R
Y
 
V
L
 
L
R
 
K
N
|
N
M
 
I
G
 
M
G
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
L
S
x
Q
E
 
R
C
 
V
Q
 
L
R
 
Q
T
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
G
 
R
F
 
Q
T
 
I
P
 
N
E
 
D
L
|
L
A
 
P
D
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
P
 
P
P
 
A
G
 
C
G
 
R
P
 
F
Q
 
I
I
 
I
N
 
N
P
 
P
D
 
N
D
 
D
S
 
D
A
 
R
F
 
F
I
 
I
A
 
N
P
 
P
D
 
D
N
 
E
M
 
M
P
 
C
H
 
S
R
 
E
I
 
I
R
 
Q
A
 
A
T
 
A
V
 
C
R
 
R
H
 
E
T
 
M
G
 
A
D
 
Q
L
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
D
 
S
P
 
D
V
 
A
A
 
E
I
 
L
T
 
A
R
 
R
C
 
C
I
 
I
M
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
L
G
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
D
A
 
V
I
 
L
A
 
H
D
 
E
A
 
L
E
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
G
R
 
E
T
 
D
V
 
F
D
 
S
V
 
Q
V
 
L
H
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
C
Q
|
Q
N
|
N
R
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
N
Q
 
Q
L
 
L
T
 
C
A
 
A
D
 
D
T
 
A
T
 
C
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
T
V
 
L
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
G
V
 
I
Q
 
Q
A
 
L
R
 
M
A
 
T
A
 
L
G
 
D
H
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
-
G
 
N
L
 
V
T
 
D
E
 
D
L
 
F
R
 
R
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
V
 
S
S
 
T
S
 
T
H
 
A
E
 
N
L
 
L
Q
 
T
T
 
T
F
 
F
T
 
T
P
 
P

Q1R415 Rhamnulokinase; Rhamnulose kinase; EC 2.7.1.5 from Escherichia coli (strain UTI89 / UPEC) (see paper)
40% identity, 95% coverage: 21:492/497 of query aligns to 8:465/489 of Q1R415

query
sites
Q1R415
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
A
|
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
R
|
R
V
 
V
I
 
M
L
 
L
G
 
A
R
 
R
I
 
Y
K
 
E
D
 
R
G
 
E
S
 
C
S
 
R
A
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
L
E
 
T
L
 
L
E
 
R
T
 
E
V
 
I
H
 
H
R
 
R
F
 
F
P
 
N
N
 
N
G
 
G
V
 
L
V
 
H
E
 
S
L
 
Q
P
 
N
G
 
G
G
 
Y
L
 
V
R
 
T
W
 
W
D
 
N
F
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
F
 
E
A
 
S
E
 
A
V
 
I
L
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
N
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
K
L
 
V
Q
 
C
D
 
E
E
 
E
-
 
G
-
 
I
T
 
R
I
 
I
T
 
D
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
T
W
 
W
A
x
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
F
G
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
D
A
 
Q
A
 
Q
G
 
G
E
 
Q
L
 
R
M
 
V
A
 
G
Q
 
L
P
 
P
F
 
V
S
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
D
 
S
R
 
R
S
 
T
R
 
N
A
 
G
A
 
L
V
 
M
A
 
A
P
 
Q
V
 
A
H
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
L
 
L
D
 
G
P
 
K
A
 
R
R
 
D
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
T
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
Q
 
P
F
 
F
N
 
N
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
A
 
R
-
 
A
-
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
D
 
Q
L
 
P
D
 
E
G
 
L
L
 
I
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
A
Q
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
P
 
P
D
 
D
L
 
Y
I
 
F
A
 
S
F
 
Y
L
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
R
 
M
R
 
N
T
 
W
E
 
E
S
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
T
T
 
T
T
 
T
G
 
Q
L
 
L
F
 
V
D
 
N
A
 
I
V
 
N
A
 
S
G
 
D
E
 
D
W
 
W
A
 
D
T
 
E
E
 
S
F
 
L
L
 
L
T
 
A
A
 
W
L
 
S
G
 
G
L
 
A
P
 
N
K
 
K
K
 
A
L
 
W
F
 
F
P
 
G
P
 
R
L
 
P
I
 
T
E
 
H
P
 
P
G
 
G
E
 
N
T
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
H
L
 
W
L
 
I
P
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
C
P
 
P
T
 
Q
G
 
G
T
 
N
K
 
E
-
 
I
-
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
S
 
S
H
|
H
D
|
D
T
|
T
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
I
A
 
A
V
 
S
P
 
P
A
 
L
Q
 
N
D
 
G
E
 
S
D
 
R
F
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
S
 
S
S
 
S
G
 
G
T
|
T
W
 
W
S
 
S
L
 
L
V
 
M
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
S
N
 
Q
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
L
 
T
T
 
N
E
 
D
A
 
T
S
 
A
R
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
N
F
 
I
T
 
T
N
 
N
E
 
E
R
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
Y
R
 
R
Y
 
V
L
 
L
R
 
K
N
|
N
M
 
I
G
 
M
G
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
L
S
 
-
E
 
-
C
 
-
Q
|
Q
R
 
R
T
 
V
W
 
L
G
 
-
A
 
Q
E
 
E
G
 
R
F
 
Q
T
 
I
P
 
N
E
 
D
L
 
L
A
 
P
D
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
P
 
P
P
 
A
G
 
C
G
 
R
P
 
F
Q
 
I
I
 
I
N
 
N
P
 
P
D
 
N
D
 
D
S
 
D
A
 
R
F
 
F
I
 
I
A
 
N
P
 
P
D
 
D
N
 
E
M
 
M
P
 
C
H
 
S
R
 
E
I
 
I
R
 
Q
A
 
A
T
 
A
V
 
C
R
 
R
H
 
E
T
 
T
G
 
A
D
 
Q
L
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
D
 
S
P
 
D
V
 
A
A
 
E
I
 
L
T
 
A
R
 
R
C
 
C
I
 
I
M
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
L
G
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
D
A
 
V
I
 
L
A
 
H
D
 
E
A
 
L
E
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
G
R
 
E
T
 
D
V
 
F
D
 
S
V
 
Q
V
 
L
H
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
C
Q
 
Q
N
 
N
R
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
N
Q
 
Q
L
 
L
T
 
C
A
 
A
D
 
D
T
 
A
T
 
C
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
T
V
 
L
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
G
V
 
I
Q
 
Q
A
 
L
R
 
M
A
 
T
A
 
L
G
 
D
H
 
E
I
 
L
T
 
-
G
 
N
G
 
N
L
 
V
T
 
D
E
 
D
L
 
F
R
 
R
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
V
 
S
S
 
T
S
 
T
H
 
A
E
 
N
L
 
L
Q
 
T
T
 
T
F
 
F
T
 
T
P
 
P

P32171 L-Rhamnulokinase; RhaB; RhuK; ATP:L-rhamnulose phosphotransferase; L-rhamnulose 1-kinase; Rhamnulose kinase; EC 2.7.1.5 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
40% identity, 95% coverage: 21:492/497 of query aligns to 8:465/489 of P32171

query
sites
P32171
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
A
|
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
R
|
R
V
 
V
I
 
M
L
 
L
G
 
A
R
 
R
I
 
Y
K
 
E
D
 
R
G
 
E
S
 
C
S
 
R
A
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
S
V
 
L
E
 
T
L
 
L
E
 
R
T
 
E
V
 
I
H
 
H
R
 
R
F
 
F
P
 
N
N
 
N
G
 
G
V
 
L
V
 
H
E
 
S
L
 
Q
P
 
N
G
 
G
G
 
Y
L
 
V
R
 
T
W
 
W
D
 
D
F
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
F
 
E
A
 
S
E
 
A
V
 
I
L
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
N
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
K
L
 
V
Q
x
C
D
x
E
E
|
E
-
 
G
-
 
I
T
x
R
I
 
I
T
 
D
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
T
W
 
W
A
x
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
F
G
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
D
A
 
Q
A
 
Q
G
 
G
E
 
Q
L
 
R
M
 
V
A
 
G
Q
 
L
P
 
P
F
 
V
S
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
D
 
S
R
 
R
S
 
T
R
 
N
A
 
G
A
 
L
V
 
M
A
 
A
P
 
Q
V
 
A
H
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
L
 
L
D
 
G
P
 
K
A
 
R
R
 
D
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
T
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
Q
 
P
F
 
F
N
 
N
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
A
 
R
-
 
A
-
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
D
 
Q
L
 
P
D
 
E
G
 
L
L
 
I
-
 
P
-
 
H
-
 
I
-
 
A
Q
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
M
P
 
P
D
 
D
L
 
Y
I
 
F
A
 
S
F
 
Y
L
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
R
 
M
R
 
N
T
 
W
E
 
E
S
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
T
T
 
T
T
 
T
G
 
Q
L
 
L
F
 
V
D
 
N
A
 
I
V
 
N
A
 
S
G
 
D
E
 
D
W
 
W
A
 
D
T
 
E
E
 
S
F
 
L
L
 
L
T
 
A
A
 
W
L
 
S
G
 
G
L
 
A
P
 
N
K
 
K
K
 
A
L
 
W
F
 
F
P
 
G
P
 
R
L
 
P
I
 
T
E
 
H
P
 
P
G
 
G
E
 
N
T
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
H
L
 
W
L
 
I
P
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
L
x
C
P
 
P
T
 
Q
G
 
G
T
 
N
K
 
E
-
 
I
-
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
S
 
S
H
|
H
D
|
D
T
|
T
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
I
A
 
A
V
 
S
P
 
P
A
 
L
Q
 
N
D
 
G
E
 
S
D
 
R
F
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
S
 
S
S
 
S
G
 
G
T
|
T
W
 
W
S
 
S
L
 
L
V
 
M
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
S
N
 
Q
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
L
 
T
T
 
N
E
 
D
A
 
T
S
 
A
R
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
N
F
 
I
T
 
T
N
 
N
E
 
E
R
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
Y
R
 
R
Y
 
V
L
 
L
R
 
K
N
|
N
M
 
I
G
 
M
G
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
L
S
 
-
E
 
-
C
 
-
Q
|
Q
R
 
R
T
 
V
W
 
L
G
 
Q
A
 
E
E
 
Q
G
 
Q
F
 
I
T
 
N
P
 
-
E
 
D
L
 
L
A
 
P
D
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
T
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
P
 
P
P
 
A
G
 
C
G
 
R
P
 
F
Q
 
I
I
 
I
N
 
N
P
 
P
D
 
N
D
 
D
S
 
D
A
 
R
F
 
F
I
 
I
A
 
N
P
 
P
D
 
E
N
 
T
M
 
M
P
 
C
H
 
S
R
 
E
I
 
I
R
 
Q
A
 
A
T
 
A
V
x
C
R
 
R
H
 
E
T
 
T
G
 
A
D
 
Q
L
 
P
L
 
I
P
 
P
D
 
E
D
 
S
P
 
D
V
 
A
A
 
E
I
 
L
T
 
A
R
 
R
C
|
C
I
 
I
M
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
L
G
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
D
A
 
V
I
 
L
A
 
H
D
 
E
A
 
L
E
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
G
R
 
E
T
 
D
V
 
F
D
 
S
V
 
Q
V
 
L
H
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
C
Q
 
Q
N
 
N
R
 
T
L
 
L
L
 
L
C
 
N
Q
 
Q
L
 
L
T
 
C
A
 
A
D
 
D
T
 
A
T
 
C
G
 
G
K
 
I
K
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
T
V
 
L
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
G
V
 
I
Q
 
Q
A
 
L
R
 
M
A
 
T
A
 
L
G
 
D
H
 
E
I
 
L
T
 
-
G
 
N
G
 
N
L
 
V
T
 
D
E
 
D
L
 
F
R
 
R
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
V
 
S
S
 
T
S
 
T
H
 
A
E
 
N
L
 
L
Q
 
T
T
 
T
F
 
F
T
 
T
P
 
P

3kzbA Crystal structure of xylulokinase from chromobacterium violaceum
38% identity, 21% coverage: 178:281/497 of query aligns to 162:264/498 of 3kzbA

query
sites
3kzbA
D
 
D
L
 
Y
I
 
V
A
 
V
F
 
L
L
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
R
R
 
H
R
 
A
T
 
T
E
 
D
S
 
R
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
R
A
 
P
V
 
K
A
 
D
G
 
D
E
 
A
W
 
W
A
 
H
T
 
V
E
 
E
F
 
L
L
 
L
T
 
A
A
 
D
L
 
Y
G
 
G
L
 
F
P
 
S
K
 
L
K
 
D
L
 
L
F
 
M
P
 
P
P
 
R
L
 
L
I
 
L
E
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
E
T
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
G
L
 
V
L
 
S
P
 
A
E
 
L
I
 
A
A
 
A
T
 
R
R
 
Q
V
 
T
G
 
G
L
 
F
P
 
V
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
C
V
 
-
G
 
G
S
 
L
H
 
G
D
 
D
T
 
A
A
 
G
S
 
A
A
 
A
V
 
T
A
 
L
A
 
G
V
 
V
P
 
G
A
 
V
Q
 
L
D
 
D
E
 
D
D
 
E
F
 
D
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
S
 
H
S
 
L
G
|
G
T
|
T

Sites not aligning to the query:

3ll3A The crystal structure of ligand bound xylulose kinase from lactobacillus acidophilus
23% identity, 36% coverage: 116:292/497 of query aligns to 90:271/492 of 3ll3A

query
sites
3ll3A
E
 
E
L
 
L
M
 
L
A
 
T
Q
 
N
P
 
S
F
 
I
S
 
T
Y
 
W
R
 
A
D
 
D
D
 
N
R
 
C
S
 
A
R
 
K
A
 
S
A
 
I
V
 
V
A
 
Q
P
 
D
V
 
A
H
 
K
R
 
N
K
 
R
L
 
G
D
 
F
P
 
A
A
 
Q
R
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
A
 
R
T
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
M
Q
 
P
F
 
M
L
x
H
Q
 
P
F
 
M
N
 
A
T
 
P
L
 
I
Y
 
Y
Q
 
K
L
 
L
-
 
L
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
K
A
 
K
T
 
T
E
 
E
R
 
V
D
 
F
L
 
S
D
 
Q
G
 
A
L
 
Q
Q
 
K
A
 
W
L
 
I
L
 
G
I
 
I
P
 
K
D
 
E
L
 
Y
I
 
I
A
 
I
F
 
F
L
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
R
 
L
R
 
V
T
 
T
E
 
D
S
 
T
T
 
T
N
 
M
A
 
A
S
 
A
T
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
I
F
 
L
D
 
N
A
 
L
V
 
K
A
 
T
G
 
L
E
 
T
W
 
W
A
 
D
T
 
Q
E
 
E
F
 
L
L
 
L
T
 
D
A
 
I
L
 
L
G
 
K
L
 
I
P
 
K
K
 
K
K
 
E
L
 
Q
F
 
L
P
 
P
P
 
K
L
 
I
I
 
A
E
 
Q
P
 
P
G
 
T
E
 
K
T
 
V
V
 
I
G
 
F
T
 
P
L
 
I
L
 
K
P
 
T
E
 
E
I
 
Y
A
 
V
T
 
K
R
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
D
T
 
S
G
 
D
T
 
T
K
 
K
V
 
I
V
 
I
A
 
-
V
 
L
G
 
G
S
 
A
H
 
S
D
|
D
T
 
G
A
 
Y
S
 
L
A
 
S
V
 
T
A
 
I
A
 
G
V
 
V
P
 
N
A
 
A
Q
 
I
D
 
D
E
 
S
D
 
D
F
 
H
A
 
C
Y
 
A
I
 
L
S
 
N
S
 
V
G
|
G
T
|
T
W
 
S
S
 
G
L
 
A
V
 
I
G
 
R
L
 
T
E
 
I
L
 
V
N
 
D
Q
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3ll3B The crystal structure of ligand bound xylulose kinase from lactobacillus acidophilus
23% identity, 36% coverage: 116:292/497 of query aligns to 89:270/490 of 3ll3B

query
sites
3ll3B
E
 
E
L
 
L
M
 
L
A
 
T
Q
 
N
P
 
S
F
 
I
S
 
T
Y
 
W
R
 
A
D
 
D
D
 
N
R
 
C
S
 
A
R
 
K
A
 
S
A
 
I
V
 
V
A
 
Q
P
 
D
V
 
A
H
 
K
R
 
N
K
 
R
L
 
G
D
 
F
P
 
A
A
 
Q
R
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
A
 
R
T
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
M
Q
 
P
F
 
M
L
x
H
Q
 
P
F
 
M
N
 
A
T
 
P
L
 
I
Y
 
Y
Q
 
K
L
 
L
-
 
L
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
K
A
 
K
T
 
T
E
 
E
R
 
V
D
 
F
L
 
S
D
 
Q
G
 
A
L
 
Q
Q
 
K
A
 
W
L
 
I
L
 
G
I
 
I
P
 
K
D
 
E
L
 
Y
I
 
I
A
 
I
F
 
F
L
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
R
 
L
R
 
V
T
 
T
E
 
D
S
 
T
T
 
T
N
 
M
A
 
A
S
 
A
T
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
I
F
 
L
D
 
N
A
 
L
V
 
K
A
 
T
G
 
L
E
 
T
W
 
W
A
 
D
T
 
Q
E
 
E
F
 
L
L
 
L
T
 
D
A
 
I
L
 
L
G
 
K
L
 
I
P
 
K
K
 
K
K
 
E
L
 
Q
F
 
L
P
 
P
P
 
K
L
 
I
I
 
A
E
 
Q
P
 
P
G
 
T
E
 
K
T
 
V
V
 
I
G
 
F
T
 
P
L
 
I
L
 
K
P
 
T
E
 
E
I
 
Y
A
 
V
T
 
K
R
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
D
T
 
S
G
 
D
T
 
T
K
 
K
V
 
I
V
 
I
A
 
-
V
 
L
G
 
G
S
 
A
H
 
S
D
 
D
T
 
G
A
 
Y
S
 
L
A
 
S
V
 
T
A
 
I
A
 
G
V
 
V
P
 
N
A
 
A
Q
 
I
D
 
D
E
 
S
D
 
D
F
 
H
A
 
C
Y
 
A
I
 
L
S
 
N
S
 
V
G
|
G
T
|
T
W
 
S
S
 
G
L
 
A
V
 
I
G
 
R
L
 
T
E
 
I
L
 
V
N
 
D
Q
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5ya1A Crystal structure of lsrk-hpr complex with atp (see paper)
25% identity, 75% coverage: 125:497/497 of query aligns to 97:471/478 of 5ya1A

query
sites
5ya1A
R
 
R
D
 
A
D
 
A
R
 
R
S
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
E
V
 
L
A
 
K
P
 
E
V
 
L
H
 
H
R
 
N
K
 
N
L
 
T
D
 
F
P
 
E
A
 
N
R
 
E
L
 
V
Y
 
Y
A
 
R
T
 
A
T
 
T
G
 
G
-
 
Q
-
 
T
L
 
L
Q
 
A
F
 
L
L
 
S
Q
 
A
F
 
I
N
 
P
T
 
R
L
 
L
Y
 
L
Q
 
W
L
 
L
A
 
A
T
 
H
E
 
H
R
 
R
D
 
S
L
 
D
D
 
I
G
 
Y
L
 
R
Q
 
Q
A
 
A
-
 
S
-
 
T
-
 
I
L
 
T
L
 
M
I
 
I
P
 
S
D
 
D
L
 
W
I
 
L
A
 
A
F
 
Y
L
 
M
L
 
L
T
 
S
G
 
G
Q
 
E
R
 
L
R
 
A
T
 
V
E
 
D
S
 
P
T
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
D
A
 
L
V
 
T
A
 
T
G
 
R
E
 
D
W
 
W
A
 
K
T
 
P
E
 
A
F
 
L
L
 
L
T
 
D
A
 
M
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
R
K
 
A
K
 
D
L
 
I
F
 
L
P
 
S
P
 
P
L
 
V
I
 
K
E
 
E
P
 
T
G
 
G
E
 
T
T
 
L
V
 
L
G
 
G
T
 
V
L
 
V
L
 
S
P
 
S
E
 
Q
I
 
A
A
 
A
T
 
E
R
 
L
V
 
C
G
 
G
L
 
L
P
 
K
T
 
A
G
 
G
T
 
T
K
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
-
V
 
V
G
 
G
S
 
G
H
 
G
D
 
D
T
 
V
A
 
Q
S
 
L
A
 
G
V
 
C
A
 
L
A
 
G
V
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
R
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
D
 
T
E
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
A
Y
 
V
I
 
L
S
 
G
S
 
G
G
 
T
T
 
F
W
 
W
S
 
Q
L
 
Q
V
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
M
G
 
N
L
 
V
E
 
R
L
 
V
N
 
N
Q
 
P
P
 
H
V
 
V
L
 
I
T
 
P
E
 
G
A
 
M
S
 
V
R
 
Q
A
 
A
A
 
E
N
 
S
F
 
I
T
 
S
N
 
F
E
 
F
R
 
T
G
|
G
V
 
L
D
 
-
G
 
-
T
 
T
I
 
M
R
|
R
Y
 
W
L
 
F
R
|
R
N
 
D
M
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
E
 
F
C
 
C
-
 
A
Q
 
E
R
 
E
T
 
K
W
 
L
G
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
R
F
 
L
T
 
G
P
 
I
E
 
D
L
 
T
A
x
Y
D
 
T
L
 
L
L
 
L
-
 
E
A
 
E
A
 
M
A
 
A
S
 
S
A
 
R
L
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
S
P
 
W
Q
 
G
I
 
V
N
 
M
P
 
P
D
 
I
D
 
F
S
 
S
A
 
Y
F
 
H
I
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
S
N
 
F
M
 
I
P
 
N
H
 
L
R
 
S
I
 
I
R
 
D
A
 
P
T
 
D
V
 
K
R
 
C
H
 
N
T
 
K
G
 
A
D
 
T
L
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
A
L
 
L
P
 
E
D
 
E
D
 
N
P
 
A
V
 
A
A
 
I
I
 
V
T
 
S
R
 
A
C
 
C
I
 
N
M
 
L
D
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
Q
A
 
Q
I
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
F
E
 
S
R
 
N
L
 
I
A
 
H
D
 
P
R
 
S
T
 
S
V
 
L
D
 
V
V
 
-
V
 
-
H
 
-
I
 
F
V
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
Q
 
K
N
x
G
R
 
K
L
 
L
L
 
W
C
 
S
Q
 
Q
L
 
I
T
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
V
T
 
S
G
 
G
K
 
L
K
 
P
V
 
V
V
 
N
A
 
I
G
 
P
P
 
V
V
 
V
-
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
L
G
 
G
N
 
C
V
 
A
L
 
I
V
 
A
Q
 
A
A
 
G
R
 
V
A
 
G
A
 
A
G
 
G
H
 
-
I
 
I
T
 
F
G
 
S
G
 
S
L
 
M
T
 
A
E
 
E
L
 
T
R
 
G
R
 
E
L
 
R
V
 
L
V
 
V
S
 
R
S
 
W
H
 
E
E
 
R
L
 
T
Q
 
H
T
 
T
F
 
P
T
 
D
P
 
P
Q
 
E
L
 
K
S
 
H
R
 
E
L
 
L

5ya2A Crystal structure of lsrk-hpr complex with adp (see paper)
25% identity, 75% coverage: 125:497/497 of query aligns to 97:471/478 of 5ya2A

query
sites
5ya2A
R
 
R
D
 
A
D
 
A
R
 
R
S
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
E
V
 
L
A
 
K
P
 
E
V
 
L
H
 
H
R
 
N
K
 
N
L
 
T
D
 
F
P
 
E
A
 
N
R
 
E
L
 
V
Y
 
Y
A
 
R
T
 
A
T
 
T
G
 
G
-
 
Q
-
 
T
L
 
L
Q
 
A
F
 
L
L
 
S
Q
 
A
F
 
I
N
 
P
T
 
R
L
 
L
Y
 
L
Q
 
W
L
 
L
A
 
A
T
 
H
E
 
H
R
 
R
D
 
S
L
 
D
D
 
I
G
 
Y
L
 
R
Q
 
Q
A
 
A
-
 
S
-
 
T
-
 
I
L
 
T
L
 
M
I
 
I
P
 
S
D
 
D
L
 
W
I
 
L
A
 
A
F
 
Y
L
 
M
L
 
L
T
 
S
G
 
G
Q
 
E
R
 
L
R
 
A
T
 
V
E
 
D
S
 
P
T
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
D
A
 
L
V
 
T
A
 
T
G
 
R
E
 
D
W
 
W
A
 
K
T
 
P
E
 
A
F
 
L
L
 
L
T
 
D
A
 
M
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
R
K
 
A
K
 
D
L
 
I
F
 
L
P
 
S
P
 
P
L
 
V
I
 
K
E
 
E
P
 
T
G
 
G
E
 
T
T
 
L
V
 
L
G
 
G
T
 
V
L
 
V
L
 
S
P
 
S
E
 
Q
I
 
A
A
 
A
T
 
E
R
 
L
V
 
C
G
 
G
L
 
L
P
 
K
T
 
A
G
 
G
T
 
T
K
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
-
V
 
V
G
 
G
S
 
G
H
 
G
D
 
D
T
 
V
A
 
Q
S
 
L
A
 
G
V
 
C
A
 
L
A
 
G
V
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
R
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
D
 
T
E
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
A
Y
 
V
I
 
L
S
 
G
S
 
G
G
 
T
T
 
F
W
 
W
S
 
Q
L
 
Q
V
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
M
G
 
N
L
 
V
E
 
R
L
 
V
N
 
N
Q
 
P
P
 
H
V
 
V
L
 
I
T
 
P
E
 
G
A
 
M
S
 
V
R
 
Q
A
 
A
A
 
E
N
 
S
F
 
I
T
 
S
N
 
F
E
 
F
R
 
T
G
|
G
V
 
L
D
 
-
G
 
-
T
 
T
I
 
M
R
|
R
Y
 
W
L
 
F
R
|
R
N
 
D
M
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
E
 
F
C
 
C
-
 
A
Q
 
E
R
 
E
T
 
K
W
 
L
G
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
R
F
 
L
T
 
G
P
 
I
E
 
D
L
 
T
A
x
Y
D
 
T
L
 
L
L
 
L
-
 
E
A
 
E
A
 
M
A
 
A
S
 
S
A
 
R
L
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
S
P
 
W
Q
 
G
I
 
V
N
 
M
P
 
P
D
 
I
D
 
F
S
 
S
A
 
D
F
 
H
I
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
S
N
 
F
M
 
I
P
 
N
H
 
L
R
 
S
I
 
I
R
 
D
A
 
P
T
 
D
V
 
K
R
 
C
H
 
N
T
 
K
G
 
A
D
 
T
L
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
A
L
 
L
P
 
E
D
 
E
D
 
N
P
 
A
V
 
A
A
 
I
I
 
V
T
 
S
R
 
A
C
 
C
I
 
N
M
 
L
D
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
R
 
Q
A
 
Q
I
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
F
E
 
S
R
 
N
L
 
I
A
 
H
D
 
P
R
 
S
T
 
S
V
 
L
D
 
V
V
 
-
V
 
-
H
 
-
I
 
F
V
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
Q
 
K
N
x
G
R
 
K
L
 
L
L
 
W
C
 
S
Q
 
Q
L
 
I
T
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
V
T
 
S
G
 
G
K
 
L
K
 
P
V
 
V
V
 
N
A
 
I
G
 
P
P
 
V
V
 
V
-
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
L
G
 
G
N
 
C
V
 
A
L
 
I
V
 
A
Q
 
A
A
 
G
R
 
V
A
 
G
A
 
A
G
 
G
H
 
-
I
 
I
T
 
F
G
 
S
G
 
S
L
 
M
T
 
A
E
 
E
L
 
T
R
 
G
R
 
E
L
 
R
V
 
L
V
 
V
S
 
R
S
 
W
H
 
E
E
 
R
L
 
T
Q
 
H
T
 
T
F
 
P
T
 
D
P
 
P
Q
 
E
L
 
K
S
 
H
R
 
E
L
 
L

Q8BX05 Glycerol kinase 5; GK 5; Glycerokinase 5; ATP:glycerol 3-phosphotransferase 5; EC 2.7.1.30 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
26% identity, 48% coverage: 22:261/497 of query aligns to 29:284/534 of Q8BX05

query
sites
Q8BX05
V
 
L
D
 
D
I
 
V
G
 
G
A
 
S
S
 
T
S
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
V
I
 
I
L
 
R
G
 
C
R
 
H
I
 
V
K
 
Y
D
 
D
G
 
-
S
 
Q
S
 
T
A
 
A
T
 
R
A
 
V
D
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
S
E
 
A
L
 
Q
E
 
K
T
 
V
V
 
E
H
 
N
R
 
V
F
 
Y
P
 
P
N
 
Q
G
 
-
V
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
P
G
 
G
G
 
W
L
 
V
R
 
E
W
 
I
D
 
D
F
 
P
D
 
D
A
 
S
L
 
L
F
 
W
A
 
A
E
 
Q
V
 
F
L
 
V
A
 
A
G
 
V
L
 
I
T
 
K
A
 
D
A
 
A
G
 
V
T
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
G
L
 
V
Q
 
Q
D
 
M
E
 
N
T
 
Q
I
 
I
T
 
V
S
 
G
I
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
S
T
 
T
W
 
Q
A
 
R
V
 
A
D
 
T
Y
 
F
G
 
I
L
 
T
V
 
W
N
 
N
A
 
K
A
 
K
-
 
T
G
 
G
E
 
H
L
 
H
M
 
F
A
 
H
Q
 
N
P
 
F
F
 
I
S
 
S
Y
 
W
R
 
Q
D
 
D
D
 
L
R
 
R
S
 
A
R
 
A
A
 
E
A
 
L
V
 
V
A
 
K
P
 
S
V
 
W
H
 
N
R
 
N
K
 
S
L
 
L
D
 
I
P
 
M
A
 
K
R
 
L
L
 
L
Y
 
H
-
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
R
G
 
V
L
 
L
Q
 
H
F
 
F
L
 
F
-
 
S
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
V
-
 
M
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
S
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
T
 
F
L
 
S
Y
 
T
Q
 
Q
L
 
H
A
 
A
T
 
T
E
x
L
R
|
R
D
x
L
L
x
T
D
x
W
G
x
I
L
|
L
Q
|
Q
A
x
N
L
|
L
-
x
S
-
x
E
-
x
V
-
x
K
-
x
R
-
x
A
-
x
V
-
x
E
-
x
E
-
x
D
-
x
N
-
x
C
-
x
C
-
x
F
-
x
G
L
x
T
I
|
I
P
x
D
D
x
T
L
x
W
I
x
L
A
x
L
F
x
Y
L
x
K
L
|
L
T
|
T
-
x
K
-
x
G
G
x
S
Q
x
S
R
x
Y
R
x
A
T
|
T
E
x
D
S
x
Y
T
x
S
N
|
N
A
|
A
S
|
S
T
|
T
T
|
T
G
|
G
L
x
F
F
|
F
D
|
D
A
x
P
V
x
Y
A
|
A
G
x
M
E
x
R
W
|
W
A
x
S
T
x
R
E
x
L
F
x
I
L
x
T
T
|
T
A
x
M
L
x
V
G
x
S
L
x
I
P
|
P
K
x
L
K
x
S
L
x
I
F
x
L
P
|
P
P
|
P
L
x
V
I
x
K
E
x
D
P
x
T
G
x
S
E
x
Y
T
x
N
V
x
F
G
|
G
T
x
S
L
x
V
L
x
D
P
x
E
E
x
K
I
|
I
A
 
-
T
 
-
R
 
-
V
x
F
G
|
G
L
x
V
P
|
P
T
x
I
G
x
P
T
x
V
K
 
-
V
|
V
V
x
A
A
x
L
V
|
V
G
|
G
S
x
D
H
x
Q
D
x
Q
T
x
S
A
|
A

Sites not aligning to the query:

P09099 Xylulose kinase; XK; Xylulokinase; 1-deoxy-D-xylulokinase; EC 2.7.1.17; EC 2.7.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 17% coverage: 166:248/497 of query aligns to 144:224/484 of P09099

query
sites
P09099
R
 
R
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
G
 
-
L
 
-
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
P
P
 
K
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
A
 
R
F
 
L
L
 
R
L
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
R
 
F
R
 
A
T
 
S
E
 
D
S
 
M
T
 
S
N
 
D
A
 
A
S
 
A
T
 
G
T
 
T
G
 
M
L
 
W
F
 
L
D
 
D
A
 
V
V
 
A
A
 
K
G
 
R
E
 
D
W
 
W
A
 
S
T
 
D
E
 
V
F
 
M
L
 
L
T
 
Q
A
 
A
L
 
C
G
 
D
L
 
L
P
 
S
K
 
R
K
 
D
L
 
Q
F
 
M
P
 
P
P
 
A
L
 
L
I
 
Y
E
 
E
P
 
G
G
 
S
E
 
E
T
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
T
 
K
R
 
A
V
 
W
G
 
G
L
 
M
P
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

2itmA Crystal structure of the e. Coli xylulose kinase complexed with xylulose (see paper)
31% identity, 17% coverage: 166:248/497 of query aligns to 144:224/476 of 2itmA

query
sites
2itmA
R
 
R
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
G
 
-
L
 
-
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
P
P
 
K
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
A
 
R
F
 
L
L
 
R
L
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
R
 
F
R
 
A
T
 
S
E
 
D
S
 
M
T
 
S
N
 
D
A
 
A
S
 
A
T
 
G
T
 
T
G
 
M
L
 
W
F
 
L
D
 
D
A
 
V
V
 
A
A
 
K
G
 
R
E
 
D
W
 
W
A
 
S
T
 
D
E
 
V
F
 
M
L
 
L
T
 
Q
A
 
A
L
 
C
G
 
D
L
 
L
P
 
S
K
 
R
K
 
D
L
 
Q
F
 
M
P
 
P
P
 
A
L
 
L
I
 
Y
E
 
E
P
 
G
G
 
S
E
 
E
T
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
T
 
K
R
 
A
V
 
W
G
 
G
L
 
M
P
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_058931374.1 NCBI__GCF_001484605.1:WP_058931374.1
MSTTENGVDGGSTSASNVFAAVDIGASSGRVILGRIKDGSSATADGSVELETVHRFPNGV
VELPGGLRWDFDALFAEVLAGLTAAGTAAKLQDETITSIGIDTWAVDYGLVNAAGELMAQ
PFSYRDDRSRAAVAPVHRKLDPARLYATTGLQFLQFNTLYQLATERDLDGLQALLIPDLI
AFLLTGQRRTESTNASTTGLFDAVAGEWATEFLTALGLPKKLFPPLIEPGETVGTLLPEI
ATRVGLPTGTKVVAVGSHDTASAVAAVPAQDEDFAYISSGTWSLVGLELNQPVLTEASRA
ANFTNERGVDGTIRYLRNMGGLWLLSECQRTWGAEGFTPELADLLAAASALPPGGPQINP
DDSAFIAPDNMPHRIRATVRHTGDLLPDDPVAITRCIMDSLATGYARAIADAERLADRTV
DVVHIVGGGSQNRLLCQLTADTTGKKVVAGPVEATAVGNVLVQARAAGHITGGLTELRRL
VVSSHELQTFTPQLSRL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory